##fileformat=VCFv4.2
##FORMAT=<ID=AD,Number=R,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele fractions of alternate alleles in the tumor">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth (reads with MQ=255 or with bad mates are filtered)">
##FORMAT=<ID=F1R2,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F1R2 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=F2R1,Number=R,Type=Integer,Description="Count of reads in F2R1 pair orientation supporting each allele">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=PGT,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing haplotype information, describing how the alternate alleles are phased in relation to one another">
##FORMAT=<ID=PID,Number=1,Type=String,Description="Physical phasing ID information, where each unique ID within a given sample (but not across samples) connects records within a phasing group">
##FORMAT=<ID=PL,Number=G,Type=Integer,Description="Normalized, Phred-scaled likelihoods for genotypes as defined in the VCF specification">
##FORMAT=<ID=PS,Number=1,Type=Integer,Description="Phasing set (typically the position of the first variant in the set)">
##FORMAT=<ID=SB,Number=4,Type=Integer,Description="Per-sample component statistics which comprise the Fisher's Exact Test to detect strand bias.">
##GATKCommandLine=<ID=Mutect2,CommandLine="Mutect2  --tumor-sample CAN2_R --panel-of-normals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/HPON.vcf --output /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/08_variant_calling/mutect2/CAN2_R.vcf --max-reads-per-alignment-start 500 --activity-profile-out CAN2_R_activity_profile --assembly-region-out CAN2_R_assembly_region --intervals /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Refseq/seqCap_VCRome_V2_intervals_list.intervals --interval-set-rule UNION --interval-padding 100 --interval-exclusion-padding 0 --interval-merging-rule ALL --input /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/07_BQSR/BQSR/CAN2_R.bam --read-validation-stringency SILENT --reference /home/rceprian/tutorial_VariantSeq/03_refseq/Reference_genome/ucsc.hg19.fasta  --f1r2-median-mq 50 --f1r2-min-bq 20 --f1r2-max-depth 200 --genotype-pon-sites false --genotype-germline-sites false --af-of-alleles-not-in-resource -1.0 --mitochondria-mode false --tumor-lod-to-emit 3.0 --initial-tumor-lod 2.0 --pcr-snv-qual 40 --pcr-indel-qual 40 --max-population-af 0.01 --downsampling-stride 1 --callable-depth 10 --max-suspicious-reads-per-alignment-start 0 --normal-lod 2.2 --ignore-itr-artifacts false --gvcf-lod-band -2.5 --gvcf-lod-band -2.0 --gvcf-lod-band -1.5 --gvcf-lod-band -1.0 --gvcf-lod-band -0.5 --gvcf-lod-band 0.0 --gvcf-lod-band 0.5 --gvcf-lod-band 1.0 --minimum-allele-fraction 0.0 --genotype-filtered-alleles false --disable-adaptive-pruning false --dont-trim-active-regions false --max-disc-ar-extension 25 --max-gga-ar-extension 300 --padding-around-indels 150 --padding-around-snps 20 --kmer-size 10 --kmer-size 25 --dont-increase-kmer-sizes-for-cycles false --allow-non-unique-kmers-in-ref false --num-pruning-samples 1 --min-dangling-branch-length 4 --recover-all-dangling-branches false --max-num-haplotypes-in-population 128 --min-pruning 2 --adaptive-pruning-initial-error-rate 0.001 --pruning-lod-threshold 2.302585092994046 --max-unpruned-variants 100 --debug-assembly false --debug-graph-transformations false --capture-assembly-failure-bam false --error-correct-reads false --kmer-length-for-read-error-correction 25 --min-observations-for-kmer-to-be-solid 20 --likelihood-calculation-engine PairHMM --base-quality-score-threshold 18 --pair-hmm-gap-continuation-penalty 10 --pair-hmm-implementation FASTEST_AVAILABLE --pcr-indel-model CONSERVATIVE --phred-scaled-global-read-mismapping-rate 45 --native-pair-hmm-threads 4 --native-pair-hmm-use-double-precision false --bam-writer-type CALLED_HAPLOTYPES --dont-use-soft-clipped-bases false --min-base-quality-score 10 --smith-waterman JAVA --emit-ref-confidence NONE --max-mnp-distance 1 --min-assembly-region-size 50 --max-assembly-region-size 300 --assembly-region-padding 100 --active-probability-threshold 0.002 --max-prob-propagation-distance 50 --force-active false --seconds-between-progress-updates 10.0 --disable-sequence-dictionary-validation false --create-output-bam-index true --create-output-bam-md5 false --create-output-variant-index true --create-output-variant-md5 false --lenient false --add-output-sam-program-record true --add-output-vcf-command-line true --cloud-prefetch-buffer 40 --cloud-index-prefetch-buffer -1 --disable-bam-index-caching false --sites-only-vcf-output false --help false --version false --showHidden false --verbosity INFO --QUIET false --use-jdk-deflater false --use-jdk-inflater false --gcs-max-retries 20 --gcs-project-for-requester-pays  --disable-tool-default-read-filters false --max-read-length 2147483647 --min-read-length 30 --minimum-mapping-quality 20 --disable-tool-default-annotations false --enable-all-annotations false",Version="4.1.2.0",Date="March 1, 2022 4:34:34 PM CET">
##INFO=<ID=CONTQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to contamination">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Approximate read depth; some reads may have been filtered">
##INFO=<ID=ECNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of events in this haplotype">
##INFO=<ID=GERMQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not germline variants">
##INFO=<ID=MBQ,Number=R,Type=Integer,Description="median base quality">
##INFO=<ID=MFRL,Number=R,Type=Integer,Description="median fragment length">
##INFO=<ID=MMQ,Number=R,Type=Integer,Description="median mapping quality">
##INFO=<ID=MPOS,Number=A,Type=Integer,Description="median distance from end of read">
##INFO=<ID=NALOD,Number=A,Type=Float,Description="Negative log 10 odds of artifact in normal with same allele fraction as tumor">
##INFO=<ID=NCount,Number=1,Type=Integer,Description="Count of N bases in the pileup">
##INFO=<ID=NLOD,Number=A,Type=Float,Description="Normal log 10 likelihood ratio of diploid het or hom alt genotypes">
##INFO=<ID=OCM,Number=1,Type=Integer,Description="Number of alt reads whose original alignment doesn't match the current contig.">
##INFO=<ID=PON,Number=0,Type=Flag,Description="site found in panel of normals">
##INFO=<ID=POPAF,Number=A,Type=Float,Description="negative log 10 population allele frequencies of alt alleles">
##INFO=<ID=ROQ,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled qualities that alt allele are not due to read orientation artifact">
##INFO=<ID=RPA,Number=.,Type=Integer,Description="Number of times tandem repeat unit is repeated, for each allele (including reference)">
##INFO=<ID=RU,Number=1,Type=String,Description="Tandem repeat unit (bases)">
##INFO=<ID=SEQQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles are not sequencing errors">
##INFO=<ID=STR,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is a short tandem repeat">
##INFO=<ID=STRANDQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality of strand bias artifact">
##INFO=<ID=STRQ,Number=1,Type=Integer,Description="Phred-scaled quality that alt alleles in STRs are not polymerase slippage errors">
##INFO=<ID=TLOD,Number=A,Type=Float,Description="Log 10 likelihood ratio score of variant existing versus not existing">
##INFO=<ID=UNIQ_ALT_READ_COUNT,Number=1,Type=Integer,Description="Number of ALT reads with unique start and mate end positions at a variant site">
##MutectVersion=2.2
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##filtering_status=Warning: unfiltered Mutect 2 calls.  Please run FilterMutectCalls to remove false positives.
##source=Mutect2
##tumor_sample=CAN2_R
#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	CAN2_R
chr1	69461	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=123,118;MMQ=25,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:11,0:13,5:10,14,0,5
chr1	566130	.	C	T	.	.	DP=337;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=1007.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,325:0.994:326:0,157:1,164:1,0,238,87
chr1	566206	.	A	G	.	.	DP=647;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=169,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:599,25:0.040:624:297,15:292,9:327,272,15,10
chr1	566371	.	A	G	.	.	DP=239;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=963.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,231:0.996:231:0,118:0,106:0,0,26,205
chr1	866319	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	866511	.	C	CCCCT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=374,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=CCCT;STR;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr1	871334	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=199,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,2:1,0:0,1,0,3
chr1	876499	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,7,4
chr1	877715	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	878314	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr1	880238	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	883625	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,12,6
chr1	883666	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=149,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:3,5,2,0
chr1	883770	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:883770_T_C:883770:1,1,0,1
chr1	883772	.	C	CTCCTATTCCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:883770_T_C:883770:1,1,0,1
chr1	887560	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,2,12
chr1	889158	.	GA	CC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	892745	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,0,6
chr1	898323	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	900285	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:900285_CA_TG:900285:0,0,2,0
chr1	900299	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=10,12;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.637:3:0,0:0,0:0|1:900285_CA_TG:900285:1,0,2,0
chr1	906229	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,0:0,6:1,5,0,6
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chr1	906688	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.460:11:1,1:4,4:0|1:906683_A_AGC:906683:1,5,5,0
chr1	906694	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=123,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,0:6,4:0|1:906683_A_AGC:906683:3,6,4,0
chr1	906698	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=122,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.311:14:2,0:7,4:0|1:906683_A_AGC:906683:4,6,4,0
chr1	911496	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr1	914192	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	916590	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,5:3,3:4,7,3,5
chr1	948846	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,2:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,6,1
chr1	948870	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:948846_T_TA:948846:0,0,9,3
chr1	949925	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=210,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	955597	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=130,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	970549	.	TGG	T,TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,24,28;MFRL=0,164,168;MMQ=60,60,60;MPOS=31,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=G;STR;TLOD=5.82,5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.477,0.394:5:0,2,2:0,1,0:0,0,5,0
chr1	970568	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:0,0:3,1,2,0
chr1	970584	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:1,0:4,2,2,0
chr1	977330	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	977570	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	978603	.	CCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=178,102;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,5:1,2:3,3,3,4
chr1	980460	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	981087	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr1	982941	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,18:0,6:0,0,8,17
chr1	985266	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=109,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:3,1,5,0
chr1	985337	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=141,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:2,9,1,2
chr1	985443	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=G;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.785:2:0,1:0,0:0|1:985443_AG_A:985443:0,0,2,0
chr1	985450	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.775:2:0,1:0,0:0|1:985443_AG_A:985443:0,0,2,0
chr1	986443	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,12:0,5:0,0,3,14
chr1	986459	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=181,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:5,3:1,1:1,5,0,5
chr1	988932	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	990380	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=206,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.451:11:6,2:0,1:3,3,3,2
chr1	990417	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,26;MFRL=201,194;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.708:4:0,2:0,1:1,0,1,2
chr1	1021415	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	1118212	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=195,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:0,2:3,1:3,0,3,1
chr1	1159380	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:1159380_A_T:1159380:0,1,0,1
chr1	1159382	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,31;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1159380_A_T:1159380:0,1,0,1
chr1	1159385	.	G	GTTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=179,117;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1159380_A_T:1159380:0,1,0,1
chr1	1168672	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	1168984	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,3:7,0:10,4,2,1
chr1	1192291	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1225612	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=189,92;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,2:2,1:3,1,2,2
chr1	1229573	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=128,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:14,3:7,0:8,13,1,2
chr1	1229680	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr1	1231968	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=158,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr1	1243928	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1243934	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1243946	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1243948	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1243950	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1243928_G_GT:1243928:0,0,1,0
chr1	1247589	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	1248121	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=247,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:4,4:1,5:1,4,2,8
chr1	1254136	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	1268781	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=8,12;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.585:5:0,0:0,0:0|1:1268781_C_G:1268781:0,2,0,3
chr1	1268787	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=16,12;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.585:5:0,0:0,1:0|1:1268781_C_G:1268781:0,2,0,3
chr1	1268847	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	1273259	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:1273259_A_C:1273259:2,0,1,0
chr1	1273264	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:1273259_A_C:1273259:3,0,1,0
chr1	1273273	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,17;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:1273259_A_C:1273259:3,0,1,0
chr1	1273278	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0|1:1273259_A_C:1273259:0,0,5,0
chr1	1276973	.	G	GACAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=38.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,2:0,0,9,0
chr1	1278237	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	1284490	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	1288583	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=12,27;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.823:7:0,4:0,2:1,0,6,0
chr1	1288823	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr1	1289367	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.907:8:0,0:0,8:0,0,4,4
chr1	1289911	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr1	1292127	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:5,1:0,9,3,0
chr1	1293764	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	1293779	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=222,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr1	1293802	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=59,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.770:5:0,1:0,1:1,1,3,0
chr1	1309836	.	C	CAGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=319,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1309836_C_CAGAT:1309836:1,0,0,1
chr1	1309838	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=319,198;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:1309836_C_CAGAT:1309836:1,0,0,1
chr1	1323078	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,4,6
chr1	1323143	.	CCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr1	1326141	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=120,103;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=28.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.315:33:12,10:10,0:15,8,10,0
chr1	1354589	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:3,2,1,4
chr1	1375819	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:1375819_A_C:1375819:1,3,2,0
chr1	1375823	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0|1:1375819_A_C:1375819:2,3,2,0
chr1	1375827	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:1,0:0|1:1375819_A_C:1375819:2,4,2,0
chr1	1387667	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr1	1389739	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=180,195;MMQ=27,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:3,2,2,0
chr1	1389820	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=217,156;MMQ=40,26;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,1:3,1:5,0,0,2
chr1	1389902	.	TC	GG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=238,195;MMQ=60,25;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:1389902_TC_GG:1389902:1,3,0,2
chr1	1389906	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=238,195;MMQ=60,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0|1:1389902_TC_GG:1389902:1,3,0,2
chr1	1390766	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:5,2,0,4
chr1	1413945	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,87;MMQ=57,29;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:10,2,2,0
chr1	1420637	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,204;MMQ=46,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	1421822	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr1	1458073	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=92,149;MMQ=38,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr1	1469501	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:1,4,2,4
chr1	1469546	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	1475804	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=225,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	1560100	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.703:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	1563789	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	1564131	.	G	GGTTCATCCGTATTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.326:7:3,2:2,0:0,5,1,1
chr1	1564194	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=213,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	1564952	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=188,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr1	1565586	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565591	.	CAG	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565596	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565598	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565606	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565608	.	AG	CC	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,12;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565611	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,27;MFRL=0,289;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:1565586_G_C:1565586:0,0,1,0
chr1	1565681	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:1565681_A_T:1565681:0,0,2,0
chr1	1565689	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:1565681_A_T:1565681:0,0,2,0
chr1	1565691	.	C	CGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,21;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:1565681_A_T:1565681:0,0,2,0
chr1	1571640	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,199;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	1571760	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=146,169;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:3,8,1,1
chr1	1571812	.	GGCC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=179,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:8,2:5,0:0|1:1571812_GGCC_G:1571812:7,6,1,1
chr1	1571818	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=164,36;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:0|1:1571812_GGCC_G:1571812:7,5,1,1
chr1	1572939	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=142,210;MMQ=59,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,2:2,1:0,6,0,3
chr1	1575616	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	1575836	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=180,178;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	1599888	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=80,216;MMQ=52,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,5:2,3:4,5,7,1
chr1	1599974	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,151;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:2,3,0,2
chr1	1599981	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,173;MMQ=27,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,2,3
chr1	1601015	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	1601052	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=197,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:0,1,11,3
chr1	1635619	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.608:16:6,5:0,4:5,1,3,7
chr1	1636274	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=202,163;MMQ=40,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:1,1,4,0
chr1	1637012	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=133,107;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	1639801	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=212,191;MMQ=57,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr1	1647722	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=36,28;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,0:0|1:1647722_G_T:1647722:2,0,3,0
chr1	1647725	.	GT	AG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=36,31;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:1647722_G_T:1647722:2,0,3,0
chr1	1647729	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=35,28;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0|1:1647722_G_T:1647722:2,0,3,0
chr1	1647745	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:5,0,5,0
chr1	1647753	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=35,27;MFRL=150,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:5,6:2,1:6,1,7,0
chr1	1647778	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=91,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,6:3,3:5,3,9,0
chr1	1647814	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=102,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:10,8:10,6:10,10,9,5
chr1	1647893	.	C	CTTTCTT	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=178,137;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTCTT;STR;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:16,3:7,5:9,14,1,8
chr1	1647928	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=7;MBQ=26,35;MFRL=131,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,5:7,2:5,9,3,4
chr1	1647968	.	C	CAT	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=27,36;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:5,1:3,3:0|1:1647968_C_CAT:1647968:0,9,0,4
chr1	1647971	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=158,180;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:0|1:1647968_C_CAT:1647968:0,9,0,3
chr1	1647983	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=30,29;MFRL=190,180;MMQ=55,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:6,1:3,2:0|1:1647983_T_A:1647983:0,10,0,3
chr1	1647990	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=208,180;MMQ=45,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:0|1:1647983_T_A:1647983:0,10,0,3
chr1	1648002	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=212,210;MMQ=40,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr1	1650920	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,0:6,4:4,11,1,3
chr1	1650938	.	CGG	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.648:15:3,4:1,4:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,5,0,10
chr1	1650942	.	A	AAG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,25;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:3,5:1,3:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,5,0,9
chr1	1650960	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=172,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,4,0,7
chr1	1650967	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=205,191;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:1,6:1,1:0|1:1650938_CGG_C:1650938:0,3,0,9
chr1	1653004	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,3:0,5:0,0,4,5
chr1	1653028	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,6,8
chr1	1653885	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	1654007	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,33;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0|1:1654007_A_T:1654007:0,0,0,2
chr1	1654011	.	TAC	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:1654007_A_T:1654007:0,0,0,2
chr1	1654017	.	T	TTTGTTAA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,33;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1654007_A_T:1654007:0,0,0,1
chr1	1654038	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,40;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1654058	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,1,1
chr1	1654064	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,1,1
chr1	1654065	.	AGCG	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:1654058_C_T:1654058:0,0,1,1
chr1	1663831	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,2:4,3:4,1,3,2
chr1	1663851	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:0|1:1663851_G_C:1663851:5,2,4,1
chr1	1663861	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:0|1:1663851_G_C:1663851:6,2,4,1
chr1	1664019	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	1669734	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=211,228;MMQ=51,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:4,2,2,0
chr1	1669748	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=216,198;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,3,2
chr1	1670570	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=198,190;MMQ=30,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:3,8,0,2
chr1	1684347	.	C	CCCT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=CCT;STR;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:0,1:3,3:3,0,4,2
chr1	1685921	.	TCCCTGGGACCGAAGTCGCCCCA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=220,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.574:14:4,2:2,6:2,4,3,5
chr1	1686943	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:1686943_T_C:1686943:0,0,0,2
chr1	1686962	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:1686943_T_C:1686943:0,0,0,4
chr1	1687625	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=102,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:4,1,4,0
chr1	1687830	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,1,1
chr1	1688469	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	1688513	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=188,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:6,3:0,1:3,3,2,2
chr1	1689762	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=108,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,6:6,2:4,5,5,3
chr1	1696659	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,12,0
chr1	1737890	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=115,88;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,1:8,1:6,6,2,0
chr1	1847856	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,3,2
chr1	1848109	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:1,1,2,2
chr1	1848734	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	1849923	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:6,2:9,1:9,6,0,3
chr1	1855450	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	1858309	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:2,4,4,3
chr1	1887091	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=150,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,2:2,1,1,2
chr1	1887111	.	GC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=252,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,1,2
chr1	1895326	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:7,0:0|1:1895326_C_T:1895326:3,6,1,1
chr1	1895327	.	A	AGGATT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,2:7,0:0|1:1895326_C_T:1895326:3,6,1,1
chr1	1895330	.	T	TGGATCA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=159,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:2,2:6,0:0|1:1895326_C_T:1895326:3,6,1,1
chr1	1897753	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,1:3,5:3,1,4,2
chr1	1900106	.	T	TCTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=167,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,2:4,2:6,7,0,4
chr1	1900332	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=241,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:1900332_A_G:1900332:0,2,0,3
chr1	1900339	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=241,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,1:0|1:1900332_A_G:1900332:0,2,0,3
chr1	1916890	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=223,84;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,5:2,2:1,2,3,4
chr1	1920434	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	1922303	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:1,2,8,2
chr1	1956362	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,11,3
chr1	1957219	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	1959121	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,6:1,3:3,4,4,5
chr1	1959186	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=173,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:0,2,0,5
chr1	1960926	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	1961470	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:3,4,1,1
chr1	1987993	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=129,322;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,1:7,2:7,5,2,1
chr1	1991014	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=136,143;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:6,3,1,1
chr1	2005818	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=68,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2005818_G_A:2005818:1,0,0,1
chr1	2005826	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=68,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:2005818_G_A:2005818:1,0,0,1
chr1	2075560	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=149,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:2075560_T_G:2075560:3,0,2,0
chr1	2075570	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=168,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0|1:2075560_T_G:2075560:5,0,2,0
chr1	2077409	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=204,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr1	2082458	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=17,32;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.640:6:1,1:0,2:0,2,0,4
chr1	2082489	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=203,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr1	2118539	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr1	2118724	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,21;MFRL=181,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	2121118	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,2:0,0,6,8
chr1	2234903	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=319,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	2235662	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.703:15:4,4:0,6:0|1:2235662_G_A:2235662:2,2,7,4
chr1	2235672	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:0|1:2235662_G_A:2235662:2,3,5,4
chr1	2235751	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=204,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:26,3:11,0:12,25,0,3
chr1	2252759	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=198,248;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	2286879	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:2286879_G_T:2286879:6,3,1,1
chr1	2286881	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:2286879_G_T:2286879:6,3,1,1
chr1	2286947	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr1	2316315	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	2316583	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,1,1
chr1	2319720	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=168,80;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:10,3:6,0:7,9,2,1
chr1	2328714	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,9:0,6:0,0,4,11
chr1	2332391	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=109,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,2:2,5:4,5,4,3
chr1	2338126	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:3,3:3,2:3,3,4,2
chr1	2419085	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=121,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:9,1:7,7,2,0
chr1	2420590	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=215,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	2420806	.	ATCCTCGT	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2420806_ATCCTCGT_A:2420806:1,0,0,1
chr1	2420815	.	AAGG	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=233,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:2420806_ATCCTCGT_A:2420806:1,0,0,1
chr1	2421263	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=176,95;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:9,2:6,0:10,5,3,0
chr1	2422614	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	2428874	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	2430617	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=219,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:0,6:2,9:1,1,5,10
chr1	2430992	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	2460944	.	C	CGCG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCG;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.498:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	2461381	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:2461381_G_C:2461381:3,5,1,1
chr1	2461383	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:2461381_G_C:2461381:3,5,1,1
chr1	2461384	.	G	GTCCCTCACCC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=155,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:2461381_G_C:2461381:3,5,1,1
chr1	2489176	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=114,68;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:9,0:10,12:10,9,2,10
chr1	2492180	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:0|1:2492180_T_TC:2492180:8,7,1,1
chr1	2492183	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:0|1:2492180_T_TC:2492180:8,7,1,1
chr1	2519242	.	GCGGGAACCCTTGGGTAGCGTGGGGT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,1:3,1:4,2,0,2
chr1	2520302	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,0:1,3:5,1,3,0
chr1	2523125	.	G	GAGGCATAATCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,268;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr1	2535496	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	2537072	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=202,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:3,4,1,3
chr1	2537095	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=127,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr1	2938407	.	CAGA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,0:1,2:2,2,2,0
chr1	2938547	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chr1	3319339	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=247,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:1,1,3,3
chr1	3347706	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,26;MFRL=266,243;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:3347706_G_A:3347706:0,1,0,2
chr1	3347709	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=265,221;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3347706_G_A:3347706:0,2,0,1
chr1	3347717	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=265,221;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:3347706_G_A:3347706:0,2,0,1
chr1	3383665	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	3385330	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	3394640	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr1	3394674	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr1	3395229	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	3397188	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	3413426	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=223,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	3417960	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	3425345	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=220,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	3426384	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=318,132;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr1	3427387	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=186,150;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:6,1,1,1
chr1	3428737	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:1,5,0,2
chr1	3440647	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	3440824	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:1,6,3,5
chr1	3496328	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr1	3496433	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=215,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:2,5,1,1
chr1	3518944	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=181,260;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	3519179	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=224,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,2:2,1:1,3,1,2
chr1	3541970	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.299:11:1,2:3,0:5,3,3,0
chr1	3542106	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:3,2:2,1:0,8,1,2
chr1	3545175	.	GTTCTGGGAGCTCCTCCCCC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=195,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCTGGGAGCTCCTCCCCC;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.735:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	3549862	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	3553743	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.314:4:2,1:1,0:0|1:3553743_G_GA:3553743:0,3,0,1
chr1	3553745	.	A	AAGATCCAGCAATAGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:3553743_G_GA:3553743:0,3,0,1
chr1	3563428	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=220,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.231:14:3,1:8,1:0,11,0,3
chr1	3566625	.	AGCAGGCTG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=169,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.501:8:2,3:2,1:0|1:3566625_AGCAGGCTG_A:3566625:0,4,0,4
chr1	3566631	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,4:0.857:4:0,2:0,2:1|0:3566625_AGCAGGCTG_A:3566625:0,0,0,4
chr1	3638832	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=288,111;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,3,0,1
chr1	3638834	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=246,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.408:3:1,1:1,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,2,0,1
chr1	3638836	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=288,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,3,0,1
chr1	3638838	.	G	GCGTCCCTTT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=288,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,3,0,1
chr1	3638840	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,29;MFRL=288,111;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:3638832_G_T:3638832:0,3,0,1
chr1	3640134	.	TCTGC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	3644349	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr1	3644374	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	3645835	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,3:0,3:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,7,1
chr1	3645844	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0|1:3645835_C_A:3645835:0,0,7,1
chr1	3647962	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	3659657	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=131,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr1	3662646	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,99;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:6,0:10,5:10,6,0,5
chr1	3662845	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=293,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	3672156	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=173,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr1	3673481	.	GG	CC	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=188,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:3,0:0|1:3673481_GG_CC:3673481:0,12,2,0
chr1	3673489	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:0|1:3673481_GG_CC:3673481:0,12,2,0
chr1	3673494	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=165,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,0:0|1:3673481_GG_CC:3673481:0,11,2,0
chr1	3673496	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,3:5,0:0,8,0,3
chr1	3679139	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,0:3,4:0|1:3679139_T_C:3679139:3,3,3,1
chr1	3679146	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=163,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,0:4,4:0|1:3679139_T_C:3679139:3,3,3,1
chr1	3684107	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=242,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	3697700	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:3,4,2,2
chr1	3703698	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=192,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:2,5,0,2
chr1	3732044	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,3,0
chr1	3732103	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,2,4
chr1	3732172	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	3732782	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:2,1,3,3
chr1	3742824	.	TTA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=159,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr1	3743109	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:2,1,2,2
chr1	3743391	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:5,5,0,2
chr1	3743433	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	3745787	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=177,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,5:2,5:2,0,10,0
chr1	3746254	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=162,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr1	3746432	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=117,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,2:7,2:12,6,1,3
chr1	3746583	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=133,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,3:4,2:0|1:3746583_G_T:3746583:0,7,1,4
chr1	3746589	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=109,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:1,4:3,3:0|1:3746583_G_T:3746583:0,6,1,6
chr1	3747580	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:3,2,5,1
chr1	3747603	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.720:16:3,2:1,9:1,3,10,2
chr1	3751459	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,2:7,2:9,1,4,0
chr1	3753013	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	3755675	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=115,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.668:19:3,6:2,7:4,2,8,5
chr1	3759784	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:5,2,3,4
chr1	3759788	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:0|1:3759788_C_T:3759788:7,5,1,1
chr1	3759794	.	CAA	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=161,48;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:7,2:0|1:3759788_C_T:3759788:8,5,1,1
chr1	3759797	.	A	ATCTGT	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:3759788_C_T:3759788:9,5,1,1
chr1	3759802	.	TG	GA	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=178,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,2:0|1:3759788_C_T:3759788:10,5,1,1
chr1	3761650	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=220,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,1,4
chr1	3762015	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,26;MFRL=213,226;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:3762015_G_A:3762015:0,1,0,1
chr1	3762018	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=215,226;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3762015_G_A:3762015:0,2,0,1
chr1	3762020	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=215,226;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3762015_G_A:3762015:0,2,0,1
chr1	3762029	.	GGTGT	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=215,226;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3762029_GGTGT_G:3762029:0,2,0,1
chr1	3762034	.	G	GCACA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=215,226;MMQ=60,48;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:3762029_GGTGT_G:3762029:0,2,0,1
chr1	3765095	.	C	CAAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,22;RU=A;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.690:1:0,0:0,1:0|1:3765095_C_CAAAAAA:3765095:0,0,1,0
chr1	3765113	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=181,164;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:3765095_C_CAAAAAA:3765095:1,2,1,0
chr1	3769033	.	AA	TT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	3774130	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=185,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:0|1:3774130_A_G:3774130:11,5,2,0
chr1	3774138	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:8,1:0|1:3774130_A_G:3774130:12,7,2,0
chr1	3774296	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=202,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:0,8,0,3
chr1	3775454	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	3788968	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	3789195	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr1	3806643	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=125,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,4:4,1:2,7,2,3
chr1	3807122	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr1	3816683	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:1,0:1,2:1,2,0,2
chr1	4715420	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=106,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	4772717	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,6:5,1:0,6,4,3
chr1	4829835	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=58,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr1	4834420	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,5:2,3:6,1,7,1
chr1	4834606	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=175,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:2,1,0,3
chr1	5925371	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	5934490	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=210,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:0|1:5934490_A_G:5934490:4,0,5,0
chr1	5934500	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:0|1:5934490_A_G:5934490:3,0,7,0
chr1	5934837	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:3,2,3,4
chr1	5935162	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	5937091	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,5,1
chr1	5937391	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:0,3,4,5
chr1	5937413	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=245,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:0,3,2,4
chr1	5947485	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=193,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:6,1:6,2:5,7,1,2
chr1	5969139	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:1,6:4,1:2,3,4,3
chr1	6029086	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=147,156;MMQ=48,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.750:8:1,3:1,2:2,0,4,2
chr1	6046432	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	6101896	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:4,2:10,1,0,2
chr1	6145365	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:1,3,0,8
chr1	6155332	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr1	6157434	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr1	6160063	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=152,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:4,1:2,0:0,6,3,0
chr1	6166767	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:10,5,2,0
chr1	6170424	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=286,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:1,0,1,2
chr1	6171992	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:4,2:2,1:3,3,1,3
chr1	6183959	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=157,154;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,0:5,0,4,0
chr1	6184221	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:6184221_C_G:6184221:0,3,0,1
chr1	6184233	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:6184221_C_G:6184221:0,3,0,1
chr1	6185064	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=136,314;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	6185532	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr1	6188546	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=198,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:6,2:2,2:5,3,3,1
chr1	6195493	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr1	6195548	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	6196493	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	6196517	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,3,2
chr1	6196943	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=117,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:6196943_A_G:6196943:0,1,0,1
chr1	6196951	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6196943_A_G:6196943:0,0,0,1
chr1	6202245	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:6,2,1,1
chr1	6203853	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=204,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:0,1,3,0
chr1	6203857	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=204,251;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:0,1,2,0
chr1	6203858	.	CTG	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,19;MFRL=204,251;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:0,1,2,0
chr1	6203862	.	T	TGGG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,18;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,1:0|1:6203853_A_C:6203853:1,1,2,0
chr1	6203868	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,1:0|1:6203853_A_C:6203853:1,1,2,0
chr1	6204266	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=213,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr1	6211257	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	6272293	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:6,2,2,0
chr1	6311373	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,3:6,0:5,4,2,1
chr1	6341370	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,12;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.634:9:1,0:0,0:1,2,0,6
chr1	6399412	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=213,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	6453520	.	C	CG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6473292	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,2:7,0:0|1:6473292_G_A:6473292:4,12,0,2
chr1	6473295	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=158,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:0|1:6473292_G_A:6473292:4,12,0,2
chr1	6524501	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=158,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:9,2:3,0:7,5,2,0
chr1	6528468	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:5,5,1,1
chr1	6529748	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=164,262;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:7,3,1,2
chr1	6530435	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,0:3,4:4,5,2,2
chr1	6530965	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr1	6531650	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=185,292;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,1,3
chr1	6535048	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,297;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,1:7,1:8,2,2,0
chr1	6556643	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:15,3:10,0:10,15,3,0
chr1	6579607	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	6586070	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,6,7
chr1	6593532	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chr1	6609559	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	6609563	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr1	6609851	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	6610382	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,0:3,0,2,0
chr1	6610773	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,138;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	6614391	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,1,5
chr1	6614415	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6614391_A_C:6614391:0,0,1,0
chr1	6614653	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	6615690	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,1
chr1	6615695	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6615690_A_G:6615690:0,0,0,1
chr1	6631319	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	6631352	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=168,110;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:1,1:0,2,0,2
chr1	6635132	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:6,4,0,2
chr1	6642140	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=125,122;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,5:6,0:6,7,5,0
chr1	6674197	.	GA	CC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.489:8:2,0:2,0:0|1:6674197_GA_CC:6674197:0,4,4,0
chr1	6674201	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.489:8:2,1:2,1:0|1:6674197_GA_CC:6674197:0,4,4,0
chr1	6679848	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,0:4,6:4,2,5,1
chr1	6681744	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr1	6685442	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	6688774	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:0,0:7,2:1,6,0,2
chr1	6694045	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=125,70;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:7,0:1,2:4,4,2,0
chr1	6694207	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,5:0,1:0,3,0,6
chr1	6695802	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=91.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,16,12
chr1	6700131	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.835:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr1	7151479	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=262,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,2,2
chr1	7527996	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=258,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,8:1,5:0,1,1,12
chr1	7700674	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,0:0,3:1,2,0,4
chr1	7737799	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=237,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,1,2
chr1	7792520	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:5,1:5,4,4,1
chr1	7797096	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=80,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:4,7,0,2
chr1	7798113	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,4:3,0:4,4,4,0
chr1	7805072	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=107,119;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:7,2:4,0:6,5,1,1
chr1	7826653	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=184,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:7826653_G_A:7826653:0,4,0,2
chr1	7826666	.	CGT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:7826653_G_A:7826653:0,5,0,2
chr1	7837432	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,17;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,0:0,1,0,2
chr1	7861153	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:3,1,3,1
chr1	7861345	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=201,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	7869915	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,6:6,4:9,3,8,2
chr1	7870144	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:2,4:1,3,1,8
chr1	7907961	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=223,49;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:0|1:7907961_A_G:7907961:3,4,1,1
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chr1	7907980	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=222,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:0|1:7907961_A_G:7907961:2,4,1,1
chr1	7907983	.	GA	CC	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=230,49;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,0:0,2:0|1:7907961_A_G:7907961:2,5,1,1
chr1	7913398	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:9,8:10,0:12,7,9,0
chr1	7913430	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=82,90;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.372:22:7,8:7,0:10,4,3,5
chr1	7998963	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr1	8022753	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=180,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:8022753_T_G:8022753:3,0,4,0
chr1	8022772	.	CAG	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0|1:8022753_T_G:8022753:2,0,5,0
chr1	8029446	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=126,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:2,2:10,2:6,6,1,3
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chr1	8029510	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=18,29;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:0,2:0,2:0,1,1,3
chr1	8384268	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	8385485	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=138,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:2,2:1,5,0,3
chr1	8390246	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr1	8390495	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=251,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:1,1,2,3
chr1	8399674	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,3:7,1:7,4,1,3
chr1	8404093	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr1	8404169	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	8415290	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=168,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,1,1
chr1	8422676	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr1	8526142	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=131,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,3:1,4:1,3,0,7
chr1	8716268	.	C	CTTATCTTT	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=35,20;MFRL=152,162;MMQ=53,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.231:15:6,2:5,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,4,0,3
chr1	8716271	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=152,162;MMQ=53,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,4,0,3
chr1	8716276	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=159,162;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,2:6,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,6,0,3
chr1	8716278	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=159,162;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,2:6,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,6,0,3
chr1	8716280	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=159,162;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:8,2:6,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:8,6,0,3
chr1	8716285	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=160,162;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:7,1:6,1:0|1:8716268_C_CTTATCTTT:8716268:7,6,0,3
chr1	8923088	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=165,168;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:1,7,0,3
chr1	8926285	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr1	8935033	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=177,233;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,0:7,6:0,11,0,6
chr1	9006127	.	T	TTTCCTGGTCTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=106,181;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	9017204	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=209,137;MMQ=60,31;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:5,2:0,14:3,2,12,4
chr1	9019104	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,0:6,3:2,14,0,3
chr1	9027843	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:9027843_C_T:9027843:9,6,1,1
chr1	9027846	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=118,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:9027843_C_T:9027843:8,6,1,1
chr1	9027876	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=120,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:4,6,0,2
chr1	9034598	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	9034814	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	9034815	.	C	CAGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=217,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	9064743	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr1	9067432	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=166,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr1	9070152	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=54,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:9070152_C_G:9070152:2,0,1,0
chr1	9070155	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=23,12;MFRL=108,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:9070152_C_G:9070152:2,1,1,0
chr1	9070165	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,15;MFRL=108,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:9070152_C_G:9070152:3,1,1,0
chr1	9074932	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr1	9075160	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:6,2,0,2
chr1	9075369	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	9078412	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:5,4,0,2
chr1	9085006	.	G	GGCCCACCTTGT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCCCACCTTGT;STR;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.521:13:4,5:2,0:4,2,2,5
chr1	9099987	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:9099987_C_T:9099987:8,3,1,1
chr1	9099999	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0|1:9099987_C_T:9099987:8,1,1,1
chr1	9100017	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:4,0:0|1:9099987_C_T:9099987:6,4,1,1
chr1	9100024	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=176,66;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:5,2:4,0:0|1:9099987_C_T:9099987:5,4,1,1
chr1	9107849	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,1,4
chr1	9171238	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=8,23;MFRL=257,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	9305163	.	GTC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=136,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:10,6,0,2
chr1	9307230	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.203:13:4,0:5,2:0,11,0,2
chr1	9415984	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=105,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.137:24:9,2:12,0:11,10,0,3
chr1	9416722	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=221,728;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,5:1,0:0,2,0,5
chr1	9599823	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr1	9633387	.	GT	G,GTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35,32;MFRL=0,152,176;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=T;STR;TLOD=5.10,3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.513,0.331:3:0,1,0:0,1,1:0,0,2,1
chr1	9642329	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=163,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:4,3:5,2:7,2,4,1
chr1	9642424	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,246;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,5:2,5:1,4,2,8
chr1	9657006	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:2,10,0,2
chr1	9658465	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr1	9658707	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	9667593	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=88,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr1	9714348	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:12,0:9,2:0|1:9714348_C_T:9714348:11,10,1,1
chr1	9714359	.	G	GCCTCCTGGGTAGC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:12,0:8,2:0|1:9714348_C_T:9714348:11,10,1,1
chr1	9781412	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=216,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:1,0,2,6
chr1	9782556	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:4,3,0,2
chr1	9815404	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=230,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,0:5,6:0,10,0,6
chr1	9815457	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,36;MFRL=282,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	9816620	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=299,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.865:13:0,3:1,7:0,1,3,9
chr1	9993029	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9993029_G_C:9993029:0,3,0,1
chr1	9993035	.	C	CTACAAGA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9993029_G_C:9993029:0,3,0,1
chr1	9993037	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9993029_G_C:9993029:0,3,0,1
chr1	9993039	.	G	GCTC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=272,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:9993029_G_C:9993029:0,3,0,1
chr1	10041311	.	T	TGCTCCTCTG	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=150,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:5,1:0,0:1,4,0,1
chr1	10041324	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:10041324_G_C:10041324:1,2,0,1
chr1	10041325	.	C	CTA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,35;MFRL=75,191;MMQ=50,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:10041324_G_C:10041324:1,1,0,1
chr1	10041327	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,33;MFRL=75,191;MMQ=50,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:10041324_G_C:10041324:1,1,0,1
chr1	10041330	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=22,27;MFRL=150,191;MMQ=40,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:0,1:0|1:10041324_G_C:10041324:1,2,0,1
chr1	10041344	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=176,150;MMQ=40,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:10041344_G_A:10041344:0,3,0,1
chr1	10041348	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=26,32;MFRL=176,150;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:10041344_G_A:10041344:0,3,0,1
chr1	10042711	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=137,109;MMQ=60,26;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:2,1,0,4
chr1	10068159	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=174,282;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:10068159_C_A:10068159:1,0,1,0
chr1	10068164	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,17;MFRL=174,282;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:10068159_C_A:10068159:1,0,1,0
chr1	10068168	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=174,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:10068159_C_A:10068159:1,0,1,0
chr1	10132300	.	CTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:4,4:3,6:1,7,5,5
chr1	10177680	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.440:16:1,3:7,4:1,8,2,5
chr1	10207145	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:7,3:10,9,1,2
chr1	10342629	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=259,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr1	10357206	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.748:8:1,2:1,3:2,0,4,2
chr1	10381747	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=174,262;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:5,1,4,0
chr1	10386506	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=207,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:1,3,0,2
chr1	10394562	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=156,125;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:10394562_T_C:10394562:4,4,2,0
chr1	10394565	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=156,125;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:10394562_T_C:10394562:4,4,2,0
chr1	10397080	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr1	10402027	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:1,1:0|1:10402027_C_A:10402027:2,0,2,0
chr1	10402034	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:10402027_C_A:10402027:4,0,1,0
chr1	10412636	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:1,3:4,0:5,1,3,0
chr1	10425063	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=222,254;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.350:4:1,0:1,1:3,0,1,0
chr1	10425163	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,214;MMQ=60,33;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,10:4,0:6,1,10,0
chr1	10431132	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=201,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr1	10478830	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=124,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,1:2,1:2,3,2,0
chr1	10479635	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:8,2:1,4:5,4,3,3
chr1	10502307	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29,29;MFRL=237,141,151;MMQ=60,60,60;MPOS=15,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=T;STR;TLOD=3.55,19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,8:0.214,0.644:11:0,1,3:1,1,5:1,0,9,1
chr1	10510136	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:10510136_T_C:10510136:5,3,0,2
chr1	10510138	.	G	GCCTGTGTAACTGTGATTCAATTGAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=124,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:10510136_T_C:10510136:5,3,0,2
chr1	10511634	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:6,0:12,4:4,15,0,4
chr1	10529194	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	10529326	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,3:10,1:9,7,4,0
chr1	10555257	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=65,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.887:24:0,10:2,11:1,1,17,5
chr1	10596388	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr1	10684486	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=177,122;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:5,13,1,2
chr1	10699014	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	10710721	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:4,1:9,4,2,0
chr1	10714436	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,5:1,5:2,1,5,5
chr1	10719905	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,12;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.826:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr1	11017022	.	C	CAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=75,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,3:2,2,4,2
chr1	11017609	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0|1:11017609_T_C:11017609:3,0,4,0
chr1	11017617	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=207,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0|1:11017609_T_C:11017609:3,0,4,0
chr1	11017634	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,3:3,2:9,1,4,1
chr1	11018723	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=249,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:1,1,1,1
chr1	11024353	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=74,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	11073933	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,2:9,3:9,12,3,2
chr1	11080723	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	11087109	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=151,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:9,9:10,0:11,8,9,0
chr1	11090916	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,9:0,12:0,0,14,7
chr1	11095039	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	11105106	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,0,8
chr1	11105122	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:11105106_C_T:11105106:0,0,0,7
chr1	11116030	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.305:11:4,1:1,0:0|1:11116030_A_C:11116030:3,5,3,0
chr1	11116035	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.284:12:6,1:2,0:0|1:11116030_A_C:11116030:3,6,3,0
chr1	11116040	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=140,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:6,0:4,1:0|1:11116030_A_C:11116030:4,6,3,0
chr1	11128001	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:4,1,8,2
chr1	11129848	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	11132217	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:2,1,3,8
chr1	11133951	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:5,6,0,2
chr1	11133956	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=39,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:7,2:3,2:4,6,0,4
chr1	11134157	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:0,3,3,2
chr1	11137778	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:1,3,1,5
chr1	11167524	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,129;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:8,0:13,8:13,8,0,8
chr1	11175617	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:0,5,0,4
chr1	11181288	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:6,5,2,0
chr1	11187082	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:6,4,3,0
chr1	11187111	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:6,3:8,0:7,7,3,1
chr1	11187893	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr1	11206829	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=126,110;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.209:22:8,0:9,4:9,9,0,4
chr1	11227514	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0|1:11227514_T_C:11227514:0,3,1,1
chr1	11227518	.	AT	TA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:11227514_T_C:11227514:0,3,0,1
chr1	11227523	.	A	ACCGGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:11227514_T_C:11227514:0,3,0,1
chr1	11227524	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=144,68;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:11227514_T_C:11227514:0,3,0,1
chr1	11254781	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,37;MFRL=224,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr1	11255156	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=175,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,0:7,4:0,11,0,4
chr1	11288633	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	11292666	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,263;MMQ=60,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	11297887	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=210,186;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,3:2,0:10,0,4,0
chr1	11307609	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	11317320	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	11575331	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=213,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr1	11575375	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=227,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,2:3,9:2,2,7,4
chr1	11579354	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,12;MFRL=137,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,0:1,0:1,1,3,0
chr1	11593793	.	T	TGCACACACGCAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	11596641	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:3,4,1,1
chr1	11708736	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr1	11709051	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=27,26;MFRL=261,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:0,1:2,1:0|1:11709051_A_AG:11709051:0,2,1,2
chr1	11709052	.	C	CCCAG	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=36,32;MFRL=261,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0|1:11709051_A_AG:11709051:0,2,2,2
chr1	11709114	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=22,20;MFRL=202,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:0,1:1,0:0|1:11709114_A_C:11709114:1,1,2,0
chr1	11709118	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=200,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:11709114_A_C:11709114:2,1,1,0
chr1	11709119	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,29;MFRL=200,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:11709114_A_C:11709114:2,1,1,0
chr1	11709122	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=200,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:11709114_A_C:11709114:2,1,1,0
chr1	11709126	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=202,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:11709114_A_C:11709114:3,1,1,0
chr1	11709130	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=24,29;MFRL=202,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:11709114_A_C:11709114:3,1,1,0
chr1	11735652	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=183,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:6,1,1,2
chr1	11735877	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=203,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:3,2,0,2
chr1	11737051	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:4,4:1,3,0,4
chr1	11740358	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:1,0,1,2
chr1	11772303	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	11772491	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:1,1,1,3
chr1	11772526	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	11779762	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=178,120;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,6:6,2:6,6,3,5
chr1	11796168	.	CGGGCG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCG;STR;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	11807426	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	11832311	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,7,6
chr1	11832376	.	AC	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:11832376_AC_GT:11832376:0,4,0,1
chr1	11832379	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=138,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:11832376_AC_GT:11832376:0,4,0,1
chr1	11836441	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	11838791	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=153,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:9,0:0,4:2,7,0,4
chr1	11838848	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,3,7
chr1	11842144	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	11844330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,5:0,2:0,0,4,4
chr1	11845169	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	11848879	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr1	11849447	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr1	11850644	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=232,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:5,4:2,0:0|1:11850644_C_A:11850644:7,0,2,2
chr1	11850648	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=206,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:5,4:3,0:0|1:11850644_C_A:11850644:8,0,2,2
chr1	11852435	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,0,2
chr1	11854244	.	C	CAAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=310,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11854244_C_CAAG:11854244:1,0,0,1
chr1	11854246	.	A	AGCTGCAACTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=310,235;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:11854244_C_CAAG:11854244:1,0,0,1
chr1	11854457	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,8:0,0,7,4
chr1	11854755	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.580:15:2,5:4,2:6,0,6,3
chr1	11876760	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=136,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:9,3:13,0:11,13,2,1
chr1	11906158	.	A	AAAAGAAAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,1,1
chr1	11917620	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.481:6:0,2:3,1:3,0,2,1
chr1	11980449	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:2,3,1,3
chr1	11982544	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,7:1,3:1,0,7,3
chr1	11983206	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=128,216;MMQ=60,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,0:5,4:4,5,4,0
chr1	12010462	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=155,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:5,0:1,2:0|1:12010462_C_T:12010462:1,5,2,0
chr1	12010469	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=177,137;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0|1:12010462_C_T:12010462:0,4,3,1
chr1	12015018	.	G	GGCCTCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=94,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr1	12024383	.	G	GTTTCTGTCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=133,70832080;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:12024383_G_GTTTCTGTCC:12024383:1,1,1,0
chr1	12024386	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=133,70832080;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12024383_G_GTTTCTGTCC:12024383:1,1,1,0
chr1	12024391	.	CA	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=133,70832080;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:12024383_G_GTTTCTGTCC:12024383:1,1,1,0
chr1	12024923	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr1	12026278	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:6,5,3,0
chr1	12027204	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr1	12033113	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:12033113_A_G:12033113:0,2,0,4
chr1	12033120	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0|1:12033113_A_G:12033113:0,2,0,4
chr1	12056440	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	12057452	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr1	12059024	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:3,6,0,2
chr1	12062205	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr1	12067044	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	12071680	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	12082208	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:5,5,1,1
chr1	12157288	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=132,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:10,0:1,4:3,8,3,1
chr1	12183245	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=225,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr1	12195694	.	A	ATCTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,20;MFRL=226,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:2,2:8,1,1,1
chr1	12248942	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=159,169;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:2,6,2,1
chr1	12248965	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:2,6,1,4
chr1	12249020	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=236,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr1	12249031	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	12251765	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=105,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:4,2,2,0
chr1	12251808	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=119,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,1:2,6:3,3,4,3
chr1	12251961	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:1,3,0,5
chr1	12252892	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:3,1,4,0
chr1	12252955	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,199;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:5,2,2,2
chr1	12254746	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=131,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,2:0,4,1,4
chr1	12318064	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:12318064_C_T:12318064:5,13,0,2
chr1	12318067	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:12318064_C_T:12318064:5,13,0,2
chr1	12318069	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:7,2:0|1:12318064_C_T:12318064:5,14,0,2
chr1	12318074	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,2:0|1:12318064_C_T:12318064:4,11,0,2
chr1	12318076	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,0:4,2:0|1:12318064_C_T:12318064:4,10,0,2
chr1	12359455	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,5:3,0:2,3,2,3
chr1	12368725	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:12368725_T_C:12368725:1,2,0,1
chr1	12368727	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:0|1:12368725_T_C:12368725:1,2,0,1
chr1	12390076	.	G	GAGTGAGGTAGACTC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	12402041	.	GG	AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr1	12409302	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:7,10,1,1
chr1	12464123	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	12567232	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	12628471	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=110,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,0:6,4:1,6,2,2
chr1	12632845	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=113,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:8,6,3,1
chr1	12639018	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	12639226	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	12704466	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=211,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	12704773	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=122,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:12704773_C_T:12704773:3,1,0,1
chr1	12704781	.	G	GGTCA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:12704773_C_T:12704773:2,1,0,1
chr1	12704783	.	T	TTTC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=117,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:12704773_C_T:12704773:1,1,0,1
chr1	12776218	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=271,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	12781028	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.709:1:0,0:0,1:0|1:12781028_G_T:12781028:0,0,1,0
chr1	12781038	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:12781028_G_T:12781028:0,0,1,0
chr1	12785093	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	12785295	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,272;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,3:5,1:8,3,1,3
chr1	12837547	.	TG	CA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=157,242;MMQ=60,24;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:12,2:6,1:5,14,2,1
chr1	12837564	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=178,242;MMQ=60,24;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:11,2:7,1:0|1:12837564_G_T:12837564:6,14,2,1
chr1	12837570	.	GA	AG	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=176,242;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:10,2:8,1:0|1:12837564_G_T:12837564:7,14,2,1
chr1	12837634	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=51,152;MMQ=25,44;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,3:7,1:16,2,3,1
chr1	12837652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=100,152;MMQ=60,44;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:2,3:6,1:5,3,3,1
chr1	12837664	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=144,54;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,1:7,1:3,5,1,1
chr1	12837728	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,222;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,2:3,2:1,10,0,4
chr1	12837764	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=242,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr1	12853977	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,209;MMQ=50,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	12854414	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,116;MMQ=50,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,2:9,3:6,7,2,3
chr1	12854713	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	12856153	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=139,174;MMQ=27,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:2,1,0,6
chr1	12885087	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=191,204;MMQ=30,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12885087_TG_CA:12885087:1,1,0,1
chr1	12885097	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=191,204;MMQ=30,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:12885087_TG_CA:12885087:1,1,0,1
chr1	12907169	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=176,186;MMQ=40,31;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	12907199	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=150,179;MMQ=40,31;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,5,0
chr1	12907212	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=150,156;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr1	12907316	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=27,33;MFRL=92,176;MMQ=54,35;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.280:9:5,1:1,1:2,5,0,2
chr1	12907438	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=25,29;MFRL=139,181;MMQ=52,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.289:12:2,2:6,1:0|1:12907438_A_G:12907438:5,4,2,1
chr1	12907446	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=138,181;MMQ=52,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,2:5,1:0|1:12907438_A_G:12907438:4,4,2,1
chr1	12907450	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=20,35;MFRL=113,181;MMQ=52,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:2,1:0|1:12907438_A_G:12907438:3,4,2,1
chr1	12907457	.	AT	GA	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=20,30;MFRL=113,181;MMQ=40,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0|1:12907438_A_G:12907438:2,4,2,1
chr1	12907465	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=20,36;MFRL=113,181;MMQ=40,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:12907438_A_G:12907438:2,5,2,1
chr1	12907469	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=20,35;MFRL=113,181;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0|1:12907438_A_G:12907438:2,5,2,1
chr1	12907483	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=138,183;MMQ=40,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:4,0:0|1:12907438_A_G:12907438:2,6,2,0
chr1	12907768	.	A	AACTGGCTAGC	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=29,23;MFRL=151,176;MMQ=52,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:11,5,0,2
chr1	12907777	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=135,222;MMQ=52,30;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,3:8,2:0|1:12907777_T_C:12907777:7,5,6,0
chr1	12907781	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=135,222;MMQ=52,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:4,2:8,3:0|1:12907777_T_C:12907777:7,5,6,0
chr1	12907798	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=122,191;MMQ=52,36;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:0|1:12907777_T_C:12907777:7,6,6,0
chr1	12907802	.	CC	TT	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=122,191;MMQ=52,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,3:7,3:0|1:12907777_T_C:12907777:7,7,6,0
chr1	12907837	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=31,26;MFRL=147,197;MMQ=52,36;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:5,2:9,4:9,6,6,0
chr1	12908236	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=128,169;MMQ=29,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:0|1:12908236_G_T:12908236:2,4,4,1
chr1	12908243	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=135,176;MMQ=41,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:1,1:6,2:0|1:12908236_G_T:12908236:2,6,2,1
chr1	12908333	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,235;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	12918784	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=205,192;MMQ=60,28;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:12918784_T_C:12918784:2,0,1,0
chr1	12918793	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=199,192;MMQ=60,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:12918784_T_C:12918784:4,0,1,0
chr1	12918814	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=168,192;MMQ=60,28;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr1	12918934	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=157,219;MMQ=49,32;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:7,6,2,0
chr1	12918945	.	CA	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=157,219;MMQ=49,32;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:5,6,2,0
chr1	12919237	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=201,211;MMQ=60,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:1,8,0,2
chr1	12919587	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=175,257;MMQ=43,32;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.219:12:4,1:3,0:0|1:12919587_T_C:12919587:3,7,0,2
chr1	12919589	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=160,257;MMQ=40,32;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.234:11:6,1:3,1:0|1:12919587_T_C:12919587:3,6,0,2
chr1	12919642	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=180,293;MMQ=50,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:8,5,0,3
chr1	12921716	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,298;MMQ=26,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,3:4,4:1,3,1,6
chr1	12943277	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,27;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,1,3
chr1	12953244	.	TG	AT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,356;MMQ=24,22;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,1,0
chr1	12954491	.	GAGGAATGGAGAGTCCAAGTC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=80,36;MMQ=50,46;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:1,0:2,4,1,1
chr1	13182899	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,33;MFRL=178,174;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,4,1
chr1	13182929	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=169,169;MMQ=34,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	13182942	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=167,169;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	13183012	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=147,197;MMQ=49,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:5,2:7,1:0|1:13183012_G_C:13183012:6,7,0,3
chr1	13183014	.	TG	CC	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=147,197;MMQ=49,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,2:5,1:0|1:13183012_G_C:13183012:6,7,0,3
chr1	13183053	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,21;MFRL=131,74;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,3:3,5,2,2
chr1	13183511	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,34;MFRL=104,203;MMQ=52,48;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.589:15:5,3:1,6:0|1:13183511_T_C:13183511:3,3,1,8
chr1	13183528	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=25,36;MFRL=109,177;MMQ=52,48;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:7,2:1,4:0|1:13183511_T_C:13183511:5,5,0,7
chr1	13183532	.	CC	TT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=115,194;MMQ=52,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:6,2:2,4:0|1:13183511_T_C:13183511:6,4,0,6
chr1	13183567	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=177,111;MMQ=52,48;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,2:9,1:10,5,1,2
chr1	13183966	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,127;MMQ=40,27;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:4,0:3,5:0|1:13183966_G_T:13183966:4,4,3,2
chr1	13183973	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=137,174;MMQ=36,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,3:0.267:13:3,2:7,1:1|0:13183966_G_T:13183966:4,6,3,0
chr1	13448084	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,248;MMQ=60,25;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	13448116	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,248;MMQ=60,25;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	13668983	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,243;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13668983_C_T:13668983:0,0,1,0
chr1	13668986	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,243;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13668983_C_T:13668983:0,0,1,0
chr1	13695974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,151;MMQ=60,24;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	13716732	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,25;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13716732_T_G:13716732:0,0,1,0
chr1	13716741	.	GC	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:13716732_T_G:13716732:0,0,1,0
chr1	13719052	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,81;MMQ=60,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	13743192	.	C	CCCAAGAAAAGAACAAAGGAACTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,171;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	13910346	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:11,4,1,1
chr1	13936822	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,6,4
chr1	13937089	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=247,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	14057460	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:6,0:14,4,2,0
chr1	14059395	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.384:37:18,8:5,6:13,10,4,10
chr1	14068753	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=218,165;MMQ=60,45;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	14099763	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	14105139	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=156,115;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,3:9,3:13,3,5,1
chr1	14106271	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:8,9,0,2
chr1	14149601	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:8,4:3,1:6,5,5,0
chr1	14149622	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=132,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,4:6,1:5,7,5,0
chr1	14507131	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,158;MMQ=60,20;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,0:6,3:3,8,0,3
chr1	15390145	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=183,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:0|1:15390145_A_G:15390145:1,4,1,3
chr1	15390178	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=187,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:1,1:0|1:15390145_A_G:15390145:1,5,0,3
chr1	15390211	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=191,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0|1:15390145_A_G:15390145:0,2,0,4
chr1	15420616	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,240;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	15427982	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=150,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:3,2,2,0
chr1	15428358	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	15438825	.	ATGTGTGTGTGTGTGTG	A,ATG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,151,160;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,14,15;RU=TG;STR;TLOD=9.34,10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,4:0.458,0.458:8:0,3,3:0,1,1:0,0,8,0
chr1	15439083	.	A	AAGGTCTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC,AAGGTCTTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28,30;MFRL=0,108,173;MMQ=60,60,60;MPOS=11,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.41,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.522,0.382:5:0,1,1:0,2,1:0,0,1,4
chr1	15495100	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,2:5,5:6,7,5,2
chr1	15495110	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,7:4,6:6,2,6,7
chr1	15497844	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	15541537	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	15578195	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=229,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr1	15616183	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	15651062	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,2:5,4:2,6,3,3
chr1	15653503	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=168,122;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	15708540	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,0:3,6:3,6,5,1
chr1	15709555	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:5,5,3,2
chr1	15755248	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0,3,1,6
chr1	15769139	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	15769876	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	15772057	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=114,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:2,2:1,2:2,1,4,1
chr1	15772933	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=234,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr1	15783117	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	15788051	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=189,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,3:6,1:5,4,3,1
chr1	15789176	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=152,227;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:7,0,3,0
chr1	15789885	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=206,222;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr1	15808289	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=184,147;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,2:7,0:2,8,0,2
chr1	15808702	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr1	15809706	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=165,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	15813751	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	15813969	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,1,4
chr1	15820576	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	15832383	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	15834297	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=213,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.826:13:0,6:1,5:1,1,8,3
chr1	15844926	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,4:3,1:1,3,0,5
chr1	15873386	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=35.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:3,9:3,2:4,2,4,8
chr1	15874961	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:1,4,0,3
chr1	15890342	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=175,217;MMQ=37,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.723:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr1	15892419	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:6,6,2,0
chr1	15901336	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=136,129;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,3:4,0:6,7,0,3
chr1	15909624	.	TGAGTACAG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=221,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	15909895	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=133,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	15911349	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	15959886	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr1	15986983	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,0:6,4:6,7,0,5
chr1	16011005	.	G	GGGC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=119,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GGC;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,0:2,0,2,0
chr1	16042724	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=198,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16042724_TC_T:16042724:1,0,1,0
chr1	16042729	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=131,160;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:16042724_TC_T:16042724:3,0,1,0
chr1	16042766	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=142,154;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:3,1,2,3
chr1	16042802	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:4,4,0,2
chr1	16043157	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,5,2
chr1	16044929	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=241,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	16044945	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	16045174	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=112,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:2,0,2,2
chr1	16047726	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:16047726_T_C:16047726:1,0,2,0
chr1	16047738	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:16047726_T_C:16047726:1,1,2,0
chr1	16047742	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=19,22;MFRL=117,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:1,0:0,1:1,1,2,0
chr1	16062916	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	16101183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=101,151;MMQ=53,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,1,1
chr1	16101217	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:1,3,3,2
chr1	16101220	.	CC	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,63;MMQ=60,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr1	16101335	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,95882405;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:7,4,1,1
chr1	16101571	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=287,249;MMQ=45,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	16101583	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,249;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:16101583_C_T:16101583:0,0,0,1
chr1	16101586	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16101583_C_T:16101583:0,0,0,1
chr1	16101588	.	GC	TT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,249;MMQ=60,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16101583_C_T:16101583:0,0,0,1
chr1	16134200	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:5,12,0,2
chr1	16255279	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:8,5:13,0:16,5,5,0
chr1	16258348	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:13,6:11,0:10,14,6,0
chr1	16258397	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:8,0:9,9,1,2
chr1	16260447	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=13,20;MFRL=158,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,2:2,0:6,2,3,0
chr1	16264264	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:6,3,1,2
chr1	16265422	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr1	16266010	.	G	GCCTCAGCCTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16266010_G_GCCTCAGCCTC:16266010:0,1,0,1
chr1	16266014	.	A	AGT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16266010_G_GCCTCAGCCTC:16266010:0,1,0,1
chr1	16266016	.	G	GCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16266010_G_GCCTCAGCCTC:16266010:0,1,0,1
chr1	16268766	.	A	ACCAGGCGCAAGGCAGGCTCTGTAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=179,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.220:11:4,0:5,2:5,4,1,1
chr1	16269595	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:5,4,3,0
chr1	16274769	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,3:6,2:11,3,4,1
chr1	16342350	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr1	16344730	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	16345619	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:2,2:0,2:2,0,3,1
chr1	16346009	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=244,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr1	16351275	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=142,156;MMQ=56,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,2:2,1:4,2,3,0
chr1	16354280	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,255;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	16354394	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=196,145;MMQ=40,24;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr1	16354433	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=168,145;MMQ=40,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:16354433_A_AT:16354433:5,0,0,2
chr1	16354435	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=168,145;MMQ=40,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:16354433_A_AT:16354433:5,0,0,2
chr1	16354441	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=139,145;MMQ=40,24;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,0,2
chr1	16356315	.	GTT	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:7,2:1,0:0|1:16356315_GTT_G:16356315:4,4,1,1
chr1	16356319	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:1,0:0|1:16356315_GTT_G:16356315:4,4,1,1
chr1	16356322	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=137,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,3:2,0:4,3,1,2
chr1	16356501	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:5,4,3,2
chr1	16356583	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,2:5,4:4,2,2,4
chr1	16358148	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,3,3
chr1	16358348	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=148,176;MMQ=58,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:2,14,2,0
chr1	16358685	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,6:1,8:1,0,12,2
chr1	16359051	.	CA	AG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:4,5,2,3
chr1	16359052	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=137,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.478:14:5,3:2,4:3,4,3,4
chr1	16359106	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	16359123	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	16370899	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	16372003	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=175,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	16372971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=207,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,6,0
chr1	16373199	.	CCTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=162,263;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	16374330	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:1,6:5,2:6,0,9,0
chr1	16374622	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	16375838	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,344;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	16376191	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,26;MFRL=305,167;MMQ=40,40;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	16376230	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=117,238;MMQ=34,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0|1:16376230_A_AT:16376230:3,1,4,1
chr1	16376232	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=117,238;MMQ=34,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,3:3,2:0|1:16376230_A_AT:16376230:3,1,4,1
chr1	16376238	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,27;MFRL=117,238;MMQ=34,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,3:3,4:3,1,6,1
chr1	16376278	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=118,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,4:2,10:2,3,10,4
chr1	16376458	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,6:3,3:0,5,1,8
chr1	16378649	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:4,2,2,1
chr1	16382086	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=173,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:4,2:1,3:1,4,4,2
chr1	16382827	.	CTCT	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:0,0,7,0
chr1	16382831	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0|1:16382827_CTCT_C:16382827:0,0,7,0
chr1	16382834	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	16382877	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:3,1,7,2
chr1	16382935	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=131,33;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:4,6,0,2
chr1	16383329	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=145,126;MMQ=52,44;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:16383329_T_TC:16383329:0,4,0,2
chr1	16383336	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=145,126;MMQ=52,44;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:16383329_T_TC:16383329:0,4,0,2
chr1	16383448	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,4,15
chr1	16383605	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,262;MMQ=34,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:6,0,1,1
chr1	16383668	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,34;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	16385248	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=126,186;MMQ=44,39;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0|1:16385248_C_T:16385248:0,2,1,2
chr1	16385250	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=126,186;MMQ=44,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0|1:16385248_C_T:16385248:0,2,1,2
chr1	16385980	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=0,162;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,3:2,5:0,7,4,4
chr1	16386008	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=197,140;MMQ=52,50;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:4,2:1,4:2,3,4,3
chr1	16386334	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,9975;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16386334_G_GC:16386334:0,0,0,1
chr1	16386336	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,9975;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:16386334_G_GC:16386334:0,0,0,1
chr1	16386341	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,23;MFRL=248,9975;MMQ=60,39;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:16386334_G_GC:16386334:1,0,0,1
chr1	16388556	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=92,127;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:16388556_C_T:16388556:4,0,2,0
chr1	16388565	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=83,127;MMQ=60,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:0|1:16388556_C_T:16388556:4,1,2,0
chr1	16388709	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,3,2
chr1	16388756	.	CACCCAT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=204,147;MMQ=39,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:2,1:3,1,0,2
chr1	16388766	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,39;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr1	16388875	.	GCCCCC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=269,186;MMQ=51,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,9;RU=C;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.332:4:0,0:3,1:3,0,0,1
chr1	16389118	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=334,25758594;MMQ=60,45;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	16456994	.	CAGGGG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGGG;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	16458814	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:3,6,3,0
chr1	16525056	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,7:1,5:1,0,7,6
chr1	16525549	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	16528233	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	16528439	.	CCAG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=194,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	16528823	.	GCCATGGGGACGGGGTGCCCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr1	16529117	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr1	16529128	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=176,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,0:6,3:1,8,1,2
chr1	16534002	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:1,0,6,4
chr1	16534730	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr1	16543175	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	16578304	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=255,161;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,0:3,6:0,5,0,6
chr1	16727446	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=215,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr1	16730324	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:7,8,0,2
chr1	16731406	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr1	16731609	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,6:1,2:1,3,1,7
chr1	16731646	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,1,4
chr1	16748153	.	CCT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=218,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16748153_CCT_C:16748153:0,1,0,1
chr1	16748161	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=218,146;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:16748153_CCT_C:16748153:0,1,0,1
chr1	16775582	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=131,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:9,4,2,1
chr1	16778265	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=127,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:7,1,5,1
chr1	16890421	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=149,153;MMQ=44,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:11,9:10,8:18,3,11,6
chr1	16890441	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,201;MMQ=60,46;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,7:0.149:51:26,5:18,2:24,20,7,0
chr1	16890737	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=160,214;MMQ=48,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.137:27:14,0:10,3:0|1:16890737_C_A:16890737:6,18,2,1
chr1	16890760	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=155,156;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,8:0.333:25:12,6:5,2:1|0:16890737_C_A:16890737:5,12,0,8
chr1	16890771	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=160,156;MMQ=52,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:12,5:8,1:4,17,0,6
chr1	16893841	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=165,207;MMQ=40,39;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,4:0.087:55:22,2:29,2:8,43,0,4
chr1	16893854	.	A	C	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=167,180;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.094:61:28,0:28,5:7,49,0,5
chr1	16893884	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=193,180;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:8,11:5,14:0,13,3,22
chr1	16907164	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=145,121;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,7:0.159:48:21,3:20,4:26,15,3,4
chr1	16907165	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=125,164;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,4:0.102:47:21,2:22,2:26,17,2,2
chr1	16907204	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=156,120;MMQ=44,32;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.181:47:18,5:21,3:23,16,7,1
chr1	16907466	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=184,228;MMQ=27,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:0,11,0,3
chr1	16909000	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=172,152;MMQ=27,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,1:7,4:4,7,0,5
chr1	16913633	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=112,144;MMQ=52,22;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:7,4:13,0:11,9,1,3
chr1	16914159	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=158,142;MMQ=51,23;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:18,3:11,2:18,13,3,2
chr1	16914160	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=142,175;MMQ=52,26;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:17,4:11,4:15,14,6,2
chr1	16914168	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=148,187;MMQ=52,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:14,7:9,6:11,12,10,3
chr1	16914176	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=158,71;MMQ=50,29;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:20,3:15,2:22,13,4,1
chr1	16914393	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=150,185;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:16914393_G_T:16914393:1,5,0,2
chr1	16914396	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,185;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,0:3,2:0|1:16914393_G_T:16914393:1,5,0,2
chr1	16915609	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=179,136;MMQ=21,20;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	16918255	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=192,213;MMQ=24,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,2:6,3:14,1,5,0
chr1	16918427	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=148,60;MMQ=52,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:27,2:27,1:23,32,2,1
chr1	16918429	.	C	T	.	.	DP=59;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=154,60;MMQ=52,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,2:0.049:59:27,2:28,0:0|1:16918429_C_T:16918429:25,32,1,1
chr1	16918430	.	T	TGATGA	.	.	DP=57;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=148,60;MMQ=53,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,2:0.051:57:27,2:28,0:0|1:16918429_C_T:16918429:24,31,1,1
chr1	16918502	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=197,175;MMQ=56,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,5:4,4,3,6
chr1	16918611	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,180;MMQ=22,20;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:1,7,2,1
chr1	17248532	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,15,7
chr1	17251055	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=127,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,2:1,4:0,2,1,6
chr1	17256313	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	17257187	.	G	GTCCGAGGGAGCACTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,258;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.490:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	17264090	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=183,168;MMQ=50,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:4,3,5,0
chr1	17264296	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=133,168;MMQ=54,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.547:11:1,2:3,4:2,3,1,5
chr1	17264863	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=128,107;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,1:5,6:5,6,5,2
chr1	17265366	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=160,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,3:6,2:8,4,2,3
chr1	17265396	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=160,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.159:21:8,2:7,0:4,14,3,0
chr1	17266512	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=158,0;MMQ=60,29;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:4,6,0,2
chr1	17266536	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=0,144;MMQ=30,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,2,3
chr1	17280022	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,3
chr1	17280025	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,3
chr1	17280045	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,2
chr1	17280051	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,2
chr1	17280057	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,24;MFRL=0,217;MMQ=60,45;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,2
chr1	17280061	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,244;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,1
chr1	17280074	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,26;MFRL=0,244;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,1
chr1	17280077	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:17280022_A_T:17280022:0,0,0,1
chr1	17281382	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr1	17282573	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=180,220;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:5,7,2,0
chr1	17296463	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	17297200	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=106,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,4:6,6,6,3
chr1	17297289	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,6:0,4:1,0,1,9
chr1	17299013	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	17301672	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr1	17303354	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=185,74;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:5,0:2,9,2,1
chr1	17303589	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=202,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:2,9:0,7:0,2,7,9
chr1	17303792	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr1	17313157	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	17323449	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=228,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:3,0,6,0
chr1	17326767	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:4,6,4,0
chr1	17328562	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:8,9,1,1
chr1	17328838	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,0:10,2:7,11,2,0
chr1	17330912	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.421:29:14,0:2,12:1,16,0,12
chr1	17331676	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,268;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr1	17345434	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:1,14,0,2
chr1	17349266	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:1,9,0,2
chr1	17359676	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr1	17395521	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=214,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:5,0,1,2
chr1	17396498	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=253,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr1	17398066	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=160,238;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17398066_G_C:17398066:0,3,0,1
chr1	17398069	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17398066_G_C:17398066:0,2,0,1
chr1	17401283	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=306,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr1	17402135	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr1	17402159	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.725:8:0,4:1,2:0,2,4,2
chr1	17402347	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr1	17405916	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=140,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,1,2
chr1	17405949	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	17409017	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,0;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:2,2,5,0
chr1	17409241	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=140,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	17410364	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	17418883	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr1	17418929	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=144,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.350:6:2,0:2,1:3,1,0,2
chr1	17550225	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr1	17555103	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:3,5:3,1:2,4,5,2
chr1	17557039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=167,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:5,2,5,1
chr1	17557118	.	G	GCCTCACCACCCTGTTTCCCTGCACTCCTC	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:3,2:15,0:0|1:17557118_G_GCCTCACCACCCTGTTTCCCTGCACTCCTC:17557118:5,13,0,2
chr1	17557122	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=143,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:3,2:15,0:0|1:17557118_G_GCCTCACCACCCTGTTTCCCTGCACTCCTC:17557118:5,14,0,2
chr1	17557125	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=26,32;MFRL=149,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:3,2:13,0:0|1:17557118_G_GCCTCACCACCCTGTTTCCCTGCACTCCTC:17557118:5,13,0,2
chr1	17557133	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=29,30;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:2,1:5,10:2,5,3,8
chr1	17557178	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=27,32;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:0,5,1,3
chr1	17557208	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=35,23;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:17557208_G_A:17557208:0,3,0,1
chr1	17557211	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,23;MFRL=151,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:17557208_G_A:17557208:0,4,0,1
chr1	17592121	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=148,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:4,2,2,0
chr1	17597721	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=201,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr1	17601345	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:17601345_G_A:17601345:0,3,0,1
chr1	17601348	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=190,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:17601345_G_A:17601345:0,3,0,1
chr1	17607068	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:6,2,3,0
chr1	17660499	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:1,6:2,11:1,2,7,10
chr1	17660697	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,5:0,7:1,0,9,3
chr1	17660802	.	A	ATT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.935:10:0,8:0,2:0,0,4,6
chr1	17662541	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	17662573	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=176,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:6,0,2,0
chr1	17662751	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=73.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,10:0,0,7,16
chr1	17662804	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	17666095	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	17668623	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=129,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.530:19:3,2:5,8:2,7,4,6
chr1	17672642	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,130;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:6,1:0,2:2,4,0,3
chr1	17674402	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=108,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr1	17683041	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=183,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,2:1,1:0,3,0,4
chr1	17689954	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=183,261;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,1:1,1:7,2,2,0
chr1	17707739	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr1	17707752	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:17707752_A_G:17707752:0,3,0,1
chr1	17707757	.	CG	TC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=165,345;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	17707758	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:17707752_A_G:17707752:0,2,0,1
chr1	17708580	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:6,0:10,4:4,12,0,4
chr1	17718671	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	17720439	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=190,298;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:4,1:1,1:4,1,1,1
chr1	17720615	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=131,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr1	17721695	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	17736578	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,4:5,3:3,6,2,5
chr1	17739586	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=151,295;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:7,1:2,1:7,2,1,1
chr1	17740079	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,0;MMQ=60,29;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:8,8,0,3
chr1	17764857	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=20,33;MFRL=186,187;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,2,0,1
chr1	17764866	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=186,187;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,2,0,1
chr1	17764870	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=186,187;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,2,0,1
chr1	17764877	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,35;MFRL=190,187;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,1,0,1
chr1	17764880	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,27;MFRL=190,187;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,1,0,1
chr1	17764882	.	A	ACTCAGGAAACCAGGGT	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=190,187;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17764857_C_T:17764857:0,1,0,1
chr1	17914846	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:4,1,3,0
chr1	17929972	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0|1:17929972_G_T:17929972:4,2,1,2
chr1	17929980	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=116,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,4:0.455:9:1,2:4,2:1|0:17929972_G_T:17929972:2,3,3,1
chr1	17929990	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,1:5,2:0|1:17929972_G_T:17929972:4,3,1,2
chr1	17944749	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	17965194	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:5,6,1,1
chr1	17981230	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=181,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr1	17982441	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,47202789;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:6,1:16,1:13,9,1,1
chr1	17982628	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr1	18021867	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr1	18023290	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	18554345	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr1	18554356	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=183,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,2,0
chr1	18702988	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	18703208	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr1	18704829	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=218,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr1	18704862	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,1,2
chr1	18808292	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=194,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:4,4,1,2
chr1	18812478	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.401:10:3,2:2,0:3,3,2,2
chr1	18960722	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	19018305	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:4,3,1,2
chr1	19199473	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:2,6:2,3:0,4,1,9
chr1	19200908	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=201,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	19202006	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:0|1:19202006_G_GA:19202006:2,3,1,1
chr1	19202009	.	G	GACATGGTGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:0|1:19202006_G_GA:19202006:2,3,1,1
chr1	19202768	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=178,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:3,2:0,0:0|1:19202768_G_A:19202768:3,0,1,1
chr1	19202770	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0|1:19202768_G_A:19202768:0,0,4,1
chr1	19204154	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=202,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,2,5
chr1	19204173	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,34;MFRL=87,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	19208145	.	G	GGGTTGCCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,10,3
chr1	19209543	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	19209615	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=171,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:8,1:8,8,1,1
chr1	19211925	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:19211925_A_C:19211925:0,0,3,0
chr1	19211930	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:19211925_A_C:19211925:0,0,3,0
chr1	19211935	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:19211925_A_C:19211925:0,0,3,0
chr1	19215834	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr1	19215877	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=158,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:6,3,4,0
chr1	19235237	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr1	19238001	.	T	TTTTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=409,133;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TTTA;STR;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.677:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	19408294	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.447:18:5,5:5,2:2,8,1,7
chr1	19408380	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:2,0:6,2:1,7,0,3
chr1	19420392	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=226,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,2:1,1:3,2,3,1
chr1	19426199	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:2,3,1,4
chr1	19431032	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=253,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	19431779	.	T	TGTCTTACTCTCTTTCTCTG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	19437185	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,5,0
chr1	19441212	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=327,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	19447843	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=185,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:2,3:11,3:6,7,1,5
chr1	19447973	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=94.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,30:0.689:43:6,0:7,30:1,12,0,30
chr1	19448326	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	19448608	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	19454758	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,71;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:7,14,1,1
chr1	19465751	.	CAAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,0:5,4:4,7,0,4
chr1	19467445	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=143,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	19476307	.	GAA	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=20,17;MFRL=179,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.170:20:1,1:6,0:4,13,1,2
chr1	19479018	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,125;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:7,2:0|1:19479018_C_T:19479018:4,8,0,2
chr1	19479027	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=151,125;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:19479018_C_T:19479018:3,7,0,2
chr1	19486839	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=236,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr1	19488839	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr1	19491857	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=277,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	19499835	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=202,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,2,2
chr1	19528281	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:9,9,1,1
chr1	19557713	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:4,2,1,1
chr1	19564529	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:9,5,2,0
chr1	19566296	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=123,40;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,1:6,3:7,3,2,2
chr1	19566525	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,0:5,2:1,7,1,1
chr1	19566833	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,18;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.152:37:18,0:14,5:21,11,5,0
chr1	19578053	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:0,5,0,6
chr1	19578192	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr1	19578404	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.556:14:1,3:5,4:1,5,2,6
chr1	19582563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=211,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,1,3
chr1	19583726	.	GG	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	19583734	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	19593748	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.475:17:6,6:3,2:7,2,5,3
chr1	19595892	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=135,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,4:2,6:2,3,0,10
chr1	19597420	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=134,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,3:6,2:3,9,4,1
chr1	19611410	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	19612404	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,142;MMQ=52,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:6,7,2,0
chr1	19638309	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr1	19644385	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=126,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:3,9,1,1
chr1	19651277	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr1	19652110	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,36;MFRL=86,246;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:0,0:3,1:1,2,0,1
chr1	19652127	.	AGTT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=86,245;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	19652642	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,311;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	19654021	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,10;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.341:4:1,0:1,0:0|1:19654021_C_A:19654021:2,1,1,0
chr1	19654023	.	A	ATCCCTCCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=15,28;MFRL=139,0;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TCCC;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr1	19654028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=79,139;MMQ=51,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:19654021_C_A:19654021:1,1,1,0
chr1	19654032	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=79,139;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:19654021_C_A:19654021:1,1,1,0
chr1	19654036	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=0,139;MMQ=42,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:19654021_C_A:19654021:0,1,1,0
chr1	19666017	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=161,67;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,0:4,3:5,5,2,1
chr1	19670918	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,0:9,6:10,8,0,6
chr1	19972444	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:4,6:13,0:9,8,6,0
chr1	19981451	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=104,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	19981467	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=210,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:19981467_C_T:19981467:3,0,1,0
chr1	19981476	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=238,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:19981467_C_T:19981467:3,0,1,0
chr1	19981791	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,2:3,8:5,1,5,5
chr1	20027207	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:7,1,2,0
chr1	20066325	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:8,5,1,1
chr1	20066485	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=298,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0|1:20066485_G_A:20066485:0,2,3,4
chr1	20066490	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=298,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,3:1,3:0|1:20066485_G_A:20066485:0,2,3,3
chr1	20067186	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr1	20073146	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,10:0,3:0,1,7,6
chr1	20107018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr1	20216860	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,3:1,6:1,1,7,2
chr1	20248709	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:9,0,2,1
chr1	20250169	.	AC	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:20250169_AC_TT:20250169:0,1,0,1
chr1	20250173	.	CCTG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=160,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:20250169_AC_TT:20250169:0,2,0,1
chr1	20305065	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,1,5
chr1	20411234	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=116,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,3:1,0:2,1,1,2
chr1	20411300	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.555:12:3,5:2,2:5,0,4,3
chr1	20442831	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:4,3,3,5
chr1	20518628	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:8,4,3,2
chr1	20520028	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=127,81;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,3:10,0:8,7,2,1
chr1	20522363	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,172;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.175:38:18,6:13,0:18,14,6,0
chr1	20645120	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:4,5,4,1
chr1	20649814	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	20657352	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=282,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:3,4:1,11:3,1,6,9
chr1	20664128	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,3:1,7:0,1,6,4
chr1	20680760	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=219,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,2,3
chr1	20680775	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.320:4:1,1:2,0:0|1:20680775_G_GA:20680775:0,3,0,1
chr1	20680777	.	G	GCACGAGAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:20680775_G_GA:20680775:0,3,0,1
chr1	20680779	.	G	GGCTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=177,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:20680775_G_GA:20680775:0,3,0,1
chr1	20680830	.	T	TTGAAACC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=270,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:20680830_T_TTGAAACC:20680830:0,1,0,1
chr1	20680832	.	G	GTGGTAGCAGAGCCTACAT	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=270,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:0,1:1,0:0|1:20680830_T_TTGAAACC:20680830:0,1,0,1
chr1	20880554	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=142,273;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	20940258	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,1:0,0,9,2
chr1	20964328	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=54.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,8,9
chr1	20972048	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,3:0,6:0,0,6,4
chr1	20972304	.	GGTTTTGTGTTCTAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=140,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr1	20975168	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	20977221	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr1	20978832	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	20979307	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr1	20980787	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,1:9,1:12,10,1,1
chr1	20980880	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=75,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:3,10:8,4:7,4,7,7
chr1	20991273	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:1,6:5,2:2,4,1,7
chr1	21030902	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	21053475	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:6,4,3,0
chr1	21091861	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,1:0,6:1,0,6,1
chr1	21094061	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,3:8,0:7,3,3,0
chr1	21102502	.	CAAAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=94,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=A;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.311:7:2,0:0,2:1,4,0,2
chr1	21175855	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	21179969	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	21180181	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,3,9
chr1	21180250	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	21188703	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.921:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	21220089	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:5,5,2,0
chr1	21220142	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=172,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:2,7,0,2
chr1	21221851	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,60;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:9,2,2,0
chr1	21267993	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,2,2
chr1	21327637	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	21377314	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	21415549	.	TCAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=185,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAAA;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr1	21494648	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,0;MMQ=55,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:1,12,2,0
chr1	21546438	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,3:8,0:10,8,2,1
chr1	21548293	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,107529728;MMQ=60,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:5,3,1,1
chr1	21551721	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	21560120	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=66,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,0,2
chr1	21571601	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:8,5:7,2:8,7,2,5
chr1	21582348	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:5,0,4,0
chr1	21583925	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=197,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr1	21583973	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=156,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.458:11:1,1:5,4:3,3,4,1
chr1	21599413	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr1	21795432	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=242,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:1,8:1,5:0,2,5,8
chr1	21797221	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=105,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,1:8,3:8,8,3,1
chr1	21797996	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr1	21799489	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,8:0,15:0,1,9,14
chr1	21799823	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=53.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,13,2
chr1	21801346	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	21804815	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr1	21805730	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,155;MMQ=60,42;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr1	21805978	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	21806525	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=205,153;MMQ=40,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,4,1
chr1	21806751	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	21807521	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,155;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	21889506	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=251,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:2,0,3,0
chr1	21889635	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=140,110;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:1,1:5,10:4,2,6,5
chr1	21889784	.	CG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:2,0:1,5,1,1
chr1	21890464	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21896767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,104;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:6,1,1,1
chr1	21902950	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=257,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	21926187	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	21929260	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	21929456	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	21932530	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	21934667	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=133,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,0:2,6:1,1,5,1
chr1	21936792	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:4,9,1,2
chr1	21938008	.	G	GA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,0:11,3:11,14,0,3
chr1	21938375	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:1,3,3,3
chr1	21939741	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=190,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:3,3,2,3
chr1	21944352	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=160,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:1,4,3,1
chr1	21946415	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	21952843	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:6,4,0,2
chr1	22007443	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	22016678	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.422:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	22033152	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:5,0:5,5:2,9,5,0
chr1	22033228	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,2:7,3:8,4,3,2
chr1	22047551	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0|1:22047551_C_T:22047551:6,5,1,1
chr1	22047554	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:9,0:2,2:0|1:22047551_C_T:22047551:6,5,1,1
chr1	22063149	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr1	22083000	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,15;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:4,0:5,0:3,6,3,0
chr1	22147963	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=162,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,5:6,0:11,6,5,0
chr1	22148164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,0,3
chr1	22151228	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=195,52;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,0:6,4:7,7,0,4
chr1	22155841	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,4:3,0:0|1:22155841_T_C:22155841:4,2,2,2
chr1	22155853	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:0|1:22155841_T_C:22155841:4,2,1,2
chr1	22157689	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=175,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:4,2,2,1
chr1	22158120	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=147,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=104.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,38:0.829:45:4,18:3,19:4,3,38,0
chr1	22160111	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=141,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:1,5,2,4
chr1	22161072	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	22165983	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=173,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:0|1:22165983_C_T:22165983:4,5,2,0
chr1	22165987	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0|1:22165983_C_T:22165983:4,3,2,2
chr1	22167988	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:3,2,3,1
chr1	22168216	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr1	22168968	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	22170828	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=245,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	22173762	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	22174600	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr1	22175612	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,219;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,0:3,2:0,4,0,3
chr1	22176500	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:3,1,4,2
chr1	22176831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,0:0,2,1,3
chr1	22180700	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0|1:22180700_G_A:22180700:4,4,0,2
chr1	22180702	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,2:5,0:0|1:22180700_G_A:22180700:4,4,0,2
chr1	22180848	.	G	GCCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=193,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:22180848_G_GCCC:22180848:1,6,1,1
chr1	22180849	.	G	GCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=193,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:22180848_G_GCCC:22180848:1,6,1,1
chr1	22180850	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=193,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:0|1:22180848_G_GCCC:22180848:1,6,1,1
chr1	22183471	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	22186234	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr1	22186479	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:7,3:6,6,3,0
chr1	22199081	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,7,1
chr1	22199821	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr1	22200835	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	22202109	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	22205408	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,1,1
chr1	22205466	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr1	22207235	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,12,9
chr1	22207804	.	ACCCAGGGTGGCAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,2:0,0,4,4
chr1	22208030	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr1	22211222	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr1	22214386	.	CTCCCCTGGCACCCAAACCACTCGTGGCCCCGGACA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=216,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:0,2:1,0:3,0,1,1
chr1	22215088	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	22216279	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr1	22303702	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=0,176;MMQ=24,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,0,3
chr1	22307743	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	22307757	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,148;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	22310104	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=197,168;MMQ=59,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,0,1
chr1	22310139	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=172,151;MMQ=40,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0|1:22310139_T_G:22310139:0,2,4,0
chr1	22310145	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=172,155;MMQ=40,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0|1:22310139_T_G:22310139:0,2,5,0
chr1	22310662	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr1	22310674	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,6,8
chr1	22313161	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr1	22313197	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=211,165;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr1	22329407	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=195,160;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,2:1,0:0|1:22329407_G_C:22329407:3,0,2,0
chr1	22329414	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=160,195;MMQ=34,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,3:0.571:5:2,2:0,1:1|0:22329407_G_C:22329407:2,0,3,0
chr1	22332253	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=142,206;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,4:6,0:6,7,4,0
chr1	22336120	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=174,166;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr1	22336371	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=161,122;MMQ=27,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:1,5:4,8:2,3,8,5
chr1	22408106	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=252,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	22447645	.	C	CTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	22827931	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:2,1,3,2
chr1	22832743	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,1,10
chr1	22837586	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.379:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr1	22837849	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=217,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,3:2,1:1,4,1,4
chr1	22838426	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.186:32:8,0:17,4:14,12,0,6
chr1	22838551	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:22838551_C_CT:22838551:14,9,0,2
chr1	22838552	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:14,2:0|1:22838551_C_CT:22838551:14,9,0,2
chr1	22838557	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=115,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:0|1:22838551_C_CT:22838551:12,9,0,2
chr1	22846452	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=178,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	22849003	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.852:11:0,3:1,7:0|1:22849003_A_C:22849003:0,1,1,9
chr1	22849009	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:0|1:22849003_A_C:22849003:0,7,0,2
chr1	22852715	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,85;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:5,3:6,3:7,5,4,2
chr1	22852880	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=250,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:1,3,1,4
chr1	22913153	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=88,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:0,1:3,4:0,3,1,4
chr1	22920280	.	C	CT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	22922546	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=259,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr1	22922560	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=259,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr1	22922722	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,1,3
chr1	22924418	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,1:5,2:0,11,0,3
chr1	22924536	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,265;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:3,1:5,1,1,2
chr1	22925292	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr1	22927314	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	22927326	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	22928265	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	22970790	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=163,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:22970790_A_T:22970790:0,1,0,1
chr1	22970797	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=163,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:22970790_A_T:22970790:0,1,0,2
chr1	22986015	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,85;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:3,2:6,0:8,1,2,0
chr1	22986186	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=207,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=41.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:5,0:5,13:0,10,0,13
chr1	22987958	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	23108089	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	23191746	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,4:4,2:0,6,1,6
chr1	23232400	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=120,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.713:4:0,0:0,3:0,1,2,1
chr1	23236826	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	23289568	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=193,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:2,2,4,2
chr1	23289703	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:5,2:9,3:3,11,0,5
chr1	23380198	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=103,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:5,0,6,2
chr1	23392552	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:9,4:7,10,0,4
chr1	23399932	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:1,3,0,3
chr1	23419261	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:3,8:8,5:9,2,9,4
chr1	23420076	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,38;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:10,7,1,1
chr1	23640112	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,6:6,4:4,7,5,5
chr1	23696481	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=190,103;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,0:8,4:5,11,0,4
chr1	23697898	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,163;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:14,8:12,0:14,12,8,0
chr1	23698042	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=128,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:6,18,2,0
chr1	23710805	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr1	23713952	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr1	23720402	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=113,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:8,2:10,5,1,1
chr1	23724183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=391,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,1,6
chr1	23735241	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,5:0,0,6,9
chr1	23745527	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=104,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr1	23758134	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,3,3
chr1	23782749	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr1	23850835	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,8;MFRL=158,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:0,0:2,0:0|1:23850835_T_A:23850835:2,0,3,0
chr1	23850841	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=12,12;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,1:0,0:0|1:23850835_T_A:23850835:3,1,3,0
chr1	23850846	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,23;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,2:0,1:0|1:23850835_T_A:23850835:3,1,3,0
chr1	23850850	.	CAGAGG	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,1:2,0:0|1:23850835_T_A:23850835:3,3,3,0
chr1	23885599	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,18:0.613:29:5,8:6,10:2,9,7,11
chr1	23956136	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=129,189;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:23956136_A_G:23956136:0,1,0,1
chr1	23956139	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=155,189;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:23956136_A_G:23956136:0,2,0,1
chr1	23956146	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=155,189;MMQ=60,46;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:23956136_A_G:23956136:0,2,0,1
chr1	23965517	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	23966894	.	T	TAAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:6,2,3,1
chr1	24019079	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,5:4,2:4,6,3,4
chr1	24080813	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,112;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:3,9:8,0:3,8,9,0
chr1	24106510	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	24119627	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=114,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:2,1,8,3
chr1	24120254	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=149,233;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:7,0:10,8,0,2
chr1	24120262	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=146,233;MMQ=60,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:7,0:9,8,0,2
chr1	24120814	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,12;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:3,0:1,0:4,4,2,0
chr1	24122986	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=241,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,1:2,7:2,0,8,0
chr1	24124801	.	CT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,36,36;MFRL=194,165,95;MMQ=60,60,59;MPOS=16,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=10.63,3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,6,2:0.463,0.199:12:3,2,0:1,4,2:0,4,0,8
chr1	24140629	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:1,0:5,2:5,2,2,0
chr1	24143932	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr1	24200969	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:24200969_T_C:24200969:0,0,2,0
chr1	24200983	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:24200969_T_C:24200969:0,0,4,0
chr1	24201262	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr1	24201919	.	TT	CC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=153,152;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:0,3,5,4
chr1	24202224	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=274,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24202224_T_A:24202224:0,1,0,1
chr1	24202225	.	G	GAGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=274,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:24202224_T_A:24202224:0,1,0,1
chr1	24288221	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=151,48;MMQ=52,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,2:14,0:13,11,1,1
chr1	24288239	.	T	TGA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=155,48;MMQ=45,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,2:14,0:0|1:24288239_T_TGA:24288239:11,11,1,1
chr1	24288240	.	T	TAAAATAAGAAATA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=163,48;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:7,2:14,0:0|1:24288239_T_TGA:24288239:11,10,1,1
chr1	24288404	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=173,117;MMQ=54,45;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:4,6:8,6:2,10,5,7
chr1	24288432	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=215,149;MMQ=56,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,7:2,5:3,1,2,10
chr1	24288529	.	TAAAC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=141,155;MMQ=52,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,4:9,2:7,6,3,3
chr1	24289891	.	ATGAATG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:1,9,0,3
chr1	24294249	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,9,14
chr1	24294362	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:5,1:3,2:4,4,2,2
chr1	24298263	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=210,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1,1,2,2
chr1	24298440	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,69;MMQ=60,30;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.223:20:6,0:10,4:11,5,1,3
chr1	24305397	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,233;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr1	24383819	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	24388371	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr1	24388417	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=115,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:3,3,7,2
chr1	24388679	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	24390731	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	24392600	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=229,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,1,3
chr1	24392671	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=87,183;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:7,4:6,7:6,7,5,6
chr1	24392796	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	24393656	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.570:19:6,6:2,5:2,6,4,7
chr1	24394424	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=113,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:4,2,2,2
chr1	24394673	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=121,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	24398560	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,32;MFRL=0,0;MMQ=60,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:24398560_G_T:24398560:1,2,0,1
chr1	24398566	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=0,0;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:24398560_G_T:24398560:1,2,0,1
chr1	24400584	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=29,33;MFRL=85,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.785:7:0,4:1,1:1,0,5,1
chr1	24400623	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=92,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.295:10:6,0:1,0:7,0,0,3
chr1	24400625	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=142,92;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,4:4,0:4,3,4,0
chr1	24400633	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=49.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr1	24408414	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=106,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr1	24418768	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=131,91;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,3:1,4:1,5,3,4
chr1	24421334	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:6,2,4,2
chr1	24421875	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:2,3:8,3:8,2,3,3
chr1	24434595	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr1	24447214	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	24447943	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:4,4:1,2:2,3,5,2
chr1	24463563	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	24463854	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:3,2:2,0:0,5,0,3
chr1	24484441	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	24485518	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,17:0,5:0,0,14,8
chr1	24486078	.	G	GTGC	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,2:16,0:19,11,0,2
chr1	24657999	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=153,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.251:30:7,4:15,3:6,17,0,7
chr1	24668842	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=123,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:0,5,0,6
chr1	24669457	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:4,4,3,2
chr1	24669497	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=183,64;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:7,7,1,1
chr1	24669509	.	TG	CA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=187,64;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:24669509_TG_CA:24669509:6,7,1,1
chr1	24669512	.	AGGGGT	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=189,64;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:0|1:24669509_TG_CA:24669509:5,7,1,1
chr1	24671464	.	ACCCTCCACACCTGTGCC	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=115,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTCCACACCTGTGCC;STR;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.345:17:3,1:5,4:3,9,1,4
chr1	24673866	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=238,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr1	24690764	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,154;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,0:11,3:9,13,3,0
chr1	24695749	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=142,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:6,2,3,1
chr1	24746205	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,5:5,0:0,6,0,5
chr1	24766764	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,0:8,6:4,8,0,6
chr1	24768778	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=531,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr1	24784139	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=272,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr1	24784197	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:3,1,3,2
chr1	24792617	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:1,6,1,3
chr1	24921969	.	CATG	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=162,53;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:1,0:0|1:24921969_CATG_C:24921969:5,4,1,1
chr1	24921974	.	CCACCAGGGGAGA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=138,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:2,0:0|1:24921969_CATG_C:24921969:6,4,1,1
chr1	24921993	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=135,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:24921969_CATG_C:24921969:5,1,1,1
chr1	24927561	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr1	24969963	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:24969963_G_C:24969963:1,2,0,1
chr1	24969973	.	ACCC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=19,16;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=C;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:24969963_G_C:24969963:1,1,0,1
chr1	24978166	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:0,15,0,3
chr1	24978892	.	CAA	C,CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34,35;MFRL=133,219,0;MMQ=60,60,60;MPOS=24,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.25,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.229,0.314:10:3,1,2:2,1,1:5,0,5,0
chr1	24989762	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	25072123	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:3,3,1,3
chr1	25124406	.	T	TC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:25124406_T_TC:25124406:0,1,0,1
chr1	25124408	.	CA	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:25124406_T_TC:25124406:0,1,0,1
chr1	25124412	.	T	TTTCCACTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=138,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:25124406_T_TC:25124406:0,1,0,1
chr1	25153692	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	25233660	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=9,32;MFRL=194,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr1	25254317	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=242,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	25611035	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,31;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,10,8
chr1	25633177	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=279,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:1,2:0,2,1,4
chr1	25678002	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=267,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr1	25678238	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr1	25729136	.	TCCA	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=187,72;MMQ=52,53;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCA;STR;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.289:14:4,4:6,0:0|1:25729136_TCCA_T:25729136:7,3,2,2
chr1	25729151	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=184,72;MMQ=60,52;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:25729136_TCCA_T:25729136:11,4,0,2
chr1	25780893	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,33;MFRL=88,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.449:11:2,3:4,2:0|1:25780893_A_G:25780893:4,2,4,1
chr1	25780909	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=20,33;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.400:5:0,2:3,0:0|1:25780893_A_G:25780893:1,2,1,1
chr1	25780913	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=101,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.400:5:0,1:2,0:0|1:25780893_A_G:25780893:1,2,1,1
chr1	25780944	.	T	TAG	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25780944_T_TAG:25780944:0,0,0,1
chr1	25780947	.	G	GCA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,34;MFRL=0,101;MMQ=60,30;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25780944_T_TAG:25780944:0,0,0,1
chr1	25780952	.	TG	CA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,35;MFRL=0,101;MMQ=60,30;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25780944_T_TAG:25780944:0,0,0,1
chr1	25780955	.	G	GACATTTAA	.	.	DP=1;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,101;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:25780944_T_TAG:25780944:0,0,0,1
chr1	25783066	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=164,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,3:2,3:6,0,5,1
chr1	25893242	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	26085048	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	26098107	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,14,5
chr1	26098333	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	26107688	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	26109237	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr1	26110065	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	26110143	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,5,4
chr1	26127655	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:5,0:12,8:8,9,0,8
chr1	26138136	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=262,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,2:0,8:0,2,6,4
chr1	26138262	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=231,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:1,11:0,7:1,0,11,7
chr1	26138451	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=231,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr1	26138466	.	CA	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26138466_CA_AC:26138466:0,2,0,1
chr1	26138469	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=218,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:26138466_CA_AC:26138466:0,3,0,1
chr1	26139137	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,105;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:1,7:2,5:2,1,6,6
chr1	26139296	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=142,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:7,2:3,1:4,7,0,3
chr1	26140500	.	GCAGGAA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,127;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:9,0:10,9,0,2
chr1	26152758	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=375,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,6:1,2:1,0,6,2
chr1	26158337	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr1	26161975	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:15,0:6,9:10,12,0,9
chr1	26310394	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	26310836	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:4,1,5,0
chr1	26317383	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:3,3:1,2:0,5,0,5
chr1	26349948	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0|1:26349948_G_A:26349948:1,2,0,1
chr1	26349958	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,13;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.509:4:0,0:1,0:0|1:26349948_G_A:26349948:0,2,0,2
chr1	26349967	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.618:3:0,1:1,1:0|1:26349948_G_A:26349948:0,1,0,2
chr1	26357855	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr1	26365549	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr1	26369215	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=129,158;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:2,0:6,4:0|1:26369215_C_T:26369215:1,7,0,4
chr1	26369221	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=129,158;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:2,0:6,4:0|1:26369215_C_T:26369215:1,7,0,4
chr1	26369297	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	26383645	.	CCAGGGGT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=135,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr1	26383664	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=165,196;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:7,7:2,0:0|1:26383664_A_C:26383664:9,1,7,0
chr1	26383668	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=165,196;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.382:19:7,7:5,0:0|1:26383664_A_C:26383664:9,3,7,0
chr1	26496455	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=154,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr1	26510402	.	C	CCTGGTGTGTGATG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26510402_C_CCTGGTGTGTGATG:26510402:0,0,0,1
chr1	26510404	.	T	TCCCTGC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:26510402_C_CCTGGTGTGTGATG:26510402:0,0,0,1
chr1	26511700	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:1,6,2,1
chr1	26515529	.	ACCAGACT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCAGACT;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.766:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	26517321	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:5,7,3,1
chr1	26517773	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,34;MFRL=141,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:26517773_T_C:26517773:3,1,1,1
chr1	26517794	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=141,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0|1:26517773_T_C:26517773:3,1,1,1
chr1	26524706	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	26526533	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=100,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.160:29:12,2:9,2:0|1:26526533_G_A:26526533:14,11,2,2
chr1	26526554	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=134,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,19:0.497:38:14,13:5,5:0|1:26526533_G_A:26526533:6,13,3,16
chr1	26527255	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=88,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:1,1:0|1:26527255_G_A:26527255:2,0,3,0
chr1	26527260	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=88,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0|1:26527255_G_A:26527255:2,0,3,0
chr1	26527304	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=192,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:2,5:6,2:0|1:26527304_T_C:26527304:7,1,6,1
chr1	26527310	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=192,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:1,5:7,2:0|1:26527304_T_C:26527304:7,1,6,1
chr1	26527809	.	AG	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=299,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:2,2:4,2,4,1
chr1	26528922	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=187,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:12,3,2,0
chr1	26583998	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	26597435	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=344,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:1,0,4,3
chr1	26597583	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:6,4,2,0
chr1	26597673	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	26601385	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr1	26601570	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:1,5,0,7
chr1	26603883	.	G	GAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr1	26607392	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,104;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:4,7,0,5
chr1	26607726	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=123,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	26608782	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:5,1:4,1:6,3,1,2
chr1	26609307	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,10:1,5:0,1,8,7
chr1	26612297	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.381:29:7,7:11,3:11,7,7,4
chr1	26620846	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	26624479	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=198,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.492:24:5,5:7,5:6,6,6,6
chr1	26629465	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=208,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	26644399	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=218,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	26646611	.	TA	T,TAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,26,26;MFRL=0,172,197;MMQ=60,44,56;MPOS=29,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=10.44,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.558,0.224:6:0,0,0:0,4,1:0,1,5,0
chr1	26648838	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	26650550	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	26655208	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,3:1,5:1,1,7,1
chr1	26658102	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:2,3,0,2
chr1	26662774	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=259,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:2,1,7,1
chr1	26665991	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=236,167;MMQ=60,56;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	26698884	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=100974072,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr1	26698938	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr1	26699103	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=133,67;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,4:8,1:3,11,2,4
chr1	26699157	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=179,150;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr1	26752992	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=116,155;MMQ=52,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,3:4,3:2,4,2,4
chr1	26769403	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:26769403_A_T:26769403:1,5,0,2
chr1	26769405	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:26769403_A_T:26769403:1,5,0,2
chr1	26769406	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,1:2,1:0|1:26769403_A_T:26769403:1,5,0,2
chr1	26774281	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:26774281_CA_TG:26774281:0,3,0,1
chr1	26774295	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:26774281_CA_TG:26774281:0,3,0,1
chr1	26774301	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,24;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:26774281_CA_TG:26774281:0,2,0,1
chr1	26774303	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:26774281_CA_TG:26774281:0,2,0,1
chr1	26795299	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:26795299_T_A:26795299:0,0,1,0
chr1	26795301	.	T	TTG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:26795299_T_A:26795299:0,0,1,0
chr1	26795302	.	GCC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:26795299_T_A:26795299:0,0,1,0
chr1	26800558	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=143,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0|1:26800558_T_C:26800558:9,6,1,1
chr1	26800565	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=151,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:26800558_T_C:26800558:8,6,1,1
chr1	26800566	.	C	CCTCCCTCCCTTCCTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:0|1:26800558_T_C:26800558:8,6,1,1
chr1	26801713	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=270,165;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:26801713_A_C:26801713:0,3,0,1
chr1	26801719	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=256,165;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:26801713_A_C:26801713:0,4,0,1
chr1	26801740	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,26;MFRL=121,283;MMQ=45,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26801740_T_A:26801740:1,1,0,1
chr1	26801743	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=121,283;MMQ=45,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26801740_T_A:26801740:1,1,0,1
chr1	26801749	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=121,283;MMQ=45,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:26801740_T_A:26801740:1,1,0,1
chr1	26878086	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:6,3,0,2
chr1	26900699	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=166,129;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,0:8,4:6,7,0,4
chr1	26900708	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,4:5,2:3,4,2,4
chr1	26900735	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=237,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:1,1,5,6
chr1	26900805	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:3,0,2,3
chr1	27057621	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,255;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,3:7,1:14,1,4,0
chr1	27057940	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:2,13,0,2
chr1	27089446	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=200,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:4,2,2,2
chr1	27094509	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr1	27105671	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,139;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:16,0:10,8:7,19,0,8
chr1	27124320	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,0:5,8:9,4,0,8
chr1	27158844	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=221,279;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr1	27190821	.	GGTGTGTGT	G,GGT,GGTGT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32,32,24;MFRL=136,148,161,160;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,23,9;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,15;RU=GT;STR;TLOD=7.58,7.67,7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,3,4,3:0.215,0.267,0.260:14:4,1,0,1:0,2,4,2:1,3,6,4
chr1	27217803	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	27220020	.	CTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=253,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=T;STR;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.681:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr1	27272600	.	A	ATCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=133,417;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,1:7,7,2,0
chr1	27277139	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,0:0|1:27277139_A_C:27277139:1,6,2,0
chr1	27277143	.	TC	AA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,0:0|1:27277139_A_C:27277139:1,7,2,0
chr1	27332982	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr1	27428321	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,2:3,4:3,5,4,2
chr1	27435974	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,19;MFRL=257,259;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:27435974_G_C:27435974:1,0,2,0
chr1	27435980	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=257,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:27435974_G_C:27435974:1,0,2,0
chr1	27435985	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,22;MFRL=257,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0|1:27435974_G_C:27435974:1,0,2,0
chr1	27435988	.	AAG	CCC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,17;MFRL=312,259;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:0,0:0|1:27435974_G_C:27435974:2,0,2,0
chr1	27435994	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,21;MFRL=312,259;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:0|1:27435974_G_C:27435974:2,0,2,0
chr1	27609980	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.919:11:0,4:0,7:0,0,3,8
chr1	27621026	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=184,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:3,5,2,0
chr1	27630237	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=166,86;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:12,0:4,3:8,8,1,2
chr1	27658709	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=173,100;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:1,6,1,2
chr1	27659965	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	27660568	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=214,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,2,3
chr1	27661135	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:3,5,2,0
chr1	27661231	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=107,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:6,4,2,4
chr1	27675858	.	GGCTC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:5,3,1,1
chr1	27678108	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=272,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	27682440	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:2,3:4,0:3,3,1,3
chr1	27682481	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=111,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,5:3,5,3,6
chr1	27683897	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:11,3:12,0:14,9,3,0
chr1	27686063	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr1	27688128	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:11,2:3,0:8,6,2,0
chr1	27690359	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	27690644	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,1,3
chr1	27696011	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	27700537	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=218,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,0:4,8:0,5,0,8
chr1	27745368	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	27941543	.	TCA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:27941543_TCA_T:27941543:0,4,0,1
chr1	27941549	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=192,186;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:27941543_TCA_T:27941543:0,4,0,1
chr1	27992800	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=34,31;MFRL=0,124;MMQ=47,40;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0|1:27992800_CAA_C:27992800:1,0,1,0
chr1	27992825	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,13;MFRL=129,124;MMQ=48,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,0,1,0
chr1	27992830	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=31,15;MFRL=129,124;MMQ=48,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:1,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,0,1,0
chr1	27992833	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,10;MFRL=171,124;MMQ=54,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:4,0,1,0
chr1	27992836	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,15;MFRL=213,124;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,0,1,0
chr1	27992838	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=25,15;MFRL=213,124;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,0,1,0
chr1	27992840	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,15;MFRL=206,124;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,1,1,0
chr1	27992844	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,15;MFRL=206,124;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:27992800_CAA_C:27992800:3,1,1,0
chr1	27992966	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=136,63;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:8,0:6,2:0|1:27992966_C_T:27992966:9,5,1,1
chr1	27992984	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=161,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:7,2:0|1:27992966_C_T:27992966:7,9,1,1
chr1	27992987	.	C	CACA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:27992966_C_T:27992966:6,7,1,1
chr1	27992988	.	T	TCACA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=163,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,1:0|1:27992966_C_T:27992966:6,7,1,1
chr1	27995077	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,7:0,0,6,8
chr1	28054163	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=190,85;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	28081934	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,159;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,0:0,6:0,3,0,6
chr1	28086955	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr1	28116179	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=172,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,0:6,4:4,11,0,4
chr1	28138537	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,0:3,7:1,8,0,7
chr1	28144352	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,169;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr1	28159396	.	ACC	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=C;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:11,0:7,3:0|1:28159396_ACC_A:28159396:2,19,3,0
chr1	28159402	.	TCTCCTG	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=129,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:11,0:7,3:0|1:28159396_ACC_A:28159396:1,19,3,0
chr1	28212272	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=218,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:3,0,5,0
chr1	28241083	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr1	28261593	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:28261593_T_C:28261593:5,0,2,0
chr1	28261600	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,22;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,1:3,0:0|1:28261593_T_C:28261593:5,0,2,0
chr1	28261658	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,26;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,1:4,1,2,1
chr1	28268706	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=122,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:3,1,3,0
chr1	28268829	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=151,104;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,5:1,5:0,2,6,4
chr1	28268833	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=104,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.191:14:3,1:7,1:8,4,0,2
chr1	28268835	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr1	28282556	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:6,4:5,9,4,0
chr1	28290231	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,3,14
chr1	28303732	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	28374815	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr1	28477205	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,2:8,1:12,3,3,0
chr1	28555426	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,4:4,1:3,3,3,2
chr1	28559574	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.747:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr1	28562676	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr1	28785729	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:10,0:5,11,0,3
chr1	28807187	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.327:7:4,0:1,2:0|1:28807187_GT_G:28807187:1,4,0,2
chr1	28807192	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=21,34;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:28807187_GT_G:28807187:1,4,0,2
chr1	28807194	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:28807187_GT_G:28807187:1,4,0,2
chr1	28807196	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,2:0|1:28807187_GT_G:28807187:1,4,0,2
chr1	28818183	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:6,1:8,2:6,8,1,2
chr1	28891130	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr1	28906141	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,2:6,0:6,7,1,1
chr1	28906515	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=64,95;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,0:6,3:3,7,1,2
chr1	29010342	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=349,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	29016715	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=22,35;MFRL=227,0;MMQ=60,21;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.504:2:0,1:1,0:0|1:29016715_GTT_G:29016715:0,1,1,0
chr1	29016718	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=227,0;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,1:1,0:0|1:29016715_GTT_G:29016715:0,1,1,0
chr1	29016739	.	CA	AT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,10;MFRL=227,0;MMQ=60,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:29016715_GTT_G:29016715:0,1,1,0
chr1	29016744	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=222,0;MMQ=60,21;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:29016715_GTT_G:29016715:0,2,1,0
chr1	29023342	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr1	29023674	.	CATATATATATAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=171,164;MMQ=47,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,13;RU=AT;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.520:2:0,0:0,1:0,1,0,1
chr1	29029152	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	29063559	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,11,3
chr1	29323636	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=223,133;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr1	29342090	.	GAAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=79,226;MMQ=58,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:3,1,1,0
chr1	29345009	.	C	CTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr1	29345027	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr1	29387045	.	G	GTCTCAAGCAGGGTCTCAAGACTTCTCC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:4,9,1,1
chr1	29442397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=180,109;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	29475341	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,5,8
chr1	29542435	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	29557224	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,3:1,7:1,2,6,5
chr1	29585371	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.376:6:1,0:3,2:0|1:29585371_G_T:29585371:0,4,0,2
chr1	29585375	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:29585371_G_T:29585371:0,4,0,2
chr1	29585376	.	AGTTAGAATG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=160,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:29585371_G_T:29585371:0,4,0,2
chr1	29585387	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,36;MFRL=163,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0|1:29585371_G_T:29585371:0,3,0,2
chr1	29587104	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,8;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	29605438	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=143,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	29631236	.	C	CTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,0:5,3,2,3
chr1	29631782	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	29642705	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.304:16:7,5:4,0:0|1:29642705_C_T:29642705:4,7,3,2
chr1	29642708	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=161,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.304:16:7,4:4,0:0|1:29642705_C_T:29642705:4,7,3,2
chr1	29651670	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=128,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.248:23:4,4:7,0:9,9,5,0
chr1	31186387	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=115,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.181:18:9,0:6,2:3,12,1,2
chr1	31188972	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:13,7,2,0
chr1	31191522	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=8,12;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:0,0:0|1:31191522_G_C:31191522:2,0,2,0
chr1	31191527	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=21,12;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:31191522_G_C:31191522:2,0,2,0
chr1	31191530	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=223,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:1,0:0|1:31191522_G_C:31191522:2,0,2,0
chr1	31206637	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=164,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr1	31206806	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=124,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:0,3:3,5:1,2,2,6
chr1	31214570	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,137;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:6,9,2,0
chr1	31230668	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	31346199	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=133,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:6,0:3,3:5,4,3,3
chr1	31347133	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:3,1,3,0
chr1	31415040	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	31465513	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=152,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,0:3,11:1,7,0,11
chr1	31467958	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=117,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.286:33:9,0:15,9:12,12,0,9
chr1	31478638	.	AAGAGAG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=50,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=AG;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.494:8:2,2:0,2:2,2,2,2
chr1	31501755	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,1:5,4:0,7,0,5
chr1	31734353	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,3:3,0:3,3,1,2
chr1	31740668	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=339,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,5:1,5:1,0,8,2
chr1	31740706	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=217,291;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:3,4,4,1
chr1	31742261	.	G	GGAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr1	31744168	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	31764693	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=215,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr1	31764713	.	C	CAAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=215,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,3:3,0,5,1
chr1	31764930	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	31840426	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr1	31882582	.	G	GGCCTCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:4,3,5,0
chr1	31897493	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=60.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr1	31898132	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,8:2,3:1,2,8,3
chr1	31898162	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=221,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:0,10:3,4:1,2,7,7
chr1	31898279	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=245,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,3:4,0,4,6
chr1	31898536	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,256;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,1,1
chr1	31899684	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,0,13
chr1	31899704	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr1	31905730	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	31905889	.	A	ACAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=260,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAG;STR;TLOD=30.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:1,1:0,5:1,0,6,3
chr1	31906882	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	31907102	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr1	32044817	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,3:11,0:7,13,0,3
chr1	32051139	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:32051139_G_GA:32051139:1,2,0,1
chr1	32051142	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:32051139_G_GA:32051139:1,2,0,1
chr1	32051306	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:10,2,2,0
chr1	32084904	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=188,173;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,5:6,0:5,3,4,1
chr1	32084908	.	T	TCTCCTGCCTCAAC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=180,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:8,3,1,1
chr1	32118160	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,250;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.486:12:2,6:4,0:6,0,6,0
chr1	32119347	.	AACACAC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=321,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=AC;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.393:3:0,1:1,0:1,1,0,1
chr1	32119431	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=211,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:3,4,6,2
chr1	32121083	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=145,184;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:4,0:10,6:0|1:32121083_T_C:32121083:6,8,0,6
chr1	32121087	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,184;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:4,0:10,6:0|1:32121083_T_C:32121083:6,8,0,6
chr1	32122164	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	32126135	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=111,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:6,3:3,8:5,4,9,2
chr1	32127911	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:1,3:4,2,2,1
chr1	32127953	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:4,2:2,5:3,3,5,3
chr1	32128283	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr1	32133737	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	32136168	.	G	C,T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20,28;MFRL=181,124,161;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.95,26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,11,11:0.448,0.440:24:1,6,8:1,5,2:1,1,7,15
chr1	32140733	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:2,3,3,1
chr1	32145009	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	32146425	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=80,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,1:3,2:3,1,2,2
chr1	32146764	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=221,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr1	32148571	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr1	32151719	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,127;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:12,0:9,2:12,9,0,2
chr1	32155284	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=140,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.502:10:5,5:0,0:4,1,5,0
chr1	32155911	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:1,2,4,3
chr1	32155929	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=123,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:4,1:10,2:6,8,2,2
chr1	32156869	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr1	32160918	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	32161675	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:1,1:1,0:0|1:32161675_A_C:32161675:0,2,3,0
chr1	32161681	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.562:5:1,1:1,1:0|1:32161675_A_C:32161675:0,2,3,0
chr1	32196647	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,1:5,3:6,2,2,3
chr1	32203163	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,1:9,1:7,6,0,2
chr1	32203218	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:14,1:16,1:6,24,2,1
chr1	32203260	.	AGGCGGCATAGAT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=173,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,2:14,0:14,10,2,0
chr1	32203401	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=222,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr1	32209765	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr1	32221913	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:4,5,1,6
chr1	32222807	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:3,0:9,6:7,6,0,6
chr1	32222849	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=150,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,4:7,0:7,8,2,2
chr1	32258805	.	AAGAG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=AG;STR;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:6,1:2,3:8,0,3,1
chr1	32262324	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=193,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:5,3:6,0:4,7,1,2
chr1	32266026	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:4,5:2,7:3,3,5,7
chr1	32280610	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=118,189;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.564:16:3,4:3,5:3,4,7,2
chr1	32280697	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:5,10,2,0
chr1	32381552	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=102,86;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:10,0:18,3:0|1:32381552_C_T:32381552:17,11,3,0
chr1	32381577	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=84,86;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:7,0:12,3:0|1:32381552_C_T:32381552:16,11,3,0
chr1	32479632	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	32505181	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:18,4,0,2
chr1	32505193	.	G	GTGT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:17,3,0,2
chr1	32541464	.	T	TCTAATATTACG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	32620192	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,69;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,3:8,0:9,6,2,1
chr1	32620226	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=155,69;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,3:11,0:8,9,2,1
chr1	32653818	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=231,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	32658062	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=336,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GT;STR;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr1	32660473	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=108,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:3,2:8,2:6,5,3,1
chr1	32692163	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,11;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.441:9:5,0:0,0:1,4,0,4
chr1	32692168	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,0:0,0,1,3
chr1	32692210	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=36,16;MFRL=272,66;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,1:2,0:0|1:32692210_C_CA:32692210:0,3,1,1
chr1	32692213	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,23;MFRL=272,66;MMQ=60,58;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.423:5:1,1:2,0:0|1:32692210_C_CA:32692210:0,3,1,1
chr1	32800706	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:1,2,1,3
chr1	32832314	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,20;MFRL=169,47;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,1,1
chr1	32832331	.	T	TTCA	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=188,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:32832331_T_TTCA:32832331:2,6,1,1
chr1	32832332	.	G	GATCT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=188,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:0|1:32832331_T_TTCA:32832331:2,6,1,1
chr1	32832336	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=29,20;MFRL=175,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:0|1:32832331_T_TTCA:32832331:1,6,1,1
chr1	32832337	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=188,47;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:32832331_T_TTCA:32832331:1,5,1,1
chr1	32842030	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=106,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,0:8,3:10,6,0,3
chr1	32842369	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=250,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	33065947	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:33065947_G_C:33065947:0,0,4,8
chr1	33065955	.	G	GAATCCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:33065947_G_C:33065947:3,8,1,1
chr1	33087566	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,16;MFRL=107,78566050;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.396:6:1,0:1,0:0|1:33087566_AG_A:33087566:2,2,0,2
chr1	33087568	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,14;MFRL=107,78566050;MMQ=60,49;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.396:6:2,0:2,0:0|1:33087566_AG_A:33087566:2,2,0,2
chr1	33087646	.	T	TAGAAAACATACCTGCAGAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	33117071	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,4,8
chr1	33134774	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:1,14:0,5:0,1,9,10
chr1	33134890	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=132,100;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:5,8:16,0:6,15,8,0
chr1	33134989	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,9,7
chr1	33138169	.	T	TTGACC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,0:6,2:8,4,0,2
chr1	33138516	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,2,8
chr1	33146113	.	CT	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=153,174;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:5,6:10,6:10,8,10,2
chr1	33160878	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr1	33231380	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=23,32;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.294:19:8,1:2,4:7,7,4,1
chr1	33231398	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=169,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,2:9,0:0|1:33231398_C_CT:33231398:9,11,1,1
chr1	33231399	.	C	CTTTCTACTCCTTCCTACAA	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,19;MFRL=163,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,1:9,0:0|1:33231398_C_CT:33231398:9,10,1,1
chr1	33231403	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.419:19:7,1:3,5:4,7,4,4
chr1	33233323	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	33233645	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:13,6:6,0:10,9,6,0
chr1	33234452	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=220,169;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:1,1,0,4
chr1	33237878	.	T	TCCCCCCCCCCCCCCCCCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=6,24;RU=C;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.563:19:6,3:2,3:0,8,11,0
chr1	33244953	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=223,88;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr1	33252099	.	TCACATGCATGACTATTCCTAGCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	33256884	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=199,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,8:1,6:0,3,1,13
chr1	33276424	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr1	33293748	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	33318634	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	33318868	.	C	CATTTGAGGTCAGGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,288;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	33330432	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	33333893	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,1:15,1:10,12,0,2
chr1	33359206	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=206,64;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:6,0:2,3:3,5,2,1
chr1	33402334	.	GA	G,GAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35,34;MFRL=153,151,145;MMQ=60,60,60;MPOS=23,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=4.24,5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.221,0.388:11:2,2,1:2,1,2:4,0,5,2
chr1	33402616	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:9,0:9,2:12,7,0,2
chr1	33402647	.	CC	AA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=147,121;MMQ=60,32;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,3:12,0:10,7,3,0
chr1	33404176	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=187,76;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:0,6,1,2
chr1	33409551	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr1	33409693	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.476:23:6,3:6,7:7,5,4,7
chr1	33412093	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:2,6,2,0
chr1	33415402	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:1,8,0,2
chr1	33476292	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,33;MFRL=158,25620358;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:10,0,3,0
chr1	33476385	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=152,307;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,6:0.189:35:10,3:18,3:0|1:33476385_C_G:33476385:15,14,3,3
chr1	33476387	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=152,307;MMQ=60,47;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.179:37:11,3:18,3:0|1:33476385_C_G:33476385:16,15,3,3
chr1	33476396	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=152,307;MMQ=60,47;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:11,3:16,3:0|1:33476385_C_G:33476385:15,17,3,3
chr1	33476404	.	T	G	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=150,307;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.180:37:11,3:15,3:0|1:33476385_C_G:33476385:14,17,3,3
chr1	33478920	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=143,149;MMQ=60,26;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:16,1:10,2:11,15,0,3
chr1	33478931	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=148,75;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:14,1:7,3:9,14,1,3
chr1	33478959	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=167,0;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:8,2:15,3:11,12,4,1
chr1	33478983	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=175,0;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:8,2:16,2:9,15,4,0
chr1	33487219	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.134:20:11,2:6,0:0|1:33487219_G_T:33487219:8,10,1,1
chr1	33487227	.	A	ATTTACTCCAACCCATGTGGGC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=136,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,2:5,0:0|1:33487219_G_T:33487219:8,9,1,1
chr1	33560338	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,4,16
chr1	33567592	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=135,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr1	33585814	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=222,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr1	33760743	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,9,4
chr1	33760862	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=140,140;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.420:53:24,0:5,21:10,21,0,22
chr1	33773152	.	ACTCCCACCCCAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=215,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	33778591	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,211;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	33794416	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=194,327;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	33795572	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr1	33795590	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=271,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,5:0,3:2,0,7,2
chr1	33798005	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=172,114;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:8,0:2,4:4,6,0,5
chr1	33798024	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=180,114;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,0:4,5:2,10,0,5
chr1	33820033	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=105,276;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:4,10,3,1
chr1	33944881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr1	33954352	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	33955255	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=216,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,0,1
chr1	33955291	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0|1:33955291_A_T:33955291:0,4,0,4
chr1	33955296	.	T	TTTTCCAGCTCAAGG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:0|1:33955291_A_T:33955291:0,4,0,4
chr1	33955299	.	G	GGTTACCATGTCTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=191,175;MMQ=60,34;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:33955291_A_T:33955291:0,2,0,1
chr1	33956743	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:6,2:6,0,1,1
chr1	33961147	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr1	33985353	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:9,6:5,3:7,7,3,6
chr1	33985521	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:9,2:9,11,0,2
chr1	34033248	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=140,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,2:13,1:11,10,1,2
chr1	34038339	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	34042810	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr1	34042834	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr1	34043169	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	34052305	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,311;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr1	34052605	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=268,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:2,2:0,3:3,0,4,1
chr1	34070826	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr1	34071434	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:6,2,8,0
chr1	34098959	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,3:3,1:5,1,4,0
chr1	34099159	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.305:34:21,0:3,10:3,21,0,10
chr1	34112452	.	T	TGC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:34112452_T_TGC:34112452:0,0,1,0
chr1	34112456	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34112452_T_TGC:34112452:1,0,1,0
chr1	34112462	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:34112452_T_TGC:34112452:1,0,1,0
chr1	34112467	.	ACT	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=125,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:34112452_T_TGC:34112452:1,1,1,0
chr1	34158472	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=220,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0|1:34158472_C_T:34158472:4,1,3,1
chr1	34158482	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=219,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0|1:34158472_C_T:34158472:3,1,5,1
chr1	34164286	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:1,2:5,0,3,0
chr1	34166207	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=131,142;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:6,0:4,5,5,0
chr1	34189917	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=195,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,4:2,6:0,4,5,5
chr1	34189957	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr1	34190184	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,93;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:5,10,2,0
chr1	34254131	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=218,201;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr1	34257966	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=127,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,1:2,0:0,3,1,0
chr1	34663612	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,2:0,3,0,3
chr1	34667863	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=130,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,1:6,3:4,8,1,3
chr1	34677724	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:7,0:0,2:7,0,2,0
chr1	34684463	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	35261044	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=177,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:3,7,2,1
chr1	35334251	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,2:9,0:3,8,0,2
chr1	35477592	.	AT	TG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,126;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:5,0:10,8:6,9,0,8
chr1	35486072	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:1,0:5,1:0,6,0,2
chr1	35561510	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,2,15
chr1	35563206	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr1	35576145	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	35655061	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=208,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	35734535	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=287,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,3:1,0:2,0,3,1
chr1	35826968	.	T	TTTTGGTC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=85,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr1	35836212	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,54;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:0|1:35836212_T_G:35836212:0,8,1,1
chr1	35836219	.	G	GTC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=172,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:5,0:5,2:0|1:35836212_T_G:35836212:0,11,1,1
chr1	35855649	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=120,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,1:0|1:35855649_T_C:35855649:7,5,1,1
chr1	35855657	.	A	AGATTGCAC	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=120,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:35855649_T_C:35855649:8,6,1,1
chr1	35870944	.	ACTTTT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTTTT;STR;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,5:8,2:6,6,4,3
chr1	35913868	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=137,275;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,3:11,1:12,8,1,3
chr1	35925861	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr1	36019913	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=114,192;MMQ=39,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:1,1:4,2:12,1,3,0
chr1	36055731	.	G	GATTGGCTGAGTCAGGCTGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=115,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.323:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	36056280	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,1:9,1:7,6,2,0
chr1	36068950	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=169,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,0:13,3:7,14,0,3
chr1	36205166	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	36212676	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=220,176;MMQ=50,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:36212676_C_T:36212676:0,2,0,1
chr1	36212681	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=220,176;MMQ=50,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0|1:36212676_C_T:36212676:0,2,0,1
chr1	36213712	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	36282417	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=17,22;MFRL=182,156;MMQ=41,58;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.781:15:1,6:0,3:3,0,12,0
chr1	36282441	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,24;MFRL=158,153;MMQ=60,53;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,3:2,1:8,2,6,0
chr1	36291713	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:0,5,0,2
chr1	36297333	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:8,2,2,0
chr1	36298033	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,10;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.581:8:0,0:2,0:2,1,5,0
chr1	36316381	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=167,190;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,1:1,0,3,2
chr1	36316418	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.888:15:1,3:0,7:1,0,3,11
chr1	36316539	.	C	CATTTAAATGAGCACCTACAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=162,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,0:7,3:0|1:36316539_C_CATTTAAATGAGCACCTACAA:36316539:10,7,0,3
chr1	36316544	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=163,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.187:19:9,0:7,3:0|1:36316539_C_CATTTAAATGAGCACCTACAA:36316539:9,7,0,3
chr1	36316571	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,9:0,0,7,14
chr1	36383132	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=359,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr1	36437530	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr1	36550722	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:9,7,1,1
chr1	36553817	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:36553817_T_A:36553817:4,0,0,1
chr1	36553819	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,1:0|1:36553817_T_A:36553817:4,0,0,1
chr1	36554442	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	36563158	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,6:0,0,8,5
chr1	36565584	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	36565617	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr1	36602943	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:3,3:4,4:1,6,0,8
chr1	36641729	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=230,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr1	36642048	.	GC	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=237,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:36642048_GC_TA:36642048:0,1,1,1
chr1	36642051	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=237,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0|1:36642048_GC_TA:36642048:0,1,1,1
chr1	36755361	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:2,6,1,1
chr1	36759529	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=125,1169;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:6,7:12,0:8,10,0,7
chr1	36762396	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,1,3
chr1	36773046	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=202,102497526;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:5,2:0|1:36773046_C_T:36773046:5,1,2,0
chr1	36773065	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=192,102497526;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:36773046_C_T:36773046:10,1,2,0
chr1	36773819	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	36785270	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:4,1:4,3:6,3,4,0
chr1	36788353	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36788353_G_T:36788353:0,0,1,0
chr1	36788356	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36788353_G_T:36788353:0,0,1,0
chr1	36826860	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:10,8:2,0:8,4,8,0
chr1	36887702	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=246,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:2,0,8,1
chr1	36888302	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=215,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.605:10:4,4:0,1:4,0,5,1
chr1	36923494	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=232,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,4:1,6:1,1,5,6
chr1	36926446	.	C	CCAAAAAATACAAGTAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	36932789	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=112,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:4,4:10,0:7,7,2,2
chr1	36933585	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:6,2:5,7,1,1
chr1	37307281	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr1	37324683	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,2:5,1:10,5,3,0
chr1	37335458	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	37335485	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,4
chr1	37335494	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:37335485_A_G:37335485:0,0,0,4
chr1	37949096	.	G	GT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:12,0:8,9:10,10,0,9
chr1	37959450	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr1	37959470	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=50.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,3,12
chr1	37959499	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,1:0,0,1,7
chr1	37961608	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=214,117;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr1	38006359	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	38030639	.	G	GTCCTGATCATGTCATGGCCACATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=108,109343603;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,1:3,1:4,4,2,0
chr1	38032706	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38032706_T_TC:38032706:0,0,0,1
chr1	38032709	.	CCCG	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38032706_T_TC:38032706:0,0,0,1
chr1	38041223	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=118,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,5:7,5:6,7,6,4
chr1	38049552	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr1	38078630	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,3:0,1:0,0,2,3
chr1	38079650	.	ATC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=167,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:1,3,1,0
chr1	38082122	.	GC	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,1:1,1,3,2
chr1	38149076	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=127,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:5,2:3,9,1,3
chr1	38149083	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=126,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:7,0:4,2:2,9,0,2
chr1	38155265	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,0:2,7:8,1,6,1
chr1	38158258	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:1,1,4,0
chr1	38161694	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=144,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:0,11,0,3
chr1	38164581	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:6,5,2,0
chr1	38164613	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:8,9,2,0
chr1	38164724	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,1,3
chr1	38167345	.	TAAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr1	38184316	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=190,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:6,4,4,0
chr1	38186294	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:3,4,1,5
chr1	38187346	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=160,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:10,8,0,2
chr1	38188841	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,3:2,1:3,3,2,2
chr1	38189142	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=236,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	38220055	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	38265148	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	38301250	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	38301476	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	38327935	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=234,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,9:1,3:3,0,8,4
chr1	38327982	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr1	38334317	.	TC	AA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr1	38345896	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	38351339	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:8,0:4,2:7,5,2,0
chr1	38411350	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=187,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr1	38425724	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=123,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:2,0,5,1
chr1	38425895	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr1	38425931	.	TAGGA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=243,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr1	38435281	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.206:22:7,2:11,2:0|1:38435281_A_T:38435281:12,6,2,2
chr1	38435284	.	T	TGACAG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.207:22:7,2:11,2:0|1:38435281_A_T:38435281:12,6,2,2
chr1	38435291	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:0|1:38435281_A_T:38435281:11,4,0,2
chr1	38444333	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,5,3
chr1	38444749	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=111,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,1:1,6:2,2,2,5
chr1	38455389	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,4:2,2:2,3,4,2
chr1	38463904	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=191,311;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	38464639	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=111.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,14:0,17:0,0,13,18
chr1	38483296	.	ATT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.254:17:3,2:9,1:7,6,2,2
chr1	39305403	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=171,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:0,4,0,4
chr1	39322587	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:9,3:8,12,2,1
chr1	39325063	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,13,3
chr1	39330399	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=127,212;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,3:8,2:9,7,1,4
chr1	39333118	.	C	CAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=217,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,21;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr1	39352083	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	39353559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=142,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:4,3,2,0
chr1	39361569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=155,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:6,0,2,1
chr1	39361615	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,8:1,3:0,2,6,5
chr1	39550210	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	39759207	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,82;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:8,7,1,2
chr1	39761509	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=97,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:15,0:10,4:17,8,4,0
chr1	39763242	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=354,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	39766055	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:1,3,1,6
chr1	39785438	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0|1:39785438_A_T:39785438:0,3,1,1
chr1	39785440	.	AA	TT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:39785438_A_T:39785438:0,3,1,1
chr1	39785450	.	A	ATGAACCAACTTGC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,20;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:39785438_A_T:39785438:0,3,1,1
chr1	39785452	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=134,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:39785438_A_T:39785438:0,3,1,1
chr1	39796844	.	CTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=35,21;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=28,17;RU=T;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,2:0,0:1,0,4,0
chr1	39796875	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=16,16;MFRL=237,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.291:5:1,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:4,0,1,0
chr1	39796880	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=21,17;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:4,0,1,0
chr1	39796884	.	GC	AA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,15;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:4,0,1,0
chr1	39796891	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,16;MFRL=225,154;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:3,0,1,0
chr1	39796898	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,15;MFRL=225,154;MMQ=60,60;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:39796875_G_T:39796875:3,0,1,0
chr1	39799473	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=159,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,1:7,2:9,9,2,1
chr1	39799906	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=174,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:9,0:9,3:11,8,1,2
chr1	39812620	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr1	39815344	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:3,8,0,3
chr1	39823032	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,2:5,2:10,3,0,4
chr1	39826391	.	A	ATTAT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=193,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr1	39845095	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=181,111;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,0:8,3:5,6,0,3
chr1	39853687	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=207,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,3:4,2:3,8,3,2
chr1	39853811	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=152,132;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:9,5,0,2
chr1	39881006	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=129,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:6,4:5,0:8,4,1,4
chr1	39881040	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=120,192;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	39881599	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=177,171;MMQ=60,22;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:6,11,0,3
chr1	39888329	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:9,3,1,1
chr1	39889677	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=116,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,1:4,2:10,4,3,0
chr1	39893093	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=108,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,2:4,5:9,2,5,2
chr1	39893720	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:6,6:9,0:10,5,6,0
chr1	39894839	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,4:3,6:4,1,9,1
chr1	39895460	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr1	39900058	.	CTTTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,13,31;MFRL=152,150,141;MMQ=60,60,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,10,14;RU=T;STR;TLOD=3.17,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.246,0.368:3:1,0,0:0,0,1:1,0,2,0
chr1	39903624	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,1:3,6,0,2
chr1	39908360	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=167,218;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:4,7,2,0
chr1	39908506	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=124,209;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,2:7,1:6,6,1,2
chr1	39913074	.	CTG	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,1:6,1:9,9,2,0
chr1	39913351	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:2,5:3,1,2,5
chr1	39927507	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr1	39929240	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.507:14:4,1:2,6:4,3,7,0
chr1	39935278	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=159,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:10,5:12,0:10,12,5,0
chr1	39988219	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=189,108;MMQ=52,21;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:39988219_C_T:39988219:1,0,0,1
chr1	39988238	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,21;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39988219_C_T:39988219:0,0,0,1
chr1	40028180	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=163,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr1	40029441	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,0:13,5:20,6,0,5
chr1	40035686	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=81,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr1	40036847	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=146,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,1:5,2:6,2,2,1
chr1	40041371	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=193,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr1	40041699	.	T	TCGGAGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=191,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGGAGC;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	40092089	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	40096053	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=204,63;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	40129027	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,5:10,0:8,6,5,0
chr1	40149865	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40149865_G_C:40149865:0,0,1,0
chr1	40149869	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:40149865_G_C:40149865:0,0,1,0
chr1	40149874	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=269,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:40149865_G_C:40149865:0,1,1,0
chr1	40207169	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,5:1,1:1,5,0,6
chr1	40209408	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	40214525	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr1	40226046	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	40229319	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=207,232;MMQ=40,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:6,1,2,1
chr1	40230531	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,263;MMQ=27,38;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,2:6,2:3,9,2,2
chr1	40313849	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=125,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:0,3,0,8
chr1	40367125	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	40536074	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,8:0,0,9,7
chr1	40545964	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,14,0
chr1	40556922	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	40557656	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	40558256	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	40559555	.	CAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=73,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.570:9:0,3:1,1:1,3,4,1
chr1	40559773	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=217,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr1	40562993	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	40713845	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=132,11523231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:2,5,1,1
chr1	40726594	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:13,0:16,4:19,10,0,4
chr1	40737516	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr1	40737589	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,1:7,1:11,9,1,1
chr1	40771973	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr1	40776112	.	GGA	CTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr1	40776431	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=80,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,0:2,5:1,3,0,5
chr1	40777800	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.704:21:2,7:3,7:5,1,7,8
chr1	40777842	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=168,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:1,5,0,4
chr1	40777884	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=157,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,0:4,1:0,5,0,2
chr1	40778377	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:9,6:10,4:9,10,8,2
chr1	40840270	.	T	TGC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=146,139;MMQ=45,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.571:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr1	40840294	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=155,139;MMQ=56,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:2,0:9,0,3,0
chr1	40840296	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=20,29;MFRL=127,155;MMQ=53,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.796:19:1,7:1,7:4,0,14,1
chr1	40879808	.	G	C,T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36,28;MFRL=0,148,189;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.35,28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,10:0.200,0.733:12:0,1,6:0,1,4:0,0,7,5
chr1	40881041	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,11,13
chr1	40887831	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40887831_G_A:40887831:0,1,0,1
chr1	40887833	.	C	CCCAGTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40887831_G_A:40887831:0,1,0,1
chr1	40887835	.	C	CACTAGGTTGCTGGGACAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=144,92;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:40887831_G_A:40887831:0,1,0,1
chr1	40928552	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,0:3,3:7,3,2,1
chr1	40955156	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=133,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr1	40955375	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=105,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr1	41006482	.	A	ACGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=326,285;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41006482_A_ACGTC:41006482:0,1,0,1
chr1	41006484	.	GCTTA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=326,285;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41006482_A_ACGTC:41006482:0,1,0,1
chr1	41101572	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,4:2,9:2,3,8,5
chr1	41107360	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,3:4,5:3,2,4,4
chr1	41107612	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,3:2,7:2,3,1,9
chr1	41232194	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr1	41235177	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=215,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,5:6,1:1,7,1,5
chr1	41236181	.	AC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=243,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.292:8:4,1:2,1:5,1,0,2
chr1	41284366	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=135,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr1	41284406	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=186,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,0:0,4:0,1,2,2
chr1	41284509	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=214,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr1	41284524	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,1:0|1:41284524_G_A:41284524:4,0,3,0
chr1	41284527	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0|1:41284524_G_A:41284524:4,0,3,0
chr1	41285171	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:3,5:5,1:2,6,2,5
chr1	41298652	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	41456808	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr1	41466803	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,5:8,5:1,12,5,5
chr1	41474400	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:3,10,0,2
chr1	41475085	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,5:3,3:5,0,6,2
chr1	41486408	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=191,260;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	41494222	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=79,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.793:17:1,7:2,7:2,1,7,7
chr1	41540853	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:2,5:1,3:0|1:41540853_A_T:41540853:2,1,4,5
chr1	41540861	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:2,6:2,4:0|1:41540853_A_T:41540853:3,1,5,6
chr1	41618248	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,3:10,0:10,6,3,0
chr1	41618442	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=173,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,0:1,8:0,4,0,8
chr1	41625333	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=170,37;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,0:15,2:15,10,1,1
chr1	41627220	.	T	TTTTGAACATTTA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,239;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	41828087	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:1,3,0,2
chr1	41949628	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	41950312	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	42049727	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=169,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,1:8,1:3,7,2,0
chr1	42619303	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	42629040	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	42776699	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:0,1:4,2:4,2,3,1
chr1	42880159	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=209,103;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,4:5,0:5,2,4,0
chr1	42915727	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:2,1:2,2:1,3,1,3
chr1	42915753	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,1:3,1:1,4,0,3
chr1	42922879	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=118,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,0:10,2:10,6,2,0
chr1	42922945	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:9,0:18,4:11,16,4,0
chr1	42925688	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=302,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	43021810	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:9,3:5,2:11,3,5,0
chr1	43032005	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:6,2,0,2
chr1	43054909	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=184,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,1:0,0:1,0,1,0
chr1	43119661	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=77,162;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,4:6,1:4,5,1,4
chr1	43124859	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=221,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:2,3,6,2
chr1	43126671	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,179;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,3:5,0:1,7,0,3
chr1	43166409	.	GAGA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:6,1:10,3,0,2
chr1	43200808	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=127,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=57.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,23:0.533:43:8,0:12,23:9,11,0,23
chr1	43201534	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=132,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:4,3,0,3
chr1	43201576	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=177,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,2:0,0:2,3,0,2
chr1	43212291	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	43212431	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.955:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr1	43213499	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,0,3
chr1	43228189	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr1	43239395	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr1	43273064	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=167,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:3,2:2,2:3,3,3,1
chr1	43296118	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,1:7,2:10,9,3,0
chr1	43296173	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=198,71;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:11,2:8,7:8,11,2,7
chr1	43296195	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=159,177;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:5,2:4,7,1,2
chr1	43300663	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	43300921	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	43302971	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=210,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	43316760	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=100,142;MMQ=60,23;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,9:8,0:8,1,9,0
chr1	43393245	.	G	GGGTGAGAAAT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=116,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.220:25:12,2:8,2:13,7,4,1
chr1	43395229	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:5,2:3,0:7,2,0,2
chr1	43652369	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,6:0,0,8,8
chr1	43663376	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,3,11
chr1	43664064	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr1	43672537	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,1:3,1:6,4,0,2
chr1	43672636	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=294,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr1	43680855	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	43687724	.	CT	AA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=190,110;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:4,2:4,0:0|1:43687724_CT_AA:43687724:7,2,3,0
chr1	43687729	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,110;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:4,2:4,0:0|1:43687724_CT_AA:43687724:6,2,3,0
chr1	43692782	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,1:11,1:16,10,0,2
chr1	43699935	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr1	43700140	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,3,6
chr1	43738340	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	43748872	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=128,0;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,0:0|1:43748872_AG_CC:43748872:0,3,1,0
chr1	43748876	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=142,0;MMQ=60,24;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:43748872_AG_CC:43748872:1,3,1,0
chr1	43748878	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=128,0;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,0:2,0:0|1:43748872_AG_CC:43748872:2,3,1,0
chr1	43748894	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=131,41;MMQ=60,42;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.242:11:3,0:5,1:3,6,2,0
chr1	43770729	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=163,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,1:9,1:9,5,1,1
chr1	43770760	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:8,9,1,1
chr1	43771016	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.424:19:5,6:6,2:5,6,3,5
chr1	43773033	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:3,3,1,2
chr1	43774878	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=149,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:1,3,1,4
chr1	43777324	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=188,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:5,1,2,0
chr1	43777344	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=188,76;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:5,2,2,0
chr1	43777852	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr1	43777873	.	C	CTAATATTTTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:1,3,0,1
chr1	43779564	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:11,4:2,3:11,2,4,3
chr1	43782846	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=152,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.645:21:2,5:5,6:7,0,10,4
chr1	43782918	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,2:8,0:7,8,0,2
chr1	43784956	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,198;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.560:19:3,5:5,6:6,2,5,6
chr1	43785061	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=169,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,0,2
chr1	43787437	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr1	43804454	.	A	ACTTCGTCTTGCATTGAGTAAACACCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:1,3,0,1
chr1	43812075	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=138,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,5,1
chr1	43814864	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=235,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,4:0,2:2,0,5,1
chr1	43817853	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43817853_A_C:43817853:4,0,1,0
chr1	43817855	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43817853_A_C:43817853:4,0,1,0
chr1	43826312	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,4,5
chr1	43830250	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:9,0:10,4:15,5,0,4
chr1	43850722	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,71;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:7,0:8,11,1,2
chr1	43853942	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=16,12;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.734:8:0,0:0,0:2,0,6,0
chr1	43855546	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=203,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.324:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr1	43855578	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	43869235	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr1	43901011	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr1	43903589	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:2,4,0,5
chr1	43904316	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr1	43904603	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=164,77;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:5,0:9,2:0|1:43904603_AT_A:43904603:6,8,1,1
chr1	43904607	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,77;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.161:16:4,0:9,1:0|1:43904603_AT_A:43904603:6,8,1,1
chr1	43907092	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:2,5,8,0
chr1	43908407	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=270,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:1,2,1,1
chr1	43909265	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=244,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr1	43912590	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=130,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	43917409	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:1,1,4,2
chr1	43917637	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,111;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,3:3,7:2,3,4,6
chr1	43918179	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,120;MMQ=60,58;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:43918179_C_T:43918179:0,0,0,1
chr1	43918188	.	C	CTTTCATTTGTCAGCTTCTGAGTTGTATTTTTATAATAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=200,120;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:43918179_C_T:43918179:1,0,0,1
chr1	44035472	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=154,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:0,4,1,5
chr1	44044468	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,99;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:4,2,3,2
chr1	44054597	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=186,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:3,4,0,2
chr1	44063378	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:3,1,1,0
chr1	44064319	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	44067859	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=165,250;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	44071853	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	44072420	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	44075227	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	44078359	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=57,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0|1:44078359_T_A:44078359:4,0,3,0
chr1	44078384	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,15:0.843:17:0,8:2,6:0|1:44078359_T_A:44078359:2,0,14,1
chr1	44079411	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr1	44083015	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	44083110	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr1	44083507	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,9:1,15:0,1,12,13
chr1	44083519	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.914:21:0,8:1,12:0,1,8,12
chr1	44085012	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,0:7,2:12,5,2,0
chr1	44086080	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr1	44087496	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	44125962	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=132,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:0,0:3,7:2,1,3,4
chr1	44386293	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,13;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.843:4:0,1:0,0:0,0,0,4
chr1	44386300	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=15,23;MFRL=272,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,0:0,1:0,2,0,2
chr1	44386305	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	44386396	.	TCCCAGCCCTCCAGCTGAACTCTGCATGCCTTCTCTCAC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.135:21:7,0:5,1:17,2,1,1
chr1	44386445	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:14,3,1,1
chr1	44386615	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	44395786	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr1	44426025	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,13:0,5:0,0,7,12
chr1	44426948	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,4,10
chr1	44432500	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,2,3
chr1	44437058	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=118,90;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,3:11,0:6,10,3,0
chr1	44438266	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,0:3,7:1,12,0,7
chr1	44447006	.	TAGC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=217,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AGC;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.503:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	44450677	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,144;MMQ=60,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,2:12,0:8,9,0,2
chr1	44455871	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=307,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	44457650	.	GACCT	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.232:11:5,2:3,0:0|1:44457650_GACCT_G:44457650:3,6,1,1
chr1	44457656	.	AGCCTGGAGCTGCGGGCGGAGGTGGGG	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:3,0:0|1:44457650_GACCT_G:44457650:3,6,1,1
chr1	44457739	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	44461391	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=186,238;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:6,0:13,10:3,16,0,10
chr1	44476519	.	G	GAGTGCTGTGGCATGA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,194;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.184:15:5,2:7,0:0|1:44476519_G_GAGTGCTGTGGCATGA:44476519:3,10,0,2
chr1	44476521	.	C	CTTGGCTCACTACAAGCTCTG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=159,194;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.184:15:5,2:7,0:0|1:44476519_G_GAGTGCTGTGGCATGA:44476519:3,10,0,2
chr1	44489914	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,107;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,0:5,5:7,3,0,5
chr1	44594966	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=136,19501006;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr1	44595113	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr1	44679552	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=178,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,1:10,0:6,15,0,2
chr1	44679556	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:7,3:3,8:3,8,3,8
chr1	44684995	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=100,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	44687386	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=100,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:44687386_T_G:44687386:0,1,0,1
chr1	44687395	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44687386_T_G:44687386:0,0,0,1
chr1	44713586	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:15,5,1,1
chr1	44805031	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=234,0;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:44805031_G_A:44805031:0,2,1,0
chr1	44805035	.	AGAAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=234,0;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:44805031_G_A:44805031:0,2,1,0
chr1	44818439	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=224,0;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:44818439_C_T:44818439:2,0,1,0
chr1	44818442	.	C	CCG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,18;MFRL=224,0;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,0:0|1:44818439_C_T:44818439:2,0,1,0
chr1	44818443	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,17;MFRL=98,0;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:44818439_C_T:44818439:3,0,1,0
chr1	45098142	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,9262192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr1	45169747	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.348:26:7,3:9,0:8,8,10,0
chr1	45169805	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:13,4:4,0:5,12,0,4
chr1	45213158	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=138,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,4:6,0:3,10,0,4
chr1	45213175	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=217,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:4,6,0,4
chr1	45219382	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.285:9:2,1:5,0:6,1,2,0
chr1	45223901	.	TATTAGCTG	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=215,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTAGCTG;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.456:7:1,2:3,1:1,3,0,3
chr1	45225921	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=211,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	45226370	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=240,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:3,0:4,2:0|1:45226370_G_GC:45226370:2,5,1,1
chr1	45226374	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=185,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.244:10:3,0:5,1:0|1:45226370_G_GC:45226370:2,6,1,1
chr1	45228375	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:45228375_TC_T:45228375:0,4,0,1
chr1	45228377	.	AGTATG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:45228375_TC_T:45228375:0,4,0,1
chr1	45241374	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=143,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr1	45241685	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=97,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.169:27:12,0:11,4:13,10,2,2
chr1	45253304	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,0:10,4:7,9,0,4
chr1	45266912	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,159;MMQ=40,32;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	45362992	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=210,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:1,2,4,2
chr1	45446902	.	AAAG	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,24;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45446902_AAAG_A:45446902:0,1,0,1
chr1	45446908	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45446902_AAAG_A:45446902:0,1,0,1
chr1	45446910	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:45446902_AAAG_A:45446902:0,1,0,1
chr1	45446916	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,29;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:45446902_AAAG_A:45446902:0,1,0,1
chr1	45470130	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr1	45471532	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:15,0:6,5:9,12,0,5
chr1	45472798	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,26,28;MFRL=198,192,171;MMQ=60,60,60;MPOS=16,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=TG;STR;TLOD=13.44,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,2:0.563,0.268:8:0,3,2:1,1,0:1,0,4,3
chr1	45473316	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	45474157	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=220,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,8:0,6:0,1,6,8
chr1	45474356	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,0:3,6:2,6,0,6
chr1	45475566	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr1	45476069	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,8,6
chr1	45478554	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,15;MFRL=167,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.208:21:11,0:3,0:0|1:45478554_A_C:45478554:3,14,4,0
chr1	45478560	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=156,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.162:23:14,1:3,1:0|1:45478554_A_C:45478554:4,16,3,0
chr1	45478566	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,23;MFRL=134,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:16,1:6,1:0|1:45478554_A_C:45478554:4,18,3,0
chr1	45479791	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=147,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:13,0:12,8:7,18,0,8
chr1	45480733	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=75.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.964:24:0,14:0,9:0,0,6,18
chr1	45486272	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	45500107	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=100,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.360:12:2,1:5,3:3,5,3,1
chr1	45502026	.	CTTTTTTT	C,CTTTTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,22,18;MFRL=140,155,159;MMQ=53,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,11,16;RU=T;STR;TLOD=5.75,9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.248,0.421:10:0,2,1:0,1,0:2,1,0,7
chr1	45504524	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	45524213	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	45794426	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	45796269	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=221,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:0,3,5,2
chr1	45797196	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=215,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:2,5,2,0
chr1	45798555	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=242,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,7:0,5:1,0,7,5
chr1	45798729	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,9:4,0:7,3,9,0
chr1	45805566	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,6,13
chr1	45806882	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:16,3:9,0:10,15,3,0
chr1	45812359	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:9,5:10,0:13,7,5,0
chr1	45851537	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr1	45887375	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=134,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:7,1,1,1
chr1	45965307	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=226,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,6:1,4:0,4,3,7
chr1	45965340	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,1,4
chr1	45973240	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=181,100;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:4,7,0,2
chr1	45981258	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,167;MMQ=40,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	45981418	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=121,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:6,3:15,0:7,14,0,3
chr1	45981480	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=138,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:2,0:8,2:1,9,2,0
chr1	45981512	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=193,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,5:1,2,1,5
chr1	46032324	.	TGGGG	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=137,241;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:11,1:7,0:0|1:46032324_TGGGG_T:46032324:8,10,0,2
chr1	46032330	.	GGCCCTGAA	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=137,241;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,1:7,0:0|1:46032324_TGGGG_T:46032324:8,10,0,2
chr1	46065998	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,12,1
chr1	46080947	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=70.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,9:1,11:0,1,13,8
chr1	46081940	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr1	46081960	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=176,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.856:19:0,7:2,9:1,1,14,3
chr1	46082431	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	46083706	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:3,14:3,6:5,1,11,9
chr1	46085852	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	46085879	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	46086329	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=118,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	46086913	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr1	46087879	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	46099248	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,1:9,2:9,9,1,2
chr1	46099842	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=108,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:4,0:12,2:7,9,1,1
chr1	46124585	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=212,198;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr1	46124663	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=120,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:3,6:5,1:4,4,2,6
chr1	46158837	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=167,144;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,7:5,0:9,0,7,0
chr1	46180059	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chr1	46193522	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46193522_A_C:46193522:0,1,0,1
chr1	46193526	.	TT	AA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=165,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:46193522_A_C:46193522:0,1,0,1
chr1	46193529	.	GT	AG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:46193522_A_C:46193522:0,0,0,1
chr1	46347910	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:4,2:1,2:6,0,4,0
chr1	46424964	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	46487560	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=195,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr1	46491423	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,1:12,2:8,13,2,1
chr1	46495434	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=270,304;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,1,1
chr1	46499443	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=157,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:6,4,0,2
chr1	46658328	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=228,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:5,1:0,4:0|1:46658328_A_G:46658328:0,5,1,4
chr1	46658343	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=253,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:5,1:0,4:0|1:46658328_A_G:46658328:1,5,1,4
chr1	46659104	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,3:3,2:5,4,2,3
chr1	46659363	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,2:2,4,2,3
chr1	46660240	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,0:7,4:9,7,0,4
chr1	46660295	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=169,168;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,5:4,2:3,6,4,3
chr1	46739974	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,22;MFRL=210,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr1	46740439	.	C	CATACGGGGTCAAATGGGTTTTTCTTGCTGCCTTCTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=191,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.245:11:3,2:5,0:2,7,1,1
chr1	46745170	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:7,14,2,0
chr1	46806429	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=176,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.571:14:3,4:2,4:6,0,8,0
chr1	46806480	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:2,6:4,10:2,4,12,4
chr1	46810842	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,362;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	46812519	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,312;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	46818508	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	46826587	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	46827214	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr1	46827591	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	46871088	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=210,34763419;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:5,3,1,1
chr1	46874936	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=228,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:3,0:10,4:0,13,0,4
chr1	46877180	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr1	47013364	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,10,7
chr1	47014821	.	A	AAAAG,AAAAAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29,31;MFRL=140,113,137;MMQ=60,46,42;MPOS=20,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.34,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,8,4:0.448,0.259:18:3,3,2:3,5,2:3,3,7,5
chr1	47016761	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,23:0.570:40:9,12:8,10:7,10,13,10
chr1	47025839	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr1	47034144	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=151,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:13,1:8,2:10,11,1,2
chr1	47059819	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:3,7,0,2
chr1	47059934	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	47108828	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,6,4
chr1	47110766	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	47138444	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,8,0
chr1	47181920	.	CAAAAAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=60757586,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=26,17;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.399:3:0,1:1,0:1,1,1,0
chr1	47278099	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,16;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.576:3:0,0:1,0:1,0,2,0
chr1	47278102	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=17,16;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr1	47278107	.	CT	GG,GT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=12,16,33;MFRL=175,251,157;MMQ=60,60,60;MPOS=7,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.04,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.333,0.333:3:0,0,1:0,0,0:1,0,2,0
chr1	47280085	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=185,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	47280746	.	GAT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=111,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:6,1:5,5,2,0
chr1	47280859	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=117,241;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:4,5,2,1
chr1	47280884	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=139,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,3:5,2:4,6,2,3
chr1	47282772	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:8,3,1,2
chr1	47282888	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,1:2,2:2,8,1,2
chr1	47398743	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=248,159;MMQ=56,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,6:1,3:1,1,4,5
chr1	47400059	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	47402487	.	TTG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=184,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.645:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr1	47495605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=154,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:2,2:1,1:3,1,3,0
chr1	47501704	.	T	TATACTTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=133,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:9,2:5,0:0|1:47501704_T_TATACTTC:47501704:9,6,1,1
chr1	47501705	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=133,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:0|1:47501704_T_TATACTTC:47501704:9,6,1,1
chr1	47504470	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47504470_G_A:47504470:0,2,0,1
chr1	47504473	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:47504470_G_A:47504470:0,2,0,1
chr1	47560403	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=146,130;MMQ=50,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,4,0,1
chr1	47560409	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=154,134;MMQ=40,48;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,1,0,2
chr1	47560413	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=154,134;MMQ=40,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,1,0,2
chr1	47560416	.	AG	GA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=154,134;MMQ=40,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,1,0,2
chr1	47560419	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=154,134;MMQ=40,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:47560403_G_T:47560403:0,1,0,2
chr1	47571902	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=146,187;MMQ=52,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:12,3:15,0:0|1:47571902_C_T:47571902:12,16,3,0
chr1	47571905	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=148,187;MMQ=52,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:10,2:16,0:0|1:47571902_C_T:47571902:12,14,3,0
chr1	47571943	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,35,33,19;MFRL=235,205,191,169;MMQ=60,60,60,60;MPOS=12,26,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.93,3.25,8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,2,5:0.191,0.237,0.424:10:1,1,1,1:0,1,1,1:0,1,2,7
chr1	47571996	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,2:3,1:0,11,0,3
chr1	47582246	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,5:2,0:5,3,4,1
chr1	47582292	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=59,139;MMQ=27,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:19,1:1,1:15,5,2,0
chr1	47607762	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,3,2
chr1	47607785	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=169,195;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:4,4,3,3
chr1	47607851	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=197,213;MMQ=60,51;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:4,2,3,4
chr1	47609668	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=154,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	47611849	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=109,212;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:4,6,0,2
chr1	47614434	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,170;MMQ=52,46;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:3,5,1,1
chr1	47649788	.	GCACTTGTGACAGTAATAGCTTCCAGAATAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.285:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr1	47735280	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	47746811	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=154,99;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:5,3:9,0:3,11,1,2
chr1	47753405	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr1	47765490	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=298,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	47767141	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=229,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	47770786	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	47838725	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,4:8,0:6,11,4,0
chr1	47840627	.	G	GCAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,1,1
chr1	47841038	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr1	47903846	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47903846_C_T:47903846:0,0,1,0
chr1	47903856	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:47903846_C_T:47903846:0,0,1,0
chr1	47905017	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=206,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr1	47905555	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=253,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,1:1,2:4,1,2,1
chr1	47905782	.	CTTTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=23,19;RU=T;STR;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.705:9:0,0:2,4:1,2,0,6
chr1	47906425	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	48695081	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=159,136;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.760:23:2,10:3,8:3,2,6,12
chr1	48701330	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:6,1:11,0,2,0
chr1	48701567	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	48705137	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=170,88;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.185:23:12,3:7,0:8,11,4,0
chr1	48705252	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:0,1:0|1:48705252_CCT_C:48705252:1,3,0,1
chr1	48705258	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0|1:48705252_CCT_C:48705252:1,0,0,2
chr1	48869453	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:8,10,1,1
chr1	49056695	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=146,246;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,1:1,4:0,3,0,6
chr1	49056741	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=286,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.253:6:1,0:4,1:0|1:49056741_A_AT:49056741:0,5,0,1
chr1	49056749	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:49056741_A_AT:49056741:0,3,0,1
chr1	49056753	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,30;MFRL=306,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:49056741_A_AT:49056741:0,1,0,1
chr1	49100332	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr1	49128720	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=213,336;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	49332969	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,1,12
chr1	50513886	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:50513886_C_T:50513886:0,0,1,0
chr1	50513889	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:50513886_C_T:50513886:0,0,1,0
chr1	50574915	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=170,49;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,2:5,0:0|1:50574915_G_T:50574915:3,9,1,1
chr1	50574917	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=181,49;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:5,0:0|1:50574915_G_T:50574915:3,10,1,1
chr1	50574919	.	GAAAA	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=181,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:50574915_G_T:50574915:3,8,1,1
chr1	50574925	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=181,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:50574915_G_T:50574915:3,8,1,1
chr1	50575675	.	CTG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:0,1:2,1,1,1
chr1	50661361	.	CCCAGCCAGAAGT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,0:9,2:10,12,1,1
chr1	50661411	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,11:0,0,12,10
chr1	50666515	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,135;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:2,4:3,2:0,5,2,5
chr1	50884778	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	50957509	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,5:0,3:0,0,4,4
chr1	51001207	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51001207_G_T:51001207:0,0,0,1
chr1	51001208	.	A	AGTGGCT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51001207_G_T:51001207:0,0,0,1
chr1	51001212	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,80;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51001207_G_T:51001207:0,0,0,1
chr1	51253765	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.180:24:4,3:14,0:10,10,4,0
chr1	51611401	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,100;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:5,5,0,2
chr1	51761796	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,0:8,3:10,7,0,3
chr1	51767352	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:4,4,0,3
chr1	51767462	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51767462_A_C:51767462:0,0,0,1
chr1	51767463	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51767462_A_C:51767462:0,0,0,1
chr1	51767466	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51767462_A_C:51767462:0,0,0,1
chr1	51768011	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=167,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:14,2:9,0:9,15,1,1
chr1	51864651	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=142,100;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	51912861	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:51912861_T_G:51912861:0,2,0,1
chr1	51912867	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:51912861_T_G:51912861:0,2,0,1
chr1	51937334	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,11:0.218:53:17,11:25,0:35,7,11,0
chr1	52082682	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,10;MFRL=198,280;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.587:3:0,0:1,0:0|1:52082682_G_C:52082682:1,0,2,0
chr1	52082686	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,12;MFRL=160,280;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.482:4:0,0:0,0:0|1:52082682_G_C:52082682:1,1,2,0
chr1	52082689	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,16;MFRL=122,270;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.665:4:1,0:0,0:0|1:52082682_G_C:52082682:0,1,3,0
chr1	52082693	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=122,270;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.665:4:1,0:0,1:0|1:52082682_G_C:52082682:0,1,3,0
chr1	52279650	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,5:0,10:0,0,10,5
chr1	52290984	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:2,2,3,6
chr1	52293570	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr1	52293638	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	52306027	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=108,200;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,1:12,2:9,9,1,2
chr1	52306063	.	ATCT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCT;STR;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.612:21:3,9:5,4:1,7,5,8
chr1	52402956	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	52489322	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,1,5
chr1	52499517	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=179,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:52499517_T_C:52499517:0,2,0,1
chr1	52499527	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:52499517_T_C:52499517:0,3,0,1
chr1	52517412	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	52729425	.	T	TGGGGGCGGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=146,163;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.496:2:0,0:1,0:1,0,1,0
chr1	52729436	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	52732311	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=176,187;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr1	52820226	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	52821418	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:52821418_G_GA:52821418:4,12,1,1
chr1	52821419	.	G	GTAGCTGGGATTAC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:0|1:52821418_G_GA:52821418:4,12,1,1
chr1	52825297	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:4,3,2,0
chr1	52827212	.	TTCCTCC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=65,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=TCC;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:4,2,0,2
chr1	52850801	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.666:16:2,11:3,0:4,1,11,0
chr1	52870325	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,188;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr1	52896751	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,1:9,1:8,10,0,2
chr1	52902670	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	52912122	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,26,27;MFRL=200,238,203;MMQ=60,60,60;MPOS=11,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.22,10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.214,0.429:11:2,0,1:0,2,3:1,3,1,6
chr1	52947350	.	TAA	T,TA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24,24;MFRL=243,191,239;MMQ=60,60,60;MPOS=15,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.80,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,3:0.203,0.213:16:5,1,2:5,2,1:5,5,6,0
chr1	52959319	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:17,3:19,0:15,21,0,3
chr1	52991506	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,75;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,6:0.145:46:19,0:19,6:27,13,5,1
chr1	53153432	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:2,3,1,3
chr1	53250650	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=111,186;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,4:7,2:4,10,1,5
chr1	53261954	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,97;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:3,6:12,0:9,6,4,2
chr1	53262569	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53267474	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=147,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:4,1,2,0
chr1	53267488	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,10;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,0:2,0:3,2,4,0
chr1	53282362	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=117,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr1	53308665	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=200,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:1,1,2,3
chr1	53323492	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	53363177	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=129,102;MMQ=60,22;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:4,0:10,5:4,10,0,5
chr1	53364976	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr1	53377366	.	AG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,12;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:53377366_AG_CC:53377366:1,3,1,0
chr1	53377371	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:53377366_AG_CC:53377366:1,3,1,0
chr1	53387215	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=169,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:7,2,2,1
chr1	53387379	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr1	53453640	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=110,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:5,1,3,1
chr1	53453683	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:9,1:2,5:3,8,5,1
chr1	53453714	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,0:3,3:6,7,3,0
chr1	53493784	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=223,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,0:1,2:0|1:53493784_CT_C:53493784:0,2,1,1
chr1	53493791	.	AA	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=215,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,0:1,1:0|1:53493784_CT_C:53493784:0,3,1,1
chr1	53513423	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr1	53527793	.	C	CGGG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,34;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=G;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.378:5:3,1:0,1:0|1:53527793_C_CGGG:53527793:3,0,2,0
chr1	53527798	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr1	53527799	.	G	GGGT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,34;MFRL=141,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGT;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr1	53527802	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.286:7:3,1:0,0:0|1:53527793_C_CGGG:53527793:5,0,2,0
chr1	53527807	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=153,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.286:7:5,1:0,0:0|1:53527793_C_CGGG:53527793:5,0,2,0
chr1	53527996	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	53532609	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:6,2:1,1:2,6,1,2
chr1	53535478	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.784:12:1,5:1,4:0|1:53535478_G_A:53535478:2,0,7,3
chr1	53535499	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.306:11:3,2:5,1:1|0:53535478_G_A:53535478:4,4,3,0
chr1	53543112	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	53543312	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:0,3:3,0,4,0
chr1	53546606	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=226,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	53547840	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=224,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	53547843	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=207,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	53554533	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:3,1,2,1
chr1	53556242	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=228,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,2:3,0:1,3,2,0
chr1	53556250	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=216,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,3,0
chr1	53568980	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:4,2,4,1
chr1	53571288	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	53608133	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=151,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr1	53683921	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=111,132;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=59.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,19:0.668:28:4,15:5,4:3,6,1,18
chr1	53686383	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	53699244	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:0|1:53699244_C_T:53699244:7,13,1,1
chr1	53699248	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=137,57;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:53699244_C_T:53699244:7,13,1,1
chr1	53716416	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=181,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,5:5,5:6,2,6,4
chr1	53723190	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=238,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,2:5,1:1,5,0,3
chr1	53736613	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr1	53742506	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr1	53930450	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:2,0:3,1:0|1:53930450_G_C:53930450:1,5,2,0
chr1	53930453	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,18;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.304:8:2,0:3,1:0|1:53930450_G_C:53930450:1,5,2,0
chr1	53930456	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=229,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,1:0|1:53930450_G_C:53930450:1,6,2,0
chr1	53974987	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,7,7
chr1	54266314	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=167,35;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr1	54298189	.	CTTA	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTA;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:10,0:12,2:17,7,1,1
chr1	54298297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,2:5,0:2,7,0,2
chr1	54303827	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54303827_C_G:54303827:0,0,1,0
chr1	54303830	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54303827_C_G:54303827:0,0,1,0
chr1	54303834	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:54303827_C_G:54303827:0,0,1,0
chr1	54303839	.	GA	CC	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:54303827_C_G:54303827:0,0,1,0
chr1	54344282	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=108,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr1	54344296	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=157,242;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,5:4,0:7,2,5,0
chr1	54370264	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=132,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,0:3,3:4,2,3,0
chr1	54370516	.	CCCACTGT	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:1,2:0|1:54370516_CCCACTGT_C:54370516:3,6,0,2
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chr1	54370529	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:54370516_CCCACTGT_C:54370516:3,6,0,2
chr1	54370532	.	T	TTC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=175,198;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,2:0|1:54370516_CCCACTGT_C:54370516:3,5,0,2
chr1	54370535	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=163,198;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0|1:54370516_CCCACTGT_C:54370516:3,4,0,2
chr1	54375701	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:1,4,0,3
chr1	54477726	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	54483694	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=199,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:2,1:2,7:3,2,3,5
chr1	54483792	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=86,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:9,1:5,2:9,6,2,1
chr1	54502436	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=111,60;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr1	54561916	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,8:2,4:3,0,9,3
chr1	54605319	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=93,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,5:1,10:1,1,6,9
chr1	54607157	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr1	54618435	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=16365647,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,3:0,4:1,1,5,2
chr1	54670658	.	CCTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	54675849	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:1,5,0,3
chr1	54683732	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	54686464	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=113,187;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,5:4,5:4,6,5,5
chr1	54692854	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=208,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	54694214	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:3,4,2,1
chr1	54703702	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr1	54704629	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	54707939	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr1	54871551	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=111,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:54871551_G_C:54871551:1,0,2,0
chr1	54871555	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,19;MFRL=111,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,0:0|1:54871551_G_C:54871551:1,0,2,0
chr1	54871562	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=141,252;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:54871551_G_C:54871551:1,1,1,0
chr1	54871566	.	ACCGC	CCCGC,A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,12,28;MFRL=0,252,141;MMQ=60,60,60;MPOS=2,8;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.55,6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,0,0:0,0,2:0,0,2,1
chr1	54871709	.	T	TCGC,TCGCCGC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32,28;MFRL=0,141,145;MMQ=60,60,60;MPOS=23,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=CGC;STR;TLOD=3.07,15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.247,0.659:5:0,0,1:0,1,2:0,0,2,3
chr1	55069986	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=231,193;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:0,2:2,1:3,0,3,0
chr1	55072726	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=253,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	55072856	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:6,7,1,1
chr1	55074570	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,12;MFRL=144,195;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.604:8:0,0:0,0:3,0,5,0
chr1	55074840	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:1,3,0,4
chr1	55074922	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=233,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,2,1
chr1	55080612	.	GGTGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GT;STR;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0|1:55080612_GGTGT_G:55080612:0,0,0,4
chr1	55080629	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:55080612_GGTGT_G:55080612:0,0,0,5
chr1	55118566	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,11:0,4:0,0,10,5
chr1	55130931	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=143,50;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:7,4:1,0:4,5,1,3
chr1	55130946	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=160,50;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:4,4:0,0:1,4,1,3
chr1	55130972	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	55134487	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=174,328;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:3,2,2,3
chr1	55134526	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=205,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:6,7,1,2
chr1	55134585	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.686:14:2,2:2,7:1,3,3,7
chr1	55136067	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr1	55136148	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:7,4,1,4
chr1	55136330	.	C	CCCAG	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,16;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,0:0,3,2,0
chr1	55136333	.	T	C,TTTCCTTACCAGAATCTAGAACTTCTAAGG	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=32,32,29;MFRL=212,189,286;MMQ=60,60,60;MPOS=25,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.36,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.375,0.250:5:0,1,1:2,1,0:0,2,2,1
chr1	55136338	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,12;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,0:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,3,2,0
chr1	55136344	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=35,33;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,3,2,0
chr1	55136350	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=233,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,3,2,0
chr1	55136355	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=242,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:3,0:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,5,2,0
chr1	55136356	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=194,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:3,1:2,2,0,2
chr1	55136357	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=35,23;MFRL=246,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,0:0|1:55136338_CAA_C:55136338:0,4,2,0
chr1	55138673	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr1	55139912	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=209,279;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	55144525	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,5:3,1:3,5,2,4
chr1	55174819	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr1	55197149	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:2,1,3,4
chr1	55199420	.	ATTTTTTTT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=26,18;RU=T;STR;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.886:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	55253575	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	55253594	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,1:1,1:3,1,0,2
chr1	55266845	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=175,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	55271774	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=191,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	55273422	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=254,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:1,1,0,4
chr1	55277430	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	55277440	.	C	CGGGGGGGGGGGGCGGGCG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=162,252;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:55277440_C_CGGGGGGGGGGGGCGGGCG:55277440:0,2,1,0
chr1	55277441	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,0;MFRL=162,252;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:55277440_C_CGGGGGGGGGGGGCGGGCG:55277440:0,2,1,0
chr1	55279708	.	G	GTTAATATTTTTAAGTCAACT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55279708_G_GTTAATATTTTTAAGTCAACT:55279708:1,3,0,1
chr1	55279710	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=105,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:55279708_G_GTTAATATTTTTAAGTCAACT:55279708:1,3,0,1
chr1	55330966	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr1	55336950	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=186,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	55446664	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:55446664_G_C:55446664:0,0,3,0
chr1	55446671	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:55446664_G_C:55446664:0,0,3,1
chr1	55446697	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.828:4:0,2:0,0:0,0,3,1
chr1	55457815	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	55464790	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=241,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,1:0,5:1,0,7,0
chr1	55473010	.	G	GATGGATCACTTGAGGCCA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=201,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	55505552	.	ACTG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=177,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:3,0:5,7,1,1
chr1	55505732	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr1	55517861	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=274,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr1	55517883	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	55518166	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=203,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,1,5
chr1	55518316	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:15,1:6,3:15,7,2,2
chr1	55518528	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	55521899	.	GGGGCGGA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGCGGA;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.715:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	55524116	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=185,93;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=72.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.933:28:1,11:0,13:1,0,26,1
chr1	55525400	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	55527323	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	55538022	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.144:19:9,0:7,2:0|1:55538022_C_T:55538022:7,10,0,2
chr1	55538027	.	G	GC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=143,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:55538022_C_T:55538022:8,10,0,2
chr1	55538028	.	A	ATT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=143,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:55538022_C_T:55538022:8,10,0,2
chr1	55538039	.	GAGA	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=163,90;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,1:7,2:8,9,0,3
chr1	55538385	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr1	55546895	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	55551718	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=280,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:2,4,2,4
chr1	55555285	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr1	55557859	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,5:0,3:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,11
chr1	55557864	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0|1:55557859_A_ATT:55557859:0,0,0,11
chr1	55558661	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr1	55562125	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,3:0,0,13,1
chr1	55563396	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,272;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.362:12:2,1:2,2:2,6,1,3
chr1	55564131	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,5:5,2:6,5,8,0
chr1	55566411	.	TTAGTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,9,0
chr1	55567410	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,0,12
chr1	55572867	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,9:0,0,10,3
chr1	55589174	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:9,1:7,5,1,1
chr1	55600181	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=230,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,0:0,5:0,3,5,0
chr1	55604692	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=148,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:5,2:13,1:0,18,0,3
chr1	55614036	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	55619422	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	55643837	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,8:0,6:0,1,1,14
chr1	57111169	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=144,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:2,2,1,6
chr1	57158051	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,2:7,2:9,7,1,3
chr1	57185818	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,4:0,6:1,1,8,2
chr1	57202879	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=198,229;MMQ=60,46;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,0:1,3:0|1:57202879_A_C:57202879:0,3,0,4
chr1	57202882	.	T	TTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=198,229;MMQ=60,46;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0|1:57202879_A_C:57202879:0,3,0,4
chr1	57216739	.	C	CAATCTTTA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=205,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,2:0|1:57216739_C_CAATCTTTA:57216739:3,1,1,1
chr1	57216741	.	G	GAAGCATTTTAATGTTAAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=205,51;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.368:6:3,0:1,2:0|1:57216739_C_CAATCTTTA:57216739:3,1,1,1
chr1	57219539	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,2:4,1:5,7,2,1
chr1	57219631	.	G	GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=105,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	57233537	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=160,43;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,3:5,0:11,2,2,1
chr1	57320593	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,4:6,0:3,9,4,0
chr1	57347205	.	A	AAATG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=151,81;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:8,1:2,1:3,7,0,2
chr1	57395251	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	57395294	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	57409329	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,1:5,3:5,5,3,1
chr1	57417633	.	G	GGGATGTGTCCAAGGTCACACA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=273,78;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,3:3,0,5,0
chr1	57420285	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr1	57425888	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:7,1:1,1:1,7,0,2
chr1	57480896	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=190,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:1,3,1,1
chr1	57491662	.	A	AGATGGATATGAGAGCTCTAATAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=174,54;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:4,2:7,0:8,3,1,1
chr1	57535198	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=196,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	57535205	.	GGC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=189,194;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	57602211	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=167,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:10,2:0|1:57602211_C_T:57602211:7,5,2,0
chr1	57602218	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=167,66;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:9,2:0|1:57602211_C_T:57602211:7,5,2,0
chr1	57602334	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:3,1:4,1:1,6,1,1
chr1	58971831	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=118,147;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:4,3:10,3:5,9,4,2
chr1	58971940	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	58996203	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	59004979	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	59043204	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=172,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:59043204_G_C:59043204:17,5,2,0
chr1	59043214	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=165,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,0:12,2:0|1:59043204_G_C:59043204:17,7,2,0
chr1	59125894	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0|1:59125894_A_G:59125894:0,5,0,3
chr1	59125899	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0|1:59125894_A_G:59125894:0,5,0,3
chr1	59127024	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=225,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:2,6,3,1
chr1	59127193	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=205,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,5:2,2:2,6,1,6
chr1	59131311	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	59134586	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:10,1,4,1
chr1	59134607	.	C	CAG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=76.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,4:0,14:0,0,12,7
chr1	59139223	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,6:7,1:11,3,5,2
chr1	59147420	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,109;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,2:6,3:7,3,4,1
chr1	59150941	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr1	59150997	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=181,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:5,1:2,1:0,8,0,2
chr1	59156155	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:0,6,0,9
chr1	59158632	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:4,0:0,2:1,3,1,1
chr1	59160724	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28,25;MFRL=145,150,140;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,0:1,0,1:1,2,2,0
chr1	59160735	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=150,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:2,1,1,2
chr1	59160982	.	ATACT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr1	59844471	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:3,5:12,5:4,11,6,4
chr1	60019769	.	ATTTGTT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=207,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTGTT;STR;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:6,0:7,2:16,4,1,1
chr1	60091792	.	T	TGAAGATA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:60091792_T_TGAAGATA:60091792:1,6,0,2
chr1	60091794	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=147,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:0|1:60091792_T_TGAAGATA:60091792:1,6,0,2
chr1	60228310	.	T	TTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=206,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,8:1,4:0,2,6,6
chr1	60280749	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	60287421	.	GT	G,GTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,162,173;MMQ=60,60,60;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.23,4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.424,0.430:4:0,0,1:0,2,1:0,0,4,0
chr1	60314648	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=211,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:8,0,3,0
chr1	60314703	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:0,5:7,3:7,1,7,1
chr1	60324818	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=172,327;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr1	60328613	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=207,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:0,5,0,5
chr1	60331664	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=221,54;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,3:4,0:5,2,1,2
chr1	60338684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=161,252;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:1,11,0,3
chr1	60463521	.	T	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	60466814	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=186,207;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,3:1,1:3,2,2,3
chr1	60466911	.	ACAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	60491030	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,35;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:6,2:5,0:10,2,1,1
chr1	60505578	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr1	60505783	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=149,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,4:7,1:7,3,0,5
chr1	60506744	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=119,268;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,0:4,3:6,6,1,2
chr1	60521102	.	T	TCTAGGGTAGGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=119,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:1,3,1,1
chr1	60538311	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0|1:60538311_G_A:60538311:0,5,1,1
chr1	60538313	.	C	CAAAACA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,2:0|1:60538311_G_A:60538311:0,5,1,1
chr1	61548344	.	TTCTC	T,TTC	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,25,25;MFRL=148,197,0;MMQ=60,60,60;MPOS=13,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TC;STR;TLOD=3.71,5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,2,3:0.101,0.159:22:8,0,3:6,2,0:14,3,5,0
chr1	61554048	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=168,256;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:6,6,1,2
chr1	61872215	.	GCCC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=149,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=C;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.706:5:0,1:1,3:0|1:61872215_GCCC_G:61872215:0,1,0,4
chr1	61872228	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=200,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.456:9:2,3:3,1:0|1:61872215_GCCC_G:61872215:0,5,1,3
chr1	61892170	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:17,3:10,0:15,12,3,0
chr1	61892301	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,1,12
chr1	62149237	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,1:7,1:4,12,0,2
chr1	62160542	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	62189405	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=148,114;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,0:10,2:11,10,0,2
chr1	62189427	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=141,114;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:10,12,0,2
chr1	62231924	.	T	TTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=138,207;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGA;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	62274312	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=53483670,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	62293170	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,181;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,0:9,12:7,8,0,12
chr1	62299478	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=145,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:5,0:0,3:0,5,0,3
chr1	62340855	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	62350123	.	GTTTTTT	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=22,16;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,1:2,0:0,3,0,1
chr1	62350141	.	T	TAAGATAGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=146,155;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62350141_T_TAAGATAGG:62350141:0,4,0,1
chr1	62350143	.	T	TCTCGCTCTG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,23;MFRL=146,155;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:62350141_T_TAAGATAGG:62350141:0,4,0,1
chr1	62350145	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=146,155;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:62350141_T_TAAGATAGG:62350141:0,4,0,1
chr1	62365217	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,118;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	62366878	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	62366968	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,6:7,0:7,7,5,1
chr1	62380270	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,8:0,10:0,0,10,8
chr1	62380298	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=101,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:8,2:4,5:9,3,3,4
chr1	62393394	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr1	62393468	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,3:7,0:8,9,3,0
chr1	62417951	.	A	AG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.852:22:2,11:1,8:2,1,18,1
chr1	62418129	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=90,90;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.251:38:17,0:11,9:7,22,0,9
chr1	62456014	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=135,126;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:5,4,3,4
chr1	62456048	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:3,2,0,3
chr1	62550128	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr1	62550173	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=208,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:3,2,3,1
chr1	62550230	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=203,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:1,3,4,3
chr1	62566018	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=112,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:9,2:4,0:11,3,2,0
chr1	62579672	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	62587014	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	62588754	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:3,2,0,2
chr1	62594677	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=188,98;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:0,6,0,2
chr1	62673037	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr1	62675619	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=70,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,31:0.830:37:1,22:4,8:2,4,17,14
chr1	62675644	.	ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC	A	.	.	DP=74;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=72.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,17:0.824:22:3,10:1,7:4,1,7,10
chr1	62677048	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=34.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr1	62704048	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=182,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:62704048_G_C:62704048:4,10,1,1
chr1	62704054	.	C	CAAGGTTATACCAGTTTTCACTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=204,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:62704048_G_C:62704048:3,8,1,1
chr1	62729015	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,2,6
chr1	62733939	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:3,2,2,1
chr1	62739324	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:2,7,0,4
chr1	62939634	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	62953183	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr1	62961928	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	62973795	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	63001120	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr1	63027411	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,1,13
chr1	63044415	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,24;MFRL=149,172;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:1,0:5,1,2,0
chr1	63044425	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=165,144;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:2,1:0|1:63044425_G_A:63044425:6,1,3,0
chr1	63044429	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=165,144;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,0:2,0:0|1:63044425_G_A:63044425:6,1,3,0
chr1	63044645	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,4:1,0:3,5,1,3
chr1	63052103	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,349;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	63066947	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=151,71754962;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr1	63085714	.	GG	AA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=151,99;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:5,2:0|1:63085714_GG_AA:63085714:4,13,1,1
chr1	63085717	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=151,99;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:63085714_GG_AA:63085714:4,13,1,1
chr1	63085719	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=151,99;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:6,2:0|1:63085714_GG_AA:63085714:4,13,1,1
chr1	63096948	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=136,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.166:40:19,0:15,6:7,27,0,6
chr1	63113511	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	63113689	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	63113719	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	63153987	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:63153987_G_A:63153987:0,2,0,1
chr1	63153992	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:63153987_G_A:63153987:0,2,0,1
chr1	63270823	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,31,32;MFRL=114,138,138;MMQ=60,60,60;MPOS=19,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.77,3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.160,0.249:14:6,1,1:1,1,2:7,2,5,0
chr1	63270923	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=142,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:15,5:11,0:9,17,0,5
chr1	63307303	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=231,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	63329699	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=157,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:11,0:7,9:8,10,0,9
chr1	63872017	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:6,0:10,6:7,9,0,6
chr1	63872871	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr1	63872905	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=200,248;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr1	63912546	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.282:9:5,0:2,2:4,3,0,2
chr1	63920090	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:14,7,0,2
chr1	63920515	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=94,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,3,2
chr1	63988904	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=224,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr1	63997633	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=130,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr1	63998326	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:10,0,3,0
chr1	64021096	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,2:6,1:8,6,2,1
chr1	64036838	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:2,7,1,4
chr1	64038107	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=110,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,1:10,2:9,10,1,2
chr1	64100478	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:9,4,3,2
chr1	64102114	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=245,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr1	64117537	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr1	64125234	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,3:7,0:7,3,2,1
chr1	64125368	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=196,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:6,4:6,4:3,10,2,6
chr1	64125439	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=203,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	64608059	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,4:1,0:4,0,1,3
chr1	64624612	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	64624842	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:6,6,1,2
chr1	64643277	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,3:6,4:6,6,7,0
chr1	64644069	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=103,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:9,2:8,2:10,7,2,2
chr1	64644409	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,136;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,6:8,0:6,9,6,0
chr1	64644545	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,0:5,4:2,6,0,4
chr1	64680682	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,155;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr1	64707243	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	64726414	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=136,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:3,2:2,2:2,3,0,4
chr1	65068638	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,2,4
chr1	65099701	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr1	65099978	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr1	65138787	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.643:9:1,2:2,1:3,0,4,2
chr1	65141676	.	TTAATAATAATAATAA	T,TTAATAATAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,29,33;MFRL=188,210,227;MMQ=60,60,60;MPOS=29,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,13;RU=TAA;STR;TLOD=8.94,7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.287,0.472:7:1,2,0:0,1,3:0,1,1,5
chr1	65143881	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:6,0:10,3:10,8,0,3
chr1	65255018	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr1	65278477	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,105;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:7,5,2,0
chr1	65310489	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=115,201;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:8,6:5,1:7,6,3,4
chr1	65316675	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:0,9,0,4
chr1	65321388	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:14,4:8,3:7,15,3,4
chr1	65330590	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,103;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.283:37:8,0:18,10:12,15,0,10
chr1	65330682	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:1,6,0,4
chr1	65335103	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:12,3:14,0:13,13,0,3
chr1	65614260	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr1	65830297	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=242,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:2,1:0|1:65830297_G_T:65830297:3,1,4,0
chr1	65830299	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=242,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,1:3,2:0|1:65830297_G_T:65830297:3,1,4,0
chr1	65860687	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=115,119;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:3,7,2,2
chr1	65867391	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=233,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:4,1,2,0
chr1	65874519	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr1	66036501	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	66037984	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=91,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	66062325	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,1,1
chr1	66064293	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,1,1
chr1	66067563	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:5,0:12,13:8,9,0,13
chr1	66085574	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=172,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:2,3,4,3
chr1	66085630	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=181,207;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:5,14:11,0:0|1:66085630_G_C:66085630:7,9,14,0
chr1	66085635	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=181,207;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,14:0.469:30:5,13:10,0:0|1:66085630_G_C:66085630:7,9,14,0
chr1	66088701	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=185,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr1	66102168	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,0:4,4:1,10,0,4
chr1	66102459	.	AAG	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=160,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AG;STR;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:8,4,0,2
chr1	66732299	.	G	GTGTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=195,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TGTTT;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:3,4:3,0:4,2,4,0
chr1	66732529	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=355,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	66829262	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=83.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,1,22
chr1	67000103	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:3,2,2,2
chr1	67109335	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,3:6,2:5,5,4,1
chr1	67126114	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	67138877	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:8,0,2,0
chr1	67142675	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,99;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,4:6,4:3,6,5,3
chr1	67145322	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	67149706	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	67154730	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=70,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,3:1,0:1,1,3,0
chr1	67155862	.	TCTC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:5,1,6,3
chr1	67160981	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=132,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.310:14:10,3:0,1:8,2,2,2
chr1	67194911	.	TTC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TC;STR;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:7,2,3,3
chr1	67206895	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,179;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:5,4:3,0:7,1,5,0
chr1	67288045	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr1	67292473	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=175,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:67292473_A_AT:67292473:0,1,1,2
chr1	67292478	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=55,224;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.503:6:2,2:1,1:0|1:67292473_A_AT:67292473:1,2,1,2
chr1	67293616	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr1	67396222	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=205,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	67423997	.	T	TTTCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	67425311	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,6:0,4:0,1,7,4
chr1	67425476	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:1,7,3,3
chr1	67425494	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.460:9:1,3:4,1:1,4,0,4
chr1	67428898	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr1	67438535	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr1	67447450	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=140,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,1:14,2:17,8,2,1
chr1	67450431	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=126,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,4:7,4:8,6,3,5
chr1	67470162	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=229,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:2,5,0,2
chr1	67474921	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,176;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:0,0:3,17:0,3,0,17
chr1	67487119	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=240,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr1	67508080	.	CCACT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr1	67512903	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr1	67512920	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr1	67560897	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	67562106	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	67577367	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr1	67591347	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	67591660	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	67591689	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	67648460	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr1	67666401	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.348:14:6,3:3,2:8,1,4,1
chr1	67672765	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:2,4,0,2
chr1	67685443	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr1	67721562	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=124,91;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:3,0:14,3:7,10,1,2
chr1	67792626	.	T	TTTTATTTATTTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,42;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=TTTA;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.704:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	67796258	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	67890526	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:8,6:13,1:11,10,4,3
chr1	67891891	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,51;MMQ=60,31;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,0:13,2:12,13,0,2
chr1	68151980	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	68173264	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=181,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:7,2,3,1
chr1	68591884	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,4:5,3:4,4,4,3
chr1	68620762	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:8,0,2,1
chr1	68620998	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr1	68905358	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=141,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,1,5
chr1	68915479	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=152,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:3,2,4,1
chr1	68943436	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=184,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0|1:68943436_G_A:68943436:5,2,2,0
chr1	68943442	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=183,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:0|1:68943436_G_A:68943436:6,2,3,0
chr1	68943665	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:1,9,0,2
chr1	68947318	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=30.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:0,5:3,6:0,4,1,10
chr1	68955352	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=216,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr1	70034370	.	C	CCAGCCGCGTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,0:2,0,0,3
chr1	70225832	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr1	70618215	.	AG	CA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=131,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=68.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:6,0:13,18:9,10,0,18
chr1	70639163	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,1:5,1:7,8,2,0
chr1	70654981	.	GAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,14;MFRL=126,278;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.614:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr1	70712592	.	TA	CC	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=110,50;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:12,0:11,4:0|1:70712592_TA_CC:70712592:9,16,2,2
chr1	70712596	.	GT	TG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:10,0:10,4:0|1:70712592_TA_CC:70712592:9,14,2,2
chr1	70712602	.	T	TATATATATATA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=114,50;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:10,0:9,4:0|1:70712592_TA_CC:70712592:8,11,2,2
chr1	70715663	.	G	GTTTCAAACCTGCTCTAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=143,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:11,6,0,2
chr1	70820802	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:11,6:12,3:9,14,6,3
chr1	70833460	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,265;MMQ=60,41;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	70881775	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=172,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,0:3,8:0,6,8,0
chr1	70887183	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	70896154	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=101,172;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.369:5:0,1:2,0:0|1:70896154_G_A:70896154:0,4,0,1
chr1	70896157	.	A	ATTTATATTCTTGCCTCTTATTTTTAATGTATCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=162,172;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:70896154_G_A:70896154:0,2,0,1
chr1	70896159	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=221,172;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	70904523	.	T	TTG,TTGTGTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30,33;MFRL=130,191,178;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,15,17;RU=TG;STR;TLOD=6.42,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.438,0.278:4:1,2,0:0,0,1:0,1,0,3
chr1	71478215	.	TG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=215,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	71512426	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=213,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr1	71533287	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,2:3,6:5,3,5,3
chr1	71537943	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=229,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,4:2,4:3,2,2,6
chr1	71544079	.	CAAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:1,4:1,9:2,0,10,3
chr1	72058405	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	72242039	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	74492550	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,2:4,1:4,8,0,3
chr1	74506942	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:4,9:6,1:3,7,5,5
chr1	74507315	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=111,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,9:4,4:4,4,9,4
chr1	74540253	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=217,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	74540517	.	T	TTCAAAAAG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,21;MFRL=149,34;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.364:6:3,2:1,0:0|1:74540517_T_TTCAAAAAG:74540517:0,4,0,2
chr1	74540519	.	T	TTA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=149,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.364:6:3,2:1,0:0|1:74540517_T_TTCAAAAAG:74540517:0,4,0,2
chr1	74540520	.	G	GTTATATGAA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=149,34;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:74540517_T_TTCAAAAAG:74540517:0,4,0,2
chr1	74610232	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,21;MFRL=182,173;MMQ=60,52;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:74610232_G_T:74610232:3,1,0,1
chr1	74610233	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=182,173;MMQ=60,52;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:74610232_G_T:74610232:3,1,0,1
chr1	74646514	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	74648408	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,1,4
chr1	74664149	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=202,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,2:5,0:0,5,0,2
chr1	74669973	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,325;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	74701295	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	74701950	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr1	74797265	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:0,8,0,2
chr1	74801864	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=222,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:0,3,1,3
chr1	74818936	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:3,2,1,1
chr1	74819077	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,7,13
chr1	74819108	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,127;MMQ=60,45;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,0:2,5:1,6,0,5
chr1	74901739	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=85,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,18;RU=T;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,3:0,0:0,2,3,0
chr1	74937749	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,3:4,6:3,4,5,4
chr1	75006027	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=148,122;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:1,2,1,2
chr1	75006076	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	75036783	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	75036812	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr1	75037857	.	CCCT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=198,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CCT;STR;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,5:4,0:3,6,1,4
chr1	75042637	.	A	AGTTGCC	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:0|1:75042637_A_AGTTGCC:75042637:2,10,0,3
chr1	75042640	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=141,111;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:0|1:75042637_A_AGTTGCC:75042637:2,10,0,3
chr1	75042709	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75042709_A_C:75042709:0,0,0,1
chr1	75042712	.	GCAAAT	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:75042709_A_C:75042709:0,0,0,1
chr1	75055419	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:10,3:6,4:9,7,5,2
chr1	75072264	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr1	75086412	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=248,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,1,2
chr1	75086665	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr1	75108863	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	75172756	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:4,4:0,5:2,4,4,5
chr1	75199103	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=170,60;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:13,0:15,3:0|1:75199103_G_C:75199103:9,19,2,1
chr1	75199108	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=180,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:12,0:14,3:0|1:75199103_G_C:75199103:8,19,2,1
chr1	75199111	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=181,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:12,0:14,3:0|1:75199103_G_C:75199103:8,18,2,1
chr1	75199152	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,1,18
chr1	75214390	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.556:9:3,3:0,2:0,4,3,2
chr1	75214441	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:7,5,1,1
chr1	75614380	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.680:10:1,2:1,4:1,2,4,3
chr1	75626420	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	75679569	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=163,300;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:3,1,2,1
chr1	75680433	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=223,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	75681351	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=219,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	75684529	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	75685403	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=211,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:7,0,4,0
chr1	75685643	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=228,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr1	75704099	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75704099_G_A:75704099:0,0,1,0
chr1	75704100	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75704099_G_A:75704099:0,0,1,0
chr1	75704103	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75704099_G_A:75704099:0,0,1,0
chr1	75704107	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=263,234;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75704099_G_A:75704099:1,0,1,0
chr1	75707652	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,0:4,3:5,3,2,1
chr1	75708529	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=20,28;MFRL=72,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr1	75708579	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=186,46;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:7,0:0|1:75708579_G_C:75708579:4,6,1,1
chr1	75708581	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=186,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:75708579_G_C:75708579:4,6,1,1
chr1	75708583	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=186,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:75708579_G_C:75708579:4,6,1,1
chr1	75708585	.	CAGTGGTCT	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=161,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:7,0:0|1:75708579_G_C:75708579:6,7,1,1
chr1	75716925	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=263,116;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.740:25:3,13:3,6:3,3,9,10
chr1	75740640	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr1	75740831	.	C	CCTTTCCACCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=219,191;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	76194229	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	76198436	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,0:8,3:3,7,1,2
chr1	76198785	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=164,120;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:8,6,2,0
chr1	76226906	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:8,5,0,2
chr1	76252011	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.499:34:9,6:8,11:7,10,9,8
chr1	76255613	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:4,4,3,0
chr1	76269372	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=189,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,1:3,2:4,2,2,1
chr1	76313874	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=57,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr1	76333172	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,1:7,5:10,2,4,2
chr1	76333288	.	T	TGTAAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=107,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:0|1:76333288_T_TGTAAA:76333288:6,5,0,2
chr1	76333292	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=107,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:76333288_T_TGTAAA:76333288:6,5,0,2
chr1	76333297	.	C	CAAAGAAAA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:76333288_T_TGTAAA:76333288:6,4,0,2
chr1	76333302	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=104,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:0|1:76333288_T_TGTAAA:76333288:6,4,0,2
chr1	76344011	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,2,5
chr1	76344856	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=148,248;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	76345640	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,4,1
chr1	76346832	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	76346920	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,8,3
chr1	76349534	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,0:2,3:1,7,1,2
chr1	76363505	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	76378357	.	ATATT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:3,1,1,0
chr1	76878156	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=192,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	77042405	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=198,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	77334268	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=154,218;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,4:7,1:3,10,1,4
chr1	77334292	.	G	GCAGCAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=149,174;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,2:3,1:2,6,1,2
chr1	77510222	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:10,12,0,2
chr1	77620035	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	77627096	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr1	77951907	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=230,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	78024345	.	C	CTAT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAT;STR;TLOD=114.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,14,14
chr1	78033981	.	AAAATG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATG;STR;TLOD=55.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.943:14:0,4:0,9:0,0,3,11
chr1	78045369	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	78098403	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,1:12,2:8,13,1,2
chr1	78099099	.	ATGT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:78099099_ATGT_A:78099099:0,3,0,1
chr1	78099110	.	AT	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:78099099_ATGT_A:78099099:0,3,0,1
chr1	78099113	.	ATGAG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:78099099_ATGT_A:78099099:0,3,0,1
chr1	78105067	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	78183670	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=166,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:10,2:3,1:8,5,2,1
chr1	78184345	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,1:9,2:11,9,3,0
chr1	78187444	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=194,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	78196274	.	AAAG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAG;STR;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr1	78200167	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr1	78207502	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,6:2,0:0,8,0,6
chr1	78245432	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=22,16;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:0,0:2,0:1,3,0,4
chr1	78245437	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=11,13;MFRL=24051878,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.620:6:0,1:0,0:0|1:78245437_C_G:78245437:1,1,0,4
chr1	78245442	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=19,13;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.703:5:0,1:0,0:0|1:78245437_C_G:78245437:0,1,0,4
chr1	78245447	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,23;MFRL=168,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.538:5:1,2:0,0:0,2,0,3
chr1	78281002	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	78332055	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.344:12:7,2:1,1:7,1,1,3
chr1	78338617	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	78383221	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=108,89;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,2:6,0:0|1:78383221_CT_C:78383221:10,6,2,0
chr1	78383225	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=106,89;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:78383221_CT_C:78383221:10,7,2,0
chr1	78383257	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=109,89;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,2:5,0:0|1:78383221_CT_C:78383221:10,11,2,0
chr1	78383264	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=115,89;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:15,2:6,0:0|1:78383221_CT_C:78383221:8,13,2,0
chr1	78383467	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	78392446	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=165,223;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.289:15:8,3:3,1:5,6,3,1
chr1	78399207	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=161,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0|1:78399207_C_G:78399207:0,5,1,3
chr1	78399212	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,5:0.500:10:1,1:4,4:1|0:78399207_C_G:78399207:1,4,0,5
chr1	78414310	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32,32;MFRL=190,186,193;MMQ=60,60,60;MPOS=2,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,17,20;RU=A;STR;TLOD=4.86,5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.334,0.332:9:2,1,1:1,2,0:3,0,6,0
chr1	78429215	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=172,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:2,2:9,2:10,1,4,0
chr1	78430689	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=47.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr1	78432647	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.186:20:7,1:6,1:11,6,1,2
chr1	78433801	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,2:6,2:5,8,2,2
chr1	78435701	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:4,1:7,4:4,8,1,4
chr1	78444734	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=203,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,0:2,4:0,6,0,4
chr1	78471049	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=127,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:0,1:3,2:0,7,1,2
chr1	78471060	.	T	TTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=147,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TC;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,2:2,3:1,2,0,6
chr1	78478675	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,2:1,0,5,1
chr1	78479281	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	78481640	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,4,0
chr1	78512053	.	CCGCCGCGCCG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=CGCCG;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	78591740	.	TAAC	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	79093910	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:5,2:7,3:8,4,3,2
chr1	79094081	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,2:3,5:2,6,1,6
chr1	79094593	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,10,7
chr1	79095339	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr1	79106899	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr1	79107304	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,0:4,3:6,10,0,3
chr1	79119975	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,161;MMQ=60,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:15,10,3,0
chr1	79120083	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,44028893;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr1	79128320	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=282,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	79128570	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=218,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:1,10:3,6:5,0,8,8
chr1	79355596	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=46,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.912:25:0,11:1,12:1,1,4,19
chr1	79358702	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=198,97;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr1	79383300	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:2,4,1,2
chr1	79383458	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=110,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:5,5:3,3:3,5,4,4
chr1	79387242	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=321,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr1	79392813	.	TAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0,4,0,1
chr1	79401927	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr1	79403450	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=146,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:1,4:6,3:6,1,7,0
chr1	79411888	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr1	82302600	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,3:5,1:9,0,4,0
chr1	82408874	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:5,5,0,2
chr1	82415814	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	82416220	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=262,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:2,0:0,7:0,2,1,6
chr1	82418682	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=129,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:10,2:5,2:8,7,1,3
chr1	82418710	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=152,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:15,0:7,2:0|1:82418710_G_C:82418710:10,13,1,1
chr1	82418716	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,82;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.108:26:13,0:8,2:0|1:82418710_G_C:82418710:12,12,1,1
chr1	82432242	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:10,5,0,2
chr1	82436281	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr1	82437548	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:5,4,2,0
chr1	82437670	.	ATTTGT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=153,50007929;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:0,1:0,5,0,2
chr1	82437682	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=157,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:0,1:0,5,0,3
chr1	82452565	.	GTT	G,GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,33,33;MFRL=170,187,163;MMQ=60,60,60;MPOS=16,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.79,4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.251,0.328:9:3,1,1:1,1,2:4,0,5,0
chr1	84383322	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=116,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:13,0:12,7:8,17,0,7
chr1	84386943	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=125,50;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,1:9,6,2,0
chr1	84412868	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=140,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:9,0:6,6:10,5,0,6
chr1	84765340	.	G	GTATATA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=TA;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,2:0,0,2,4
chr1	84791239	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	84864314	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=119,71;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:10,3:10,0:10,10,2,1
chr1	84876501	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,1:7,1:12,6,2,0
chr1	84878124	.	ACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCTCCTCACCACACTTCAGTCGGC	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=163,264;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,9:0.127:32:3,3:8,2:0|1:84878124_ACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCTCCTCACCACACTTCAGTCGGC_A:84878124:11,12,2,7
chr1	84878177	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,2:0.171:15:5,0:8,2:1|0:84878124_ACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCTCCTCACCACACTTCAGTCGGC_A:84878124:9,4,0,2
chr1	84878183	.	GG	TT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.130:22:12,0:7,1:1|0:84878124_ACCAGGGCCAGCTCATCAGAGATTCCTGGCAGGCTCCTCACCACACTTCAGTCGGC_A:84878124:9,11,0,2
chr1	84946745	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	84955478	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=166,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr1	84955999	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.377:43:13,16:13,0:12,15,16,0
chr1	84986213	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr1	84988200	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=113,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr1	84998445	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr1	84998637	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:5,4:4,7:4,5,6,5
chr1	84999571	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
chr1	85009864	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:8,4,3,0
chr1	85014464	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=147,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.520:14:4,2:2,4:2,5,2,5
chr1	85014690	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=235,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr1	85016112	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,4:5,2:4,9,1,5
chr1	85020979	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=176,164;MMQ=60,24;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.654:2:0,0:0,1:0|1:85020979_G_GT:85020979:0,1,0,1
chr1	85020983	.	A	ATGGATTGGAATGGAATGGAATGGAATGAAAGGGAATGGAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=222,164;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.653:2:0,0:0,0:0|1:85020979_G_GT:85020979:0,1,0,1
chr1	85035839	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=147,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,1,4
chr1	85036239	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=210,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:6,3,2,0
chr1	85039998	.	CGCAGCGCCA	C,CGCAGCGCCAGCAGCGCCA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=24,27,30;MFRL=218,161,166;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=3,2,4;RU=GCAGCGCCA;STR;TLOD=27.63,35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,9:0.358,0.540:18:0,4,3:1,4,6:0,1,1,16
chr1	85096589	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=129,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.673:10:0,2:3,5:1,2,0,7
chr1	85097247	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=128,233;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:6,2,2,0
chr1	85121983	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:4,2,4,0
chr1	85128262	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=195,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,1:1,4:1,1,1,4
chr1	85128280	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0,1,1,5
chr1	85128311	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	85131982	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr1	85132005	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=182,65;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:0,7,0,2
chr1	85135655	.	T	TGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr1	85331808	.	G	GAGA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=212,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=103.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.930:26:0,10:1,15:1,0,4,21
chr1	85397286	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,1,6
chr1	85397340	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr1	85406629	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:8,7,1,2
chr1	85418307	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	85422061	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=242,91;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	85424182	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,4,2
chr1	85424479	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=186,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	85462582	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=230,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,4:3,4:2,1,2,7
chr1	85462652	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=242,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr1	85462665	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=242,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr1	85488154	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr1	85537522	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	85538655	.	A	AAAG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=132,0;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.692:14:1,4:1,5:3,1,4,6
chr1	85547945	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=111,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr1	85550156	.	A	AAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AT;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.673:3:1,0:0,1:1,0,2,0
chr1	85551468	.	A	ATCAGTTTTTCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.624:6:2,2:0,1:1,1,4,0
chr1	85559118	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	85559302	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,92;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,1:11,1:10,10,2,0
chr1	85561546	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,9:0,3:0,0,11,1
chr1	85564138	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=177,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	85573705	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr1	85575838	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=123,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,1:1,2:3,2,2,1
chr1	85583323	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr1	85589939	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=60,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=31.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.583:17:4,6:3,4:2,5,5,5
chr1	85590031	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	85592126	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	85595645	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,5:1,5:4,1,8,2
chr1	85598527	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,8:0,3:0,0,6,5
chr1	85647713	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,11,2
chr1	85648620	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,7,4
chr1	85666327	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	85725032	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:13,3:5,0:13,5,2,1
chr1	85725353	.	GCCGGAAA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCGGAAA;STR;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:3,4:1,4:0,5,1,7
chr1	85741921	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=55.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,12:0,3:0,0,14,2
chr1	85787114	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,6,4
chr1	85824387	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:7,3,1,1
chr1	86046561	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:1,3:1,1:2,0,5,0
chr1	86047311	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=186,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0,3,1,4
chr1	86119898	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=179,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	86167957	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr1	86173298	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.702:14:2,4:1,6:3,1,8,2
chr1	86200555	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:0|1:86200555_G_A:86200555:9,9,1,1
chr1	86200561	.	T	TTCAGGG	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=141,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:0|1:86200555_G_A:86200555:8,9,1,1
chr1	86210546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	86246849	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr1	86249063	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	86249187	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=112,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:6,9,1,1
chr1	86249911	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr1	86252025	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,2,3
chr1	86252165	.	A	ACTACCAGCCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=193,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr1	86334150	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:3,0,4,0
chr1	86340262	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=71,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:1,1,5,3
chr1	86340880	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	86342866	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=148,178;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:2,0:7,2:0|1:86342866_A_T:86342866:4,6,0,3
chr1	86342870	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=145,178;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:2,0:9,3:0|1:86342866_A_T:86342866:6,7,0,3
chr1	86361802	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,1,1
chr1	86362184	.	AT	A,ATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28,27;MFRL=202,199,93;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.66,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.273,0.272:8:2,0,0:2,2,2:0,4,0,4
chr1	86435957	.	TA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=124,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.258:19:6,2:8,3:2,12,0,5
chr1	86453237	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chr1	86453265	.	CTCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TCT;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,2:6,1:6,2,3,0
chr1	86453409	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,7:0,3:0,1,3,7
chr1	86482922	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:2,3,0,9
chr1	86487981	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr1	86487992	.	A	AACAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr1	86497647	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,1:6,1:3,11,0,2
chr1	86529390	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:4,5:9,1:10,3,5,1
chr1	86554813	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=153,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.328:12:3,2:5,1:0|1:86554813_G_GA:86554813:7,1,3,1
chr1	86554821	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,18:0.827:21:0,13:3,5:0|1:86554813_G_GA:86554813:2,1,16,2
chr1	86820385	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,257;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr1	86821194	.	A	ACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	86826250	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,30;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:86826250_A_T:86826250:0,10,0,2
chr1	86826252	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:2,0:0|1:86826250_A_T:86826250:0,10,0,2
chr1	86826254	.	G	GAGGCA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=148,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:86826250_A_T:86826250:0,8,0,2
chr1	86826258	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=24,27;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:86826250_A_T:86826250:0,8,0,2
chr1	86890931	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,6:1,5:1,1,11,0
chr1	86891005	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=150,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=73.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,26:0.750:34:4,15:4,11:6,2,16,10
chr1	86891179	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.626:22:3,7:5,7:2,6,4,10
chr1	86896541	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,5:5,3:8,4,4,4
chr1	86896706	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr1	86897973	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,32;MFRL=180,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr1	86900491	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr1	86900525	.	GG	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=196,189;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:86900525_GG_CA:86900525:0,4,0,1
chr1	86900528	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=196,189;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:86900525_GG_CA:86900525:0,4,0,1
chr1	86909703	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,4:2,1:2,5,3,2
chr1	86919011	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=210,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	86939194	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:13,12,2,0
chr1	86939390	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,6:5,2:6,3,5,3
chr1	86948051	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=108,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.386:24:8,0:6,9:7,8,0,9
chr1	86951039	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=135,146;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:19,4:13,0:0|1:86951039_G_A:86951039:23,11,4,0
chr1	86951042	.	CA	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=136,146;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:21,4:14,0:0|1:86951039_G_A:86951039:24,11,4,0
chr1	86952399	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:3,11,3,0
chr1	86959014	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	86959796	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=243,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	86959989	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,55;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:86959989_C_T:86959989:10,9,1,1
chr1	86960006	.	G	GCTCCTCAAAACCTACCCACCTTCACAGAACTTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,55;MMQ=60,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:86959989_C_T:86959989:10,7,1,1
chr1	86964185	.	AAGAAAAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.589:8:2,2:0,3:2,1,5,0
chr1	87012728	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=160,73;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr1	87025819	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,95;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:5,4,2,1
chr1	87029337	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,3:5,3:9,2,3,3
chr1	87036746	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=267,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,5,3
chr1	87036946	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:1,5,0,2
chr1	87038240	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=188,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,2:3,1:3,1,4,0
chr1	87038415	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:5,0:7,6:5,8,0,6
chr1	87045896	.	TCCTACA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=199,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,2:6,2:7,5,1,3
chr1	87045902	.	A	ACCTACT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=247,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCTACT;STR;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:1,2:1,4:2,0,4,2
chr1	87100226	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr1	87101245	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=134,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:8,1,0,2
chr1	87101861	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	87102593	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=134,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:6,7:3,9:2,7,8,8
chr1	87181515	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:9,4:13,0:7,15,4,0
chr1	87458695	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	87549858	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	87563668	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr1	87570398	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	87633761	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	87633918	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:87633918_G_A:87633918:1,2,0,1
chr1	87633924	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:2,0:0|1:87633918_G_A:87633918:1,3,0,1
chr1	89150164	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.695:1:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:0,0,1,0
chr1	89150168	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:0,0,1,0
chr1	89150170	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,10;MFRL=233,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:1,0,1,0
chr1	89150172	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,17;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:0,0,1,0
chr1	89150176	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=0,15;MFRL=210,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:3,0,1,0
chr1	89150179	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,10;MFRL=210,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:89150164_C_G:89150164:3,0,1,0
chr1	89150182	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,10;MFRL=210,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:89150164_C_G:89150164:3,0,1,0
chr1	89150189	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=17,12;MFRL=210,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:0,0:0|1:89150164_C_G:89150164:3,0,1,0
chr1	89236029	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=107,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:3,2,4,2
chr1	89271574	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,5:7,5:8,5,4,6
chr1	89289938	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=200,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:89289938_C_T:89289938:3,0,1,0
chr1	89289949	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=192,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:89289938_C_T:89289938:4,0,1,0
chr1	89289954	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,2:0.427:5:1,1:2,1:1|0:89289938_C_T:89289938:3,0,2,0
chr1	89318880	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=120,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:1,2:5,1:6,1,3,0
chr1	89357092	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:1,4:5,3:7,0,7,0
chr1	89430420	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	89449361	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=139,164;MMQ=48,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.117:40:22,0:12,4:21,15,4,0
chr1	89449390	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=136,148;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:23,3:15,1:24,16,2,2
chr1	89449483	.	C	G	.	.	DP=56;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=145,209;MMQ=52,32;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.080:52:20,3:27,0:18,30,2,2
chr1	89449508	.	AT	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=145,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.138:43:13,6:22,1:16,20,5,2
chr1	89475230	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr1	89478854	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=99,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.805:13:0,7:2,4:1,1,8,3
chr1	89478868	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:9,5,3,2
chr1	89520329	.	GAAAAAC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=236,163;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,5:1,4:2,1,8,1
chr1	89520574	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=70.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,10:0,13:0,0,3,20
chr1	89520636	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0|1:89520636_G_A:89520636:0,0,3,7
chr1	89520643	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0|1:89520636_G_A:89520636:0,0,3,7
chr1	89522512	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,5:5,6:3,3,8,3
chr1	89522646	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=213,176;MMQ=45,49;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:2,8:0,12:2,0,12,8
chr1	89523927	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=123,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,2:1,0:4,5,1,1
chr1	89524718	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=118,140;MMQ=52,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:7,8,2,0
chr1	89525086	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=116,101;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:12,0:16,4:11,17,4,0
chr1	89525812	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:12,4:8,0:0|1:89525812_C_G:89525812:16,4,2,2
chr1	89525820	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:13,3:7,0:0|1:89525812_C_G:89525812:15,5,1,2
chr1	89574026	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=223,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:0,3,0,8
chr1	89582690	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=241,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:0,8:3,4:2,1,7,5
chr1	89582746	.	T	TAAGAAAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,22;MFRL=156,846;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:8,0:0|1:89582746_T_TAAGAAAA:89582746:7,8,2,0
chr1	89582747	.	C	CTACAGAAAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=156,846;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:89582746_T_TAAGAAAA:89582746:7,8,2,0
chr1	89582751	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=156,846;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:0|1:89582746_T_TAAGAAAA:89582746:7,8,2,0
chr1	89583544	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr1	89597755	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,2:3,5:3,0,7,0
chr1	89615979	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=178,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,4:2,7:1,1,8,3
chr1	89650850	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=211,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:2,0,7,0
chr1	89652071	.	TC	CT	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=185,149;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:2,6:1,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,4,5
chr1	89652078	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=185,143;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:2,4:1,3:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,4,4
chr1	89652087	.	CC	TG	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,30;MFRL=189,149;MMQ=60,44;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,4,2,3
chr1	89652090	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=30,33;MFRL=189,151;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,1:2,2:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,4,2,2
chr1	89652094	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=193,138;MMQ=60,35;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,1,1
chr1	89652097	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=193,88;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,2:1,1:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,4,1
chr1	89652102	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=25,25;MFRL=193,88;MMQ=60,40;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:2,3:1,0:0|1:89652071_TC_CT:89652071:0,3,4,1
chr1	89726592	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr1	89730723	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=225,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	89731959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr1	89733273	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=228,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	89734389	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.130:29:13,2:12,1:15,11,1,2
chr1	89845926	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,7:0,2:0,0,9,1
chr1	89847153	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=199,319;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	89848146	.	AC	GT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=111,1050;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr1	89849201	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=81.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,11,13
chr1	89849350	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr1	89849574	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr1	89849812	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=101,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:12,0:12,8:6,18,0,8
chr1	89851100	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr1	90178268	.	GT	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=156,112;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.173:33:10,0:17,5:15,13,0,5
chr1	90178743	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=77.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,11:0,0,11,12
chr1	90493026	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=111,130;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.496:28:8,8:6,5:8,6,12,2
chr1	91404959	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,1:7,1:8,11,0,2
chr1	91727835	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:2,4,0,2
chr1	91728202	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	91739208	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	91781304	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	91781506	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=102,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:1,4,0,4
chr1	91782011	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=109,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,1:4,1:7,5,1,1
chr1	91813148	.	TC	CG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr1	91818302	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=166,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:1,4,0,2
chr1	91841301	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr1	91843745	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:4,9,1,1
chr1	91845858	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=219,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	91846374	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	91846595	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	91846654	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	91973557	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=61.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,0,17
chr1	91989572	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr1	92149277	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=223,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	92163786	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=277,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr1	92174375	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:10,0:5,4:2,13,0,4
chr1	92184814	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,4:3,0:8,0,3,1
chr1	92200593	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	92446112	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	92446398	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr1	92447004	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr1	92447227	.	GAGCAGCAGCAGC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=125,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,3;RU=AGC;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:8,0:4,8,1,1
chr1	92456631	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=292,262;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92456631_GGC_G:92456631:1,0,1,0
chr1	92456634	.	A	ATG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=292,262;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:92456631_GGC_G:92456631:1,0,1,0
chr1	92456643	.	TGT	CAC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=260,262;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:92456631_GGC_G:92456631:2,0,1,0
chr1	92508301	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,15;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.740:2:0,0:0,0:0|1:92508301_G_T:92508301:0,0,2,0
chr1	92508312	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=211,177;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:92508301_G_T:92508301:1,0,2,0
chr1	92508318	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=31,10;MFRL=152,186;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:92508301_G_T:92508301:2,0,1,0
chr1	92508320	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,15;MFRL=152,186;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:92508301_G_T:92508301:2,0,1,0
chr1	92508325	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=197,186;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:92508301_G_T:92508301:3,0,1,0
chr1	92508329	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=155,186;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:92508301_G_T:92508301:4,0,1,0
chr1	92508331	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=155,186;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:92508301_G_T:92508301:4,0,1,0
chr1	92528649	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,2:7,0:0|1:92528649_A_AC:92528649:8,8,0,3
chr1	92528653	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:0|1:92528649_A_AC:92528649:8,8,0,3
chr1	92568263	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,271;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr1	92606627	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:9,2,2,1
chr1	92632496	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr1	92632609	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=114,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:13,9,0,2
chr1	92634557	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,85;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr1	92645826	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=142,28683793;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:4,8,2,0
chr1	92649335	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.658:4:1,1:0,0:1,0,3,0
chr1	92697087	.	A	ACTTCTTTACC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=180,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:4,4,0,2
chr1	92709689	.	T	TAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=199,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr1	92711067	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=136,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,6:4,6:2,4,7,5
chr1	92712266	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr1	92712598	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=220,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,6,1
chr1	92735359	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:3,1:2,4,1,5
chr1	92754470	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=78,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:9,10:3,0:5,7,10,0
chr1	92755943	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,219;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	92763091	.	CA	C,CAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=35,36,33;MFRL=129,154,96;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=7.54,5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,4:0.280,0.269:17:0,2,2:6,4,1:1,6,2,8
chr1	92765848	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=84,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.733:9:1,4:1,3:0,2,2,5
chr1	92765880	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	92801916	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.204:47:3,8:34,0:34,4,9,0
chr1	92852504	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=151,185;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:1,0,8,0
chr1	92944122	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=136,16025;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:10,9,2,0
chr1	92944314	.	C	CAGAG,CAGAGAGAG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=17,17,17;MFRL=126,138,48;MMQ=55,60,32;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,20,22;RU=AG;STR;TLOD=7.11,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.498,0.343:6:0,0,0:0,1,0:0,1,1,4
chr1	93071048	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	93163385	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	93167610	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,9,0
chr1	93308853	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr1	93426866	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,2,0
chr1	93426869	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:93426866_T_C:93426866:0,0,2,0
chr1	93545157	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:1,1:0,3,3,4
chr1	93575839	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:7,7,1,1
chr1	93580992	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.292:11:4,1:3,1:3,5,0,3
chr1	93581024	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:6,4,2,4
chr1	93584870	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.393:10:3,2:2,2:4,2,4,0
chr1	93599300	.	T	TTCTTCTTGTACTTTCTAATA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=156,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.323:7:1,2:4,0:4,1,1,1
chr1	93602194	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr1	93620393	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:2,6:9,5:2,9,4,7
chr1	93621483	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	93648816	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	93649111	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=201,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr1	93649732	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,5:1,1:0,4,0,6
chr1	93659350	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	93671130	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:5,5:10,0:0|1:93671130_C_T:93671130:7,8,5,0
chr1	93671138	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:4,5:10,0:0|1:93671130_C_T:93671130:6,8,5,0
chr1	93672688	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=105,114;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:13,6:1,5:11,3,8,3
chr1	93672706	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=110,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:11,9:10,0:13,8,7,2
chr1	93672723	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,14:0,10:0,0,11,13
chr1	93672839	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=139,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,1:7,1:11,9,0,2
chr1	93676314	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=202,100;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:2,0,3,1
chr1	93676578	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=183,188;MMQ=54,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	93683193	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=198,140;MMQ=60,30;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr1	93683210	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	93691855	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=82,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.549:16:3,4:3,3:3,5,5,3
chr1	93691926	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=102,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,3:10,0:4,15,0,3
chr1	93692081	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AT;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	93704793	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=129,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.541:11:3,3:2,3:4,1,6,0
chr1	93704903	.	GCTGT	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=146,287;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:10,0:0|1:93704903_GCTGT_G:93704903:18,7,2,0
chr1	93704910	.	AAAATG	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,21;MFRL=146,287;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,1:13,0:0|1:93704903_GCTGT_G:93704903:18,7,2,0
chr1	93711782	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=122,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,2,5
chr1	93913982	.	GGAGGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=264,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAGGGT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,0:0,2,0,2
chr1	93998640	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=127,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:5,5:0,3:1,4,1,7
chr1	94009830	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr1	94028070	.	TA	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=316,178;MMQ=40,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	94041787	.	G	GAC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AC;STR;TLOD=29.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	94048352	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:8,3,3,0
chr1	94312482	.	T	TC	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=0,28;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=73.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,9,12
chr1	94312528	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,4,8
chr1	94312533	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,8
chr1	94312542	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,9
chr1	94312544	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,2:0,6:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,9
chr1	94312554	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,3:0|1:94312528_G_GC:94312528:0,0,1,6
chr1	94312559	.	CGGCTGGGTCGGGCG	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=151,163;MMQ=52,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0|1:94312559_CGGCTGGGTCGGGCG_C:94312559:0,1,0,3
chr1	94312576	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:94312559_CGGCTGGGTCGGGCG_C:94312559:0,0,0,3
chr1	94335194	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=275,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:4,1:2,2,2,0
chr1	94335585	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr1	94341137	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:3,1,4,0
chr1	94344580	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.553:14:2,3:4,3:5,1,5,3
chr1	94360316	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.204:21:6,2:11,1:5,12,1,3
chr1	94473896	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:6,9,0,2
chr1	94474328	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=93,222;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:9,3:16,1:10,15,1,3
chr1	94474452	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=136,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:1,1:5,2:1,6,0,3
chr1	94476555	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=221,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,0:0,4:1,1,0,4
chr1	94476991	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=170,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	94486992	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:1,4,1,1
chr1	94487285	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=138,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:4,4:4,5,3,3
chr1	94487354	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:9,4,2,4
chr1	94495930	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr1	94496602	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,0:4,6:2,8,6,0
chr1	94508378	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=111,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:11,6:9,0:12,8,6,0
chr1	94544971	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:5,3:14,0:9,11,0,3
chr1	94568491	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr1	94574053	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=174,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:8,0,3,0
chr1	94574342	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=226,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	94576968	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,4:6,0:2,7,2,2
chr1	94639337	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	94643143	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=136,96;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:7,1,1,1
chr1	94645181	.	CT	GA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:0,0,1,0
chr1	94645185	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:0,0,1,0
chr1	94645189	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=230,231;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:1,0,1,0
chr1	94645198	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=230,231;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:1,0,1,0
chr1	94645203	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=230,231;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,0:0|1:94645181_CT_GA:94645181:1,0,1,0
chr1	94654909	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:9,7,0,3
chr1	94667430	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,1:0,1,0,7
chr1	94674295	.	TA	CG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=153,120;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:4,1:8,0,2,0
chr1	94674723	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:94674723_G_A:94674723:0,0,7,2
chr1	94674726	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0|1:94674723_G_A:94674723:0,0,7,2
chr1	94924046	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=175,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr1	94941376	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	94980671	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.956:19:0,9:0,10:0,0,15,4
chr1	94997924	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,3:12,0:9,9,3,0
chr1	95001600	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr1	95286658	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=200,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:0,3,1,5
chr1	95286675	.	GTCCCAAATGTAAA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=203,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr1	95290003	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=197,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,2:1,5:3,0,7,0
chr1	95290051	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=166,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.178:24:12,3:8,0:14,6,3,1
chr1	95293005	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=113,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:1,2:0,1,2,0
chr1	95305440	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=112,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,6,1
chr1	95332814	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr1	95332864	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=182,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:4,6:7,0:10,1,3,4
chr1	95358009	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=151,81;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:11,9,2,0
chr1	95358035	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=140,41;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,2:13,0:12,10,1,1
chr1	95363698	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=193,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr1	95367136	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	95367416	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:2,4,0,3
chr1	95367669	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,0:1,4:2,4,3,1
chr1	95367894	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	95368574	.	T	TAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=183,84;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=A;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr1	95368706	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:7,6,0,4
chr1	95615671	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	97250520	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	97278804	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=217,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,1:5,3,5,1
chr1	97544771	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	97547831	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	97700589	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=119,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr1	97771947	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:1,3,0,3
chr1	97847874	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=336,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr1	98039541	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:4,2:7,1:1,11,2,1
chr1	98164998	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,0:7,5:5,5,0,5
chr1	99127392	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr1	99150635	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr1	99164377	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:12,0:11,9,0,3
chr1	99358542	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:7,3,4,1
chr1	99358761	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr1	99387628	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=259,256;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,0:3,3:1,5,2,2
chr1	99772424	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=183,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:99772424_C_T:99772424:4,7,1,1
chr1	99772440	.	TTCCCGCGA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=195,62;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:99772424_C_T:99772424:2,8,1,1
chr1	99772453	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=204,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:99772424_C_T:99772424:1,9,1,1
chr1	100111956	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,5:7,6:1,11,6,5
chr1	100152443	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:1,9:3,8:3,1,10,7
chr1	100203704	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:10,5:18,0:12,16,5,0
chr1	100316765	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	100329889	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	100330237	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	100335883	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	100340225	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr1	100342227	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	100343153	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=222,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	100345409	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=216,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,5:0,4:2,0,7,2
chr1	100346741	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:0,1,3,3
chr1	100353675	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	100357141	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=116,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,9:1,1:1,2,6,4
chr1	100358200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	100366446	.	GTTT	G,GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20,30;MFRL=0,151,204;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.06,3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.455,0.423:5:0,1,1:0,1,1:0,0,1,4
chr1	100376448	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0|1:100376448_G_A:100376448:0,0,0,11
chr1	100376456	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0|1:100376448_G_A:100376448:0,0,0,11
chr1	100381109	.	A	AT,ATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27,26;MFRL=0,148,165;MMQ=60,60,60;MPOS=21,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=8.32,3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.569,0.331:6:0,1,1:0,3,1:0,0,0,6
chr1	100381869	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr1	100533960	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=277,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr1	100542702	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,31,34;MFRL=172,165,171;MMQ=60,60,60;MPOS=29,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.34,5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,3:0.217,0.235:15:2,0,3:3,3,0:8,1,6,0
chr1	100542718	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,10;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.284:20:0,0:8,0:10,4,6,0
chr1	100546162	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:8,3:5,5:5,8,5,3
chr1	100547830	.	T	TTGATTGATAAATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	100598866	.	GC	AT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=270,145;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=142.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,34:0.814:41:4,21:3,13:2,5,5,29
chr1	100617887	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	100626033	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=88,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:7,1:12,2:17,5,2,1
chr1	100671865	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.359:9:3,1:2,2:0|1:100671865_T_TA:100671865:0,6,1,2
chr1	100671866	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=226,161;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.750:9:1,4:1,3:0,2,1,6
chr1	100671885	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=155,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:3,0:0|1:100671865_T_TA:100671865:0,7,1,1
chr1	100680593	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr1	100715454	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:0,4:2,6:0,2,0,10
chr1	100731819	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=246,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,2:2,4:0|1:100731819_C_CA:100731819:3,0,7,0
chr1	100731820	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=246,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,1:2,4:0|1:100731819_C_CA:100731819:3,0,7,0
chr1	100733207	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,13;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,0:0,2:0,0,0,7
chr1	100750733	.	AGTTTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=276,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GTTTT;STR;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr1	100750846	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=151,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:11,5,0,3
chr1	100818464	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=42.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr1	100908521	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:10,0:14,2:13,12,0,2
chr1	100964925	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=196,139;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,0:7,4:0,10,0,4
chr1	101188976	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=286,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.640:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	101190218	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:8,6,0,2
chr1	101194965	.	GT	G,GTT,GTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33,35,25;MFRL=245,193,200,182;MMQ=60,60,60,60;MPOS=30,16,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,10,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.48,5.92,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,3,2:0.251,0.336,0.249:8:1,1,0,0:0,1,3,1:0,1,0,7
chr1	101199979	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=275,267;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	101203698	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,5:1,4:1,3,7,2
chr1	101342497	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	101372607	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	101437919	.	T	TGTGGTAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.690:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	101704532	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=247,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:4,1,5,0
chr1	101704687	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.195:27:13,0:9,4:8,14,5,0
chr1	101705764	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=158,162;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,1:11,0:0|1:101705764_C_A:101705764:18,6,2,0
chr1	101705766	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=158,162;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,2:12,0:0|1:101705764_C_A:101705764:18,6,2,0
chr1	102271774	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=209,351;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	102296290	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:9,0:8,4:5,12,0,4
chr1	102462446	.	GTCAGT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:1,6,0,4
chr1	103354138	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,9:0,0,9,5
chr1	103354939	.	C	CTGTGTGTGTG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=239,156;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=13,18;RU=TG;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	103356168	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=208,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	103379300	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:0,9,0,2
chr1	103380285	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.181:25:10,0:11,4:11,10,4,0
chr1	103380377	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.264:19:0,0:7,1:2,12,0,5
chr1	103380379	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,5:1,5:2,1,1,12
chr1	103381129	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:9,3:3,1:6,6,1,3
chr1	103400491	.	GA	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr1	103428389	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,2,13
chr1	103449598	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	103455020	.	AAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr1	103455217	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	103461508	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,13,8
chr1	103463928	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=170,274;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.202:22:5,4:11,0:2,16,0,4
chr1	103463976	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr1	103467615	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	103471456	.	CCATCAT	C,CCAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32,35;MFRL=0,311,197;MMQ=60,60,60;MPOS=26,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=CAT;STR;TLOD=3.01,19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,5:0.214,0.696:6:0,0,2:0,1,3:0,0,1,5
chr1	103471734	.	A	AAAATAAAT,AAAATAAATAAAT,AAAATAAATAAATAAAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27,29,24;MFRL=0,181,173,166;MMQ=60,60,40,40;MPOS=26,15,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=7,9,10,11;RU=AAAT;STR;TLOD=7.55,11.39,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,3,1:0.334,0.406,0.187:6:0,1,0,1:0,1,3,0:0,0,1,5
chr1	103471934	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:103471934_T_C:103471934:0,4,0,1
chr1	103471936	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,18;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:103471934_T_C:103471934:0,4,0,1
chr1	103471940	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=189,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:103471934_T_C:103471934:0,4,0,1
chr1	103478062	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,0:4,12:2,9,0,12
chr1	103483514	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	103487374	.	CTTTCTTTCTTTCTTTTCTTCTTTTTTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=191,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.259:11:3,0:2,2:0,9,1,1
chr1	103487394	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.880:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	103496620	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr1	103496805	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.857:8:1,5:0,1:0,1,1,6
chr1	103548319	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	103573547	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	104093684	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=144,162;MMQ=60,24;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=58.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,25:0.578:43:9,0:9,25:6,12,0,25
chr1	104093719	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=165,162;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=57.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,25:0.703:35:6,0:4,25:2,8,0,25
chr1	104116312	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,1:5,7:6,2,4,4
chr1	107601494	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=157,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=49.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,19:0.500:38:7,0:12,19:5,14,0,19
chr1	108023196	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0|1:108023196_G_C:108023196:0,5,6,0
chr1	108023198	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,0:2,2:0|1:108023196_G_C:108023196:0,5,6,0
chr1	108023202	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,0:2,1:0|1:108023196_G_C:108023196:1,6,6,0
chr1	108023205	.	C	CCCCCCCCCCCCACAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.465:13:4,2:3,4:0|1:108023196_G_C:108023196:1,6,6,0
chr1	108138772	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=226,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr1	108139003	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=205,182;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=103.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,32:0.917:34:0,4:2,28:0,2,3,29
chr1	108160260	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.661:13:1,3:2,4:3,1,3,6
chr1	108299775	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30,26;MFRL=150,198,195;MMQ=40,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=TG;STR;TLOD=7.11,6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.402,0.401:7:1,2,2:0,1,1:1,0,6,0
chr1	108307642	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr1	108315305	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	108507209	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=235,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	108507541	.	GGCCGCC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=222,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=GCC;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	108679323	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:13,8,2,0
chr1	108681600	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:4,0,4,0
chr1	108697845	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr1	108700316	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0,10,0,3
chr1	108724518	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,6:1,1:2,0,4,3
chr1	108724693	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=233,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr1	108766424	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=161,164;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr1	108771524	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=239,244;MMQ=37,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:2,1,2,0
chr1	109167249	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=145,89;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:9,7,1,3
chr1	109170746	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,10,3
chr1	109235166	.	T	TGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=142,300;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,0:2,1:0|1:109235166_T_TGG:109235166:1,2,1,0
chr1	109235172	.	CCT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=142,300;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,0:2,0:0|1:109235166_T_TGG:109235166:1,2,1,0
chr1	109235298	.	TGCG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCG;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:8,1:7,0:12,4,2,0
chr1	109241967	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:19,0:11,3:18,12,0,3
chr1	109255513	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,9,5
chr1	109260357	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	109261321	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr1	109265029	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=224,119;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,5:0,4:1,0,3,6
chr1	109271473	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=162,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:5,0:14,2:5,14,1,1
chr1	109289236	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:0,2:7,5:7,0,7,0
chr1	109289487	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:0,8,0,9
chr1	109299453	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=218,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr1	109301250	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.601:21:5,4:3,9:0,8,4,9
chr1	109315211	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:3,0,4,0
chr1	109321824	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr1	109325028	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,278;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr1	109325436	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr1	109337482	.	A	ACCATTGCACTCCAGC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=104,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:5,6,1,1
chr1	109339414	.	GT	G,GTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32,32;MFRL=257,226,279;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=6.57,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.365,0.357:8:0,1,1:2,2,1:0,2,0,6
chr1	109358755	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=205,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.378:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr1	109358958	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:1,10,3,3
chr1	109363075	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=204,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	109365782	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:15,1:7,1:13,9,2,0
chr1	109366370	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	109369791	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=136,249;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0|1:109369791_G_A:109369791:0,3,2,0
chr1	109369797	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=136,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:109369791_G_A:109369791:0,3,3,0
chr1	109391486	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,8:0,0,4,10
chr1	109465174	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,0:1,2:2,7,0,2
chr1	109466562	.	TTTTTTTG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=127,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTTTG;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:3,2:9,1:11,4,3,0
chr1	109486240	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=96,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:12,2:9,1:14,8,1,2
chr1	109492879	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=116,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.496:24:5,5:7,6:8,4,10,2
chr1	109525421	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=233,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	109529322	.	T	TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,5,4
chr1	109545046	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	109648794	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=126,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,0:8,3:0,9,2,1
chr1	109714403	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr1	109714635	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=129,217;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,2:9,1:5,7,2,1
chr1	109727653	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=224,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:3,3,5,4
chr1	109727832	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:0,7,1,4
chr1	109731858	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,129;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,0:5,7:0,9,0,7
chr1	109732387	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=216,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr1	109734157	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=156,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr1	109734541	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=125,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	109734567	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:109734567_G_T:109734567:0,1,0,1
chr1	109734570	.	A	ACT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,24;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109734567_G_T:109734567:0,1,0,1
chr1	109734572	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109734567_G_T:109734567:0,1,0,1
chr1	109734575	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,25;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:109734567_G_T:109734567:0,1,0,1
chr1	109735504	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=226,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:3,3,2,4
chr1	109737314	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,0,15
chr1	109740310	.	AGT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=GT;STR;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr1	109742452	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=126,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,3:1,8:4,1,9,2
chr1	109742485	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=126,190;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.587:17:5,3:1,7:5,2,7,3
chr1	109745618	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=122,123;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,9:2,3:3,4,6,6
chr1	109773705	.	ATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=291,0;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.832:9:1,1:0,5:0,1,0,8
chr1	109774357	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,0:5,3:8,9,0,3
chr1	109778577	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=282,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,4:2,8:2,0,11,1
chr1	109779556	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,3,8
chr1	109795858	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:15,4:5,0:9,12,4,0
chr1	109805463	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.140:21:7,2:8,0:0|1:109805463_G_A:109805463:9,9,2,1
chr1	109805465	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=156,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.138:20:9,2:8,0:0|1:109805463_G_A:109805463:9,9,1,1
chr1	109806442	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=192,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr1	109806991	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:1,5,0,5
chr1	109812173	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:7,3,2,0
chr1	109813020	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=229,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr1	109813236	.	TTCCCAGTCTTGGGG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:2,4:0,2:0,2,1,5
chr1	109815252	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=109,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,2:4,3:7,5,4,1
chr1	109815509	.	C	CAGAGCATCAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=229,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:0|1:109815509_C_CAGAGCATCAA:109815509:3,2,1,1
chr1	109815511	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=229,59;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:3,0:2,1:0|1:109815509_C_CAGAGCATCAA:109815509:3,2,1,1
chr1	109816176	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	109838833	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,14,4
chr1	109838873	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=166,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,0:8,3:9,9,3,0
chr1	109839063	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=156,180;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.763:6:0,0:0,1:0,1,0,5
chr1	109839392	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=94,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.923:24:0,13:1,10:0,1,10,13
chr1	109839954	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr1	109840697	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=224,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:3,0,1,0
chr1	109840702	.	T	TGC	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840704	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=78,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr1	109840707	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=26,28;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840709	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=34,27;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840712	.	GGA	G	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,36;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840716	.	TC	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,29;MFRL=178,78;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:3,0,1,0
chr1	109840719	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=25,28;MFRL=201,78;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:109840697_GC_G:109840697:4,0,1,0
chr1	109840918	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:1,5,0,3
chr1	109856842	.	TGG	T,TG	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,29,27;MFRL=239,191,204;MMQ=60,60,60;MPOS=14,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=G;STR;TLOD=5.57,15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,6:0.285,0.503:11:0,2,4:2,0,2:2,0,6,3
chr1	109856856	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:1,0:0|1:109856856_C_A:109856856:6,4,2,0
chr1	109856864	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,18;MFRL=204,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:8,0:0,1:0|1:109856856_C_A:109856856:6,4,2,0
chr1	109883576	.	C	CAT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=195,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.412:5:1,0:2,1:0,3,0,2
chr1	109958035	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr1	110018148	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	110029667	.	G	GCCCCCCC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=151,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,11;RU=C;STR;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.323:19:8,4:5,2:0,13,6,0
chr1	110029672	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.217:19:7,2:6,1:1,14,4,0
chr1	110029678	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,12;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.218:19:7,1:6,0:0|1:110029678_A_C:110029678:1,14,4,0
chr1	110029681	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=177,120;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.203:17:8,2:6,1:0|1:110029678_A_C:110029678:1,13,3,0
chr1	110029684	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=26,19;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.202:17:8,0:4,0:0|1:110029678_A_C:110029678:2,12,3,0
chr1	110030895	.	GTC	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TC;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,0:2,1:2,0,1,0
chr1	110030945	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=133,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	110035159	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:4,8:8,5:8,4,9,4
chr1	110035318	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=142,230;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.639:14:3,4:2,5:0,5,0,9
chr1	110036919	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=170,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,6:5,2:4,8,7,1
chr1	110036998	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=219,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:3,4,4,2
chr1	110037838	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.441:23:7,6:6,4:8,5,5,5
chr1	110086141	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:5,5:13,0:9,10,5,0
chr1	110087178	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=135,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:9,0:14,4:8,15,1,3
chr1	110091271	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=144,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr1	110128928	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,79;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:15,6:12,0:11,16,1,5
chr1	110145987	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=147,210;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:6,5:7,0:8,5,5,0
chr1	110153198	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,3:1,2:1,1,0,5
chr1	110155355	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,0:7,3:10,1,1,2
chr1	110155524	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=189,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,3:6,3:0,9,1,5
chr1	110163879	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:4,7:10,5:8,6,9,4
chr1	110168888	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:5,5:0,11:2,3,7,9
chr1	110169957	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:2,0,0,5
chr1	110170640	.	GC	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:4,3:6,2,4,4
chr1	110171705	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=227,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr1	110172346	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=180,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:1,0,7,0
chr1	110172362	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=172,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:5,1,3,0
chr1	110200360	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=106,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:23,2:17,2:20,21,3,1
chr1	110201580	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=77.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,13,11
chr1	110201809	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0|1:110201809_G_T:110201809:0,0,7,19
chr1	110201812	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=116.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,27:0.966:27:0,14:0,12:0|1:110201809_G_T:110201809:0,0,8,19
chr1	110210780	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,5:0,14:0,0,10,9
chr1	110211681	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	110212293	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	110230767	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr1	110231284	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,19644;MMQ=52,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:2,5,5,0
chr1	110231295	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=159,19644;MMQ=40,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:3,8,5,0
chr1	110232801	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr1	110233147	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,29;MFRL=59,131;MMQ=52,57;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:2,5:0,6:1,1,4,7
chr1	110233178	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=157,59;MMQ=40,52;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:0|1:110233178_C_T:110233178:6,8,1,1
chr1	110233197	.	C	CG	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=157,59;MMQ=40,52;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:0|1:110233178_C_T:110233178:6,8,1,1
chr1	110233199	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=152,59;MMQ=40,52;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:7,2:3,0:0|1:110233178_C_T:110233178:5,8,1,1
chr1	110233247	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,7:0,1:0,0,3,5
chr1	110254812	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,1:5,0,2,0
chr1	110255126	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=203,159;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,4:6,0:0|1:110255126_G_A:110255126:12,1,4,0
chr1	110255129	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=208,159;MMQ=60,55;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.249:18:7,4:6,0:0|1:110255126_G_A:110255126:12,2,4,0
chr1	110256430	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0|1:110256430_G_A:110256430:2,4,0,2
chr1	110256435	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=179,96;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:0|1:110256430_G_A:110256430:2,6,0,2
chr1	110279821	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,2:1,3:6,2,2,3
chr1	110281941	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=93,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	110282972	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,3:1,3,0,5
chr1	110295890	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	110300072	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:3,7,2,0
chr1	110301766	.	AGTGT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=83,244;MMQ=58,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=GT;STR;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.687:7:0,3:2,2:1,1,4,1
chr1	110464422	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,4:6,0:0|1:110464422_G_A:110464422:10,2,4,0
chr1	110464432	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=165,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:6,4:6,0:0|1:110464422_G_A:110464422:11,3,4,0
chr1	110465872	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=173,52;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,7,1,1
chr1	110465889	.	GCC	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=C;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,4,1,1
chr1	110465893	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,4,1,1
chr1	110465898	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=168,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,3,1,1
chr1	110465901	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=169,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,4,1,1
chr1	110465906	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=169,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:110465872_C_T:110465872:3,4,1,1
chr1	110466867	.	C	CAAGACCGCACCACTGCACTCAGCCTGAGTGACAGAGCAAGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=347,180;MMQ=60,39;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.662:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	110558094	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:16,2:15,0:0|1:110558094_T_G:110558094:16,15,2,0
chr1	110558100	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=151,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,2:17,0:0|1:110558094_T_G:110558094:17,16,2,0
chr1	110581780	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=128,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,1:12,10,1,1
chr1	110589487	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=217,154;MMQ=53,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	110592048	.	CTTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=194,310;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=T;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:2,2:2,1:0|1:110592048_CTTTT_C:110592048:11,2,2,1
chr1	110592058	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,9:0.487:18:5,8:4,1:1|0:110592048_CTTTT_C:110592048:5,4,9,0
chr1	110603283	.	CAGAGGTGGGCTGGGAGCGACTGGGAATGGAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.351:4:0,1:1,0:2,1,1,0
chr1	110656454	.	TCC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=169,237;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:5,1:7,6,0,2
chr1	110716511	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,3:3,1:2,1,4,0
chr1	110734575	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,4:10,0:10,5,4,0
chr1	110735037	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=233,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr1	110740688	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,1,1
chr1	110765535	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=217,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr1	110766466	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,3:11,0:7,10,1,2
chr1	110924235	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,2:2,7:2,2,5,4
chr1	110950295	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:3,8:11,3:11,3,8,3
chr1	111059812	.	C	CGA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=GA;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	111060153	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=202,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:7,2,2,1
chr1	111060649	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,4:1,1:5,4,5,0
chr1	111060669	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,13:0,4:0,0,14,4
chr1	111136541	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:0|1:111136541_C_T:111136541:6,9,1,1
chr1	111136551	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:0|1:111136541_C_T:111136541:9,8,1,1
chr1	111136553	.	A	ATGTTCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:111136541_C_T:111136541:9,8,1,1
chr1	111136554	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:111136541_C_T:111136541:9,8,1,1
chr1	111145966	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,141;MMQ=60,33;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,0:13,4:10,11,0,4
chr1	111434170	.	CTGGTG	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=125,237;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr1	111436857	.	TC	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=267,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr1	111661413	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,6:4,8:2,6,7,7
chr1	111661467	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=142,58;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.137:34:15,4:15,0:19,11,4,0
chr1	111661528	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:11,5:7,7:8,10,5,7
chr1	111703791	.	GGAAC	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=122,48;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:9,2:0|1:111703791_GGAAC_G:111703791:16,11,1,1
chr1	111703796	.	TTGTA	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=118,48;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:11,2:0|1:111703791_GGAAC_G:111703791:17,13,1,1
chr1	111726026	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=307,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:3,0,6,0
chr1	111726213	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,13,15
chr1	111726288	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=331,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr1	111737183	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:0,5:5,8:5,0,8,5
chr1	111737398	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:0,7,0,8
chr1	111739771	.	G	GCAGGACAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:2,3:0,2:2,0,6,0
chr1	111743061	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.141:33:17,2:12,2:15,14,1,3
chr1	111770423	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:3,5,0,3
chr1	111773273	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=251,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	111778241	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr1	111778468	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=200,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:1,3,0,5
chr1	111778824	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=148,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.605:12:0,2:1,5:1,4,1,6
chr1	111784148	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	111784816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:5,0,2,1
chr1	111833441	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=197,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:6,1,3,0
chr1	111833488	.	C	CCT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=172,150;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:6,2:5,6,2,2
chr1	111833517	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=138,79955;MMQ=60,43;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:4,5,0,2
chr1	111833661	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,387;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	111853060	.	A	AGCCAATCTAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:11,2:4,2:11,4,3,1
chr1	111854207	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=212,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr1	111854223	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=195,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:4,1,5,0
chr1	111854741	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=214,192;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:5,0,2,0
chr1	111854755	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr1	111857087	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=77,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:1,2:0,5:1,1,5,2
chr1	111857107	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,3:1,2:5,2,5,0
chr1	111857120	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,3:2,2:7,2,5,0
chr1	111857154	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,5:1,3:3,1,7,1
chr1	111861202	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:111861202_C_T:111861202:9,8,2,0
chr1	111861210	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=159,49;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:7,0:8,2:0|1:111861202_C_T:111861202:9,6,2,0
chr1	111861714	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:4,3,4,0
chr1	111862078	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=151,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,4:6,1:6,11,3,2
chr1	111890244	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=97,322;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:2,1:0|1:111890244_C_T:111890244:2,0,1,0
chr1	111890246	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=97,322;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:2,1:0|1:111890244_C_T:111890244:2,0,1,0
chr1	111891192	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,3:8,0:5,11,2,1
chr1	111892905	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111892905_T_C:111892905:0,2,0,1
chr1	111892909	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111892905_T_C:111892905:0,2,0,1
chr1	111893788	.	G	GTTT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,23;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	111893837	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=151,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:4,3,1,1
chr1	111957245	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,6:3,4:8,2,7,3
chr1	111969294	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=336,192;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:2,1,0,2
chr1	111990265	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr1	111991845	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	111992095	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.418:24:6,3:8,6:9,5,6,4
chr1	112028334	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:1,1:1,3,4,0
chr1	112029150	.	AG	CC	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=15,22;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:0,1:0|1:112029150_AG_CC:112029150:4,0,2,0
chr1	112029156	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,0:1,0:0|1:112029150_AG_CC:112029150:5,0,2,0
chr1	112029160	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=25,10;MFRL=203,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,0:0|1:112029150_AG_CC:112029150:7,0,2,0
chr1	112029163	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=27,22;MFRL=203,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,0:2,1:0|1:112029150_AG_CC:112029150:7,0,2,0
chr1	112029168	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=29,21;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,1:0|1:112029150_AG_CC:112029150:7,1,2,0
chr1	112029171	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:2,0:0|1:112029150_AG_CC:112029150:7,1,2,0
chr1	112029189	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=31,29;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,5:7,2:7,2,4,3
chr1	112029193	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=31,30;MFRL=234,189;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.832:16:1,5:1,8:2,0,9,5
chr1	112029325	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=213,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:1,6:0,5:0,1,1,10
chr1	112032126	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=232,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:112032126_T_C:112032126:3,0,3,0
chr1	112032131	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=232,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:112032126_T_C:112032126:3,0,3,0
chr1	112032347	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr1	112032372	.	CACAGGGCTGAAAACAG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=207,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0,4,0,1
chr1	112033454	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=88,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.415:6:2,1:2,0:0|1:112033454_G_GA:112033454:0,4,0,2
chr1	112033456	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=88,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.415:6:2,1:2,1:0|1:112033454_G_GA:112033454:0,4,0,2
chr1	112042732	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.342:36:11,7:13,5:14,10,6,6
chr1	112043139	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,1:6,2:8,6,2,1
chr1	112106444	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,3,4
chr1	112237915	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,287;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:8,1,2,1
chr1	112281899	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:5,2,4,3
chr1	112298829	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	112298875	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112298875_G_A:112298875:0,0,0,1
chr1	112298878	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112298875_G_A:112298875:0,0,0,1
chr1	112298881	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:112298875_G_A:112298875:0,0,0,1
chr1	112302208	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:2,7,0,3
chr1	112302219	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:1,6,0,4
chr1	112303237	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:5,4,2,5
chr1	112303622	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,250;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.139:41:16,5:20,0:21,15,5,0
chr1	112303791	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=191,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.475:19:8,4:2,5:3,7,4,5
chr1	112305305	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:5,2,2,0
chr1	112305406	.	TAAAAA	T,TAAAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,30,25;MFRL=133,175,196;MMQ=60,60,60;MPOS=18,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,15;RU=A;STR;TLOD=5.75,4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.184,0.271:13:5,1,1:3,1,1:3,5,3,2
chr1	112305437	.	T	TTTAAGGGGAGG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAAGGGGAGG;STR;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.372:22:4,0:10,4:9,5,4,4
chr1	112322841	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=213,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:9,0:8,1:0|1:112322841_A_C:112322841:10,7,1,1
chr1	112322848	.	GTG	TCA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=196,41;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:112322841_A_C:112322841:11,8,1,1
chr1	112322854	.	T	TCCTATTTTTATAAAAA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=193,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:8,1:0|1:112322841_A_C:112322841:9,7,1,1
chr1	112329580	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=197,83;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:7,6,1,1
chr1	112998767	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=42.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,16:0.378:43:15,0:12,16:15,12,0,16
chr1	113063125	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=117,183;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,2:11,2:6,10,3,1
chr1	113063204	.	C	CACACACACACACACACACA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr1	113140583	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,2:5,0:11,2,2,0
chr1	113159448	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.082:46:25,3:18,0:18,25,0,3
chr1	113196179	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=213,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.534:7:3,2:0,1:3,0,4,0
chr1	113196197	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=237,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.772:10:2,3:0,1:2,0,6,2
chr1	113202417	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=244,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,5:1,5:0,1,3,7
chr1	113231999	.	T	TTCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,14;MFRL=283,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,1:0|1:113231999_T_TTCC:113231999:0,1,2,0
chr1	113232003	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=283,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:0,1:0|1:113231999_T_TTCC:113231999:0,1,2,0
chr1	113232007	.	CAA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,0:0,0:0|1:113231999_T_TTCC:113231999:1,0,2,0
chr1	113234456	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=374,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,5:1,5:0,3,3,8
chr1	113239382	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,2:3,0:5,8,1,1
chr1	113239478	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=279,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr1	113240790	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=189,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,0:7,2:3,4,0,2
chr1	113240987	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=143,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:7,4:9,0:6,10,2,2
chr1	113242488	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=244,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,22:0.697:31:8,9:1,13:5,4,8,14
chr1	113244433	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr1	113245160	.	G	GCA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:9,1:4,1:0|1:113245160_G_GCA:113245160:11,3,2,0
chr1	113245163	.	C	CTGATGGCA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:9,1:5,1:0|1:113245160_G_GCA:113245160:11,3,2,0
chr1	113246229	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=229,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:4,0,7,0
chr1	113246506	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=233,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	113254484	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	113255686	.	TTGTG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=145,173;MMQ=50,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=TG;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr1	113255719	.	T	TGTCATGTGTATGTGTGTGTTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=198,125;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	113456668	.	TTGCCAAAAGTCGATAATTGATGCCCA	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=149,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:12,0:15,2:15,21,1,1
chr1	113460567	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=202,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:5,0:5,7,5,0
chr1	113636252	.	G	GTTGATTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,114;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	113636924	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr1	113653075	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:1,2:2,3,0,2
chr1	113658887	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,5,1
chr1	113659065	.	ACT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=204,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:2,4,2,2
chr1	114092111	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:3,1:1,2:5,1,3,0
chr1	114092306	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr1	114133022	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.904:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	114137013	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	114189067	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,4:3,2:3,3,3,3
chr1	114189185	.	GA	TG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=157,40;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:0|1:114189185_GA_TG:114189185:3,6,1,1
chr1	114189189	.	A	ACTCTTAATTTGCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=155,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:114189185_GA_TG:114189185:3,7,1,1
chr1	114191994	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.472:17:5,4:4,4:4,5,4,4
chr1	114196364	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=232,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	114196723	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:1,2:8,1:0,9,0,3
chr1	114224782	.	ATT	A,ATTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32,28;MFRL=170,247,179;MMQ=60,60,60;MPOS=33,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=T;STR;TLOD=5.57,5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.272,0.497:6:0,2,0:1,0,2:1,0,3,2
chr1	114226705	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35,34;MFRL=249,249,206;MMQ=60,60,60;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=3.32,7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.197,0.370:11:2,0,2:3,2,2:0,5,0,6
chr1	114240319	.	T	TA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=85.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,13:0,13:0,0,16,11
chr1	114248622	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:7,0:9,5:9,7,0,5
chr1	114249382	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr1	114255828	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=98,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	114256139	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=186,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr1	114267347	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	114280717	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=172,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:2,2:10,1:9,3,1,2
chr1	114309172	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	114339956	.	C	CTAAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=141.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,12:0,17:0,0,21,11
chr1	114354739	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=173,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:3,0:1,0:0|1:114354739_T_G:114354739:1,4,2,0
chr1	114354741	.	CT	GG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,17;MFRL=173,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,0:1,0:0|1:114354739_T_G:114354739:1,4,2,0
chr1	114372332	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:2,3,1,3
chr1	114372528	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:6,0,2,1
chr1	114377093	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,5,9
chr1	114377568	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,15:0,16:0,0,12,19
chr1	114377640	.	TAACAATTGTTAATTAG	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:7,0:1,14,0,2
chr1	114399075	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=259,155;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,12:1,0:1,0,12,0
chr1	114401088	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=175,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:7,0:16,3:20,3,3,0
chr1	114401114	.	CC	TT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.120:22:9,0:9,2:13,7,2,0
chr1	114401231	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:6,3,3,4
chr1	114401273	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,0:1,5:0|1:114401273_T_TC:114401273:0,5,0,5
chr1	114401279	.	T	TTAACAA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,38;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,0:1,5:0|1:114401273_T_TC:114401273:0,5,0,5
chr1	114401282	.	G	GAAT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=166,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:114401273_T_TC:114401273:0,4,0,1
chr1	114401904	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:2,2:0,3:2,0,3,2
chr1	114423653	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:11,1:2,4:12,2,3,2
chr1	114429340	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=247,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	114429956	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=114,75;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:10,6,2,1
chr1	114438071	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,6:6,0:6,6,5,1
chr1	114443035	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:6,5:3,6:2,7,2,9
chr1	114483379	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:6,3,1,1
chr1	114495348	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.390:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	114495565	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=136,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:9,4:15,0:11,13,0,4
chr1	114504860	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=158,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr1	114510971	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,8:3,0:5,0,8,0
chr1	114523168	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,14:0.366:39:9,13:16,0:12,13,14,0
chr1	114641685	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.785:12:1,6:1,4:2,0,10,0
chr1	114940211	.	GTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=0,195;MMQ=52,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.324:4:2,1:1,0:0|1:114940211_GTTTT_G:114940211:3,0,1,0
chr1	114940228	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.334:14:2,2:3,2:1|0:114940211_GTTTT_G:114940211:5,4,3,2
chr1	114940229	.	G	GGT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,16;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.334:14:5,0:4,0:1|0:114940211_GTTTT_G:114940211:5,4,3,2
chr1	114940632	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr1	114963067	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:9,1:10,10,2,0
chr1	114973610	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=177,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114973610_T_C:114973610:0,3,0,1
chr1	114973619	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:114973610_T_C:114973610:0,3,0,1
chr1	115006230	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=121,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:1,1:0,5,0,3
chr1	115110683	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,130;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:5,1,5,0
chr1	115110785	.	T	TGG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=122,53;MMQ=60,48;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:8,9,1,1
chr1	115110797	.	TGC	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=22,20;MFRL=122,53;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:11,2:0|1:115110797_TGC_T:115110797:10,11,1,1
chr1	115110801	.	T	TTA	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,20;MFRL=127,53;MMQ=60,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:0|1:115110797_TGC_T:115110797:9,11,1,1
chr1	115128087	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=194,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr1	115144703	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,7,6
chr1	115166350	.	ATTGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTGT;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	115218413	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,261;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:8,2,3,1
chr1	115236202	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr1	115238016	.	CAA	C,CA,CAAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34,16,35;MFRL=0,199,183,225;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,11,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.88,3.57,7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,2,3:0.273,0.273,0.365:7:0,1,0,2:0,1,0,0:0,0,4,3
chr1	115238177	.	T	TCCTTCAAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:3,2:8,0:3,9,0,2
chr1	115256669	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	115280193	.	CA	C,CAA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=158,197,196;MMQ=60,60,60;MPOS=23,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.64,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,3,3:0.143,0.155:23:8,3,1:7,0,2:4,13,1,5
chr1	115398044	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,9:0,2:0,0,7,4
chr1	115399788	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.315:8:2,0:1,2:2,4,1,1
chr1	115399940	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=182,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,1:9,3:6,9,0,4
chr1	115401136	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr1	115418751	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=176,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.137:26:10,0:13,3:10,13,0,3
chr1	115420905	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=99,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr1	115601528	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:11,7,1,1
chr1	115601615	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr1	115615636	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=146,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,1:1,2:3,6,0,3
chr1	115631924	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	116224940	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr1	116225180	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=234,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,7:0,5:0,1,1,11
chr1	116228220	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=261,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr1	116243874	.	ATCG	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:7,1:18,1:7,18,0,2
chr1	116243877	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=198,128;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:3,5:7,11:2,8,6,10
chr1	116245655	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:1,5,1,2
chr1	116260532	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,1:4,2:4,4,3,0
chr1	116260544	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=153,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:3,4,3,0
chr1	116268178	.	GAA	G,GAAAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,17,34;MFRL=0,155,0;MMQ=60,60,60;MPOS=7,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=23,21,27;RU=A;STR;TLOD=3.72,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.382,0.503:5:0,0,2:0,0,0:0,0,2,3
chr1	116283343	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,11,6
chr1	116283526	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	116311198	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	116383010	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,148;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.097:49:21,4:24,0:19,26,4,0
chr1	116383145	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:10,0:3,2:6,7,1,1
chr1	116383333	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,144;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,0:6,4:2,13,3,1
chr1	116383364	.	A	ATTTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=T;STR;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.846:4:0,0:0,2:0,0,2,2
chr1	116384534	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:7,2:6,4:6,7,2,4
chr1	116385467	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,198;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:1,6:1,7:1,1,9,4
chr1	116386243	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=191,93;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,1:3,2:5,3,2,1
chr1	116386244	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:3,4,4,0
chr1	116562210	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=161,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:4,3:17,0:11,10,3,0
chr1	116577981	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr1	116609126	.	TC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.736:16:0,7:4,5:1,3,9,3
chr1	116655272	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,3:12,0:13,9,1,2
chr1	116663724	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:3,7,0,2
chr1	116670774	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.223:21:9,2:3,2:11,6,2,2
chr1	116671061	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=234,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr1	116931984	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=220,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,0:4,2:10,0,2,0
chr1	116933372	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:14,3,2,0
chr1	116940481	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=163,179;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.495:10:1,2:1,2:2,3,4,1
chr1	116946469	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,2:6,3:10,5,4,1
chr1	116946605	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,3:7,0:4,11,0,3
chr1	116946635	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=148,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,3:4,2:2,7,1,4
chr1	117122285	.	G	GTCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=109,240;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.317:4:1,0:1,1:0|1:117122285_G_GTCC:117122285:1,2,0,1
chr1	117122288	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=109,138;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:1,1:2,2:0|1:117122285_G_GTCC:117122285:1,2,0,3
chr1	117142531	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,2:2,7:6,0,9,0
chr1	117142700	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=179,92;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,14:0.348:41:9,6:18,8:15,12,4,10
chr1	117142736	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=201,138;MMQ=60,37;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.234:36:10,5:18,3:15,13,5,3
chr1	117142855	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.255:37:13,5:15,4:15,13,8,1
chr1	117142868	.	CA	TG	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=180,160;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,8:0.235:36:13,4:15,4:14,14,6,2
chr1	117142977	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=184,195;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:1,15,0,2
chr1	117149041	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=138,175;MMQ=52,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:8,5,1,2
chr1	117150928	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=182,167;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:7,6:10,1:0|1:117150928_C_T:117150928:4,17,2,5
chr1	117150933	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=182,167;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.266:28:9,4:12,1:0|1:117150928_C_T:117150928:4,17,2,5
chr1	117150966	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=172,190;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,3:7,2:4,12,0,5
chr1	117151017	.	A	ACCCCCTCC	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,18;MFRL=179,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,0:0,4,1,1
chr1	117156326	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=198,184;MMQ=52,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.221:16:6,2:7,1:0|1:117156326_C_T:117156326:12,1,3,0
chr1	117156333	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=190,184;MMQ=52,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:6,1:9,1:0|1:117156326_C_T:117156326:14,1,3,0
chr1	117156459	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=172,187;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.282:44:14,8:18,4:19,13,4,8
chr1	117156490	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=156,162;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.177:43:19,5:17,2:20,16,1,6
chr1	117156584	.	TG	CA	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=189,207;MMQ=58,27;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:15,3:18,1:19,14,0,4
chr1	117156600	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=178,233;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:11,4:13,0:13,11,0,4
chr1	117158690	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=173,86;MMQ=49,36;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:7,3:13,3:11,9,2,4
chr1	117158857	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=134,160;MMQ=28,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:9,0:9,2:0|1:117158857_C_T:117158857:8,12,3,0
chr1	117158862	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=139,160;MMQ=30,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,0:10,3:0|1:117158857_C_T:117158857:7,12,3,0
chr1	117158898	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=33,26;MFRL=156,160;MMQ=25,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,3:5,10,3,0
chr1	117158909	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,22;MFRL=196,144;MMQ=30,24;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:9,0:8,4:7,10,3,1
chr1	117158972	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=29,35;MFRL=202,147;MMQ=48,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:9,2:12,3:14,7,3,2
chr1	117159024	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,29;MFRL=181,131;MMQ=25,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:7,2:5,3:4,8,1,4
chr1	117214318	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=156,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:3,1,2,2
chr1	117487710	.	AT	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,3,14
chr1	117509981	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:6,6:5,2:0|1:117509981_G_A:117509981:2,9,1,7
chr1	117509987	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:5,4:5,1:0|1:117509981_G_A:117509981:2,8,1,7
chr1	117560818	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,3:6,5:6,5,5,3
chr1	117603188	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:2,6,2,4
chr1	117605130	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.511:13:1,5:3,1:0,6,1,6
chr1	117618722	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr1	117622286	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=291,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0,2,2,4
chr1	117629155	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=106,40;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.159:17:10,0:4,2:0|1:117629155_G_A:117629155:5,10,1,1
chr1	117629160	.	A	AGTCGCGTGATCTCG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=106,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:10,0:1,2:0|1:117629155_G_A:117629155:3,8,1,1
chr1	117631391	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=111,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:7,7:1,5:4,4,8,4
chr1	117633133	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.231:15:7,3:4,0:7,5,3,0
chr1	117638946	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,1:10,1:8,12,1,1
chr1	117659416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=158,132;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:6,0:5,9:0,12,0,10
chr1	117660608	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=64,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,6,1
chr1	117661130	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:4,9,0,2
chr1	117690272	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,0:3,9:6,2,7,2
chr1	117695862	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=221,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:3,7,2,0
chr1	117696037	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,2:6,3:1,12,1,4
chr1	117712629	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,272;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	117957288	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=287,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,2,1
chr1	117957505	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=233,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:4,1:7,3:0,11,0,4
chr1	117984776	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=227,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr1	118065817	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:6,6,2,0
chr1	118166750	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=186,107;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:7,5:2,7:6,5,9,3
chr1	118167727	.	G	GT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,2:8,1:8,4,3,1
chr1	118168804	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=172,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,0:7,2:10,5,1,2
chr1	118168826	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,5:7,7:6,5,6,6
chr1	118168970	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,4:11,0:8,8,4,0
chr1	118170466	.	CTG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TG;STR;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.566:14:1,5:4,3:3,3,3,5
chr1	118171000	.	CATTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=193,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:1,4,0,4
chr1	118488616	.	ATCTG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr1	118491213	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,15;MFRL=238,78;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,0:3,0:0,5,0,2
chr1	118491215	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=238,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.466:9:2,0:3,1:0,5,0,4
chr1	118502087	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32,32;MFRL=118,135,195;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.60,4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.257,0.249:9:2,1,0:3,1,2:1,4,3,1
chr1	118502099	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,10;MFRL=118,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,0:2,5,2,0
chr1	118514496	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,67;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:0|1:118514496_C_T:118514496:11,5,1,1
chr1	118514508	.	T	TGGTCTGTGCC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:8,2:0|1:118514496_C_T:118514496:10,7,1,1
chr1	118526592	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	118566105	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=146,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:4,0:0|1:118566105_T_C:118566105:2,4,1,1
chr1	118566107	.	T	TATCCACCATGATCAAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=146,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:118566105_T_C:118566105:2,4,1,1
chr1	118617274	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=99,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:11,4:7,1:7,12,2,3
chr1	118644430	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=187,217;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.128:29:11,1:8,2:0|1:118644430_A_G:118644430:8,18,1,2
chr1	118644436	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,201;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:22,7:0.250:29:13,0:9,6:1|0:118644430_A_G:118644430:8,14,0,7
chr1	118693998	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:6,13,1,1
chr1	119433449	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	119466275	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=65,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr1	119925490	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=174,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr1	119935232	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=109,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,2:7,0:9,7,1,1
chr1	120166453	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=141,295;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	120166570	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:7,0:13,7:10,10,4,3
chr1	120263799	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.209:30:12,5:12,0:15,9,6,0
chr1	120269567	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:11,3:9,2:12,8,3,2
chr1	120285482	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,109;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,0:8,7:7,10,0,7
chr1	120293367	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	120293394	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=231,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:5,2,3,4
chr1	120293568	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,0,4
chr1	120296033	.	AACAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=268,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=AC;STR;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.689:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	120298314	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	120302539	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,0:6,2:10,7,2,0
chr1	120379932	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=148,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.278:27:13,0:6,7:8,12,2,5
chr1	120380008	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr1	120383054	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=124,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,1,1
chr1	120437547	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:4,15,1,1
chr1	120465425	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,141;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.352:18:7,0:4,5:5,7,0,6
chr1	120471857	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:5,2:0,9,1,2
chr1	120478177	.	GC	CT	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:18,0:16,6:15,20,0,6
chr1	120478285	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr1	120480394	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr1	120480709	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=255,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	120484421	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:0,2:5,2:1,4,0,4
chr1	120496119	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,3:3,1:0|1:120496119_A_T:120496119:7,1,1,3
chr1	120496127	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:0|1:120496119_A_T:120496119:9,1,2,3
chr1	120512104	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr1	120529750	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:0,8,1,4
chr1	120548095	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=140,178;MMQ=40,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:10,2:4,0:4,10,0,2
chr1	120572466	.	GT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,379;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	120927081	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,137;MMQ=25,25;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr1	143912316	.	G	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=101,130;MMQ=25,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,21:0.366:58:16,0:21,21:14,23,0,21
chr1	144013853	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=194,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,15:0.401:38:13,9:9,6:21,2,12,3
chr1	144013865	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=189,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,14:0.326:44:17,9:13,5:24,6,11,3
chr1	144617992	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=179,134;MMQ=42,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:144617992_T_G:144617992:5,3,0,2
chr1	144617997	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=179,134;MMQ=42,23;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:0|1:144617992_T_G:144617992:5,3,0,2
chr1	144816724	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,129;MMQ=31,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	144825525	.	AG	CT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=207,139;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144825525_AG_CT:144825525:0,1,0,1
chr1	144825528	.	GA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=207,139;MMQ=50,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:144825525_AG_CT:144825525:0,1,0,1
chr1	144828484	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=154,185;MMQ=52,32;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,1:0|1:144828484_G_A:144828484:6,4,0,2
chr1	144828497	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=145,187;MMQ=40,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0|1:144828484_G_A:144828484:4,3,1,3
chr1	144828532	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=122,219;MMQ=34,24;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:1,3,1,3
chr1	144828748	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=188,199;MMQ=30,23;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,2:3,4:4,5,6,0
chr1	144828764	.	GA	TT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=194,194;MMQ=52,23;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,2:8,4:3,10,7,0
chr1	144828784	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=201,203;MMQ=52,24;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:8,4:4,9,4,1
chr1	144852321	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=232,211;MMQ=51,35;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,3:3,1:6,0,4,0
chr1	144852545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=125,239;MMQ=42,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	144854052	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=36,30;MFRL=325,195;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:2,1,8,0
chr1	144854083	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=187,190;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,6:6,2:7,4,8,0
chr1	144854087	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=190,224;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:8,3:4,4:0|1:144854087_A_G:144854087:13,1,4,3
chr1	144854095	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=197,224;MMQ=60,43;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:9,3:6,4:0|1:144854087_A_G:144854087:14,1,4,3
chr1	144854277	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,4:2,10:1,4,1,13
chr1	144854454	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=223,206;MMQ=60,51;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:9,2:6,3:13,3,4,1
chr1	144854491	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=174,208;MMQ=56,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:6,3:5,11:0|1:144854491_T_G:144854491:8,3,10,4
chr1	144854497	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=27,30;MFRL=116,232;MMQ=56,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,11:0.546:20:4,2:5,9:0|1:144854491_T_G:144854491:6,3,7,4
chr1	144854501	.	CCT	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=175,191;MMQ=56,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:5,1:11,1:11,6,2,0
chr1	144854528	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=183,206;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:9,0:16,2:0|1:144854528_A_G:144854528:15,11,0,2
chr1	144854537	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=156,174;MMQ=60,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:12,1:18,2:0|1:144854528_A_G:144854528:15,15,0,3
chr1	144854730	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=166,132;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,5:5,0:1,10,0,5
chr1	144855935	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,186;MMQ=52,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:11,1:2,4:3,10,0,5
chr1	144857068	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,177;MMQ=40,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:3,6,1,3
chr1	144859720	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr1	144859889	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,299;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.100:38:20,1:14,2:16,19,1,2
chr1	144860026	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:5,8:2,9:0,7,5,12
chr1	144863505	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=217,209;MMQ=60,37;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,2:4,4:0,9,0,6
chr1	144866509	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:4,1:3,7:7,0,7,1
chr1	144868170	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=124,191;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,4:8,2:6,9,2,4
chr1	144868204	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:0,7,1,5
chr1	144868239	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:0,6,0,6
chr1	144871889	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:4,5:9,8:2,11,5,8
chr1	144873794	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:5,6:1,2:5,1,8,0
chr1	144873818	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=152,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.577:26:8,9:2,6:7,4,13,2
chr1	144873840	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:5,9:5,9:6,4,12,6
chr1	144873962	.	CT	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=129,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.396:41:8,7:17,9:8,17,8,8
chr1	144874038	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=226,164;MMQ=60,51;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,6:7,6:3,10,2,10
chr1	144874070	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=210,187;MMQ=60,51;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:0,7,0,8
chr1	144874088	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=205,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,2:4,2:0,10,0,4
chr1	144874641	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=133,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,3:5,7:13,1,8,2
chr1	144874760	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=137,162;MMQ=60,49;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:6,3:11,6:11,6,5,4
chr1	144874950	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=208,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,1:4,6:0,7,0,7
chr1	144877366	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=206,264;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:1,4,1,3
chr1	144881389	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:6,5:13,7:14,5,8,4
chr1	144881711	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=241,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:1,3:9,0:0,10,0,3
chr1	144882912	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:2,0:1,7:0,4,1,6
chr1	144886063	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:4,7:4,6:5,4,10,3
chr1	144886092	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,17:0.581:29:6,7:6,10:5,7,10,7
chr1	144886409	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=154,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,4:2,3:1,3,0,7
chr1	144892089	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=253,214;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,5,0
chr1	144892149	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=164,169;MMQ=59,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,3:8,3:13,1,5,1
chr1	144906159	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,223;MMQ=60,33;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,3:13,0:7,14,0,3
chr1	144916486	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=178,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:7,0,5,0
chr1	144916493	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=178,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.498:14:3,3:4,4:7,0,7,0
chr1	144916676	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=180,191;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,8:8,4:5,9,7,5
chr1	144917827	.	CA	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=172,140;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=79.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,26:0.574:45:10,14:9,12:11,8,14,12
chr1	144917841	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=169,140;MMQ=42,43;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,35:0.655:53:9,18:9,17:12,6,20,15
chr1	144922109	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,2:7,6:3,7,1,7
chr1	144922171	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=173,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:3,4,3,2
chr1	144923823	.	TAGGAAGAAACGGCA	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGAAGAAACGGCA;STR;TLOD=128.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.971:29:0,13:0,15:0,0,14,15
chr1	144923887	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=205,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.172:16:7,0:7,2:2,12,0,2
chr1	144930571	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.452:38:12,11:8,6:13,8,13,4
chr1	144930596	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.435:51:14,13:14,9:16,13,15,7
chr1	144931727	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.703:15:2,2:2,8:1,3,1,10
chr1	144946768	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,3:6,7:1,7,0,10
chr1	145016020	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=142.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,41:0.956:42:0,20:1,20:0,1,13,28
chr1	145016032	.	C	CA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:8,2:12,4:5,15,0,8
chr1	145016035	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.125:33:13,2:16,2:8,21,0,4
chr1	145021024	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,9:0.370:25:9,3:7,6:0|1:145021024_G_C:145021024:14,2,9,0
chr1	145021034	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:8,3:9,8:0|1:145021024_G_C:145021024:17,0,11,0
chr1	145021265	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=200,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,2:7,1:0,16,0,3
chr1	145074882	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=196,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:10,2:13,4:22,1,5,1
chr1	145074919	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.064:44:17,1:25,1:31,11,2,0
chr1	145074939	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,23:0.500:46:12,8:11,15:17,6,11,12
chr1	145075903	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=201,258;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,2:5,3:0,13,0,5
chr1	145075923	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=234,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,2:8,0:0,15,0,2
chr1	145103844	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.424:43:13,10:11,8:20,5,16,2
chr1	145104052	.	AGT	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:5,3:6,5:0,11,0,8
chr1	145104075	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=194,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,1:8,2:0,15,0,3
chr1	145109430	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=186,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr1	145109456	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:5,4:9,1:13,1,4,1
chr1	145109468	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,9:0,0,16,2
chr1	145109493	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=146,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.192:29:12,2:12,3:23,1,4,1
chr1	145112284	.	CCG	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,2:13,2:0|1:145112284_CCG_C:145112284:23,2,4,0
chr1	145112287	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=191,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,6:10,5:17,0,9,2
chr1	145112288	.	G	GCA	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:10,1:13,2:0|1:145112284_CCG_C:145112284:23,2,4,0
chr1	145112313	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.308:37:9,6:17,5:22,4,7,4
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:7,4:11,5:20,0,9,0
chr1	145115820	.	T	C	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,172;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,17:0.193:91:32,7:37,10:33,41,9,8
chr1	145273473	.	T	C	.	.	DP=76;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=163,175;MMQ=51,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,22:0.304:73:25,13:26,9:15,36,5,17
chr1	145273520	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=202,203;MMQ=27,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,3:10,1:2,16,1,3
chr1	145281361	.	TC	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=186,145;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,14:0.269:53:27,4:11,10:19,20,8,6
chr1	145281780	.	T	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=199,179;MMQ=57,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,15:0.277:55:13,9:26,5:13,27,7,8
chr1	145282093	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,191;MMQ=49,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,1:11,3:4,19,0,4
chr1	145290317	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=165,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,10:0.199:53:22,4:20,6:40,3,10,0
chr1	145290320	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=64.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,22:0.434:51:16,10:13,12:27,2,21,1
chr1	145290346	.	A	G	.	.	DP=63;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=130,168;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,35:0.584:60:13,16:11,18:17,8,25,10
chr1	145290351	.	A	G	.	.	DP=76;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=155,170;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,15:0.213:73:27,8:28,7:39,19,9,6
chr1	145290377	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=8;MBQ=26,34;MFRL=136,175;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=73.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,26:0.334:79:27,12:26,14:22,31,14,12
chr1	145290398	.	G	A	.	.	DP=96;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=159,158;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,20:0.236:87:27,14:38,6:29,38,6,14
chr1	145290401	.	T	G	.	.	DP=90;ECNT=8;MBQ=27,35;MFRL=158,175;MMQ=52,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,12:0.143:89:39,3:36,9:0|1:145290401_T_G:145290401:33,44,4,8
chr1	145290409	.	G	A	.	.	DP=93;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=162,175;MMQ=52,40;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,13:0.152:90:39,4:36,9:0|1:145290401_T_G:145290401:37,40,4,9
chr1	145290498	.	T	G	.	.	DP=87;ECNT=7;MBQ=29,31;MFRL=159,183;MMQ=52,50;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,14:0.178:82:31,5:37,9:34,34,4,10
chr1	145290535	.	C	T	.	.	DP=65;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=160,152;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,9:0.153:63:23,3:31,6:16,38,2,7
chr1	145290547	.	C	A	.	.	DP=56;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=162,152;MMQ=60,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.140:55:21,2:26,5:11,37,1,6
chr1	145290553	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,14:0.273:53:16,7:22,7:7,32,3,11
chr1	145290560	.	T	C	.	.	DP=52;ECNT=7;MBQ=29,32;MFRL=162,138;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,5:0.119:48:19,1:23,4:7,36,1,4
chr1	145290570	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=7;MBQ=32,25;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,12:0.270:46:15,8:19,4:6,28,1,11
chr1	145290583	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=169,230;MMQ=60,33;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:14,0:16,2:3,27,1,1
chr1	145298070	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=214,169;MMQ=40,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:8,2:11,3:16,3,4,1
chr1	145298089	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=212,204;MMQ=25,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:5,4:7,3,4,1
chr1	145298095	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=193,231;MMQ=24,29;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,3:5,0:5,3,2,1
chr1	145298129	.	C	CTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=170,124;MMQ=38,23;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:145298129_C_CTT:145298129:0,4,0,1
chr1	145298130	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=170,124;MMQ=38,23;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:145298129_C_CTT:145298129:0,4,0,1
chr1	145298416	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=218,226;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr1	145438702	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=236,277;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr1	145439634	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=141,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:6,13,2,0
chr1	145456732	.	GAA	G,GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32,32;MFRL=199,144,150;MMQ=60,60,60;MPOS=17,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.41,12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,7:0.224,0.355:21:2,2,2:4,2,4:2,7,1,11
chr1	145473898	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:12,7:8,0:11,9,7,0
chr1	145475584	.	TG	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=169,114;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:9,0:11,13:11,9,0,13
chr1	145475728	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=251,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	145487217	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,3:5,0:8,0,3,0
chr1	145507826	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=211,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.471:19:2,3:8,5:3,7,4,5
chr1	145510376	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,238;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	145518051	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:8,7:15,0:19,4,7,0
chr1	145518092	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=152,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:15,0:25,4:20,20,2,2
chr1	145525223	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=203,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:1,10,0,2
chr1	145530254	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=130,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:4,3:7,1:4,8,1,3
chr1	145530939	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=172,324;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,1:11,2:9,5,3,0
chr1	145532043	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:145532043_TG_T:145532043:1,0,1,0
chr1	145532045	.	TGTG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=22,15;MFRL=208,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:145532043_TG_T:145532043:1,0,1,0
chr1	145532050	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:145532043_TG_T:145532043:0,0,1,0
chr1	145532994	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=140,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,4:2,3:0|1:145532994_GT_G:145532994:4,1,7,0
chr1	145533001	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:0|1:145532994_GT_G:145532994:4,2,8,0
chr1	145533314	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:2,4:1,3:2,2,4,3
chr1	145535921	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=126,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,2:2,0,2,3
chr1	145536143	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=199,138;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,0:3,7:0|1:145536143_A_C:145536143:3,6,0,7
chr1	145536146	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=199,138;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,0:3,6:0|1:145536143_A_C:145536143:3,6,0,7
chr1	145538664	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	145538915	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,0:8,5:3,10,0,5
chr1	145549292	.	AT	CA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=219,235;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,1,0
chr1	145555653	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:1,8:2,5:3,0,11,2
chr1	145556986	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=182,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr1	145558565	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr1	145558824	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=208,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.444:18:4,2:6,5:8,2,6,2
chr1	145560918	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:10,1:5,1:9,6,1,2
chr1	145562073	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:7,1,4,2
chr1	145578792	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=173,133;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:7,14,0,2
chr1	145579090	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,249;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,0:1,2:2,4,0,2
chr1	145579272	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:0,9,0,2
chr1	145581644	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:0,0:0,2,0,3
chr1	145585317	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	145586780	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,4:7,3:8,4,5,2
chr1	145587250	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr1	145587539	.	TC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=262,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:4,2:3,5,1,1
chr1	145587631	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=188,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.595:3:0,1:1,0:0|1:145587631_G_C:145587631:1,0,1,1
chr1	145587634	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=21,31;MFRL=203,266;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:1,0:2,0,1,1
chr1	145587640	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=216,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:145587631_G_C:145587631:3,0,1,0
chr1	145587644	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=216,245;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:145587631_G_C:145587631:3,0,1,0
chr1	145588536	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:3,2:7,11:8,2,2,11
chr1	145589491	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	145597116	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr1	145597417	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr1	145598459	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,4:0,0,4,2
chr1	145601861	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=52.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,6,11
chr1	145663414	.	G	GCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr1	145687100	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=211,278;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:1,6,0,3
chr1	145696694	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr1	145706856	.	A	AAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:145706856_A_AAAT:145706856:0,0,0,1
chr1	145706857	.	C	CAGGAATT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0|1:145706856_A_AAAT:145706856:0,0,0,1
chr1	145747133	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:11,0:12,9,1,1
chr1	145826770	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=195,134;MMQ=57,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr1	146633933	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=134,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	146638519	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:21,0:10,3:10,21,0,3
chr1	146639588	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr1	146643492	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:14,0,2,0
chr1	146643495	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=149,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:11,0,5,0
chr1	146643555	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,16:0.449:36:12,7:7,9:9,11,8,8
chr1	146643580	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=149,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,14:0.384:37:18,4:5,10:6,17,5,9
chr1	146656040	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,8:4,3:6,2,9,2
chr1	146656097	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=115,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,10:7,3:4,9,6,7
chr1	146673178	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	146680394	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=195,64;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:3,3:6,0:7,2,2,1
chr1	146683873	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=204,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr1	146684131	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	146685121	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=209,273;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	146687250	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	146696435	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=208,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr1	146714255	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	146714281	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=237,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	146714392	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=150,182;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,2:3,0:3,1,1,2
chr1	146714427	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=136,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:4,0:0,5:1,3,2,3
chr1	146724408	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=153,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,1:6,6:0,8,3,4
chr1	146728149	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.504:24:7,4:4,8:7,5,9,3
chr1	146728162	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=87.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,13,12
chr1	146739039	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=178,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr1	146739068	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=227,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:4,1,2,1
chr1	146739277	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:0,4,0,7
chr1	146740576	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,7:1,3:0,2,0,10
chr1	146747153	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:0,6,0,7
chr1	146747232	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=247,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr1	146751782	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr1	146756222	.	AAAAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=99,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAAC;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr1	146759320	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,4:2,4:4,0,7,1
chr1	146763089	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr1	146766069	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,3:0,0,6,3
chr1	146766105	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,1:6,2:10,5,3,0
chr1	146767062	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=267,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:4,2,1,3
chr1	147085066	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	147086504	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr1	147087721	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=107,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr1	147096794	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=268,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:0,1,0,11
chr1	147096828	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	147131005	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=118,147;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.200:43:9,8:26,0:32,3,8,0
chr1	147131465	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,5,4
chr1	147131501	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=117,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,1:5,2:3,8,0,3
chr1	147131663	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:5,4,2,0
chr1	147131729	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=202,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:2,0:8,2:6,5,1,1
chr1	147131945	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr1	147230217	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=170,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,0:4,5:6,0,5,0
chr1	147381411	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=22,27;MFRL=202,1122916;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.334:7:3,0:1,2:0|1:147381411_C_A:147381411:1,4,2,0
chr1	147381413	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=205,1122916;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.301:8:2,0:2,0:0|1:147381411_C_A:147381411:1,5,2,0
chr1	147381415	.	C	CTTCATTTTTGAAAGT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,14;MFRL=207,1122916;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:3,0:0|1:147381411_C_A:147381411:0,5,2,0
chr1	147381444	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=259,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr1	148004475	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=147,253;MMQ=40,22;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr1	148009318	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=220,207;MMQ=40,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,1:12,1:20,5,2,0
chr1	148009349	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=204,181;MMQ=40,40;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:21,1:10,4:28,3,5,0
chr1	148009510	.	G	A	.	.	DP=135;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,24:0.199:123:55,8:44,15:45,54,12,12
chr1	148252164	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,166;MMQ=47,22;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:11,3:4,4:6,9,1,6
chr1	148342066	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=131,139;MMQ=44,20;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,1:5,3:2,5,0,4
chr1	148644408	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,22;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr1	148644428	.	TG	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=215,161;MMQ=24,22;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1,1,0,1
chr1	148756347	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,183;MMQ=60,22;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr1	148756397	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=215,115;MMQ=23,23;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	148756448	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=115,188;MMQ=23,23;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:0,3,3,2
chr1	149755813	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=188,156;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,0:5,3:7,4,3,0
chr1	149783975	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=164,384853;MMQ=50,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,13:0.207:65:37,0:15,13:14,38,0,13
chr1	149880650	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=205,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	149882087	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.846:4:0,1:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:0,0,4,0
chr1	149882092	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,2:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:0,0,4,0
chr1	149882097	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,23;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.709:5:1,2:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:1,0,4,0
chr1	149882103	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,15;MFRL=96,252;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:2,0:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:2,0,3,0
chr1	149882105	.	CA	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,16;MFRL=96,252;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:2,0:0,0:0|1:149882087_A_C:149882087:2,0,1,0
chr1	149897701	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:11,9:7,0:10,9,9,0
chr1	149897864	.	TG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=174,278;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:3,0:7,1:9,9,1,1
chr1	149900985	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=244,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.416:12:3,3:3,1:5,2,4,1
chr1	149902342	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,315;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:12,7,2,1
chr1	149906024	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,4:7,0:10,4,4,0
chr1	149906167	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=118,114;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:18,0:11,3:10,19,1,2
chr1	149906272	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:15,2:4,0:11,8,1,1
chr1	149907175	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=211,258;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:3,0:1,8,1,1
chr1	149907259	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:11,6:6,2:9,8,4,4
chr1	149922148	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=219,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr1	149939361	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.239:14:2,1:6,1:3,8,3,0
chr1	149943157	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:4,8,1,1
chr1	150049934	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	150053893	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:6,0:10,3,1,1
chr1	150082563	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,307;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:2,2:6,0:9,1,2,0
chr1	150122493	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	150128425	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=243,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,1:3,1:0,5,1,2
chr1	150129267	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	150195530	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:9,0:16,8:13,12,0,8
chr1	150199039	.	CTCCTCT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=126,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCCTCT;STR;TLOD=32.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.532:17:2,2:6,7:0,8,4,5
chr1	150201638	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150201638_T_TC:150201638:0,0,0,1
chr1	150201657	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=212,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150201638_T_TC:150201638:0,1,0,1
chr1	150235055	.	A	ACTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,18;MFRL=205,37;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,1:2,0:0|1:150235055_A_ACTC:150235055:2,2,1,1
chr1	150235061	.	T	TAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=205,37;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:0|1:150235055_A_ACTC:150235055:2,2,1,1
chr1	150235062	.	C	CTCCAGGTACACA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=205,37;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:0|1:150235055_A_ACTC:150235055:2,2,1,1
chr1	150236171	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:4,1:14,1:11,7,0,2
chr1	150241230	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=193,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.377:24:9,4:6,4:4,11,3,6
chr1	150257152	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:4,0:4,5:0|1:150257152_A_AC:150257152:0,9,0,5
chr1	150257161	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,0:4,5:0|1:150257152_A_AC:150257152:0,8,0,5
chr1	150258838	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,1:6,6:9,6,7,1
chr1	150297350	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=136,66;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:9,1:0,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:5,6,2,0
chr1	150297353	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=139,66;MMQ=60,50;MPOS=-1073741819;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:1,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:6,8,2,0
chr1	150297357	.	AG	TT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,15;MFRL=136,66;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:2,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:6,9,2,0
chr1	150297360	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=25,16;MFRL=139,66;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:2,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:6,10,2,0
chr1	150297363	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=32,21;MFRL=139,66;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:13,1:2,0:0|1:150297350_TA_T:150297350:6,10,2,0
chr1	150300727	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,3:2,1:6,0,2,2
chr1	150305182	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=104,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.149:31:9,4:17,0:22,5,2,2
chr1	150305374	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:3,10:8,0:7,5,10,0
chr1	150315719	.	AAAAAAAT	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=137,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:0,1:9,1:9,0,2,0
chr1	150315722	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=136,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr1	150315724	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,0:0,9:0,0,9,0
chr1	150337420	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:12,0:18,6:9,21,0,7
chr1	150432870	.	GGTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GTT;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.717:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	150445819	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=88,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,8:8,2:7,6,6,4
chr1	150471848	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.726:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	150477061	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:5,1,5,1
chr1	150484395	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=176,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=C;STR;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	150524787	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=166,52;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:12,4,1,1
chr1	150524800	.	A	ACACACGTGATTCAGGATG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=165,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:13,0:3,2:18,3,1,1
chr1	150524875	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=178,61;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,2:13,0:13,17,0,2
chr1	150524878	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=136,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:18,2:11,1:11,18,1,2
chr1	150526020	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=153,151;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.194:22:8,0:10,3:7,11,0,4
chr1	150526044	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,3:5,7:4,5,2,8
chr1	150526134	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=125,212;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,0:7,4:3,11,0,4
chr1	150526787	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,21;MFRL=135,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.408:5:2,0:1,1:0|1:150526787_C_A:150526787:3,0,2,0
chr1	150526806	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=68,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.352:6:1,0:1,0:0|1:150526787_C_A:150526787:3,1,2,0
chr1	150526810	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=68,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:150526787_C_A:150526787:3,1,1,0
chr1	150528090	.	G	GACAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=AC;STR;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,0,8
chr1	150528118	.	T	TACAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=AC;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	150529322	.	T	TAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	150529665	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,12;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:150529665_G_C:150529665:1,0,2,0
chr1	150529669	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=16,33;MFRL=134,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0|1:150529665_G_C:150529665:1,0,2,0
chr1	150529673	.	CGGA	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:150529665_G_C:150529665:2,0,1,0
chr1	150529681	.	AGG	CCC	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:150529665_G_C:150529665:2,1,1,0
chr1	150529685	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,12;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:150529665_G_C:150529665:2,1,1,0
chr1	150529689	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=150,136;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:150529665_G_C:150529665:2,2,1,0
chr1	150530548	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,1:10,1:15,7,1,1
chr1	150531380	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=209,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.815:8:0,2:1,4:1,0,7,0
chr1	150532626	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=211,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.692:21:3,7:3,6:3,3,6,9
chr1	150534614	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,16:0.456:35:10,7:8,8:9,10,5,11
chr1	150550019	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=50.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,4:0,10:0,0,1,13
chr1	150671243	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:2,6:6,7:4,4,4,9
chr1	150676485	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr1	150676674	.	TA	T,TAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,26,30;MFRL=201,216,194;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=A;STR;TLOD=6.67,3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,2:0.358,0.233:10:2,2,1:2,1,1:1,3,2,4
chr1	150679104	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:7,7:15,0:11,11,7,0
chr1	150679358	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:0,3,0,4
chr1	150686547	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,180;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.314:33:11,9:12,0:12,11,10,0
chr1	150686654	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:11,2:8,11,0,2
chr1	150730279	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	150769317	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:6,6,1,1
chr1	150771703	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,17:0,17:0,0,14,20
chr1	150789906	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,2:6,5:7,5,2,5
chr1	150789961	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=103,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:1,2,0,6
chr1	150790313	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=13,16;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,0:2,0:0|1:150790313_C_A:150790313:8,0,2,0
chr1	150790318	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=9,11;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,0:2,0:0|1:150790313_C_A:150790313:8,0,2,0
chr1	150790321	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=15,23;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:1,0:2,1:0|1:150790313_C_A:150790313:9,0,2,0
chr1	150790340	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:2,0:5,0:0|1:150790313_C_A:150790313:10,0,2,0
chr1	150790345	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=167,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:2,0:4,0:0|1:150790313_C_A:150790313:9,0,2,0
chr1	150799019	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:19,0:14,3:19,14,3,0
chr1	150804392	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=191,302;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:1,2,3,0
chr1	150804424	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,23;MFRL=211,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:150804424_CG_C:150804424:1,3,1,0
chr1	150804429	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=206,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,0,3
chr1	150804431	.	CTC	AAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:150804424_CG_C:150804424:0,3,1,0
chr1	150825320	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:0|1:150825320_A_T:150825320:3,12,1,1
chr1	150825324	.	T	TATCTCTAGAG	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:150825320_A_T:150825320:3,12,1,1
chr1	150848912	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,0:3,3:7,3,3,0
chr1	150849071	.	ACC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=C;STR;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.886:5:0,3:0,1:0,0,1,4
chr1	150923774	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:4,4:0,7:4,0,8,3
chr1	150933658	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,126;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.430:16:5,0:4,5:2,7,0,7
chr1	150938571	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=143,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:5,1,5,2
chr1	150938616	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,8:0,0,9,8
chr1	150939042	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.107:40:20,3:16,0:22,14,2,2
chr1	150939744	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	150940357	.	GC	TT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,6:6,6:7,6,5,7
chr1	150941381	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:1,10:3,4:2,2,13,2
chr1	150958977	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:1,3,0,3
chr1	150970836	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=279,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr1	150972538	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr1	150974162	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=238,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,7:1,5:1,1,9,3
chr1	150981267	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	150990466	.	C	CAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr1	150997940	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=166,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,5,3
chr1	150999863	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	151011155	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:4,7,0,2
chr1	151018318	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,253;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,4:9,0:8,7,0,4
chr1	151026815	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr1	151028234	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,12:0,11:0,0,10,13
chr1	151039609	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr1	151079555	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=159,38;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:5,4,1,1
chr1	151079559	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,69;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:3,3:3,4,2,1
chr1	151089803	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=105,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:4,4,2,0
chr1	151090795	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,0:3,9:0|1:151090795_AG_A:151090795:1,5,0,9
chr1	151090798	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:3,0:3,9:0|1:151090795_AG_A:151090795:1,5,0,9
chr1	151104950	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,14,0
chr1	151108137	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,10:0,1:0,0,4,7
chr1	151109641	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	151110981	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=168,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,1:1,0:0|1:151110981_CTG_C:151110981:1,2,1,0
chr1	151110985	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,13;MFRL=168,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:2,0:1,0:0|1:151110981_CTG_C:151110981:1,2,1,0
chr1	151114882	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr1	151115186	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr1	151139073	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.280:9:4,2:2,0:0,7,0,2
chr1	151139680	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=129,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:20,4:15,0:20,15,2,2
chr1	151143166	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:1,0:0,7,0,2
chr1	151143408	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=146,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,1:4,1:8,2,2,0
chr1	151144057	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=267,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:4,2,8,0
chr1	151146171	.	G	GAACCATGGC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr1	151146186	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr1	151149601	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr1	151209297	.	CTTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	151210789	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,1,4
chr1	151237589	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,8,3
chr1	151239570	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=211,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:2,4:1,6:2,1,6,4
chr1	151252694	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,1:12,7,3,0
chr1	151278829	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=155,53;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:13,0:7,2:7,13,1,1
chr1	151282841	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=205,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:6,1:0,15,0,2
chr1	151288159	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=174,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:5,3:11,0:9,8,1,2
chr1	151288172	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:6,3:4,6:4,7,6,3
chr1	151314379	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=212,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.571:7:0,2:2,2:2,1,4,0
chr1	151337788	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:2,4:0,7:0,2,2,9
chr1	151341703	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=142,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:1,2,0,7
chr1	151341728	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=175,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr1	151342812	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,1,1
chr1	151373200	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=106.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,16:0,13:0,0,15,14
chr1	151377244	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=251,211;MMQ=60,56;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:151377244_A_C:151377244:1,3,1,0
chr1	151377248	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:151377244_A_C:151377244:0,0,2,3
chr1	151377250	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=251,211;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,0:0|1:151377244_A_C:151377244:1,3,1,0
chr1	151378736	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=90,74;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,4:0.111:43:20,0:15,3:0|1:151378736_C_T:151378736:22,17,2,2
chr1	151378749	.	GGGGT	G	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=97,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,4:0.100:48:24,0:18,4:0|1:151378736_C_T:151378736:25,19,2,2
chr1	151379818	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=142,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:2,6,0,4
chr1	151380505	.	AAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAG;STR;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	151380727	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=180,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.337:19:11,4:2,1:4,9,2,4
chr1	151381320	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=49.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.860:19:0,4:1,11:0,2,3,14
chr1	151384052	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=136,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:1,1:6,3:6,2,4,0
chr1	151384711	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=228,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	151395782	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	151396037	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,2,10
chr1	151396124	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	151400942	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,1:1,6:0,1,0,7
chr1	151402045	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=110,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:3,0,7,0
chr1	151492610	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:10,2:5,2:15,0,5,1
chr1	151497140	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:6,3:3,3:2,7,3,5
chr1	151497376	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=196,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	151499635	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,8:0,2:0,1,2,8
chr1	151501737	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,285;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	151502396	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=151,314;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,1:4,1:13,4,1,1
chr1	151502427	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,4:5,1:8,3,4,1
chr1	151504778	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	151505008	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=109,72;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.176:26:8,4:14,0:10,12,3,1
chr1	151505088	.	CTTT	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=19,19;MFRL=168,266;MMQ=44,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr1	151505103	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=234,168;MMQ=60,44;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:151505103_T_TG:151505103:0,3,0,1
chr1	151505112	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=224,168;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:151505103_T_TG:151505103:0,4,0,1
chr1	151505127	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=185,168;MMQ=60,44;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:151505103_T_TG:151505103:0,4,0,1
chr1	151507620	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=147,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.330:21:9,1:5,1:0,14,7,0
chr1	151512802	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:6,1:5,2:9,2,2,2
chr1	151542099	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=153,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:6,5:1,2:6,1,5,2
chr1	151546931	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,3:2,5:0,7,1,7
chr1	151551320	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=125,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:1,4,0,3
chr1	151552301	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,3:4,4:0,4,0,7
chr1	151634803	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	151665550	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,183;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:9,0:10,9:2,17,0,10
chr1	151665554	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=153,183;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=32.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:5,0:9,9:1,17,0,9
chr1	151666826	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:3,1:8,2,1,1
chr1	151681567	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,2:7,2:7,7,2,2
chr1	151686983	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:10,0,2,0
chr1	151688298	.	T	TACCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=242,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr1	151688317	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=223,162;MMQ=60,60;MPOS=-1073741814;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:3,1:3,2,3,0
chr1	151688328	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=223,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:1,0:3,0:3,2,1,0
chr1	151700189	.	C	CCTG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,5:0,0,0,9
chr1	151700214	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=216,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr1	151701345	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=177,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:4,3,0,3
chr1	151733385	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:151733385_A_AGG:151733385:1,2,0,1
chr1	151733387	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=136,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:151733385_A_AGG:151733385:1,2,0,1
chr1	151735582	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=163,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:9,1:2,1:1,10,1,1
chr1	151740479	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,2:0,16:0,0,13,5
chr1	151742550	.	GGAGAGA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=GA;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:0,0,4,1
chr1	151742565	.	GGGAGACCATGGGGAGACGGAGAC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=106,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:0|1:151742550_GGAGAGA_G:151742550:1,0,5,2
chr1	151742682	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=152,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:11,12,0,2
chr1	151747043	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,5:1,6:0,1,5,6
chr1	151747733	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr1	151747799	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr1	151748425	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=36.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr1	151751081	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,5:1,3:1,0,6,2
chr1	151754112	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	151755370	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:9,7,2,0
chr1	151780177	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,268;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	151789588	.	C	CTG,CTGTGTG,CTGTGTGTG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,35,31,34;MFRL=0,132,181,183;MMQ=60,59,41,40;MPOS=25,13,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,11,13,14;RU=TG;STR;TLOD=3.02,4.99,6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,1,2,4:0.165,0.298,0.469:7:0,1,0,2:0,0,2,1:0,0,7,0
chr1	151789609	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr1	151789611	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=139,150;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:1,0,8,1
chr1	151789647	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=250,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,5:0,5:1,1,8,3
chr1	151802012	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=198,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:2,9,0,2
chr1	151810304	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=196,298;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr1	151810909	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	151811566	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=156,65;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:3,8,1,1
chr1	151811585	.	AG	GC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=163,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:4,0:0|1:151811585_AG_GC:151811585:3,10,1,1
chr1	151811589	.	A	ACTGCATCTGCC	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,24;MFRL=163,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,0:0|1:151811585_AG_GC:151811585:2,9,1,1
chr1	151825991	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=215,117;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,7:2,8:0,6,7,8
chr1	152005327	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:0,3,0,8
chr1	152009530	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	152080631	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,0:14,3:14,16,3,0
chr1	152082956	.	GCTC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:5,0:4,2:6,4,1,1
chr1	152086620	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=162,171;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:152086620_T_A:152086620:0,1,0,1
chr1	152086626	.	T	TTCCAACGAAGGCCTCAAAGAGGTCCAAATA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=162,171;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:152086620_T_A:152086620:0,1,0,1
chr1	152127279	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=116,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.139:45:19,3:19,2:11,28,2,4
chr1	152185762	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,1598;MMQ=60,53;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,6,2
chr1	152185768	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,901;MMQ=60,43;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,2,2
chr1	152185774	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,38;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,0,2
chr1	152185780	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,38;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:152185762_C_G:152185762:0,0,0,2
chr1	152188176	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=143,210;MMQ=25,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:19,3:30,1:29,20,1,3
chr1	152188463	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,145;MMQ=27,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,21:0.391:54:17,10:15,10:17,16,7,14
chr1	152191051	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,210;MMQ=60,54;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,1:11,3:10,10,2,2
chr1	152192114	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=126,158;MMQ=34,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,18:1,10:1,0,16,13
chr1	152193990	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,2,8
chr1	152195728	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.882:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr1	152276040	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,7670;MMQ=60,29;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,3:5,0:8,8,0,3
chr1	152278010	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,0;MFRL=196,97;MMQ=27,22;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.408:20:7,0:5,0:0|1:152278010_T_A:152278010:3,9,8,0
chr1	152278017	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=195,97;MMQ=27,22;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.390:21:7,8:6,0:0|1:152278010_T_A:152278010:4,9,8,0
chr1	152278036	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=154,97;MMQ=27,22;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,8:5,0:7,6,8,0
chr1	152282838	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,144;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,0:11,2:15,12,2,0
chr1	152283742	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,207;MMQ=45,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:5,1:5,5:4,6,5,1
chr1	152326487	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,188;MMQ=60,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:21,4:13,0:8,26,4,0
chr1	152330166	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr1	152384498	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,3:3,0,7,0
chr1	152538358	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=209,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:8,0,4,0
chr1	152538646	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=157,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.240:20:8,1:3,1:7,8,0,5
chr1	152552123	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:6,2,2,0
chr1	152552461	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=110,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:4,3:10,3:5,9,1,5
chr1	152671778	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:12,6:2,0:8,6,6,0
chr1	152681543	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,10:0,2:0,0,8,4
chr1	152681680	.	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=119,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.365:17:5,3:6,2:6,5,3,3
chr1	152733184	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=168,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,0:8,2:12,6,2,0
chr1	152759678	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:7,0,4,0
chr1	152759950	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=125,152;MMQ=45,37;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:6,2:4,2:5,6,3,1
chr1	153004721	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=203,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,6:1,2:2,1,8,0
chr1	153004778	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=90,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,1:7,2:17,3,2,1
chr1	153004809	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=126,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,4:8,3:11,5,3,4
chr1	153066044	.	GTGGGGAAGGTGT	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=184,81;MMQ=52,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:12,0:8,2:0|1:153066044_GTGGGGAAGGTGT_G:153066044:16,12,0,2
chr1	153066057	.	CACAGGAGGACATTTT	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=213,81;MMQ=53,51;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:12,0:11,2:0|1:153066044_GTGGGGAAGGTGT_G:153066044:15,15,0,2
chr1	153085306	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,276;MMQ=38,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:1,1,0,4
chr1	153122310	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=110,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.528:13:5,5:1,1:5,1,5,2
chr1	153122620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr1	153234602	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr1	153279462	.	TAAG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	153283004	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=45.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,13:0,3:0,0,17,0
chr1	153283179	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=97,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,6:4,8:3,4,4,10
chr1	153312792	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,120;MMQ=60,35;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,4:4,0:6,3,4,0
chr1	153314347	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr1	153315467	.	T	TAAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,10,1
chr1	153315784	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	153317723	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:9,3:7,4:9,7,6,1
chr1	153362788	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=213,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:4,1:3,6:3,4,4,4
chr1	153430249	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.240:11:4,2:3,0:7,2,2,0
chr1	153509890	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:5,5:5,2:0|1:153509890_T_C:153509890:4,8,5,2
chr1	153509892	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=175,131;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,8:0.428:19:6,5:4,3:1|0:153509890_T_C:153509890:7,4,2,6
chr1	153517092	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=179,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:2,2:7,1:7,2,3,0
chr1	153520138	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:6,2:10,3:14,3,3,2
chr1	153520784	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=212,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:0|1:153520784_C_A:153520784:7,0,3,1
chr1	153520790	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:2,4:5,1:0|1:153520784_C_A:153520784:7,0,3,2
chr1	153520804	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:3,4:5,0:8,1,2,2
chr1	153521018	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr1	153533898	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:14,4,3,1
chr1	153587308	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr1	153587702	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,124;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,6:9,2:11,6,4,4
chr1	153587913	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=193,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr1	153601076	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=200,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,0:6,2:0,8,0,2
chr1	153604112	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:3,2,2,4
chr1	153609039	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=91,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:5,3,4,3
chr1	153614712	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,17:0.461:37:6,5:14,12:15,5,9,8
chr1	153631701	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.305:17:6,0:6,4:6,6,0,5
chr1	153635425	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:3,0,3,3
chr1	153636468	.	CTA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,1:4,1:0|1:153636468_CTA_C:153636468:10,0,1,1
chr1	153636471	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:4,1:0|1:153636468_CTA_C:153636468:10,0,1,1
chr1	153640665	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=253,292;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr1	153640827	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	153654276	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:15,3:15,0:14,16,1,2
chr1	153658187	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,73;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:5,1,1,1
chr1	153658767	.	A	AG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	153660514	.	AC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.250:25:9,3:9,2:4,15,3,3
chr1	153661374	.	CG	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=162,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:7,2,4,0
chr1	153661408	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.357:16:4,0:4,0:4,6,6,0
chr1	153661414	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.210:16:4,1:4,0:7,6,3,0
chr1	153662331	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:15,0:5,2:0|1:153662331_G_A:153662331:6,14,1,1
chr1	153662340	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,12:0.591:20:5,7:3,5:0|1:153662331_G_A:153662331:2,6,4,8
chr1	153665566	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,10:5,0:7,2,10,0
chr1	153665919	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=265,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,6:2,2:3,4,1,7
chr1	153733254	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=137,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:8,1,1,1
chr1	153742142	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=131,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,1:5,2:12,0,3,0
chr1	153743289	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=138,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	153743317	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr1	153746474	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=128,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:2,0:5,7:1,7,1,7
chr1	153750207	.	C	CCTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=224,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:0|1:153750207_C_CCTT:153750207:6,0,6,0
chr1	153750214	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=263,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.530:13:2,2:3,5:0|1:153750207_C_CCTT:153750207:6,0,6,1
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chr1	153752320	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=133,28;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.155:17:10,1:5,0:0|1:153752314_A_ACATGACATACCTGCTCCCTCTTTGCCTT:153752314:8,7,0,2
chr1	153784666	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.697:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	153790054	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:1,4,0,2
chr1	153791165	.	AGAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=217,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr1	153800582	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,0:7,2:7,10,0,2
chr1	153907346	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,2:7,0:6,10,0,2
chr1	153909294	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	153912855	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,99;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.229:26:12,4:7,0:11,9,6,0
chr1	153926140	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,120;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.449:20:6,0:5,8:2,9,0,9
chr1	153926159	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=213,120;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,0:3,9:0,10,0,9
chr1	153941114	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:9,1:10,2:9,11,1,2
chr1	153949135	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=122,355;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.274:13:8,1:2,2:5,5,3,0
chr1	153955345	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=210,152;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,1:6,1:2,7,0,2
chr1	154033329	.	ATAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAAG;STR;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr1	154042656	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=168,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,0:2,2:4,0,2,0
chr1	154061855	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr1	154072666	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=117,120;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:4,6,0,2
chr1	154098854	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:5,11,3,0
chr1	154110733	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.597:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr1	154141908	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=155,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,2:3,3:0,7,0,5
chr1	154144673	.	GA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.198:28:13,2:4,3:6,17,2,3
chr1	154144781	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:14,3:16,0:19,13,3,0
chr1	154145532	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=118,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,3:5,2:5,7,4,1
chr1	154164586	.	G	GACACTTTTACATGC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,152;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr1	154178079	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:3,2:5,0:2,6,1,2
chr1	154178197	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=256,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr1	154178202	.	CA	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=256,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	154178821	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=155,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:1,8,1,1
chr1	154185159	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:154185159_T_C:154185159:0,3,0,1
chr1	154185167	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=192,135;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:154185159_T_C:154185159:0,3,0,1
chr1	154185190	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154185190_G_T:154185190:0,1,0,1
chr1	154185192	.	A	ATT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,23;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154185190_G_T:154185190:0,1,0,1
chr1	154185195	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:154185190_G_T:154185190:0,1,0,1
chr1	154186918	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:1,6:12,2:5,9,5,3
chr1	154192463	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.493:12:2,1:4,5:0,6,0,6
chr1	154207834	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,0,4
chr1	154226450	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:10,10,2,0
chr1	154227239	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=204,245;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,1:8,0,4,0
chr1	154228287	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr1	154229975	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:154229975_T_C:154229975:0,3,0,1
chr1	154229977	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:154229975_T_C:154229975:0,3,0,1
chr1	154229979	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:154229975_T_C:154229975:0,4,0,1
chr1	154241846	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.101:27:15,0:10,2:13,12,0,2
chr1	154243246	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=235,199;MMQ=40,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:0,1:1,0:0|1:154243246_G_GT:154243246:1,0,2,0
chr1	154243261	.	TTG	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=173,235;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,0:1,0:1|0:154243246_G_GT:154243246:2,1,1,0
chr1	154243263	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,20;MFRL=0,199;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:0,1:1,0:0|1:154243246_G_GT:154243246:0,1,2,0
chr1	154243271	.	TC	GA,GC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=29,16,16;MFRL=58,235,173;MMQ=60,40,40;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.39,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.298,0.250:4:1,0,0:1,0,0:1,1,2,0
chr1	154243274	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=23,15;MFRL=128,173;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:154243246_G_GT:154243246:2,2,1,0
chr1	154245142	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:9,1:13,3:12,11,4,0
chr1	154247576	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,0:8,2:9,7,0,2
chr1	154247927	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,144;MMQ=60,46;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:11,2:12,8,0,2
chr1	154293675	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=216,155;MMQ=52,51;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:0,1,4,5
chr1	154303705	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=213,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:2,1,1,5
chr1	154305010	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr1	154305190	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=228,99;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=83.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.926:24:0,12:1,11:1,0,11,12
chr1	154309884	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=146,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,4:9,0:0|1:154309884_C_G:154309884:11,12,4,0
chr1	154309894	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=152,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:15,4:10,0:0|1:154309884_C_G:154309884:13,12,4,0
chr1	154310223	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=192,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:0,4,0,8
chr1	154313232	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:2,1,3,2
chr1	154313598	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	154316798	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:11,9,2,0
chr1	154317281	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,94;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:4,12:4,6:2,6,9,9
chr1	154318172	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=205,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:2,1,3,1
chr1	154318716	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=169,59;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:13,4:4,0:8,9,4,0
chr1	154321072	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr1	154321084	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=368,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.691:8:0,3:2,1:1,1,0,6
chr1	154321663	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr1	154437600	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=157,59;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.259:21:7,2:8,3:0|1:154437600_T_G:154437600:10,6,2,3
chr1	154437606	.	GAA	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=127,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.155:30:14,2:9,1:0|1:154437600_T_G:154437600:16,10,1,3
chr1	154437609	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=123,53;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:0|1:154437600_T_G:154437600:16,9,1,1
chr1	154437896	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr1	154458932	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr1	154459197	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr1	154461511	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:5,1:4,1:9,0,2,0
chr1	154471615	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=169,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:6,2:0|1:154471615_G_A:154471615:9,6,1,1
chr1	154471622	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=172,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:154471615_G_A:154471615:11,8,1,1
chr1	154471624	.	AA	TT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:10,2:0|1:154471615_G_A:154471615:13,8,1,1
chr1	154479657	.	C	CAT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,3:0,0,8,2
chr1	154479670	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr1	154492702	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	154493721	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr1	154517385	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=118,63;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,0:3,7,1,1
chr1	154523588	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	154524973	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:9,4:8,2:5,12,2,4
chr1	154528086	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr1	154548174	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,2:5,3:6,0,4,1
chr1	154557685	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=197,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:1,2:6,1:6,1,2,2
chr1	154562625	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,365;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr1	154574075	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=237,142;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,3:3,0:6,2,3,0
chr1	154744528	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,3:8,0:10,9,0,3
chr1	154744540	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:9,2:7,0:8,10,1,1
chr1	154744937	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,2:4,3:0,11,0,5
chr1	154832304	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=141,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	154832322	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr1	154924015	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:7,1:3,7,0,2
chr1	154936227	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=152,110;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:5,4:5,0:0|1:154936227_A_G:154936227:9,7,4,0
chr1	154936230	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=152,110;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:9,4:7,0:0|1:154936227_A_G:154936227:9,7,4,0
chr1	154938106	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:16,0:7,7:12,11,0,7
chr1	154941213	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.126:22:13,0:5,2:15,5,1,1
chr1	154960996	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:11,1:15,3:13,13,1,3
chr1	154987697	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,12;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.229:14:5,0:2,0:0|1:154987697_A_C:154987697:3,8,3,0
chr1	154987700	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,13;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.229:14:6,0:2,0:0|1:154987697_A_C:154987697:3,8,3,0
chr1	154987705	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=193,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:4,5,1,1
chr1	154987706	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:7,0:2,0:0|1:154987697_A_C:154987697:3,6,2,0
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chr1	154988343	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.370:15:4,1:3,0:2,7,0,6
chr1	155001929	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,3:5,0:1,4,0,3
chr1	155002721	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.490:20:2,0:8,8:1,9,0,10
chr1	155004236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:2,8,0,2
chr1	155006450	.	CC	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,2,1
chr1	155007293	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=186,222;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155007293_C_T:155007293:0,1,0,1
chr1	155007302	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=186,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:155007293_C_T:155007293:0,1,0,1
chr1	155014426	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=181,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	155020444	.	GCA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CA;STR;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:3,0:2,3:1,4,0,3
chr1	155028966	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.293:8:3,0:3,2:0|1:155028966_C_A:155028966:1,5,1,1
chr1	155028970	.	C	CAACCT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=162,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:155028966_C_A:155028966:1,5,1,1
chr1	155030364	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=204,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,1:8,1:4,9,2,0
chr1	155034688	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.268:12:5,0:2,2:0|1:155034688_A_C:155034688:1,8,3,0
chr1	155034690	.	CTAAG	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.205:16:7,0:2,3:0|1:155034688_A_C:155034688:3,10,3,0
chr1	155034697	.	GG	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:9,0:4,0:0|1:155034688_A_C:155034688:3,10,2,0
chr1	155051431	.	CGCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GCT;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:5,1:9,1,1,1
chr1	155057499	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr1	155058579	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0|1:155058579_T_TG:155058579:0,7,3,0
chr1	155058584	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:3,1:7,2:0|1:155058579_T_TG:155058579:1,10,3,0
chr1	155058588	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:2,1:7,1:0|1:155058579_T_TG:155058579:1,9,3,0
chr1	155058590	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:2,1:6,1:0|1:155058579_T_TG:155058579:2,9,3,0
chr1	155058595	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:3,1:11,0:0|1:155058579_T_TG:155058579:4,10,2,0
chr1	155105882	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	155106550	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=47,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,5:2,7:1,3,4,8
chr1	155108287	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=196,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:2,2:3,1:2,3,2,2
chr1	155108663	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr1	155109483	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=231,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:0,11,0,2
chr1	155142210	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=113,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:2,2:5,7:6,1,7,3
chr1	155142229	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:3,5:9,7:10,2,9,3
chr1	155142262	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=100,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:17,0:16,2:26,7,2,0
chr1	155152084	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=127,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:2,6,0,2
chr1	155165047	.	T	TC	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.278:23:12,3:3,2:0|1:155165047_T_TC:155165047:1,16,6,0
chr1	155165059	.	GG	CC	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=164,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.316:20:7,3:5,1:0|1:155165047_T_TC:155165047:1,13,6,0
chr1	155165067	.	GG	CC	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.248:18:7,2:5,1:0|1:155165047_T_TC:155165047:1,13,4,0
chr1	155165071	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,12;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:7,1:5,0:0|1:155165047_T_TC:155165047:0,12,4,0
chr1	155165076	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:7,3:5,0:0|1:155165047_T_TC:155165047:0,12,4,0
chr1	155165078	.	TA	CC	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.275:16:7,2:5,0:0|1:155165047_T_TC:155165047:0,12,4,0
chr1	155169521	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=185,169;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:155169521_A_G:155169521:4,0,1,0
chr1	155169524	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=185,169;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:155169521_A_G:155169521:4,0,1,0
chr1	155171036	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=50.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.559:32:5,0:9,18:2,12,0,18
chr1	155174881	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:15,0:13,3:15,14,0,3
chr1	155175892	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=224,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	155178500	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	155180279	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,77;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:16,3:15,0:19,13,3,0
chr1	155181843	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=188,210;MMQ=43,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,5:1,0:6,0,4,1
chr1	155182164	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=198,206;MMQ=52,33;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.154:23:7,1:13,2:9,11,2,1
chr1	155183010	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=235,261;MMQ=27,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155183010_C_T:155183010:0,1,0,1
chr1	155183016	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=235,261;MMQ=27,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155183010_C_T:155183010:0,1,0,1
chr1	155183023	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155183010_C_T:155183010:0,0,0,1
chr1	155184975	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=122,187;MMQ=27,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.504:8:1,1:3,3:2,2,0,4
chr1	155194531	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=176,188;MMQ=45,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr1	155194679	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:12,3:6,4:4,14,3,4
chr1	155205669	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,4:0,0,2,5
chr1	155209360	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=133,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,0:7,2:8,4,3,0
chr1	155217812	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=146,85;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:7,6:6,0:0|1:155217812_A_C:155217812:12,3,6,0
chr1	155217815	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=146,85;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:7,6:8,0:0|1:155217812_A_C:155217812:12,3,6,0
chr1	155218168	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,2:10,2:12,7,2,2
chr1	155218365	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=182,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0,9,0,2
chr1	155224091	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=180,323;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:9,1,1,1
chr1	155224301	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:1,6,1,2
chr1	155224761	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=212,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:155224761_A_C:155224761:0,1,0,1
chr1	155224762	.	C	CGTCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=212,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:155224761_A_C:155224761:0,1,0,1
chr1	155224766	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=16,26;MFRL=212,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:0,1:0|1:155224761_A_C:155224761:0,1,0,1
chr1	155231545	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:1,17,1,1
chr1	155231877	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,105;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:19,0:12,3:14,18,0,3
chr1	155254532	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:7,0:10,3:8,9,2,1
chr1	155271200	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=153,87;MMQ=60,56;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:0|1:155271200_G_A:155271200:17,8,0,2
chr1	155271204	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,87;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:15,0:0|1:155271200_G_A:155271200:17,8,0,2
chr1	155289545	.	T	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.225:38:13,3:17,5:14,16,4,4
chr1	155294772	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=88.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,9:0,16:0,0,12,13
chr1	155311658	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,0,2
chr1	155313047	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr1	155330245	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:2,2:0|1:155330245_T_G:155330245:1,5,1,1
chr1	155330266	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=142,72;MMQ=56,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:0|1:155330245_T_G:155330245:0,4,1,1
chr1	155385689	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:6,13,3,0
chr1	155429725	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=160,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:1,7,1,1
chr1	155450991	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:5,5,1,1
chr1	155451205	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=193,48;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:5,4,1,1
chr1	155491266	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:6,8,0,2
chr1	155581311	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=141,241;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,1:5,2:6,8,2,1
chr1	155630752	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=201,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	155679543	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:3,2:0,1:3,2,2,1
chr1	155686739	.	CAA	C,CA,CAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35,34,28;MFRL=127,211,119,87;MMQ=60,60,60,50;MPOS=26,17,13;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,15,16,19;RU=A;STR;TLOD=3.05,4.15,3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,3,2:0.186,0.274,0.267:9:2,2,2,2:0,0,1,0:2,0,5,2
chr1	155695904	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,17;MFRL=149,286;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr1	155701055	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35,23;MFRL=183,194,218;MMQ=60,60,60;MPOS=15,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=7.63,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,2:0.421,0.289:8:2,3,1:0,1,0:2,0,4,2
chr1	155733307	.	G	GCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=156,121;MMQ=58,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:155733307_G_GCC:155733307:2,2,0,1
chr1	155733308	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,31;MFRL=156,121;MMQ=58,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:155733307_G_GCC:155733307:2,2,0,1
chr1	155736345	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:7,10,1,1
chr1	155737425	.	AACAC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,33;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=AC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	155746340	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=188,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.732:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	155747369	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=176,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:2,3:9,1:9,3,3,1
chr1	155753676	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0,0,5,11
chr1	155785578	.	CAACT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,9:0,12:0,0,13,9
chr1	155785789	.	T	TAAATAAACAAACTTCTTATAACCTGAATGACAA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=181,192;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	155786128	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=233,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=34.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,0:2,13:0,5,0,13
chr1	155796746	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:10,9,0,2
chr1	155823002	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	155838639	.	G	GGAATTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=217,88;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155838639_G_GGAATTGCT:155838639:0,1,0,1
chr1	155838643	.	A	ACGTTGGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=217,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:155838639_G_GGAATTGCT:155838639:0,1,0,1
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chr1	155880760	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.932:13:1,6:0,6:0,1,1,11
chr1	155899020	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.910:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr1	155903408	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=310,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,7:0,4:2,0,4,7
chr1	155917880	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr1	155921435	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=181,81002738;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:4,7,2,0
chr1	155927752	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	155928232	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,5,9
chr1	155928242	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:155928232_T_C:155928232:0,0,3,9
chr1	155931368	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=266,246;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr1	155934683	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=155,202;MMQ=50,45;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	155934707	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=154,150;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:2,1:2,1,4,0
chr1	155935244	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,4:0,12,2,3
chr1	155981529	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr1	156011444	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=126,179;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,5:1,9:1,4,3,11
chr1	156011469	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=187,141;MMQ=60,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:7,0:8,1:3,12,1,1
chr1	156012511	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=242,520;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr1	156107441	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,233;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:5,0:4,3,3,0
chr1	156131050	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr1	156132909	.	GCA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,383;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr1	156142524	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=211,236;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,7:3,0:4,0,0,7
chr1	156142537	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=202,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,7:3,0:4,0,0,7
chr1	156145360	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=159,99;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,5:7,0:9,6,5,0
chr1	156169610	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=104,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	156182710	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr1	156203399	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=186,109;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,0:0,4:3,0,3,1
chr1	156203605	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=176,115;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:156203605_C_T:156203605:0,4,0,1
chr1	156203614	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=176,115;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:156203605_C_T:156203605:0,4,0,1
chr1	156206121	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=195,196;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,2:6,2:8,8,3,1
chr1	156206158	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.443:20:5,2:6,5:7,4,3,6
chr1	156206297	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:0,8,0,4
chr1	156209319	.	T	TCTGTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:12,8,1,1
chr1	156215562	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=184,300;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr1	156219450	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:3,1,5,2
chr1	156230141	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=189,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr1	156230206	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:7,2,3,2
chr1	156231266	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr1	156231283	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,2:6,0:0,7,0,2
chr1	156237516	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=202,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:156237516_G_A:156237516:0,6,1,1
chr1	156237517	.	G	GTTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,2:4,0:0|1:156237516_G_A:156237516:0,7,1,1
chr1	156237520	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=201,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,0:0|1:156237516_G_A:156237516:0,7,1,1
chr1	156247907	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=209,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:1,6,0,3
chr1	156255833	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,4:0,3:0,0,0,9
chr1	156256000	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=162,333;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,2:6,0:5,2,1,1
chr1	156263097	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:4,4,1,1
chr1	156265439	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.433:30:9,6:8,6:10,7,6,7
chr1	156280296	.	GATAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ATAA;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr1	156280934	.	AGGAGAACATTGCGACACACTTGCATGGCATCCTGGAGGTTGCGTTCTACTTCCTT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:8,0:5,2:10,14,1,1
chr1	156281020	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=205,242;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr1	156287403	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=133,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:0,2,0,5
chr1	156303527	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=249,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr1	156304488	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:8,4:5,0:9,4,4,0
chr1	156304782	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:3,3:0,1:1,3,0,4
chr1	156308031	.	GGA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GA;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,0:3,3:2,6,1,2
chr1	156347834	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,1:3,5,5,3
chr1	156351792	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=233,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:2,3,2,5
chr1	156352447	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr1	156354347	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=112,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.282:16:6,3:6,1:4,8,0,4
chr1	156354367	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=136,112;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,4:1,5:0,2,3,7
chr1	156374256	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=156,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:2,1,3,0
chr1	156437482	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:6,0:4,12:3,7,0,12
chr1	156446242	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,12,7
chr1	156449656	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=218,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	156496188	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr1	156496417	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=123,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.232:14:3,0:8,2:2,9,0,3
chr1	156498673	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=166,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr1	156500128	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr1	156502991	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=77,252;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr1	156503541	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,6:0,8:0|1:156503541_T_C:156503541:0,0,11,4
chr1	156503560	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=129,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:4,2:4,5:0|1:156503541_T_C:156503541:5,3,4,3
chr1	156504937	.	T	TGGGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=4,19;RU=G;STR;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.410:17:4,1:5,0:9,1,0,7
chr1	156505061	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,9:1,3:0,4,2,10
chr1	156509552	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr1	156520173	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr1	156524221	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=101,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:2,5,0,6
chr1	156526234	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr1	156526564	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:1,2:5,3:1,6,0,5
chr1	156531871	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr1	156532344	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=135,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,1:7,5:8,4,3,3
chr1	156532908	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:9,4:7,4:12,4,3,6
chr1	156534525	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=261,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,0:8,3:2,8,0,3
chr1	156534539	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=235,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0,8,0,2
chr1	156536123	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.896:17:0,6:1,10:0|1:156536123_T_C:156536123:1,0,15,1
chr1	156536133	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0|1:156536123_T_C:156536123:0,0,15,2
chr1	156536353	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr1	156539154	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr1	156539335	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=124,123;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr1	156551228	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:11,0:10,8:9,12,0,8
chr1	156553102	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=53.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.681:26:4,8:4,10:5,3,12,6
chr1	156553762	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr1	156562008	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,8,11
chr1	156562143	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,18,7
chr1	156563898	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=62.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,13:0,0,3,14
chr1	156564922	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=296,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr1	156565049	.	A	AAC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=124.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,10:0,18:0,0,8,20
chr1	156565834	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,6:4,6:5,1,7,5
chr1	156593560	.	G	GTGAGGGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:4,0,0,1
chr1	156594364	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr1	156617968	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr1	156621500	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	156626920	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr1	156628717	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=319,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:1,2,7,0
chr1	156639671	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:4,4:0,4:0|1:156639671_A_C:156639671:0,4,9,0
chr1	156639674	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:4,5:0,3:0|1:156639671_A_C:156639671:0,4,9,0
chr1	156639677	.	CAG	C	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.625:14:4,5:0,4:0|1:156639671_A_C:156639671:0,5,9,0
chr1	156639683	.	C	CCCCCG	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:6,4:0,2:0|1:156639671_A_C:156639671:0,6,8,0
chr1	156639684	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=30,23;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:6,2:0,1:0|1:156639671_A_C:156639671:0,6,8,0
chr1	156639688	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,20;MFRL=173,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:6,1:0,2:0|1:156639671_A_C:156639671:0,6,6,0
chr1	156639692	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,19;MFRL=172,209;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:6,0:1,2:0|1:156639671_A_C:156639671:1,6,5,0
chr1	156639697	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=29,12;MFRL=172,175;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:6,0:1,0:0|1:156639671_A_C:156639671:1,6,3,0
chr1	156640678	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=186,182;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:1,5,1,1
chr1	156646668	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	156670388	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=154,164;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,0:4,4:7,5,0,4
chr1	156670545	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr1	156698866	.	TCGCTCCCCG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:10,0,2,0
chr1	156704328	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=239,150;MMQ=60,41;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:1,0:2,1:0,3,0,2
chr1	156706559	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,2,5
chr1	156707461	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=201,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,2:5,1:9,8,1,2
chr1	156707775	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=99.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.969:30:0,19:0,10:0,0,22,8
chr1	156708244	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:11,6:6,3:8,9,5,4
chr1	156721032	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=213,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:0,3:2,1:2,0,5,0
chr1	156752231	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=206,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	156761618	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,1:2,2:3,4,2,1
chr1	156785083	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:1,0:8,11:1,8,0,12
chr1	156785762	.	AG	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:0|1:156785762_AG_A:156785762:2,5,4,5
chr1	156785771	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=188,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.526:17:4,4:4,4:0|1:156785762_AG_A:156785762:3,5,4,5
chr1	156785779	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=308,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:0,9:2,8:1,1,9,8
chr1	156812066	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=200,251;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,0:0,3:0|1:156812066_A_T:156812066:0,2,0,4
chr1	156812072	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=200,251;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:2,0:0,3:0|1:156812066_A_T:156812066:0,2,0,4
chr1	156814478	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=218,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:10,0:3,2:5,9,2,0
chr1	156823600	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=200,25661885;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:4,8,1,1
chr1	156838141	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=292,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.530:2:0,1:0,0:0,1,1,0
chr1	156875092	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=194,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:1,0,4,1
chr1	156875097	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=194,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,5:0,0:0|1:156875092_G_A:156875092:1,0,4,1
chr1	156875107	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,23;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:1,4:1,1:0|1:156875092_G_A:156875092:2,0,4,2
chr1	156875985	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=223,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:0,3:0,1,3,0
chr1	156878887	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:4,2:3,0:0,9,0,2
chr1	156879504	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr1	156881959	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=217,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	156883617	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,272;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,5:5,0:5,10,2,3
chr1	156884365	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=208,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr1	156884399	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.218:16:8,2:5,1:12,1,2,1
chr1	156894353	.	C	CCCGG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=299,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0|1:156894353_C_CCCGG:156894353:2,1,6,0
chr1	156894356	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=299,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.637:9:1,3:0,1:0|1:156894353_C_CCCGG:156894353:2,1,6,0
chr1	156894363	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=371,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,2:0|1:156894353_C_CCCGG:156894353:0,1,6,0
chr1	156894367	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=371,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0|1:156894353_C_CCCGG:156894353:0,1,6,0
chr1	156894825	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.222:19:9,2:5,1:4,11,1,3
chr1	156897350	.	AGGCGCTGTCCACG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=148,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:5,7,1,1
chr1	156899592	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=118,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr1	156901888	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr1	156902222	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=171,147;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:8,3:4,1:7,5,3,2
chr1	156902254	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,3:6,0:8,8,0,3
chr1	156902259	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:4,4,4,7
chr1	156902281	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,7:7,0:4,11,1,6
chr1	156906065	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,0:5,3:2,6,0,3
chr1	156906881	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=265,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:3,3,0,2
chr1	156907031	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,3:4,4:5,5,5,2
chr1	156909303	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=184,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	156912564	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=92,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:10,1:5,1:6,9,0,2
chr1	156914070	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=287,221;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:2,3,4,0
chr1	156914172	.	CCT	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:156914172_CCT_C:156914172:7,7,1,1
chr1	156914180	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=152,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,1:6,0:0|1:156914172_CCT_C:156914172:8,7,1,1
chr1	156914183	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=175,62;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,1:6,0:0|1:156914172_CCT_C:156914172:7,7,1,1
chr1	156914240	.	CCATTCATT	C,CCATT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,35,34;MFRL=241,179,130;MMQ=60,60,60;MPOS=23,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=CATT;STR;TLOD=15.57,6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.517,0.296:7:1,0,1:0,4,1:1,0,2,4
chr1	156916027	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr1	156925435	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,4,0
chr1	156928776	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,3:9,3:13,3,4,2
chr1	156929023	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,268;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr1	156939175	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:1,3:9,2:5,5,0,5
chr1	156941412	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=241,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr1	156946898	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,1,2
chr1	156947902	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=205,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr1	156947928	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:5,1:7,2:12,1,3,0
chr1	156947953	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=29,24;MFRL=85,69;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,1:9,3:12,4,4,0
chr1	156948021	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=173,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.242:33:8,6:16,0:8,17,1,7
chr1	156948049	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=136,138;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.282:37:17,0:9,10:10,17,0,10
chr1	156954267	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:4,7,0,2
chr1	157062364	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr1	157062594	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,5:6,2:5,9,1,6
chr1	157062696	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:1,7:7,3:4,4,3,8
chr1	157485561	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,4:1,4:3,1,5,3
chr1	157485720	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=68.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,11,9
chr1	157491173	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=198,289;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr1	157508801	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,6:3,3:4,1,9,0
chr1	157509025	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,225;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:3,8:1,7:0,4,9,6
chr1	157522016	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr1	157545231	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=267,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:5,0,5,0
chr1	157548669	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=244,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:4,5:0,5:2,2,4,6
chr1	157550066	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:13,4:6,3:11,8,2,5
chr1	157557957	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=254,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	157566019	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,1:0,4:2,0,5,0
chr1	157566211	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=191,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0,4,2,3
chr1	157567751	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,12,9
chr1	157652929	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=265,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.686:11:0,5:3,3:2,1,7,1
chr1	157669580	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:7,1:0,4:1,6,2,3
chr1	157718283	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,7,1
chr1	157718430	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=185,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:4,0:5,5:5,4,3,2
chr1	157718486	.	C	CTAGAGT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=197,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:0|1:157718486_C_CTAGAGT:157718486:2,4,1,1
chr1	157718490	.	A	AATCTATTTTCTTGCTAC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=197,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.292:8:2,1:4,0:0|1:157718486_C_CTAGAGT:157718486:2,4,1,1
chr1	157718645	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=200,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:2,5,2,2
chr1	157718780	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:3,4,1,4
chr1	157718835	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	157737504	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=122,255;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	157738435	.	C	CCCCCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=138,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,2:8,0:3,6,1,1
chr1	157738539	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=250,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr1	157740186	.	GTC	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=158,81;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,1:5,2:0|1:157740186_GTC_G:157740186:6,4,1,3
chr1	157740189	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=158,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:0|1:157740186_GTC_G:157740186:6,4,1,3
chr1	157767056	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=193,251;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	157772060	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=225,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:1,5,0,2
chr1	157802979	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr1	157806006	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	157811392	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=74.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,17,7
chr1	158054379	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=165,241;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0,9,1,1
chr1	158056299	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=203,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr1	158058109	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.907:20:1,4:0,11:1,0,11,8
chr1	158151609	.	T	TTCTTCAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=189,314;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:158151609_T_TTCTTCAAAG:158151609:2,1,0,1
chr1	158151611	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=189,314;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:158151609_T_TTCTTCAAAG:158151609:2,1,0,1
chr1	158152685	.	C	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=144,96;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:10,0:17,3:19,8,3,0
chr1	158152850	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=149,92;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.239:27:9,0:12,6:8,13,1,5
chr1	158153996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	158224575	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:2,6,0,2
chr1	158226667	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,172;MMQ=52,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,1:12,2:9,12,2,1
chr1	158227452	.	T	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=113,220;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:14,4:19,0:11,23,4,0
chr1	158260878	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31,29;MFRL=141,169,175;MMQ=60,60,60;MPOS=25,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.39,5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.256,0.281:13:4,1,1:3,2,2:5,2,6,0
chr1	158298679	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:1,2:9,1:7,4,3,0
chr1	158325891	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=183,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:7,1:5,3:2,10,2,2
chr1	158368392	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,1:8,2,2,1
chr1	158369188	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=174,129;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:3,7,0,2
chr1	158369319	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=160,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr1	158389630	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=159,205;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr1	158389659	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:7,5,3,0
chr1	158435250	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	158435278	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	158436299	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,2:2,2:2,6,1,3
chr1	158436354	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=251,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	158517142	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,7:5,2:3,5,4,5
chr1	158532405	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=197,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:6,4:6,4:11,2,5,3
chr1	158549492	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=135,172;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:4,4:7,5:5,6,5,4
chr1	158549511	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:4,8:6,3:5,5,5,6
chr1	158549627	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=172,125;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:7,3:8,0:8,7,3,0
chr1	158582543	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:158582543_G_A:158582543:3,0,4,0
chr1	158582552	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=116,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0|1:158582543_G_A:158582543:3,0,4,0
chr1	158582838	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=186,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	158584091	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=197,252;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:3,2:6,3:4,6,1,5
chr1	158584101	.	A	AAT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=187,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.219:15:5,2:7,1:4,8,0,3
chr1	158584103	.	GA	G,GAA,AA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=10,18,29,25;MFRL=149,211,202,259;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,9,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=4.66,15.50,4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,5,3:0.196,0.412,0.201:12:0,0,2,2:0,0,1,1:0,2,1,9
chr1	158585230	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,5:4,3:0,5,1,7
chr1	158587784	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr1	158595824	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=290,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr1	158595842	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=197,226;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	158606449	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,210;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,3:9,0:6,13,1,2
chr1	158607788	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	158612548	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:4,2,1,4
chr1	158618223	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=219,115;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr1	158618455	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:1,1,2,5
chr1	158619728	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr1	158619822	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0,4,0,4
chr1	158627383	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=134,45824;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,0:9,3:8,11,3,0
chr1	158631171	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,202;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,7:7,1:3,6,3,5
chr1	158644105	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:6,2,6,1
chr1	158647631	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr1	158647669	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:0,7,2,3
chr1	158654852	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,1:6,2:7,1,1,2
chr1	158655162	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	158656347	.	C	CAGAG,CAGAGAGAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33,34;MFRL=0,289,215;MMQ=60,60,60;MPOS=31,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,11,13;RU=AG;STR;TLOD=3.72,3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.443,0.429:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr1	158725427	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=106,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:12,3:19,0:17,14,3,0
chr1	158735691	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:2,6:5,7:3,4,5,8
chr1	158747506	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=226,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:1,6,0,3
chr1	158908886	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:6,3,3,0
chr1	158909164	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,14:0,0,16,8
chr1	158913525	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,10:0,5:0,0,12,4
chr1	158913532	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=122,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:8,2,3,3
chr1	158984651	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,73;MMQ=60,44;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.147:45:22,0:17,6:17,22,1,5
chr1	158985652	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=164,294;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,2:8,2:13,5,3,1
chr1	158985831	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:5,2:16,0:3,18,0,2
chr1	158986225	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	158986477	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,40:0.855:46:5,22:1,18:0,6,24,16
chr1	158986561	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=163,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,1:9,2:1,17,2,1
chr1	158987941	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,4,0
chr1	158990412	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=256,196;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	159002222	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr1	159002301	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=225,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:7,0,4,0
chr1	159002557	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=233,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,2:4,5:0,5,0,7
chr1	159002577	.	TGGATTG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=233,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:0,5,0,6
chr1	159163119	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=232,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr1	159166612	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr1	159174824	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr1	159174885	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=168,348;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	159275706	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr1	159284490	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=189,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:0,7,1,2
chr1	159409533	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=108,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,0:1,5:3,1,4,1
chr1	159409584	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:10,4,2,0
chr1	159410278	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=153,47;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:13,1:11,1:16,9,0,2
chr1	159410340	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=131,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:4,0:5,2:2,7,2,1
chr1	159684186	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=137,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.569:33:8,5:6,13:4,10,6,13
chr1	159750802	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=334,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	159778699	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=223,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.315:10:4,0:3,2:7,0,3,0
chr1	159779122	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.502:12:2,2:3,4:1,5,3,3
chr1	159785370	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,266;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:5,7,3,2
chr1	159799599	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,10:0,4:0,0,10,5
chr1	159802627	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=293,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.176:21:11,0:2,3:17,1,2,1
chr1	159803114	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=116,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:10,2:12,4:10,12,2,4
chr1	159804940	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=121,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:5,2:5,6,5,1
chr1	159810958	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=133,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.301:27:11,0:8,7:10,9,1,7
chr1	159825061	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,0:2,2:3,4,0,2
chr1	159825916	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1,7,1,1
chr1	159827703	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:9,8,0,2
chr1	159828128	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,2:2,8:1,4,3,7
chr1	159828746	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	159832425	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=201,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	159842691	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,2:3,1:6,0,3,0
chr1	159846280	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,4:8,0:12,0,4,0
chr1	159854392	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=224,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.770:14:1,4:1,7:1,2,4,7
chr1	159858290	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=206,98;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,5:2,2:1,5,3,4
chr1	159860259	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,19:0.572:33:10,5:4,14:10,4,15,4
chr1	159860488	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:1,6,0,5
chr1	159889686	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=237,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	159897126	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=179,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,4:8,6:11,5,7,3
chr1	159897327	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:15,3:9,1:9,15,1,3
chr1	159897681	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,30,28,27;MFRL=144,132,104,146;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,18,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.24,7.47,9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,4,5,6:0.238,0.315,0.354:16:1,1,4,1:0,3,1,5:0,1,3,12
chr1	159902526	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=273,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	159904202	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=210,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,4:9,3:9,8,3,4
chr1	159922369	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,5:0,0:0,0,0,6
chr1	160012406	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=294,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	160057697	.	A	ACTC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160057697_A_ACTC:160057697:0,1,0,1
chr1	160057698	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,23;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160057697_A_ACTC:160057697:0,1,0,1
chr1	160057701	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=176,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:160057697_A_ACTC:160057697:0,1,0,1
chr1	160090674	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=56.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,6:0,10:0,0,14,2
chr1	160090681	.	CCCTT	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=91.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,7:0,14:0,0,19,2
chr1	160091136	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr1	160093222	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,8:0,0,3,13
chr1	160093911	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr1	160093927	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=260,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr1	160095127	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr1	160097315	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:5,2,3,1
chr1	160097666	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr1	160098927	.	A	AG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=254,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=38.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.862:12:0,5:1,6:1,0,4,7
chr1	160105367	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=160,196;MMQ=55,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:3,4,7,1
chr1	160109408	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=116,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:1,2:1,1:3,1,3,0
chr1	160109636	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:2,1,3,2
chr1	160109656	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,1:0,2:1,2,2,1
chr1	160109788	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,4:3,1:2,2,2,4
chr1	160109835	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	160111217	.	C	CCAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:7,2:0,10,0,2
chr1	160121873	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=185,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,3:8,4:9,6,5,2
chr1	160121899	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=108,154;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,2:9,5:9,5,3,4
chr1	160124875	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,7:0,0,8,11
chr1	160124904	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.336:21:8,1:6,0:2,12,7,0
chr1	160124907	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=24,12;MFRL=137,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.204:22:7,0:7,0:4,14,4,0
chr1	160128994	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr1	160136225	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=200,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr1	160137300	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	160140950	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=195,309;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr1	160140998	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,2:5,3:7,6,5,0
chr1	160141164	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=183,95;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,1:11,1:6,10,1,1
chr1	160141196	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,8,8
chr1	160141222	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:4,8,2,0
chr1	160141268	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=148,241;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,2:8,3:3,7,1,4
chr1	160141285	.	CC	TG	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=32,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:3,6,1,2
chr1	160141286	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.484:12:3,3:3,3:3,3,1,5
chr1	160141636	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=222,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	160146173	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=229,172;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:3,3,2,1
chr1	160147502	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=162,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.282:12:4,0:4,2:0|1:160147502_T_G:160147502:0,9,0,3
chr1	160147510	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:0|1:160147502_T_G:160147502:0,10,0,4
chr1	160151421	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=218,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:5,1:7,2,4,0
chr1	160151450	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=129,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:4,4:8,1:5,7,3,2
chr1	160151624	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=205,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:1,5,6,3
chr1	160163446	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	160163449	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=157,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,2:5,0,3,0
chr1	160163509	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:4,2,5,3
chr1	160168368	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr1	160178356	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,9,2
chr1	160181518	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:4,0:5,0:4,8,0,4
chr1	160182974	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:10,3:5,2:8,7,1,4
chr1	160195360	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:160195360_C_T:160195360:7,5,1,1
chr1	160195366	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,71;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:5,2:0|1:160195360_C_T:160195360:7,6,1,1
chr1	160267555	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr1	160275434	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=134,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.486:16:3,3:5,3:3,5,4,4
chr1	160281748	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=156,92;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,5:10,0:10,8,5,0
chr1	160295462	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,1:14,2:7,13,1,2
chr1	160309664	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=155,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,2:8,1:8,6,2,1
chr1	160313330	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=150,309;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,0:4,3:6,9,2,1
chr1	160318940	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:2,5,1,3
chr1	160321656	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,1:3,1:2,4,0,2
chr1	160322580	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,10:3,0:6,0,10,0
chr1	160322700	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:9,3:18,0:11,16,3,0
chr1	160322904	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,1:10,1:10,5,1,1
chr1	160341514	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:7,4,2,0
chr1	160341680	.	GAA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:4,2:4,0:5,4,1,1
chr1	160390179	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,3,1
chr1	160394173	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=235,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,4:2,0:0,6,0,4
chr1	160458782	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,0:0,3:2,0,4,0
chr1	160459909	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,4,1
chr1	160460099	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=197,167;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr1	160518202	.	G	GTCCTGTGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=230,124;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	160519812	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.449:18:5,4:5,4:0|1:160519812_C_CA:160519812:1,9,1,7
chr1	160519815	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.449:18:5,4:5,4:0|1:160519812_C_CA:160519812:1,9,1,7
chr1	160582213	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=86,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr1	160582248	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,2:3,5:5,1,5,2
chr1	160650913	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,12,1
chr1	160681649	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=18,14;MFRL=204,254;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:1,0:1,0:0|1:160681649_G_T:160681649:0,9,0,2
chr1	160681651	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=17,11;MFRL=204,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:1,0:0,0:0|1:160681649_G_T:160681649:0,9,0,3
chr1	160681652	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=16,17;MFRL=204,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:0,0:1,1:0|1:160681649_G_T:160681649:0,9,0,3
chr1	160681653	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=12,28;MFRL=203,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.309:11:0,1:1,2:0|1:160681649_G_T:160681649:0,8,0,3
chr1	160717938	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,92;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:11,8:6,0:14,3,8,0
chr1	160720074	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:14,5:19,0:17,16,3,2
chr1	160722064	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=107.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,12:0,21:0,0,11,22
chr1	160766179	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=251,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,5:1,7:0,2,0,12
chr1	160783477	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=174,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,1:5,1:6,4,1,1
chr1	160786670	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr1	160789196	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr1	160803802	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=117,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:9,8:11,3:14,6,7,4
chr1	160810957	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=207,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:0,2:6,0,2,0
chr1	160849030	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr1	160849060	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,8:0,0,9,9
chr1	160849082	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=235,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=87.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,27:0.904:29:1,13:1,14:0,2,11,16
chr1	160850280	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=356,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr1	160850936	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=188,83;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,3:3,5:1,2,5,3
chr1	160852022	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=186,189;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:3,5:0,2:1,2,2,5
chr1	160852046	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=303,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr1	160854526	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=273,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:2,1:5,0,2,0
chr1	160917902	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=168,268;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr1	160920809	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=162,171;MMQ=60,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.647:23:3,5:4,10:6,2,6,9
chr1	160920813	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,55;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=100.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,9:0,15:0,0,12,12
chr1	160924544	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:5,8,0,2
chr1	160968538	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,13:4,0:6,0,13,0
chr1	160968745	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:14,0:18,4:0|1:160968745_A_C:160968745:18,15,0,4
chr1	160968749	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,4:0.125:38:15,0:19,4:0|1:160968745_A_C:160968745:18,16,0,4
chr1	160969585	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:2,6:1,12:1,2,9,9
chr1	160969930	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=165,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:7,3,0,2
chr1	160970968	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,1:10,2:6,10,3,0
chr1	160971015	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=187,289;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,3:9,1:8,5,3,1
chr1	160990875	.	TC	CA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.572:19:1,7:5,4:0|1:160990875_TC_CA:160990875:4,4,2,9
chr1	160990878	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.572:19:1,7:6,4:0|1:160990875_TC_CA:160990875:4,4,2,9
chr1	160990906	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=155,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:1,11,0,2
chr1	161008535	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=243,252;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,2:2,0:4,6,2,0
chr1	161008572	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=217,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:8,1:1,1:5,5,1,1
chr1	161008803	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,251;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,1:2,8,0,2
chr1	161010774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	161011041	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,184;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,2:8,0:8,0,2,0
chr1	161011716	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr1	161012760	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=234,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:0,7,0,2
chr1	161013121	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.173:27:10,1:12,3:11,12,2,2
chr1	161022047	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=149,96;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,6:9,0:12,0,6,0
chr1	161022380	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,3:1,4:4,2,6,1
chr1	161022639	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=209,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr1	161023252	.	TTCTCTC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,237;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=TC;STR;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.491:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	161049358	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,5:0,6:0,0,7,5
chr1	161058927	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.495:16:3,2:5,5:5,3,5,3
chr1	161058990	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:8,10,2,0
chr1	161068240	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=236,255;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:4,0,4,0
chr1	161089450	.	C	CTAAACT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.386:16:6,4:4,2:2,8,2,4
chr1	161126975	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,6:5,1:8,3,6,1
chr1	161133999	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,102;MMQ=60,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.200:43:16,0:18,8:14,21,0,8
chr1	161136843	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:4,1,8,2
chr1	161141666	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:17,3:12,0:16,13,3,0
chr1	161143312	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	161160872	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr1	161163633	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.671:7:2,2:0,3:0,2,3,2
chr1	161166352	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,409;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,16:0.472:34:7,13:11,3:9,9,0,16
chr1	161166723	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	161167698	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=172,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,4:3,3:5,0,7,0
chr1	161176137	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr1	161179877	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:9,4:1,3:3,7,3,4
chr1	161185236	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=192,89;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:4,0:4,2:0,9,1,1
chr1	161197244	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,265;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:0,6,2,5
chr1	161200586	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=156,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:2,1:8,2:7,4,2,1
chr1	161254280	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:6,7:3,2:2,7,4,5
chr1	161275652	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr1	161276434	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,14:0,3:0,0,12,6
chr1	161276487	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=160,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:9,7:10,0:3,17,6,1
chr1	161276803	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:1,3,0,1
chr1	161276804	.	CAAAAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,18,32;MFRL=283,166,386;MMQ=60,60,60;MPOS=27,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,16,20;RU=A;STR;TLOD=3.22,3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.222,0.393:3:0,0,0:0,0,1:0,1,1,1
chr1	161293492	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=150,133;MMQ=49,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,1:0,1:1,2,0,2
chr1	161332091	.	CT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=138,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.339:21:5,3:6,4:12,2,6,1
chr1	161475173	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=193,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr1	161475295	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:9,6,2,0
chr1	161479745	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=145,216;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:10,1:18,1:0|1:161479745_A_G:161479745:8,20,1,1
chr1	161479753	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,127;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,10:0.333:31:12,0:9,10:1|0:161479745_A_G:161479745:10,11,0,10
chr1	161479851	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,137;MMQ=52,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.418:43:15,0:10,17:13,12,0,18
chr1	161487887	.	AAACATCTACCTGACTCTTCCTCCCAACGACCATGTC	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=182,155;MMQ=27,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.092:31:11,0:5,1:12,17,1,1
chr1	161487914	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=180,223;MMQ=27,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,2:7,0:7,10,0,2
chr1	161488017	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=238,151;MMQ=39,46;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr1	161495820	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,189;MMQ=57,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:22,2:8,1:16,15,3,0
chr1	161495970	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,100;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.080:48:26,0:18,3:23,22,0,3
chr1	161518908	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=132,245;MMQ=39,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	161519411	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,207;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:10,0,2,0
chr1	161559327	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=161,132;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.566:28:7,6:5,10:10,2,9,7
chr1	161561234	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=142,180;MMQ=39,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:1,11,0,2
chr1	161561287	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,27;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	161565479	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,172;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,1,4
chr1	161594226	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=68.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,16,7
chr1	161594246	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr1	161594525	.	GT	CG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,30;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr1	161596283	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,279;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	161599693	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=223,119;MMQ=27,27;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:5,1,2,0
chr1	161600109	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=142,196;MMQ=51,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,2:10,1:10,11,2,1
chr1	161600744	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=189,243;MMQ=59,37;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,2:7,2:8,0,4,0
chr1	161600787	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,165;MMQ=60,43;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr1	161600792	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=144,241;MMQ=50,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:1,2:6,1:3,4,3,0
chr1	161600832	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=35,26;MFRL=162,150;MMQ=52,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:6,3:6,7:9,3,4,6
chr1	161600995	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.512:37:9,9:9,10:7,11,11,8
chr1	161644976	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,160;MMQ=40,46;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,3,1
chr1	161676904	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=187,264;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr1	161680159	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr1	161681297	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:161681297_G_GT:161681297:0,6,1,1
chr1	161681298	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:161681297_G_GT:161681297:0,6,1,1
chr1	161681300	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,1:0|1:161681297_G_GT:161681297:0,6,1,1
chr1	161681661	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,5:0,2:2,0,7,0
chr1	161721402	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:11,2,2,1
chr1	161722272	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,296;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,5:8,0:2,11,1,4
chr1	161722779	.	C	CAAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=138,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=A;STR;TLOD=20.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.634:17:4,4:2,7:6,0,11,0
chr1	161772145	.	T	TCAAGAAAGTGC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=231,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	161822959	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=190,245;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr1	161823011	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,6:3,0:6,2,4,2
chr1	161823197	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	161829973	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=101,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.560:20:4,6:5,5:8,1,11,0
chr1	161967784	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.435:23:4,4:9,5:7,6,0,10
chr1	161976099	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,2:11,1:14,11,3,0
chr1	161976272	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,4:0,2:0,0,1,7
chr1	161976309	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=273,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	162257033	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,41165721;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr1	162313597	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,6,6
chr1	162313735	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=150,202;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:14,1:12,2:0|1:162313735_C_T:162313735:18,9,1,2
chr1	162313736	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=187,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,5:0.194:29:10,5:12,0:1|0:162313735_C_T:162313735:14,10,5,0
chr1	162335424	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	162343774	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr1	162344172	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,1:7,6:6,5,3,4
chr1	162345199	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=116,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:6,4:6,5:7,5,1,8
chr1	162348637	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=174,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:5,1,2,0
chr1	162348662	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,3:0,0,10,4
chr1	162351586	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=181,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr1	162352941	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,1:3,4:4,4,5,0
chr1	162367235	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	162381833	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=117,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:2,8,2,3
chr1	162560300	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=140,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:12,1:14,3:10,16,2,2
chr1	162722846	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,8:0,0,13,0
chr1	162725655	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	162740327	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,8:0,9:0,0,6,11
chr1	162741794	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:8,4:1,3:6,3,5,2
chr1	162743418	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.939:13:0,4:0,9:0,0,4,9
chr1	162745733	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=218,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr1	162748588	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	162760554	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	162760565	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=138,165;MMQ=34,33;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,1:4,2:9,1,3,0
chr1	162766476	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=140,206;MMQ=56,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:3,3,4,4
chr1	162769510	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,162;MMQ=45,21;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:8,2:12,3,2,0
chr1	162822771	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr1	162825457	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=136,157;MMQ=60,59;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.467:17:3,5:6,2:6,3,1,7
chr1	163038613	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr1	163038853	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=213,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,1:5,6:3,3,0,7
chr1	163122356	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=104,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:163122356_G_T:163122356:9,4,1,1
chr1	163122364	.	GAA	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:163122356_G_T:163122356:12,4,1,1
chr1	163122368	.	T	TTCGTTTATG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:8,0:7,2:0|1:163122356_G_T:163122356:12,4,1,1
chr1	163187232	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=281,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr1	163187263	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=218,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr1	163298767	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=17,16;MFRL=138,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.413:19:1,1:2,1:4,7,0,8
chr1	163298768	.	TA	T,TAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30,28;MFRL=149,182,178;MMQ=60,60,60;MPOS=20,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.06,16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,7:0.193,0.568:12:1,1,4:1,1,2:0,3,1,8
chr1	163307944	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr1	163309302	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,2,10
chr1	163313695	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,0:6,3:1,7,0,3
chr1	163318934	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=246,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:5,3:1,4:1,5,0,7
chr1	164789444	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,7,8
chr1	165175306	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,104;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,1,4
chr1	165179874	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:1,3,3,1
chr1	165180089	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr1	165182908	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=201,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:7,3,3,0
chr1	165218792	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,2:10,2:4,15,1,3
chr1	165376043	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=128,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,6:3,0:5,3,3,3
chr1	165376229	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:165376229_C_G:165376229:0,0,0,1
chr1	165376233	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:165376229_C_G:165376229:0,0,0,1
chr1	165377389	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr1	165377552	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.881:14:1,6:0,7:1,0,4,9
chr1	165378729	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=20,23,28;MFRL=59,148,177;MMQ=60,60,60;MPOS=14,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=AC;STR;TLOD=3.45,25.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,7:0.198,0.537:12:3,1,6:0,1,1:2,1,7,2
chr1	165378733	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=24,27;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.385:14:6,5:1,0:0|1:165378733_C_T:165378733:6,3,5,0
chr1	165378735	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=95,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:5,5:2,0:0|1:165378733_C_T:165378733:5,3,5,0
chr1	165378757	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=141,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,3:7,0:0|1:165378757_C_T:165378757:11,6,2,1
chr1	165378760	.	A	ATATTT	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=148,59;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,3:8,0:0|1:165378757_C_T:165378757:12,6,2,1
chr1	165378992	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,0:4,3:0,4,0,3
chr1	165533075	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,1:6,1:5,7,1,1
chr1	165601365	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,3:5,1:6,0,4,0
chr1	165601566	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,3:10,1:6,12,1,3
chr1	165623693	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=211,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	165624799	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=151,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr1	165630784	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr1	165634356	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=170,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:9,0:6,12,2,0
chr1	165634425	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr1	165636749	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=260,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr1	165648886	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=162,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,1:0|1:165648886_G_A:165648886:0,3,0,3
chr1	165648894	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=162,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0|1:165648886_G_A:165648886:0,3,0,3
chr1	165649715	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=199,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:4,5,4,3
chr1	165651502	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:1,1,1,7
chr1	165652325	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=151,49;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:0|1:165652325_G_A:165652325:7,10,1,1
chr1	165652331	.	A	AC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=110,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:11,2:0|1:165652325_G_A:165652325:7,10,1,1
chr1	165652332	.	T	TGCCTAC	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=27,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:165652325_G_A:165652325:7,9,1,1
chr1	165652335	.	C	CTTACATATTCA	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=107,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:10,2:0|1:165652325_G_A:165652325:7,9,1,1
chr1	165652348	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=195,84;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:3,6,0,2
chr1	165652445	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=199,256;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr1	165664724	.	CTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=23,20;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.710:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr1	165712555	.	GAAAAAA	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=17,35;MFRL=158,245;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,9;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.218:7:0,0:0,1:1,5,0,1
chr1	165721223	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=267,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr1	165859630	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,2,10
chr1	165859640	.	G	GTGT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=223,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:0,2:1,1,0,3
chr1	166123874	.	GGGGGCA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGCA;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr1	166124108	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=166,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,1:1,1:1,5,1,1
chr1	166124134	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr1	166826773	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,6:0,1,11,0
chr1	166831676	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:166831676_T_A:166831676:2,1,0,1
chr1	166831677	.	T	TAACTGTCACAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:166831676_T_A:166831676:2,1,0,1
chr1	166831703	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	166833199	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,1:6,5:1,9,1,5
chr1	166839166	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=168,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.252:6:5,1:0,0:0,5,0,1
chr1	166908811	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,3:6,2:4,7,3,2
chr1	166958937	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:2,1:17,1:14,5,1,1
chr1	166961857	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=202,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	166974420	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:4,6,1,3
chr1	167059575	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,3:7,0:1,8,1,2
chr1	167082869	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=182,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:0,2:2,2:2,0,5,0
chr1	167088473	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=163,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.335:19:8,3:4,3:10,3,5,1
chr1	167095765	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=148,230;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,3:7,4:8,4,6,1
chr1	167097567	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:4,6,7,2
chr1	167353258	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:2,4:0,4:0,2,1,7
chr1	167367193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=221,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr1	167381640	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=164,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr1	167382374	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,4:4,10:4,3,1,13
chr1	167382399	.	AGTGTGT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=128827731,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=GT;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.738:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr1	167384723	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=189,297;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr1	167385178	.	G	GA,GAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33,35;MFRL=199,87,226;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=3.24,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.332:6:2,0,1:0,2,0:2,0,3,1
chr1	167385324	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=16,26,19;MFRL=110,163,143;MMQ=60,60,60;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=A;STR;TLOD=8.18,4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,8,4:0.533,0.297:14:1,1,0:0,5,2:0,2,1,11
chr1	167403369	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr1	167408670	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:3,4:3,4:1,5,3,6
chr1	167487586	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:4,2,2,2
chr1	167515272	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,7,4
chr1	167654598	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,0:7,4:10,3,2,2
chr1	167734793	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr1	167741808	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	167793670	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,1:5,4:9,2,4,1
chr1	167802226	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,0:3,4:7,3,2,2
chr1	167805646	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,1:4,1:6,8,0,2
chr1	167815167	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=182,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:2,1,3,2
chr1	167823512	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr1	167825718	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:0,4,0,3
chr1	167839679	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:4,3,1,3
chr1	167847584	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=203,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	167849318	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=129,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:8,2:4,2:10,2,3,1
chr1	167889145	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:7,0,2,1
chr1	167893759	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,5:6,8:8,1,6,7
chr1	167905411	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=135,131;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	167992344	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:1,3,1,8
chr1	168013916	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:11,0:5,6:9,8,0,6
chr1	168044791	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=219,179;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=60.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.858:26:1,13:2,9:0,3,0,23
chr1	168056724	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	168059796	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=172,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:4,9,2,0
chr1	168074145	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=248,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr1	168165767	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=211,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:4,0:0,2:3,1,3,0
chr1	168169146	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:10,2:10,0:13,8,2,0
chr1	168200733	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:2,8:1,5:3,0,11,2
chr1	168205862	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,71;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.217:30:12,6:12,0:8,16,5,1
chr1	168206118	.	GTTTAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTAA;STR;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr1	168208308	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=82,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,7:1,8:1,1,11,4
chr1	168216466	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:168216466_TA_T:168216466:0,4,0,1
chr1	168216468	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:168216466_TA_T:168216466:0,4,0,1
chr1	168262289	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:168262289_A_G:168262289:0,0,8,0
chr1	168262299	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:168262289_A_G:168262289:0,0,6,0
chr1	168262570	.	T	TATGGGTTGTGTGTGTGGTATA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,95;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr1	168274201	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr1	168282261	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,1:6,5:5,8,4,2
chr1	168510122	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=220,141;MMQ=60,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr1	168511155	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,184;MMQ=52,49;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,7:1,1:3,0,6,2
chr1	168511349	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=159,171;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:2,1,1,1
chr1	168513243	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:4,6:9,11:4,9,4,13
chr1	168545758	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=262,299;MMQ=27,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:9,0,3,0
chr1	168545821	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=208,189;MMQ=60,42;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:10,3,1,1
chr1	168549254	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,150;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr1	168549422	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=218,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,9:3,6:1,5,3,12
chr1	168550535	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=200,128;MMQ=44,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,7:1,4:0,2,1,10
chr1	168665747	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,4,2
chr1	168683461	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:7,8,2,0
chr1	168698173	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:2,5:10,4:8,5,5,4
chr1	169076212	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=108,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:5,2:2,2:1,6,0,5
chr1	169094100	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=191,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:1,0,9,2
chr1	169101280	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,20;MFRL=0,101;MMQ=60,38;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0|1:169101280_G_T:169101280:0,0,2,0
chr1	169101289	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=13,16;MFRL=0,201;MMQ=35,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169101280_G_T:169101280:1,0,1,0
chr1	169101291	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=18,10;MFRL=0,201;MMQ=35,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:169101280_G_T:169101280:1,0,1,0
chr1	169101295	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=24,10;MFRL=169,201;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:169101280_G_T:169101280:3,0,1,0
chr1	169101300	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,16;MFRL=169,201;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:169101280_G_T:169101280:3,0,1,0
chr1	169101305	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,15;MFRL=169,201;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:169101280_G_T:169101280:3,0,1,0
chr1	169101312	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=34,17;MFRL=169,201;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:169101280_G_T:169101280:3,0,1,0
chr1	169272451	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:169272451_A_T:169272451:0,0,4,10
chr1	169272453	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0|1:169272451_A_T:169272451:0,0,4,10
chr1	169279196	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,1:3,2:7,5,1,2
chr1	169345704	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr1	169349914	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:1,5,0,5
chr1	169351596	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=261,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr1	169366598	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,2:8,1:10,8,3,0
chr1	169390674	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,155;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:9,5,3,0
chr1	169394226	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	169435027	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	169446945	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,1:8,2:10,7,3,0
chr1	169483762	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr1	169492676	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=184,198;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,6:0,0:0,1,0,7
chr1	169494196	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr1	169498834	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,14:0,11:0,0,17,8
chr1	169499951	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:0,7:1,3:1,0,10,0
chr1	169500210	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,1:6,1:3,4,0,2
chr1	169505838	.	CT	AG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,5:11,0:7,11,5,0
chr1	169510118	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=122,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:8,4:12,3:12,8,4,3
chr1	169510524	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=98,142;MMQ=33,31;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:1,4:2,1:2,1,3,3
chr1	169511734	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,6:1,4:2,3,4,6
chr1	169513436	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=230,239;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	169515874	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	169515916	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=167,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	169528571	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr1	169528580	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=191,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr1	169529973	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,1:6,3:7,11,4,0
chr1	169530070	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=293,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	169530093	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=242,226;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	169564167	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=237,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,1:5,2:2,6,1,2
chr1	169572230	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=164,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:169572230_T_C:169572230:3,2,2,0
chr1	169572238	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0|1:169572230_T_C:169572230:4,2,2,0
chr1	169580717	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=114,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:7,5,2,1
chr1	169580972	.	C	CAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=143,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:1,3,0,2
chr1	169586220	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.428:10:4,2:1,2:4,2,4,0
chr1	169599254	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=102,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=87.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,29:0.650:44:4,12:11,14:8,7,20,9
chr1	169665551	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,4:2,3:5,0,7,0
chr1	169665632	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:5,4:2,13:2,5,9,8
chr1	169672595	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=10,17;MFRL=191,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.433:13:0,0:0,1:0,7,1,5
chr1	169679553	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:5,9:6,5:8,3,12,2
chr1	169697166	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=199,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:14,2,1,1
chr1	169698825	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=143,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,6:2,0:1,3,1,5
chr1	169699819	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=200,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr1	169762472	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=182,572;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.296:35:10,10:15,0:19,6,0,10
chr1	169763042	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=18,10;MFRL=149,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.466:10:1,0:1,0:0|1:169763042_G_T:169763042:1,4,0,5
chr1	169763046	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,10;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.593:8:0,0:1,0:0|1:169763042_G_T:169763042:1,2,0,5
chr1	169771872	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,8:0.333:25:7,0:10,8:0|1:169771872_T_A:169771872:6,11,0,8
chr1	169771884	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.359:23:6,0:9,8:0|1:169771872_T_A:169771872:6,9,0,8
chr1	169772245	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,4:4,0:9,1,4,0
chr1	169796407	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=201,125;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,0:1,6:0,7,0,6
chr1	169823655	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=166,100;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:7,0:7,6:2,12,0,6
chr1	169823660	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=115,179;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:3,5:10,4:2,11,1,8
chr1	169824995	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=127,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:13,1:14,2:15,12,3,0
chr1	169831690	.	CTCTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=148,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,4:2,1:4,0,4,1
chr1	169831993	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=115,246;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:1,7:4,1:1,4,1,7
chr1	169835950	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=187,218;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,5:4,1:4,0,6,0
chr1	169838278	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr1	169847683	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	169890933	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=68.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:2,7:0,12:0,2,0,19
chr1	169941761	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.898:17:1,6:0,10:0,1,5,11
chr1	169947146	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=107,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	169951748	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	169952385	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,9,1
chr1	169993762	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=190,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:1,6,0,2
chr1	170001151	.	ATACTCATT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.439:14:3,2:4,4:1,7,1,5
chr1	170004508	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=228,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr1	170115453	.	T	TTAAGAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=197,91;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170115453_T_TTAAGAA:170115453:0,3,0,1
chr1	170115455	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=197,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170115453_T_TTAAGAA:170115453:0,3,0,1
chr1	170115457	.	T	TTAATTAGACAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=197,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:170115453_T_TTAAGAA:170115453:0,3,0,1
chr1	170135669	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=117,252;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:7,1:7,8:9,5,5,4
chr1	170135828	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=252,111;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,2:6,1:6,5,2,1
chr1	170501456	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.306:21:11,2:3,3:2,13,2,4
chr1	170501521	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=224,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	170511604	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=198,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:4,3,3,1
chr1	170521277	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=121,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:15,2:7,4:17,5,4,2
chr1	170927570	.	C	CTT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.312:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr1	170927590	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=134,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:2,0:4,4,2,0
chr1	170927597	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=111,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,0:4,0:0|1:170927597_C_A:170927597:3,4,2,0
chr1	170927611	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:4,0:6,0:0|1:170927597_C_A:170927597:5,6,2,0
chr1	170927668	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,3:14,0:10,13,0,3
chr1	170934394	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:5,5,0,2
chr1	170993444	.	G	GGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,101;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=GT;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.779:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	171072862	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=218,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr1	171077165	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:5,1,1,1
chr1	171077198	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=175,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:5,6:7,4:7,5,7,3
chr1	171080203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:2,0:2,2:1,4,0,2
chr1	171083174	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=188,108;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,4:7,4:4,7,6,2
chr1	171083242	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:1,6:7,4:5,3,4,6
chr1	171083537	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=159,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,0:1,2:1,2,0,2
chr1	171085314	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.287:22:9,2:7,4:7,9,3,3
chr1	171115567	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=138,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.558:32:10,9:4,9:6,8,10,8
chr1	171115645	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:9,5:6,5:5,10,4,6
chr1	171116760	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:1,1:5,2:6,0,3,0
chr1	171118840	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:8,4,3,3
chr1	171121173	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:8,4:8,3:7,10,3,4
chr1	171121268	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=222,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:14,5:4,3:8,10,3,6
chr1	171121421	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=197,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:1,9,0,2
chr1	171227216	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:12,2:2,1:10,4,2,1
chr1	171227382	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=172,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:12,0:5,2:4,14,0,2
chr1	171252240	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,0:10,4:13,8,4,0
chr1	171252303	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,0:13,3:14,6,3,0
chr1	171252410	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=180,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:2,2,1,0
chr1	171252419	.	A	G,ACAGAGACAAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,32,27;MFRL=151,0,233;MMQ=60,60,60;MPOS=2,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.09,7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,2:0.223,0.334:6:3,0,0:0,1,2:0,3,1,2
chr1	171300959	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=251,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:0,7:6,8:0,6,2,13
chr1	171302094	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=238,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr1	171303925	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=217,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:2,6:2,8:2,2,5,9
chr1	171311003	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=326,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr1	171486743	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.123:38:17,4:17,0:13,21,3,1
chr1	171491264	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,1:5,2:13,1,3,0
chr1	171496895	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr1	171509014	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	171509058	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,4,1
chr1	171511165	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,0:10,2:8,7,0,2
chr1	171514731	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:7,7:6,1:2,11,7,1
chr1	171514848	.	T	TTTTA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TTTA;STR;TLOD=27.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.710:10:1,5:2,1:0,3,0,7
chr1	171526570	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=117,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.445:21:8,4:1,5:9,3,3,6
chr1	171526743	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=108,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:19,1:18,2:21,17,3,0
chr1	171527322	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=162,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:2,3:4,2:1,6,0,6
chr1	171548868	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	171557595	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:11,0:12,3:11,12,0,3
chr1	171607702	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr1	171673749	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:0,11,0,3
chr1	171679958	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:7,1:11,2:4,14,2,1
chr1	171751051	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:4,0:6,4:9,2,4,0
chr1	171755071	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:6,2:13,2:8,11,1,3
chr1	171755182	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,3:9,3:9,8,4,2
chr1	171761458	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=217,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr1	171763549	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,4:3,2:7,4,3,3
chr1	171765965	.	A	ATGTCCTTCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=228,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171765965_A_ATGTCCTTCTT:171765965:0,1,0,1
chr1	171765967	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=24,22;MFRL=228,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:171765965_A_ATGTCCTTCTT:171765965:0,1,0,1
chr1	171810960	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=233,272;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:1,3,0,4
chr1	172001552	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.153:37:15,0:17,5:19,13,5,0
chr1	172038079	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:3,9,0,2
chr1	172113808	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,3:8,3:4,14,0,6
chr1	172356582	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,177;MMQ=40,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,4:0,5:0,1,0,9
chr1	172410769	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=966,179;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,5:7,0:5,6,5,0
chr1	172410967	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.585:22:5,8:4,5:5,4,8,5
chr1	172411496	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=144,261;MMQ=60,51;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.437:16:4,2:5,4:4,5,2,5
chr1	172425529	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,10:2,1:6,0,10,1
chr1	172431210	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=217,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr1	172434375	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,22:0.804:27:2,15:2,6:1,4,19,3
chr1	172502041	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,326;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr1	172526801	.	TA	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=167,115;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,2:13,0:16,13,2,0
chr1	172548330	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:15,2:7,1:10,12,2,1
chr1	172558148	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:12,6:7,0:3,16,6,0
chr1	172577864	.	CTT	C,CT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32,34;MFRL=133,187,167;MMQ=60,60,60;MPOS=15,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.13,8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,5:0.238,0.321:17:3,1,3:2,3,2:4,4,8,1
chr1	172628780	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=219,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:5,2:1,10,0,2
chr1	172633480	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,103;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.249:36:9,7:18,0:11,16,9,0
chr1	172634734	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	173019971	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,91;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,3:9,0:13,10,3,0
chr1	173157541	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=201,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr1	173490547	.	GA	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,101;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.243:25:3,0:10,4:2,17,1,5
chr1	173490616	.	C	CTATATA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=285,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=TA;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	173504959	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,1240;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:12,0:15,7:14,13,7,0
chr1	173735426	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,3:17,0:12,14,1,2
chr1	173795803	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=210,193;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:1,0:2,3,1,0
chr1	173797451	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:0,5,1,3
chr1	173819421	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,32,33;MFRL=175,237,182;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,17;RU=A;STR;TLOD=4.94,3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.351,0.270:9:1,1,1:0,3,1:1,2,6,0
chr1	173825692	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=193,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	173840219	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=154,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:9,3:7,14,1,2
chr1	173855298	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=139,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,0,3
chr1	173950205	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=210,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:1,2,0,5
chr1	173961807	.	AACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AC;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.751:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	174188285	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:5,11:6,5:5,6,10,6
chr1	174190291	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=170,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,2:8,1:2,14,1,2
chr1	174210539	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=164,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	174274328	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:174274328_A_AT:174274328:0,4,0,1
chr1	174274330	.	G	GTTGT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:174274328_A_AT:174274328:0,4,0,1
chr1	174274333	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:174274328_A_AT:174274328:0,4,0,1
chr1	174274349	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=236,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr1	174417231	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=157,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:2,9:2,3:3,1,10,2
chr1	174945278	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=119,81;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:17,0:11,3:14,14,0,3
chr1	174969271	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=112,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,7:5,6:4,4,9,4
chr1	175046488	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=208,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,2,1
chr1	175052828	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=251,76;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr1	175053069	.	C	CAATTATTCCTTTGACGAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=175,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:2,0:8,2:1,9,1,1
chr1	175087677	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=133,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:2,3,6,2
chr1	175092840	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=207,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:1,5:3,8:0,4,2,11
chr1	175097331	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=235,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:1,5:4,3:0,5,4,5
chr1	175097349	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=496,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,2:1,0,1,6
chr1	175097755	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.175:38:17,6:15,0:11,21,6,0
chr1	175105880	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	175105942	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0,0,12,1
chr1	175116046	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,34,32;MFRL=237,74,140;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,16;RU=T;STR;TLOD=5.81,8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.185,0.590:11:1,2,1:0,0,5:1,1,7,2
chr1	175116065	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.305:16:1,0:6,0:7,4,5,0
chr1	175116252	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,5,11
chr1	175129945	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.896:17:0,7:1,7:0|1:175129945_TC_T:175129945:1,0,8,8
chr1	175129947	.	TTCTTCTTG	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,16:0.895:17:0,8:1,8:0|1:175129945_TC_T:175129945:1,0,8,8
chr1	175293424	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr1	175336530	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=219,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,2:1,3:0,1,0,6
chr1	175355128	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=267,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,5:2,5:1,2,7,3
chr1	175355152	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=222,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,3:3,6:4,3,4,5
chr1	175914315	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,66;MMQ=60,29;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,5:4,0:6,3,4,1
chr1	175916267	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr1	176012807	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	176050430	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=10,35;MFRL=192,296;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.459:3:0,0:0,1:0|1:176050430_GA_G:176050430:0,2,0,1
chr1	176050437	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=179,296;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.308:5:2,0:2,1:0|1:176050430_GA_G:176050430:0,4,0,1
chr1	176105710	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,3:1,0,1,3
chr1	176132913	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=142,90;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.429:21:6,8:6,0:7,5,9,0
chr1	176145007	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	176153658	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	176525360	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	176664842	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=302,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,4:1,5:1,3,6,3
chr1	176668823	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,361;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr1	176671881	.	T	TTGTGTGTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,199;MMQ=60,36;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=16,20;RU=TG;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.386:8:1,2:4,0:0,5,0,3
chr1	176675566	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=128,57;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:12,3:10,0:10,12,3,0
chr1	176681165	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=217,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=TG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr1	176734756	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=114,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.688:11:1,3:2,4:2,1,7,1
chr1	176769358	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr1	176857156	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=209,81;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:7,1:0,1:7,0,3,0
chr1	176857347	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr1	177199323	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=149,293;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr1	177898948	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,133;MMQ=60,48;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,3:13,0:11,12,3,0
chr1	177899121	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:2,5,0,4
chr1	177901713	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:3,7:8,4:1,10,6,5
chr1	177901741	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,6:2,5:0,4,4,7
chr1	177902387	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:5,4:6,5:0|1:177902387_C_A:177902387:5,6,4,5
chr1	177902388	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,7:0.363:20:7,2:6,5:1|0:177902387_C_A:177902387:6,7,3,4
chr1	177902482	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=133,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,1:1,6:0,4,1,6
chr1	177911253	.	G	GACTGAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=225,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr1	177915474	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	177915698	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,346;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:1,6,0,2
chr1	177916859	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=25,31;MFRL=155,190;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:177916859_T_G:177916859:1,0,1,0
chr1	177916866	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,29;MFRL=169,190;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:177916859_T_G:177916859:2,0,1,0
chr1	177916868	.	GGA	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=20,16;MFRL=169,190;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:177916859_T_G:177916859:2,0,1,0
chr1	177916872	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=17,20;MFRL=169,190;MMQ=60,51;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:177916859_T_G:177916859:2,0,1,0
chr1	177916878	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=169,190;MMQ=60,51;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:177916859_T_G:177916859:2,0,1,0
chr1	177917479	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=152,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:6,1,4,0
chr1	177929379	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,2,1
chr1	177929501	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,6:5,2:6,4,4,4
chr1	177930642	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=261,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr1	177930894	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=241,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,1,4
chr1	177933443	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:8,1:1,3:2,7,0,4
chr1	177933505	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=194,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	177934351	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr1	177935203	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=239,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	177936960	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,4:6,1:3,9,5,0
chr1	178063551	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	178408795	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=296,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	178433368	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,1:2,4:4,3,4,1
chr1	178442190	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.548:29:7,6:6,9:9,4,10,6
chr1	178442208	.	A	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:20,3:14,0:24,10,3,0
chr1	178442267	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=141,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:13,0:19,4:16,16,0,4
chr1	178483198	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=91,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:7,6,2,0
chr1	178483231	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=162,86;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,0:6,3:7,3,2,1
chr1	178489978	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:4,2:11,6:10,5,6,2
chr1	178514165	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=116,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,0:6,3:5,8,2,1
chr1	178514203	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:4,8,3,5
chr1	178514560	.	A	AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=36.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:0,9:6,4:0,6,1,12
chr1	178515135	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	178745778	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178745778_C_T:178745778:3,0,1,0
chr1	178745792	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:178745778_C_T:178745778:3,0,1,0
chr1	178745830	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=161,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:11,3:3,0:11,3,3,0
chr1	178858711	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.252:14:6,2:4,1:10,1,3,0
chr1	178861475	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=179,78;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:12,4:0|1:178861475_C_T:178861475:8,11,1,3
chr1	178861477	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=179,78;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:12,4:0|1:178861475_C_T:178861475:8,11,1,3
chr1	178861504	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=172,78;MMQ=60,53;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,0:8,3:2,8,0,3
chr1	178863023	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,2:5,5:4,10,3,4
chr1	178871430	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:178871430_TCA_T:178871430:0,2,0,1
chr1	178871435	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:178871430_TCA_T:178871430:0,2,0,1
chr1	178871438	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:178871430_TCA_T:178871430:0,2,0,1
chr1	178871439	.	T	TCTTTACTCAGTA	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=186,258;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:178871430_TCA_T:178871430:0,2,0,1
chr1	179012947	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=151,101;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:7,0,1,1
chr1	179041011	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,6:4,2:6,1,5,3
chr1	179054692	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:7,7:4,5:5,6,7,5
chr1	179077450	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.270:15:3,0:5,1:8,3,0,4
chr1	179087934	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:3,8,3,5
chr1	179089239	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.326:13:6,3:3,1:9,0,4,0
chr1	179271948	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.402:10:4,3:2,1:1,5,0,4
chr1	179304892	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	179312102	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,1:0,13:0,0,5,10
chr1	179312708	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=135,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,0:6,2:0|1:179312708_G_C:179312708:12,4,1,1
chr1	179312721	.	T	TCTTTCTCTC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=159,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.163:16:6,0:7,2:0|1:179312708_G_C:179312708:11,3,1,1
chr1	179316687	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=132,112;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:5,3:4,1:7,2,2,2
chr1	179317895	.	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	A,ATG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30,32;MFRL=0,200,199;MMQ=60,60,60;MPOS=18,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=27,13,14;RU=TG;STR;TLOD=5.37,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.437,0.435:4:0,1,2:0,1,0:0,0,4,0
chr1	179319580	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.868:12:0,8:1,3:1,0,3,8
chr1	179320404	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=167,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,2:7,0:13,4,1,1
chr1	179320665	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=195,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	179339099	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=159,101;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:9,2,1,1
chr1	179364391	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=128,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,1,2
chr1	179380472	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr1	179398563	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr1	179401379	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=132,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:2,0:4,2:5,1,1,1
chr1	179401484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=119,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,0:5,4:11,3,4,0
chr1	179401564	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=91,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:1,0,0,4
chr1	179452194	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=143,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,2,2
chr1	179462149	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	179494595	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=170,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:18,3:6,0:10,14,3,0
chr1	179494612	.	CTACA	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TACA;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr1	179494665	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,1:0,0,0,6
chr1	179503806	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,267;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,3:6,0:8,0,3,0
chr1	179504025	.	AAAG	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=125,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAG;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:4,4:4,1:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:4,5,2,3
chr1	179504043	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=86,231;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.306:21:8,5:6,1:0|1:179504025_AAAG_A:179504025:6,9,2,4
chr1	179520254	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr1	179520506	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:7,7:5,6:8,4,7,6
chr1	179561683	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=206,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr1	179600001	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=140,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,3:7,1:5,6,2,2
chr1	179605058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	179632727	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	179815963	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=196,61;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:3,7,1,2
chr1	179858333	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	179873078	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=218,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:4,3,0,5
chr1	179983665	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,0,14
chr1	179992076	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	180010702	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	180010938	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=113,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:18,0:16,2:12,23,1,1
chr1	180022343	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr1	180023117	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=198,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0,11,0,2
chr1	180023156	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:180023156_C_A:180023156:0,3,0,1
chr1	180023159	.	T	TCTCACAACAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:180023156_C_A:180023156:0,3,0,1
chr1	180023161	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=190,218;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:180023156_C_A:180023156:0,3,0,1
chr1	180043109	.	TTTG	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=206,135;MMQ=60,45;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:6,0:0,4:0|1:180043109_TTTG_T:180043109:0,7,0,4
chr1	180043115	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=190,135;MMQ=60,45;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:6,0:0,4:0|1:180043109_TTTG_T:180043109:0,6,0,4
chr1	180043135	.	T	TCTGTCTGCTTTATG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=204,140;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr1	180053219	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,17:0.419:41:9,17:15,0:15,9,17,0
chr1	180059811	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	180064589	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=141,69;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:17,3,2,0
chr1	180080115	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,15,3
chr1	180155376	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,4:7,1:0,9,0,5
chr1	180155382	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=137,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,3:1,7:0,3,0,11
chr1	180155402	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=181,138;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,3:0,12,0,4
chr1	180158668	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr1	180159797	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=202,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	180163390	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=192,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,6:5,3:4,5,7,2
chr1	180240510	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=197,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:6,6:3,6:5,4,7,5
chr1	180240752	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=289,247;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.609:6:0,1:2,1:1,1,1,3
chr1	180257692	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,3,10
chr1	180601229	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,10:2,0:10,0,10,0
chr1	180757007	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,2:9,1:2,10,0,3
chr1	180804082	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:6,2:8,7,2,0
chr1	180849494	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=207,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr1	180853261	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr1	180897521	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr1	180905352	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:5,2,6,1
chr1	180991665	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr1	181018180	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=176,137;MMQ=40,33;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:8,2,4,1
chr1	181018236	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=168,159;MMQ=59,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,3:9,0:8,10,2,1
chr1	181022895	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	181058540	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=217,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr1	181058618	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=261,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:1,2,1,2
chr1	181058643	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr1	181452781	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	181453186	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:181453186_G_T:181453186:0,4,0,1
chr1	181453192	.	C	CATTTTTTTTTTCCTTTTTCTAAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:181453186_G_T:181453186:0,4,0,1
chr1	181479756	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=208,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:8,0:4,2:0|1:181479756_G_C:181479756:0,13,0,2
chr1	181479757	.	TC	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,0:4,2:0|1:181479756_G_C:181479756:0,15,0,2
chr1	181479765	.	GG	TC	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=208,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:181479756_G_C:181479756:0,17,0,2
chr1	181479770	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:181479756_G_C:181479756:0,16,0,2
chr1	181479775	.	CC	TT	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=212,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,1:0|1:181479756_G_C:181479756:0,17,0,2
chr1	181549963	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:2,0:2,10:0|1:181549963_G_T:181549963:0,5,0,10
chr1	181549971	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:2,0:4,1:0|1:181549963_G_T:181549963:0,6,0,10
chr1	181549972	.	G	GTTCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:2,0:4,1:0|1:181549963_G_T:181549963:0,6,0,10
chr1	181680101	.	AAG	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AG;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:10,2:14,5,1,2
chr1	181684605	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,4:0,1:1,2,0,5
chr1	181686216	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=73,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr1	181688832	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=252,189;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:5,0,4,0
chr1	181688868	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=253,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,0:4,3:7,3,3,0
chr1	181706598	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,6:2,0:8,0,6,0
chr1	181719679	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=155,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:1,5,0,3
chr1	181719738	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=219,233;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181719738_T_TG:181719738:0,1,0,1
chr1	181719739	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=219,233;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:181719738_T_TG:181719738:0,1,0,1
chr1	181727030	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=194,244;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,2:5,1:9,1,3,0
chr1	181727273	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=158,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,3:4,7:2,6,3,7
chr1	181731667	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=217,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.399:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr1	181732695	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=191,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:5,8,0,3
chr1	181750469	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=160,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:7,0,4,0
chr1	181752923	.	AAGCTT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGCTT;STR;TLOD=29.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.567:14:2,1:4,7:2,4,1,7
chr1	181754803	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,2:4,4:9,1,6,0
chr1	182027022	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=165,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:1,5,3,0
chr1	182027044	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:7,2:15,0:17,6,2,0
chr1	182354850	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=252,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:1,6:3,9:2,2,12,3
chr1	182354890	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=158,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:12,7,3,0
chr1	182355046	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:3,6,2,7
chr1	182441719	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=230,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:2,0:1,6:0,3,0,7
chr1	182491107	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=262,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr1	182501933	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,10:1,5:0,1,2,13
chr1	182509292	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr1	182509602	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=169,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr1	182509617	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr1	182509646	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr1	182517357	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	182556036	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	182573227	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	182812410	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:2,0:10,1,3,0
chr1	182854017	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	182993358	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=195,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:6,1:6,2:0,12,0,4
chr1	183077615	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:183077615_C_T:183077615:0,4,0,2
chr1	183077618	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0|1:183077615_C_T:183077615:0,4,0,2
chr1	183079853	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=242,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:1,3,0,5
chr1	183084607	.	AC	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=183,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,6:1,5:3,0,10,1
chr1	183085696	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:4,2,4,1
chr1	183087075	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,7:8,0:10,5,7,0
chr1	183090919	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=151,78;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:15,2:2,0:11,7,1,1
chr1	183095185	.	TAAA	T,TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,28,28;MFRL=188,236,140;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,12;RU=A;STR;TLOD=5.14,8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.215,0.438:9:1,1,3:2,1,1:3,0,6,0
chr1	183095234	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:4,5:10,8:6,8,10,4
chr1	183095477	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=80,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr1	183096634	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=228,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr1	183097754	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,4:6,0:7,6,4,0
chr1	183097956	.	G	GTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr1	183099701	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=287,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:3,8:4,4:1,6,2,11
chr1	183100327	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:183100327_G_T:183100327:0,0,1,0
chr1	183100333	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:183100327_G_T:183100327:0,0,1,0
chr1	183100338	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,10;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.679:1:0,0:0,0:0|1:183100327_G_T:183100327:0,0,1,0
chr1	183101441	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=243,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:183101441_A_C:183101441:2,0,2,0
chr1	183101448	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.614:3:1,0:0,2:0|1:183101441_A_C:183101441:1,0,2,0
chr1	183101471	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=208,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr1	183101686	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=200,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	183102719	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=227,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,4:5,2:1,9,0,6
chr1	183104003	.	GGTCTGT	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,2:7,2:2,8,1,3
chr1	183104013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.452:11:4,1:2,3:2,4,2,3
chr1	183104340	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=221,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:1,4:0,5,0,6
chr1	183105534	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.654:27:5,8:4,9:6,3,9,9
chr1	183106739	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr1	183176970	.	GTT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,2:2,0:8,1,2,0
chr1	183177218	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.438:21:6,6:5,3:7,5,5,4
chr1	183184524	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=251,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr1	183187494	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,4:5,1:11,0,4,1
chr1	183191144	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=229,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr1	183191367	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,4:4,5:3,8,3,6
chr1	183205523	.	CAAAA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,0;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:2,2:5,1:7,5,2,1
chr1	183207603	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr1	183209086	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=198,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:9,0,3,0
chr1	183209127	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,0;MFRL=182,132;MMQ=60,59;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:2,0:6,0:0|1:183209127_C_G:183209127:7,2,5,0
chr1	183209133	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=175,132;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:2,5:8,0:0|1:183209127_C_G:183209127:8,2,5,0
chr1	183212548	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:4,4,0,5
chr1	183230516	.	ATCCGC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=212,266;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:0,2:0,3,0,3
chr1	183253213	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr1	183253959	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.846:17:2,5:0,10:1,1,7,8
chr1	183496658	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,4:2,6:8,0,9,1
chr1	183496758	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=173,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=48.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,16:0.304:54:18,16:20,0:18,20,16,0
chr1	183498191	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=130,99;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:3,0:6,3:0,9,0,3
chr1	183513616	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,125;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.128:37:21,0:12,4:13,20,0,4
chr1	183516440	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:2,11,0,4
chr1	183525452	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	183533175	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:5,5,3,4
chr1	183534935	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,8:4,2:2,6,2,8
chr1	183538212	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=190,84;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,0:3,3:3,3,1,2
chr1	183542387	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,4:8,6:7,6,5,5
chr1	183592570	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=151,120;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:3,3:4,4:0|1:183592570_C_T:183592570:4,4,3,4
chr1	183592594	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=147,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,4:0.333:13:5,1:4,3:1|0:183592570_C_T:183592570:6,3,1,3
chr1	183596703	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=77.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.683:39:6,23:6,4:6,6,9,18
chr1	183599638	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,4:9,1:13,3,2,3
chr1	183602308	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:7,9:3,3:4,6,6,6
chr1	183616781	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:183616781_G_T:183616781:1,0,3,0
chr1	183616805	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=161,227;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,0:3,1:0|1:183616781_G_T:183616781:4,0,2,0
chr1	183616884	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=159,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,3:4,1:5,3,2,2
chr1	183617094	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:9,4:8,4:14,3,6,2
chr1	183617105	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,23:0.751:30:3,15:4,8:6,1,14,9
chr1	183617311	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:12,3:7,6:5,15,6,3
chr1	183617413	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=208,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,6:6,3:6,8,4,5
chr1	183617693	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=196,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,3:8,4:4,8,4,3
chr1	183711483	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=164,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	183775597	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=174,73;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:10,0:11,2:13,8,2,0
chr1	183775638	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.578:19:2,3:5,8:1,7,3,8
chr1	183775704	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=176,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.262:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr1	183852914	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.419:22:9,5:3,4:6,7,5,4
chr1	183869220	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,74;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,1:7,0:0|1:183869220_G_A:183869220:17,0,1,1
chr1	183869225	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=175,74;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,2:6,0:0|1:183869220_G_A:183869220:16,0,1,1
chr1	183871637	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=195,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:0,7:2,7:1,1,9,5
chr1	183895178	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=220,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr1	183909934	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,235;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,2,3
chr1	183920334	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=210,224;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr1	183938304	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=234,308;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:183938304_C_A:183938304:1,0,4,0
chr1	183938313	.	G	GTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=234,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.753:6:0,2:1,3:0|1:183938304_C_A:183938304:1,0,5,0
chr1	183942950	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	184024034	.	GTA	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:0|1:184024034_GTA_G:184024034:4,17,0,2
chr1	184024037	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:13,2:0|1:184024034_GTA_G:184024034:4,17,0,2
chr1	184039911	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=189,318;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr1	184476621	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,5:0,2:1,0,7,0
chr1	184537506	.	ACTC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:4,3,3,2
chr1	184588639	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=158,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,3:3,0:7,2,3,0
chr1	184680963	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=130,86;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:8,9,2,0
chr1	184681065	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.616:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	184688237	.	CGT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GT;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:6,1:2,1:9,0,2,0
chr1	184692812	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=304,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr1	184695571	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr1	184706212	.	GT	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,263;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:4,2:12,4:6,11,2,4
chr1	184718750	.	GAAAAAA	G,GA,GAAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32,35,19;MFRL=145,183,151,174;MMQ=60,60,60,60;MPOS=19,22,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.70,3.65,7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,5:0.157,0.173,0.361:13:1,1,1,2:1,1,1,0:2,2,2,7
chr1	184723535	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,20:0.538:37:6,15:11,0:17,0,20,0
chr1	184764067	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	184764410	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr1	184777467	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr1	184787677	.	AAGG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:4,0:9,1,1,1
chr1	184787681	.	G	GAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:9,1,1,1
chr1	184943502	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=262,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:184943502_C_A:184943502:2,0,0,1
chr1	184943509	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=262,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:184943502_C_A:184943502:2,0,0,1
chr1	185060851	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=83,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,0:4,2:0|1:185060851_C_T:185060851:9,3,1,1
chr1	185060872	.	G	GAATTCTCCACA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,0:4,2:0|1:185060851_C_T:185060851:8,4,1,1
chr1	185069235	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=209,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr1	185094277	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr1	185137454	.	T	TAAATGATAGAC	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=118.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,29:0.682:42:4,13:9,6:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:5,8,20,9
chr1	185137461	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=145,154;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=105.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,26:0.659:39:3,14:9,10:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:5,8,21,5
chr1	185137464	.	T	TAA	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,25:0.666:37:3,14:8,10:0|1:185137454_T_TAAATGATAGAC:185137454:4,8,20,5
chr1	185137628	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=257,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	185153545	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,0,6
chr1	185259731	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=239,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr1	185267114	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,5:2,3:2,1,7,1
chr1	185833565	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:1,1,1,2
chr1	185834851	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=114,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:0,0:0,2:2,0,3,0
chr1	185951607	.	C	CACTACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=188,72;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185951607_C_CACTACTT:185951607:0,4,0,1
chr1	185951609	.	G	GCCCCCAGAGGCC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=188,72;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185951607_C_CACTACTT:185951607:0,4,0,1
chr1	185951610	.	T	TTC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=188,72;MMQ=60,48;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:185951607_C_CACTACTT:185951607:0,4,0,1
chr1	185956764	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=240,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,0:2,7:0,2,0,7
chr1	186022032	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=245,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr1	186030900	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:186030900_C_T:186030900:3,0,2,0
chr1	186030902	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=193,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0|1:186030900_C_T:186030900:2,0,3,0
chr1	186039006	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=236,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	186047150	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=214,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,1:3,5:9,0,6,0
chr1	186055371	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=240,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,2:0,6:4,2,5,3
chr1	186057181	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:4,2,1,4
chr1	186081918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,4,0
chr1	186083201	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=155,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:16,4:10,0:16,10,3,1
chr1	186086578	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,3,0
chr1	186089072	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=266,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,2:8,7:9,2,4,5
chr1	186089102	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=191,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.209:19:4,0:10,4:10,5,3,1
chr1	186089112	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:3,1:8,10:7,4,7,4
chr1	186089363	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=325,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	186092076	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr1	186105949	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=130,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:4,4:9,2:6,8,2,4
chr1	186106861	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=208,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:8,5,1,1
chr1	186106949	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:5,2:7,0:6,8,2,0
chr1	186113852	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=230,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr1	186141301	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:1,5,1,6
chr1	186143799	.	C	CAGAA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=158,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:186143799_C_CAGAA:186143799:7,4,1,1
chr1	186143802	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=158,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:0|1:186143799_C_CAGAA:186143799:7,4,1,1
chr1	186151493	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:0,5,0,9
chr1	186265948	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	186281488	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:2,10,0,2
chr1	186292720	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=142,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,1:5,2:4,1,3,0
chr1	186304298	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,3:10,0:4,10,1,2
chr1	186313249	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr1	186315474	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=200,239;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,0:1,3:0,9,0,3
chr1	186329869	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=139,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,1:7,1:11,7,1,1
chr1	186330695	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=128,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:4,1:3,2:7,0,2,1
chr1	186357523	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,6:0,6:0,0,12,0
chr1	186360814	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,1:11,2:14,8,2,1
chr1	186363211	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=118,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	186368092	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=144,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,1:10,2:6,10,0,3
chr1	186370598	.	T	TTCTG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCTG;STR;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:1,4:1,4,1,4
chr1	186370630	.	TTC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,1:2,1:0,6,0,2
chr1	186386861	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr1	186413205	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:5,0:7,3:7,6,2,1
chr1	186908385	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr1	186919675	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=220,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:6,0,3,0
chr1	186919732	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr1	186925552	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	190250905	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:2,9,0,2
chr1	192127788	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:18,0:16,4:0|1:192127788_C_T:192127788:19,16,4,0
chr1	192127794	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=119,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,4:0.122:39:19,0:15,4:0|1:192127788_C_T:192127788:17,18,4,0
chr1	192335271	.	C	CTAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=232,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAT;STR;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr1	192545099	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:0,1,0,8
chr1	192548316	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.109:39:15,0:20,3:16,19,0,4
chr1	192778159	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.174:27:11,1:8,3:17,6,2,2
chr1	192779227	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:6,0,3,0
chr1	192780088	.	GCT	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CT;STR;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.249:30:10,1:11,6:9,14,3,4
chr1	192780337	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=254,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	192780498	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,2:9,2:17,1,4,0
chr1	193038360	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:6,1:9,1:9,7,1,1
chr1	193051685	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=145,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.591:25:6,8:4,6:8,2,11,4
chr1	193051925	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=105,118;MMQ=40,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:193051925_C_A:193051925:0,1,1,0
chr1	193051931	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,118;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:193051925_C_A:193051925:0,0,1,0
chr1	193053675	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=224,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,2,0
chr1	193053762	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,289;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,2:6,1:11,5,1,2
chr1	193094375	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	193104805	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,18;MFRL=219,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,0,1
chr1	193104827	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	193117124	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:14,0:6,2:5,15,0,2
chr1	193205370	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:2,0:3,0:4,4,3,0
chr1	196227578	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=198,67;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr1	196251522	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	196254970	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr1	196398619	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=256,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr1	196398974	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	196461513	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr1	196642072	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,4,2
chr1	196642969	.	C	CTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=T;STR;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:3,1:3,3:4,2,5,1
chr1	196659237	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=132,166;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.615:24:3,3:6,12:3,6,6,9
chr1	196684625	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=204,285;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr1	196705926	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:0,2:2,0,4,0
chr1	196757258	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=153,141;MMQ=59,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr1	196796184	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr1	196797123	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,147;MMQ=56,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr1	196801190	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:1,3,1,2
chr1	196879488	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:12,0:20,2:11,22,0,2
chr1	196881825	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,177;MMQ=55,33;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:6,3,2,0
chr1	196920148	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=153,186;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.407:15:4,2:4,3:2,7,4,2
chr1	196920178	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=164,298;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:1,4:3,0:3,1,0,4
chr1	196946869	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=146,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:6,7,2,3
chr1	196967458	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:1,8,0,3
chr1	196973890	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,1:3,1:4,5,0,2
chr1	197009631	.	CA	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.221:21:5,2:9,2:13,4,4,0
chr1	197009798	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=172,207;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:11,1:6,1:8,9,1,1
chr1	197026672	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=294,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr1	197053373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=337,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	197053561	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:2,0:4,3:0,7,0,3
chr1	197055925	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=220,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,2:3,10:4,1,7,5
chr1	197059221	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.228:16:2,0:8,2:5,8,1,2
chr1	197059878	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=239,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr1	197059892	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=207,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,4:1,4:3,0,8,0
chr1	197059928	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,4:1,7:3,0,10,1
chr1	197063352	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=264,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,6:2,4:0,5,1,9
chr1	197071363	.	AAGT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:10,0:9,10,0,2
chr1	197071774	.	A	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:22,0:15,4:20,17,0,4
chr1	197091808	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=256,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=34.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,4:1,6:0,3,0,10
chr1	197097891	.	AAAAT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=227,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,1:6,4:0,7,0,5
chr1	197101303	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=273,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr1	197101374	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=158,105;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.383:32:14,12:6,0:12,8,12,0
chr1	197104149	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr1	197109042	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=229,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=52.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,5:1,12:0,2,2,15
chr1	197113073	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=105,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,27:0.878:30:3,8:0,19:1,2,21,6
chr1	197141243	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=299,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:1,0,10,2
chr1	197150256	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.436:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr1	197297540	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,4:6,9:5,4,9,4
chr1	197316408	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=133,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr1	197316435	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr1	197325908	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	197398632	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=213,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,7:10,0:11,5,7,0
chr1	197411404	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=201,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:5,6,3,0
chr1	197447037	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr1	197480927	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,21:0.550:38:9,10:8,11:6,11,10,11
chr1	197482167	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	197510025	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,8:0,0,16,6
chr1	197515777	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	197515981	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,1:3,5:0,7,1,5
chr1	197576307	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=46.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr1	197741951	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr1	197742171	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	197890422	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr1	197898395	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=199,272;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr1	198492490	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.130:29:13,1:13,2:16,10,2,1
chr1	198687125	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=217,262;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	198711170	.	CA	C,CAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32,35;MFRL=138,171,204;MMQ=60,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.77,4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,3:0.254,0.185:19:5,3,2:3,2,0:5,6,3,5
chr1	198717218	.	GTTTT	G,GTTTTT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,34,32;MFRL=139,186,115;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,12,17;RU=T;STR;TLOD=3.40,16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,12:0.112,0.633:20:3,1,4:0,1,7:3,3,10,4
chr1	198717235	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=36,10;MFRL=103,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.489:28:2,1:10,1:2,12,14,0
chr1	198719611	.	GT	TC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,60993601;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:10,0:9,11,1,1
chr1	198721441	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:12,8:11,0:9,14,8,0
chr1	198721651	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=164,273;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:4,1,0,2
chr1	200014762	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=275,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr1	200017289	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,14;MFRL=199,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.465:11:2,1:3,1:3,3,5,0
chr1	200080463	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:2,1,2,4
chr1	200080487	.	T	TAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:200080487_T_TAC:200080487:0,3,0,1
chr1	200080488	.	T	TGAGCACACAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:200080487_T_TAC:200080487:0,3,0,1
chr1	200089872	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,1:0,4:4,0,5,0
chr1	200090120	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr1	200143064	.	CTTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=212,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=T;STR;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.592:10:1,5:2,1:3,1,6,0
chr1	200143143	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=182,56;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:12,3:13,0:14,11,3,0
chr1	200182654	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	200182709	.	CGCCGGAGAGGAG	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=262,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.430:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr1	200182799	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=198,161;MMQ=60,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,4:8,2:7,10,2,4
chr1	200182834	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=198,176;MMQ=60,50;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:12,4:7,3:9,10,2,5
chr1	200312534	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,3:8,0:6,13,0,3
chr1	200312546	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,33,20,17;MFRL=175,222,223,162;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,17,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=9.15,6.57,6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,6,4,4:0.345,0.257,0.259:16:0,2,2,1:2,2,0,0:2,0,0,14
chr1	200377259	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=160,175;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:6,0:10,4:12,4,0,4
chr1	200522566	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,8:1,6:0,1,5,9
chr1	200523514	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	200524415	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,153;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=46.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.643:23:5,15:3,0:8,0,15,0
chr1	200549590	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=154,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr1	200550243	.	G	GAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=227,151;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=18,21;RU=A;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,1:1,1:1,0,3,0
chr1	200569183	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,21:0.458:46:16,0:8,20:0|1:200569183_A_C:200569183:13,12,0,21
chr1	200569189	.	T	TCATCTTGAAAAACAACCCATGCATTACA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=169,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=56.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,21:0.458:46:17,0:7,21:0|1:200569183_A_C:200569183:13,12,0,21
chr1	200569392	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,2,4
chr1	200574499	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:3,4,0,3
chr1	200578093	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	200594240	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	200619478	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	200619530	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr1	200619614	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=162,52211570;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,2:8,0:9,6,0,2
chr1	200801540	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,1:5,1:0,7,0,2
chr1	200811203	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:8,11,0,2
chr1	200816520	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:200816520_TG_T:200816520:0,0,0,2
chr1	200816522	.	TG	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:200816520_TG_T:200816520:0,0,0,2
chr1	200816658	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr1	200821747	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:16,0:17,6:16,17,0,6
chr1	200826552	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=171,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:6,3:0,9,0,3
chr1	200843305	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr1	200860825	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:3,3:12,0:6,9,0,3
chr1	200877089	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,0:6,2:2,10,1,1
chr1	200877786	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=184,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr1	200877850	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=137,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,4:9,2:10,6,3,3
chr1	200943793	.	CAGGA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGA;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr1	200944840	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=225,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.663:10:0,5:3,1:0,3,0,7
chr1	200960307	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=123,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,5:7,3:6,6,2,6
chr1	200967490	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,1:6,3:12,2,4,0
chr1	200968613	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.185:19:8,0:8,3:2,14,2,1
chr1	200969766	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,2:2,1:8,1,1,2
chr1	200969942	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,242;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:9,10,1,1
chr1	200971521	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0|1:200971521_G_A:200971521:0,9,0,3
chr1	200971528	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,1:5,2:0|1:200971521_G_A:200971521:0,9,0,3
chr1	201009556	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,2,2
chr1	201009897	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	201012578	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:9,11,2,0
chr1	201012597	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:5,4,1,6
chr1	201017687	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:5,1:6,3:7,4,3,1
chr1	201019623	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:3,7,1,1
chr1	201020105	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.549:29:8,9:5,6:8,5,7,9
chr1	201021619	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:5,1:11,1:16,1,1,1
chr1	201022773	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:0,0:3,0:0|1:201022773_G_GC:201022773:0,3,0,1
chr1	201022775	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,15;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:0,0:3,0:0|1:201022773_G_GC:201022773:0,3,0,3
chr1	201022779	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,19;MFRL=264,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.622:6:0,1:2,1:0|1:201022773_G_GC:201022773:0,2,0,4
chr1	201022784	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=20,12;MFRL=264,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.622:6:0,0:1,0:0|1:201022773_G_GC:201022773:0,2,0,4
chr1	201031059	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,0,2
chr1	201031307	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=190,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr1	201043845	.	ACT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	201044748	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=141,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,1:2,6:1,4,2,5
chr1	201052199	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:9,0,2,0
chr1	201052310	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:5,3:5,3:0|1:201052310_A_T:201052310:6,6,3,3
chr1	201052312	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:0|1:201052310_A_T:201052310:6,6,3,3
chr1	201052474	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:3,3:7,2:2,10,1,4
chr1	201058692	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:0,9,0,4
chr1	201079235	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:7,3,6,0
chr1	201079458	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=196,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,6:3,3:1,3,0,9
chr1	201081283	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=12,29;MFRL=214,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,1:0,6:1,0,6,3
chr1	201113118	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,1:0,0,1,6
chr1	201115822	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:1,9:0,3:0,1,11,1
chr1	201116018	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=46.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,2,12
chr1	201169601	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=229,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,2:2,3:1,4,0,5
chr1	201170772	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	201170824	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,3,2
chr1	201171007	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	201173104	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr1	201174204	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:1,7:2,8:2,1,10,5
chr1	201182647	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=188,143;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=28.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.452:29:7,0:9,13:9,7,0,13
chr1	201185908	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr1	201187828	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=208,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	201193767	.	AGCTTCCCCTTCTCAACTTTTCCTTCCTCTCCTTTCTCAGGCCATGCCCATGCCTGAGGTGACCTGGCTGAAGGATG	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.123:43:4,0:13,5:21,15,1,6
chr1	201253119	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,229;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	201285909	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	201286614	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=191,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.662:16:1,4:4,7:4,1,9,2
chr1	201286628	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=290,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:1,8:6,9:6,1,14,3
chr1	201286678	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.333:40:12,7:15,6:16,11,8,5
chr1	201288007	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr1	201288898	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=66.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,14,4
chr1	201288955	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,4:9,5:12,5,5,4
chr1	201288982	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=165,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:5,2:11,4:9,8,4,2
chr1	201291066	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=225,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,3:3,7:3,2,7,3
chr1	201291283	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr1	201292110	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr1	201293970	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr1	201293985	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:5,1,3,0
chr1	201328272	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:3,1:5,1,3,0
chr1	201328824	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=147,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.214:29:12,1:11,4:10,13,3,3
chr1	201328913	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr1	201331249	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=221,79;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:1,7,0,2
chr1	201331554	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.622:24:4,7:4,8:5,4,9,6
chr1	201331664	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=214,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr1	201332422	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=146,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:11,11,1,1
chr1	201332470	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,0:11,4:6,13,0,4
chr1	201335899	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr1	201338553	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=180,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,4:1,0:0,1,0,4
chr1	201338586	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr1	201338896	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:6,4,3,1
chr1	201339043	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=205,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,6:6,5:1,7,2,9
chr1	201341175	.	CAGAAG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=223,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGAAG;STR;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,2:3,4:1,5,2,4
chr1	201341341	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	201358196	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr1	201368463	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.911:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr1	201383643	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr1	201438087	.	G	GGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	201465428	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.208:13:5,2:5,0:4,7,1,1
chr1	201617699	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,18;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201617699_T_G:201617699:0,0,1,0
chr1	201617702	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201617699_T_G:201617699:0,0,1,0
chr1	201617705	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201617699_T_G:201617699:0,0,1,0
chr1	201617711	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:201617699_T_G:201617699:0,0,1,0
chr1	201687451	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr1	201749520	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,5:5,8:8,1,10,3
chr1	201754606	.	G	GCTGCTTATTTATTAGACAAAATCA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=190,8457803;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.245:11:4,2:3,0:0|1:201754606_G_GCTGCTTATTTATTAGACAAAATCA:201754606:0,9,0,2
chr1	201754609	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=186,8457803;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:2,0:0|1:201754606_G_GCTGCTTATTTATTAGACAAAATCA:201754606:0,8,0,2
chr1	201755469	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=227,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:3,2:2,5:5,0,6,2
chr1	201763499	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=192,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	201772863	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,19;MFRL=136,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.821:7:0,1:0,2:0,1,0,6
chr1	201772903	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=231,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr1	201773566	.	CT	C,CTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31,35;MFRL=77,139,140;MMQ=60,60,60;MPOS=31,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=6.10,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.333,0.249:9:3,1,2:1,2,0:3,1,5,0
chr1	201816639	.	ATCTTTT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=139,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,2,3
chr1	201824390	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr1	201826340	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0,5,3,5
chr1	201827919	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,2:4,7:8,0,8,1
chr1	201837934	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27,27;MFRL=166,213,186;MMQ=60,60,60;MPOS=25,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=GT;STR;TLOD=4.79,22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,9:0.219,0.680:13:0,3,8:1,0,1:0,1,3,9
chr1	201840059	.	GTTATT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTATT;STR;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.821:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr1	201840464	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,11,9
chr1	201843997	.	AGAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAG;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr1	201844128	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,5,5
chr1	201861016	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:3,2:10,0:3,10,2,0
chr1	201869257	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,177;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:9,1,6,2
chr1	201952294	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=275,275;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:201952294_C_G:201952294:0,1,0,1
chr1	201952310	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=261,275;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:201952294_C_G:201952294:0,2,0,1
chr1	201952574	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,8:7,4:6,4,7,5
chr1	201952755	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=224,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,1,4
chr1	201970748	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:3,1,1,4
chr1	201970971	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,0:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970976	.	GA	TT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,31;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970979	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970983	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970985	.	A	ATG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201970986	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,34;MFRL=223,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1|0:201970971_T_G:201970971:0,2,1,1
chr1	201970988	.	C	CTTTATTTTTTAGAGCAG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,35;MFRL=226,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:201970971_T_G:201970971:1,2,0,1
chr1	201981354	.	TG	CC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,2:3,5:1,9,3,4
chr1	201984351	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,0:7,2:9,6,0,2
chr1	202092046	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr1	202096815	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,2:1,7:0,1,5,4
chr1	202107422	.	AACACAC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=225,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=AC;STR;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.566:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr1	202121643	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=217,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr1	202122783	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr1	202122840	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=180,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:14,2:4,2:13,6,3,1
chr1	202163621	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,4:5,1:10,2,3,2
chr1	202166497	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:7,1:11,7,2,0
chr1	202194441	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:9,0,2,0
chr1	202197161	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:2,7,2,2
chr1	202266547	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=214,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	202266607	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,4:3,0:6,3,3,1
chr1	202270434	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=0,218;MMQ=60,27;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,2:0,5,0,3
chr1	202274936	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,4:2,3:1,5,2,5
chr1	202287156	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:9,4,3,0
chr1	202288000	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,0:5,2:4,5,0,2
chr1	202302232	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,1:9,3:6,7,3,1
chr1	202318316	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,1,5
chr1	202386075	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,4,9
chr1	202400761	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=163,54;MMQ=60,55;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,2:10,0:5,10,0,2
chr1	202443000	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,244;MMQ=55,58;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:5,2:13,2:10,8,3,1
chr1	202536848	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=117,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:4,2,2,0
chr1	202568484	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,1:13,2:6,15,0,3
chr1	202710733	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,2:3,4:1,7,2,4
chr1	202711546	.	A	ATGTATGTATT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,0:7,2:0|1:202711546_A_ATGTATGTATT:202711546:7,6,1,1
chr1	202711547	.	C	CTTAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:7,2:0|1:202711546_A_ATGTATGTATT:202711546:7,6,1,1
chr1	202711778	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=108,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.447:27:8,9:6,2:7,8,9,3
chr1	202715139	.	TGAGACGTGTAGCTTTG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:4,6,1,1
chr1	202715499	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=255,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:202715499_C_T:202715499:0,2,0,1
chr1	202715517	.	A	ATATGCATGGGTCCTGTTTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=255,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:202715499_C_T:202715499:0,2,0,1
chr1	202718028	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=140,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:4,3:1,3:4,1,3,3
chr1	202718262	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.288:33:14,0:8,9:5,19,0,9
chr1	202731986	.	C	CCTCAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=249,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,1:1,3:0,2,1,4
chr1	202861566	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr1	202887295	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.844:17:1,7:1,8:1,1,6,9
chr1	202888971	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,23;MFRL=148,86;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:10,0:7,3:10,7,0,3
chr1	202910609	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,140;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:4,9:9,0:13,0,9,0
chr1	202914356	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	202931839	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,2:0,3:0,0,1,5
chr1	202931958	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=37,28;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,4:0,4:1,0,7,1
chr1	202931998	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,5,3
chr1	202933657	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:2,0,10,0
chr1	202936456	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	202990056	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=103,274;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,3:0.080:48:22,0:21,3:0|1:202990056_A_T:202990056:32,13,0,3
chr1	202990058	.	GGGAATGATATTTACTCTGGTAAGTGGGGACTCAGGATGTCATTCTCAGCT	G	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=103,274;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,3:0.069:56:23,0:22,3:0|1:202990056_A_T:202990056:32,21,0,3
chr1	202990110	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=20,26;MFRL=160,293;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,1:0,0:0,2,0,2
chr1	203012661	.	CGT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=47,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.328:9:4,0:2,3:3,3,0,3
chr1	203012705	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	203024710	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,1:17,1:17,14,0,2
chr1	203025428	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:4,3,2,1
chr1	203029017	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=196,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:1,3,3,4
chr1	203030071	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:6,0,5,2
chr1	203030685	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=208,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,2:7,2:8,2,3,1
chr1	203032922	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr1	203033146	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:4,2:3,0:1,6,0,3
chr1	203036757	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=232,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,4,1
chr1	203040740	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	203040922	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,3:1,6:0,5,6,4
chr1	203045369	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,546;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	203053741	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:8,1:16,3:15,9,3,1
chr1	203053768	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=118.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,11:0,23:0,0,17,17
chr1	203054523	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr1	203055101	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=182,273;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:2,2:8,6:6,4,3,5
chr1	203137784	.	A	ACT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=51.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr1	203148633	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,14:0,13:0,0,10,17
chr1	203153634	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,3:1,5:3,0,5,3
chr1	203154532	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,2:1,4:1,3,3,3
chr1	203155882	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,270;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr1	203188692	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=260,234;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	203192567	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,3:4,1:4,4,3,1
chr1	203192820	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=218,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,0:0,6,0,4
chr1	203192844	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=230,96;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.321:4:2,1:1,0:0|1:203192844_C_CAG:203192844:0,3,0,1
chr1	203192846	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=230,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:203192844_C_CAG:203192844:0,3,0,1
chr1	203194758	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=177,291;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:203194758_A_C:203194758:0,1,1,0
chr1	203194761	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,12;MFRL=176,291;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:203194758_A_C:203194758:2,1,1,0
chr1	203194764	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=177,291;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:203194758_A_C:203194758:3,1,1,0
chr1	203194768	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=177,291;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:3,1,1,0
chr1	203198842	.	T	TTTG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,1:4,1:0|1:203198842_T_TTTG:203198842:0,6,1,1
chr1	203198843	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.297:8:2,1:4,0:0|1:203198842_T_TTTG:203198842:0,6,1,1
chr1	203198845	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=196,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr1	203274936	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr1	203311644	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,4:10,1:9,13,2,3
chr1	203317162	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:1,10:3,9:3,1,13,8
chr1	203452929	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=147,291;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,1:6,3:10,4,3,1
chr1	203455902	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=209,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:15,2:12,4:13,14,1,5
chr1	203465362	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=115,64;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:9,1:1,1:4,6,0,2
chr1	203465396	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=114,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:2,6,1,2
chr1	203668627	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=127,146;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.284:26:10,0:9,7:12,7,0,7
chr1	203679934	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=201,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:5,3,3,1
chr1	203709034	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=193,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr1	203709068	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	203740458	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=136,299;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,1:7,1:0|1:203740458_C_A:203740458:9,2,2,0
chr1	203740462	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=113,299;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,1:11,1:0|1:203740458_C_A:203740458:10,5,2,0
chr1	203740615	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=125,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,1:7,1:3,11,0,3
chr1	203741368	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=285,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	203786224	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=163,72;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,2:6,0:9,6,2,0
chr1	203797335	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,37;MFRL=173,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:6,2:6,0:13,0,2,0
chr1	203797384	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:9,2:17,3:16,10,3,2
chr1	203800735	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:5,1,2,1
chr1	203803016	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr1	203807233	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr1	203807273	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=180,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	203821200	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr1	203831261	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:7,0:13,6:15,6,3,3
chr1	203832964	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=178,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr1	204082323	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,0,4
chr1	204085609	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:5,4:5,4,6,3
chr1	204094902	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,334;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	204095280	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:5,9:4,0:6,3,2,7
chr1	204101421	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=166,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:4,4,2,2
chr1	204103618	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=243,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,2,0
chr1	204115934	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=205,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:3,3,1,1
chr1	204120976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=122,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:3,2,0,5
chr1	204130376	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr1	204131060	.	TGA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:8,0,3,0
chr1	204131229	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:8,6:15,0:17,6,6,0
chr1	204159611	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr1	204159787	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:1,3,3,3
chr1	204167672	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=233,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr1	204170825	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=138,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:7,3:11,2:6,12,0,5
chr1	204210539	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=193,60;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:0|1:204210539_C_T:204210539:8,5,1,1
chr1	204210552	.	G	GTACAAATTATTTTCAACTGCTAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=199,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:204210539_C_T:204210539:7,7,1,1
chr1	204210997	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=68643952,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,1,4
chr1	204216410	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	204216468	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=193,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,3,2
chr1	204216601	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=104,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:2,4,1,4
chr1	204219559	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=203,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	204219821	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=183,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,3:0,1:0,3,1,3
chr1	204219850	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=189,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	204234196	.	GGT	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=135,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=GT;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.089:33:15,2:11,1:6,24,2,1
chr1	204234216	.	AGC	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=172,109;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,3:8,0:6,12,1,2
chr1	204234222	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.485:18:7,3:2,6:2,7,2,7
chr1	204234225	.	G	A,GCA	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,29,20;MFRL=172,178,109;MMQ=60,60,60;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.74,5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,3:0.329,0.194:17:5,1,3:3,5,0:1,7,3,6
chr1	204242731	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:6,1,4,2
chr1	204379758	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=176,208;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:6,0:14,8:8,12,0,8
chr1	204379804	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=156,283;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:6,0:14,6:9,11,0,6
chr1	204380404	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=140,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:14,3:16,1:8,22,2,2
chr1	204394731	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,15;MFRL=129,136;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:1,0:10,0:7,8,2,0
chr1	204394888	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=160,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:1,7,1,1
chr1	204402500	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:8,3:6,3:5,10,3,3
chr1	204402898	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:12,5:4,6:10,6,7,4
chr1	204408135	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,4:9,1:11,6,4,1
chr1	204409281	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,8,4
chr1	204409288	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=191,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.428:17:7,3:2,3:5,5,6,1
chr1	204410532	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=177,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,5:2,1:5,0,6,0
chr1	204410795	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:0,6,1,2
chr1	204413236	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=144,67;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,19:0.336:57:21,11:17,7:22,16,0,19
chr1	204413297	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:10,10:4,4:0|1:204413297_C_T:204413297:3,11,8,7
chr1	204413299	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=150,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,15:0.516:29:10,9:4,5:0|1:204413297_C_T:204413297:3,11,8,7
chr1	204415304	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,95;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:10,0:5,2:4,11,0,3
chr1	204416501	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:6,1,4,1
chr1	204416717	.	A	AACAACAGTTAAAGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=180,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:204416717_A_AACAACAGTTAAAGG:204416717:4,1,1,1
chr1	204416719	.	A	AGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=180,49;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:204416717_A_AACAACAGTTAAAGG:204416717:4,1,1,1
chr1	204418889	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr1	204418939	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=118,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.458:20:4,4:7,5:5,6,6,3
chr1	204426036	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.907:9:0,1:0,7:0,0,9,0
chr1	204426069	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:7,1,2,1
chr1	204426295	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0,11,1,1
chr1	204429838	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=208,234;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,1:3,4:1,4,0,5
chr1	204433093	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,3:5,4:7,1,4,3
chr1	204433511	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr1	204434277	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr1	204438869	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=197,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:14,2:7,0:9,12,0,2
chr1	204506507	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:6,2,2,0
chr1	204512100	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=167,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,0:5,2:0,10,0,2
chr1	204515863	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:8,2:2,3:8,3,3,2
chr1	204516025	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:3,5,1,4
chr1	204588004	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:9,10,2,0
chr1	204589854	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:13,0:4,4:8,9,0,4
chr1	204589866	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,7:3,1:3,6,5,3
chr1	204590688	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,7:2,2:2,3,4,5
chr1	204921258	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=177,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:4,4,0,3
chr1	204921312	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=234,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr1	204926980	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=221,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:0,7,0,3
chr1	204943285	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,14,3
chr1	204943991	.	CA	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.876:6:0,1:0,4:0,0,0,6
chr1	204954993	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr1	204955329	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=208,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr1	204978643	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:7,2,2,0
chr1	205027165	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:5,8,1,1
chr1	205027525	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,422;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	205027561	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=240,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr1	205028152	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,2:9,0:10,0,2,0
chr1	205028823	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,2:7,1:5,7,0,3
chr1	205033371	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,165;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,9:4,0:5,2,9,0
chr1	205033803	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=157,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr1	205038731	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr1	205039288	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,0:2,4:1,7,0,4
chr1	205041015	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=185,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr1	205052734	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,132;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.203:21:9,0:8,3:9,8,0,4
chr1	205063949	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,0:8,2:10,1,1,1
chr1	205064080	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=162,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,8:5,0:3,9,8,0
chr1	205083865	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,4,2
chr1	205084120	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:3,2:8,5:3,8,2,5
chr1	205085068	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:1,11,0,3
chr1	205090885	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=201,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr1	205091105	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,291;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr1	205119981	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,311;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr1	205129466	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.840:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	205138321	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=136,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,2,0
chr1	205272620	.	C	CAACTGGG	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=160,43;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,2:14,0:0|1:205272620_C_CAACTGGG:205272620:11,11,1,1
chr1	205272623	.	T	TACGCCACCC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:8,2:13,0:0|1:205272620_C_CAACTGGG:205272620:11,11,1,1
chr1	205273333	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=161,54;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:11,3:12,0:9,14,2,1
chr1	205277781	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.526:32:7,10:8,6:8,7,7,10
chr1	205277883	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=217,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:4,4:9,3:2,11,1,6
chr1	205290633	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.194:39:17,0:15,7:12,20,0,7
chr1	205290794	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=258,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr1	205306590	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=190,194;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,2:6,4:4,5,4,2
chr1	205307742	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=259,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.666:19:2,6:4,7:2,4,1,12
chr1	205308591	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=251,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:2,1,0,7
chr1	205417586	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=319,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:0,5:2,4:0,2,1,8
chr1	205493545	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=254,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	205495392	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=198,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:0,1,4,3
chr1	205495976	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,4,10
chr1	205499355	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=215,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr1	205499577	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=202,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.595:13:0,5:5,2:1,4,5,3
chr1	205499701	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,4:5,3:6,3,5,2
chr1	205499921	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr1	205500543	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,4:4,5:7,6,6,3
chr1	205549122	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,1:0,1:1,4,0,2
chr1	205549751	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=226,325;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:205549751_A_C:205549751:0,1,1,0
chr1	205549757	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=116,325;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.344:4:0,0:1,1:0|1:205549751_A_C:205549751:1,2,1,0
chr1	205549763	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=134,325;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:1,0:2,1:0|1:205549751_A_C:205549751:1,3,1,0
chr1	205555145	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:4,5:7,3:8,3,5,3
chr1	205561493	.	GCT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,337;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.877:5:0,3:0,1:0|1:205561493_GCT_G:205561493:0,0,0,5
chr1	205561511	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,209;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0|1:205561493_GCT_G:205561493:0,0,0,5
chr1	205568213	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,284;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,1:6,2:11,0,3,0
chr1	205568442	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr1	205588009	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr1	205687348	.	CTTTTTTCTTT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=163,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTTTCTTT;STR;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:2,5:1,0:8,1,5,0
chr1	205687365	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:2,1:9,0,3,1
chr1	205689807	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr1	205739396	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=224,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr1	205740824	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:5,0:0|1:205740824_G_A:205740824:2,7,0,2
chr1	205740829	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:0|1:205740824_G_A:205740824:2,6,0,2
chr1	205744138	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.436:16:4,2:5,4:0,9,2,5
chr1	205764433	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=263,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,2:4,5:7,3,7,0
chr1	205764640	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=172,267;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:2,5:5,5:3,4,2,8
chr1	205766159	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,6:3,5:1,7,2,9
chr1	205768875	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,1:7,1:10,6,2,0
chr1	205814671	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.621:14:2,0:3,8:1,4,0,9
chr1	205816923	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=209,226;MMQ=40,34;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr1	205883972	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,114;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,5:10,0:15,1,5,0
chr1	205884646	.	CTGTGTGTG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=246,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=TG;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.406:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr1	205886381	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=227,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:6,2,5,2
chr1	205888143	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=127,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr1	205892411	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:3,1:8,1:0|1:205892411_T_C:205892411:8,3,1,1
chr1	205892415	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=131,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,1:7,1:0|1:205892411_T_C:205892411:8,3,1,1
chr1	205896293	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:5,1,4,2
chr1	205896475	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr1	205896948	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=226,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,1:4,1:6,1,0,2
chr1	205901788	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=211,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:8,1,3,0
chr1	205902242	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:5,0:8,4:5,8,2,2
chr1	206224997	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=168,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,1:3,1:6,4,1,1
chr1	206516159	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=263,304;MMQ=34,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr1	206566000	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=123,261;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,1:0,1:5,0,2,0
chr1	206566195	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=145,93;MMQ=27,27;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,15:0.237:65:21,7:28,8:25,25,6,9
chr1	206566860	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=193,170;MMQ=60,21;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.370:17:2,2:8,4:6,5,6,0
chr1	206566904	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=121,152;MMQ=60,27;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,19:0.434:44:15,11:10,8:12,13,12,7
chr1	206567100	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=183,198;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,1:8,2:0,13,0,3
chr1	206579936	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=160,156;MMQ=27,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,7:2,0:4,0,7,0
chr1	206592731	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:13,0:7,13,0,2
chr1	206623685	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=120,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:7,2,7,3
chr1	206623866	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.501:20:6,3:4,7:1,9,0,10
chr1	206626779	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=243,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr1	206648378	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=230,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,4:1,7:2,4,1,10
chr1	206649952	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,263;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,2:8,4:6,4,6,0
chr1	206651467	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:6,3:6,3,4,0
chr1	206653520	.	G	GTGTACCGGTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=253,320;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0|1:206653520_G_GTGTACCGGTT:206653520:1,0,0,1
chr1	206653523	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=253,320;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:206653520_G_GTGTACCGGTT:206653520:1,0,0,1
chr1	206670827	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=217,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr1	206758077	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=220,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,4:1,2:0,2,0,7
chr1	206760474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=235,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	206769047	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,4:8,2:9,5,5,1
chr1	206776203	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	206776612	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:5,0:4,7:0,10,7,0
chr1	206810946	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	206858615	.	TCCCC	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=270,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:206858615_TCCCC_T:206858615:1,1,1,0
chr1	206858624	.	CGG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=292,221;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:206858615_TCCCC_T:206858615:1,0,1,0
chr1	206858630	.	CGCCGCCGCAG	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=292,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:206858615_TCCCC_T:206858615:1,0,1,0
chr1	206858647	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=22,35;MFRL=191,221;MMQ=60,60;MPOS=-12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:1,1:1,0:0|1:206858615_TCCCC_T:206858615:2,0,1,0
chr1	206904464	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,3:6,3:7,5,4,2
chr1	206905299	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=205,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.155:27:8,0:12,1:16,7,0,4
chr1	206943351	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	206944233	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.863:27:2,17:1,7:2,1,14,10
chr1	206944645	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,4:1,7:1,0,8,3
chr1	206944861	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,1:0,2:0,1,1,3
chr1	207009910	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	207014472	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,271;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:1,0:9,5:3,7,1,4
chr1	207016036	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:0,8,0,4
chr1	207040659	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,13808516;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:7,1,2,0
chr1	207083509	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.222:43:18,8:16,0:27,7,9,0
chr1	207087053	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr1	207109167	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=138,276;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:9,1:18,2:14,13,0,3
chr1	207110363	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=178,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr1	207139046	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,268;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,1:5,1:9,7,2,0
chr1	207143550	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=116,226;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:1,7,0,3
chr1	207235954	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:10,8,1,1
chr1	207237199	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:2,7,1,1
chr1	207237281	.	C	CAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr1	207241440	.	A	AGTGTGTGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,15;RU=GT;STR;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.504:12:2,4:4,0:4,2,6,0
chr1	207243846	.	T	TCCGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,29;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:207243846_T_TCCGGG:207243846:0,4,0,1
chr1	207243849	.	C	CCTGCCT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:207243846_T_TCCGGG:207243846:0,4,0,1
chr1	207243851	.	A	G,AC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,35,23;MFRL=165,225,143;MMQ=60,60,60;MPOS=16,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.37,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.500,0.250:5:0,1,1:1,2,0:0,1,0,4
chr1	207243853	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=202,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:207243846_T_TCCGGG:207243846:0,4,0,1
chr1	207262914	.	G	GTGTGTGT	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=130,76;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.090:31:8,2:20,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:10,19,0,2
chr1	207262916	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=132,76;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:8,2:21,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:11,19,0,2
chr1	207262918	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=6;MBQ=28,29;MFRL=134,76;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,2:21,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:12,19,0,2
chr1	207262921	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=26,30;MFRL=141,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:10,2:22,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:13,20,0,2
chr1	207262923	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=141,76;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:11,2:21,0:0|1:207262914_G_GTGTGTGT:207262914:13,20,0,2
chr1	207262980	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,3:7,4:2,8,2,5
chr1	207263829	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=176,72;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,1:5,4:3,10,2,3
chr1	207265189	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=123,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:2,6,0,2
chr1	207288897	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:1,2,1,3
chr1	207300259	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,6:3,4:1,3,2,8
chr1	207500072	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=128,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:11,0:16,3:20,8,1,2
chr1	207500131	.	C	CA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.074:38:18,0:18,2:21,15,0,2
chr1	207504669	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr1	207510126	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,11:0.272:42:12,0:18,10:13,18,0,11
chr1	207510596	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,8:0,7:0,0,16,0
chr1	207532861	.	C	CTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,22;RU=T;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.769:6:1,3:0,1:1,0,5,0
chr1	207640209	.	C	CTGTAAACATGTTTTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,2:6,0:5,11,1,1
chr1	207640345	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr1	207680119	.	TCCAGTTCGGATC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=172,111;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:5,0:8,11,1,1
chr1	207726023	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=178,47;MMQ=25,55;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:7,2:1,0:0|1:207726023_G_GC:207726023:4,4,1,1
chr1	207726025	.	A	ATTCACT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=178,47;MMQ=25,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:7,2:1,0:0|1:207726023_G_GC:207726023:4,4,1,1
chr1	207737670	.	GAC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=208,63;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,1:2,1:1,3,1,1
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chr1	207787912	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0,12,0,2
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chr1	207870936	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,94;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:5,6:10,7:9,6,13,0
chr1	207881485	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=146,163;MMQ=56,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,4:7,1:0|1:207881485_TA_T:207881485:8,3,3,2
chr1	207881489	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=146,163;MMQ=56,52;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:4,4:7,1:0|1:207881485_TA_T:207881485:9,4,3,2
chr1	207881491	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=146,163;MMQ=56,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,3:8,1:0|1:207881485_TA_T:207881485:9,4,3,2
chr1	207956559	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,3:0,5:2,1,7,1
chr1	207959070	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=162,214;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:1,5,0,3
chr1	207959122	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=T;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,0,4
chr1	207959136	.	T	TAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=A;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	207975949	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=163,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:2,0:4,2:0,7,0,2
chr1	207992546	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=238,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:3,3:0,4:0,3,0,8
chr1	208062260	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=248,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,0:0,5:1,2,0,5
chr1	208062471	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=116,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,11:4,2:4,3,8,5
chr1	208062973	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=239,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:2,9:6,5:4,4,3,12
chr1	208063067	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=140,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,24:0.756:31:4,12:3,10:3,4,14,10
chr1	208200737	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=141,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr1	208206946	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=193,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:0,6,0,3
chr1	208208034	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=248,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr1	208211887	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr1	208212397	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=243,170;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	208213125	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr1	208213518	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=204,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,1,3
chr1	208219164	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr1	208225674	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=200,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:6,2,1,1
chr1	208252681	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=163,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,2:9,0:8,12,2,0
chr1	208255877	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,6:3,3:0,3,1,8
chr1	208257629	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=229,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr1	208272239	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:10,2:10,0:11,9,2,0
chr1	208276399	.	C	CCTCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=CT;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr1	208315692	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:3,3:7,0:8,2,3,0
chr1	209605636	.	TAGCAGCAGCAGC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=211,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=AGC;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.301:15:3,2:3,2:0,11,0,4
chr1	209779805	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,2:3,3:2,9,0,5
chr1	209784856	.	AGCCTCCAG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,19;MFRL=150,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:4,0:2,6,1,1
chr1	209784927	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr1	209786078	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	209788514	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=235,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr1	209792015	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr1	209804095	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:1,4:2,10:1,2,1,13
chr1	209805895	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=141,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:4,6:9,6:6,7,5,7
chr1	209811829	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=226,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:5,2,4,0
chr1	209812063	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=86,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr1	209849002	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.392:21:7,2:6,6:7,6,5,3
chr1	209849399	.	AG	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=121,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,10:0.367:28:7,5:11,5:0|1:209849399_AG_A:209849399:12,6,3,7
chr1	209849406	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,31:0.970:31:0,14:0,16:0|1:209849399_AG_A:209849399:0,0,14,17
chr1	209849714	.	TA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=78.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,30:0.970:30:0,17:0,12:0,0,13,17
chr1	209880259	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=205,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,3:5,4:4,7,5,2
chr1	209880508	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=260,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.628:14:1,4:2,2:1,4,3,6
chr1	209905734	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.394:6:2,0:2,2:0|1:209905734_G_C:209905734:4,0,2,0
chr1	209905743	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.297:5:2,0:2,0:0|1:209905734_G_C:209905734:4,0,1,0
chr1	209933331	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=184,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:3,2:5,2:7,2,2,2
chr1	209933757	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:3,5,0,3
chr1	209935778	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=196,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	209936060	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,1:9,2:0|1:209936060_A_G:209936060:10,9,0,3
chr1	209936064	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=209,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,1:9,2:0|1:209936060_A_G:209936060:10,9,0,3
chr1	209936074	.	C	CTTAGTAACTAGCTG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=209,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:0|1:209936060_A_G:209936060:10,9,0,2
chr1	209936571	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=200,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,4:9,4:8,6,3,5
chr1	209936631	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,3:6,0:8,6,0,3
chr1	209936964	.	T	TCA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:13,3:8,2:8,13,1,4
chr1	209948711	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,0:11,6:11,7,4,2
chr1	209949055	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:3,7,1,3
chr1	209950681	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,4:8,5:7,5,4,5
chr1	209950848	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=115,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.143:33:11,0:18,4:10,19,0,4
chr1	209951422	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:8,7:14,0:16,6,7,0
chr1	209951583	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=163,55;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,3:5,0:2,11,0,3
chr1	209952865	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:2,5,2,5
chr1	209956542	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:14,4:12,4:13,13,4,4
chr1	209963803	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,1,1
chr1	209965587	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=138,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:5,2,2,2
chr1	209969902	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=127,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:8,4,2,6
chr1	209974528	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=160,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.574:7:0,3:2,0:2,1,3,1
chr1	209974723	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=185,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,3:3,0:5,4,0,3
chr1	210001586	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr1	210003388	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,3,2
chr1	210003402	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:4,0,5,2
chr1	210003445	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:9,7,1,1
chr1	210004332	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:11,1:16,2:11,16,2,1
chr1	210006437	.	GC	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	210006603	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,18:0.576:31:10,11:3,7:0|1:210006603_C_T:210006603:8,5,8,10
chr1	210006604	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,5:0.176:32:17,4:10,1:1|0:210006603_C_T:210006603:11,16,5,0
chr1	210008367	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:2,10:1,5:3,0,12,3
chr1	210012102	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr1	210015568	.	GCT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	210111733	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=332,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr1	210194460	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=121,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.299:24:6,6:11,0:8,9,7,0
chr1	210267893	.	TGAA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=112,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAA;STR;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,5:4,2:4,7,4,3
chr1	210273696	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,3:11,1:10,8,1,3
chr1	210273886	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	210406940	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=237,243;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr1	210407031	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,200;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,3:4,5:2,3,7,1
chr1	210407329	.	GTT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=191,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr1	210411266	.	GT	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=215,111;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.376:11:3,2:2,2:0|1:210411266_GT_G:210411266:6,1,4,0
chr1	210411281	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=31,11;MFRL=170,111;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.223:19:4,0:7,0:0|1:210411266_GT_G:210411266:8,7,4,0
chr1	210411286	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=170,92;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.219:17:3,0:6,0:0|1:210411266_GT_G:210411266:7,7,3,0
chr1	210414871	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=36,36;MFRL=181,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.395:13:5,2:1,1:8,0,5,0
chr1	210414879	.	CTT	C,TCT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,32,26;MFRL=118,184,145;MMQ=60,60,60;MPOS=14,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.41,5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,4:0.139,0.208:18:5,1,3:3,1,1:7,5,6,0
chr1	210536078	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,33;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:210536078_C_G:210536078:1,0,1,0
chr1	210536088	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=207,183;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:210536078_C_G:210536078:1,0,1,0
chr1	210591742	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.730:5:1,2:0,1:0,1,0,4
chr1	210686570	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr1	210761344	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=182,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:9,5:7,2:9,8,2,5
chr1	210761462	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr1	210856585	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=122,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr1	210856604	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=125,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	210857457	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr1	210857483	.	GGA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=209,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GA;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr1	210970823	.	T	TG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=192,166;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:7,0:8,3,2,2
chr1	211276828	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:6,1,4,2
chr1	211280724	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.574:5:1,0:0,3:0|1:211280724_TAA_T:211280724:0,2,0,3
chr1	211280737	.	A	AC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,2:0.366:6:1,1:3,0:1|0:211280724_TAA_T:211280724:0,4,0,2
chr1	211447435	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr1	211451393	.	TATC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	211452529	.	TAA	T,TA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28,27;MFRL=202,122,167;MMQ=60,60,60;MPOS=19,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.28,7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.353,0.466:8:0,3,2:1,0,2:1,0,4,3
chr1	211452678	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=123,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,0:13,3:8,11,1,2
chr1	211545442	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.603:8:1,1:0,4:0|1:211545442_CT_C:211545442:3,0,5,0
chr1	211545459	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=18,10;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.670:7:0,0:0,0:0|1:211545442_CT_C:211545442:2,0,5,0
chr1	211652755	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=222,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,1:0,2:0,2,0,3
chr1	211749427	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,5:5,0:10,6,5,0
chr1	212142054	.	GAA	GA,G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,22,32;MFRL=156,161,166;MMQ=60,60,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,12;RU=A;STR;TLOD=6.87,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,3:0.383,0.266:11:1,1,2:2,1,1:2,2,1,6
chr1	212151860	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,0:7,2:2,8,0,2
chr1	212209367	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr1	212217944	.	GAA	G,GA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,35,35;MFRL=139,233,194;MMQ=42,60,60;MPOS=16,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.40,5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.325,0.349:9:2,2,2:1,1,1:3,0,6,0
chr1	212217971	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=150,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=51.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,3:0,6:1,1,12,3
chr1	212236157	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	212240063	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=182,245;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr1	212240141	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,57;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:9,9,2,1
chr1	212241714	.	TAAA	T,TA,TAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29,31,29;MFRL=133,134,293,224;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,28,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.89,3.21,6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,2,4:0.215,0.215,0.355:10:2,1,0,2:0,1,2,2:0,2,0,8
chr1	212274082	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=153,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:9,10,0,2
chr1	212274503	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=174,271;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.632:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	212520750	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:15,3:9,0:15,9,3,0
chr1	212521639	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=155,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr1	212521770	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=155,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:0|1:212521770_T_C:212521770:13,8,1,1
chr1	212521777	.	T	TTCTGAGCATACCACTACA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=147,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:0|1:212521770_T_C:212521770:12,7,1,1
chr1	212530192	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr1	212530659	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.435:8:2,1:2,1:1,4,0,3
chr1	212583736	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,66;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,3:13,0:17,12,3,0
chr1	212588206	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=192,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr1	212615875	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=64,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr1	212617692	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=137,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:0|1:212617692_C_T:212617692:6,5,2,0
chr1	212617717	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=141,83;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:0|1:212617692_C_T:212617692:7,6,2,0
chr1	212900434	.	C	CG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=177,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,4:4,3:6,0,6,1
chr1	212911739	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=173,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:6,3:5,7,3,1
chr1	212960866	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=150,117;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,5:6,0:7,3,3,2
chr1	212969842	.	CT	C,CTT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,32,32;MFRL=163,137,129;MMQ=60,60,60;MPOS=22,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.99,15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,11:0.195,0.498:21:1,1,0:4,3,8:3,3,10,5
chr1	212969856	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,12;MFRL=140,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.205:28:5,0:12,3:9,12,7,0
chr1	212970375	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr1	212977690	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=125,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=42.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.516:31:8,16:7,0:9,6,16,0
chr1	212977908	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:10,4,2,1
chr1	213032568	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=101,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:0,4,1,6
chr1	213036987	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,2:1,1:6,1,3,0
chr1	213037310	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=195,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	213056819	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr1	213056892	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	213061362	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:2,7,0,4
chr1	213062017	.	T	TTTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TTG;STR;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,3:0,5:0,1,1,7
chr1	213068233	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=149,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,6:0,2:1,0,8,0
chr1	213068404	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=159,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:9,1:2,5:4,7,1,5
chr1	213068436	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:3,1,3,2
chr1	213068542	.	C	CTGAT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:0,6:6,5:4,2,6,5
chr1	213068595	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.604:16:3,5:3,3:2,4,3,7
chr1	213139748	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=229,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:0,7,0,4
chr1	213140362	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=193,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,4,1
chr1	213140398	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,0,3
chr1	213161825	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=191,191;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.227:37:12,5:16,0:21,7,9,0
chr1	213173696	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=148,247;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,3:15,0:7,16,1,2
chr1	213178340	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	213180441	.	GAA	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=117,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,2:1,1:2,1,2,2
chr1	213180467	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=127,187;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:8,0:7,9,2,0
chr1	213188855	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,12;MFRL=177,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.668:7:0,0:1,0:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,5,0
chr1	213188857	.	G	GGCC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,19;MFRL=177,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,0:2,0:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,5,0
chr1	213188861	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=35,13;MFRL=177,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:2,1:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,5,0
chr1	213188866	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=177,293;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,2,0
chr1	213188871	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=177,293;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:0,1:2,0:0|1:213188855_T_C:213188855:0,2,2,0
chr1	213224719	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.656:15:2,4:2,5:5,0,9,1
chr1	213341188	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=178,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:4,1:6,1,2,0
chr1	213349849	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:12,0:6,3:8,10,0,3
chr1	213405414	.	GGCAACTGAGGAT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCAACTGAGGAT;STR;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.413:15:2,2:4,4:6,3,3,3
chr1	213416013	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:12,0:6,13:5,13,1,12
chr1	214170167	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:11,5:12,0:15,8,5,0
chr1	214478459	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr1	214491536	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,9:1,3:2,2,4,8
chr1	214500907	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=312,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr1	214503489	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=142,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:12,2:6,5:11,7,4,3
chr1	214505282	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,276;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr1	214549501	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=70,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr1	214551276	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=152,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,4:7,1:5,5,3,2
chr1	214558228	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=102,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr1	214558230	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,19;MFRL=242,102;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0,3,0,1
chr1	214564442	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,1:10,1:0,18,0,2
chr1	214566952	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr1	214567013	.	CG	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.530:24:5,9:5,4:6,5,6,7
chr1	214637882	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,1:1,4:6,0,5,0
chr1	214638172	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=232,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr1	214791895	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,5:7,5:7,7,6,4
chr1	214804041	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,249;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:3,2:5,1:2,7,0,3
chr1	214816162	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=192,218;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:14,0:11,4:11,14,0,4
chr1	214817856	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,283;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr1	214818633	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=203,143;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.183:26:10,0:9,4:0|1:214818633_T_C:214818633:14,8,0,4
chr1	214818636	.	G	GATACTCTACTAACTTTGCACTTCTTATTTTTTTT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=203,143;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.183:26:11,0:10,4:0|1:214818633_T_C:214818633:14,8,0,4
chr1	214826364	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=166,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,0:4,4:1,7,2,2
chr1	214828812	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr1	214830617	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,112;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:3,3:7,5:6,5,4,4
chr1	215256781	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=322,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:215256781_C_T:215256781:0,1,0,1
chr1	215256790	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=358,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:215256781_C_T:215256781:0,1,0,1
chr1	215256888	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=313,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	215259613	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr1	215345263	.	GTCTCTC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=128,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=TC;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.616:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr1	215368514	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	215749406	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:2,2:6,3:2,7,0,5
chr1	215753355	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=115,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:8,2:1,1:0,9,0,3
chr1	215781574	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,4:0,7:0,2,2,9
chr1	215785187	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,26:0.441:59:17,25:15,0:17,16,26,0
chr1	215791420	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:10,6,3,0
chr1	215824195	.	GAAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=18,17;MFRL=200,0;MMQ=60,58;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.489:6:0,1:0,0:0,3,0,3
chr1	215849044	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=249,130;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr1	215853748	.	GTT	G,GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,62,150;MMQ=60,60,60;MPOS=20,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.76,9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.334,0.571:6:0,1,3:0,1,1:0,0,1,5
chr1	215914646	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:10,0,3,0
chr1	215916728	.	ATG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	215916732	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr1	215931922	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,35,32;MFRL=131,147,155;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.43,4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.247:9:3,2,0:2,0,2:5,0,4,0
chr1	215931928	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=149,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:10,0,3,1
chr1	215932957	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:9,3,1,1
chr1	215956304	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:1,4:3,6:1,3,2,8
chr1	216019426	.	GAA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=A;STR;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr1	216062079	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:6,7:8,0:11,4,7,0
chr1	216062110	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=122,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.268:28:9,7:10,0:14,7,7,0
chr1	216246675	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr1	216348764	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr1	216348916	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=233,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr1	216370130	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr1	216373476	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,10;MFRL=169,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.486:8:1,0:0,0:1,3,0,4
chr1	216390694	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr1	216424241	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=193,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:5,5,2,1
chr1	216465765	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=219,132;MMQ=60,43;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:4,0:1,3:1,4,0,4
chr1	216495416	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,16:0.496:32:10,0:6,14:0|1:216495416_G_T:216495416:0,16,0,16
chr1	216495421	.	T	TTTTTATAAACA	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=41.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,16:0.511:31:10,0:3,16:0|1:216495416_G_T:216495416:0,15,0,16
chr1	216692477	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:7,3,2,0
chr1	216741314	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:9,2:6,4:9,6,4,2
chr1	216896541	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=194,257;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:216896541_G_C:216896541:2,1,1,0
chr1	216896543	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,14;MFRL=194,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:216896541_G_C:216896541:2,1,1,0
chr1	217604777	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=180,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.181:15:5,1:8,1:1,12,0,2
chr1	217671771	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,0,5
chr1	217784372	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:13,0:7,4:9,11,0,4
chr1	217793938	.	T	TTAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAA;STR;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,3:0,3:0,3,0,6
chr1	217822135	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,1,1
chr1	217856787	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr1	217856803	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=204,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr1	218458557	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=233,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:1,3:2,0,5,0
chr1	218610662	.	CTT	C,CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29,33;MFRL=144,154,193;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=4.08,7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,4:0.220,0.308:14:2,2,2:3,0,1:4,3,6,1
chr1	218683530	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,3:15,0:11,17,0,3
chr1	219366400	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.890:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr1	219383848	.	A	ACTTTTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,5:0,8:0,0,13,2
chr1	219383867	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=69.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.910:20:0,10:1,9:0,1,13,6
chr1	219384959	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr1	220142070	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=234,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	220145371	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,4:2,5:5,1,5,4
chr1	220145584	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=210,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr1	220153332	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=208,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:2,0:0,1:2,0,0,1
chr1	220154659	.	TAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.815:7:1,6:0,0:1,0,6,0
chr1	220156090	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=193,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:5,9:4,6:6,3,11,4
chr1	220157527	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,0:5,5:5,9,0,5
chr1	220160433	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr1	220162195	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr1	220178717	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	220191932	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=11,27;MFRL=208,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:1,1:0,5,0,2
chr1	220192495	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr1	220197545	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr1	220207017	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=177,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.866:13:1,9:0,2:1,0,5,7
chr1	220208154	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=303,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr1	220231180	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.799:18:3,9:0,6:2,1,9,6
chr1	220269426	.	CT	C,CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35,33;MFRL=148,212,183;MMQ=60,60,60;MPOS=15,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=4.03,3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:2,2,1:0,0,1:2,0,4,0
chr1	220280539	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr1	220299989	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr1	220307743	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:7,5,2,0
chr1	220331298	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=184,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr1	220771832	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=218,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr1	220789236	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr1	220789362	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr1	220791604	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=181,163;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,5:7,0:0|1:220791604_A_T:220791604:8,4,5,0
chr1	220791610	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=172,163;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:6,3:7,0:0|1:220791604_A_T:220791604:9,4,5,0
chr1	220808921	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=228,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr1	220824115	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=198,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr1	220825523	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,3:0,12:0,0,2,13
chr1	220825543	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=147,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr1	220957215	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:10,4:18,0:22,6,4,0
chr1	220978645	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.601:23:4,8:5,6:3,6,4,10
chr1	220982320	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=194,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:0,4:4,4:0,4,0,8
chr1	221055463	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,2:3,7:5,1,7,2
chr1	222697088	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:2,11,1,1
chr1	222700416	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=132,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,5:6,3:3,7,1,7
chr1	222705270	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:9,2,2,0
chr1	222721333	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=189,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,0:9,2:0|1:222721333_G_T:222721333:11,7,1,1
chr1	222721339	.	C	CAGCTGTGT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=193,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:222721333_G_T:222721333:13,6,1,1
chr1	222736498	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=140,310;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:8,4:1,1:3,6,4,1
chr1	222737568	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	222751034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=143,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,1,4
chr1	222791646	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr1	222802006	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,12,7
chr1	222802606	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,131;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.197:47:20,8:18,0:25,13,9,0
chr1	222802848	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=155,100;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:6,0:17,3:15,8,0,3
chr1	222802866	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,100;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,0:13,3:14,5,0,3
chr1	222805698	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chr1	222805725	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=125,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:1,6,0,2
chr1	222823529	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=226,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr1	222823743	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=200,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.714:21:4,10:2,5:2,4,6,9
chr1	222825717	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=62.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.777:25:3,8:2,11:1,4,4,16
chr1	222825761	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr1	222826481	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:1,7:4,12:1,4,10,9
chr1	222832010	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.238:22:7,2:10,2:15,2,3,2
chr1	222833538	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:6,6:10,2:8,8,3,5
chr1	222867687	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=227,165;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr1	222892400	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=147,102;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:5,0:0|1:222892400_T_C:222892400:3,9,0,2
chr1	222892413	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=165,102;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:0|1:222892400_T_C:222892400:2,12,0,2
chr1	222904869	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.241:15:3,1:8,2:4,8,0,3
chr1	222920135	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,143;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:3,0:7,11:0,10,0,11
chr1	222923001	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr1	223152868	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	223156382	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=79.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,8,17
chr1	223156406	.	CTTT	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=169,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=T;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:8,1:10,1:5,17,1,1
chr1	223168205	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.127:26:11,1:10,2:19,4,3,0
chr1	223179250	.	AT	CC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:0|1:223179250_AT_CC:223179250:1,8,1,1
chr1	223179253	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=160,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:5,1:0|1:223179250_AT_CC:223179250:1,8,1,1
chr1	223397037	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=172,340;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr1	223532570	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,1:1,2:1,5,0,3
chr1	223568522	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:4,2:9,0:8,6,1,1
chr1	223712863	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=186,102;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,1:2,2:1,4,1,2
chr1	223712870	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=109,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr1	223712903	.	G	GGCTGA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:223712903_G_GGCTGA:223712903:0,0,0,1
chr1	223712913	.	GCA	CTC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,36;MFRL=257,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,1:0|1:223712903_G_GGCTGA:223712903:0,2,0,1
chr1	223715248	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.335:22:7,4:8,3:5,10,2,5
chr1	223716349	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr1	223717379	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr1	223718518	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr1	223718567	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=168,115;MMQ=60,54;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,0:7,6,3,0
chr1	223722646	.	T	TA,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,25,28;MFRL=120,209,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=A;STR;TLOD=16.37,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,8,3:0.542,0.235:14:1,2,2:2,6,1:3,0,9,2
chr1	223722780	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=162,222;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr1	223814671	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:1,0,7,2
chr1	223816322	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,8:0,5:0,1,12,1
chr1	223816347	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=187,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,8:0,5:0,1,11,2
chr1	223816577	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	223853440	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr1	223900408	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,14:0,4:0,0,8,10
chr1	223900612	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.438:23:7,5:6,5:2,11,2,8
chr1	223938565	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=197,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:1,16:0,12:1,0,13,15
chr1	223959994	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:1,0:2,2:0,4,0,2
chr1	223984092	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.195:18:8,2:7,1:7,8,2,1
chr1	223984306	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=239,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:1,1:4,1:0,6,0,2
chr1	223990623	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:5,2:3,1:0,8,1,2
chr1	224301749	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr1	224302154	.	T	TGAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=64.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,1,14
chr1	224318151	.	T	TTTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTG;STR;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr1	224321984	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	224341053	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:224341053_A_C:224341053:0,4,0,1
chr1	224341055	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=227,157;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:224341053_A_C:224341053:0,4,0,1
chr1	224345012	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr1	224380234	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=217,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr1	224418834	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=264,138,265;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.19,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,2:0.248,0.388:5:1,1,1:1,0,1:2,0,3,0
chr1	224444628	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr1	224444901	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr1	224492381	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr1	224505570	.	T	TAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=53.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr1	224505719	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr1	224514275	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	224517907	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,6:0,0,2,13
chr1	224544529	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr1	224599311	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:224599311_G_A:224599311:1,2,0,1
chr1	224599313	.	GTAATAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=170,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=TAA;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:224599311_G_A:224599311:1,2,0,1
chr1	224868596	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr1	224872443	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=157,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,3:7,3:7,5,4,2
chr1	224872473	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,95;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:9,6:6,3:5,10,4,5
chr1	225142710	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=143,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:8,4:15,2:9,15,2,4
chr1	225142722	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=145,143;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.151:31:13,0:14,4:13,14,0,4
chr1	225230608	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,11,8
chr1	225230895	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	225231636	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.364:17:4,0:7,6:3,8,1,5
chr1	225237850	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr1	225267274	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=234,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:2,1:0,5,1,1
chr1	225341515	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,154;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,3:14,0:7,18,3,0
chr1	225346975	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=163,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr1	225380414	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,98;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:4,0:7,3,3,0
chr1	225380561	.	CAAAG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAG;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:3,0:5,4,1,1
chr1	225439988	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=196,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:5,3,6,1
chr1	225445589	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=194,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.409:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr1	225445652	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,1:4,3:10,2,4,0
chr1	225460626	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=254,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr1	225460884	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=31,27;MFRL=175,127;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:225460884_C_T:225460884:0,3,0,1
chr1	225460886	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,24;MFRL=175,127;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:225460884_C_T:225460884:0,3,0,1
chr1	225460897	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=175,127;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,1,0,1
chr1	225460899	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=33,30;MFRL=238,127;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,2,0,1
chr1	225460901	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=301,127;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,3,0,1
chr1	225460903	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=23,31;MFRL=301,127;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,3,0,1
chr1	225460905	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=30,29;MFRL=301,127;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,3,0,1
chr1	225460909	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=9;MBQ=35,28;MFRL=301,127;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,3,0,1
chr1	225460912	.	A	ATTGCT	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=27,23;MFRL=333,127;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:225460897_G_T:225460897:0,2,0,1
chr1	225477869	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr1	225521044	.	T	TATTGTTATAATAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=210,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:5,0:1,2:4,2,1,1
chr1	225521077	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=230,52;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,3:4,0:4,3,1,2
chr1	225562385	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,13,9
chr1	225576058	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr1	225577648	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr1	225586752	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr1	225600351	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,6:9,3:4,12,3,6
chr1	225603029	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=195,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:9,7:5,9:10,4,6,10
chr1	225603103	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr1	225605661	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,159;MMQ=60,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,5:10,0:15,4,5,0
chr1	225605840	.	A	AG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=187,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,0:8,7:7,9,0,7
chr1	225611845	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,4:1,5:0,1,0,9
chr1	225685621	.	TAAG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr1	225686222	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,0:4,5:0,12,0,5
chr1	225688923	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=195,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=G;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:3,0:0|1:225688923_T_TGG:225688923:0,7,0,2
chr1	225688926	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=195,262;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,0:0|1:225688923_T_TGG:225688923:0,7,0,2
chr1	225707271	.	GAAA	G,GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=17,25,17;MFRL=58,149,176;MMQ=60,60,60;MPOS=14,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.74,9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.185,0.455:11:0,1,0:1,0,1:0,4,0,7
chr1	225965527	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,4:2,4:8,0,7,1
chr1	226016492	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=173,69;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:7,2:14,1:10,11,2,1
chr1	226016633	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,2:4,2:1,4,1,3
chr1	226027067	.	GGTGT	G	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=218,239;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=GT;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.280:7:3,0:1,2:0,5,0,2
chr1	226027103	.	TCCTCTAAGAA	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=196,170;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.235:18:4,4:4,0:0|1:226027103_TCCTCTAAGAA_T:226027103:0,14,0,4
chr1	226027116	.	GGACC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=196,170;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.263:16:6,3:5,0:0|1:226027103_TCCTCTAAGAA_T:226027103:0,12,0,4
chr1	226033030	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=170,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,4:3,0:0,4,2,2
chr1	226034839	.	TCTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=189,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CTG;STR;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:3,1:8,1:11,6,1,1
chr1	226036309	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=166,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,5:3,1:0,3,0,6
chr1	226043474	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=214,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr1	226044489	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr1	226044500	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=202,248;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,0:4,4:5,7,2,2
chr1	226044591	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=174,99;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.372:19:6,5:6,1:9,3,5,2
chr1	226048746	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,1,3
chr1	226049909	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=204,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:3,1:7,1,3,0
chr1	226050222	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=157,107;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:8,0:14,3:11,12,0,3
chr1	226061956	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=116,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:7,5:16,3:12,11,3,5
chr1	226074373	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	226075410	.	GC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=259,133;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	226108894	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.285:26:7,5:10,2:0|1:226108894_C_T:226108894:10,9,5,2
chr1	226108899	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:8,6:11,2:0|1:226108894_C_T:226108894:9,10,5,3
chr1	226125178	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,221;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:10,0:3,2:10,3,1,1
chr1	226125543	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,3,11
chr1	226127443	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,48;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	226180026	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=234,233;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr1	226252232	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=76.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,10:0,13:0,0,2,22
chr1	226253316	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=58.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,9:0,0,15,5
chr1	226334578	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr1	226334605	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,37;MFRL=220,204;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226334605_T_C:226334605:0,3,0,1
chr1	226334611	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=220,204;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226334605_T_C:226334605:0,3,0,1
chr1	226334615	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=220,204;MMQ=60,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:226334605_T_C:226334605:0,3,0,1
chr1	226340049	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=130,50;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,2:11,1:8,11,1,2
chr1	226352498	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=119,126;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:1,5:5,5:3,3,6,4
chr1	226353521	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=116,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:6,6:2,4:6,2,6,4
chr1	226353593	.	AC	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=90,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:16,6:15,0:33,6,6,0
chr1	226420722	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:3,0,6,0
chr1	226438449	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr1	226455784	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=179,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,0:6,6:7,7,0,6
chr1	226465693	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=231,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr1	226485327	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=131,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr1	226485496	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:3,11,1,2
chr1	226488826	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=12382833,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr1	226496811	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:2,10,5,1
chr1	226550741	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:5,4,4,0
chr1	226556094	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr1	226567563	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,273;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr1	226573402	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=188,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,1:5,4:1,8,1,4
chr1	226576270	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=245,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:6,0,6,1
chr1	226576296	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:9,1,3,1
chr1	226578047	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr1	226578099	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,8:0,0,10,9
chr1	226579981	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=167,87;MMQ=60,59;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:4,0:15,3:8,12,1,2
chr1	226580021	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:8,2:7,1:4,11,1,2
chr1	226589709	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=263,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.770:14:1,5:1,6:3,0,11,0
chr1	226595647	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=182,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:3,6:0,10:0,3,8,8
chr1	226822594	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:226822594_A_G:226822594:6,6,0,2
chr1	226822601	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:0|1:226822594_A_G:226822594:5,7,0,2
chr1	226825341	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:1,3,4,1
chr1	226923146	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr1	226923264	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.586:22:6,7:3,6:6,3,6,7
chr1	227069677	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=216,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=80.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,26:0.750:34:4,10:4,16:5,3,13,13
chr1	227069737	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=215,159;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.778:25:4,9:1,11:0,5,7,13
chr1	227071364	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=195,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,8:2,5:5,1,12,1
chr1	227071377	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=218,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:5,7:4,6:7,2,11,2
chr1	227073410	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=219,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr1	227078955	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,5:3,4:0|1:227078955_T_C:227078955:6,3,6,3
chr1	227078964	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,2:0.136:20:10,2:8,0:1|0:227078955_T_C:227078955:11,7,2,0
chr1	227081622	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=228,111759071;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr1	227081850	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=291,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.711:12:2,2:1,6:0,3,0,9
chr1	227170768	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:2,2,2,2
chr1	227171584	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	227171736	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=210,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr1	227171738	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=210,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr1	227171769	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=196,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,3:5,0:9,3,3,0
chr1	227171958	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr1	227172518	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,3,3
chr1	227172903	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	227172935	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=201,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr1	227174122	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,6:0,0:1,0,4,2
chr1	227174145	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,3,3
chr1	227181923	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,10,1
chr1	227182179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr1	227192579	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=235,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,2,3
chr1	227198775	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=98,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:0,6:2,6:0,2,4,8
chr1	227216421	.	C	CATTA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.246:10:6,2:1,0:0|1:227216421_C_CATTA:227216421:3,5,1,1
chr1	227216423	.	G	GCTGACAGCTCATCAGTAGAAGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.242:10:7,2:1,0:0|1:227216421_C_CATTA:227216421:3,5,1,1
chr1	227216775	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=140,198;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:7,5,2,1
chr1	227218069	.	C	CAT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=126,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,3:1,0,4,2
chr1	227218085	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.503:14:5,3:2,4:3,4,4,3
chr1	227221222	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr1	227222515	.	G	GACAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=40.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr1	227223367	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=208,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr1	227239562	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,1:13,2:15,8,2,1
chr1	227239739	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:2,1:6,2:0|1:227239739_T_A:227239739:0,8,0,3
chr1	227239746	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=122,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0|1:227239739_T_A:227239739:0,4,0,5
chr1	227247016	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:9,4,2,1
chr1	227259884	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,124;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:6,2:8,4:5,9,5,1
chr1	227288655	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,7:2,7:3,1,12,2
chr1	227299978	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,228;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:5,1,4,1
chr1	227300277	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=173,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,4,2
chr1	227330759	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=250,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,3:3,3:1,2,2,4
chr1	227330783	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=219,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:2,2,0,4
chr1	227387361	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,5:1,3:0,4,3,5
chr1	227400792	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=144,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,7:2,6:4,2,11,2
chr1	227400833	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:15,0:12,4:15,12,0,4
chr1	227504613	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	227834233	.	TC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.810:8:1,2:0,5:1,0,4,3
chr1	227834400	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:3,6:0,4:1,2,2,8
chr1	227920061	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:0,9:5,3:2,3,5,7
chr1	227920665	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:4,6,1,4
chr1	227920667	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=187,90;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:5,8,0,2
chr1	227921236	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:8,7,1,1
chr1	227922640	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=88,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,1,3
chr1	227935355	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,0:0,8:0,0,7,1
chr1	227935762	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,2,3
chr1	228109319	.	C	CATCCTCTCCA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=180,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:228109319_C_CATCCTCTCCA:228109319:7,15,1,1
chr1	228109320	.	G	GATGCCCAGCCTCATT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=180,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.116:24:11,2:11,0:0|1:228109319_C_CATCCTCTCCA:228109319:7,15,1,1
chr1	228112121	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=314,184;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:0,9:2,3:2,0,3,9
chr1	228290033	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,0:5,2:6,3,1,1
chr1	228295926	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=146,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,7:0.173:42:15,6:20,0:17,18,7,0
chr1	228401329	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,2:6,1:0,8,0,3
chr1	228402121	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=125,242;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:5,3:6,3:7,4,3,3
chr1	228404668	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=320,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	228404690	.	CC	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=157,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr1	228412106	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=212,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,4,2
chr1	228412227	.	TG	CA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=199,152;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,4:2,7:5,1,5,8
chr1	228412272	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=162,178;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,0:11,2:9,12,2,0
chr1	228412308	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=191,158;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,23:0.775:29:3,10:2,13:1,5,13,10
chr1	228430956	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=135,50;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:1,0:11,1:0|1:228430956_C_T:228430956:8,5,1,1
chr1	228430963	.	C	CAGCTCAGCGGCCGTCTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=137,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:1,0:12,2:0|1:228430956_C_T:228430956:8,6,1,1
chr1	228431095	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=200,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:3,11:4,9:4,3,11,9
chr1	228431235	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=206,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr1	228431930	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,4:1,3:8,0,7,0
chr1	228434602	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	228437603	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.665:19:3,3:3,9:6,0,12,1
chr1	228444297	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=224,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:4,2,4,2
chr1	228444318	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,6:0,3:2,1,8,1
chr1	228456147	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=301,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,7:1,1:1,0,8,0
chr1	228461381	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=219,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:2,2:5,3:6,2,3,2
chr1	228461408	.	A	AG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,2:0,8:0,0,6,4
chr1	228461757	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=70,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,5:2,1:1,2,2,4
chr1	228462154	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:3,11,1,1
chr1	228462412	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:3,4,4,0
chr1	228464154	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,274;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	228464842	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=277,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=37.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,7:1,4:0,1,9,2
chr1	228465370	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr1	228466750	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=236,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr1	228466856	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,1:5,1:7,6,1,1
chr1	228469796	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=154,192;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:12,6:11,1:12,12,7,0
chr1	228469870	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=149,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:19,5:8,2:15,12,3,4
chr1	228471200	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,152;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:11,0:8,4:11,8,0,5
chr1	228474840	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=286,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr1	228475747	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,162;MMQ=60,31;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:3,7:12,0:10,5,7,0
chr1	228476414	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=125,255;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:12,7,1,1
chr1	228480964	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr1	228481315	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=202,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:4,0:3,4,0,2
chr1	228496066	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=120,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:4,2:5,2:5,5,2,2
chr1	228497053	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.690:11:2,6:1,1:1,2,2,6
chr1	228497286	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=132,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,1:4,1:2,3,0,2
chr1	228504645	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=289,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	228505699	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=241,126;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:1,7:2,11:2,1,10,8
chr1	228505727	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=130,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:9,1:9,8,0,2
chr1	228505739	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=228,122;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:1,8:3,8:2,2,6,10
chr1	228506661	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,4:4,6:2,8,3,7
chr1	228509427	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=252,207;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:2,3:3,3:6,0,2,4
chr1	228523412	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=154,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,3:4,0:3,1,3,0
chr1	228523442	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=128,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,5:3,0:4,3,4,1
chr1	228523447	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr1	228523618	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:2,5,0,3
chr1	228525898	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=207,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,1,1
chr1	228529826	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:4,0:7,6,1,1
chr1	228547256	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=124,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:3,3,1,2
chr1	228548197	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=205,283;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:3,2,0,2
chr1	228556788	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:3,4:1,2:4,0,2,4
chr1	228558522	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=192,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr1	228559654	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=142,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,3:5,2:6,7,2,3
chr1	228564844	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:228564844_A_G:228564844:1,3,0,1
chr1	228564849	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:228564844_A_G:228564844:1,2,0,1
chr1	228565445	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=195,269;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr1	228584930	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.279:15:5,0:4,0:0|1:228584930_T_C:228584930:1,10,4,0
chr1	228584935	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.281:15:5,0:5,2:0|1:228584930_T_C:228584930:1,10,4,0
chr1	228584940	.	TG	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,12;MFRL=121,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.281:15:5,0:5,1:0|1:228584930_T_C:228584930:1,10,4,0
chr1	228588654	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=219,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr1	228595893	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:6,5,1,1
chr1	228601638	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,3,9
chr1	228602660	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=199,291;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:9,13,1,1
chr1	228613052	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=211,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:1,8:2,7:1,2,3,12
chr1	228645063	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,1:0,10:0,0,11,0
chr1	228646356	.	C	CGTGT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,163;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=GT;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.445:18:5,4:4,2:6,4,6,2
chr1	228646473	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.108:43:21,4:18,0:19,20,0,4
chr1	228647697	.	ATT	A,AT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,25,29;MFRL=189,198,150;MMQ=60,54,60;MPOS=14,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.15,13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,8:0.205,0.386:20:5,3,3:3,1,5:3,5,4,8
chr1	229385407	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=125,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:4,4,1,2
chr1	229385927	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,17;MFRL=302,249;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:229385927_G_A:229385927:2,0,1,0
chr1	229385932	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=302,249;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:229385927_G_A:229385927:2,0,1,0
chr1	229385938	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=285,249;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:229385927_G_A:229385927:3,0,1,0
chr1	229386324	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=187,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:7,7:18,0:15,10,7,0
chr1	229422193	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,4:2,0:7,4,2,2
chr1	229462408	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=174,18800975;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:229462408_C_T:229462408:12,0,2,0
chr1	229462415	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,18800975;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,2:6,0:0|1:229462408_C_T:229462408:13,0,2,0
chr1	229568231	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr1	229600326	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,2,1
chr1	229606493	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:3,2:10,1:6,7,3,0
chr1	229633790	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=191,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr1	229662901	.	CAA	C,CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34,35;MFRL=154,170,226;MMQ=60,60,60;MPOS=14,32;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.47,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.250,0.327:7:1,2,2:1,0,0:3,0,4,0
chr1	229663064	.	GAGGAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGGAA;STR;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,7:0,3:0,0,2,8
chr1	229730691	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=162,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,3:8,2:7,7,1,4
chr1	229738170	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,10:0,21:0,0,21,10
chr1	229738193	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,0:9,7:12,5,4,3
chr1	229746019	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr1	229779534	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr1	229781532	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr1	229781744	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,2,10
chr1	229783236	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,12,0
chr1	229783240	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,4:0,6:0|1:229783236_T_C:229783236:0,0,12,0
chr1	229790048	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=295,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.820:20:2,6:1,11:3,0,8,9
chr1	229795045	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=186,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:2,3:12,4:1,13,2,5
chr1	229795070	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,4:5,8:2,8,0,12
chr1	230313911	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:3,3,1,4
chr1	230371883	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=230,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,7:4,5:2,2,3,9
chr1	230372061	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=212,144;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:5,3,2,2
chr1	230384843	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=186,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	230386341	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=222,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr1	230398445	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=257,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.615:8:2,2:0,3:2,1,2,3
chr1	230410162	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.236:18:5,1:8,2:9,5,2,2
chr1	230410374	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr1	230415025	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=65.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,12:0,7:0,0,14,5
chr1	230415293	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=226,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr1	230459433	.	GC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr1	230473103	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=217,281;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr1	230497940	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	230503684	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr1	230503925	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=131,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:12,4:5,2:3,14,0,6
chr1	230778243	.	AC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,2:0,6:2,0,8,0
chr1	230778491	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr1	230795177	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=193,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,1:3,6:4,0,4,3
chr1	230798864	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.402:20:5,2:7,6:8,4,7,1
chr1	230800358	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=194,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:0,5,0,4
chr1	230819295	.	ATTC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:3,6,2,0
chr1	230819479	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=13,22;MFRL=228,321;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,0:0,1,0,2
chr1	230822607	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,6:1,2:2,0,8,0
chr1	230822903	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=222,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,0,4
chr1	230825942	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=226,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,3:0,0:0,1,0,4
chr1	230828987	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=215,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,6:1,9:0,1,11,4
chr1	230838940	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:7,6,1,1
chr1	230841687	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,120;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:0,6:8,11:2,6,9,8
chr1	230845900	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:3,3,1,1
chr1	230883466	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:9,2:6,8,1,2
chr1	230883484	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=232,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,1:3,5:3,3,1,5
chr1	230883499	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=226,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,1:1,6:1,3,1,6
chr1	230891248	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=80,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr1	230898615	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=240,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr1	230904911	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,1:5,3:4,7,3,1
chr1	230914706	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:8,1:6,4:0|1:230914706_C_A:230914706:9,6,4,1
chr1	230914729	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.523:25:6,6:4,7:0|1:230914706_C_A:230914706:8,4,4,9
chr1	230915827	.	CGTGTGTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=220,277;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=GT;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:1,0,1,0
chr1	230923187	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=229,93;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:4,1,3,0
chr1	230928089	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=171,156;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,8:3,0:8,0,9,0
chr1	230928512	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,225;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr1	230937435	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=147,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:9,4:2,15,0,4
chr1	231047310	.	TAC	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.964:22:0,5:0,17:0,0,10,12
chr1	231047392	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr1	231051977	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,58;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:11,12,0,2
chr1	231057310	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr1	231060736	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr1	231064611	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr1	231066951	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=318,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr1	231067236	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=324,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=50.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:2,2:0,14:0,2,2,14
chr1	231067318	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=302,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:1,1,3,2
chr1	231069652	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr1	231081304	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=279,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,1:2,5:0,3,0,6
chr1	231094050	.	GAAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,12;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:1,1:0,0:2,2,1,0
chr1	231114915	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=160,284;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,1:5,1:7,5,2,0
chr1	231377081	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=130,277;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,2:4,1:9,3,2,1
chr1	231396485	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:0,0:5,2:0,5,0,2
chr1	231401596	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=165,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,3:3,1:2,9,1,3
chr1	231480507	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=45.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.849:15:1,5:0,8:2,0,5,8
chr1	231486989	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=105,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr1	231487017	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=109,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:3,5:0,5:2,1,7,3
chr1	231502310	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr1	231509769	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,112;MMQ=60,35;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:13,0:14,6:17,10,0,6
chr1	231665038	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:16,2:9,3:13,12,4,1
chr1	231936016	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr1	232002392	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=215,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,0:7,3:1,13,1,2
chr1	232094560	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,536;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:10,0:12,5:6,16,5,0
chr1	232535030	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr1	232535060	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=221,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr1	232538161	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:12,9,2,0
chr1	232551416	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:4,4:0,4:1,3,0,8
chr1	232564162	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:13,5:4,6:8,9,6,5
chr1	232568293	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=232,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,4:1,6:0,1,1,9
chr1	232581247	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=31.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,3:2,9:5,0,11,1
chr1	232581436	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:3,2:12,6:4,11,2,6
chr1	232601208	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=228,304;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr1	232607050	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:0,4:4,2:3,1,6,0
chr1	232607094	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,8:3,0:4,1,6,2
chr1	232619629	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.273:30:12,0:10,7:10,12,0,8
chr1	232629475	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:0,4,0,6
chr1	232943980	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=155,97;MMQ=60,43;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:8,14,2,0
chr1	232944176	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.250:38:15,9:14,0:20,9,9,0
chr1	233091276	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,34;MFRL=217,206;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.303:12:5,3:3,0:8,1,3,0
chr1	233091305	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,16;MFRL=132,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.298:18:7,0:3,0:0|1:233091305_G_T:233091305:3,10,5,0
chr1	233091315	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.210:26:11,1:6,0:0|1:233091305_G_T:233091305:7,14,5,0
chr1	233091318	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.177:31:13,2:7,1:0|1:233091305_G_T:233091305:8,18,5,0
chr1	233091322	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=142,137;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.158:29:12,0:11,0:0|1:233091305_G_T:233091305:7,18,4,0
chr1	233119951	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=214,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:2,0,6,0
chr1	233121884	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.420:22:5,6:7,3:4,9,6,3
chr1	233135198	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=16,17;MFRL=131,115;MMQ=54,41;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:0,0:0,1:0,3,0,4
chr1	233152910	.	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.206:19:7,1:8,0:4,12,0,3
chr1	233160950	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=202,107;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.298:28:11,5:9,3:10,10,4,4
chr1	233225957	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:1,8,2,2
chr1	233295992	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=250,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:2,2:3,1:6,1,3,0
chr1	233337912	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,54;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:18,0:18,3:16,22,0,3
chr1	233388450	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:12,3:11,4:9,14,5,2
chr1	233397752	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr1	233398670	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=181,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr1	233398927	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:0|1:233398927_C_G:233398927:0,6,0,2
chr1	233398931	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,0:0|1:233398927_C_G:233398927:0,6,0,2
chr1	233431030	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:9,4:10,1:14,5,2,3
chr1	233431241	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=161,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,2:5,0:2,7,0,2
chr1	233489499	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=279,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr1	233489529	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=193,119;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,2:3,6:2,2,7,1
chr1	233489707	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=190,87;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.790:22:3,9:1,9:2,2,9,9
chr1	233490536	.	A	AATGTCTTGGGGATAATCTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=295,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,4:1,0:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:2,0,10,1
chr1	233490543	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=266,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,12:0.764:15:2,7:1,5:0|1:233490536_A_AATGTCTTGGGGATAATCTG:233490536:3,0,11,1
chr1	233490764	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,4:1,7:1,2,3,8
chr1	233490776	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=255,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:1,4,1,8
chr1	233508042	.	T	TATCCATGTCGGTAGCTGCAAACAGCTC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=371,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	233511913	.	TAGAG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=AG;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,0:2,2:1,5,0,2
chr1	233512362	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=329,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	233749855	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=158,399;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr1	233802576	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:20,1:9,2:10,19,0,3
chr1	233802779	.	TTTTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTA;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.718:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	233807093	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:14,7,2,0
chr1	234444761	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,1:4,2:9,0,3,0
chr1	234454405	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr1	234509876	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:2,0:0,0:2,1,3,0
chr1	234563405	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=154,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.132:35:19,0:12,4:17,14,1,3
chr1	234563556	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=183,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:6,3:0,10,0,6
chr1	234565078	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=214,234;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:4,3,1,1
chr1	234565787	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:8,3:2,1:7,4,3,1
chr1	234569192	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,236;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.279:16:8,3:3,1:7,5,3,1
chr1	234573171	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=113,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:11,3:7,0:1,17,0,3
chr1	234573172	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:14,0:3,4:1,16,0,4
chr1	234582457	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=174,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:0,2:1,1:0|1:234582457_C_T:234582457:1,0,4,0
chr1	234582461	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=256,124;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0|1:234582457_C_T:234582457:3,0,3,0
chr1	234582651	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,3:4,7:3,4,4,6
chr1	234593403	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.693:24:3,6:4,11:4,3,7,10
chr1	234596202	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,309;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	234607055	.	TG	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=166,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.206:12:5,1:5,1:2,8,0,2
chr1	234744413	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=230,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr1	234744503	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,333;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	234745009	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr1	235285740	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,3:1,2:3,4,1,4
chr1	235295214	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=126,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:7,7,0,2
chr1	235301496	.	CAA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=120,127;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.153:17:4,0:6,1:5,10,0,2
chr1	235357259	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr1	235357303	.	A	ATG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr1	235357314	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=174,119;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr1	235357543	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=121,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:1,8,2,3
chr1	235384838	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=220,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr1	235394554	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=195,126;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr1	235403595	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=139,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:9,3,2,0
chr1	235505313	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=188,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.525:13:3,4:3,3:4,2,4,3
chr1	235506853	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.537:28:7,9:5,6:7,6,8,7
chr1	235506865	.	C	CA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=113,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.432:26:6,8:9,2:7,8,4,7
chr1	235507466	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,21;MFRL=294,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.652:6:1,2:0,0:1,1,0,4
chr1	235543281	.	TCC	AAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,10;MFRL=164,169;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:235543281_TCC_AAA:235543281:4,0,1,0
chr1	235543286	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,10;MFRL=164,169;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:235543281_TCC_AAA:235543281:4,0,1,0
chr1	235543291	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=17,16;MFRL=164,169;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:0,0:0|1:235543281_TCC_AAA:235543281:4,0,1,0
chr1	235582924	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,249;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,2:4,0:0,8,0,2
chr1	235594182	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr1	235611801	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=209,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:235611801_C_CT:235611801:4,5,0,2
chr1	235611807	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=209,99;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:235611801_C_CT:235611801:4,5,0,2
chr1	235618788	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=136,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr1	235628908	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,6:2,6:3,2,9,3
chr1	235647631	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,5:1,2:4,0,4,3
chr1	235715523	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=172,221;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:1,5,1,5
chr1	235715556	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=206,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr1	235826382	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=114,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr1	235856860	.	A	AGAGAATTCTGCTTCCTCTCATC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=199,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	235860340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr1	235866014	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:7,0,4,0
chr1	235872665	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=214,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr1	235896726	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	235915331	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:13,4:11,0:13,12,4,0
chr1	235918688	.	C	CAAAAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,344;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AAAAG;STR;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.781:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr1	235922196	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	235938388	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=191,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,0:2,5,1,1
chr1	235945480	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,283;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	236141366	.	T	TC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr1	236176846	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,1:11,11,2,0
chr1	236205121	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=278,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,1:2,1:1,1,3,0
chr1	236208688	.	AT	GA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=229,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr1	236209024	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=213,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr1	236209081	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=360,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr1	236368391	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:10,3,2,0
chr1	236381897	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=139,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,1:13,2:15,6,1,2
chr1	236381981	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,0:8,7:0,15,0,7
chr1	236381987	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=140,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:4,1:13,1:0|1:236381987_A_G:236381987:0,17,0,2
chr1	236381989	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=140,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,1:7,1:0|1:236381987_A_G:236381987:0,17,0,2
chr1	236384278	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=191,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:1,4,2,7
chr1	236385116	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=196,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	236385165	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:1,1:7,3:0|1:236385165_G_C:236385165:8,0,3,1
chr1	236385173	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,1:7,3:0|1:236385165_G_C:236385165:8,1,3,1
chr1	236385360	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=126,255;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:5,0:1,9,0,3
chr1	236385379	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=136,166;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:0,8,0,3
chr1	236389500	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=167,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr1	236389859	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=177,328;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:2,0:5,2:5,3,1,1
chr1	236389926	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=177,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,0:4,2:8,5,1,1
chr1	236390131	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=150,271;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	236393654	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr1	236396048	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:3,4:8,1:7,4,5,0
chr1	236396144	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=178,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,2:11,0:7,18,0,2
chr1	236399752	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=270,262;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	236399772	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=270,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr1	236433135	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr1	236557771	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,16,5
chr1	236572475	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=137,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,3:4,3:6,0,6,1
chr1	236590659	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=206,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr1	236590816	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,0:1,5:1,3,0,5
chr1	236631633	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=171,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,7:2,4:2,4,3,8
chr1	236700807	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=145,212;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:3,2,1,5
chr1	236700823	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:4,1:6,4:6,4,2,3
chr1	236700857	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=107,222;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,1:6,4:9,4,3,2
chr1	236700982	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=214,266;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr1	236702117	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=159,271;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:7,1,2,1
chr1	236702153	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=131,271;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:2,1:10,2:7,6,1,2
chr1	236702374	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=108,334;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:13,0:6,4:9,10,2,2
chr1	236702447	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:2,2:0|1:236702447_T_G:236702447:1,5,1,2
chr1	236702450	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=28,36;MFRL=162,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0|1:236702447_T_G:236702447:1,4,1,2
chr1	236702475	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=231,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr1	236703767	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=171,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr1	236703832	.	CG	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:11,0:3,2:11,3,1,1
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chr1	236704891	.	TAAA	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=126,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,1;RU=A;STR;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,2:5,3:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:8,4,4,1
chr1	236704897	.	ATT	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=126,240;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,2:8,3:0|1:236704888_A_AACAGGT:236704888:8,5,4,1
chr1	236706352	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=176,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,2:5,0:1,6,1,1
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chr1	236708022	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr1	236708224	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=139,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:4,12,1,1
chr1	236711297	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=98,271;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:6,3,4,0
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chr1	236714335	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=165,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,3:9,0:1,12,0,3
chr1	236714384	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr1	236716833	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:8,1:1,1:8,1,2,0
chr1	236717102	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=187,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:0|1:236717102_A_T:236717102:0,8,0,5
chr1	236717104	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=179,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,7:0.534:13:4,1:1,6:1|0:236717102_A_T:236717102:0,6,0,7
chr1	236718524	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,298;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr1	236718561	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=156,245;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,4,0
chr1	236719259	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=172,299;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:3,2,2,4
chr1	236721452	.	GA	G,GAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35,36;MFRL=196,221,216;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.58,3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.334,0.246:9:2,2,2:2,1,0:4,0,5,0
chr1	236722489	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=144,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:0,3:0,2,1,4
chr1	236723177	.	GC	AA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=107,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.349:24:9,4:6,4:3,13,0,8
chr1	236724605	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=126,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:2,2:11,4:4,9,2,4
chr1	236729867	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,280;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr1	236732197	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=173,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:236732197_AC_A:236732197:1,0,2,0
chr1	236732202	.	AAAAAAAAAC	A,CAAAAAAAAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,23,32;MFRL=155,181,205;MMQ=60,60,60;MPOS=18,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,0:1,1,1:2,0,2,0
chr1	236732204	.	AAAAAAACT	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:1,1:0|1:236732197_AC_A:236732197:2,0,1,0
chr1	236735939	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=170,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:4,6:5,2:7,2,6,3
chr1	236737888	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=220,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr1	236740039	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.415:15:2,3:6,2:5,4,5,1
chr1	236744712	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=171,279;MMQ=60,60;MPOS=32;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr1	236744720	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=279,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.710:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr1	236746275	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=146,257;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:6,4,2,1
chr1	236748570	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:0,1:4,5:0,4,0,6
chr1	236749022	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=197,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr1	236749026	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=197,240;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr1	236749451	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=117,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr1	236749649	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=138,240;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:8,2:6,5:9,5,2,5
chr1	236755814	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=196,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:4,2,5,0
chr1	236755837	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,236;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,0:4,5:3,6,4,1
chr1	236759060	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=188,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=29.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,4:3,5:2,3,4,5
chr1	236766447	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=183,123;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:0,2:10,2:8,2,3,1
chr1	236767176	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=191,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,1:2,4:5,0,5,0
chr1	236767178	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=172,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,1:1,5:4,0,6,0
chr1	236882110	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr1	236883564	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr1	236894647	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=159,268;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:3,11,0,2
chr1	236899042	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=158,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,1:6,2:3,12,1,2
chr1	236900597	.	G	GTATATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=171,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,1:0|1:236900597_G_GTATATA:236900597:0,2,0,1
chr1	236900598	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=171,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,0:0,3:0|1:236900597_G_GTATATA:236900597:0,2,0,3
chr1	236902532	.	ATT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,2:2,0:3,1,2,1
chr1	236902560	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=134,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr1	236902594	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=255,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,3:2,6:0,3,6,3
chr1	236902865	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=209,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:1,6,1,2
chr1	236907847	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:4,3,2,0
chr1	236912597	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,4:3,1:3,2,1,4
chr1	236917151	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,16;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:236917151_T_A:236917151:0,0,1,0
chr1	236917155	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:236917151_T_A:236917151:0,0,1,0
chr1	236917161	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=113,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:236917151_T_A:236917151:1,0,1,0
chr1	236923197	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=230,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr1	236924506	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr1	236972186	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=270,136;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,1,4
chr1	237024414	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.554:7:1,2:0,0:0|1:237024414_G_T:237024414:2,1,4,0
chr1	237024416	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.498:8:2,0:1,0:0|1:237024414_G_T:237024414:3,1,4,0
chr1	237024423	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=132,146;MMQ=60,45;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:2,0:2,0:0|1:237024414_G_T:237024414:3,2,2,0
chr1	237037051	.	A	AGCAATATCTGCATTGCAGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=135,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:5,6,1,1
chr1	237038161	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=350,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,7:0,7:0,2,6,8
chr1	237057608	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=171,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr1	237057923	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,291;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0,12,0,2
chr1	237519137	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	237519165	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr1	237532763	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=218,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr1	237540615	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:8,2,3,1
chr1	237551376	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,4:8,2,5,5
chr1	237619875	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,245;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr1	237620049	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:0,13:2,7:0,2,5,16
chr1	237659767	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=167,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:5,2:5,1:9,4,3,0
chr1	237670140	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:3,1:4,1:2,5,3,0
chr1	237711644	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr1	237729774	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr1	237730124	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,2,12
chr1	237730169	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr1	237732395	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=138,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:6,0,2,1
chr1	237753074	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=203,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,6:1,0:2,0,6,0
chr1	237753364	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=227,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	237753390	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=227,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	237754340	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=312,279;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr1	237755188	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=37,32;MFRL=85,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,2:2,4:0,2,2,4
chr1	237755203	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=85,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr1	237765470	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:0,4,1,7
chr1	237788862	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr1	237802559	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr1	237814783	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,260;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,1:3,2:5,6,2,1
chr1	237824332	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	237831103	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,9,2
chr1	237862164	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=217,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr1	237862436	.	TA	CA,CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33,30;MFRL=180,245,223;MMQ=60,60,60;MPOS=18,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.84,3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.428,0.286:4:0,1,0:1,1,1:0,1,0,3
chr1	237863439	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr1	237863790	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=139,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:1,0:2,3:2,3,1,2
chr1	237865203	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr1	237872714	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=333,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,2:0,1:1,0,3,0
chr1	237875040	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=180,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:3,4,4,0
chr1	237893674	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr1	237923053	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr1	237944814	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,1:8,4:12,1,4,1
chr1	237946964	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,10:3,4:6,3,6,8
chr1	237947552	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=199,171;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,4:8,0:8,9,5,0
chr1	237951451	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,4:4,6:3,3,2,8
chr1	237955682	.	CGT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:237955682_CGT_C:237955682:0,0,0,1
chr1	237955698	.	CGTGTGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,5;RU=GT;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237955682_CGT_C:237955682:0,0,0,1
chr1	237955715	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:237955682_CGT_C:237955682:0,0,0,1
chr1	237955723	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,24;MFRL=191,146;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:237955682_CGT_C:237955682:0,1,0,1
chr1	237957146	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,7:1,8:1,0,13,2
chr1	237957161	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=128,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,7:1,6:1,0,10,3
chr1	237957309	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,4,9
chr1	237995986	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:237995986_C_CA:237995986:0,4,0,1
chr1	237995987	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,34;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:237995986_C_CA:237995986:0,4,0,1
chr1	237995994	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=207,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:237995986_C_CA:237995986:0,3,0,1
chr1	237996035	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,36;MFRL=395,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr1	238053118	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,16;MFRL=133,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.749:6:1,2:0,0:0|1:238053118_A_C:238053118:0,1,5,0
chr1	238053123	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,26;MFRL=133,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.598:8:1,4:0,0:0|1:238053118_A_C:238053118:2,1,5,0
chr1	238053129	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=18,35;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.425:12:1,5:1,0:0|1:238053118_A_C:238053118:3,4,5,0
chr1	238053132	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=23,29;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.425:12:3,3:2,0:0|1:238053118_A_C:238053118:3,4,5,0
chr1	238053137	.	CACAAGA	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=133,263;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:2,1:4,0:0|1:238053118_A_C:238053118:8,5,2,0
chr1	238053524	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,261;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,2:4,6:0,6,1,7
chr1	240070680	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr1	240072721	.	G	GA,GAA,GAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=22,33,17,27;MFRL=105,179,132,222;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,11,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,11,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.10,9.71,4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,4,5,2:0.234,0.305,0.150:17:1,1,0,1:5,2,2,0:4,2,6,5
chr1	240073619	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=208,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:2,3:2,2:2,2,3,4
chr1	240073884	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=160,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.248:24:11,2:6,4:11,7,4,2
chr1	240074554	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.237:21:4,4:9,0:8,8,1,4
chr1	240075307	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:12,0:15,8,2,0
chr1	240076975	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=203,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,7:7,3:5,8,5,5
chr1	240255568	.	GGGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	240341119	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=238,387;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr1	240341164	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,346;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr1	240351628	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr1	240371983	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=162,291538;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,2:8,0:7,9,2,0
chr1	240421383	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr1	240421437	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr1	240492543	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=233,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:2,5:0,6:1,1,3,8
chr1	240492734	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,4:7,7:1,11,4,7
chr1	240519251	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	C,CA	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=30,23,27;MFRL=177,146,139;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=35,15,16;RU=A;STR;TLOD=3.05,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,5,2:0.347,0.203:13:1,2,0:2,1,1:0,6,0,7
chr1	240519266	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=145,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:3,1:2,2:0|1:240519266_A_G:240519266:1,4,0,3
chr1	240519270	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAGCTACAAG	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.396:8:1,1:2,2:0|1:240519266_A_G:240519266:0,5,0,3
chr1	240519296	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=34,22;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:0|1:240519266_A_G:240519266:0,11,0,3
chr1	240519300	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0|1:240519266_A_G:240519266:0,7,0,3
chr1	240601269	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr1	240656530	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=209,363;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:7,0:4,11,2,0
chr1	240656824	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=238,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:2,3:2,2:0,5,0,5
chr1	240939391	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=168,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:4,0,2,1
chr1	240964859	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=109,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:1,2,0,2
chr1	240975213	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,1:7,2:7,8,2,1
chr1	240975435	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=179,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr1	240976878	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=217,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:4,5,3,0
chr1	240977964	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=105,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr1	240979663	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:11,0:11,8:7,15,0,10
chr1	240979803	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr1	241146322	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=219,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr1	241519098	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr1	241661248	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,66;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:10,3:9,0:13,6,2,1
chr1	241663925	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:1,0:8,3:0|1:241663925_G_C:241663925:1,8,0,3
chr1	241663929	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:1,0:7,3:0|1:241663925_G_C:241663925:1,8,0,3
chr1	241663933	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,33;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:0|1:241663925_G_C:241663925:1,6,0,3
chr1	241663937	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,36;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:1,6,0,3
chr1	241667244	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr1	241712246	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=164,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:5,0:0|1:241712246_C_A:241712246:5,5,1,1
chr1	241712249	.	G	GCCTTTATCCCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:241712246_C_A:241712246:5,5,1,1
chr1	241767930	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr1	241847018	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=185,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,3:2,8:1,2,5,6
chr1	241907691	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.582:12:3,3:1,4:1,4,2,5
chr1	241913062	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=224,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=53.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.909:19:1,7:0,11:0,1,3,15
chr1	241920562	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,1:4,1:9,3,2,0
chr1	241933876	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.849:15:0,8:1,5:1,1,7,6
chr1	241946766	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=245,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr1	241951106	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=86,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:3,2:24,1:25,2,3,0
chr1	241951329	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=145,116;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:0,6,1,3
chr1	241954005	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=235,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr1	241958401	.	C	CTTGT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,248;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr1	241958595	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:241958595_T_C:241958595:3,9,1,1
chr1	241958597	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:0|1:241958595_T_C:241958595:3,9,1,1
chr1	241964559	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr1	242016590	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr1	242042141	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:8,6:7,5:13,2,11,0
chr1	242042690	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=161,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr1	242045275	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,9,10
chr1	242048514	.	G	GTAAA,GTAAATAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35,36;MFRL=109,140,204;MMQ=60,60,60;MPOS=24,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,6,7;RU=TAAA;STR;TLOD=11.92,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.523,0.255:5:1,2,1:0,1,0:1,0,4,0
chr1	242383201	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=221,267;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr1	242383352	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,10:5,0:7,6,10,0
chr1	242383510	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=192,272;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr1	242511556	.	AACAAAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAAAG;STR;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr1	243327520	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=203,178;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,5:2,2:3,0,7,0
chr1	243328915	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,174;MMQ=39,39;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:4,1:11,1:10,5,1,1
chr1	243332884	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=198,190;MMQ=40,24;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:1,2,2,0
chr1	243419429	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:9,4:16,3:16,9,3,4
chr1	243433654	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=196,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr1	243507680	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,12:2,3:0,4,3,12
chr1	243736210	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.661:10:1,3:2,3:3,0,7,0
chr1	243736301	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:4,2:8,1:8,5,1,2
chr1	243809237	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:11,3:6,0:6,11,3,0
chr1	244219033	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,185;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:3,2:6,1:4,5,1,2
chr1	244219893	.	CTCTT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,3:6,3:11,3,4,2
chr1	244528127	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:0,1,1,9
chr1	244574520	.	C	CAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,209;MMQ=56,40;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.281:5:0,0:4,1:4,0,1,0
chr1	244587644	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=162,329;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:5,6:12,0:5,12,0,6
chr1	244595958	.	A	ATTT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,21;MFRL=157,239;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,6;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.259:9:1,1:5,0:1,6,0,2
chr1	244595962	.	CTTTTTTT	C,TTTTTTTT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=20,21,32;MFRL=158,141,249;MMQ=60,60,40;MPOS=21,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.69,6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.268,0.371:8:0,0,1:2,2,2:0,3,0,5
chr1	244596022	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=205,149;MMQ=40,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr1	244601152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:0,3,0,7
chr1	244624635	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=230,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr1	244624887	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr1	244735547	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=262,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:0|1:244735547_A_G:244735547:7,0,3,0
chr1	244735556	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:244735547_A_G:244735547:0,0,9,0
chr1	244773514	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:4,2,4,0
chr1	244803205	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=155,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,6:0,3:1,0,9,0
chr1	245006461	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=148,125;MMQ=52,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,18:0.422:43:14,10:11,8:13,12,5,13
chr1	245021291	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.307:21:10,0:4,5:9,6,5,1
chr1	245022642	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:9,2:10,1:7,12,0,3
chr1	245133539	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,2,7
chr1	245133549	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=173,254;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GC;STR;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,2,1
chr1	245133574	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:245133574_G_C:245133574:0,2,1,0
chr1	245133579	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=214,189;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:245133574_G_C:245133574:0,2,1,0
chr1	245180639	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,21;MFRL=152,106;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.798:13:1,8:1,3:0,2,5,6
chr1	245180671	.	A	AAC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:245180671_A_AAC:245180671:2,5,1,1
chr1	245180672	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=140,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0|1:245180671_A_AAC:245180671:2,5,1,1
chr1	245222634	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,7,0
chr1	245222839	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,8:0,0,0,8
chr1	245318688	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,1:2,2:6,3,2,1
chr1	245530218	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=225,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:7,1:7,1:3,12,0,2
chr1	245850296	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:8,4,0,4
chr1	245912840	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=189,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:4,6:6,3:7,3,8,1
chr1	245927242	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=243,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr1	246022071	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr1	246027024	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,8,0
chr1	246027029	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,9,1
chr1	246027034	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=44.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0|1:246027024_A_G:246027024:0,0,8,3
chr1	246489706	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,1:0,2:0,1,0,6
chr1	246490438	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,5,1
chr1	246490442	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0|1:246490438_T_C:246490438:0,0,5,1
chr1	246490452	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=133,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.402:8:3,3:2,0:0|1:246490438_T_C:246490438:4,1,2,1
chr1	246670333	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr1	246704563	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=239,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr1	246707816	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=137,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:4,5,3,0
chr1	246711789	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr1	246714475	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=202,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,8:3,0:4,1,8,0
chr1	246727558	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr1	246903654	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr1	246927543	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,0:7,5:8,7,0,5
chr1	246929483	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=203,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:1,3,1,2
chr1	246939610	.	A	ATATT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TATT;STR;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:3,3:2,2:2,3,3,4
chr1	246940179	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0|1:246940179_G_A:246940179:6,2,2,0
chr1	246940182	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:0|1:246940179_G_A:246940179:6,2,2,0
chr1	246940442	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=238,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:8,5:2,1:8,3,5,2
chr1	246940790	.	TAAAGA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=235,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:0,2:3,1:0,4,0,3
chr1	246943547	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:15,3:4,0:15,4,3,0
chr1	247004099	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=146,241;MMQ=27,51;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,2:4,1:7,4,3,0
chr1	247007013	.	TAAATA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATA;STR;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:0,1:5,5:5,1,6,0
chr1	247007042	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:6,2:4,7:9,1,7,2
chr1	247025207	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,297;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,0:1,5:5,1,5,0
chr1	247025531	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=258,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr1	247039256	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr1	247054344	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=166,126;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,2:10,1:8,7,1,2
chr1	247055018	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=131,102;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,2:4,5:5,1,7,0
chr1	247061466	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:6,0,3,1
chr1	247063729	.	A	ACCCGCCTCGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=180,173;MMQ=51,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:5,2:0|1:247063729_A_ACCCGCCTCGG:247063729:8,6,0,2
chr1	247063733	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=176,173;MMQ=52,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:0|1:247063729_A_ACCCGCCTCGG:247063729:9,6,0,2
chr1	247068785	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr1	247109014	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,4,1
chr1	247109168	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=142,254;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:4,2:2,5,0,2
chr1	247162658	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=83.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,16,12
chr1	247162681	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:5,1:6,2:5,7,0,3
chr1	247163187	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr1	247202032	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=37,25;MFRL=235,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:5,1,5,0
chr1	247241795	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=208,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:4,3,5,1
chr1	247275608	.	G	GTGA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247275608_G_GTGA:247275608:0,0,0,1
chr1	247275612	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247275608_G_GTGA:247275608:0,0,0,1
chr1	247319830	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,2:2,2:6,3,4,0
chr1	247320258	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,2:9,1:9,10,1,2
chr1	247322967	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:4,0:11,4,2,0
chr1	247419509	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr1	247473546	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=240,24428174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr1	247486421	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=153,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:2,2,3,1
chr1	247582187	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,2:4,0:8,4,1,1
chr1	247582461	.	TATA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:247582461_TATA_T:247582461:0,0,0,1
chr1	247582466	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:247582461_TATA_T:247582461:0,0,0,1
chr1	247588927	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247588927_T_C:247588927:0,0,0,1
chr1	247588933	.	C	CCGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:247588927_T_C:247588927:0,0,0,1
chr1	247599232	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:4,1,4,1
chr1	247614553	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=215,207;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:2,6,2,2
chr1	247614802	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:7,4:10,2:6,11,2,4
chr1	247615252	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=204,242;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,2:1,3:2,4,1,4
chr1	247615261	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr1	247654498	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,3:5,2:2,8,0,5
chr1	247655102	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=198,223;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,2:9,1:8,10,0,3
chr1	247655275	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.261:25:6,0:12,6:12,7,3,3
chr1	247694822	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=192,137;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,0:3,9:6,2,9,0
chr1	247729115	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr1	247729206	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.497:11:4,5:1,0:4,2,5,0
chr1	247729211	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:6,4:1,0:5,2,4,0
chr1	247752019	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,130;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:3,6:6,8:3,6,5,9
chr1	247752367	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=192,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,16:0.369:44:19,11:9,5:16,12,4,12
chr1	247835352	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr1	247835779	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=177,291;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:13,0:8,14,0,2
chr1	247835792	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:10,9,0,2
chr1	247875314	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,3:4,2:5,7,2,3
chr1	247886949	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=123,158;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,4:2,3:5,5,5,2
chr1	247921412	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=110,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:5,7:2,7:4,3,7,7
chr1	247921789	.	AGT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=172,313;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=GT;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.623:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr1	247978087	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,3,2
chr1	247978541	.	AAGG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=278,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.787:7:0,2:1,3:1,0,3,3
chr1	248004551	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=121,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:9,0:16,6:0|1:248004551_C_T:248004551:10,15,0,6
chr1	248004561	.	A	T	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,6:0.184:36:13,0:16,6:0|1:248004551_C_T:248004551:14,16,0,6
chr1	248004566	.	A	AG	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=25,36;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:15,0:16,6:0|1:248004551_C_T:248004551:15,17,0,6
chr1	248004568	.	A	ATCGTATTTCTCCTTC	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=106,137;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:16,0:16,1:0|1:248004551_C_T:248004551:15,17,0,6
chr1	248004614	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,7,15
chr1	248005213	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr1	248024073	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr1	248058797	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr1	248058845	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr1	248058879	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr1	248059703	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,4:2,2:3,4,2,4
chr1	248059712	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.417:12:5,3:2,2:3,4,2,3
chr1	248059779	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,34;MFRL=231,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:2,6,1,3
chr1	248059873	.	G	GTACTCTAGCCTGGGCGACAGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=234,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr1	248084554	.	A	ACTAAACCTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=214,48;MMQ=25,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr1	248084825	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=273,147;MMQ=24,24;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr1	248084829	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=143,152;MMQ=24,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr1	248085341	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr1	248097154	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,154;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:7,3,0,3
chr1	248186214	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=175,16157;MMQ=60,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:8,4,0,3
chr1	248201550	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:4,3,2,1
chr1	248224595	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=34,22;MFRL=171,132;MMQ=60,49;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.393:31:10,6:9,6:7,12,6,6
chr1	248224618	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=169,68;MMQ=58,42;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,2:8,2:8,10,1,3
chr1	248224625	.	A	AGAAAAGAT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=163,47;MMQ=55,37;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,2:10,0:11,11,1,1
chr1	248224713	.	C	CATCACTCAGTCATACCCAAAGT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=36,33;MFRL=145,28896;MMQ=59,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr1	248262644	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr1	248308673	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=101,118;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:14,3:13,0:13,15,0,3
chr1	248343379	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=103,143;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:13,0:13,8:16,10,0,8
chr1	248458223	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,169;MMQ=25,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,42:0.811:51:5,40:4,0:4,5,42,0
chr1	248458941	.	T	TCTTGGGTTGGGGGAAAGCTCCTCAGTGGCTCTGG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=147,86;MMQ=40,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.335:7:5,1:0,0:0,6,0,1
chr1	248458974	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr1	248486895	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr1	248486913	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,9,2
chr1	248512064	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr1	248512094	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,6:0,14:0,0,6,14
chr1	248512099	.	TGGAATTTCTCC	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=173,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:4,2:14,0:7,14,1,1
chr1	248513023	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr1	248513088	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr1	248524799	.	AAC	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=199,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:2,1:4,1,4,0
chr1	248525066	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,305;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:2,4:13,0:8,7,0,4
chr1	248525638	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:3,6:3,5:2,4,2,9
chr1	248569282	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=166,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr1	248570440	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,4,16
chr1	248637685	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=146,239;MMQ=27,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr1	248651985	.	TG	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=187,49;MMQ=27,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:248651985_TG_GC:248651985:3,6,1,1
chr1	248651990	.	T	TTAGCTGAGTCATTGTATGTAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=187,49;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:248651985_TG_GC:248651985:3,6,1,1
chr1	248685544	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,64;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:5,0:10,3:0|1:248685544_C_T:248685544:9,6,1,2
chr1	248685567	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=140,64;MMQ=60,59;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:6,0:8,1:0|1:248685544_C_T:248685544:10,5,1,2
chr1	248685919	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,31;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685922	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,32;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685926	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,30;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685928	.	C	CATGA	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,35;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685933	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,33;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685936	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=20,32;MFRL=74,184;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:248685919_C_T:248685919:1,2,0,1
chr1	248685951	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,20;MFRL=271,74;MMQ=58,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr1	248722722	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=137,122;MMQ=53,21;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.225:20:10,0:6,4:6,10,3,1
chr1	248722883	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:248722883_A_G:248722883:0,0,0,2
chr1	248722888	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:248722883_A_G:248722883:0,0,0,2
chr1	248737293	.	GC	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,125;MMQ=33,48;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,2:5,0,4,0
chr1	248737319	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=151,145;MMQ=52,50;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,5:9,3:10,3,6,2
chr1	248757165	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr1	248789454	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,6,5
chr1	248801944	.	TCAGCACG	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,11:0,0,5,10
chr1	248801982	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=116,126;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:248801982_G_A:248801982:1,2,0,1
chr1	248801984	.	C	CTGGG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=121,105;MMQ=27,27;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.392:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr1	248801986	.	T	TTTGCTTA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=116,126;MMQ=27,27;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,0:1,1:0|1:248801982_G_A:248801982:0,3,0,1
chr1	248813135	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=198,182;MMQ=52,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr1	248814209	.	GAT	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=264,202;MMQ=57,27;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248814209_GAT_G:248814209:0,1,0,1
chr1	248814216	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=264,202;MMQ=57,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:248814209_GAT_G:248814209:0,1,0,1
chr1	249110906	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=218,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:3,2,4,2
chr1	249144376	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=115,75;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:15,7:4,0:15,5,7,1
chr1	249145072	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=183,295;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr1	249149486	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=134,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr1	249212725	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,0,2
chr1	249213360	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=164,103;MMQ=60,56;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:7,2,2,0
chr2	45895	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	224970	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,2:4,1:3,9,0,3
chr2	234130	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,2:2,0:5,2,2,0
chr2	242732	.	T	TAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=213,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAC;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr2	243493	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,36;MFRL=104,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,3:7,3:9,4,5,1
chr2	243504	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,0:7,5:10,6,5,0
chr2	243533	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=159,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:0|1:243533_C_T:243533:14,8,1,1
chr2	243548	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=23,20;MFRL=132,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.130:20:5,0:13,2:0|1:243533_C_T:243533:11,7,1,1
chr2	243567	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=169,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:2,2:15,4:1,16,1,5
chr2	262553	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=180,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,4:0,2:6,0,5,1
chr2	264895	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr2	271998	.	CAAA	C,CA,CAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,34,35,32;MFRL=214,224,247,222;MMQ=60,60,60,60;MPOS=2,17,11;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.15,13.48,24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,3,8,14:0.106,0.261,0.454:30:3,3,4,9:2,0,4,4:2,3,14,11
chr2	275055	.	G	GT,GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35,36;MFRL=334,234,73;MMQ=60,60,60;MPOS=26,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=T;STR;TLOD=8.79,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,2:0.505,0.298:7:0,2,2:1,2,0:1,0,6,0
chr2	276908	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:1,0,9,2
chr2	276942	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:8,1:6,6:6,8,4,3
chr2	283231	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:0,4:1,7:0,1,0,11
chr2	672745	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=186,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:11,0,5,0
chr2	677423	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:0,7,1,5
chr2	906044	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,4:3,3:1,7,2,5
chr2	1079130	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=128,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:0|1:1079130_G_A:1079130:1,0,4,1
chr2	1079132	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=128,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:0|1:1079130_G_A:1079130:1,0,4,1
chr2	1079143	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr2	1079442	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=266,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr2	1093965	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=257,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,21:0.815:25:2,11:2,10:2,2,11,10
chr2	1099065	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=119,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.344:13:5,1:2,2:5,4,1,3
chr2	1099109	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=138,153;MMQ=60,53;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr2	1133188	.	G	GCACA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=CA;STR;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.581:10:2,1:2,5:4,0,5,1
chr2	1168756	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:1,4:0,9:0,1,9,4
chr2	1168865	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,1,1
chr2	1241592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	1243447	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,6:7,1:8,7,6,1
chr2	1251087	.	A	AAAGGTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=181,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0|1:1251087_A_AAAGGTT:1251087:6,1,4,0
chr2	1251088	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=181,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,1:4,2:0|1:1251087_A_AAAGGTT:1251087:6,1,4,0
chr2	1271110	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:3,1:7,1:4,6,1,1
chr2	1271426	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=259,238;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr2	1426787	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,250;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:13,1:8,3:15,6,3,1
chr2	1437410	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr2	1442476	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=218,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	1442551	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:8,0,1,1
chr2	1457364	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	1459806	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=69.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.918:22:0,12:1,9:1,0,14,7
chr2	1488668	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,1,6
chr2	1499728	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:4,1,4,0
chr2	1546327	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=227,152;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,1:5,4:5,8,2,3
chr2	1639151	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,4,2
chr2	1642537	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,12,0
chr2	1642539	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,9:0,3:0|1:1642537_T_C:1642537:0,0,13,0
chr2	1642544	.	CC	TG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,2:1,3:9,0,5,0
chr2	1642545	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,11:0,4:0,0,15,0
chr2	1642680	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:13,3:7,1:10,10,0,4
chr2	1651842	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:4,1:5,0,5,0
chr2	1667310	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	1805430	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=211,108;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:5,3,2,1
chr2	1805489	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=215,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:4,3,3,3
chr2	1844458	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr2	1844464	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=169,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr2	1844652	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=84,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr2	1891188	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=166,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,3:7,0:12,2,2,1
chr2	1891283	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=203,1566;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.197:33:10,0:17,6:17,10,3,3
chr2	1925993	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=186,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr2	1927132	.	CAAGTCA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=256,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	1946914	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=91,161;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.548:24:7,9:2,4:5,6,6,7
chr2	1982915	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=232,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.172:25:10,3:8,1:17,4,1,3
chr2	1983241	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,3:2,8:2,6,7,4
chr2	1983374	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:9,6,0,2
chr2	1983619	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=251,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:1,3,0,4
chr2	3212817	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=299,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	3217908	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,8,7
chr2	3322555	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=213,186;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr2	3322797	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr2	3342009	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=89,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr2	3356953	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,12,3
chr2	3358295	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:9,4,4,2
chr2	3358458	.	ATTATGAAGTTAGAT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,11:0,4:0,0,3,12
chr2	3392513	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	3393565	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:8,1:5,4:3,10,1,5
chr2	3428508	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=225,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr2	3460870	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:2,1,3,0
chr2	3469278	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=327,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	3470186	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=61.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.818:20:1,10:2,7:1,2,5,12
chr2	3470254	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=163,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr2	3481637	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,6:2,3:0,2,0,9
chr2	3481659	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr2	3482722	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=158,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.254:10:2,1:4,1:3,5,2,0
chr2	3482796	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=158,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,2,1
chr2	3482912	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr2	3502709	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=207,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,4:2,9:6,0,10,3
chr2	3502909	.	A	ACTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=243,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.785:7:1,2:0,4:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,1,0,6
chr2	3502910	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=243,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.783:7:1,1:0,3:0|1:3502909_A_ACTT:3502909:0,1,0,6
chr2	3502932	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=226,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	3504819	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=252,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr2	3599700	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,10,1
chr2	3623540	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,8:2,6:1,3,3,11
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chr2	3660856	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,1:7,3:5,4,4,0
chr2	3685046	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.694:21:3,8:3,6:6,0,9,6
chr2	3685074	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,7:3,8:4,3,8,8
chr2	3688836	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:18,3:9,0:15,12,3,0
chr2	3718723	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=90,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,3:8,2:8,5,5,0
chr2	3721766	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=127,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:6,8,0,2
chr2	3730431	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=200,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	3774519	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,7,3
chr2	3800496	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr2	3815532	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=102,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	3826324	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:2,3:7,0:7,2,2,2
chr2	5834249	.	G	GTGA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=364,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGA;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.495:4:1,0:1,2:1,1,1,1
chr2	5834751	.	A	AT	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=123,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.205:17:9,0:5,3:8,6,1,2
chr2	5834798	.	ATTTTT	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,23;MFRL=103,265;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=32,27;RU=T;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,0:0,2,1,1
chr2	5834814	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=265,103;MMQ=50,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:5834814_T_C:5834814:1,1,0,2
chr2	5834817	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=30,35;MFRL=250,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,0:1,2:0|1:5834814_T_C:5834814:1,2,0,2
chr2	5834820	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,35;MFRL=250,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:5834814_T_C:5834814:1,2,0,2
chr2	5834823	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=250,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:1,2:0|1:5834814_T_C:5834814:2,3,0,2
chr2	5834831	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=249,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:0|1:5834814_T_C:5834814:3,3,0,2
chr2	5834833	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=28,17;MFRL=199,265;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:3,0:2,4,1,1
chr2	5835335	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:0|1:5835335_TA_T:5835335:9,0,0,3
chr2	5835352	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=197,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,5:0.299:18:3,3:9,0:1|0:5835335_TA_T:5835335:8,5,5,0
chr2	5835359	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=174,71;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,1:9,0:0|1:5835335_TA_T:5835335:14,2,0,2
chr2	5835564	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.468:17:3,3:4,5:4,5,7,1
chr2	5835697	.	GTTTTT	G,GTTTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32,13;MFRL=390,199,171;MMQ=60,60,60;MPOS=18,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,14,18;RU=T;STR;TLOD=6.35,7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,7:0.198,0.617:11:1,1,1:1,1,0:0,2,2,7
chr2	5835727	.	TC	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,16;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:9,0:5,16,1,1
chr2	5837271	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=227,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:2,3:3,2:4,2,3,3
chr2	5837291	.	G	GACTCTAATGAAAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=212,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:8,6,1,1
chr2	5838030	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=232,136;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:7,6:5,2:7,5,5,3
chr2	5838161	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,5:3,0:4,2,1,4
chr2	5838482	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=35,10;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,0:0|1:5838482_C_G:5838482:16,2,0,2
chr2	5838489	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.163:22:11,0:5,0:0|1:5838482_C_G:5838482:17,2,0,3
chr2	5838492	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,12;MFRL=151,95;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.281:26:11,0:7,1:0|1:5838482_C_G:5838482:16,3,1,6
chr2	5838496	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=145,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.208:27:8,2:10,3:0|1:5838482_C_G:5838482:17,5,0,5
chr2	5838683	.	TAAA	T,TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27,27;MFRL=132,134,224;MMQ=60,60,60;MPOS=15,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=A;STR;TLOD=19.42,9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,7,5:0.400,0.334:16:1,2,3:2,3,2:0,4,6,6
chr2	5839811	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=230,196;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:1,5,0,4
chr2	5839841	.	CTTTTTT	C,CTT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25,25;MFRL=172,227,100;MMQ=60,60,60;MPOS=9,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.38,8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,4:0.306,0.518:7:0,0,1:1,1,3:1,0,3,3
chr2	5840563	.	AAAAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:4,2:9,2:5,8,1,3
chr2	7001233	.	ACG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,172;MMQ=24,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.804:8:1,3:0,3:1,0,6,1
chr2	7005069	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr2	7017903	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	7027323	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,7,15
chr2	7136981	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,2:5,1:5,0,3,0
chr2	7154826	.	A	AT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=200,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:17,0:10,3:10,17,1,2
chr2	7164483	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,5:6,5,4,3
chr2	7179961	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0,11,0,2
chr2	7208324	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=176,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:3,2:7,6:2,8,6,2
chr2	7208422	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=152,244;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,5:3,6:4,3,4,7
chr2	8822912	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=201,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.486:19:3,5:3,4:10,0,2,7
chr2	8870814	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	8871342	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=140,264;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:6,8,1,2
chr2	8890179	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,2:4,0:14,0,2,0
chr2	8910987	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	8911010	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=198,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr2	8916847	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr2	8943291	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr2	8946542	.	T	TAATTGGATTGTTTGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=150,102;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:8946542_T_TAATTGGATTGTTTGTA:8946542:0,4,0,1
chr2	8946545	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=150,102;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:8946542_T_TAATTGGATTGTTTGTA:8946542:0,4,0,1
chr2	8946568	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=129,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,0:0,2:0,7,0,2
chr2	8998775	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=189,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr2	9013489	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=198,88;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:1,10,0,3
chr2	9022603	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=209,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,1:6,2:9,8,2,1
chr2	9419411	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.734:13:2,7:1,3:0|1:9419411_G_A:9419411:3,0,8,2
chr2	9419415	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.733:13:2,7:1,3:0|1:9419411_G_A:9419411:3,0,8,2
chr2	9463454	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,0,15
chr2	9475200	.	TTG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TG;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,2:7,1:14,1,2,1
chr2	9484561	.	TAAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,6;RU=A;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	9496291	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=147,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,3:9,4:7,12,4,3
chr2	9499046	.	T	TAGAATGCCAAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:0|1:9499046_T_TAGAATGCCAAAA:9499046:2,12,0,2
chr2	9499048	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:7,0:6,1:0|1:9499046_T_TAGAATGCCAAAA:9499046:2,12,0,2
chr2	9528607	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,142;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=34.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:9,0:9,12:2,16,0,12
chr2	9543410	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:7,8,2,0
chr2	9554255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,8:6,4:3,5,7,5
chr2	9554280	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=117,266;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:4,4:17,1:9,12,2,3
chr2	9554461	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=210,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,3:3,5:0,6,1,7
chr2	9569972	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=258,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr2	9571054	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=293,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,1,3
chr2	9572872	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr2	9580540	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	9616035	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:5,8:3,13:6,2,12,9
chr2	9630231	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	9630244	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=130,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	9631340	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:0,8,1,2
chr2	9633137	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,6:5,3:6,4,2,7
chr2	9642478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	9657947	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.403:15:5,5:4,1:9,0,5,1
chr2	9667891	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=149,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:10,3,1,1
chr2	9728406	.	T	TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=135,40;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.128:36:16,4:16,0:0|1:9728406_T_TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC:9728406:13,19,2,2
chr2	9728408	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=135,40;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,4:0.130:36:16,4:16,0:0|1:9728406_T_TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC:9728406:13,19,2,2
chr2	9728412	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=135,40;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,1:17,0:0|1:9728406_T_TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC:9728406:12,20,1,2
chr2	9983591	.	A	AG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=86.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,14:0,13:0,0,20,8
chr2	9986162	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=222,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,13:0.451:29:5,7:11,6:10,6,6,7
chr2	9989570	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=181,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:4,2:2,2:2,5,0,4
chr2	10023016	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=290,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	10044941	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=200,217;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:2,1:4,2:0|1:10044941_G_T:10044941:5,2,3,0
chr2	10044951	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=218,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,6:0.638:9:1,1:1,5:1|0:10044941_G_T:10044941:2,1,4,2
chr2	10045147	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=85.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,7,19
chr2	10051053	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=62.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.715:26:4,6:3,13:1,6,6,13
chr2	10051792	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=209,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,1:4,6:0,5,0,7
chr2	10059097	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:8,0,1,1
chr2	10094992	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=178,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:4,7:1,9:5,0,16,0
chr2	10095103	.	C	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.285:47:12,10:21,3:15,19,5,8
chr2	10126416	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,1:5,3:2,6,1,4
chr2	10135956	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:11,0,2,0
chr2	10140651	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,5:1,3:2,1,6,2
chr2	10183748	.	TGCC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=291,259;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCC;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr2	10225241	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,7,10
chr2	10226306	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=160,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr2	10267078	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=122,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:13,1:2,1:9,7,2,0
chr2	10268962	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=156,289112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:13,0:3,3:9,7,3,0
chr2	10281903	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr2	10563236	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=142,206;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:0,8:2,12:0,2,14,7
chr2	10563297	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr2	10566804	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=168,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:7,5,2,0
chr2	10566864	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=170,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,2:9,1:12,8,2,1
chr2	10583523	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,1:14,1:7,14,1,1
chr2	10583735	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:7,1:8,5:8,7,2,4
chr2	10583989	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,224;MMQ=60,54;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:10,3:13,0:9,16,0,3
chr2	10595534	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=171,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:6,6:10,6:12,4,7,5
chr2	10717714	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:6,2,8,0
chr2	10729897	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr2	10743153	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=137,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:8,4,5,1
chr2	10743191	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:7,4:9,4:13,3,6,2
chr2	10762302	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,2,13
chr2	10808776	.	C	CAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=127.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,15:0,15:0,0,19,13
chr2	10811657	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:6,10,3,0
chr2	10813782	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	10911891	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,0:1,3:3,0,3,0
chr2	10912092	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=229,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,1:0,5:1,1,3,3
chr2	10914867	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=242,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.345:7:1,1:2,1:4,1,2,0
chr2	10922516	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=205,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:2,5,0,4
chr2	10924524	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	10927345	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,5:1,3:2,2,8,0
chr2	10928777	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,9:1,6:0,1,10,5
chr2	10928906	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=168,196;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,11:1,8:1,0,9,11
chr2	10928962	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,6,5
chr2	10929133	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,8:1,7:1,0,5,10
chr2	10929867	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=68.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:1,9:0,13:1,0,15,7
chr2	10930050	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:1,0,2,7
chr2	10930106	.	ATTT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.860:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	10931001	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	10931046	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,268;MMQ=60,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	10932082	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,3,7
chr2	10933195	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:2,7:3,4:4,1,10,1
chr2	10933421	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	10942567	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr2	10942644	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,112;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,0:12,3:12,6,3,0
chr2	10959292	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr2	10959461	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,4:4,3:4,9,3,4
chr2	10959475	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:8,4:3,2:3,8,3,3
chr2	10987572	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	10994418	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	11300732	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=204,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,24:0.782:30:4,15:2,9:4,2,11,13
chr2	11300869	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=20,29;MFRL=80,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:2,9:0,10:1,1,5,15
chr2	11300927	.	TAAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=10,10;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,0:0,1:0,1,0,5
chr2	11312016	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=127,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:4,2,1,2
chr2	11312181	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr2	11312224	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	11334037	.	TATTA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=217,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	11348364	.	C	CTAACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=300,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:1,4:0,1:1,0,6,0
chr2	11348609	.	CAAAT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=300,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,4:0,4:0,1,0,8
chr2	11355237	.	AAC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=164,152;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:6,9,0,3
chr2	11356190	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:1,8:1,2:2,0,6,4
chr2	11359031	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	11597454	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	11716433	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=132,0;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:4,1:3,1:6,4,1,1
chr2	11716463	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=130,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:15,2:12,0:13,14,0,2
chr2	11718591	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:3,5,2,2
chr2	11720858	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=180,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:5,1:4,10,1,1
chr2	11720986	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,231;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:5,1:5,1:4,6,1,1
chr2	11725241	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=105,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,5:7,5:10,4,7,3
chr2	11725947	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=116,272;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,6:1,4:6,2,2,8
chr2	11726061	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=193,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.323:10:3,2:4,1:2,5,2,1
chr2	11729096	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=171,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr2	11736229	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=139,158;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:8,2:9,0:0|1:11736229_T_A:11736229:11,7,3,0
chr2	11736234	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=139,158;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:8,3:8,0:0|1:11736229_T_A:11736229:10,7,3,0
chr2	11736305	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,1:3,3:4,4,2,2
chr2	11738765	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	11741193	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	11742458	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=215,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,5:2,2:2,0,7,0
chr2	11750918	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:5,2:4,0:8,1,2,0
chr2	11751166	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:3,1:11,1:7,9,1,1
chr2	11755443	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,1,3
chr2	11905636	.	GT	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.821:26:1,7:3,14:4,0,17,5
chr2	11905648	.	C	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=185,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.201:38:11,7:17,0:21,10,7,0
chr2	11905857	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:12,2:13,0:7,18,1,1
chr2	11905876	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=172,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:5,4:5,9:3,7,5,8
chr2	11924950	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:1,0,5,3
chr2	11931931	.	A	AT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:8,4:10,5:8,10,6,3
chr2	11932074	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:17,0:10,3:9,18,0,4
chr2	11932173	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,5:1,8:0,1,0,13
chr2	11936798	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=217,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,5:2,7:2,0,11,1
chr2	11937047	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=149,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:3,7,0,2
chr2	11944746	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=121,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr2	11945108	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=239,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.642:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	12863770	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:0,13,0,3
chr2	12865048	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr2	14776975	.	CTTTCTT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,46;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTCTT;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:11,1:10,1:15,9,1,1
chr2	14778525	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=172,80;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:12,3:10,0:12,10,1,2
chr2	14779227	.	T	TAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=102,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=AC;STR;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.435:14:3,1:4,3:4,4,4,2
chr2	14780256	.	AT	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	15319070	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.265:16:6,0:2,4:9,3,4,0
chr2	15359124	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,0:8,7:2,14,0,7
chr2	15378822	.	G	GAATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=52.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr2	15427173	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:6,3:5,1:6,6,3,1
chr2	15448311	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:4,4,3,3
chr2	15468025	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=190,102;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:8,1:2,2:2,8,0,3
chr2	15492018	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=175,114;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,2:4,0:8,0,2,0
chr2	15493881	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr2	15519992	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr2	15523266	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr2	15523307	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,8:0,0,15,4
chr2	15533689	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	15533734	.	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAATGAAAGCGTATGTCTACAC;STR;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,1:0,4:0,0,8,5
chr2	15533779	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,15:0,0,13,9
chr2	15533884	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,4,8
chr2	15533895	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,3,8
chr2	15533899	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,3:0,5:0|1:15533884_C_A:15533884:0,0,2,7
chr2	15536509	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.220:17:6,2:6,1:12,2,3,0
chr2	15555651	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,319;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,1,1
chr2	15601287	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,16,3
chr2	15608013	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	15616013	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,3,13
chr2	15616030	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,7:1,6:0,1,1,12
chr2	15623608	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	15644401	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	15676456	.	CAA	C,CA,CAAA,CAAAA	.	.	DP=454;ECNT=1;MBQ=32,32,32,33,32;MFRL=221,278,221,231,225;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=14,20,12,17;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,12,13;RU=A;STR;TLOD=11.63,103.85,15.86,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:263,9,62,17,4:0.026,0.171,0.048,0.013:355:131,3,27,9,3:130,6,35,8,0:252,11,83,9
chr2	15676686	.	G	A	.	.	DP=698;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=181,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=1736.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,652:0.997:653:1,320:0,322:0,1,96,556
chr2	15676703	.	TAA	T,TA,TAAA,TAAAA	.	.	DP=551;ECNT=2;MBQ=17,29,17,15,15;MFRL=220,230,227,223,206;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=19,21,20,18;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=8.23,60.31,70.40,17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:271,8,45,52,17:0.019,0.110,0.138,0.044:393:57,2,9,6,1:74,6,12,16,3:5,266,6,116
chr2	15694164	.	T	TA	.	.	DP=1022;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=228,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3775.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,955:0.998:956:0,471:1,451:1,0,669,286
chr2	15697051	.	TA	T,TAA	.	.	DP=781;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=207,263,204;MMQ=60,60,60;MPOS=23,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=A;STR;TLOD=9.35,5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:599,12,12:0.019,0.018:623:310,8,7:286,4,4:64,535,1,23
chr2	15701212	.	A	C	.	.	DP=92;ECNT=2;MBQ=18,31;MFRL=217,264;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:79,8:0.099:87:12,3:10,5:71,8,8,0
chr2	15701216	.	A	C	.	.	DP=151;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=223,266;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:104,14:0.104:118:44,3:31,5:95,9,14,0
chr2	15731998	.	A	G	.	.	DP=777;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=205,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=2322.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,706:0.989:715:4,336:3,365:7,2,591,115
chr2	15735419	.	G	A	.	.	DP=976;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=188,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=2922.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,915:0.989:924:6,451:3,460:1,8,297,618
chr2	15735430	.	G	GT	.	.	DP=989;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=227,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:775,10:0.013:785:372,4:400,6:282,493,3,7
chr2	15742587	.	AT	A,ATT	.	.	DP=1155;ECNT=1;MBQ=29,28,28;MFRL=213,210,190;MMQ=60,60,60;MPOS=10,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=T;STR;TLOD=10.41,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:921,15,15:0.015,0.016:951:465,7,6:442,7,7:774,147,26,4
chr2	15744484	.	CT	C	.	.	DP=545;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=1678.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,495:0.987:501:2,252:3,231:5,1,475,20
chr2	15746047	.	ATC	A	.	.	DP=932;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=209,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=58.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:715,32:0.043:747:341,18:337,14:516,199,26,6
chr2	15753307	.	ATT	A,AT,ATTT,ATTTT	.	.	DP=1041;ECNT=1;MBQ=30,30,30,28,28;MFRL=208,176,199,214,186;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=15,12,6,2;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=28.93,179.36,94.54,21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:512,24,126,71,20:0.027,0.153,0.113,0.030:753:265,10,78,37,8:234,14,44,33,6:387,125,200,41
chr2	15768846	.	AT	A	.	.	DP=1736;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=207,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1463,24:0.015:1487:748,17:646,5:779,684,8,16
chr2	15768876	.	G	A	.	.	DP=1695;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5013.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,1581:0.991:1596:8,812:7,762:8,7,833,748
chr2	16082088	.	GC	G	.	.	DP=715;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=233,290;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:614,9:0.015:623:301,6:293,3:565,49,9,0
chr2	16082103	.	GC	G	.	.	DP=742;ECNT=4;MBQ=27,29;MFRL=223,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:629,9:0.013:638:304,5:298,4:578,51,8,1
chr2	16082110	.	A	C	.	.	DP=771;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=218,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:563,136:0.124:699:121,7:174,1:499,64,136,0
chr2	16082123	.	A	C	.	.	DP=823;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=216,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:684,75:0.027:759:228,1:253,2:608,76,75,0
chr2	16082313	.	AC	A	.	.	DP=1754;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=213,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1442,29:0.020:1471:730,16:645,12:679,763,13,16
chr2	16086264	.	AT	A,ATT	.	.	DP=1564;ECNT=1;MBQ=27,27,28;MFRL=222,220,228;MMQ=60,60,60;MPOS=20,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=53.92,21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1062,53,29:0.042,0.024:1144:515,25,12:535,28,15:155,907,13,69
chr2	16734284	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:6,4:8,7:6,8,6,5
chr2	16734295	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=175,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,3:10,5:8,9,4,4
chr2	16743287	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:14,1:13,1:20,8,2,0
chr2	16743453	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=231,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr2	16746897	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=127,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:9,6:4,3:3,10,2,7
chr2	17773524	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=216,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=39.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,10:4,5:3,5,3,12
chr2	17883218	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1,6,0,4
chr2	17888457	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:5,2:10,3:10,6,4,1
chr2	17890091	.	G	GTATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TA;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	17898326	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,273;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,3:4,2:8,5,2,3
chr2	17899558	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=161,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr2	17899584	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=190,286;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr2	17927275	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:0,2,0,8
chr2	17941423	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=214,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr2	17950049	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,176;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:12,11:9,0:9,12,11,0
chr2	17954140	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	17954647	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:5,3:1,5:0,6,1,7
chr2	17959420	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:0,2:0|1:17959420_TAC_T:17959420:0,1,0,4
chr2	17959443	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0|1:17959420_TAC_T:17959420:0,1,0,4
chr2	18114295	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,35;MFRL=384,323;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.529:2:0,0:0,1:1,0,0,1
chr2	18758121	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:6,0:12,6:8,11,0,6
chr2	18765728	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=240,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,5:5,3:5,1,7,1
chr2	18766123	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=172,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:2,3,0,3
chr2	18766156	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0,5,0,2
chr2	20097721	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:15,5:8,0:13,10,5,0
chr2	20113221	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=215,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	20131079	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,2:7,5:5,5,4,4
chr2	20131184	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr2	20166496	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=120,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,1:5,3:9,5,3,1
chr2	20173255	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=126,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr2	20175368	.	AC	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=155,96;MMQ=60,56;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,0:10,2:12,12,0,2
chr2	20189089	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.457:15:4,3:4,2:1,7,1,6
chr2	20201930	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=243,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr2	20205423	.	A	AAAAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=219,277;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,2:9,0:12,0,2,0
chr2	20212322	.	GGCA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	20251070	.	T	TGCCC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.697:8:2,3:0,2:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:2,0,6,0
chr2	20251075	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:0,0,7,0
chr2	20251080	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=206,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,4:0,1:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:1,0,7,0
chr2	20251083	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=34,18;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:0,0:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:1,1,4,0
chr2	20251087	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,1:0|1:20251070_T_TGCCC:20251070:1,1,4,0
chr2	20403794	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,5,10
chr2	20405041	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,0:0,3:5,0,3,0
chr2	20405050	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	20455176	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=221,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:0,2:0,1:0,2,0,4
chr2	20648933	.	AT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,27,28,28;MFRL=199,191,115,158;MMQ=60,60,60,60;MPOS=8,19,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.73,22.14,5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,4,13,4:0.123,0.479,0.153:28:2,3,6,1:5,1,6,1:5,2,14,7
chr2	20699667	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=95,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,7:1,3:3,2,7,3
chr2	20699814	.	GC	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=170,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.425:24:7,5:6,5:7,7,7,3
chr2	20700900	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr2	20701120	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,221;MMQ=40,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr2	20792087	.	T	TAA	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:20792087_T_TAA:20792087:0,0,1,0
chr2	20792093	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:20792087_T_TAA:20792087:1,0,1,0
chr2	20792098	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:20792087_T_TAA:20792087:1,0,1,0
chr2	20792103	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:20792087_T_TAA:20792087:1,0,1,0
chr2	20823612	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=105,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.837:16:2,5:0,9:1,1,8,6
chr2	20823724	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,7:0,8:0,0,11,4
chr2	20823816	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=172,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:0,5,1,3
chr2	20823850	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	20824658	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:5,7:2,9:3,4,5,11
chr2	20824708	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=188,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,3:1,7:0,4,1,9
chr2	20845273	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=255,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,5:0,0:0,1,1,4
chr2	20871190	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,6,7
chr2	20884550	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=191,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,1,1
chr2	21224853	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:6,5,2,3
chr2	21225629	.	C	CCCGCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=214,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:6,2:6,0:0|1:21225629_C_CCCGCT:21225629:6,6,1,1
chr2	21225632	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=214,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:21225629_C_CCCGCT:21225629:6,6,1,1
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chr2	21232195	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,183;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:8,3,2,4
chr2	21233832	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=190,182;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,0:6,4:7,7,0,4
chr2	21236482	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr2	21237238	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=129,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	21245813	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,5:10,2:9,5,5,2
chr2	21265141	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=241,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,6:1,0:3,0,4,2
chr2	21361576	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,83;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,1:8,2:6,12,1,2
chr2	21365965	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,72;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,3:10,0:8,11,2,1
chr2	23698353	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=202,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	23698467	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:11,3:19,0:14,16,0,3
chr2	23862187	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=224,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:2,8,0,3
chr2	23865139	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,0:5,4:7,0,4,0
chr2	23865176	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:8,3,3,2
chr2	23914776	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=253,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,2:1,1:0,7,1,2
chr2	23916038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=212,301;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:5,0,2,0
chr2	23925980	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:4,0,5,1
chr2	24009163	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=247,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr2	24021231	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:1,9,0,2
chr2	24042550	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	24046471	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr2	24087771	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,0:9,7:5,13,0,7
chr2	24110611	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr2	24194314	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,2:5,5:2,7,1,6
chr2	24222649	.	T	TGAAAACACACACACACACA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:4,3,0,2
chr2	24246175	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=240,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr2	24246679	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,316;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:0,2,0,8
chr2	24255862	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr2	24276736	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,55;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,1:3,7,1,4
chr2	24342352	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,0,2
chr2	24360925	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:0,7:7,3:5,2,4,6
chr2	24384553	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,0:0,6:0,5,0,7
chr2	24387178	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,2,9
chr2	24398281	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	24400769	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:3,10,0,3
chr2	24402127	.	C	CAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=93.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,9:0,12:0,0,7,14
chr2	24429234	.	CCCGGCGGGAAGGAAGGTGGAGATGCAGGGGG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=250,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.447:9:1,0:2,3:0,5,0,4
chr2	24432620	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	24432667	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr2	24475205	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=64.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,6:0,12:0,0,10,8
chr2	24484150	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr2	24521493	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,0:0,0,2,2
chr2	24521766	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	24550867	.	CAA	C,CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=111,188,198;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=8.69,9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,4:0.456,0.391:10:0,4,3:1,1,1:1,0,7,2
chr2	24896389	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr2	24929516	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:10,0:13,2:13,10,0,2
chr2	24949602	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:10,1:4,3:5,9,2,2
chr2	24952740	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	24952754	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=323,122;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24952754_A_G:24952754:0,2,0,1
chr2	24952756	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=323,122;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:24952754_A_G:24952754:0,2,0,1
chr2	24962252	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=124,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:5,4,3,0
chr2	24974945	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,16,8
chr2	24985621	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:7,2:10,0:8,9,2,0
chr2	25013523	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=212,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr2	25038268	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,8,0
chr2	25045458	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:9,0:18,2:12,17,2,0
chr2	25046297	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=215,103;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:1,6,0,2
chr2	25047408	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,8:2,5:2,4,3,10
chr2	25048847	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr2	25061270	.	GGGGTGGGGT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=125,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GGGTGGGGT;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	25061810	.	ATTT	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=166,186;MMQ=50,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr2	25061827	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr2	25061858	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=234,177;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,1:0|1:25061858_A_C:25061858:0,3,0,1
chr2	25061868	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=234,177;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:25061858_A_C:25061858:0,3,0,1
chr2	25064079	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,251;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,0:3,0,3,0
chr2	25065106	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:10,1,2,0
chr2	25100738	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,5:5,4:8,2,6,3
chr2	25100902	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:3,7:3,3:0,6,1,9
chr2	25458546	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:2,6:6,4:6,2,7,3
chr2	25462478	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=186,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:0|1:25462478_C_A:25462478:0,2,1,1
chr2	25462484	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=138,209;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:25462478_C_A:25462478:0,2,0,1
chr2	25462493	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1|0:25462478_C_A:25462478:0,3,0,1
chr2	25463483	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,2:6,4:7,5,3,3
chr2	25466888	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=399,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,9:1,5:0,1,5,9
chr2	25469913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=243,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:0,6:1,3:0,1,5,4
chr2	25551692	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=216,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:1,3,0,5
chr2	25602142	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.505:18:3,4:5,5:6,3,7,2
chr2	25602310	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,292;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	25610287	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=144,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:2,6,1,3
chr2	25642294	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:13,0,3,1
chr2	25656880	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,12:0,4:0,0,5,11
chr2	25875585	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.269:12:4,2:4,0:0,9,0,3
chr2	25973309	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=172,75;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	25994412	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=204,57;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.181:15:4,1:9,1:3,10,0,2
chr2	26203678	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,12:0,5:0,0,5,12
chr2	26203942	.	GCAC	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAC;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,1:12,2:12,13,2,1
chr2	26350136	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=235,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,7:0,6:0,1,5,8
chr2	26357748	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,8,5
chr2	26405985	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	26410086	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,65;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:12,0,2,0
chr2	26417533	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,10:0,0,8,11
chr2	26420708	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr2	26454996	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr2	26477125	.	G	GACT	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACT;STR;TLOD=117.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.969:27:0,9:0,15:0,0,15,12
chr2	26499990	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=179,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.089:42:25,0:14,3:24,15,3,0
chr2	26500098	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:0,0:1,0:1,2,0,3
chr2	26532491	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,7:2,3:0,3,1,9
chr2	26533023	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=136,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.311:27:11,4:8,4:6,13,3,5
chr2	26536555	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	26537499	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=98.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,14:0,12:0,0,14,12
chr2	26539806	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=137,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:16,2:11,1:12,15,2,1
chr2	26587076	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=210,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,1:3,0:5,0,3,0
chr2	26590084	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:3,4,2,3
chr2	26590118	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=216,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:1,3,0,4
chr2	26609176	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,3:4,0:8,0,3,0
chr2	26609469	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=234,162;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,7:3,0:0,6,0,7
chr2	26625042	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=201,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	26652671	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr2	26653826	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:1,0:0|1:26653826_CT_C:26653826:1,2,0,1
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chr2	26663187	.	T	TTG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=277,159;MMQ=60,56;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=TG;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	26671389	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=124,111;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:9,0:3,3:1,12,0,3
chr2	26671544	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,288;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,4:2,4:2,1,6,2
chr2	26679394	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,4:4,4:7,5,4,4
chr2	26689600	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=199,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:3,3:11,0:5,9,1,2
chr2	26691352	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=128,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,11:0.248:45:23,0:10,10:9,25,0,11
chr2	26726752	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:5,5:7,8:3,9,1,12
chr2	26739247	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,10,4
chr2	26750645	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,20,1
chr2	26781418	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:6,7,0,3
chr2	26799091	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=197,285;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	26801586	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:2,1,3,2
chr2	26801795	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=251,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:1,1,0,4
chr2	26804122	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=187,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:2,3:2,6:4,0,9,1
chr2	26804143	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,13,2
chr2	26818006	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=270,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,6:1,7:0,1,12,1
chr2	26818021	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:0,6:4,8:3,1,11,3
chr2	26863503	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.492:10:3,3:2,1:0,5,0,5
chr2	26951449	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	26997042	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr2	27014980	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,251;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:4,6,2,1
chr2	27015118	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,3:6,3:2,8,2,4
chr2	27015141	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:1,2:6,2:1,6,2,2
chr2	27015969	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=252,130;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.371:11:3,2:4,1:7,0,4,0
chr2	27156017	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=192,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:10,1,0,2
chr2	27157396	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=221,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:2,3:0,1:2,0,5,0
chr2	27157400	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	27164806	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.576:24:4,7:6,7:7,3,8,6
chr2	27167784	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=247,276;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr2	27249245	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,1:5,4:2,6,1,4
chr2	27262763	.	GGGA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=48.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr2	27263122	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=222,243;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	27276202	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=258,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,2:5,1:5,3,1,2
chr2	27279416	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	27280092	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=309,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr2	27280127	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:8,3:5,3:12,2,5,1
chr2	27291661	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=246,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr2	27292651	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:0,4,0,8
chr2	27293150	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=214,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.394:23:5,4:9,4:7,7,5,4
chr2	27302165	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,5:2,1:0,3,0,6
chr2	27307769	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=195,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:7,0,2,0
chr2	27327272	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.223:19:11,2:4,1:8,7,2,2
chr2	27327581	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:0|1:27327581_A_C:27327581:3,9,1,1
chr2	27327584	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:27327581_A_C:27327581:3,9,1,1
chr2	27351279	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:9,1,2,1
chr2	27354173	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,7,1
chr2	27354971	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,1:9,3:10,8,4,0
chr2	27355422	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=18,12;MFRL=238,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.628:9:0,1:1,0:2,1,6,0
chr2	27355425	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=233,273;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.438:9:2,0:2,0:0|1:27355425_A_C:27355425:4,1,4,0
chr2	27355427	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=22,12;MFRL=233,273;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.438:9:1,0:2,0:0|1:27355425_A_C:27355425:4,1,4,0
chr2	27355454	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr2	27356278	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:4,1:3,2:5,3,3,0
chr2	27360804	.	G	GA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=145,164;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.177:32:16,0:11,5:21,6,0,5
chr2	27424496	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	27424962	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=138,89;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:13,2:0|1:27424962_AG_A:27424962:10,11,0,2
chr2	27424968	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=149,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:11,2:0|1:27424962_AG_A:27424962:10,10,0,2
chr2	27428147	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr2	27428815	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,8:1,7:1,0,15,0
chr2	27435374	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=243,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr2	27438710	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=148,265;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,4:6,0:5,5,0,4
chr2	27439372	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=205,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:6,7:6,0:11,1,6,2
chr2	27440742	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:14,4:8,2:8,14,2,4
chr2	27445315	.	G	GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=60.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:2,11:5,8:4,3,10,9
chr2	27448184	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=303,105;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27448184_T_C:27448184:0,3,0,1
chr2	27448187	.	T	TCC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=303,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:27448184_T_C:27448184:0,3,0,1
chr2	27449293	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=179,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:4,6:4,5:2,6,7,4
chr2	27462405	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=180,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:4,1:1,2:2,3,0,3
chr2	27464680	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	27466258	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=211,304;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=21,18;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,1:1,1:2,0,1,2
chr2	27481522	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,11;MFRL=215,210;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:27481522_C_A:27481522:1,0,1,0
chr2	27481524	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=215,210;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:27481522_C_A:27481522:1,0,1,0
chr2	27481527	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,16;MFRL=0,210;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27481522_C_A:27481522:0,0,1,0
chr2	27481532	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:27481522_C_A:27481522:0,0,1,0
chr2	27481535	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,15;MFRL=0,210;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:27481522_C_A:27481522:0,0,1,0
chr2	27505782	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,5:3,1:2,7,2,4
chr2	27528692	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=101,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:2,2,0,2
chr2	27532869	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,16:0.411:38:17,0:5,12:0|1:27532869_C_T:27532869:13,9,0,16
chr2	27532870	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=236,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,10:0.256:39:10,5:17,3:1|0:27532869_C_T:27532869:6,23,7,3
chr2	27535311	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=61.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,8:0,0,9,9
chr2	27549833	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=241,289;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr2	27550229	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=186,199;MMQ=60,30;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr2	27550967	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:1,3:9,4:6,4,2,5
chr2	27556721	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:3,4,2,3
chr2	27587266	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=115,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:3,0:15,2:9,9,2,0
chr2	27589651	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,161;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:12,6:12,0:7,17,6,0
chr2	27589810	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:4,3:4,5:2,7,1,7
chr2	27591804	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:6,0,4,0
chr2	27592423	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=98,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.249:34:12,3:14,5:5,21,2,6
chr2	27597190	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.279:20:7,2:6,3:12,3,5,0
chr2	27597620	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,2:7,1:8,10,1,2
chr2	27598097	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,163;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,2:1,4:0,2,0,7
chr2	27599132	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,249;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:7,3:16,2:12,11,2,3
chr2	27601052	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr2	27656822	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,0:7,3:6,6,1,3
chr2	27657681	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:1,7,1,4
chr2	27659832	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.228:22:5,2:11,3:10,7,3,2
chr2	27663215	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:5,3,1,2
chr2	27663416	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,1:5,1:5,6,1,1
chr2	27665361	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:3,6,0,4
chr2	27670307	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr2	27681598	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=132,259;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:6,2:0,3:5,1,5,0
chr2	27684734	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=84,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:4,6,0,4
chr2	27688601	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=105,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:2,1:5,2:4,3,3,1
chr2	27706056	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr2	27715207	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=180,289;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:5,2:2,1:8,0,3,0
chr2	27715416	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,270;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,3:6,3:3,6,3,3
chr2	27720321	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=227,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.146:19:2,0:11,2:4,13,0,2
chr2	27721510	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,5:7,0:15,0,5,0
chr2	27721971	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=147,315;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:8,1,1,2
chr2	27722416	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	27729480	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,269;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:5,4,3,4
chr2	27804432	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=228,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.649:31:0,8:8,10:5,6,10,10
chr2	27830990	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr2	27839107	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,7:2,6:3,0,7,6
chr2	27849810	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,228;MMQ=52,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,3:11,2:11,11,3,2
chr2	27852117	.	A	AGGTCTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=237,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:1,3:5,6:0|1:27852117_A_AGGTCTT:27852117:2,4,1,9
chr2	27852118	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=237,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:1,2:5,6:0|1:27852117_A_AGGTCTT:27852117:2,4,1,9
chr2	27852150	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=234,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:8,7,2,1
chr2	27852637	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=234,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:7,0,8,0
chr2	27855397	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr2	27857992	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=47.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,19:0.513:37:14,10:4,9:15,3,15,4
chr2	27858167	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=216,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:1,1:0,1,0,2
chr2	27861707	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=144,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,2:3,7:7,1,8,1
chr2	27888086	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,3:0.085:45:22,3:20,0:24,18,3,0
chr2	27892023	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=214,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.384:6:3,0:1,2:3,1,2,0
chr2	27898467	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=152,98;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:10,0:13,2:12,11,0,2
chr2	27900569	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:1,5:2,2:3,1,5,2
chr2	27910706	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:4,3:8,6:11,1,9,0
chr2	27997428	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:9,1:10,3:6,13,2,2
chr2	28467620	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:6,5:8,0:14,1,5,0
chr2	28718897	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,290;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,12,0
chr2	28748857	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr2	28748916	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=229,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	28752498	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	28752555	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=54.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr2	28752727	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,12
chr2	28752741	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=43.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,6:0,3:0|1:28752727_C_G:28752727:0,0,0,10
chr2	28761257	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=106.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,18:0,13:0,0,5,26
chr2	28761282	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=78.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,12:0,9:0,0,1,22
chr2	28763374	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr2	28766254	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,4:1,6:0,1,0,10
chr2	28771452	.	CTA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr2	28771624	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,6,1
chr2	28771897	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=190,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,0:6,4:0,7,0,4
chr2	28773037	.	G	GTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,166;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.631:6:1,3:1,0:0,2,0,4
chr2	28795962	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=236,230;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	28800894	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=141,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:6,0,2,1
chr2	28804836	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=200,182;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr2	28816814	.	C	CTTT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=280,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=T;STR;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.695:18:2,7:2,4:3,2,11,2
chr2	28816948	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=85.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,31:0.696:44:7,9:6,22:3,10,16,15
chr2	28821662	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=73.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,8,16
chr2	28824303	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	28824940	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,268;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,1,3
chr2	28825607	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=201,225;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,1:5,4:10,0,5,0
chr2	28827625	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=167,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.418:29:8,9:9,3:5,12,6,6
chr2	28827644	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:7,6:10,2:4,13,3,5
chr2	28828908	.	G	GATAAAAAAGAGGCTGGGACCATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:1,1:0,0:0,2,0,1
chr2	28840691	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,8:5,5:2,6,1,12
chr2	28843871	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:13,3:3,5:6,10,3,5
chr2	28843909	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=165,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:2,1:1,8,0,2
chr2	28847806	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:5,4:0,2:5,0,6,0
chr2	28849461	.	CCCCGAGCTCCTTGCT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=94,239;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.643:9:1,2:2,4:2,1,0,6
chr2	28853352	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr2	28853377	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=178,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr2	28854816	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:5,0,6,0
chr2	28855918	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=59.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,2,15
chr2	28863738	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:3,1,4,1
chr2	28865968	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0|1:28865968_T_C:28865968:0,0,4,8
chr2	28865977	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=232,58;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.361:9:5,2:1,1:0|1:28865968_T_C:28865968:2,4,1,2
chr2	28975107	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,4:2,0:0,5,0,4
chr2	29001991	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,277;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr2	29004734	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:5,1:2,1:2,5,0,2
chr2	29004798	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr2	29045323	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr2	29052256	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,18685932;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	29052283	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,14;MFRL=227,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr2	29075170	.	T	TGAGAC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,253;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	29075178	.	CAAAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=201,251;MMQ=50,59;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.410:3:1,1:0,0:1,1,1,0
chr2	29075208	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,21;MFRL=284,253;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:2,1,2,0
chr2	29087814	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=300,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr2	29129300	.	ATT	A,AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30,30;MFRL=166,133,175;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.84,7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.214,0.474:10:0,0,2:3,2,3:2,1,6,1
chr2	29140711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	29145681	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,11;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:0,0:1,0,4,0
chr2	29145687	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,15;MFRL=164,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:0,0:3,0,2,0
chr2	29145698	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=16,16;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:1,0:4,2,2,0
chr2	29145725	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=104,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:3,3,1,4
chr2	29149282	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:13,0,2,1
chr2	29152376	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:4,1,5,0
chr2	29169194	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=237,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr2	29226343	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=208,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:9,5,2,1
chr2	29226559	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=154,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,2:7,3:6,7,2,3
chr2	29237448	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,2:5,0:3,8,0,2
chr2	29239942	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=162,229;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:7,1,2,0
chr2	29240005	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=155,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,4:4,3:10,3,3,4
chr2	29240582	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:6,2:3,2:9,0,4,0
chr2	29245075	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,2:12,0:13,15,0,2
chr2	29249903	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,2:5,3:1,8,0,5
chr2	29274704	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=187,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,3:7,2:9,5,4,1
chr2	29274720	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=203,203;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.289:19:7,3:5,2:8,6,4,1
chr2	29287708	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr2	29287926	.	C	CGCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GCT;STR;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,3:0,5:0,0,3,6
chr2	29295389	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:5,6:5,2:4,7,7,1
chr2	29295866	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:8,5:10,3:10,8,3,5
chr2	29296984	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=206,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,4:7,0:4,13,2,2
chr2	29356728	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr2	29366830	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=167,260;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:3,3:9,2:2,10,1,4
chr2	29366875	.	C	CACAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=40.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,1,9
chr2	29383374	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,6:1,8:0,1,4,10
chr2	29386646	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:7,5,3,0
chr2	29390299	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=214,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,2:3,2:7,1,0,4
chr2	29416025	.	C	CATTG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATTG;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,1:6,2:12,1,2,1
chr2	29416794	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:5,2:10,5:6,9,2,5
chr2	29419591	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:7,2,3,0
chr2	29446128	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=222,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr2	29446184	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=192,240;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,0:8,4:11,2,4,0
chr2	29449697	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=216,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr2	29455267	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.571:16:5,6:0,3:3,4,4,5
chr2	29498210	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr2	29917940	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	30379557	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=151,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.279:41:12,0:18,11:18,12,0,11
chr2	30379574	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.299:38:10,0:17,10:13,14,0,11
chr2	30454501	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,1:6,2:9,1,3,0
chr2	30682470	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:16,2:13,1:15,14,1,2
chr2	30682630	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=162,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,4:5,1:4,5,0,5
chr2	30756196	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,6:2,3:1,8,2,7
chr2	30828792	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:0,3:2,3:2,0,7,0
chr2	30955528	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=259,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	30959262	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=230,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:4,2:4,0,5,0
chr2	30977073	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=204,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	30986989	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr2	30987143	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:15,0:4,2:9,10,0,2
chr2	31009977	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=251,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,4:4,5:3,4,6,3
chr2	31133939	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:1,7,0,3
chr2	31189236	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=300,355;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	31397696	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=217,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	31399414	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:2,0:4,5:6,0,3,2
chr2	31399591	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=228,269;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:1,9,0,2
chr2	31400502	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=264,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:0|1:31400502_A_C:31400502:6,0,2,1
chr2	31400510	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=259,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:0|1:31400502_A_C:31400502:5,0,2,1
chr2	31400722	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.358:17:4,1:7,4:2,9,2,4
chr2	31401290	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,9,2
chr2	31401499	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:1,6,1,2
chr2	31410708	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,1,15
chr2	31410728	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:0,9,0,5
chr2	31411184	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=191,122;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.163:22:11,3:6,0:11,8,1,2
chr2	31415955	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.287:5:2,0:1,0:3,1,1,0
chr2	31415957	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=211,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:0,0:3,1,1,0
chr2	31415967	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=184,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,5,0
chr2	31420245	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0,11,1,1
chr2	31422452	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=210,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:1,10,3,3
chr2	31422514	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=212,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,0,3
chr2	31424885	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=126,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:2,4:1,6:0,3,5,6
chr2	31428030	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,4:6,2:8,1,6,0
chr2	31428084	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:12,8,1,2
chr2	31467079	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=288,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	31467351	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=146,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr2	31484334	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	31488965	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	31570376	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=127,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=42.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,10:4,3:6,1,11,3
chr2	31571241	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:2,6:0,7:0,2,4,9
chr2	31572482	.	T	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,1:0,0,6,0
chr2	31588288	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=102,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:0,6:7,10:4,3,10,6
chr2	31589654	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	31590759	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=214,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr2	31590785	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=210,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:8,3,1,1
chr2	31600146	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr2	31609448	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,8:0,11:0,0,6,13
chr2	31611029	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,3:6,2:6,3,4,1
chr2	31621598	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.621:19:4,10:2,2:0,7,2,10
chr2	31626045	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,4:5,2:0,11,0,6
chr2	31628705	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=116,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=41.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:4,4:7,9:7,4,10,3
chr2	31758917	.	C	CGTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=349,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:31758917_C_CGTT:31758917:0,1,0,1
chr2	31758918	.	A	ATTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=18,25;MFRL=349,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:31758917_C_CGTT:31758917:0,1,0,1
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chr2	32264285	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.400:23:7,5:7,4:0|1:32264285_TC_T:32264285:10,4,7,2
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chr2	32264594	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,80;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:4,0:0,8,0,2
chr2	32369901	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	32400532	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=277,193;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	32422366	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.388:18:3,3:7,3:6,5,3,4
chr2	32434701	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=42.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr2	32449871	.	ATTTT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,4;RU=T;STR;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.705:15:2,6:2,5:0,4,0,11
chr2	32449879	.	T	TAAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=165,249;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=9,12;RU=A;STR;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:0,3,0,8
chr2	32461493	.	T	TC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	32466029	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	32481793	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:32481793_AT_A:32481793:0,0,6,6
chr2	32481795	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,23;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0|1:32481793_AT_A:32481793:0,0,6,6
chr2	32481939	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	32532184	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:16,6:11,0:14,13,6,0
chr2	32620589	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,94;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:7,0:14,3:12,9,1,2
chr2	32626399	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=214,143;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:5,3,0,4
chr2	32641218	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=128,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,3:9,0:6,12,3,0
chr2	32661267	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=187,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:4,3,0,2
chr2	32661310	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr2	32667058	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,4,1
chr2	32667061	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0|1:32667058_C_A:32667058:0,0,5,1
chr2	32667182	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,10,5
chr2	32690109	.	AT	A	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.225:38:18,3:10,6:25,4,7,2
chr2	32690176	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:27,0:18,5:20,25,5,0
chr2	32690253	.	ATT	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.330:13:1,0:7,4:4,5,1,3
chr2	32694600	.	G	A	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=145,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,6:0.108:56:27,6:23,0:24,26,6,0
chr2	32695219	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,191;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:10,5:7,0:14,3,5,0
chr2	32706579	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	32712875	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,5,13
chr2	32733196	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:7,5:12,0:13,6,5,0
chr2	32740138	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.556:18:1,6:6,4:3,5,3,7
chr2	32749880	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,9,0
chr2	32749890	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,12,2
chr2	32749893	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=70.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,10:0,6:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,12,4
chr2	32749903	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0|1:32749880_C_T:32749880:0,0,13,4
chr2	32757201	.	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	C,CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,31,34;MFRL=0,105,184;MMQ=60,60,56;MPOS=26,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,8,23;RU=GT;STR;TLOD=5.37,24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.108,0.814:9:0,2,2:0,0,0:0,0,5,4
chr2	32757256	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=101,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.079:41:14,2:20,0:12,26,3,0
chr2	32757349	.	G	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.328:28:11,2:7,6:3,16,0,9
chr2	32822729	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr2	32823096	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=288,198;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:4,0:0,3:0,4,4,0
chr2	32836574	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=173,204;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:8,5:7,0:0|1:32836574_G_T:32836574:10,5,5,0
chr2	32836579	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,204;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:8,5:6,0:0|1:32836574_G_T:32836574:9,5,5,0
chr2	32927863	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=131,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,2:9,3:10,8,3,2
chr2	32958838	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr2	32959024	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=141,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,4:5,0:2,12,2,2
chr2	32961745	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,10,6
chr2	32961858	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,2:6,1:10,7,1,2
chr2	33007817	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,1,4
chr2	33036324	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=117,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:2,4,1,2
chr2	33045867	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=138,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:10,3,2,0
chr2	33174072	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=205,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,4:2,2:0,2,2,5
chr2	33246146	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,1:9,1:5,13,1,1
chr2	33335847	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:2,5:6,8:7,2,4,9
chr2	33413640	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=355,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	33414009	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.867:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr2	33442549	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=247,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:8,0,3,0
chr2	33498691	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=139,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:2,2:7,0,1,1
chr2	33540138	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=315,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,8,0
chr2	33540172	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=158,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,5:1,3:5,0,5,3
chr2	33568113	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr2	33572461	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:13,0:16,2:18,11,1,1
chr2	33572472	.	GAAGCCT	G	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,0:17,2:0|1:33572472_GAAGCCT_G:33572472:18,11,1,1
chr2	33572480	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:9,0:17,2:0|1:33572472_GAAGCCT_G:33572472:17,10,1,1
chr2	33586464	.	C	CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:2,2:5,1:6,1,3,0
chr2	33614187	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,259;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.424:17:3,4:6,3:8,2,7,0
chr2	33622448	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=211,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	33623387	.	AT	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr2	33744958	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=60.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,7:0,0,12,9
chr2	33748913	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=259,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,3,1
chr2	33752152	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:2,3:5,0:7,0,3,0
chr2	33759395	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:6,2:6,2:12,2,3,1
chr2	33810455	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=200,84;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.181:26:8,4:9,0:5,17,0,4
chr2	36605417	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=113,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,6:5,1:5,5,6,1
chr2	36605585	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,3,7
chr2	36669670	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:8,0,4,0
chr2	36691600	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,2:6,0:12,1,2,0
chr2	36739553	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,152;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=88.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,1,26
chr2	36740643	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=210,256;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:7,4,2,0
chr2	36756288	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,2:0,9:0,1,2,9
chr2	36771701	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=162,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr2	36779144	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=137,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.256:10:3,0:3,2:4,4,1,1
chr2	36783215	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:4,7,0,2
chr2	36785667	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,2:1,0:0,3,1,2
chr2	36806021	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,2:10,1:0,14,1,2
chr2	36810473	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=144,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:4,2:8,3,1,1
chr2	36810654	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,196;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:1,12,0,3
chr2	36824956	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,324;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	36825170	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,51;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	36825330	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	36943419	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr2	36982078	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=110,93;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:11,6:7,0:11,7,6,0
chr2	36994439	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=80,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:3,5,1,3
chr2	37000877	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=230,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:4,0,6,1
chr2	37010574	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:3,9:1,6:0,4,7,8
chr2	37032686	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=109,109;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:2,3:19,0:14,7,4,0
chr2	37036091	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:8,8,0,2
chr2	37077015	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	37078095	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.871:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	37096970	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	37111045	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=223,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,8:1,5:2,1,10,3
chr2	37152337	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=120,229;MMQ=58,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,2:21,0:0|1:37152337_G_A:37152337:12,19,2,0
chr2	37152340	.	GG	AA	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=120,229;MMQ=58,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,2:20,0:0|1:37152337_G_A:37152337:12,19,2,0
chr2	37235964	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=141,44;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:0|1:37235964_T_C:37235964:5,6,1,1
chr2	37235967	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:37235964_T_C:37235964:4,6,1,1
chr2	37247122	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=182,128;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37247122_T_C:37247122:0,1,0,1
chr2	37247128	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=182,128;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37247122_T_C:37247122:0,1,0,1
chr2	37247132	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=182,128;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:37247122_T_C:37247122:0,1,0,1
chr2	37287775	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=130,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:12,2:13,0:0|1:37287775_C_T:37287775:12,13,1,1
chr2	37287784	.	CCT	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=131,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,2:9,0:0|1:37287775_C_T:37287775:12,12,1,1
chr2	37302556	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,13,0
chr2	37316717	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,22;MFRL=151,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:1,1:2,0:3,2,2,3
chr2	37373982	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,8,4
chr2	37402270	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=121,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.501:28:6,8:8,6:7,7,6,8
chr2	37402373	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=133,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,1:2,6,1,1
chr2	37406761	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.417:15:6,2:2,4:2,7,3,3
chr2	37410537	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=214,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:5,1,3,1
chr2	37414431	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	37415496	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	37428743	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,16,1
chr2	37429119	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,0:6,3:0,11,0,3
chr2	37429848	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:9,1:0,1:8,1,2,0
chr2	37430037	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:5,4:12,0:10,7,3,1
chr2	37447463	.	A	AAG	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr2	37447464	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=30,28;MFRL=198,181;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr2	37447465	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=195,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr2	37447472	.	ATAT	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=202,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.645:9:2,4:1,2:3,0,6,0
chr2	37447473	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0|1:37447473_T_A:37447473:0,0,14,2
chr2	37447475	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0|1:37447473_T_A:37447473:0,0,14,2
chr2	37447477	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=26,28;MFRL=201,93;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=28.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,4:4,4:8,0,7,2
chr2	37447479	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=24,26;MFRL=200,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:4,3:6,3:11,0,4,2
chr2	37447627	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.227:32:11,3:13,4:9,16,1,6
chr2	37450377	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,35;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:11,0:16,2:16,11,1,1
chr2	37475273	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=181,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:7,3,1,1
chr2	37475458	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:6,5:6,0:6,7,1,4
chr2	37480249	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=224,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr2	37481327	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:16,2:7,0:14,9,2,0
chr2	37483771	.	ATTTTTTT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=31,24;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.517:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	37494489	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=225,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.435:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	37494521	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=190,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:4,0,1,0
chr2	37499406	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=241,143;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,2:0,14:1,0,16,0
chr2	37501792	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=145,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:7,11,1,1
chr2	37513285	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:3,2,2,1
chr2	37586681	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:9,0,3,0
chr2	37595696	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=184,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:4,5:4,3:7,2,6,2
chr2	38177525	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	38178362	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,3:1,0:2,3,2,1
chr2	38179414	.	CTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=175,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr2	38202502	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=170,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	38208606	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=253,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr2	38216766	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32,21;MFRL=209,169,147;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.97,6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,4:0.242,0.282:15:4,1,1:2,3,1:1,6,3,5
chr2	38218281	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=237,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:2,0,3,1
chr2	38218470	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr2	38244417	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=117,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,2:8,3:7,6,4,1
chr2	38244818	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=239,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0|1:38244818_A_C:38244818:1,5,0,4
chr2	38244824	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=239,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0|1:38244818_A_C:38244818:1,5,0,4
chr2	38244826	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=206,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.250:10:3,1:5,1:1|0:38244818_A_C:38244818:0,8,1,1
chr2	38298203	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,9,4
chr2	38302544	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=104,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:1,2,1,3
chr2	38526333	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=126,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr2	38526547	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,3:3,0:0,6,0,3
chr2	38537626	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:2,1:15,1:4,13,0,2
chr2	38570327	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=245,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:38570327_G_T:38570327:4,0,1,0
chr2	38570330	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=245,218;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:38570327_G_T:38570327:4,0,1,0
chr2	38791356	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=184,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,0:10,3:12,9,0,3
chr2	38975332	.	GT	G,GTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35,32;MFRL=244,182,346;MMQ=60,60,60;MPOS=22,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.98,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.298,0.295:10:3,1,1:0,2,1:0,4,1,5
chr2	38977371	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:0,3,0,8
chr2	38977402	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,4:3,4:0,3,0,8
chr2	39025174	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=130,103;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.518:27:9,14:4,0:8,5,14,0
chr2	39025607	.	A	AACTAACCTGATTG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39025607_A_AACTAACCTGATTG:39025607:0,3,0,1
chr2	39025609	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39025607_A_AACTAACCTGATTG:39025607:0,3,0,1
chr2	39025610	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,23;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39025607_A_AACTAACCTGATTG:39025607:0,3,0,1
chr2	39025632	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	39030074	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=140,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:0,1,1,4
chr2	39042639	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr2	39043366	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=177,210;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:7,4:2,12,0,4
chr2	39050061	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	39074202	.	AG	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,144;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,1:5,7,0,2
chr2	39075356	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=231,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,4:1,7:1,1,9,2
chr2	39083645	.	CTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,27;MFRL=161,172;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,1:0,0:1,4,1,1
chr2	39088323	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,202;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,2:9,2:9,8,2,2
chr2	39090688	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=34,29;MFRL=204,162;MMQ=60,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr2	39090696	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr2	39090717	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,31;MFRL=212,162;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:39090717_C_T:39090717:0,4,0,3
chr2	39090721	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=212,162;MMQ=60,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0|1:39090717_C_T:39090717:0,4,0,3
chr2	39095410	.	TCCA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCA;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	39107750	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:5,2,3,0
chr2	39117117	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=247,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,9:0,10:1,0,6,13
chr2	39157032	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.331:4:0,1:3,0:0|1:39157032_ACC_A:39157032:0,3,0,1
chr2	39157035	.	TGGTA	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=170,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:39157032_ACC_A:39157032:0,3,0,1
chr2	39157049	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.598:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	39162947	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,69;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,0:11,3:11,9,1,2
chr2	39184018	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:9,1:5,4:10,4,4,1
chr2	39185186	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=138,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:6,4,2,1
chr2	39196644	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,5:9,2:8,10,0,7
chr2	39198966	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=68,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:2,9:4,10:5,1,13,6
chr2	39199075	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:10,0:11,6:7,14,0,6
chr2	39199087	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=178,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:5,0:14,6:6,13,0,6
chr2	39214821	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	39224351	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr2	39224597	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=179,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:9,0:2,10:0,11,0,10
chr2	39224615	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr2	39233500	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr2	39234342	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=217,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr2	39239572	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=173,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	39251375	.	T	TCAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAC;STR;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,4:3,4:0,4,1,7
chr2	39281730	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=181,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:4,0,7,3
chr2	39440727	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr2	39479122	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,3:0,0,0,9
chr2	39494469	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=138,231;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr2	39514136	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=127,306;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,1,2
chr2	39514204	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	39526842	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,11,3
chr2	39530136	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr2	39553271	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:8,9:4,3:5,7,6,6
chr2	39564620	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=69,155;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:4,3:3,4:5,2,5,2
chr2	39570427	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=117,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	39893460	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	39944055	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=216,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:4,0,5,0
chr2	39993167	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.759:23:2,9:3,8:4,1,12,6
chr2	39997047	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,3:9,0:10,7,3,0
chr2	40402275	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr2	40404839	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,9,7
chr2	40404913	.	A	AAGTAC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=170,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:10,8,1,1
chr2	40655563	.	CCACA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,0;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=CA;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	42275819	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	42275914	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=157,87;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.517:4:0,2:1,0:0,2,1,1
chr2	42281307	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,0:10,4:11,9,0,4
chr2	42284884	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=212,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,2:1,1:0,5,1,2
chr2	42488198	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=242,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	42491951	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:1,6,3,0
chr2	42511903	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=124,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:2,5,1,1
chr2	42513554	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0,6,0,5
chr2	42522562	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=146,124;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:17,10:12,0:17,12,10,0
chr2	42552711	.	TTA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=116,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.314:11:3,2:5,1:0|1:42552711_TTA_T:42552711:1,7,0,3
chr2	42552742	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=313,169;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.555:2:0,1:1,0:0|1:42552711_TTA_T:42552711:0,1,0,1
chr2	42553210	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=237,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,6:3,3:5,1,7,2
chr2	42556022	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,2:4,2:7,5,3,1
chr2	42578274	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=188,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr2	42588195	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:7,0,5,0
chr2	42797716	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=169,96;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:42797716_G_GA:42797716:0,3,0,1
chr2	42797718	.	G	GGATATGTGCATT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:0|1:42797716_G_GA:42797716:0,3,0,1
chr2	42836516	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=151,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr2	42836588	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=155,112;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,7:7,0:13,2,7,0
chr2	42925001	.	T	TAAAGAAACAATTGAAACTCAGCAAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=116,43;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,2:10,0:6,8,1,1
chr2	42925079	.	TTTC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=236,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTC;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr2	42935961	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=144,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,5:6,4:5,4,7,2
chr2	42935979	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,3:5,5:4,5,6,2
chr2	42989994	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=191,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	42990010	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=125,227;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,2,1
chr2	42991468	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=306,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	42994995	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=131,66;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:10,0:4,2:12,3,0,2
chr2	42996750	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=178,239;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.341:4:1,1:2,0:3,0,1,0
chr2	42996759	.	AAGAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,6;RU=AG;STR;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:0,1:1,0,2,0
chr2	42997040	.	AG	CC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=206,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,1:6,1:0|1:42997040_AG_CC:42997040:0,10,3,0
chr2	42997045	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=205,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,0:4,2:0|1:42997040_AG_CC:42997040:0,9,3,0
chr2	43015612	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=150,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:5,1,5,0
chr2	43015814	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=224,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	43019730	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=215,269;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	43452183	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	43514036	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:7,1,3,3
chr2	43625078	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:4,1:11,1:11,4,1,1
chr2	43754992	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:6,2,5,1
chr2	43768233	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=157,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.235:14:6,2:5,1:10,1,2,1
chr2	43768504	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=150,73;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,1:10,1:0,23,0,2
chr2	43778857	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:0,1:6,0,3,1
chr2	43787576	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr2	43798792	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	43800174	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:2,3,1,5
chr2	43801630	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:8,1:7,10,2,0
chr2	43802261	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	43804229	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.588:20:5,5:3,6:4,4,5,7
chr2	43813764	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=146,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,0:11,3:13,5,2,1
chr2	43817950	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:1,4:9,2:5,5,2,4
chr2	43871983	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=190,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:2,3:2,5:2,2,0,8
chr2	43902511	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=139,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,7:1,2:1,2,3,6
chr2	43903354	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=105,228;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,4:6,4:4,4,4,4
chr2	43903483	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=182,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:2,2,3,4
chr2	43921489	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=259,92;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,1,1
chr2	43926890	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=167,107;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:9,0:11,3:0|1:43926890_A_T:43926890:11,10,0,3
chr2	43926894	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=180,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:8,0:14,3:0|1:43926890_A_T:43926890:12,11,0,3
chr2	43931055	.	CTTTTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=126,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=25,19;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.510:2:0,0:0,1:0|1:43931055_CTTTTTT_C:43931055:0,1,1,0
chr2	43931082	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=136,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.399:3:2,0:0,0:0|1:43931055_CTTTTTT_C:43931055:1,1,1,0
chr2	43937485	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:2,7,0,3
chr2	43947760	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,3,2
chr2	43947849	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=160,97;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,2:3,0:2,7,2,0
chr2	43953664	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=239,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	43965558	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,72;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:7,5:7,0:5,9,4,1
chr2	43965709	.	T	TGTTTGTTTTGAGACAGGGTTTCA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	43965733	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=235,117;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	43968050	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,6:3,2:5,3,7,1
chr2	43973196	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	43984328	.	A	AAATATATTGAAAAGAGTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=166,10842886;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,1:7,0:8,11,0,2
chr2	43985940	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	43986027	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=218,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:10,0,2,0
chr2	43991310	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=206,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr2	43991357	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:3,4:4,7:4,3,6,5
chr2	44001139	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,4:1,4:1,0,8,0
chr2	44004099	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=229,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr2	44010620	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=227,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,3:1,6:2,1,6,3
chr2	44022970	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,6,2
chr2	44023109	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:9,0:8,9,0,2
chr2	44047110	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,189;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:11,2:14,0:10,15,2,0
chr2	44050098	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=178,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:7,0:7,5:2,12,0,5
chr2	44101214	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=182,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr2	44101649	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=129,40;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:0,3:1,0:1,1,0,4
chr2	44104610	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=215,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr2	44116836	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=119,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,3,1
chr2	44117578	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=148,116;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.251:22:12,4:4,1:5,12,1,4
chr2	44123672	.	TC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=195,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr2	44123759	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:7,5,4,1
chr2	44145374	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:2,2,5,1
chr2	44152180	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:2,0:7,3:7,2,3,1
chr2	44172444	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,2:2,4:5,3,4,2
chr2	44175648	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=179,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.163:20:7,0:10,2:6,11,0,3
chr2	44190789	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr2	44201259	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=113,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:7,0:10,4,3,0
chr2	44201376	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:4,7:9,3:7,6,7,3
chr2	44202420	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=212,324;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	44207042	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,0:14,2:14,14,0,2
chr2	44428483	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=159,120;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:14,1:21,1:23,13,0,2
chr2	44428873	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:4,9,2,0
chr2	44445685	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=156,43;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.123:22:9,0:11,2:0|1:44445685_T_A:44445685:5,15,1,1
chr2	44445696	.	A	AAATTTTCTTGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=157,43;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:44445685_T_A:44445685:3,14,1,1
chr2	44471313	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.432:8:2,1:1,2:2,3,3,0
chr2	44512971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=225,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:0,2:2,2:0,2,0,5
chr2	44528267	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,2,2
chr2	44531484	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,5:3,4:2,4,3,6
chr2	44548414	.	A	AT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=145,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:12,0:6,2:16,2,2,0
chr2	44548613	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.506:16:3,6:4,2:1,7,1,7
chr2	44556298	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr2	44559529	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=206,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr2	44559896	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=179,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	44565447	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	44566523	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=178,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.267:9:2,2:5,0:0|1:44566523_A_AG:44566523:0,7,1,1
chr2	44566524	.	T	TGAGTGAGAGA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=178,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:2,2:4,0:0|1:44566523_A_AG:44566523:0,7,1,1
chr2	44569474	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr2	44569700	.	AAAT	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=187,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=36.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:2,5:3,5:2,3,4,6
chr2	44569739	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	44570804	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	44573624	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	44617324	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,321;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,0:1,2:3,0,2,1
chr2	44933475	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,2:8,0:8,10,2,0
chr2	44942384	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.618:8:1,4:1,1:2,1,1,4
chr2	44981119	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=221,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,0:1,2:5,0,2,0
chr2	45647043	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	45773816	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr2	45774050	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	45780962	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	45826526	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	46070269	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=163,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	46583235	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=202,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr2	46583271	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,22;MFRL=146,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:3,1,1,0
chr2	46583278	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=195,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0|1:46583278_C_CG:46583278:2,2,2,0
chr2	46583279	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,35;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,2:1,0:0|1:46583278_C_CG:46583278:1,2,2,1
chr2	46583281	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=195,126;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.441:7:3,3:1,0:0|1:46583278_C_CG:46583278:2,2,2,1
chr2	46587713	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=210,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,4:7,0:14,1,4,0
chr2	46603671	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=60,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,5:4,7:2,2,7,5
chr2	46605954	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=134,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.692:16:2,5:1,6:1,4,1,10
chr2	46739157	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,3,3
chr2	46770870	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:10,2:17,1:14,13,3,0
chr2	46808243	.	GGA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=137,243;MMQ=40,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr2	46818992	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=128,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,5:7,1:8,5,4,2
chr2	46819815	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr2	46839487	.	GA	G,GAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=18,32,17;MFRL=157,152,153;MMQ=60,60,60;MPOS=20,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=12.00,4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,7,3:0.305,0.151:23:2,1,0:3,4,0:2,11,2,8
chr2	46988727	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=153,198;MMQ=54,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,1:12,2:14,12,1,2
chr2	47045267	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=153,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,0:4,5:4,3,4,1
chr2	47083046	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=216,421;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr2	47177665	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=231,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:3,6,0,2
chr2	47221525	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,3:5,1:9,2,2,2
chr2	47221693	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=222,241;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,2,3
chr2	47222236	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=147,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.172:21:7,2:11,1:0|1:47222236_G_T:47222236:12,6,1,2
chr2	47222243	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=130,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.119:23:10,0:11,2:1|0:47222236_G_T:47222236:14,7,0,2
chr2	47233048	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=138,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,1:1,2:6,2,1,2
chr2	47233720	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=173,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:6,3:1,0:0|1:47233720_G_T:47233720:6,1,3,0
chr2	47233722	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=173,256;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:0|1:47233720_G_T:47233720:6,1,3,0
chr2	47233749	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=173,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.404:18:7,5:3,2:6,5,6,1
chr2	47256618	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=169,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	47273668	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=68,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	47277035	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=184,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:0|1:47277035_C_T:47277035:9,0,0,2
chr2	47277043	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=184,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,3:0.308:11:2,3:6,0:1|0:47277035_C_T:47277035:6,2,3,0
chr2	47277207	.	CA	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr2	47278823	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=228,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,3,1
chr2	47314052	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=226,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,5,0
chr2	47357458	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=95,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,6:1,4:0,2,2,8
chr2	47380145	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=177,107;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:9,1:4,5:8,5,3,3
chr2	47380203	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=143,223;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:1,7,2,4
chr2	47380250	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:4,2:0,2:1,3,0,4
chr2	47382214	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr2	47388766	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	47389328	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:11,2,2,0
chr2	47389342	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=175,67;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:4,2:0,3:3,1,4,2
chr2	47397750	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=26.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:7,0,7,0
chr2	47399601	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:3,8,2,4
chr2	47597034	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,303;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	47613870	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=200,286;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	47630550	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,2:5,0:3,8,2,0
chr2	47630639	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=201,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr2	47693959	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:6,1:0,4:2,4,1,4
chr2	48010654	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=199,266;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,1,2
chr2	48018081	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=80,203;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,4:5,3:7,5,4,3
chr2	48018314	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.762:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr2	48030458	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	48030838	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=112,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,3:4,7:1,5,2,8
chr2	48032740	.	AT	A,ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=150,168,123;MMQ=60,60,60;MPOS=23,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=3.27,3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,4:0.214,0.305:13:4,2,2:2,1,0:6,0,5,2
chr2	48032874	.	ACTAT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTAT;STR;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.929:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	48032937	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	48033546	.	C	CT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:16,4:4,2:7,13,2,4
chr2	48033551	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=106.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,20:0,7:0,0,11,17
chr2	48033890	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=160,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.552:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr2	48033934	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,15;MFRL=134,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.214:15:7,0:4,0:5,7,3,0
chr2	48035631	.	TTTATA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	48040477	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,6:0.162:41:17,0:17,5:15,20,0,6
chr2	48040588	.	G	GTTTTTTTTTT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,14;MFRL=155,149;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:48040588_G_GTTTTTTTTTT:48040588:0,3,0,1
chr2	48040592	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=163,149;MMQ=60,30;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:48040588_G_GTTTTTTTTTT:48040588:0,4,0,1
chr2	48040598	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=163,149;MMQ=60,30;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:48040588_G_GTTTTTTTTTT:48040588:0,4,0,1
chr2	48040851	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=200,126;MMQ=57,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:2,0:0|1:48040851_C_A:48040851:2,0,1,0
chr2	48040855	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=200,126;MMQ=57,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:48040851_C_A:48040851:2,0,1,0
chr2	48040904	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr2	48046012	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=243,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:5,3:2,2:5,4,1,4
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chr2	48725786	.	CCCAGGAA	C,TCCAGGAA	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,20,20;MFRL=144,62,69;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.28,3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,2,2:0.100,0.130:20:7,0,0:9,2,2:10,6,2,2
chr2	48734576	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
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chr2	48738687	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
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chr2	48808882	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=195,121;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,2:9,1:7,4,2,1
chr2	48808898	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=181,305;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:8,4,2,1
chr2	48844968	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=321,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:2,10:0,5:2,0,13,2
chr2	48847918	.	G	GAATA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AATA;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,1:0,0:0,0,1,0
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chr2	48906625	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,2,6
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chr2	48925986	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,0:0,0,1,4
chr2	48948802	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=133,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:3,1:11,1:8,6,1,1
chr2	48948856	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=136,227;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,2:6,2:4,6,2,2
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chr2	48956417	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=131,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,2,0
chr2	48956475	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr2	49216284	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=223,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr2	49244559	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:2,1,2,2
chr2	49381585	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=15845309,279;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr2	50201383	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=154,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:11,5:5,2:5,11,1,6
chr2	50434759	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=406,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	50574038	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr2	50692560	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=197,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,0:3,3:9,2,2,1
chr2	50693504	.	AAC	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.468:13:4,1:3,5:7,0,5,1
chr2	50724541	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=226,289;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	50758309	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:0,1,7,0
chr2	50765822	.	TGTTATA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=181,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:2,14,1,1
chr2	50858107	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:4,1,3,0
chr2	51148872	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	53832072	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=132,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,3:4,6:3,5,3,6
chr2	53941493	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,225;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:5,10:9,0:13,1,10,0
chr2	53943696	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=146,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,2:7,1:6,6,3,0
chr2	53943933	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=217,228;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=40.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,10:0.688:14:2,0:2,10:0|1:53943933_C_T:53943933:0,4,0,10
chr2	53943940	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=212,228;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.648:15:2,0:3,9:0|1:53943933_C_T:53943933:0,5,0,10
chr2	53992593	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,5:9,1:12,4,5,1
chr2	54001762	.	AAACTTTTATTTT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=205,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.403:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	54014558	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=203,116;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr2	54021679	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	54023247	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.891:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	54024626	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,3:6,4:11,3,3,4
chr2	54042180	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=195,136;MMQ=60,24;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	54093415	.	A	AAACAGCAATTCAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=199,20952089;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:4,2:0,0:1,3,0,2
chr2	54114967	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,4:7,4:8,5,7,1
chr2	54115097	.	G	GACTACAGGCACACGCCGC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:54115097_G_GACTACAGGCACACGCCGC:54115097:5,17,0,2
chr2	54115100	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,2:8,0:0|1:54115097_G_GACTACAGGCACACGCCGC:54115097:5,17,0,2
chr2	54115102	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=161,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:13,2:8,0:0|1:54115097_G_GACTACAGGCACACGCCGC:54115097:5,17,0,2
chr2	54115845	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:7,1,1,1
chr2	54116003	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:0,4,0,4
chr2	54119870	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:6,1,3,0
chr2	54120820	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=127,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,7:3,5:6,2,8,4
chr2	54122956	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=137,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	54125102	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=101,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.077:37:9,2:26,0:14,21,2,0
chr2	54125185	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=191,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:6,3:0,11,0,4
chr2	54131154	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:5,3:2,1:4,3,3,1
chr2	54135429	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:2,3:9,3:5,6,5,1
chr2	54137136	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,1:4,3:8,3,4,0
chr2	54146387	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=167,193;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.455:11:2,0:2,1:2,4,0,5
chr2	54148331	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	54150079	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr2	54152927	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=230,322;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:3,1,0,2
chr2	54155240	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,4,1
chr2	54158957	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=154,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,4:4,1:7,5,4,1
chr2	54159999	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=219,322;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	54161885	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=263,225;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr2	54483325	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:5,8:12,0:8,9,7,1
chr2	54483443	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=209,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:1,8:2,9:2,1,3,15
chr2	54494370	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,3:0,11:0,0,11,3
chr2	54558079	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=220,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,6:6,2:8,2,6,2
chr2	54570995	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=137,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:6,5:10,2:6,10,3,4
chr2	54839276	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=197,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:1,6:3,8:2,2,9,5
chr2	54844911	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=246,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	54845117	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=194,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr2	54850583	.	C	CAG	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=122,176;MMQ=60,46;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.310:27:7,8:12,0:0|1:54850583_C_CAG:54850583:16,3,8,0
chr2	54850586	.	TAC	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=132,176;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:7,7:12,0:0|1:54850583_C_CAG:54850583:16,4,8,0
chr2	54855137	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=295,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,5:0,2:3,0,7,0
chr2	54855454	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	54877146	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	54882381	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:0,6,0,8
chr2	54893237	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=213,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.313:17:6,4:6,1:2,10,1,4
chr2	55040426	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr2	55071101	.	TTGTGTGTGTGTGTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,13;RU=TG;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.616:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	55077061	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	55077241	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=123,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:3,0:10,5:8,5,0,5
chr2	55080703	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=185,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	55091029	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=249,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,5:1,4:2,2,6,3
chr2	55093842	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=191,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr2	55098600	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,230;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:7,6,0,2
chr2	55122589	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=153,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:0,3,0,5
chr2	55126730	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:8,2,4,1
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chr2	55138272	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr2	55155672	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:4,3:7,4:6,6,3,4
chr2	55179848	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,1:3,3:2,10,0,4
chr2	55181351	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	55181382	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr2	55186229	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr2	55187297	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr2	55200253	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:7,0:15,4,3,0
chr2	55200800	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=84.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,9:0,14:0,0,7,16
chr2	55201038	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,3,8
chr2	55214618	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,6,3
chr2	55214912	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	55252469	.	C	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,6:0.165:40:16,0:18,6:25,9,0,6
chr2	55407935	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	55439963	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	55445151	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:11,2:4,0:5,10,0,2
chr2	55460605	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=192,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:2,14:2,5:1,3,5,14
chr2	55471407	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr2	55473371	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=217,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	55473386	.	CAT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=305,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,4,1
chr2	55473681	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	55489629	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=201,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	55518742	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	55527108	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	55528257	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,8,0
chr2	55528514	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	55530348	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:55530348_G_GC:55530348:0,4,0,1
chr2	55530349	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:55530348_G_GC:55530348:0,4,0,1
chr2	55566538	.	CTATT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr2	55576634	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=262,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:1,0,4,4
chr2	55582684	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	55589364	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=242,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	55589434	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:4,6:1,9:3,2,11,4
chr2	55747471	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,147;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:5,0,2,1
chr2	55760940	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr2	55764754	.	AATATGAATAC	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=119,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:1,4:6,0:2,20,0,4
chr2	55765882	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=157,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.323:12:3,0:3,2:5,3,2,2
chr2	55771050	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=114,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,7:5,3:3,4,6,4
chr2	55795557	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=237,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr2	55800937	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:8,0:0|1:55800937_A_C:55800937:3,9,1,1
chr2	55800942	.	A	ATAAGTCTTAGTTATCTAGTAGGT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=176,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:55800937_A_C:55800937:1,8,1,1
chr2	55844445	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,4:6,1:1,7,1,4
chr2	55867845	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=191,66;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:1,4,1,2
chr2	55867938	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=178,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr2	55881966	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr2	55883509	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:9,2:3,1:3,9,0,3
chr2	55887176	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=313,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	55889061	.	CG	TA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=154,62;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:7,0:12,3:0|1:55889061_CG_TA:55889061:11,8,2,1
chr2	55889062	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,22:0.959:22:0,7:0,14:1|0:55889061_CG_TA:55889061:0,0,13,9
chr2	55894247	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=152,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,0:3,3:2,2,1,2
chr2	55899228	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=36.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,0,13
chr2	55900283	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	56097778	.	CACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=186,296;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=ACA;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,0:2,1:3,0,1,0
chr2	56098272	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,2:3,2:2,11,0,4
chr2	56102130	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=109,56;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:16,0:16,4:18,14,0,4
chr2	56108765	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=138,251;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:12,1:9,1:11,10,1,1
chr2	56108839	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=180,177;MMQ=60,35;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:10,3:7,0:4,14,3,0
chr2	56145270	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,1:6,7:6,8,5,3
chr2	56149475	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,1:9,2:12,3,2,1
chr2	56216052	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,9,5
chr2	56603118	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:3,5:2,4:2,3,3,6
chr2	56611543	.	C	CAAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=129,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAG;STR;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	58285542	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=201,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:4,9,0,2
chr2	58311273	.	GGTAA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,3:7,4:9,5,5,2
chr2	58362160	.	AG	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	58392789	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=214,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr2	58392797	.	TTTA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=209,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:3,2:8,1,3,0
chr2	58431446	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=181,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	59482217	.	T	TGACTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GACTC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	59504636	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,17;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=25,21;RU=T;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,0:2,0,0,2
chr2	59504688	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=140,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:6,7,0,2
chr2	60768978	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=107,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,2:8,1:6,4,1,2
chr2	60769080	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:9,0:9,12,2,1
chr2	60773035	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr2	60997757	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36,23;MFRL=0,304,203;MMQ=60,60,60;MPOS=25,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.55,6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,2:0.333,0.500:3:0,0,0:0,1,1:0,0,0,3
chr2	60997770	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=304,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	61007782	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr2	61009788	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=25,26;RU=T;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.768:6:0,3:0,2:0,1,5,0
chr2	61009909	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,31:0.788:39:2,18:5,13:2,6,15,16
chr2	61009938	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=174,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.575:15:4,4:2,4:4,2,1,8
chr2	61014075	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,5:8,0:9,6,5,0
chr2	61018820	.	A	AAAAGGGAATTTTCAAGGTATC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,68;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.261:9:4,2:3,0:5,2,1,1
chr2	61021349	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=223,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,4:2,2:0,2,0,6
chr2	61108829	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	61119005	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,1:11,2:3,11,0,3
chr2	61121492	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	61128284	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,1:0,1,1,2
chr2	61145523	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=234,140;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:3,0:4,0:0|1:61145523_G_T:61145523:4,3,2,0
chr2	61145525	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=204,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:4,0:0|1:61145523_G_T:61145523:5,3,2,0
chr2	61149070	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.174:27:10,4:11,0:10,13,4,0
chr2	61192218	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=149,102;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.146:39:17,0:16,5:18,16,0,5
chr2	61235855	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=62,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:0,0:5,3:4,1,3,0
chr2	61298691	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=132,143;MMQ=40,27;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,3:5,0:5,0,3,0
chr2	61300556	.	CT	C,CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32,24;MFRL=154,196,166;MMQ=60,60,60;MPOS=17,0;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=5.07,4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,4,3:0.242,0.248:14:3,0,0:4,3,3:6,1,7,0
chr2	61304002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=153,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,4,1
chr2	61308517	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=136,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:1,0,5,0
chr2	61308569	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.506:12:3,4:1,2:4,2,6,0
chr2	61361325	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=126,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:9,2:6,8,1,1
chr2	61385248	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=242,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr2	61389609	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,5:5,1:8,2,5,2
chr2	61412559	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,62473650;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	61413037	.	TATTA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,2:2,0:1,7,0,2
chr2	61413723	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=220,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:1,8:1,8:2,0,7,9
chr2	61417617	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=218,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:0,7:2,9:1,1,10,7
chr2	61420140	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,3:9,0:3,11,2,1
chr2	61448776	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:6,13,1,2
chr2	61456592	.	T	TAAAAAAA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,78;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=18,25;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.761:2:0,1:0,0:0|1:61456592_T_TAAAAAAA:61456592:0,0,2,0
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chr2	61576517	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
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chr2	61605379	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr2	61605614	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:5,1:3,7,1,1
chr2	61622251	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=188,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr2	61622374	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:6,0:12,3:5,13,1,2
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chr2	61709551	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=181,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=37.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,13:0.389:34:14,13:7,0:1|0:61709462_GAGCCACTGTGCCCGACCAGGAACATTCTACGTTTATTAAAAGGTATATTTACTCTTGTAGGTGAGGGAAGGCCGACTTAAGGAGATT_G:61709462:12,9,13,0
chr2	61709747	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=396,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,2:0,1:1,0,1,2
chr2	61722519	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=231,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr2	61722833	.	AAG	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=210,199;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.425:5:2,0:1,2:0|1:61722833_AAG_A:61722833:0,3,0,2
chr2	61722838	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=207,199;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0|1:61722833_AAG_A:61722833:0,2,0,2
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chr2	61722847	.	T	TCG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=207,201;MMQ=60,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:61722833_AAG_A:61722833:0,2,0,1
chr2	61727084	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=305,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,0:0,2:0,2,1,1
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chr2	61729268	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0|1:61729258_A_G:61729258:0,0,6,4
chr2	61749690	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,1:0,7:1,0,7,2
chr2	61749716	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,3:1,8:2,0,8,3
chr2	62053546	.	CGCT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:5,2:9,6,3,0
chr2	62063093	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:3,2:3,1:6,1,3,0
chr2	62063110	.	AC	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,2:8,2,4,0
chr2	62063341	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=164,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr2	62065851	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,3:4,3:1,7,1,5
chr2	62067189	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,114;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,0:4,4:1,9,0,4
chr2	62067433	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=109,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:14,5:4,3:6,12,3,5
chr2	62081217	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	62107376	.	T	TC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr2	62729747	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=141,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,4:2,3:0,2,4,3
chr2	63170905	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=103,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.334:28:7,3:11,6:12,7,6,3
chr2	63176139	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:5,2:11,3:12,4,1,4
chr2	63182611	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.510:10:3,2:2,1:4,1,4,1
chr2	63272232	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,41;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:9,0:19,3:14,14,1,2
chr2	63282567	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr2	63380809	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	63401973	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=204,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.575:10:1,5:3,0:0,4,2,4
chr2	63540324	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,6,1
chr2	63540523	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	63605430	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,245;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr2	63609017	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:4,2,2,4
chr2	63666804	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=223,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	63719887	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,5:4,4:5,0,9,0
chr2	64069311	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,172;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:3,3:4,3:1,6,6,1
chr2	64085114	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	64126765	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=216,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	64126775	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=128,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	64139831	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.420:14:3,3:3,3:1,7,2,4
chr2	64140301	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,2:0,4:0,1,4,2
chr2	64169646	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=143,65;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:15,1:13,0:12,16,1,1
chr2	64169659	.	CTG	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=134,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,2:13,0:0|1:64169659_CTG_C:64169659:12,14,1,1
chr2	64169662	.	G	GAGA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=131,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:64169659_CTG_C:64169659:11,12,1,1
chr2	64195997	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32,34;MFRL=68,199,248;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,15;RU=A;STR;TLOD=3.88,7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.263,0.439:8:2,0,2:0,2,2:2,0,6,0
chr2	64210979	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:1,1:3,3:3,2,3,1
chr2	64323751	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.385:10:2,4:3,0:0,6,1,3
chr2	64682364	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,4,0
chr2	64685502	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=151,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:13,2:8,11,1,1
chr2	64779509	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=176,127;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,2:8,2:7,9,3,1
chr2	64796817	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.414:17:7,3:3,3:3,7,3,4
chr2	64819220	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,54;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.182:15:7,1:5,1:6,7,2,0
chr2	65216886	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=207,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	65217391	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,294;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:0,11,0,3
chr2	65231063	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:0,7:1,5:1,0,8,4
chr2	65237924	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=181,81;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:2,1:8,1:1,9,2,0
chr2	65315880	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:1,3,0,6
chr2	65315903	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,0,3
chr2	65481008	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=145,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,1:4,2:1,7,1,2
chr2	65488538	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=162,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,2:4,0:0|1:65488538_G_A:65488538:1,9,1,2
chr2	65488543	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=173,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:0|1:65488538_G_A:65488538:1,9,1,1
chr2	65495887	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,148;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:1,5,1,4
chr2	65540693	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=174,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:7,0:13,2:0|1:65540693_C_T:65540693:11,10,1,1
chr2	65540700	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=176,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:0|1:65540693_C_T:65540693:9,11,1,1
chr2	65559027	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=221,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	65604914	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=274,272;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	66665146	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=177,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:1,5,0,3
chr2	66667200	.	A	AACACACACACAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,157;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,18;RU=AC;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	66668519	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,80;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.214:35:13,7:14,0:10,18,6,1
chr2	66798282	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=243,228;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:4,0,5,1
chr2	66798621	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=145,85;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,0:18,3:0|1:66798621_C_T:66798621:16,16,0,3
chr2	66798630	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,85;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:16,0:13,3:0|1:66798621_C_T:66798621:14,17,0,3
chr2	67624799	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=229,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:2,5,0,3
chr2	67632081	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,0:8,8:7,8,0,8
chr2	67637196	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=64.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,7,14
chr2	68269960	.	CGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=130,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=G;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.505:2:1,1:0,0:0|1:68269960_CGGG_C:68269960:1,0,1,0
chr2	68269979	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,16;MFRL=154,87;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:68269960_CGGG_C:68269960:4,0,1,0
chr2	68269981	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=157,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:68269960_CGGG_C:68269960:4,0,1,0
chr2	68273085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:9,4,1,1
chr2	68274510	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:0,5,1,1
chr2	68358341	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=192,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.627:19:2,4:4,8:5,2,6,6
chr2	68358653	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=172,252;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr2	68389276	.	GA	G,GAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32,31;MFRL=209,208,210;MMQ=60,60,60;MPOS=18,2;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.25,7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,5:0.200,0.292:17:4,0,2:5,3,3:9,0,8,0
chr2	68389481	.	CTT	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:13,7:9,2:6,16,1,8
chr2	68402012	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr2	68415563	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34,35,32;MFRL=207,185,180,185;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,26,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.31,4.98,9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:6,2,4,5:0.144,0.205,0.308:17:3,0,3,2:3,2,1,3:6,0,10,1
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chr2	68546304	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=324,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr2	68592551	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:16,2:12,0:13,16,0,2
chr2	68592584	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=190,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.607:26:7,7:3,9:3,7,2,14
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chr2	68615654	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,1:3,2:2,7,1,2
chr2	68620410	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:4,6:5,1:1,8,3,4
chr2	68620463	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=175,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr2	68621338	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.475:23:5,7:7,3:5,7,5,6
chr2	68622952	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.389:21:7,5:6,3:9,4,3,5
chr2	68740314	.	AAG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:5,9,0,2
chr2	68753240	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,64;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chr2	68762501	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,6:0.149:45:25,3:14,3:3,36,4,2
chr2	68881938	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=384,266;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:0,2:2,1,2,0
chr2	68962258	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=149,155;MMQ=60,43;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:17,2,2,0
chr2	68962417	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:11,0:9,6:9,12,1,5
chr2	69002281	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,291;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:5,1,1,1
chr2	69009304	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,1:8,1:10,1,2,0
chr2	69043539	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:1,6,3,6
chr2	69053115	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=115,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.548:9:1,3:3,2:2,2,5,0
chr2	69177997	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=186,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr2	69201894	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:1,1,2,6
chr2	69205942	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,2:5,2:6,2,4,0
chr2	69298817	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,3:3,2:6,4,5,0
chr2	69300087	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,1:6,1:0|1:69300087_G_C:69300087:9,4,2,1
chr2	69300088	.	GGAC	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,2:6,1:0|1:69300087_G_C:69300087:9,4,2,1
chr2	69300093	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=170,220;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.220:16:7,2:6,1:0|1:69300087_G_C:69300087:9,4,2,1
chr2	69304719	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr2	69317925	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,7,3
chr2	69318129	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	69330118	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=242,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,1:7,2:2,8,1,2
chr2	69409029	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,3:6,7:4,9,3,7
chr2	69475343	.	GT	G	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=154,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.161:27:8,1:13,3:12,11,1,3
chr2	69554272	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:5,2:0,7,0,2
chr2	69573029	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=126,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:4,5:3,2:6,1,7,0
chr2	69586370	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=124,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,3:6,1:5,7,4,0
chr2	69623536	.	A	AAATTAAATCACCTTTTGAAGAAACCCAATTCAAAACCCCTTCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=239,142;MMQ=60,24;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	69627442	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=138,101;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr2	69642513	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=342,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.511:6:1,1:2,1:0|1:69642513_CT_C:69642513:0,3,0,3
chr2	69642524	.	T	TTG	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=182,229;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.327:4:2,1:1,0:1|0:69642513_CT_C:69642513:0,3,0,1
chr2	69642530	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=177,229;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:69642513_CT_C:69642513:0,2,0,1
chr2	69709783	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,4:6,0:7,11,4,0
chr2	69736629	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:2,3,0,2
chr2	69741562	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:6,2:8,1:11,4,4,0
chr2	69741753	.	CTGT	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=134,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGT;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:5,2:0,4:3,3,3,3
chr2	69741854	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,7,8
chr2	69746165	.	TGTTGCTGCTTGAGGAAGA	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,0:11,2:14,15,1,1
chr2	69746207	.	GCCTGGGCCTGAGCGGGCAGAC	G	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=149,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:7,0:7,2:13,15,1,1
chr2	69748167	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=164,281;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,0:4,6:0,11,0,6
chr2	69771484	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	69771716	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,0:4,6:0,9,0,6
chr2	70015108	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=231,269;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,2:5,0:5,0,2,0
chr2	70031797	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,3:7,5:2,8,2,6
chr2	70033649	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=144,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,2:8,1:10,10,2,1
chr2	70039677	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=163,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr2	70045840	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:9,9:14,0:7,16,9,0
chr2	70047969	.	C	CCTGCATCTGGTCCGAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=156,50;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:5,6,1,1
chr2	70066571	.	C	CTT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=189,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.122:22:11,2:8,0:15,5,2,0
chr2	70066614	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=170,70;MMQ=52,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:16,2:13,0:15,14,2,0
chr2	70066682	.	GA	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.105:36:25,3:8,0:14,19,0,3
chr2	70068258	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	70070184	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=185,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,0:3,2:9,0,3,0
chr2	70076954	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=120,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr2	70096862	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:6,0:4,3:9,4,2,1
chr2	70098808	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	70121197	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.443:32:9,7:8,7:7,11,3,11
chr2	70164034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	70189331	.	GACAC	G,GAC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32,34;MFRL=168,182,229;MMQ=60,60,60;MPOS=24,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=AC;STR;TLOD=9.04,7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,3:0.362,0.373:9:1,2,3:0,2,0:0,2,5,2
chr2	70315448	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:19,1:18,3:18,20,3,1
chr2	70377769	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:6,0:2,5:0,8,0,6
chr2	70456452	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=165,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:3,1:4,2:3,4,1,2
chr2	70458050	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr2	70463334	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33,22;MFRL=159,268,103;MMQ=60,60,60;MPOS=10,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=3.37,4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.290,0.245:8:2,1,0:2,1,1:0,4,2,2
chr2	70463362	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,15;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0,4,1,0
chr2	70485252	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	70529037	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,5:1,4:3,1,3,6
chr2	70677913	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=222,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr2	70741998	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,112;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:11,1:12,2:10,13,2,1
chr2	70901785	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:0|1:70901785_A_G:70901785:5,8,2,0
chr2	70901788	.	GGT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:0|1:70901785_A_G:70901785:5,8,2,0
chr2	70905099	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=213,290;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	70906115	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:1,8,1,3
chr2	70910991	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=136,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr2	70915134	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=222,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:9,1,1,1
chr2	70923542	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:4,12,0,2
chr2	71004368	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,7,0
chr2	71004413	.	C	CA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:6,2:2,2:7,4,1,3
chr2	71017516	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr2	71043467	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=149,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,3:8,1:9,6,3,1
chr2	71058144	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:4,1,1,1
chr2	71058795	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=124,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:5,4:4,2:4,5,4,2
chr2	71058811	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=120,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,4:2,2:2,6,2,4
chr2	71058835	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=204,158;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:9,3:3,5:3,9,4,4
chr2	71060733	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr2	71060936	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=110,147;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.766:19:2,8:2,7:1,3,11,4
chr2	71061001	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:9,2:5,6:5,9,3,5
chr2	71062744	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=216,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:1,3:9,0:4,6,3,0
chr2	71062833	.	G	GC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=63.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,7:0,0,11,8
chr2	71160421	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	71162996	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,4:0,4:3,0,8,0
chr2	71163225	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=124,290;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.442:11:0,1:6,2:1,5,2,3
chr2	71185391	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=178,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,4:7,2:6,7,4,2
chr2	71190228	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.471:10:2,0:1,0:2,3,5,0
chr2	71205976	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:0,5,0,10
chr2	71219173	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=161,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:2,0:6,2:2,7,0,2
chr2	71221897	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,1:6,1:0|1:71221897_A_C:71221897:3,10,2,0
chr2	71221901	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,23;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,1:8,0:0|1:71221897_A_C:71221897:3,12,2,0
chr2	71221905	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,12;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,0:0|1:71221897_A_C:71221897:3,11,2,0
chr2	71221962	.	ACCG	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCG;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	71297982	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.249:29:12,2:10,4:6,16,5,2
chr2	71305359	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,3:6,0:9,0,3,0
chr2	71357417	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,1:11,2:8,14,2,1
chr2	71360108	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,270;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:14,3:7,0:9,12,0,3
chr2	71360723	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=160,169;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:3,3:3,1:0|1:71360723_A_G:71360723:0,6,0,4
chr2	71360735	.	T	TTCC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=160,160;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TCC;STR;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:2,2:1,1:0|1:71360723_A_G:71360723:0,4,0,3
chr2	71366876	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=131,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:11,3,1,1
chr2	71375065	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=148,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:6,0:3,3:6,3,3,0
chr2	71376419	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=187,82;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,0:10,3:10,5,1,2
chr2	71417183	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,0:9,2:7,10,1,1
chr2	71620563	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,4:11,2:13,5,4,2
chr2	71620818	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr2	71626735	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=141,141;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,8:0.218:40:20,0:10,8:0|1:71626735_T_C:71626735:16,16,0,8
chr2	71626740	.	A	AATTTAGCAGCCATATCTGCCATAGTGTCC	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=141,141;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,8:0.191:45:19,0:13,7:0|1:71626735_T_C:71626735:17,20,0,8
chr2	71631109	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:10,0:8,2:4,14,1,1
chr2	71635462	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=154,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	71635931	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:4,2:4,9,2,1
chr2	71645828	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,0:5,3:2,7,1,2
chr2	71651939	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:1,3:1,8:0,2,0,11
chr2	71654450	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=167,282;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,3:10,1:10,11,0,4
chr2	71655586	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=185,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr2	71658364	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=155,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:9,1,2,0
chr2	71660495	.	T	TC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=C;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	71661855	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=244,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=71.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,25:0.866:28:1,10:2,15:3,0,13,12
chr2	71738968	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:2,2:8,2:9,2,2,2
chr2	71738987	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:7,7,0,2
chr2	71742892	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,5:6,2:3,9,0,7
chr2	71742978	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0,8,0,2
chr2	71743206	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=203,248;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	71743242	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=221,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,0:1,4:4,0,3,1
chr2	71743411	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=158,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:6,4,1,3
chr2	71747235	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,6:0,0,9,5
chr2	71747851	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr2	71747855	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=184,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr2	71747899	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=212,218;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:5,1,3,2
chr2	71748088	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,2:8,3:1,14,1,4
chr2	71753572	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	71755380	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr2	71762232	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=216,155;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.689:24:3,6:4,8:2,5,10,7
chr2	71762310	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,6:0,10:0,0,7,9
chr2	71762413	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:6,6:2,5:5,3,6,5
chr2	71778829	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=217,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:3,4,1,3
chr2	71781161	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=184,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr2	71783052	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:5,4,1,1
chr2	71796865	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	71801267	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=155,286;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr2	71801334	.	C	CAGGCGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=191,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AGGCGG;STR;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.498:12:5,3:1,3:6,0,3,3
chr2	71829821	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	71871039	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,6:2,3:0,2,6,3
chr2	71871106	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=139,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:12,0:8,4:10,12,4,0
chr2	71871236	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=334,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,11:1,6:1,0,8,9
chr2	71871263	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=135,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	71891361	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=182,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,4:1,6:2,2,9,1
chr2	71901286	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	71906171	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=243,252;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:1,1,6,1
chr2	71909822	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.488:16:4,3:3,3:2,6,4,4
chr2	72359312	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=183,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:4,1:8,1,2,0
chr2	72692272	.	A	AAG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=74.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,9:0,0,15,4
chr2	72741728	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=209,187;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.543:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	72741732	.	TAA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=134,179;MMQ=60,46;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr2	72742083	.	GAC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=141,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AC;STR;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	72742160	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=130,178;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:12,3:24,0:14,22,3,0
chr2	72786528	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=214,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,5,1
chr2	72958022	.	T	TAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	73188268	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=209,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.513:14:4,3:1,4:2,5,4,3
chr2	73195490	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,18;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:73195490_T_G:73195490:2,0,1,0
chr2	73195492	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,12;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:73195490_T_G:73195490:2,0,1,0
chr2	73195500	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,16;MFRL=190,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0|1:73195490_T_G:73195490:2,0,1,0
chr2	73226090	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=115,257;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,1:4,1:7,6,1,1
chr2	73249746	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,14;MFRL=165,77;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.386:3:0,0:1,0:0|1:73249746_T_G:73249746:0,2,0,1
chr2	73249753	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=142,77;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:73249746_T_G:73249746:0,1,0,1
chr2	73249756	.	G	GATAACATTA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=77,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr2	73285752	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=199,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,1:7,1:5,7,1,1
chr2	73339430	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=170,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:1,0,6,1
chr2	73430234	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	73435786	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,4:0,2:0,2,1,5
chr2	73447736	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=146,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:2,1,3,0
chr2	73447775	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:4,3,1,1
chr2	73450139	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=71,117;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,5,2
chr2	73455747	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:4,0:1,9,1,2
chr2	73467676	.	GAA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=103,108;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:2,3:4,5,2,4
chr2	73471653	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:11,1,5,1
chr2	73477351	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,4:3,0:10,0,3,1
chr2	73497888	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,1:8,1:8,1,2,0
chr2	73518533	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:2,2,1,2
chr2	73613031	.	TGGAGGA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=200,154;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=GGA;STR;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.730:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr2	73613341	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=119,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr2	73649928	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=225,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr2	73650122	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=97,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.613:16:0,6:6,4:2,4,0,10
chr2	73675019	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	73675227	.	T	TCTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTC;STR;TLOD=57.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr2	73678616	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=194,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:8,4,2,2
chr2	73761881	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:5,2,2,0
chr2	73784477	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:4,6,1,3
chr2	73799563	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=178,165;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:14,0:5,4:11,9,0,4
chr2	73828310	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	73830454	.	AC	TT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=168,187;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0|1:73830454_AC_TT:73830454:0,4,0,2
chr2	73830458	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=168,187;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:73830454_AC_TT:73830454:0,4,0,2
chr2	73868366	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.395:28:8,6:9,4:7,10,4,7
chr2	73868496	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=178,111;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,3:7,3:7,9,0,6
chr2	73868538	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,2:8,3:6,6,1,4
chr2	73927931	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,5,10
chr2	73928078	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:7,2,2,2
chr2	73928098	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=166,195;MMQ=60,59;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,8:2,8:4,1,12,4
chr2	73957227	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr2	73994074	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr2	73996554	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:73996554_T_C:73996554:0,4,0,1
chr2	73996557	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:73996554_T_C:73996554:0,4,0,1
chr2	74000908	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,127;MMQ=60,54;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:10,7:10,0:10,10,7,0
chr2	74005370	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,48;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:9,5,1,1
chr2	74040982	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:10,2:3,1:5,8,2,1
chr2	74086336	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=172,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:7,2:7,4,2,0
chr2	74089266	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=238,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.449:8:3,2:0,1:4,1,3,0
chr2	74128361	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,8,0
chr2	74128369	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:74128361_T_G:74128361:0,0,9,0
chr2	74128391	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	74128433	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,9:0,10:0,0,17,5
chr2	74128677	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,32;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,1,0,1
chr2	74128679	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,1,0,1
chr2	74128681	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,1,0,1
chr2	74128685	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,23;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,1,0,1
chr2	74128688	.	TG	GT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:74128677_G_C:74128677:0,0,0,1
chr2	74129474	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,2:0,6:0,0,8,1
chr2	74129664	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=60.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,10,9
chr2	74129712	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,8:0,0,5,13
chr2	74129895	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,3,10
chr2	74135380	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,10,3
chr2	74135732	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	74135797	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,7,4
chr2	74135898	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,13:0,8:0,0,8,13
chr2	74140581	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,11,4
chr2	74140789	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr2	74140830	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=142,110;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,0:2,5:0,6,0,5
chr2	74143990	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	74274180	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=218,403;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.163:16:7,0:5,0:3,11,2,0
chr2	74274353	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:10,6,3,0
chr2	74326443	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=101,97;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:5,0:10,4,1,1
chr2	74327528	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:0|1:74327528_C_T:74327528:5,12,1,1
chr2	74327537	.	GGA	TTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=122,65;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:11,2:0|1:74327528_C_T:74327528:8,13,1,1
chr2	74386266	.	CTCTTGCAGCTGCATCACAGAAT	C	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,0:9,2:9,12,1,1
chr2	74386299	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:0|1:74386299_GT_G:74386299:4,8,1,2
chr2	74386302	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,23;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:0|1:74386299_GT_G:74386299:4,8,1,2
chr2	74386305	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,1:6,1:0|1:74386299_GT_G:74386299:4,8,1,2
chr2	74386463	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	74435784	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=99,119;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:20,4:11,0:12,19,4,0
chr2	74448655	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=239,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,3:5,5:6,2,2,6
chr2	74450125	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=96,247;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:1,2,0,3
chr2	74454291	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr2	74469074	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,0:4,2:4,3,1,1
chr2	74512800	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,282;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	74531583	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=186,292;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,1,1
chr2	74589900	.	G	GAGGCTGACTGGA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:1,8,0,2
chr2	74598716	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,337;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,0:9,2:8,12,1,1
chr2	74601371	.	G	GCCCCCCCCCC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=37,36;MFRL=211,279;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,15;RU=C;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.523:2:1,1:0,0:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:1,0,1,0
chr2	74601377	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=16,36;MFRL=144,279;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.342:4:0,1:0,0:0|1:74601371_G_GCCCCCCCCCC:74601371:3,0,1,0
chr2	74643417	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=194,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,0,3
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chr2	74746322	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=112,227;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:6,1:13,1:10,10,0,2
chr2	74749790	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,183;MMQ=60,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:7,0:11,8,2,0
chr2	74750213	.	GTTT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=19.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,4:7,2:8,5,5,1
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chr2	74754818	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=236,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:4,5,2,2
chr2	74755778	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=188,355;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:10,0,3,0
chr2	74756111	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=198,271;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.237:18:3,0:11,4:5,9,0,4
chr2	74756176	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=187,264;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,4:3,4:6,1,6,2
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chr2	74761422	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,1:1,2:6,2,2,1
chr2	74761539	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=132,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,1:2,5:5,4,5,1
chr2	74783252	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=248,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.405:5:2,0:1,0:1,2,0,2
chr2	74783626	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=121,239;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:4,4:8,0:7,6,4,0
chr2	74783824	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:11,5:11,2:10,12,5,2
chr2	74786974	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=206,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr2	74882505	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=192,58;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:0|1:74882505_C_A:74882505:5,12,1,1
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chr2	74882514	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=197,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:9,2:0|1:74882505_C_A:74882505:5,11,1,1
chr2	74882519	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=203,58;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:74882505_C_A:74882505:4,10,1,1
chr2	74882523	.	GA	TT	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=201,58;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:8,1:0|1:74882505_C_A:74882505:4,11,1,1
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chr2	74902855	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,2:9,1:6,5,0,3
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chr2	75099381	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,10:0.276:38:15,3:12,7:25,3,8,2
chr2	75101454	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.418:34:11,9:8,5:9,11,9,5
chr2	75104218	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:8,0,4,2
chr2	75105798	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=133.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,38:0.975:38:0,24:0,13:0,0,22,16
chr2	75107367	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=224,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	75108744	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,1:4,2:12,0,3,0
chr2	75113572	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:1,0,3,7
chr2	75116627	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=127,83;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=76.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,27:0.758:35:3,14:5,13:2,6,8,19
chr2	75276846	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=216,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:1,1:8,1:2,7,1,1
chr2	75425623	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.547:7:1,0:2,3:3,0,4,0
chr2	75745081	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,291;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:6,1,2,1
chr2	75874390	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:2,8,1,2
chr2	75881828	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=273,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr2	75882156	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=17,34;MFRL=212,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.659:5:0,2:0,1:0,2,3,0
chr2	75900700	.	C	CA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=177,278;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.377:17:3,3:8,3:0,11,0,6
chr2	75907435	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,18;MFRL=146,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:3,1:0|1:75907435_C_T:75907435:1,7,1,1
chr2	75907439	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=146,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:0|1:75907435_C_T:75907435:1,7,1,1
chr2	75919272	.	AATAT	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=141,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=AT;STR;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.511:6:0,0:2,3:0|1:75919272_AATAT_A:75919272:0,3,0,3
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chr2	75933830	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr2	75933858	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=275,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	76975772	.	G	GACAGGCCAGCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr2	77746750	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.138:20:8,1:8,1:10,8,1,1
chr2	77747000	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr2	79253150	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:9,0,4,0
chr2	79253375	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,71;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:1,7,0,2
chr2	79253818	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,2:4,1:7,1,1,2
chr2	79253987	.	ATAGGGGAAAGT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=209,155;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,2:3,0:0|1:79253987_ATAGGGGAAAGT_A:79253987:3,5,1,1
chr2	79254000	.	CATGCA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=215,155;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:2,2:2,0:0|1:79253987_ATAGGGGAAAGT_A:79253987:3,2,1,1
chr2	79254101	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:9,3,1,2
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chr2	79314081	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=197,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:0,3:3,5:0,3,3,6
chr2	79314094	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=150,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,2,6
chr2	79348145	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=269,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,1,0
chr2	79348148	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:79348148_G_C:79348148:0,3,1,0
chr2	79348152	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,10;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:79348148_G_C:79348148:0,3,1,0
chr2	79348154	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,15;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:79348148_G_C:79348148:0,3,1,0
chr2	79348156	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=223,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:79348148_G_C:79348148:0,3,1,0
chr2	79350186	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=232,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:4,6,2,2
chr2	79384917	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	79385946	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=220,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,1:1,0:0,1,0,6
chr2	79914570	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr2	80101515	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=274,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,2:1,0:0,3,0,3
chr2	80136693	.	TTG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=135,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr2	80530632	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:6,7,1,1
chr2	80531022	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.402:33:11,0:8,13:8,12,0,13
chr2	80772972	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr2	80801524	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=247,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	80809027	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=202,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr2	80846147	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,274;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,2:0,2:3,1,4,0
chr2	81421230	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,184;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.413:22:9,6:4,3:6,7,6,3
chr2	81421464	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,3:4,0:8,7,3,0
chr2	84650826	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=127,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:7,0:0|1:84650826_G_A:84650826:8,10,1,1
chr2	84650832	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=119,90;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,1:6,0:0|1:84650826_G_A:84650826:8,9,1,1
chr2	84676163	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr2	84676886	.	TAAA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=25,22;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.888:5:0,2:0,2:0,0,1,4
chr2	84755996	.	A	ATT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.595:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr2	84756008	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,11;MFRL=198,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,0:0,0:3,0,5,0
chr2	84756341	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	84784930	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.290:22:9,2:7,4:0|1:84784930_G_T:84784930:8,8,0,6
chr2	84784938	.	A	ATTTTAAG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=201,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:8,2:6,4:0|1:84784930_G_T:84784930:7,7,0,6
chr2	84800605	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,10,9
chr2	84800621	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=187,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:4,4:10,2:9,6,3,3
chr2	84806553	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	84811234	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=141,73;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:14,2:10,0:13,11,2,1
chr2	84822715	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	84831767	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	84834063	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr2	84834237	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr2	84897361	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	84899360	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	84912420	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,2:2,1:5,0,3,0
chr2	84915469	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	84940477	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr2	84950006	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=216,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr2	85024731	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:7,0:10,6:8,10,3,3
chr2	85035596	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:5,8,0,3
chr2	85041316	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,254;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	85051122	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=172,205;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,1:10,2:14,8,2,1
chr2	85059255	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=164,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,5:7,5:2,7,6,4
chr2	85066245	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:7,7,1,2
chr2	85069180	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=254,177;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr2	85108252	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	85262213	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=158,0;MMQ=60,55;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:15,4,0,2
chr2	85270887	.	G	GGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.318:4:2,1:1,0:0|1:85270887_G_GGA:85270887:0,3,0,1
chr2	85270889	.	T	TGCAATGGCACCATCGCGGCACAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=162,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:1,0:0|1:85270887_G_GGA:85270887:0,3,0,1
chr2	85276516	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,0:8,2:9,11,0,2
chr2	85360828	.	GGGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=238,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GGC;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	85510777	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr2	85570273	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr2	85570942	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=140,195;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,3:4,1:3,4,1,3
chr2	85571710	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,128;MMQ=60,45;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,6:1,4:2,0,7,3
chr2	85573033	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=200,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr2	85573049	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=158,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	85578212	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,11;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:85578212_G_T:85578212:0,1,0,1
chr2	85578219	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:85578212_G_T:85578212:0,1,0,1
chr2	85579054	.	AAAG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=217,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	85590299	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=164,55;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:2,0:3,2:2,3,2,0
chr2	85596739	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=126,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:6,4:13,3:15,4,5,2
chr2	85598381	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=228,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:5,0:3,5:2,6,0,6
chr2	85662017	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,20;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,2,1
chr2	85662650	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:1,3,4,6
chr2	85769246	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,14,4
chr2	85769975	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=149,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,3:4,4:9,0,5,2
chr2	85776965	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,16;MFRL=255,186;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:85776965_AC_A:85776965:2,0,1,0
chr2	85776971	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=255,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:85776965_AC_A:85776965:2,0,1,0
chr2	85776973	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,15;MFRL=255,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:85776965_AC_A:85776965:2,0,1,0
chr2	85777633	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:13,1,2,0
chr2	85778837	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=236,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,2,0
chr2	85779785	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,181;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,5:4,0:2,7,5,0
chr2	85781318	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,10,16
chr2	85788140	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=240,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:1,4:5,3:2,4,2,5
chr2	85788401	.	GA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,368;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	85804825	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.183:19:3,1:13,2:0|1:85804825_G_GA:85804825:8,8,2,1
chr2	85804826	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=138,67;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.186:19:3,1:13,2:0|1:85804825_G_GA:85804825:8,8,2,1
chr2	85806068	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=86,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr2	85807081	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=195,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.543:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr2	85808871	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=111,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:1,2:9,1:2,8,0,3
chr2	85824084	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,359;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:6,2:5,11,1,2
chr2	85826225	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,128;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.274:19:7,0:7,4:7,7,0,5
chr2	85826931	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=180,182;MMQ=60,43;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.320:26:10,0:7,7:12,6,0,8
chr2	85828986	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=120,132;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:9,4:6,7:12,3,6,5
chr2	85836153	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=185,86;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:8,4:4,0:6,6,5,0
chr2	85836661	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,1:10,2:10,8,0,3
chr2	85848747	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.512:6:1,2:0,1:1,2,0,3
chr2	85890771	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:0,4:4,4:3,1,8,0
chr2	85890859	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=121,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:2,7,0,2
chr2	85893741	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=116,195;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:4,2,2,1
chr2	85924899	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=164,275;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr2	85925756	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=169,283;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:3,1,0,2
chr2	86075582	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:0,9,1,2
chr2	86079932	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=205,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:10,3,2,0
chr2	86258784	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.277:19:9,2:3,2:6,8,1,4
chr2	86275985	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr2	86292656	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:0,2,0,8
chr2	86302103	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr2	86304934	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,249;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,0:0,0,4,0
chr2	86305123	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,9,10
chr2	86310110	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=214,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	86332809	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.699:18:3,3:2,9:2,3,10,3
chr2	86334199	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,6:2,5:2,1,7,4
chr2	86335718	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,5,5
chr2	86338252	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=141,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:9,14,0,2
chr2	86344095	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=138,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr2	86344367	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	86352010	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=145,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	86352825	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=176,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr2	86357842	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=194,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:4,3:7,5,3,0
chr2	86358244	.	T	TAGG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:11,2:12,0:0|1:86358244_T_TAGG:86358244:10,13,1,1
chr2	86358248	.	TTAA	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=169,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,2:12,0:0|1:86358244_T_TAGG:86358244:10,13,1,1
chr2	86358254	.	T	TAG	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=166,61;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:10,1:11,0:0|1:86358244_T_TAGG:86358244:9,14,1,1
chr2	86359405	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr2	86360225	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:3,1,4,0
chr2	86360573	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=153,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,0:4,2:3,8,1,1
chr2	86362204	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=259,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,9:0,3:0,2,0,12
chr2	86364706	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr2	86378518	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=109,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:16,1:7,1:12,11,0,2
chr2	86378593	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,3:12,0:0|1:86378593_G_A:86378593:8,14,2,1
chr2	86378596	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:9,3:12,0:0|1:86378593_G_A:86378593:8,14,2,1
chr2	86385886	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr2	86393802	.	CC	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=139,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr2	86408385	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,3:9,0:7,5,2,1
chr2	86422416	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,16:0.340:48:15,8:17,8:0|1:86422416_T_C:86422416:11,21,13,3
chr2	86422421	.	T	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,15:0.327:47:12,6:14,8:0|1:86422416_T_C:86422416:11,21,12,3
chr2	86437551	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,5:0,0,9,2
chr2	86478980	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=247,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:5,0,6,0
chr2	86479035	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,3:1,6:4,3,5,4
chr2	86479287	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=255,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr2	86491245	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=274,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.536:7:1,1:2,1:0,3,0,4
chr2	86509267	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,53;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:9,3,2,2
chr2	86509388	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=124,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,8:6,2:3,9,6,4
chr2	86678124	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr2	86683539	.	ATTT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.426:8:2,3:2,0:4,1,3,0
chr2	86683569	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=115,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.172:28:9,0:12,0:9,14,5,0
chr2	86691250	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=107,242;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:4,2:12,3:3,13,3,2
chr2	86707504	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=121,283;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:6,3:5,0:5,6,1,2
chr2	86716658	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=193,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:9,9,0,2
chr2	86719203	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:9,7,0,3
chr2	86737393	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,17;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.782:2:0,0:0,0:0|1:86737393_C_G:86737393:0,0,2,0
chr2	86737397	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,23;MFRL=0,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0|1:86737393_C_G:86737393:0,0,2,0
chr2	86737401	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,27;MFRL=868,66;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0|1:86737393_C_G:86737393:1,0,2,0
chr2	86737405	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,12;MFRL=235,66;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,0:3,0:0|1:86737393_C_G:86737393:2,1,2,0
chr2	86737408	.	TC	GA	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=24,17;MFRL=223,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,0:3,0:0|1:86737393_C_G:86737393:2,2,2,0
chr2	86737412	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=223,66;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,0:0|1:86737393_C_G:86737393:2,2,2,0
chr2	86737415	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=32,18;MFRL=235,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.325:7:2,0:3,0:0|1:86737393_C_G:86737393:3,2,2,0
chr2	86737649	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr2	86756280	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=232,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr2	86831055	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=124,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:3,3,2,0
chr2	86850022	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,1:7,1:3,15,2,0
chr2	86992337	.	T	TAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,1:6,1:3,11,0,2
chr2	86998659	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=130,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	87073743	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,215;MMQ=52,36;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr2	87073879	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=125,204;MMQ=52,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,2:7,1:0|1:87073879_T_C:87073879:4,12,3,0
chr2	87073883	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=138,97;MMQ=52,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,5:0.299:18:9,0:4,5:1|0:87073879_T_C:87073879:6,7,0,5
chr2	87088964	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,288;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	87808726	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,179;MMQ=27,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,3:6,1:3,4,1,3
chr2	88384084	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=245,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr2	88396080	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=123,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:8,2,5,0
chr2	88410102	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	88472925	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=184,313;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	88474370	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	88484808	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,4:0,3:0,0,6,3
chr2	88484958	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:4,6,1,1
chr2	88485392	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=59.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr2	88748201	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=153,48;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.297:14:5,3:5,0:6,4,2,2
chr2	88748390	.	A	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.305:44:7,2:23,11:0,31,2,11
chr2	88825315	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=161,328;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.616:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr2	88826071	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=187,227;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:0,8,0,4
chr2	88870632	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	88874469	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=159,167;MMQ=60,48;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:10,0:14,4:9,15,0,4
chr2	88882942	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:0,4:7,1:5,2,2,3
chr2	88885313	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=147,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,6:3,0:7,2,6,0
chr2	88926510	.	C	CTCTCTGTCTCTCTCT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:9,0:3,2:0|1:88926510_C_CTCTCTGTCTCTCTCT:88926510:3,10,1,1
chr2	88926511	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=128,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:8,0:2,1:0|1:88926510_C_CTCTCTGTCTCTCTCT:88926510:3,10,1,1
chr2	89160909	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.595:5:0,2:1,1:2,0,2,1
chr2	89196757	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:8,0,4,0
chr2	89196906	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:6,0:5,5:4,7,2,3
chr2	89197190	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=137,145;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,4:2,4:3,4,4,4
chr2	89247007	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=225,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,4:6,0:6,6,3,1
chr2	89265717	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=235,74;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.402:15:5,2:4,3:7,2,3,3
chr2	89265785	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=194,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:14,8,4,0
chr2	89292201	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=266,156;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:6,3,0,2
chr2	89292476	.	T	TTGTGCCCTGGGAACATGCAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,244;MMQ=60,37;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,2:0,3:0,0,0,7
chr2	89309424	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=244,69;MMQ=60,56;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,1:7,3:9,2,2,2
chr2	89417087	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=206,100;MMQ=40,30;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,1:7,1:0|1:89417087_G_T:89417087:8,8,3,0
chr2	89417090	.	AG	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=206,100;MMQ=40,30;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,2:7,1:0|1:89417087_G_T:89417087:8,8,3,0
chr2	89544163	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,146;MMQ=27,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	89544473	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=175,168;MMQ=27,27;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,2:1,1:1,4,1,2
chr2	90024874	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,145;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,4:2,4:6,3,4,4
chr2	90043717	.	TG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,153;MMQ=60,27;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	90078066	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=180,109;MMQ=49,21;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,27:0.683:39:7,0:5,27:8,4,0,27
chr2	90078370	.	TA	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	90108416	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	90108778	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,10:0,7:1,0,13,5
chr2	90139116	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,127;MMQ=27,33;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,3:4,4:9,1,4,3
chr2	90211898	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=164,57;MMQ=50,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:10,9,1,1
chr2	90211936	.	T	TGCTTTTTCTCATCGTTGCATA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=178,176;MMQ=40,23;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:9,8,0,2
chr2	90211969	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=185,158;MMQ=40,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,3:7,4:5,6,3,4
chr2	95542363	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=189,181;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:5,3,1,1
chr2	95542376	.	GC	TT	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=185,181;MMQ=60,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:4,5,1,1
chr2	95542415	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=177,144;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:95542415_CA_TG:95542415:5,5,2,0
chr2	95542419	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=169,144;MMQ=60,25;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:3,0:4,2:0|1:95542415_CA_TG:95542415:4,5,2,0
chr2	95846118	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=237,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:1,7,0,2
chr2	95847040	.	TGCG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCG;STR;TLOD=89.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,13:0,9:0,0,12,10
chr2	95847826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:5,7,2,0
chr2	95942897	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr2	95944902	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,2,2
chr2	95945568	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=185,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,3:4,4:3,1,6,1
chr2	95945830	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	95952177	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	95952622	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,0,2
chr2	95963242	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	96012907	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.710:11:2,5:0,3:1,2,2,6
chr2	96040560	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,181;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr2	96048862	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048867	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,13;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048872	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,16;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048875	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,12;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048879	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,23;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048883	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=9;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:96048862_C_T:96048862:0,0,1,0
chr2	96048888	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=24,15;MFRL=218,177;MMQ=60,49;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:96048862_C_T:96048862:1,0,1,0
chr2	96048891	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=9;MBQ=29,12;MFRL=218,177;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:96048862_C_T:96048862:1,0,1,0
chr2	96048895	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=9;MBQ=29,26;MFRL=218,177;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:96048862_C_T:96048862:1,0,1,0
chr2	96049917	.	T	TAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=AC;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.789:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr2	96071285	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:5,0:8,3:10,3,2,1
chr2	96072754	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=180,160;MMQ=60,55;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,1:15,2:12,13,1,2
chr2	96076409	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,3,7
chr2	96076797	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=155,76;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,0:4,2:5,4,2,0
chr2	96260979	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	96780569	.	GC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=152,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:7,2:9,7,1,1
chr2	96780986	.	C	CTCCTCCTCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=206,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCCTCCTCT;STR;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:1,1,2,6
chr2	96781986	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=289,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr2	96789953	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=150,77;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,3:14,0:15,10,1,2
chr2	96790056	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=211,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:96790056_A_C:96790056:0,4,0,1
chr2	96790059	.	T	TCA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=211,119;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:96790056_A_C:96790056:0,4,0,1
chr2	96799062	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=246,108;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr2	96858914	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:5,3:4,1:4,5,4,1
chr2	96860715	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,99;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,0:13,4:20,6,0,4
chr2	96861159	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,2:8,3:11,7,0,5
chr2	96873853	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,12;MFRL=149,84;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:5,0:2,11,2,0
chr2	96906148	.	ACTC	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:3,3:7,4:6,7,4,4
chr2	96906353	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=140,314;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:8,1:17,2:10,15,3,0
chr2	96943473	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=232,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,6:3,2:2,2,2,6
chr2	96952833	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=384,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:1,4:0,7:1,0,4,7
chr2	96955480	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=216,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:1,0,9,0
chr2	96956315	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=66.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,9,9
chr2	96963360	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:12,2:8,1:11,9,2,1
chr2	96966661	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,3:1,3:5,0,5,1
chr2	96970664	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,214;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:9,0:9,3:1,17,0,3
chr2	96991492	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,7:4,4:3,2,5,6
chr2	97001694	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,23;MFRL=105,315;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr2	97020170	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=196,115;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:0,5,0,5
chr2	97216820	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=218,43;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:6,2,2,0
chr2	97267293	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=242,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:4,0,4,0
chr2	97269907	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=167,205;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr2	97313450	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=210,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr2	97319534	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr2	97328077	.	T	TTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	97329354	.	C	CTAATATGGTGAAACCCCATCTCTATGA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	97353725	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:6,5:1,5:1,6,3,7
chr2	97359442	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=120,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,1:8,3:3,12,1,3
chr2	97360079	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=216,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:4,1,2,1
chr2	97366303	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	97400324	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,1:1,8:0,3,1,8
chr2	97426708	.	AGCG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=288,308;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GCG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr2	97465215	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:7,1,2,0
chr2	97465340	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=144,81;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.188:28:13,0:9,4:9,14,4,1
chr2	97506312	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=202,124;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:4,6,0,2
chr2	97529360	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:6,1,2,1
chr2	97543591	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,266;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:7,1,2,0
chr2	97544089	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.685:7:0,4:1,1:2,0,5,0
chr2	97568453	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=133,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:12,2:10,0:8,14,1,1
chr2	97587049	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr2	97595109	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,1,9
chr2	97595158	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=62.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.732:28:3,0:3,21:0,7,0,21
chr2	97613647	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:9,1:7,1:8,8,1,2
chr2	97617227	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,4,12
chr2	97638352	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,90;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	97757509	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr2	97784155	.	C	CCTACTAG	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,64642713;MMQ=50,38;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.101:27:8,2:17,0:0|1:97784155_C_CCTACTAG:97784155:8,17,0,2
chr2	97784157	.	T	TATATGG	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=147,64642713;MMQ=50,38;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:8,1:17,0:0|1:97784155_C_CCTACTAG:97784155:8,17,0,2
chr2	97784295	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,220;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	98128172	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=199,155;MMQ=25,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,4:0,8:0,1,11,1
chr2	98128194	.	GGT	CAC	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=259,169;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=72.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,8:1,8:0,2,16,1
chr2	98128228	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=128,175;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:8,4,3,0
chr2	98128256	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=7;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,7
chr2	98128258	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=0,36;MFRL=0,144;MMQ=60,25;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0|1:98128256_C_T:98128256:0,0,0,7
chr2	98128300	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=27,34;MFRL=164,172;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:0,4,1,5
chr2	98128313	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=33,26;MFRL=177,192;MMQ=26,26;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:0,4,1,5
chr2	98128364	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=25,27;MFRL=285,210;MMQ=25,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,2:1,0,3,4
chr2	98128387	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=33,27;MFRL=273,251;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	98128402	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=285,251;MMQ=25,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	98128421	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=0,34;MFRL=0,251;MMQ=60,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	98128449	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	98128473	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=174,191;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr2	98128515	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=34,27;MFRL=114,155;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0|1:98128515_C_T:98128515:1,0,4,0
chr2	98128520	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=10;MBQ=35,30;MFRL=114,155;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0|1:98128515_C_T:98128515:1,0,4,0
chr2	98128531	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=34,29;MFRL=114,155;MMQ=25,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	98128574	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=10;MBQ=34,32;MFRL=200,191;MMQ=25,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,6:1,7:0,2,0,13
chr2	98129586	.	GG	AT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=167,223;MMQ=27,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:0|1:98129586_GG_AT:98129586:5,2,2,0
chr2	98129589	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=167,223;MMQ=27,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,1:2,1:0|1:98129586_GG_AT:98129586:5,2,2,0
chr2	98129603	.	TAA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=175,210;MMQ=27,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:3,2,4,0
chr2	98129670	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=163,162;MMQ=25,25;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,2,0
chr2	98129682	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=30,33;MFRL=163,143;MMQ=27,25;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:0|1:98129682_TG_CA:98129682:2,4,5,0
chr2	98129690	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=163,134;MMQ=27,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:4,2:2,2:0|1:98129682_TG_CA:98129682:2,4,5,0
chr2	98129707	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=33,25;MFRL=178,121;MMQ=27,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.611:16:3,6:3,4:0|1:98129707_G_T:98129707:2,4,10,0
chr2	98129716	.	AC	GT	.	.	DP=20;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=167,121;MMQ=27,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.619:19:4,5:3,4:0|1:98129707_G_T:98129707:3,4,11,1
chr2	98129731	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=163,134;MMQ=27,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=127.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,30:0.816:36:3,9:3,15:0|1:98129731_C_T:98129731:3,3,22,8
chr2	98129733	.	AT	CC	.	.	DP=38;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=163,139;MMQ=27,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=132.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,32:0.825:38:3,13:3,17:0|1:98129731_C_T:98129731:3,3,22,10
chr2	98129744	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=137,145;MMQ=27,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=149.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,40:0.805:49:2,18:7,22:0|1:98129731_C_T:98129731:3,6,27,13
chr2	98129802	.	C	CTTTTTT	.	.	DP=28;ECNT=12;MBQ=35,22;MFRL=142,77;MMQ=25,37;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=7,13;RU=T;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.150:17:6,0:9,2:5,10,0,2
chr2	98129817	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=29,34;MFRL=141,132;MMQ=25,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,1,4
chr2	98129879	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=163,161;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,2:6,2:0,11,0,4
chr2	98129924	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=12;MBQ=32,27;MFRL=199,224;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr2	98154551	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=215,176;MMQ=27,35;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	98154803	.	G	GATT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,23;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	98164084	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,224;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	98169519	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=164,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:0,1,7,1
chr2	98169544	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=161,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,7:0,2:1,1,8,1
chr2	98169583	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=158,137;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	98169742	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=251,168;MMQ=52,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,3:2,6:5,1,4,5
chr2	98169901	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=236,194;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,1,1
chr2	98171807	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=204,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:0,1,2,5
chr2	98173368	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,164;MMQ=50,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:0,11:1,5:1,0,9,8
chr2	98192743	.	A	AAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=201,181;MMQ=58,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0|1:98192743_A_AAC:98192743:3,0,2,0
chr2	98192749	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=195,181;MMQ=59,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:98192743_A_AAC:98192743:2,0,2,0
chr2	98196849	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=110,136;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:1,2:0,6:0|1:98196849_G_A:98196849:1,0,9,1
chr2	98196859	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=110,128;MMQ=60,51;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.848:11:1,2:0,8:0|1:98196849_G_A:98196849:1,0,8,2
chr2	98196987	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,78;MMQ=52,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:10,0:17,5:13,14,0,5
chr2	98205924	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=210,203;MMQ=50,36;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr2	98206188	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=263,147;MMQ=44,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.848:18:0,3:2,11:0,2,5,11
chr2	98273290	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:2,1,4,2
chr2	98276014	.	CCCTCACCTGCCCTGACCAGAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCTCACCTGCCCTGACCAGAA;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.791:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	98340485	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	98351654	.	TG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,5:2,1:6,0,6,0
chr2	98351986	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=445,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	98353847	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=193,261;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:2,0,3,0
chr2	98354139	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=226,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:0,1:4,2:1,3,2,2
chr2	98355929	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:16,0:5,4:0|1:98355929_A_C:98355929:6,15,0,4
chr2	98355931	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=153,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:16,0:5,4:0|1:98355929_A_C:98355929:6,15,0,4
chr2	98355990	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:0,1,0,7
chr2	98373770	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=225,50;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.079:41:20,0:18,2:12,26,0,3
chr2	98376989	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=30.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr2	98382886	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:2,6:0,11:2,0,9,8
chr2	98392302	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=203,41;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,6:5,0:6,3,3,3
chr2	98413469	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:11,0:3,10:3,11,0,10
chr2	98413781	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=200,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:5,4:1,3:6,0,4,3
chr2	98418812	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr2	98421642	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=128,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:19,0:4,2:12,12,1,1
chr2	98449796	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,7:0,0,6,10
chr2	98451036	.	TAA	T,TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25,26;MFRL=184,131,152;MMQ=60,60,60;MPOS=27,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.86,5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,4:0.181,0.289:14:5,0,2:3,2,2:4,4,5,1
chr2	98460742	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:1,8,1,3
chr2	98475985	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=199,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:3,1:0,6,0,2
chr2	98543829	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=190,138;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,6:6,0:10,3,6,0
chr2	98544058	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,2:6,3:0,12,1,4
chr2	98795873	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,201;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,3:1,4:0,2,0,8
chr2	98797744	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	98872570	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=162,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.232:22:12,2:3,3:11,6,2,3
chr2	98872662	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,1:0,1:0,2,1,1
chr2	98907052	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=126,83;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,2:0.075:38:13,2:19,0:21,15,0,2
chr2	98907089	.	GT	G,GTT	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,33,33;MFRL=126,192,118;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=5.22,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,5:0.147,0.196:28:12,1,0:7,2,4:10,9,6,3
chr2	98994309	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=170,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.152:18:5,2:8,0:3,13,0,2
chr2	98996730	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=173,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:3,9,1,1
chr2	99013338	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=225,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,2:10,0:3,9,1,1
chr2	99154229	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	99165524	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=132,162;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.261:17:6,0:7,4:0|1:99165524_T_C:99165524:1,12,0,4
chr2	99165528	.	C	CCAGTCGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:5,0:6,4:0|1:99165524_T_C:99165524:0,12,0,4
chr2	99184977	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,4:5,0:7,0,4,0
chr2	99220707	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=162,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0,12,1,1
chr2	99227409	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:0,6,1,5
chr2	99232873	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,2:8,3:6,5,5,0
chr2	99234586	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.559:10:3,3:1,2:4,0,5,1
chr2	99237792	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=225,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,5,0
chr2	99272057	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=332,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:0,2,1,5
chr2	99294714	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,229;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99294714_T_A:99294714:0,0,1,0
chr2	99294716	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,229;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:99294714_T_A:99294714:0,0,1,0
chr2	99295003	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=223,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	99414067	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	99443369	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=184,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.399:6:1,2:2,0:4,0,2,0
chr2	99449536	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=314,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	99688127	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=139,238;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.255:10:5,2:3,0:6,2,1,1
chr2	99689440	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=168,168;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.202:26:10,4:10,0:12,9,5,0
chr2	99689610	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=161,14624;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0,10,0,2
chr2	99721804	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.541:7:1,3:1,1:2,1,4,0
chr2	99725223	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	99725479	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=202,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=56.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,8:1,8:0,1,4,12
chr2	99766927	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	99778840	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,105;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:9,5,1,1
chr2	99779653	.	AAC	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=184,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.220:11:3,1:5,1:2,7,0,2
chr2	99779655	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=74,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.775:16:1,5:2,8:0,3,3,10
chr2	99802820	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	99936182	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=109,108;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,2:12,1:14,9,2,1
chr2	99936265	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=176,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:3,2:3,1:1,5,1,2
chr2	99980159	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=117,113;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:11,4:8,0:9,10,5,0
chr2	99995458	.	ATT	A,AT,ATTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=16,31,29,32;MFRL=142,130,183,140;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,14,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.46,14.92,3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,8,3:0.142,0.355,0.165:21:1,2,2,2:2,1,5,1:3,4,13,1
chr2	99995571	.	G	GTGAAGTAGCCCACCTGAGGTC	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=132,42;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:13,1:20,2:13,20,1,2
chr2	99995804	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:8,2:12,2:12,8,1,3
chr2	100006620	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:4,6,2,1
chr2	100006649	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=159,270;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,0:6,3:8,7,3,0
chr2	100006890	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,2:2,1:1,7,3,0
chr2	100029242	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:22,0:9,4:16,15,0,4
chr2	100079159	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=182,47820305;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr2	100081561	.	A	AAAGTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=190,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr2	100176775	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:1,2:9,1:9,1,3,0
chr2	100210614	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:6,7,0,2
chr2	100368849	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:0,10,0,4
chr2	100454085	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr2	100623130	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr2	100628034	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=164,122;MMQ=60,29;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:2,9,0,2
chr2	100628052	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=154,122;MMQ=60,29;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:2,0:5,2:0|1:100628052_C_T:100628052:1,7,0,2
chr2	100628055	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=154,122;MMQ=60,29;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0|1:100628052_C_T:100628052:1,7,0,2
chr2	100721050	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=263,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr2	100915629	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:3,1,6,1
chr2	101011877	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=195,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr2	101014363	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=94,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:9,5:2,6:5,6,5,6
chr2	101031561	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=176,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:5,4:8,2:2,12,1,5
chr2	101031588	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.270:12:3,2:6,1:0,9,0,3
chr2	101086966	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=152,81;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,2,0
chr2	101096903	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=206,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,4:3,1:6,3,3,2
chr2	101437762	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	101521173	.	ATT	A,AT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27,24;MFRL=190,46,103;MMQ=60,60,60;MPOS=3,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=T;STR;TLOD=8.03,8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,6,8:0.331,0.405:19:2,1,6:2,5,0:3,2,8,6
chr2	101541798	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,6:2,3:4,3,1,8
chr2	101564628	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:1,0,4,0
chr2	101581294	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.445:11:4,1:2,3:6,0,4,1
chr2	101611775	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,58;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,0:4,2:7,0,2,0
chr2	101612051	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=193,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:1,1,0,4
chr2	101619283	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=45.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:3,5:2,8:0,5,2,11
chr2	101619321	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=169,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:0,3,0,9
chr2	101622696	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=113,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	101627343	.	CAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,36,32;MFRL=228,174,159;MMQ=45,40,53;MPOS=18,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,11,15;RU=A;STR;TLOD=3.13,7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,3:0.201,0.472:6:2,1,0:0,0,3:2,0,4,0
chr2	101627367	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=137,199;MMQ=60,57;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:4,0:7,0:6,7,2,0
chr2	101627852	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=139,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,5,0
chr2	101675808	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=280,248;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	101874442	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,2:4,3:2,10,2,3
chr2	101881549	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=146,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:5,11,0,4
chr2	101883046	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	101885656	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:5,2:9,2:8,6,4,0
chr2	101911385	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:14,1:4,1:15,3,1,1
chr2	101925026	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:0,3,1,3
chr2	101967346	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	102000210	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,4:1,5:0,3,0,9
chr2	102003962	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	102027050	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.318:15:4,2:4,3:9,1,4,1
chr2	102027178	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:6,14,0,2
chr2	102027188	.	A	ACGTCCCCTGAGCTAATTCCAGCC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=196,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,3:9,0:4,10,0,3
chr2	102029548	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:10,1:2,5:2,10,1,5
chr2	102031489	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	102083183	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:9,2:5,2:11,4,2,2
chr2	102314437	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=196,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr2	102407332	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=209,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr2	102440581	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=102,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,0:0,1:0|1:102440581_G_GC:102440581:1,0,0,1
chr2	102440586	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=102,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:102440581_G_GC:102440581:1,0,0,1
chr2	102448164	.	CT	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=150,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:19,1:11,2:21,10,2,1
chr2	102505434	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:1,8,2,0
chr2	102632582	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr2	102641201	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=250,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:0,7,0,7
chr2	102642558	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,114;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:6,1,0,2
chr2	102785158	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=152,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.467:9:1,1:4,3:2,3,1,3
chr2	102788409	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr2	102792760	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	102849348	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr2	102954653	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.594:17:4,4:1,6:5,2,7,3
chr2	102957026	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=203,200;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.556:25:5,1:4,0:0|1:102957026_T_C:102957026:11,0,14,0
chr2	102957035	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=203,200;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,15:0.565:26:6,14:4,1:0|1:102957026_T_C:102957026:11,0,15,0
chr2	102957348	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	102957628	.	C	CTT,CTTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35,19;MFRL=126,156,158;MMQ=60,60,60;MPOS=24,9;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,17,18;RU=T;STR;TLOD=3.23,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.555,0.223:6:0,3,0:1,0,0:1,0,4,1
chr2	102957644	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,11;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:2,0:2,0:3,2,4,0
chr2	102967928	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	102984624	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	103006448	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr2	103010912	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,14,2
chr2	103013408	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr2	103039686	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:8,2,3,0
chr2	103039873	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,7:2,4:0,5,2,9
chr2	103040177	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:103040177_A_T:103040177:0,0,8,0
chr2	103040182	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,27;MFRL=112,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.819:9:0,2:1,6:0|1:103040177_A_T:103040177:1,0,8,0
chr2	103040247	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.942:15:0,2:0,12:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,10,5
chr2	103040249	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.944:15:0,2:0,13:0|1:103040247_T_TG:103040247:0,0,10,5
chr2	103040797	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:6,8,0,2
chr2	103057668	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr2	103057892	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=283,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,7:1,0:1,0,3,4
chr2	103059613	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr2	103059874	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,294;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	103061714	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:11,6,2,0
chr2	103063489	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,4:1,2:1,3,5,1
chr2	103063520	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=182,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,3:1,1:3,1,0,4
chr2	103068156	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr2	103120232	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	103121654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=223,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr2	103125457	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,9
chr2	103125466	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=32.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,5:0|1:103125457_A_G:103125457:0,0,0,8
chr2	103136309	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=65.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,13,6
chr2	103136446	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=40.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	103141447	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr2	103141651	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,6:0,2:0,0,3,5
chr2	103149162	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,0,16
chr2	103149182	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr2	103236646	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr2	103281540	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=211,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:1,3:3,2:4,0,4,2
chr2	103300506	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	103324820	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,265;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:9,4,2,0
chr2	103324998	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=217,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,1:3,2:2,8,0,3
chr2	103335719	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:0,7,0,3
chr2	103343234	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=307,126;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=82.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,12:1,12:1,0,24,1
chr2	103343275	.	GAA	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,4:2,1:2,3,5,0
chr2	103343309	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=165,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:11,0:15,4:12,14,4,0
chr2	103343339	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=100,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.178:35:15,1:14,4:8,21,3,3
chr2	103348789	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=132,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,0:10,4:12,13,0,4
chr2	103378857	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=220,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,5:4,4:3,6,0,9
chr2	105654716	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:7,3:3,2:2,8,2,3
chr2	105713697	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,4:7,0:5,7,2,2
chr2	105713868	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=203,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:105713868_A_G:105713868:0,5,0,2
chr2	105713877	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=203,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:105713868_A_G:105713868:0,5,0,2
chr2	105859249	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,259;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:13,2:6,1:6,13,1,2
chr2	105897261	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	105924017	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=180,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr2	105961703	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,21:0.757:27:3,2:3,18:6,0,19,2
chr2	105979730	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:6,8:7,5:4,9,7,6
chr2	105979827	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=175,248;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,2:11,0:0|1:105979827_T_G:105979827:11,10,2,0
chr2	105979830	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,2:11,0:0|1:105979827_T_G:105979827:11,10,2,0
chr2	105983987	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=144,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr2	105994498	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.374:22:2,2:12,6:8,6,3,5
chr2	105994564	.	C	CATCAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=189,98;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.461:24:4,6:9,5:8,5,6,5
chr2	106013147	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=120,102;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.629:33:8,4:4,17:6,6,11,10
chr2	106013155	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=120,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.188:35:15,0:14,6:13,16,1,5
chr2	106013216	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.404:22:6,7:7,1:2,11,1,8
chr2	106471825	.	CA	C,CAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,34,32;MFRL=245,287,198;MMQ=60,60,60;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.71,8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.230,0.485:8:0,1,2:2,1,1:0,2,0,6
chr2	106509654	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=162,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr2	106682365	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=264,158;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	106687456	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,106;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:2,3:7,2:5,4,2,3
chr2	106690542	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=227,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,5:3,3:2,1,0,8
chr2	106715342	.	G	A,T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27,30;MFRL=0,226,235;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.71,5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,2:0.500,0.375:5:0,1,1:0,2,1:0,0,0,5
chr2	106717647	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=45.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.590:25:4,0:6,14:2,8,0,15
chr2	106717656	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=197,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:1,3:17,3:0,18,1,5
chr2	106729102	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:9,3,2,0
chr2	106742177	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,9:0,5:0,1,2,12
chr2	106746247	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=183,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,0:5,3:4,11,0,3
chr2	106780015	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	106780055	.	C	CTG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,6:0,0,9,5
chr2	106782398	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr2	107032279	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=0,148;MMQ=24,28;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:1,0,4,2
chr2	107032404	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=168,68;MMQ=47,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,0:10,5:7,11,2,3
chr2	107057642	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=173,140;MMQ=53,46;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,2,2
chr2	107073501	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,27;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr2	107423128	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:4,6,1,1
chr2	107446430	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,4:0,0,10,0
chr2	107449174	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:1,7,0,2
chr2	107460474	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	108488331	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=104,895209;MMQ=57,29;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:7,8,0,3
chr2	108507032	.	ACCC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,22;MFRL=169,295;MMQ=27,25;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=C;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:1,0:1,1,1,1
chr2	108875198	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=131,58;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:7,2:6,3:4,9,1,4
chr2	108921795	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:3,3,5,3
chr2	108994808	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:5,4,3,3
chr2	108999022	.	A	AAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	108999786	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:8,3,1,1
chr2	109065858	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,0:8,5:2,9,1,4
chr2	109087062	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=157,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:12,0:18,5:12,18,0,5
chr2	109089404	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=146,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,1:2,5:2,5,2,4
chr2	109092121	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:5,2:14,3:5,14,3,2
chr2	109103108	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=110,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:7,7,0,3
chr2	109106381	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,232;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:14,2:8,3:14,8,4,1
chr2	109113658	.	CA	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,137;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:4,1:4,9,1,1
chr2	109123950	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=136,341;MMQ=57,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,2:6,2:10,4,1,3
chr2	109237905	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=163,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:15,0:6,3:8,13,0,3
chr2	109276178	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=153,129;MMQ=25,25;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,4:6,4:6,5,4,4
chr2	109278823	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,195;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:4,10,0,4
chr2	109292280	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	109300258	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=169,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr2	109370225	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=194,240;MMQ=55,42;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:10,3,2,0
chr2	109381283	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,0:11,2:10,9,1,1
chr2	109393522	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	109407894	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=209,229;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr2	109411248	.	GAATAT	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATAT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	109455815	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=184,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	109490104	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	109490146	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	109513321	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.887:7:0,3:0,2:0,0,7,0
chr2	109513786	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr2	109522720	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr2	109527087	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	109988086	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:5,1:8,7,2,0
chr2	109988215	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr2	110053248	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr2	110323270	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=158,116;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:5,1,2,0
chr2	110332142	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:1,2:3,7:4,0,8,1
chr2	110343358	.	GCAAACTCT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,119;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,2:10,0:11,13,1,1
chr2	110372192	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	110373938	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.581:22:4,8:5,5:4,5,5,8
chr2	110374215	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,254;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:7,1:12,2:10,9,2,1
chr2	110375592	.	CAAAAA	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=95,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=18,13;RU=A;STR;TLOD=15.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:4,1:3,5:4,10,5,1
chr2	110375685	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:13,5:13,0:12,15,0,5
chr2	110376288	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:5,5:9,5:3,11,5,5
chr2	110886686	.	A	AGACCAGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:0,4:6,0:5,1,4,0
chr2	110905664	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	110922064	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=238,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:0,1:0,2:2,0,3,0
chr2	110922703	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,245;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:9,1:15,2:6,19,1,2
chr2	110925982	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=156,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:4,2:4,2:7,2,4,0
chr2	111397237	.	CT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=141,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.444:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr2	111406968	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=58,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.520:8:0,1:1,1:0,4,2,2
chr2	111408282	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.171:19:10,0:6,2:9,7,0,3
chr2	111644475	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,0:1,3:1,0,1,2
chr2	111644491	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	111721142	.	ATGTGTGTG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,15;RU=TG;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:0,1:1,1:3,0,2,0
chr2	111753449	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,3:6,3:5,4,4,2
chr2	111753627	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:1,7,0,2
chr2	111875388	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=181,345;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:5,1:0,8,0,2
chr2	111907691	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,3:13,2:7,13,2,3
chr2	112582766	.	CTT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,135;MMQ=50,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:5,2:12,5:11,6,2,5
chr2	112583476	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,144;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,4:7,2:6,7,3,3
chr2	112604685	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=201,135;MMQ=25,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,3:8,2:5,5,5,0
chr2	112605465	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr2	112625575	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=222,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:6,2,4,5
chr2	112631255	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,175;MMQ=40,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,0:9,4:13,6,0,4
chr2	112686689	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=148,74;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,3:9,0:9,4,2,1
chr2	112687157	.	A	ATATTTATTTATT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=123,307;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,7;RU=TATT;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.651:4:0,1:1,1:0|1:112687157_A_ATATTTATTTATT:112687157:0,1,0,3
chr2	112687176	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,228;MMQ=60,58;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.367:6:3,0:1,1:0|1:112687157_A_ATATTTATTTATT:112687157:0,4,0,2
chr2	112702647	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:0,5,0,6
chr2	112705157	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,28;MFRL=132,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:8,3:1,9:2,7,3,9
chr2	112705185	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:4,4:0,8:0,4,0,12
chr2	112725684	.	A	ATGTG,ATGTGTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,17,28;MFRL=212,195,154;MMQ=60,60,60;MPOS=8,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,9,10;RU=TG;STR;TLOD=6.35,7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,4:0.370,0.409:9:0,1,2:2,0,1:2,0,4,3
chr2	112740373	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=129,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr2	112751727	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=265,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:112751727_G_A:112751727:4,0,0,1
chr2	112751737	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=261,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0|1:112751727_G_A:112751727:4,0,1,1
chr2	112751928	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=132,204;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:10,5:6,4:8,8,7,2
chr2	112754880	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=77,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:3,0,6,1
chr2	112754943	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=77,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.783:26:2,8:3,9:2,3,7,14
chr2	112761653	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,5:2,2:0,3,0,7
chr2	112767483	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=157,271;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:6,2,4,0
chr2	112767739	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=198,255;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	112776913	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,21;MFRL=170,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,1:3,0:6,0,2,0
chr2	112776979	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=157,253;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,1:8,3:7,4,3,1
chr2	112786413	.	CCTCAGAAGG	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=170,66;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:11,2:10,0:13,11,1,1
chr2	112813163	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=202,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr2	112813391	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=68.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,13:1,7:1,0,6,14
chr2	112817630	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.450:38:7,0:14,17:10,11,0,17
chr2	112821880	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr2	112832535	.	CAAT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,6:4,4:9,5,1,9
chr2	112847164	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:3,7:7,2:9,1,8,1
chr2	112854563	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.349:12:5,3:2,1:6,2,4,0
chr2	112856165	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=139,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.637:31:2,12:9,8:6,5,12,8
chr2	112858122	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,2,0
chr2	112865517	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr2	112945188	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr2	112990804	.	T	TATAAAGA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,2:4,6:3,2,7,4
chr2	112991609	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=230,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr2	113074775	.	CTT	C,CT	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=32,32,19;MFRL=143,183,123;MMQ=60,60,60;MPOS=20,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.36,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,5:0.102,0.235:20:7,0,2:2,2,0:9,4,4,3
chr2	113074866	.	A	AATT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=129,90;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:9,4:13,0:5,17,0,5
chr2	113088520	.	TAA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0|1:113088520_TAA_T:113088520:5,1,3,1
chr2	113088524	.	TTTATTA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0|1:113088520_TAA_T:113088520:5,1,3,1
chr2	113147889	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=229,304;MMQ=25,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr2	113300330	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	113305150	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,4:2,5:2,5,4,5
chr2	113308622	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr2	113309653	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=160,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr2	113310197	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=126,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,4:1,4:2,0,8,0
chr2	113315523	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:6,2:13,0:14,5,2,0
chr2	113315735	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=243,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:4,2:0,4:0,4,1,5
chr2	113321900	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=154,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,3:5,1:6,1,1,3
chr2	113326281	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	113326502	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=50.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,11:0,0,6,11
chr2	113332323	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,16;MFRL=0,292;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.739:2:0,0:0,0:0|1:113332323_G_T:113332323:0,0,2,0
chr2	113332329	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,329;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113332323_G_T:113332323:0,0,1,0
chr2	113342269	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,7:0.174:44:19,0:17,7:13,24,0,7
chr2	113343488	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,2:0,7:1,0,8,2
chr2	113346512	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,5:0,0,2,9
chr2	113479745	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,307;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr2	113480726	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=119,80;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:9,12,0,2
chr2	113480938	.	G	GCACA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,112;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,19;RU=CA;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.796:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	113481105	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=231,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:3,3,1,2
chr2	113481442	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,2,0,1
chr2	113481446	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,2,0,1
chr2	113481448	.	AA	TG	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=23,32;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,2,0,1
chr2	113481453	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=201,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,2,0,1
chr2	113481455	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=23,27;MFRL=216,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,1,0,1
chr2	113481458	.	GA	TC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=216,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:113481442_C_T:113481442:0,1,0,1
chr2	113481547	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr2	113484319	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,5:0,19:0,0,12,12
chr2	113484353	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,5,11
chr2	113513504	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=200,110;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	113514180	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=128,262;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:11,1:10,1:7,15,2,0
chr2	113514763	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:3,2:8,1:6,6,0,3
chr2	113514883	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=92655774,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	113532885	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=120,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,4:2,4:1,2,2,6
chr2	113535770	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=GT;STR;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.804:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	113537148	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:17,0:13,4:17,13,4,0
chr2	113539363	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=196,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:5,6,2,5
chr2	113540177	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=191,247;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr2	113540205	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=159,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr2	113588793	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,291;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr2	113590297	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:9,0:12,8:10,11,1,7
chr2	113590467	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,4:2,1:0,7,0,5
chr2	113671303	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,60;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:3,5:1,3:2,2,8,0
chr2	113671410	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,27;MFRL=221,109;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.595:22:6,4:1,9:3,6,12,1
chr2	113671518	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=241,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:2,4:0,4,1,5
chr2	113672795	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,100;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,0:11,4:12,10,0,4
chr2	113783909	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=191,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	113816940	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.463:11:6,2:0,3:0|1:113816940_C_G:113816940:5,1,4,1
chr2	113816942	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.463:11:6,2:0,3:0|1:113816940_C_G:113816940:5,1,4,1
chr2	113816999	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=149,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:7,6:16,0:11,12,6,0
chr2	113819614	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=239,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr2	113830201	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=217,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,3:2,1:6,0,4,0
chr2	113832044	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=186,111;MMQ=60,56;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,0:6,6:3,10,0,6
chr2	113887335	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=115,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:2,3:0,6:0,2,0,9
chr2	113940839	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:3,2:6,8:5,4,5,5
chr2	113942891	.	ACCTCTCTGTGTATCCAGGGCTCATGGGAATGCCTTTG	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=128,235;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.128:23:2,2:2,0:0|1:113942891_ACCTCTCTGTGTATCCAGGGCTCATGGGAATGCCTTTG_A:113942891:13,8,2,0
chr2	113942903	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=243,57;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.327:7:4,1:1,1:1|0:113942891_ACCTCTCTGTGTATCCAGGGCTCATGGGAATGCCTTTG_A:113942891:3,2,2,0
chr2	113943470	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:8,5:3,5:9,3,5,5
chr2	113953401	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,8:0,6:0,0,4,10
chr2	113953657	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=144,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,4,2
chr2	113953952	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=195,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:1,6,1,7
chr2	113953973	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,5,0,4
chr2	113953974	.	GACA	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=184,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:113953973_A_AT:113953973:0,5,0,4
chr2	113953984	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr2	113955074	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,173;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,4,0
chr2	113956821	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:1,2,1,2
chr2	113977862	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr2	113999736	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.570:7:2,1:0,3:1,2,0,4
chr2	114000458	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	114004237	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	114256759	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,124;MMQ=24,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,1:6,4:8,1,3,2
chr2	114258779	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=205,177;MMQ=25,25;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,2:5,7:5,3,6,3
chr2	114340469	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=159,141;MMQ=22,22;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.165:34:10,2:19,3:24,5,4,1
chr2	114340494	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=139,201;MMQ=22,22;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,19:0.317:61:15,13:27,6:28,14,12,7
chr2	114340511	.	G	A	.	.	DP=85;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,105;MMQ=22,22;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,14:0.181:80:30,3:35,11:38,28,9,5
chr2	114340663	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=144,156;MMQ=40,22;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,23:0.489:47:11,11:13,12:12,12,7,16
chr2	114340677	.	C	A	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=158,139;MMQ=32,22;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.371:41:13,6:13,9:15,11,2,13
chr2	114340706	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=154,136;MMQ=38,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.211:45:23,5:13,4:11,25,3,6
chr2	114386353	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,117;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:114386353_C_T:114386353:0,0,1,0
chr2	114386361	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,117;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:114386353_C_T:114386353:0,0,1,0
chr2	114399145	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,193;MMQ=57,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:2,5:2,6,1,7
chr2	114475418	.	T	TCTCTCTCTCTCTCCCCCTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=155,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.265:9:5,2:2,0:4,3,1,1
chr2	114480812	.	A	AAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAC;STR;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	114486907	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:4,0,2,2
chr2	114492135	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:2,3:0,2:1,1,3,2
chr2	114493260	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,3:4,7:11,0,9,1
chr2	114493509	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,280;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	114500473	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=95,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.616:6:2,2:0,2:0,2,1,3
chr2	114513386	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,4:1,2:7,0,6,0
chr2	114513901	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=204,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.549:18:6,6:2,4:6,2,8,2
chr2	114684848	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=190,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,3:3,1:9,0,4,0
chr2	114691809	.	GT	G,GTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=163,235,148;MMQ=60,60,60;MPOS=7,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.10,5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,4:0.213,0.301:14:2,0,0:4,3,3:5,2,6,1
chr2	115822286	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,4,1
chr2	115919677	.	CT	GC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr2	116066984	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr2	116485344	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	116497479	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=72.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,13:0,8:0,0,7,14
chr2	116497528	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	116534922	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr2	116539846	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:5,0:0,4:5,0,4,0
chr2	116548820	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,8,8
chr2	116593675	.	ATG	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	116593695	.	GAT	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=223,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=AT;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:3,1,3,0
chr2	116594221	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=163,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:3,7,3,0
chr2	116599927	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr2	118578691	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=145,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.750:13:2,6:1,4:3,0,8,2
chr2	118579618	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:5,10,1,1
chr2	118582936	.	A	ATAAAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=218,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.394:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr2	118582951	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,26;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:118582951_C_G:118582951:4,0,1,0
chr2	118582953	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,36;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0|1:118582951_C_G:118582951:4,0,1,0
chr2	118688711	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:9,0:12,8:10,11,0,8
chr2	118688754	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,4,15
chr2	118694393	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	118698699	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=233,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	118704478	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=70.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,9:0,0,6,16
chr2	118704503	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=143,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,5:5,3:2,5,0,8
chr2	118705570	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	118706879	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr2	118709122	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr2	118743736	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	118753148	.	A	ATC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	118764242	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.532:15:4,1:3,6:4,3,5,3
chr2	118766024	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr2	118766178	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=151,45;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:7,9,1,1
chr2	118771663	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr2	118771682	.	TGCC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=235,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GCC;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr2	119732042	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=219,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,4:7,4:6,6,3,5
chr2	119735073	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,3:5,0:8,4,0,3
chr2	119735333	.	C	CAAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=242,452;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:119735333_C_CAAA:119735333:10,0,0,2
chr2	119735336	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=242,452;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:0|1:119735333_C_CAAA:119735333:10,0,0,2
chr2	119739127	.	C	CATTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=252,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.568:11:3,3:2,1:2,3,2,4
chr2	119739269	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=122,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:0,4,2,6
chr2	119749477	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,5,7
chr2	119915132	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	119915509	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=217,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.508:8:1,1:2,3:4,0,2,2
chr2	120003642	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	120005840	.	TC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	120014985	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,9,2
chr2	120014995	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:8,2,2,0
chr2	120059988	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=140,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:5,3:2,1:5,2,3,1
chr2	120078689	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:8,1,4,0
chr2	120078778	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=160,94;MMQ=60,54;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,26:0.693:37:6,5:5,20:4,7,20,6
chr2	120078797	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,2:8,0:11,9,1,1
chr2	120125363	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=197,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,1:1,2:4,2,2,1
chr2	120125936	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	120125973	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=137.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,17:0,12:0,0,16,15
chr2	120197670	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,5,1
chr2	120209689	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,5,7
chr2	120230998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,4,6
chr2	120231165	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr2	120236332	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,2,0
chr2	120362407	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=76.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,6,19
chr2	120362897	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,4,4
chr2	120366057	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33,35;MFRL=0,228,174;MMQ=60,60,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=T;STR;TLOD=3.21,12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.250,0.625:5:0,0,2:0,1,2:0,0,5,0
chr2	120366070	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=17,10;MFRL=225,174;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.741:5:0,0:0,0:1,0,4,0
chr2	120366240	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120366240_G_A:120366240:0,3,0,1
chr2	120366246	.	GGA	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120366240_G_A:120366240:0,3,0,1
chr2	120366255	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:120366240_G_A:120366240:0,3,0,1
chr2	120387619	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr2	120387637	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	120404629	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=167,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.766:6:1,2:0,3:0,1,1,4
chr2	120404671	.	T	TTTTTTGTTTTG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:120404671_T_TTTTTTGTTTTG:120404671:0,3,0,1
chr2	120404673	.	C	CTTGTTTTGTTTTGAGA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:120404671_T_TTTTTTGTTTTG:120404671:0,3,0,1
chr2	120414083	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:1,6:1,5:1,1,1,10
chr2	120439758	.	GT	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=210,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr2	120439760	.	G	GTGATCTTGGCTTGCTACA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=195,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	120567392	.	AT	A,ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33,24;MFRL=204,143,210;MMQ=60,60,60;MPOS=18,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=6.21,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,3:0.352,0.283:11:3,3,2:1,1,1:2,2,6,1
chr2	120620092	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr2	120689905	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=233,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	120704164	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=95.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,24:0.927:25:1,6:0,18:0|1:120704164_A_AT:120704164:1,0,9,15
chr2	120704166	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=37,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=95.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,24:0.927:25:1,6:0,17:0|1:120704164_A_AT:120704164:1,0,9,15
chr2	120718322	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	120830815	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,4:0,0,9,6
chr2	120831654	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=145,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.420:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr2	120889172	.	TG	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.249:13:9,1:1,2:0|1:120889172_TG_T:120889172:10,0,3,0
chr2	120889173	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=200,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.679:14:4,7:0,3:4,0,10,0
chr2	120889176	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.249:13:9,1:1,1:0|1:120889172_TG_T:120889172:10,0,3,0
chr2	120900736	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0,9,0,2
chr2	120918585	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=217,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr2	121036385	.	TT	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=149,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:5,4:2,6:2,5,3,7
chr2	121043403	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr2	121106850	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=223,132;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,5:8,0:11,6,4,1
chr2	121709091	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	121712729	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	121713022	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,0,2
chr2	121713030	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:121713022_C_G:121713022:0,0,0,2
chr2	121713041	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	121729490	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	121729686	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	121740190	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,3,0
chr2	121740194	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:121740190_C_T:121740190:0,0,3,0
chr2	121740294	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,2:7,1:15,1,2,1
chr2	121740505	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	121744225	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,2,4
chr2	121982011	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=125,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,2:4,3:1,5,2,4
chr2	121989489	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=178,200;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:5,4,0,3
chr2	121992954	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=178,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:2,0,0,1
chr2	121995511	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,0:8,2:3,10,0,2
chr2	121997120	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr2	122004596	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=206,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:0,2,1,6
chr2	122005928	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr2	122042750	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	122098360	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=132,95;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,3,1
chr2	122184950	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=137,104;MMQ=60,48;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,31:0.736:42:6,20:5,11:8,3,28,3
chr2	122185031	.	GA	AT	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=114,83;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,9:0.199:48:27,0:11,8:9,30,0,9
chr2	122219996	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:3,3:12,0:15,0,3,0
chr2	122273187	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=145,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,5:2,3:7,0,8,0
chr2	122485106	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=140,220;MMQ=59,56;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr2	122516480	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=203,99;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0,6,0,2
chr2	125405302	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=212,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:7,2:4,4:5,6,4,2
chr2	125505013	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=333,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	125671948	.	C	CTCT	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=36,36;MFRL=107,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:0,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,1,0,1
chr2	125671951	.	TCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,2,0,1
chr2	125671957	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=170,132;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,1,0,1
chr2	125671964	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,2,0,1
chr2	125671966	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:125671948_C_CTCT:125671948:0,2,0,1
chr2	127447763	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=170,111;MMQ=52,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:1,3:0,3:1,0,5,2
chr2	127808161	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0|1:127808161_G_A:127808161:0,10,0,3
chr2	127808170	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=233,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,1:4,2:0|1:127808161_G_A:127808161:0,9,0,3
chr2	127808532	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,228;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:3,2:4,6,0,2
chr2	127821085	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,4:1,3:7,1,7,0
chr2	127821452	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=187,291;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:7,3,2,0
chr2	127821499	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:10,1,4,1
chr2	127834136	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=175,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:7,3,2,0
chr2	127834369	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=177,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0|1:127834369_C_T:127834369:0,3,0,4
chr2	127834384	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=185,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:127834369_C_T:127834369:0,4,0,4
chr2	127944781	.	A	AC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr2	127950904	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:2,1,2,7
chr2	127951458	.	GC	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:1,8:12,1:5,8,2,7
chr2	127961180	.	A	ACTCTCTGTGCCTATCTTCTGT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:127961180_A_ACTCTCTGTGCCTATCTTCTGT:127961180:0,0,0,1
chr2	127961186	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:127961180_A_ACTCTCTGTGCCTATCTTCTGT:127961180:0,1,0,1
chr2	128015367	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=220,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr2	128029065	.	GAA	G,GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=243,142,150;MMQ=60,60,60;MPOS=17,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.73,5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.228,0.342:9:2,2,2:1,0,0:0,4,1,4
chr2	128050134	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr2	128051381	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=266,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr2	128081682	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,3:4,3:7,0,4,2
chr2	128178986	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=167,101;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:4,3:7,0:4,8,1,2
chr2	128181028	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	128186595	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	128263014	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,5:8,1:11,6,4,2
chr2	128263377	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=234,118;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:128263377_C_T:128263377:0,4,0,2
chr2	128263379	.	AT	TC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=234,118;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0|1:128263377_C_T:128263377:0,4,0,2
chr2	128324125	.	C	CT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	128334236	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=237,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:1,7,2,0
chr2	128339456	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,4:4,2:4,1,5,1
chr2	128341603	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=213,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:4,0,3,0
chr2	128341769	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,0:5,5:6,9,5,0
chr2	128342547	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	128345960	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:2,2,2,4
chr2	128346228	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	128347801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=123,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:3,0:1,2:1,5,1,1
chr2	128350551	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=165,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,3:1,6:0,4,3,6
chr2	128350578	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr2	128354024	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,104;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,3:5,1:6,3,3,1
chr2	128363530	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=30.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,3:0,0,1,8
chr2	128363608	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	128364684	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr2	128370200	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=209,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr2	128381594	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,2,0
chr2	128382842	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	128382859	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	128388485	.	TGCCCCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,15;MFRL=145,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.168:22:6,0:8,0:0|1:128388485_TGCCCCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACC_T:128388485:9,10,0,3
chr2	128388526	.	CAGCCCCACCTCACCTCATTGCACCCCCTGCT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,17;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.352:12:4,1:2,0:0|1:128388485_TGCCCCCCAGCCCCGCTCCGCCTCATTGCACCCCCACC_T:128388485:0,8,0,4
chr2	128389343	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=192,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:1,5:3,3:1,3,4,4
chr2	128389422	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=285,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:0,4,0,4
chr2	128393261	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=176,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:4,3,1,1
chr2	128393289	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:7,2:5,5,3,2
chr2	128394875	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.402:10:1,1:5,3:0|1:128394875_C_CA:128394875:3,3,4,0
chr2	128394877	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=146,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:1,1:5,5:0|1:128394875_C_CA:128394875:3,3,4,2
chr2	128396807	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	128399592	.	C	CCCCCTGCTCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=157,66;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr2	128407499	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr2	128410244	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr2	128411934	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	128411950	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr2	128431188	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr2	128520547	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:5,1,2,0
chr2	128526579	.	TTAAA	T,TTAAATAAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30,33;MFRL=0,200,219;MMQ=60,60,60;MPOS=29,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TAAA;STR;TLOD=3.71,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.420,0.402:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr2	128528266	.	AAAATAAATAAAT	A,AAAAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29,31;MFRL=194,221,391;MMQ=60,55,40;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,8,9;RU=AAAT;STR;TLOD=5.81,3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.387,0.434:4:0,1,1:1,1,0:1,0,3,0
chr2	128608168	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=102,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,3:5,0:6,9,0,3
chr2	128608290	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.511:10:2,4:3,1:1,4,1,4
chr2	128610719	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=164,287;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,1,1
chr2	128610747	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=205,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,1,1
chr2	128615500	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=136,211;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	128699750	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=187,47779204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:0,1:4,1:0,4,1,1
chr2	128707503	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:8,0:5,2:5,8,2,0
chr2	128708063	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	128712953	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=217,109;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:128712953_A_G:128712953:0,4,0,1
chr2	128712961	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=196,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128712953_A_G:128712953:0,3,0,1
chr2	128712963	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=196,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0|1:128712953_A_G:128712953:0,3,0,1
chr2	128744580	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:0,3:5,4:1,4,0,7
chr2	128753854	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr2	128757804	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,5,2
chr2	128770731	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:1,1:5,1:0,8,0,2
chr2	128773928	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr2	128854948	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr2	128855206	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=182,276;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	128867131	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=196,70;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	128877837	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	128880899	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	128890878	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=41.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr2	128927864	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:8,2,1,1
chr2	128936000	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:7,1:7,2:10,4,1,2
chr2	128944207	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr2	128944424	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=113,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,6:3,1:5,5,3,4
chr2	130739444	.	TGAAGACG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=270,150;MMQ=60,53;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGACG;STR;TLOD=71.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:0,6:1,11:1,1,12,5
chr2	130739646	.	TTAAC	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,27;MFRL=105,125;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=74.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:2,9:2,8:1,5,13,5
chr2	130739712	.	CT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=144,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.246:17:8,1:5,3:6,7,3,1
chr2	130833159	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=260,261;MMQ=25,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,1:5,3:0,6,1,3
chr2	130897055	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	130899642	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=274,184;MMQ=44,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	130900699	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=177,193;MMQ=55,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:10,4,2,0
chr2	130910847	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,1:0,3:3,2,3,1
chr2	130925088	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=180,165;MMQ=52,52;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:4,3:5,3:3,6,4,2
chr2	130929962	.	AG	GC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=95,72;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:15,2:14,0:16,13,1,1
chr2	130930819	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,125;MMQ=40,33;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:2,0,3,1
chr2	130939288	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:2,7:6,4:3,5,4,7
chr2	130940090	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=284,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,3,3
chr2	130949303	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=181,272;MMQ=60,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	130952038	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=137,212;MMQ=57,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr2	130952053	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,212;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:2,5,2,0
chr2	130952613	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=228,109;MMQ=52,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:5,7,1,2
chr2	130952625	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=233,109;MMQ=52,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:4,2:5,8,1,2
chr2	131097159	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=125,58;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:8,3:13,0:16,6,2,1
chr2	131103133	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=130,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,2:8,0:9,10,2,0
chr2	131104049	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,299;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,2:10,1:5,8,2,1
chr2	131116404	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=168,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:7,0,5,1
chr2	131117120	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,296;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:1,0:5,2:2,6,0,2
chr2	131129928	.	AGACGGG	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GACGGG;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	131130588	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=219,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,2:2,1:2,7,2,1
chr2	131130678	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,5:3,6:4,0,7,4
chr2	131132361	.	C	CCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=139,98;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:1,1:0|1:131132361_C_CCTCT:131132361:0,1,0,1
chr2	131132365	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=202,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:131132361_C_CCTCT:131132361:0,2,0,1
chr2	131221170	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=124,126;MMQ=25,25;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:2,2,3,0
chr2	131390238	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,168;MMQ=29,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	131813195	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:8,1:7,9,1,1
chr2	131883287	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	131888361	.	ATT	A,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,25,27;MFRL=95,118,96;MMQ=60,60,60;MPOS=12,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.28,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.216,0.238:14:4,3,0:4,0,3:2,6,1,5
chr2	132021201	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=317,211;MMQ=25,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	132021860	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=180,100;MMQ=24,22;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.331:22:9,4:6,3:4,11,2,5
chr2	132021878	.	CG	TA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=202,98;MMQ=25,22;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:1,8,0,2
chr2	132021908	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=206,122;MMQ=24,25;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	132110828	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,366;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	132110862	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,366;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	132120501	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,214;MMQ=57,57;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=28.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.873:13:1,6:0,6:0,1,8,4
chr2	132121686	.	T	TTCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCGGCTTCCCCAGCCGCCGCCGCC;STR;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.843:4:0,2:0,1:0,0,1,3
chr2	132233676	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=270,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,1,1
chr2	132237608	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,31;MFRL=94,219;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:2,1,2,1
chr2	132237643	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,21;MFRL=148,179;MMQ=40,24;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,0:1,1:5,2,2,0
chr2	132238043	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=204,187;MMQ=44,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr2	132240047	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,161;MMQ=40,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	132248330	.	G	GGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=162,124;MMQ=60,56;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,2:8,2:0|1:132248330_G_GGC:132248330:9,6,1,3
chr2	132248336	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,142;MMQ=60,57;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:5,2:9,3:0|1:132248330_G_GGC:132248330:9,6,2,3
chr2	132249372	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,275;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr2	132905664	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=123,280;MMQ=48,24;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:0|1:132905664_G_T:132905664:6,7,1,1
chr2	132905682	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=123,280;MMQ=26,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:9,1:6,0:0|1:132905664_G_T:132905664:7,9,1,1
chr2	132911056	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=209,215;MMQ=39,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:2,2,1,1
chr2	132911314	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=197,203;MMQ=49,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	133402607	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=254,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,4,0
chr2	133425912	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,246;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr2	133426183	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=233,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr2	133486440	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,100;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:9,5:8,0:9,9,5,0
chr2	133539460	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,299;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:5,1:3,1:7,1,2,0
chr2	133539669	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=123,50199212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,2:11,0:8,11,2,0
chr2	133539732	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=162,88;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,3:6,0:5,13,3,0
chr2	133541107	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=125,214;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:4,3:11,0:6,9,3,0
chr2	133541444	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=127,213;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.500:20:7,7:2,3:0|1:133541444_T_C:133541444:4,6,7,3
chr2	133541454	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=127,210;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:9,7:1,4:0|1:133541444_T_C:133541444:4,6,8,3
chr2	133618220	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=210,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr2	135102453	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=112,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:3,3:3,1:4,2,3,1
chr2	135160755	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=210,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0,3,1,7
chr2	135214259	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,4:3,6:3,1,5,5
chr2	135214358	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=187,77;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:5,8,0,2
chr2	135470735	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:7,4:9,5:13,3,7,2
chr2	135619446	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=150,152;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.394:26:10,10:6,0:11,5,10,0
chr2	135628469	.	TAACATCACTGAATTCTTCTTGGTGGGGTG	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=183,175;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:2,4:9,5,4,0
chr2	135677471	.	A	AGTTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.383:24:7,1:7,7:8,7,1,8
chr2	135694324	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	135694354	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:5,0,6,0
chr2	135694379	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,14,3
chr2	135700151	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:8,3:12,3:10,11,4,2
chr2	135705558	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	135710322	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,8,10
chr2	135745448	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=188,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	135762980	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=130,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:3,5,1,2
chr2	135780951	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:9,9:4,0:7,6,9,0
chr2	135809912	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:11,0:16,3:13,14,3,0
chr2	135887514	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,0:3,2:5,1,2,1
chr2	135893372	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:4,8,1,5
chr2	135982079	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,0:3,2:2,9,2,0
chr2	135988416	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,136;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,1:4,4:3,5,4,1
chr2	136023128	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=115,145;MMQ=60,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:4,6:4,0:6,2,6,0
chr2	136023150	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=115,145;MMQ=60,21;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.428:14:3,5:5,0:7,1,6,0
chr2	136148401	.	AA	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=117,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,1:1,2,0,2
chr2	136379194	.	GT	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.196:28:14,2:9,3:6,17,1,4
chr2	136407445	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=145,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:6,3:4,1:7,4,4,0
chr2	136407479	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=123,167;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:4,9:8,6:5,7,13,2
chr2	136409466	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=167,86;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:1,9,2,0
chr2	136467119	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=137,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:5,5:10,3:7,8,3,5
chr2	136467164	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr2	136511291	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=193,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	136511874	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:4,3,0,2
chr2	136546110	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,124;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:1,1:5,1:4,3,0,2
chr2	136547067	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=172,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:7,0,3,0
chr2	136548169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	136548192	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr2	136552188	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=112,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:3,2:7,1:6,5,3,0
chr2	136558157	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=183,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.421:19:4,4:7,3:6,5,4,4
chr2	136561735	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,25;MFRL=156,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr2	136565028	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr2	136566631	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=211,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:2,3,2,0
chr2	136567633	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,53;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	136570613	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=213,266;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr2	136575534	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr2	136575568	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=147,159;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.459:20:6,9:4,0:8,3,9,0
chr2	136575704	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	136614255	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=191,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr2	136617008	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=163,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,1:7,1:3,6,0,2
chr2	136622543	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr2	136622825	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	136633771	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:4,0,5,1
chr2	136633962	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr2	136664812	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=147,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=19,16;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:2,1:0,0:2,0,1,0
chr2	136668781	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=180,98;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,14:0.451:31:6,0:11,13:9,8,0,14
chr2	136674028	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	136680534	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=148,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr2	136690414	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=197,258;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:0,3:2,3:1,5,0,6
chr2	136690425	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=219,222;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,3:3,2:1,6,0,5
chr2	136740900	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:1,2:2,2:3,0,4,1
chr2	136743143	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,3:4,4:3,7,2,5
chr2	136873458	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:11,9,1,1
chr2	137748604	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137748604_G_A:137748604:0,1,0,1
chr2	137748610	.	TGG	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137748604_G_A:137748604:0,1,0,1
chr2	137748614	.	TA	CC	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:137748604_G_A:137748604:0,1,0,1
chr2	137814804	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=213,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,5:1,6:2,0,9,2
chr2	137872961	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=249,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr2	137988722	.	CAT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=155,145;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,1:9,9,0,2
chr2	137988729	.	T	TAA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=165,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:10,9,0,2
chr2	137999979	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=210,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:4,1,5,0
chr2	138000226	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	138030271	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr2	138163391	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr2	138169158	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr2	138208631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr2	138375896	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=211,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:138375896_G_A:138375896:3,0,3,0
chr2	138375898	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.445:7:1,1:2,1:0|1:138375896_G_A:138375896:4,0,3,0
chr2	138378351	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=163,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr2	138378388	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=265,320;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr2	138727872	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=97,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.306:8:5,1:0,1:1,5,0,2
chr2	138762873	.	C	CTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=216,228;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	138771760	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=186,260;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr2	139308191	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,7:6,5:5,7,9,3
chr2	139308397	.	T	TTCTCTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,14;RU=TC;STR;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.688:7:2,4:0,1:1,1,5,0
chr2	139316934	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=208,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:4,4,3,5
chr2	139318315	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:2,4:8,5:9,1,8,1
chr2	139318332	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=179,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.697:19:1,4:5,8:5,1,11,2
chr2	139429286	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,274;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr2	140992337	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,68;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr2	140997197	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=249,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr2	141027926	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=251,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:0,1,3,9
chr2	141032220	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr2	141092084	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.305:17:5,2:7,2:6,6,3,2
chr2	141260507	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:8,1,2,1
chr2	141283603	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,5,10
chr2	141294285	.	GAAAA	G,GAAA,GAAAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,19,26,27;MFRL=176,238,194,230;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,18,16;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,9,12,14;RU=A;STR;TLOD=6.66,13.57,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,3,8,2:0.199,0.485,0.156:15:0,1,1,1:1,0,4,0:1,1,2,11
chr2	141298674	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=189,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,2:4,1:0|1:141298674_T_C:141298674:3,6,1,2
chr2	141298682	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:4,1:4,2:0|1:141298674_T_C:141298674:3,5,1,3
chr2	141298749	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=198,253;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr2	141299317	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=194,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,2:3,1:4,1,3,0
chr2	141359287	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=246,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	141473505	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=274,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,4,3
chr2	141474402	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=258,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.590:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	141528592	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:0,3:5,4:0,5,1,6
chr2	141533573	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=212,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	141533662	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,6:2,0:4,1,4,2
chr2	141571440	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=184,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:1,2:4,2:0,6,0,4
chr2	141571456	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=193,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	141598473	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,3:0,0,9,1
chr2	141625630	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=145,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr2	141625834	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=11,18;MFRL=257,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.683:6:0,1:0,1:0,2,2,2
chr2	141762830	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=226,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,0:0,3:3,0,2,1
chr2	141771058	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr2	141777763	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,322;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	141812617	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=121,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr2	141819877	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,277;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr2	141945949	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr2	142012036	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=145,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr2	142237868	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=124,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	142567910	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=225,176;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:5,8:8,7:3,10,7,8
chr2	142568019	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=183,328;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr2	143676141	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=182,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.478:10:3,2:2,2:5,0,3,2
chr2	143787161	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,1:2,0,3,2
chr2	143787274	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=67.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,15:0,8:0,0,9,14
chr2	143913004	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	143973860	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:2,1,7,1
chr2	143986143	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=133,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:17,2:9,0:19,7,2,0
chr2	144193151	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=315,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.649:6:1,1:1,2:2,0,3,1
chr2	144525534	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=215,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:3,1:6,0,2,0
chr2	145155789	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr2	145156244	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=159,79;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:7,5:9,0:9,7,5,0
chr2	145156807	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=220,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:8,3,0,2
chr2	145274732	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,3:2,3:5,0,7,0
chr2	148674893	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=134,110;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,2:6,1:6,12,2,1
chr2	148701099	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,24;MFRL=178,74;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:0,0:0,1:0,6,1,1
chr2	148730342	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=134,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,2:12,1:10,9,1,2
chr2	148731002	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,160;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:10,12:8,0:6,12,12,0
chr2	148733548	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=181,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	149225934	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:8,1:17,2:16,9,0,3
chr2	149243260	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr2	149270523	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,92;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:4,0:10,4:2,12,2,2
chr2	149520214	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,4:1,8:2,0,7,5
chr2	149529043	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=192,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr2	149539325	.	G	T	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,111;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,13:0.273:49:20,6:16,7:15,21,5,8
chr2	149633149	.	C	CGGGGGG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,8;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.805:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr2	149639328	.	T	C	.	.	DP=440;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,104;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=1329.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,415:0.970:427:9,189:3,218:8,4,320,95
chr2	149853960	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr2	149861805	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=269,174;MMQ=60,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	150064999	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065002	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=31,33;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065005	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=24,27;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065009	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065010	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=22,28;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065012	.	GT	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,1,0,1
chr2	150065019	.	TT	GG	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,0,0,1
chr2	150065026	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:150064999_T_G:150064999:0,0,0,1
chr2	150069645	.	C	CGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=203,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GT;STR;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:3,3:4,3:2,5,3,3
chr2	150305703	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr2	150320627	.	TA	T,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25,26;MFRL=238,118,140;MMQ=60,60,60;MPOS=13,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=16.18,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,9,2:0.623,0.187:13:1,4,1:1,5,1:1,1,11,0
chr2	150426399	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	150427516	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=170,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,4:3,4:3,0,8,0
chr2	150432377	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=49.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:6,10:1,5:3,4,3,12
chr2	150433128	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr2	150435889	.	C	CAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=39.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	150443689	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=83.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,7,16
chr2	151328284	.	GAA	G,GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,19,19;MFRL=0,259,146;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.00,28.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,12:0.192,0.759:15:0,1,2:0,0,3:0,0,0,15
chr2	151343988	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr2	151857799	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=197,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:7,4:7,2:9,5,4,2
chr2	151900223	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,3:0,0,10,3
chr2	151900390	.	TAAAAACAAAAAC	T,TAAAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31,30;MFRL=0,130,204;MMQ=60,60,60;MPOS=25,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,4,5;RU=AAAAAC;STR;TLOD=3.01,16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,4:0.219,0.675:5:0,0,2:0,1,2:0,0,0,5
chr2	152108261	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	152117780	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,5:7,5:7,3,9,1
chr2	152118338	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,4:5,1:1,6,0,5
chr2	152135270	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=266,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr2	152135514	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,270;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:0,8,0,2
chr2	152139271	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr2	152139493	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,4:5,1:2,4,1,4
chr2	152214352	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:152214352_A_T:152214352:0,2,0,1
chr2	152214359	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:152214352_A_T:152214352:0,2,0,1
chr2	152222567	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,0:6,3:9,6,0,3
chr2	152236045	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=11,30;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.565:5:0,0:0,2:0,2,0,3
chr2	152267072	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:7,4:9,5:8,9,6,3
chr2	152267672	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	152267721	.	ATT	A,AT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,20,26;MFRL=195,91,147;MMQ=60,60,60;MPOS=24,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=5.76,24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,14:0.166,0.489:29:4,5,6:4,0,8:7,3,10,9
chr2	152267897	.	G	GT	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,8:0.542:15:6,4:1,4:0|1:152267897_G_GT:152267897:0,7,0,8
chr2	152267919	.	TT	GG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=194,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:0|1:152267897_G_GT:152267897:0,13,0,2
chr2	152273503	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=228,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	152289767	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:1,4,0,4
chr2	152292169	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	152299824	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=135,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:7,3:4,0:3,8,3,0
chr2	152300262	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr2	152303171	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	152314547	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	152318713	.	TATC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=231,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATC;STR;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,1:4,3:10,4,4,1
chr2	152342481	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=188,109;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr2	152348842	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:2,4,2,3
chr2	152349026	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=262,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:1,0,2,6
chr2	152349960	.	C	CACAATTTGTTCATGTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=229,231;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr2	152350462	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=274,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:5,1:1,5,0,4
chr2	152353395	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,0:4,3:8,1,2,1
chr2	152359276	.	AT	A,ATT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30,31;MFRL=177,153,101;MMQ=60,60,60;MPOS=21,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=20.48,8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,10,5:0.462,0.287:19:1,8,3:3,2,2:4,0,13,2
chr2	152374800	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=223,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,4:2,6:2,1,7,3
chr2	152382454	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,12,5
chr2	152383913	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=224,142;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,5:2,4:3,0,8,1
chr2	152388228	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,8,1
chr2	152388415	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,8:1,6:0,3,4,10
chr2	152394534	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=221,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:1,7:1,6:1,2,0,13
chr2	152403014	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	152404294	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=214,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,6:0,1,1,6
chr2	152410106	.	G	GACATGAAGGAAACTGAATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152410106_G_GACATGAAGGAAACTGAATT:152410106:0,0,0,1
chr2	152410108	.	C	CACA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:152410106_G_GACATGAAGGAAACTGAATT:152410106:0,0,0,1
chr2	152417064	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	152417311	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=250,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr2	152421593	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=109,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:13,4:13,0:14,12,4,0
chr2	152424933	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28,28;MFRL=167,165,236;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=5.59,3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.334,0.247:9:1,1,1:1,2,1:0,4,2,3
chr2	152425692	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:3,0,4,0
chr2	152432886	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=151,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:0,1:5,2:1,4,0,3
chr2	152466728	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=246,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	152474001	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AG;STR;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr2	152475938	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr2	152476028	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=160,80;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:0|1:152476028_C_G:152476028:4,5,3,1
chr2	152476050	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=161,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,6:0.280:23:9,6:8,0:1|0:152476028_C_G:152476028:11,6,6,0
chr2	152481977	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,3,0
chr2	152487574	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=336,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,2:0,3:1,1,5,0
chr2	152520395	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=245,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr2	152528985	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=182,72;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:12,0:6,3:10,8,2,1
chr2	152544786	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.282:23:8,6:8,0:11,6,6,0
chr2	152548656	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,246;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,2:7,0:3,10,0,2
chr2	152552062	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=210,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:1,0,6,3
chr2	152573902	.	A	AGGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=178,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGC;STR;TLOD=60.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,8:1,7:1,0,10,5
chr2	152581866	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	152584153	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	152671599	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,64;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr2	152671754	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:4,2:3,2:3,4,2,2
chr2	152684704	.	A	AC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=107,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.477:22:5,1:7,6:3,9,3,7
chr2	152955550	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=185,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.587:15:3,4:3,5:1,5,3,6
chr2	152977337	.	A	AACTGGT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=133,67;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,1,1
chr2	153000337	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:4,2,5,0
chr2	153004825	.	AAAG	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:5,2:10,0:1,16,0,2
chr2	153192324	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=209,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:0,6,0,3
chr2	153378574	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:0,1:4,4:0,4,1,4
chr2	153415170	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	153415229	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=170,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:2,2:2,1:5,0,3,1
chr2	153415234	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=155,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr2	153415244	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,31;MFRL=155,229;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:2,4:4,1,7,0
chr2	153415376	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:3,2,0,3
chr2	153417325	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	153464015	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.447:7:2,0:1,3:0|1:153464015_A_G:153464015:0,4,0,3
chr2	153464017	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=23,26;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.447:7:2,0:1,3:0|1:153464015_A_G:153464015:0,4,0,3
chr2	153464018	.	C	CATG	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.402:8:2,0:1,3:0|1:153464015_A_G:153464015:0,5,0,3
chr2	153464020	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=176,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:0|1:153464015_A_G:153464015:0,4,0,3
chr2	153468187	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr2	153473521	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:0,1,7,0
chr2	153473794	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	153476066	.	G	GCCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,6:0,0,0,13
chr2	153481943	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,9:0,0,10,13
chr2	153483257	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr2	153492910	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr2	153514583	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=218,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr2	153519524	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,7:1,4:1,0,10,1
chr2	153520782	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=175,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:4,4:0,8:1,3,5,7
chr2	153520819	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=202,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr2	153533260	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:12,1:3,1:4,11,1,1
chr2	153535670	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=65.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,11,10
chr2	153572438	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	153574145	.	TGG	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=G;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr2	153577013	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=259,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,10:2,5:3,1,9,6
chr2	155099146	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=215,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr2	155099242	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:8,2,1,2
chr2	155115579	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=149,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:10,0:3,3:6,7,2,1
chr2	155252653	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr2	155265623	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr2	155295162	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,131;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,4:5,0:3,6,4,0
chr2	155306885	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,14,3
chr2	157182849	.	AA	TT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,127;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:6,0:8,12:5,9,0,12
chr2	157183211	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,6,2
chr2	157352734	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.334:22:5,2:9,5:7,8,2,5
chr2	157370018	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=183,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.445:8:2,0:2,3:2,3,1,2
chr2	157406296	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=117,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:4,1:16,7:4,16,2,6
chr2	157427593	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	157467106	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=228,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr2	158165004	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	158272233	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=141,72;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.107:44:20,4:20,0:17,23,3,1
chr2	158272578	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=188,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:11,0:10,5:5,16,5,0
chr2	158275111	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=A;STR;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.860:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr2	158291107	.	TAG	T,TAGAG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,24,27;MFRL=195,117,155;MMQ=60,60,60;MPOS=13,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=AG;STR;TLOD=7.98,16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,6:0.240,0.433:15:2,0,3:3,4,0:4,1,8,2
chr2	158300586	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:0,9,2,0
chr2	158390468	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:3,4,2,4
chr2	158395079	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr2	158400908	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:5,1,4,2
chr2	158401137	.	TG	CA,CG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31,30;MFRL=179,123,206;MMQ=60,60,60;MPOS=7,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.35,23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,8:0.166,0.501:15:2,0,3:3,2,5:2,3,4,6
chr2	158406601	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=148,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr2	158412542	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr2	158443889	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,1,9
chr2	158485075	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:5,4,1,2
chr2	158485076	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:4,5,2,1
chr2	158637136	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.453:11:3,5:1,0:0|1:158637136_GA_G:158637136:0,6,0,5
chr2	158637137	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,21;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,8:0,0:0,0,2,9
chr2	158637138	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=130,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.453:11:4,4:2,0:0|1:158637136_GA_G:158637136:0,6,0,5
chr2	158655883	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,5:1,2:1,0,7,0
chr2	158655984	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=135,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:10,8,0,3
chr2	158958461	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:158958461_T_G:158958461:3,0,1,0
chr2	158958471	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=161,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:158958461_T_G:158958461:2,0,1,0
chr2	158958551	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=175,283;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:4,7,1,1
chr2	158958605	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:2,5,2,2
chr2	158958679	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr2	158978178	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr2	158980230	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:3,4,2,0
chr2	159028800	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=190,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,0,6
chr2	159035344	.	A	ATT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=238,163;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=T;STR;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,1:2,3:3,1,4,0
chr2	159077019	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr2	159195225	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=201,282;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr2	159389727	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:11,0:8,4:11,8,0,4
chr2	159389762	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,4:6,3:8,5,4,3
chr2	159434802	.	ATC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=132,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TC;STR;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:0,5,2,5
chr2	159477439	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=T;STR;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,2:4,0,3,0
chr2	159498940	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	159499306	.	CAGGTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=244,320;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:1,0:0,3,0,1
chr2	159519368	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=165,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.263:32:6,7:18,1:22,2,6,2
chr2	159522879	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:7,2,2,2
chr2	159523058	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=220,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,1:7,1:4,7,0,2
chr2	159526461	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=176,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,2:8,5:4,12,2,5
chr2	159652035	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=36,32;MFRL=196,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr2	159652059	.	AC	CT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:8,2:0|1:159652059_AC_CT:159652059:1,11,0,2
chr2	159652063	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:7,2:0|1:159652059_AC_CT:159652059:1,10,0,2
chr2	159672251	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.235:18:8,3:6,0:8,6,2,2
chr2	159672256	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:8,7,1,1
chr2	159683047	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=150,114;MMQ=50,42;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.377:6:2,0:0,1:0|1:159683047_G_A:159683047:2,2,1,1
chr2	159683050	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=113,114;MMQ=40,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:159683047_G_A:159683047:1,2,0,1
chr2	159954420	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=252,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	160005600	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=137,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,0:3,4:8,0,4,0
chr2	160019863	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,20:0,11:0,0,18,13
chr2	160032843	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	160042430	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,4:5,8:1,9,5,7
chr2	160055448	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr2	160074181	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:1,1:8,1:2,7,0,2
chr2	160082354	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,1:3,4:0,4,1,4
chr2	160084263	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	160084534	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,305;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	160085289	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=173,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:4,4,4,2
chr2	160086395	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=178,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:8,8,1,1
chr2	160086692	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=204,169;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.725:16:3,7:1,5:2,2,4,8
chr2	160087535	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=193,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:1,7,1,5
chr2	160092703	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=194,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:1,2:2,0:0,5,1,1
chr2	160116281	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,2:10,1:7,10,2,1
chr2	160132196	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:2,5:0,2,0,6
chr2	160176943	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=65.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,10:0,9:0,0,7,12
chr2	160181552	.	TATTA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160181552_TATTA_T:160181552:0,0,0,1
chr2	160181561	.	T	TTC	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:160181552_TATTA_T:160181552:0,0,0,1
chr2	160182302	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=188,83;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,6:5,3:7,6,5,4
chr2	160203934	.	A	C,T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31,26;MFRL=0,175,183;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=15.55,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,5,2:0.600,0.300:7:0,0,1:0,5,1:0,0,6,1
chr2	160231108	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=129,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr2	160241936	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=182,252;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:0,11,0,3
chr2	160243183	.	TA	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=202,288;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr2	160261387	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=194,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:5,0:6,3:5,6,3,1
chr2	160261568	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=129,84;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,1:8,2:8,10,1,2
chr2	160261721	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=302,187;MMQ=47,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	160261729	.	AC	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr2	160287304	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=227,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:160287304_C_T:160287304:2,0,1,0
chr2	160287311	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=227,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:160287304_C_T:160287304:2,0,1,0
chr2	160289911	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr2	160294779	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=208,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr2	160295732	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,123;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:7,6:3,4:6,4,2,8
chr2	160585740	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:0,4,0,5
chr2	160599595	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,4:6,6,3,1
chr2	160605484	.	CTTTTCTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,20;MFRL=187,127;MMQ=50,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:0,1:0|1:160605484_CTTTTCTTT_C:160605484:0,2,0,1
chr2	160605513	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=187,127;MMQ=50,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:160605484_CTTTTCTTT_C:160605484:0,2,0,1
chr2	160609162	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr2	160615943	.	AAAT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	160634564	.	ACC	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr2	160634582	.	TAATATC	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.812:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr2	160637324	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	160663435	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr2	160663678	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:1,2:6,6:0,7,4,4
chr2	160667004	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr2	160676427	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,4,9
chr2	160676445	.	A	AT,ATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25,26;MFRL=0,136,168;MMQ=60,60,60;MPOS=11,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=6,7,8;RU=T;STR;TLOD=6.59,10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,5:0.367,0.550:8:0,2,1:0,1,3:0,0,0,8
chr2	160688351	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=90,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr2	160691978	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,2,2
chr2	160698700	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr2	160708645	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=219,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,1,2
chr2	160708933	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.559:9:0,2:2,1:0,4,0,5
chr2	160711556	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	160714990	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr2	160729134	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr2	160729186	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr2	160737495	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	160737560	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	160738721	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,0:11,2:11,7,0,2
chr2	160742862	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:7,0,3,1
chr2	160746800	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,3:6,3:6,6,2,4
chr2	160833354	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:160833354_T_C:160833354:0,3,0,1
chr2	160833363	.	C	CAGGTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=210,217;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:160833354_T_C:160833354:0,3,0,1
chr2	160840370	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,0:0,6:0,0,6,0
chr2	160843623	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=146,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.442:16:4,1:4,5:7,2,5,2
chr2	160862094	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:2,2:3,1:5,1,3,0
chr2	160873270	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=171,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,3:2,2:0,7,1,4
chr2	160873294	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=176,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr2	160876827	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=207,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr2	160889673	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=113,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:1,3,0,5
chr2	160958145	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=234,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr2	160958349	.	GAA	G,GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,215,178;MMQ=60,60,60;MPOS=24,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=3.04,19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,9:0.212,0.724:11:0,2,4:0,0,5:0,0,3,8
chr2	160968743	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=32.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,7:3,3:4,1,0,10
chr2	160994180	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,124;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:8,7,2,0
chr2	161028992	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:2,1:4,0,7,0
chr2	161135000	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.563:30:6,12:7,5:13,0,14,3
chr2	161169828	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=226,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,1,2
chr2	161223688	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.227:12:4,1:6,1:8,2,2,0
chr2	162059969	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:2,1:14,4:9,7,4,1
chr2	162080591	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0|1:162080591_CA_C:162080591:0,10,0,2
chr2	162080599	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,2:0.213:12:7,1:3,1:1|0:162080591_CA_C:162080591:0,10,0,2
chr2	162081128	.	AT	A,ATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29,31;MFRL=171,177,191;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=10.72,4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,3:0.330,0.219:16:5,4,1:1,2,1:6,1,7,2
chr2	162091836	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=166,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:9,5:13,1:13,9,5,1
chr2	162175290	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,10:0,5:0,0,13,2
chr2	162224193	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=195,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:0,5:2,4:2,0,3,6
chr2	162224495	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=168,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:0,6,0,3
chr2	162247772	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=213,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,3:1,4:0,2,1,6
chr2	162265270	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=163,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:5,0,2,2
chr2	162280748	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,0:1,3:0,1,3,2
chr2	162280752	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,12;MFRL=180,310;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,0:1,0:0,1,2,1
chr2	162661056	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=173,148;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,4:8,0:4,10,4,0
chr2	162799267	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=286,115;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	162813807	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,232;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr2	162865838	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=195,260;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:14,0:8,5:4,18,0,5
chr2	162868303	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=167,167;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,16:0.362:45:10,16:18,0:20,9,16,0
chr2	162873188	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	162873410	.	A	ATTTT	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,21;MFRL=153,129731968;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,9,0,2
chr2	162873411	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=153,129731968;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,9,0,2
chr2	162873413	.	ATG	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=153,129731968;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:5,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,9,0,2
chr2	162873421	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=157,129731968;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,2:3,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,10,0,2
chr2	162873423	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=28,23;MFRL=163,129731968;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:0|1:162873410_A_ATTTT:162873410:2,8,0,2
chr2	162876828	.	CA	TT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=10,28;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.309:8:0,2:1,0:5,1,1,1
chr2	162877041	.	CA	C,CAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32,24;MFRL=146,175,123;MMQ=60,60,60;MPOS=21,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=6.56,6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,6:0.188,0.265:22:5,1,4:7,3,0:9,3,6,4
chr2	162881513	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	162890175	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=59,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.874:13:0,5:1,7:0,1,1,11
chr2	162891848	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,5,7
chr2	162894766	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=136,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,1:8,2:8,4,3,0
chr2	163030336	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=159,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,1:2,6:3,3,4,3
chr2	163076254	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=226,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr2	163080245	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0,8,1,2
chr2	163144899	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=154,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,1,6
chr2	163374254	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=189,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,2:6,0:4,7,2,0
chr2	163694878	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=251,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:0|1:163694878_C_G:163694878:3,0,6,0
chr2	163694886	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=251,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:0|1:163694878_C_G:163694878:3,0,7,0
chr2	164466039	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=197,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr2	164468328	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:10,1:4,10,0,2
chr2	164468360	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:0,7,1,4
chr2	165349459	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=286,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr2	165358672	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr2	165381580	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=45.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.405:40:7,0:17,16:7,17,0,16
chr2	165383686	.	AATATATATATATATATAT	A,AAT,AATAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25,27,28;MFRL=0,233,250,225;MMQ=60,60,60,60;MPOS=32,30,26;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=22,13,14,15;RU=AT;STR;TLOD=8.24,4.69,4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,2,3:0.342,0.253,0.328:8:0,2,1,1:0,1,1,2:0,0,0,8
chr2	165560236	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=142,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:3,13,0,2
chr2	165578581	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=246,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:1,7:3,7:4,0,10,5
chr2	165579065	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,2:6,2:7,5,1,3
chr2	165584407	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr2	165586652	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:3,5,1,1
chr2	165630100	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	165636332	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0,4,0,3
chr2	165793968	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr2	165809138	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=192,263;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TG;STR;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.446:7:3,1:1,2:2,2,1,2
chr2	165811653	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,295;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:18,5:7,0:18,7,5,0
chr2	165946623	.	TA	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165946623_TA_T:165946623:0,0,1,0
chr2	165946631	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:165946623_TA_T:165946623:0,0,1,0
chr2	165971883	.	AT	A,ATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30,29;MFRL=204,210,207;MMQ=60,60,60;MPOS=19,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.16,9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,6:0.169,0.397:16:3,1,3:4,2,3:7,0,9,0
chr2	166003573	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=266,234;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr2	166012203	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	166018764	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:4,3:0,0:3,2,2,1
chr2	166153499	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=75.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,8:0,0,17,5
chr2	166170073	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,2:2,8:3,0,9,1
chr2	166170080	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=183,243;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,1:9,1:12,0,1,1
chr2	166170127	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,8:0,0,11,6
chr2	166172317	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	166179650	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0,0,14,0
chr2	166221569	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=273,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.787:7:0,2:0,4:1,0,6,0
chr2	166229922	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	166514594	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=160,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,1:1,4:0,3,0,6
chr2	166535640	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=187,4680716;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:6,0:8,7,2,0
chr2	166616096	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:2,9,1,2
chr2	166621354	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	166626606	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr2	166740578	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:2,5:1,2:0,3,2,5
chr2	166747444	.	AGT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:14,0:4,2:0|1:166747444_AGT_A:166747444:8,11,1,1
chr2	166747449	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=120,62;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:13,0:4,1:0|1:166747444_AGT_A:166747444:8,9,1,1
chr2	166756257	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=47.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.454:38:10,17:8,0:15,6,17,0
chr2	166758447	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.327:13:2,1:4,3:1,8,0,4
chr2	166770120	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:3,2:6,4:5,4,4,2
chr2	166771663	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:10,2,3,1
chr2	166781242	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:5,2:6,1:1,10,1,2
chr2	166786973	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	166788336	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,7:0,14:0,0,13,8
chr2	166797450	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=71,272;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,4,0
chr2	166799893	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr2	166810161	.	G	GCCCGCTCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCCGCTCA;STR;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.797:6:1,2:0,1:1,0,4,1
chr2	166848349	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=191,751817;MMQ=60,46;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:6,5,2,0
chr2	166848612	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,183;MMQ=58,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:14,3:14,0:15,13,3,0
chr2	166859002	.	A	AAAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=211,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.279:12:2,3:7,0:0|1:166859002_A_AAAT:166859002:6,3,2,1
chr2	166859004	.	C	CATGAAGATGGGAAAAAAATAGCA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=211,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.275:12:2,3:7,0:0|1:166859002_A_AAAT:166859002:6,3,2,1
chr2	166892712	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=159,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,10:0.268:39:16,10:13,0:10,19,10,0
chr2	166893081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr2	166895913	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32,34;MFRL=183,145,106;MMQ=60,60,60;MPOS=16,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=7.12,3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,5,3:0.476,0.350:9:0,2,2:0,3,1:0,1,8,0
chr2	166896143	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:3,5,0,5
chr2	166896178	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:1,5,0,6
chr2	166897989	.	GAAAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=12,32;MFRL=238,257;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,10;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.217:7:0,0:1,1:1,5,0,1
chr2	166898717	.	CCCAACTCACAAATATATTTGTTTGAAATGAGACAATATAAGTTTGGTGAAAATAATTGAAACGAAAATAGAATTTGTTA	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=186,47;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.122:24:5,0:3,2:15,6,1,2
chr2	166898740	.	TGAAATGAGACAATATAAGTTTGGTGAAAATAATTGAAACGAAAATAGAATTTGTTACCAACCTTCTACTGTATTTGTTA	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.191:27:2,4:4,1:13,8,4,2
chr2	166901897	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=169,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr2	166903188	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=268,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	166903228	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=286,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:2,4,2,0
chr2	166903445	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:1,4,3,4
chr2	166905375	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=160,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,4:5,2:7,3,3,3
chr2	166905480	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=165,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:3,3,2,2
chr2	166905572	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=259,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	166909477	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,0:11,3:7,14,0,3
chr2	166909544	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=194,173;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,3:6,3:6,5,4,2
chr2	166930214	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	167055313	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=140,134;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,0:13,5:13,13,0,5
chr2	167060449	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=182,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:0,2:5,1:3,2,2,1
chr2	167060517	.	G	GAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=155,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,0:5,2:0|1:167060517_G_GAA:167060517:6,4,1,1
chr2	167060521	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=153,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:167060517_G_GAA:167060517:7,4,1,1
chr2	167060980	.	GAAAC	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=254,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,2:1,1:0,3,1,2
chr2	167085124	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=187,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr2	167085141	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=126,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:2,3:0,1:3,0,3,1
chr2	167090042	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=205,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr2	167137119	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=242,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:0|1:167137119_G_A:167137119:0,6,2,3
chr2	167137120	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=149,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,5:0.461:11:2,2:4,3:1|0:167137119_G_A:167137119:2,4,0,5
chr2	167145212	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=277,114;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,0:3,3:0,7,0,3
chr2	167149693	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,5,0
chr2	167160658	.	AGT	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=191,87;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,0:5,3:0|1:167160658_AGT_A:167160658:6,8,0,3
chr2	167160661	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=191,87;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:9,0:5,3:0|1:167160658_AGT_A:167160658:6,8,0,3
chr2	167160664	.	G	GC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=197,87;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:9,0:4,3:0|1:167160658_AGT_A:167160658:6,9,0,3
chr2	167160674	.	CAAACGAACAAAGA	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=181,87;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:9,0:5,2:0|1:167160658_AGT_A:167160658:7,9,0,3
chr2	167162277	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr2	167163199	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	167163372	.	TC	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=142,273;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr2	167163663	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr2	167299920	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=156,117;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr2	167327064	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:5,1,4,0
chr2	167328750	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=136,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0|1:167328750_C_T:167328750:1,0,6,0
chr2	167328754	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=178,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0|1:167328750_C_T:167328750:4,0,4,0
chr2	167334234	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,1:3,4:1,8,2,3
chr2	167759948	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=172,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	167760451	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=129,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr2	168041152	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=152,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:3,13,1,2
chr2	168096268	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,5:1,1:2,0,6,0
chr2	168098199	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=271,168;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	168099738	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:4,4,1,1
chr2	168099775	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:168099775_C_G:168099775:5,6,1,1
chr2	168099796	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=178,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:3,5:5,0:0|1:168099775_C_G:168099775:3,5,2,3
chr2	168100610	.	AA	GG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=153,118;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,3:7,0:12,8,3,0
chr2	168103304	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,4:6,1:6,10,1,4
chr2	168103863	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=241,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,5:2,3:6,4,4,4
chr2	168104199	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:4,4,0,4
chr2	168104370	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:11,6:5,4:8,8,5,5
chr2	168104627	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.344:24:9,3:7,5:8,8,3,5
chr2	168104988	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,2:8,3:9,6,5,0
chr2	168106085	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:7,3:5,8,2,2
chr2	168106246	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:7,3,2,1
chr2	168106423	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:9,8:9,0:10,8,8,0
chr2	168106885	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,0:10,5:7,11,0,5
chr2	168107491	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=163,81;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.297:25:9,1:8,6:10,8,2,5
chr2	168108357	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,1:6,2:3,8,2,1
chr2	168115769	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=166,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.371:17:5,4:5,2:8,3,3,3
chr2	168115797	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:9,3:2,2:5,6,2,3
chr2	168116187	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:0|1:168116187_C_A:168116187:6,6,2,1
chr2	168116189	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:6,2:5,1:0|1:168116187_C_A:168116187:6,6,2,1
chr2	168116318	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=196,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.570:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr2	168920066	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,119;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:6,3:22,0:14,14,3,0
chr2	168931467	.	TAATA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,108;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AATA;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.377:11:3,2:2,2:5,2,3,1
chr2	168986154	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=111.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.971:31:0,12:0,18:0,0,17,14
chr2	168986188	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=143,105;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:10,0:18,4:13,15,0,4
chr2	168986376	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	168996775	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=244,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:6,1,2,2
chr2	168997097	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr2	169487610	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.777:11:0,3:2,6:1,1,0,9
chr2	169622332	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=145,291;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr2	169681278	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,256;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTG;STR;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,1:0,1,1,4
chr2	169699644	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=197,114;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,0:9,4:2,10,0,4
chr2	169716114	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,2:9,1:10,9,2,1
chr2	169721377	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0|1:169721377_G_A:169721377:1,3,3,1
chr2	169721381	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:169721377_G_A:169721377:3,3,1,1
chr2	169727879	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	169728069	.	GAAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:0,1:3,1:2,3,2,1
chr2	169763148	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=154,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	169780366	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,266;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,2,1
chr2	169783565	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=200,317;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0|1:169783565_T_G:169783565:7,0,3,0
chr2	169783567	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=200,317;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:5,1:0|1:169783565_T_G:169783565:7,0,3,0
chr2	169801488	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=154,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,6:6,3:5,7,3,6
chr2	169824964	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.188:28:7,0:16,4:10,13,0,5
chr2	169824988	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:5,0:20,3:7,18,0,3
chr2	169825992	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,152;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:11,7,2,0
chr2	169828277	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=180,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr2	169828325	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=209,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:5,9:3,5:4,4,10,4
chr2	169828410	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,2:8,0:0|1:169828410_C_G:169828410:10,10,0,2
chr2	169828412	.	AT	GG	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=169,146;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:8,0:0|1:169828410_C_G:169828410:10,10,0,2
chr2	169830155	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,276;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:6,0,5,0
chr2	169830443	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=215,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	169836321	.	G	GGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.623:3:1,1:0,1:0|1:169836321_G_GGC:169836321:1,0,2,0
chr2	169836326	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0|1:169836321_G_GGC:169836321:0,0,3,0
chr2	169842809	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=120,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:1,1,0,5
chr2	169853073	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=145,202;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,4:1,0:7,0,4,0
chr2	169870753	.	CA	GG	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:9,5:17,0:16,10,5,0
chr2	169873205	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,4:4,4:8,3,8,0
chr2	169873241	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,2:10,0:15,8,1,1
chr2	169874712	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	169994021	.	AAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=178,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:1,2:0,4,1,2
chr2	170009390	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,1:8,3:8,13,4,0
chr2	170022389	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=208,101;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,3:1,0:7,0,3,0
chr2	170025198	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:1,1:6,1:2,5,0,2
chr2	170050472	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	170053580	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=206,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	170055255	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:2,2,3,2
chr2	170059190	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=216,130;MMQ=60,49;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,1:7,7:9,1,8,0
chr2	170077170	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=199,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr2	170082013	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=297,251;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	170088351	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=164,106;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:4,5:10,4:7,7,3,6
chr2	170089824	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=222,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr2	170092395	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,1:3,3:2,4,3,1
chr2	170096095	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:4,5,2,2
chr2	170096291	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=106,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:3,0:7,3:2,8,1,2
chr2	170099446	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=200,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:3,3,2,2
chr2	170099473	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:5,3,3,3
chr2	170099895	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=197,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:1,3:1,3:0|1:170099895_A_C:170099895:1,2,6,0
chr2	170099899	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=197,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0|1:170099895_A_C:170099895:1,2,6,0
chr2	170100011	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,270;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:8,5,1,1
chr2	170101156	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=128,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	170104104	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=285,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	170115807	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=184,68487256;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:0|1:170115807_T_A:170115807:0,6,0,2
chr2	170115809	.	T	TCCCTAGGTATA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=184,68487256;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:170115807_T_A:170115807:0,6,0,2
chr2	170129636	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr2	170134191	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	170139346	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=169,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	170148682	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=A;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr2	170151250	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=145,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.246:6:3,0:0,1:2,3,0,1
chr2	170163743	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,73;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,3:5,0:3,7,2,1
chr2	170175473	.	G	GGCAAATAGTTAGCACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=184,208;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.491:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	170218816	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr2	170218847	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr2	170336024	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=54.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,8:0,0,12,3
chr2	170344193	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr2	170355912	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=374,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr2	170355944	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=152,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,4:0,5:2,0,9,0
chr2	170371073	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=107,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:5,2:7,3,2,0
chr2	170371545	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=160,156;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.329:12:3,2:3,0:0,8,0,4
chr2	170386294	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr2	170394487	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=171,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:2,3:8,1:6,4,1,3
chr2	170402752	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,1,1
chr2	170417368	.	TTTTTTGTA	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,30;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170417368_TTTTTTGTA_T:170417368:0,0,0,1
chr2	170417379	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170417368_TTTTTTGTA_T:170417368:0,0,0,1
chr2	170417381	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,228;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170417368_TTTTTTGTA_T:170417368:0,0,0,1
chr2	170417385	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,228;MMQ=60,30;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:170417368_TTTTTTGTA_T:170417368:0,0,0,1
chr2	170441001	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:6,1:11,2:6,11,3,1
chr2	170460846	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=227,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:170460846_T_G:170460846:0,2,0,1
chr2	170460858	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=227,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:170460846_T_G:170460846:0,2,0,1
chr2	170463547	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=160,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:0|1:170463547_T_C:170463547:5,3,2,1
chr2	170463551	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=90,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,3:0.332:10:3,1:4,2:1|0:170463547_T_C:170463547:4,3,2,1
chr2	170488454	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=195,219;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr2	170492567	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=97,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,1:2,6:2,1,5,2
chr2	170492584	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=142,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:1,4:3,7:3,1,4,8
chr2	170493234	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=175,158;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:9,0:14,4:10,13,4,0
chr2	170505684	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,1:5,4:8,5,4,1
chr2	170531572	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.525:17:5,3:3,6:2,6,4,5
chr2	170531614	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr2	170550727	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.348:18:5,4:7,2:6,6,4,2
chr2	170632896	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=27,32;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:5,5,2,0
chr2	170632960	.	C	CA,CAA	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=31,32,31;MFRL=124,147,100;MMQ=60,60,60;MPOS=16,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=A;STR;TLOD=19.80,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,12,4:0.491,0.167:24:3,6,2:5,5,1:3,5,9,7
chr2	170632969	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=116,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.771:24:2,10:3,9:2,3,10,9
chr2	170633001	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=7;MBQ=32,29;MFRL=122,297;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,2:13,0:10,9,1,1
chr2	170633023	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=7;MBQ=23,28;MFRL=116,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.714:15:1,6:3,5:3,1,3,8
chr2	170633067	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=33,30;MFRL=118,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:0,2,0,6
chr2	170633103	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	170665108	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr2	170668106	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr2	170668813	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	170671883	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,137;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,10:3,0:10,0,10,0
chr2	170676227	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr2	170677805	.	A	ACACACACACACACACACACACAC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=171,153;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.291:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr2	170677855	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	170732524	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	170762487	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,2:0,4:0,0,5,2
chr2	170782037	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	170782338	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=265,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr2	170783092	.	CAAAAACA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=240,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAAAACA;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.516:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	170783769	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=385,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr2	170804033	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:7,2:8,3,4,0
chr2	170804306	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=205,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr2	170850738	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	170871976	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	170917544	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:7,1,7,1
chr2	170917983	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.904:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	170938410	.	C	CCAATTGCCTATCAGA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:2,10,0,3
chr2	171055942	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=111,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:0,2,0,3
chr2	171056569	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=252,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr2	171070810	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=242,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:2,0:8,3:10,0,3,0
chr2	171070850	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.460:24:7,3:6,8:9,4,10,1
chr2	171092445	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=208,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.734:9:0,4:2,3:2,0,6,1
chr2	171225841	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,4:7,6:5,7,5,5
chr2	171239560	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:5,1,2,1
chr2	171256597	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=220,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	171260708	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr2	171260787	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,10,13
chr2	171260797	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=151,124;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:12,2:7,4:7,13,4,2
chr2	171260803	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=151,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:16,0:8,4:12,12,0,4
chr2	171260820	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,16:0,9:0,0,11,14
chr2	171300575	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,5:2,3:0,4,1,7
chr2	171319996	.	AAG	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:4,2:2,0:0|1:171319996_AAG_A:171319996:2,5,1,1
chr2	171319997	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=163,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.672:7:1,4:1,1:0,2,2,3
chr2	171319999	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:171319996_AAG_A:171319996:2,5,1,1
chr2	171320002	.	TG	CA	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:1,0:0|1:171319996_AAG_A:171319996:2,6,1,1
chr2	171323280	.	CTGTGTCCTAAGAT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,2:4,3:0,9,1,4
chr2	171358211	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr2	171358474	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	171371350	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=201,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,13:3,0:6,0,13,0
chr2	171399309	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	171503330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,4,1
chr2	171508056	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,1:1,5:3,0,6,0
chr2	171508262	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,3:3,2:2,7,2,3
chr2	171508490	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	171570488	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=261,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:1,3,4,3
chr2	171573185	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=232,240;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,1,1
chr2	171654663	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=93,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr2	171702480	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=142,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:13,4:5,3:10,8,3,4
chr2	171710537	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:9,2:6,0:5,11,2,0
chr2	171786169	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	171786239	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=223,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.629:25:2,13:7,3:6,3,8,8
chr2	171793253	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=174,148;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr2	171818289	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,2,13
chr2	171822466	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=63.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,6:0,13:0,0,7,12
chr2	171822576	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=134,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:12,1:10,4:8,14,4,1
chr2	171850200	.	AG	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=179,221;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:0|1:171850200_AG_A:171850200:2,0,1,0
chr2	171850207	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=191,221;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:171850200_AG_A:171850200:3,0,1,0
chr2	171850212	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=195,221;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:171850200_AG_A:171850200:4,0,1,0
chr2	171850329	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=103,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:13,1:5,2:8,10,2,1
chr2	171862578	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27,28;MFRL=243,157,229;MMQ=60,60,60;MPOS=9,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=3.55,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.248,0.248:9:2,1,2:3,1,0:5,0,4,0
chr2	171902604	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	171902653	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.251:17:6,3:6,0:11,2,4,0
chr2	171902955	.	TGAA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=187,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0|1:171902955_TGAA_T:171902955:0,4,1,1
chr2	171902959	.	A	ATT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=198,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0|1:171902955_TGAA_T:171902955:0,3,1,1
chr2	171906469	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=170,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.433:16:5,3:3,4:3,6,1,6
chr2	171911713	.	CAAA	C,CAA	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=21,26,18;MFRL=181,110,115;MMQ=60,60,60;MPOS=18,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,15,17;RU=A;STR;TLOD=8.53,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,3:0.176,0.202:18:3,1,0:3,1,0:1,10,0,7
chr2	171912911	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:3,0,3,0
chr2	171916371	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=212,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr2	172016717	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=249,280;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:172016717_G_T:172016717:2,0,2,0
chr2	172016727	.	CG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=232,239;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	172016729	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=239,239;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:172016717_G_T:172016717:3,0,1,0
chr2	172182292	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:16,1:8,2:14,10,2,1
chr2	172188368	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=115,243;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:14,3:3,3:10,7,1,5
chr2	172305177	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	172309653	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:17,4:4,0:12,10,4,0
chr2	172378818	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,6:3,4:1,4,4,6
chr2	172378889	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=209,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.548:7:1,2:2,2:0|1:172378889_C_G:172378889:0,3,2,2
chr2	172378893	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=209,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.556:7:1,2:0,2:0|1:172378889_C_G:172378889:0,3,2,2
chr2	172379686	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=146,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:5,0,3,3
chr2	172398311	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=224,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.617:16:1,5:4,4:2,4,4,6
chr2	172549248	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=90.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,19,8
chr2	172582104	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=35,30;MFRL=140,0;MMQ=60,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.175:28:15,3:8,1:22,1,0,5
chr2	172582108	.	GTT	G,GTTT	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=30,35,35;MFRL=55,155,151;MMQ=60,60,60;MPOS=18,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,17;RU=T;STR;TLOD=3.55,16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,3,10:0.124,0.393:25:4,2,5:2,1,3:2,10,13,0
chr2	172582125	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,12;MFRL=55,155;MMQ=59,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.388:33:8,2:8,1:3,17,13,0
chr2	172582136	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=138,0;MMQ=60,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,3:12,0:10,16,0,3
chr2	172582281	.	A	ATTAC	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=88.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.960:20:0,14:0,6:0,0,2,18
chr2	172582344	.	AAC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=217,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr2	172600716	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=144,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,1,4
chr2	172644229	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=61.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,11,6
chr2	172647907	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=175,85;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,2:6,0:13,1,2,0
chr2	172671619	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=149,83;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:13,1:11,1:17,7,2,0
chr2	172683461	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=228,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.532:9:0,1:3,4:0|1:172683461_C_CA:172683461:0,4,1,4
chr2	172683481	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:0|1:172683461_C_CA:172683461:0,3,1,4
chr2	172690418	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=149,235;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,1:1,1:6,1,1,1
chr2	172693780	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,5:4,2:3,3,2,5
chr2	172712433	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=166,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:9,3:3,0:3,9,2,1
chr2	172712480	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr2	172865009	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=203,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,8:1,0:0,1,1,9
chr2	172942448	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=222,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	172943886	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=187,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.592:10:4,1:0,5:2,2,5,1
chr2	172945107	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:14,4:13,2:12,15,2,4
chr2	173344474	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:9,3:10,7:7,12,6,4
chr2	173354339	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=146,109;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:8,0:18,8:9,17,0,8
chr2	173368989	.	TA	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,244;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:7,2:12,0:7,15,0,3
chr2	173369000	.	A	AT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=172,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.342:28:9,3:8,7:4,14,3,7
chr2	173428874	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:1,4,0,5
chr2	173451163	.	C	CATTCCATTCCATTCGATT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,20;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.319:4:1,1:2,0:0|1:173451163_C_CATTCCATTCCATTCGATT:173451163:0,3,0,1
chr2	173451168	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=147,69;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:173451163_C_CATTCCATTCCATTCGATT:173451163:0,3,0,1
chr2	173600783	.	C	CG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	173659913	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr2	173662238	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:3,3:3,0:7,1,2,1
chr2	173662354	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,5:2,2:0,8,2,5
chr2	173848200	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=158,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,2:2,0:5,0,1,1
chr2	173861340	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=220,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,6:2,5:0,3,1,10
chr2	173913258	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,7:6,2:9,3,6,3
chr2	173913309	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.106:26:13,2:11,0:0|1:173913309_T_TC:173913309:16,8,0,2
chr2	173913315	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=141,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,1:12,0:0|1:173913309_T_TC:173913309:17,10,0,2
chr2	174055731	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=189,86;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,4:3,2:4,7,3,3
chr2	174074407	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=134,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:4,1,8,0
chr2	174094345	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	174094500	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=107,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:3,1:4,3:2,6,1,3
chr2	174230153	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,11:0.667:16:4,7:1,4:0|1:174230153_C_G:174230153:5,0,8,3
chr2	174230162	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=174,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:12,1:4,1:0|1:174230153_C_G:174230153:15,1,0,2
chr2	174230974	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,2:9,1:12,1,3,0
chr2	174230983	.	G	GT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=206,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:2,3:1,7:3,0,9,1
chr2	174232076	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:2,5,1,4
chr2	174774753	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.127:21:10,0:9,2:7,12,1,1
chr2	174777699	.	ATC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	174783338	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=133,101;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:18,3:6,0:9,16,3,0
chr2	174943876	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=153,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:1,8,0,4
chr2	174946001	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:2,9,1,1
chr2	175093978	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:3,3:4,3:3,4,6,1
chr2	175213540	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=181,114;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,3:7,0:6,9,3,0
chr2	175264627	.	CTT	C,CT	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=32,34,35;MFRL=167,189,160;MMQ=60,60,60;MPOS=12,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=4.21,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.360,0.289:8:0,3,2:3,0,0:3,0,5,0
chr2	175264647	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=80,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:3,0:3,1:7,5,3,0
chr2	175264649	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:5,0:0|1:175264649_G_T:175264649:8,5,2,0
chr2	175264662	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,0:5,0:0|1:175264649_G_T:175264649:6,7,2,0
chr2	175264668	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=35,15;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:7,0:0|1:175264649_G_T:175264649:7,8,2,0
chr2	175300997	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,1:12,2:12,7,1,2
chr2	175310003	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=258,252;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr2	175318387	.	CAAAAAAAAGA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=106,227;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.600:4:0,2:0,1:0,1,3,0
chr2	175326258	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:7,5:8,0:9,6,3,2
chr2	175335076	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	175427243	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:17,0:7,2:15,10,0,2
chr2	175431707	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:3,0,4,0
chr2	175436580	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=146,133;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.256:40:10,9:20,0:10,20,10,0
chr2	175439512	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr2	175439536	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=144,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,1:5,2:13,2,3,0
chr2	175439681	.	TA	T,TAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,28,30;MFRL=97,173,144;MMQ=60,60,60;MPOS=22,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=13.42,7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,5:0.319,0.253:22:2,5,0:6,3,5:2,7,4,9
chr2	175613059	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=232,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	175613600	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	175614908	.	CAA	C,CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34,33;MFRL=0,173,208;MMQ=60,60,60;MPOS=25,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,16;RU=A;STR;TLOD=4.46,3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.308,0.562:5:0,1,1:0,1,1:0,0,0,5
chr2	175622788	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,14:0,5:0,0,7,12
chr2	175624107	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,272;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,0:5,4:8,7,1,3
chr2	175629021	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=143,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,0:4,7:9,4,4,3
chr2	175677022	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=179,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:11,8:3,1:8,6,6,3
chr2	175677111	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=214,78;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:8,9,1,2
chr2	175689342	.	C	CTATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=280,268;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=TA;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.489:2:1,0:0,0:0,1,0,1
chr2	175742915	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr2	175957450	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	175982957	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:6,2:8,2:11,4,3,1
chr2	175994967	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=137,255;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:10,2:2,4:5,7,2,4
chr2	176032377	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,103;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:22,0:10,3:12,20,0,3
chr2	176044008	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=139,232;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,1:4,3:2,10,0,4
chr2	176947237	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:2,3,0,3
chr2	176964947	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:4,3,4,1
chr2	176983598	.	CAAAACCAAAACA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=231,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.505:8:2,0:2,4:4,0,3,1
chr2	176988290	.	C	CGCA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCA;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:2,8,0,3
chr2	176996015	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=230,295;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,2:2,0:0|1:176996015_TC_T:176996015:4,0,1,1
chr2	176996023	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=252,309;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,5:0.537:9:3,3:1,2:1|0:176996015_TC_T:176996015:3,1,5,0
chr2	177014970	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.493:14:2,3:5,2:7,0,4,3
chr2	177033779	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,3,1
chr2	177036531	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=161,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:4,6,1,1
chr2	177054411	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,4:3,3:3,5,0,7
chr2	177054769	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,10:5,4:5,5,2,12
chr2	178129390	.	TGGC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=198,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr2	178301428	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr2	178326838	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:178326838_C_G:178326838:0,0,0,7
chr2	178326847	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,3:0|1:178326838_C_G:178326838:0,3,0,3
chr2	178357852	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.451:7:4,0:0,3:3,1,3,0
chr2	178362572	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	178364464	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=174,64;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:178364464_G_T:178364464:3,13,1,1
chr2	178364472	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:5,0:11,2:0|1:178364464_G_T:178364464:3,13,1,1
chr2	178364475	.	AT	TG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:178364464_G_T:178364464:3,14,1,1
chr2	178364478	.	A	ATTTC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,1:0|1:178364464_G_T:178364464:3,13,1,1
chr2	178378452	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr2	178402786	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=138,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.482:25:7,6:6,6:9,4,9,3
chr2	178417540	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:19,4:22,0:23,18,4,0
chr2	178417609	.	A	T	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=158,121;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,8:0.140:62:31,0:23,8:20,34,0,8
chr2	178417835	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	178494173	.	G	GGGA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGA;STR;TLOD=43.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,3:4,8:4,4,9,3
chr2	178528703	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,7:1,4:3,2,3,8
chr2	178534110	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=223,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr2	178534324	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=239,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	178540293	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=170,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:6,2,1,5
chr2	178540366	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,0:12,6:8,11,0,6
chr2	178545713	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	178565775	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=224,337;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr2	178565815	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,10,6
chr2	178681534	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=189,103;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.649:18:3,6:3,6:6,0,9,3
chr2	178681716	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=210,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr2	178682558	.	A	ATATAAAC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=220,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr2	178684878	.	A	AAG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0|1:178684878_A_AAG:178684878:5,1,4,0
chr2	178684879	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0|1:178684878_A_AAG:178684878:5,1,4,0
chr2	178684921	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:6,3,7,3
chr2	178685129	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=223,326;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	178764364	.	A	AAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AT;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr2	178769992	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	178936614	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,7:0,0,11,6
chr2	178937048	.	C	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,98;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,6:0.151:44:15,6:23,0:21,17,6,0
chr2	178969206	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=172,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:2,4,1,1
chr2	178977620	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=248,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr2	178988219	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=184,251;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:6,7,2,0
chr2	178990447	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=101,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,1:5,2:8,4,1,2
chr2	178990941	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AT;STR;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,2:1,3:0,5,2,3
chr2	179200947	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=198,244;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr2	179208974	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=146,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.184:34:14,5:12,0:16,12,3,3
chr2	179236831	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=219,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,8:2,3:2,1,9,2
chr2	179238841	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=236,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,1:0,3:0,4,0,4
chr2	179247998	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:5,0:1,6,0,2
chr2	179300971	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,2783;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,0:4,6:3,10,5,1
chr2	179315031	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,1803;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:15,2:13,0:15,13,1,1
chr2	179315726	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=142,820;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:4,0:0|1:179315726_G_A:179315726:4,1,1,2
chr2	179315734	.	GGC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=149,820;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:1,2:5,1:0|1:179315726_G_A:179315726:5,1,1,2
chr2	179324025	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,0:2,4:0,5,0,4
chr2	179325632	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=252,190;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.263:6:2,0:1,0:5,0,1,0
chr2	179330468	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	179341953	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=151,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:9,5:7,3:4,12,3,5
chr2	179363909	.	AT	A,ATT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32,30;MFRL=153,144,120;MMQ=60,60,60;MPOS=10,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=9.66,8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,6,7:0.236,0.266:26:8,4,2:5,2,1:8,5,13,0
chr2	179392080	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:4,7,3,1
chr2	179392573	.	A	ATGCACACACCCCACCTGTTCTACGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=207,168;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	179398153	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=229,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,2:7,1:14,3,3,0
chr2	179400585	.	GAA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.371:9:1,2:3,0:4,2,2,1
chr2	179403593	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:6,4,0,4
chr2	179404786	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=274,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,0,3
chr2	179406191	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:5,4,2,2
chr2	179407662	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:10,3:8,1:11,7,1,3
chr2	179410704	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:6,2:4,8,2,1
chr2	179414633	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=246,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,1:7,2:4,4,1,2
chr2	179418703	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,1:0,0:2,1,1,0
chr2	179426327	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,135;MMQ=60,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:10,0:14,4:9,15,0,4
chr2	179429523	.	TT	AC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=156,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:7,2:0|1:179429523_TT_AC:179429523:8,7,0,2
chr2	179429528	.	G	GTTGCAAACTTTTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=185,127;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,0:4,2:0|1:179429523_TT_AC:179429523:8,5,0,2
chr2	179442139	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:5,0:3,3:2,6,0,3
chr2	179443626	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,0:11,3:9,10,1,2
chr2	179449131	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,3:6,5:5,10,4,4
chr2	179449799	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:0|1:179449799_C_CT:179449799:7,11,0,2
chr2	179449800	.	C	CTA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:13,0:5,2:0|1:179449799_C_CT:179449799:7,11,0,2
chr2	179449801	.	ATG	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=138,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:5,2:0|1:179449799_C_CT:179449799:7,13,0,2
chr2	179449807	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=142,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:179449799_C_CT:179449799:6,12,0,2
chr2	179454861	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:6,6,1,1
chr2	179455270	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=142,115;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:8,1:9,1:11,6,0,3
chr2	179460214	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=231,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.422:12:5,4:2,1:7,0,5,0
chr2	179466070	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,2:8,1:8,10,0,3
chr2	179470523	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=A;STR;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	179477332	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	179482506	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=164,52;MMQ=60,48;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:7,4:10,0:8,9,4,0
chr2	179483475	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=176,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.224:20:10,0:6,4:8,8,2,2
chr2	179486478	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:11,3:6,1:7,10,2,2
chr2	179489454	.	G	GACCACTGTGTCTGTCGAACACA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=197,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.264:9:2,2:4,0:1,6,1,1
chr2	179497976	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,73;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:10,2:5,0:5,10,1,1
chr2	179499546	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:3,7,2,0
chr2	179504795	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:10,9,2,0
chr2	179510831	.	TTATA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=172,228;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=TA;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr2	179511767	.	GTATATA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=159,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,8;RU=TA;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.262:12:5,2:2,1:8,1,1,2
chr2	179514433	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=203,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,1:7,2:5,6,2,1
chr2	179516006	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=149,84;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,0:7,4:14,6,0,4
chr2	179517019	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=144,203;MMQ=43,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:2,9,2,3
chr2	179528746	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,137;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,0:5,5:9,3,0,6
chr2	179547860	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:6,2,4,0
chr2	179548695	.	AT	A,ATT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29,24;MFRL=182,187,224;MMQ=60,60,60;MPOS=20,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.34,3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.358,0.301:9:2,0,1:0,2,0:2,1,3,3
chr2	179548980	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,0,1
chr2	179549048	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:7,6,1,1
chr2	179553542	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,0:2,3:0,6,0,3
chr2	179553888	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:8,5,0,3
chr2	179558282	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=195,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:4,1:8,4:11,2,2,3
chr2	179563457	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=217,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr2	179563643	.	TAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,16;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:1,1:3,0:3,3,0,3
chr2	179566146	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr2	179566802	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=154,284;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.161:16:6,1:3,1:8,6,1,1
chr2	179572417	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=241,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:4,2,3,2
chr2	179575559	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:12,7,1,1
chr2	179576596	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr2	179578108	.	T	TACAAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=ACAAA;STR;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.432:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr2	179582605	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:4,5,3,1
chr2	179583398	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=188,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.388:21:8,5:5,3:8,5,6,2
chr2	179587101	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,0:6,7:2,6,0,7
chr2	179587130	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,158;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:1,4,3,0
chr2	179590460	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=182,125;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,3:12,0:7,9,0,3
chr2	179593270	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:10,6,2,2
chr2	179595372	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:5,1:8,3:7,6,2,2
chr2	179597108	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:2,5,2,0
chr2	179599473	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=121,66;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,2:8,0:0|1:179599473_C_T:179599473:8,13,1,1
chr2	179599479	.	T	TTAG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=101,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:10,2:9,0:0|1:179599473_C_T:179599473:7,14,1,1
chr2	179600563	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr2	179611691	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=195,88;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:5,4:7,11:7,5,15,0
chr2	179614952	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,4,13
chr2	179616770	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=253,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,1:0,2:0,1,0,7
chr2	179618019	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	179623939	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr2	179631362	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=224,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,4:7,1:2,9,2,3
chr2	179632710	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,8:3,8:3,4,8,8
chr2	179633298	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=15,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr2	179634376	.	GTA	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=168,277;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TA;STR;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,8:0.671:12:2,3:2,5:0|1:179634376_GTA_G:179634376:4,0,8,0
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chr2	179635882	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr2	179636059	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=184,98;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,3:7,0:7,5,1,2
chr2	179639297	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	179640233	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:10,0:8,2:11,7,2,0
chr2	179640868	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:9,0:6,7:8,7,0,7
chr2	179642425	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=38.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,7,6
chr2	179643886	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr2	179643934	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr2	179647824	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=256,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr2	179650954	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=177,292;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr2	179666830	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:6,2:11,1,2,1
chr2	179667090	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,2:4,8:3,4,1,9
chr2	179702268	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,9,9
chr2	179702319	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:2,11,3,0
chr2	179732980	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.587:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr2	179736940	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:11,8,2,0
chr2	179753245	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:9,4:9,3:11,7,6,1
chr2	179783696	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,323;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	179826241	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=125,338;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,0,3
chr2	179839888	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:4,4:4,6,1,4
chr2	179843310	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:6,2:15,1:15,6,0,3
chr2	179974761	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,3:7,1:5,7,1,3
chr2	179980053	.	G	GAAATT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	179980070	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr2	179988395	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=136,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.717:5:0,2:0,2:1,0,4,0
chr2	179989039	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=165,226;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	180015941	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=139,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr2	180036775	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=229,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:5,0,1,1
chr2	180039068	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:4,0,8,1
chr2	180047746	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=139,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:4,0,6,1
chr2	180307879	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	180725481	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr2	180815528	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=198,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,9:2,2:2,0,7,4
chr2	180829244	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=149,195;MMQ=60,48;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:11,2,3,0
chr2	180835589	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=73.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,9:0,11:0,0,6,14
chr2	180837806	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:2,5:1,5:3,0,11,0
chr2	180843126	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=151,256;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr2	180846743	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,2:1,4:0,3,2,4
chr2	181851996	.	TT	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=158,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:7,0,8,3
chr2	181925374	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=140,244;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:4,3:6,2,3,0
chr2	182344846	.	G	GT	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=118,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.681:24:7,6:1,7:7,1,8,8
chr2	182350743	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,1,7
chr2	182359613	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	182374328	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=162,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,1:9,3:14,2,4,0
chr2	182374534	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:0,5:2,3:0,2,1,8
chr2	182376546	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=67.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.960:21:0,7:0,12:0,0,4,17
chr2	182387133	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	182392143	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:1,8,0,2
chr2	182395345	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=101,137;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,6:0,5:1,1,3,8
chr2	182399497	.	A	ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=210,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:1,1:3,1,4,0
chr2	182399685	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,2:5,1:4,9,0,3
chr2	182402790	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=227,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr2	182403792	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,4,4
chr2	182412633	.	G	GACACACACACACAC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=50211368,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,11;RU=AC;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.690:8:0,1:2,4:0,2,0,6
chr2	182413602	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,0,12
chr2	182430120	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=138,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.669:13:2,4:2,5:2,2,8,1
chr2	182778704	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=190,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:1,5,0,5
chr2	182852689	.	A	ATGGAATGGAATCGAATGCAATG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=215,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.290:8:3,2:3,0:0,6,1,1
chr2	182852729	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=171,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr2	182928555	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,11:0,5:0,0,5,11
chr2	182981846	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=134,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr2	183053658	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,269;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:8,3,2,0
chr2	183066171	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=122,93;MMQ=60,59;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:10,5,3,0
chr2	183066276	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:9,0:17,3:15,11,3,0
chr2	183066377	.	C	CAAAA,CAAAAAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32,32;MFRL=228,183,209;MMQ=60,60,60;MPOS=9,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,17,19;RU=A;STR;TLOD=6.26,3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,2:0.456,0.280:8:1,1,0:0,3,2:1,1,5,1
chr2	183066394	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=202,209;MMQ=33,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.186:23:4,0:13,2:4,15,4,0
chr2	183088584	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=224,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,7:1,2:3,0,7,2
chr2	183593451	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:2,3:1,3:1,2,1,5
chr2	183597318	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr2	183616592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr2	183616748	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr2	183622319	.	AATAAT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=11015246,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAT;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr2	183622439	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,2:6,0:12,7,1,1
chr2	183627619	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr2	183793653	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,2:7,3:3,12,2,3
chr2	183806893	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.342:16:0,4:11,1:3,8,1,4
chr2	183827018	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=108,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,3,1
chr2	183827056	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=161,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:4,0:0,6,1,1
chr2	183832100	.	CAA	C,CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=172,188,213;MMQ=60,60,60;MPOS=29,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=4.40,6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,2,4:0.124,0.221:20:4,1,4:4,1,0:1,13,1,5
chr2	183841691	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:2,1:1,1:3,0,0,4
chr2	183848114	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:1,2,2,4
chr2	183851058	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	183867004	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=215,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr2	183960143	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=153,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,2:5,0:5,1,2,0
chr2	183995115	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=110,227;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.727:4:0,3:1,0:1,0,2,1
chr2	183995142	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=185,234;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.271:9:3,0:2,0:0|1:183995142_G_T:183995142:5,2,2,0
chr2	183995144	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=26,15;MFRL=185,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,0:0|1:183995142_G_T:183995142:5,2,2,0
chr2	183995153	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=148,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,0:0|1:183995142_G_T:183995142:6,2,2,0
chr2	184024143	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=221,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr2	185463815	.	C	CCT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.375:17:6,5:4,1:4,7,0,6
chr2	185798504	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,5:0,9:0,1,3,11
chr2	185802211	.	C	CACA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=208,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACA;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,1:2,1,1,3
chr2	185802243	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=212,180;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,4:1,5:1,0,4,5
chr2	185803074	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,3:10,0:9,5,3,0
chr2	186670104	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,10:0,6:0,0,9,7
chr2	186671973	.	T	TGATCCAAGTACTTCCTTCTC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=163,41;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:10,4,1,1
chr2	186672897	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,8:2,2:3,2,6,4
chr2	186678241	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=12.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:2,5:3,1:4,1,5,1
chr2	186680041	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=208,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:1,1:2,7:2,1,4,4
chr2	186692859	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=111,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:3,1:5,2:7,1,3,0
chr2	186697876	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr2	187351020	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=216,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:5,4:6,0,6,0
chr2	187364811	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,11,0
chr2	187364878	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,7:1,10:1,1,9,8
chr2	187369013	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:187369013_T_TG:187369013:0,0,0,7
chr2	187369037	.	G	GA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=188,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:187369013_T_TG:187369013:0,3,0,1
chr2	187455278	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	187466921	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=131,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,0:0,3:0,5,0,3
chr2	187490371	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=80.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,10:0,0,5,14
chr2	187490389	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0|1:187490389_G_T:187490389:0,0,2,13
chr2	187490405	.	T	TGTGTGA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=164,191;MMQ=46,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.719:5:0,1:1,2:0|1:187490389_G_T:187490389:0,1,0,4
chr2	187497988	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,5,0
chr2	187501682	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=150,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr2	187503226	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:5,5:3,3:4,4,1,7
chr2	187505738	.	T	TGTCCTTGAGAAATGATG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=248,125;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	187529823	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,30,30;MFRL=157,148,99;MMQ=60,60,60;MPOS=27,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.34,5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.285,0.431:4:0,0,0:1,1,2:1,0,3,0
chr2	187529841	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:187529841_G_T:187529841:3,0,1,0
chr2	187529844	.	CT	AT,AA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=17,10,10;MFRL=99,148,157;MMQ=60,60,60;MPOS=6,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:0,0,0:0,0,0:2,0,2,0
chr2	187529848	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=25,10;MFRL=74,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:187529841_G_T:187529841:2,0,1,0
chr2	187529860	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=110,157;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:187529841_G_T:187529841:2,1,1,0
chr2	187529975	.	TC	CT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:187529975_TC_CT:187529975:1,1,0,1
chr2	187529979	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:187529975_TC_CT:187529975:1,1,0,1
chr2	187532010	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:0,6,0,7
chr2	187532373	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:3,1,5,2
chr2	187559029	.	A	ACAGCAG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=208,252;MMQ=60,52;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=CAG;STR;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.496:6:0,0:2,1:2,1,1,2
chr2	187559047	.	G	GCAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=246,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=CAA;STR;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.537:11:2,2:3,4:3,2,3,3
chr2	187559222	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:0,5,0,4
chr2	187611748	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	187627567	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=172,122;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,2:7,1:3,8,1,2
chr2	187693104	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,140;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:6,2:13,1:11,9,1,2
chr2	187693521	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr2	187697883	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,6:5,3:5,3,4,5
chr2	187697996	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,2:2,0:2,4,0,2
chr2	187698037	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr2	187703983	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,116;MMQ=60,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr2	187709415	.	AC	A	.	.	DP=77;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=106,155;MMQ=54,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,4:0.091:51:13,2:30,2:42,5,3,1
chr2	187709553	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,32;MFRL=200,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.392:21:10,5:3,3:0|1:187709553_A_G:187709553:4,9,0,8
chr2	187709555	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=24,28;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:11,4:6,0:0|1:187709553_A_G:187709553:4,14,0,4
chr2	187709557	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:11,4:7,0:0|1:187709553_A_G:187709553:4,15,0,4
chr2	187709559	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=182,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:12,4:7,0:0|1:187709553_A_G:187709553:4,15,0,4
chr2	188216807	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr2	188224057	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	188224086	.	A	ATTCATGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr2	188225486	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:12,2:3,1:0,16,0,3
chr2	188243633	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr2	188250301	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,10:0,7:0,0,10,7
chr2	189434711	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:2,2:5,0:6,1,3,1
chr2	189448896	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr2	189454355	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=164,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:4,1,5,0
chr2	189849773	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	189855674	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=139,87;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:5,13:2,2:5,2,12,3
chr2	189859131	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=223,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,0:6,5:4,8,0,5
chr2	189859434	.	CTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:7,0:8,5,2,0
chr2	189861031	.	T	TAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=102,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=AC;STR;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.708:8:1,3:1,3:1,1,3,3
chr2	189862203	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr2	189863389	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,297;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,1:9,10,2,1
chr2	189867805	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,20;MFRL=175,53;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:17,2:0|1:189867805_T_A:189867805:2,22,1,1
chr2	189867811	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=35,20;MFRL=175,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:189867805_T_A:189867805:2,19,1,1
chr2	189867813	.	C	CTGT	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=35,20;MFRL=175,53;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:189867805_T_A:189867805:2,19,1,1
chr2	189867815	.	A	ATC	.	.	DP=23;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=175,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:6,2:0|1:189867805_T_A:189867805:2,19,1,1
chr2	189867819	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=7;MBQ=25,20;MFRL=158,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:189867805_T_A:189867805:1,10,1,1
chr2	189867844	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=25,28;MFRL=156,271;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr2	189867882	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,29;MFRL=212,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr2	189872236	.	GC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:4,0:3,5,6,0
chr2	189872864	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=174,115;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,0:4,3:0,7,1,2
chr2	189872907	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=186,49;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,0:6,4:0,9,0,5
chr2	189874873	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=114,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:6,3,6,0
chr2	189876305	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	189899541	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	189899572	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,4:0,5:0,0,10,0
chr2	189901295	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=174,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr2	189910066	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,267;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=TG;STR;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:4,1:0,1:0,4,0,2
chr2	189918787	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=183,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:1,0,5,4
chr2	189922016	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,20;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	189923104	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr2	189923630	.	ATT	A,AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,28,28;MFRL=152,150,172;MMQ=60,60,60;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=6.63,31.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,15:0.218,0.699:20:1,1,6:0,3,9:0,1,7,12
chr2	189925548	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr2	189926229	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=103,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.281:12:3,2:6,1:7,2,3,0
chr2	189927506	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	189928834	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=225,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	189936687	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=222,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,2,1
chr2	189943121	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr2	189949786	.	TG	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:4,3:5,0,5,1
chr2	189964747	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=161,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:4,1,1,1
chr2	190313276	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=154,63;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:190313276_G_A:190313276:4,10,1,1
chr2	190313281	.	T	TGGGAAGAAAGTGCAGGACTGTCTTTTGCCGGATTGAAGG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=156,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,0:6,2:0|1:190313276_G_A:190313276:3,10,1,1
chr2	190313396	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr2	190319966	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr2	190319990	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	190321967	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=162,72;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:2,2:1,0:3,0,1,1
chr2	190322196	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	190323453	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=226,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr2	190327126	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr2	190331057	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr2	190443304	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	190444630	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,9:0,0,6,10
chr2	190445076	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=233,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,2:2,5:3,0,6,1
chr2	190445284	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=169,350;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.268:12:3,0:6,2:0,9,0,3
chr2	190535538	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	190554305	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr2	190570001	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	190593168	.	ATTTTT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=131,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,1:12,2:10,13,0,3
chr2	190593311	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr2	190603201	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=171,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr2	190611084	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:3,1,5,3
chr2	190611414	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr2	190615305	.	C	CTGAAGCAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:9,0:9,7,0,2
chr2	190636411	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=223,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr2	190640434	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=174,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:13,0:8,14,1,1
chr2	190640475	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=264,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:0,2,1,7
chr2	190647108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,7:0,0,5,6
chr2	190670539	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=150,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.296:14:4,3:6,1:5,5,2,2
chr2	190926859	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,297;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr2	191065236	.	TTTTG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=288,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTG;STR;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:3,8:1,6:4,0,9,5
chr2	191065782	.	A	AGAT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=194,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=54.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.826:15:1,7:1,6:2,0,8,5
chr2	191066769	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr2	191067766	.	T	TTC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=235,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=80.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:1,10:2,8:1,2,12,8
chr2	191109533	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,4,2
chr2	191116355	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,1:0,4:0,2,0,5
chr2	191155224	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=18,25;MFRL=260,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:191155224_G_A:191155224:0,1,0,1
chr2	191155233	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=260,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:191155224_G_A:191155224:0,1,0,1
chr2	191175639	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	191184524	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=117,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.933:28:0,8:1,19:1,0,12,15
chr2	191224752	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=220,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,2:2,8:3,0,9,1
chr2	191227235	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	191227492	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=268,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,4:2,3:1,1,1,6
chr2	191231458	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,4:3,6:3,3,5,5
chr2	191231503	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=163,145;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:1,3:4,8:2,3,5,6
chr2	191235760	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=138,127;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:11,0:14,5:10,16,0,5
chr2	191235761	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,22;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:10,1:17,2:10,17,0,3
chr2	191235785	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=157,127;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:5,0:12,5:6,11,0,5
chr2	191300770	.	AGTT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=152,55;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:0|1:191300770_AGTT_A:191300770:6,6,1,1
chr2	191300774	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:5,0:0|1:191300770_AGTT_A:191300770:6,6,1,1
chr2	191301368	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=130,180;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:9,5:8,2:7,10,4,3
chr2	191301518	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=165,19765286;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:7,5,0,2
chr2	191302277	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=128,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,0:9,2:5,9,1,1
chr2	191334459	.	A	ATTTTTAT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTTAT;STR;TLOD=81.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,11:0,6:0,0,16,3
chr2	191354491	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,2:7,3:8,2,3,2
chr2	191354658	.	C	CCT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	191383348	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=207,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr2	191390126	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:9,2:4,13,1,1
chr2	191523862	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.388:8:3,0:2,2:5,0,3,0
chr2	191523894	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.238:11:2,0:3,1:4,5,2,0
chr2	191537793	.	GTT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	191746233	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:12,6:5,5:4,13,0,11
chr2	191765206	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	191789206	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,0:2,4:6,0,4,0
chr2	191795063	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=194,107;MMQ=60,36;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:2,1,1,1
chr2	191839464	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:10,1,2,0
chr2	191839976	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr2	191841759	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,2:7,2:2,12,2,2
chr2	191848312	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr2	191851485	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=252,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr2	191851805	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=156,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:8,4:7,1:5,10,1,4
chr2	191851897	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:0,6,1,2
chr2	191854423	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,5:9,3:4,13,3,5
chr2	191875035	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=127,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.451:27:7,3:7,9:9,6,6,6
chr2	191898256	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:11,4:17,0:15,13,4,0
chr2	191899148	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=239,199;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=A;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr2	191899346	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=194,122;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,2:6,2:4,10,2,2
chr2	191900808	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=204,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr2	191923026	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=167,184;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr2	191923064	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	191923375	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=141,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:8,0:12,4:13,7,2,2
chr2	191923543	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:7,3:1,5:3,5,1,7
chr2	191996518	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=102,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,3:0,1:2,1,4,0
chr2	192214833	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:2,3,3,1
chr2	192225294	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=338,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,4:1,4:2,1,8,0
chr2	192225477	.	G	GTGTTGT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=TGT;STR;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.637:7:1,2:1,3:1,1,2,3
chr2	192226908	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr2	192228433	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:2,1:9,3:10,1,4,0
chr2	192246208	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,0:6,2:4,8,1,1
chr2	192246243	.	T	TCACCA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=187,63;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:5,2:4,5,1,1
chr2	192250543	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,13,0
chr2	192250568	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,13:0,0,15,7
chr2	192261256	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,0:4,5:1,9,0,5
chr2	192283457	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	192711162	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=76.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,12,9
chr2	192711385	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:11,3:10,3:12,10,4,2
chr2	192814958	.	TGTCTTA	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=207,161;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:192814958_TGTCTTA_T:192814958:5,0,2,0
chr2	192814967	.	CTTTTG	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=54,161;MMQ=60,44;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:1,2:0|1:192814958_TGTCTTA_T:192814958:6,1,2,0
chr2	192814973	.	T	TAAAA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,21;MFRL=69,161;MMQ=60,44;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,0:1,2:0|1:192814958_TGTCTTA_T:192814958:7,1,2,0
chr2	192818609	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,15;MFRL=187,157;MMQ=35,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=24,22;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.540:4:0,0:2,0:0,2,0,2
chr2	192818646	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=198,334;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr2	192820898	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	193056509	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=227,142;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:8,3:1,0:0|1:193056509_G_T:193056509:9,0,3,0
chr2	193056514	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=217,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:8,2:2,0:0|1:193056509_G_T:193056509:10,0,3,0
chr2	196545217	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:11,7:4,0:9,6,7,0
chr2	196578151	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:2,0:10,2:6,6,2,0
chr2	196578312	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=180,56;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:7,0:12,2:0|1:196578312_T_C:196578312:4,15,1,1
chr2	196578327	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=167,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:196578312_T_C:196578312:1,9,1,1
chr2	196578330	.	CAAA	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=167,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:5,1:0|1:196578312_T_C:196578312:1,9,1,1
chr2	196581295	.	T	TGTCTAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=57.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,4:0,0,13,0
chr2	196602559	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr2	196602582	.	A	AAAT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=43.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,8:0,0,10,0
chr2	196602914	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=187,135;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.575:17:4,0:3,9:0,7,0,10
chr2	196636662	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr2	196642488	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:3,1:7,1:7,4,2,0
chr2	196663997	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,9,5
chr2	196681284	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr2	196682630	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	196722195	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,0:7,7:5,10,0,7
chr2	196753659	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=143,52;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:8,2:0|1:196753659_A_T:196753659:11,10,1,1
chr2	196753666	.	C	CATG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,19;MFRL=151,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:12,0:8,1:0|1:196753659_A_T:196753659:10,10,1,1
chr2	196753669	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=151,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:8,2:0|1:196753659_A_T:196753659:10,10,1,1
chr2	196756535	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=208,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr2	196825238	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=196,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:1,1:2,3,1,1
chr2	196891449	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	196912067	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,11,3
chr2	197010580	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=124,103;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,0:8,3:11,4,2,1
chr2	197010823	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	197021086	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr2	197021141	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=60.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.956:21:0,12:0,8:0,0,13,8
chr2	197021276	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=89.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,14:0,11:0,0,13,12
chr2	197065964	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=79.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,19,4
chr2	197066174	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.346:8:3,0:1,3:0|1:197066174_GT_G:197066174:0,5,0,3
chr2	197066175	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr2	197066176	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=203,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.345:8:3,0:1,3:0|1:197066174_GT_G:197066174:0,5,0,3
chr2	197106759	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=215,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=75.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.889:25:1,10:1,13:2,0,15,8
chr2	197118729	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=120.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,37:0.974:37:0,24:0,13:0,0,8,29
chr2	197122493	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=312,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr2	197122528	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=272,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,2:3,5:5,2,4,3
chr2	197171175	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:7,5:5,1:0|1:197171175_C_T:197171175:9,3,6,0
chr2	197171183	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.332:19:7,5:6,1:0|1:197171175_C_T:197171175:10,3,6,0
chr2	197172816	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,4:7,2:3,8,1,5
chr2	197172856	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=209,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr2	197184267	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=184,72;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:3,1:9,2:6,6,1,2
chr2	197194333	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:15,0:5,3:14,6,0,3
chr2	197208531	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr2	197298222	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:197298222_T_C:197298222:0,0,0,8
chr2	197298232	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=209,242;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,2:1,3:0|1:197298222_T_C:197298222:0,1,0,6
chr2	197504473	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:18,3:6,5:12,12,4,4
chr2	197534692	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	197541296	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=116,62;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:10,1:7,2:0|1:197541296_G_A:197541296:9,8,2,1
chr2	197541314	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=131,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:4,2:0|1:197541296_G_A:197541296:8,9,1,1
chr2	197541316	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=131,62;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:5,2:0|1:197541296_G_A:197541296:8,9,1,1
chr2	197590701	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=132,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:6,0:17,2:0|1:197590701_C_A:197590701:13,13,1,1
chr2	197590707	.	A	AGGC	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=165,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:11,2:0|1:197590701_C_A:197590701:13,7,1,1
chr2	197590710	.	GA	TC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:0|1:197590701_C_A:197590701:13,6,1,1
chr2	197593868	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=185,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr2	197594203	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr2	197595762	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	197664437	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,0:4,3:2,6,1,2
chr2	197664521	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	197744755	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:4,4,1,1
chr2	197777589	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,10,3
chr2	197854233	.	T	TAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=118,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AC;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	197863214	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=205,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,4:1,8:0,3,0,12
chr2	197863668	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,102;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.321:29:11,0:9,9:9,11,0,9
chr2	197863851	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=426,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,2:0,7:0,1,0,9
chr2	197872727	.	T	TTCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=382,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TC;STR;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.820:9:1,5:0,3:0,1,1,7
chr2	197873563	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=220,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	197943382	.	ATG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=197,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.386:16:4,3:5,2:4,6,4,2
chr2	197946392	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=126,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,1:10,1:9,5,1,1
chr2	197948310	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=212,177;MMQ=60,36;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:3,2:6,1:0,9,1,2
chr2	197953372	.	TAAGTC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGTC;STR;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr2	197954780	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,4,8
chr2	197986048	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,10,4
chr2	197990509	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,11,0
chr2	198001443	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,9:0,10:0,0,1,18
chr2	198011904	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr2	198051678	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=262,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr2	198175179	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=206,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	198257652	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=153,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.515:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr2	198265173	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,7:0,4:1,0,2,10
chr2	198266943	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr2	198267243	.	GAA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=230,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:2,1:3,1,2,0
chr2	198267770	.	G	GAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=A;STR;TLOD=68.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,5,14
chr2	198283364	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,0:4,4:2,7,1,3
chr2	198285940	.	AAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=225,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr2	198318758	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=154,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:19,0:9,3:0|1:198318758_G_T:198318758:14,15,0,3
chr2	198318764	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=165,125;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:21,0:9,3:0|1:198318758_G_T:198318758:15,15,0,3
chr2	198359530	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=167,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0|1:198359530_T_C:198359530:1,7,0,2
chr2	198359534	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=167,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0|1:198359530_T_C:198359530:1,7,0,2
chr2	198359537	.	CCTT	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=168,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:1,1:7,1:0|1:198359530_T_C:198359530:1,8,0,2
chr2	198365043	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=80.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,18:0,8:0,0,23,3
chr2	198571340	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=193,48;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:0|1:198571340_G_T:198571340:9,10,1,1
chr2	198571347	.	CT	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=200,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:10,2:0|1:198571340_G_T:198571340:9,12,1,1
chr2	198571349	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=200,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,0:9,2:0|1:198571340_G_T:198571340:9,12,1,1
chr2	198643631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=79,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.593:5:0,2:0,1:0|1:198643631_G_A:198643631:1,1,2,1
chr2	198643651	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=22,34;MFRL=79,83;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.725:8:0,4:1,1:0|1:198643631_G_A:198643631:1,1,3,3
chr2	198646515	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,7:9,0:7,8,7,0
chr2	198669869	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:198669869_G_A:198669869:0,0,1,0
chr2	198669871	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:198669869_G_A:198669869:0,0,1,0
chr2	198670032	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	198951040	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=211,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:198951040_A_C:198951040:0,4,0,1
chr2	198951042	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=211,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0|1:198951040_A_C:198951040:0,4,0,1
chr2	200137304	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=153,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:13,0:5,3:9,9,1,2
chr2	200173684	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=50.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,6,10
chr2	200245245	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	200246318	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr2	200298313	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr2	200800572	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=234,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.459:11:3,1:3,4:6,0,5,0
chr2	200813082	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=147,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.223:28:7,5:15,0:13,9,6,0
chr2	200820505	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=187,270;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,2:5,1:7,1,1,2
chr2	201171014	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=73.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.922:23:0,8:1,14:1,0,11,11
chr2	201171355	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	201194279	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,3:0,2:0,0,1,5
chr2	201254049	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,3,9
chr2	201277011	.	CT	C,CTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31,35;MFRL=228,223,173;MMQ=60,60,60;MPOS=11,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.53,6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.358,0.358:8:2,1,2:0,1,1:2,0,5,1
chr2	201277181	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=204,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:0,9,0,6
chr2	201280996	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.859:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	201337806	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=14,17;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,0:0,0:0,2,0,3
chr2	201371768	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=62.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0,0,6,13
chr2	201397647	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=238,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,3:2,4:2,0,7,0
chr2	201445152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,3:0,3:4,0,4,2
chr2	201459998	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=202,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:11,5,1,1
chr2	201460104	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=197,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,2:4,9,0,2
chr2	201464295	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=180,257;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr2	201470233	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=239,223;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:3,3:0,0:2,2,3,0
chr2	201473674	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0,0,7,8
chr2	201474179	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=160,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,2:4,0:4,6,1,1
chr2	201474234	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	201474237	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr2	201477581	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,137;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr2	201488758	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=268,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:1,2,1,8
chr2	201501568	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=261,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:3,1,2,1
chr2	201505953	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=146,69;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:0,4,2,1
chr2	201515939	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,6:0,7:1,0,1,12
chr2	201521509	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=177,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr2	201521731	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr2	201541626	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:8,6,0,2
chr2	201677454	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=177,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:7,9:3,11:4,6,14,6
chr2	201683695	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=164,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:0,7,0,8
chr2	201686121	.	A	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=274,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201686121_A_AC:201686121:0,2,0,1
chr2	201686122	.	T	C,TGACCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,36,32;MFRL=0,274,88;MMQ=60,60,60;MPOS=28,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.46,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,0:0,2,1:0,0,0,3
chr2	201686124	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=274,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201686121_A_AC:201686121:0,2,0,1
chr2	201686127	.	T	TTGACTTCC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=274,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:201686121_A_AC:201686121:0,2,0,1
chr2	201719258	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.830:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr2	201719916	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=231,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr2	201721782	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,0,3
chr2	201778717	.	T	TAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=17,31;MFRL=192,51013112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.491:4:0,1:0,1:0,2,1,1
chr2	201796248	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=184,168;MMQ=60,21;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr2	201950166	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32,32;MFRL=142,229,125;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.10,4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.180,0.241:14:5,1,2:3,1,1:7,2,5,0
chr2	202013826	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:1,1:10,4:4,7,0,5
chr2	202025131	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=154,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:0,0:3,0,2,0
chr2	202025137	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,22;MFRL=187,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr2	202025375	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:13,5:9,0:6,16,2,3
chr2	202028491	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,5:6,1:8,1,4,2
chr2	202052617	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr2	202070735	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=191,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.581:10:3,1:1,5:0,4,0,6
chr2	202072973	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=189,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr2	202073989	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,0:8,5:10,11,0,5
chr2	202074098	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:13,4:6,1:8,11,3,2
chr2	202139739	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=188,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:4,1:3,2:1,6,0,3
chr2	202151163	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,317;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr2	202151400	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,172;MMQ=44,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr2	202211443	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=212,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr2	202215426	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=103,260;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:2,0:10,3:0|1:202215426_AT_A:202215426:10,4,3,0
chr2	202215428	.	ACTTACTTTGGGG	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=103,260;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:4,0:10,3:0|1:202215426_AT_A:202215426:10,7,3,0
chr2	202245244	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=150,287;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,3:4,1:2,2,3,1
chr2	202245944	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,24,28;MFRL=78,159,97;MMQ=60,60,60;MPOS=30,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,15,18;RU=A;STR;TLOD=5.07,4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.407:7:0,0,2:2,1,0:0,2,2,3
chr2	202245955	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=134,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:2,5,0,2
chr2	202246034	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=207,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,1,4
chr2	202248788	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,276;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:4,2,2,0
chr2	202248979	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,3:3,1:2,9,1,3
chr2	202252478	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=163,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.501:30:5,4:10,11:8,7,9,6
chr2	202254288	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=261,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr2	202257666	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:9,1:11,5,2,0
chr2	202264316	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=200,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr2	202272032	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=248,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr2	202285100	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:6,1,1,3
chr2	202337730	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,181;MMQ=52,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:9,4:10,3:12,7,3,4
chr2	202342737	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=157,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,1:9,1:12,1,1,1
chr2	202342802	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=216,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=60.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:3,11:4,9:5,2,12,8
chr2	202344179	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=274,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=33.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,6:1,8:1,0,8,6
chr2	202352649	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=188,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,0,4
chr2	202402250	.	AAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=25.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,2,4
chr2	202410300	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:6,1,5,0
chr2	202410395	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,1:1,1:0,2,1,2
chr2	202430543	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,4:10,0:8,9,0,4
chr2	202430669	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=207,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr2	202447009	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr2	202469472	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr2	202491995	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr2	202499683	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:3,5:7,5:4,6,6,4
chr2	202501448	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr2	202505545	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=159,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,6:7,8:11,2,11,3
chr2	202505740	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.845:17:2,12:0,3:0,2,0,15
chr2	202507982	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.902:8:0,3:0,3:0,0,4,4
chr2	202523347	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,0:0,4:1,0,0,4
chr2	202528830	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=40.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,4:0,9:0,0,6,9
chr2	202531136	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr2	202546113	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,5,1
chr2	202550645	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,107;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.252:30:15,7:6,0:19,4,7,0
chr2	202566741	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr2	202569992	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,3:0,10:0,0,6,7
chr2	202570232	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,3,9
chr2	202571651	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:2,7,1,1
chr2	202572806	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=218,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	202574825	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr2	202575907	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	202580370	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,8:0,2:0,0,7,3
chr2	202606639	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	202626528	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=143,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,2:10,0:8,10,0,2
chr2	202626566	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:2,2:3,0:1,8,0,3
chr2	202688293	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr2	202712095	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr2	202736953	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=144,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,1:2,1:10,3,0,2
chr2	202737075	.	TTTAAGGGA	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:8,4:3,0:0|1:202737075_TTTAAGGGA_T:202737075:4,7,0,4
chr2	202737085	.	CTTT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,4:3,0:0|1:202737075_TTTAAGGGA_T:202737075:4,6,0,4
chr2	202901910	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=121,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,2:8,3:8,6,2,3
chr2	202902385	.	TAA	T,TA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=24,22,24;MFRL=131,166,157;MMQ=60,60,60;MPOS=13,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=5.77,12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,3,8:0.120,0.283:29:11,0,5:4,2,3:14,4,8,3
chr2	202902870	.	ATTAAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,133;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,1:5,4,3,0
chr2	202939836	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,1:7,1:6,9,1,1
chr2	202955454	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=237,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:2,1,6,1
chr2	202962310	.	CTTTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=19,35;MFRL=148,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,1:1,1:1,8,0,2
chr2	202962335	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:4,0:0|1:202962335_C_T:202962335:0,11,0,2
chr2	202962337	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=172,148;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:202962335_C_T:202962335:0,11,0,2
chr2	202962358	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=165,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr2	202964517	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:0,5,1,3
chr2	202964528	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=246,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	202964986	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:5,0,6,0
chr2	202965222	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr2	202979369	.	G	GACA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.763:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	202979615	.	T	TTGAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=216,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TGAA;STR;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:2,3,2,0
chr2	202979791	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=188,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,0:5,3:0,9,0,3
chr2	203003066	.	GGT	G,GGTGTGT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32,32;MFRL=85,186,180;MMQ=60,60,60;MPOS=15,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,6,9;RU=GT;STR;TLOD=4.65,29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,8:0.199,0.601:12:0,2,4:2,0,3:2,0,7,3
chr2	203003085	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=65,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:10,1:3,1:8,5,1,1
chr2	203029951	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr2	203051886	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr2	203079025	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,23;MFRL=124,254;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.338:16:3,3:7,2:8,3,5,0
chr2	203103035	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,36;MFRL=268,247;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,1:1,0:0|1:203103035_A_C:203103035:1,1,1,0
chr2	203103038	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,12;MFRL=268,247;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.402:3:0,0:1,0:0|1:203103035_A_C:203103035:1,1,1,0
chr2	203139738	.	A	AC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.773:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	203142654	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=224,113;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr2	203152410	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=129,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,2:8,0:9,10,0,2
chr2	203160626	.	T	TTTA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.318:5:2,0:1,1:0|1:203160626_T_TTTA:203160626:1,3,0,1
chr2	203160629	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.318:5:2,0:1,1:0|1:203160626_T_TTTA:203160626:1,3,0,1
chr2	203168235	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:3,9,0,2
chr2	203379604	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=166,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:8,3,0,2
chr2	203384776	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr2	203589804	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	203630102	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=117,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.518:8:2,3:2,1:3,1,4,0
chr2	203653587	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:1,8:8,1:6,3,7,2
chr2	203680554	.	TAA	T,TAAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25,27;MFRL=0,180,163;MMQ=60,60,60;MPOS=30,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,15;RU=A;STR;TLOD=3.34,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.410,0.404:2:0,0,1:0,1,0:0,0,2,0
chr2	203690387	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	203693559	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=119,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,1:0,9:1,0,7,3
chr2	203748544	.	A	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr2	203834829	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:1,0:4,2:0|1:203834829_T_TA:203834829:1,6,1,1
chr2	203834831	.	A	ATC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:2,0:5,2:0|1:203834829_T_TA:203834829:1,6,1,1
chr2	203834833	.	T	TAAAAGATGGGCTGAATGAACC	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=153,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.268:9:1,0:5,1:0|1:203834829_T_TA:203834829:1,6,1,1
chr2	203880992	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=216,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr2	203921270	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,9,13
chr2	203942441	.	CTTAT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTAT;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:7,2:9,2,3,0
chr2	203964456	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=134,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.378:9:4,0:1,3:1,5,1,2
chr2	203991488	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:2,2,4,2
chr2	203996635	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr2	203996870	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr2	203997912	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,3:3,4:6,6,2,5
chr2	204002809	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	204009437	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=220,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:3,2,2,0
chr2	204022457	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr2	204062061	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,10:0,4:0,0,7,7
chr2	204103895	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=206,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:4,2:3,0:0,7,1,2
chr2	204111394	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,4:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,6,0
chr2	204111398	.	GTTAA	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:204111394_T_C:204111394:0,0,6,0
chr2	204111443	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,7,1
chr2	204111705	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr2	204116660	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=85,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:6,0,4,0
chr2	204116690	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,12,2
chr2	204116887	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	204143508	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204143508_T_A:204143508:0,0,0,1
chr2	204143512	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:204143508_T_A:204143508:0,0,0,1
chr2	204154686	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr2	204304307	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,169;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:5,0:15,4:10,10,0,4
chr2	204305009	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=142,278;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,1:9,1:10,8,2,0
chr2	204305087	.	AGGT	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=152,260;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GGT;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:6,0:11,6,1,1
chr2	204305093	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:7,5:1,6:6,2,6,5
chr2	204305330	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:7,4,0,2
chr2	204322298	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,1:3,1:7,7,1,1
chr2	204324635	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=180,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.122:30:15,3:12,0:13,14,2,1
chr2	204326558	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=154,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,5:11,0:12,8,6,0
chr2	204594512	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:3,3:6,2:2,7,2,3
chr2	204732850	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr2	204736141	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:7,8:14,0:16,5,8,0
chr2	204821494	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.451:18:7,4:3,4:3,7,1,7
chr2	204824178	.	AGT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GT;STR;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr2	204824200	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=127,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr2	204824324	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=123,124;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:9,4:6,2:6,9,3,3
chr2	205912210	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=211,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr2	205978114	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	205986321	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=218,192;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:3,3,2,1
chr2	206036918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,6,2
chr2	206041337	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.215:17:6,1:4,2:1,13,1,2
chr2	206041366	.	TAA	T,TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=15,16,24;MFRL=223,195,138;MMQ=60,60,60;MPOS=26,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.54,3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.393,0.373:6:0,1,0:0,0,1:0,1,0,5
chr2	206364791	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:2,5,2,5
chr2	206418032	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=56.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,8,11
chr2	206480393	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,231;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,2:11,3:10,7,4,1
chr2	206480593	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,2:6,0:0|1:206480593_GC_G:206480593:2,12,0,2
chr2	206480597	.	TTTCTAAA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:206480593_GC_G:206480593:2,14,0,2
chr2	206562250	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=75.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,20,5
chr2	206590879	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=206,285;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr2	206592534	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr2	206614646	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=61.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr2	206628658	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:0|1:206628658_C_T:206628658:5,12,1,1
chr2	206628666	.	G	GTGAATA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=186,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:206628658_C_T:206628658:5,13,1,1
chr2	206884595	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=101,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.295:12:5,0:4,3:3,6,0,3
chr2	206911191	.	C	CA,CAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,32,32;MFRL=220,147,111;MMQ=60,60,60;MPOS=15,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=12.34,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,2:0.597,0.258:9:1,2,2:0,4,0:1,0,8,0
chr2	206911228	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=244,138;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.595:23:4,4:5,8:6,3,10,4
chr2	206995010	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=237,342;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr2	207006716	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,0:5,2:9,5,1,1
chr2	207006730	.	A	AGTAGCCTAATAGGC	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=151,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:8,5,1,1
chr2	207024886	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr2	207025444	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,1:5,14,1,2
chr2	207027407	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=128,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:5,2:10,1:9,7,3,1
chr2	207413181	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=269,161;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr2	207451965	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,242;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,1:4,2:7,1,2,1
chr2	207452151	.	GT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr2	207527648	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:6,2,2,0
chr2	207527840	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:12,4:1,2:6,7,3,3
chr2	207564692	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=238,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:6,3,0,2
chr2	207569715	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr2	207582852	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,2:4,0:7,0,2,0
chr2	207604427	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr2	207605882	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:3,5,1,4
chr2	207610909	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr2	207610948	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=123,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr2	207613690	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	207613980	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=399,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr2	207625567	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,1:5,2:6,1,2,1
chr2	207629904	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.445:34:7,8:12,7:14,5,12,3
chr2	207630012	.	G	C	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=148,100;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:23,0:24,5:28,19,0,5
chr2	207630093	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,4:9,2:0,17,0,6
chr2	207653474	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=216,0;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr2	207653653	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,200;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:0,7,0,5
chr2	207656613	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=281,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr2	207824548	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=241,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:0,4,1,8
chr2	207825656	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=93,193;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,4:1,4:3,4,4,4
chr2	207833848	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=262,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr2	208576731	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:4,3:8,9:11,1,5,7
chr2	208602105	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:10,2:3,5:6,7,4,3
chr2	208605479	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,16;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,0:6,0:0|1:208605479_T_G:208605479:4,10,2,0
chr2	208605482	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=104,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:4,0:0|1:208605479_T_G:208605479:4,10,2,0
chr2	208605489	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=114,114;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:3,0:3,6,2,1
chr2	208606875	.	CAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=245,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.330:4:1,1:1,0:2,1,1,0
chr2	208632340	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=185,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:9,4,2,0
chr2	208693261	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=201,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:1,4,1,1
chr2	208811284	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	208986385	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,4:7,2:5,6,4,2
chr2	209025664	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,0:5,9:6,7,0,9
chr2	209027871	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=226,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr2	209028421	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,37;MFRL=198,229;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr2	209035658	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,10:0,0:0,0,6,4
chr2	209035849	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr2	209036605	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr2	209049830	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=265,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.650:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr2	209051586	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:5,1,2,1
chr2	209101905	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	209163556	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:1,1,0,3
chr2	209168853	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	209169716	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=170,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:14,2:0|1:209169716_C_T:209169716:16,10,0,2
chr2	209169722	.	C	CCCTGCCCCCTAATTCCTAGCCCACAT	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=175,107;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.089:31:13,0:14,2:0|1:209169716_C_T:209169716:18,11,0,2
chr2	209184999	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,6:5,3:4,5,4,5
chr2	209189912	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=220,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:3,1,6,1
chr2	209194696	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	209195491	.	G	GAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=208,269;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.670:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr2	209199945	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr2	209201528	.	CAT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AT;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.170:21:7,2:9,1:12,6,2,1
chr2	209201590	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,2:9,0:15,9,2,0
chr2	209201739	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr2	209203122	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	209204714	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=142,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,4:6,4:10,6,3,5
chr2	209209997	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	209215448	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,1:1,5:2,1,6,0
chr2	209219190	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	209292981	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=188,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:6,0:4,5,1,1
chr2	209315573	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:5,8:1,3:1,5,2,9
chr2	209345944	.	CTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,37,20;MFRL=134,209,170;MMQ=41,40,48;MPOS=17,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,12,16;RU=T;STR;TLOD=3.09,3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,3:0.230,0.572:5:0,0,0:0,1,2:0,1,0,4
chr2	209353656	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=210,215;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.758:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr2	210594540	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr2	210594622	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=199,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,0:8,3:4,10,0,3
chr2	210594717	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr2	210594768	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,3,3
chr2	210683750	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=154,37;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,0:7,4:0|1:210683750_C_T:210683750:4,7,5,0
chr2	210683760	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=159,37;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.285:19:5,0:9,5:0|1:210683750_C_T:210683750:5,9,5,0
chr2	210690608	.	TC	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,89;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	210745681	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr2	210786137	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	210810528	.	AA	TG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:5,1,2,0
chr2	210824471	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=176,126;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,0:12,2:3,15,0,2
chr2	210834640	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:7,2:4,1:4,7,2,1
chr2	210880893	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=77.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,26:0.887:29:1,13:1,12:2,1,9,17
chr2	210889759	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr2	211069438	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,3,10
chr2	211070619	.	C	CAAAAACCCCTGCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=234,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.486:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr2	211163063	.	TAC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=AC;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr2	211168202	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=187,253;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,1:8,1:6,2,2,0
chr2	211168346	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=139,229;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,0:4,5:3,3,1,4
chr2	211319824	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,1:4,4:6,1,3,2
chr2	211319847	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=154,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:3,0:13,3:11,5,3,0
chr2	211319943	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:6,1:16,1:12,10,2,0
chr2	211320041	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=191,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:2,1:0,3,0,2
chr2	211341156	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=190,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.681:20:3,9:3,5:2,4,5,9
chr2	211341204	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr2	211342502	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=283,152;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.702:25:4,6:3,11:2,5,8,10
chr2	211421452	.	A	ATCT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=110,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,3:4,5:3,8,4,5
chr2	211481257	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,239;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,4:1,5:2,2,3,6
chr2	211513118	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr2	211514995	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=189,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr2	211515058	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=259,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,5:6,6:6,3,5,6
chr2	211521227	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31,33,32;MFRL=80,157,161,205;MMQ=60,60,60,60;MPOS=24,21,23;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.98,4.93,8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,3,3,5:0.204,0.249,0.364:13:0,1,2,1:2,2,1,3:2,0,10,1
chr2	211521270	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=157,266;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:8,0:17,2,2,0
chr2	211523457	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr2	211527827	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=161,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.693:8:0,3:2,3:1,1,5,1
chr2	211533070	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	212252809	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=190,68;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	212285103	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=137,359;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	212295875	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=177,256;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr2	212488870	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	212495377	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=219,139;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr2	212530240	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,77;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr2	212543691	.	CAAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=330,110;MMQ=40,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=25,22;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.504:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	212543924	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:2,4,3,3
chr2	212569983	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=163,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr2	212578379	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.603:10:3,2:1,3:0,4,0,6
chr2	212589986	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=255,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:1,6,0,2
chr2	212615516	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=259,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,0,3
chr2	213403091	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr2	213872836	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.201:17:3,1:6,2:2,12,1,2
chr2	213872853	.	TACA	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=182,116;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACA;STR;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.505:16:2,2:4,6:2,6,0,8
chr2	213872868	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,2:4,5:1,4,0,7
chr2	213914343	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	214012403	.	CAA	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=A;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:5,0:5,2:8,3,2,0
chr2	214012405	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,16,3
chr2	214012446	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=146,80;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:18,0:13,3:21,10,2,1
chr2	214012508	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=146,184;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:2,17,1,2
chr2	214162120	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=133,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:8,2:9,1:4,13,1,2
chr2	214174767	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:4,1,2,3
chr2	214182100	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr2	214228959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr2	214727150	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=218,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:8,1,2,0
chr2	214727221	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=214,130;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.316:14:4,1:5,3:5,5,1,3
chr2	214727367	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=215,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:1,8,0,3
chr2	215013801	.	GTA	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=TA;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	215593522	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=170,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,2:8,3:13,5,2,3
chr2	215617335	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=212,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr2	215632124	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,25;MFRL=207,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr2	215632155	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr2	215632192	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=28,33;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr2	215632255	.	CA	TG	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=33,30;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,6:2,10:3,1,5,11
chr2	215632256	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.953:20:0,8:0,12:0,0,8,12
chr2	215634055	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:0,3:5,7:0,5,3,7
chr2	215661716	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,1:5,1:7,3,2,0
chr2	215661933	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	215674090	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:4,4:3,2:4,4,5,1
chr2	215674323	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	215797332	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.492:12:2,2:4,3:4,2,5,1
chr2	215809768	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=147,115;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,0:8,3:13,6,0,3
chr2	215809798	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=146,115;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:7,5,0,3
chr2	215809847	.	C	CAAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=149,281;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,9;RU=A;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:3,8,0,2
chr2	215812297	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=199,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:2,3,0,2
chr2	215812360	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=180,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.617:14:2,0:3,7:0,5,0,9
chr2	215813919	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr2	215819853	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:8,0,4,0
chr2	215821549	.	CAA	C,CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33,32;MFRL=186,211,233;MMQ=60,60,60;MPOS=8,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.04,5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.308,0.346:9:0,1,2:2,2,1:0,3,0,6
chr2	215833415	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,2:3,7:4,1,6,3
chr2	215833622	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=274,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr2	215840829	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=279,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr2	215851246	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,6:0,5:0,0,8,3
chr2	215851303	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=171,129;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:2,2:4,8:5,2,7,3
chr2	215855780	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:4,7:7,4:4,7,2,9
chr2	215862383	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:0,9:5,8:4,1,15,3
chr2	215862542	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.453:18:8,0:2,8:2,8,0,8
chr2	215862633	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr2	215865575	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=132,216;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:16,2:10,1:16,11,2,1
chr2	215874965	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	215875251	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr2	215876603	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=18,23;MFRL=292,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:0,1:0|1:215876603_C_A:215876603:2,1,1,0
chr2	215876607	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=23,15;MFRL=285,131;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:215876603_C_A:215876603:2,2,1,0
chr2	215876610	.	CT	AA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=24,15;MFRL=278,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:1,0:0|1:215876603_C_A:215876603:3,2,1,0
chr2	215883988	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	215890312	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	215890324	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=262,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr2	215890352	.	GTT	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	215891471	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr2	215901592	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=294,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,4:0,2:3,0,6,0
chr2	215928972	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,5:3,2:1,3,2,5
chr2	215929028	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr2	215976231	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr2	216182769	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr2	216190654	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	216190691	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	216191515	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,3:2,2:2,0,2,3
chr2	216197971	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=225,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:10,0,2,0
chr2	216198049	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=98,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:9,4,1,2
chr2	216200907	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,1:8,3:3,12,0,4
chr2	216209472	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,4:9,3,7,2
chr2	216211712	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,1,13
chr2	216226336	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=106,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:8,2:11,0:10,9,3,0
chr2	216226642	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=158,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:0,3:7,3:6,1,6,0
chr2	216229671	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=174,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:4,4,2,2
chr2	216229692	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=230,210;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:4,2,0,2
chr2	216232556	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,4:2,1:3,2,4,1
chr2	216240126	.	AAC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:2,3:5,1:1,6,0,4
chr2	216243832	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,9:0,7:0,0,13,3
chr2	216247962	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=168,90;MMQ=60,37;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr2	216248305	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr2	216248707	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	216249587	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=122,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.624:22:3,9:5,5:4,4,7,7
chr2	216251316	.	TTG	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,15;MFRL=157,437;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:216251316_TTG_T:216251316:1,0,1,0
chr2	216251320	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=157,437;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:216251316_TTG_T:216251316:1,0,1,0
chr2	216251323	.	CT	GG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,16;MFRL=157,437;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:216251316_TTG_T:216251316:1,0,1,0
chr2	216251697	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=95,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.356:20:6,2:7,4:8,5,4,3
chr2	216253039	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:2,8,0,3
chr2	216256615	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:0,2,0,9
chr2	216262302	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=296,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	216262621	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:1,5:0,3:0,1,0,8
chr2	216263926	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr2	216263938	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,1:0,5:0,0,3,3
chr2	216269028	.	TTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=324,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr2	216272819	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr2	216272900	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0|1:216272900_T_G:216272900:0,0,4,5
chr2	216272907	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.747:10:0,4:2,2:0|1:216272900_T_G:216272900:1,1,3,5
chr2	216274853	.	AAC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=244,114;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.620:11:1,3:3,4:0,4,1,6
chr2	216283958	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,118;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,3:4,1:7,3,2,2
chr2	216295337	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:7,0,4,0
chr2	216295520	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=164,61;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:9,2:0|1:216295520_C_T:216295520:10,10,1,1
chr2	216295527	.	T	TCCC	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=170,61;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=C;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:216295520_C_T:216295520:8,10,1,1
chr2	216295531	.	C	CCTTAAAATTCA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=175,61;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0|1:216295520_C_T:216295520:7,10,1,1
chr2	216295533	.	A	AGT	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=175,61;MMQ=60,57;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:9,1:0|1:216295520_C_T:216295520:7,10,1,1
chr2	216298230	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=119,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:0,3,1,5
chr2	216299550	.	GC	AA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=97,167;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.684:17:2,5:3,7:0,5,5,7
chr2	216299571	.	T	TTAC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAC;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0,0,2,5
chr2	216299629	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr2	216300482	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	216810468	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:2,4,0,2
chr2	216811707	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,5:2,5:2,2,9,1
chr2	216861043	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=139,64;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:7,0:11,3:0|1:216861043_C_A:216861043:9,9,1,2
chr2	216861049	.	G	GCA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=150,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:0|1:216861043_C_A:216861043:8,9,1,1
chr2	216861273	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	216904016	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=140,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:2,5,1,4
chr2	216990772	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=214,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:2,6,0,2
chr2	217001834	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,210;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.135:35:17,4:14,0:20,11,4,0
chr2	217012887	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,1:11,1:8,16,2,0
chr2	217012901	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,13:0,13:0,0,7,19
chr2	217059809	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=263,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr2	217069151	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=103,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,3:3,5:3,1,2,6
chr2	217123958	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	217142311	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr2	217148546	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	217234580	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=159,70;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:5,3:10,0:5,11,1,2
chr2	217280261	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=208,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.621:6:0,1:1,2:0,2,0,4
chr2	217281150	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=252,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=C;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr2	217342000	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr2	217498311	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	217541582	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=112.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,32:0.971:32:0,19:0,13:0,0,17,15
chr2	217724544	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=270,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:4,5,1,1
chr2	218672891	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=176,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.373:11:4,1:2,0:1,6,4,0
chr2	218675144	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	218679599	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=146,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.712:12:1,5:2,3:3,0,5,4
chr2	218694510	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=51.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,7,5
chr2	218694512	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:218694510_CT_C:218694510:0,0,7,5
chr2	218694551	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=141,209;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,4:6,3:9,3,5,2
chr2	218694675	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=188,270;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.310:5:2,1:2,0:0|1:218694675_G_A:218694675:0,4,0,1
chr2	218694691	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=209,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.264:6:1,1:4,0:0|1:218694675_G_A:218694675:0,5,0,1
chr2	218694962	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	218745685	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=282,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,6:1,10:2,0,8,8
chr2	218750453	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:2,0:8,2:7,3,2,0
chr2	218758123	.	GCA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=144,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=CA;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:1,0:2,2,2,0
chr2	218938244	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=251,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,2:7,0:1,10,0,2
chr2	218940344	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,74;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr2	218941095	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=187,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:13,0:6,2:12,7,1,1
chr2	218999467	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=143,260;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	219000992	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=19,31;MFRL=161,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:1,1:1,1:1,8,0,3
chr2	219082119	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,5:0,13:0,0,13,6
chr2	219082330	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr2	219103313	.	CTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,130;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=22,19;RU=T;STR;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.846:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	219103580	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=33.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr2	219114671	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,106;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,1:2,6,1,3
chr2	219127350	.	CAGGAGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	219142023	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,10,2
chr2	219142492	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr2	219142773	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	219146803	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,18,8
chr2	219187901	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	219206919	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr2	219209393	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr2	219221982	.	G	GTC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,13;MFRL=164,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=TC;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.430:5:2,0:0,0:0,3,0,2
chr2	219232247	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,86;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:13,4:8,0:9,12,2,2
chr2	219232354	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr2	219257688	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,6,2
chr2	219266518	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=144,226;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr2	219267705	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,32;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.560:5:0,1:1,2:0|1:219267705_CA_C:219267705:1,1,3,0
chr2	219267711	.	CACACTG	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=33,12;MFRL=184,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:0,0:2,1:2,1,3,0
chr2	219267721	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=193,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.347:9:0,0:4,0:0|1:219267705_CA_C:219267705:4,2,3,0
chr2	219267724	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,10;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,0:6,0:0|1:219267705_CA_C:219267705:4,2,2,0
chr2	219267730	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,20;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:0,0:6,1:0|1:219267705_CA_C:219267705:4,3,2,0
chr2	219267901	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:8,3:3,3:3,8,5,2
chr2	219267913	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,7:5,2:6,5,4,6
chr2	219288899	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=129,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	219296545	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=104,275;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:7,3:5,6,3,1
chr2	219305404	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=233,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.728:13:1,3:2,5:0,3,6,4
chr2	219313852	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=170,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr2	219320207	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=315,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr2	219339283	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=242,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,5,0
chr2	219350358	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=24,25;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.657:4:0,1:1,0:1,0,2,1
chr2	219353195	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=211,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr2	219362396	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=136,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:6,1,0,2
chr2	219433597	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=219,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=55.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.777:25:0,9:4,10:4,1,17,3
chr2	219447612	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=231,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	219452372	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,135;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.262:25:9,0:9,6:8,11,0,6
chr2	219480804	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:0,4:2,1:0,2,1,5
chr2	219487299	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	219498759	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=207,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr2	219501133	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=178,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:3,2,3,2
chr2	219501328	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=195,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:4,4,2,6
chr2	219507979	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,213;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,2:13,3:10,10,4,1
chr2	219508372	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=122,271;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,4:6,5:2,7,6,3
chr2	219527005	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=166,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,1:10,1:3,12,0,2
chr2	219529348	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=238,289;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,1,1
chr2	219530032	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	219530674	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=21.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.255:41:18,0:13,10:9,22,0,10
chr2	219532903	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:2,4:8,4:0|1:219532903_C_T:219532903:4,6,4,4
chr2	219532905	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=152,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=27.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:1,3:8,3:0|1:219532903_C_T:219532903:4,6,4,4
chr2	219533438	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=120,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr2	219537586	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.262:37:13,9:14,0:13,15,9,0
chr2	219540243	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=15,19;MFRL=186,139;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr2	219541056	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=197,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr2	219544058	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr2	219544388	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=220,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:8,1:3,6:4,7,4,3
chr2	219545309	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=212,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:3,7:2,3:4,1,8,2
chr2	219553468	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=187,110;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,17:0.449:38:13,7:8,10:10,11,10,7
chr2	219563602	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:9,3:6,3:6,9,2,4
chr2	219609762	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=222,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr2	219609776	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=176,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.827:15:1,9:1,4:2,0,11,2
chr2	219609995	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=221,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.791:12:0,4:2,6:0,2,0,10
chr2	219610322	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr2	219612282	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=135,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,7:1,4:2,1,9,2
chr2	219612401	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,13;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,0:0|1:219612401_G_A:219612401:8,11,1,1
chr2	219612417	.	T	TCACAGTATAATGTAAAGTC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=149,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.118:23:11,2:10,0:0|1:219612401_G_A:219612401:10,11,1,1
chr2	219612843	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,85;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:10,14,0,2
chr2	219618237	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr2	219618497	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=215,287;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,7:1,6:0,2,0,13
chr2	219619166	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr2	219691566	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	219692527	.	G	GC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=62.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,6:0,13:0,0,9,10
chr2	219692790	.	A	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,10:0,0,6,9
chr2	219694615	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	219696014	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=167,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.916:14:0,5:0,8:0,1,9,4
chr2	219826149	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=108,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:21,4:14,0:15,20,4,0
chr2	219826934	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=216,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:0,10,0,4
chr2	219870111	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=163,93;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,4:5,0:8,2,4,0
chr2	219883883	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=178,97;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,1:10,1:6,9,0,2
chr2	219886552	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,71;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,2:4,0:9,3,1,1
chr2	219895514	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=192,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:8,3:5,1:9,4,0,4
chr2	219896008	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,92;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:5,0:8,3:6,8,0,3
chr2	219896333	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:7,2:6,4:4,9,0,6
chr2	219903723	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,106;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:4,1,5,2
chr2	219903787	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:0,4:5,4:1,5,0,9
chr2	219905304	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=141,125;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:14,7:9,0:12,11,7,0
chr2	219922073	.	G	GC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220011568	.	C	CA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220011568_C_CA:220011568:0,0,0,1
chr2	220011571	.	C	CCTTTGTATGACCTA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:220011568_C_CA:220011568:0,0,0,1
chr2	220012576	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=202,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr2	220022176	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,11:0,0,12,6
chr2	220022435	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,3:2,3:2,7,1,5
chr2	220029887	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,0:2,3:5,4,2,1
chr2	220032740	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=109,124;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,25:0.419:60:15,0:18,24:6,29,0,25
chr2	220033956	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,5:2,5:4,0,9,1
chr2	220034497	.	C	CCA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=271,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=45.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:2,4:1,9:1,2,9,5
chr2	220039506	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,3:6,0:9,0,2,1
chr2	220040216	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=182,186;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.664:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr2	220040330	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=119,179;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.255:41:14,6:17,4:10,21,3,7
chr2	220041433	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:7,0,3,0
chr2	220041455	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,6:0,0,10,4
chr2	220045035	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=218,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,3:0,7:1,0,1,9
chr2	220046349	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=245,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:3,8:1,9:1,3,9,8
chr2	220047393	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:0,3,0,5
chr2	220071803	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=211,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,2:1,9:0,2,2,9
chr2	220071879	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=222,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr2	220072766	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=84.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,15:0,0,10,17
chr2	220072852	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=114,202;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:3,10:9,6:4,8,8,8
chr2	220073118	.	TG	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=168,168;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,0:13,2:19,13,0,2
chr2	220078496	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0,0,10,8
chr2	220079710	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=178,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:11,2:4,1:8,7,2,1
chr2	220082365	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=148,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.403:14:5,0:4,5:5,4,2,3
chr2	220083453	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:2,1:0,1:0,3,0,2
chr2	220085056	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr2	220085845	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,13,12
chr2	220087075	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:6,3:12,0:9,9,0,3
chr2	220087354	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=197,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.350:21:3,3:10,4:8,6,5,2
chr2	220088248	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr2	220089590	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,16;MFRL=190,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:0,0:0,2,0,4
chr2	220096809	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=40.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:4,0:10,16:3,11,0,16
chr2	220100683	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=205,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,1:9,5:6,8,4,2
chr2	220100922	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=231,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:4,3,2,2
chr2	220101222	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=202,59;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	220101974	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,4:6,3:6,6,3,4
chr2	220102932	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,90;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,3:10,0:14,7,3,0
chr2	220107938	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=146,112;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:10,0:14,2:12,12,0,4
chr2	220112957	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.170:39:18,0:15,6:17,16,1,5
chr2	220115222	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,125;MMQ=60,44;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,8:0.195:44:18,0:18,8:24,12,0,8
chr2	220118672	.	CG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=122,222;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.457:14:4,3:1,1:5,3,0,6
chr2	220145286	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.560:30:7,10:6,6:9,4,10,7
chr2	220146402	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:0,3:5,5:4,1,5,3
chr2	220146609	.	C	CG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,2:5,3,4,0
chr2	220146651	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=177,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,3:8,1:11,1,4,0
chr2	220147595	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=121,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,8:0.236:35:15,7:12,0:16,11,8,0
chr2	220147732	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:7,5:4,5:3,8,6,4
chr2	220161306	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,1:3,3:4,3,1,3
chr2	220173703	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=86,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:7,6,0,2
chr2	220194247	.	A	AATT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=232,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr2	220195446	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:3,1:1,3:3,1,4,1
chr2	220197207	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.337:7:4,0:0,2:4,1,2,0
chr2	220197835	.	ATAATATTATATATTAT	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=120,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:9,5:10,4:21,2,7,4
chr2	220197929	.	CTTTTT	C,CTTT	.	.	DP=93;ECNT=2;MBQ=32,27,20;MFRL=0,115,195;MMQ=60,60,60;MPOS=19,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,15,18;RU=T;STR;TLOD=5.62,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,3:0.120,0.225:14:3,1,2:5,1,0:7,2,0,5
chr2	220239534	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,7,5
chr2	220239561	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr2	220239828	.	G	GT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=174,356;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220239828_G_GT:220239828:0,1,0,1
chr2	220239830	.	G	GTGGCTCACAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=174,356;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:220239828_G_GT:220239828:0,1,0,1
chr2	220246218	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,8,6
chr2	220250322	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=59.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,5:0,12:0,0,13,8
chr2	220250826	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,2,13
chr2	220250897	.	AG	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr2	220251178	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr2	220251208	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,223;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr2	220251528	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=177,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,0:4,8,6,0
chr2	220251592	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.390:13:2,0:6,0:0|1:220251592_A_C:220251592:0,8,5,0
chr2	220251598	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,12;MFRL=210,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.390:13:2,0:6,0:0|1:220251592_A_C:220251592:0,8,5,0
chr2	220251603	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=28,12;MFRL=204,160;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,0:5,1:0|1:220251592_A_C:220251592:0,7,3,0
chr2	220264543	.	C	CAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,9:0,6:0,0,14,1
chr2	220283826	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,346;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	220284717	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220284779	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=163,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.571:21:3,4:5,8:4,5,3,9
chr2	220285309	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=176,147;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,9:6,0:4,4,5,4
chr2	220306413	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=122,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:0,1:4,2:1,3,0,3
chr2	220316579	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr2	220327142	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,1:3,4:1,6,0,5
chr2	220329106	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=286,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr2	220330642	.	TGTGCGCGC	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,370;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0|1:220330642_TGTGCGCGC_T:220330642:0,0,1,0
chr2	220330657	.	GTGCA	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,370;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.689:1:0,1:0,0:0|1:220330642_TGTGCGCGC_T:220330642:0,0,1,0
chr2	220331851	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	220336517	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr2	220336723	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=332,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,0,2
chr2	220341935	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:220341935_A_AG:220341935:0,0,2,0
chr2	220341938	.	C	CGGGGCCTGGTACAGCGGCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.748:2:0,1:0,1:0|1:220341935_A_AG:220341935:0,0,2,0
chr2	220353104	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=153,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:2,3:1,3:0,3,4,2
chr2	220353217	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=184,87;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:6,0:2,2:4,4,2,0
chr2	220353440	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=197,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:2,2,2,0
chr2	220353532	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=145,255;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.288:11:4,0:4,2:3,5,1,2
chr2	220356806	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr2	220361265	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr2	220361435	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,283;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr2	220361486	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=202,248;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr2	220366824	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=231,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,2:3,1:0,10,0,3
chr2	220370255	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=194,66;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:4,9,2,0
chr2	220371181	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr2	220379175	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=148,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,2:2,6:2,4,4,4
chr2	220402099	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:220402099_G_A:220402099:2,1,0,1
chr2	220402106	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:220402099_G_A:220402099:2,1,0,1
chr2	220402624	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=171,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:6,3,1,2
chr2	220404648	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=141,222;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.237:22:5,1:12,2:11,6,1,4
chr2	220406239	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr2	220412889	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,462;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	220415646	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=169,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr2	220416164	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	220416570	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220416591	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	220416803	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,3:0,10:0,0,8,5
chr2	220416967	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:1,3:0,4:1,0,2,7
chr2	220418334	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,5:8,2:7,8,2,5
chr2	220421417	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=353,152;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,22:0.921:23:0,14:1,8:0,1,13,9
chr2	220422400	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=166,326;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	220424160	.	CCAAGGTCACGGCGAT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.352:24:8,2:5,6:10,6,4,4
chr2	220427996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	220428381	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=154,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr2	220430093	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,66;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:4,9,1,1
chr2	220431919	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr2	220432630	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=171,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:9,0:14,4:12,11,2,2
chr2	220432709	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:7,6:7,4:4,10,6,4
chr2	220462814	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=177,204;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.230:28:10,0:7,1:6,15,7,0
chr2	220466344	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.847:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr2	220471116	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=51.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,9:0,0,5,10
chr2	220471716	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=224,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:8,6,1,1
chr2	220476645	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	220479055	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=136,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:8,2:1,10,1,2
chr2	220480520	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=180,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:220480520_C_CT:220480520:4,13,1,1
chr2	220480522	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=180,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:7,0:0|1:220480520_C_CT:220480520:4,13,1,1
chr2	220480523	.	G	GTCT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,20;MFRL=180,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:220480520_C_CT:220480520:4,13,1,1
chr2	220480693	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,292;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	220494118	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,10:0,2:0,0,8,5
chr2	220500321	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=208,270;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:3,1,1,1
chr2	220502367	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=256,166;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,9:1,5:1,0,4,10
chr2	220505421	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:2,2:6,1:5,4,0,3
chr2	220505752	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr2	222301357	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=213,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:1,5:2,7:0,3,0,12
chr2	222301713	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=241,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:2,0,8,0
chr2	222301912	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr2	222301960	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr2	222307534	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=122,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:5,2,4,3
chr2	222307778	.	CAAGATGA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=198,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,2:0,0:0,2,1,1
chr2	222307831	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=158,213;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:222307831_T_C:222307831:0,2,0,1
chr2	222307834	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:222307831_T_C:222307831:0,2,0,1
chr2	222320427	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=124,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:3,9:2,2:1,5,2,9
chr2	222365893	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,140;MMQ=60,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:15,0:6,3:7,14,0,4
chr2	222429106	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=139,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:12,0:4,7:4,12,0,7
chr2	222436870	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:11,4,1,1
chr2	223065870	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=149,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:10,5:10,3:12,9,5,3
chr2	223066017	.	AC	A,CC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,25,12;MFRL=204,152,266;MMQ=60,60,60;MPOS=13,23;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.47,9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,4:0.159,0.248:16:6,2,0:4,0,0:0,10,4,2
chr2	223066029	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=179,289;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,0:6,0:0|1:223066029_A_C:223066029:3,12,3,0
chr2	223066036	.	TA	GT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=188,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:8,0:7,0:0|1:223066029_A_C:223066029:7,9,3,0
chr2	223066919	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:9,3:7,6:4,12,2,7
chr2	223085886	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=160,94;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,4:4,0:6,1,4,0
chr2	223085955	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=102,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,6:4,1:3,4,3,4
chr2	223096709	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr2	223158424	.	ACT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CT;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,1:5,1:10,7,1,1
chr2	223160316	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:8,3:10,3:10,8,5,1
chr2	223161624	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=182,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr2	223162024	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr2	223339533	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,1:0,0,0,4
chr2	223386439	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:5,5,1,1
chr2	223436607	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,10:0,12:0,0,12,10
chr2	223489249	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=137,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr2	223489293	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,2,2
chr2	223493435	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr2	223499077	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=168,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,3,1
chr2	223520905	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=371,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr2	223781018	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:7,0,5,1
chr2	223785846	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:2,3,2,6
chr2	223787559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,2,6
chr2	223787691	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:3,2,2,1
chr2	223789080	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=146,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:2,0,8,0
chr2	223793471	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=89,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:223793471_C_T:223793471:1,1,4,0
chr2	223793480	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:223793471_C_T:223793471:0,0,5,1
chr2	223797797	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=151,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	223799207	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	223806192	.	TTC	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=189,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.377:9:2,1:4,2:0|1:223806192_TTC_T:223806192:6,0,3,0
chr2	223806194	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=149,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,8:0.815:9:1,2:0,6:1|0:223806192_TTC_T:223806192:1,0,8,0
chr2	223919674	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=287,219;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr2	223919877	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=151,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,3:0,2:2,0,7,3
chr2	224629876	.	C	CCAT,CCATCAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30,32;MFRL=179,166,154;MMQ=60,60,60;MPOS=4,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,8,9;RU=CAT;STR;TLOD=5.97,10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.270,0.362:8:0,2,2:2,0,1:1,2,4,1
chr2	224746864	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=224,127;MMQ=54,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:224746864_C_T:224746864:0,4,0,1
chr2	224746868	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=224,127;MMQ=54,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:224746864_C_T:224746864:0,4,0,1
chr2	224758906	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,15,1
chr2	224763816	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr2	224765894	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr2	224770780	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	224770812	.	A	AAATTACCTGGGCATGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=202,113;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr2	224777094	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=67.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,7,10
chr2	224777105	.	G	GTGAT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,6:0,5:0|1:224777094_T_C:224777094:0,0,4,10
chr2	224824617	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=150,135;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,4:8,4:5,7,4,4
chr2	224866387	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:9,4,1,2
chr2	224866576	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,0:1,4:1,4,1,3
chr2	224866694	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=155,300;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:224866694_CT_C:224866694:0,1,0,1
chr2	224866712	.	CAGAT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=155,300;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:224866694_CT_C:224866694:0,1,0,1
chr2	225362384	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=249,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:4,0,1,0
chr2	225362492	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=229,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,4:5,3:6,4,5,2
chr2	225367718	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=176,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:5,7,2,1
chr2	225368321	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,1,1
chr2	225376032	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=150,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:13,6,1,1
chr2	225422585	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,11;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:225422585_A_T:225422585:2,1,0,1
chr2	225422599	.	AC	GA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=155,62;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.599:3:0,1:1,0:0|1:225422585_A_T:225422585:1,0,0,2
chr2	225669776	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=190,112;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:13,3:10,10,0,3
chr2	225669794	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=192,112;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:7,1:14,3:12,9,1,3
chr2	225695334	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=127,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:10,2:7,2:8,9,1,3
chr2	225702565	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=198,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:0,3:2,0:2,0,0,3
chr2	225719781	.	G	GACAC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,17;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,20;RU=AC;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.795:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr2	225848390	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=167,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr2	225848579	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.647:23:2,7:5,8:2,6,6,9
chr2	226491755	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:5,0:11,2:0|1:226491755_G_T:226491755:6,10,2,0
chr2	226491759	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:9,2:0|1:226491755_G_T:226491755:6,9,2,0
chr2	226491770	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr2	227660776	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=174,208;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:9,3:9,2:9,9,2,3
chr2	227663855	.	AGC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,21;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=GC;STR;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:2,1:7,2:8,3,2,2
chr2	227771389	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=166,46390873;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr2	227773466	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:7,1,2,1
chr2	227860250	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,83;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:6,0:15,4:6,15,0,4
chr2	227874957	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:6,1:8,5,4,0
chr2	227877037	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,5:4,3:3,4,0,8
chr2	227886925	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:4,3,0,6
chr2	227892720	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,4:4,1:1,6,1,4
chr2	227896652	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=107,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.319:17:3,4:8,1:7,5,4,1
chr2	227912331	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=61,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:1,1,1,5
chr2	227915601	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,265;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr2	227915924	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=234,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:1,4,0,3
chr2	227922104	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=245,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:0|1:227922104_T_C:227922104:1,0,5,0
chr2	227922109	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=245,220;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.757:6:1,2:0,2:0|1:227922104_T_C:227922104:1,0,5,0
chr2	227922321	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,4:5,1:6,6,2,3
chr2	227954525	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:5,2,2,1
chr2	227954599	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=117,146;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:3,2,3,1
chr2	227966148	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr2	227966298	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=49,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.585:12:4,3:1,4:2,3,3,4
chr2	227966309	.	A	AAAGGAGCTGCTCTGAGAGCAG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=182,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.260:12:3,3:5,0:3,6,2,1
chr2	227967601	.	ACAATATTTCAGCAATAGGGAAAG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.921:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr2	227967830	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=218,116;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,5:0,5:1,1,4,7
chr2	227973410	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr2	227973623	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.940:13:0,4:0,9:0,0,5,8
chr2	227973968	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=122,75;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:2,2:5,0:4,3,0,2
chr2	227974113	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	227979484	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr2	227983394	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=174,279;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,1:3,3:5,4,2,2
chr2	228104760	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr2	228109626	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.592:10:2,2:2,3:3,1,5,1
chr2	228109784	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr2	228112186	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,7,6
chr2	228113175	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr2	228118156	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=191,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:7,1:1,1:1,7,0,2
chr2	228118392	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=156,71;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:5,4,2,0
chr2	228119461	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:5,3,1,2
chr2	228144706	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr2	228145543	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	228146991	.	AATAT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AT;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr2	228149107	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=148,249;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr2	228158418	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=100,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,4:6,4:5,4,5,3
chr2	228158531	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,98;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:6,13,3,0
chr2	228159660	.	GTT	G,GT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32,33;MFRL=109,180,167;MMQ=60,60,60;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.52,6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.330,0.458:6:1,0,2:0,2,1:1,0,3,2
chr2	228159677	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,14;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:1,0:3,2,2,0
chr2	228169632	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr2	228194480	.	AG	TT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:6,2:15,0:8,13,1,1
chr2	228194570	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr2	228197368	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr2	228204929	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr2	228204982	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr2	228207625	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	228211074	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr2	228220528	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,2:4,3:1,9,0,5
chr2	228243905	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=114,232;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:6,1:16,4:11,11,2,3
chr2	228356364	.	GTT	G,GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33,34;MFRL=141,136,140;MMQ=60,60,60;MPOS=18,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=17.03,26.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,10,15:0.335,0.493:30:2,7,8:3,3,7:3,2,9,16
chr2	228373404	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=259,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,0:0,1,0,2
chr2	228384735	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:4,9:7,2:5,6,7,4
chr2	228395825	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:15,0:5,2:11,9,0,2
chr2	228399480	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	228401306	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,3:5,1:9,2,3,1
chr2	228416818	.	T	TGGCA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=164,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,2:14,0:0|1:228416818_T_TGGCA:228416818:8,16,0,2
chr2	228416820	.	T	TTTGTGGG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=161,84;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:8,2:16,0:0|1:228416818_T_TGGCA:228416818:8,17,0,2
chr2	228416822	.	A	AGG	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=161,84;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,2:15,0:0|1:228416818_T_TGGCA:228416818:8,17,0,2
chr2	228493211	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:10,1:4,4:8,6,4,1
chr2	228560800	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.928:11:0,5:0,6:0,0,7,4
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chr2	228565936	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:228565934_C_CATGCACCACCACGCCTGGCTAATTTTT:228565934:0,0,0,1
chr2	228680153	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=150,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr2	228736341	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:5,6,3,2
chr2	228750239	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:1,1,0,6
chr2	228756144	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,345;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	228758456	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,0:6,3:7,0,3,0
chr2	228767618	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr2	228767631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=200,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr2	228776938	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=192,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr2	228783447	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:11,4,2,0
chr2	228884686	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:4,3:7,2:5,6,3,2
chr2	228886413	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:4,2:2,0:3,6,2,0
chr2	228890166	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,1:8,1:8,3,2,0
chr2	228973660	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,5:2,2:1,5,1,6
chr2	228973723	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=218,237;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.412:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr2	230096837	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr2	230135711	.	G	GC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=89.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,14:0,12:0,0,14,13
chr2	230231889	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	230252994	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=127,54;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:9,5,1,1
chr2	230253006	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,0:4,2:0|1:230253006_A_C:230253006:8,4,1,1
chr2	230253007	.	C	CTGGCT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=121,54;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,0:5,2:0|1:230253006_A_C:230253006:8,4,1,1
chr2	230341979	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr2	230453214	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:0,3:1,3:1,1,3,4
chr2	230656987	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=117,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:5,2:3,3:0,8,0,5
chr2	230663576	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:5,0,8,2
chr2	230666898	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr2	230668489	.	AGC	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:230668489_AGC_A:230668489:0,1,0,1
chr2	230668492	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,22;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:230668489_AGC_A:230668489:0,1,0,1
chr2	230668858	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=122,110;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:10,6:5,7:8,7,8,5
chr2	230668968	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:1,4,2,3
chr2	230668982	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:1,2,1,4
chr2	230705516	.	TA	T,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27,24;MFRL=139,201,174;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.13,3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,3:0.294,0.243:13:3,3,1:3,0,1:5,1,5,2
chr2	230723777	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=175,168;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.274:27:8,4:12,3:9,11,0,7
chr2	230841074	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=179,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:2,5,3,1
chr2	231035575	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=198,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,0:0,3:0,1,1,2
chr2	231036311	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=301,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr2	231036754	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=225,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:2,2,2,2
chr2	231036768	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=205,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,2:0,3:1,3,2,3
chr2	231036860	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=143,287;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:4,1:7,3,1,1
chr2	231036866	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=238,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:2,1,5,4
chr2	231037616	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:13,2:9,3:15,7,1,4
chr2	231037770	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=206,220;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,0:1,7:0,4,0,7
chr2	231065503	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=209,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr2	231076289	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=322,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:0,8:2,5:1,1,6,8
chr2	231077110	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:16,3:11,3:17,11,3,3
chr2	231077155	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=168,276;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:23,0:9,2:13,19,0,2
chr2	231077676	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=166,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:7,0:7,4:9,5,2,2
chr2	231081711	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=211,172;MMQ=56,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:231081711_G_A:231081711:0,4,0,1
chr2	231081713	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=211,172;MMQ=56,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:231081711_G_A:231081711:0,4,0,1
chr2	231081723	.	GG	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=223,172;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:231081711_G_A:231081711:0,3,0,1
chr2	231110737	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	231113499	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=191,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr2	231120255	.	CGG	C,CG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28,29;MFRL=0,163,145;MMQ=60,60,60;MPOS=22,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,9;RU=G;STR;TLOD=8.36,12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,6:0.427,0.511:12:0,1,3:0,5,3:0,0,5,7
chr2	231149108	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.968:29:0,14:0,15:0,0,12,17
chr2	231152633	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,0:9,2:11,10,0,2
chr2	231155269	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,236;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:7,12,1,2
chr2	231157512	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=92,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:15,2:14,2:7,22,0,4
chr2	231157527	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=82,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:8,6:12,2:1,19,0,8
chr2	231175763	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=152,240;MMQ=56,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr2	231176376	.	A	ATTCCATACTATTATTATGTAAGT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=164,45107;MMQ=27,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:231176376_A_ATTCCATACTATTATTATGTAAGT:231176376:2,4,0,2
chr2	231176379	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=164,45107;MMQ=27,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:231176376_A_ATTCCATACTATTATTATGTAAGT:231176376:2,4,0,2
chr2	231177200	.	CTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=T;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr2	231222499	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,266;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:7,2,2,0
chr2	231223880	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:3,10,1,3
chr2	231226488	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=283,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr2	231253183	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:4,1:4,2:6,2,3,0
chr2	231253216	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:5,3,4,1
chr2	231253434	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=192,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:1,6,1,1
chr2	231254570	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=156,261;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr2	231256861	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,12:7,0:10,4,12,0
chr2	231327294	.	T	TATATAATTAAAATTATAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=208,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.315:4:3,1:0,0:1,2,0,1
chr2	231331799	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:2,1,6,0
chr2	231334532	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=180,108;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.331:30:14,6:6,2:12,8,2,8
chr2	231337960	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=154,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	231359225	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=131,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.118:32:19,0:10,3:7,22,2,1
chr2	231363252	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,4:2,8:2,10,2,11
chr2	231368897	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=119,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,1:6,3:7,4,2,2
chr2	231372772	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:10,0:11,6,3,0
chr2	231375865	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=139,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:2,6:10,3:8,5,6,3
chr2	231375974	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,212;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr2	231380033	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,68;MMQ=60,44;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:15,7,2,0
chr2	231406529	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr2	231407519	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,5:3,5:3,3,5,5
chr2	231407663	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:7,4:2,8:6,3,6,6
chr2	231674958	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,1:9,1:13,6,3,0
chr2	231678888	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=102,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,0:16,4:4,25,0,4
chr2	231742711	.	T	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=265,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.610:21:3,7:5,6:3,5,4,9
chr2	231860848	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr2	231864600	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=270,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr2	231865018	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:7,2,2,0
chr2	231865047	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,2:12,2:12,6,3,1
chr2	231865144	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,6:5,4:6,4,4,6
chr2	231927382	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:8,2:14,0:10,12,2,0
chr2	231940295	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=144,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=18.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.459:24:4,7:7,4:7,6,7,4
chr2	231943277	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	231943556	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=213,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:231943556_C_T:231943556:0,3,0,1
chr2	231943567	.	G	GACATGATCAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=232,120;MMQ=55,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:231943556_C_T:231943556:0,2,0,1
chr2	231944373	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=209,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.414:15:3,4:6,2:5,4,0,6
chr2	231948178	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=291,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	231948391	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=131,240;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:10,0:12,9,0,2
chr2	231978627	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.282:37:10,0:17,10:9,18,0,10
chr2	232030510	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=327,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr2	232030555	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=327,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	232035429	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,4:6,3:5,5,3,4
chr2	232121407	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=188,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr2	232135541	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=230,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:3,4,2,2
chr2	232196472	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=154,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:4,3,1,2
chr2	232317402	.	CA	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=44.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,6:5,8:6,4,6,8
chr2	232321956	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:8,3:6,4:7,7,4,3
chr2	232378381	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=193,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:1,4:0,3,1,5
chr2	232390151	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:2,2:5,5:2,5,0,7
chr2	232458201	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=158,121;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:6,7,1,2
chr2	232572381	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,9,1
chr2	232574807	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr2	232576661	.	GG	CT	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,174;MMQ=54,20;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:13,0:11,6:5,19,0,6
chr2	232577421	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=268,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,5:3,1:4,3,4,2
chr2	232577586	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=205,165;MMQ=60,48;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,3:4,1:8,2,2,2
chr2	232597631	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:7,5,0,2
chr2	232653481	.	A	ACT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CT;STR;TLOD=52.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,5:2,7:1,2,2,11
chr2	232879564	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=154,246;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr2	233028070	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr2	233243660	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=55.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,7:0,0,7,8
chr2	233243981	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=62,159;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:0,6:3,3:1,2,5,4
chr2	233244000	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=141,62;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:9,0:4,3:7,6,1,2
chr2	233245090	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=100,154;MMQ=45,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:2,2,4,1
chr2	233246562	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233246562_T_C:233246562:0,0,0,1
chr2	233246565	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233246562_T_C:233246562:0,0,0,1
chr2	233246567	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233246562_T_C:233246562:0,0,0,1
chr2	233246569	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:233246562_T_C:233246562:0,0,0,1
chr2	233271697	.	TAC	T,TACAC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28,27;MFRL=181,161,233;MMQ=60,56,60;MPOS=14,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=AC;STR;TLOD=6.01,8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.248,0.333:9:3,1,2:1,1,1:1,3,3,2
chr2	233271853	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=185,105;MMQ=52,29;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:5,1:5,4,0,2
chr2	233272162	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=238,220;MMQ=56,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,3,1
chr2	233274145	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,39;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	233274169	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	233321371	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.538:22:4,0:6,11:5,5,0,12
chr2	233321723	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=171,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,0:6,3:6,7,2,1
chr2	233321836	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,3:3,1:5,2,2,2
chr2	233322424	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=113,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.487:15:3,5:2,2:4,4,5,2
chr2	233323177	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,3,3
chr2	233323205	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=186,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:2,2,1,1
chr2	233344991	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=107,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:1,3,2,1
chr2	233345249	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0,7,0,2
chr2	233346662	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr2	233347290	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=176,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:4,0:6,3:3,7,0,3
chr2	233347919	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=230,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,2:3,6:1,2,1,7
chr2	233348647	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr2	233350000	.	C	G,CGCGGGCG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25,24;MFRL=0,159,70;MMQ=60,60,60;MPOS=20,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.89,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.634,0.245:5:0,2,0:0,2,1:0,0,1,4
chr2	233350001	.	A	ATGCGGCGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,17;MFRL=159,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:1,3,0,1
chr2	233396009	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=151,242;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:3,1,1,1
chr2	233400074	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,1,1
chr2	233404334	.	C	CGGGCTGGCT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=228,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GGGCTGGCT;STR;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr2	233404590	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=96,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,1,2
chr2	233407120	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:5,5,1,2
chr2	233407510	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=232,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:233407510_CT_C:233407510:1,0,1,0
chr2	233407516	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=232,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0|1:233407510_CT_C:233407510:1,0,1,0
chr2	233408190	.	A	ACCC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=240,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=C;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,0:2,1:2,2,0,2
chr2	233408220	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=G;STR;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0,0,2,2
chr2	233408239	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=285,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,1:1,3:1,0,2,2
chr2	233415978	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.521:19:6,4:3,5:2,7,3,7
chr2	233421284	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr2	233428927	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=102,243;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:13,2:6,2:12,8,0,4
chr2	233429144	.	GTATTT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TATTT;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.699:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233470931	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,242;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:6,11,1,1
chr2	233536926	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=123,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	233612413	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,100235600;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:2,13,0,2
chr2	233641010	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr2	233641083	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=238,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,4:2,6:2,0,6,4
chr2	233655361	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr2	233660704	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=227,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr2	233660846	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:3,1:2,4:2,4,2,3
chr2	233661032	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233677041	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.431:5:1,0:1,2:0|1:233677041_CT_C:233677041:1,2,2,0
chr2	233677056	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.335:7:2,0:2,0:0|1:233677041_CT_C:233677041:3,2,2,0
chr2	233681512	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr2	233697763	.	TGCA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCA;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,2:3,0:0,7,0,2
chr2	233708806	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,79;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.802:18:0,11:3,4:1,2,7,8
chr2	233711987	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,4:3,0:5,0,4,0
chr2	233712049	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=222,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,6:1,10:2,1,11,5
chr2	233712208	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,20;MFRL=148,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:233712208_G_A:233712208:7,11,1,1
chr2	233712212	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:8,2:0|1:233712208_G_A:233712208:6,12,1,1
chr2	233712226	.	CACA	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=35,28;MFRL=244,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=60.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,7:1,7:0,2,4,12
chr2	233712248	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,1:4,4:0,12,1,4
chr2	233712296	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,3:0,6:0,1,1,8
chr2	233721455	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=209,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:2,3,4,3
chr2	233740227	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=235,124;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,4:1,5:1,0,6,4
chr2	233744130	.	GCCC	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=36,19;MFRL=260,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:233744130_GCCC_G:233744130:1,0,1,0
chr2	233744141	.	CCCA	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,12;MFRL=159,260;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:1,0,1,0
chr2	233744148	.	TC	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=15,10;MFRL=260,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:233744130_GCCC_G:233744130:1,0,1,0
chr2	233744161	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,10;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:233744130_GCCC_G:233744130:2,0,1,0
chr2	233744163	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,15;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:233744130_GCCC_G:233744130:2,0,1,0
chr2	233744478	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	233750074	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=173,147;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:6,2:2,4:4,5,4,2
chr2	233750118	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.777:10:0,5:1,3:1,1,3,5
chr2	233752639	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr2	233757683	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,1:6,2:6,6,1,2
chr2	233757697	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,4,7
chr2	233759362	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=211,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr2	233759695	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=149,287;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:0,5,0,5
chr2	233791988	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	233834975	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=70,198;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,4:5,4:4,5,6,2
chr2	233877867	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=160,53;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:12,5,2,1
chr2	233899377	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=185,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,3:6,3:6,7,4,2
chr2	233899554	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=237,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:3,3,3,0
chr2	233925406	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:7,4:0,14,0,4
chr2	233990412	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:6,4,2,1
chr2	234072626	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr2	234091135	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=171,98;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:2,10,0,3
chr2	234091158	.	TG	CA,CG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,35,27;MFRL=206,187,166;MMQ=60,60,60;MPOS=13,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.76,6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,3,3:0.265,0.266:12:2,1,3:4,2,0:1,5,1,5
chr2	234093035	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr2	234104029	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.344:18:4,2:7,3:7,5,4,2
chr2	234160669	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=191,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr2	234178624	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=34,34,32,26;MFRL=127,181,179,161;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,10,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,14,16;RU=T;STR;TLOD=4.62,12.14,13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,6,7:0.117,0.309,0.369:19:3,1,2,2:0,1,3,1:3,1,11,4
chr2	234178781	.	AT	A	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.305:26:8,2:10,4:5,13,1,7
chr2	234181556	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=187,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:11,2:6,4:15,2,5,1
chr2	234181593	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,22:0.575:38:13,12:3,10:12,4,17,5
chr2	234183468	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr2	234186261	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,1:9,2:8,12,0,3
chr2	234201017	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:15,0:7,3:13,11,3,0
chr2	234227693	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=158,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr2	234229395	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,2:7,3:4,11,4,1
chr2	234235749	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,269;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.633:9:2,1:1,4:1,2,4,2
chr2	234238254	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:1,1,0,2
chr2	234294561	.	T	TTC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=217,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,6:1,7:2,2,9,4
chr2	234296944	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=149,48;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:12,0:17,3:16,13,0,3
chr2	234343086	.	TGGATTGCA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=146,76;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:13,0:9,2:12,12,1,1
chr2	234347091	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr2	234363127	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:6,9,0,2
chr2	234375944	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr2	234378074	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=142,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,1:8,1:6,15,1,1
chr2	234398195	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=257,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:6,0:1,2:0,7,1,1
chr2	234429739	.	T	TTTC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=129,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTC;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:11,2:5,14,1,1
chr2	234429764	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=179,111;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:5,0:7,5:4,9,0,5
chr2	234438246	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	234442437	.	CA	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=152,173;MMQ=57,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,2:1,5:0,4,1,6
chr2	234449462	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=231,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0,1,0,3
chr2	234450822	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	234457877	.	TAAAAGAAAAAAGAACAAAAATATTGATATAGTTTTCATAAAATGCTGATAATAATC	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,10:0.137:32:10,3:6,4:0|1:234457877_TAAAAGAAAAAAGAACAAAAATATTGATATAGTTTTCATAAAATGCTGATAATAATC_T:234457877:7,15,3,7
chr2	234457900	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=167,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,13:0.796:16:1,9:2,4:1|0:234457877_TAAAAGAAAAAAGAACAAAAATATTGATATAGTTTTCATAAAATGCTGATAATAATC_T:234457877:2,1,4,9
chr2	234469974	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=228,199;MMQ=31,30;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr2	234602277	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=140,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,4:9,2:11,7,4,2
chr2	234698065	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,124;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	234704495	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=226,224;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,2:8,1:2,8,0,3
chr2	234704746	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=239,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:0,1,1,2
chr2	234707341	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=252,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,5,0
chr2	234708570	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:3,4:1,3:1,3,3,4
chr2	234712921	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=224,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,3:1,4:2,2,1,6
chr2	234713812	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=266,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,2:1,2:0,2,1,3
chr2	234727250	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,4,4
chr2	234738472	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:0,8,0,3
chr2	234740797	.	C	CAAAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=159,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.410:15:6,2:2,3:0|1:234740797_C_CAAAA:234740797:6,3,5,1
chr2	234740798	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=159,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:6,3:3,3:0|1:234740797_C_CAAAA:234740797:6,3,5,1
chr2	234740809	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=162,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:7,2:8,1:11,4,2,1
chr2	234740985	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=182,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:234740985_G_A:234740985:1,1,0,2
chr2	234740987	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=182,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:234740985_G_A:234740985:1,1,0,2
chr2	234741022	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=244,277;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr2	234750400	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:12,5,2,0
chr2	234753008	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=174,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr2	234754273	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=198,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:3,1,1,1
chr2	234754506	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:2,4,0,3
chr2	234761355	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:0,6,1,7
chr2	234763226	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=138,240;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,3:3,1:0,3,0,4
chr2	234846198	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr2	234890391	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=37,28;MFRL=180,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,2:0,6:1,0,5,3
chr2	234967410	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr2	234969154	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:2,6:9,2:3,8,3,5
chr2	235405561	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235405561_G_A:235405561:0,0,0,1
chr2	235405566	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:235405561_G_A:235405561:0,0,0,1
chr2	235405629	.	TGCTCCC	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCTCCC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	235943682	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.264:13:4,0:4,3:0|1:235943682_T_C:235943682:5,5,2,1
chr2	235943684	.	GC	TT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,0:4,3:0|1:235943682_T_C:235943682:5,5,2,1
chr2	235943691	.	T	TTAGCCACAGTCCTGTTC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=145,49;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,0:5,3:0|1:235943682_T_C:235943682:5,6,2,1
chr2	235943693	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,35;MFRL=145,49;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,0:5,1:0|1:235943682_T_C:235943682:5,6,2,1
chr2	236433161	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=136,87;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:5,6,1,1
chr2	236433282	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=157,76;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.275:16:5,4:7,0:5,7,3,1
chr2	236433331	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=138,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,1,1
chr2	236682856	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=238,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr2	236682914	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=276,123;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:4,2,4,0
chr2	236685532	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=226,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr2	236685731	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=136,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:2,6,2,1
chr2	236706510	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=156,39;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:8,2:0|1:236706510_T_A:236706510:7,5,1,1
chr2	236706515	.	C	CGATGACACT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,39;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:236706510_T_A:236706510:7,5,1,1
chr2	236761396	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.539:24:4,9:7,4:6,5,4,9
chr2	236761414	.	C	CCAGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=162,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGG;STR;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:9,2:6,3:8,7,2,3
chr2	236817629	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr2	236877066	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=127,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.751:13:2,7:0,3:1,2,7,3
chr2	236923361	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.317:12:4,3:3,1:7,1,2,2
chr2	237028849	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=172,103;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:6,1:3,0:5,4,1,1
chr2	237029026	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:8,3,0,2
chr2	237029163	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr2	237032523	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=121,249;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,1:3,1:4,1,0,2
chr2	237032574	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=146,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,2:11,2:9,10,2,2
chr2	237032837	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=146,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr2	237032856	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,23;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr2	237076711	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	237105050	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=126,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:3,3,2,1
chr2	237255303	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,158;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:6,4,4,1
chr2	237255500	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=208,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr2	237289197	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=114,234;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:10,5,3,0
chr2	237327743	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=133,69;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:4,4:12,0:9,7,2,2
chr2	237396935	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	237405766	.	CAAA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,314;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,5;RU=A;STR;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:6,2:7,3,2,0
chr2	237995981	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=167,279;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,2:2,2:7,4,3,1
chr2	238005515	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:11,2:7,18,2,0
chr2	238166147	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,5:0,4:0,2,0,9
chr2	238243429	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=142,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,2:9,1:11,13,2,1
chr2	238243464	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,16:0,6:0,0,12,10
chr2	238249771	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=149,142;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:2,7,0,2
chr2	238256544	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=221,102;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,0:14,3:5,18,0,3
chr2	238259675	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=280,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,7:1,2:1,0,10,0
chr2	238261112	.	GC	AA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=203,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:3,7:0,9:3,0,12,4
chr2	238265995	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,0:10,2:9,14,0,2
chr2	238266019	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=131,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:11,0:8,2:8,11,0,2
chr2	238266633	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr2	238267058	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=268,67;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	238268681	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=117,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:6,3:6,1:8,4,3,1
chr2	238269871	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=136,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:10,1:3,2:6,8,0,4
chr2	238270411	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=113,157;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:8,2,2,0
chr2	238283472	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,0:10,3:10,8,2,1
chr2	238285592	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,161;MMQ=60,54;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.142:23:9,2:11,0:11,9,3,0
chr2	238287514	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=179,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:11,8,1,1
chr2	238289817	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=234,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,1:5,2:4,4,2,1
chr2	238296807	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:11,4:9,1:8,12,3,2
chr2	238330273	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=152,292;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:11,9,0,2
chr2	238330797	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:11,2:9,0:8,13,1,1
chr2	238461723	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,102;MMQ=60,49;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,0:5,3:10,6,0,3
chr2	238484222	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=150,222;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr2	238486629	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,3:7,0:6,5,2,1
chr2	238494123	.	T	TGCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.331:16:6,1:5,3:0|1:238494123_T_TGCC:238494123:1,10,5,0
chr2	238494127	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=118,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:0|1:238494123_T_TGCC:238494123:1,9,5,0
chr2	238494132	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:4,2:0|1:238494123_T_TGCC:238494123:0,9,5,0
chr2	238494136	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=144,123;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,1:6,2:0|1:238494123_T_TGCC:238494123:0,13,4,0
chr2	238499988	.	C	CCTCTTCTTCCAGCTTCTAATATAGCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=200,122;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr2	238636409	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:8,0,4,0
chr2	238636606	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=206,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:12,4:8,1:7,13,1,4
chr2	238641117	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:9,2:3,4:1,11,0,6
chr2	238642489	.	CGCA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=140,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.196:18:11,2:4,1:0,15,3,0
chr2	238656936	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=105,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,3:3,2:5,1,3,2
chr2	238658030	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=249,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr2	238661870	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=203,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	238662154	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr2	238664831	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:10,7:9,0:11,8,7,0
chr2	238666081	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=158,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,2:9,1:10,9,1,2
chr2	238667501	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=249,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:2,0:0,1:0,2,0,2
chr2	238688244	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr2	238722438	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=313,175;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr2	238726702	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,1:8,3:4,9,2,2
chr2	238730317	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr2	238732220	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:7,2:13,0:4,17,0,2
chr2	238742837	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,1:7,2:7,7,1,2
chr2	238896494	.	CT	C,CAT	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,35,33;MFRL=196,164,185;MMQ=60,60,60;MPOS=27,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.71,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:2,2,1:0,0,1:2,0,4,0
chr2	238896495	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.615:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr2	238896496	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr2	238903310	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr2	238912120	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=160,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,5:0,1:0,2,1,6
chr2	238939370	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=264,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:0,7,0,5
chr2	238944441	.	ACT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr2	238991557	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=245,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.451:9:1,2:4,2:0|1:238991557_CT_C:238991557:5,0,4,0
chr2	238991560	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,31;MFRL=234,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.353:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr2	238991562	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=245,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.466:9:1,2:4,2:0|1:238991557_CT_C:238991557:5,0,4,0
chr2	239002480	.	CTTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=177,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=31.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,5:2,3:1,2,7,1
chr2	239005465	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,225;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:3,2:14,0:9,8,2,0
chr2	239007806	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr2	239007850	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=22,28;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.405:13:4,4:3,1:4,4,3,2
chr2	239007991	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=153,122;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:1,4,1,6
chr2	239007997	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=140,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:1,7,1,3
chr2	239010577	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=226,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:2,1,2,0
chr2	239016466	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=193,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:5,2,4,2
chr2	239025523	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=144,203;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:1,4:7,3:5,3,5,2
chr2	239034043	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=184,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:5,4,1,2
chr2	239036416	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,6:1,1:0,2,0,7
chr2	239037273	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:10,0,4,0
chr2	239039896	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=251,149;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,5,1
chr2	239053436	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr2	239053685	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr2	239054504	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,4:1,11:0,2,6,9
chr2	239073046	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=205,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,0,2
chr2	239082166	.	G	GC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,4:1,6:4,0,8,2
chr2	239092474	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=234,372;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,2,1
chr2	239093788	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr2	239102856	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr2	239103574	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=216,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:2,4,2,4
chr2	239103603	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,1,3
chr2	239133843	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=152,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=27.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,5:3,3:6,2,4,5
chr2	239139907	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=59,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,3:0,7:0,2,5,5
chr2	239147792	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=148,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,0:3,2:6,5,0,2
chr2	239148970	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:8,2,4,0
chr2	239148996	.	CCCGT	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=146,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCGT;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,2:4,4:5,3,1,5
chr2	239165636	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,6:6,1:7,4,4,3
chr2	239168596	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=140,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.232:19:6,1:8,3:11,4,3,1
chr2	239181851	.	T	TCA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=133,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=24.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.638:9:2,1:1,4:0|1:239181851_T_TCA:239181851:1,2,0,6
chr2	239181860	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=160,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,6:0.583:10:2,1:1,5:0|1:239181851_T_TCA:239181851:1,3,0,6
chr2	239181904	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,0:2,4:0,7,0,4
chr2	239186589	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.463:11:2,3:4,2:3,3,1,4
chr2	239241445	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.324:16:5,2:5,3:9,2,3,2
chr2	239242719	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=204,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.438:7:2,2:1,1:1,3,2,1
chr2	239247174	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	239353136	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,1:12,1:9,14,1,1
chr2	239988606	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:7,2:4,1:7,4,2,2
chr2	240016771	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=141,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:9,5:4,3:5,8,3,5
chr2	240016824	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=161,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:0,12,0,2
chr2	240024654	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=169,226;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr2	240029736	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=52.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,14,1
chr2	240055901	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=179,238;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:3,0,4,0
chr2	240066417	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr2	240078488	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr2	240085403	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=200,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,6,0
chr2	240085674	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:1,0,1,5
chr2	240098165	.	T	TC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:8,14,0,2
chr2	240111477	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=234,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr2	240504878	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr2	240721598	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:5,5:6,2:5,7,2,5
chr2	240900607	.	TG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,6:3,1:4,5,0,7
chr2	240921463	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,276;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr2	240923146	.	TC	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=122,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:3,4:5,6:2,6,1,9
chr2	240954110	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=143,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,3:5,2:4,2,5,0
chr2	240957312	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,83;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:3,7,0,2
chr2	240958129	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:0,6,0,4
chr2	240961728	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,172;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:5,6:5,6:6,4,6,6
chr2	240961852	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr2	240981179	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=230,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:0,3:4,1:4,0,5,0
chr2	240985279	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=203,50;MMQ=27,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:12,6:8,0:9,11,6,0
chr2	241066280	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,6:3,3:1,2,3,6
chr2	241073450	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=211,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,5:1,3:2,3,2,6
chr2	241075538	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,346;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:241075538_GC_G:241075538:0,0,1,0
chr2	241075545	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=175,346;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:241075538_GC_G:241075538:0,1,1,0
chr2	241075548	.	CC	AT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=204,346;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:241075538_GC_G:241075538:0,2,1,0
chr2	241075809	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,2,4
chr2	241389280	.	C	CCAGCTGCAACACTA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:241389280_C_CCAGCTGCAACACTA:241389280:6,7,1,1
chr2	241389282	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=156,42;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:4,0:0|1:241389280_C_CCAGCTGCAACACTA:241389280:6,7,1,1
chr2	241390002	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=188,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,3:3,0:9,3,2,1
chr2	241394317	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=79,63;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.414:8:0,3:3,0:3,2,3,0
chr2	241395482	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:241395482_C_G:241395482:2,2,0,1
chr2	241395500	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=152,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:241395482_C_G:241395482:0,2,1,0
chr2	241395503	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=139,186;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0|1:241395482_C_G:241395482:0,1,1,1
chr2	241403955	.	GTGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.719:12:2,3:0,6:2,1,8,1
chr2	241404213	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=181,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:7,3,0,2
chr2	241404237	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,5:4,2:2,3,4,3
chr2	241405400	.	C	CGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr2	241439809	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr2	241439962	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=136,129;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,0:3,2:8,5,0,2
chr2	241440020	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=136,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,3:4,0:1,4,1,2
chr2	241452198	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=57.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:1,7:1,10:1,1,13,4
chr2	241452212	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=207,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,21:0.880:23:1,8:1,13:1,1,15,6
chr2	241465118	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=148,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:12,0:0|1:241465118_G_A:241465118:14,9,1,1
chr2	241465122	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=139,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:10,2:13,0:0|1:241465118_G_A:241465118:14,10,1,1
chr2	241471592	.	AAAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=136,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,1:8,1:6,7,1,1
chr2	241492255	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=194,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr2	241496567	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=254,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.866:20:2,12:0,6:2,0,11,7
chr2	241500674	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:5,1,7,1
chr2	241500896	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:7,4:1,6:1,7,5,5
chr2	241512470	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr2	241534188	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=209,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr2	241534381	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=239,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr2	241538229	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr2	241555784	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=233,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:4,1,3,0
chr2	241570249	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=180,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:1,3:4,2:4,1,0,6
chr2	241570284	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=178,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:2,3,2,1
chr2	241570736	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:2,4:0,1:1,1,0,6
chr2	241627767	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=219,263;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr2	241659368	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,5:0,1:0,3,0,6
chr2	241663019	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr2	241663432	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.141:26:11,2:11,1:0|1:241663432_G_A:241663432:7,16,1,2
chr2	241663436	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=109,213;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,6:0.259:25:13,0:6,6:1|0:241663432_G_A:241663432:7,12,0,6
chr2	241674222	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=233,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:0,7:1,8:1,0,5,10
chr2	241680644	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	241696840	.	ATCC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TCC;STR;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:1,4:1,5:2,2,4,5
chr2	241702403	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,33;MFRL=245,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241702403_G_C:241702403:1,0,0,1
chr2	241702408	.	GC	TG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=245,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241702403_G_C:241702403:1,0,0,1
chr2	241702412	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=245,170;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:241702403_G_C:241702403:1,0,0,1
chr2	241702561	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	241726646	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=130,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:3,2:7,1,3,0
chr2	241727441	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=118,340;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241727441_T_TG:241727441:0,1,1,0
chr2	241727448	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=118,340;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241727441_T_TG:241727441:0,1,1,0
chr2	241727452	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,12;MFRL=118,340;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:241727441_T_TG:241727441:0,1,1,0
chr2	241808792	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,3,6
chr2	241813289	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr2	241813496	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=140,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:2,5:2,2:3,1,4,4
chr2	241815307	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	241815473	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:0,7:2,8:1,1,5,10
chr2	241827650	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=143,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr2	241827676	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.724:9:1,3:1,1:2,0,5,2
chr2	241827696	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=23,30;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:0,4:1,3:2,0,4,3
chr2	241828138	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr2	241834830	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=288,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:3,0,5,0
chr2	241834875	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=288,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,6:1,3:1,0,7,2
chr2	241858338	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:8,1:1,1:5,4,0,2
chr2	241859307	.	G	GGCCC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:241859307_G_GGCCC:241859307:1,0,1,0
chr2	241859309	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:241859307_G_GGCCC:241859307:1,0,1,0
chr2	241861904	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=187,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr2	241870583	.	C	CAGCGGTGGGGCTGGACTCTCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=227,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr2	241870593	.	CG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	241871821	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=153,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:9,2:11,0:9,13,1,1
chr2	241871847	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,2:6,8:6,9,3,7
chr2	241874559	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=147,335;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,2,1
chr2	241889171	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:1,1,1,7
chr2	241889937	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,6:0,13:0,0,9,10
chr2	241898947	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=297,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.621:9:2,2:1,1:0,3,0,6
chr2	241973977	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,20;MFRL=202,100;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:2,0:1,3:4,2,1,2
chr2	241976615	.	CG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=120,250;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:5,2,4,1
chr2	242003558	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr2	242004199	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=224,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,5:2,4:2,1,9,0
chr2	242004219	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=39.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,7,4
chr2	242011151	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.757:2:0,1:0,0:0,0,1,1
chr2	242011330	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,0:1,2:1,4,0,2
chr2	242047529	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=170,142;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,5:8,0:10,0,5,0
chr2	242062130	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=137,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:3,9:4,10:4,3,11,8
chr2	242065601	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=135,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,4:2,7:3,1,7,4
chr2	242072280	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=122,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,7:3,7:4,2,6,8
chr2	242075192	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,279;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr2	242075423	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,0:7,5:7,11,0,5
chr2	242077348	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.212:20:13,2:3,1:13,3,1,3
chr2	242078057	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=201,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,5:2,0:4,2,4,1
chr2	242079103	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=134,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:0,9,0,4
chr2	242079210	.	G	GTCACCCAAACCACTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=255,460;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:3,1,0,1
chr2	242079233	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=201,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr2	242079261	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr2	242082480	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,35;MFRL=357,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.803:6:0,1:0,4:1,0,2,3
chr2	242099961	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr2	242105939	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=230,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr2	242139491	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr2	242142737	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr2	242146949	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,15;MFRL=293,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.664:4:0,0:1,0:1,0,3,0
chr2	242149010	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=198,117;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,2,0
chr2	242149027	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr2	242174860	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=207,149862254;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:7,3,2,0
chr2	242176019	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=99,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.243:31:8,3:15,4:20,4,1,6
chr2	242186391	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=181,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:7,1,1,2
chr2	242202390	.	CCA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,225;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,2:3,0:0,7,0,2
chr2	242259614	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,5:1,8:1,0,9,4
chr2	242263615	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,2:10,0:12,7,3,0
chr2	242265313	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,219;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr2	242276377	.	CGT	C,TGT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,27,28;MFRL=224,291,176;MMQ=35,40,40;MPOS=16,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.286:4:2,1,1:0,0,0:0,2,0,2
chr2	242276382	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,21;MFRL=239,176;MMQ=40,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr2	242276386	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,265;MMQ=60,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr2	242276389	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=291,239;MMQ=40,30;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr2	242282597	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=194,100;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242282597_G_GC:242282597:0,1,0,1
chr2	242282598	.	T	TTCCATGCTTGCCCTGTGC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,100;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:242282597_G_GC:242282597:0,1,0,1
chr2	242283071	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr2	242283094	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr2	242285545	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=127,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,3:2,4:7,3,4,3
chr2	242289663	.	C	CATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATT;STR;TLOD=66.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,5:0,0,0,15
chr2	242352633	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=228,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr2	242374519	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr2	242375813	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=203,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr2	242402087	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=171,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr2	242429426	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=128,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:3,2:8,0:7,5,1,1
chr2	242433348	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,7:0,1:1,0,6,2
chr2	242440126	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:4,1:6,1,1,1
chr2	242441220	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242592868	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,0:7,7:4,8,0,7
chr2	242598862	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:1,1:2,2,1,1
chr2	242607483	.	GC	TT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,275;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr2	242611525	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:2,2:6,0,2,0
chr2	242615462	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr2	242618050	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:2,10:3,4:3,2,4,10
chr2	242624280	.	A	AAAGAAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=187,121;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:1,4,0,1
chr2	242648545	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:242648545_C_T:242648545:0,0,3,0
chr2	242648549	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:242648545_C_T:242648545:0,0,3,0
chr2	242662761	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=115,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:6,2:5,4:4,8,0,6
chr2	242674959	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr2	242680366	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:4,1,3,0
chr2	242682029	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=140,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,2:4,1:3,11,0,3
chr2	242707101	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:5,2,1,1
chr2	242707195	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,69;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:2,1:3,3,1,4
chr2	242738596	.	TGCCCCGGGTACCTCCTAACA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=213,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:4,2:2,5,1,1
chr2	242742842	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=210,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:9,0,2,1
chr2	242742875	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:6,6:4,2:7,3,5,3
chr2	242743651	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=199,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr2	242755465	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr2	242755645	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=189,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:6,1,3,0
chr2	242756826	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=115,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:8,0:5,10,2,0
chr2	242812080	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,33;MFRL=164,166;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.400:11:2,1:1,3:0,7,2,2
chr2	242813202	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=221,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:0|1:242813202_G_A:242813202:2,3,2,5
chr2	242813205	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=221,138;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,4:0|1:242813202_G_A:242813202:2,3,2,4
chr2	242813241	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr2	242841399	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr2	242842382	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=264,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr2	242842634	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=156,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr3	367757	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=142,238;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:7,6,1,2
chr3	367825	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=184,289;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	370051	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=160,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,2:4,1:1,9,0,3
chr3	386247	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr3	391001	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=135,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:3,7:5,2:8,0,9,0
chr3	391027	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:9,0:5,1:0|1:391027_A_G:391027:12,2,1,1
chr3	391029	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:9,0:5,2:0|1:391027_A_G:391027:12,2,1,1
chr3	403288	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0|1:403288_G_A:403288:0,0,4,0
chr3	403297	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:403288_G_A:403288:0,0,4,0
chr3	403308	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=293,204;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr3	403345	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr3	424417	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=196,72;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,1:0,3,0,2
chr3	440088	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	1269607	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:9,4:10,3:9,10,2,5
chr3	1269625	.	C	CT	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:8,0:0|1:1269625_C_CT:1269625:8,15,1,1
chr3	1269628	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=152,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,2:9,0:0|1:1269625_C_CT:1269625:6,15,1,1
chr3	1269680	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=198,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,3:7,1:3,13,4,0
chr3	1269763	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=152,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr3	1320271	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=142,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr3	1337203	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	1339680	.	GGTTTTT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GTTTTT;STR;TLOD=32.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.702:11:2,4:1,4:1,2,2,6
chr3	1369278	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=206,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,2:1,6:1,3,2,6
chr3	1415195	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=270,115;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr3	1418792	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=157,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,0:3,4:2,8,0,4
chr3	1418859	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	1425168	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=204,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr3	1427204	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=122,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr3	1445139	.	GC	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:1445139_GC_AA:1445139:3,13,0,3
chr3	1445144	.	TC	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:1445139_GC_AA:1445139:3,13,0,3
chr3	2908335	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	2908667	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=207,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0,6,0,3
chr3	2928832	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=154,77;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:9,0:0,4:3,6,1,3
chr3	3067759	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=233,110;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:7,1,2,0
chr3	3076284	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=165,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:5,4:5,3:7,3,4,3
chr3	3076315	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=165,89;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:8,6,1,1
chr3	3076401	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=197,92;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:5,4:1,7:4,2,7,4
chr3	3078795	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=152,1789;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr3	3078840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,2:5,2:5,5,4,0
chr3	3079012	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:2,10,1,1
chr3	3080527	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	3082025	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=237,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:0,8,0,2
chr3	3084570	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=84,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3084570_A_G:3084570:2,0,1,0
chr3	3084575	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=84,196;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:3084570_A_G:3084570:2,0,1,0
chr3	3116438	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,4:6,2:6,5,6,0
chr3	3118142	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=260,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,4:2,0:2,0,3,1
chr3	3170910	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	3171502	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=261,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr3	3171713	.	G	GCCTGACT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr3	3179089	.	TCGGATGA	T	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=153,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,0:14,2:0|1:3179089_TCGGATGA_T:3179089:15,14,0,2
chr3	3179101	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,2:0|1:3179089_TCGGATGA_T:3179089:14,13,0,2
chr3	3179104	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,2:0|1:3179089_TCGGATGA_T:3179089:14,13,0,2
chr3	3179106	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=145,73;MMQ=60,60;MPOS=-6;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,1:0|1:3179089_TCGGATGA_T:3179089:14,13,0,2
chr3	3188165	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=187,130;MMQ=60,25;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:3188165_G_T:3188165:4,7,0,2
chr3	3188170	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=193,130;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:3188165_G_T:3188165:3,8,0,2
chr3	3188172	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=190,130;MMQ=60,25;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,0:4,2:0|1:3188165_G_T:3188165:3,7,0,2
chr3	3188362	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=152,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:0,1,0,8
chr3	3189059	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.883:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	3189398	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=276,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.803:18:0,7:3,8:1,2,5,10
chr3	3192524	.	A	ATAAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=263,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAC;STR;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,0:1,6:3,0,4,4
chr3	3195600	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=196,72;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:4,0:9,3:9,4,2,2
chr3	3195606	.	TAAAACATGGGCATCA	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:5,0:8,3:12,11,2,2
chr3	3197871	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,12,8
chr3	3215954	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,10:0,7:0,0,3,14
chr3	3221430	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=264,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.701:15:3,6:1,3:1,3,3,8
chr3	3889067	.	CTT	C,CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33,32;MFRL=0,309,301;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.54,4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.334,0.525:4:0,1,1:0,1,1:0,0,4,0
chr3	4354692	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=171,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.175:14:7,2:5,0:0|1:4354692_T_G:4354692:5,7,1,1
chr3	4354695	.	C	CACTTTCTTAATATAACAGGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=171,45;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0|1:4354692_T_G:4354692:5,7,1,1
chr3	4403767	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:1,5:2,1:2,1,6,1
chr3	4403817	.	TT	AC	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=51.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,4:2,8:5,3,9,4
chr3	4403837	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=128,201;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:5,2,6,3
chr3	4452676	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=153,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:4,8,0,2
chr3	4452737	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr3	4461698	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,0:0,5:0,0,3,2
chr3	4491046	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,3:8,6:6,8,1,8
chr3	4562667	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=115,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:3,6:6,3:6,3,8,1
chr3	4562844	.	G	GGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=152,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.437:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr3	4686995	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=176,73;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr3	4687470	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=CT;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.693:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	4693937	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,9:0,8:0,0,6,11
chr3	4712710	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	4722956	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	4735161	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=145,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:3,2:11,2,1,2
chr3	4739034	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=130,254;MMQ=50,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:4739034_G_A:4739034:0,4,0,2
chr3	4739038	.	AG	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=130,254;MMQ=50,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:4739034_G_A:4739034:0,4,0,2
chr3	4739040	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=130,254;MMQ=50,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:4739034_G_A:4739034:0,4,0,2
chr3	4819128	.	G	GTATA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=202,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.252:6:3,1:2,0:0|1:4819128_G_GTATA:4819128:0,5,0,1
chr3	4819133	.	TGG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=212,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:4819128_G_GTATA:4819128:0,4,0,1
chr3	4819137	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=212,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:4819128_G_GTATA:4819128:0,4,0,1
chr3	4856993	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr3	4859725	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=105.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,33:0.972:33:0,17:0,16:0,0,25,8
chr3	5022981	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=146,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:3,1:10,0,3,0
chr3	5025098	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=173,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:18,0:17,2:0|1:5025098_T_C:5025098:20,17,1,1
chr3	5025106	.	T	TATGA	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=163,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:21,0:17,2:0|1:5025098_T_C:5025098:22,17,1,1
chr3	5241223	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,12,2
chr3	6903601	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:1,6:0,3:0,1,3,7
chr3	7188063	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=230,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,3,1
chr3	7188072	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=185,244;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:5,1:7,2,2,0
chr3	7188116	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=175,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,3:9,2:15,3,3,2
chr3	7188243	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:11,0:10,8:5,16,0,8
chr3	7456675	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=103,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,4:3,3:4,4,6,1
chr3	7494245	.	TTGTGTGTGTG	T,TTGTGTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27,26;MFRL=0,231,196;MMQ=60,60,60;MPOS=8,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,9,12;RU=TG;STR;TLOD=13.65,6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,2:0.388,0.261:9:1,1,1:2,3,1:2,1,4,2
chr3	7621093	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,3:3,7:0,3,3,7
chr3	8543601	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=192,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:8,5:7,4:9,6,6,3
chr3	8543713	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=33.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,4:0,8:0,0,3,9
chr3	8543757	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:0,7,0,7
chr3	8609071	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=193,193;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=89.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,32:0.785:40:6,17:2,13:5,3,30,2
chr3	8609220	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:15,0:15,2:19,11,0,2
chr3	8667896	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=55.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,5:0,10:0,0,9,6
chr3	8669361	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=129,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.392:31:10,8:9,4:0|1:8669361_C_A:8669361:9,10,6,6
chr3	8669367	.	TG	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=98.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,30:0.969:30:0,18:0,12:0|1:8669361_C_A:8669361:0,0,15,15
chr3	8671319	.	C	CTGACTCACCAGTGGTTCACAGA	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGACTCACCAGTGGTTCACAGA;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.335:23:6,2:9,1:10,5,5,3
chr3	8672476	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=177,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,2:7,0:8,11,0,2
chr3	8675318	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=228,256;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr3	8787247	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=162,67;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.182:18:7,2:8,0:6,9,2,1
chr3	8787313	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=136,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,4:2,4:6,4,4,4
chr3	8931984	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=199,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:2,0,8,0
chr3	8932189	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=125,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:3,7:3,3:4,3,2,8
chr3	8943988	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,6:0,3:1,0,9,0
chr3	8955240	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr3	8983554	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr3	8988809	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=169,228;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr3	8990302	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=175,250;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:2,13,0,2
chr3	9032159	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=143,419;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:7,2,2,0
chr3	9034558	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.249:13:5,2:5,0:8,2,1,2
chr3	9034774	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,340;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	9036010	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:7,1:5,2:8,4,2,1
chr3	9055293	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=256,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	9066853	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=153,229;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr3	9069747	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=116,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.518:23:3,7:8,5:5,6,5,7
chr3	9089254	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,3:0,1:0,0,0,5
chr3	9406661	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=231,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:6,1,4,0
chr3	9407094	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=253,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:0,4,0,4
chr3	9408524	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=255,214;MMQ=22,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,1:7,1:7,0,2,0
chr3	9422334	.	TAG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=230,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr3	9426026	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=196,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:12,4:6,1:0|1:9426026_T_C:9426026:11,7,0,5
chr3	9426028	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=183,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:17,6:0.279:23:10,6:7,0:1|0:9426026_T_C:9426026:5,12,6,0
chr3	9488715	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=110,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,3:8,1:8,6,2,2
chr3	9489334	.	A	ATTTC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=193,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTC;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,1:2,4:0|1:9489334_A_ATTTC:9489334:4,0,5,0
chr3	9489340	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=193,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:2,1:4,5:0|1:9489334_A_ATTTC:9489334:6,0,6,0
chr3	9489767	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	9495385	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=174,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,3:5,3:7,4,5,1
chr3	9506356	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,26;MFRL=123,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:3,4,0,2
chr3	9512104	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=119,271;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:15,3:10,0:19,6,3,0
chr3	9514856	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,314;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr3	9517375	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,161;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:3,1:11,2:4,10,1,2
chr3	9547950	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.784:7:0,2:1,4:0|1:9547950_G_C:9547950:0,1,0,6
chr3	9547959	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:9547950_G_C:9547950:0,1,0,4
chr3	9730319	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:7,2,2,0
chr3	9754144	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=211,96;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr3	9754334	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=182,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,1:5,5,2,1
chr3	9754621	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=219,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,2:5,1:3,5,2,1
chr3	9757086	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=184,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=67.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.770:24:1,7:4,12:3,2,11,8
chr3	9757582	.	CCCT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,4:4,0:0|1:9757582_CCCT_C:9757582:7,3,3,1
chr3	9757586	.	ATGGGCCTCACTT	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=158,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:4,4:6,0:0|1:9757582_CCCT_C:9757582:9,3,3,1
chr3	9757727	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=139,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,1:9,2:5,9,2,1
chr3	9757754	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=209,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,3:3,3:1,6,2,4
chr3	9783147	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,0,3
chr3	9798140	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,3:2,2:4,2,3,2
chr3	9799113	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=266,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,1:2,2:2,5,3,0
chr3	9803126	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=121,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,4:3,6:1,4,6,4
chr3	9804600	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=136,97;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:3,2:7,0:4,7,0,2
chr3	9831680	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:1,4,1,4
chr3	9839458	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,0:3,11:5,7,0,11
chr3	9841989	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,3:0,5:1,0,3,6
chr3	9854865	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=200,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,5:4,3:3,4,2,6
chr3	9854913	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=36,24;MFRL=206,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:2,3:5,2:2,5,1,4
chr3	9859376	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=20,20;MFRL=116,63;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:12,0:2,2:7,7,1,1
chr3	9859395	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:10,0:3,2:5,8,1,1
chr3	9859408	.	G	GCCCA	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=134,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:9,0:2,2:3,8,1,1
chr3	9859456	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=134,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,2:3,0:4,2,0,2
chr3	9859460	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=187,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:2,3,1,1
chr3	9860623	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0,2,5,2
chr3	9867625	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=206,174;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,27:0.792:33:2,5:4,12:3,3,3,24
chr3	9867651	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=169,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=71.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,22:0.794:27:4,0:1,22:3,2,0,22
chr3	9870857	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=153,187;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,1:5,2:6,7,1,2
chr3	9870888	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=165,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:9,7,2,0
chr3	9876301	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	9908736	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=214,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:9908736_G_A:9908736:3,0,1,0
chr3	9908741	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:9908736_G_A:9908736:2,0,1,0
chr3	9918861	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.513:21:6,6:4,3:2,8,6,5
chr3	9918890	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,1:4,1:3,8,0,2
chr3	9920247	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=135,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:3,6,0,2
chr3	9932337	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:1,6:0,7:0,1,13,0
chr3	9944937	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=181,262;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,1,1
chr3	9947997	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:7,4:2,6:6,3,9,1
chr3	9948241	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=207,257;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,2:4,4:2,3,3,3
chr3	9951038	.	TAC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr3	9952788	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=254,208;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:2,1,1,2
chr3	9956279	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=2898590,174;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.732:9:2,6:0,1:1,1,6,1
chr3	9956299	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=118,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr3	9960070	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=216,190;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:9,3:4,10:9,4,5,8
chr3	9962157	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=0,82;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,0:3,2:3,0,1,1
chr3	9962767	.	TATTC	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=278,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ATTC;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.612:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	9969932	.	TGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=265,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,3:2,4:2,1,4,3
chr3	9970081	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=190,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr3	9972021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,3:6,0:7,2,3,0
chr3	9972493	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=178,237;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr3	9974204	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=210,29026912;MMQ=60,55;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:11,0,2,0
chr3	9974982	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=160,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:5,2,1,1
chr3	9975353	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	9979660	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr3	9982445	.	A	AAGGGAGAGGGAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=4,6;RU=AGGGAG;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr3	9984989	.	TGA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GA;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,2:6,0:11,1,3,0
chr3	10016224	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10016224_G_A:10016224:0,2,0,1
chr3	10016227	.	CT	TA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=183,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:10016224_G_A:10016224:0,2,0,1
chr3	10089723	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,2:6,1:6,9,1,2
chr3	10089738	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=171,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:10,2:5,1:6,9,1,2
chr3	10089749	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=205,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:4,11,1,2
chr3	10089772	.	CA	GG	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=102,156;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:7,1:4,1:0|1:10089772_CA_GG:10089772:3,8,0,2
chr3	10089775	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=102,156;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,1:3,1:0|1:10089772_CA_GG:10089772:3,8,0,2
chr3	10091035	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,202;MMQ=52,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:4,0:0,3:1,3,1,3
chr3	10094265	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=181,143;MMQ=58,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:10094265_C_T:10094265:0,4,0,2
chr3	10094271	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=163,143;MMQ=55,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0|1:10094265_C_T:10094265:0,3,0,2
chr3	10094278	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=198,143;MMQ=48,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,2:0,0:0|1:10094265_C_T:10094265:0,3,0,2
chr3	10094281	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=198,143;MMQ=48,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0|1:10094265_C_T:10094265:0,3,0,2
chr3	10103811	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=31,24;MFRL=194,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:0,4:2,10:0,3,12,2
chr3	10103843	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:7,0:13,6:0|1:10103843_C_T:10103843:12,9,6,0
chr3	10103845	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,6:0.241:27:7,0:14,6:0|1:10103843_C_T:10103843:12,9,6,0
chr3	10103931	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=22,26;MFRL=127,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:1,2:3,1:3,3,0,4
chr3	10108951	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,104;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,3:6,1:4,3,4,0
chr3	10157542	.	CCG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=175,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,2:2,0:4,5,0,2
chr3	10167380	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=131,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:9,0:8,3:0|1:10167380_C_T:10167380:9,8,1,2
chr3	10167387	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=138,75;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:6,0:7,2:0|1:10167380_C_T:10167380:7,7,1,2
chr3	10168108	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=245,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:1,3,0,4
chr3	10219729	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,4:1,1:0,3,1,4
chr3	10241987	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=168,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.565:16:4,6:2,3:6,1,8,1
chr3	10242243	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=194,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:7,4:2,2:1,8,1,5
chr3	10251196	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:4,1:3,1,1,2
chr3	10258762	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=118,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:7,10,1,1
chr3	10301805	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=188,203;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,1:6,4,3,0
chr3	10302045	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=153,235;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:10,3:9,2:0|1:10302045_C_T:10302045:14,6,2,3
chr3	10302056	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=156,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:13,3:10,2:0|1:10302045_C_T:10302045:14,10,2,3
chr3	10302369	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=178,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,1,1
chr3	10320200	.	GGGT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGT;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:0,0:0|1:10320200_GGGT_G:10320200:1,2,0,1
chr3	10320205	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=139,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:10320200_GGGT_G:10320200:1,2,0,1
chr3	10342876	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,171;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:4,7:4,7:5,4,8,6
chr3	10380129	.	T	TC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10380129_T_TC:10380129:0,0,0,1
chr3	10380132	.	T	TGCAGCCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:10380129_T_TC:10380129:0,0,0,1
chr3	10380136	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.682:1:0,1:0,0:0|1:10380129_T_TC:10380129:0,0,0,1
chr3	10382111	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,3:1,4:2,0,3,4
chr3	10382148	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,4:1,6:2,1,4,6
chr3	10387059	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=111,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:0,1:1,6:1,0,8,0
chr3	10400643	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=234,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	10401856	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=253,323;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	10413715	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=123,192;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,18:0.653:27:4,10:5,7:7,2,4,14
chr3	10417313	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=167,140;MMQ=60,48;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:16,0:5,3:9,12,0,3
chr3	10420875	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=214,112;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:3,0:5,7:3,5,3,4
chr3	10442779	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=147,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:2,10,0,3
chr3	10452231	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr3	10967711	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:9,1:6,1:8,7,0,2
chr3	10967739	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:11,2:4,1:10,5,2,1
chr3	10971050	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,21;MFRL=160,188;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:6,0:8,7,0,2
chr3	10971062	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,13;MFRL=158,188;MMQ=60,41;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,16;RU=GT;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:6,0:5,8,0,2
chr3	10975745	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=195,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.504:22:6,6:4,5:5,6,3,8
chr3	10976973	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,3:0,0:0,4,0,3
chr3	11071131	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=259,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr3	11075503	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	11076184	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,17;MFRL=266,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.401:3:0,0:1,0:0|1:11076184_C_G:11076184:2,0,1,0
chr3	11076186	.	CCCT	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=254,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:0,1:1,0:0|1:11076184_C_G:11076184:3,0,1,0
chr3	11076189	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=193,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1|0:11076184_C_G:11076184:1,0,1,0
chr3	11076193	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=193,254;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:2,0:0,1:1|0:11076184_C_G:11076184:2,0,1,0
chr3	11076400	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=157,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:3,7,1,1
chr3	11300707	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,9:0,5:0,0,13,1
chr3	11350553	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.199:28:9,2:14,3:7,16,3,2
chr3	11383560	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=0,71;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:2,1,1,1
chr3	11744544	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=225,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	11744584	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	11831953	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=182,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,1:4,3:8,2,3,1
chr3	11832084	.	AG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=182,60;MMQ=60,51;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:11,0:7,2:7,11,0,2
chr3	11880816	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=202,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:1,4,0,7
chr3	12045986	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,1:0,0,9,0
chr3	12046013	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,3:0,0,7,5
chr3	12046124	.	AG	GC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,4
chr3	12046131	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,4
chr3	12046148	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,4
chr3	12046168	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:12046124_AG_GC:12046124:0,0,0,2
chr3	12208652	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,11,2
chr3	12208671	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,13,4
chr3	12208783	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:11,2:4,13,1,1
chr3	12231997	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,60;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:13,0:10,2:14,10,0,2
chr3	12232208	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	12475390	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,90;MMQ=60,39;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,2:3,7,0,2
chr3	12537955	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,20;MFRL=0,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,3:1,0,3,2
chr3	12560763	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=124,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:1,2:1,4:0,3,0,6
chr3	12571420	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.735:9:0,4:2,3:1,1,2,5
chr3	12611640	.	C	CACGT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=114,173;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.278:5:2,1:2,0:2,2,0,1
chr3	12616460	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=161,102;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,4:8,0:10,9,4,0
chr3	12616533	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,2:3,4:2,7,2,4
chr3	12618139	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,25;MFRL=182,154;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:9,4:8,0:0|1:12618139_A_T:12618139:11,6,4,0
chr3	12618144	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=182,154;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:11,4:8,0:0|1:12618139_A_T:12618139:11,8,4,0
chr3	12618262	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=128,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:10,3:7,0:9,8,0,3
chr3	12618269	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,6:3,2:2,6,3,5
chr3	12626516	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,0:4,2:5,3,2,0
chr3	12650482	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr3	12660291	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr3	12778020	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=218,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr3	12778209	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,0:1,2:2,4,2,0
chr3	12779187	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=135,56;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:7,3,2,1
chr3	12790241	.	G	GTAACAAAATTTCAAGAATTAGTTTTCT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=198,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:3,2:5,0:5,3,1,1
chr3	12790338	.	C	CCCTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:12790338_C_CCCTTT:12790338:0,4,0,1
chr3	12790339	.	A	AGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:12790338_C_CCCTTT:12790338:0,4,0,1
chr3	12791172	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,6:0,5:2,1,10,1
chr3	12845158	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr3	12848822	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,9,8
chr3	12849011	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=26.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	12849031	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.391:6:3,0:1,1:0,4,0,2
chr3	12856552	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	12857823	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	12868857	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=74,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr3	12942408	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=194,279;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	12942850	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	12944158	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=121,218;MMQ=56,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.566:9:2,4:2,1:0|1:12944158_CA_C:12944158:3,1,5,0
chr3	12944170	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=171,157;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=24,23;RU=A;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.269:9:5,0:1,2:1|0:12944158_CA_C:12944158:6,1,2,0
chr3	12944206	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=131,157;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.154:17:4,0:8,0:1|0:12944158_CA_C:12944158:5,10,2,0
chr3	12944208	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=27,15;MFRL=131,157;MMQ=60,56;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:15,2:0.154:17:3,0:10,0:1|0:12944158_CA_C:12944158:5,10,2,0
chr3	12949778	.	CTGAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,2:1,1:3,0,3,0
chr3	12954868	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,5:2,3:4,1,6,2
chr3	12956531	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:4,0,5,2
chr3	12963610	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:3,0:10,3,2,0
chr3	12976863	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=261,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	12983423	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	13114408	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=233,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr3	13384829	.	G	GGGAAAGAGAAGGAGGAGGAAGAGAAAGCAGGGAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=54,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.311:6:2,1:3,0:0|1:13384829_G_GGGAAAGAGAAGGAGGAGGAAGAGAAAGCAGGGAA:13384829:3,2,0,1
chr3	13384832	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=97,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,1:0.301:7:1,1:2,0:0|1:13384829_G_GGGAAAGAGAAGGAGGAGGAAGAGAAAGCAGGGAA:13384829:3,3,0,1
chr3	13399948	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=211,169;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr3	13415146	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	13417999	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=125,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,2:2,1:1,5,0,3
chr3	13419123	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=15,30;MFRL=182,165;MMQ=60,44;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr3	13421320	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=192,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.630:11:2,4:1,3:0,4,0,7
chr3	13427998	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr3	13438830	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr3	13439005	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,0,2
chr3	13522973	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	13522977	.	G	GAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=164,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13522977_G_GAT:13522977:0,2,0,1
chr3	13522980	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=164,108;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:13522977_G_GAT:13522977:0,2,0,1
chr3	13544310	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,133;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,0:1,3:4,0,3,0
chr3	13669537	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=281,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,6:2,1:1,1,0,7
chr3	13670837	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr3	13679044	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,4:4,3:5,1,7,0
chr3	13896153	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=160,97;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:8,0:14,4:12,11,1,3
chr3	13916407	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:2,0,6,2
chr3	14173963	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=254,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,7:3,3:5,0,10,0
chr3	14174146	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=254,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,6:5,5:4,5,2,9
chr3	14176446	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=326,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr3	14187345	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,203;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,3:3,6:6,0,9,0
chr3	14187699	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=234,259;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:14187699_T_C:14187699:0,2,0,1
chr3	14187710	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=234,259;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:14187699_T_C:14187699:0,2,0,1
chr3	14188700	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=235,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr3	14188762	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=131,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.300:24:4,4:13,2:10,7,5,2
chr3	14189340	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,206;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,3:4,3:9,0,6,0
chr3	14190237	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=301,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:1,6:1,7:2,0,9,4
chr3	14190268	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,3:6,4:6,5,6,1
chr3	14201400	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr3	14208625	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=157,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,4:5,4:8,2,5,3
chr3	14208647	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:10,2:8,3:14,5,3,2
chr3	14211941	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:11,5,1,1
chr3	14214524	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=152,244;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,1:14,2:13,12,1,2
chr3	14220095	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=182,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,2:7,2:7,6,1,3
chr3	14220517	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=185,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr3	14223224	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=235,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,4:1,5:1,3,1,8
chr3	14519885	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,6:2,0:2,0,6,0
chr3	14520164	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:0,10,0,3
chr3	14520560	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,2:2,0:1,3,3,0
chr3	14526538	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,0:4,4:0,5,1,3
chr3	14537867	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:6,0,2,1
chr3	14538072	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=254,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr3	14548494	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=133,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,2:2,5:7,3,6,1
chr3	14555367	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=174,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr3	14555409	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=187,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:14555409_T_C:14555409:0,3,0,1
chr3	14555411	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=187,254;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:14555409_T_C:14555409:0,3,0,1
chr3	14555739	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,3:7,2:8,1,5,0
chr3	14555758	.	C	CAGTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=170,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:2,1:3,3:4,1,5,0
chr3	14561627	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=45.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,7,6
chr3	14563244	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:7,0:2,2:0,9,0,2
chr3	14563258	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:0,7,0,5
chr3	14702982	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,2:0,0,5,3
chr3	14708918	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr3	14725668	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	14725878	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:5,2:4,1:4,5,2,2
chr3	14744694	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=178,146;MMQ=60,49;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.402:25:12,0:3,9:10,5,0,10
chr3	14745762	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=232,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	14745813	.	CT	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	14745857	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=49,157;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,2:1,9:0,2,4,7
chr3	14756730	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr3	14763381	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=150,1032448;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:1,3,0,2
chr3	14768534	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=179,82;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:6,3,2,1
chr3	14768554	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=102,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:1,1,5,4
chr3	14801550	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:1,6,0,4
chr3	14939088	.	GA	AT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=117,240;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,3:5,1:5,5,2,2
chr3	14939198	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=215,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,2,3
chr3	14939364	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,3,1
chr3	14939679	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	14942024	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=189,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:0,4:1,3:0,1,1,6
chr3	14942675	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	14949102	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=112,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,5:7,3:9,4,5,3
chr3	14949268	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=228,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:0,6,0,6
chr3	14960170	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	14965466	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=168,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,6:0,4:1,0,10,0
chr3	14965507	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,4:0,0,6,2
chr3	15064945	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=288,107;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15064945_C_CA:15064945:0,1,0,1
chr3	15064947	.	C	CACTTTAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=288,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15064945_C_CA:15064945:0,1,0,1
chr3	15073944	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,149;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,0:10,2:8,9,1,1
chr3	15258903	.	CCTT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:3,3:5,1:6,2,1,3
chr3	15259865	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	15301297	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=145,45;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,0:9,5:12,3,0,5
chr3	15301363	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:1,7,1,6
chr3	15311464	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	15455717	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=95,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	15471528	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=207,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.552:12:3,6:2,1:1,4,2,5
chr3	15473515	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:6,0,6,0
chr3	15478009	.	C	CGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTTTTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=191,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.156:16:8,2:6,0:6,8,0,2
chr3	15507761	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=110,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,7:1,1:1,0,8,0
chr3	15512054	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,152;MMQ=60,54;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.233:28:10,6:12,0:14,8,6,0
chr3	15515695	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=89,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.750:17:1,11:2,1:3,1,7,6
chr3	15515874	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	15516820	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr3	15516910	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=54.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:2,10:4,6:3,3,9,7
chr3	15517025	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,6:3,3:0,5,1,8
chr3	15518731	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=57,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,6:4,1:2,5,2,5
chr3	15520639	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=201,310;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,3,0
chr3	15613347	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,36;MFRL=267,257;MMQ=40,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15613347_T_C:15613347:0,1,0,1
chr3	15613355	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=267,257;MMQ=40,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15613347_T_C:15613347:0,1,0,1
chr3	15613371	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=267,257;MMQ=40,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15613347_T_C:15613347:0,1,0,1
chr3	15632999	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=201,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr3	15643043	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	15643435	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=213,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.434:11:2,0:2,0:1,5,0,5
chr3	15718652	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=254,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr3	15736385	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr3	15737610	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,3,1
chr3	15752830	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr3	15756039	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,5:0,4:0,0,9,1
chr3	15756215	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr3	15762696	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=205,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr3	15807725	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,2:0,6:0,0,4,4
chr3	15900950	.	C	CGCCGCT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=250,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GCCGCT;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:15900950_C_CGCCGCT:15900950:0,1,0,1
chr3	15900973	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0|1:15900950_C_CGCCGCT:15900950:0,0,0,4
chr3	15900975	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=217,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:3,0:0,1:1|0:15900950_C_CGCCGCT:15900950:0,3,0,1
chr3	16242101	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=73,265;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,3,0
chr3	16242381	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=195,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr3	16254172	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:5,0:5,3:1,9,2,1
chr3	16264037	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,0:3,3:6,0,3,0
chr3	16305717	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,0:10,2:9,14,0,2
chr3	16343092	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=243,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:0,9:2,7:0,2,14,2
chr3	16343155	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=128,79;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:18,2:21,0:0|1:16343155_C_G:16343155:24,16,2,0
chr3	16343158	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:17,2:21,0:0|1:16343155_C_G:16343155:23,16,2,0
chr3	16450872	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=159,105;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:4,4,3,0
chr3	16535229	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=77,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,3:4,0:4,2,2,1
chr3	16636093	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=124,203;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:2,2:11,1:4,10,0,3
chr3	17051081	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr3	17131421	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=134,300;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:1,5,0,2
chr3	17208484	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=272,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	17209202	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,1:2,2:1,8,1,2
chr3	17226694	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,2,0
chr3	17300133	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=200,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:0,2,0,8
chr3	17413531	.	A	AAAACAAACAAACAAAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=252,244;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=AAAC;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr3	17425385	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=173,95;MMQ=60,21;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:11,4:8,0:13,6,4,0
chr3	17469887	.	ATG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,4:1,0:2,0,4,0
chr3	17470114	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=145,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:0,6,0,6
chr3	18390770	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,30;MFRL=176,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:12,2:0|1:18390770_C_T:18390770:14,9,0,2
chr3	18390784	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,0:10,2:0|1:18390770_C_T:18390770:7,7,0,2
chr3	18390788	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=194,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0|1:18390770_C_T:18390770:8,6,0,2
chr3	18390791	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:10,2:0|1:18390770_C_T:18390770:9,6,0,2
chr3	18390795	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=184,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:18390770_C_T:18390770:10,7,0,2
chr3	18390796	.	TATA	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=25,33;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:18390770_C_T:18390770:10,8,0,2
chr3	18391132	.	CCTG	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,227;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CTG;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,1:7,1:5,8,0,2
chr3	18419859	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=110,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:0,5,1,5
chr3	18427924	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=109,157;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.679:26:3,9:5,9:5,3,7,11
chr3	19295089	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	19436587	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,3:10,3:5,8,2,4
chr3	19498221	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=T;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr3	19925807	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	19926027	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,55;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:9,2:17,0:12,14,2,0
chr3	19930003	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=107,157;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:7,3:4,6:8,3,3,6
chr3	19947105	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:5,1,7,0
chr3	19947296	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	19956962	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=132,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr3	19956995	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=176,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr3	19974700	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,5:0,8:1,0,10,3
chr3	19975582	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	20017489	.	GG	CG,CC	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,30,32;MFRL=288,140,125;MMQ=60,60,60;MPOS=21,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=33.43,17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,12,6:0.605,0.307:19:0,5,4:1,7,2:1,0,9,9
chr3	20082151	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	20113989	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=213,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,3:0,3:0,3,0,6
chr3	20114044	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,3
chr3	20114048	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:20114044_T_C:20114044:0,0,0,3
chr3	20136959	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,297;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr3	20141301	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,2:3,3:6,1,5,0
chr3	20143020	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	20156302	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,5,1
chr3	20168875	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=171,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:7,4,2,0
chr3	20168996	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,100;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:10,0:14,11:11,13,0,11
chr3	20181676	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr3	20212189	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=198,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:2,1,6,3
chr3	20212762	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:19,0:4,5:2,21,0,5
chr3	20212796	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.379:14:5,4:3,1:1,8,0,5
chr3	20216376	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=167,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,4:9,0:12,8,4,0
chr3	20219885	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=144,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,7:3,2:1,3,1,8
chr3	21606027	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=137,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	23848835	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,24;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:8,4:20,1:13,15,2,3
chr3	23848923	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=176,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,2:7,2:4,11,0,4
chr3	23932176	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,19;MFRL=227,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.610:6:1,0:0,2:0,2,0,4
chr3	23934772	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=114,321;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,0:3,2:6,7,2,0
chr3	23959921	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.201:33:13,3:13,3:18,9,6,0
chr3	23987002	.	A	AGGC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	24001078	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=291,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	24006744	.	T	TGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=199,146;MMQ=44,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.339:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr3	24006753	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=199,245;MMQ=44,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	24009279	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	24270493	.	C	CACCTTTCCGA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=176,76;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.227:11:2,2:7,0:0|1:24270493_C_CACCTTTCCGA:24270493:3,6,0,2
chr3	24270496	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=172,76;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,2:8,0:0|1:24270493_C_CACCTTTCCGA:24270493:3,7,0,2
chr3	25542812	.	AATGTAAGTGGAGT	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=154,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:2,2:0|1:25542812_AATGTAAGTGGAGT_A:25542812:4,7,1,1
chr3	25542827	.	TC	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:25542812_AATGTAAGTGGAGT_A:25542812:2,7,1,1
chr3	25542830	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:25542812_AATGTAAGTGGAGT_A:25542812:2,7,1,1
chr3	25542834	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=168,60;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:25542812_AATGTAAGTGGAGT_A:25542812:2,7,1,1
chr3	25611472	.	GACACAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=212,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=AC;STR;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.690:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	25639973	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=142,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:3,1:1,2:0,4,1,2
chr3	25648796	.	GTCA	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=148,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TCA;STR;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,1:8,2:10,5,1,2
chr3	25660094	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,37;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.383:13:6,3:2,1:4,4,3,2
chr3	25661557	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=158,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr3	25674091	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=171,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:10,2:2,0:6,6,1,1
chr3	25775356	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr3	25777500	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=187,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:3,1,1,0
chr3	25805879	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	25833108	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:13,7,2,0
chr3	25836023	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	26752199	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=231,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:1,1:0|1:26752199_C_T:26752199:0,2,0,1
chr3	26752206	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=166,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:26752199_C_T:26752199:0,3,0,1
chr3	27173447	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=200,61;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:5,10,0,2
chr3	27203864	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=213,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr3	27233498	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr3	27233716	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr3	27243119	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=243,274;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,2,0
chr3	27243871	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=145,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr3	27332282	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=271,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0|1:27332282_C_T:27332282:0,2,0,4
chr3	27332302	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=168,271;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.333:7:1,1:3,1:1|0:27332282_C_T:27332282:0,5,0,2
chr3	27332820	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:5,3:4,1:5,5,2,2
chr3	27350384	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:8,6:2,4:5,5,6,4
chr3	27353716	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=105,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,6:2,3:0,4,1,8
chr3	27355767	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=114,257;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.156:36:11,0:20,5:14,17,0,5
chr3	27363637	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.604:10:2,5:2,1:3,1,6,0
chr3	27394419	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=182,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr3	27427521	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,20:0.618:32:7,10:5,10:4,8,8,12
chr3	27475351	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr3	27478834	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=154,176;MMQ=58,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:1,1:3,1,3,0
chr3	27478842	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.458:7:3,0:1,2:4,0,1,2
chr3	27759308	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,13;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.239:10:3,0:1,0:0|1:27759308_T_A:27759308:0,8,0,2
chr3	27759312	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=18,18;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.219:11:2,0:1,0:0|1:27759308_T_A:27759308:0,9,0,2
chr3	27759314	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=18,14;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.262:13:2,0:2,0:0|1:27759308_T_A:27759308:0,10,0,3
chr3	27759338	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=167,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.659:10:2,2:1,5:0,3,0,7
chr3	28304768	.	CT	C	.	.	DP=67;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=110,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,5:0.091:59:17,3:36,2:0|1:28304768_CT_C:28304768:46,8,4,1
chr3	28304801	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:15,1:13,1:0|1:28304768_CT_C:28304768:19,11,0,2
chr3	28454802	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,0:4,2:10,3,0,2
chr3	28557063	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.148:29:18,0:7,3:17,8,4,0
chr3	28557206	.	C	CTGTG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,19;MFRL=181,198;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=TG;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.464:2:0,0:1,0:0,1,0,1
chr3	28562695	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	29476428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:2,5,1,2
chr3	29529907	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0|1:29529907_G_A:29529907:0,0,10,0
chr3	29529913	.	TTC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TC;STR;TLOD=43.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0|1:29529907_G_A:29529907:0,0,11,0
chr3	29628718	.	G	GTTTTTT	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=22,28;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.928:9:0,4:0,3:0|1:29628718_G_GTTTTTT:29628718:0,0,7,2
chr3	29628741	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.841:3:0,2:0,1:0|1:29628718_G_GTTTTTT:29628718:0,0,0,3
chr3	29628743	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.831:3:0,2:0,1:0|1:29628718_G_GTTTTTT:29628718:0,0,0,3
chr3	29804300	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr3	29804487	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,3:5,5:5,7,3,5
chr3	29804509	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,6:4,4:3,4,1,9
chr3	29938822	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,5:7,0:10,3,5,0
chr3	29977739	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	30686414	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:3,8:6,8:4,5,5,11
chr3	30713126	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,21;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.373:14:5,4:4,1:7,2,3,2
chr3	30732821	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=187,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:5,1:1,1:6,0,3,0
chr3	30769948	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=37,30;MFRL=196,248;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr3	30819708	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=159,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:11,12:12,0:18,5,12,0
chr3	30842346	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=225,226;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=AG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:2,0:3,0,2,0
chr3	30842597	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=97,242;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	30885806	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=210,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,4:7,2:8,6,5,1
chr3	31574393	.	T	TTCCTCC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=236,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TCC;STR;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.494:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr3	31621228	.	T	TAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr3	31642037	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=216,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr3	31663515	.	A	AGTGTG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	31674403	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,81;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,0:12,3:14,8,1,2
chr3	31677395	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,10,1
chr3	31705649	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:11,6:2,2:6,7,3,5
chr3	31710054	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=74,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:3,0:7,3,3,0
chr3	31710396	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=153,247;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	31725691	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	32022333	.	GCACA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=206,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=CA;STR;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr3	32030544	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,4:6,1:7,7,2,3
chr3	32031355	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=138,0;MMQ=60,29;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:7,8,0,3
chr3	32032408	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=178,69;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.146:18:9,0:7,2:0|1:32032408_C_T:32032408:10,6,1,1
chr3	32032430	.	A	AATGACAAATAATTGGCAAAG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=169,69;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:0|1:32032408_C_T:32032408:9,7,1,1
chr3	32200322	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=159,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,3:1,0:3,0,3,0
chr3	32490894	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,168;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:5,3:3,9:7,1,10,2
chr3	32491084	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,5:2,1:1,8,1,5
chr3	32533478	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=208,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	32571684	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr3	32571823	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=262,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.526:13:1,1:2,3:2,4,4,3
chr3	32576183	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=157,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,1:9,2:3,8,1,2
chr3	32746288	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=146,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.372:21:9,3:3,5:9,4,5,3
chr3	32761674	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=132,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,1:8,2:5,10,1,2
chr3	32766905	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,6,2
chr3	32804328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=161,2314;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:2,6,0,2
chr3	32805840	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,147;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	32915214	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr3	32933344	.	G	GTC,GTCTC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34,32;MFRL=100,203,185;MMQ=60,60,55;MPOS=19,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=TC;STR;TLOD=5.08,5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.335:6:0,1,0:2,1,2:1,1,0,4
chr3	32995220	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,61;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,2:6,0:0|1:32995220_G_T:32995220:9,8,1,1
chr3	32995224	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:0|1:32995220_G_T:32995220:10,8,1,1
chr3	32995652	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,3:5,1:8,3,2,2
chr3	32997239	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=209,174;MMQ=40,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32997239_C_T:32997239:0,2,0,1
chr3	32997244	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=209,174;MMQ=40,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:32997239_C_T:32997239:0,2,0,1
chr3	32997254	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:32997254_C_A:32997254:0,0,0,2
chr3	32997256	.	CA	AG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:32997254_C_A:32997254:0,0,0,2
chr3	32997262	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0|1:32997254_C_A:32997254:0,0,0,2
chr3	33063050	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,1:6,4:11,3,4,1
chr3	33093190	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,5,5
chr3	33114226	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,154;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:9,0:6,5:6,10,0,5
chr3	33171659	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr3	33174156	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=149,183;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,7:3,6:3,3,5,8
chr3	33174168	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=148,191;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,6:4,6:4,3,4,8
chr3	33175793	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,11:0,8:0,0,5,14
chr3	33175854	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=175,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	33194138	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	33216357	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=220,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:1,1,2,3
chr3	33249488	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,54;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:0,7,1,1
chr3	33255592	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,102;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:1,9:2,7:0,3,7,9
chr3	33339136	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	33414468	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	33414923	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=270,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,8:2,3:0,3,5,6
chr3	33419736	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=250,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr3	33426900	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=212,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	33434954	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.396:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr3	33444286	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,9:7,2:8,4,7,4
chr3	33481400	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=153,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	33552004	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:4,0:3,5:4,3,3,2
chr3	33557605	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=205,152;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:4,0:9,5:7,6,0,5
chr3	33558407	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:3,1:3,1:7,0,1,1
chr3	33612364	.	TAA	T,TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28,19;MFRL=0,196,252;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.27,7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.389,0.514:7:0,1,1:0,1,1:0,0,0,7
chr3	33626186	.	GA	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=115,327;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	33626229	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=115,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:7,1:0,1:4,3,2,0
chr3	33645814	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=278,167;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.406:13:4,0:4,5:1,7,0,5
chr3	33648301	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33648301_C_A:33648301:0,0,0,1
chr3	33648303	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33648301_C_A:33648301:0,0,0,1
chr3	33648308	.	A	AT	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,22;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33648301_C_A:33648301:0,0,0,1
chr3	33648309	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:33648301_C_A:33648301:0,0,0,1
chr3	33653622	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=143,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,1,1
chr3	33668662	.	ATTAAGT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=132,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,2:1,0:1,5,0,2
chr3	33673767	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=162,85;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,2:10,1:11,7,1,2
chr3	33729801	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.147:29:11,2:14,2:10,15,2,2
chr3	33866868	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=100,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.708:15:2,7:2,4:2,2,1,10
chr3	33866929	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=170,250;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr3	33870363	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=146,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.185:21:9,0:7,3:10,8,0,3
chr3	33870393	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:14,2:4,0:5,13,2,0
chr3	33877500	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=236,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.461:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	33879602	.	CTA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr3	33887102	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,207;MMQ=60,51;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr3	33893929	.	CTT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:0,1:1,1,3,0
chr3	33893958	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=35,19;MFRL=163,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.627:9:0,1:3,2:1,2,6,0
chr3	33893987	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=112,88;MMQ=49,31;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,1:5,2:3,6,1,2
chr3	33907835	.	T	TCTCC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,6:9,2:5,11,5,5
chr3	33907945	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,180;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:5,2:4,2:7,2,4,0
chr3	35724256	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	35731710	.	A	ATAATTGTGCTGCTTCAGTATAAACTGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=180,233;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	35731725	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=167,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	35780734	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,2:3,1:0|1:35780734_G_T:35780734:7,0,3,0
chr3	35780735	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,3:0.286:12:4,2:5,1:1|0:35780734_G_T:35780734:9,0,3,0
chr3	35785296	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:6,1,3,0
chr3	36422064	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=170,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:5,0,4,0
chr3	36422126	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:5,2:7,5:0|1:36422126_C_T:36422126:7,5,5,2
chr3	36422135	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.400:18:5,2:5,5:0|1:36422126_C_T:36422126:6,5,5,2
chr3	36422216	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:9,5:2,4:5,6,4,5
chr3	36422286	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=185,44;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:10,0:0|1:36422286_T_A:36422286:5,12,1,1
chr3	36422288	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=185,44;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,2:9,0:0|1:36422286_T_A:36422286:5,12,1,1
chr3	36422290	.	C	CTTA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=185,44;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,2:9,0:0|1:36422286_T_A:36422286:4,12,1,1
chr3	36524405	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.404:13:5,4:2,1:8,0,5,0
chr3	36534622	.	CTCTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,4:3,0:5,6,2,2
chr3	36570279	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=196,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr3	36872819	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr3	36887973	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:0,6,0,3
chr3	36896653	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr3	36896794	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,1:12,1:8,12,2,0
chr3	37032770	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:16,0:10,3:12,14,0,3
chr3	37048633	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=330,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	37062040	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=224,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr3	37067050	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr3	37096057	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=223,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:0,10,0,2
chr3	37107470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=252,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,5:1,4:1,1,1,8
chr3	37133124	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=205,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr3	37144535	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=250,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.800:18:1,6:2,9:1,2,3,12
chr3	37150988	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:1,2,6,3
chr3	37170717	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=287,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr3	37190376	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=209,72;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:5,0:9,2:12,4,1,1
chr3	37285152	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=213,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.461:22:7,6:4,3:5,7,3,7
chr3	37360696	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.268:17:8,3:5,1:7,6,1,3
chr3	37366876	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:16,1:12,1:19,9,2,0
chr3	37369209	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=135,73;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,3:10,0:11,9,2,1
chr3	37370065	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=152,165;MMQ=60,57;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:9,0:9,5:0|1:37370065_C_T:37370065:4,14,0,5
chr3	37370068	.	C	CA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=152,165;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.240:23:9,0:9,5:0|1:37370065_C_T:37370065:4,14,0,5
chr3	37376500	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=118,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:3,0,5,1
chr3	37476427	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=202,85;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:7,1:4,1:4,7,2,0
chr3	37512646	.	TG	CC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	37514881	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:14,0:13,3:16,11,1,2
chr3	37514968	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:3,6,0,2
chr3	37522875	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=236,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,0:4,6:6,1,6,0
chr3	37549983	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	37550027	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=141,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.508:6:0,1:3,2:3,0,3,0
chr3	37560708	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,1:4,4:6,3,5,0
chr3	37575039	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	37670876	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=197,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,6:2,0:0,6,0,6
chr3	37778481	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=128,205;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:5,1:8,2:7,7,1,2
chr3	37818805	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:6,0,6,0
chr3	37988787	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=218,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37988787_A_G:37988787:0,2,0,1
chr3	37988789	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=218,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37988787_A_G:37988787:0,2,0,1
chr3	38012899	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=197,181;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,2:5,0:10,5,2,0
chr3	38022163	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=137,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr3	38035508	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:3,13,0,2
chr3	38040909	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=138,23;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:13,2:18,0:17,14,1,1
chr3	38044592	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=142,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr3	38047527	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=174,75;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:5,4,0,2
chr3	38050159	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr3	38051211	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=150,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,1:5,2:3,9,1,2
chr3	38053206	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:5,1:3,1:1,7,0,2
chr3	38087024	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=248,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,3:3,5:3,3,5,3
chr3	38105467	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,15;MFRL=138,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.193:26:7,0:4,0:4,17,0,5
chr3	38105487	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=22,31;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.304:17:7,0:4,4:0,12,0,5
chr3	38134438	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	38138797	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=204,82;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=33.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:6,0:5,12:4,7,0,12
chr3	38139324	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=134,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,2:10,2:7,11,2,2
chr3	38153096	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=190,277;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	38153840	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=99,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,2:15,0:9,14,1,1
chr3	38158982	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=221,265;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:4,1:5,4,2,1
chr3	38159546	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=242,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:2,1,0,4
chr3	38168125	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,1:5,3:2,8,2,2
chr3	38168210	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=203,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:2,7,0,3
chr3	38182136	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=190,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,5:2,3:4,5,3,5
chr3	38207529	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:2,0:5,3:0,7,0,4
chr3	38257567	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.363:22:7,3:7,5:13,1,8,0
chr3	38289251	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=205,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:0|1:38289251_C_G:38289251:1,7,2,6
chr3	38289275	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=212,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0|1:38289251_C_G:38289251:0,3,3,2
chr3	38293904	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,3:5,3:2,5,1,5
chr3	38307803	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,54;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	38347633	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,4:4,1:3,5,3,2
chr3	38347851	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=235,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:3,3,2,4
chr3	38348686	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,5,1
chr3	38350630	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=170,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,5:3,0:1,7,2,3
chr3	38355176	.	T	TGTGTGTGTGTGTGCGCGCGC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=234,122;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.513:13:3,4:2,2:4,2,6,1
chr3	38355184	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=122,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.220:11:7,1:2,1:6,3,1,1
chr3	38355225	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=167,242;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.377:21:7,2:6,4:5,8,5,3
chr3	38355509	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=247,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr3	38390020	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr3	38401839	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,11,9
chr3	38401918	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,5,10
chr3	38402007	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	38406648	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.948:16:0,7:0,8:0,0,11,5
chr3	38406773	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,6:0,10:0,0,8,9
chr3	38406793	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,5,7
chr3	38408248	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr3	38408459	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	38409600	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,7,3
chr3	38411742	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=167,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.325:4:1,0:2,1:0|1:38411742_C_T:38411742:0,3,0,1
chr3	38411752	.	C	CATATATACGCACGTAT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=226,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:38411742_C_T:38411742:0,3,0,1
chr3	38438457	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=159,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr3	38442490	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,5:1,10:0,2,7,8
chr3	38454497	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:5,10,0,2
chr3	38521156	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=160,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.763:19:3,12:1,3:1,3,7,8
chr3	38524592	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=177,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:13,1:5,1:13,5,2,0
chr3	38548388	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,52;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:7,5:7,0:9,5,5,0
chr3	38598136	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	38627629	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	38646423	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr3	38648062	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	38739845	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=224,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,8:4,4:2,4,4,8
chr3	38739847	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=163,250;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:5,11,1,1
chr3	38751047	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=187,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:7,2:0|1:38751047_G_C:38751047:8,7,0,2
chr3	38751057	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,1:0|1:38751047_G_C:38751047:9,7,0,2
chr3	38753977	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr3	38780971	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=149,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,2:1,0:6,3,2,0
chr3	38784029	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=95,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:4,2:1,3:3,2,2,3
chr3	38791605	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:4,0:0|1:38791605_C_A:38791605:6,4,1,1
chr3	38791606	.	T	TTGTGGTTGG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=163,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:38791605_C_A:38791605:6,4,1,1
chr3	38798724	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:38798724_G_A:38798724:0,0,0,1
chr3	38798725	.	AGTTTTATGTC	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=217,97;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:38798724_G_A:38798724:0,1,0,1
chr3	38798737	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,24;MFRL=217,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38798724_G_A:38798724:0,1,0,1
chr3	38798744	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=217,97;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:38798724_G_A:38798724:0,1,0,1
chr3	38812708	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=192,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr3	38888740	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:38888740_G_T:38888740:3,4,2,0
chr3	38888743	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:38888740_G_T:38888740:3,4,2,0
chr3	38913189	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=148,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,2:3,3:3,3,1,5
chr3	38926912	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:2,7,1,5
chr3	38938299	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.858:8:1,2:0,2:1,0,5,2
chr3	38949363	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	38951753	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=257,232;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr3	38961537	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:0,1:9,1:0,9,1,1
chr3	38962577	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:2,1:8,1:8,2,0,2
chr3	38967103	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.321:8:1,2:4,0:0,6,0,2
chr3	39108056	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=118,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:7,3:4,0:8,4,1,2
chr3	39110246	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:2,4:7,4:5,4,7,1
chr3	39110376	.	TA	T,TAA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=24,28,28;MFRL=105,123,114;MMQ=60,60,60;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.86,14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,3,9:0.158,0.412:22:6,2,4:4,1,5:2,8,5,7
chr3	39119615	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:6,5,4,0
chr3	39125609	.	CTTAATA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:3,1,6,2
chr3	39129742	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=251,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:3,2,2,2
chr3	39144910	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=165,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,5:2,3:2,0,6,2
chr3	39149092	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,327;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	39152248	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	39152575	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=208,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr3	39161456	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=165,133;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:6,3:3,4:0|1:39161456_G_A:39161456:3,7,2,5
chr3	39161464	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:7,2:4,4:0|1:39161456_G_A:39161456:3,8,2,4
chr3	39166484	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=144,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr3	39166509	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	39166701	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=301,288;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,1:0|1:39166701_G_T:39166701:1,2,0,1
chr3	39166708	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=301,288;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:39166701_G_T:39166701:1,2,0,1
chr3	39166711	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=301,288;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:39166701_G_T:39166701:1,2,0,1
chr3	39166743	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,5:0,0,5,5
chr3	39167905	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr3	39170732	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.331:25:8,0:9,7:14,3,0,8
chr3	39170747	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=146,111;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:8,0:11,7:15,5,0,9
chr3	39170763	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=139,111;MMQ=60,49;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,0:9,9:12,5,0,9
chr3	39171676	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=194,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:3,3,5,1
chr3	39174462	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,0:2,4:8,0,3,1
chr3	39177949	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=207,49;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:7,2:6,0:6,7,2,0
chr3	39178899	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.631:9:1,5:2,0:3,0,2,4
chr3	39179859	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:5,2:6,6,1,3
chr3	39179909	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,6:5,6:3,3,6,6
chr3	39180162	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=141,97;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:7,4:9,2:7,9,3,3
chr3	39180263	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:6,5:0,4:0|1:39180263_G_A:39180263:1,5,5,4
chr3	39180272	.	GG	TT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:39180263_G_A:39180263:5,8,1,1
chr3	39180275	.	C	CCAAAACCT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=166,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:8,2:3,0:0|1:39180263_G_A:39180263:5,7,1,1
chr3	39184522	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=177,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:6,5:8,0:13,2,5,0
chr3	39185968	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=118,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr3	39186038	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=118,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	39187955	.	GA	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:8,1:11,0:11,8,2,0
chr3	39188182	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:5,4:3,4:5,4,4,4
chr3	39225585	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,4:6,1:4,8,2,3
chr3	39227899	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,10;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:13,0:0|1:39227899_T_A:39227899:17,6,1,1
chr3	39227903	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:39227899_T_A:39227899:16,6,1,1
chr3	39227905	.	G	GTA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=119,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:14,2:0|1:39227899_T_A:39227899:16,6,1,1
chr3	39373902	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=137,159;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:8,2:4,2:6,6,2,2
chr3	39374488	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=186,232;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,0:8,5:7,8,5,0
chr3	39374587	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=194,86;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.214:15:5,2:7,0:6,6,1,2
chr3	39375140	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=146,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:4,1:4,1:1,7,1,1
chr3	39431996	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.303:31:15,0:7,9:9,13,0,9
chr3	39433147	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,3,13
chr3	39435865	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=140,246;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:8,0:3,2:8,3,2,1
chr3	39437800	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	39450065	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,3:11,1:12,6,2,2
chr3	39450276	.	C	CAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=137,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AT;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:3,1:6,1:1,8,0,2
chr3	39453057	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=264,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr3	39453160	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=194,104;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.251:6:5,0:0,1:0,5,0,1
chr3	39453183	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=150,142;MMQ=40,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39453183_A_T:39453183:0,3,0,1
chr3	39453185	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=150,142;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:39453183_A_T:39453183:0,3,0,1
chr3	39453610	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,0,2
chr3	39543487	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	39554946	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:6,4:8,4:7,7,5,3
chr3	40204178	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=126,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr3	40231383	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=182,95;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:3,0:6,3:4,6,2,1
chr3	40251282	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr3	40251392	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=165,186;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.817:12:1,6:0,4:0,2,4,6
chr3	40251628	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:0,2,0,8
chr3	40275461	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=166,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,2:5,3:7,5,2,3
chr3	40291836	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:7,6,0,2
chr3	40291983	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=148,286;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,1:11,2:12,7,0,3
chr3	40352355	.	ATTT	A,ATT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29,29;MFRL=138,96,187;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,15;RU=T;STR;TLOD=6.92,12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,7:0.272,0.502:14:0,1,4:2,2,2:2,1,8,3
chr3	40352640	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,0,11
chr3	40352884	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=259,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:8,0,4,0
chr3	40352995	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,74;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:19,0:7,3:15,11,2,1
chr3	40353425	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:1,3,2,0
chr3	40429437	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=278,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	40503809	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=40,26;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:6,6:0,2:0,6,0,8
chr3	40528242	.	CT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	40552916	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=108,67;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,5:4,1:2,3,4,2
chr3	40557271	.	TTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=237,215;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=TG;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	40557821	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.316:17:4,0:8,5:0|1:40557821_C_A:40557821:4,8,0,5
chr3	40557824	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=159,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:4,0:8,5:0|1:40557821_C_A:40557821:4,8,0,5
chr3	41266708	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=164,80;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,3:11,0:10,11,0,3
chr3	41267243	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=167,125;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.101:32:20,0:9,2:15,14,0,3
chr3	41267307	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,0:13,2:10,9,0,3
chr3	41274764	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr3	41277915	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,1:8,3:6,14,0,4
chr3	41279440	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:15,1:4,2:15,4,3,0
chr3	41291081	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=140,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:7,0:5,7,1,2
chr3	41607701	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	41756845	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=147,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.221:21:8,4:8,0:6,11,1,3
chr3	41841716	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,185;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:3,4,2,3
chr3	41877473	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:3,1:3,2:1,5,0,4
chr3	41925260	.	CAGAGAAAAAACAAGTGA	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	41925301	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=31.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	41938500	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,3,2
chr3	41939993	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.899:18:0,13:1,3:0,1,7,10
chr3	41942199	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	41952781	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=68.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.960:23:0,11:0,12:0,0,14,9
chr3	41961168	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=152,100;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:4,3,1,2
chr3	41977214	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	41977488	.	CCT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,0,9
chr3	41996275	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,6:0,0,3,10
chr3	42133149	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr3	42201759	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=252,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:0,1:2,1:2,0,3,0
chr3	42202061	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	42226151	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=301,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=44.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.761:19:3,5:1,9:3,1,14,1
chr3	42234758	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=225,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:0,4,0,6
chr3	42235280	.	TATCTTAGGAAGTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,2:7,2:8,11,2,2
chr3	42244321	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,2:2,5:0,2,0,7
chr3	42251577	.	CGGA	C,CGGAGGA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30,28;MFRL=241,181,194;MMQ=60,60,60;MPOS=11,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=GGA;STR;TLOD=12.84,13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,4,5:0.338,0.444:11:1,0,4:1,4,0:1,1,4,5
chr3	42305131	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=69.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,7,13
chr3	42438754	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=229,154;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.779:25:3,12:2,8:4,1,14,6
chr3	42448296	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=210,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	42560882	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=170,231;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:1,0:4,2:2,4,0,2
chr3	42569715	.	TC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=260,110;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	42573767	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=209,153;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:8,10,0,2
chr3	42576776	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=142,240;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:2,0:7,3:8,2,0,3
chr3	42598980	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=179,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,5,1
chr3	42599049	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=240,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.376:11:3,2:4,2:7,0,3,1
chr3	42599091	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=235,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.613:21:3,8:4,4:5,3,6,7
chr3	42599234	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=239,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:0,4:6,6:0,6,1,9
chr3	42605006	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,80;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:9,7:15,0:19,5,6,1
chr3	42672010	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=119,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.235:32:15,7:9,0:0|1:42672010_C_G:42672010:12,13,7,0
chr3	42672012	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,7:0.229:33:15,7:9,0:0|1:42672010_C_G:42672010:12,14,7,0
chr3	42672019	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=122,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.242:31:14,7:10,0:0|1:42672010_C_G:42672010:10,14,7,0
chr3	42679327	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,4:8,0:8,2,4,0
chr3	42728144	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=70,138;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.782:16:2,6:1,7:1,2,4,9
chr3	42733341	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:7,2,4,0
chr3	42738297	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr3	42738311	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,12;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.498:6:1,0:1,0:0|1:42738311_A_C:42738311:0,3,3,0
chr3	42738317	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.398:8:1,0:2,0:0|1:42738311_A_C:42738311:2,3,3,0
chr3	42772180	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=223,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	42774475	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,240;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr3	42784630	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	42799554	.	TACACACAC	T,TACACACACACACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28,23;MFRL=321,209,177;MMQ=60,60,40;MPOS=24,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,20;RU=AC;STR;TLOD=5.42,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.433,0.283:4:1,2,0:0,0,1:1,0,3,0
chr3	42799858	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	42827437	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=130,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,0:1,5:4,0,5,0
chr3	42906345	.	C	CGTTGTAGGGTGTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=127,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:2,3,0,2
chr3	42907411	.	T	TCTCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CTCC;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.318:7:2,0:4,1:0,6,0,1
chr3	42908370	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,21;MFRL=173,266;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.514:4:0,1:1,0:1,1,0,2
chr3	42947776	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	42956790	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,2:10,4:9,10,1,5
chr3	43094974	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,164;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.195:27:10,4:12,0:22,0,5,0
chr3	43097045	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:0|1:43097045_T_A:43097045:6,7,1,1
chr3	43097047	.	G	GTGATTAGAGCTAT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=160,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:4,2:8,0:0|1:43097045_T_A:43097045:6,7,1,1
chr3	43121385	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=200,140;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.229:20:5,0:10,4:10,6,0,4
chr3	43408582	.	G	GGAAATCAGATTCTCTCCCTTCCCC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:1,1:3,0:0,5,0,1
chr3	43591142	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=15215367,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:1,6:2,0,5,1
chr3	43642126	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=98,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr3	43756577	.	C	CTG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=214,263;MMQ=60,56;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=TG;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.495:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr3	44283525	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,2,1
chr3	44308662	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=204,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:44308662_C_T:44308662:1,5,1,1
chr3	44308664	.	T	TCGTA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=204,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0|1:44308662_C_T:44308662:1,5,1,1
chr3	44332176	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	44345646	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr3	44364825	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=222,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,1,3
chr3	44373384	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=149,89;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:10,8,0,2
chr3	44373517	.	CTTT	C,CT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=20,37,29;MFRL=159,187,211;MMQ=60,60,60;MPOS=23,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.64,3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.212,0.229:10:1,0,1:2,2,1:0,6,0,4
chr3	44399668	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=253,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:0,1:1,5:1,0,6,0
chr3	44408864	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	44434311	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=103,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,5:5,3:4,5,6,2
chr3	44437870	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,8:0,15:0,0,16,7
chr3	44489880	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,2:5,3:8,2,3,2
chr3	44609829	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,3:10,0:4,13,0,3
chr3	44612158	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:2,4,0,2
chr3	44612895	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,1:0,1:0,0,1,2
chr3	44816851	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,0:6,3:6,8,3,0
chr3	44827967	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=126,261;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:5,8,0,2
chr3	44839100	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,3:8,0:6,7,3,0
chr3	44846477	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=86,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.364:11:2,2:1,2:6,1,3,1
chr3	44867681	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:8,0:11,7:10,9,0,7
chr3	44871505	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,9:7,2:4,4,8,3
chr3	44893815	.	ATGTCAGGCTTGCTGAGGTAAACCT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=174,91;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,1:8,1:2,21,0,2
chr3	44905770	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=106,286;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:11,3:14,2:10,15,5,0
chr3	44926857	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=168,109;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,3:9,3:10,5,4,2
chr3	44938303	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=198,161;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.216:15:9,0:3,2:8,4,0,3
chr3	44952407	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:6,0,4,1
chr3	44974570	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=180,133;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,2:11,0:11,7,2,0
chr3	45017782	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=164,172;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:6,5,2,1
chr3	45030564	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=140,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,1:7,1:8,3,2,0
chr3	45030749	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:8,4:10,1:6,12,2,3
chr3	45042934	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	45076972	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=196,163;MMQ=60,39;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr3	45130582	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=116,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:14,0:13,3:16,11,0,3
chr3	45132577	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:1,0,3,0
chr3	45132637	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=160,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:2,0:0,4:2,1,4,0
chr3	45137087	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=158,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,9:1,8:0,2,6,11
chr3	45151954	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,77;MMQ=60,43;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.115:32:11,3:18,0:15,14,2,1
chr3	45153676	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:10,2:7,0:7,10,2,0
chr3	45187671	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,5:3,5:2,1,7,3
chr3	45267058	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=218,283;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,1,2
chr3	45461102	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=57.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chr3	45500174	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,4,1
chr3	45515648	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=126,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr3	45527099	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	45527218	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,7:0,18:0,0,12,13
chr3	45542083	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=177,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:2,6,0,3
chr3	45557707	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.479:17:5,4:3,4:4,5,4,4
chr3	45559621	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=190,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	45583297	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=197,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr3	45637439	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=188,190;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:6,7:2,4:4,4,7,4
chr3	45637830	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=152,141;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,2:4,4:6,7,2,4
chr3	45677635	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=63.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.943:15:0,12:0,3:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,9,6
chr3	45677638	.	CA	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=63.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,12:0,3:0|1:45677635_C_CT:45677635:0,0,9,6
chr3	45677815	.	G	GAGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGA;STR;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,4:0,4,1,6
chr3	45715767	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=116,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,1:4,3:2,2,1,3
chr3	45718602	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=250,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr3	45730910	.	CGCGGG	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCGGG;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:5,0:13,4,1,1
chr3	45748429	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=131,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:3,4:4,2:0|1:45748429_G_A:45748429:2,5,1,5
chr3	45748435	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:0|1:45748429_G_A:45748429:1,5,0,5
chr3	45754749	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr3	45755579	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,3:8,0:8,10,0,3
chr3	45761115	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:0,5,2,4
chr3	45763635	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=115,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:1,9:2,2:0,3,2,9
chr3	45764544	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	45765132	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr3	45772742	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=137,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,2:3,3:3,4,3,2
chr3	45772772	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,4:5,10:5,8,9,5
chr3	45773732	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr3	45784963	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=158,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0|1:45784963_T_C:45784963:2,0,2,0
chr3	45784972	.	GGT	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=158,294;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:45784963_T_C:45784963:2,0,1,0
chr3	45804391	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=188,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr3	45812650	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,272;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	45813025	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	45814094	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:2,7,1,1
chr3	45821624	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=134,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,1,4
chr3	45943595	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,254;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,0:7,4:11,5,3,1
chr3	45977866	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,302;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,1:5,1:7,2,2,0
chr3	45977899	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,11,2
chr3	46007702	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=209,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	46016850	.	G	GTTCCTC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=191,65;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.162:16:7,2:6,0:0|1:46016850_G_GTTCCTC:46016850:4,10,1,1
chr3	46016851	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,6:0.389:16:6,2:3,4:1|0:46016850_G_GTTCCTC:46016850:2,8,3,3
chr3	46016852	.	T	TGTCTATCACTATGAAACAG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=191,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,1:7,0:0|1:46016850_G_GTTCCTC:46016850:4,10,1,1
chr3	46026259	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=182,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:5,1,4,0
chr3	46400756	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,216;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=43.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:13,0:7,15:8,13,0,15
chr3	46416371	.	GAGGATGGGAAGGAGGGAGGTATTCGTA	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.133:30:8,2:7,1:13,14,2,1
chr3	46416470	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,15:0.590:25:5,5:5,9:0|1:46416470_G_T:46416470:5,5,4,11
chr3	46416491	.	GGA	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=143,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:12,1:15,1:0|1:46416470_G_T:46416470:10,17,0,2
chr3	46417069	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=120,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:6,5,3,3
chr3	46450131	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:5,3,2,0
chr3	46450297	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:12,1:9,2:10,11,1,2
chr3	46479668	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=169,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr3	46484898	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=104,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.630:17:2,6:4,4:4,2,9,2
chr3	46501284	.	C	CCTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.931:11:0,6:0,4:0,0,2,9
chr3	46592879	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	46593147	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=142,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr3	46713102	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:10,2:4,2:6,8,1,3
chr3	46714797	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=143,309;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,2,0
chr3	46714821	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=153,309;MMQ=60,60;MPOS=34;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:4,2,2,0
chr3	46717931	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=176,227;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr3	46717957	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=201,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr3	46718298	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,1,4
chr3	46719835	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,1:5,1:4,6,0,2
chr3	46722692	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=201,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr3	46726948	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,4:2,5:3,0,9,0
chr3	46730749	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:6,2:3,2:10,0,3,1
chr3	46750553	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr3	46751073	.	TAAG	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AAG;STR;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:4,3:3,0:7,2,2,1
chr3	46785452	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=166,112;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.205:17:8,3:6,0:9,5,2,1
chr3	46902399	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=214,103;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:6,0:7,8,2,0
chr3	46925180	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	46963502	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=117,270;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:5,1:8,3:9,4,4,0
chr3	46965197	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=146,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,1:9,1:6,16,0,2
chr3	46966898	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.659:18:4,9:1,3:1,5,7,5
chr3	46967040	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:4,8:2,8:5,1,5,11
chr3	46982503	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,1:6,2:7,7,1,2
chr3	46982530	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,94;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,5:6,0:5,9,5,0
chr3	47021509	.	CGCGCGCGCGG	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	47033937	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,248;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:1,1:9,1:8,2,1,1
chr3	47035900	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr3	47036073	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:1,5,0,2
chr3	47037096	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=184,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:4,3:4,3,1,2
chr3	47038135	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr3	47041471	.	G	GCT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,31;MFRL=87,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47041471_G_GCT:47041471:1,1,0,1
chr3	47041472	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=87,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47041471_G_GCT:47041471:1,1,0,1
chr3	47041474	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=87,114;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:47041471_G_GCT:47041471:1,1,0,1
chr3	47041478	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:47041471_G_GCT:47041471:0,1,0,1
chr3	47043386	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=244,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:3,3,2,2
chr3	47044122	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,4:0,13:0,0,10,7
chr3	47047176	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:7,7,2,0
chr3	47047358	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=184,231;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,1:10,2:10,9,1,2
chr3	47048452	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	47048818	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:7,2,0,2
chr3	47049017	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=189,131;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:9,0:9,7,2,0
chr3	47050631	.	GGTGGGGAGGCCCCTCGAACGGGGCGGGGC	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=227,46;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.231:16:3,0:4,3:10,3,3,0
chr3	47059323	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=187,283;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr3	47098695	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:13,2:14,0:19,8,0,2
chr3	47103861	.	GTTT	G,GTT	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=134,180,128;MMQ=60,60,60;MPOS=15,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.32,9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,5,6:0.153,0.233:31:4,2,2:7,2,2:0,20,0,11
chr3	47108515	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,224;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:6,5,2,0
chr3	47125229	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=154,65;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:10,0:11,4,2,0
chr3	47125916	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=16,20;MFRL=190,210;MMQ=50,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:0,0:0,2,0,2
chr3	47129747	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=148,115;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.307:14:7,0:3,4:5,5,2,2
chr3	47205502	.	CGCGGCGGCG	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=261,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,7;RU=GCG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr3	47277885	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:0,1:8,2:7,1,3,0
chr3	47286227	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr3	47287603	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0|1:47287603_A_AT:47287603:0,0,7,3
chr3	47287615	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=160,32;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:8,0:6,1:0|1:47287603_A_AT:47287603:7,7,1,1
chr3	47287622	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=172,32;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:0|1:47287603_A_AT:47287603:6,8,1,1
chr3	47305928	.	TTTTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.777:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	47316725	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	47318747	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=66.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,12:0,7:0,0,12,7
chr3	47361082	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=222,127;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.749:6:0,4:1,1:1,0,2,3
chr3	47363971	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	47376095	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	47451378	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:6,2:0|1:47451378_A_T:47451378:11,2,1,1
chr3	47451385	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=150,100;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:47451378_A_T:47451378:10,4,1,1
chr3	47451411	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.938:14:0,4:0,7:0,0,7,7
chr3	47452025	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	47452118	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,25;MFRL=184,137;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,5:1,4:3,1,1,8
chr3	47452137	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=31,17;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:47452137_G_C:47452137:0,5,2,0
chr3	47452142	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,15;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,0:0|1:47452137_G_C:47452137:0,3,2,0
chr3	47452148	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0|1:47452137_G_C:47452137:0,3,2,0
chr3	47452156	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,13;MFRL=134,129;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0,4,1,0
chr3	47453216	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,1,2
chr3	47454381	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=163,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.404:5:0,0:3,0:0,3,2,0
chr3	47454399	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=8,27;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.795:6:0,1:0,4:1,0,0,5
chr3	47455261	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr3	47456225	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chr3	47459237	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,0:9,2:2,12,0,2
chr3	47459564	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=234,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr3	47462587	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0|1:47462587_A_G:47462587:0,0,1,9
chr3	47462591	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=140,36898649;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.275:9:1,2:5,0:0|1:47462587_A_G:47462587:0,7,0,2
chr3	47463859	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:5,0,4,0
chr3	47539751	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	47543389	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=182,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:0,6,0,2
chr3	47604258	.	G	GC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=227,106;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47604258_G_GC:47604258:2,1,0,1
chr3	47604259	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=227,106;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47604258_G_GC:47604258:2,1,0,1
chr3	47604261	.	G	GCTA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,31;MFRL=227,106;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:47604258_G_GC:47604258:2,1,0,1
chr3	47604266	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=202,106;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:47604258_G_GC:47604258:1,1,0,1
chr3	47604299	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	47614413	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr3	47676902	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,221;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	47680119	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:0,1:1,7:0,1,8,0
chr3	47734700	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,107;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:2,3:6,0:4,5,1,2
chr3	47779460	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,0:5,2:6,4,2,0
chr3	47882727	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	47913498	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=213,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:4,5:9,3:7,6,4,4
chr3	47956424	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:1,6,2,2
chr3	47956506	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr3	48019258	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr3	48209486	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr3	48219320	.	AAC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.933:11:0,5:0,5:0,0,10,1
chr3	48219537	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=224,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr3	48222216	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=168,48;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:5,5,0,2
chr3	48222240	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=168,48;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0|1:48222240_G_A:48222240:6,4,0,2
chr3	48222247	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=181,48;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:6,2:6,0:0|1:48222240_G_A:48222240:8,4,0,2
chr3	48228083	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,19;MFRL=178,177;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,1:2,0:6,0,2,0
chr3	48228098	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=173,96;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:4,0:12,0,3,0
chr3	48282620	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=135,65942820;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:10,4:10,0:11,9,1,3
chr3	48282651	.	TGCGC	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=131,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=GC;STR;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:5,2:4,3:4,9,3,2
chr3	48282695	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=118,111;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,0:6,4:2,7,1,3
chr3	48338173	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=222,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr3	48342669	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=217,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:4,0,3,0
chr3	48342882	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,21;MFRL=172,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:4,3:4,3:0,8,1,6
chr3	48348564	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=226,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:1,7,0,4
chr3	48351560	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=345,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:0,6,1,2
chr3	48360992	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,169;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:5,3,1,3
chr3	48414197	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,8,2
chr3	48414215	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=160,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.278:11:4,0:4,3:6,2,2,1
chr3	48414820	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,3:8,0:8,10,3,0
chr3	48415007	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=235,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:1,5:1,11:2,0,12,4
chr3	48416756	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	48419723	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	48420103	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,235;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.772:2:0,0:0,0:0,0,0,2
chr3	48423614	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.303:11:5,2:3,1:3,5,0,3
chr3	48450706	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,2:3,0:6,2,2,0
chr3	48450808	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=132,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,0:15,4:6,19,4,0
chr3	48450952	.	C	CACACACACACACACACA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=216,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,3:2,10,0,3
chr3	48453305	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,18:0.558:32:5,8:9,10:3,11,8,10
chr3	48463618	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=197,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:5,0:9,3:6,8,0,3
chr3	48463711	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,1:2,7,0,2
chr3	48505302	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:6,2:5,7,0,3
chr3	48505927	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:6,3,2,0
chr3	48506805	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:9,7,1,1
chr3	48602523	.	G	GGGC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=81.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,10:0,9:0,0,8,12
chr3	48605980	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:9,1:4,1:3,10,1,1
chr3	48607420	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=173,177;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,1:4,0:0|1:48607420_A_G:48607420:2,4,2,0
chr3	48607422	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=173,177;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,1:4,0:0|1:48607420_A_G:48607420:2,4,2,0
chr3	48607507	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=201,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,0,1
chr3	48628315	.	T	TGCCTCCCGGCAGAGAGAAGTCCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48628315_T_TGCCTCCCGGCAGAGAGAAGTCCA:48628315:0,1,0,1
chr3	48628318	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:48628315_T_TGCCTCCCGGCAGAGAGAAGTCCA:48628315:0,1,0,1
chr3	48628342	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	48629501	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:10,9,2,0
chr3	48629793	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=140,20328;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:8,8,0,2
chr3	48637151	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:5,4:6,0:7,4,2,2
chr3	48668170	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0,6,2,2
chr3	48670876	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=185,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:7,10,1,1
chr3	48681631	.	TCCAG	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=170,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCAG;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,0:7,2:5,6,1,1
chr3	48681765	.	CAG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=213,91;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AG;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr3	48682390	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,181;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.546:16:5,4:2,3:5,2,0,9
chr3	48686489	.	TATCTGGGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:1,2:5,1:4,4,3,0
chr3	48693293	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=156,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:0,1:1,0:1,0,1,1
chr3	48716741	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=230,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:2,2,3,1
chr3	48717048	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=141,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.263:20:7,0:7,4:9,6,2,3
chr3	48719638	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=192,255;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,2:1,0:1,1,1,1
chr3	48731718	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.112:34:11,0:17,3:6,25,2,1
chr3	48897078	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr3	48921467	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=154,114;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:2,0:5,3:2,5,0,3
chr3	48921494	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:2,4,0,2
chr3	48955609	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=248,169;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr3	48956862	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=223,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:0,2:1,1:0,2,0,3
chr3	49004723	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=156,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:2,11,1,1
chr3	49011036	.	C	A,G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,10,17;MFRL=183,179,177;MMQ=60,60,40;MPOS=24,34;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.20,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,1:0.524,0.250:5:0,0,0:0,0,0:1,0,4,0
chr3	49011042	.	CA	AA,AT	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,10,10;MFRL=0,181,177;MMQ=60,60,40;MPOS=25,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.53,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,1:0.623,0.250:5:0,0,0:0,0,0:0,0,5,0
chr3	49011050	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=193,177;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.430:7:4,0:0,0:0|1:49011050_G_T:49011050:4,0,3,0
chr3	49011067	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,16;MFRL=193,166;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:3,0:0,0:0|1:49011050_G_T:49011050:4,0,2,0
chr3	49020465	.	G	GCTCAGCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=183,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:3,4,1,1
chr3	49052785	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=199,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,1,2
chr3	49053219	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=156,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:5,8,0,2
chr3	49054692	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=142,198;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,5:0.199:28:8,2:15,3:0|1:49054692_T_C:49054692:17,6,3,2
chr3	49054697	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,4:0.156:30:9,4:17,0:1|0:49054692_T_C:49054692:15,11,4,0
chr3	49056090	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr3	49063829	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=129,39;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:12,2:11,0:9,14,1,1
chr3	49063869	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,78;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,3:9,0:7,9,0,3
chr3	49070499	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=232,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:2,2:3,2,3,3
chr3	49094832	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=173,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:9,7,0,2
chr3	49114404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,1:8,1:9,8,1,1
chr3	49133351	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=144,0;MMQ=60,45;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:49133351_G_C:49133351:4,0,1,0
chr3	49133353	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=144,0;MMQ=60,45;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:49133351_G_C:49133351:4,0,1,0
chr3	49137692	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=155,106;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:5,0:12,4:4,13,0,4
chr3	49137904	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,2:3,6:2,9,3,5
chr3	49139966	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=146,278;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:1,7,0,3
chr3	49140001	.	CTA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr3	49140792	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=164,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:7,2,2,0
chr3	49146656	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=250,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:3,1:4,1:0,8,0,2
chr3	49148890	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=250,252;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:2,2,3,2
chr3	49152813	.	CA	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.121:23:13,2:8,0:11,10,0,2
chr3	49154152	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=198,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr3	49156676	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=165,301;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	49158657	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=143,80;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:10,2,1,1
chr3	49166069	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:7,2:3,3:4,6,3,3
chr3	49166561	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=302,311;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:4,4,2,0
chr3	49169782	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,2:13,2:13,8,2,2
chr3	49249381	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=203,278;MMQ=47,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	49278804	.	C	CAAAAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=4,9;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,1:0|1:49278804_C_CAAAAA:49278804:4,8,0,2
chr3	49278809	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:49278804_C_CAAAAA:49278804:4,8,0,2
chr3	49278811	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:0|1:49278804_C_CAAAAA:49278804:4,8,0,2
chr3	49292991	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,152;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=T;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.795:2:0,0:0,1:0,0,0,2
chr3	49321424	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=225,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,1:5,2:3,2,1,2
chr3	49321851	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=141,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:4,0,0,2
chr3	49322426	.	G	GC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=232,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.322:7:4,2:1,0:0|1:49322426_G_GC:49322426:1,4,1,1
chr3	49322427	.	A	ATGCACCTAAAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=232,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.325:7:4,2:1,0:0|1:49322426_G_GC:49322426:1,4,1,1
chr3	49362429	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:2,10,2,1
chr3	49365269	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=166,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	49406080	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=132,311;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr3	49459114	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=171,270;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr3	49463926	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr3	49548294	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	49569398	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,2:7,4:7,8,4,2
chr3	49570189	.	G	GCAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=181,58;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:4,3,1,1
chr3	49592137	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49592137_A_C:49592137:0,0,1,0
chr3	49592152	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49592137_A_C:49592137:0,0,1,0
chr3	49592167	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,16;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49592137_A_C:49592137:0,0,1,0
chr3	49592169	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,12;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:49592137_A_C:49592137:0,0,1,0
chr3	49679800	.	CC	TT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=126,126;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:4,7,1,1
chr3	49680063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=185,225;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr3	49698656	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,143;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,0:6,4:11,3,0,4
chr3	49712629	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:12,3:11,0:14,9,3,0
chr3	49713753	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr3	49715051	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=179,90;MMQ=60,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:5,12,1,1
chr3	49719789	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=209,135;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.206:17:11,0:2,3:6,8,2,1
chr3	49720393	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=228,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,2,3
chr3	49720679	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:5,7:10,0:0|1:49720679_C_A:49720679:7,9,7,0
chr3	49720686	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:5,7:11,0:0|1:49720679_C_A:49720679:8,8,7,0
chr3	49724048	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=199,190;MMQ=50,25;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr3	49725948	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,127;MMQ=56,36;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr3	49736565	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=248,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr3	49739086	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=119,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.305:24:1,4:16,3:0,17,3,4
chr3	49750188	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=223,279;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	49753003	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=121,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,2:3,4:3,2,2,4
chr3	49753788	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,216;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:2,4,2,6
chr3	49758764	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=150,280;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:9,2:5,1:4,10,1,2
chr3	49828155	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	49828285	.	CTG	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,0:5,2:4,4,1,1
chr3	49828911	.	GAA	G,GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35,35;MFRL=126,135,133;MMQ=60,60,60;MPOS=24,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.25,6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,4,4:0.203,0.226:20:5,3,2:7,1,2:5,7,3,5
chr3	49834451	.	A	AAAAAGAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=137,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:4,4,1,1
chr3	49836707	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,223;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:10,3:11,1:11,10,3,1
chr3	49842881	.	T	TG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=241,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.665:10:2,1:1,5:1,2,4,3
chr3	49847623	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=196,287;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,0:7,2:11,3,1,1
chr3	49847642	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=173,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,2:2,1:4,1,2,1
chr3	49848414	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,3:8,1:9,7,4,0
chr3	49866584	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=156,91;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:11,1:8,8:0|1:49866584_T_G:49866584:6,13,3,6
chr3	49866605	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=144,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:24,3:0.137:27:11,0:13,3:1|0:49866584_T_G:49866584:11,13,0,3
chr3	49878395	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=194,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,3:3,4:3,2,4,3
chr3	49881134	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=137,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr3	49884913	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,239;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:6,1:9,1,2,0
chr3	49897830	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=273,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:0,11:1,3:0,1,8,6
chr3	49898000	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.782:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr3	49898318	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:1,7:2,4:0|1:49898318_C_G:49898318:1,2,7,4
chr3	49898320	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:0|1:49898318_C_G:49898318:7,5,1,1
chr3	49899447	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=239,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:4,0:2,0:0|1:49899447_A_C:49899447:2,7,2,0
chr3	49899452	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,12;MFRL=244,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.251:10:4,0:3,0:0|1:49899447_A_C:49899447:2,6,2,0
chr3	49899838	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=146,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,0:6,5:4,9,0,5
chr3	49935910	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=199,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:4,2:5,0:9,1,1,1
chr3	49940317	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=166,80;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:15,0:9,2:12,12,0,2
chr3	49967162	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=218,153;MMQ=60,60;MPOS=-18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:2,1:2,3,0,1
chr3	50091942	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=216,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:0,5,0,4
chr3	50095103	.	CTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,11;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr3	50095816	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,198;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:1,5:8,0:7,2,5,0
chr3	50112589	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=116,44;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.402:10:1,0:4,2:5,1,2,2
chr3	50129374	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,4:0,0,13,0
chr3	50129399	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=195,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr3	50137307	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=212,250;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr3	50153045	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:12,0:7,6:8,11,0,6
chr3	50155887	.	T	TGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=130,261;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GA;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.376:6:1,1:2,0:0,4,0,2
chr3	50211536	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:9,7,0,2
chr3	50212512	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=230,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,10:1,3:3,0,6,7
chr3	50220171	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,1,1
chr3	50221058	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:1,2,0,1
chr3	50221071	.	A	ACAGAGTCCCCTTTATTCTTACCTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=148,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.488:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr3	50223977	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:4,2,2,0
chr3	50230902	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,2:7,1:7,7,1,2
chr3	50251833	.	A	AG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=30.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.923:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr3	50253196	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,0;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:6,8,1,1
chr3	50255663	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=214,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:50255663_C_T:50255663:1,1,3,1
chr3	50255666	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=214,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0|1:50255663_C_T:50255663:1,1,3,1
chr3	50293591	.	G	GGC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:50293591_G_GGC:50293591:1,3,2,0
chr3	50293601	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:50293591_G_GGC:50293591:0,4,1,0
chr3	50306752	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,4,2
chr3	50308718	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr3	50312393	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=191,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,1:4,0:3,10,2,0
chr3	50312998	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=149,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,1:6,1:9,7,1,1
chr3	50329626	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=163,104;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	50377912	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,271;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	50380253	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:5,5:0,0:5,0,5,0
chr3	50389409	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=178,245;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,4:13,0:15,8,4,0
chr3	50389497	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,14:0.441:32:7,7:11,7:8,10,8,6
chr3	50403460	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:11,2:5,0:10,8,2,0
chr3	50404533	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.240:18:1,1:10,2:6,8,0,4
chr3	50404542	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,13;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.302:20:2,0:8,2:5,9,0,6
chr3	50404553	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=15,15;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:0,1:1,1:1,6,0,6
chr3	50417407	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=152,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:12,5,1,1
chr3	50608463	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,104;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:12,0,2,0
chr3	50609123	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=92.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,11:0,14:0,0,18,7
chr3	50615302	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:10,0:12,3:10,12,3,0
chr3	50615416	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,232;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:0,4,0,3
chr3	50644967	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=198,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr3	50644992	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=182,70;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,0:4,2:5,3,2,0
chr3	50645635	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	50645793	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=65.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,15,5
chr3	50678001	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	50683258	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=130,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:6,0:5,6:0,11,0,6
chr3	50684489	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr3	50971400	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:3,4:7,2:4,6,3,3
chr3	51127848	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=235,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,2:3,2:1,2,1,3
chr3	51246360	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	51264940	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=120,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	51266880	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:1,1:3,2:4,1,3,0
chr3	51273711	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,9:0,1:0,0,8,2
chr3	51274902	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=213,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,3:3,3:2,2,5,1
chr3	51312525	.	TG	CC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:3,6,1,1
chr3	51349357	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	51349887	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=195,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=39.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:1,9:4,5:4,1,12,2
chr3	51393457	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=186,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	51393706	.	C	CAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.887:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr3	51399933	.	CCTG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTG;STR;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,4:2,0:6,1,3,1
chr3	51419046	.	A	ACTAT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,24;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51419046_A_ACTAT:51419046:0,0,0,1
chr3	51419048	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51419046_A_ACTAT:51419046:0,0,0,1
chr3	51419051	.	TG	GT	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:51419046_A_ACTAT:51419046:0,0,0,1
chr3	51426316	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,3:7,2:10,1,5,0
chr3	51429584	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=252,285;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51429584_TA_T:51429584:1,0,0,1
chr3	51429586	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=252,285;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:51429584_TA_T:51429584:1,0,0,1
chr3	51430821	.	GCCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=253,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CCA;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,0:2,2:4,3,2,0
chr3	51431679	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,1:8,2:11,5,1,2
chr3	51431981	.	C	CTTAT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.258:21:6,3:10,2:9,7,3,2
chr3	51433343	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:8,1:9,4:10,7,4,1
chr3	51433932	.	AACTT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=ACTT;STR;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:5,5:7,1:4,9,3,3
chr3	51435059	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=122,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:3,3:19,0:13,9,3,0
chr3	51436289	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51436289_T_C:51436289:1,0,0,1
chr3	51436295	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51436289_T_C:51436289:1,0,0,1
chr3	51436296	.	T	TTAGA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=203,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:51436289_T_C:51436289:1,0,0,1
chr3	51440548	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=200,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,2:5,3,3,0
chr3	51440602	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=219,258;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:5,4,0,2
chr3	51458204	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=213,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,1:4,1:10,7,1,1
chr3	51459974	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,193;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:0,5,0,5
chr3	51465085	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	51467552	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,37;MMQ=60,58;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:8,4,1,1
chr3	51679215	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,4:11,0:9,11,4,0
chr3	51697493	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	51747021	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=178,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,6:5,0:6,4,6,0
chr3	51752166	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.467:11:1,3:4,2:1,5,0,5
chr3	51864849	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=225,230;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	51864862	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=301,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr3	51864879	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=301,230;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:51864879_A_T:51864879:0,2,0,1
chr3	51864882	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=36,22;MFRL=301,230;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:51864879_A_T:51864879:0,2,0,1
chr3	51895850	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:3,2:4,5:4,3,4,3
chr3	51907736	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	51908226	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	51929360	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,4,9
chr3	51936949	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:0,1:2,6:2,0,7,0
chr3	51975395	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=149,78;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,0:6,2:8,3,2,0
chr3	51975577	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.494:14:2,3:5,3:0,7,0,7
chr3	51978220	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,4:0,15:0,0,9,10
chr3	51993023	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=194,253;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:1,0:4,0:0|1:51993023_A_C:51993023:2,5,2,0
chr3	51993029	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,10;MFRL=174,253;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:5,0:0|1:51993023_A_C:51993023:3,7,2,0
chr3	51993034	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=158,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:4,0:0|1:51993023_A_C:51993023:4,6,2,0
chr3	51993038	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,10;MFRL=158,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,0:6,0:0|1:51993023_A_C:51993023:4,6,2,0
chr3	51995170	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=181,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:3,1:7,3:7,3,2,2
chr3	52021196	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=171,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:6,0:3,7,0,2
chr3	52022742	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.359:26:10,3:6,6:8,9,4,5
chr3	52022852	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=158,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,2:8,3:7,8,0,5
chr3	52029326	.	TGAA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:0|1:52029326_TGAA_T:52029326:10,2,1,1
chr3	52029330	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=159,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,1:8,1:0|1:52029326_TGAA_T:52029326:10,2,1,1
chr3	52088276	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:14,1:11,2:5,20,3,0
chr3	52097303	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=167,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:13,0:8,5:11,10,0,6
chr3	52110089	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=182,161;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:0,5,0,3
chr3	52236762	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=192,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.828:27:2,5:2,18:1,3,7,16
chr3	52238656	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr3	52238677	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,5:3,0,9,0
chr3	52240088	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=161,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr3	52258372	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=272,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr3	52293312	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:8,4:5,4:7,6,4,4
chr3	52293859	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=209,96;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,5:5,2:0|1:52293859_A_G:52293859:5,3,1,6
chr3	52293861	.	A	AAG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,2:7,0:0|1:52293859_A_G:52293859:5,10,1,1
chr3	52293862	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:7,0:0|1:52293859_A_G:52293859:5,10,1,1
chr3	52325759	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=309,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:1,7:1,8:2,0,9,6
chr3	52379420	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr3	52390555	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=215,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr3	52390845	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=204,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr3	52396944	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr3	52400740	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.388:11:4,1:2,3:3,4,2,2
chr3	52404111	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=248,220;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,2:4,1:2,4,2,1
chr3	52404212	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=214,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:2,5,3,0
chr3	52415865	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr3	52420901	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=217,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,4:5,1:2,5,2,3
chr3	52428988	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=176,126;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:3,5,1,5
chr3	52429022	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=153,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:9,4,0,2
chr3	52431671	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=231,109;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr3	52454262	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=248,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:1,1:3,0,2,0
chr3	52456973	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=162,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:2,8:4,4:2,4,4,8
chr3	52471942	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=162,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,1,1
chr3	52472044	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:8,2,2,0
chr3	52489677	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=197,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,1:1,1:4,0,2,0
chr3	52491836	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=139,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,4:11,2:9,8,5,1
chr3	52505758	.	G	GAT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,0:0,0,4,0
chr3	52506282	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr3	52506426	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr3	52506491	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	52510592	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr3	52510697	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	52512318	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,1:1,8:0,1,7,2
chr3	52513940	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	52522659	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr3	52523765	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=393,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr3	52536308	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	52537969	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,1,7
chr3	52540153	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,0:8,2,5,0
chr3	52544104	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=186,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.226:11:4,1:5,1:7,2,2,0
chr3	52546487	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,4,5
chr3	52546820	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=202,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:0,2:2,0:0,2,1,2
chr3	52551265	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,33;MFRL=155,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,3:1,2:0|1:52551265_T_C:52551265:2,0,5,0
chr3	52551284	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=126,208;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:52551265_T_C:52551265:2,0,3,0
chr3	52553625	.	TGTAA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=112,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.562:7:0,2:3,2:1,2,4,0
chr3	52555957	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=135,120;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:1,1,2,4
chr3	52557038	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,7:4,2:2,5,3,6
chr3	52559167	.	CGGGG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=G;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.820:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	52561779	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=206,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,2:3,5:3,2,2,5
chr3	52561919	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=194,154;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,2:8,0:7,6,2,0
chr3	52584715	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,1,4
chr3	52588655	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:6,1:1,1:7,0,1,1
chr3	52597571	.	G	GGGCACAAAGCGGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=200,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52597571_G_GGGCACAAAGCGGC:52597571:0,3,0,1
chr3	52597575	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=200,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52597571_G_GGGCACAAAGCGGC:52597571:0,3,0,1
chr3	52597576	.	G	GGGC	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=200,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:52597571_G_GGGCACAAAGCGGC:52597571:0,3,0,1
chr3	52597605	.	C	CTTCACCAAA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=256,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52597605_C_CTTCACCAAA:52597605:0,1,0,1
chr3	52597607	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=33,23;MFRL=256,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:52597605_C_CTTCACCAAA:52597605:0,1,0,1
chr3	52637486	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr3	52643307	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:2,1:6,6:5,3,5,2
chr3	52661351	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=129,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,4:6,0:1,8,2,2
chr3	52692124	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	52692359	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=209,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:1,2,0,3
chr3	52722266	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=169,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,0:0,2:0,4,0,2
chr3	52725735	.	TTT	GCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=130,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:1,2,0,1
chr3	52727189	.	G	GTT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.240:10:5,2:3,0:6,2,2,0
chr3	52727257	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=127,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:4,4:8,6:7,5,3,7
chr3	52727493	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:10,5:7,2:6,11,5,2
chr3	52728312	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=144,224;MMQ=46,43;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.410:10:3,4:3,0:1,5,0,4
chr3	52740920	.	G	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=136,66;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.209:31:17,0:8,5:6,19,0,6
chr3	52745875	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:7,8,0,2
chr3	52778347	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:2,6,2,2
chr3	52780005	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,95;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:5,1,2,0
chr3	52804641	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:3,2:5,2,2,0
chr3	52814256	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.234:11:5,1:3,1:3,6,1,1
chr3	52815905	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=194,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr3	52819327	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr3	52821666	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:6,3:10,0:7,10,2,1
chr3	52821992	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=270,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,5:0,5:1,1,7,5
chr3	52825462	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=215,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	52825528	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr3	52833150	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.303:11:2,0:2,0:0|1:52833150_T_G:52833150:1,7,0,3
chr3	52833153	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,12;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.303:11:3,1:1,0:0|1:52833150_T_G:52833150:1,7,0,3
chr3	52833536	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=167,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.295:25:9,0:9,7:3,15,0,7
chr3	52833558	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:5,2:2,1:0,7,1,2
chr3	52837855	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr3	52847601	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=194,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	52847908	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	52848207	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=167,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,3,0
chr3	52848355	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:4,8,2,0
chr3	52851137	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=228,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	52852060	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=79,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:1,7,0,3
chr3	52853340	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr3	52853401	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,6:2,2:4,4,3,5
chr3	52854186	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:6,0,4,0
chr3	52858197	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=187,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:2,1,1,1
chr3	52864689	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:52864689_G_T:52864689:3,6,1,1
chr3	52864693	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=152,86;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:0|1:52864689_G_T:52864689:3,6,1,1
chr3	52867288	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr3	52867595	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,5:2,6:2,1,10,2
chr3	52867811	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr3	52874446	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	52874706	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:52874706_C_A:52874706:0,2,0,1
chr3	52874711	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,13;MFRL=194,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:52874706_C_A:52874706:0,2,0,1
chr3	52874713	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.491:4:0,0:2,0:0|1:52874706_C_A:52874706:0,2,0,2
chr3	52874715	.	TG	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=194,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.491:4:0,2:1,0:0|1:52874706_C_A:52874706:0,2,0,2
chr3	52877647	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,3,1
chr3	52877649	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:52877647_C_CA:52877647:0,0,3,1
chr3	52877720	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,1:0,0,7,4
chr3	52878746	.	C	CAG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,0:0,5:0,0,8,0
chr3	52878825	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,11,7
chr3	52886605	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=211,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:7,4:3,3:7,3,6,1
chr3	52960013	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=58.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,12,4
chr3	52968726	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	52968801	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	53003021	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	53126143	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=174,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr3	53126504	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=141,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:6,3:13,0:11,8,3,0
chr3	53126672	.	TTGCCCTGGACAAGGC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.533:15:2,3:3,5:1,6,3,5
chr3	53133526	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=169,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	53154132	.	ATTAACT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=241,299;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,0:4,2:0,5,0,2
chr3	53212574	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=107,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:3,2,0,4
chr3	53213538	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,4,1
chr3	53213815	.	C	CGTGT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GT;STR;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.735:9:0,1:2,5:0,2,0,7
chr3	53215141	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=193,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:6,0,2,0
chr3	53215799	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=170,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.328:13:2,1:7,3:2,7,1,3
chr3	53217413	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=176,225;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr3	53218818	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,266;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:8,2:9,3,3,0
chr3	53219675	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=155,70;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,2:2,0:2,5,0,2
chr3	53220444	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr3	53220569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,305;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:4,2,1,1
chr3	53220763	.	GCTCAGAGC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:0,10,0,3
chr3	53223286	.	GCTGGT	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=210,163;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,1,0
chr3	53223291	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	53259996	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,232;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,1,2
chr3	53260716	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=149,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr3	53260903	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,2:5,3:4,8,2,3
chr3	53262000	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=129,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,2,2
chr3	53262400	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=221,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:1,5,1,3
chr3	53262472	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=228,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	53263279	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,4:4,1:3,4,4,1
chr3	53267100	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,1:4,2:8,0,2,1
chr3	53267133	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=18,33;MFRL=37,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,6:0,6:0,1,5,8
chr3	53267155	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=135,276;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,2:6,2:6,9,2,2
chr3	53267296	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,1:5,5:5,7,3,3
chr3	53269275	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=246,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr3	53276052	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,17;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.485:6:2,1:1,0:3,0,3,0
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGCAC;STR;TLOD=79.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.959:18:0,6:0,12:0,0,3,15
chr3	53324915	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=30.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:0,6:1,3:0,1,2,7
chr3	53326795	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=141,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.219:11:4,0:5,2:0,9,1,1
chr3	53353319	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=221,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr3	53529121	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,25;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0|1:53529121_T_TC:53529121:1,0,1,0
chr3	53529127	.	T	TACCCCCCCCCC	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=15,24;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:53529121_T_TC:53529121:1,0,1,0
chr3	53529128	.	T	TG,C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,25,32;MFRL=0,211,163;MMQ=60,60,60;MPOS=20,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chr3	53529131	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,22;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:53529121_T_TC:53529121:0,0,2,0
chr3	53529137	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,21;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.762:2:0,0:0,1:0|1:53529121_T_TC:53529121:0,0,2,0
chr3	53529140	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=164,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:0,0:1,1:1|0:53529121_T_TC:53529121:3,0,1,0
chr3	53529143	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,13;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,0:1|0:53529121_T_TC:53529121:2,0,1,0
chr3	53529145	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=186,211;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:1,1:1|0:53529121_T_TC:53529121:2,0,1,0
chr3	53685039	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=154,240;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr3	53776995	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=189,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:1,8:2,8:3,0,12,4
chr3	53777176	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=230,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:3,4:1,3,2,4
chr3	53778875	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,8:6,6:4,7,7,7
chr3	53779580	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=225,263;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr3	53806803	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=164,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,6:1,7:3,0,10,3
chr3	53806817	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=209,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:5,4:1,7:5,2,9,2
chr3	53814197	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0,4,1,2
chr3	53820776	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=33,14;MFRL=167,0;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:53820776_G_C:53820776:2,0,1,0
chr3	53820783	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,13;MFRL=115,0;MMQ=60,45;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:53820776_G_C:53820776:3,0,1,0
chr3	53820787	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,13;MFRL=123,0;MMQ=60,45;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:53820776_G_C:53820776:4,0,1,0
chr3	53853009	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=92,291;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,1:7,2:5,7,1,2
chr3	53853490	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=125,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:5,1:0,1:4,1,2,0
chr3	53880789	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	53882661	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=160,281;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,0:4,5:4,6,3,2
chr3	53882663	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=281,160;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:0,6:5,4:3,2,4,6
chr3	53882673	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.913:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr3	53890787	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	53904229	.	C	CCA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1,2,0,1
chr3	53906334	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=243,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,0:2,2:9,1,2,0
chr3	53909952	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=188,83;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,2:1,5:4,1,3,4
chr3	53910117	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=183,30;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:0,4,2,6
chr3	53910118	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=60,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:4,2:6,1:0|1:53910118_A_G:53910118:3,7,0,3
chr3	53910121	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=60,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:0|1:53910118_A_G:53910118:3,7,0,3
chr3	53910122	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=149,60;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,3:0,6:0,1,3,6
chr3	53911270	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=197,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,1:10,1:13,4,2,0
chr3	53911338	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=141,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,9:0.249:38:15,8:14,0:17,12,9,0
chr3	53911728	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:8,4,2,0
chr3	53911783	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=169,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:4,5,4,4
chr3	53912341	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=227,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:1,1,8,0
chr3	53912380	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,2:8,3:12,6,5,0
chr3	53914093	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.389:39:15,8:8,7:11,13,8,7
chr3	53916130	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:14,5:10,2:8,16,2,5
chr3	53919720	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=256,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,3:4,1:6,3,2,2
chr3	53921028	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:0,3:2,6:1,1,0,9
chr3	54157710	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,1,2
chr3	54420721	.	G	GTTT	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=30,36;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=18,21;RU=T;STR;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.572:5:1,2:0,1:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,3,0
chr3	54420740	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,15;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.499:4:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,2,0
chr3	54420742	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,16;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,1,0
chr3	54420744	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,1,0
chr3	54420749	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,16;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,1,0
chr3	54420752	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,16;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:54420721_G_GTTT:54420721:0,2,1,0
chr3	54596815	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=207,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr3	54604188	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=173,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,2:2,4:0,6,0,7
chr3	54615971	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,0,5
chr3	54913354	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,4:2,1:2,1,4,1
chr3	54913369	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=195,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:5,0:1,0:3,4,3,0
chr3	54919272	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=139,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:1,0:5,7:4,2,4,3
chr3	54962013	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=159,239;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=25.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:5,3:2,5:3,4,3,5
chr3	55003733	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=47,236;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,4,1
chr3	55038898	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,8:0,7:0,0,6,9
chr3	55107558	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:6,0:9,6:6,9,6,0
chr3	55108055	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=274,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,4:2,1,5,0
chr3	55508274	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=199,202;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,5:5,0:10,0,5,0
chr3	55514766	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.402:23:7,2:6,7:12,2,6,3
chr3	55733390	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=97,119;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:10,2,6,3
chr3	55769009	.	ATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr3	56026034	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:9,0,4,0
chr3	56041187	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:6,2:10,3,2,1
chr3	56052839	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=212,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:7,0,4,0
chr3	56207593	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=198,48;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:4,4,1,1
chr3	56207609	.	T	TTTTTGTTTGTTTGC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=202,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:1,7,1,1
chr3	56591178	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=349,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.811:12:1,6:0,4:2,0,10,0
chr3	56591278	.	T	TGGGGTAAGCA	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=285,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGTAAGCA;STR;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.874:13:0,9:1,2:0,1,6,6
chr3	56593543	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=228,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.750:18:3,9:1,5:4,0,6,8
chr3	56593647	.	C	CCT	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=176,53;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.147:18:9,2:7,0:0|1:56593647_C_CCT:56593647:9,7,1,1
chr3	56593653	.	T	TCC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=177,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:0|1:56593647_C_CCT:56593647:10,7,1,1
chr3	56593654	.	T	TTAGTGCACC	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=177,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:56593647_C_CCT:56593647:10,7,1,1
chr3	56593680	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=219,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:4,4:1,4:1,4,2,6
chr3	56597688	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=294,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr3	56601115	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=125,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:0,2,0,7
chr3	56605334	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=143,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:8,2:6,4:10,4,2,4
chr3	56605404	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.712:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	56627598	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.949:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr3	56647799	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,1:6,1:9,11,1,1
chr3	56650054	.	T	TCTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:8,1:4,4:6,6,4,1
chr3	56650178	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=140,273;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr3	56653201	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	56653609	.	CGT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,261;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,4:1,1:1,5,3,2
chr3	56658871	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=108,226;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,7:0.200:38:14,3:16,4:0|1:56658871_T_C:56658871:13,18,2,5
chr3	56658890	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=172,108;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,4:0.147:32:14,0:14,4:1|0:56658871_T_C:56658871:12,16,0,4
chr3	56661715	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=154,113;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:14,0:17,5:12,19,0,5
chr3	56662727	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=23,26;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	56674190	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=223,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,0:2,6:1,1,0,6
chr3	56683063	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,122;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:11,4:11,0:13,9,4,0
chr3	56695060	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=126,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:5,3:3,0:2,7,0,3
chr3	56763228	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr3	56763328	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=126,243;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:8,1:8,4:5,11,3,2
chr3	56766435	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=129,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:6,1:22,3:7,21,1,3
chr3	56771243	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=127,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:9,0:12,3:0|1:56771243_A_T:56771243:12,11,0,3
chr3	56771248	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=131,87;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:9,0:15,3:0|1:56771243_A_T:56771243:11,13,0,3
chr3	56807854	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=188,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.438:11:3,1:3,3:0,6,0,5
chr3	56808956	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=115,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,3:0,4:2,0,6,1
chr3	57069226	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=221,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr3	57132200	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,7:2,4:1,3,4,7
chr3	57136585	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:6,2:2,7:2,6,3,6
chr3	57137090	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=117,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:0,3:5,4:4,2,6,3
chr3	57137232	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,1,4
chr3	57137272	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57137272_C_T:57137272:0,3,0,1
chr3	57137278	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:57137272_C_T:57137272:0,3,0,1
chr3	57139833	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=171,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,4:2,1:2,0,3,2
chr3	57139972	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,4:5,3:3,4,5,2
chr3	57140108	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,5:4,8:3,3,4,9
chr3	57144258	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:6,0:6,1:8,4,1,1
chr3	57232928	.	TG	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:0|1:57232928_TG_T:57232928:5,11,0,2
chr3	57232930	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:0|1:57232928_TG_T:57232928:5,11,0,2
chr3	57232933	.	TCCCA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:0|1:57232928_TG_T:57232928:5,12,0,2
chr3	57261995	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=234,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,2:0,0:1,1,1,1
chr3	57264872	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:1,1:3,1:1,3,0,3
chr3	57276258	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=270,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,2:0,7:0,1,0,9
chr3	57294085	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=177,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,4:2,6:0,2,5,5
chr3	57294295	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,310;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	57294884	.	CAAATT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAATT;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	57335705	.	TACACACACAC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=AC;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.793:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	57335876	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=190,112;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.827:21:2,9:1,9:3,0,10,8
chr3	57386148	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=147,111;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,0:5,3:5,6,1,2
chr3	57386170	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.183:14:3,2:9,0:0|1:57386170_G_T:57386170:6,6,1,1
chr3	57386176	.	C	CAAG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:8,0:0|1:57386170_G_T:57386170:5,8,1,1
chr3	57386178	.	T	TTGA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=158,67;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,1:8,0:0|1:57386170_G_T:57386170:5,7,1,1
chr3	57391284	.	GTTCA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=173,262;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	57422824	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=161,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr3	57422876	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=216,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	57430626	.	TG	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=219,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:57430626_TG_GT:57430626:0,3,0,2
chr3	57430629	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=219,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:57430626_TG_GT:57430626:0,3,0,2
chr3	57431740	.	ATAAATAAATAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,1:0,4:1,0,5,0
chr3	57432064	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	57432418	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,119;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr3	57443817	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=120,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:5,1,5,3
chr3	57456093	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=128,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.578:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr3	57456371	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=197,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:2,3,0,5
chr3	57457123	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	57469053	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	57469097	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:1,1,5,2
chr3	57469272	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr3	57475351	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=129,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.537:15:4,7:2,1:2,5,6,2
chr3	57488279	.	T	TTTC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr3	57563120	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:1,2:8,0:4,5,1,2
chr3	57582718	.	GAAA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=143,145;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,4;RU=A;STR;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:4,5:1,2:5,0,6,1
chr3	57627500	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,0,12
chr3	57631951	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=169,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:10,0,2,0
chr3	57632095	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:8,0:5,3:8,5,0,3
chr3	57743337	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=204,78;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:8,1,2,1
chr3	57835653	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=253,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57835653_G_C:57835653:0,2,0,1
chr3	57835659	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=253,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:57835653_G_C:57835653:0,2,0,1
chr3	57846577	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.388:21:4,4:8,4:4,9,1,7
chr3	57850505	.	CT	C,CTT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,30,32;MFRL=149,174,109;MMQ=60,60,60;MPOS=15,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=7.18,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,3:0.276,0.218:15:2,2,2:5,2,1:3,5,5,2
chr3	57850593	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=119,135;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:11,6:6,0:7,10,6,0
chr3	57908594	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=261,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:1,1:4,1,2,1
chr3	58080505	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=178,252;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	58083446	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr3	58089585	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=222,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,2:1,3:5,0,5,0
chr3	58089877	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=126,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:1,5,2,7
chr3	58094157	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=85,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:4,1,7,0
chr3	58094852	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,8:2,6:3,0,12,2
chr3	58095466	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=199,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	58095500	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,236;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	58111285	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,2:6,6:5,3,7,1
chr3	58112251	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=232,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr3	58112556	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	58116369	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=162,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr3	58118555	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=99,136;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:3,5:0,7:2,1,7,5
chr3	58118700	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=111,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:1,5,0,5
chr3	58121626	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	58134636	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:58134636_G_A:58134636:0,0,0,1
chr3	58134639	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:58134636_G_A:58134636:0,0,0,1
chr3	58145263	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=110,210;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,4:0,3:1,2,3,4
chr3	58179028	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr3	58186719	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:2,5,2,2
chr3	58186911	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	58194051	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=215,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.255:18:7,3:7,1:4,10,2,2
chr3	58196639	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=194,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,3:7,8,1,3
chr3	58242292	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=136,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,2:8,0:10,6,2,0
chr3	58270963	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=170,262;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:1,2,4,2
chr3	58296209	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:2,4:3,1:3,2,4,1
chr3	58296421	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=160,216;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr3	58303069	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,320;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	58351660	.	CTTT	C,CTT,CTTTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=19,35,27,26;MFRL=146,81,190,67;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,23,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,14,16;RU=T;STR;TLOD=10.91,7.23,5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,5,4,4:0.251,0.238,0.235:18:0,1,1,1:2,4,2,1:1,4,2,11
chr3	58355273	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=136,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,2,2
chr3	58355283	.	G	GAC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr3	58376992	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,1:6,2:3,7,0,3
chr3	58384995	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,2:4,2:4,2,3,1
chr3	58385194	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr3	58410431	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=226,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:5,4:5,3:7,3,5,2
chr3	58410554	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=207,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:8,2:2,3:5,5,2,4
chr3	58410596	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=63.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,21:0.478:44:10,21:12,0:11,12,21,0
chr3	58413662	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr3	58413669	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=200,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr3	58414382	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=224,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:0,4,1,3
chr3	58415590	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=151,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:0,2,1,7
chr3	58416535	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=155,112;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.210:17:8,2:6,1:0|1:58416535_C_T:58416535:8,6,2,1
chr3	58416538	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,18:0.952:18:0,10:0,8:0|1:58416535_C_T:58416535:0,0,11,7
chr3	58417190	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=221,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	58417345	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=166,104;MMQ=60,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,0:16,4:11,18,0,4
chr3	58417416	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=175,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,6:4,4:9,3,8,2
chr3	58484429	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=162,162;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,18:0.314:58:11,17:29,0:34,6,18,0
chr3	58490918	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=134,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:9,0:6,2:0|1:58490918_G_C:58490918:12,6,1,1
chr3	58490924	.	GTTGC	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:7,2:0|1:58490918_G_C:58490918:11,7,1,1
chr3	58490932	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=141,84;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:10,0:6,1:0|1:58490918_G_C:58490918:10,8,1,1
chr3	58520306	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	58520731	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:6,6:12,3:9,9,5,4
chr3	58520859	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,2,8
chr3	58555343	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=164,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	58555386	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=115,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:5,1,5,0
chr3	58621935	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	58625975	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=438,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=30.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:0,1,0,9
chr3	58631184	.	G	GAAATA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AAATA;STR;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.872:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr3	58635197	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	58641352	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,285;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:2,1:15,2:8,9,0,3
chr3	58849417	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:17,3:10,0:14,13,0,3
chr3	58849569	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=253,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr3	58870321	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=155,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.201:23:9,2:9,2:7,12,4,0
chr3	59996969	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=199,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:7,0,3,0
chr3	59999690	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:2,3:2,4:4,0,4,3
chr3	61734539	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:3,11:4,7:6,1,14,4
chr3	62142723	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,114;MMQ=60,23;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:13,0:12,3:19,6,0,3
chr3	62189189	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=211,195;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,9:3,2:3,4,5,6
chr3	62253355	.	TGAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=198,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr3	62267213	.	C	CTTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=T;STR;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:2,2:2,2:4,0,4,2
chr3	62357611	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=342,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr3	62423865	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=181,119;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:4,5,2,1
chr3	62431367	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=23,31;MFRL=158,158;MMQ=60,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.369:12:3,4:2,0:8,0,4,0
chr3	62431387	.	GA	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,18;MFRL=150,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.619:9:2,1:1,1:3,0,3,3
chr3	62431402	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,24;MFRL=127,109;MMQ=60,47;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:5,1:4,0:8,4,2,0
chr3	62431415	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=113,137;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.795:17:1,6:1,7:3,0,9,5
chr3	62459763	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=223,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:62459763_G_A:62459763:2,0,1,0
chr3	62459773	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=223,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:62459763_G_A:62459763:2,0,1,0
chr3	62477933	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=251,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:6,2:1,2:6,1,3,1
chr3	62498378	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	62499344	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,36;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:6,2:6,3,1,1
chr3	62571037	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=144,293;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:1,9,1,1
chr3	62578336	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:7,0:4,3:7,4,2,1
chr3	62631553	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=233,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr3	62636826	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	62647904	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=181,254;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,1:3,0,5,0
chr3	62647928	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=21,35;MFRL=99,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:3,3:1,1:2,2,4,0
chr3	62648142	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=212,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,6:2,1:0,4,0,7
chr3	62739067	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=187,82;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:4,0,0,4
chr3	62739092	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr3	63638501	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:11,0:3,2:6,8,0,2
chr3	63640601	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=155,113;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	63645575	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:1,5,0,4
chr3	63821914	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr3	63898360	.	G	GGCAGCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=251,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=GCA;STR;TLOD=24.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.827:9:0,3:1,4:0,1,0,8
chr3	63976033	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=144,53;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.180:31:16,0:9,5:15,11,2,3
chr3	63996262	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:9,0,2,0
chr3	63999322	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:1,8,1,1
chr3	64145759	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,4:5,6:0,6,1,9
chr3	64518994	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr3	64526717	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,8,1
chr3	64526942	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr3	64527321	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	64527336	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr3	64527378	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,2,7
chr3	64527465	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr3	64553963	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=199,227;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr3	64554254	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=225,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,5:1,7:0,1,4,8
chr3	64580169	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=183,350;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:1,6,2,0
chr3	64589851	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=161,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,5:3,1:2,2,4,2
chr3	64599279	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=190,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr3	64601550	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=191,260;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:6,0,2,0
chr3	64607901	.	A	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:11,0:15,11:16,10,0,11
chr3	64617070	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=135,239;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:3,1,4,2
chr3	64617423	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,266;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:4,1,2,1
chr3	64617690	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=263,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:64617690_A_G:64617690:0,3,0,1
chr3	64617699	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=263,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:2,2:0|1:64617690_A_G:64617690:0,3,0,3
chr3	64619048	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=135,251;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	64640206	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=58.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0|1:64640206_TA_T:64640206:0,0,7,8
chr3	64640212	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.612:16:5,5:1,5:0|1:64640206_TA_T:64640206:5,1,3,7
chr3	64667059	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,1:2,5:2,3,1,5
chr3	65350478	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=186,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:12,1:7,10:17,2,11,0
chr3	65350694	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:0,1,1,7
chr3	65369200	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,2:8,0:7,5,2,0
chr3	65416648	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	65425560	.	T	TCTG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=151,262;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=CTG;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.225:16:6,2:6,0:13,0,2,1
chr3	65464223	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr3	65464522	.	G	GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=250,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr3	65607592	.	T	TCA,TCACACACACA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,31,0;MFRL=155,112,107;MMQ=60,60,60;MPOS=2,50;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,17;RU=CA;STR;TLOD=3.55,10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,3:0.270,0.360:8:1,1,0:2,1,0:1,2,3,2
chr3	65607637	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=159,107;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,21:0.688:30:3,10:6,11:4,5,10,11
chr3	65607754	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=164,59;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:14,2:0|1:65607754_A_T:65607754:5,16,1,1
chr3	65607763	.	C	CATCTACTTTTAAGAACCCTTGTT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=162,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:65607754_A_T:65607754:4,16,1,1
chr3	66293766	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=255,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.442:7:2,1:2,2:2,2,1,2
chr3	66428282	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=218,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,4:8,2:0,9,1,5
chr3	66432680	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=224,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,6,0
chr3	66433312	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr3	66434372	.	T	TCACA,TCACACA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,23,26;MFRL=198,173,136;MMQ=60,60,59;MPOS=3,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,14,15;RU=CA;STR;TLOD=7.53,3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.387,0.190:6:1,0,0:2,2,1:1,2,3,0
chr3	66463251	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.931:12:0,4:0,5:0,0,11,1
chr3	66465259	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=187,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,4:0,2:2,0,6,0
chr3	67053788	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,1:10,1:11,12,0,2
chr3	67058329	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.582:5:1,3:1,0:2,0,3,0
chr3	67426125	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=213,186;MMQ=60,47;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,1:1,3:9,0,4,0
chr3	67559216	.	CTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=169,234;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,1:0,1:3,2,2,0
chr3	67659817	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:4,5:3,3:7,0,7,1
chr3	67660028	.	A	ACTCAGC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=304,240;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.318:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr3	67660040	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=339,271;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:67660040_G_A:67660040:0,1,0,2
chr3	67660049	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=22,32;MFRL=339,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:67660040_G_A:67660040:0,1,0,2
chr3	68587884	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=128,59348183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:5,2,1,1
chr3	68788248	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,316;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:5,10,0,2
chr3	68788363	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:2,5,0,2
chr3	68801921	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=189,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr3	69036524	.	GA	G,GAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32,36;MFRL=0,188,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=7.30,6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.401,0.498:7:0,1,3:0,2,1:0,0,7,0
chr3	69036678	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:9,3:4,2:2,11,2,3
chr3	69036683	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=188,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:8,4:4,2:2,10,2,4
chr3	69036707	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=130,190;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.536:15:2,7:4,1:2,5,1,7
chr3	69047141	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=129,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:1,1:6,2:4,3,3,0
chr3	69053447	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	69054266	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,95;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.582:10:1,3:3,3:3,1,4,2
chr3	69072481	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=187,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.608:21:5,11:3,2:2,6,5,8
chr3	69073410	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=230,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:1,1:1,3,0,3
chr3	69073419	.	G	GTT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.438:5:3,1:0,0:0,3,0,2
chr3	69074878	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=120,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,3:4,4:1,5,2,5
chr3	69074930	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=165,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	69082657	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr3	69084161	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:7,3:6,5,3,1
chr3	69088918	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=275,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr3	69093598	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=100,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:2,6:1,7:2,1,10,3
chr3	69104695	.	T	A	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=136.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,47:0.980:47:0,29:0,18:0,0,9,38
chr3	69104752	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,16:0,12:0,0,5,23
chr3	69106304	.	CC	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=197,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,1:7,4:11,0,6,0
chr3	69111084	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=196,214;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:7,1:4,9,2,1
chr3	69112049	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:7,0,4,1
chr3	69112658	.	CAA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=160,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,0:2,0:3,5,0,2
chr3	69113153	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=166,60;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,2:4,1:8,2,2,1
chr3	69113185	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,2:6,3:6,8,2,3
chr3	69124733	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=189,214;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.538:24:6,13:5,0:0|1:69124733_T_A:69124733:1,10,0,13
chr3	69124738	.	T	TCCTTTGTCCCTTAGAAAGGAAGGAATC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,37;MFRL=189,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.583:22:5,13:4,0:0|1:69124733_T_A:69124733:0,9,0,13
chr3	69127133	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=157,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:0,9,0,3
chr3	69153854	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=212,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr3	69225588	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,15,0
chr3	69225875	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	69229976	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr3	69230026	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,13,3
chr3	69230061	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,9:0,9:0,0,10,8
chr3	69242770	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr3	69244162	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,11:0,7:0,0,15,3
chr3	69245454	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,13,14
chr3	69245949	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr3	69246152	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,9:0,11:0,0,9,11
chr3	69246274	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	69265371	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=104,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:0,2:2,2:1,1,4,0
chr3	69267578	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,1,4
chr3	69271036	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,0:11,2:6,11,0,2
chr3	69273656	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	69351460	.	AAG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=79,115;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,6:2,5:6,4,3,8
chr3	69360315	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:3,1:2,1:5,0,3,0
chr3	69362706	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=273,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:0,1,0,7
chr3	69988437	.	GT	G,GTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35,16;MFRL=218,178,289;MMQ=60,60,60;MPOS=14,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=5.37,5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.308,0.370:10:1,2,0:2,1,1:0,3,1,6
chr3	71015021	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=94,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.807:13:2,2:0,9:1,1,9,2
chr3	71247576	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	71739332	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,33;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.514:8:1,2:0,1:1,3,1,3
chr3	72427690	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,164;MMQ=60,54;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.329:40:15,6:12,6:11,16,0,13
chr3	72495593	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=145,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.475:7:1,2:3,1:2,2,3,0
chr3	72495777	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=94.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,15:0,13:0,0,12,16
chr3	72897558	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=239,225;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:1,7,0,3
chr3	73004157	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=68,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr3	73006471	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:8,0:2,5:2,8,0,6
chr3	73016635	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=222,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr3	73024106	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=160,276;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,0:3,2:6,3,1,1
chr3	73024350	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=142,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:1,8:1,4:1,1,4,8
chr3	73096591	.	A	ATAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,2:3,4:0,5,1,5
chr3	73108092	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	73110076	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr3	73111481	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=195,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:4,5:12,2:8,8,2,5
chr3	73111503	.	T	TTGG	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGG;STR;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.390:21:3,5:10,2:7,6,3,5
chr3	73112489	.	A	AAAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=216,215;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:4,1:1,9,0,2
chr3	73112919	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=59,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:6,2:7,3:4,9,1,4
chr3	73112974	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=201,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr3	73434086	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=207,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,2:5,1:6,5,2,1
chr3	73437112	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:1,3,3,1
chr3	73437146	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=173,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:7,4,0,2
chr3	73440108	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.578:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr3	73651469	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=171,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:1,2,3,2
chr3	73651621	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,4:1,1:0,1,1,4
chr3	74315580	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=159,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:2,0,4,0
chr3	74347060	.	AAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr3	74351863	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=197,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:8,1:3,1:3,8,1,1
chr3	74570197	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.229:18:6,4:8,0:11,3,2,2
chr3	74570373	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=194,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.481:8:2,0:2,4:1,3,0,4
chr3	75679812	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=19;MBQ=35,27;MFRL=176,198;MMQ=25,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,4:2,3:10,0,6,3
chr3	75679833	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=32,27;MFRL=184,198;MMQ=25,25;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:75679833_C_T:75679833:15,3,2,0
chr3	75679834	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=28,26;MFRL=192,160;MMQ=25,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:0|1:75679834_G_T:75679834:13,0,3,3
chr3	75679836	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=31,25;MFRL=201,160;MMQ=25,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,4:6,2:12,0,3,3
chr3	75679841	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=32,25;MFRL=192,145;MMQ=25,31;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.363:20:7,4:6,1:0|1:75679834_G_T:75679834:13,0,4,3
chr3	75679843	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=175,198;MMQ=25,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:0|1:75679833_C_T:75679833:14,3,2,0
chr3	75679850	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=19;MBQ=32,30;MFRL=192,152;MMQ=25,25;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,8:0.391:21:7,5:6,3:0|1:75679834_G_T:75679834:12,1,5,3
chr3	75679863	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=19;MBQ=34,33;MFRL=172,152;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,6:0.259:25:9,4:8,2:0|1:75679863_C_G:75679863:13,6,4,2
chr3	75679866	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=28,30;MFRL=171,152;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:10,3:9,2:0|1:75679863_C_G:75679863:13,7,4,2
chr3	75679876	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=19;MBQ=33,30;MFRL=161,174;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.394:31:11,4:7,8:13,6,9,3
chr3	75679881	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=33,26;MFRL=171,161;MMQ=25,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,6:0.194:34:11,3:14,3:0|1:75679863_C_G:75679863:21,7,4,2
chr3	75679891	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=34,31;MFRL=170,156;MMQ=25,25;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,10:0.333:31:6,7:15,3:0|1:75679891_G_A:75679891:14,7,7,3
chr3	75679892	.	GC	CG	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=35,32;MFRL=170,158;MMQ=25,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:15,0:13,3:22,9,2,1
chr3	75679893	.	C	T,G	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=32,27,35;MFRL=171,161,164;MMQ=25,25,25;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=38.82,4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,11,5:0.352,0.150:32:4,7,2:10,3,3:10,6,12,4
chr3	75679899	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=19;MBQ=29,30;MFRL=164,161;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,11:0.375:30:6,8:12,3:0|1:75679891_G_A:75679891:12,7,8,3
chr3	75679914	.	CC	TT	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=33,28;MFRL=161,164;MMQ=25,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,5:0.176:32:13,2:13,2:0|1:75679863_C_G:75679863:17,10,4,1
chr3	75679930	.	A	C	.	.	DP=45;ECNT=19;MBQ=27,34;MFRL=175,171;MMQ=25,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=91.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,24:0.556:43:7,13:12,11:0|1:75679930_A_C:75679930:7,12,14,10
chr3	75679938	.	T	C	.	.	DP=46;ECNT=19;MBQ=28,34;MFRL=175,177;MMQ=25,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=98.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,26:0.574:45:7,14:10,11:0|1:75679930_A_C:75679930:7,12,15,11
chr3	75679945	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=19;MBQ=33,32;MFRL=177,176;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:19,2:18,3:17,22,2,3
chr3	75679958	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=176,172;MMQ=25,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,10:0.177:60:24,6:21,4:0|1:75679958_C_T:75679958:21,29,5,5
chr3	75679963	.	C	T	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=171,197;MMQ=25,46;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,8:0.142:61:23,4:26,4:20,33,6,2
chr3	75679965	.	C	A	.	.	DP=63;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=173,171;MMQ=25,26;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=105.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,28:0.446:63:16,10:17,13:0|1:75679965_C_A:75679965:15,20,10,18
chr3	75679973	.	A	G	.	.	DP=68;ECNT=13;MBQ=26,32;MFRL=187,163;MMQ=26,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,7:0.116:67:27,4:30,3:0|1:75679958_C_T:75679958:22,38,4,3
chr3	75679975	.	C	T	.	.	DP=69;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=185,177;MMQ=25,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=107.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,29:0.423:69:20,14:20,14:0|1:75679965_C_A:75679965:16,24,11,18
chr3	75679988	.	A	G	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=27,34;MFRL=185,165;MMQ=29,25;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=102.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,27:0.444:61:14,13:16,13:0|1:75679965_C_A:75679965:14,20,9,18
chr3	75679993	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=13;MBQ=33,25;MFRL=178,192;MMQ=25,48;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,5:0.114:50:20,2:22,3:14,31,5,0
chr3	75679997	.	C	T	.	.	DP=49;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=185,156;MMQ=43,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=83.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,22:0.460:48:11,10:14,10:0|1:75679965_C_A:75679965:10,16,7,15
chr3	75680010	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=13;MBQ=29,27;MFRL=192,173;MMQ=26,48;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,7:0.169:45:16,3:21,4:14,24,2,5
chr3	75680037	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=234,188;MMQ=34,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:5,10:9,3:0|1:75680037_G_T:75680037:1,13,3,10
chr3	75680045	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=27,32;MFRL=229,188;MMQ=31,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=48.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.500:26:5,9:8,3:0|1:75680037_G_T:75680037:0,13,3,10
chr3	75680081	.	TGTG	T	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=212,176;MMQ=43,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,1:6,1:0|1:75680081_TGTG_T:75680081:0,12,0,2
chr3	75680108	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=13;MBQ=29,28;MFRL=211,176;MMQ=46,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0|1:75680081_TGTG_T:75680081:0,4,0,2
chr3	75713442	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=200,248;MMQ=31,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:0|1:75713442_G_A:75713442:11,2,0,2
chr3	75713444	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=200,234;MMQ=31,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:10,3,1,1
chr3	75713449	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=29,33;MFRL=211,306;MMQ=31,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:8,2:5,0:0|1:75713442_G_A:75713442:11,2,1,2
chr3	75713472	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=200,300;MMQ=31,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:5,6:7,0:11,2,3,3
chr3	75713496	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=13;MBQ=31,29;MFRL=171,300;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,0:9,3,4,2
chr3	75713507	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=191,341;MMQ=55,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:5,3:5,0:7,3,2,1
chr3	75713561	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=196,199;MMQ=51,27;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:8,2:10,3:0|1:75713561_C_T:75713561:13,7,4,1
chr3	75713563	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=192,199;MMQ=50,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:9,2:11,3:0|1:75713561_C_T:75713561:14,7,4,1
chr3	75713564	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=13;MBQ=28,27;MFRL=196,192;MMQ=34,51;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,3:8,7:12,4,6,4
chr3	75713566	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=25,32;MFRL=192,196;MMQ=51,25;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:8,3:10,5:11,7,7,1
chr3	75713618	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=28,28;MFRL=173,198;MMQ=46,36;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:12,4:12,2:17,7,4,2
chr3	75713654	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=182,173;MMQ=50,34;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,10:0.249:42:15,5:17,5:18,14,4,6
chr3	75713669	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=27,28;MFRL=177,167;MMQ=50,37;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.285:47:15,5:19,8:19,15,6,7
chr3	75713725	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=167,157;MMQ=42,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,17:0.339:51:14,7:20,10:15,19,8,9
chr3	75713738	.	T	G	.	.	DP=51;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=152,161;MMQ=41,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,17:0.353:49:13,7:18,10:11,21,6,11
chr3	75713748	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=167,172;MMQ=40,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,7:0.162:47:17,2:22,5:12,28,4,3
chr3	75713751	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=8;MBQ=34,28;MFRL=169,165;MMQ=41,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,9:0.221:43:14,5:19,4:10,24,3,6
chr3	75713757	.	AGG	A	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=29,28;MFRL=172,167;MMQ=41,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=67.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,19:0.400:48:16,7:13,10:0|1:75713757_AGG_A:75713757:9,20,7,12
chr3	75713762	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=173,170;MMQ=42,48;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=64.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,18:0.380:48:16,7:14,9:0|1:75713757_AGG_A:75713757:10,20,6,12
chr3	75713782	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=172,195;MMQ=60,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=78.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.614:42:8,8:8,15:7,9,5,21
chr3	75713794	.	T	C	.	.	DP=41;ECNT=8;MBQ=30,33;MFRL=195,172;MMQ=55,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.279:41:10,8:20,3:9,21,2,9
chr3	75713858	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=203,211;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:5,1,2,6
chr3	75713879	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=34,26;MFRL=192,175;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,1:11,3:11,9,0,4
chr3	75713897	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=29,34;MFRL=184,212;MMQ=60,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,2:6,5:7,5,2,5
chr3	75713903	.	AT	GA	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=203,172;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:8,1:9,2:12,8,0,3
chr3	75713909	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=187,212;MMQ=60,25;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,2:7,5:9,6,2,5
chr3	75714034	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=180,212;MMQ=40,25;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,0:10,3:7,12,1,2
chr3	75714039	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=211,107;MMQ=31,25;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:75714039_C_T:75714039:7,11,1,1
chr3	75714041	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=211,107;MMQ=31,25;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:75714039_C_T:75714039:7,11,1,1
chr3	75714095	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=146,221;MMQ=25,25;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:11,1:9,2:0|1:75714095_G_A:75714095:11,10,1,2
chr3	75714102	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=146,221;MMQ=25,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:10,1:7,1:0|1:75714095_G_A:75714095:10,9,1,2
chr3	75714139	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=258,177;MMQ=60,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,6:3,2:4,3,4,4
chr3	75714146	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=199,285;MMQ=33,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,3:5,0:5,5,1,2
chr3	75714185	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=210,221;MMQ=50,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:2,1:10,1:8,4,2,0
chr3	75714202	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=197,209;MMQ=44,25;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:1,1:11,2:9,3,2,1
chr3	75714263	.	CA	TT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=173,186;MMQ=50,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:1,3:7,4:6,2,4,3
chr3	75714298	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=191,129;MMQ=60,25;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,14:0.394:36:9,8:13,6:11,11,10,4
chr3	75714345	.	G	T	.	.	DP=73;ECNT=11;MBQ=34,27;MFRL=136,108;MMQ=60,45;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,12:0.172:71:26,9:31,2:34,25,8,4
chr3	75714382	.	G	C,T	.	.	DP=71;ECNT=11;MBQ=32,33,25;MFRL=139,107,144;MMQ=60,60,40;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=34.71,22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:44,16,8:0.240,0.128:68:18,14,4:23,2,4:27,17,15,9
chr3	75714388	.	G	T	.	.	DP=63;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=136,144;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,8:0.139:63:29,4:23,3:31,24,7,1
chr3	75714391	.	G	T	.	.	DP=59;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=112,138;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,17:0.302:58:24,7:16,8:0|1:75714391_G_T:75714391:24,17,9,8
chr3	75714394	.	G	T	.	.	DP=55;ECNT=11;MBQ=32,28;MFRL=111,138;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=51.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,15:0.283:55:23,6:16,7:0|1:75714391_G_T:75714391:22,18,7,8
chr3	75714396	.	T	TG	.	.	DP=53;ECNT=11;MBQ=28,30;MFRL=125,144;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=45.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,14:0.276:52:21,6:16,6:0|1:75714391_G_T:75714391:20,18,7,7
chr3	75714422	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=34,26;MFRL=154,136;MMQ=48,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:12,3:16,1:10,18,0,4
chr3	75714423	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=161,154;MMQ=56,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:9,5:12,5:5,16,4,6
chr3	75714447	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=203,162;MMQ=60,43;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:5,4:10,6:6,9,1,9
chr3	75714459	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=181,184;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:9,2:13,0:7,15,1,2
chr3	75714465	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=33,33;MFRL=167,186;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:8,2:8,5:6,16,2,5
chr3	75714608	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=35,25;MFRL=206,196;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:8,4:7,5:11,4,7,2
chr3	75714648	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=166,127;MMQ=49,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:17,2:5,3:15,7,4,1
chr3	75714663	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=165,127;MMQ=49,42;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.313:36:18,6:7,5:17,8,8,3
chr3	75714674	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=135,147;MMQ=50,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,12:0.333:37:18,7:7,5:13,12,8,4
chr3	75714702	.	A	G	.	.	DP=44;ECNT=6;MBQ=27,33;MFRL=160,153;MMQ=60,50;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=115.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,32:0.787:40:6,20:2,11:4,4,18,14
chr3	75714709	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=169,200;MMQ=56,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,11:0.278:41:18,7:10,4:14,16,7,4
chr3	75714771	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=17;MBQ=28,32;MFRL=173,168;MMQ=50,25;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.118:40:19,2:17,2:14,22,1,3
chr3	75714788	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=17;MBQ=29,30;MFRL=156,128;MMQ=49,31;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,3:0.081:47:19,0:24,3:0|1:75714788_A_C:75714788:14,30,0,3
chr3	75714805	.	TG	T	.	.	DP=47;ECNT=17;MBQ=29,27;MFRL=156,167;MMQ=31,43;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=58.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,16:0.362:45:9,9:17,6:0|1:75714805_TG_T:75714805:10,19,7,9
chr3	75714807	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=17;MBQ=32,28;MFRL=156,161;MMQ=31,42;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,17:0.375:46:12,10:17,6:0|1:75714805_TG_T:75714805:10,19,8,9
chr3	75714809	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=17;MBQ=32,30;MFRL=156,172;MMQ=47,25;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,4:0.104:46:21,2:21,2:0|1:75714788_A_C:75714788:16,26,2,2
chr3	75714819	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=17;MBQ=28,29;MFRL=175,172;MMQ=50,25;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,6:0.175:38:16,3:16,3:0|1:75714788_A_C:75714788:18,14,3,3
chr3	75714825	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=17;MBQ=33,28;MFRL=186,161;MMQ=52,39;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,19:0.513:37:7,10:9,8:0|1:75714805_TG_T:75714805:14,4,10,9
chr3	75714831	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=17;MBQ=29,30;MFRL=173,172;MMQ=44,25;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:13,3:12,3:0|1:75714788_A_C:75714788:19,8,4,2
chr3	75714835	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=17;MBQ=32,29;MFRL=174,172;MMQ=44,26;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,8:0.231:36:11,4:13,3:0|1:75714788_A_C:75714788:20,8,5,3
chr3	75714840	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=17;MBQ=29,32;MFRL=193,169;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=102.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,26:0.729:35:3,13:6,12:8,1,16,10
chr3	75714843	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=17;MBQ=25,28;MFRL=189,165;MMQ=54,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=72.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,19:0.513:37:7,9:11,9:0|1:75714805_TG_T:75714805:14,4,11,8
chr3	75714853	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=29,29;MFRL=195,174;MMQ=50,41;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,18:0.487:37:8,10:11,8:0|1:75714805_TG_T:75714805:15,4,11,7
chr3	75714898	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=17;MBQ=33,28;MFRL=163,135;MMQ=54,50;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,9:0.212:45:11,4:25,5:21,15,6,3
chr3	75714917	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=17;MBQ=33,28;MFRL=155,168;MMQ=50,46;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,12:0.228:55:18,4:23,6:0|1:75714917_G_A:75714917:28,15,5,7
chr3	75714923	.	G	C	.	.	DP=58;ECNT=17;MBQ=32,32;MFRL=149,202;MMQ=50,47;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,3:0.068:57:23,1:28,2:30,24,3,0
chr3	75714929	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=17;MBQ=32,27;MFRL=146,174;MMQ=50,47;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,11:0.197:59:21,4:25,7:0|1:75714917_G_A:75714917:28,20,5,6
chr3	75714950	.	C	A	.	.	DP=70;ECNT=17;MBQ=32,28;MFRL=151,174;MMQ=50,39;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,11:0.174:67:27,4:27,7:0|1:75714917_G_A:75714917:34,22,5,6
chr3	75715173	.	CT	TG	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=33,25;MFRL=183,212;MMQ=60,39;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,6:0.113:60:28,2:26,4:0|1:75715173_CT_TG:75715173:27,27,5,1
chr3	75715181	.	G	A	.	.	DP=61;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=177,212;MMQ=60,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,6:0.115:59:26,2:25,4:0|1:75715173_CT_TG:75715173:26,27,5,1
chr3	75715199	.	T	G	.	.	DP=45;ECNT=10;MBQ=28,34;MFRL=171,188;MMQ=50,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,16:0.378:43:12,7:15,8:0|1:75715199_T_G:75715199:11,16,7,9
chr3	75715202	.	G	C	.	.	DP=41;ECNT=10;MBQ=33,34;MFRL=183,198;MMQ=50,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,14:0.349:41:11,6:14,8:0|1:75715199_T_G:75715199:11,16,6,8
chr3	75715205	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=180,187;MMQ=53,42;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.194:39:15,2:16,5:14,18,3,4
chr3	75715220	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=10;MBQ=34,28;MFRL=187,177;MMQ=49,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:10,1:15,4:8,20,2,3
chr3	75715222	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=10;MBQ=28,33;MFRL=185,177;MMQ=50,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.293:31:7,4:15,5:5,17,3,6
chr3	75715261	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=191,181;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:3,8:9,3:2,10,1,10
chr3	75715264	.	CC	TG	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=34,30;MFRL=188,170;MMQ=60,42;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:5,5:11,1:3,14,0,6
chr3	75715268	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=181,171;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:7,3:11,1:2,17,1,3
chr3	75785996	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=158,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=81.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.724:27:3,9:4,11:7,0,19,1
chr3	75785999	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=16;MBQ=30,35;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,18:0.613:29:4,8:7,8:0|1:75785999_A_G:75785999:11,0,17,1
chr3	75786007	.	CA	TG	.	.	DP=35;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=78.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,20:0.568:35:6,9:6,8:0|1:75785999_A_G:75785999:14,1,19,1
chr3	75786013	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,5:0.158:36:16,2:12,2:0|1:75786013_G_C:75786013:29,2,5,0
chr3	75786031	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=30,34;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,4:0.116:41:17,3:18,1:0|1:75786013_G_C:75786013:34,3,4,0
chr3	75786035	.	G	GA	.	.	DP=47;ECNT=16;MBQ=34,32;MFRL=153,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=51.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,21:0.468:45:16,10:8,11:21,3,20,1
chr3	75786036	.	A	C	.	.	DP=48;ECNT=16;MBQ=30,32;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,5:0.120:48:23,3:18,2:0|1:75786013_G_C:75786013:39,4,5,0
chr3	75786042	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=137.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,34:0.648:52:10,17:7,14:0|1:75785999_A_G:75785999:15,3,33,1
chr3	75786059	.	CA	TA,TG	.	.	DP=56;ECNT=16;MBQ=33,27,25;MFRL=143,158,112;MMQ=60,60,60;MPOS=23,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=89.44,59.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,24,17:0.434,0.312:55:8,13,3:6,9,13:10,4,35,6
chr3	75786071	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=32,30;MFRL=128,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=120.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,32:0.471:68:10,19:24,11:0|1:75786071_C_A:75786071:24,12,27,5
chr3	75786073	.	C	G	.	.	DP=69;ECNT=16;MBQ=32,36;MFRL=145,153;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,3:0.058:66:27,2:36,1:47,16,3,0
chr3	75786079	.	CG	TA	.	.	DP=77;ECNT=16;MBQ=31,27;MFRL=124,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=122.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,34:0.473:72:9,20:26,12:0|1:75786071_C_A:75786071:26,12,25,9
chr3	75786080	.	G	T,A	.	.	DP=76;ECNT=16;MBQ=26,26,28;MFRL=142,159,117;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.76,68.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,27:0.138,0.607:42:4,2,7:6,3,20:7,3,17,15
chr3	75786132	.	T	C	.	.	DP=137;ECNT=16;MBQ=29,30;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=190.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,59:0.513:115:20,37:32,21:0|1:75786132_T_C:75786132:27,29,28,31
chr3	75786163	.	C	T	.	.	DP=117;ECNT=16;MBQ=33,27;MFRL=146,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=192.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,61:0.540:113:20,32:26,21:0|1:75786132_T_C:75786132:25,27,29,32
chr3	75786175	.	C	A	.	.	DP=108;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=145,148;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,11:0.110:107:46,5:39,6:50,46,7,4
chr3	75786202	.	TG	CA	.	.	DP=103;ECNT=13;MBQ=29,33;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:93,10:0.105:103:50,6:41,4:0|1:75786202_TG_CA:75786202:46,47,7,3
chr3	75786211	.	A	G	.	.	DP=101;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=138,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,49:0.499:98:20,30:28,18:0|1:75786211_A_G:75786211:26,23,22,27
chr3	75786221	.	G	A	.	.	DP=91;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:79,12:0.140:91:38,6:37,6:0|1:75786202_TG_CA:75786202:33,46,7,5
chr3	75786225	.	G	A	.	.	DP=89;ECNT=13;MBQ=32,27;MFRL=151,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:74,13:0.152:87:35,7:33,5:28,46,8,5
chr3	75786230	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=136,155;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,8:0.102:81:35,4:31,3:28,45,2,6
chr3	75786243	.	C	T	.	.	DP=72;ECNT=13;MBQ=33,28;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=91.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,25:0.351:72:24,14:20,10:0|1:75786211_A_G:75786211:19,28,4,21
chr3	75786245	.	T	A	.	.	DP=73;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=91.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,25:0.347:73:25,14:18,9:0|1:75786211_A_G:75786211:19,29,4,21
chr3	75786251	.	GG	AT	.	.	DP=68;ECNT=13;MBQ=32,25;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,19:0.286:68:26,11:19,6:0|1:75786202_TG_CA:75786202:13,36,9,10
chr3	75786252	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,25:0.507:50:14,14:9,10:0|1:75786211_A_G:75786211:10,15,4,21
chr3	75786256	.	T	A	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=28,25;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,24:0.368:66:25,13:14,9:0|1:75786211_A_G:75786211:16,26,3,21
chr3	75786278	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=25,33;MFRL=147,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=78.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,21:0.407:52:17,12:10,8:0|1:75786211_A_G:75786211:10,21,4,17
chr3	75786302	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=81.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,21:0.500:42:12,14:8,7:0|1:75786211_A_G:75786211:8,13,5,16
chr3	75786314	.	CCTACATTCT	C	.	.	DP=39;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,19:0.488:39:10,13:6,6:0|1:75786211_A_G:75786211:9,11,4,15
chr3	75786379	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=39;MBQ=28,32;MFRL=197,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,17:0.514:33:3,9:11,8:8,8,9,8
chr3	75786381	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=39;MBQ=29,33;MFRL=225,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.368:36:9,3:12,9:12,11,6,7
chr3	75786385	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=39;MBQ=31,33;MFRL=227,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=117.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,29:0.750:38:2,11:7,16:5,4,15,14
chr3	75786387	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=39;MBQ=26,33;MFRL=214,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,9:0.227:42:13,3:18,6:0|1:75786387_T_C:75786387:17,16,3,6
chr3	75786403	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=39;MBQ=28,28;MFRL=189,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,11:0.235:49:17,3:18,7:0|1:75786387_T_C:75786387:19,19,6,5
chr3	75786415	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=39;MBQ=33,25;MFRL=183,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,10:0.207:51:18,4:21,6:0|1:75786387_T_C:75786387:22,19,7,3
chr3	75786417	.	T	C	.	.	DP=51;ECNT=39;MBQ=25,34;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=94.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,26:0.509:51:9,14:15,11:0|1:75786417_T_C:75786417:16,9,12,14
chr3	75786421	.	G	T	.	.	DP=51;ECNT=39;MBQ=32,30;MFRL=178,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.077:50:21,2:24,1:0|1:75786421_G_T:75786421:26,21,1,2
chr3	75786423	.	T	TTC	.	.	DP=50;ECNT=39;MBQ=28,30;MFRL=178,249;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TC;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,3:0.077:50:21,2:25,1:0|1:75786421_G_T:75786421:26,21,1,2
chr3	75786430	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=39;MBQ=32,29;MFRL=189,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,8:0.173:50:18,6:24,2:21,21,5,3
chr3	75786438	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=39;MBQ=33,29;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=121.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,31:0.542:57:10,16:13,12:0|1:75786417_T_C:75786417:15,11,16,15
chr3	75786440	.	C	T	.	.	DP=53;ECNT=39;MBQ=32,28;MFRL=168,182;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=183.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,45:0.837:53:3,21:5,22:5,3,26,19
chr3	75786449	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=39;MBQ=32,25;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,9:0.175:55:21,3:23,6:27,19,6,3
chr3	75786450	.	G	A	.	.	DP=55;ECNT=39;MBQ=31,29;MFRL=167,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=117.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,30:0.544:55:10,15:14,15:0|1:75786417_T_C:75786417:15,10,18,12
chr3	75786453	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=39;MBQ=32,28;MFRL=175,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=154.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,38:0.697:54:8,15:8,19:9,7,24,14
chr3	75786469	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=39;MBQ=33,29;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,14:0.288:50:15,8:20,6:0|1:75786469_G_A:75786469:23,13,9,5
chr3	75786476	.	G	A	.	.	DP=53;ECNT=39;MBQ=33,31;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,15:0.291:53:12,9:24,4:0|1:75786469_G_A:75786469:22,16,11,4
chr3	75786483	.	C	A	.	.	DP=50;ECNT=39;MBQ=33,30;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,14:0.306:47:15,6:18,8:18,15,9,5
chr3	75786490	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=39;MBQ=33,35;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,14:0.263:55:15,9:21,5:0|1:75786469_G_A:75786469:17,24,11,3
chr3	75786499	.	CA	TG	.	.	DP=60;ECNT=39;MBQ=31,30;MFRL=161,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,5:0.097:60:25,3:25,2:28,27,2,3
chr3	75786500	.	AT	GA,GT	.	.	DP=60;ECNT=39;MBQ=28,29,28;MFRL=175,160,137;MMQ=60,60,60;MPOS=12,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=60.45,72.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:18,17,20:0.310,0.362:55:8,10,8:10,5,10:6,12,21,16
chr3	75786506	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=39;MBQ=28,32;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=79.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,22:0.354:63:22,10:18,11:0|1:75786506_T_C:75786506:21,20,10,12
chr3	75786515	.	GG	AG,AT	.	.	DP=70;ECNT=39;MBQ=32,27,30;MFRL=168,157,177;MMQ=60,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=191.91,15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,48,6:0.671,0.095:70:6,27,4:8,16,2:4,12,28,26
chr3	75786518	.	A	C	.	.	DP=66;ECNT=39;MBQ=26,32;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,19:0.294:66:22,14:23,5:0|1:75786469_G_A:75786469:19,28,12,7
chr3	75786521	.	G	A	.	.	DP=67;ECNT=39;MBQ=32,29;MFRL=158,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,20:0.313:65:21,14:23,6:0|1:75786469_G_A:75786469:18,27,13,7
chr3	75786533	.	T	G	.	.	DP=67;ECNT=39;MBQ=28,32;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=83.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,24:0.362:67:23,13:16,10:0|1:75786506_T_C:75786506:22,21,11,13
chr3	75786555	.	C	CTG	.	.	DP=84;ECNT=39;MBQ=35,33;MFRL=168,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=217.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,55:0.712:77:13,30:8,19:11,11,28,27
chr3	75786572	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=39;MBQ=27,28;MFRL=149,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=80.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,26:0.335:78:27,16:22,8:34,18,12,14
chr3	75786586	.	G	T	.	.	DP=81;ECNT=39;MBQ=32,29;MFRL=146,202;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:73,8:0.108:81:37,6:31,2:0|1:75786586_G_T:75786586:48,25,4,4
chr3	75786593	.	C	A	.	.	DP=81;ECNT=39;MBQ=32,27;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,9:0.120:81:39,6:33,2:0|1:75786586_G_T:75786586:47,25,5,4
chr3	75786597	.	C	T	.	.	DP=84;ECNT=39;MBQ=31,28;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,16:0.198:84:35,9:30,7:0|1:75786597_C_T:75786597:45,23,7,9
chr3	75786598	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=39;MBQ=30,29;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,9:0.114:86:38,5:35,3:0|1:75786586_G_T:75786586:48,29,5,4
chr3	75786607	.	C	T	.	.	DP=92;ECNT=39;MBQ=32,28;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=56.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,17:0.191:92:33,7:39,8:0|1:75786597_C_T:75786597:48,27,7,10
chr3	75786608	.	C	T	.	.	DP=90;ECNT=39;MBQ=32,28;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,7:0.087:90:35,4:41,3:0|1:75786586_G_T:75786586:49,34,5,2
chr3	75786610	.	T	G	.	.	DP=91;ECNT=39;MBQ=28,33;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,15:0.172:91:33,6:38,7:0|1:75786597_C_T:75786597:49,27,6,9
chr3	75786619	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=39;MBQ=28,27;MFRL=142,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,15:0.174:90:31,6:36,9:0|1:75786597_C_T:75786597:49,26,7,8
chr3	75786620	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=39;MBQ=33,30;MFRL=146,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:81,4:0.057:85:35,2:42,2:0|1:75786586_G_T:75786586:49,32,4,0
chr3	75786623	.	G	T	.	.	DP=88;ECNT=39;MBQ=33,25;MFRL=156,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=117.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,48:0.562:85:13,24:23,22:23,14,30,18
chr3	75786628	.	G	C	.	.	DP=84;ECNT=39;MBQ=33,31;MFRL=148,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,10:0.132:81:30,3:36,7:38,33,6,4
chr3	75786662	.	A	T	.	.	DP=96;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=156,221;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,5:0.061:96:45,4:45,1:45,46,2,3
chr3	75786670	.	G	A	.	.	DP=106;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=167,143;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,52:0.514:101:24,33:23,19:26,23,21,31
chr3	75786672	.	C	T	.	.	DP=104;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=156,136;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:99,5:0.056:104:51,4:37,0:46,53,2,3
chr3	75786681	.	G	A	.	.	DP=97;ECNT=6;MBQ=30,28;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=270.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,69:0.730:94:12,42:13,23:14,11,30,39
chr3	75786684	.	G	T	.	.	DP=96;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=156,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:89,4:0.052:93:53,4:34,0:40,49,2,2
chr3	75786687	.	A	T	.	.	DP=95;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:86,8:0.093:94:50,4:32,4:42,44,2,6
chr3	75786737	.	A	T	.	.	DP=84;ECNT=26;MBQ=29,29;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=215.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,56:0.678:82:11,26:14,28:15,11,27,29
chr3	75786740	.	CA	GG	.	.	DP=82;ECNT=26;MBQ=32,34;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:69,12:0.157:81:26,8:36,4:0|1:75786740_CA_GG:75786740:33,36,8,4
chr3	75786741	.	A	G	.	.	DP=81;ECNT=26;MBQ=28,30;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=170.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,46:0.670:68:9,19:12,23:0|1:75786741_A_G:75786741:12,10,22,24
chr3	75786748	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=26;MBQ=32,28;MFRL=179,198;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,8:0.103:85:34,5:38,3:0|1:75786748_C_T:75786748:39,38,4,4
chr3	75786753	.	C	T	.	.	DP=88;ECNT=26;MBQ=31,29;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,17:0.204:86:31,5:32,11:36,33,7,10
chr3	75786754	.	G	T	.	.	DP=93;ECNT=26;MBQ=31,28;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,15:0.168:93:31,9:39,4:0|1:75786740_CA_GG:75786740:37,41,9,6
chr3	75786759	.	T	C	.	.	DP=91;ECNT=26;MBQ=28,33;MFRL=171,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=257.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,63:0.688:91:14,30:13,31:12,16,33,30
chr3	75786760	.	TC	T	.	.	DP=90;ECNT=26;MBQ=29,28;MFRL=179,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=C;STR;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:84,6:0.076:90:39,5:42,1:0|1:75786748_C_T:75786748:41,43,3,3
chr3	75786764	.	C	CT	.	.	DP=90;ECNT=26;MBQ=30,32;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:74,16:0.185:90:36,8:37,7:0|1:75786740_CA_GG:75786740:35,39,10,6
chr3	75786773	.	T	A	.	.	DP=88;ECNT=26;MBQ=28,28;MFRL=169,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=170.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,44:0.504:88:23,19:18,21:0|1:75786741_A_G:75786741:22,22,22,22
chr3	75786784	.	T	C	.	.	DP=71;ECNT=26;MBQ=29,30;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,12:0.178:71:26,7:29,3:0|1:75786740_CA_GG:75786740:29,30,7,5
chr3	75786802	.	G	C,A	.	.	DP=63;ECNT=26;MBQ=31,35,28;MFRL=171,198,187;MMQ=60,60,60;MPOS=26,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.70,110.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:30,4,29:0.076,0.455:63:17,1,17:10,3,12:13,17,17,16
chr3	75786817	.	CACATTCATT	C,AACATTCATT	.	.	DP=70;ECNT=26;MBQ=33,35,28;MFRL=163,172,198;MMQ=60,60,60;MPOS=7,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=26.17,10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:51,9,4:0.150,0.068:64:24,4,1:17,5,3:28,23,6,7
chr3	75786827	.	A	T	.	.	DP=55;ECNT=26;MBQ=28,28;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=159.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,39:0.715:54:6,19:8,15:7,8,22,17
chr3	75786832	.	C	T	.	.	DP=60;ECNT=26;MBQ=31,28;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=153.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,39:0.690:56:7,22:7,14:9,8,24,15
chr3	75786845	.	T	C	.	.	DP=64;ECNT=26;MBQ=30,32;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=200.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,49:0.769:63:6,24:8,22:5,9,28,21
chr3	75786854	.	A	T	.	.	DP=71;ECNT=26;MBQ=29,28;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=108.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,37:0.535:69:13,19:16,18:17,15,22,15
chr3	75786866	.	G	T	.	.	DP=85;ECNT=26;MBQ=32,30;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,19:0.230:85:26,10:34,8:0|1:75786866_G_T:75786866:37,29,9,10
chr3	75786888	.	C	T	.	.	DP=94;ECNT=26;MBQ=30,28;MFRL=172,136;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,15:0.168:93:32,9:43,6:0|1:75786888_C_T:75786888:33,45,9,6
chr3	75786892	.	A	C	.	.	DP=96;ECNT=26;MBQ=29,30;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=63.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:77,19:0.204:96:33,8:38,9:0|1:75786866_G_T:75786866:36,41,8,11
chr3	75786894	.	GT	G	.	.	DP=96;ECNT=26;MBQ=32,32;MFRL=172,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=47.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:78,16:0.175:94:32,9:44,6:0|1:75786888_C_T:75786888:33,45,9,7
chr3	75786899	.	T	C	.	.	DP=94;ECNT=26;MBQ=28,34;MFRL=160,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=63.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:75,19:0.208:94:29,7:42,11:0|1:75786866_G_T:75786866:34,41,8,11
chr3	75786916	.	C	A	.	.	DP=105;ECNT=26;MBQ=33,28;MFRL=151,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=66.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,20:0.196:105:40,8:40,10:0|1:75786866_G_T:75786866:39,46,10,10
chr3	75786919	.	A	T	.	.	DP=109;ECNT=26;MBQ=27,28;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=66.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:85,20:0.196:105:42,8:38,10:0|1:75786866_G_T:75786866:38,47,10,10
chr3	75786921	.	G	A	.	.	DP=107;ECNT=26;MBQ=32,29;MFRL=145,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:91,14:0.140:105:47,8:41,6:41,50,7,7
chr3	75786942	.	C	A	.	.	DP=111;ECNT=26;MBQ=33,28;MFRL=152,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:97,10:0.093:107:48,8:46,2:40,57,6,4
chr3	75786965	.	C	T	.	.	DP=115;ECNT=18;MBQ=33,29;MFRL=126,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=177.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,56:0.499:112:32,30:20,25:0|1:75786965_C_T:75786965:24,32,22,34
chr3	75786991	.	C	T	.	.	DP=85;ECNT=18;MBQ=33,28;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=132.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,38:0.448:85:26,16:17,21:0|1:75786965_C_T:75786965:17,30,13,25
chr3	75786993	.	T	A	.	.	DP=83;ECNT=18;MBQ=29,28;MFRL=150,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:78,5:0.070:83:39,4:37,1:28,50,2,3
chr3	75787015	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,21:0.297:72:21,13:25,8:0|1:75787015_C_T:75787015:18,33,8,13
chr3	75787032	.	T	C	.	.	DP=70;ECNT=18;MBQ=28,30;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=82.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,24:0.347:70:27,9:18,11:0|1:75787032_T_C:75787032:16,30,10,14
chr3	75787042	.	G	GAAAT	.	.	DP=69;ECNT=18;MBQ=32,32;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=91.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,25:0.366:69:24,11:19,12:0|1:75787032_T_C:75787032:16,28,10,15
chr3	75787043	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=18;MBQ=32,25;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=57.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,17:0.240:73:24,12:22,4:0|1:75787015_C_T:75787015:22,34,6,11
chr3	75787044	.	A	ACTT	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=26,27;MFRL=160,145;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=103.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,28:0.382:74:24,10:15,10:0|1:75787032_T_C:75787032:18,28,11,17
chr3	75787047	.	G	GACTTATA	.	.	DP=69;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,17:0.254:69:20,12:27,4:0|1:75787015_C_T:75787015:21,31,7,10
chr3	75787049	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=18;MBQ=33,25;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,11:0.174:67:26,7:27,3:22,34,4,7
chr3	75787057	.	G	A	.	.	DP=73;ECNT=18;MBQ=35,27;MFRL=196,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=217.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,54:0.743:72:6,30:12,17:8,10,24,30
chr3	75787081	.	A	T	.	.	DP=75;ECNT=18;MBQ=28,29;MFRL=180,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,16:0.221:75:32,8:25,2:0|1:75787015_C_T:75787015:26,33,5,11
chr3	75787098	.	CCT	C	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=32,30;MFRL=181,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=76.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,22:0.329:68:23,14:20,8:23,23,9,13
chr3	75787116	.	T	G	.	.	DP=73;ECNT=18;MBQ=28,32;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:60,13:0.187:73:33,8:21,5:0|1:75787015_C_T:75787015:30,30,6,7
chr3	75787127	.	G	T	.	.	DP=72;ECNT=18;MBQ=32,28;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,13:0.189:72:32,9:23,4:0|1:75787015_C_T:75787015:31,28,7,6
chr3	75787145	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=18;MBQ=27,27;MFRL=150,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=107.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,31:0.432:72:20,21:19,7:0|1:75787145_T_C:75787145:25,16,13,18
chr3	75787159	.	C	T	.	.	DP=68;ECNT=18;MBQ=30,29;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=83.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,24:0.362:67:21,15:18,6:0|1:75787145_T_C:75787145:27,16,9,15
chr3	75787169	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=18;MBQ=30,28;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=140.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,37:0.596:62:11,26:12,11:14,11,19,18
chr3	75787186	.	C	T	.	.	DP=63;ECNT=21;MBQ=33,28;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,34:0.540:63:13,13:15,16:16,13,17,17
chr3	75787199	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=21;MBQ=28,32;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:42,20:0.328:62:18,10:18,8:0|1:75787199_A_C:75787199:20,22,12,8
chr3	75787218	.	T	A	.	.	DP=60;ECNT=21;MBQ=29,29;MFRL=141,137;MMQ=60,57;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:55,4:0.082:59:27,1:22,3:0|1:75787218_T_A:75787218:25,30,2,2
chr3	75787221	.	CA	TG,TA	.	.	DP=59;ECNT=21;MBQ=33,31,25;MFRL=127,137,166;MMQ=60,57,60;MPOS=24,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.84,68.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,4,19:0.081,0.323:59:20,1,9:14,3,7:14,22,12,11
chr3	75787224	.	C	T,G	.	.	DP=55;ECNT=21;MBQ=28,27,32;MFRL=122,137,176;MMQ=60,57,60;MPOS=21,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.00,61.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,4,17:0.086,0.310:55:16,1,8:15,2,6:13,21,11,10
chr3	75787236	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=32,29;MFRL=136,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,17:0.305:57:22,9:17,6:0|1:75787199_A_C:75787199:17,23,8,9
chr3	75787240	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=21;MBQ=27,34;MFRL=146,130;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:54,3:0.068:57:31,1:17,2:0|1:75787218_T_A:75787218:22,32,1,2
chr3	75787244	.	A	G	.	.	DP=55;ECNT=21;MBQ=25,33;MFRL=157,130;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,3:0.070:55:33,1:18,2:0|1:75787218_T_A:75787218:20,32,1,2
chr3	75787266	.	CCT	C	.	.	DP=49;ECNT=21;MBQ=32,33;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=57.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,16:0.333:49:15,7:13,8:0|1:75787199_A_C:75787199:11,22,6,10
chr3	75787269	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=21;MBQ=32,28;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,15:0.355:43:16,7:10,8:0|1:75787199_A_C:75787199:11,17,5,10
chr3	75787279	.	A	T	.	.	DP=39;ECNT=21;MBQ=24,30;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.392:39:13,5:8,9:10,14,5,10
chr3	75787288	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=21;MBQ=28,33;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,13:0.389:34:11,5:8,8:0|1:75787199_A_C:75787199:10,11,5,8
chr3	75787298	.	TG	CA	.	.	DP=33;ECNT=21;MBQ=28,33;MFRL=150,176;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.400:33:11,1:9,9:0|1:75787199_A_C:75787199:9,11,3,10
chr3	75787302	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=21;MBQ=29,32;MFRL=156,174;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:10,1:7,9:0|1:75787199_A_C:75787199:8,12,3,9
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chr3	75787353	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=21;MBQ=33,30;MFRL=179,149;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=37.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,11:0.240:48:18,6:15,4:0|1:75787347_TCCC_T:75787347:20,17,8,3
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chr3	75787405	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,27;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,19:0.377:51:17,10:14,8:0|1:75787405_C_T:75787405:16,16,12,7
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chr3	75787424	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=27,32;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,27:0.540:51:11,10:8,15:9,15,17,10
chr3	75787427	.	T	C	.	.	DP=55;ECNT=16;MBQ=27,33;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,19:0.370:53:12,10:18,7:0|1:75787405_C_T:75787405:14,20,11,8
chr3	75787455	.	A	G	.	.	DP=60;ECNT=16;MBQ=28,32;MFRL=169,153;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,11:0.194:60:23,2:25,8:0|1:75787455_A_G:75787455:22,27,4,7
chr3	75787458	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=16;MBQ=33,27;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,6:0.109:62:23,2:27,4:26,30,1,5
chr3	75787462	.	GC	AT	.	.	DP=63;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=165,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:52,11:0.185:63:25,2:25,9:0|1:75787455_A_G:75787455:23,29,4,7
chr3	75787464	.	C	T	.	.	DP=64;ECNT=16;MBQ=34,29;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=91.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,25:0.400:63:12,15:21,10:0|1:75787464_C_T:75787464:14,24,13,12
chr3	75787474	.	G	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,12:0.186:68:27,3:24,8:0|1:75787455_A_G:75787455:29,27,3,9
chr3	75787476	.	C	T,A	.	.	DP=70;ECNT=16;MBQ=33,25,28;MFRL=164,155,176;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=39.06,43.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:35,20,13:0.295,0.192:68:14,13,3:19,6,8:15,20,17,16
chr3	75787486	.	C	T	.	.	DP=74;ECNT=16;MBQ=32,27;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=175.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,44:0.592:74:12,23:18,20:14,16,23,21
chr3	75787490	.	A	T	.	.	DP=77;ECNT=16;MBQ=28,32;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=38.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,12:0.165:77:32,3:26,9:0|1:75787455_A_G:75787455:34,31,2,10
chr3	75787511	.	C	A	.	.	DP=68;ECNT=16;MBQ=33,28;MFRL=174,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,11:0.171:68:31,4:22,7:0|1:75787455_A_G:75787455:33,24,4,7
chr3	75787516	.	C	G	.	.	DP=67;ECNT=16;MBQ=33,35;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=114.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,30:0.449:67:14,21:21,9:0|1:75787464_C_T:75787464:20,17,17,13
chr3	75787519	.	CT	AG	.	.	DP=71;ECNT=16;MBQ=32,29;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=116.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,31:0.451:69:14,21:20,10:0|1:75787464_C_T:75787464:19,19,17,14
chr3	75787520	.	T	G	.	.	DP=70;ECNT=16;MBQ=26,30;MFRL=164,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=34.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,13:0.338:39:9,5:16,7:0|1:75787455_A_G:75787455:14,12,6,7
chr3	75787620	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=10;MBQ=28,31;MFRL=178,159;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,7:0.131:55:25,2:22,5:19,29,4,3
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chr3	75787645	.	GAA	G	.	.	DP=62;ECNT=10;MBQ=32,32;MFRL=170,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=A;STR;TLOD=73.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,21:0.349:61:13,10:21,9:0|1:75787637_C_T:75787637:16,24,8,13
chr3	75787679	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=10;MBQ=25,33;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,15:0.340:45:9,8:18,5:0|1:75787679_T_C:75787679:13,17,4,11
chr3	75787688	.	T	A	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=28,28;MFRL=178,183;MMQ=60,54;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=74.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,24:0.438:55:9,11:21,13:0|1:75787679_T_C:75787679:15,16,11,13
chr3	75787702	.	C	G	.	.	DP=55;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=128.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,35:0.667:52:4,11:13,24:7,10,19,16
chr3	75787726	.	G	A	.	.	DP=54;ECNT=10;MBQ=30,29;MFRL=177,166;MMQ=60,57;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=172.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,42:0.768:54:3,13:7,27:8,4,24,18
chr3	75787728	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=10;MBQ=30,25;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,9:0.167:58:17,2:28,6:28,21,7,2
chr3	75787732	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=10;MBQ=29,29;MFRL=155,173;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,26:0.429:60:10,10:24,13:21,13,15,11
chr3	75787739	.	A	T	.	.	DP=75;ECNT=10;MBQ=25,26;MFRL=205,159;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=294.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,71:0.961:73:2,24:0,47:1,1,41,30
chr3	75787770	.	C	T	.	.	DP=91;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=147,118;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,6:0.078:86:34,1:43,5:36,44,5,1
chr3	75787794	.	A	G	.	.	DP=95;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=286.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,76:0.803:94:9,35:9,41:8,10,32,44
chr3	75787801	.	TG	CA	.	.	DP=95;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=113.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:58,32:0.359:90:30,11:26,20:23,35,15,17
chr3	75787809	.	T	C	.	.	DP=83;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,32:0.388:83:25,12:25,18:17,34,16,16
chr3	75787840	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:50,6:0.120:56:27,2:22,4:0|1:75787840_C_A:75787840:20,30,1,5
chr3	75787863	.	AT	TA	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=28,29;MFRL=167,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.111:52:20,1:18,3:0|1:75787840_C_A:75787840:21,26,0,5
chr3	75787869	.	CA	TG	.	.	DP=51;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=166,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=172.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,41:0.824:49:3,19:5,19:0|1:75787869_CA_TG:75787869:3,5,18,23
chr3	75787876	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=32,28;MFRL=156,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=158.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,38:0.830:45:2,20:5,16:0|1:75787869_CA_TG:75787869:2,5,16,22
chr3	75787880	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=26,32;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,15:0.321:48:13,10:16,5:12,21,6,9
chr3	75787897	.	T	C	.	.	DP=50;ECNT=12;MBQ=29,27;MFRL=185,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=82.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,25:0.500:50:12,9:13,16:10,15,8,17
chr3	75787918	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=180,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:46,4:0.096:50:21,3:24,1:0|1:75787918_C_T:75787918:18,28,2,2
chr3	75787926	.	T	C	.	.	DP=53;ECNT=12;MBQ=28,34;MFRL=185,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,4:0.092:52:20,3:23,1:0|1:75787918_C_T:75787918:18,30,2,2
chr3	75787927	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=12;MBQ=28,32;MFRL=195,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=126.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,35:0.693:50:7,15:8,18:7,8,11,24
chr3	75787949	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=12;MBQ=34,29;MFRL=207,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=148.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,37:0.808:45:3,13:5,18:3,5,15,22
chr3	75787961	.	A	G	.	.	DP=49;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=207,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.281:47:17,5:15,7:17,17,5,8
chr3	75787962	.	G	C	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=32,34;MFRL=208,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.396:46:11,11:16,7:11,17,10,8
chr3	75788010	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=408,189;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=167.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,43:0.937:45:1,15:1,25:0|1:75788010_A_C:75788010:1,1,25,18
chr3	75788023	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=4;MBQ=31,27;MFRL=187,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=76.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,24:0.498:48:11,7:13,16:0|1:75788010_A_C:75788010:16,8,13,11
chr3	75788028	.	G	C	.	.	DP=49;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,13:0.279:48:12,4:21,9:0|1:75788010_A_C:75788010:22,13,8,5
chr3	75788040	.	G	A	.	.	DP=60;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=181,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,6:0.118:57:21,2:30,4:0|1:75788010_A_C:75788010:30,21,5,1
chr3	75788068	.	A	C	.	.	DP=63;ECNT=29;MBQ=29,31;MFRL=161,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=68.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,25:0.422:61:16,7:20,17:22,14,16,9
chr3	75788076	.	A	C	.	.	DP=67;ECNT=29;MBQ=27,32;MFRL=159,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=196.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,51:0.765:66:7,21:8,27:9,6,31,20
chr3	75788085	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=29;MBQ=27,33;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,5:0.092:63:20,2:30,3:0|1:75788085_A_G:75788085:32,26,5,0
chr3	75788105	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=191,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,7:0.111:70:27,3:32,4:0|1:75788085_A_G:75788085:34,29,4,3
chr3	75788109	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=29;MBQ=33,29;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,8:0.123:71:26,3:31,5:0|1:75788085_A_G:75788085:37,26,5,3
chr3	75788114	.	C	T	.	.	DP=70;ECNT=29;MBQ=33,26;MFRL=188,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,13:0.194:70:25,3:30,9:0|1:75788085_A_G:75788085:34,23,10,3
chr3	75788115	.	G	A	.	.	DP=71;ECNT=29;MBQ=31,29;MFRL=159,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=173.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,44:0.634:69:10,17:14,25:1|0:75788085_A_G:75788085:16,9,27,17
chr3	75788130	.	C	T,A	.	.	DP=76;ECNT=29;MBQ=33,26,30;MFRL=192,173,160;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.25,89.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:29,18,27:0.240,0.369:74:16,4,10:11,11,15:16,13,28,17
chr3	75788137	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=29;MBQ=34,27;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=63.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,19:0.259:75:25,6:25,12:0|1:75788085_A_G:75788085:34,22,10,9
chr3	75788150	.	A	AG	.	.	DP=79;ECNT=29;MBQ=29,29;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=105.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,33:0.438:76:19,15:24,18:25,18,20,13
chr3	75788152	.	T	C,G	.	.	DP=82;ECNT=29;MBQ=28,32,32;MFRL=198,160,202;MMQ=60,60,60;MPOS=18,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=201.62,30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,54,12:0.695,0.145:78:6,21,6:5,32,5:7,5,39,27
chr3	75788192	.	T	C	.	.	DP=82;ECNT=29;MBQ=28,33;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:65,16:0.205:81:28,9:35,7:0|1:75788192_T_C:75788192:28,37,7,9
chr3	75788195	.	A	T	.	.	DP=84;ECNT=29;MBQ=28,29;MFRL=158,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=53.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:68,16:0.198:84:28,9:34,7:0|1:75788192_T_C:75788192:27,41,6,10
chr3	75788199	.	T	C	.	.	DP=86;ECNT=29;MBQ=28,29;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=99.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,40:0.479:83:21,18:21,22:18,25,15,25
chr3	75788200	.	G	A	.	.	DP=86;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,16:0.193:86:31,7:36,6:0|1:75788192_T_C:75788192:28,42,6,10
chr3	75788211	.	C	T	.	.	DP=81;ECNT=29;MBQ=33,29;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:70,11:0.145:81:32,7:35,4:0|1:75788192_T_C:75788192:27,43,5,6
chr3	75788226	.	CA	GG,AG	.	.	DP=79;ECNT=29;MBQ=35,32,26;MFRL=180,152,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=91.87,95.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,26,29:0.346,0.385:75:10,18,13:10,7,16:8,12,19,36
chr3	75788230	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=29;MBQ=33,27;MFRL=162,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,11:0.150:79:33,7:28,4:24,44,5,6
chr3	75788245	.	C	T	.	.	DP=80;ECNT=29;MBQ=33,27;MFRL=166,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,14:0.187:78:30,9:33,4:22,42,9,5
chr3	75788258	.	C	A	.	.	DP=77;ECNT=29;MBQ=33,28;MFRL=161,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=208.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,55:0.709:77:11,28:10,25:0|1:75788258_C_A:75788258:11,11,20,35
chr3	75788260	.	C	A	.	.	DP=85;ECNT=29;MBQ=33,28;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,13:0.163:84:31,6:31,3:0|1:75788260_C_A:75788260:26,45,6,7
chr3	75788270	.	A	T	.	.	DP=81;ECNT=29;MBQ=28,29;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:67,14:0.181:81:29,7:33,7:0|1:75788260_C_A:75788260:29,38,8,6
chr3	75788273	.	G	T	.	.	DP=88;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=165,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:72,15:0.181:87:31,5:37,4:0|1:75788273_G_T:75788273:34,38,9,6
chr3	75788281	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=29;MBQ=28,30;MFRL=162,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=276.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,67:0.716:93:12,28:10,37:0|1:75788258_C_A:75788258:13,13,32,35
chr3	75788291	.	AT	GA	.	.	DP=95;ECNT=29;MBQ=28,33;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=110.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,32:0.337:95:32,10:28,18:0|1:75788291_AT_GA:75788291:33,30,14,18
chr3	75788292	.	T	A	.	.	DP=94;ECNT=29;MBQ=27,29;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=129.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,36:0.555:65:15,18:12,18:14,15,20,16
chr3	75788294	.	A	G	.	.	DP=94;ECNT=29;MBQ=28,30;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:80,14:0.156:94:35,5:41,8:0|1:75788260_C_A:75788260:38,42,9,5
chr3	75788314	.	T	C	.	.	DP=85;ECNT=29;MBQ=28,32;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,22:0.251:85:25,11:30,11:0|1:75788273_G_T:75788273:31,32,8,14
chr3	75788316	.	C	T	.	.	DP=83;ECNT=29;MBQ=32,28;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:57,25:0.309:82:22,11:27,13:0|1:75788291_AT_GA:75788291:24,33,13,12
chr3	75788366	.	C	A	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=33,25;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=46.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,15:0.291:53:20,7:18,8:14,24,4,11
chr3	75788376	.	G	C,GTT	.	.	DP=49;ECNT=13;MBQ=33,32,33;MFRL=168,182,159;MMQ=60,60,60;MPOS=15,21;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.68,18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:25,10,6:0.221,0.157:41:10,4,5:15,6,1:11,14,5,11
chr3	75788382	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,6:0.163:41:12,5:21,1:0|1:75788382_C_T:75788382:14,21,2,4
chr3	75788390	.	A	C,ACTGC	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=28,32,25;MFRL=174,159,180;MMQ=60,60,60;MPOS=10,6;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=19.06,4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:28,6,2:0.163,0.077:36:8,5,2:20,0,0:11,17,2,6
chr3	75788391	.	A	AGACAAAGGGT	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=27,26;MFRL=166,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:13,2:20,0:13,21,0,2
chr3	75788394	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=13;MBQ=32,30;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,5:0.167:34:10,5:17,0:0|1:75788382_C_T:75788382:11,18,2,3
chr3	75788434	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=13;MBQ=33,31;MFRL=213,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:3,2:4,6:1,6,0,8
chr3	75788506	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=13;MBQ=32,32;MFRL=211,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=A;STR;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.604:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr3	75788513	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=13;MBQ=31,26;MFRL=216,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.437:12:6,2:0,3:0,7,0,5
chr3	75788532	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=29,32;MFRL=222,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.375:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr3	75788545	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=227,266;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr3	75788564	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=266,258;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	75788565	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=13;MBQ=25,34;MFRL=227,281;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	75790370	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,22:0.657:33:5,10:5,7:0|1:75790370_A_C:75790370:6,5,19,3
chr3	75790376	.	T	C	.	.	DP=39;ECNT=13;MBQ=28,32;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=98.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,26:0.692:37:5,14:6,12:0|1:75790370_A_C:75790370:6,5,22,4
chr3	75790394	.	C	G	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=32,33;MFRL=170,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,3:0.071:54:24,1:22,2:0|1:75790394_C_G:75790394:30,21,3,0
chr3	75790405	.	TG	AA	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=29,29;MFRL=169,176;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:26,2:26,2:35,22,3,1
chr3	75790406	.	G	C	.	.	DP=61;ECNT=13;MBQ=34,32;MFRL=180,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=136.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,35:0.621:56:9,18:12,15:11,10,23,12
chr3	75790409	.	TG	CA,CT	.	.	DP=64;ECNT=13;MBQ=29,32,35;MFRL=192,155,176;MMQ=60,60,60;MPOS=17,31;POPAF=7.30,7.30;TLOD=177.74,10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,44,4:0.693,0.077:62:6,24,2:7,18,2:5,9,33,15
chr3	75790419	.	TG	CA	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=28,31;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,8:0.132:66:32,3:24,4:0|1:75790394_C_G:75790394:33,25,7,1
chr3	75790427	.	C	T	.	.	DP=75;ECNT=13;MBQ=33,27;MFRL=166,152;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:66,9:0.130:75:33,4:27,4:0|1:75790394_C_G:75790394:37,29,7,2
chr3	75790446	.	GG	TA	.	.	DP=77;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:64,9:0.133:73:31,6:31,2:0|1:75790446_GG_TA:75790446:36,28,4,5
chr3	75790448	.	T	C	.	.	DP=74;ECNT=13;MBQ=28,33;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,9:0.135:72:33,4:29,5:0|1:75790394_C_G:75790394:33,30,6,3
chr3	75790466	.	G	T	.	.	DP=72;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=155,195;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:62,9:0.137:71:31,6:29,2:0|1:75790446_GG_TA:75790446:36,26,4,5
chr3	75790472	.	C	T	.	.	DP=71;ECNT=13;MBQ=33,30;MFRL=155,152;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:66,5:0.082:71:32,4:30,1:37,29,1,4
chr3	75790479	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=170,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=62.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,25:0.388:65:22,13:17,12:19,21,11,14
chr3	75790513	.	T	C	.	.	DP=57;ECNT=9;MBQ=27,33;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=201.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,50:0.946:52:0,26:2,24:0|1:75790513_T_C:75790513:1,1,19,31
chr3	75790516	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=9;MBQ=29,29;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,14:0.283:51:18,7:18,6:0|1:75790513_T_C:75790513:14,23,4,10
chr3	75790527	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,4:0.102:47:22,2:21,2:0|1:75790513_T_C:75790513:14,29,0,4
chr3	75790536	.	A	T	.	.	DP=48;ECNT=9;MBQ=27,31;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,12:0.260:48:17,5:15,7:0|1:75790513_T_C:75790513:10,26,1,11
chr3	75790542	.	G	T	.	.	DP=46;ECNT=9;MBQ=34,28;MFRL=152,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=89.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,25:0.578:43:6,15:11,10:0|1:75790513_T_C:75790513:4,14,6,19
chr3	75790554	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=89.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,29:0.660:44:8,14:7,12:0|1:75790513_T_C:75790513:4,11,7,22
chr3	75790583	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=9;MBQ=32,25;MFRL=212,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=101.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,26:0.592:44:11,16:6,9:0|1:75790513_T_C:75790513:6,12,9,17
chr3	75790585	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=9;MBQ=33,32;MFRL=212,212;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=104.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,27:0.601:45:12,15:6,10:0|1:75790513_T_C:75790513:6,12,9,18
chr3	75790607	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=215,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=66.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,18:0.475:38:13,10:6,7:0|1:75790513_T_C:75790513:7,13,6,12
chr3	75790668	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=34,27;MFRL=174,341;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,3:6,2:6,4,5,0
chr3	75790704	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=15;MBQ=32,27;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.500:34:7,8:10,9:14,3,15,2
chr3	75790705	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=32,25;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,4:0.135:35:14,1:16,3:0|1:75790705_C_T:75790705:26,5,4,0
chr3	75790717	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=15;MBQ=33,30;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=123.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,31:0.627:49:9,12:9,15:0|1:75790717_G_A:75790717:14,4,26,5
chr3	75790724	.	A	T	.	.	DP=56;ECNT=15;MBQ=30,25;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,14:0.258:56:22,2:18,12:33,9,10,4
chr3	75790726	.	T	C	.	.	DP=59;ECNT=15;MBQ=27,32;MFRL=163,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=148.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,37:0.623:59:11,12:8,23:0|1:75790717_G_A:75790717:17,5,30,7
chr3	75790730	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=15;MBQ=30,25;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=152.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,38:0.619:61:14,13:8,23:0|1:75790717_G_A:75790717:17,6,31,7
chr3	75790733	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=15;MBQ=32,27;MFRL=173,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:53,9:0.150:62:28,2:24,6:0|1:75790705_C_T:75790705:40,13,8,1
chr3	75790747	.	C	G	.	.	DP=58;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=162,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=112.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,29:0.517:56:17,11:9,18:0|1:75790717_G_A:75790717:17,10,22,7
chr3	75790758	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=15;MBQ=34,24;MFRL=154,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,4:0.091:52:24,2:24,2:32,16,1,3
chr3	75790797	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=15;MBQ=28,25;MFRL=151,118;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.221:34:12,4:14,3:0|1:75790797_C_T:75790797:13,14,4,3
chr3	75790810	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=32,26;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:9,4:16,2:0|1:75790797_C_T:75790797:16,11,3,3
chr3	75790811	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=15;MBQ=32,27;MFRL=148,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.200:33:10,4:17,2:0|1:75790797_C_T:75790797:16,11,3,3
chr3	75790814	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=145,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,6:0.206:32:9,4:17,2:0|1:75790797_C_T:75790797:14,12,3,3
chr3	75790822	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=15;MBQ=29,29;MFRL=124,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=71.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,25:0.742:33:6,9:2,14:5,3,14,11
chr3	75790972	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=157,91;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.419:14:6,2:2,2:4,4,3,3
chr3	77147112	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=240,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	77572047	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=191,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,6:6,2:5,4,3,5
chr3	77572057	.	A	ATTTTTTTTGTTGTTGTTGTT	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=211,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:6,0:4,8,1,1
chr3	77599877	.	TCC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=211,118;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=C;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:4,2:7,0,1,1
chr3	77607070	.	A	AC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=237,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:1,4:2,4:2,1,5,4
chr3	77645946	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=121,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:3,3:1,2:2,2,0,5
chr3	77645984	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=166,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr3	78663873	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=181,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,2:9,2:5,12,4,0
chr3	78664011	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=221,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:3,1:1,2:1,4,0,3
chr3	78676405	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=112,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,5:5,0:5,2,4,1
chr3	78676467	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=122,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:2,9:5,4:4,3,9,4
chr3	78680265	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=180,106;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,3:8,0:13,6,3,0
chr3	78680468	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=176,96;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:9,0:0,3:0,9,0,3
chr3	78695185	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=155,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:16,4:11,3:26,1,7,0
chr3	78695326	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,68;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.122:38:11,0:22,4:14,20,2,2
chr3	78695366	.	A	AATAAAAAAAGCTGT	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=154,68;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.102:27:8,0:13,2:0|1:78695366_A_AATAAAAAAAGCTGT:78695366:6,19,0,2
chr3	78695370	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=154,68;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:9,0:12,2:0|1:78695366_A_AATAAAAAAAGCTGT:78695366:6,19,0,2
chr3	78706502	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=221,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	78706514	.	C	CCCAAAAACGT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=252,194;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr3	78706519	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=252,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	78709044	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=265,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.572:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr3	78711299	.	C	CCAACCTCTCTTCACTCTTCAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr3	81548209	.	T	TAAG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=182,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr3	81584268	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=194,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.608:6:1,3:1,1:2,0,4,0
chr3	81630214	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=16,31;MFRL=260,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,3:0,1:1,0,4,0
chr3	81698119	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,1:5,1:4,10,1,1
chr3	81720076	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,284;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:6,6,1,2
chr3	81810516	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=214,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=79.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,29:0.789:36:4,16:3,13:1,6,15,14
chr3	81810702	.	A	AG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr3	86010600	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,0:5,3:3,3,2,1
chr3	87313507	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,1:7,3:9,6,2,2
chr3	87325558	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,1:9,1:5,10,0,2
chr3	88042501	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=164,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.573:12:2,4:3,3:3,2,4,3
chr3	88042990	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr3	88188420	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,6:4,3:6,1,5,4
chr3	88188723	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:9,5:16,0:13,12,4,1
chr3	88189927	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:12,6:3,4:7,8,3,7
chr3	88199179	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,109;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.500:30:4,12:11,3:5,10,10,5
chr3	88199185	.	T	TC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=156,74;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.453:26:5,9:9,3:4,10,7,5
chr3	88205293	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=164,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,0:2,5:3,7,1,4
chr3	88205539	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=66,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.108:35:15,3:16,0:20,12,3,0
chr3	89259624	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=166,76;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:0,2:3,0:1,2,1,1
chr3	89390264	.	T	TACCATGAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=347,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	89456555	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:3,6,0,7
chr3	89480265	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=186,259;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:7,0,1,1
chr3	89498619	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr3	89521602	.	T	TC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,1:9,1:5,6,3,0
chr3	89521725	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,204;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:7,5,1,2
chr3	89521820	.	TTG	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.358:12:4,4:4,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,8,0,4
chr3	89521824	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=34,32;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,8,0,4
chr3	89521828	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,24;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,8,0,4
chr3	89521831	.	TGAAAG	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=160,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,4:4,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,8,0,4
chr3	89521838	.	TTTG	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=152,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:4,4:3,0:0|1:89521820_TTG_T:89521820:0,7,0,4
chr3	89528461	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=194,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:7,0,3,0
chr3	89528477	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=190,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:8,0,3,0
chr3	93722401	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,3:1,0:2,0,4,0
chr3	93754286	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=113,133;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.491:15:1,7:6,0:3,5,4,3
chr3	93768420	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=18,35;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.526:12:2,0:0,4:1,5,0,6
chr3	96533884	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,19;MFRL=174,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.391:11:1,1:0,1:0,7,0,4
chr3	97367230	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,0:2,4:1,2,1,3
chr3	97467361	.	ATCTC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=71,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=TC;STR;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr3	97499532	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,3:10,0:7,14,2,1
chr3	97600097	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=111,162;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:0|1:97600097_A_C:97600097:5,14,0,2
chr3	97600102	.	ATT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=123,162;MMQ=60,34;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:7,2:0|1:97600097_A_C:97600097:5,15,0,2
chr3	97605460	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.357:20:5,1:8,6:11,2,6,1
chr3	97605677	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr3	97611916	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=155,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,3:2,4:0,5,0,7
chr3	97619250	.	C	CAACTA	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:9,2:9,4:5,13,6,0
chr3	97660084	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:11,3:4,5:9,6,4,4
chr3	97660198	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:0,1,2,9
chr3	97669543	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	97727727	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:7,0,1,2
chr3	97727753	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,1:5,1,2,3
chr3	97731434	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:1,2:5,3:0,6,0,5
chr3	97753883	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=156,11;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,0:3,13:0,6,13,0
chr3	97753931	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=208,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	97805954	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=146,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	97806220	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=195,189;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,0:9,4:7,7,0,4
chr3	97806999	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	97851475	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=200,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr3	97851998	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=130,178;MMQ=52,37;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:7,4:7,3:6,8,5,2
chr3	97852229	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=164,106;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:4,3:11,2:8,7,3,2
chr3	97887865	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=125,208;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:4,7,1,2
chr3	97983117	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=178,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:4,7:3,0:6,1,5,2
chr3	97983207	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:7,0:10,4,1,2
chr3	97983257	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,8:4,3:2,4,5,6
chr3	97983265	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=196,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:4,5:6,2:5,5,3,4
chr3	97983374	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=169,132;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,2:8,5:8,6,4,3
chr3	97983391	.	C	G,T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,33,28;MFRL=131,132,206;MMQ=60,40,60;MPOS=19,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=13.14,17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,5,7:0.273,0.364:19:2,2,4:5,3,3:6,1,5,7
chr3	97983487	.	TTGTAACCAC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTAACCAC;STR;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.502:16:3,2:5,6:1,7,2,6
chr3	98001662	.	C	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=279,442;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98001662_C_CA:98001662:1,0,1,0
chr3	98001664	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=279,442;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:98001662_C_CA:98001662:1,0,1,0
chr3	98001670	.	CA	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=257,442;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,0:0,1:0|1:98001662_C_CA:98001662:2,0,1,0
chr3	98073591	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	98109489	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,7,0
chr3	98109996	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,0:0,2:2,4,0,2
chr3	98110406	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:1,5:4,1:2,3,3,3
chr3	98236026	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:9,0:12,4:6,15,0,4
chr3	98251093	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=194,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:10,4:7,9,0,4
chr3	98251120	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:6,0:10,4:5,11,0,4
chr3	98311994	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=202,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,0:6,2:4,7,1,1
chr3	98487206	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:14,1,2,1
chr3	98489686	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=195,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.320:20:5,2:8,4:8,6,4,2
chr3	98491619	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=148,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:8,0:1,5:4,5,3,2
chr3	98491853	.	T	TGAGA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=224,179;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	98503776	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,3:7,3:7,4,4,2
chr3	98503941	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=201,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr3	98507134	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,7:6,0:5,8,4,4
chr3	98512610	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=183,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:9,1:9,8,0,2
chr3	98518160	.	T	TA,TAA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25,26;MFRL=460,225,194;MMQ=60,60,60;MPOS=20,7;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=13.85,3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,6,2:0.591,0.247:9:0,2,1:1,4,1:1,0,7,1
chr3	98519481	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=213,140;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,2:5,6:9,2,5,3
chr3	98531342	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=259,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr3	98536571	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,1,1
chr3	98540982	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=185,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr3	98541012	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	98541422	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:4,0,6,1
chr3	98541633	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=158,303;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr3	98544123	.	CAAA	C,CA,CAA,CAAAA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=31,33,31,33,32;MFRL=96,174,222,165,167;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=12,13,22,12;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=9.67,4.56,6.54,10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:3,8,3,4,5:0.316,0.148,0.179,0.215:23:1,5,1,2,2:2,2,2,2,2:3,0,17,3
chr3	98544203	.	A	G	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,4:0.085:49:22,0:22,3:16,29,1,3
chr3	98544304	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,4:7,4:0,10,0,8
chr3	98544323	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=224,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:2,1:7,3:0,10,0,5
chr3	98600284	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=208,223;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	99643175	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=161,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.402:28:9,5:7,6:9,8,6,5
chr3	99865772	.	TGA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=140,99;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GA;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:3,0:4,6,1,1
chr3	100000706	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=111,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:9,0:4,2:4,9,0,2
chr3	100009610	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=353,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	100015146	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=161,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:4,7:1,3:2,3,1,9
chr3	100016726	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.433:12:5,1:2,4:7,0,5,0
chr3	100034849	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr3	100053684	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=215,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,2:1,1,1,3
chr3	100057846	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=252,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr3	100058102	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=229,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr3	100084432	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,248;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.606:23:5,5:3,9:6,3,5,9
chr3	100086861	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,7,7
chr3	100092526	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,6
chr3	100092528	.	T	TGCA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,2:0,4:0|1:100092526_A_AG:100092526:0,0,0,7
chr3	100170825	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=176,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:0,1,1,3
chr3	100174722	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=134,132;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.600:28:8,12:3,5:4,7,8,9
chr3	100277476	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=119,146;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.575:24:9,8:1,5:3,7,3,11
chr3	100277514	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:5,3:0,1:0,5,0,4
chr3	100287901	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=152,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr3	100328623	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=196,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:8,2,4,0
chr3	100354508	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=173,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.457:22:6,6:6,4:5,7,9,1
chr3	100354524	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=138,258;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.156:30:12,2:14,2:14,12,2,2
chr3	100354683	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:0,1,1,7
chr3	100354698	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr3	100365491	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:12,3,2,1
chr3	100368692	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	100387709	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr3	100387990	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=128,788;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:3,7,0,2
chr3	100432752	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=222,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr3	100438784	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=262,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.691:11:1,4:2,3:3,0,7,1
chr3	100438797	.	CTT	C,CT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29,29;MFRL=136,185,191;MMQ=60,60,60;MPOS=3,3;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.70,4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,3:0.168,0.183:20:5,0,1:9,3,2:11,3,6,0
chr3	100447791	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr3	100455609	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=256,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0,4,1,6
chr3	100463651	.	TTGTG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=163,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TG;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.117:23:12,1:6,1:17,4,2,0
chr3	100467097	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=155,76;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,10:0.261:40:16,0:14,10:16,14,0,10
chr3	100471885	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=245,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	100493607	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	100499155	.	A	ATGAGTTTCAT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100499155_A_ATGAGTTTCAT:100499155:0,0,0,1
chr3	100499157	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:100499155_A_ATGAGTTTCAT:100499155:0,0,0,1
chr3	100511446	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=187,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr3	100515197	.	ATT	A,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33,30;MFRL=135,207,177;MMQ=60,60,60;MPOS=12,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.27,6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,4:0.135,0.253:17:2,2,1:7,0,3:10,1,6,0
chr3	100523771	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=146,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:6,1:3,3:1,8,0,4
chr3	100566555	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr3	100567592	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,2,1
chr3	100567799	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	100567811	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=194,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr3	100569452	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,2:4,0:3,1,2,0
chr3	100581261	.	ATT	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=17,25;MFRL=222,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.242:14:2,2:2,1:1,10,0,3
chr3	100583651	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=15.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.620:11:1,2:3,5:2,2,6,1
chr3	100585694	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:4,2:8,3:8,4,4,1
chr3	100594326	.	CGGCATA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:7,6:1,3:4,6,7,2
chr3	100605206	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr3	100621426	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=209,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,3:0,10:0,1,10,4
chr3	100712059	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=199,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:8,0,3,0
chr3	100992385	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr3	101038339	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=227,234;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.454:7:1,1:2,2:1,3,3,0
chr3	101039107	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=107,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:2,2,3,4
chr3	101046671	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:7,6:1,4:4,4,1,9
chr3	101049219	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=132,84;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:5,3:5,8,1,2
chr3	101051794	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,4:0,5,5,4
chr3	101060716	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	101066964	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=234,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.510:8:2,4:1,0:0,4,0,4
chr3	101066992	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	101080652	.	AAT	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.139:20:5,0:13,2:0|1:101080652_AAT_A:101080652:7,11,1,1
chr3	101080656	.	CTGGAAATGTTCTCCATGACAGGATTATATGGGCATAAT	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=151,58;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.105:27:5,0:13,2:0|1:101080652_AAT_A:101080652:9,16,1,1
chr3	101083895	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=204,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:101083895_G_T:101083895:0,1,0,1
chr3	101083899	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=204,99;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:101083895_G_T:101083895:0,1,0,1
chr3	101085208	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr3	101085683	.	TAAAAA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=201,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,3;RU=A;STR;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	101136340	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	101136385	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	101177901	.	GA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.459:9:4,3:1,1:1,4,0,4
chr3	101212889	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr3	101219818	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:3,0,5,0
chr3	101231823	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=8,12;MFRL=171,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.594:5:0,0:0,0:0|1:101231823_G_C:101231823:2,0,3,0
chr3	101231829	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=9;MBQ=24,26;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,0:0,2:1,0,3,0
chr3	101231833	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=25,12;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,0:0|1:101231823_G_C:101231823:3,0,3,0
chr3	101231835	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=9;MBQ=24,12;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,0:0|1:101231823_G_C:101231823:3,0,3,0
chr3	101231841	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=26,25;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:2,1:2,2:0|1:101231823_G_C:101231823:4,1,3,0
chr3	101231843	.	GG	CC	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=28,12;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,0:2,0:0|1:101231823_G_C:101231823:4,1,3,0
chr3	101231871	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=33,27;MFRL=98,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:5,2,4,2
chr3	101231894	.	TA	GT	.	.	DP=21;ECNT=9;MBQ=27,33;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,0:8,2:12,4,1,2
chr3	101231921	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=141,191;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:5,4:4,6:7,2,9,2
chr3	101232057	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,24;MFRL=124,178;MMQ=60,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.593:3:1,1:0,0:0,1,1,1
chr3	101232093	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	101298573	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,5:2,0:2,2,5,0
chr3	101370551	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	101373480	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=236,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,1:4,4:4,0,5,0
chr3	101383321	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr3	101383562	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=102,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,0:7,4:2,8,0,4
chr3	101399910	.	GAA	G,GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35,35;MFRL=220,215,144;MMQ=60,60,60;MPOS=22,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=9.10,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.335,0.222:11:2,3,1:1,1,1:5,0,5,1
chr3	101400167	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=274,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:6,2:0,2:0,6,0,4
chr3	101404813	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=187,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr3	101443461	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=62.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr3	101504624	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr3	101540149	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=126,240;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	101572000	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:12,2:14,0:13,13,2,0
chr3	101573345	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.477:12:3,0:2,5:5,1,6,0
chr3	101573361	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,12;MFRL=173,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.585:15:4,0:1,1:2,4,9,0
chr3	101574503	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,7,1
chr3	101575877	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,1:2,5:0|1:101575877_AT_A:101575877:7,0,7,0
chr3	101575882	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:7,0,7,0
chr3	101575883	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:4,1:3,6:0|1:101575877_AT_A:101575877:7,0,7,0
chr3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=91.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,6:0,5:0,0,8,13
chr3	101576404	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr3	105238890	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=139,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.361:13:2,1:4,4:0|1:105238890_CT_C:105238890:4,4,4,1
chr3	105238901	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=163,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.313:15:4,1:6,4:0|1:105238890_CT_C:105238890:5,5,4,1
chr3	105243350	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=127,88;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:5,2:6,10,0,2
chr3	105252377	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:7,1,4,1
chr3	105266412	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr3	105412286	.	C	CTT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,16,2
chr3	105422988	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,18:0.393:46:14,0:14,17:14,14,0,18
chr3	105423088	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr3	105438806	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,10,0
chr3	105452751	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	105453034	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,1,11
chr3	105455955	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=243,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:3,4:4,0,6,3
chr3	105470228	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=183,229;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr3	105495432	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	105588069	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=260,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr3	107451771	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=137,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:4,0:12,2:10,7,0,2
chr3	107451907	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,2,10
chr3	107510197	.	A	ATAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAG;STR;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr3	107519843	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr3	107776511	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr3	107790015	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,88;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.171:39:18,6:15,0:15,18,5,1
chr3	107882643	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	107884211	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,10,1
chr3	107910327	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,67;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,16;RU=T;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:4,0:0,1:4,0,1,1
chr3	107932819	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=165,106;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,0:13,3:7,13,0,3
chr3	107932839	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=186,106;MMQ=60,46;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:10,3:3,15,0,3
chr3	107937286	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	107937571	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,0,13
chr3	107938240	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,11,6
chr3	108070556	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:2,5:0,4:2,0,8,1
chr3	108072243	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=164,258;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr3	108072704	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=223,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	108081175	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=176,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:5,3:2,0:4,3,3,0
chr3	108096227	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	108103433	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	108107925	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:9,6:9,4:6,12,5,5
chr3	108135606	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:1,2:6,2:0|1:108135606_TAA_T:108135606:6,1,4,0
chr3	108135607	.	AA	TT	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.902:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr3	108135609	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:0,2:6,2:0|1:108135606_TAA_T:108135606:6,1,4,0
chr3	108135799	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,3:2,7:0,2,0,10
chr3	108140148	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	108147295	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.587:8:1,2:2,1:2,1,4,1
chr3	108156633	.	A	AAAAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=193,242;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AAAG;STR;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr3	108158574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=110,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:6,1,4,2
chr3	108172817	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=145,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:6,2,3,4
chr3	108179063	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=245,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:6,0,4,1
chr3	108179219	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.751:12:1,3:2,6:0,3,1,8
chr3	108181904	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	108189750	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,1,5
chr3	108211869	.	A	AAAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,112;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAGG;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.691:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	108214537	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr3	108224685	.	CAAAAA	C,CAAAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,20,35;MFRL=106,86,164;MMQ=60,60,60;MPOS=28,10;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,14;RU=A;STR;TLOD=5.04,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.166,0.266:13:5,2,2:3,0,1:3,5,2,3
chr3	108229437	.	G	GA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,19;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.767:12:2,1:1,2:1,2,1,8
chr3	108271012	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:9,0,2,1
chr3	108272414	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=214,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,2:1,0,4,0
chr3	108276217	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=136,227;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:6,0:24,2:16,14,0,2
chr3	108276264	.	C	CAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=A;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.226:15:3,0:8,2:3,9,1,2
chr3	108286947	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=182,249;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.302:11:6,2:2,1:8,0,3,0
chr3	108295067	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=152,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,6:0,6:1,0,10,2
chr3	108298469	.	CA	C	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=119,134;MMQ=60,56;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,2:0.076:37:11,0:24,2:14,21,0,2
chr3	108298483	.	C	CA	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=142,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:9,0:17,6:12,14,0,6
chr3	108324365	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=224,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr3	108327050	.	T	TAAC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=72.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,7:0,8:0,0,1,16
chr3	108344636	.	TA	T,TAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,21,25;MFRL=273,202,49;MMQ=60,60,60;MPOS=1,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=4.93,5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.443,0.334:6:1,1,0:0,2,2:1,0,5,0
chr3	108344771	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:8,3:5,4:9,4,6,1
chr3	108355423	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	108355475	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=137,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:20,4:12,0:22,10,4,0
chr3	108355575	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,34,33,33;MFRL=78,74,136,156;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,27,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=12,9,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.33,9.31,10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,5,5:0.148,0.343,0.344:14:0,1,2,2:2,1,2,3:1,1,1,11
chr3	108356501	.	T	TTTAAGGTAGTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=33.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	108362961	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=161,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	108366978	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=224,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,5:2,2:2,1,2,5
chr3	108394771	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,2:2,5:1,2,0,7
chr3	108403019	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=G;STR;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:1,4:4,3:3,2,7,0
chr3	108405410	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=186,61;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:6,0:15,2:0|1:108405410_C_T:108405410:9,12,1,1
chr3	108405418	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=186,61;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:15,2:0|1:108405410_C_T:108405410:10,11,1,1
chr3	108406724	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=181,286;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	108549431	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=249,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr3	108565815	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr3	108566077	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=206,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	108567923	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,220;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:5,1,2,0
chr3	108639270	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:8,2:22,1:14,16,1,2
chr3	108672335	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=192,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:6,1:0,1:5,1,2,0
chr3	108678002	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:2,5,0,4
chr3	108703518	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:1,1,5,3
chr3	108703548	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,3:0,6:0,2,4,5
chr3	108703702	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=169,223;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	108705715	.	A	AT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.406:12:5,1:2,4:6,1,3,2
chr3	108725759	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,320;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	108725848	.	ATTGC	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:0|1:108725848_ATTGC_A:108725848:4,3,1,1
chr3	108725862	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0|1:108725848_ATTGC_A:108725848:4,3,2,1
chr3	108725984	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=116,126;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:0,3:3,2:1,2,0,6
chr3	108746836	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	108754146	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,3:0,5:0,0,8,1
chr3	108754238	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.953:18:0,4:0,14:0,0,11,7
chr3	108754260	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=176,166;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.774:20:2,3:2,13:3,1,9,7
chr3	108754320	.	T	TAA	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,0:0,7:0,0,0,9
chr3	108754346	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr3	108773772	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=217,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr3	108776343	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,3:0,10:0,0,3,10
chr3	108782160	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=257,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.592:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr3	108788461	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=143,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:1,0,2,1
chr3	108813715	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=198,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,4:6,0:8,1,4,0
chr3	109027157	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=200,260;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:0,4,2,3
chr3	109027820	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,114;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,3:0,2:1,1,4,1
chr3	109049720	.	C	CTAAGGGT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,0:0,3,0,4
chr3	109052934	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr3	109213091	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=189,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:0,8,1,1
chr3	110790859	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=187,189;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.247:13:3,1:7,1:10,0,0,3
chr3	111260975	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:2,2:0,3:2,0,5,0
chr3	111261242	.	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTGCTGAAATTGATCACCA;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.881:6:0,1:0,2:0,0,0,6
chr3	111298145	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:2,6,1,4
chr3	111316886	.	C	CTTATG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:3,1:1,0:4,0,2,0
chr3	111343069	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=179,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr3	111394208	.	TC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=174,265;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:4,2:15,0:3,16,2,0
chr3	111564839	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=252,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:1,3,0,4
chr3	111564873	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,31;MFRL=229,121;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0|1:111564873_TA_T:111564873:0,3,0,1
chr3	111564876	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=229,121;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:111564873_TA_T:111564873:0,3,0,1
chr3	111564878	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,24;MFRL=229,121;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:111564873_TA_T:111564873:0,3,0,1
chr3	111564882	.	GA	TC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=35,32;MFRL=177,121;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:111564873_TA_T:111564873:0,2,0,1
chr3	111564883	.	AG	TC	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=229,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	111602828	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=197,138;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr3	111632132	.	ACCCACTGACCT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=132,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.436:21:3,2:8,7:7,5,9,0
chr3	111637904	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=78.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,18:0,7:0,0,18,7
chr3	111638132	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	111639353	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	111658290	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,3:3,3:4,1,6,0
chr3	111658486	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=62.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,4,13
chr3	111658514	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:0,9,0,5
chr3	111659377	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,8:0,0,9,13
chr3	111664064	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=186,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:4,6,2,0
chr3	111685374	.	GGTGT	G,GGT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33,26;MFRL=0,203,132;MMQ=60,59,60;MPOS=27,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=GT;STR;TLOD=6.52,4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.382,0.486:4:0,1,1:0,1,1:0,0,3,1
chr3	111685572	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=166,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,4:7,3:2,12,2,5
chr3	111685607	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=182,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr3	111686738	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	111692693	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,1:5,9:4,6,3,7
chr3	111697867	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:2,1,7,0
chr3	111698098	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:0,10,0,2
chr3	111705275	.	G	GTTTGT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=113,165;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=TTTGT;STR;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.497:10:3,2:2,2:1,4,0,5
chr3	111705287	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=168,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:111705287_T_A:111705287:0,16,1,1
chr3	111705294	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=182,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,0:4,2:0|1:111705287_T_A:111705287:0,13,1,1
chr3	111705298	.	T	TTATTTTTTCCTA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=181,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.189:14:8,0:4,2:0|1:111705287_T_A:111705287:0,12,1,1
chr3	111705727	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=197,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:3,0:6,0,2,0
chr3	111705992	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,206;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,2:2,2:0,4,0,4
chr3	111710140	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr3	111710201	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=210,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:7,1,3,0
chr3	111710206	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=233,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,4,1
chr3	111710398	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=178,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.097:29:16,1:11,1:8,19,0,2
chr3	111719835	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=208,157;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:2,6,0,2
chr3	111719879	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=224,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr3	111730546	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=162,260;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,1:8,2:11,3,3,0
chr3	111730591	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=149,124;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,1:10,3:15,5,2,2
chr3	111760771	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,9:0,7:0,0,15,1
chr3	111763278	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr3	111766559	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,6:0,0,14,0
chr3	111768736	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:10,5:7,0:8,9,5,0
chr3	111769417	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr3	111785208	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr3	111793316	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=146,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,3,7
chr3	111794365	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=245,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=39.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:3,11:3,3:1,5,7,7
chr3	111795976	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:18,4:20,0:21,18,3,1
chr3	111805438	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=112,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=49.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:0,1,1,13
chr3	111828384	.	G	GT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=110,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:9,2:22,1:16,15,1,2
chr3	111828476	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=85,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,2:4,0:4,6,1,1
chr3	111851817	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=154,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:9,0,2,0
chr3	111851890	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:16,3:12,0:17,11,2,1
chr3	111873899	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=24,17;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:1,1:4,0:0|1:111873899_G_T:111873899:2,8,0,2
chr3	111873902	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=21,17;MFRL=209,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,4:0.634:6:0,1:1,1:1|0:111873899_G_T:111873899:0,2,0,4
chr3	111899383	.	C	A	.	.	DP=53;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=174,161;MMQ=48,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,9:0.182:53:16,9:27,0:40,4,9,0
chr3	111899432	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=124,53;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:12,4:18,0:14,16,4,0
chr3	111918215	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=219,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.720:20:2,5:3,10:3,2,6,9
chr3	111918216	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=234,164;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:2,4:1,10:1,2,8,6
chr3	111921010	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=202,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:3,5:0,3:3,0,9,0
chr3	111921042	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,4:6,0:8,3,4,0
chr3	111923047	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr3	111936200	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr3	111936491	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	111981696	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=257,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:1,1:2,5:0|1:111981696_CA_C:111981696:3,0,6,0
chr3	111981704	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=257,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,1:2,6:0|1:111981696_CA_C:111981696:3,0,7,0
chr3	111983197	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.908:19:1,9:0,8:0,1,5,13
chr3	111985048	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,2:8,1:12,6,1,2
chr3	111988992	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=122,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr3	111993691	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=228,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,0:0,6:2,0,6,0
chr3	111993716	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,13,1
chr3	111996730	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=197,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,7:3,3:0,6,3,7
chr3	111997791	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=209,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr3	112052173	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	112184927	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=61.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,9:0,8:0,0,11,7
chr3	112185021	.	G	GGTTTTTTTTT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=171,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.133:20:8,2:10,0:10,8,0,2
chr3	112185025	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.951:17:0,7:0,10:0,0,10,7
chr3	112185138	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:11,0:4,2:6,9,0,2
chr3	112198293	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=172,91;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,5:0.140:41:17,5:19,0:21,15,5,0
chr3	112253058	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,2:0,6:0,1,7,2
chr3	112253193	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.424:12:5,0:2,4:1,6,2,3
chr3	112256837	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=278,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:3,1,3,2
chr3	112267523	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr3	112277331	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,261;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,2:7,0:0,12,0,2
chr3	112280218	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	112289320	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	112289372	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,9,0
chr3	112301458	.	C	CCTTAGTAAT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr3	112335773	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=177,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:1,4,0,2
chr3	112338027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr3	112357683	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.176:24:13,3:7,0:13,7,2,2
chr3	112357710	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=133,90;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:13,4:11,0:17,7,4,0
chr3	112538571	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr3	112642568	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr3	112647613	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	112648125	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.900:18:1,9:0,8:0|1:112648125_G_T:112648125:0,1,12,5
chr3	112648127	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,17:0.900:18:1,9:0,7:0|1:112648125_G_T:112648125:0,1,12,5
chr3	112666859	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	112709828	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=46.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,15,0
chr3	112711845	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=119,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:14,5,2,0
chr3	112718470	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,0:6,3:1,11,0,3
chr3	112719791	.	CAA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=175,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.356:7:0,0:3,1:2,3,0,2
chr3	112727288	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=203,187;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:7,0:5,7:3,9,7,0
chr3	112732298	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=173,122;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:0,2:6,0:1,7,1,1
chr3	112732309	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=17,33;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:1,0:2,4:2,5,0,4
chr3	112738318	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr3	112991196	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,7:4,1:5,0,8,0
chr3	112997725	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=271,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	112999611	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=240,282;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr3	113004123	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr3	113005753	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.370:11:1,1:5,2:0,7,0,4
chr3	113120117	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=141,173;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:6,0:10,10:11,5,0,10
chr3	113127955	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=141,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:8,7,2,0
chr3	113169372	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=18,18;MFRL=168,113;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.316:10:1,0:2,1:1,6,0,3
chr3	113285185	.	TTGTG	T,TTG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,22,25;MFRL=159,189,188;MMQ=60,60,60;MPOS=3,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=TG;STR;TLOD=5.81,12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,5:0.212,0.346:15:3,0,2:3,3,3:6,1,8,0
chr3	113320477	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,134;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:8,2:8,6,2,4
chr3	113376110	.	TTGCTGC	T,TTGC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27,28;MFRL=0,253,223;MMQ=60,60,60;MPOS=12,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TGC;STR;TLOD=6.21,27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,7:0.228,0.701:9:0,1,4:0,1,3:0,0,6,3
chr3	113377481	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=181,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,2:2,2:2,4,2,2
chr3	113379865	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,8:0.500:16:3,6:5,2:0|1:113379865_G_C:113379865:4,4,6,2
chr3	113379868	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=184,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,2:7,0:0|1:113379865_G_C:113379865:9,6,1,1
chr3	113380332	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	113442198	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,3:3,4:8,0,5,2
chr3	113464859	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,4:4,8,5,4
chr3	113503354	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.639:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr3	113508499	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=241,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:4,2:7,1,3,0
chr3	113522544	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=135,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:2,4,1,2
chr3	113524425	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=154,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	113524465	.	G	GTGCGATCA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr3	113557787	.	AGCC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr3	113594377	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=162,158;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,5:3,1:3,2,0,6
chr3	113595156	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,2,11
chr3	113619872	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,13,7
chr3	113649716	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:1,4,0,3
chr3	113656833	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=165,203;MMQ=38,42;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr3	113656982	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=157,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:12,3:9,0:0|1:113656982_G_A:113656982:12,12,0,3
chr3	113656991	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,3:7,0:0|1:113656982_G_A:113656982:10,11,0,3
chr3	113656995	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:12,3:8,0:0|1:113656982_G_A:113656982:10,11,0,3
chr3	113664183	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=155,237;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:5,6:3,1:8,0,5,2
chr3	113672657	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,78;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,3:11,0:14,11,2,1
chr3	113677316	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.227:23:9,0:9,4:8,10,0,5
chr3	113720624	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr3	113750720	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:113750720_C_A:113750720:0,3,0,1
chr3	113750725	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:113750720_C_A:113750720:0,3,0,1
chr3	113755447	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=153,100;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,5:9,0:11,8,5,0
chr3	113789422	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=193,172;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,4:1,0:5,0,4,0
chr3	113955055	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,316;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.713:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	113955320	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,4,10
chr3	113956021	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,270;MMQ=44,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,1:6,2:0,12,0,3
chr3	114027065	.	C	CGTGT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=217,259;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=GT;STR;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:5,0:2,2:0,7,0,3
chr3	114070090	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=242,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:3,5,2,0
chr3	115382818	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=197,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr3	115529092	.	G	GTCTC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TC;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,3,0
chr3	115529360	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=181,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr3	115561349	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:10,7,0,2
chr3	118864980	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=70,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:118864980_AG_CC:118864980:1,1,1,0
chr3	118864985	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=70,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:118864980_AG_CC:118864980:1,1,1,0
chr3	118864991	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=20,12;MFRL=70,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:118864980_AG_CC:118864980:2,1,1,0
chr3	118866376	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.499:24:6,10:6,2:6,6,2,10
chr3	118866515	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr3	118870025	.	A	AC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr3	118906555	.	T	TGG	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:118906555_T_TGG:118906555:0,0,1,0
chr3	118906559	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=174,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:0,0:0|1:118906555_T_TGG:118906555:2,0,1,0
chr3	118906616	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.280:16:4,2:7,2:9,3,4,0
chr3	118909962	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=55.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,4,14
chr3	118909987	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=45.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,2,11
chr3	118913261	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,232;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,2:5,1:0,6,0,3
chr3	118922654	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=136,206;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,0:4,3:6,0,3,0
chr3	118931389	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=37.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,8,4
chr3	118945614	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=228,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	119013878	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,21;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.307:8:2,0:2,1:0|1:119013878_G_C:119013878:2,4,1,1
chr3	119013898	.	TG	CC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=197,84;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,0:1,0:0|1:119013878_G_C:119013878:0,2,0,1
chr3	119101039	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=192,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,0:7,4:8,0,4,0
chr3	119101925	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=134,146;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:6,1:5,4:8,3,4,1
chr3	119118037	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=129,112;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:1,2:8,0:8,2,2,0
chr3	119128628	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.428:23:6,5:7,5:5,8,6,4
chr3	119128634	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=144,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:6,3:6,4:5,8,4,3
chr3	119128712	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=214,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr3	119171280	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,2:7,3:4,6,3,2
chr3	119196334	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=242,186;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,1:1,3:0,7,0,4
chr3	119198873	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:8,5:5,0:10,3,3,2
chr3	119204063	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr3	119204311	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=180,79;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.233:19:8,3:7,1:0,15,0,4
chr3	119205752	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,3:12,0:10,10,3,0
chr3	119235977	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=202,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	119236017	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:5,0,7,0
chr3	119263680	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:6,2,4,5
chr3	119327604	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=207,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,2:7,0:8,5,2,0
chr3	119334986	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=229,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr3	119338352	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.490:16:7,8:1,0:7,1,7,1
chr3	119348345	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=262,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,0:2,1:1,4,0,3
chr3	119373257	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=155,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,5:7,0,7,0
chr3	119373301	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:5,1:5,8:6,4,6,3
chr3	119373315	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,6:6,4,4,4
chr3	119501580	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.499:14:1,3:6,3:4,3,3,4
chr3	119501780	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr3	119501798	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr3	119529113	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	119531709	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=199,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,2:9,3:6,9,0,5
chr3	119533773	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	119534153	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,295;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,4,2
chr3	119535823	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr3	119721171	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=156,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr3	119892121	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=241,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:6,1,1,2
chr3	119900260	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	119904125	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr3	119904315	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	119905641	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr3	119912297	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:8,1:1,1:0,9,0,2
chr3	120053931	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:7,7,1,1
chr3	120114637	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=132,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,1:5,2:0,6,0,3
chr3	120130883	.	GACACACACACACACATACATGC	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=218,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.422:15:3,4:5,2:0,9,0,6
chr3	120130897	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=205,262;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr3	120130899	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.920:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr3	120134720	.	A	AG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=253,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:3,4:4,6:8,0,9,1
chr3	120134883	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=215,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:3,8:4,11:1,6,6,13
chr3	120169641	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	120371369	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=245,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,3:2,0:2,2,2,1
chr3	120371414	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:5,6:1,4:2,4,4,6
chr3	120371579	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,15;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:120371579_T_A:120371579:0,3,0,1
chr3	120371581	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:120371579_T_A:120371579:0,3,0,1
chr3	120371585	.	AG	CC	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,16;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:120371579_T_A:120371579:0,3,0,1
chr3	120371595	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,18;MFRL=115,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:120371579_T_A:120371579:0,3,0,1
chr3	120389429	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=225,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,1,2
chr3	120413158	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,1,5
chr3	120833994	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=224,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,1,1
chr3	120976056	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=179,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:7,1:3,1:8,2,1,1
chr3	121100116	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr3	121132268	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=210,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	121137976	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=206,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:1,1,2,5
chr3	121138015	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=153,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,1,5
chr3	121155198	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=245,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	121168344	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=241,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=55.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.826:21:3,14:0,4:0,3,17,1
chr3	121178915	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=146,138;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:8,0:12,6:13,7,0,6
chr3	121186543	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=139,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr3	121195302	.	TACAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=244,256;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=AC;STR;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr3	121202131	.	CTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	121202433	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=97,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,3:1,4:2,4,1,8
chr3	121202449	.	AAG	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=171,97;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:0|1:121202449_AAG_A:121202449:3,10,0,2
chr3	121202453	.	A	AC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=138,97;MMQ=60,60;MPOS=-1073741822;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:5,2:5,0:0|1:121202449_AAG_A:121202449:3,9,0,2
chr3	121208703	.	CTTT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=181,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,3;RU=T;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:10,2:6,1:11,7,3,0
chr3	121212277	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=275,247;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	121217297	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,1:5,1:9,4,1,1
chr3	121228833	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,3:3,7:2,1,9,1
chr3	121238819	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:12,8,0,2
chr3	121238853	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=130,77;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.182:25:13,4:8,0:11,10,3,1
chr3	121238863	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=89,218;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:14,2:7,1:12,9,2,1
chr3	121239027	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=231,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:0,1,0,8
chr3	121241058	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=255,41914206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr3	121339354	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=222,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,4:1,3:1,0,6,1
chr3	121340910	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,0:6,2:5,5,1,1
chr3	121345829	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr3	121350966	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,10,5
chr3	121351315	.	G	GGGCTCAGGCTCA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=112,150;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=GGCTCA;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.443:16:7,3:2,4:3,6,2,5
chr3	121353254	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr3	121354670	.	C	CTGAGGGCCTGCGTTCCGAGT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,16;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.420:5:0,1:3,0:0|1:121354670_C_CTGAGGGCCTGCGTTCCGAGT:121354670:1,2,1,1
chr3	121354672	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,10;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.424:5:0,0:3,0:0|1:121354670_C_CTGAGGGCCTGCGTTCCGAGT:121354670:1,2,1,1
chr3	121354677	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=139,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:121354670_C_CTGAGGGCCTGCGTTCCGAGT:121354670:1,2,0,1
chr3	121361787	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=129,158;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:3,4,1,2
chr3	121361820	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:2,9,0,2
chr3	121366123	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=203,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,4:8,4,4,0
chr3	121366377	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=190,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr3	121383297	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,4:3,4:3,0,7,1
chr3	121387060	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=169,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr3	121396059	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=264,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.533:9:2,2:2,3:4,0,4,1
chr3	121400725	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	121414217	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,163;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,3:4,4:4,5,2,5
chr3	121418765	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,0,2
chr3	121418799	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr3	121500699	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=160,270;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:13,0:4,3:7,10,2,1
chr3	121508830	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	121514212	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=238,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:9,1:3,4:12,0,5,0
chr3	121514458	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.785:13:0,5:2,5:0,3,1,9
chr3	121517997	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:7,2:5,8:8,4,9,1
chr3	121526099	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,2:4,2:9,0,4,0
chr3	121563271	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=155,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,1:8,2:10,1,3,0
chr3	121563494	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=172,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:1,6,0,2
chr3	121573729	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr3	121613330	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=165,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:4,0:9,3:7,6,1,2
chr3	121615212	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,3:6,2:6,5,5,0
chr3	121630328	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=160,233;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:5,1,2,0
chr3	121631841	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,5:1,4:1,1,5,4
chr3	121641528	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	121643143	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.280:12:1,2:7,1:8,1,3,0
chr3	121643163	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=166,123;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.789:17:2,2:1,12:3,0,10,4
chr3	121643170	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:4,2:12,1:12,4,3,0
chr3	121643699	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=180,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr3	121643893	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,2:7,1:3,12,2,2
chr3	121646495	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=193,201;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	121646759	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=207,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,0:2,3:0,10,0,3
chr3	121647782	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=169,251;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,1:5,1:11,1,2,0
chr3	121659197	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr3	121712051	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,146;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.328:25:10,3:6,4:5,12,5,3
chr3	121724038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=218,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,1:3,1:0|1:121724038_G_A:121724038:2,1,2,1
chr3	121724049	.	T	TGC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,8;MFRL=221,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.334:4:0,0:2,0:1|0:121724038_G_A:121724038:1,2,1,0
chr3	121724056	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=230,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:0,0:3,1:0,3,1,0
chr3	121774281	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=123,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,2:1,0:2,2,1,1
chr3	121810427	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=50.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.959:19:0,8:0,11:0,0,14,5
chr3	121836966	.	TGA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=GA;STR;TLOD=71.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.954:18:0,12:0,6:0,0,7,11
chr3	121973063	.	CC	TT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,0:9,3:12,6,0,3
chr3	121973091	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,22;MFRL=170,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:10,0:8,2:13,5,0,3
chr3	121976253	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr3	122000871	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr3	122003717	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=160,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,1:9,2:6,11,0,3
chr3	122003769	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=184,222;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:8,4:5,1:6,7,1,4
chr3	122004098	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	122081881	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.229:16:6,1:5,2:1,12,1,2
chr3	122128519	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:5,1:8,1,2,1
chr3	122134889	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=198,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.231:27:13,2:7,3:10,11,1,5
chr3	122145810	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,10,3
chr3	122186141	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,240;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:3,2,2,0
chr3	122247606	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr3	122255886	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:7,12,2,1
chr3	122275016	.	AAAAAG	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0|1:122275016_AAAAAG_A:122275016:0,2,1,0
chr3	122275026	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,15;MFRL=171,113;MMQ=60,60;MPOS=-3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:1,0:1,0:0|1:122275016_AAAAAG_A:122275016:0,2,1,0
chr3	122287289	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,289;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr3	122329434	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=155,138;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:11,0:15,12:16,10,0,12
chr3	122329447	.	A	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=150,138;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,12:0.351:35:10,0:13,12:13,10,0,12
chr3	122406077	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=172,194;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	122418750	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.371:25:11,5:5,4:9,7,5,4
chr3	122437834	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:7,2:6,0:2,11,1,2
chr3	122446733	.	C	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,9:0.238:40:15,8:15,0:14,17,9,0
chr3	122459290	.	G	GAGA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=211,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:8,1:9,6:9,8,3,5
chr3	122459732	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:2,3,2,1
chr3	122471407	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28,28;MFRL=173,155,178;MMQ=60,60,60;MPOS=22,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=4.82,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,5:0.238,0.296:15:2,2,3:2,1,2:4,3,6,2
chr3	122471562	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:10,0:17,7:4,23,1,6
chr3	122474284	.	T	TA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=137,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.368:12:3,1:5,3:5,3,1,3
chr3	122474305	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=142,205;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.794:16:0,4:2,8:1,2,5,8
chr3	122478032	.	C	CCACACA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,232;MMQ=60,45;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,20;RU=CA;STR;TLOD=18.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr3	122512631	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,234;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr3	122514252	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=212,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:2,2,1,2
chr3	122564645	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:11,8,0,2
chr3	122578968	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=130,51;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:10,0:8,3:10,8,1,2
chr3	122598291	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:0,8,0,4
chr3	122629589	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	122629656	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=170,182;MMQ=53,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,1:2,1:2,4,2,0
chr3	122630416	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=231,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:5,1:3,1:2,6,0,3
chr3	122631896	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr3	122642401	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	122642415	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr3	122680141	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=156,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:7,3:3,3:1,9,1,5
chr3	122680171	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.736:13:2,7:1,3:0,3,0,10
chr3	122807995	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=207,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,5:2,4:2,0,6,3
chr3	122811351	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	122821385	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,1,9
chr3	122821478	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=282,182;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	122821671	.	AT	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=227,177;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,4:2,7:2,2,5,6
chr3	122829918	.	GG	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=72482199,103;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,0,1
chr3	122835210	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	122843020	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,1:9,2:8,8,2,1
chr3	122843024	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,1:7,1:0|1:122843024_TC_T:122843024:7,6,0,2
chr3	122843026	.	TAAAGCTCA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=170,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,1:7,1:0|1:122843024_TC_T:122843024:6,8,0,2
chr3	122843212	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=239,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:0,3:5,2:1,4,1,4
chr3	122865136	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=142,188;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,1:1,4:0,2,1,4
chr3	122873923	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr3	122880118	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:2,1,2,5
chr3	122942358	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=193,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr3	122942402	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,4:1,3:3,0,7,0
chr3	122964900	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,3:3,4:1,3,1,6
chr3	122978486	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=158,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,6:0,4:0,2,1,9
chr3	123003448	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=199,36;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:2,2:7,0:7,3,1,1
chr3	123008519	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	123010276	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.350:15:6,3:4,2:5,5,1,4
chr3	123014877	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=195,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,3,1
chr3	123014904	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=213,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:2,1,4,0
chr3	123015094	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr3	123019147	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=159,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:6,5,0,2
chr3	123021838	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr3	123021870	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,2,3
chr3	123037047	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,0,8
chr3	123047395	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.749:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr3	123047478	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,2:6,0:6,2,2,0
chr3	123047666	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,2:2,0:2,6,1,1
chr3	123049707	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:5,3:10,1:9,6,4,0
chr3	123051484	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:11,1:11,1:10,12,2,0
chr3	123066555	.	A	AAAGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGG;STR;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,6:0,0,10,2
chr3	123301205	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=135,128;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=20.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,0:8,8:5,10,0,8
chr3	123332875	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=155,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.370:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr3	123401060	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=183,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:7,4:11,1:12,7,4,1
chr3	123418913	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,8,5
chr3	123440967	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=41.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,5:0,0,10,4
chr3	123441179	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,256;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	123452508	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=207,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	123454314	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=201,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:0,7,0,4
chr3	123454374	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=244,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,0:4,2:0,4,2,0
chr3	123456294	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:4,1:17,1:8,13,1,1
chr3	123456432	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	123456458	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:123456458_C_T:123456458:0,2,0,1
chr3	123456464	.	A	ATG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:123456458_C_T:123456458:0,2,0,1
chr3	123456466	.	T	TTGAGGCCTCCCCAG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=205,197;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:123456458_C_T:123456458:0,2,0,1
chr3	123456470	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=208,197;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:123456458_C_T:123456458:0,1,0,1
chr3	123457711	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,4,4
chr3	123633612	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,7:4,3:4,2,7,3
chr3	123650432	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,4:0,0,0,7
chr3	123650447	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,22;MFRL=162,266;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:0,1:0,1,0,4
chr3	123652476	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=102,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,3:3,0:4,3,2,1
chr3	123666192	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr3	123667482	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,3:6,1:11,3,4,0
chr3	123674879	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=167,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.321:25:8,2:6,5:12,5,2,6
chr3	123983604	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=213,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr3	124113929	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,10:1,7:1,0,12,5
chr3	124132263	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	124165217	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,306;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr3	124195987	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	124210344	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=196,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,7:2,1:1,2,0,8
chr3	124211666	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=138,77;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,1:8,2:7,7,1,2
chr3	124281980	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=166,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,6:4,2:2,8,1,7
chr3	124303786	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:4,3:2,0:4,3,0,3
chr3	124352860	.	T	TTTAAGTCTTTAGTAAGACTAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:0,1:3,0:0,3,0,1
chr3	124369640	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=108,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:2,3:4,6:3,3,5,4
chr3	124369744	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=118,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:7,5,2,0
chr3	124377196	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=249,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	124378386	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=125,107;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	124379716	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:8,8:2,0:6,4,8,0
chr3	124379748	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.857:19:1,13:1,4:0,2,13,4
chr3	124380793	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:2,1:6,1:4,5,1,2
chr3	124390796	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=265,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,6:1,4:1,0,1,9
chr3	124397249	.	ATT	A,AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,20,28;MFRL=233,271,261;MMQ=60,60,60;MPOS=31,31;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.91,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,3:0.300,0.403:7:0,1,0:1,0,3:0,2,0,5
chr3	124420940	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=133,71;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,2:7,0:5,9,0,2
chr3	124431798	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,41;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,2:10,0:9,7,1,1
chr3	124438399	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,35;MFRL=185,350;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124438399_T_C:124438399:0,3,0,1
chr3	124438404	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=185,350;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124438399_T_C:124438399:0,3,0,1
chr3	124438413	.	C	CAT	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=185,350;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124438399_T_C:124438399:0,3,0,1
chr3	124438416	.	GCA	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=185,350;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:124438399_T_C:124438399:0,3,0,1
chr3	124449505	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,129;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.257:22:8,0:9,5:5,12,0,5
chr3	124458816	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=124,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	124462710	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,212;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:8,3,2,0
chr3	124629222	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=122,89;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.372:14:6,5:2,0:7,2,4,1
chr3	124635428	.	C	CTCGTGAT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=190,236;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	124642586	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=377,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	124646926	.	CTT	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,318;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	124692785	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=133,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,2:3,0:2,3,0,2
chr3	124728472	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	124729193	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=263,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,0:0,5:1,0,5,0
chr3	124732842	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=198,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,7:2,2:0,3,0,9
chr3	124802677	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr3	124802881	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:6,3:1,2:5,2,2,4
chr3	124802888	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:6,3:1,4:4,3,2,5
chr3	124854425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	124896861	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr3	124997930	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=145,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,0:8,4:8,2,4,0
chr3	124998098	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=86,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.473:16:4,2:5,5:2,7,2,5
chr3	125199069	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=142,90;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:11,0:14,7,3,0
chr3	125249251	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:125249251_C_T:125249251:2,0,1,0
chr3	125249258	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=207,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:125249251_C_T:125249251:2,0,1,0
chr3	125271404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=153,74;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:9,0:6,3:8,7,1,2
chr3	125651602	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=270,128;MMQ=60,39;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.557:5:0,2:2,0:0,2,2,1
chr3	125725268	.	TAACA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AACA;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.192:23:6,0:12,4:12,7,3,1
chr3	125727476	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=225,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.580:5:0,0:1,0:0|1:125727476_A_C:125727476:2,0,3,0
chr3	125727482	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,21;MFRL=272,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.658:4:0,0:0,1:0|1:125727476_A_C:125727476:1,0,3,0
chr3	125731523	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:3,1:8,1:6,6,1,1
chr3	125734272	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:8,1,3,0
chr3	125734465	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:9,1:5,6,1,1
chr3	125741771	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=143,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:0|1:125741771_C_T:125741771:8,9,0,2
chr3	125741790	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:125741771_C_T:125741771:5,10,0,2
chr3	125769757	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:2,2,3,0
chr3	125775428	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr3	125786695	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=282,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr3	125786760	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=285,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:2,1,2,3
chr3	125787126	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=343,81;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr3	125831572	.	GGC	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=211,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GC;STR;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:0,1:3,0,1,1
chr3	125849031	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,1:3,3:4,2,3,1
chr3	125850169	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=204,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,2:1,1:4,1,3,0
chr3	125850193	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=186,233;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:4,3,3,2
chr3	125850381	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=150,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:10,2:2,1:5,9,1,2
chr3	125850434	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=184,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr3	125854311	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=167,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	125855620	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=187,71;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:4,3:6,0:8,3,2,1
chr3	125874388	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,1,6
chr3	125877376	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=111,318;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:6,3,1,1
chr3	126071467	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:4,6,3,2
chr3	126125990	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=153,252;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:3,2:7,3:5,5,3,3
chr3	126132880	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=196,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr3	126135070	.	C	CCGCGTCCCCGGCCTCAGGTCCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,1:0,0,4,0
chr3	126135365	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,6:1,1:0,1,5,2
chr3	126138462	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,39;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:126138462_C_T:126138462:3,1,1,1
chr3	126138465	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=171,39;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:0|1:126138462_C_T:126138462:3,1,1,1
chr3	126138778	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,10,6
chr3	126142496	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=192,431;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr3	126142512	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=218,90;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:6,0:0,11,0,2
chr3	126152980	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr3	126154319	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr3	126158622	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:2,2:0,3:0|1:126158622_A_C:126158622:0,2,0,6
chr3	126158639	.	G	GCAAATCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=242,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:126158622_A_C:126158622:0,4,0,1
chr3	126178390	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=175,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr3	126184941	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.366:17:5,2:6,4:11,0,5,1
chr3	126184948	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=172,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.202:18:5,2:9,1:13,2,3,0
chr3	126185238	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr3	126189919	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=159,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,4:4,6:0,6,1,9
chr3	126201096	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=272,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr3	126202147	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=251,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr3	126207222	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	126208249	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,4:0,1:0,1,1,4
chr3	126216829	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,1:0,0,5,0
chr3	126219030	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr3	126219086	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	126219733	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr3	126219973	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,7:0,2:0,0,8,1
chr3	126226518	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,6,2
chr3	126227185	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=188,160;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr3	126228410	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=30.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:5,6:1,6:3,3,7,5
chr3	126236348	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	126255166	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=236,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:3,2:5,1:5,3,2,2
chr3	126268783	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,0:4,3:6,6,3,0
chr3	126268953	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:2,1:1,1:0,3,2,2
chr3	126270757	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr3	126290985	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=183,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:5,0:10,2:9,6,0,2
chr3	126452133	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=195,101;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,5:3,2:0,4,0,8
chr3	126633419	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=283,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr3	126724881	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr3	126749154	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=156,132;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:7,0:1,3:7,2,0,3
chr3	126749165	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=140,132;MMQ=60,22;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:7,0:2,3:6,3,0,3
chr3	126751689	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr3	126752889	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:6,0:12,6:8,10,0,6
chr3	127298657	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:5,8,2,0
chr3	127336934	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=289,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.852:11:1,7:0,3:0,1,2,8
chr3	127379790	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=206,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:11,3:4,0:6,9,3,0
chr3	127391018	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	127396220	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,0:0,4:0,1,4,0
chr3	127410959	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=17,25;MFRL=263,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.398:3:0,0:0,1:2,0,1,0
chr3	127410961	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=12,17;MFRL=263,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:0,0:2,0,1,0
chr3	127410971	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,10;MFRL=242,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:0,0:2,0,2,0
chr3	127411206	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=168,373;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:1,8,0,2
chr3	127429567	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=186,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:0,2:3,2:1,2,1,3
chr3	127440083	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=181,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr3	127703085	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,201;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,0:4,3:3,7,0,3
chr3	127820310	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=178,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:10,0,2,0
chr3	128181471	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=164,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,4:6,3:5,5,2,5
chr3	128182816	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=185,90;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:2,4:6,4:4,4,4,5
chr3	128182997	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	128200072	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=122,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.134:28:15,0:9,3:12,13,2,1
chr3	128204919	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=154,100;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:3,0:2,2:4,4,0,2
chr3	128292062	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=190,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.430:9:0,2:3,2:2,3,4,0
chr3	128348735	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,3,0
chr3	128351054	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=154,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr3	128356852	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=228,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,8:3,4:3,4,6,6
chr3	128516905	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,130;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.411:32:12,1:7,12:3,16,0,13
chr3	128598469	.	CGT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GT;STR;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr3	128614133	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=116,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:6,5:3,9:5,4,12,2
chr3	128624880	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=160,228;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:3,0,7,0
chr3	128627753	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,1:3,4:6,4,4,1
chr3	128629505	.	C	CTGAT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGAT;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:5,2,2,0
chr3	128631481	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,1:4,1:1,6,0,2
chr3	128690036	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=218,40;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,2:9,0:8,4,1,1
chr3	128712042	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:11,3:13,0:10,14,3,0
chr3	128722958	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	128749803	.	A	ACACCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	128755814	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,2:2,6:1,3,4,4
chr3	128755953	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=179,188;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr3	128755971	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,1,2
chr3	128757560	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=182,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:6,0,5,0
chr3	128781258	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.581:7:0,1:2,1:0,3,1,3
chr3	128840034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr3	128853622	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr3	128859202	.	C	CTTAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr3	128864520	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,6,1
chr3	128864540	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0|1:128864520_C_G:128864520:0,0,7,0
chr3	128877521	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr3	128890101	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=184,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:5,2:0|1:128890101_T_C:128890101:6,10,1,1
chr3	128890106	.	C	CTCAGACACCA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=184,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:128890101_T_C:128890101:6,10,1,1
chr3	128890108	.	C	CTGCA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=184,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:128890101_T_C:128890101:6,10,1,1
chr3	128890350	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=106.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,35:0.973:35:0,21:0,14:0,0,18,17
chr3	128890618	.	TG	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,66;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:11,2:13,0:5,19,0,2
chr3	128991839	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,155;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.355:29:13,0:6,10:0,19,0,10
chr3	129020778	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr3	129034828	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:129034828_G_GA:129034828:0,4,0,1
chr3	129034830	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=22,29;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:129034828_G_GA:129034828:0,4,0,1
chr3	129034832	.	GG	CT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=148,207;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:129034828_G_GA:129034828:0,3,0,1
chr3	129035031	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=118,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.259:17:6,0:7,2:10,3,2,2
chr3	129120743	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=218,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr3	129123294	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,0:1,3:0,7,0,3
chr3	129130022	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=120,111;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,2:2,1:4,2,3,0
chr3	129140489	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,2:6,4:9,4,2,4
chr3	129140738	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=232,293;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	129147370	.	GAA	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.082:34:19,0:12,2:0|1:129147370_GAA_G:129147370:10,22,1,1
chr3	129147379	.	T	TGTGTAAGATAGA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:13,0:11,1:0|1:129147370_GAA_G:129147370:6,21,1,1
chr3	129147380	.	C	CA	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,36;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:14,0:12,1:0|1:129147370_GAA_G:129147370:6,21,1,1
chr3	129151927	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=163,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:9,3:9,3:9,9,3,3
chr3	129152144	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,2:3,1:0,10,0,3
chr3	129153036	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:8,3:4,1:1,11,0,4
chr3	129155547	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=188,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.279:12:4,1:5,2:3,6,1,2
chr3	129156536	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=171,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,2:5,2:5,4,4,0
chr3	129168854	.	CTTTT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,36,33,34;MFRL=145,162,261,180;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,10,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,11,13,14;RU=T;STR;TLOD=5.65,3.77,3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,2,2,2:0.214,0.300,0.298:7:0,0,1,1:1,2,1,1:0,1,0,6
chr3	129185641	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=227,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr3	129185661	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,5,2
chr3	129185924	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=235,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr3	129188325	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:1,7,0,5
chr3	129202316	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=153,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:12,3:13,5:14,11,5,3
chr3	129202336	.	C	T	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=159,75;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.113:41:21,2:16,2:19,18,2,2
chr3	129214511	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr3	129218944	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.122:39:8,2:27,2:3,32,1,3
chr3	129231261	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,89;MMQ=60,39;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,0:13,2:9,13,0,2
chr3	129234259	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=105,248;MMQ=52,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,3:4,4:5,4,2,5
chr3	129247551	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=18,30;MFRL=106,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.483:11:3,3:0,2:3,3,2,3
chr3	129247606	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=203,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:13,2:8,0:11,10,0,2
chr3	129251263	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=201,307;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:6,2:4,0:8,6,2,0
chr3	129252604	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=213,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr3	129266162	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:4,2,2,1
chr3	129275403	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,3:7,1:8,1,3,1
chr3	129275619	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr3	129275870	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,17;MFRL=224,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:0,1:0|1:129275870_GA_CC:129275870:1,0,2,0
chr3	129275877	.	GA	CC	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=17,12;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:3,0,1,0
chr3	129275883	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=25,15;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:3,0,1,0
chr3	129275886	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,13;MFRL=206,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:3,0,1,0
chr3	129275888	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,15;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:4,0,1,0
chr3	129275890	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,15;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:4,0,1,0
chr3	129275892	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:129275870_GA_CC:129275870:4,0,1,0
chr3	129278446	.	GC	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:5,3,0,2
chr3	129279570	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=114,209;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:16,0:18,3:14,20,1,2
chr3	129279597	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.942:13:0,8:0,5:0,0,8,5
chr3	129280631	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=175,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:13,0,2,0
chr3	129281866	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=83,230;MMQ=57,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:4,8,1,2
chr3	129282137	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr3	129284150	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=176,310;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,2:5,1:9,4,3,0
chr3	129286531	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.249:17:6,1:7,2:7,6,2,2
chr3	129286635	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,213;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,2:10,1:10,9,0,3
chr3	129289831	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=128,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:6,4:6,2:4,8,3,3
chr3	129290187	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=167,270;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:5,2:4,1:4,8,0,3
chr3	129290322	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=313,230;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.493:4:2,0:0,0:0|1:129290322_T_A:129290322:1,1,2,0
chr3	129290325	.	C	CCCCCCAAACGCCCCCCCAATCCAA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=313,230;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:129290322_T_A:129290322:1,1,2,0
chr3	129293394	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:0,9,0,2
chr3	129294294	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=162,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:7,2,2,0
chr3	129294456	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:1,6,0,2
chr3	129303197	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,7,2
chr3	129303436	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=218,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.443:14:4,4:3,2:2,6,0,6
chr3	129308096	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr3	129694934	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	129695538	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,4,3
chr3	129800783	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=130,150;MMQ=54,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:5,4:5,1:6,4,3,3
chr3	129800895	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=154,138;MMQ=51,30;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:0,3:8,3:5,4,4,4
chr3	129800934	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=154,136;MMQ=52,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,1:5,8:0|1:129800934_C_G:129800934:2,7,3,6
chr3	129800938	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=30,24;MFRL=154,136;MMQ=52,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:4,1:5,8:0|1:129800934_C_G:129800934:2,7,3,6
chr3	129801012	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=176,185;MMQ=52,34;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr3	129811073	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=191,95;MMQ=60,53;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,1,3
chr3	129811872	.	GAAAAAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=119,266;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=25,19;RU=A;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,0:0,2:0,1,2,0
chr3	129814847	.	CG	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=133,137;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:6,2:5,2:7,4,4,0
chr3	129814863	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=147,139;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:4,7,5,0
chr3	129814869	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=144,139;MMQ=60,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:5,6,5,2
chr3	129814934	.	GC	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=144,158;MMQ=43,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=45.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.654:21:4,7:3,7:0,7,5,9
chr3	129815930	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,152;MMQ=54,49;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr3	130095031	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:8,1,3,0
chr3	130109923	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=251,202;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:4,0,1,0
chr3	130114408	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	130116388	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=112,112;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:0,5:8,0:8,0,5,0
chr3	130122409	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.859:9:0,4:1,4:0,1,8,0
chr3	130122549	.	CTGT	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.179:20:7,0:10,3:0|1:130122549_CTGT_C:130122549:6,11,2,1
chr3	130122552	.	TACAC	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AC;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.264:9:3,1:2,1:1|0:130122549_CTGT_C:130122549:0,7,0,2
chr3	130124491	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.923:24:0,11:1,12:0,1,8,15
chr3	130124989	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,199;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,7:2,4:4,2,5,6
chr3	130129035	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=203,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr3	130132302	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,8,1
chr3	130132304	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0|1:130132302_T_A:130132302:0,0,8,1
chr3	130132509	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=72,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:1,1,0,5
chr3	130132851	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	130135575	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,11:0,5:0,0,9,7
chr3	130137866	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=74,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr3	130140113	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=182,83;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:4,2:12,6:10,6,6,3
chr3	130142584	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=174,239;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:5,2:1,0:6,1,2,0
chr3	130142587	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=239,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.723:9:2,6:0,1:2,0,6,1
chr3	130144984	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr3	130145175	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:8,2:12,4:11,9,2,4
chr3	130148510	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=213,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,1:5,3:2,5,0,4
chr3	130158343	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:2,0,6,3
chr3	130187570	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	130282383	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:6,14,1,1
chr3	130285553	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.140:19:10,2:7,0:9,8,2,0
chr3	130285929	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,4:7,3:3,9,2,5
chr3	130286886	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=142,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:1,1,2,2
chr3	130287191	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:21,2:6,0:5,22,0,2
chr3	130289617	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr3	130311343	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=174,144;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,8:5,0:7,3,8,0
chr3	130311366	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=198,144;MMQ=60,54;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,8:8,0:11,2,8,0
chr3	130313017	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=228,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr3	130317341	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr3	130360600	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=170,112;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.397:24:5,5:9,3:6,8,2,8
chr3	130361930	.	AC	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:4,1:2,7,0,2
chr3	130367860	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=159,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:3,1:2,2:5,1,3,0
chr3	130393973	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=197,310;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr3	130427085	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=186,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr3	130452998	.	T	TAC	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=186,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:8,2:13,2:6,15,2,2
chr3	130660392	.	A	AT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.241:18:3,4:11,0:11,3,4,0
chr3	130674022	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	130678263	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,1:7,2:0,10,0,3
chr3	130683005	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr3	130712710	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:7,1,2,0
chr3	130733046	.	CT	C,CTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,33,30;MFRL=155,157,107;MMQ=60,60,60;MPOS=19,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=10.62,5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,3:0.344,0.198:17:4,4,0:4,2,3:3,5,4,5
chr3	130733206	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=162,78;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,3:10,0:6,14,1,2
chr3	130734887	.	GT	G,GTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32,34;MFRL=227,300,224;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=4.45,5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.335,0.441:6:0,0,2:1,2,1:1,0,5,0
chr3	130737632	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr3	130748733	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,0:5,2:1,9,0,2
chr3	130799205	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=258,285;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.290:11:0,2:8,0:8,0,3,0
chr3	130828790	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=146,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,4:6,1:5,10,3,2
chr3	130851686	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:1,4,2,1
chr3	130881409	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,2:6,6:2,7,3,5
chr3	130884417	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,0:9,8:1,13,0,8
chr3	130887626	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=118,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:8,2,3,3
chr3	130887748	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=118,81;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,12:0.261:48:12,12:22,0:20,16,12,0
chr3	130962181	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=147,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	131102022	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=192,74;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:12,2:7,2:8,11,3,1
chr3	131186893	.	CAA	C,CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34,22;MFRL=161,178,141;MMQ=60,60,60;MPOS=13,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=A;STR;TLOD=6.05,3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.332,0.334:7:1,3,0:1,0,1:1,1,4,1
chr3	131217208	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,290;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,3:1,0:0,9,0,3
chr3	131261662	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=G;STR;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,2:0,2:0,0,2,3
chr3	131268824	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=140,218;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,1:5,3:10,4,1,3
chr3	131404625	.	A	AAC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AC;STR;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,3:1,0:2,1,3,0
chr3	131404641	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=175,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,1:1,1:5,1,1,1
chr3	131404826	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,1:5,4:0,7,0,5
chr3	131415340	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=157,300;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:6,2:2,1:5,3,3,0
chr3	131418719	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=155,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:6,0:2,3:4,5,0,3
chr3	131418898	.	CTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=126,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=T;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr3	131624385	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=215,225;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AC;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr3	132063914	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=216,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0,1,1,4
chr3	132068876	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=132,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.749:10:1,6:1,1:0,2,1,7
chr3	132075554	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:1,3:7,5:6,2,6,3
chr3	132075604	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=180,78;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:5,5,0,4
chr3	132075746	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=299,99;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:0,2,4,4
chr3	132153333	.	T	TAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=134,236;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:7,0,3,1
chr3	132166148	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.423:22:6,5:7,4:12,1,7,2
chr3	132166765	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=134,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:6,0:5,11,0,3
chr3	132169705	.	TA	T,AA,TAA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,27,25,28;MFRL=165,110,175,180;MMQ=60,60,60,60;MPOS=25,16,22;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=3.65,10.86,4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,3,7,3:0.145,0.287,0.154:21:3,2,4,1:5,1,3,2:0,8,2,11
chr3	132172395	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=152,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:11,3:8,0:12,8,3,0
chr3	132173004	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=168,59;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:4,2:7,2:5,6,1,3
chr3	132176152	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=131,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.141:26:10,3:13,0:11,12,3,0
chr3	132179072	.	GTT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:4,0:3,2:2,8,2,0
chr3	132182443	.	TG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=288,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,4:3,1:3,0,5,0
chr3	132196761	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=175,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.361:28:8,8:10,1:8,10,5,5
chr3	132196816	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=171,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,5:3,5:3,1,6,4
chr3	132197995	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=133,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr3	132198156	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=135,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:5,0:7,2:4,8,0,2
chr3	132202449	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=163,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,1:3,2:2,5,1,2
chr3	132211285	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=206,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.377:22:7,2:6,6:7,7,5,3
chr3	132217957	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=130,236;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.104:27:9,0:15,2:12,13,1,1
chr3	132219554	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=160,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:5,3:4,1:9,0,4,0
chr3	132221076	.	CTTTT	C,CTT,CTTT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,34,32,35;MFRL=0,177,149,80;MMQ=60,60,60,59;MPOS=17,12,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,12,14,15;RU=T;STR;TLOD=5.94,5.44,5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,2,2:0.301,0.301,0.300:6:0,2,2,2:0,0,0,0:0,0,5,1
chr3	132221097	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=157,80;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:2,0:7,5,2,0
chr3	132221139	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:9,7:9,3:14,4,5,5
chr3	132221167	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=167,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:14,3:13,0:19,8,0,3
chr3	132224128	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=155,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:14,1:10,1:18,6,2,0
chr3	132242642	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=221,201;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	132247160	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:6,0:7,2:5,8,2,0
chr3	132320802	.	T	TA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=158,149;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.367:22:7,5:7,3:5,9,6,2
chr3	132321036	.	TA	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=137,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.150:25:10,1:12,2:18,4,2,1
chr3	132322262	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=236,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr3	132338346	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:7,3:11,2:8,10,4,1
chr3	132394556	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:10,2:12,2:11,11,0,4
chr3	132407567	.	C	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,70;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,7:0.186:41:16,6:16,1:27,7,6,1
chr3	132413796	.	C	CATCTATTGCAATGAATAACAAAAAATGTA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=243,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.245:11:3,0:5,2:5,4,1,1
chr3	132415672	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,1:7,3:4,9,0,4
chr3	133108978	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,3:3,3:8,1,3,3
chr3	133114893	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.879:6:0,3:0,2:0,0,0,6
chr3	133185834	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=64.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,4,14
chr3	133191453	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr3	133329901	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=119,445;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:9,2:13,0:8,14,0,2
chr3	133329943	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,5,11
chr3	133331163	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=148,155;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:1,2:4,1,2,0
chr3	133335787	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr3	133335960	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	133335977	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	133347604	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=126,300;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,3:3,0:4,8,0,3
chr3	133359065	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=139,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,0:4,6:1,6,0,6
chr3	133368199	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr3	133368334	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=180,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,1:7,3:4,7,1,3
chr3	133368362	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,7:0,10:0,0,8,9
chr3	133375785	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,6:0,0:0,1,0,6
chr3	133380026	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,22;MFRL=157,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.186:24:12,2:8,2:5,15,1,3
chr3	133472558	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=130,92;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.180:29:13,0:11,4:6,18,1,4
chr3	133476852	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,1,8
chr3	133524591	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,300;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr3	133526756	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,69;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:0,9,0,2
chr3	133547692	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=148,177;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:3,3:2,3:2,3,2,4
chr3	133553554	.	C	CCATTTACCACAACATGAATAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=145,84;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr3	133556972	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=181,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,0:1,2:1,0,1,1
chr3	133583577	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=153,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr3	133661397	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:7,2:11,3:13,5,5,0
chr3	133666360	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,0:3,4:0,7,0,4
chr3	133692497	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=161,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,4:1,4:1,0,7,1
chr3	133692648	.	T	TG	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.113:24:12,2:10,0:0|1:133692648_T_TG:133692648:7,15,0,2
chr3	133692650	.	A	ACC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:0|1:133692648_T_TG:133692648:7,15,0,2
chr3	133692652	.	G	GGAGA	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,2:10,0:0|1:133692648_T_TG:133692648:7,15,0,2
chr3	133692743	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=252,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:0,1,0,9
chr3	133698280	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=231,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:4,1,3,1
chr3	133877113	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=88,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:3,7,2,4
chr3	133894390	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=185,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:5,5:1,6:6,0,9,2
chr3	134078433	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr3	134080661	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,3,7
chr3	134214042	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=227,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr3	134226159	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=89,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.576:17:5,4:2,5:2,5,3,7
chr3	134256159	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:0,5,0,3
chr3	134266124	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=197,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:2,1,1,0
chr3	134266148	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr3	134266321	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=196,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.476:15:4,3:3,3:2,6,1,6
chr3	134277195	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=190,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.253:13:3,2:7,1:1,9,1,2
chr3	134280395	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr3	134323112	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=216,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,1:8,1:7,8,2,0
chr3	134323156	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,9,3
chr3	134327421	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=194,180;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,0:8,0,6,0
chr3	134514579	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,4,8
chr3	134644636	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=203,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:2,0,7,1
chr3	134825512	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=134,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:1,9,0,4
chr3	134885886	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=122,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:3,2,0,2
chr3	134920489	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=121,311;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:8,0:6,2:6,8,1,1
chr3	134967368	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,3,2
chr3	135720241	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,487;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	135720783	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=130,168;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:5,0:7,4:5,7,0,4
chr3	135741887	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=209,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:7,1,3,0
chr3	135742057	.	G	GTGTTTTGTTT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=222,147;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TGTTT;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.295:7:0,1:5,0:0,5,0,2
chr3	135759669	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=194,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,1:4,2:7,4,3,0
chr3	135768232	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.875:5:0,0:0,4:0,0,2,3
chr3	135975486	.	T	TC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=159,41;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:0|1:135975486_T_TC:135975486:7,9,1,1
chr3	135975497	.	CTT	GAA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=166,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:11,0:4,2:0|1:135975486_T_TC:135975486:7,10,1,1
chr3	136035737	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.603:8:1,3:2,2:2,1,3,2
chr3	136059537	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr3	136060387	.	C	CCAGCCCTAA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=181,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,1,1
chr3	136139878	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=187,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.635:9:1,3:2,3:2,1,5,1
chr3	136196071	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr3	136287679	.	A	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=141,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:13,0:14,5:19,8,0,5
chr3	136287686	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=138,28972543;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:13,0:17,2:0|1:136287686_C_T:136287686:17,14,1,1
chr3	136287698	.	CA	AC	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=162,28972543;MMQ=60,57;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:13,0:11,1:0|1:136287686_C_T:136287686:12,12,1,1
chr3	136573284	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=133,164;MMQ=60,31;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:0|1:136573284_G_A:136573284:10,6,2,0
chr3	136573289	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,16:0.773:20:1,7:3,9:0|1:136573284_G_A:136573284:4,0,9,7
chr3	136574578	.	T	TTAA	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=91.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,22:0.854:25:0,7:3,15:2,1,9,13
chr3	136664589	.	A	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=44.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,16:0.304:54:17,16:21,0:20,18,16,0
chr3	136677064	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=155,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:12,0:7,2:7,13,1,1
chr3	136728886	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=222,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr3	137717991	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,267;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr3	137783700	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	137787192	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,128;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,25:0.929:26:0,14:1,10:0,1,9,16
chr3	137787282	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr3	137799291	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr3	137799498	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,4:0,7:0,0,5,7
chr3	137800656	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,6,6
chr3	137805944	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=140,212;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr3	137843018	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.872:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr3	137843073	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=127,155;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,6:10,0:14,5,6,0
chr3	137843106	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,15:0,11:0,0,17,10
chr3	137843708	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=174,122;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:12,4:9,0:7,14,2,2
chr3	137850003	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,2:0,12:0,0,8,6
chr3	137880695	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.930:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr3	137882377	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,2,8
chr3	137882752	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=54.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr3	137892530	.	CG	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=188,271;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,0:8,2:0,11,0,2
chr3	137893395	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=221,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.535:7:2,0:1,1:0,3,4,0
chr3	137907220	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=185,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:2,0:3,0,2,0
chr3	137907242	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=172,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:3,0:6,0,2,0
chr3	137940690	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=210,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr3	137958438	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	137982718	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=266,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0,1,1,5
chr3	137988855	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr3	138009460	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=164,35;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:4,4:13,0:0|1:138009460_C_A:138009460:11,6,2,2
chr3	138009462	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=153,70;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.164:22:5,3:14,0:0|1:138009460_C_A:138009460:11,8,2,1
chr3	138025136	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=222,285;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,2,1
chr3	138025396	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	138091701	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr3	138116364	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=213,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:3,1:5,1:1,7,0,3
chr3	138170788	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=25.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr3	138171042	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	138176533	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=226,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:0,6:1,5:0,1,1,10
chr3	138189031	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr3	138189658	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr3	138193038	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,12;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:2,0:9,0,3,0
chr3	138195529	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,5:0,5:1,0,7,3
chr3	138213849	.	ATTTGT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=168,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:6,6,0,2
chr3	138251447	.	CGGTAT	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGTAT;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:6,2:7,11,1,1
chr3	138341284	.	CTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.763:6:0,3:1,2:1,0,1,4
chr3	138348081	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=183,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,0,4
chr3	138383993	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:14,0:5,4:10,9,4,0
chr3	138403390	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=253,172;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr3	138413666	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:8,2:10,6,0,2
chr3	138413778	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:1,6,0,2
chr3	138417989	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,0:2,5:0,2,0,5
chr3	138433568	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=200,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,6:0,4:0,1,2,8
chr3	138724212	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:9,0,2,0
chr3	138739143	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,64;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:8,3:6,0:9,5,2,1
chr3	138763627	.	GTGC	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TGC;STR;TLOD=58.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,12:0,2:0,0,10,4
chr3	139066902	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	139069771	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:7,8:9,0:8,8,8,0
chr3	139075938	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=208,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0,7,0,3
chr3	139077527	.	GA	G,GAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,29,33;MFRL=167,180,157;MMQ=60,60,60;MPOS=10,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=3.32,9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,4:0.229,0.409:10:1,0,1:1,2,2:2,2,5,1
chr3	139090736	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,3:3,1:1,7,0,4
chr3	139098357	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:0,5,1,3
chr3	139102120	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,8:1,7:1,0,12,3
chr3	139108250	.	C	CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=294,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=42.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:0,4:1,3:1,0,10,0
chr3	139180919	.	ATG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=130,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,0:6,3:6,1,2,1
chr3	139195177	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=117,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:6,5:0,5:3,3,5,5
chr3	139257545	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr3	139257603	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=132,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,5:7,1:9,6,4,2
chr3	139280328	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,1:0,1,0,6
chr3	139894697	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=31462617,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	140140213	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=203,278;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr3	140178638	.	CCCT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.570:14:2,2:4,6:4,2,2,6
chr3	140282084	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=276,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,2,5
chr3	140285115	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,10:0,1:0,0,3,8
chr3	140419715	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=217,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:3,5:2,8:3,2,5,8
chr3	140675348	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:3,1:5,0,1,1
chr3	140678384	.	TA	T,TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30,21;MFRL=202,144,200;MMQ=60,60,60;MPOS=21,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.32,3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.297:7:1,1,0:1,1,1:0,3,0,4
chr3	140689795	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:11,4:14,0:13,12,4,0
chr3	140692486	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=218,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr3	140784929	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=162,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,3:1,2:1,0,4,1
chr3	140979115	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=217,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0,5,0,2
chr3	140979184	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,363;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	140998214	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=85.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,12:0,14:0,0,18,8
chr3	141235118	.	TTATTATTTATTTTA	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=166,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:9,0:4,2:14,2,1,1
chr3	141277651	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,2:5,1:12,0,3,0
chr3	141327593	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=197,212;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr3	141464146	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=157,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:4,4:7,5:4,7,3,6
chr3	141497195	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:5,8,1,1
chr3	141625999	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:1,5:3,6:4,0,6,5
chr3	141626123	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=83,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:2,5:9,3:5,6,5,3
chr3	141644274	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=399,236;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141644274_G_C:141644274:1,0,1,0
chr3	141644278	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=399,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:141644274_G_C:141644274:1,0,1,0
chr3	141678537	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,86;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:5,0:11,2:11,5,2,0
chr3	141682825	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,299;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:3,6,0,4
chr3	141689017	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=202,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,9:0.527:17:3,4:5,5:0|1:141689017_T_C:141689017:2,6,1,8
chr3	141689025	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=227,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:2,4:4,4:0|1:141689017_T_C:141689017:1,5,1,7
chr3	141712485	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr3	141713823	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,241;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,1:7,2:9,4,3,0
chr3	141904808	.	TCA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=154,90;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,2:0|1:141904808_TCA_T:141904808:6,11,1,1
chr3	141904811	.	TCCACTG	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:8,2:0|1:141904808_TCA_T:141904808:8,13,1,1
chr3	141904977	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:1,6:5,9:5,1,10,5
chr3	141905253	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=250,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:12,2:3,2:0|1:141905253_C_A:141905253:19,0,4,0
chr3	141905259	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=250,164;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.231:24:14,2:5,3:0|1:141905253_C_A:141905253:19,0,5,0
chr3	141905261	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=250,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,5:0.230:24:13,2:5,3:0|1:141905253_C_A:141905253:19,0,5,0
chr3	141906446	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	141917810	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=224,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,1,2
chr3	141923506	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=55,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,1:5,7:4,5,5,3
chr3	141932531	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=221,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	142051147	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=239,166;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr3	142076059	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=147,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr3	142089990	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=184,175;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,0:1,0:6,0,2,0
chr3	142089997	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,15;MFRL=178,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:2,0:1,0:5,0,2,0
chr3	142090008	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,13;MFRL=178,191;MMQ=60,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:2,0:6,1,2,0
chr3	142094816	.	G	GCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=205,196;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=CA;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.348:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr3	142119301	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:7,0:5,0:9,8,0,4
chr3	142131378	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:3,4,2,1
chr3	142178144	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,108;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:13,0:12,6,2,0
chr3	142218425	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,2:11,1:11,6,1,2
chr3	142231254	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,179;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:8,7:7,2:9,6,0,9
chr3	142241692	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=137,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:0,2:0,1:0,3,0,4
chr3	142255090	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=179,342;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:1,13,0,2
chr3	142259706	.	CA	C,CAA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32,29;MFRL=147,200,160;MMQ=60,60,60;MPOS=4,1;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.10,12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,3,6:0.235,0.412:14:3,0,1:2,3,5:4,1,8,1
chr3	142272314	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=227,191;MMQ=60,21;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,4:1,8:0,1,0,12
chr3	142274739	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:1,0:7,2:7,1,3,0
chr3	142277399	.	AATAGATAG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=151,148;MMQ=60,56;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=ATAG;STR;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:2,0:3,2:3,5,2,0
chr3	142287047	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,4:2,2:1,6,1,5
chr3	142413407	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:1,2:4,3:0,5,2,4
chr3	142430389	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,73;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:12,2:15,1:9,18,1,2
chr3	142467310	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,1:4,1:4,9,0,2
chr3	142521224	.	C	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.355:14:5,3:4,2:1,8,1,4
chr3	142523555	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=299,282;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:0,8,0,2
chr3	142548492	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,131;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,0:6,2:8,1,2,0
chr3	142567030	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=164,312;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:9,2,1,1
chr3	142567327	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr3	142720348	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,6,1
chr3	142735816	.	C	T	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=69.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,23:0.462:50:15,0:12,23:7,20,0,23
chr3	142746095	.	GG	TC	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:142746095_GG_TC:142746095:2,17,0,2
chr3	142746098	.	G	GT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:8,2:0|1:142746095_GG_TC:142746095:2,17,0,2
chr3	142752293	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	142773738	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=261,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,11:0,7:1,0,10,8
chr3	142985837	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=210,200;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.378:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	143371003	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=183,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr3	143513975	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=203,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	143567207	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=81.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,15:0,9:0,0,3,21
chr3	143691889	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	145788467	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=169,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:7,5:7,7:11,3,9,3
chr3	145788803	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=189,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,2:10,1,5,0
chr3	145794776	.	CTTTA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=231,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr3	145796891	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,4:4,4:5,5,6,2
chr3	145803138	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=229,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0|1:145803138_T_C:145803138:0,6,1,4
chr3	145803142	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=229,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.462:11:2,2:3,3:0|1:145803138_T_C:145803138:0,6,1,4
chr3	145804524	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,188;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:3,1:6,1:9,0,3,0
chr3	145820684	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,2:4,2:1,9,1,3
chr3	145824478	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=183,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,0:3,3:0,6,0,3
chr3	145824504	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=202,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:0,4,0,4
chr3	145828256	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr3	145838895	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,8,4
chr3	145841854	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	145878591	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=190,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,3,0
chr3	145878621	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=171,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0|1:145878621_C_T:145878621:7,0,2,0
chr3	145878629	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=171,218;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:4,3:3,0:0|1:145878621_C_T:145878621:7,0,2,1
chr3	145912299	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,6:0,2:2,0,0,8
chr3	145924632	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=211,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr3	145938528	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:4,0,6,1
chr3	145938782	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=204,270;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:3,1:8,2:0,11,0,3
chr3	145939916	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:3,3,2,1
chr3	146166913	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=247,68;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,2:6,2:8,0,4,0
chr3	146167163	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:0,11,0,3
chr3	146176075	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr3	146251430	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:146251430_A_G:146251430:0,2,0,4
chr3	146251433	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=220,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0|1:146251430_A_G:146251430:0,2,0,4
chr3	146254478	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr3	146303750	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,1:0,5:1,1,6,0
chr3	146303911	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=143,204;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=42.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,16:0.348:47:12,0:18,16:15,16,0,16
chr3	146307371	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr3	146307487	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,2:6,0:4,8,2,0
chr3	146307635	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=209,260;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr3	146311937	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=129,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.579:10:1,3:3,3:1,3,0,6
chr3	146312941	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=151,153;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,3:3,3:3,5,1,5
chr3	148459395	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=125,162;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,4:7,2:9,7,4,2
chr3	148558447	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=297,111;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:1,1,4,2
chr3	148562397	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:2,3:0,6:0|1:148562397_G_C:148562397:0,2,2,7
chr3	148562399	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=178,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:1,3:0,5:0|1:148562397_G_C:148562397:0,2,2,7
chr3	148562425	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=170,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:4,6,1,2
chr3	148562620	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=98,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr3	148563493	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:0,6,0,4
chr3	148575380	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=159,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,0:9,3:0,13,0,3
chr3	148597482	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=243,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	148714025	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=320,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,4:3,3:4,0,5,2
chr3	148727223	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,22;MFRL=184,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.482:27:9,0:4,13:5,9,0,13
chr3	148750245	.	T	TA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,511;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr3	148756825	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,10,3
chr3	148757290	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr3	148759542	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=245,290;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:0,8,0,2
chr3	148760079	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:14,0:8,2:5,17,0,2
chr3	148764090	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,2:6,1:1,6,0,3
chr3	148791966	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,5:4,0:7,1,5,0
chr3	148793854	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr3	148857714	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=244,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr3	148858987	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=167,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.417:8:3,3:1,0:1,4,1,2
chr3	148871532	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=151,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr3	148879878	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:148879878_A_G:148879878:0,0,11,1
chr3	148879883	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:1,5:4,2:0|1:148879878_A_G:148879878:4,1,7,0
chr3	148885077	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=240,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr3	148885779	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.557:9:3,5:1,0:2,2,2,3
chr3	148885851	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	148891654	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:148891654_T_TA:148891654:0,9,0,2
chr3	148891656	.	T	TCCCGTTTCCAACG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=197,119;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:148891654_T_TA:148891654:0,9,0,2
chr3	148895531	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=159,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr3	148896430	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,1:5,4:0,7,0,5
chr3	148901407	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=148,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.661:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	148924030	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,130;MMQ=60,33;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,0:8,7:5,10,0,7
chr3	148925257	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=180,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:8,7,1,1
chr3	148925418	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:5,6,0,2
chr3	149039324	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=97,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:2,6:0,6:1,1,6,6
chr3	149040186	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=183,1376;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:12,1:8,1:13,7,0,2
chr3	149050925	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	149087714	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,6,19
chr3	149192564	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr3	149192851	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=179,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr3	149216761	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:1,8,0,2
chr3	149238595	.	C	CTTAA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=171,40;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:6,2:8,2:4,10,2,2
chr3	149243715	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=185,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr3	149290605	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=132,17181301;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr3	149459341	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,8,6
chr3	149469181	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=131,97;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:17,3:9,0:13,13,3,0
chr3	149469333	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=363,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,5:1,4:0,1,0,9
chr3	149485901	.	T	TG	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=27.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:4,7:4,6:3,6,9,6
chr3	149613232	.	ATT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.927:10:0,3:0,5:0,0,9,1
chr3	149678534	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=99,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.877:22:0,12:2,8:2,0,5,15
chr3	149684096	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,3:5,1:4,5,1,3
chr3	149686076	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr3	149686366	.	AAC	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AC;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.246:14:5,1:6,2:2,9,1,2
chr3	149686367	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=225,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:3,4:0,8:0,3,3,9
chr3	150128154	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:7,2:10,2,2,0
chr3	150128392	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=236,305;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:2,7,0,3
chr3	150128484	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=328,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr3	150129171	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=172,302;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	150176389	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=128,42;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:15,0:12,2:0|1:150176389_A_C:150176389:13,16,1,1
chr3	150176394	.	CCACAGCA	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=131,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:14,0:16,2:0|1:150176389_A_C:150176389:14,17,1,1
chr3	150262318	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=66.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,25:0.530:47:14,9:8,16:8,14,8,17
chr3	150263783	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:5,2:8,5:10,3,7,0
chr3	150264003	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=182,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:0,13,0,2
chr3	150270077	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,3:3,4:6,0,7,0
chr3	150276151	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:0|1:150276151_A_AT:150276151:4,1,4,1
chr3	150276153	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.521:10:1,3:4,2:0|1:150276151_A_AT:150276151:4,1,4,1
chr3	150280253	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=199,272;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	150280506	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,0:0,3:0,4,0,3
chr3	150282061	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=286,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.424:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr3	150285664	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=144,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:5,9:6,3:7,4,8,4
chr3	150290399	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=222,196;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150290399_C_T:150290399:0,2,0,1
chr3	150290408	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=222,196;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150290399_C_T:150290399:0,2,0,1
chr3	150290416	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=222,196;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:150290399_C_T:150290399:0,2,0,1
chr3	150340114	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	150384807	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr3	150404208	.	A	AAAGAAGTGGCATTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=197,62;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr3	150421590	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,19;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.254:16:4,0:5,1:6,6,1,3
chr3	150421707	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:6,0:14,2:5,15,0,2
chr3	150661472	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=249,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr3	150661495	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=249,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,2:1,6:1,0,6,2
chr3	150690439	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:10,1:7,5:4,14,4,2
chr3	150690566	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr3	150804629	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	150804908	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=234,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr3	150845574	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:3,4,6,1
chr3	150845795	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=213,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,4:0,3:0,1,0,7
chr3	150883600	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=192,205;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:8,1,1,1
chr3	150906314	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:6,0:1,2:0,8,0,2
chr3	150916131	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=182,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,3:5,6:7,0,9,0
chr3	150916715	.	G	GCCAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=177,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:5,2,1,1
chr3	150931137	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,0:7,3:5,15,0,3
chr3	151046135	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=170,63;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,3:11,0:0|1:151046135_C_A:151046135:10,10,2,1
chr3	151046149	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=176,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.180:20:7,3:10,0:0|1:151046135_C_A:151046135:7,10,2,1
chr3	151046150	.	C	CTACTTCCATCTCTCTTTCTCTTTG	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=176,63;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.177:20:7,3:10,0:0|1:151046135_C_A:151046135:7,10,2,1
chr3	151046604	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:17,2:8,1:10,16,2,1
chr3	151078216	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=151,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:7,3,2,0
chr3	151083695	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=162,104;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:4,3:16,0:8,13,3,0
chr3	151085842	.	AAAT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAT;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:7,0,3,0
chr3	151094995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=258,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	151102790	.	ACT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=185,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CT;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,1:5,2:12,4,2,1
chr3	151102901	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,0:14,2:12,14,0,2
chr3	151131074	.	A	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=126,182;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,12:0.296:42:14,0:14,10:17,13,0,12
chr3	151131183	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr3	151134104	.	AGCAGCCCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCTTGGTCTCCAAGCAAT	A	.	.	DP=97;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=147,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:73,24:0.074:97:10,4:4,5:41,32,17,7
chr3	151148113	.	CCAG	C	.	.	DP=50;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=174,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAG;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.118:31:12,3:14,0:15,13,1,2
chr3	151150422	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=204,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr3	151155758	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:10,4:9,1:8,11,4,1
chr3	151161612	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:5,5,0,2
chr3	151166343	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=212,200;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr3	151461960	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=192,102;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.425:14:6,3:1,3:4,4,2,4
chr3	151463421	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=129,217;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,1:7,2:5,9,0,3
chr3	151531894	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=126,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,1:2,5:6,0,6,0
chr3	151535422	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,0,3
chr3	151542408	.	AAAAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=22,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAC;STR;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:3,1,2,0
chr3	151545318	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	151545321	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	151545323	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:151545318_A_T:151545318:0,0,5,0
chr3	151546041	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=237,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:4,1:0,3:0,5,0,4
chr3	152017897	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=89,263;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:0,1:4,0,3,0
chr3	152164599	.	AG	CT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=247,145;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:4,2:3,10,0,2
chr3	152174242	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=204,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:0,5,0,5
chr3	152881441	.	TC	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=222,231;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:5,1:1,2:2,4,3,1
chr3	152881449	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=202,174;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.734:15:1,3:2,4:3,1,3,8
chr3	152881453	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=192,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.792:14:0,5:2,4:2,1,3,8
chr3	152881852	.	AT	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=92,117;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.299:30:13,6:6,2:17,4,4,5
chr3	152881927	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=145,259;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.184:47:25,0:14,8:25,14,0,8
chr3	152881936	.	GGT	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=170,85;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.109:24:14,1:8,0:14,8,1,1
chr3	152883389	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,11:0.245:47:12,11:20,0:32,4,11,0
chr3	152883395	.	CTT	C,CT	.	.	DP=53;ECNT=3;MBQ=34,32,32;MFRL=165,215,121;MMQ=60,60,60;MPOS=10,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.05,9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,3,7:0.075,0.166:44:20,1,2:12,2,3:32,2,7,3
chr3	152883481	.	AT	A	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=144,141;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.154:30:14,2:10,2:7,19,1,3
chr3	152884097	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=162,323;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:9,6:11,0:17,3,6,0
chr3	153839959	.	CT	TC	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=291,160;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,20:0.877:22:0,8:2,12:0|1:153839959_CT_TC:153839959:2,0,9,11
chr3	153839960	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,22:0.958:22:0,8:0,14:1|0:153839959_CT_TC:153839959:0,0,11,11
chr3	153840898	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=161,259;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,1:9,1:3,11,0,2
chr3	153870511	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=259,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,6:0,8:1,0,14,0
chr3	153958173	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=155,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:5,4:2,8,2,3
chr3	153970796	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	153972500	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,7,5
chr3	153973083	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=113,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.261:17:3,2:9,2:12,1,3,1
chr3	153994502	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr3	153995307	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=124,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr3	154002357	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=146,83;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.301:16:6,2:5,3:5,6,4,1
chr3	154007682	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr3	154010515	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=186,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=AC;STR;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr3	154021063	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,9:0,7:0,0,12,4
chr3	154024165	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	154029544	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:154029544_G_A:154029544:0,2,0,1
chr3	154029549	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=238,167;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:154029544_G_A:154029544:0,2,0,1
chr3	154033066	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=136,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,2:11,3:10,12,1,4
chr3	154147149	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:6,4:11,0:10,8,5,0
chr3	154834379	.	GTA	G,GTATATATA,GTATATATATA,GTATATATATATA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33,33,32,33;MFRL=119,219,171,122,324;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=23,17,8,8;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=8,7,11,12,13;RU=TA;STR;TLOD=13.00,13.30,7.23,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,4,5,3,3:0.249,0.293,0.191,0.176:16:0,2,2,2,2:1,2,3,1,1:1,0,9,6
chr3	154866453	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=287,127;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,6:1,5:2,1,4,7
chr3	154878158	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=182,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,1:3,5:0,7,3,3
chr3	155205993	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=254,241;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr3	155212325	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=116,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:0,1,2,6
chr3	155241593	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr3	155241740	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,4:3,5:3,3,3,6
chr3	155241872	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155241872_C_A:155241872:0,3,0,1
chr3	155241873	.	A	AGAATAGTATTTGT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=169,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:155241872_C_A:155241872:0,3,0,1
chr3	155241885	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	155271825	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=124,232;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:0,3:5,6:1,4,8,1
chr3	155520239	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:7,1,2,0
chr3	155547696	.	C	CTTGTGG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.680:1:0,0:0,1:0|1:155547696_C_CTTGTGG:155547696:0,0,0,1
chr3	155547699	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:155547696_C_CTTGTGG:155547696:0,0,0,1
chr3	155551206	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	155611557	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=145,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr3	155628877	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=144,277;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,2:12,2:16,7,1,3
chr3	155637190	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=176,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,0:4,4:0,7,1,3
chr3	155643189	.	CTT	C,CT	.	.	DP=52;ECNT=3;MBQ=36,32,35;MFRL=163,102,144;MMQ=57,60,60;MPOS=23,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.53,7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:36,3,7:0.078,0.153:46:4,1,4:32,1,3:3,33,4,6
chr3	155643196	.	T	TC	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=138,163;MMQ=60,57;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=75.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,28:0.568:49:12,0:9,28:0|1:155643196_T_TC:155643196:8,13,0,28
chr3	155643198	.	T	G	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=138,163;MMQ=60,57;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=76.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,28:0.568:49:12,0:8,28:0|1:155643196_T_TC:155643196:8,13,0,28
chr3	155649472	.	T	TTAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=194,352;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.293:5:2,0:2,1:0|1:155649472_T_TTAA:155649472:4,0,1,0
chr3	155649492	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=195,352;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:155649472_T_TTAA:155649472:2,1,1,0
chr3	155649494	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=195,352;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:155649472_T_TTAA:155649472:2,1,1,0
chr3	155652860	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=172,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:9,2:3,2:7,5,2,2
chr3	155655279	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,314;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr3	155861240	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:4,6,0,2
chr3	156009614	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=127,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr3	156266642	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,6:0,7:0,0,12,1
chr3	156266880	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=253,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr3	156411797	.	G	GT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=211,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:9,2:17,1:23,4,2,1
chr3	156421525	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr3	156742775	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,5:1,4:0,1,0,9
chr3	156867776	.	G	GAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=A;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.182:14:7,2:5,0:3,9,0,2
chr3	156876605	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,0:11,3:18,0,3,0
chr3	157004323	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:5,3:2,3:4,3,4,2
chr3	157082082	.	C	CAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=209,305;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,0:2,1,2,0
chr3	157131650	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:5,5:10,0:12,3,5,0
chr3	157154768	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=131,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:5,2:9,0:8,6,0,2
chr3	157154861	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:8,2:10,3:6,12,2,3
chr3	157155623	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	157188045	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr3	157188378	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=214,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr3	157289936	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr3	157318257	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr3	157820423	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=197,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.798:8:0,1:1,5:1,0,7,0
chr3	157822821	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=C;STR;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr3	158072602	.	GT	AA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,2:10,0:12,14,0,2
chr3	158072623	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.331:25:11,4:4,4:7,10,4,4
chr3	158178856	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=191,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:1,5,1,3
chr3	158254806	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=132,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:7,0,6,1
chr3	158310153	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=125,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr3	158314810	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:0,6,0,8
chr3	158318015	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr3	158364613	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,103;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:8,5:19,0:11,16,5,0
chr3	158367007	.	A	ACAACAGGTGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:158367007_A_ACAACAGGTGCT:158367007:0,1,0,1
chr3	158367011	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=179,159;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:158367007_A_ACAACAGGTGCT:158367007:0,2,0,1
chr3	158378836	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0,11,0,2
chr3	158384733	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=180,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr3	158384883	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=33.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:6,4:4,10:4,6,6,8
chr3	158384920	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,1:8,1:0,16,1,1
chr3	158387271	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,9:0.192:50:19,9:22,0:26,15,9,0
chr3	158387487	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,276;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr3	158399757	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,234;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.302:14:5,3:5,1:9,1,3,1
chr3	158409093	.	C	CA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.198:18:6,1:8,2:0|1:158409093_C_CA:158409093:12,3,1,2
chr3	158409106	.	C	CT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=142,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.155:24:10,1:11,2:0|1:158409093_C_CA:158409093:14,7,1,2
chr3	158409262	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=96,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:2,6,1,1
chr3	158415402	.	TAGA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=180,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,1:4,3:6,0,4,0
chr3	158415840	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=203,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr3	158428809	.	A	AAGGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=185,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AGGC;STR;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr3	158523248	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=131,131;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.142:40:22,0:13,5:10,25,0,5
chr3	158526942	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=135,219;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:2,1:6,2,2,0
chr3	158526958	.	C	A,G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,10,17;MFRL=109,219,62;MMQ=60,60,60;MPOS=26,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.59,3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,4:0.232,0.464:8:0,0,0:2,0,0:0,2,6,0
chr3	158531676	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:4,0:2,2:7,0,2,0
chr3	158537415	.	CTTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=T;STR;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.732:9:0,3:1,4:0|1:158537415_CTTTTT_C:158537415:2,0,6,1
chr3	158537443	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=88,145;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.648:15:2,4:2,5:0|1:158537415_CTTTTT_C:158537415:2,3,8,2
chr3	158539294	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,131;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:6,0,5,1
chr3	158539486	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=95,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.561:23:8,7:2,6:4,6,8,5
chr3	158539961	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=178,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:1,8:4,3:4,1,4,7
chr3	158970613	.	TA	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,142;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.407:30:9,0:9,12:9,9,0,12
chr3	158980279	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr3	158991724	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,1,7
chr3	159482271	.	GGCA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=221,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GCA;STR;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:5,5,1,1
chr3	159609921	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=177,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:7,2:10,0:12,5,2,0
chr3	159609989	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,3:5,1:4,5,1,3
chr3	160073723	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:7,0,2,0
chr3	160075370	.	T	TAGTCCTTGCTTATTTG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:2,8,1,1
chr3	160083969	.	GC	TG	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=32,31;MFRL=175,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:7,1:2,12,0,2
chr3	160083978	.	CTTT	C	.	.	DP=16;ECNT=7;MBQ=33,33;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,1:7,1:0|1:160083978_CTTT_C:160083978:2,12,0,2
chr3	160083982	.	AATT	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=191,116;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATT;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,1:7,1:0|1:160083978_CTTT_C:160083978:2,13,0,2
chr3	160083988	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=28,33;MFRL=193,116;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:7,1:6,1:0|1:160083978_CTTT_C:160083978:2,12,0,2
chr3	160084034	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,32;MFRL=232,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:160084034_A_C:160084034:0,4,0,1
chr3	160084036	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=232,195;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:160084034_A_C:160084034:0,4,0,1
chr3	160084037	.	A	ATTCTTCT	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,24;MFRL=232,195;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.297:5:3,1:1,0:0|1:160084034_A_C:160084034:0,4,0,1
chr3	160102249	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	160131236	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.333:12:6,2:1,2:6,2,3,1
chr3	160134208	.	G	GT	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=165,117;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.328:16:4,2:4,0:5,6,0,5
chr3	160141294	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=149,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,3:0.104:36:22,3:11,0:8,25,1,2
chr3	160141656	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=182,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.425:12:6,2:1,2:2,5,1,4
chr3	160142810	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=15,25,20;MFRL=151,129,140;MMQ=60,60,60;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=TG;STR;TLOD=6.23,5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.221,0.257:13:1,1,2:2,1,0:0,7,1,5
chr3	160148756	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=187,90;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:5,0:11,3:10,6,2,1
chr3	160219837	.	CAT	C,CATAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30,33;MFRL=115,194,78;MMQ=60,60,60;MPOS=13,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=AT;STR;TLOD=4.40,4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.250,0.276:8:1,1,1:3,1,0:3,1,4,0
chr3	160227606	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=164,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,2:2,0:5,2,1,1
chr3	160249220	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24,25,27;MFRL=143,130,187,136;MMQ=60,60,60,60;MPOS=7,12,14;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=A;STR;TLOD=10.18,10.61,7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:8,5,6,4:0.223,0.264,0.185:23:4,2,2,2:4,3,4,2:3,5,14,1
chr3	160395561	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,249;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,3:11,0:12,10,3,0
chr3	160474540	.	CGT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=GT;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.798:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	160679422	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	160679744	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr3	160939732	.	A	AATCCCAAC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=144,250;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATCCCAAC;STR;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.603:13:2,5:2,2:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:5,0,7,1
chr3	160939746	.	CTTTTTTTTTTTTTTTTT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=144,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=30,13;RU=T;STR;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,9:0.624:14:3,3:2,4:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:5,0,7,2
chr3	160939776	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=175,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.716:12:2,4:0,4:0|1:160939732_A_AATCCCAAC:160939732:3,0,5,4
chr3	160942727	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,5:7,0:10,4,5,0
chr3	160951094	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,0:1,2:2,0,3,0
chr3	160955879	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=228,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,1:7,0,4,3
chr3	160955882	.	CTTT	C,CT,CTT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32,23,32;MFRL=186,166,191,144;MMQ=60,60,60,60;MPOS=17,16,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=8.01,5.81,8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,3,3:0.277,0.239,0.279:12:2,3,0,1:0,0,2,2:2,0,7,3
chr3	160964271	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=147,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr3	160967354	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=146,118;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.514:27:7,7:6,6:8,5,4,10
chr3	161064193	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,4:3,3:0,3,0,7
chr3	161216912	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:10,3,2,0
chr3	164697082	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr3	164699998	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,5:4,3:4,5,6,2
chr3	164700734	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,0:1,4:4,0,2,2
chr3	164710040	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=120,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:6,1:4,3:7,3,1,3
chr3	164714296	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=96,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr3	164724567	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,1:4,5:3,2,3,3
chr3	164733721	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr3	164741534	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,1:7,5:6,6,3,3
chr3	164748687	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,28;MFRL=124,0;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.244:11:2,1:1,1:3,6,1,1
chr3	164755664	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:4,5:8,0,6,1
chr3	164758630	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=206,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	164766835	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr3	164772957	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=108,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:3,1,4,1
chr3	164776913	.	C	CAT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,2:4,2:3,6,1,3
chr3	164777677	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.473:13:2,3:4,3:6,1,3,3
chr3	164781368	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=112,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,7:3,3:2,3,3,7
chr3	164785338	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr3	164786413	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=215,200;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr3	164786629	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,2:6,2:2,9,2,2
chr3	164793648	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:10,2,3,1
chr3	164905648	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=123,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:3,1:7,1,3,0
chr3	164908195	.	TTCTGAAGACATC	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:6,0:3,10,1,1
chr3	166958643	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=178,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,0:6,2:0|1:166958643_C_T:166958643:5,10,1,1
chr3	166958646	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=178,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:5,2:0|1:166958643_C_T:166958643:5,10,1,1
chr3	166960278	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=119,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,7:2,3:3,1,7,3
chr3	167000256	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=137,154;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:7,1:8,10,1,1
chr3	167078544	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,5:3,5:6,3,5,5
chr3	167164352	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr3	167167100	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=161,132;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:4,2:9,4:7,6,4,2
chr3	167170829	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.294:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr3	167506967	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=153,147;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:10,1:8,3:9,9,1,3
chr3	167506996	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=157,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:5,14,3,0
chr3	167508062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr3	167542351	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=163,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:3,9,0,2
chr3	167745703	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,3:7,2:0,10,0,5
chr3	167747543	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,0:9,2:12,5,1,1
chr3	167754573	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,3:2,5:2,1,8,0
chr3	167754852	.	A	ATCTATGAATGCC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=166,166;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr3	167761070	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=203,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr3	167762678	.	CAA	C,CAAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33,34;MFRL=221,65,147;MMQ=60,60,60;MPOS=15,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=5.37,8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,4:0.229,0.429:9:0,1,2:3,1,2:1,2,4,2
chr3	167764820	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=125,180;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:11,6:2,1:4,9,6,1
chr3	168269756	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,3:6,2:3,10,2,3
chr3	168810980	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,263;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:0,5,0,6
chr3	168818560	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr3	168819788	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr3	168840571	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr3	168840607	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr3	169486144	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr3	169492016	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,3:3,0:8,0,3,0
chr3	169539926	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=177,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:0|1:169539926_AT_A:169539926:8,8,1,1
chr3	169539930	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=178,64;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:10,2:6,0:0|1:169539926_AT_A:169539926:8,9,1,1
chr3	169539932	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=177,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,1:6,0:0|1:169539926_AT_A:169539926:8,10,1,1
chr3	169540459	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:7,10,1,1
chr3	169550759	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=85,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,3:7,0:7,6,1,2
chr3	169550796	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=131,110;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:7,0:8,8:5,10,0,8
chr3	169637195	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=195,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:5,1,2,0
chr3	169644945	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=125,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:9,0:7,3:8,9,3,0
chr3	169654252	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:13,4:9,0:7,15,2,2
chr3	169710363	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:5,3,2,0
chr3	169803231	.	GGAA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=189,219;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr3	169815009	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=185,68;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:12,0:8,2:0|1:169815009_A_C:169815009:15,6,1,1
chr3	169815013	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=187,68;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:14,0:7,2:0|1:169815009_A_C:169815009:15,7,1,1
chr3	169847291	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.333:28:7,4:12,5:12,7,2,7
chr3	169988154	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=138,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:8,2,1,1
chr3	169988364	.	C	CTTTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=224,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=20,24;RU=T;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.411:5:0,1:1,0:0,3,1,1
chr3	169991161	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:15,3:4,1:3,17,2,2
chr3	169999670	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,1:7,1:8,3,1,1
chr3	170016808	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=119,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,2:5,0:7,8,2,0
chr3	170078232	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=239,141;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=92.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.915:33:1,14:1,17:1,1,16,15
chr3	170079240	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=121,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:5,1:11,2:3,14,0,3
chr3	170099218	.	ATTAT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=115,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTAT;STR;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.625:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr3	170109112	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:2,0:0,3:1,2,0,4
chr3	170140974	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:9,6:9,0:13,6,6,0
chr3	170198967	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=115,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,3:2,3:3,5,5,1
chr3	170218862	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,2:6,6:5,8,5,3
chr3	170584074	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=209,223;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:2,1:6,0,2,0
chr3	170586057	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,3:8,5:5,5,6,2
chr3	170715878	.	AGG	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,2:0.083:34:19,2:13,0:16,16,0,2
chr3	170720299	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:2,1:1,1:6,0,3,0
chr3	170723276	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:2,4:6,0:0,9,0,4
chr3	170723664	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:4,2:9,0:0|1:170723664_A_G:170723664:10,4,2,0
chr3	170723668	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=136,65;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:4,2:10,0:0|1:170723664_A_G:170723664:10,4,2,0
chr3	170724883	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,3,3
chr3	170727739	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.509:10:3,2:1,3:3,2,2,3
chr3	170732300	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=143,67;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:3,4:9,1:12,0,3,2
chr3	170732599	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr3	170784283	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,10;MFRL=203,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.291:11:3,0:5,0:4,4,3,0
chr3	170784423	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=127,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:4,4:10,0:7,7,0,4
chr3	170801912	.	TAAAAA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,1:5,1:7,7,1,1
chr3	170825905	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,5,7
chr3	170825920	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,0:3,4:1,5,1,3
chr3	170844016	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=221,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.641:6:2,1:0,2:0,2,0,4
chr3	170846676	.	CAAA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=67,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.350:12:0,2:5,2:4,4,0,4
chr3	170857166	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=172,206;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:3,1:10,0,2,0
chr3	170857240	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=98,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.173:33:13,3:12,2:7,21,2,3
chr3	170885097	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=243,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr3	170893070	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=126,140;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.634:28:2,8:8,10:6,4,9,9
chr3	170906609	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:18,0:10,8:8,21,0,8
chr3	170912469	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=205,120;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:1,10,1,6
chr3	171405384	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:0,8,0,3
chr3	171405424	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=156,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr3	171452645	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=187,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,2:6,2:7,2,4,0
chr3	171969423	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=349,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,1,0
chr3	172003831	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=192,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:2,1:2,1:1,5,0,2
chr3	172046695	.	G	GTT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=114,105;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,15;RU=T;STR;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.478:13:3,3:4,1:6,1,4,2
chr3	172046933	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:5,3:16,5:1,20,0,8
chr3	172052897	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=31,19;MFRL=104,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.419:12:0,0:7,2:3,4,0,5
chr3	172052903	.	T	TG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=179,59;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:13,2:0|1:172052903_T_TG:172052903:6,11,1,1
chr3	172052913	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:2,0:8,2:0|1:172052903_T_TG:172052903:2,10,1,1
chr3	172052916	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=147,59;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:2,0:8,2:0|1:172052903_T_TG:172052903:2,9,1,1
chr3	172058906	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,178;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:11,7,3,0
chr3	172059121	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=266,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr3	172064091	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,1:3,3:6,1,3,1
chr3	172065051	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,141;MMQ=60,59;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,3:6,0:8,9,3,0
chr3	172224769	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,11
chr3	172224771	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0|1:172224769_GC_G:172224769:0,0,0,11
chr3	172227199	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr3	172240999	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=103,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:3,3,2,4
chr3	172351917	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=191,274;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr3	172365619	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,5:5,6:8,2,10,1
chr3	172473194	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=156,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:7,1:4,10,1,1
chr3	172480173	.	A	ATT	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,19:0.741:25:4,8:2,10:0|1:172480173_A_ATT:172480173:4,2,13,6
chr3	172480174	.	AC	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=169,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=77.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,19:0.741:25:4,8:2,11:0|1:172480173_A_ATT:172480173:4,2,13,6
chr3	172520818	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr3	172534428	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=223,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:4,6:3,4:5,2,7,3
chr3	172537850	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=293,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr3	172634039	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,10;MFRL=227,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:172634039_C_A:172634039:2,1,1,0
chr3	172634044	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,13;MFRL=227,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:172634039_C_A:172634039:2,1,1,0
chr3	172634047	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=227,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:172634039_C_A:172634039:2,1,1,0
chr3	172634054	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:172634039_C_A:172634039:2,2,1,0
chr3	174951631	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=239,215;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr3	174974177	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=179,100;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:13,4,1,2
chr3	175165201	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	175185060	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	175189406	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=47.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.934:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr3	175189417	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=122,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,4:1,11:0,1,9,6
chr3	175189447	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=152,179;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.870:21:0,7:2,12:1,1,11,8
chr3	175293752	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=223,264;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:0,2:1,1:1,1,3,0
chr3	175455116	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=153,278;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,2:4,0:10,4,1,1
chr3	176756048	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=198,138;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:11,0:9,8:10,11,0,8
chr3	176765253	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=104.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,33:0.971:33:0,12:0,21:0|1:176765253_G_A:176765253:0,0,22,11
chr3	176765269	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=110,227;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,2:0.069:41:16,2:23,0:0|1:176765253_G_A:176765253:21,18,1,1
chr3	178545952	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:9,4:6,3:10,5,3,4
chr3	178560693	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=204,111;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:2,14,0,2
chr3	178785549	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,121;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,19:0.714:26:2,7:5,12:1,6,4,15
chr3	178919397	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,15;MFRL=207,185;MMQ=58,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.664:7:0,0:1,1:0,2,0,5
chr3	178922274	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=231,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr3	178922430	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,0,4
chr3	178936082	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=184,111;MMQ=40,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.126:37:10,3:22,1:10,23,3,1
chr3	178936094	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=184,184;MMQ=60,21;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,13:0.367:36:9,0:14,13:11,12,1,12
chr3	178942431	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,122;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,3:6,3:9,0,6,0
chr3	178960607	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=175,212;MMQ=49,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr3	178960766	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,187;MMQ=40,50;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,1:9,1:5,18,0,2
chr3	178962491	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=222,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr3	178968660	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=1;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:12,2:6,1:7,11,0,3
chr3	178968888	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=112,100;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,0:7,8:5,10,0,8
chr3	178976591	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=206,140;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,4:4,0:6,0,3,1
chr3	178976777	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=181,145;MMQ=60,57;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:6,5:12,6:11,7,8,3
chr3	178976821	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=187,144;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,2:11,2:10,9,2,2
chr3	179051745	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=211,204;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,0:7,6:6,10,0,6
chr3	179085722	.	G	GTA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=176,337;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:1,0:5,1,1,1
chr3	179092989	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=162,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:11,6,1,1
chr3	179109735	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=160,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr3	179298584	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=247,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.461:9:4,4:1,0:3,2,2,2
chr3	179304255	.	GAAAAAAA	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=213,0;MMQ=50,57;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=19,12;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.408:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr3	179320386	.	CG	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=G;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr3	179320401	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,16;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:5,0:6,3,2,0
chr3	179419003	.	G	GTGTCTGTGTGTGCCTTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=217,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.401:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr3	179439357	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=193,74;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,0:12,4:11,9,1,3
chr3	179439466	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=193,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr3	179448066	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=75,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=11.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,4:1,2:2,0,1,5
chr3	179448383	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=242,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,5:0,8:0,1,8,5
chr3	179463076	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:0|1:179463076_A_G:179463076:1,0,1,4
chr3	179463081	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0|1:179463076_A_G:179463076:1,0,0,4
chr3	179469995	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,78;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr3	179472674	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=185,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,6:3,2:1,2,2,6
chr3	179474767	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=204,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:2,1,3,0
chr3	179481955	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=79,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:9,3:5,0:7,8,1,2
chr3	179481971	.	CTG	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=99,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:0,2:0,2,0,6
chr3	179501993	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=161,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:2,0:0,4,0,2
chr3	179527459	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,1:0,1:0,0,0,5
chr3	179592053	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr3	179592240	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,3:3,5:0,4,0,8
chr3	179593072	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=122,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:2,1,6,0
chr3	179593352	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr3	179597775	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,292665;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:10,3,2,0
chr3	179597979	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:1,7,0,4
chr3	180320897	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=198,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,4:6,1:6,3,4,1
chr3	180322080	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=150,89;MMQ=60,22;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.160:35:16,0:13,5:8,22,0,5
chr3	180322260	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,18;MFRL=156,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.278:15:4,0:4,0:4,7,4,0
chr3	180334623	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,160;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:8,3:9,0:12,6,1,2
chr3	180372448	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=15,26;MFRL=215,234;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.334:6:0,1:0,1:0|1:180372448_C_A:180372448:4,0,2,0
chr3	180372451	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=21,15;MFRL=215,234;MMQ=60,53;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.334:6:3,0:0,0:0|1:180372448_C_A:180372448:4,0,2,0
chr3	180372455	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=232,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.322:7:4,2:0,0:5,0,2,0
chr3	180372457	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=31,15;MFRL=231,241;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:0,0:5,0,3,0
chr3	180372461	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,17;MFRL=207,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:2,0:1,0:3,1,3,0
chr3	180396974	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=239,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:8,0,2,0
chr3	180397129	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,141;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:10,0:12,5:11,11,0,5
chr3	180630565	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=166,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.110:34:17,3:14,0:9,22,2,1
chr3	180679235	.	CTT	C,CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32,33;MFRL=155,145,100;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=7.95,3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.325,0.236:11:3,2,1:2,2,1:4,1,5,1
chr3	180687878	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=208,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,0:11,3:14,2,2,1
chr3	180693215	.	GTT	G,GT	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=129,127,142;MMQ=60,60,60;MPOS=17,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.07,10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,4,8:0.136,0.313:28:7,1,7:8,3,1:8,8,4,8
chr3	181431226	.	GA	G,GAA	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=34,33,34;MFRL=170,136,148;MMQ=60,60,60;MPOS=9,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.18,3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,4,3:0.140,0.137:26:10,2,1:8,2,2:11,8,5,2
chr3	182546017	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=51.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,4:0,13:0,0,6,11
chr3	182559753	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=222,76;MMQ=58,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr3	182575631	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,10:1,5:0,1,11,4
chr3	182576923	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,8:0,10:0,0,13,5
chr3	182590354	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,1,6
chr3	182598863	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=290,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,7:0,1:0,1,0,8
chr3	182681740	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=187,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:3,2:5,7:2,6,5,4
chr3	182681853	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,3:0,5:1,1,1,7
chr3	182698377	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	182735182	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	182735211	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr3	182804385	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=201,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr3	182810144	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=163,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,3:0,3:4,0,6,0
chr3	182810171	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:11,0,2,0
chr3	182817328	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr3	182858287	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=243,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,5:7,3:6,4,5,3
chr3	182858461	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=244,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.542:20:6,4:3,6:1,8,0,11
chr3	182870082	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,9,1
chr3	182880480	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=126,249;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,0:1,2:2,3,0,2
chr3	182913092	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:1,1:5,3:0,7,1,3
chr3	182933912	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=194,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:4,0:7,2:1,10,0,2
chr3	182946002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr3	182947413	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=206,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,2,1
chr3	183013198	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=138,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,3:13,0:11,14,3,0
chr3	183015011	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=156,990;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:5,2:2,0:1,7,1,1
chr3	183040924	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=207,252;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,2:6,1:11,1,3,0
chr3	183432983	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:11,1:6,2:9,8,3,0
chr3	183490383	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr3	183491612	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=143,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:1,10,0,2
chr3	183521761	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:4,0:3,2:7,0,2,0
chr3	183528164	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=286,212;MMQ=60,39;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr3	183528442	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=171,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:5,0:0,7,1,2
chr3	183535763	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=123,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,5:6,1,6,0
chr3	183558481	.	C	CT	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=32,21;MFRL=135,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.258:29:12,1:2,3:11,11,3,4
chr3	183558497	.	C	CT	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=21,20;MFRL=173,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.421:16:1,0:4,4:1,8,0,7
chr3	183558517	.	A	ATT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=142,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:6,2:1,12,0,2
chr3	183560292	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=169,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	183663833	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,0,5
chr3	183665062	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.568:19:3,5:5,5:6,2,6,5
chr3	183677501	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=173,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:8,1:13,4,1,1
chr3	183679532	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=249,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:2,2:0,1:0,2,0,4
chr3	183682897	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:6,5:6,2:12,0,5,2
chr3	183689448	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=29.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.307:43:18,12:12,0:12,18,13,0
chr3	183699421	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	183700211	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:9,3:7,3:9,7,4,2
chr3	183754253	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,151;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:9,5:8,0:9,9,5,0
chr3	183754768	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=183,344;MMQ=60,57;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:0,8,0,2
chr3	183756426	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=114,139;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:5,8:5,2:2,10,1,9
chr3	183756780	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,3:5,5:3,6,2,6
chr3	183756808	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:0,6,1,5
chr3	183773250	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,178;MMQ=46,50;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr3	183776469	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr3	183777210	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=101,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,0:3,3:5,3,3,0
chr3	183777895	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=205,189;MMQ=52,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,1:4,2:5,5,0,3
chr3	183777919	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=253,189;MMQ=52,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,3:2,2:3,3,2,3
chr3	183818416	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=199,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.541:18:5,5:3,3:2,6,2,8
chr3	183818511	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=98,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	183823863	.	G	GAAGA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGA;STR;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:4,3,3,3
chr3	183824013	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=158,228;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.333:12:6,1:1,0:2,6,4,0
chr3	183857809	.	CAAAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=97,334;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=16,11;RU=A;STR;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.290:5:1,0:0,1:2,2,1,0
chr3	183860907	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=167,89;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:16,2:11,1:15,12,3,0
chr3	183860989	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=194,267;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,1:9,1:1,16,0,2
chr3	183884550	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=217,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,3:3,4:4,6,2,5
chr3	183885529	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=191,205;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,0:2,0:0|1:183885529_T_G:183885529:5,1,0,2
chr3	183885533	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=191,205;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:183885529_T_G:183885529:5,1,0,2
chr3	183885937	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=214,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr3	183888514	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:13,0:15,7:13,15,0,7
chr3	183896641	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=218,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=65.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.809:24:2,10:2,10:2,2,14,6
chr3	183900680	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:10,3:2,3:3,9,2,4
chr3	183900729	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=179,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:3,5:1,4:0,4,0,9
chr3	183903937	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=318,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:1,1:4,2:5,0,3,0
chr3	183904226	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=209,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:6,1:13,3:0|1:183904226_C_T:183904226:9,10,2,2
chr3	183904232	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=368,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,17:0.693:24:0,7:5,9:0|1:183904226_C_T:183904226:0,7,11,6
chr3	183904520	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.367:9:1,3:3,0:2,4,1,2
chr3	183905103	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=129,138;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:7,1,2,0
chr3	183906515	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=246,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.811:19:1,6:2,10:0,3,10,6
chr3	183909143	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=247,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,0,3
chr3	183955231	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=159,98;MMQ=60,48;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:183955231_T_C:183955231:1,3,0,1
chr3	183955234	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=159,98;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:183955231_T_C:183955231:1,3,0,1
chr3	183955238	.	A	ATCTCTGT	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=149,98;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:183955231_T_C:183955231:0,2,0,1
chr3	183955240	.	G	GAGTCCTAGGAGATAGTAGAGAAGC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=149,98;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:183955231_T_C:183955231:0,2,0,1
chr3	183961337	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=120,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.229:33:13,7:12,0:16,10,7,0
chr3	183994536	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=183,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,1,3
chr3	183995341	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=207,334;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr3	183995854	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,271;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,3:3,4:6,6,2,5
chr3	183996213	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=90,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:1,2,2,1
chr3	184003194	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:6,0,4,0
chr3	184005825	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=240,151;MMQ=60,40;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:184005825_G_A:184005825:0,3,0,1
chr3	184005827	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=240,151;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:184005825_G_A:184005825:0,3,0,1
chr3	184005836	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=228,151;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:184005825_G_A:184005825:0,2,0,1
chr3	184020100	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=153,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=41.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,6:1,6:3,0,11,1
chr3	184025069	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=188,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr3	184025732	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=160,154;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.146:18:13,2:3,0:8,8,2,0
chr3	184038969	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=187,263;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:7,2:4,0:10,3,2,0
chr3	184045799	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=324,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr3	184049442	.	G	GAGATTTGGACCGCTTTGAGGCCTAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,90;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.305:4:3,0:0,1:1,2,0,1
chr3	184064916	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=162,315;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr3	184070675	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=181,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:4,3,2,5
chr3	184075218	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:9,2:3,0:10,2,1,1
chr3	184076037	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=130,67;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.137:26:13,3:10,0:12,11,1,2
chr3	184090242	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=106,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:19,1:8,2:26,1,3,0
chr3	184090266	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=139,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=47.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:8,14:4,4:10,2,13,5
chr3	184094183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr3	184098647	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	184100574	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=197,87;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.267:17:3,4:7,0:7,6,1,3
chr3	184100611	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=201,87;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:8,3:11,0:9,12,0,3
chr3	184100961	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=195,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr3	184102579	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr3	184105889	.	GA	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=296,193;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,0:1,8:0,3,0,8
chr3	184106757	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,0:3,2:0|1:184106757_GT_G:184106757:3,6,1,1
chr3	184106763	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,18;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:6,0:3,1:0|1:184106757_GT_G:184106757:3,6,1,1
chr3	184289152	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=169,154;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:3,8:4,2:3,4,5,5
chr3	184297166	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=183,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:7,5:1,0:7,1,5,0
chr3	184429133	.	A	ATCC	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=221,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TCC;STR;TLOD=50.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.875:13:0,5:1,4:0,1,4,8
chr3	184557636	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=224,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr3	184587434	.	AAC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=199,97;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.302:8:3,2:3,0:0,6,1,1
chr3	184616504	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr3	184642587	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=104,219;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.686:7:2,3:0,2:1,1,5,0
chr3	184654166	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr3	184658058	.	T	TTA,TTATA,TTATATA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30,30,29;MFRL=197,112,145,178;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,24,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=9,10,11,12;RU=TA;STR;TLOD=7.36,16.83,9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,3,6,4:0.212,0.410,0.286:14:1,2,5,2:0,1,0,0:1,0,1,12
chr3	184675359	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=51.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,10:0,0,4,12
chr3	184682214	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr3	184700418	.	C	CCCCGCCTTTTTTTTTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,211;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:12,2:8,0:8,12,0,2
chr3	184717703	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr3	185155430	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,21;MFRL=147,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr3	185169030	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr3	185212593	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,1:7,1:0,9,0,2
chr3	185226492	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,4:3,5:4,0,9,0
chr3	185232169	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=172,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,2,1
chr3	185234895	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.318:17:6,3:5,2:4,8,0,5
chr3	185252918	.	C	CTTTTCTTTCTTTCT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=102,108;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr3	185252919	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.678:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	185308069	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,1,3
chr3	185330304	.	TTGA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=346,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr3	185337185	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=155,140;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:8,3,2,0
chr3	185339575	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,6:2,0:3,1,5,1
chr3	185341970	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=347,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.698:8:1,3:1,1:0,2,0,6
chr3	185347459	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=228,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr3	185766711	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=97,276;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,1,1
chr3	185782260	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=115,127;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:17,0:9,7:7,19,0,7
chr3	185879296	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	185882643	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,2:0,4:2,0,5,1
chr3	185906246	.	CGTGT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=GT;STR;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.849:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr3	185960192	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	185960414	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr3	185982972	.	TC	CC,CT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33,14;MFRL=203,181,171;MMQ=60,60,60;MPOS=14,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.56,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,1:0.445,0.222:6:1,2,0:1,1,0:1,1,4,0
chr3	185993415	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=201,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,2:9,1:13,8,3,0
chr3	186006618	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,256;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:9,4,1,4
chr3	186015283	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=70,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.657:12:2,7:1,1:2,2,5,3
chr3	186015303	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,5:0,1:2,1,3,3
chr3	186015315	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=227,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:0,2,0,5
chr3	186262054	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=183,117;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.386:19:2,4:8,3:5,7,3,4
chr3	186276393	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=13455301,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,3:1,6:0,2,1,8
chr3	186293820	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,0,5
chr3	186295417	.	AT	A,ATT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,29,17;MFRL=167,183,190;MMQ=60,60,60;MPOS=16,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=9.98,10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,6,6:0.258,0.302:21:1,2,1:6,4,1:6,3,9,3
chr3	186295674	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=188,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,0:6,3:0,10,0,3
chr3	186302391	.	A	AGTGTGTGTGT,AGTGTGTGTGTGT,ATTGTGTGTGTGT	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,20,24,26;MFRL=0,125,73,131;MMQ=60,40,60,60;MPOS=10,24,15;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.88,3.01,16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,3,2,6:0.442,0.303,0.212:11:0,0,1,1:0,2,1,3:0,0,1,10
chr3	186302412	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=155,126;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,0:3,3:3,11,0,3
chr3	186337827	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=177,252;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr3	186338540	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=188,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,1:8,2:9,10,1,2
chr3	186384015	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,3:8,1:3,11,1,3
chr3	186386664	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr3	186395231	.	GCATCCCCATGGACACCACCCCCATGGACACCATCCTCATGGACACCACCCCCATGGACAC	G	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,12;MFRL=157,65;MMQ=60,31;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,7:0.156:43:4,0:6,2:11,25,1,6
chr3	186435583	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=140,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,1:0,1:0,3,0,2
chr3	186438037	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=73,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:4,0:4,3:3,5,1,2
chr3	186442833	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,1:2,5:2,0,5,1
chr3	186456969	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=108,86;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,0:6,2:8,5,1,1
chr3	186459227	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,3,0
chr3	186501502	.	C	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=68.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.649:38:3,13:10,11:3,10,5,20
chr3	186502665	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:12,1,2,1
chr3	186504148	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=197,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:6,6,2,0
chr3	186505706	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:10,3:7,2:2,17,1,4
chr3	186507922	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=168,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,13:0.412:32:7,8:12,5:0|1:186507922_C_T:186507922:11,8,5,8
chr3	186507928	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=26.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,9:0.345:27:8,4:10,5:1|0:186507922_C_T:186507922:9,9,7,2
chr3	186518806	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=208,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,0:6,0,2,0
chr3	186571123	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,2:1,4:0,5,0,6
chr3	186938897	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=140,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,2:16,0:12,14,2,0
chr3	186938956	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=189,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,4:8,2:1,13,1,5
chr3	186953932	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=185,257;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:6,5,1,1
chr3	186961478	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	186965268	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=211,236;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr3	186967942	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,26;MFRL=228,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,1,1
chr3	186967952	.	C	CTCAGCCTCCCAAGT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=162,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.325:4:1,1:2,0:3,0,0,1
chr3	187009351	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,269;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,2:12,0:15,10,1,1
chr3	187387107	.	TGG	T	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:1,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,2,0,1
chr3	187387112	.	AGGAC	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=160,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,2,0,1
chr3	187387119	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=172,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,1,0,1
chr3	187387122	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=172,96;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,1,0,1
chr3	187387126	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=172,96;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:187387107_TGG_T:187387107:0,1,0,1
chr3	187387896	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=239,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,4:0,4:2,2,4,4
chr3	187416253	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,21;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,0:5,4:8,1,3,1
chr3	187419661	.	G	GCCTGCC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=194,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.535:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr3	187419728	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:4,4,3,2
chr3	187444656	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=155,234;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:12,1:13,1:10,15,1,1
chr3	187446191	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=159,65;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,2:10,1:12,7,1,2
chr3	187446211	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=141,128;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:3,3:5,11:4,4,8,7
chr3	188123819	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr3	188202550	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=87.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,21:0.957:21:0,14:0,7:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,1,20
chr3	188202582	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=86.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0|1:188202550_A_T:188202550:0,0,0,20
chr3	188425999	.	G	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=243,259;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,7:1,0:5,0,7,0
chr3	188426021	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=253,259;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:12,0,2,0
chr3	188426256	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=209,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr3	188590358	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,5:0,7:0,0,12,0
chr3	188592160	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,2:10,0:13,7,2,0
chr3	188933213	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=172,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:1,4,1,6
chr3	189028117	.	AT	A,ATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30,28;MFRL=141,148,155;MMQ=60,60,60;MPOS=2,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=T;STR;TLOD=8.27,14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,5,8:0.298,0.447:17:1,3,4:3,2,4:3,1,13,0
chr3	189038648	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:0,3,0,6
chr3	189349247	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:3,6:2,4:3,2,8,2
chr3	189507518	.	C	CAGAG	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=210,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,3:7,2:9,0,4,1
chr3	189547652	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=154,230;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,3:4,0:11,0,3,0
chr3	189547697	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:19,1:8,2:14,13,2,1
chr3	189582249	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr3	189584420	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,104;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.267:27:10,6:10,0:16,4,7,0
chr3	189587091	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:13,7:8,4:14,7,8,3
chr3	189587274	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=216,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr3	189590824	.	GG	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=108,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.629:16:4,5:2,5:2,4,4,6
chr3	189604149	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=141,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,4:2,4:4,0,7,1
chr3	189604160	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,5:1,7:3,0,11,1
chr3	189607152	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=148,210;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.263:21:7,0:7,5:12,4,2,3
chr3	189688569	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=133,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=50.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.731:24:3,10:3,8:1,5,12,6
chr3	189690816	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=129,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.603:6:0,1:1,1:0,2,1,3
chr3	189690861	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr3	189692565	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=219,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr3	189702395	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:1,1,3,7
chr3	189705337	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=122,61;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.132:21:11,0:6,2:9,10,0,2
chr3	189712089	.	GG	AA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=64.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:2,7:1,9:0,3,4,12
chr3	189712094	.	A	AAAAC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=168,149;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AAAC;STR;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.300:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chr3	189837993	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:3,5:0,7:3,0,11,2
chr3	189838018	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=171,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.427:21:4,5:8,4:7,5,5,4
chr3	190030726	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,141;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.218:30:15,0:9,6:11,13,0,6
chr3	190106071	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:8,1:7,3:0|1:190106071_AG_A:190106071:12,6,2,2
chr3	190106074	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=138,199;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:11,1:7,2:0|1:190106071_AG_A:190106071:12,6,2,2
chr3	190106242	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:6,0:6,5:4,8,2,3
chr3	190106332	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr3	190167647	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=139,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,6:3,2:2,4,3,5
chr3	190282197	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:0,2,1,5
chr3	190322271	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0|1:190322271_T_C:190322271:0,2,0,7
chr3	190322277	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=149,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0|1:190322271_T_C:190322271:0,2,0,7
chr3	190341241	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=73,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:1,1,2,6
chr3	190341292	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr3	190345043	.	TTTTTG	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=132,115;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTTG;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:2,2:0,0:2,0,2,0
chr3	190345098	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=103,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=34.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.837:18:2,7:1,7:2,1,6,9
chr3	190347391	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr3	190362220	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr3	190363588	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:10,0:14,6:0|1:190363588_A_C:190363588:13,12,0,6
chr3	190363590	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=136,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,6:0.212:31:11,0:12,6:0|1:190363588_A_C:190363588:13,12,0,6
chr3	190363594	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=122,174;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.290:29:8,4:13,4:7,14,4,4
chr3	190573263	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=190,62;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,0:6,2:0|1:190573263_G_A:190573263:7,5,1,1
chr3	190573267	.	C	CATTTTGCTCCTAGACATCATA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=190,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:190573263_G_A:190573263:7,5,1,1
chr3	190573594	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=132,72;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:9,10,1,1
chr3	190967718	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr3	190967778	.	CA	TG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=146,57;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:4,2,2,0
chr3	190967779	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,3:1,1:1,2,4,0
chr3	190986110	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,6:0,7:1,0,10,4
chr3	190995847	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:4,11:2,8:3,3,13,6
chr3	190999790	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=251,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr3	190999872	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=206,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:4,8:5,9:5,4,11,6
chr3	190999990	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:0,5:5,7:1,4,6,6
chr3	191074796	.	TAA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=131,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,2:5,0:8,0,2,0
chr3	191075012	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,3:0,0,1,6
chr3	191093384	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,5:3,5:3,5,5,5
chr3	191093434	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=217,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:3,4:3,8:0,6,0,12
chr3	191093475	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:1,2:11,1:0,12,0,3
chr3	191097908	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=171,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr3	191097928	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.488:16:6,5:1,2:7,1,7,1
chr3	191097966	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=183,132;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,25:0.785:31:5,12:1,8:1,5,16,9
chr3	191098121	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,3:3,5:1,4,1,7
chr3	191098731	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=232,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,5:3,9:3,3,3,11
chr3	191100448	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=203,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:1,0,10,0
chr3	191107192	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,2:3,2:8,0,4,0
chr3	191109465	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,150;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,18:0.463:39:7,17:14,0:18,3,18,0
chr3	192053274	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=143,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:3,1:6,3:2,7,2,3
chr3	192444899	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=140,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.309:20:7,2:7,3:10,4,3,3
chr3	192635348	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=144,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr3	193016895	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=65.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,10:0,9:0,0,15,4
chr3	193023255	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:2,2,5,0
chr3	193023361	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=150,74;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:9,3:5,0:8,6,2,1
chr3	193044923	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=40.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr3	193062906	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,8:0,3:0,0,3,8
chr3	193068800	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	193080414	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=153,181;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,1:8,2:5,6,2,1
chr3	193081830	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr3	193081864	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=163,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,1:2,7:3,0,7,1
chr3	193081866	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=188,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:1,0:7,2:7,1,2,0
chr3	193151703	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=151,391;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:193151703_T_TG:193151703:5,9,2,0
chr3	193151704	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,391;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:0|1:193151703_T_TG:193151703:5,9,2,0
chr3	193153562	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,2:0,11:0,0,2,11
chr3	193153611	.	AG	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:193153611_AG_A:193153611:0,5,0,2
chr3	193153616	.	AGG	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=155,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:193153611_AG_A:193153611:0,5,0,2
chr3	193153625	.	A	AAAAAAAAGAAAACAAAAAAC	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=28,28;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:193153625_A_AAAAAAAAGAAAACAAAAAAC:193153625:0,4,0,1
chr3	193153629	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,1:0|1:193153625_A_AAAAAAAAGAAAACAAAAAAC:193153625:0,4,0,1
chr3	193180510	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,3:4,2:4,2,5,0
chr3	193180661	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr3	193180732	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr3	193185128	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=195,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:11,5:7,3:10,8,6,2
chr3	193209018	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=193,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:3,2:0,2:3,0,5,0
chr3	193209281	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=221,149;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:193209281_T_G:193209281:0,1,0,1
chr3	193209284	.	T	TTGGTTGTTTGCTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=221,149;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0|1:193209281_T_G:193209281:0,1,0,1
chr3	193210596	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=234,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr3	193220219	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=170,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr3	193272442	.	CGTGTGTGTGT	C,CGTGT,CGTGTGTGT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32,34,8;MFRL=0,144,154,0;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,25,6;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,12,14,16;RU=GT;STR;TLOD=3.04,6.18,6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,1,3,3:0.185,0.358,0.377:7:0,0,2,1:0,1,1,0:0,0,5,2
chr3	193272703	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=212,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr3	193332420	.	C	CTGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=TG;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,2:4,1:7,0,3,0
chr3	193365974	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:0,10,1,1
chr3	193386239	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=183,187;MMQ=60,60;MPOS=0;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:12,2:7,1:9,10,2,1
chr3	193854148	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=25,25,25,25;MFRL=155,199,162,168;MMQ=60,60,60,60;MPOS=9,14,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=A;STR;TLOD=13.32,10.83,9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,9,7,8:0.204,0.244,0.321:29:2,4,2,3:1,4,2,2:3,2,16,8
chr3	193854245	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,5:0.108:53:26,5:22,0:18,30,0,5
chr3	193854283	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=179,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.162:35:18,5:10,0:7,23,0,5
chr3	193856061	.	C	CCCACTTTCACCTGAACGGTGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=284,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr3	194061906	.	TG	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=156,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,3:2,7:2,2,4,6
chr3	194079943	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr3	194084001	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=174,79;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:0,0:5,2:5,0,2,0
chr3	194084153	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,125;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:5,7,1,1
chr3	194165532	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.096:39:19,0:17,3:17,19,3,0
chr3	194168500	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=153,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:8,0,5,0
chr3	194176712	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:5,1:9,2:3,11,1,2
chr3	194180743	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:1,8,0,2
chr3	194324982	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:9,4:11,0:12,8,2,2
chr3	194325006	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.291:29:9,4:11,4:9,12,4,4
chr3	194325010	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=183,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.205:27:7,5:15,0:11,11,2,3
chr3	194346544	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,1,0
chr3	194346553	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:194346544_T_A:194346544:0,0,1,0
chr3	194346803	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=165,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:1,3:1,8:0,2,0,11
chr3	194349027	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=206,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr3	194353772	.	C	CCCGCCCGACAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCGCCCGACAG;STR;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr3	194354032	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	194362721	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=158,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr3	194371801	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=172,0;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,1:7,0:0|1:194371801_G_T:194371801:7,13,0,2
chr3	194371810	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=170,0;MMQ=60,54;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:0|1:194371801_G_T:194371801:9,13,0,2
chr3	194373832	.	TG	CA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,11:0,14:0,0,12,13
chr3	194379596	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr3	194379646	.	T	TC	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,7:1,5:1,0,6,6
chr3	194379905	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=32.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.929:11:0,5:0,6:0,0,0,11
chr3	194379959	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=41.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr3	194380687	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr3	194386881	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,5,2
chr3	194387300	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,11:0,0,1,20
chr3	194390713	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,6:0,11:0,0,10,7
chr3	194390869	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=60.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,12:0,9:0,0,6,15
chr3	194408704	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr3	194409257	.	T	TA,TAAA	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,25,28;MFRL=177,179,153;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,18;RU=A;STR;TLOD=12.79,4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,8,3:0.451,0.191:18:3,2,0:4,5,2:4,3,5,6
chr3	194409729	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=171,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,1:6,1:1,7,0,2
chr3	194409809	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=252,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:194409809_G_T:194409809:0,2,0,1
chr3	194409813	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,30;MFRL=278,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:194409809_G_T:194409809:0,1,0,1
chr3	194409815	.	GACCC	G,GGTACCC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,30,32;MFRL=0,278,188;MMQ=60,60,60;MPOS=4,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,1,1:0,0,0:0,0,0,2
chr3	194409816	.	A	ATTTTTATTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:194409809_G_T:194409809:0,0,0,1
chr3	194790641	.	C	CATAGTTACAGGAGTGCCTATTCCA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=94,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:5,2:5,0:2,8,1,1
chr3	194877355	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:2,6,1,2
chr3	194991220	.	AA	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr3	194999996	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,11,0
chr3	195022627	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=219,255;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,0,2
chr3	195022917	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=150,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:6,3:9,0:6,10,0,3
chr3	195053916	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=186,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr3	195065978	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.205:32:16,2:10,4:15,11,3,3
chr3	195102590	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,2:6,1:21,0,3,0
chr3	195102787	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.314:14:6,2:3,2:2,8,0,4
chr3	195245771	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=184,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:1,2:8,2:7,2,4,0
chr3	195245805	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=156,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:9,4:8,6:10,7,6,4
chr3	195295704	.	G	GC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:1,3:5,0,2,1
chr3	195295708	.	G	GGGT,GGGGT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,32,35;MFRL=242,161,122;MMQ=60,60,60;MPOS=4,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.05,7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,4:0.371,0.460:8:1,0,3:0,3,1:1,0,6,1
chr3	195300676	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.942:14:0,7:0,7:0,0,12,2
chr3	195300740	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=158,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,1:9,1:0,15,1,1
chr3	195447795	.	CCCT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:0|1:195447795_CCCT_C:195447795:4,2,3,0
chr3	195447805	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,142;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,2:0.253:10:5,1:2,1:1|0:195447795_CCCT_C:195447795:6,2,2,0
chr3	195452951	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,150;MMQ=51,59;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:2,5:3,5,2,6
chr3	195453017	.	GC	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=158,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:6,0:11,3:8,10,1,2
chr3	195456478	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=136,106;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:4,2,2,0
chr3	195456638	.	AGT	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=216,53;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:195456638_AGT_A:195456638:1,5,1,1
chr3	195456642	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=31,20;MFRL=216,53;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:195456638_AGT_A:195456638:1,5,1,1
chr3	195456644	.	G	GATCA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=216,53;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:195456638_AGT_A:195456638:1,5,1,1
chr3	195456708	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=175,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr3	195475989	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr3	195477713	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=153,173;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.819:9:0,5:0,2:0|1:195477713_G_A:195477713:1,0,8,0
chr3	195477715	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=153,173;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.822:9:0,5:1,3:0|1:195477713_G_A:195477713:1,0,8,0
chr3	195478012	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.934:12:0,9:0,3:0,0,10,2
chr3	195479226	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=177,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:2,0:2,3:4,1,4,0
chr3	195479256	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.871:13:0,5:1,6:1,0,5,7
chr3	195484244	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,6,7
chr3	195485949	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,24;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:195485949_C_T:195485949:4,0,1,0
chr3	195485952	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,25;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:195485949_C_T:195485949:4,0,1,0
chr3	195485953	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=23,12;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:195485953_T_C:195485953:4,0,1,0
chr3	195485954	.	A	AACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,15;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:195485953_T_C:195485953:4,0,1,0
chr3	195487737	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=122,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.290:19:5,2:7,3:6,8,3,2
chr3	195489669	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr3	195490284	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr3	195490838	.	ATCC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,10;MFRL=199,170;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:2,1,1,0
chr3	195492027	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr3	195501258	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=252,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.662:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr3	195505072	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=391,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0|1:195505072_C_T:195505072:2,0,6,0
chr3	195505091	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:195505072_C_T:195505072:0,0,7,0
chr3	195505251	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=110,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,2:14,0:0|1:195505251_G_A:195505251:17,12,1,1
chr3	195505254	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:11,2:14,0:0|1:195505251_G_A:195505251:16,12,1,1
chr3	195505417	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=297,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:2,2,1,4
chr3	195506037	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=71,101;MMQ=48,52;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,6:3,3:2,1,5,5
chr3	195506415	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,16;MFRL=123,56;MMQ=33,45;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:3,1:4,0:0|1:195506415_A_T:195506415:6,2,2,1
chr3	195506420	.	T	TGGTAGC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=123,80;MMQ=33,38;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:2,0:0|1:195506415_A_T:195506415:6,2,2,0
chr3	195507166	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=164,96;MMQ=29,30;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.750:26:1,13:5,6:4,2,11,9
chr3	195507226	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=17,31;MFRL=73,115;MMQ=46,40;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.428:15:2,6:1,2:4,3,7,1
chr3	195508336	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=105,80;MMQ=52,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.187:35:14,0:14,6:15,14,3,3
chr3	195508402	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=108,0;MMQ=60,29;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:13,0:11,3:16,8,1,2
chr3	195511142	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,118;MMQ=60,40;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.296:32:12,5:9,4:16,7,5,4
chr3	195512245	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=129,179;MMQ=50,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.888:16:0,7:1,6:0,1,5,10
chr3	195512933	.	AGGTGGTGTCACCTGTGGATGCTGAGGAAGCGTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTCACCTGTGGATGCTGAGGAAGGGCTGGTGACAGGAAGAGGGATGGCCTGACCTGTGGATGCCGAGGAAACGTCGGTGACAGGAAGACG	A	.	.	DP=147;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=123,98;MMQ=59,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:133,14:0.024:147:25,5:12,5:76,57,9,5
chr3	195513102	.	A	G	.	.	DP=77;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=90,130;MMQ=60,49;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,28:0.351:77:30,15:19,10:23,26,12,16
chr3	195513146	.	C	CTGAGAGAGACGGTTCTGCGCA	.	.	DP=61;ECNT=6;MBQ=33,36;MFRL=121,1484;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.112:50:28,0:15,4:0|1:195513146_C_CTGAGAGAGACGGTTCTGCGCA:195513146:22,23,0,5
chr3	195513153	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=123,1484;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:48,5:0.109:53:30,0:16,5:0|1:195513146_C_CTGAGAGAGACGGTTCTGCGCA:195513146:24,24,0,5
chr3	195513157	.	T	G	.	.	DP=52;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=121,1484;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,5:0.111:52:22,0:14,4:0|1:195513146_C_CTGAGAGAGACGGTTCTGCGCA:195513146:23,24,0,5
chr3	195513173	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=32,27;MFRL=124,81;MMQ=60,57;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.178:37:18,2:10,4:0|1:195513173_G_A:195513173:17,14,2,4
chr3	195513180	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=124,91;MMQ=60,50;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.116:32:17,1:8,1:0|1:195513173_G_A:195513173:16,13,0,3
chr3	195513207	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=128,86;MMQ=60,48;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.221:28:14,1:8,3:17,5,3,3
chr3	195513364	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=119,152;MMQ=39,29;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,10:0.214:48:10,7:23,0:0|1:195513364_C_T:195513364:12,26,7,3
chr3	195513383	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=117,157;MMQ=43,33;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,9:0.167:56:20,5:20,2:0|1:195513364_C_T:195513364:10,37,6,3
chr3	195513398	.	CGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCGGTGGATGCTGAGGAAGTGCT	C	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=26,24;MFRL=104,125;MMQ=46,40;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.166:43:19,1:2,2:15,24,1,3
chr3	195515190	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=194,92;MMQ=37,39;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:2,3:7,2:5,4,4,1
chr3	195515437	.	TGACC	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=161,247;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:13,2:2,0:0|1:195515437_TGACC_T:195515437:12,5,2,0
chr3	195515443	.	GTGGATA	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=162,247;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,1:2,0:0|1:195515437_TGACC_T:195515437:14,7,2,0
chr3	195515454	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=150,247;MMQ=60,60;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:16,2:6,0:0|1:195515437_TGACC_T:195515437:15,7,2,0
chr3	195515566	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=136,141;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:17,0:9,2:0|1:195515566_G_A:195515566:15,12,1,1
chr3	195515568	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=154,121;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.500:28:8,9:6,5:7,7,9,5
chr3	195515572	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=132,141;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:17,0:8,2:0|1:195515566_G_A:195515566:14,13,1,1
chr3	195515582	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=132,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:17,0:10,2:0|1:195515566_G_A:195515566:15,13,0,2
chr3	195515594	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=99.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,31:0.889:34:2,18:1,13:2,1,13,18
chr3	195515617	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=106,124;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=107.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,33:0.945:34:0,21:1,11:0,1,11,22
chr3	195517124	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=145,181;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,2:7,1:6,12,1,2
chr3	195518112	.	T	TGTCTCCTGCGTAACA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,3:0,1,6,5
chr3	195538501	.	TTC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=166,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:3,2:4,2,2,0
chr3	195593904	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=170,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:8,1,2,0
chr3	195596501	.	T	TAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=193,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=AG;STR;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.609:11:2,4:2,3:0,4,1,6
chr3	195596907	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,1:1,3:5,0,4,0
chr3	195599085	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=186,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:1,6:3,2:4,1,7,1
chr3	195778996	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=153,83;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:4,3:10,0:7,7,2,1
chr3	195782176	.	CA	TG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:6,3:9,4:0|1:195782176_CA_TG:195782176:7,8,4,3
chr3	195782184	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.364:20:4,3:8,2:0|1:195782176_CA_TG:195782176:6,7,4,3
chr3	195785328	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:6,2:6,1:8,5,2,1
chr3	195789376	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=192,187;MMQ=60,48;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:1,0:5,3:6,0,3,0
chr3	195789414	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,3:8,4:5,5,6,1
chr3	195789428	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:0,8:1,10:1,0,11,8
chr3	195789708	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,6:2,2:3,1,5,3
chr3	195792288	.	CGGG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,101;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=G;STR;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:195792288_CGGG_C:195792288:0,0,6,0
chr3	195792301	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=12,26;MFRL=70,101;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.839:7:0,3:0,3:0|1:195792288_CGGG_C:195792288:0,1,6,0
chr3	195792485	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=264,164;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:1,3:0,5,0,3
chr3	195798258	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=255,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:4,4:0,4:4,0,6,2
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chr3	195804021	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=138,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:6,4:2,1:3,5,1,4
chr3	195925103	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr3	195925216	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,3:7,0:4,9,0,3
chr3	195936446	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=191,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,4:2,0:1,4,0,4
chr3	195937410	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr3	195937659	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=149,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:1,2,0,5
chr3	195937678	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=253,75;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr3	195943475	.	G	GGCCC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,37;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:1,1:0,0:0|1:195943475_G_GGCCC:195943475:1,0,1,0
chr3	195943482	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,35;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,1:1,0:0|1:195943475_G_GGCCC:195943475:2,1,1,0
chr3	195943486	.	CGG	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:1,0:0|1:195943475_G_GGCCC:195943475:1,2,1,0
chr3	195953775	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,4:5,4:5,2,7,1
chr3	195954078	.	C	CCGTCACTTT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=135,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,0:0,4:0,1,0,4
chr3	195956726	.	AAGAG	A,AAG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31,32;MFRL=181,181,207;MMQ=60,60,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=AG;STR;TLOD=5.48,5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.272,0.365:6:1,1,1:1,1,1:2,0,4,0
chr3	195959215	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,76;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:8,4,2,0
chr3	195959416	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=202,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr3	195959859	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=168,3841485;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr3	195959924	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=164,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:0,2:3,2:2,2,2,2
chr3	195974170	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=200,239;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr3	195974181	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=200,239;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,2:6,0:8,0,2,0
chr3	195984575	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.685:14:1,9:3,0:4,0,10,0
chr3	196044894	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=169,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,4:4,3:8,3,3,4
chr3	196044943	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=163,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:5,6,0,2
chr3	196051403	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=219,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:0,5:2,6:0,2,3,8
chr3	196054488	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=192,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,4:3,3:2,2,2,5
chr3	196088809	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.471:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr3	196096451	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr3	196118621	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=115,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,1,1
chr3	196199070	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=121,94;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:8,2:13,0:12,9,2,0
chr3	196210590	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=208,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:2,0,2,1
chr3	196210808	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,212;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:0,3,0,7
chr3	196215451	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=110,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=19.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:5,0,6,2
chr3	196215660	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:0,2,1,3
chr3	196281379	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,130;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.149:38:18,0:15,5:19,14,0,5
chr3	196434364	.	AGTCTG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=127,306;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,2,0
chr3	196532154	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:8,3:1,0:7,2,3,0
chr3	196554020	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:5,1,4,4
chr3	196554266	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,3:1,0:1,1,0,3
chr3	196612193	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,0:5,4:8,9,2,2
chr3	196613245	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=170,120;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:4,5:10,0:0|1:196613245_G_T:196613245:8,6,5,0
chr3	196613249	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=175,120;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:4,5:11,0:0|1:196613245_G_T:196613245:9,6,5,0
chr3	196627335	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=213,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr3	196627356	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=213,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,2:0|1:196627356_C_T:196627356:0,6,0,4
chr3	196627361	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=213,171;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0|1:196627356_C_T:196627356:0,6,0,4
chr3	196656501	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=144,105;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:8,0:12,3:15,6,1,2
chr3	196657670	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=209,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:5,4:6,8:4,7,6,6
chr3	196666059	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=158,202;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:5,2,2,0
chr3	196674259	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:7,0:7,7,1,1
chr3	196675384	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=171,30;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:12,0:3,2:0|1:196675384_C_T:196675384:8,7,1,1
chr3	196675387	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=176,30;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:3,2:0|1:196675384_C_T:196675384:8,6,1,1
chr3	196678838	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=123,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,1:11,2:9,13,1,2
chr3	196733371	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=221,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr3	196742395	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=156,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,6:3,2:3,6,4,4
chr3	196749798	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=208,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:0,5:1,6:1,0,8,4
chr3	196750016	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr3	196778438	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=127,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,1:4,1:4,5,0,2
chr3	196803647	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,235;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr3	196846437	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,3:6,7:2,9,1,9
chr3	196869518	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=115,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:10,3,1,1
chr3	196869688	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr3	196876600	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=150,104;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.629:25:5,8:4,8:5,4,7,9
chr3	197023445	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=176,210;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr3	197239266	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=198,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,2:1,3:1,0,0,5
chr3	197273186	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,69;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,3:9,0:10,5,2,1
chr3	197401268	.	AG	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=180,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:8,1,2,1
chr3	197403844	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:7,1:4,1:7,5,1,1
chr3	197410287	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=143,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:19,0:17,3:16,20,0,3
chr3	197421203	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:7,1,1,1
chr3	197427557	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=168,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:9,2:13,0:10,12,0,2
chr3	197432000	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,2:10,1:9,11,1,2
chr3	197432029	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,2:11,1:6,11,1,2
chr3	197483279	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=160,103;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=92.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,30:0.940:31:0,16:1,13:1,0,18,12
chr3	197496984	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=53.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr3	197544200	.	C	CGTGTGTGTGTGT,CGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,29,29;MFRL=0,83,153;MMQ=60,60,60;MPOS=1,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=43.70,5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,16,4:0.725,0.214:21:0,11,1:1,4,3:1,0,11,9
chr3	197544201	.	A	ATTTTGTGTGTGTGTGCG	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=8,26;MFRL=0,90;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=102.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.942:30:0,12:0,6:1,0,18,11
chr3	197544231	.	G	GTATATATATATATATATA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,36;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,18;RU=TA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr3	197547332	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:0,6,2,5
chr3	197557635	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:6,3:2,5:2,6,6,2
chr3	197557731	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:12,2:0|1:197557731_T_A:197557731:8,14,1,1
chr3	197557737	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=167,61;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:11,2:0|1:197557731_T_A:197557731:8,14,1,1
chr3	197557739	.	G	GCTCC	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=177,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:8,0:11,2:0|1:197557731_T_A:197557731:8,13,1,1
chr3	197566084	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr3	197574248	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:9,6:7,8:11,5,13,2
chr3	197574936	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=140,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:2,2:1,7,0,4
chr3	197574960	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=196,147;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.489:8:3,2:1,1:0,4,0,4
chr3	197581147	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:2,0,3,0
chr3	197585598	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=172,234;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,1:2,3:8,0,4,0
chr3	197592449	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=155,232;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=43.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:4,0:4,13:0,8,0,13
chr3	197597194	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=218,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,1,1
chr3	197616627	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=173,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:6,1:0,3:0,6,2,2
chr3	197619577	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=120,119;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:8,0:12,12:0|1:197619577_T_A:197619577:10,10,0,12
chr3	197619581	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=118,119;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,12:0.361:34:9,0:13,12:0|1:197619577_T_A:197619577:11,11,0,12
chr3	197665561	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=179,92;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:11,0:8,3:9,10,1,2
chr3	197701913	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=138,300;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:11,10,0,2
chr3	197717643	.	A	ATATT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=170,277;MMQ=60,42;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr3	197762623	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr3	197765432	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,223;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:10,3:13,6,1,2
chr3	197880130	.	GGCAGCAGCA	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=149,141;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=GCA;STR;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,3:6,4:8,2,0,8
chr3	197894800	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=179,147;MMQ=51,28;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:15,2:5,2:8,12,4,0
chr4	53360	.	C	G	.	.	DP=63;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=167,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,6:0.112:60:29,1:24,5:29,25,3,3
chr4	53364	.	G	A	.	.	DP=64;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.082:58:24,3:29,1:27,27,3,1
chr4	53428	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=126.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,41:0.977:41:0,22:0,18:0,0,13,28
chr4	53446	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,1:12,2:6,24,0,3
chr4	53498	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=61.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0,0,1,16
chr4	59299	.	C	G	.	.	DP=60;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=162,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,5:0.100:57:31,3:21,2:42,10,3,2
chr4	59469	.	A	G	.	.	DP=73;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,132;MMQ=60,52;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,8:0.121:72:28,3:36,5:23,41,2,6
chr4	60087	.	GC	G	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,2:0.060:47:21,1:24,1:13,32,0,2
chr4	85526	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=168,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	85562	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=158,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,4,0
chr4	86101	.	G	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,47;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=54.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,4,11
chr4	86798	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=161,128;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:3,2:5,5:5,4,4,3
chr4	87277	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,5:0,11:0,0,10,6
chr4	87313	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=60.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,12:0,0,6,13
chr4	331658	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=173,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:0|1:331658_T_C:331658:9,1,3,0
chr4	331666	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:0|1:331658_T_C:331658:9,1,4,0
chr4	331693	.	G	GC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=47.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr4	337474	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,113;MMQ=49,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:1,2:5,1:6,0,3,0
chr4	338186	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=116,197;MMQ=60,45;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,2:9,1:11,10,0,3
chr4	338197	.	T	TGA	.	.	DP=25;ECNT=10;MBQ=26,32;MFRL=116,96;MMQ=60,44;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:12,1:9,1:0|1:338197_T_TGA:338197:11,11,0,3
chr4	338200	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=10;MBQ=31,36;MFRL=116,96;MMQ=60,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:13,1:8,2:0|1:338197_T_TGA:338197:11,12,0,3
chr4	338201	.	ATC	A	.	.	DP=27;ECNT=10;MBQ=24,29;MFRL=116,48;MMQ=60,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:13,1:8,2:0|1:338197_T_TGA:338197:11,12,1,3
chr4	338205	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=27,34;MFRL=116,48;MMQ=60,43;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.178:26:14,1:8,3:0|1:338197_T_TGA:338197:10,12,1,3
chr4	338246	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=132,0;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:11,2:4,3:0|1:338246_G_A:338246:4,11,2,3
chr4	338252	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=132,0;MMQ=60,42;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:10,2:5,2:0|1:338246_G_A:338246:4,11,2,2
chr4	338258	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=10;MBQ=31,27;MFRL=132,0;MMQ=60,42;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:8,2:5,2:0|1:338246_G_A:338246:4,10,2,2
chr4	338260	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=10;MBQ=26,34;MFRL=132,0;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,2:5,2:0|1:338246_G_A:338246:3,10,2,2
chr4	338266	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=10;MBQ=33,30;MFRL=138,0;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,2:4,1:0|1:338246_G_A:338246:2,10,2,2
chr4	344138	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	499439	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=228,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:2,1:0,1:2,1,1,1
chr4	515577	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=158,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:15,2:14,1:16,14,2,1
chr4	515632	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=136,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,3:0.090:42:18,0:21,3:21,18,1,2
chr4	517481	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=143,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:10,0:10,8,0,2
chr4	521068	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,3:0,7:0,0,0,10
chr4	650749	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=174,107;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,0:4,3:2,7,2,1
chr4	651283	.	GGTGCGGCGGGGCAGGACGTCCAGGGGTCACCCAGGGGTCACGGCT	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=162,149;MMQ=60,32;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.181:26:12,2:7,2:8,14,1,3
chr4	651290	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=159,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.139:20:10,2:7,0:6,12,2,0
chr4	654495	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=206,207;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:0,4,0,2
chr4	658582	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=232,105;MMQ=41,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:2,1:0,0:4,0,1,0
chr4	672675	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:11,4:6,2:9,8,3,3
chr4	677077	.	G	GAGCTGCCCA	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.164:16:10,2:4,0:0|1:677077_G_GAGCTGCCCA:677077:6,8,0,2
chr4	677082	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,23;MFRL=145,132;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:9,2:4,0:0|1:677077_G_GAGCTGCCCA:677077:5,8,0,2
chr4	677349	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,13;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:677349_A_C:677349:1,0,1,0
chr4	677352	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=24,12;MFRL=176,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:677349_A_C:677349:1,1,1,0
chr4	677356	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=26,32;MFRL=181,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:677349_A_C:677349:1,2,1,0
chr4	677360	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=201,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:677349_A_C:677349:2,2,1,0
chr4	755025	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=212,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.541:22:8,6:2,6:8,2,10,2
chr4	755129	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=158,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:12,4:4,5:7,9,4,5
chr4	759709	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr4	759733	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr4	780286	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=144,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:2,0,4,2
chr4	786401	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=171,88;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,1,1
chr4	818248	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=21,14;MFRL=166,274;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.388:6:1,0:1,0:0|1:818248_A_C:818248:2,2,2,0
chr4	818254	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=160,274;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.336:7:2,1:1,0:0|1:818248_A_C:818248:2,3,2,0
chr4	818264	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,13;MFRL=148,274;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.337:7:2,0:2,0:0|1:818248_A_C:818248:1,4,2,0
chr4	843622	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=172,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=C;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.520:6:1,0:2,0:0,3,0,3
chr4	845772	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr4	871675	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	877865	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=89,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:4,7,2,0
chr4	882845	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:882845_C_T:882845:0,0,0,3
chr4	882849	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:882845_C_T:882845:0,0,0,3
chr4	898664	.	A	ATCTCG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=198,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:898664_A_ATCTCG:898664:0,4,1,1
chr4	898665	.	A	AGGCCCCCTTTCGTGCGACAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=198,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0|1:898664_A_ATCTCG:898664:0,4,1,1
chr4	906647	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=27.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	946226	.	TGGGGTCGTGCAGGTAGGGGGCCTGGGGGGCCTGCACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATCACCATC	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,22;MFRL=110,143;MMQ=60,41;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.238:13:5,1:3,0:7,4,1,1
chr4	946301	.	TG	AA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,24;MFRL=0,125;MMQ=60,48;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:946301_TG_AA:946301:0,1,0,1
chr4	946307	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=0,125;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:946301_TG_AA:946301:0,1,0,1
chr4	952156	.	C	CCTGTCATGGAGATCAGTGATATTCTG	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=168,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:3,3,1,1
chr4	952178	.	T	TCAGG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=240,120;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:952178_T_TCAGG:952178:1,3,0,1
chr4	952182	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=240,120;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:952178_T_TCAGG:952178:1,3,0,1
chr4	954311	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=252,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	960713	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=198,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr4	961373	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=192,156;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,7:3,3:3,1,6,4
chr4	961375	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:6,0:9,4,1,1
chr4	984138	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=173,43;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:4,6,0,2
chr4	1006200	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=171,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr4	1006365	.	GCCCAGCCCGGCCAGCCTGGCCTCCGCCAGCGCCGCCCCCTTCCCGCCCGGCCCTGAA	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=207,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0,4,0,1
chr4	1006386	.	CTC	ACG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=214,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	1019054	.	CCA	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=150,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.228:20:3,3:10,1:11,5,3,1
chr4	1067032	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.537:9:4,3:0,1:1,3,1,4
chr4	1067267	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr4	1075329	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,129;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:13,0:5,6:8,10,0,6
chr4	1084723	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,99;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	1102050	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:2,0,5,0
chr4	1107278	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=160,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr4	1161480	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=231,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0,1,1,3
chr4	1164378	.	AGAG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=151,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=28.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,3:6,5:3,10,4,4
chr4	1165587	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=202,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:1,5:1,3,7,0
chr4	1165748	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,212;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.429:17:4,4:4,3:5,5,7,0
chr4	1207445	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr4	1219373	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=207,103;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,1,1
chr4	1232201	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=256,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	1235157	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=172,42;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:0|1:1235157_G_T:1235157:4,5,1,1
chr4	1235158	.	A	ATCAGCTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=172,42;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:5,2:3,0:0|1:1235157_G_T:1235157:4,5,1,1
chr4	1244267	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=229,332;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr4	1305802	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=153,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:14,2:12,1:16,10,3,0
chr4	1332175	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=126,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:0,2:6,2:4,2,3,1
chr4	1343720	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=241,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr4	1345647	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=144,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:6,2:3,1:1,9,0,3
chr4	1348691	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,16;MFRL=181,328;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.713:4:1,1:0,0:0,1,2,1
chr4	1348806	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:3,1:3,2:5,2,2,1
chr4	1369093	.	CT	GG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=114,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.742:11:0,3:3,5:2,1,8,0
chr4	1373751	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr4	1373896	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:6,4,1,1
chr4	1374695	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=129,102;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,5:3,4:7,1,5,4
chr4	1374710	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=102,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:9,4,2,0
chr4	1657086	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	1670480	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,86;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:4,8,2,0
chr4	1701317	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:8,4:1,8:6,3,7,5
chr4	1720346	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	1725651	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,0,8
chr4	1729347	.	AT	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=234,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr4	1729425	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:1,5:4,7:3,2,6,6
chr4	1730262	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=156,83;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:7,2:13,0:13,7,1,1
chr4	1730299	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:2,8:5,7:3,4,10,5
chr4	1732734	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,201;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,3:1,6:1,3,0,9
chr4	1737109	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=248,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,4:1,1:1,0,1,4
chr4	1737404	.	C	CCT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	1737585	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr4	1739252	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:2,1,6,2
chr4	1741325	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=203,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr4	1742779	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,0:4,4:0,9,0,4
chr4	1746229	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=169,72;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,0:1,3:3,0,1,2
chr4	1746844	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr4	1805573	.	TCTG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr4	1806739	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,12;MFRL=171,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.531:9:1,0:1,1:0,4,0,5
chr4	1807595	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=148,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:1,5,0,6
chr4	1817523	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:4,1,0,2
chr4	1920076	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=149,153;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,6:10,0:0|1:1920076_T_G:1920076:6,10,6,0
chr4	1920080	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=152,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:5,6:9,0:0|1:1920076_T_G:1920076:6,8,6,0
chr4	1920100	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=153,182;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:10,7:8,0:15,4,7,0
chr4	1940337	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	1954774	.	GC	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,363;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	1961137	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,5:4,5:6,1,8,2
chr4	1961359	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=187,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:9,2:5,0:8,7,0,2
chr4	1976737	.	A	AAGAGCTGAAGTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=158,41;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.223:11:5,2:4,0:1,8,1,1
chr4	1985257	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=205,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:5,1:1,1:2,4,2,0
chr4	1988188	.	C	CCT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=192,158;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0|1:1988188_C_CCT:1988188:2,3,1,3
chr4	1988193	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0|1:1988188_C_CCT:1988188:2,3,1,2
chr4	2065946	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	2082795	.	C	CTTATCTTCCTCCCACTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=129,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,2:1,0:3,4,1,1
chr4	2158408	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,5,1
chr4	2176546	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,16;MFRL=157,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.270:11:2,0:2,0:0|1:2176546_G_C:2176546:1,7,0,3
chr4	2176551	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=19,20;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.302:10:2,0:1,2:0|1:2176546_G_C:2176546:1,6,0,3
chr4	2322039	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=166,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:4,1:2,2:3,3,0,3
chr4	2337603	.	GC	TT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=254,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	2343150	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=260,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,2:0,4:2,1,5,1
chr4	2343349	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=226,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,4:1,1:1,6,2,3
chr4	2502299	.	A	ATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,1:0,0,3,1
chr4	2513620	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=113,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:3,5:11,1:0|1:2513620_G_A:2513620:9,5,4,2
chr4	2513624	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=117,248;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,3:10,1:0|1:2513620_G_A:2513620:10,5,3,1
chr4	2691219	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=172,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.480:8:2,2:2,1:1,3,3,1
chr4	2717690	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=145,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:7,4,2,0
chr4	2746285	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=215,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.383:6:2,2:1,0:1,3,0,2
chr4	2746307	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=225,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	2822289	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:0,3:1,7:1,0,9,2
chr4	2829077	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=64,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:0,4:6,5:3,3,2,7
chr4	2831341	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=123,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.570:5:1,1:1,1:0|1:2831341_A_C:2831341:0,2,3,0
chr4	2831347	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,12;MFRL=190,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:2,0:1,1:0|1:2831341_A_C:2831341:1,2,3,0
chr4	2831383	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=95,144;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,4:0,1:1,1,1,4
chr4	2886199	.	TA	CC	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=169,207;MMQ=60,30;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:2886199_TA_CC:2886199:5,0,2,0
chr4	2886202	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=30,35;MFRL=169,207;MMQ=60,30;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:2886199_TA_CC:2886199:5,0,2,0
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chr4	2916762	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,214;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:3,4,2,2
chr4	2933271	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:3,3,3,3
chr4	2934308	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,5:1,5:0,2,5,5
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chr4	2956334	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=218,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,1:2,1:0,6,0,2
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chr4	3039311	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:3,2:1,2:0,5,0,4
chr4	3040044	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=194,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,0:3,2:2,1,1,1
chr4	3040279	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.790:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	3088747	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,128;MMQ=60,33;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=58.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.489:43:13,0:9,21:11,11,1,20
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chr4	3144441	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=289,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
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chr4	3161958	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,7:6,0:6,4,7,0
chr4	3180021	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=86,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:4,6:4,7:9,0,8,5
chr4	3201682	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.380:16:4,0:6,5:4,6,0,6
chr4	3208684	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=145,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:10,5:16,0:13,14,3,2
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chr4	3240526	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,3:0,2:0,0,5,1
chr4	3257699	.	AGGC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=178,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GGC;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0,3,1,0
chr4	3427151	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=179,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,6:3,0:4,1,6,0
chr4	3443783	.	T	TTCC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TCC;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	3444503	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:8,4,2,0
chr4	3445745	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,5,0
chr4	3446820	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	3449781	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=225,280;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:2,3,2,0
chr4	3475107	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,1,1
chr4	3475122	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=249,160;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr4	3475390	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=148,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:0,0:3,3:0,3,1,2
chr4	3478013	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:3478013_G_A:3478013:0,0,3,0
chr4	3478051	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0|1:3478013_G_A:3478013:0,0,6,3
chr4	3478323	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,0,9
chr4	3487237	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,7:0,0,11,3
chr4	3516689	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr4	3516742	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=165,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr4	3769789	.	G	GGGGGAGCTTTCCCAGAGACCC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGGAGCTTTCCCAGAGACCC;STR;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.816:7:0,1:1,3:1,0,5,1
chr4	4190507	.	C	CTTG	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=125,108;MMQ=60,33;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.351:35:10,7:13,4:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:12,11,6,6
chr4	4190508	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=125,108;MMQ=60,33;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,12:0.351:35:10,7:13,4:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:12,11,6,6
chr4	4190511	.	G	GTCACTTGTTA	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=129,97;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=68.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,19:0.444:43:11,8:13,5:0|1:4190507_C_CTTG:4190507:12,12,10,9
chr4	4190688	.	G	GCT	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=124,58;MMQ=60,21;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,2:13,0:0|1:4190688_G_GCT:4190688:10,13,1,1
chr4	4190689	.	A	AAG	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=124,58;MMQ=60,21;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:8,2:13,0:0|1:4190688_G_GCT:4190688:10,13,1,1
chr4	4190723	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=26,35;MFRL=162,174;MMQ=60,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:3,9,0,2
chr4	4190792	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	4198815	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=305,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr4	4199261	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,180;MMQ=60,52;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:7,5,2,0
chr4	4239516	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=30,22;MFRL=193,144;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.432:35:10,4:8,10:0|1:4239516_C_T:4239516:10,10,11,4
chr4	4239539	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=167,144;MMQ=60,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,7:0.234:32:8,1:14,6:0|1:4239516_C_T:4239516:13,12,0,7
chr4	4239697	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=209,272;MMQ=52,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,4:8,1:3,11,0,5
chr4	4241953	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=262,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr4	4249414	.	AT	GC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:3,3:0,6,0,6
chr4	4249483	.	CA	TC	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr4	4249855	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=207,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1,2,3,0
chr4	4249884	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:4,2:0,0:1,3,2,1
chr4	4249974	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,4:0,0:0,2,0,4
chr4	4269560	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=142,90;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:6,0,2,0
chr4	4275280	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=159,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.278:16:6,1:5,3:0|1:4275280_C_T:4275280:7,5,3,1
chr4	4275287	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=143,117;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:5,2:4,3:0|1:4275280_C_T:4275280:6,5,4,1
chr4	4281570	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=320,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	4283676	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=198,258;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:3,2:0,5:0,3,0,7
chr4	4285265	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	4304437	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=191,60;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:5,5,0,2
chr4	4317464	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:15,2:7,1:9,13,3,0
chr4	4317777	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=158,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,0:2,3:1,6,0,3
chr4	4322275	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr4	4425422	.	CAG	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	5016841	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr4	5016972	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=219,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,4:3,1:5,6,2,3
chr4	5018702	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=214,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:3,9:3,2:1,5,5,6
chr4	5021008	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=214,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:1,5:5,0:5,2,3,2
chr4	5418485	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=190,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr4	5418539	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=114,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:0,9:1,5:1,0,7,7
chr4	5527008	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=177,114;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,2:2,5:5,1,6,1
chr4	5527249	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=240,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:2,2,1,2
chr4	5528115	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27,27;MFRL=200,183,145;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=6.56,5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,3:0.452,0.372:8:1,2,0:0,2,3:0,1,1,6
chr4	5577884	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,10,1
chr4	5617295	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=105,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.673:10:1,7:1,0:2,1,1,6
chr4	5617369	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=260,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	5630470	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=16.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:1,3:0,3:0,1,0,7
chr4	5642274	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,140;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,1:8,5:6,6,3,4
chr4	5687263	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	5693112	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=153,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:2,1,0,5
chr4	5710106	.	C	CAGAGCT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	5730954	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=147,139;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr4	5733068	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:5,0,5,0
chr4	5746916	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.644:15:2,7:3,2:5,0,7,3
chr4	5747072	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,1:2,4:4,5,2,3
chr4	5747078	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.735:17:1,7:3,5:1,3,5,8
chr4	5747106	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=246,194;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr4	5747131	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=36,25;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr4	5749784	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=196,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:5749784_G_A:5749784:1,0,3,0
chr4	5749804	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:5749784_G_A:5749784:2,0,2,0
chr4	5750084	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:0,4,0,4
chr4	5754544	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=185,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,4:7,1:8,3,5,0
chr4	5757932	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=16.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.853:4:0,1:0,3:0|1:5757932_GA_G:5757932:0,0,3,1
chr4	5757944	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=140,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0|1:5757932_GA_G:5757932:2,1,2,1
chr4	5798721	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=17,20;MFRL=165,49;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.207:13:3,1:2,0:7,4,2,0
chr4	5803669	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=199,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,7:2,4:5,1,9,2
chr4	5803829	.	AC	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=193,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr4	5809915	.	TT	CC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=235,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:5,0,2,1
chr4	5812195	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=180,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.656:12:0,3:3,5:2,2,3,5
chr4	5812778	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:1,6:0,2:0,1,2,6
chr4	5812817	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=178,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	5830414	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:2,5:2,9:2,2,4,10
chr4	5843196	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=172,252;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr4	5863032	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	5966905	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:0,1,3,5
chr4	5966943	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	5969113	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,6,4
chr4	5969235	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=42.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,5:0,0,3,10
chr4	5969252	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,2,9
chr4	5969292	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	5969303	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	5975538	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=192,191;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,6:1,1:1,1,0,7
chr4	5981849	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=273,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,3:2,2:9,0,3,2
chr4	5982108	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=126,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,2:3,4:2,5,0,7
chr4	5982135	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=141,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.422:10:2,2:3,2:1,5,0,4
chr4	6055971	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=211,252;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	6062061	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=109,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr4	6081920	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=168,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr4	6114420	.	GCC	TAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=235,373;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,2:3,0:5,2,2,0
chr4	6279194	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=207,41;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:0|1:6279194_C_G:6279194:11,5,1,1
chr4	6279200	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=207,41;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:6279194_C_G:6279194:11,5,1,1
chr4	6279203	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=207,41;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:0|1:6279194_C_G:6279194:11,5,1,1
chr4	6279206	.	GGGC	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=35,20;MFRL=202,41;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:10,0:5,2:0|1:6279194_C_G:6279194:13,7,1,1
chr4	6279211	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=202,41;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:13,0:6,2:0|1:6279194_C_G:6279194:13,7,1,1
chr4	6292909	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:6292909_C_T:6292909:4,4,1,2
chr4	6292915	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=169,106;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:6292909_C_T:6292909:4,4,1,2
chr4	6302519	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=140,145;MMQ=60,59;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:2,1:6,10:2,6,7,4
chr4	6303277	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=200,150;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,2:3,0:5,5,1,1
chr4	6304242	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	6304286	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=227,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.669:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	6325018	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=107,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.538:20:4,2:5,7:5,4,7,4
chr4	6330938	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:8,0,1,1
chr4	6335203	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=185,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr4	6374189	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr4	6374230	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=164,239;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:3,1,2,1
chr4	6374468	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,5:2,1:0,4,1,5
chr4	6377530	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=148,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:3,2,5,1
chr4	6377534	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,8,5
chr4	6377713	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	6577164	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:6577164_G_A:6577164:0,1,0,1
chr4	6577173	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6577164_G_A:6577164:0,0,0,1
chr4	6577176	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:6577164_G_A:6577164:0,0,0,1
chr4	6578318	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:8,0:13,4,2,0
chr4	6578487	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,0,12
chr4	6580283	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr4	6594827	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	6596476	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=239,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:1,4:1,4:0,2,4,4
chr4	6596515	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,3:0,4:0,0,1,7
chr4	6602255	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,93;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	6602516	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	6606864	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:0,8:2,12:2,0,10,10
chr4	6610889	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:3,1,4,3
chr4	6619052	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,2,5
chr4	6623032	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,1,10
chr4	6719092	.	TAGTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=269,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:1,7:0,6:0,1,5,8
chr4	6955922	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=192,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.448:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr4	6956134	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=202,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.845:17:0,6:2,9:0,2,6,9
chr4	6968942	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=250,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr4	6969163	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=55,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr4	6996129	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:0,4,0,3
chr4	7002803	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,7,4
chr4	7006524	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=176,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr4	7006541	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=148,82;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:7,2:5,2:11,1,3,1
chr4	7027041	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=313,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,3:0,6:0,1,0,9
chr4	7044357	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:7044357_A_G:7044357:0,0,0,5
chr4	7044380	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:7044357_A_G:7044357:0,0,0,3
chr4	7064010	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:7064010_A_C:7064010:0,0,1,0
chr4	7064015	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:7064010_A_C:7064010:2,0,1,0
chr4	7064016	.	CAG	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=185,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,0:0|1:7064010_A_C:7064010:2,0,1,0
chr4	7064214	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=35,31;MFRL=352,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,4:0,1,1,7
chr4	7064243	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=352,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr4	7064277	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=284,254;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr4	7069606	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=267,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr4	7069804	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=226,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,5:0,7:0,2,0,12
chr4	7434988	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=166,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	7435009	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=261,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,1:0,1:1,0,3,0
chr4	7663167	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=152,238;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.232:11:5,0:3,2:9,0,2,0
chr4	7666212	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=127,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:3,2:8,1:5,6,1,2
chr4	7666241	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=127,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:3,1:2,2:1,4,0,4
chr4	7684641	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=191,273;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:4,0:5,3:3,6,1,2
chr4	7684661	.	CT	AC	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,340;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr4	7691193	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr4	7726847	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=203,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	7728472	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,7:0,0:1,0,6,1
chr4	7728658	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=134,134;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,0,7
chr4	7731310	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=157,244;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:5,4:0,2:3,2,4,2
chr4	7738730	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	7765566	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=147,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:1,7,0,2
chr4	7817698	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,0:5,2:7,0,2,0
chr4	7820727	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	7820795	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=187,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.541:18:3,3:5,5:2,6,6,4
chr4	7870503	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,4:1,2:0,5,1,5
chr4	7985343	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=151,99;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:3,1:7,1:3,7,0,2
chr4	8006928	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=242,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr4	8006988	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=171,229;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.369:9:3,1:2,2:6,0,3,0
chr4	8009759	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=110,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,10:0,2:1,1,7,5
chr4	8034497	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.610:11:3,2:1,4:1,3,1,6
chr4	8062638	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr4	8062871	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=167,273;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr4	8089880	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=144,71;MMQ=60,33;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:11,5,2,1
chr4	8090028	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=166,91;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:4,2:4,8:4,4,1,9
chr4	8207154	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:2,1:4,2:0,7,0,3
chr4	8214636	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	8216389	.	AACTGGTGCTTTGTTTATTTATTT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=188,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.318:6:0,1:2,1:0,4,0,2
chr4	8217829	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.335:16:9,1:1,4:8,3,4,1
chr4	8221058	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=161,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:10,4:2,7:5,7,6,5
chr4	8228627	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.696:8:1,2:1,3:0|1:8228627_G_C:8228627:2,0,6,0
chr4	8228632	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.908:9:0,4:0,4:0|1:8228627_G_C:8228627:0,0,9,0
chr4	8228894	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,94;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0,0,9,5
chr4	8230456	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	8235262	.	AGG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=166,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.210:12:5,2:5,0:0|1:8235262_AGG_A:8235262:3,7,1,1
chr4	8235269	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=172,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:3,0:0|1:8235262_AGG_A:8235262:2,9,1,1
chr4	8235273	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=24,29;MFRL=167,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:3,0:0|1:8235262_AGG_A:8235262:2,9,1,1
chr4	8237096	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr4	8239389	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,17;MFRL=98,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.246:13:5,0:5,0:0|1:8239389_G_C:8239389:8,2,0,3
chr4	8239399	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,12;MFRL=101,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.345:9:3,0:2,0:0|1:8239389_G_C:8239389:4,2,0,3
chr4	8239403	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,12;MFRL=176,231;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.428:7:3,0:1,0:0|1:8239389_G_C:8239389:3,1,0,3
chr4	8288370	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=168,82;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:7,0:13,5:8,12,0,5
chr4	8288581	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,329;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	8304137	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=217,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,3:5,5:4,2,8,0
chr4	8306028	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=178,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:4,6,0,3
chr4	8375342	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:4,6,5,0
chr4	8376835	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:5,1:4,3:4,6,1,3
chr4	8383167	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=352,114;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,3,1
chr4	8390859	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:2,1,1,1
chr4	8391049	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=206,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,6:0,1:1,4,3,4
chr4	8417534	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=122,159;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:9,0:9,3:14,4,0,3
chr4	8465689	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=125,80;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:5,6,0,2
chr4	8465721	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=119,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,3:8,6:3,10,4,6
chr4	8469777	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,1:13,2:11,8,1,2
chr4	8584448	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=236,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	8588685	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,328;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	8589023	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:3,10,0,2
chr4	8594574	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	8602793	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	8602816	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	8613908	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=207,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0|1:8613908_G_A:8613908:1,1,2,0
chr4	8613917	.	CG	GT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:8613908_G_A:8613908:0,0,1,0
chr4	8620325	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=219,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr4	8621392	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=232,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr4	9446325	.	AG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=210,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,6:3,3:5,2,1,8
chr4	9785354	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,161;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.376:14:6,3:3,2:3,6,3,2
chr4	9889261	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:6,4,3,3
chr4	9909850	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=155,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:6,5,4,1
chr4	9921931	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.557:14:4,6:2,1:6,0,7,1
chr4	9922170	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:8,4:5,2:1,12,2,5
chr4	9982191	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=118,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,3:10,2:8,6,3,2
chr4	9998605	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=154,152;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:4,3:3,5:3,4,2,6
chr4	10020564	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=130,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.457:15:6,3:2,2:8,0,7,0
chr4	10020757	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=167,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:0,5,0,2
chr4	10027643	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=135,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,0:7,3:1,11,1,2
chr4	10079351	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=181,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:2,4:9,1:7,4,4,1
chr4	10084570	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	10086015	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=223,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,3,0
chr4	10086188	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:2,6,3,2
chr4	10089489	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:11,4,1,1
chr4	10089865	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,14:0.497:28:5,6:9,7:11,3,11,3
chr4	10089966	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,4:15,0:8,22,4,0
chr4	10090178	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,5,1
chr4	10099277	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:5,1,3,2
chr4	10099542	.	CAAAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=207,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=18,14;RU=A;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:0,1:2,0:2,1,0,2
chr4	10117728	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:15,4:13,8:19,9,4,8
chr4	10118377	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	10445508	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=144,192;MMQ=60,56;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:10,4:10,0:7,13,4,0
chr4	10446385	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,5,14
chr4	10446906	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=70.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,7:0,17:0,0,14,10
chr4	10447985	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,4:3,5:3,9,2,7
chr4	10509699	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:1,2,0,5
chr4	10534027	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:0,3,0,3
chr4	10542058	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=136,272;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr4	13578405	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr4	13583838	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,196;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:8,4:8,1:11,6,5,0
chr4	13589212	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=216,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:4,0,2,0
chr4	13603107	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=143,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:8,8,1,1
chr4	13603465	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=197,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,3:6,0:3,10,3,0
chr4	13605242	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=114,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,0:13,3:16,9,2,1
chr4	13615293	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=216,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:2,6:3,3:1,4,3,6
chr4	13616922	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,3:8,0:10,5,3,0
chr4	13617012	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=156,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:6,6:13,4:9,10,6,4
chr4	15005604	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,99;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:4,2:2,4:4,2,3,3
chr4	15009232	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=207,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,5:2,0:1,3,0,5
chr4	15482477	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=60.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.863:19:2,9:0,8:1,1,7,10
chr4	15504026	.	GTTTTGT	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=100,45;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTGT;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.098:28:13,2:9,0:19,7,0,2
chr4	15538744	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr4	15539498	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,11:0,6:0,0,12,5
chr4	15568992	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=123,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:18,4:8,3:12,15,5,2
chr4	15569018	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=133,123;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,27:0.823:32:3,16:2,10:5,0,11,16
chr4	15569146	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=192,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.276:23:6,3:11,3:10,7,1,5
chr4	15575718	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=241,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,3,1
chr4	15575751	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=222,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,5,1
chr4	15587897	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	15589345	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=19,24;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:0,1:0,2:1,0,3,0
chr4	15602773	.	C	CTTA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	15603069	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=206,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	15629409	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:15629409_T_C:15629409:2,0,1,0
chr4	15629419	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,11;MFRL=177,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:15629409_T_C:15629409:2,0,1,0
chr4	15632228	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr4	15632315	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,80;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,2:9,0:12,8,2,0
chr4	15689632	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,164;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.501:26:5,3:8,10:6,7,5,8
chr4	15706502	.	G	GTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=174,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,2:8,1:11,3,2,1
chr4	15717321	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=161,196;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,6:2,1:4,1,5,2
chr4	15937526	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=180,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.330:16:2,1:9,4:7,4,3,2
chr4	15964040	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:4,3,3,0
chr4	15972549	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	15980975	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=206,106;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,4,1
chr4	15981665	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=204,204;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:15,0:1,4:1,15,0,4
chr4	15981948	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=16,15;MFRL=146,146;MMQ=27,44;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr4	15982166	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=135,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,2:0,5:0,1,2,5
chr4	15982222	.	TTGG	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=278,111;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15982222_TTGG_T:15982222:0,1,0,1
chr4	15982226	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=278,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15982222_TTGG_T:15982222:0,1,0,1
chr4	15982232	.	TT	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=278,111;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:15982222_TTGG_T:15982222:0,1,0,1
chr4	15982237	.	TT	CA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,35;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:15982222_TTGG_T:15982222:0,0,0,1
chr4	15986042	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=164,125;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.780:7:0,1:1,1:1,0,4,2
chr4	15989191	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	15991275	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=341,135;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,3,2
chr4	15994002	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,3:3,1:7,2,0,4
chr4	16002050	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	16024885	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	16026841	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=116,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:3,2:17,1:13,8,2,1
chr4	16035209	.	CTTTTTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=247,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=21,12;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:0,1:1,2,0,1
chr4	16168512	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=236,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr4	16172181	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	16175827	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=128,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.113:24:8,0:14,2:14,8,1,1
chr4	16181301	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=138,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:5,2:8,0:5,8,0,2
chr4	16189991	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr4	16204226	.	GA	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.230:23:2,0:7,3:3,15,0,5
chr4	16215537	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=195,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,3:3,5:2,7,2,6
chr4	16504335	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=112,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,13:0.311:43:23,0:7,13:7,23,0,13
chr4	16510131	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,2:3,2:10,0,4,0
chr4	16513748	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:1,7,1,1
chr4	16597280	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=47.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,11:0,3:0,0,10,5
chr4	16597366	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,102;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:11,0:6,7:8,9,1,6
chr4	16899946	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=73,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:7,6:3,3:7,3,6,3
chr4	17494054	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,354;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	17503544	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=97,341;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:1,2,0,2
chr4	17506164	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=118,7643047;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr4	17513724	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=210,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr4	17513757	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=224,219;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr4	17517242	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=219,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr4	17524570	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=187,296;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.161:23:7,1:12,2:10,10,2,1
chr4	17581617	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=242,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,8:3,4:0,4,3,9
chr4	17581643	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=240,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=35.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:2,7:1,2:0,3,0,9
chr4	17585014	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=223,168;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr4	17590686	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.831:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr4	17600149	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=127,193;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:14,1:13,2:12,15,0,3
chr4	17608620	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=204,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,1:2,5:0,2,0,6
chr4	17616214	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.825:21:2,4:1,13:3,0,16,2
chr4	17625209	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,95;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,14:4,1:3,4,7,8
chr4	17634213	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,9:0,5:0,0,6,8
chr4	17634255	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=269,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr4	17634256	.	C	CAA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=269,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=A;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.666:7:0,3:2,2:1,1,2,3
chr4	17635556	.	CAAAAT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=337,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr4	17636535	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=246,192;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr4	17636676	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=163,319;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:13,6:9,0:16,7,6,0
chr4	17640858	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=144,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:3,0,5,1
chr4	17643620	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	17654648	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=288,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,0:2,5:1,2,0,5
chr4	17659936	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=155,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:5,3,4,4
chr4	17660237	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=315,194;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	17661737	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,0:5,2:2,5,1,1
chr4	17661762	.	C	CAT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=36,34;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.499:2:0,0:1,1:0|1:17661762_C_CAT:17661762:0,1,0,1
chr4	17661768	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,27;MFRL=177,88;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:17661762_C_CAT:17661762:0,1,0,1
chr4	17666303	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,17;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.592:3:0,0:0,0:1,0,0,2
chr4	17689974	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	17694880	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=211,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,1:1,7:1,2,7,1
chr4	17694916	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=216,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:1,5,7,2
chr4	17694943	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=204,142;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,6:4,5:1,5,6,5
chr4	17706928	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=177,300;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	17710726	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=67046296,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr4	17812615	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,5:1,1:5,0,4,2
chr4	17812796	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=157,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:11,1:8,1:9,10,0,2
chr4	17814110	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,2:4,1:0,7,0,3
chr4	17841848	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:2,5:10,2:3,9,2,5
chr4	17842156	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,2:4,3,4,1
chr4	17844029	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=154,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:2,6,1,3
chr4	17885296	.	A	AAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=59,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AC;STR;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.586:10:2,3:2,3:2,2,5,1
chr4	17963474	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,136;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,8:5,0:8,2,8,0
chr4	20259621	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.306:11:6,3:2,0:0|1:20259621_A_AT:20259621:0,8,0,3
chr4	20259622	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:6,2:2,0:0|1:20259621_A_AT:20259621:0,8,0,3
chr4	20270600	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:1,8,0,4
chr4	20469517	.	TAAA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=241,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:0|1:20469517_TAAA_T:20469517:0,6,0,2
chr4	20469524	.	TC	GG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=241,162;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,2:2,0:0|1:20469517_TAAA_T:20469517:0,7,0,2
chr4	20469528	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=241,162;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:20469517_TAAA_T:20469517:0,7,0,2
chr4	20487975	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,295;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:0,6,0,3
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chr4	20533700	.	A	AT,ATT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,20,31;MFRL=181,118,246;MMQ=60,60,60;MPOS=19,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,9,10;RU=T;STR;TLOD=8.46,3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,7,2:0.449,0.183:14:2,2,2:3,5,0:3,2,6,3
chr4	20535276	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=135,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,0:12,4:9,13,0,4
chr4	20541005	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.249:14:4,3:7,0:0|1:20541005_AG_A:20541005:7,4,1,2
chr4	20541008	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=130,135;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:4,3:7,0:0|1:20541005_AG_A:20541005:7,4,1,2
chr4	20620683	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,5:0,13:0,0,2,16
chr4	20706067	.	CT	C,CTT	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,30,31;MFRL=132,227,173;MMQ=60,60,60;MPOS=9,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=14.09,6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,11,4:0.356,0.170:28:4,7,0:5,4,3:9,4,12,3
chr4	20709411	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,2:5,2:7,2,3,1
chr4	20728966	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=215,92;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.496:25:6,2:6,10:6,7,4,8
chr4	20729046	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=220,158;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:7,0:1,10,0,4
chr4	20733708	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=201,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=34.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.679:20:3,8:3,6:1,5,5,9
chr4	20736416	.	A	AAAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAC;STR;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,1:0,3,1,5
chr4	20751278	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=100,134;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:0,3:2,1:1,1,3,1
chr4	20760387	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:5,2,2,1
chr4	21305525	.	TTCATGGTCAGCTAGG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=144,250;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,2:5,0:7,7,2,0
chr4	22390256	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=209,159;MMQ=60,54;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,0:8,3:10,7,0,3
chr4	22394193	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:10,14,2,0
chr4	22414708	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=254,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr4	22426062	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=166,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:0,2,0,6
chr4	22449028	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,83;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.559:12:2,5:3,2:4,1,6,1
chr4	22456381	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=215,255;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:2,3:2,0,3,0
chr4	22456431	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=22,30;MFRL=136,165;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr4	22463486	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=269,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr4	22750485	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:0|1:22750485_A_T:22750485:9,6,1,1
chr4	22750488	.	T	TCAAATTG	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=152,52;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:10,0:4,2:0|1:22750485_A_T:22750485:10,5,1,1
chr4	22750493	.	G	GACCCTATTAACTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=36,20;MFRL=153,52;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:0|1:22750485_A_T:22750485:9,5,1,1
chr4	23814419	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=114,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,0:8,2:0|1:23814419_C_T:23814419:12,8,1,1
chr4	23814428	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=117,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:23814419_C_T:23814419:14,8,1,1
chr4	23814431	.	T	TTCACTGCAATCAGAATCAC	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=119,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:0|1:23814419_C_T:23814419:14,9,1,1
chr4	23816242	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=10,23;MFRL=158,119;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:0,2:0,2:0,2,0,5
chr4	23826219	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,35;MFRL=234,307;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23826219_A_C:23826219:0,1,0,1
chr4	23826223	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=234,307;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23826219_A_C:23826219:0,1,0,1
chr4	23826225	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=24,36;MFRL=234,307;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23826219_A_C:23826219:0,1,0,1
chr4	23826229	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,34;MFRL=234,307;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:23826219_A_C:23826219:0,1,0,1
chr4	23886323	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr4	24521943	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=165,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,0:6,2:4,4,0,2
chr4	24534572	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,3:12,0:14,11,3,0
chr4	24578260	.	T	TCCTCTCTCTCTCTCTCTC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:8,0:2,14,0,2
chr4	24801354	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	24802323	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr4	24824076	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=164,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:4,1:3,2:7,6,3,0
chr4	24836685	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.314:11:4,2:2,1:1,7,0,3
chr4	25028492	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=154,93;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:11,3:12,0:11,14,2,1
chr4	25030312	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=211,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr4	25125802	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,4:8,0:7,9,0,4
chr4	25129031	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=153,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,0:4,5:1,7,0,5
chr4	25146307	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	25160732	.	T	TA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.311:16:7,1:1,3:0,11,2,3
chr4	25262251	.	TATATATATATATAC	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=195,219;MMQ=52,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.194:18:6,0:8,3:1,14,0,3
chr4	25262285	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=215,218;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:8,0:1,4:0,10,0,4
chr4	25262293	.	CA	TG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=199,218;MMQ=60,40;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:9,0:1,4:0|1:25262293_CA_TG:25262293:0,10,0,4
chr4	25262297	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=203,218;MMQ=60,40;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:8,0:1,4:0|1:25262293_CA_TG:25262293:0,9,0,4
chr4	25262301	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=209,218;MMQ=60,40;MPOS=-13;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:8,0:1,4:0|1:25262293_CA_TG:25262293:0,10,0,4
chr4	25315637	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=170,252;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.527:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	25334977	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:4,0:10,2:6,8,0,2
chr4	25366059	.	G	GT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=166,100;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:4,1:7,2:7,5,2,1
chr4	25370840	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=215,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr4	25393889	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=218,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:0,2,7,2
chr4	25394078	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,2,10
chr4	25396413	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=182,119;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,2:11,0:14,6,0,2
chr4	25404553	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=137,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=36.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,8:0,5:0,1,11,2
chr4	25408724	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,4:2,8:2,0,12,0
chr4	25417244	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=374,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.775:7:0,3:1,2:0,1,0,6
chr4	25669492	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=173,79;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:3,3,2,0
chr4	25674905	.	TCACA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,2,6
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,2,6
chr4	25674913	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,4:0,2:0|1:25674905_TCACA_T:25674905:0,0,2,6
chr4	25678396	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=194,263;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:3,4,2,0
chr4	25750261	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=228,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr4	25759128	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,15;MFRL=185,255;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,0:4,1,2,0
chr4	25760693	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=193,148;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:2,6,1,3
chr4	25767064	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=161,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:1,11,0,2
chr4	25767133	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	25769129	.	CC	GG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=126,113;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:8,3:8,3:9,7,6,0
chr4	25769135	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=126,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,8:7,4:9,2,8,4
chr4	25769319	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:0|1:25769319_T_C:25769319:6,4,2,2
chr4	25769327	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0|1:25769319_T_C:25769319:5,5,2,1
chr4	25780599	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=170,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr4	25780891	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=200,233;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr4	25792247	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=224,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:25792247_A_G:25792247:0,3,0,1
chr4	25792249	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=224,146;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:25792247_A_G:25792247:0,3,0,1
chr4	25803830	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=181,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:3,0,3,3
chr4	25804063	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=195,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,0:7,7:7,8,0,7
chr4	26364300	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=179,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,0,5
chr4	26387959	.	AT	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=110,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.462:21:1,6:4,4:6,5,6,4
chr4	26417068	.	GT	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.312:11:5,1:2,1:3,5,1,2
chr4	26422255	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,46;MMQ=60,29;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:13,4:16,0:15,14,3,1
chr4	26483208	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=174,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.335:13:5,2:3,2:9,0,4,0
chr4	26491156	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=261,222;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr4	26491974	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	26615982	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	26616196	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=314,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	26690045	.	A	ACATATCTGTGAAGC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=168,198;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:1,8,0,2
chr4	26719692	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr4	26721578	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=213,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	26737063	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,7:1,4:1,1,6,7
chr4	26959207	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:8,0,3,0
chr4	26997101	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:5,10,0,2
chr4	27000995	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:1,3,0,5
chr4	27004490	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=179,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr4	27009062	.	CT	C,CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34,33;MFRL=189,212,233;MMQ=60,60,60;MPOS=25,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=3.55,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.300,0.300:7:0,1,1:3,1,1:3,0,4,0
chr4	27019664	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=240,132;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27019664_A_T:27019664:0,1,0,1
chr4	27019665	.	G	GTTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=240,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27019664_A_T:27019664:0,1,0,1
chr4	27019666	.	G	GCA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=240,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:27019664_A_T:27019664:0,1,0,1
chr4	30723330	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:9,5,1,1
chr4	30726180	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=167,98;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,3:2,0:3,5,1,2
chr4	36109409	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	36123024	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=193,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr4	36130375	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=200,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:1,5:2,2:1,2,2,5
chr4	36149025	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=150,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,5:3,8:0,3,4,9
chr4	36149113	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr4	36160340	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:3,1:9,3:8,4,3,1
chr4	36162273	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=90,226;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.335:7:2,2:3,0:1,4,0,2
chr4	37447753	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=193,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:9,3:12,0:8,13,3,0
chr4	37590570	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=212,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	37592602	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=45.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.656:30:6,8:4,12:0,10,0,20
chr4	37592674	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=221,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr4	37636750	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,4:4,1:0,8,1,4
chr4	37841430	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=140,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,0:4,5:3,2,4,1
chr4	37848530	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=65,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,3:3,1,2,3
chr4	37848827	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:8,0:17,4:11,14,0,4
chr4	37850312	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:1,4,1,1
chr4	38019917	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,0:6,2:8,1,2,0
chr4	38022167	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,5:3,6:8,2,8,3
chr4	38047545	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:1,2:6,3:2,5,0,6
chr4	38047613	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=204,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:0,8,1,1
chr4	38047618	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=193,270;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr4	38055946	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=146,147;MMQ=60,21;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:6,10,0,4
chr4	38097478	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=144,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr4	38119885	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=206,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr4	38134423	.	GTT	G,GT,GTTT	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,31,32,32;MFRL=147,146,130,142;MMQ=60,60,60,60;MPOS=13,18,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,14,15,17;RU=T;STR;TLOD=5.46,6.78,6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:13,3,5,7:0.113,0.177,0.247:28:7,2,4,3:6,1,1,4:9,4,11,4
chr4	38134442	.	C	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=14,16;MFRL=128,130;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,13:0.202:60:12,0:5,0:36,11,13,0
chr4	38698924	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=191,143;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.714:19:4,6:1,8:1,4,2,12
chr4	38829163	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=137,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,1:15,1:12,12,2,0
chr4	38880046	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=142,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,1:10,1:4,12,2,0
chr4	38880136	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=198,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	38930921	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,1:3,2:3,5,1,2
chr4	38930985	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,10;MFRL=150,304;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.392:3:1,0:1,0:0|1:38930985_T_TAA:38930985:0,2,0,1
chr4	38930995	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=187,304;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.296:5:1,1:3,0:0|1:38930985_T_TAA:38930985:0,4,0,1
chr4	38933859	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=162,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:6,0:9,2:7,8,1,1
chr4	38942697	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=19,35;MFRL=162,225;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:0,1:1,2:0,3,1,2
chr4	38944976	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,313;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	39064126	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=251,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:0,7:2,6:2,0,11,2
chr4	39064162	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=147,129;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,20:0.915:21:0,11:1,9:1,0,14,6
chr4	39105183	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=222,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,0:2,8:0,3,0,8
chr4	39109399	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=209,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr4	39114559	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=196,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr4	39114637	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=153,39;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,2:8,0:9,4,1,1
chr4	39116775	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=204,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,8:3,1:4,3,6,3
chr4	39122577	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=193,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:7,2,3,1
chr4	39184297	.	AAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=202,255;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AG;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr4	39187521	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=139,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.506:6:1,0:2,3:0|1:39187521_TG_T:39187521:0,3,0,3
chr4	39187522	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,6:0.883:6:0,2:0,4:1|0:39187521_TG_T:39187521:0,0,0,6
chr4	39205365	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr4	39216377	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=166,270;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.219:12:4,2:2,0:0,10,0,2
chr4	39226486	.	AT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.503:8:3,2:0,2:4,0,4,0
chr4	39233948	.	G	GAATACTTTTACACTGTTGGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=251,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.313:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr4	39233977	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=244,314;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	39241821	.	A	ATT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,251;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39241821_A_ATT:39241821:0,0,1,0
chr4	39241822	.	AGG	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,251;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:39241821_A_ATT:39241821:0,0,1,0
chr4	39255496	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:5,3,2,1
chr4	39271541	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,258;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,1,1
chr4	39276623	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,2,2
chr4	39279724	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.587:20:3,5:4,2:2,6,10,2
chr4	39279790	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=151,145;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:14,3:10,0:13,11,0,3
chr4	39279907	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:6,3:5,1:3,8,0,4
chr4	39297200	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=170,286;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:0|1:39297200_G_A:39297200:6,4,2,0
chr4	39297211	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=238,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,6:0.466:13:2,3:5,3:1|0:39297200_G_A:39297200:4,3,4,2
chr4	39301605	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr4	39303925	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=129,149;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:4,5:5,5,5,4
chr4	39308187	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=97,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:6,8:3,4:6,3,5,7
chr4	39318706	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:0,6,0,2
chr4	39321969	.	CAA	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=130,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=21,19;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.420:14:3,2:1,2:4,4,4,2
chr4	39321987	.	AAAAC	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=129,215;MMQ=60,52;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.113:34:15,1:12,1:15,16,3,0
chr4	39329102	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=73,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:1,1,5,2
chr4	39343940	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:3,3,7,1
chr4	39353122	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr4	39408882	.	A	ATGGAATGGAATGGAATGG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,2:10,0:10,8,0,2
chr4	39409416	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:0,7,1,2
chr4	39439478	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,4:8,0:5,10,0,4
chr4	39447972	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=160,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:6,2,2,0
chr4	39448529	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=205,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr4	39448542	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,2,3
chr4	39449824	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	39456392	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,3:1,4:2,0,6,1
chr4	39459154	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=146,222;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:6,2:10,1:11,6,2,1
chr4	39459724	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr4	39463903	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=197,97;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:5,5:6,6:7,4,5,6
chr4	39469279	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:8,2:8,0:10,6,1,1
chr4	39472786	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,152;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:2,2,3,1
chr4	39472946	.	CTT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=213,117;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:2,1:2,1:4,1,1,2
chr4	39478832	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=261,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	39501722	.	CAAAA	C,CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,35,33;MFRL=0,168,175;MMQ=60,60,60;MPOS=19,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,15;RU=A;STR;TLOD=7.26,13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,11:0.274,0.540:19:1,3,6:1,2,4:2,1,8,8
chr4	39511530	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=176,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.296:11:3,2:5,1:0,8,0,3
chr4	39747536	.	A	G	.	.	DP=78;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=246.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,65:0.986:65:0,26:0,38:0,0,0,65
chr4	39776627	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=247,131;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	39847505	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=109,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.290:16:8,1:3,3:5,7,0,4
chr4	39851058	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=132,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr4	39871117	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=195,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.596:8:0,3:2,2:0,3,1,4
chr4	39903924	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=141,238;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:10,3,2,0
chr4	39904136	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=19,11;MFRL=200,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.413:7:0,0:1,0:0,4,0,3
chr4	39904142	.	ATTT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=176,301;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr4	39910172	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=249,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	39918636	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.590:8:1,1:2,2:3,0,2,3
chr4	39924372	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=163,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.755:6:0,2:0,1:0,1,2,3
chr4	39928382	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=99,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:10,3,2,1
chr4	40123351	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=123,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:16,0:11,2:14,13,1,1
chr4	40245005	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=171,192;MMQ=60,59;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.130:36:16,4:16,0:14,18,4,0
chr4	40245036	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=164,192;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.136:42:21,5:16,0:18,19,4,1
chr4	40337944	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:5,7:4,2:3,6,3,6
chr4	40438576	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.791:22:1,4:3,13:4,0,8,10
chr4	40809207	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=221,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:2,1:3,4,1,1
chr4	40818013	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:5,1,2,0
chr4	40818114	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=129,124;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:7,0:10,3:8,9,0,3
chr4	41266046	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=186,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:8,2,2,0
chr4	41270055	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=135,85;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:7,3:11,0:9,9,2,1
chr4	41615249	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=376,262;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=24.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:0,1,0,9
chr4	41615664	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=130,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.110:25:9,0:13,2:0|1:41615664_G_T:41615664:10,13,1,1
chr4	41615669	.	AGCAGCG	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=142,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:10,0:14,2:0|1:41615664_G_T:41615664:10,17,1,1
chr4	41615690	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=221,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:2,10:2,9:0,4,6,13
chr4	41646651	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=195,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,1:9,3:11,7,3,1
chr4	41652442	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=150,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,2:6,5:7,4,5,2
chr4	41684342	.	C	CATCTTGACAGTT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=191,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:41684342_C_CATCTTGACAGTT:41684342:3,2,1,1
chr4	41684345	.	C	CCAGG	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=191,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:41684342_C_CATCTTGACAGTT:41684342:3,2,1,1
chr4	41684346	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=191,47;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.324:7:3,2:2,0:0|1:41684342_C_CATCTTGACAGTT:41684342:3,2,1,1
chr4	41691709	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=85,221;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	41699137	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.231:37:13,8:16,0:18,11,8,0
chr4	41699154	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:24,0:11,2:0|1:41699154_G_GT:41699154:19,16,0,2
chr4	41699157	.	G	GT	.	.	DP=38;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:23,0:12,2:0|1:41699154_G_GT:41699154:20,16,0,2
chr4	41748007	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,355;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	41941462	.	G	GTGTAGCTGTCATTATGTTGAAA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=212,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.289:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	41956251	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=144,262;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:3,0:8,2:0|1:41956251_G_A:41956251:1,10,0,2
chr4	41956255	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=145,262;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:2,0:7,2:0|1:41956251_G_A:41956251:1,9,0,2
chr4	41985272	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=149,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.693:10:1,3:2,3:1,2,4,3
chr4	41986857	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=203,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:0,9:2,8:0,2,7,10
chr4	41987125	.	G	GTA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TA;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:6,2:4,3:7,3,3,2
chr4	41987233	.	CA	C,CAA	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,35,36;MFRL=136,171,186;MMQ=60,60,24;MPOS=25,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=5.35,21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,4,10:0.172,0.400:25:5,2,2:6,2,8:4,7,2,12
chr4	41987266	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=179,186;MMQ=60,24;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:9,0:10,6:5,14,0,6
chr4	41988385	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=226,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=31.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:1,5:1,2,1,7
chr4	42003671	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.886:15:1,7:0,7:1,0,8,6
chr4	42003835	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,10:1,4:0,2,4,10
chr4	42024982	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr4	42025049	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	42040947	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,13,1
chr4	42065144	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=136,98;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:6,8,0,3
chr4	42069029	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	42080152	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=159,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,2:1,0:6,0,2,0
chr4	42402992	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=128,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:4,1,5,0
chr4	42403561	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=199,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:0,5,0,3
chr4	42457516	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=117,115;MMQ=60,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:7,7:13,0:13,7,7,0
chr4	42466641	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:3,0,4,1
chr4	42571074	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,17,3
chr4	42580397	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=169,209;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:11,0:5,5:8,9,0,5
chr4	42580428	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=178,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:3,3:3,1:1,5,0,4
chr4	42582047	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=33.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr4	42592935	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=216,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr4	42602606	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,5:0,11:0,0,6,10
chr4	42626521	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,0:10,6:11,6,6,0
chr4	42626659	.	GAAA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=93,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.208:19:4,1:1,1:3,12,2,2
chr4	42627805	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	42658902	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,4:5,2:1,6,1,5
chr4	42965159	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=138,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=30.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,9:4,2:2,4,4,7
chr4	43032612	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=220,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:1,4:1,5:0,2,0,9
chr4	44631514	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=144,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:2,1:6,4,2,0
chr4	44631587	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=196,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:4,1:0,4:1,4,1,5
chr4	44651968	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:2,1,3,0
chr4	44652187	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=36,35;MFRL=160,245;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,2:1,7:0,1,0,9
chr4	44652214	.	A	AACACTG	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=25,26;MFRL=197,244;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:0|1:44652214_A_AACACTG:44652214:0,6,0,4
chr4	44652217	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=197,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,0:2,4:0|1:44652214_A_AACACTG:44652214:0,6,0,4
chr4	44682661	.	CT	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:9,3:8,2:13,7,3,2
chr4	44684455	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=78.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,15:0,9:0,0,4,20
chr4	44684507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr4	44685224	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,6,4
chr4	44685225	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,10:0.921:10:0,5:0,4:0|1:44685224_T_TA:44685224:0,0,6,4
chr4	44685236	.	ATT	A,AT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,32,28;MFRL=112,119,155;MMQ=60,60,60;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=4.04,6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,3,4:0.184,0.254:18:4,2,4:7,1,0:7,4,6,1
chr4	44691206	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	44691795	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:2,3:4,4:6,0,7,0
chr4	44696538	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,4,14
chr4	44699484	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:5,5:0,3:2,3,5,3
chr4	44699506	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=183,99;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:5,6:0,1:1,4,3,4
chr4	44709695	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr4	44712908	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=166,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr4	44713156	.	T	TGCACCTTTACTATCAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=158,58;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:7,2:3,0:4,6,1,1
chr4	44713235	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:2,4:0,3:0,2,0,7
chr4	44719048	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=173,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr4	44720248	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=44.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,9:0,5:2,0,14,0
chr4	46263862	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=233,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:46263862_A_AG:46263862:1,0,3,0
chr4	46263864	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=233,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0|1:46263862_A_AG:46263862:1,0,3,0
chr4	46314593	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=117,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,1:6,1:5,9,2,0
chr4	46388044	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,0:5,2:8,1,2,0
chr4	47033770	.	TCG	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=135,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.438:21:8,4:4,5:0|1:47033770_TCG_T:47033770:4,8,4,5
chr4	47033772	.	GCT	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CT;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,7:0.479:14:4,4:2,3:1|0:47033770_TCG_T:47033770:2,5,2,5
chr4	47034032	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=140,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:5,0:11,3:4,12,3,0
chr4	47034081	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=31,18;MFRL=136,267;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,0:0|1:47034081_G_C:47034081:0,3,0,3
chr4	47034088	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=136,267;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:2,0:0|1:47034081_G_C:47034081:0,3,0,3
chr4	47034104	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,24;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0|1:47034081_G_C:47034081:0,0,0,3
chr4	47163253	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=14,20;MFRL=358,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.486:4:0,0:0,1:0|1:47163253_C_G:47163253:2,0,2,0
chr4	47163263	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,15;MFRL=254,358;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.600:3:0,0:1,0:1|0:47163253_C_G:47163253:1,0,2,0
chr4	47163277	.	CA	AC	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,10;MFRL=358,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:47163253_C_G:47163253:2,0,1,0
chr4	47524961	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,28;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:7,1,4,0
chr4	47524997	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.316:16:5,1:5,4:11,0,4,1
chr4	47525009	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=66.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,7:0,12:0,0,14,5
chr4	47527537	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,2:13,0:13,5,1,1
chr4	47538044	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:6,6:7,4:7,6,4,6
chr4	47538360	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=214,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,4:0,8:3,0,12,0
chr4	47560386	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=247,248;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr4	47561141	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=187,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr4	47589299	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr4	47592997	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=163,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0|1:47592997_G_GT:47592997:2,0,3,0
chr4	47593008	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=15,35;MFRL=211,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:0,1:0|1:47592997_G_GT:47592997:1,0,3,0
chr4	47605318	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=201,271;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	47625811	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,1,3
chr4	47625968	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,144;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:7,5,0,2
chr4	47667257	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=203,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:9,4:6,0:7,8,4,0
chr4	47679928	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:3,1,3,2
chr4	47853843	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=255,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:2,0,2,2
chr4	47857040	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=187,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=55.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,17:0.601:28:6,6:5,11:6,5,8,9
chr4	47881191	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,0:7,2:0,8,0,2
chr4	47886319	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=157,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:6,2:3,2:8,1,2,2
chr4	47886329	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,3:4,0:4,4,3,0
chr4	47898491	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr4	47901155	.	CAAAAAA	C,CAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34,17;MFRL=144,156,180;MMQ=60,60,60;MPOS=15,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=22,16,19;RU=A;STR;TLOD=7.96,6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.447,0.341:6:1,0,0:0,3,0:0,1,1,4
chr4	47901315	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr4	47905158	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,6:0,4:1,0,9,1
chr4	47944029	.	CAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	47945275	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=137,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,0:15,3:11,12,2,1
chr4	47945295	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.211:30:9,0:12,5:10,14,5,1
chr4	47951945	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=403,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,5:0,7:0,1,5,7
chr4	47953515	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=218,242;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	48037926	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:3,5:0,4:2,1,3,6
chr4	48069725	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=163,172;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,8:1,3:0,6,5,6
chr4	48073501	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr4	48076091	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,1:3,1:6,5,1,1
chr4	48078593	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	48081896	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=171,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.709:8:1,2:1,4:2,0,6,0
chr4	48082208	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	48088419	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=177,355;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:5,3,1,1
chr4	48088446	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr4	48114397	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=171,100;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:8,3:17,0:14,11,3,0
chr4	48139565	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr4	48147612	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:0,3,0,5
chr4	48152960	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=138,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:8,2:12,0:12,8,0,2
chr4	48165834	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:6,2:1,1:0|1:48165834_T_C:48165834:1,6,0,3
chr4	48165835	.	T	TGAAA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=200,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GAAA;STR;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.330:10:6,2:1,1:0|1:48165834_T_C:48165834:1,6,0,3
chr4	48165888	.	CTTA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=223,285;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTA;STR;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.502:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	48169769	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=128,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:4,4:2,7:4,2,6,5
chr4	48170669	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=195,186;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,0:7,5:1,7,2,3
chr4	48172218	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr4	48173547	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=207,222;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr4	48178003	.	A	AAATCAGCC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=150,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AATCAGCC;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,2:4,1:4,0,3,0
chr4	48343693	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=197,174;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:4,1:7,1:10,1,2,0
chr4	48343732	.	AGGC	A,AGGCGGCGGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29,28;MFRL=157,193,147;MMQ=60,60,60;MPOS=27,28;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,4,7;RU=GGC;STR;TLOD=6.34,10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.212,0.343:9:3,0,0:1,2,3:4,0,4,1
chr4	48372085	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=218,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	48492434	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	48516970	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	48523041	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=145,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:3,8:9,0:8,4,0,9
chr4	48529683	.	TAA	T,TA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,28,28;MFRL=216,173,116;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=9.18,10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,5,7:0.341,0.444:15:1,2,5:1,2,2:0,3,1,11
chr4	48529733	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,1:0,5:0,0,2,5
chr4	48533148	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=53.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr4	48537603	.	T	TACACAC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,178;MMQ=60,45;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,17;RU=AC;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	48541973	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,13:0,9:0,0,20,2
chr4	48553586	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=183,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:8,3:6,0:5,9,1,2
chr4	48572782	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,168;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:10,1,0,2
chr4	48573028	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	48577121	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.952:18:0,7:0,10:0,0,10,8
chr4	48582836	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	48583061	.	AT	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=219,203;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr4	48591791	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=142,51;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:7,0:10,4:11,6,2,2
chr4	48596036	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.602:13:2,4:3,4:3,2,2,6
chr4	48607938	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr4	48610961	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=146,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.578:17:4,4:3,6:6,1,8,2
chr4	48611153	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,1,9
chr4	48611929	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=168,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,2:3,6:0,4,0,8
chr4	48625086	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,0:12,3:14,7,3,0
chr4	48625204	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=125,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.304:15:4,2:6,3:0,10,3,2
chr4	48625212	.	AC	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=117,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:3,2:8,1:3,8,0,3
chr4	48625213	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,5:0,11:0,0,3,13
chr4	48636434	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=91,250;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.204:23:10,3:8,1:7,12,1,3
chr4	48894981	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=159,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr4	48896125	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=202,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr4	48990476	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.895:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	48993610	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:3,1:3,2:3,4,0,3
chr4	48994138	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.651:18:4,4:2,8:0,6,2,10
chr4	49034669	.	CA	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.306:24:11,3:6,4:8,9,2,5
chr4	52729635	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=139,48;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.096:29:17,0:10,2:0|1:52729635_G_T:52729635:16,11,1,1
chr4	52729640	.	T	TTA	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=166,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:16,0:12,2:0|1:52729635_G_T:52729635:15,14,1,1
chr4	52729644	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=166,48;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,0:11,2:0|1:52729635_G_T:52729635:15,16,1,1
chr4	52729646	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=168,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:18,0:12,2:0|1:52729635_G_T:52729635:14,16,1,1
chr4	52779651	.	G	GTTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=220,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TTA;STR;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:5,1:3,1:5,3,0,2
chr4	52860887	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,101;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,4:7,0:5,5,4,0
chr4	52863824	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=158,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr4	52894142	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,127;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,3:9,0:10,7,3,0
chr4	52894797	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=139,267;MMQ=60,41;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr4	52894798	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=196,124;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:3,0,1,0
chr4	52895891	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=164,99;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,0:12,4:11,10,0,4
chr4	52896050	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,1,2
chr4	52927113	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,5:1,4:0,3,0,9
chr4	52928352	.	GTT	G,GT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33,35;MFRL=0,209,164;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,16,17;RU=T;STR;TLOD=5.36,5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,3:0.444,0.444:6:0,1,2:0,2,1:0,0,6,0
chr4	52946161	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	52951206	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=158,90736703;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr4	52951213	.	CTT	C,CT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35,36;MFRL=0,92,90736703;MMQ=60,60,60;MPOS=21,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.20,3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.587,0.248:3:0,1,0:0,1,1:0,0,0,3
chr4	52960908	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=189,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,3,4
chr4	53463763	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=206,68;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:4,1,2,2
chr4	53476693	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=176,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,0:6,4:11,2,1,3
chr4	53729429	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=134,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,3:8,6:8,6,4,5
chr4	53740236	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.303:17:5,1:6,3:6,6,2,3
chr4	54179854	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=173,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,2:10,0:11,13,2,0
chr4	54232001	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=172,38022107;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:0,7,1,1
chr4	54243905	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	54244174	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.668:16:2,7:3,4:0,5,0,11
chr4	54245476	.	A	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=122.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,17:0,21:0,0,10,29
chr4	54248502	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=210,136;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,0:9,3:9,9,2,1
chr4	54280705	.	GAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=167,84;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	54291954	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=217,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr4	54310188	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,9:0,3:0,0,7,5
chr4	54310340	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=32.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,1,10
chr4	54319011	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr4	54327211	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=180,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,0:4,2:0,6,0,2
chr4	54327235	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,2:0,9:0,0,0,11
chr4	54327584	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,11,3
chr4	54362150	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,0:3,4:3,0,3,1
chr4	54373464	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=216,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:11,5:5,3:13,4,3,5
chr4	54852693	.	CTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,5;RU=TTTTA;STR;TLOD=35.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,6:0,2:0,0,7,1
chr4	54880331	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=158,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:5,2:4,12,0,2
chr4	54966830	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,9,5
chr4	54967709	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=222,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,5,1
chr4	55125058	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=165,231;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,1:2,1:0,6,2,0
chr4	55131001	.	TAA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=258,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr4	55139978	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	55144447	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	55146406	.	T	TTGTAGGTCCCCCAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=47.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,6:0,0,10,1
chr4	55151711	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr4	55151958	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,0:0,0,2,1
chr4	55156380	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,5,0
chr4	55156400	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr4	55161254	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,8:0,8:0,0,11,5
chr4	55161517	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,266;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	55161537	.	G	GTTTT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=297,235;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:55161537_G_GTTTT:55161537:0,3,0,1
chr4	55161538	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=297,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:55161537_G_GTTTT:55161537:0,3,0,1
chr4	55946081	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,5:0,9:0,0,12,3
chr4	55948108	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=48.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,10,3
chr4	55955232	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	55955737	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=281,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.663:7:1,1:1,3:1,1,3,2
chr4	55961159	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:6,3:2,1:3,5,0,4
chr4	55967986	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	55968053	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=170,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr4	55976947	.	TA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=22,18,20,11;MFRL=60,49,76,113;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,20,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,12,14,15;RU=A;STR;TLOD=5.35,8.27,3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,4,6,4:0.235,0.365,0.241:16:0,1,3,0:1,1,1,1:0,2,5,9
chr4	55980239	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:4,2,1,1
chr4	55987207	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr4	55987454	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,0:4,8:0,8,0,8
chr4	56235897	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=222,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.507:2:0,0:1,1:1,0,1,0
chr4	56235928	.	TTGCGAGTGAAGTGGTGAAACTTTCTTTTCAAACCTTTAAATGCTTATGAGATCTTCTTTTACCCTTTCAGGAG	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=145,106;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.185:21:1,1:3,3:11,6,4,0
chr4	56235931	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=22,28;MFRL=216,73;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:0,1:1,1:2,0,1,1
chr4	56236091	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=153,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:7,2:8,8,0,3
chr4	56262374	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr4	56291479	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=156,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:1,1:3,2:5,0,3,0
chr4	56291528	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=146,137;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,3:3,8:6,4,9,2
chr4	56291620	.	CAA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=110,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:7,5:8,4:4,11,2,7
chr4	56319350	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=181,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:1,0:6,2:3,4,0,2
chr4	56322244	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=255,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=17.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,1:1,5:2,0,6,1
chr4	56342326	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=226,358;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.561:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr4	56428820	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=202,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:1,3,0,6
chr4	56435849	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:5,0,2,1
chr4	56448235	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=139,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr4	56465418	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr4	56466653	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=133,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,2:0,5:4,0,6,1
chr4	56471551	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=127,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:2,4:4,4:2,4,2,7
chr4	56502307	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	56734701	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:6,6:6,7:4,8,5,8
chr4	56736794	.	T	TTTTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=169,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=TTTG;STR;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,3:2,1:4,0,4,0
chr4	56758700	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=184,296;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	56758857	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=184,31;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0|1:56758857_A_C:56758857:2,5,1,1
chr4	56758858	.	C	CTCCCCCATTCCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=184,31;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0|1:56758857_A_C:56758857:2,5,1,1
chr4	56759773	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,23;MFRL=182,87;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:2,0:4,2:3,3,2,0
chr4	56768601	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=152,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:7,2:8,1:8,7,2,1
chr4	56768790	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=261,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0,8,0,2
chr4	56830605	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:0,4,0,3
chr4	56835114	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=199,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr4	56840846	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr4	56858007	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=182,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr4	56865884	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=162,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:56865884_G_A:56865884:0,3,0,1
chr4	56865897	.	CA	TG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:56865884_G_A:56865884:0,4,0,1
chr4	56865900	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=186,138;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:56865884_G_A:56865884:0,4,0,1
chr4	56878193	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=198,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,3:7,1:0,12,0,4
chr4	56884079	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=196,217;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	56885581	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=135,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:14,1:9,2:13,10,0,3
chr4	57176955	.	T	TC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=C;STR;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:57176955_T_TC:57176955:0,0,0,3
chr4	57176974	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=237,272;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:57176955_T_TC:57176955:0,3,0,1
chr4	57189498	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,1:2,4:2,0,4,1
chr4	57193762	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,246;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr4	57208955	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=215,164;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:3,2:7,0,3,0
chr4	57211352	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,125;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,4:9,2:5,7,3,3
chr4	57248591	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr4	57267124	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:3,1,2,3
chr4	57269363	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,2:5,0:8,5,0,2
chr4	57269579	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:1,7,1,4
chr4	57269646	.	A	AAAAG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	57272612	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=192,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:57272612_C_T:57272612:4,0,1,0
chr4	57272620	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=192,94;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0|1:57272612_C_T:57272612:4,0,2,0
chr4	57301478	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=189,116;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,0:1,2:2,0,1,1
chr4	57312387	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=219,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	57314903	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=160,131;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:8,0:8,4:6,10,4,0
chr4	57319694	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=174,146;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.280:5:1,0:2,1:4,0,1,0
chr4	57333927	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=229,252;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.116:24:13,0:8,2:8,14,0,2
chr4	57340592	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,5:1,2:1,3,1,6
chr4	57349282	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,5:5,3:4,4,6,2
chr4	57384894	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=170,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.170:33:14,5:14,0:12,16,5,0
chr4	57516896	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,115;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.690:14:3,7:1,3:1,3,4,6
chr4	57521972	.	GGCTCAGCC	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr4	57522232	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=304,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:57522232_G_A:57522232:0,2,0,1
chr4	57522240	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=304,230;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:57522232_G_A:57522232:0,2,0,1
chr4	57523869	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=192,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.649:15:0,5:5,5:3,2,6,4
chr4	57686849	.	C	CTAGAGTGCAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=174,246;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:57686849_C_CTAGAGTGCAG:57686849:0,4,0,1
chr4	57686852	.	G	GCGCAATCTCGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=174,246;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:57686849_C_CTAGAGTGCAG:57686849:0,4,0,1
chr4	57777283	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,95;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.183:25:13,0:8,3:10,11,0,4
chr4	57796900	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=196,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.349:17:7,2:4,1:7,4,6,0
chr4	57798174	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=135,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:4,4:6,2:5,5,2,4
chr4	57830501	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=117,193;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	57830663	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=175,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:3,3,2,5
chr4	57861091	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=32,10;MFRL=281,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,0:1,0:0|1:57861091_G_T:57861091:0,3,0,3
chr4	57861095	.	TG	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,15;MFRL=281,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:2,1:0,0:0|1:57861091_G_T:57861091:0,3,0,3
chr4	57861096	.	GAAAAAAAA	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=10,32;MFRL=286,291;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,8;RU=A;STR;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,2:0.618:3:0,2:0,0:1|0:57861091_G_T:57861091:0,1,0,2
chr4	57861097	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.819:3:0,0:0,0:0|1:57861091_G_T:57861091:0,0,0,3
chr4	57861117	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,25;MFRL=0,281;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:57861091_G_T:57861091:0,0,0,5
chr4	57861358	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=232,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr4	57871400	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=129,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:5,2:4,4:6,3,4,2
chr4	57871750	.	T	TTC	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.218:20:7,3:7,2:12,3,2,3
chr4	57881581	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	57883175	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=126,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,5:0,6:0,1,9,2
chr4	57887252	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=187,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:1,1:2,2:0,4,0,3
chr4	57888510	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=218,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:0,4,0,4
chr4	57891239	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=225,189;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr4	57897570	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=157,258;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	57906986	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=174,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:4,3,2,0
chr4	62453209	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=237,215;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0,7,0,2
chr4	62599289	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=133,116;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:3,5:5,3:1,7,3,6
chr4	62758398	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=205,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:9,2:6,6:8,7,4,4
chr4	62758491	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:6,2:3,2:5,4,3,1
chr4	62758736	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=32,22;MFRL=217,228;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.568:12:3,0:2,6:0|1:62758736_G_A:62758736:0,5,0,7
chr4	62758741	.	CTTTTCCTTTTCCTT	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=30,36;MFRL=217,228;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.566:12:2,0:2,6:0|1:62758736_G_A:62758736:0,5,0,7
chr4	62758761	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,28;MFRL=215,228;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62758736_G_A:62758736:0,2,0,1
chr4	62758767	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,32;MFRL=215,228;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:62758736_G_A:62758736:0,2,0,1
chr4	62758771	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=31,19;MFRL=215,228;MMQ=60,53;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:62758736_G_A:62758736:0,2,0,1
chr4	62758773	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=34,32;MFRL=215,228;MMQ=60,53;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:0|1:62758736_G_A:62758736:0,2,0,1
chr4	62775479	.	ATGTG	A,ATG	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=0,28,25;MFRL=0,232,160;MMQ=60,60,60;MPOS=15,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,18,19;RU=TG;STR;TLOD=3.59,61.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,24:0.119,0.851:27:0,1,15:0,2,8:0,0,5,22
chr4	62775485	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=61.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,24:0.875:27:1,14:1,6:0,3,5,19
chr4	62800554	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,8,8
chr4	62800728	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	62861941	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.749:14:1,8:2,2:2,1,7,4
chr4	62861964	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.790:17:1,10:2,4:2,1,10,4
chr4	62897192	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=123,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,2:7,0:6,8,1,1
chr4	65145955	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,4:0,4:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,9
chr4	65145966	.	T	TAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0|1:65145955_T_G:65145955:0,0,0,8
chr4	65146700	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,9,3
chr4	65146711	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=38.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,2:0,10:0,0,8,4
chr4	65165660	.	CG	TA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.233:15:8,1:4,2:0|1:65165660_CG_TA:65165660:9,3,1,2
chr4	65165661	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,17:0.947:17:0,10:0,7:1|0:65165660_CG_TA:65165660:0,0,10,7
chr4	65165849	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=196,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr4	65180310	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=36.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.686:17:3,9:2,2:5,0,10,2
chr4	65240805	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,6:0,0:0,0,6,0
chr4	65240822	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=156,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:7,2:0,0:4,3,2,0
chr4	65240967	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=159,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,2,4
chr4	66218728	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=160,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=69.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,23:0.889:25:1,8:1,15:1,1,12,11
chr4	66218805	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:6,0:5,2:3,8,1,1
chr4	66218917	.	G	GTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=194,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=TA;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	66231686	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:11,3:9,1:7,13,1,3
chr4	66233029	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr4	66286088	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr4	66286100	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr4	66286237	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:6,2:5,0:0|1:66286237_GT_G:66286237:6,5,1,1
chr4	66286244	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=143,109;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:0|1:66286237_GT_G:66286237:6,6,1,1
chr4	66356248	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,0:6,2:9,10,0,2
chr4	66509194	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,3:1,5:0,5,0,8
chr4	67142470	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:3,3:6,0:6,3,3,1
chr4	67142691	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=203,216;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.383:8:2,0:3,2:0,5,0,3
chr4	67142703	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=230,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,0:2,3:0,2,0,3
chr4	68360955	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=120,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=46.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:2,3:0,11:1,1,3,11
chr4	68374597	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=136,183;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.288:18:7,2:6,2:6,7,4,1
chr4	68384861	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=129,247;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,0:3,3:8,1,3,0
chr4	68384908	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=20,30;MFRL=114,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:9,3:6,4:8,7,7,0
chr4	68385143	.	A	AT	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=133,130;MMQ=60,28;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.422:36:12,0:8,15:12,9,0,15
chr4	68396525	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=172,237;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:6,1,0,2
chr4	68406882	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=199,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr4	68410009	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=272,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0|1:68410009_C_T:68410009:0,4,0,2
chr4	68410030	.	T	TCTCTCACACAGCTCTGCTGAGGGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=302,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.322:4:2,1:1,0:0|1:68410009_C_T:68410009:0,3,0,1
chr4	68441091	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,3:1,6:4,1,5,4
chr4	68442968	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=195,109;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,9:1,7:0,1,12,5
chr4	68447200	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=205,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,9:1,3:4,2,4,8
chr4	68447249	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=150,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:0,4,2,0
chr4	68458937	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,56;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.189:14:4,1:7,1:10,2,2,0
chr4	68490019	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=147,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,4:3,7:1,5,4,7
chr4	68490044	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=154,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,4:2,2:0,3,0,6
chr4	68490650	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=154,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr4	68492060	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,3:3,3:4,1,5,1
chr4	68492244	.	T	TAA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,2:2,2:0,3,1,3
chr4	68496080	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,3,1
chr4	68497333	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=177,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,5,1
chr4	68499205	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=174,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:1,2:3,0:0,6,0,2
chr4	68500052	.	AAAAGAAAAAAAAAATTACAAATAGAAGTCTGTTTAAAGTCAGAAATATCTTCTTTCTCACTTC	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.090:32:7,2:7,0:16,14,1,1
chr4	68514739	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=153,254;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,0:5,4:4,3,2,2
chr4	68528744	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=211,262;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr4	68543240	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	68544318	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:0,3,1,5
chr4	68547165	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=168,152;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,2:6,0,4,2
chr4	68547774	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:9,0,2,0
chr4	68547809	.	A	ATAC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=130,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=64.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.708:22:2,6:4,10:4,2,13,3
chr4	68620063	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620068	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,30;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620070	.	GCTT	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620075	.	AAG	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=28,26;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620079	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=36,32;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68620086	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=36,27;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.503:2:0,0:1,1:0|1:68620063_G_A:68620063:0,1,0,1
chr4	68703866	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,115;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:10,8:8,0:12,6,8,0
chr4	68777054	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=176,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:6,6:5,0:7,4,3,3
chr4	68780253	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=299,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,6,0
chr4	68780512	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=299,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr4	68788719	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=109,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr4	68789778	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=189,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:3,1,3,1
chr4	68789815	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=133,78;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:7,3:7,0:8,6,2,1
chr4	68829004	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.496:10:3,5:2,0:5,0,5,0
chr4	68829207	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,0,3
chr4	68919617	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=123,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.425:17:3,4:6,3:7,3,4,3
chr4	68934252	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=237,251;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr4	68934306	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=166,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:1,1,7,1
chr4	68937948	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=AT;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	68938002	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=126,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	68939842	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=228,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,0:2,13:0,4,0,13
chr4	68956422	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=267,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	68964768	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=185,263;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,0,2
chr4	69057073	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr4	69083563	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=198,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,6:3,2:3,3,6,2
chr4	69094926	.	TTAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:2,3:4,1:3,3,2,2
chr4	69097150	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,1:0,0,0,3
chr4	69098006	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=205,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,2:1,3:2,0,6,0
chr4	69100137	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr4	69101798	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,4:5,0:4,4,4,0
chr4	69101997	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=145,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.678:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	69203634	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=177,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,2:2,0:0,6,0,2
chr4	69215349	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	69327543	.	G	A	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=90.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,29:0.601:48:10,29:9,0:6,13,29,0
chr4	69340500	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,16142641;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,2:6,0:9,6,1,1
chr4	69342169	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=178,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,1:7,1:3,14,1,1
chr4	69362301	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,14,0
chr4	69362527	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=126,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.751:18:4,9:0,4:1,3,5,9
chr4	69416353	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=263,220;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,5:0,4:1,0,5,4
chr4	69417450	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,7,1
chr4	69433714	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=213,126;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,21:0.787:26:3,11:2,9:4,1,9,12
chr4	69434217	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr4	69528890	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,137;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,2,2
chr4	69536084	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,11:0,3:1,0,4,10
chr4	69681675	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,170;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	69682471	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr4	69682555	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr4	69683953	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	69687964	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=80.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,17:0,9:0,0,20,6
chr4	69687987	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=97.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,22:0,9:0,0,10,21
chr4	69795871	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,0,10
chr4	69796548	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,1,2
chr4	69796838	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,129;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=34.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,8,3
chr4	69810923	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	69962966	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=178,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.568:12:2,3:3,4:0,5,3,4
chr4	69964209	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=363,290;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	69964337	.	AT	TC	.	.	DP=61;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=96,294;MMQ=31,55;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:55,3:0.066:58:16,2:14,1:44,11,2,1
chr4	69978554	.	CAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=152,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.353:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr4	70066205	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=166,94183;MMQ=59,20;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,9:0.283:33:13,9:11,0:12,12,9,0
chr4	70146423	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,136;MMQ=60,53;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:7,1:6,5:6,7,4,2
chr4	70146687	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=172,162;MMQ=60,24;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,20:0.497:40:15,19:5,0:7,13,20,0
chr4	70146704	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=197,170;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,7:5,0:9,6,3,4
chr4	70152685	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=186,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:0,0:5,2:1,4,0,2
chr4	70155477	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=158,166;MMQ=51,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr4	70160309	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,31;MFRL=169,211;MMQ=60,51;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:6,1:5,3:3,8,1,3
chr4	70160338	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=133,215;MMQ=55,36;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:7,4:6,2:0|1:70160338_G_C:70160338:10,3,1,5
chr4	70160342	.	TG	CC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=139,215;MMQ=55,36;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,4:6,2:0|1:70160338_G_C:70160338:10,4,1,5
chr4	70346680	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=29,30;MFRL=144,297;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0|1:70346680_G_A:70346680:4,4,1,1
chr4	70346693	.	A	ATG	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=24,25;MFRL=133,165;MMQ=60,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,3,0,1
chr4	70346695	.	ACC	A	.	.	DP=5;ECNT=10;MBQ=24,24;MFRL=133,165;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.329:4:2,1:1,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,3,0,1
chr4	70346700	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=33,27;MFRL=133,165;MMQ=60,24;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:2,1:1,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,3,0,1
chr4	70346706	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=10;MBQ=34,28;MFRL=133,165;MMQ=60,24;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,1:1,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,3,0,1
chr4	70346711	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=314,165;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,1,0,1
chr4	70346715	.	CC	GG	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=31,32;MFRL=314,165;MMQ=60,24;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,1,0,1
chr4	70346721	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=26,31;MFRL=257,165;MMQ=52,24;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:2,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,2,0,1
chr4	70346723	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=10;MBQ=30,26;MFRL=257,165;MMQ=52,24;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,2,0,1
chr4	70346727	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=10;MBQ=27,27;MFRL=199,165;MMQ=43,24;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1|0:70346680_G_A:70346680:0,1,0,1
chr4	70355380	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,1,2
chr4	70361182	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=189,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,3:7,3:4,5,3,3
chr4	70455084	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,82;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:7,1,2,0
chr4	70465153	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr4	70592790	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=138,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:4,2:0,2:4,0,4,1
chr4	70599073	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,4,0
chr4	70620708	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=145,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr4	70713584	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0,9,0,2
chr4	70723444	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,4:0,0:0,4,0,4
chr4	70798436	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=195,290;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr4	70803380	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=269,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	70805829	.	TCA	T,TCACACA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31,32;MFRL=0,158,170;MMQ=60,60,40;MPOS=9,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,18,21;RU=CA;STR;TLOD=4.31,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.553,0.314:3:0,1,0:0,1,1:0,0,0,3
chr4	70811806	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=184,148;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:5,1,3,1
chr4	70824865	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=248,165;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr4	70824887	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=200,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,0,4
chr4	70826810	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=135,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	70864065	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr4	70896355	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=239,230;MMQ=49,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:5,0,7,0
chr4	70899037	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	70921164	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.918:10:0,6:0,3:0,0,3,7
chr4	70921337	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=115,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,2,4
chr4	71020205	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr4	71021888	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr4	71024010	.	T	TACAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAA;STR;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,6,3
chr4	71027213	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:2,1,4,2
chr4	71062308	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=212,123;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,6:7,1:2,7,5,2
chr4	71062342	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=219,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,3:10,2:6,10,2,3
chr4	71067317	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	71110639	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=150,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:2,2:6,1:2,6,0,3
chr4	71227802	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,177;MMQ=40,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:1,5,4,1
chr4	71227998	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=267,259;MMQ=52,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,2,0
chr4	71228001	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	71232493	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,19;MFRL=169,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.137:20:5,1:10,0:0|1:71232493_T_A:71232493:6,12,1,1
chr4	71232497	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=169,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,1:8,1:0|1:71232493_T_A:71232493:5,11,1,1
chr4	71250308	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,190;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,5,2
chr4	71250399	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr4	71255370	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=230,145;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.459:13:4,4:3,1:5,2,5,1
chr4	71255593	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=196,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:2,3:5,6:1,6,5,4
chr4	71275012	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr4	71275480	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=128,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:10,0:17,4:18,9,0,4
chr4	71275889	.	C	CTAAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TAAA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	71347694	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	71396989	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,2:7,1:7,8,1,2
chr4	71471966	.	G	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,155;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:23,0:14,4:12,26,0,4
chr4	71471974	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=144,139;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.201:27:13,0:9,5:11,11,0,5
chr4	71507969	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,101;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.395:26:10,0:5,10:4,12,0,10
chr4	71554619	.	CGAG	C	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=127,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GAG;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.088:34:16,1:11,2:15,16,3,0
chr4	71554626	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:22,0:13,2:20,19,1,1
chr4	71554690	.	GGGA	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=32,24;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGA;STR;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.115:23:9,0:11,1:13,8,0,2
chr4	71629196	.	ATG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=133,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,2:4,0:5,3,2,0
chr4	71656830	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=313,225;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:0|1:71656830_TG_T:71656830:2,0,3,0
chr4	71656834	.	T	TAAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=263,252;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:71656830_TG_T:71656830:3,0,2,0
chr4	71656836	.	AT	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=263,252;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0|1:71656830_TG_T:71656830:3,0,2,0
chr4	71691743	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr4	71698183	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,8:0,2:0,0,1,9
chr4	71892513	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.928:12:0,2:0,10:0,0,3,9
chr4	71894941	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=248,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr4	72306560	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=279,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr4	72316822	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0,0,8,1
chr4	72397710	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	72397964	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	72411967	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr4	72423624	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr4	72429409	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	72429433	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=195,270;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr4	72429452	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr4	72433481	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.266:9:3,2:4,0:6,1,2,0
chr4	72620865	.	C	CTATTTATT,CTATTTATTTATT,CTATTTATTTATTTATT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,36,33,36;MFRL=0,186,369,272;MMQ=60,54,46,40;MPOS=25,23,21;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=7,9,10,11;RU=TATT;STR;TLOD=4.54,3.29,7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:0,2,1,2:0.286,0.256,0.390:5:0,0,1,0:0,2,0,2:0,0,0,5
chr4	72622403	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,2:0,7:0,0,6,3
chr4	72634211	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634214	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634216	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=27,29;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634219	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634220	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634225	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=24,29;MFRL=136,126;MMQ=40,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:72634211_A_T:72634211:0,3,0,1
chr4	72634246	.	T	TACAACGTCG	.	.	DP=6;ECNT=8;MBQ=28,27;MFRL=221,136;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.480:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	72634249	.	G	GCACA	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=213,161;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr4	72934632	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	73012963	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=187,150;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:3,0:8,2:8,4,0,2
chr4	73164077	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=154,88;MMQ=60,35;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:6,3:13,0:7,12,3,0
chr4	73175093	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=49.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,2:0,14:0,0,9,7
chr4	73178188	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=185,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:4,8,0,3
chr4	73188746	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,109;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,0:5,2:8,9,0,2
chr4	73433122	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:3,3,3,2
chr4	73434379	.	GT	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,12:0,9:0,0,15,6
chr4	73930615	.	A	C	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=46.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,18:0.405:45:17,0:8,18:7,20,0,18
chr4	73933671	.	ATGTGTG	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=TG;STR;TLOD=29.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:0,9:1,0:1,2,9,1
chr4	73944311	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,71;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr4	73990623	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=126,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:9,2:12,0:14,7,1,1
chr4	73991006	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,13:0,9:0,0,15,8
chr4	74007870	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	74008554	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=189,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:0,4,0,2
chr4	74012462	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:0,6:3,7:3,0,9,4
chr4	74282092	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=275,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:2,4:0,2:0,2,2,4
chr4	74285204	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,11;MFRL=178,211;MMQ=44,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:1,0:8,0,2,0
chr4	74285239	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=134,191;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,6:0,9:1,0,11,4
chr4	74285254	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:7,8:7,0:9,5,8,0
chr4	74302151	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	74304118	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,0,7
chr4	74310844	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=233,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,3:1,7:1,2,2,8
chr4	74313169	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=86.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,12:0,13:0,0,15,10
chr4	74354469	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,1:4,1:3,7,1,1
chr4	74357851	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	74361163	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:5,6,1,2
chr4	74364992	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.651:9:1,2:1,3:0,3,0,6
chr4	74447452	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=155,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:4,1,3,1
chr4	74448078	.	ATCT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=220,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr4	74450830	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=228,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,2:6,1:9,0,3,0
chr4	74451073	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=195,133;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:6,3:4,2:0|1:74451073_A_G:74451073:2,9,3,2
chr4	74451092	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:5,3:3,4:0|1:74451073_A_G:74451073:1,7,2,5
chr4	74453656	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:12,4:5,7:7,10,5,6
chr4	74453691	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=201,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,0:4,7:5,6,1,6
chr4	74464285	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TG;STR;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,11,1
chr4	74464443	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.882:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr4	74486052	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	74486264	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr4	74607412	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=132,111;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.089:31:15,2:14,0:9,20,2,0
chr4	74713799	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=201,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.693:7:0,2:1,3:0,2,0,5
chr4	74713950	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=157,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr4	74714003	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:9,2:12,2,5,1
chr4	74719925	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr4	74735150	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=289,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	74735244	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,191;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:3,0:3,3:6,1,1,2
chr4	74736144	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,2:3,5:3,1,6,1
chr4	74847292	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,3,8
chr4	74853684	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=116,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:12,7,2,0
chr4	74903134	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=244,292;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	75040944	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,1:0,9:0,0,9,1
chr4	75065735	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=151,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:0,10,0,2
chr4	75147056	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=144,309;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:6,2:3,0:8,1,2,0
chr4	75167331	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=171,79;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,0:3,2:8,1,2,0
chr4	75245343	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,0,10
chr4	75248544	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr4	75673363	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	75675706	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	75680978	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=384,248;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	75681217	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=177,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,6:3,0:0,7,1,5
chr4	75938373	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=238,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	76415985	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	76416779	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=106,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,4:8,4:9,3,7,1
chr4	76434352	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=171,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:5,0,5,2
chr4	76525648	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr4	76572191	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:5,3,2,0
chr4	76580894	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=232,90;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:10,0,1,1
chr4	76649924	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.837:10:0,5:1,4:1,0,9,0
chr4	76650176	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,10:0,3:0,0,1,12
chr4	76678576	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,5:0,5:2,0,10,0
chr4	76695810	.	TTCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=199,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:2,5:8,1,5,2
chr4	76721414	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,36;MFRL=164,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:4,0,5,0
chr4	76721459	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=117,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,2:4,6:4,3,7,1
chr4	76721705	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=228,176;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,2:2,1,5,0
chr4	76722041	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=213,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:0,1,2,6
chr4	76722422	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,4:0,3:0,2,0,7
chr4	76725245	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	76726528	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=20.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.721:9:1,2:1,4:0|1:76726528_T_C:76726528:0,2,1,6
chr4	76726539	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0|1:76726528_T_C:76726528:0,2,1,2
chr4	76727576	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=143,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.731:13:2,4:1,6:3,0,9,1
chr4	76730004	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=173,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr4	76730061	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=176,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.502:14:3,2:4,5:4,3,5,2
chr4	76730201	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=125,228;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:6,2:9,2:3,12,1,3
chr4	76730258	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=203,158;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr4	76733417	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=175,105;MMQ=60,53;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,2:3,0:6,7,2,0
chr4	76734266	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr4	76734343	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=131,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,15:0.485:31:9,5:7,10:5,11,5,10
chr4	76782138	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=174,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.335:10:2,3:4,0:0,7,3,0
chr4	76785716	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,1,3
chr4	76785723	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:76785716_C_T:76785716:0,0,1,1
chr4	76785736	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	76804067	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr4	76805692	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	76805962	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,225;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	76805978	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	76809319	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr4	76857268	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,4:7,0:4,5,4,0
chr4	76861137	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=251,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:0,4:1,5:1,0,7,2
chr4	76861859	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	76878956	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,28;MFRL=213,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,0:6,3:6,2,2,1
chr4	76878982	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=182,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,1:3,7:2,2,7,1
chr4	76879074	.	G	GTA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=132,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:6,2:9,2:9,6,2,2
chr4	76879082	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=161,72;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=43.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:5,2:7,14:7,5,2,14
chr4	76881392	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:0|1:76881392_C_T:76881392:0,11,0,2
chr4	76881401	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,4:0.384:11:3,1:4,3:1|0:76881392_C_T:76881392:0,7,0,4
chr4	76885423	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=186,93;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:1,5,0,2
chr4	76895403	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=223,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:12,0:1,11:0,13,0,11
chr4	76903036	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,3:1,5:2,0,6,3
chr4	76924933	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=297,218;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr4	76928428	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=228,241;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr4	76942943	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=197,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr4	76943677	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=129,255;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.619:6:1,1:1,2:0,2,2,2
chr4	76943764	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=164,207;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,5:5,1:8,0,5,1
chr4	76944491	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=224,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,3:1,5:3,1,6,2
chr4	76956289	.	C	CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=A;STR;TLOD=26.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:4,4,2,5
chr4	76956528	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=82,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:1,4:1,4:1,1,2,6
chr4	76957171	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,19:0.753:24:4,12:1,6:1,4,8,11
chr4	76996958	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.594:13:1,1:4,7:3,2,7,1
chr4	77002952	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,130;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:4,3,2,5
chr4	77021433	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=140,150;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.392:13:4,1:4,4:6,2,3,2
chr4	77022286	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=165,234;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr4	77024982	.	C	CT,CTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33,35;MFRL=163,217,136;MMQ=60,60,60;MPOS=16,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.23,3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,1:0.428,0.287:4:0,1,1:1,1,0:1,0,3,0
chr4	77024996	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,15;MFRL=194,136;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.336:4:0,0:0,0:3,0,1,0
chr4	77033697	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=25,30;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0,5,0,1
chr4	77033700	.	C	CTTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,33;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,10;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77033700_C_CTTTTTTT:77033700:0,4,0,1
chr4	77033705	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=35,29;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77033700_C_CTTTTTTT:77033700:0,4,0,1
chr4	77033708	.	GA	TT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77033700_C_CTTTTTTT:77033700:0,4,0,1
chr4	77033711	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,29;MFRL=186,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:77033700_C_CTTTTTTT:77033700:0,4,0,1
chr4	77033725	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=182,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	77038807	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:7,7:4,2:10,1,5,4
chr4	77038974	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=212,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,4:4,3:0,9,0,7
chr4	77039174	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=193,78;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr4	77039193	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=237,149;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:3,1,3,1
chr4	77045777	.	TGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=115,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=G;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:1,1:7,1,2,0
chr4	77052288	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:8,1:3,1:11,0,2,0
chr4	77052451	.	AA	TC	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=130,186;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=97.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.542:46:7,0:14,25:7,14,0,25
chr4	77052530	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=176,324;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	77053642	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=173,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,1:6,1:10,1,2,0
chr4	77055474	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.368:19:6,0:5,5:8,4,2,5
chr4	77057501	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:7,2:7,5:7,7,3,4
chr4	77065264	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,4:2,3:4,2,5,2
chr4	77065318	.	C	CTGT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TGT;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:6,0:8,6,3,0
chr4	77065476	.	TAAAA	T,TAA,TAAA	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=29,30,25,28;MFRL=67,244,206,154;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,20,31;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,11,13,14;RU=A;STR;TLOD=4.99,14.43,9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:2,2,7,5:0.147,0.402,0.303:16:1,1,2,4:1,1,5,1:0,2,5,9
chr4	77065518	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,20:0.723:27:3,7:4,12:3,4,9,11
chr4	77065580	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=185,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.293:32:12,2:11,7:12,11,5,4
chr4	77097758	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=200,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	77134786	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=226,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:3,1:3,1:0,6,0,3
chr4	77199400	.	GAT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,153;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr4	77201332	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:1,0,8,0
chr4	77204500	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=154,229;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:2,4,7,1
chr4	77272940	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:8,0:11,4:0|1:77272940_T_C:77272940:5,15,0,4
chr4	77272945	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=114,124;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:7,0:12,4:0|1:77272940_T_C:77272940:5,14,0,4
chr4	77274242	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=126,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,0:1,3:4,2,2,1
chr4	77303898	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0|1:77303898_C_T:77303898:0,0,1,8
chr4	77303906	.	A	AAAATCTAC	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=165,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0|1:77303898_C_T:77303898:0,6,1,1
chr4	77324472	.	CTA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=220,308;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:3,0:0,1:0,3,0,1
chr4	77662309	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=229,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:2,2,5,0
chr4	77675746	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=168,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,2:11,0:8,9,2,0
chr4	77699987	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=126,223;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:7,5:6,2:12,1,6,1
chr4	77816837	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=136,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.307:30:11,0:9,8:12,9,0,9
chr4	77871016	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	77949885	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=122,69;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.170:27:10,4:13,0:8,15,2,2
chr4	77949997	.	TGGTCCAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.402:8:2,2:2,1:0,5,0,3
chr4	77969825	.	GA	G,GAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,18,33;MFRL=153,230,127;MMQ=60,60,60;MPOS=24,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=4.21,3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.333,0.333:6:0,0,1:1,0,1:0,2,0,4
chr4	77987351	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	78079695	.	T	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=122,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:19,3:11,4:15,15,4,3
chr4	78086900	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=207,279;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:9,0:11,1,2,0
chr4	78532232	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=227,279;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	78666116	.	GC	AA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr4	78694206	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=172,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:4,1:13,2:11,6,2,1
chr4	78694327	.	TA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.486:12:0,5:5,1:1,5,1,5
chr4	78697552	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,131;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,7:1,4:0,3,1,10
chr4	78815272	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=122,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.301:15:10,4:1,0:10,1,3,1
chr4	78870940	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=192,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:7,2,6,2
chr4	78873605	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=165,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:7,4:1,9:7,1,12,1
chr4	78873629	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=144,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,19:0.645:29:9,8:1,11:7,3,12,7
chr4	78987157	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=147,249;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:16,1:14,2:13,17,1,2
chr4	79176325	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr4	79176361	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr4	79188160	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=242,248;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,1,5
chr4	79199873	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=145,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:11,0:2,3:4,9,0,3
chr4	79202486	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=159,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,5:2,1:2,2,2,4
chr4	79204209	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr4	79205699	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=109,111;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,6:4,3:3,4,6,3
chr4	79205747	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=170,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,2:3,4:0,5,2,4
chr4	79207784	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=21.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	79229435	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=230,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr4	79238448	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,34;MFRL=218,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr4	79238496	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,30;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,2:10,1:9,5,3,0
chr4	79238649	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=89,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:3,4:1,5:2,2,2,7
chr4	79238657	.	GCAAAGGTATCGTTGGTGTCA	G	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,2:4,0:0|1:79238657_GCAAAGGTATCGTTGGTGTCA_G:79238657:3,10,1,1
chr4	79238684	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:79238657_GCAAAGGTATCGTTGGTGTCA_G:79238657:1,6,1,1
chr4	79238687	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=30,20;MFRL=173,38;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:5,2:2,0:0|1:79238657_GCAAAGGTATCGTTGGTGTCA_G:79238657:1,6,1,1
chr4	79240196	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=149,255;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,0:6,3:0,6,0,3
chr4	79295418	.	C	CTG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=176,244;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TG;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,0,6
chr4	79321972	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:4,4:16,0:13,7,3,1
chr4	79334264	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=177,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:5,1:2,1:0,8,1,1
chr4	79340016	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr4	79350200	.	C	CTGTG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=183,213;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,10;RU=TG;STR;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:5,0:0,2:4,1,3,0
chr4	79369296	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=164,71;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:2,0:6,2:4,4,2,0
chr4	79371474	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=131,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:2,2:6,4:4,4,5,1
chr4	79372856	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=298,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr4	79372930	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=90,132;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,0:0,3:1,1,3,0
chr4	79373254	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=144,241;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:2,1,4,1
chr4	79385803	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=126,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr4	79387278	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=203,238;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:5,0,6,0
chr4	79391036	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	79391256	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=52.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0,0,6,8
chr4	79391327	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=133,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr4	79393269	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=186,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr4	79393390	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,2:12,2:12,10,1,3
chr4	79403682	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,3:5,2:5,10,1,4
chr4	79403747	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=176,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:0,2,0,7
chr4	79409997	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=221,165;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:3,3,6,0
chr4	79417863	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr4	79420787	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=279,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:3,1:2,3:5,0,4,1
chr4	79420864	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=123,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,4:6,2:0|1:79420864_T_C:79420864:8,3,5,1
chr4	79420870	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=123,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,2:5,3:0|1:79420864_T_C:79420864:8,3,5,1
chr4	79421011	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=141,269;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:7,3:6,1:3,10,1,3
chr4	79428796	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,64;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,1:5,1:1,11,0,2
chr4	79430170	.	G	GAAGCCTTTGTCAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr4	79430211	.	GTTGTTCT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=155,293;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.673:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	79434685	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=161,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:4,3:4,3:3,5,0,6
chr4	79436875	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=174,223;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,4:4,1:7,0,4,1
chr4	79436888	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=180,228;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,3:3,3:8,0,5,1
chr4	79437178	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=174,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.478:19:7,5:3,4:2,8,2,7
chr4	79440425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr4	79442799	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=206,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:1,2:0,1:0,1,1,2
chr4	79443738	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=33,15;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:79443738_C_A:79443738:3,1,1,0
chr4	79443741	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,18;MFRL=190,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:79443738_C_A:79443738:3,1,1,0
chr4	79443746	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=33,17;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:79443738_C_A:79443738:2,1,1,0
chr4	79443748	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=182,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,0:0|1:79443738_C_A:79443738:2,1,1,0
chr4	79443774	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	79443837	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=159,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:5,3:5,2:6,4,3,2
chr4	79443850	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=29,28;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.631:17:4,5:2,6:5,1,5,6
chr4	79444029	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:0,2,0,6
chr4	79444043	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	79455858	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	79458112	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=87,81;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr4	79461956	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr4	79462311	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=186,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr4	79494343	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=154,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:3,3,1,1
chr4	79503230	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr4	79503378	.	TCTCATGGTGGCC	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=142,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:9,0:12,2:11,12,1,1
chr4	79512800	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,1,5
chr4	79522598	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=196,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.393:16:5,3:4,3:7,3,5,1
chr4	79525584	.	A	ATTTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=280,88;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,8;RU=T;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0|1:79525584_A_ATTTT:79525584:1,2,0,3
chr4	79525590	.	CCCT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=280,88;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:1,0:1,2:0|1:79525584_A_ATTTT:79525584:1,2,0,3
chr4	79531186	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=121,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,5:4,1:7,1,4,2
chr4	79531202	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=143,121;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:6,3,4,2
chr4	79531308	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=138,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:0,1,1,5
chr4	79531381	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr4	79754716	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.366:9:1,1:5,2:5,1,3,0
chr4	79786974	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr4	79793969	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=165,76;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr4	80246380	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,2:9,1:7,13,2,1
chr4	80828668	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=53,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,2:1,1:0,2,1,3
chr4	80828740	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,315;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	80899219	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.178:38:24,6:7,0:18,14,6,0
chr4	80899329	.	C	CCACAG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=195,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:0|1:80899329_C_CCACAG:80899329:3,10,0,2
chr4	80899334	.	AA	TG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=208,149;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,2:5,0:0|1:80899329_C_CCACAG:80899329:2,10,0,2
chr4	80905851	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=195,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:4,0,5,0
chr4	80906131	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr4	80939979	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=218,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	80957195	.	GA	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,20;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.294:20:4,0:3,4:2,12,1,5
chr4	80975372	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,7:0,11:0,0,11,8
chr4	80976420	.	G	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=80.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,30:0.755:39:3,13:6,15:6,3,22,8
chr4	81124596	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=204,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:3,4:4,9:5,2,8,5
chr4	81207649	.	T	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=212,199;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:13,4:27,0:14,26,4,0
chr4	81884610	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=33.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr4	81974755	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=269,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:1,1:0|1:81974755_G_T:81974755:0,5,0,1
chr4	81974779	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=186,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:81974755_G_T:81974755:0,4,0,1
chr4	82013619	.	AAAGGAAGGAAGG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=120,267;MMQ=54,58;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;RPA=12,9;RU=AAGG;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.415:8:1,1:3,2:2,3,0,3
chr4	82025691	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,0,4
chr4	82056440	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=161,49;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:6,0:12,2:7,11,0,2
chr4	82369160	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:4,1,2,0
chr4	82369205	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=139,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:10,0:4,2:10,4,2,0
chr4	83347309	.	TAAGA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:6,3:5,3:5,7,0,6
chr4	83347787	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=128,118;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:10,3:10,11,0,3
chr4	83376098	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=204,215;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr4	83424089	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:5,1:4,2:6,3,3,1
chr4	83552412	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=243,103;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr4	83557880	.	C	CCTGACAATTT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=165,99;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,1:9,1:12,6,0,2
chr4	83582064	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,163;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,5:8,1:9,8,4,2
chr4	83602150	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=319,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	83626382	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=208,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:3,1,3,1
chr4	83763690	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=230,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0,4,0,4
chr4	83765691	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=199,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:1,4,1,4
chr4	83774687	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr4	83787875	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=185,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.784:21:1,9:3,8:4,0,17,0
chr4	83788139	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:9,4:11,2:8,12,3,3
chr4	83788562	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr4	83793243	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=94,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,2:7,4:7,5,2,4
chr4	83800181	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	83825823	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=203,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:4,1,3,0
chr4	83827822	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,5:1,2:0,2,0,7
chr4	83838262	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,13:0.400:33:10,6:10,7:3,17,5,8
chr4	83852065	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=48.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,11,3
chr4	83857108	.	AT	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,2,2
chr4	83857402	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,12,5
chr4	83900260	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	83905258	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	83970297	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,45;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.319:7:3,1:1,1:4,1,2,0
chr4	83989516	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	84189012	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,2:0,0,0,5
chr4	84193366	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr4	84205618	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,15:0,10:0,0,20,5
chr4	84205872	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	84223461	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr4	84229897	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=122,225;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:2,1,4,1
chr4	84231340	.	G	GTAAGTATGTCTCCTATTCTTAATACTAGGAAA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=231,123;MMQ=60,53;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	84232104	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	84234190	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=78,180;MMQ=36,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr4	84234195	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=186,155;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr4	84234229	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,5:1,5:2,1,8,2
chr4	84234253	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=180,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:10,0:6,2:11,5,1,1
chr4	84240654	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	84240680	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	84255641	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=192,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr4	84350824	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=181,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:6,0:9,5:4,12,0,5
chr4	84352750	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=195,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,2:5,0:6,0,2,0
chr4	84361149	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=111,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.334:40:16,13:11,0:15,12,13,0
chr4	84362443	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,0:5,3:8,4,2,1
chr4	84364808	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=167,158;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:1,5,0,3
chr4	84367286	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:1,1:4,3:0,5,0,5
chr4	84370091	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=130,148;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.263:21:9,4:6,1:7,9,2,3
chr4	84370124	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=118,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.439:12:3,4:4,1:1,6,2,3
chr4	84374927	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,0:6,5:5,7,0,5
chr4	84393475	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=221,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,0:2,5:1,6,0,5
chr4	84458001	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr4	84465613	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:4,0,5,1
chr4	84465855	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr4	84509465	.	T	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr4	84515968	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=132,84;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr4	84517995	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,1:5,2:7,2,2,1
chr4	84519775	.	AT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=115,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.641:17:4,5:2,6:4,2,7,4
chr4	84525976	.	TTTTTG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=142,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr4	85414741	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=195,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:0,6,1,3
chr4	85552882	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=213,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr4	85555196	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=194,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr4	85560000	.	T	TTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=TA;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,0:4,1,3,1
chr4	85618001	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=215,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.358:9:2,1:4,2:1,5,1,2
chr4	85656350	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=247,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.596:5:0,3:1,0:0,2,0,3
chr4	85699579	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=177,199;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,1:2,2:5,2,3,0
chr4	85710822	.	ACC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=156,171;MMQ=57,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=6,4;RU=C;STR;TLOD=57.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.907:22:0,3:2,13:2,0,15,5
chr4	85738482	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=235,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:4,1,4,0
chr4	86643026	.	T	A	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=123,151;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.115:41:16,4:21,0:18,19,4,0
chr4	86643029	.	T	TACTAGTATATAAACCTGCAGTCATTA	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=151,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,2:0.069:41:18,2:20,0:20,19,1,1
chr4	86844948	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:4,1,0,4
chr4	86863166	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=166,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,2:2,0:4,1,2,0
chr4	86863206	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=108,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.605:10:3,6:1,0:2,2,4,2
chr4	86952648	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr4	87024228	.	C	CTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,34;MFRL=211,214;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=21,22;RU=TG;STR;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.665:4:0,3:0,0:1,0,3,0
chr4	87610268	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=141,88;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:12,4:16,8:9,19,6,6
chr4	87638364	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,286;MMQ=60,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	87643538	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=142,69;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:12,0:14,2:14,13,2,0
chr4	87671907	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=130,101;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,0:6,4:13,6,0,4
chr4	87717945	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr4	87728676	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=142,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:8,2,2,0
chr4	87731238	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=194,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0,3,0,4
chr4	87754419	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=183,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:5,5:1,5:6,0,9,1
chr4	87809330	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:9,2:0|1:87809330_G_T:87809330:7,12,0,2
chr4	87809337	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,124;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,0:10,1:0|1:87809330_G_T:87809330:7,12,0,2
chr4	87812564	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=118,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,1:3,1:4,1,2,0
chr4	87812586	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=57,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.807:14:0,6:1,6:2,0,8,4
chr4	87928652	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=23,14;MFRL=161,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.400:10:3,0:1,1:0|1:87928652_T_G:87928652:4,2,0,4
chr4	87928654	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,13;MFRL=161,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.401:10:3,0:2,0:0|1:87928652_T_G:87928652:4,2,0,4
chr4	87968798	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=243,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr4	88005203	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:3,6:3,6:4,2,7,5
chr4	88029482	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,3:4,0:0,10,0,3
chr4	88052219	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:4,3,7,3
chr4	88056719	.	GT	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=58,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=30.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.664:19:4,6:2,7:4,2,7,6
chr4	88056925	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=47.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr4	88226480	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=173,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr4	88231339	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.434:7:0,0:4,3:2,2,1,2
chr4	88234874	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr4	88238448	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=47.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,0,13
chr4	88239609	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:2,0:9,3:4,7,1,2
chr4	88261828	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=147,217;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:1,2,0,4
chr4	88295786	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,5:4,2:4,0,7,0
chr4	88296051	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=227,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:0,1:1,1:0,1,0,3
chr4	88312293	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=220,228;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	88356111	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=106,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:1,1,5,1
chr4	88362904	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=241,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.845:11:0,5:1,4:1,0,9,1
chr4	88362916	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=171,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=33.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:6,12:9,0:12,3,12,0
chr4	88532182	.	A	AGTGT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=195,261;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=GT;STR;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.466:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	88533163	.	TTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr4	88536520	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=74,103;MMQ=55,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.506:18:4,5:3,3:6,3,4,5
chr4	88536818	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=155,85;MMQ=54,45;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.679:23:3,7:3,6:2,5,7,9
chr4	88537737	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	88577573	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=117,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,4:3,2:2,1,6,0
chr4	88578310	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr4	88732453	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	88732531	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,9,6
chr4	88732692	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=139,123;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:5,6:14,5:8,11,5,6
chr4	88733085	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=157,99;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr4	88755828	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,5:0,0,10,3
chr4	88755967	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=169,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:2,3:5,0:3,5,0,3
chr4	88759690	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,5,1
chr4	88902748	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=143,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:11,0:10,4:11,10,0,4
chr4	88959381	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=131,371;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr4	88959493	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:5,7,2,0
chr4	88979080	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,285;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr4	89015857	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.832:10:0,3:1,5:1,0,1,8
chr4	89016782	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,4:0,5:0,0,2,7
chr4	89018565	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=252,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,2:0,8:1,0,7,3
chr4	89022362	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=225,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.878:14:0,6:1,7:0,1,9,4
chr4	89022518	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89022518_T_A:89022518:0,1,0,1
chr4	89022519	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=31,31;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89022518_T_A:89022518:0,1,0,1
chr4	89022525	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=36,31;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89022518_T_A:89022518:0,1,0,1
chr4	89022527	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=212,138;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89022518_T_A:89022518:0,1,0,1
chr4	89028359	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,0:4,6:0|1:89028359_A_C:89028359:3,6,0,6
chr4	89028361	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:5,0:4,6:0|1:89028359_A_C:89028359:3,6,0,6
chr4	89326847	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,191;MMQ=60,23;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,0:4,5:0,7,0,5
chr4	89349921	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=161,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:3,9,0,2
chr4	89352469	.	CTT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:1,1:7,1:3,8,1,1
chr4	89361230	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,87;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:11,0:8,5:8,11,0,5
chr4	89389640	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=181,291;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	89391771	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=182,103;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.463:26:8,2:6,10:8,6,4,8
chr4	89397091	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,141;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:5,6:3,4:2,6,3,7
chr4	89400435	.	CAAAA	C,CAAAAA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31,35;MFRL=242,125,136;MMQ=50,40,40;MPOS=32,33;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,14,19;RU=A;STR;TLOD=3.34,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.285,0.284:4:1,0,1:1,1,0:2,0,2,0
chr4	89400460	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,23;MFRL=125,156;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:4,1:7,3,2,0
chr4	89588689	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=163,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,3:9,1:1,12,1,3
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chr4	89589113	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=165,56;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:8,3:10,0:0|1:89589111_G_GAATT:89589111:7,11,1,2
chr4	89589119	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=163,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:11,2:9,0:0|1:89589111_G_GAATT:89589111:8,13,1,1
chr4	89649659	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=190,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,3:3,4:7,2,4,3
chr4	89658633	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=133,113;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:8,0:9,4:10,7,0,4
chr4	89660237	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=182,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:15,2:11,1:9,17,3,0
chr4	89680032	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:3,2:9,0:5,7,2,0
chr4	89708850	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	89711690	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=144,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.256:18:4,1:10,3:8,6,3,1
chr4	89711849	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=282,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:89711849_T_C:89711849:1,0,0,3
chr4	89711854	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=282,224;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:89711849_T_C:89711849:1,0,0,1
chr4	89726073	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=57.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.871:21:1,6:1,12:2,0,14,5
chr4	89726283	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:1,1,0,9
chr4	89827492	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,1:6,6:6,5,2,5
chr4	90168882	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:5,3,7,0
chr4	90171478	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	90647865	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:3,5,0,3
chr4	90743317	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0|1:90743317_T_TC:90743317:1,0,6,0
chr4	90743331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.672:7:0,4:2,1:0|1:90743317_T_TC:90743317:2,0,5,0
chr4	90816023	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr4	90816790	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=233,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:1,4:0,9:0,1,1,12
chr4	90855932	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr4	90874095	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	91234250	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,234;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr4	91549156	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=118,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:1,2:1,4:5,0,4,2
chr4	91701720	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	91737018	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=85,116;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:2,2,2,2
chr4	93225703	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,9:4,0:5,0,9,0
chr4	93511481	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,1:4,2:1,9,0,3
chr4	94032125	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=171,227;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:6,6,1,1
chr4	94750058	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:7,7,2,0
chr4	94751372	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:2,2:5,2:3,4,4,0
chr4	95161996	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=113,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr4	95194740	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=182,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:11,0,3,1
chr4	95197660	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,107;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:1,7,0,2
chr4	95255637	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=127,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:1,1,7,3
chr4	95445051	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:1,8,0,2
chr4	95496882	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=168,123;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:11,6:6,2:8,9,2,6
chr4	95506214	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=228,131;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:11,4:6,5:6,11,3,6
chr4	95508134	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=131,260;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.172:19:9,0:5,0:9,7,3,0
chr4	95561651	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=184,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr4	95575601	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=186,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,5:9,2:8,6,5,2
chr4	95578719	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=137,96;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.234:28:12,0:9,6:6,16,0,6
chr4	96035796	.	GAC	G,GACAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31,34;MFRL=0,227,170;MMQ=60,60,60;MPOS=11,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=AC;STR;TLOD=5.76,6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,2:0.438,0.433:4:0,0,1:0,2,1:0,0,3,1
chr4	96051304	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr4	96073956	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr4	96091250	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=195,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:5,5:2,7:6,1,12,0
chr4	96091524	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=217,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,1:5,4:0,6,0,5
chr4	96761220	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=199,241;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr4	96761256	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=205,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,3:4,2:7,1,5,0
chr4	96762629	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,320;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	96762698	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	98761900	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=139,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:5,4:3,1:8,0,5,0
chr4	98893334	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=207,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	98893388	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,4:2,0:5,1,4,0
chr4	98902278	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=105,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:2,6:2,4:4,0,6,4
chr4	98902492	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:98902492_G_A:98902492:0,5,1,1
chr4	98902493	.	C	CCT	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0|1:98902492_G_A:98902492:0,5,1,1
chr4	98902495	.	A	ACTGCTGGGAATCTC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=188,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:98902492_G_A:98902492:0,5,1,1
chr4	99027137	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=138,140;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:1,7:3,5:3,1,7,5
chr4	99027159	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=136,179;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:7,10,2,0
chr4	99027184	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=138,134;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,6:3,4:2,2,4,6
chr4	99027218	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.707:8:0,4:2,2:1,1,3,3
chr4	99049593	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,2:2,4:3,5,3,3
chr4	99055406	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=135,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr4	99055480	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=136,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.552:16:3,3:4,5:5,2,8,1
chr4	99055637	.	CAGATA	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGATA;STR;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,1:6,2:2,12,0,3
chr4	99064336	.	AGG	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=26,23;MFRL=192,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:11,2:8,0:0|1:99064336_AGG_A:99064336:6,14,0,2
chr4	99064339	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=192,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,2:8,0:0|1:99064336_AGG_A:99064336:6,14,0,2
chr4	99064342	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=191,221;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,2:7,0:0|1:99064336_AGG_A:99064336:4,13,0,2
chr4	99337881	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=146,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,4:1,4:0,3,6,2
chr4	99338058	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=253,89;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chr4	99339708	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=185,167;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr4	99341156	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=150,232;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:7,1:11,1:11,7,1,1
chr4	99358083	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,2:2,1:3,5,2,1
chr4	99408106	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,1,4
chr4	99808136	.	CTTAAA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,1:1,1:4,0,2,0
chr4	99964627	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=356,170;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:99964627_C_T:99964627:0,1,0,1
chr4	99964630	.	CCTGTACTTA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=356,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:99964627_C_T:99964627:0,1,0,1
chr4	99996106	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,32;MMQ=46,58;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,1:7,1:9,9,2,0
chr4	100009738	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:2,6:1,6:3,0,11,1
chr4	100045500	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,6:0,5:2,0,11,0
chr4	100048327	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=58.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,8:0,9:0,0,15,2
chr4	100048506	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0|1:100048506_G_A:100048506:0,0,7,8
chr4	100048509	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=142,278;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:7,0:5,2:0|1:100048506_G_A:100048506:4,8,2,0
chr4	100052963	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,226;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr4	100057858	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=146,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr4	100065509	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=240,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	100128530	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr4	100128725	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=147,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,2:0.097:29:12,0:15,2:0|1:100128725_G_C:100128725:10,17,0,2
chr4	100128732	.	C	CCACTCTGTCCCCAA	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=156,250;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.093:30:13,0:15,2:0|1:100128725_G_C:100128725:10,18,0,2
chr4	100128753	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=215,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,5:2,10:3,3,5,10
chr4	100131163	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	100131746	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=188,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.260:6:3,1:1,0:0,5,0,1
chr4	100134713	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,8:0,1:0,0,5,4
chr4	100137344	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=184,89;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,3:4,0:6,9,0,3
chr4	100200509	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	100203447	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=181,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,4:7,0:11,0,4,0
chr4	100205819	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=145,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,9:0.476:19:5,3:5,6:0|1:100205819_C_A:100205819:8,2,5,4
chr4	100205829	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=136,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.428:19:4,3:7,5:0|1:100205819_C_A:100205819:8,3,4,4
chr4	100212173	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=83,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0|1:100212173_A_T:100212173:2,4,0,2
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chr4	100258054	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,0,14
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chr4	100260681	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=157,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.720:8:1,1:0,1:2,0,5,1
chr4	100268131	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=164,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:4,3:2,4:5,1,6,1
chr4	100348837	.	GT	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=152,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	100356337	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:7,2:13,1:12,8,2,1
chr4	100356466	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:11,2:3,1:5,9,1,2
chr4	100443561	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=202,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:6,4:2,2:8,0,6,0
chr4	100445589	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr4	100472004	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,7,1
chr4	100479378	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=172,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,3:4,0:0,6,0,3
chr4	100496105	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=157,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=45.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:1,7:8,10:4,5,10,7
chr4	100513027	.	TTGTG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=218,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TG;STR;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.809:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	100518247	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=190,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:2,2,2,3
chr4	100521805	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=244,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,9:4,4:3,3,9,4
chr4	100530143	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=222,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:2,5:7,1:2,7,1,5
chr4	100532222	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr4	100532425	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=170,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,0:6,2:6,10,0,3
chr4	100533973	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=201,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:0,2:3,2:3,0,5,0
chr4	100534041	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,4,1
chr4	100540099	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr4	100543836	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,10:3,0:3,6,10,0
chr4	100784118	.	T	G	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=132,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.092:41:10,3:28,0:33,5,3,0
chr4	100784142	.	TTG	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=120,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.153:36:14,3:13,2:13,18,3,2
chr4	100784884	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=33.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.654:18:2,12:4,0:6,0,12,0
chr4	100806727	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:12,0:22,2:21,13,0,2
chr4	100813221	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=136,76;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.178:37:8,3:23,3:17,14,0,6
chr4	100824844	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,2:8,3:11,4,3,2
chr4	100827622	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=173,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:5,1,4,1
chr4	100851508	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr4	101337150	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	101338217	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,2:0,8:0,0,9,1
chr4	101950251	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=128,100;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:12,7:9,0:13,8,7,0
chr4	101953322	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	102001793	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=155,115;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.266:28:9,0:12,6:5,16,0,7
chr4	102020924	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=158,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr4	102116994	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=238,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:2,0,3,0
chr4	102267821	.	AA	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr4	102268034	.	A	ACGCCGC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=164,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=CGC;STR;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:1,2:0,6,0,2
chr4	102776406	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=31,30;MFRL=128,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr4	102776418	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,3,0,1
chr4	102776427	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,4,0,1
chr4	102776430	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,4,0,1
chr4	102776432	.	CATTA	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,4,0,1
chr4	102776437	.	G	GCTGT	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=180,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:102776418_G_T:102776418:0,4,0,1
chr4	102839183	.	A	ACATTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,0:13,2:0|1:102839183_A_ACATTT:102839183:11,9,0,2
chr4	102839186	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:15,2:0|1:102839183_A_ACATTT:102839183:12,10,0,2
chr4	102839190	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=149,228;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:5,0:17,2:0|1:102839183_A_ACATTT:102839183:12,10,0,2
chr4	102839362	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,1,11
chr4	102942761	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=166,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,12:0.620:19:4,10:3,2:0|1:102942761_C_T:102942761:4,3,4,8
chr4	102942765	.	TTA	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=187,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,2:6,0:0|1:102942761_C_T:102942761:6,12,0,2
chr4	102946347	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,1:4,6:8,1,5,2
chr4	102951254	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=113,169;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:19,0:12,5:19,12,0,5
chr4	102992517	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,3:6,2:3,8,0,5
chr4	103189114	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=155,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:2,2:14,0:7,9,1,1
chr4	103228545	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=190,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:9,2:5,5:9,5,3,4
chr4	103505784	.	CAAA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.319:10:1,0:5,3:5,2,3,0
chr4	103506023	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=128,110;MMQ=60,30;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103506023_T_A:103506023:0,4,0,1
chr4	103506025	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=128,110;MMQ=60,30;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103506023_T_A:103506023:0,4,0,1
chr4	103506027	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=128,110;MMQ=60,30;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:103506023_T_A:103506023:0,4,0,1
chr4	103533821	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,4:4,3:0,5,0,7
chr4	103553447	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=252,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.808:8:1,0:0,4:0,1,1,6
chr4	103557192	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=232,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=39.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,5:0,7:0,1,2,10
chr4	103557219	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	103557251	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=191,155;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr4	103571686	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=109,103;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:9,2:3,1:9,3,2,1
chr4	103610872	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=291,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,4:1,7:1,1,1,10
chr4	103731067	.	CAAAT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,4:1,4:1,2,2,6
chr4	103747541	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:3,10:2,6:4,2,13,3
chr4	103789782	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=218,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:4,5:3,8:5,2,10,3
chr4	103789810	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.838:23:1,9:2,8:1,2,12,8
chr4	103790186	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=261,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,6:2,4:3,0,10,0
chr4	103806308	.	CTA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:1,1:2,6:3,1,7,1
chr4	103826635	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=185,153;MMQ=60,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.694:11:2,3:1,5:2,1,5,3
chr4	103866480	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.667:25:2,10:6,7:4,4,5,12
chr4	103911159	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=226,260;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	103971560	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=202,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,2:4,2:1,7,1,3
chr4	103987761	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=247,78;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:5,1:0,1:0,5,0,2
chr4	104041293	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=151,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,2:12,0:14,8,1,1
chr4	104053941	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=126,92;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.171:25:12,3:9,0:12,9,4,0
chr4	104057248	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.267:12:4,1:5,1:7,2,3,0
chr4	104061331	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=182,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:1,0:3,2:2,2,1,1
chr4	104063071	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=98,270;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:3,6,0,2
chr4	104066176	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=143,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0|1:104066176_CA_C:104066176:5,0,4,0
chr4	104066202	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=108,72;MMQ=60,53;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:16,2:0.150:18:3,0:7,1:1|0:104066176_CA_C:104066176:11,5,2,0
chr4	104068838	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:104068838_AG_A:104068838:2,2,0,1
chr4	104068842	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=107,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,1:0|1:104068838_AG_A:104068838:2,2,0,1
chr4	104079424	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:5,2,1,1
chr4	104084374	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=145,68;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,3:5,0:5,11,2,1
chr4	104084765	.	CAAAA	C,CAAA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,35,32;MFRL=192,133,150;MMQ=60,60,60;MPOS=13,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,13,16;RU=A;STR;TLOD=6.04,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,3:0.170,0.338:11:2,1,0:2,1,2:2,4,1,4
chr4	104510766	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=248,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr4	105393361	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,2:0,1:0,0,4,0
chr4	106155751	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,1:6,2:4,7,1,2
chr4	106159271	.	AGT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=147,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=20.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:9,2:4,4:7,6,5,1
chr4	106159701	.	T	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:16,0:11,9:11,16,0,9
chr4	106160231	.	G	GTTTTTTTGTTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=154,145;MMQ=40,43;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.823:9:1,3:0,4:0,1,6,2
chr4	106160244	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,17;MFRL=145,158;MMQ=41,53;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.366:11:1,0:3,1:4,3,3,1
chr4	106163108	.	TTTC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=164,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.442:19:4,4:5,5:5,5,2,7
chr4	106163109	.	TTC	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.691:15:1,5:3,6:3,1,2,9
chr4	106194000	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=158,99;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:18,0:14,4:17,15,0,4
chr4	106196920	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=199,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:4,10,0,2
chr4	106196951	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=222,198;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,4:3,4:2,4,5,3
chr4	106196963	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=223,184;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:7,6,3,0
chr4	106292109	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,1:5,5:1,8,3,3
chr4	106292121	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr4	106317370	.	T	TATAAA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=216,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,1:4,1:6,0,3,1
chr4	106317498	.	CCAAA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=139,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CAAA;STR;TLOD=40.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:1,5:2,5:0,3,3,7
chr4	106317511	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=174,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.386:13:4,2:4,3:2,6,1,4
chr4	106359209	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=263,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,0:0,4:0,1,1,3
chr4	106534691	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,5:3,2:1,4,1,6
chr4	106620983	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,8:2,4:4,1,12,0
chr4	106638697	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=270,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr4	106647679	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:5,0,2,0
chr4	106766496	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=190,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr4	106766746	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:106766746_C_T:106766746:4,8,1,1
chr4	106766755	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=194,232;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,1:0|1:106766746_C_T:106766746:4,8,1,1
chr4	106818983	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=181,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:3,2,4,0
chr4	106848524	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.335:25:7,5:9,3:7,10,4,4
chr4	106879592	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=159,143;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.652:14:4,4:1,5:2,3,7,2
chr4	106888263	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.664:13:4,4:0,4:4,0,9,0
chr4	107116007	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=41.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,0:3,13:1,4,0,13
chr4	107152952	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=148,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:8,0:16,2:10,14,0,2
chr4	107154273	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr4	107156365	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,6,1
chr4	107165685	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	107169345	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:6,5:11,0:14,3,5,0
chr4	107169364	.	GG	AA	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=170,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,5:11,0:11,6,5,0
chr4	107258228	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:5,2:6,2:3,10,2,2
chr4	108575955	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=206,169;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:4,1:9,4:7,7,1,4
chr4	108608100	.	CTCTAACACT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=214,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr4	108622241	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr4	108622475	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,3:4,4:0,6,0,8
chr4	108641169	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr4	108641317	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:4,4:5,6:4,5,5,5
chr4	108641437	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=339,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	108817135	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,116;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.158:27:11,0:12,3:13,10,0,4
chr4	108820650	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=170,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr4	108824307	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=203,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:6,0:4,2:11,0,2,0
chr4	108853295	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=235,170;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.320:13:4,2:5,1:1,8,0,4
chr4	108853384	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	108866058	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=198,227;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr4	108868515	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=83,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:3,5:1,3:2,2,4,4
chr4	108870764	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=185,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr4	108931039	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=113.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.972:34:0,19:0,15:0,0,16,18
chr4	108935768	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=22,33;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.360:11:1,2:3,1:0|1:108935768_CT_C:108935768:0,7,0,4
chr4	108935770	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=203,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.554:11:2,1:2,4:0,5,0,6
chr4	108935771	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.360:11:2,2:4,2:0|1:108935768_CT_C:108935768:0,7,0,4
chr4	108944579	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr4	108944821	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	108948928	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:7,2:4,8,0,2
chr4	108953505	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=157,80;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:12,2:4,1:6,10,1,2
chr4	108985388	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr4	108985517	.	TCTCTTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=125,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTCTTC;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,0:7,2:5,7,1,1
chr4	108991979	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	108999300	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr4	108999366	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr4	109010207	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,13,0
chr4	109010312	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=161,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.384:27:8,10:7,0:7,10,10,0
chr4	109546420	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr4	109576622	.	C	CAAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=7,11;RU=A;STR;TLOD=19.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,1:2,0,4,1
chr4	109576843	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=123,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.501:8:0,0:4,4:2,2,0,4
chr4	109578572	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr4	109588323	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,2:2,3:4,2,4,1
chr4	109669319	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=158,290;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.365:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr4	109669378	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=113,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	109734959	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr4	109735133	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=135,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,6:0.304:21:8,0:7,6:0|1:109735133_T_C:109735133:7,8,1,5
chr4	109735146	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=135,116;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:8,0:7,5:0|1:109735133_T_C:109735133:7,8,1,4
chr4	109735209	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=169,252;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0,3,0,2
chr4	109748227	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=111,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:7,1,4,0
chr4	109762918	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,3,2
chr4	109766290	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=175,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:2,5:0,5:0,2,6,4
chr4	109769899	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,73;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:1,2,3,2
chr4	109780823	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:8,1:18,1:13,13,0,2
chr4	109780921	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:9,1:4,1:3,11,0,2
chr4	109782249	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	109784409	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=203,191;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:3,5:8,0:8,3,5,0
chr4	109784622	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=249,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr4	109790361	.	T	G	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=160,153;MMQ=60,27;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=43.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.567:30:6,0:6,16:4,9,0,17
chr4	109790373	.	TAAATA	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr4	109790374	.	AAAT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.408:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	109810975	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,0:3,9:0,8,0,9
chr4	109811003	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=174,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr4	109817962	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	109820195	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.893:7:0,1:0,5:0|1:109820195_C_A:109820195:0,0,5,2
chr4	109820202	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0|1:109820195_C_A:109820195:0,0,5,2
chr4	109820446	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	109895718	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=194,238;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=13.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.760:6:0,3:1,2:1,0,1,4
chr4	109931455	.	AC	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.610:21:2,7:5,6:0|1:109931455_AC_A:109931455:6,2,8,5
chr4	109931457	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,13:0.610:21:3,7:5,6:0|1:109931455_AC_A:109931455:6,2,8,5
chr4	109969183	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=168,249;MMQ=47,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr4	109969337	.	G	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=103,219;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.328:28:7,4:11,4:11,8,2,7
chr4	110384047	.	G	GCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTTT;STR;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr4	110384147	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=191,128;MMQ=60,48;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,3:1,0:4,2,3,0
chr4	110441477	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=89,103;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:1,1:1,0:0|1:110441477_T_A:110441477:2,0,1,0
chr4	110441487	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=89,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:110441477_T_A:110441477:2,0,1,0
chr4	110446454	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=174,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:2,0,10,0
chr4	110580084	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr4	110585578	.	CTTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=17,13;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.321:4:3,1:0,0:2,1,0,1
chr4	110585645	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,222;MMQ=60,52;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	110606394	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.856:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	110608643	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=157,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:12,0:4,2:9,7,0,2
chr4	110615762	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=131,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,0:11,2:8,11,0,2
chr4	110619534	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=75.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,7:0,15:0,0,5,17
chr4	110635488	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=212,215;MMQ=60,57;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,6:1,1:2,0,5,2
chr4	110650657	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=179,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:2,0:6,2:8,0,2,0
chr4	110670807	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	110678819	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=198,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.452:9:3,2:1,2:2,3,3,1
chr4	110678979	.	T	TTTTAA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=30.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.899:7:0,4:0,3:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,7
chr4	110679002	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:110678979_T_TTTTAA:110678979:0,0,0,6
chr4	110681618	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr4	110737549	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr4	110745095	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=150,113;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,4:5,4:12,4,6,2
chr4	110754499	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=220,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:0,6,0,4
chr4	110758499	.	C	CT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=238,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,0:1,0,2,0
chr4	110758769	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=168,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr4	110765361	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr4	110765372	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=173,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,5:0,1,4,7
chr4	110772730	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,1:7,1:7,4,1,1
chr4	110786290	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr4	110791543	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,2:7,2:7,9,3,1
chr4	110864370	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=186,134;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=25.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:3,0:8,12:8,3,12,0
chr4	110864566	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,30;MFRL=103,103;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:15,0:2,3:6,11,0,3
chr4	110896050	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=188,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr4	110897316	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=151,93;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.151:24:7,0:14,3:11,10,2,1
chr4	111398208	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:4,11:3,5:5,2,8,8
chr4	111398252	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=203,193;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:11,2:4,2:3,12,1,3
chr4	111412391	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,29;MFRL=253,234;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,1:0,1:0,1,0,3
chr4	111469295	.	GTTTTT	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=128,172;MMQ=50,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=25,20;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr4	111469323	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,15;MFRL=129,128;MMQ=60,40;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.323:7:0,0:4,0:2,3,2,0
chr4	111474659	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:4,2:1,2:1,4,1,4
chr4	111781650	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=151,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,5,0
chr4	113066831	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr4	113107829	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=198,218;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,17;RU=T;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.296:8:2,1:3,1:0|1:113107829_C_CTT:113107829:5,1,2,0
chr4	113107852	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=181,218;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:3,0:0|1:113107829_C_CTT:113107829:9,6,2,0
chr4	113178857	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=128,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:9,3:4,4:6,7,5,2
chr4	113178894	.	ATTTGT	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=130,128;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:11,5:5,5:6,10,5,5
chr4	113178966	.	TA	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=144,67;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.211:22:9,4:8,1:8,9,1,4
chr4	113179077	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=217,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.602:8:2,3:1,2:0|1:113179077_C_T:113179077:0,3,0,5
chr4	113179080	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=217,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:2,3:0,2:0|1:113179077_C_T:113179077:0,3,0,5
chr4	113184202	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=137,457;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:10,1:10,1:8,12,1,1
chr4	113184233	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=113,146;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:8,3:11,0:11,8,0,3
chr4	113187786	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,92;MMQ=60,35;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:12,3:16,0:13,15,3,0
chr4	113346714	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=173,293;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr4	113356259	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:5,1,4,0
chr4	113356495	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,2:3,2:0,3,0,4
chr4	113359883	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr4	113479555	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113479555_A_G:113479555:0,0,0,1
chr4	113479562	.	CA	TG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:113479555_A_G:113479555:0,0,0,1
chr4	113483446	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:8,0,5,0
chr4	113506885	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=241,181;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.436:5:0,0:1,1:0,3,0,2
chr4	113540785	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=156,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.214:17:7,3:7,0:7,7,3,0
chr4	113541270	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,0;MFRL=133,115;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,9:0.394:23:6,0:8,0:0|1:113541270_C_T:113541270:10,4,9,0
chr4	113541279	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=110,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,9:0.378:24:6,8:9,0:0|1:113541270_C_T:113541270:10,5,9,0
chr4	113554385	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=143,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:7,6:1,3:3,5,1,8
chr4	113565886	.	AAAG	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=32.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:9,5:8,5:12,5,4,6
chr4	113568126	.	TA	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=150,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.313:10:2,1:3,2:3,4,2,1
chr4	113569135	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.453:20:6,3:5,6:7,4,8,1
chr4	113570639	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,12,2
chr4	113578418	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=130,138;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.112:38:22,3:11,0:8,26,0,4
chr4	113578433	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=138,128;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:18,4:12,0:9,23,0,4
chr4	113825548	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=189,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:9,2:4,0:12,1,2,0
chr4	114028149	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=63,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:1,2,0,2
chr4	114117481	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=168,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr4	114179628	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=144,157;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.154:17:10,0:5,2:0|1:114179628_G_GT:114179628:0,15,0,2
chr4	114179629	.	G	GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=144,157;MMQ=60,50;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:10,0:5,2:0|1:114179628_G_GT:114179628:0,15,0,2
chr4	114204106	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=174,226;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:1,3,0,4
chr4	114238807	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=215,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,1:5,3:8,1,4,0
chr4	114260538	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=138,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:0,10,0,2
chr4	114267023	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=67.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,8:0,13:0,0,17,5
chr4	114269552	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=123,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:0,4,1,1
chr4	114274507	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=165,241;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,13:0.326:41:18,13:10,0:15,13,13,0
chr4	114274531	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=169,241;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,13:0.324:40:17,11:10,0:14,13,13,0
chr4	114279870	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=194,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:9,0:10,4:11,8,0,4
chr4	114284645	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=205,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,0,5
chr4	114286357	.	ATG	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=196,155;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=TG;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.634:3:0,2:0,0:0,1,0,2
chr4	114376932	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:17,4:8,0:15,10,4,0
chr4	115544150	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:3,7:7,0:4,6,7,0
chr4	115544714	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,6,6
chr4	115544834	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=163,141;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,0:5,4:1,5,0,4
chr4	115544848	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=163,141;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,0:5,4:1,5,0,4
chr4	115589159	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr4	115589302	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,5,8
chr4	115748914	.	A	ATT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,21;MFRL=168,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=T;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,1:5,0:8,2,1,1
chr4	115748918	.	A	AT,T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29,30;MFRL=201,58,235;MMQ=60,60,60;MPOS=11,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.69,6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.237,0.200:10:4,1,1:2,1,1:4,2,3,1
chr4	115751064	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:2,10,1,2
chr4	115898522	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	118976065	.	A	ATAAAAGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=215,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr4	119035948	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=44.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,11,4
chr4	119064666	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=144,56;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:3,0:2,2:5,0,1,1
chr4	119064668	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=56,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.662:7:0,3:2,2:1,1,5,0
chr4	119161619	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr4	119174563	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,30;MFRL=237,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr4	119174640	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr4	119176703	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:4,1,4,1
chr4	119216054	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=215,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,6:7,2:10,3,5,3
chr4	119217114	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	119234470	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=126,58;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,0:4,4:7,5,2,2
chr4	119239788	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=205,260;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr4	119609039	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr4	119609182	.	C	CT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,20;MFRL=140,137;MMQ=50,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=T;STR;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:0,2:0,1:0,2,1,5
chr4	119615544	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=237,129;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.599:8:1,1:2,3:3,0,3,2
chr4	119653822	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=136,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:7,2,2,1
chr4	119666217	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=10,20;MFRL=144,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,0:0,1:0,5,0,2
chr4	119736598	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=98,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,3:1,7:2,2,9,1
chr4	119947961	.	AAAG	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=207,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=75.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,19:0.626:30:3,8:7,11:5,6,11,8
chr4	119947985	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=198,166;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.391:34:7,7:13,6:12,9,7,6
chr4	119950975	.	A	ATTT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=191,229;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=13,16;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:2,0,1,0
chr4	119978892	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=131,340;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,13:0.305:44:19,13:12,0:17,14,13,0
chr4	120071926	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr4	120072233	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:2,2:0|1:120072233_G_C:120072233:1,3,0,3
chr4	120072238	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=196,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,0:2,2:0|1:120072233_G_C:120072233:1,3,0,3
chr4	120079159	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,3:2,7:3,1,6,4
chr4	120079387	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=216,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr4	120107098	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=172,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr4	120169956	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=129,81;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,5:6,0:8,9,4,1
chr4	120177522	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.615:16:3,7:3,3:4,2,6,4
chr4	120177708	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:4,4:1,4,2,5
chr4	120181724	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=183,155;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.346:21:7,5:7,2:6,8,3,4
chr4	120192436	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,220;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:1,2:3,0:4,0,2,0
chr4	120193005	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,154;MMQ=60,50;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:5,0:15,6:14,6,0,6
chr4	120194718	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=241,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,5:0,3:0,1,8,1
chr4	120212425	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=249,163;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=20.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:4,4:0,4:1,3,1,7
chr4	120212514	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=353,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr4	120221425	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:6,4:0,2:6,0,6,0
chr4	120240131	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:7,7:1,4:7,1,10,1
chr4	120240802	.	C	CATAATAATA	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,13;RU=ATA;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.565:5:1,1:1,0:0,2,0,3
chr4	120240812	.	AT	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,36;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120240817	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=191,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120240825	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120240833	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=26,36;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120240835	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=170,205;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:120240812_AT_CA:120240812:0,4,0,1
chr4	120243336	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.799:3:0,3:0,0:0,0,1,2
chr4	120423719	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=170,129;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.470:15:5,4:1,3:0|1:120423719_C_T:120423719:8,0,5,2
chr4	120423729	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:4,2:2,3:0|1:120423719_C_T:120423719:7,0,4,2
chr4	120425777	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=151,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:7,4:1,1:1,7,2,3
chr4	120446868	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=182,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,2:0,0:0,3,0,2
chr4	120463856	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr4	120481431	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=217,279;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:5,2:7,2,1,3
chr4	120483931	.	TATAGAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=186,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:2,1:6,2:7,3,3,0
chr4	120486402	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=218,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:4,0,4,1
chr4	120527929	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.165:28:16,4:8,0:13,11,4,0
chr4	120528524	.	ATCT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=346,433;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.503:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr4	120981214	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,188;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr4	120983086	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.610:16:1,4:5,6:6,0,8,2
chr4	120983259	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.546:29:8,6:5,9:2,11,3,13
chr4	121702270	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=189,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:7,0,6,0
chr4	121719584	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr4	121720771	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=125,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.418:10:2,4:4,0:4,2,4,0
chr4	121720941	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=199,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,2:3,3:0,3,0,5
chr4	121720960	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr4	121737767	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,2:4,4:2,4,1,5
chr4	121739411	.	G	GCA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=186,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=CA;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr4	121828550	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=172,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:7,0:4,0:12,1,3,0
chr4	121843611	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr4	121957734	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr4	121961031	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=228,170;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:3,0,4,0
chr4	121961279	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=218,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,2:1,4:0,4,1,5
chr4	121961295	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=206,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr4	122068133	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:10,0,3,1
chr4	122082481	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=225,270;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr4	122253910	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=198,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=34.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:2,15:6,0:7,1,15,0
chr4	122258063	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=121,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:7,1:3,2:2,8,1,2
chr4	122261785	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=231,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,4:2,5:2,4,3,6
chr4	122590906	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=175,158;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.258:13:3,1:7,1:1,9,1,2
chr4	122590913	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,0:4,3:1,6,1,2
chr4	122617631	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=181,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:4,3:8,1:9,3,4,0
chr4	122617654	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=34,27;MFRL=184,115;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.324:19:4,3:9,2:10,3,6,0
chr4	122617688	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=171,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.280:30:8,5:14,3:11,11,5,3
chr4	122617718	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=171,118;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.351:32:8,6:13,5:10,11,5,6
chr4	122681373	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,1:2,3:7,0,4,0
chr4	122722693	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:8,6:7,2:5,10,2,6
chr4	122732899	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=101,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr4	122735225	.	C	CTTA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:2,0,2,4
chr4	122737487	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=153,187;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:7,0:6,2:12,1,2,0
chr4	122739183	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,3:3,1:10,0,4,0
chr4	122749436	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,0:4,2:5,4,1,1
chr4	122756480	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=191,202;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,0:7,4:0,10,0,4
chr4	122789142	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=128,101;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:7,6:5,7:7,5,9,4
chr4	122791601	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=276,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr4	122831281	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:9,1:1,3:10,0,4,0
chr4	122833314	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	122835967	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.298:35:14,10:10,0:9,16,10,0
chr4	122846338	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=185,118;MMQ=60,27;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.306:30:10,0:11,8:8,13,1,8
chr4	122853500	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,172;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:4,4,0,2
chr4	123097178	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=205,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,0:5,8:0,8,0,8
chr4	123108762	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	123128692	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=170,152;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,2:3,3:5,1,6,0
chr4	123130886	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=223,206;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:0,2:6,3:6,0,5,0
chr4	123140739	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=82.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,11:0,11:0,0,6,16
chr4	123155881	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=214,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr4	123175900	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=183,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.540:5:2,0:0,3:2,0,3,0
chr4	123178574	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,276;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:13,2:7,1:15,6,1,2
chr4	123185682	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	123187869	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr4	123222417	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=132,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.565:7:1,4:2,0:2,1,4,0
chr4	123222483	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=177,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:8,3:5,0:5,9,2,1
chr4	123239432	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=113,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.239:19:8,0:6,4:6,9,0,4
chr4	123246825	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=122,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,0:9,3:11,8,3,0
chr4	123246971	.	GTT	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.200:21:6,1:5,3:9,8,3,1
chr4	123333671	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=243,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:3,0,4,0
chr4	123342616	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	123374819	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=143,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:3,2:6,1,2,0
chr4	123662997	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=119,227;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:8,1,3,0
chr4	123665366	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=182,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,1:6,1:7,11,1,1
chr4	123666156	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=161,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,3:2,4:0,4,0,7
chr4	123854495	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr4	123855925	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=173,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=36.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:5,0:6,14:0,11,0,14
chr4	123856827	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=197,99;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,0:3,3:6,2,2,1
chr4	123949267	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,2:0,1:5,0,3,0
chr4	123949556	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,4:0,10:0,0,5,9
chr4	124324242	.	CCTT	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=118.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,9:0,19:0,0,16,12
chr4	125631108	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:8,1,1,1
chr4	126237726	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=170,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:4,15,1,1
chr4	126240717	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=197,56;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:8,0:11,3:8,12,1,2
chr4	126315034	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	126335978	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr4	126336990	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr4	126337555	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr4	126355609	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=43.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,3,11
chr4	126373570	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=187,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:5,5,0,2
chr4	126384905	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=145,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr4	126389627	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr4	126390010	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,2:4,2:0,8,0,4
chr4	126390022	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr4	126400825	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=182,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr4	126402618	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr4	126411179	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=155,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.257:29:8,7:14,0:13,9,7,0
chr4	128554404	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=159,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,5:1,6:0,5,0,11
chr4	128621144	.	CTT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=107,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.280:12:4,2:4,1:6,3,3,0
chr4	128627050	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=220,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr4	128628019	.	T	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:12,3:4,0:9,7,3,0
chr4	128632023	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:4,0,4,0
chr4	128665981	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=147,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:0,5,0,4
chr4	128688444	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=222,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr4	128724855	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=177,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:8,2:9,0:9,9,2,0
chr4	128739528	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=112,94;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.229:33:9,7:17,0:16,10,6,1
chr4	128741498	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:8,0,2,0
chr4	128751775	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=152,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,1:2,2:6,0,3,0
chr4	128802922	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=185,75;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,3:4,0:11,2,2,1
chr4	128803159	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=137,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr4	128812152	.	C	CAGAGGAGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=179,241;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.497:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	128814425	.	AT	A,ATT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31,29;MFRL=119,167,167;MMQ=60,60,46;MPOS=20,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=9.34,10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,7:0.237,0.310:23:7,4,1:2,1,6:8,3,12,0
chr4	128851890	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,86;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,0:10,5:10,6,0,5
chr4	128865056	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=185,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:7,11,0,2
chr4	128886330	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.242:27:10,0:10,6:4,17,0,6
chr4	128932965	.	TG	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,19;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=G;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr4	128995989	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=208,229;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr4	129121807	.	AA	GC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=140,33;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,0:6,2:7,4,1,1
chr4	129193739	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	129767748	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=245,276;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:129767748_A_G:129767748:0,3,0,1
chr4	129767758	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=251,276;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:129767748_A_G:129767748:0,2,0,1
chr4	129770068	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=171,345;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:5,1:4,3:6,3,4,0
chr4	129776983	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=221,123;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=21.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.577:17:3,7:4,3:1,6,3,7
chr4	129789060	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:10,0:14,5:11,13,0,5
chr4	129805716	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,0:5,2:3,3,0,2
chr4	129873987	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,61;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:4,6,0,2
chr4	129878342	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr4	130023759	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=196,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.864:20:1,8:1,9:1,1,11,7
chr4	138442119	.	TTTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=143,136;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TTG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:1,3,1,0
chr4	138449812	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:7,4:3,3:3,7,4,3
chr4	139093228	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=225,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	139103366	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr4	139140388	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr4	139965724	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=243,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr4	139965977	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,3:10,4:10,4,4,3
chr4	139981918	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=199,245;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	140217010	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=184,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,5:1,9:1,1,4,10
chr4	140255423	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:13,5:12,0:11,14,0,5
chr4	140308984	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=213,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,2:0,6:1,0,6,2
chr4	140375296	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=205,187;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.715:19:3,11:2,3:5,0,13,1
chr4	140439236	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=123,105;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:3,0:5,3:4,5,0,3
chr4	140450204	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,4:4,6:7,5,6,4
chr4	140450455	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0|1:140450455_G_C:140450455:0,0,0,3
chr4	140450464	.	T	TTATTGTGTGGGAGTC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=283,155;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.491:2:1,0:0,1:0|1:140450455_G_C:140450455:0,1,0,1
chr4	140454523	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=194,57;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:0|1:140454523_G_T:140454523:3,5,1,1
chr4	140454525	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=203,57;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:0|1:140454523_G_T:140454523:3,6,1,1
chr4	140454532	.	GG	TT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=206,57;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,0:4,2:0|1:140454523_G_T:140454523:2,8,1,1
chr4	140616462	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:10,4:2,3:4,8,1,6
chr4	140625139	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=128,129;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,6:7,0:9,6,6,0
chr4	140625323	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,2,11
chr4	140641419	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=190,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,0:15,3:11,12,0,3
chr4	140646929	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=165,108;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,4:10,0:9,12,4,0
chr4	140651584	.	TCTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CTG;STR;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.919:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr4	140810637	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.342:30:15,7:5,3:11,9,6,4
chr4	140810682	.	TTGCTGC	T	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=170,81;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=TGC;STR;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,2:0.066:43:26,2:12,0:22,19,1,1
chr4	140810700	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=177,129;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,19:0.455:42:17,13:6,6:14,9,6,13
chr4	141264871	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=162,251;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:15,2:7,1:10,12,1,2
chr4	141264896	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=155,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:13,3:7,2:9,11,1,4
chr4	141310450	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=142,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:0|1:141310450_T_G:141310450:4,12,1,1
chr4	141310458	.	TCTAGAAAA	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=164,49;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:5,2:0|1:141310450_T_G:141310450:2,9,1,1
chr4	141310470	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=149,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:4,0:2,2:0|1:141310450_T_G:141310450:1,6,1,1
chr4	141310474	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=24,20;MFRL=144,49;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0|1:141310450_T_G:141310450:0,6,1,1
chr4	141311960	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr4	141448595	.	CT	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=186,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.329:16:4,3:4,2:4,7,4,1
chr4	141448705	.	TA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=179,178;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.371:19:8,2:3,5:4,8,0,7
chr4	141458485	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	141481203	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=16,27;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.440:8:0,1:2,2:1,4,0,3
chr4	141489057	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,65;MMQ=60,27;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:14,0:10,3:13,12,0,3
chr4	141549393	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,4:3,1,8,0
chr4	141555062	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=175,276;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr4	141578155	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:7,0,5,0
chr4	141598220	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=187,90;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:7,3:0,0:2,5,0,3
chr4	141677006	.	A	AG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,268;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0,0,2,0
chr4	141847077	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr4	141847110	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=194,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:3,1,5,3
chr4	141847279	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr4	141868736	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=29.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:3,6:7,5:9,1,7,4
chr4	142147855	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr4	142153726	.	A	G	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=107,50;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,4:0.106:45:20,4:21,0:20,21,4,0
chr4	142153856	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.329:18:3,0:9,6:1,11,0,6
chr4	142155193	.	T	TTTATCAA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.327:4:2,0:1,1:0|1:142155193_T_TTTATCAA:142155193:0,3,0,1
chr4	142155195	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=148,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:142155193_T_TTTATCAA:142155193:0,3,0,1
chr4	142155214	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=196,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	142640538	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=124,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.902:18:1,7:0,10:1,0,11,6
chr4	142651159	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=222,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,5:0,7:2,1,3,9
chr4	142949864	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=165,195;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:10,0,2,0
chr4	143003155	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=37,33;MFRL=130,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=36.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.918:15:1,6:0,8:1,0,6,8
chr4	143007197	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr4	143007419	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=96,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr4	143007460	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr4	143029391	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=180,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:1,9,0,2
chr4	143043397	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=166,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,0:11,5:4,13,3,2
chr4	143043404	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=169,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:4,2:12,2:6,10,0,4
chr4	143044666	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr4	143066925	.	A	AT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=199,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr4	143067053	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:11,2:9,1:0|1:143067053_C_T:143067053:8,12,2,1
chr4	143067054	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,11:0.480:23:7,6:5,5:1|0:143067053_C_T:143067053:5,7,5,6
chr4	143130034	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,7:0,0,8,2
chr4	143130219	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:3,5,0,3
chr4	143181731	.	TA	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=20,23;MFRL=118,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.362:11:2,3:2,1:0,7,1,3
chr4	143181747	.	AT	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=23,30;MFRL=130,118;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.609:11:3,4:1,2:1,3,0,7
chr4	143226768	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=206,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr4	143324036	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=166,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,3,1
chr4	143326312	.	AAGAG	A,AAGAGAGAGAG	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29,30;MFRL=131,199,175;MMQ=60,60,60;MPOS=1,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,8,13;RU=AG;STR;TLOD=6.59,8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,6:0.183,0.381:16:3,1,2:1,2,3:4,3,8,1
chr4	144108906	.	TG	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,0:6,1:9,1,2,0
chr4	144124492	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr4	144130642	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.566:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr4	144136193	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr4	144354912	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:5,0:1,5:0,6,0,5
chr4	144378766	.	TTTA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,15;MFRL=0,266;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:2,0:0,0:0|1:144378766_TTTA_T:144378766:1,1,1,0
chr4	144378775	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,15;MFRL=0,266;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:144378766_TTTA_T:144378766:2,1,1,0
chr4	144378777	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=0,266;MMQ=60,46;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:144378766_TTTA_T:144378766:2,1,1,0
chr4	144378783	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=68,266;MMQ=60,46;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:144378766_TTTA_T:144378766:1,1,1,0
chr4	144387217	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:2,1:4,1,2,1
chr4	144446519	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr4	144447630	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=190,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.851:18:1,10:1,6:1,1,5,11
chr4	144449220	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	144456124	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=81.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,12:0,10:0,0,6,16
chr4	144466050	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=137,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.806:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr4	144469383	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	144471174	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=145,143;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,0:11,4:12,10,0,4
chr4	144797848	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=150,213;MMQ=52,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,1:6,3:5,3,3,1
chr4	144797949	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=156,66;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:7,9,1,1
chr4	144801662	.	C	G,T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,34,29;MFRL=227,126,180;MMQ=60,46,57;MPOS=22,10;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.17,20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,7:0.474,0.421:16:1,4,5:0,3,2:0,1,5,10
chr4	144801671	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=189,119;MMQ=57,44;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:5,4:2,4:2,5,2,6
chr4	144917514	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,231;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr4	144918867	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=200,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr4	144920480	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=172,117;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,4:3,1:7,3,4,1
chr4	144940333	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=201,240;MMQ=52,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:5,3,2,0
chr4	145035788	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr4	145037980	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=15,33;MFRL=97,170;MMQ=60,49;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.877:10:0,3:0,6:1,0,5,4
chr4	145040784	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=125,187;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,3,2
chr4	145040962	.	CA	GT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=101,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr4	145040999	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=185,172;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr4	145041011	.	AC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=24,25;MFRL=203,172;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr4	145041036	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=185,192;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	145041741	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=153,249;MMQ=40,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:1,0,1,2
chr4	145061822	.	CA	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=153,292;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.202:23:10,4:9,0:11,8,2,2
chr4	145573954	.	GA	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.425:10:0,2:6,2:1,5,0,4
chr4	145579907	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,3:0,5:1,0,5,3
chr4	146031323	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,145;MMQ=60,57;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:13,4:15,0:13,15,0,4
chr4	146033368	.	CT	C	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=21,33;MFRL=143,125;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.177:14:2,2:3,0:4,8,2,0
chr4	146033386	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,11;MFRL=147,125;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:5,0:8,0:0|1:146033386_C_A:146033386:10,13,2,0
chr4	146033389	.	AG	TT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=147,125;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:7,0:12,0:0|1:146033386_C_A:146033386:10,13,2,0
chr4	146033577	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=176,193;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:9,9:10,0:0|1:146033577_A_G:146033577:0,19,9,0
chr4	146033584	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=32.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,9:0.333:28:9,8:10,0:0|1:146033577_A_G:146033577:0,19,9,0
chr4	146042445	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=145,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:8,2:12,1:11,10,1,2
chr4	146046123	.	AT	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=200,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.423:19:4,2:7,6:0|1:146046123_AT_A:146046123:6,5,5,3
chr4	146046138	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=89.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,24:0.962:24:0,10:0,13:0|1:146046123_AT_A:146046123:0,0,13,11
chr4	146048583	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,116;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,4:0,8:0,0,12,0
chr4	146059446	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=177,103;MMQ=52,22;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.134:28:11,0:13,3:0|1:146059446_A_C:146059446:9,16,0,3
chr4	146059450	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=179,103;MMQ=52,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,0:11,3:0|1:146059446_A_C:146059446:8,15,0,3
chr4	146065006	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,4:0,9:0,0,12,2
chr4	146067487	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:12,7:16,0:18,10,7,0
chr4	146073850	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=198,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:1,0:6,2:1,7,0,2
chr4	146076632	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=147,165;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:6,2:7,2:8,7,1,3
chr4	146077132	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=109,205;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:9,3:13,2:12,10,1,4
chr4	146083703	.	C	CA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,186;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,2:3,1:5,1,3,0
chr4	146475243	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=19,29;MFRL=81,270;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:0,0:0,2:0,1,0,2
chr4	146650449	.	A	ATTTTTTTTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,0;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;RPA=24,33;RU=T;STR;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.815:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr4	146686396	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=249,262;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr4	146686414	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=249,1625902;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:1,4,0,2
chr4	146744690	.	AGG	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=15,24;MFRL=256,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,3;RU=G;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.247:6:0,1:1,0:2,3,0,1
chr4	147110891	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=230,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:1,7,1,2
chr4	147204439	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=128,128;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:6,2:3,16,0,2
chr4	147214029	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,2,2
chr4	147425114	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=222,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:3,4:5,4:2,6,0,8
chr4	147438084	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=367,265;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr4	147560457	.	T	TGGC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=GGC;STR;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,1:0,0,4,3
chr4	147754924	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=151,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:2,2,1,0
chr4	148457021	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,16;MFRL=211,244;MMQ=60,52;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,0:4,0:0|1:148457021_C_A:148457021:5,5,2,0
chr4	148457031	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=199,244;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:5,0:4,0:0|1:148457021_C_A:148457021:7,5,2,0
chr4	148463840	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr4	148564160	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=176,131;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	148575543	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=188,73;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.207:17:4,3:10,0:9,5,1,2
chr4	148589677	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,7,0
chr4	148591769	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,1:0,8:0,0,8,2
chr4	148591873	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=147,154;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:6,0:10,2:4,12,0,2
chr4	148604886	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.918:9:0,2:0,3:0,0,3,6
chr4	148778685	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=152,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=18.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.773:11:2,3:0,3:1,1,4,5
chr4	148800299	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr4	148803101	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=116,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:1,6,3,3
chr4	148827747	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,6:4,2:6,1,6,2
chr4	148827920	.	T	TGGTTGCGTG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=56,82;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr4	148827933	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	148968080	.	CA	AG	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:10,0:6,2:8,8,0,2
chr4	148985720	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=194,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:0,4,1,3
chr4	149002409	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=155,229;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr4	149035449	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr4	149073555	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr4	149116035	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,1,6
chr4	149358014	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=259,275;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr4	151161470	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=262,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr4	151161490	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,7,2
chr4	151161502	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=178,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,6:2,6:1,2,8,4
chr4	151177340	.	CC	TG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr4	151177432	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr4	151207054	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,72;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:11,0:6,5:10,7,1,4
chr4	151231371	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=291,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,5:2,4:2,1,6,3
chr4	151356900	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=220,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr4	151357816	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=160,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr4	151408800	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:1,0,5,0
chr4	151504131	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=199,149;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr4	151505624	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,242;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=C;STR;TLOD=33.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,7:1,6:0,1,0,13
chr4	151656589	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr4	151683003	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=148,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:13,3:13,1:10,18,2,2
chr4	151719263	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=121,152;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,2:12,2:8,13,1,3
chr4	151765243	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=51.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,10,6
chr4	151773512	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=176,207;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:5,6,3,0
chr4	151789381	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,4:6,4:3,6,4,4
chr4	151817507	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,267;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,1,1
chr4	151829659	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,7,9
chr4	151835502	.	GAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.206:12:0,1:2,1:2,8,0,2
chr4	152020736	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=178,91;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.183:18:6,2:6,0:7,8,3,0
chr4	152025273	.	G	GCTTAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTTAT;STR;TLOD=48.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,4:0,0,7,4
chr4	152048936	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,0,7
chr4	152053408	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0,0,6,0
chr4	152095955	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.220:26:7,0:8,0:15,5,0,6
chr4	152201018	.	G	GCAGGT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=141,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CAGGT;STR;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.497:12:2,1:4,3:3,3,3,3
chr4	152201053	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=221,193;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,1:2,5:3,2,3,3
chr4	152201204	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr4	152203664	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=422,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr4	152204403	.	GC	AG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=170,36;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:152204403_GC_AG:152204403:8,6,1,1
chr4	152204409	.	G	GGTTTCA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=170,36;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:152204403_GC_AG:152204403:8,6,1,1
chr4	152204412	.	A	AGAATATG	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=170,36;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:8,2:0|1:152204403_GC_AG:152204403:8,6,1,1
chr4	152212704	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr4	152510130	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=127,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,5:6,0:1,8,0,5
chr4	152559717	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.520:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	152583907	.	C	CTT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=102,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,18;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.359:7:2,1:2,1:3,2,1,1
chr4	152592469	.	A	ATTAC	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTAC;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.205:17:6,1:8,2:0,14,0,3
chr4	152609694	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=225,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0|1:152609694_A_G:152609694:4,0,2,0
chr4	152609700	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=225,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:2,1:1,1:0|1:152609694_A_G:152609694:4,0,2,0
chr4	152681952	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.225:11:6,1:3,1:6,3,2,0
chr4	153245523	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=155,132;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,2:6,1:4,13,1,2
chr4	153245525	.	T	TGGC	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=29,33;MFRL=158,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:10,0:6,2:0|1:153245525_T_TGGC:153245525:4,13,0,2
chr4	153245527	.	AC	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=165,123;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:5,2:0|1:153245525_T_TGGC:153245525:4,14,0,2
chr4	153245532	.	ATGG	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:11,0:6,2:0|1:153245525_T_TGGC:153245525:4,14,0,2
chr4	153245537	.	T	TACATTAAAA	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:0|1:153245525_T_TGGC:153245525:4,14,0,2
chr4	153247401	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:9,0:18,3:0|1:153247401_G_A:153247401:4,24,0,3
chr4	153247403	.	A	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:10,0:16,3:0|1:153247401_G_A:153247401:4,24,0,3
chr4	153249365	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=200,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:15,3:12,0:0|1:153249365_T_C:153249365:15,13,3,0
chr4	153249367	.	C	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=195,249;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,3:0.124:30:17,2:10,1:1|0:153249365_T_C:153249365:17,10,0,3
chr4	153268227	.	CAA	C,CA,AAA	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=24,27,23,22;MFRL=177,175,173,71;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,24,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;TLOD=6.07,14.76,4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:12,4,9,4:0.156,0.317,0.118:29:3,1,3,2:6,2,2,1:4,8,5,12
chr4	153549745	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,4,9
chr4	153549852	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,333;MMQ=60,52;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	153565641	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=159,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,1:3,3:2,11,1,3
chr4	153574173	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=180,455;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,10:1,0:0,4,0,10
chr4	153791955	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=200,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:6,1:8,3:5,9,2,2
chr4	153864378	.	T	TG	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=29,21;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.165:22:8,1:9,2:0|1:153864378_T_TG:153864378:0,19,3,0
chr4	153864383	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=29,12;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:9,0:8,0:0|1:153864378_T_TG:153864378:0,19,3,0
chr4	153864386	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=30,12;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:8,0:8,0:0|1:153864378_T_TG:153864378:0,17,3,0
chr4	153864389	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=26,12;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:8,1:8,0:0|1:153864378_T_TG:153864378:0,16,3,0
chr4	153864395	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=25,31;MFRL=157,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.197:19:6,1:8,1:0|1:153864378_T_TG:153864378:1,15,3,0
chr4	153864398	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=25,25;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.187:20:7,0:9,2:0|1:153864378_T_TG:153864378:1,16,3,0
chr4	153864401	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=8;MBQ=29,18;MFRL=163,187;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.179:21:7,0:9,1:0|1:153864378_T_TG:153864378:1,17,3,0
chr4	153864403	.	CACTT	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,12;MFRL=163,118;MMQ=60,51;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.147:19:8,0:7,0:0|1:153864378_T_TG:153864378:1,16,2,0
chr4	153882002	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,196;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.173:19:6,0:10,2:5,11,1,2
chr4	154191710	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=194,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,3:3,2:0,5,1,5
chr4	154330064	.	GTATA	G,GTA,GTATATATATATA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,33,30,34;MFRL=134,149,152,137;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,2,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=11,9,10,15;RU=TA;STR;TLOD=4.33,4.23,7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,2,4:0.153,0.174,0.344:12:2,1,0,1:2,1,2,1:4,0,7,1
chr4	154388336	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:5,1:8,1:6,7,2,0
chr4	154395112	.	C	CCAA	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:154395112_C_CCAA:154395112:3,13,0,2
chr4	154395115	.	T	TCC	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:7,2:0|1:154395112_C_CCAA:154395112:3,13,0,2
chr4	154395116	.	A	ATTCTATCCACTC	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:154395112_C_CCAA:154395112:2,12,0,2
chr4	154476924	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:9,3:4,1:10,3,3,1
chr4	154478300	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr4	154525458	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=197,140;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:2,4,8,1
chr4	154542037	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=149,58;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.169:33:17,1:11,4:15,13,2,3
chr4	154542814	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=220,125;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:4,6:4,1:7,1,6,1
chr4	154548909	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=184,274;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:1,2:3,0:0,5,0,2
chr4	154556798	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,0,9
chr4	154557383	.	ATG	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=46.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,2:0,9:0,0,11,0
chr4	154557405	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=27.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.860:12:0,4:1,6:1,0,11,0
chr4	154633580	.	GA	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr4	154633734	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=190,49;MMQ=60,28;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:3,3:4,1:3,4,2,2
chr4	154641489	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=25.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:1,5:4,4:0,5,1,8
chr4	154644454	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,8,1
chr4	154644537	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,154;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:7,5:4,3:5,6,7,1
chr4	154669993	.	C	CAAA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=160,93;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=A;STR;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:0,13,2,2
chr4	154709480	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,5:0,0:0,0,4,1
chr4	155158236	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=138,145;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:7,0:11,4:9,9,0,4
chr4	155161666	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,12,4
chr4	155225784	.	AAAACAAAC	A,CAAACAAAC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29,32;MFRL=0,204,109;MMQ=60,60,60;MPOS=33,3;POPAF=7.30,7.30;TLOD=10.40,13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,4:0.286,0.612:7:0,0,3:0,3,1:0,0,7,0
chr4	155226421	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=160,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr4	155242383	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr4	155244401	.	TTTTG	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TTTG;STR;TLOD=47.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.943:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr4	155244475	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,10:0,0,9,7
chr4	155244486	.	C	CA,CAA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,24,32;MFRL=274,219,245;MMQ=60,60,60;MPOS=15,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=5.35,4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,4,3:0.393,0.322:10:1,1,1:2,1,1:3,0,2,5
chr4	155249431	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr4	155250915	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=240,134;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:5,4:4,2:0,9,1,5
chr4	155252934	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=190,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr4	155287317	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=163,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr4	155305430	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155305430_C_T:155305430:1,0,1,0
chr4	155305432	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=181,230;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:155305430_C_T:155305430:1,0,1,0
chr4	155305491	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=36,29;MFRL=256,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,5:0,1:2,0,4,2
chr4	155407569	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=58.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,9,8
chr4	155410407	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,280;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,3,0
chr4	155412141	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=180,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:3,4,1,3
chr4	155412398	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:5,4,0,2
chr4	155457781	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=168,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.491:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr4	155458728	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	155460459	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr4	155461687	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:8,0,4,0
chr4	155465535	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,2:4,0:5,1,2,0
chr4	155466935	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=155,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,0:5,3:9,2,2,1
chr4	155467187	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=165,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:9,2:3,5:5,7,6,1
chr4	155486470	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=178,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr4	155487221	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=218,218;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr4	155488858	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=127,63;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,0:5,2:6,10,1,1
chr4	155488887	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:155488887_G_A:155488887:1,6,1,1
chr4	155488891	.	G	GCC	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:0|1:155488887_G_A:155488887:1,6,1,1
chr4	155507962	.	CC	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,121;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,4:6,0:8,8,4,0
chr4	155508627	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,1:1,6:1,0,6,1
chr4	155510224	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr4	155511897	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=164,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr4	155525970	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=144,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,5,1
chr4	155720349	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,259;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,2,0
chr4	156136705	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=183,109;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:7,1,4,2
chr4	156274377	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,146;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,1:8,2:9,6,2,1
chr4	156290032	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr4	156296868	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=192,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:1,3:5,3:6,0,6,0
chr4	156297060	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=167,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:5,3:1,2:2,4,0,5
chr4	156617994	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.596:13:4,3:1,4:3,2,6,2
chr4	156629276	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=194,181;MMQ=60,32;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr4	156631707	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,4:3,1:5,5,4,1
chr4	156632034	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=175,35;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,1:11,3:11,12,3,1
chr4	156634157	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=331,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr4	156643176	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,11,7
chr4	156721187	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=161,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:5,0:11,4:8,8,1,3
chr4	156721198	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=158,137;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:5,1:11,3:7,10,1,3
chr4	156750959	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=174,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.801:8:0,5:1,2:1,0,5,2
chr4	156757789	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=103,147;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.855:10:0,4:1,3:1,0,6,3
chr4	156757818	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=129,143;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,1:10,2:13,6,3,0
chr4	156787340	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,11:0,0,12,5
chr4	156826166	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=53.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,8,7
chr4	156830023	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=193,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:2,1,2,2
chr4	156831444	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=239,188;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr4	156832841	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=132,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,2:1,7:0,1,1,8
chr4	156839462	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	156847230	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=137,166;MMQ=50,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.822:14:0,9:1,3:0|1:156847230_A_G:156847230:0,2,4,8
chr4	156847237	.	AG	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,13:0.887:14:0,10:1,3:0|1:156847230_A_G:156847230:0,1,4,9
chr4	156863528	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=166,63;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,3:11,0:10,15,2,1
chr4	157732191	.	G	GGAACAAAAAGATTATGGA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=176,71;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:2,17,0,2
chr4	158041896	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=1196,145;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr4	158242540	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr4	158254014	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,64;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.094:40:25,0:11,3:24,13,0,3
chr4	159154032	.	T	TAG	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=48.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.412:32:15,13:4,0:14,5,13,0
chr4	159443131	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.195:13:5,1:6,1:6,5,0,2
chr4	159514466	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=220,306;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	159529091	.	A	AT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr4	159548100	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=243,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr4	159549720	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=173,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,2:7,0:7,2,1,1
chr4	159568383	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	159572962	.	A	AG	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=139,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.232:24:7,5:10,0:13,6,5,0
chr4	159590922	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.286:11:1,1:5,2:3,5,0,3
chr4	159616585	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=230,104;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,1,1
chr4	159618695	.	CTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=194,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:5,1:7,1,2,0
chr4	159630817	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,255;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr4	159638426	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,37;MFRL=225,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr4	159642576	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=160,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.210:12:4,0:6,2:4,6,2,0
chr4	159644494	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=194,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,1:3,3:0|1:159644494_G_C:159644494:0,7,0,4
chr4	159644501	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=205,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,1:3,2:0|1:159644494_G_C:159644494:0,6,0,4
chr4	159754865	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=202,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.338:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr4	159780244	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=140,393;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,1:8,1:9,6,2,0
chr4	159789441	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,212;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,0:2,2:1,4,1,1
chr4	159881328	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=245,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,2:3,0,3,0
chr4	159894250	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr4	159894283	.	G	GGAGAA	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,0:6,2:0|1:159894283_G_GGAGAA:159894283:7,5,1,1
chr4	159894286	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=155,46;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0|1:159894283_G_GGAGAA:159894283:7,5,1,1
chr4	159894305	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,9:0,0,7,8
chr4	160189200	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32,34;MFRL=209,184,190;MMQ=60,60,60;MPOS=19,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.17,4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,2:0.200,0.237:10:2,1,2:4,1,0:6,0,4,0
chr4	160252704	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=187,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:6,2:3,8:6,3,2,8
chr4	160271268	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,2:3,2:6,3,3,1
chr4	160274613	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=203,272;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:4,3:9,0:14,5,3,0
chr4	160277276	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=145,137;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,3:4,3:5,5,2,4
chr4	160279317	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,0:6,3:2,10,0,3
chr4	162307060	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=180,147;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.386:29:9,8:9,3:8,10,5,6
chr4	162459299	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr4	162463660	.	G	GA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,221;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.262:13:4,0:6,3:7,3,1,2
chr4	162841814	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr4	164069397	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=269,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,3:0,2:2,0,5,0
chr4	164087954	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr4	164436633	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=173,104;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:10,0:7,8:4,13,0,8
chr4	164438523	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=124,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,2:4,0:6,2,2,0
chr4	164440461	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.450:9:1,1:3,2:4,1,2,2
chr4	164466970	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,1:3,4:0,6,0,5
chr4	164507104	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=180,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:3,2,0,6
chr4	165118066	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=185,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:8,0,5,0
chr4	165118652	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=111,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:3,7:4,7:4,3,5,9
chr4	165878170	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=177,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr4	165879215	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=164,289;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:4,0:5,6,1,1
chr4	165962078	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=179,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:2,1,0,1
chr4	166009844	.	T	TCTCATTTGGATAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=186,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr4	166149870	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,200;MMQ=52,24;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.428:26:5,11:10,0:15,0,11,0
chr4	166150086	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=157,122;MMQ=60,51;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,6:0.153:39:10,3:23,3:7,26,2,4
chr4	166215662	.	CT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=177,92;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.367:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr4	166232715	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=163,48;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.091:30:16,0:12,2:0|1:166232715_G_A:166232715:15,13,1,1
chr4	166232720	.	A	AGCGTCAGGAAATCTTCT	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=166,48;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:14,0:10,2:0|1:166232715_G_A:166232715:14,12,1,1
chr4	166259161	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0|1:166259161_C_T:166259161:0,2,0,2
chr4	166259163	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,19;MFRL=196,75;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,0:2,0:0|1:166259161_C_T:166259161:0,2,0,2
chr4	166259168	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=220,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:166259161_C_T:166259161:0,3,0,1
chr4	166307302	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr4	166336465	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:0,7,1,4
chr4	166403574	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=133,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:1,8,0,4
chr4	166405640	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=158,54;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:8,0:11,2:11,8,1,1
chr4	166408782	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=151,251;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:1,1:0,2:0,1,0,4
chr4	166910665	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,2:6,1:3,8,0,3
chr4	166916362	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,0:6,2:0,7,0,2
chr4	166929276	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=164,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr4	166960481	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:3,4:13,1:10,6,3,2
chr4	166978539	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:0,10,0,2
chr4	166981419	.	A	AGAACTGC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=178,163;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,2:3,0:0|1:166981419_A_AGAACTGC:166981419:0,10,0,2
chr4	166981422	.	A	AAGG	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:0|1:166981419_A_AGAACTGC:166981419:0,11,0,2
chr4	167012241	.	GTTT	G,GTT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,34,33;MFRL=0,165,277;MMQ=60,60,60;MPOS=13,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,6,8;RU=T;STR;TLOD=32.99,5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,3:0.712,0.233:15:0,5,0:0,5,3:0,0,14,1
chr4	167012250	.	T	TAA,A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,27,28;MFRL=0,165,277;MMQ=60,60,60;MPOS=17,15;POPAF=7.30,7.30;TLOD=32.99,5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,12,3:0.712,0.233:15:0,6,0:0,6,2:0,0,14,1
chr4	167012480	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=58.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,1,15
chr4	167012506	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=23,35;MFRL=106,207;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.779:7:1,1:0,5:0,1,1,5
chr4	167012543	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr4	167020778	.	CAA	C,CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,32,25;MFRL=268,196,247;MMQ=60,60,60;MPOS=29,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.60,3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.437,0.341:6:0,1,1:1,2,0:0,1,0,5
chr4	167656073	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,145;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:7,0,7,0
chr4	167656278	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:4,2:2,6,1,2
chr4	167675635	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=227,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	167983844	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=199,150;MMQ=60,33;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:4,0:2,3:0,7,0,3
chr4	169083757	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:6,2:5,9,1,1
chr4	169085249	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:4,13:6,0:10,0,13,0
chr4	169086540	.	CAA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr4	169098984	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=192,150;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,3:6,2:7,8,1,4
chr4	169143035	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=215,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:5,4:6,3:2,9,2,5
chr4	169143091	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=160,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr4	169158369	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=169,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,0:4,5:6,0,5,0
chr4	169158471	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:8,4:10,6:9,9,6,4
chr4	169158489	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=164,162;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:8,3:12,5:13,7,4,4
chr4	169172098	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=219,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,0:2,5:3,3,4,1
chr4	169183789	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=57.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,13,4
chr4	169188927	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=58.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,9:0,9:0,0,6,12
chr4	169190129	.	CAA	C,CA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35,32;MFRL=255,207,158;MMQ=60,60,60;MPOS=21,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=A;STR;TLOD=6.03,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,3:0.307,0.286:12:3,2,0:1,2,3:2,3,2,5
chr4	169206467	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=183,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr4	169213001	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=156,98;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:8,6,2,0
chr4	169213139	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	169223582	.	A	AGAGGAGTTGCAAG	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=167,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:2,11,1,1
chr4	169282187	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,0:6,2:7,0,2,0
chr4	169282232	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:3,1,5,1
chr4	169292759	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=102,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=51.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.681:23:2,8:5,8:3,4,12,4
chr4	169296472	.	TAACC	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=168,206;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:11,3:4,2:15,0,5,0
chr4	169299676	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=281,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr4	169301059	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=174,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:0,4,0,6
chr4	169301077	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=199,290;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:0,1:3,1:0,4,0,2
chr4	169312800	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,2:2,3:1,7,0,6
chr4	169312801	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=31,10;MFRL=92,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.758:9:0,0:2,0:2,1,0,6
chr4	169312802	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.403:14:5,0:3,3:1,7,0,6
chr4	169315571	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=53.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,13,3
chr4	169317081	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=212,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:2,0,3,1
chr4	169317279	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=193,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:5,1:0,11,0,2
chr4	169317284	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,31,31,20;MFRL=202,219,170,527;MMQ=60,60,60,60;MPOS=26,18,17;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=3.15,12.09,3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,5,2:0.186,0.378,0.186:12:1,0,2,0:2,2,3,1:0,3,0,9
chr4	169325124	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=164,227;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:7,2:13,0:10,10,2,0
chr4	169325282	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.666:12:2,5:2,2:2,2,0,8
chr4	169325297	.	AATTTGTGGAAACAG	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=154,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:5,1:2,11,0,2
chr4	169327905	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=152,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:1,9,0,2
chr4	169340431	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:5,1:17,1:13,9,1,1
chr4	169362557	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=117,131;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:2,7:2,4:1,3,7,4
chr4	169374487	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=195,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=48.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.885:15:1,7:0,7:0,1,1,13
chr4	169382822	.	A	AC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=344,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,5,2
chr4	169382991	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,204;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:5,5,3,0
chr4	169393972	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=224,225;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:2,1:0,5:0,2,0,6
chr4	169432892	.	T	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=192,197;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,11:0.324:35:7,10:17,0:16,8,11,0
chr4	169604080	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=209,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr4	169612441	.	C	T	.	.	DP=50;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,4:0.101:46:25,2:16,2:19,23,2,2
chr4	169612461	.	GT	G	.	.	DP=41;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=116,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.235:23:7,4:9,1:5,13,0,5
chr4	169819902	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=149,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,2:0,0:2,5,0,2
chr4	169835048	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:1,8:2,8:2,1,12,4
chr4	169842707	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=171,116;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:7,6:9,0:10,6,6,0
chr4	169842976	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=131,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr4	169846255	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=91.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.844:30:2,16:2,10:2,2,8,18
chr4	169846359	.	GCT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=210,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CT;STR;TLOD=46.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.830:15:1,9:1,4:0,2,9,4
chr4	169931268	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=247,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=130.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,32:0.892:35:1,17:2,14:0|1:169931268_G_A:169931268:2,1,12,20
chr4	169931274	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=108.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,25:0.897:27:0,13:2,12:0|1:169931268_G_A:169931268:1,1,8,17
chr4	169931288	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=31,32;MFRL=247,153;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=85.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,20:0.913:21:0,11:1,8:0|1:169931268_G_A:169931268:0,1,5,15
chr4	169931326	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=21,26;MFRL=147,248;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.754:10:0,1:1,4:0,2,0,8
chr4	170017860	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=282,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,4:3,6:1,4,2,8
chr4	170038575	.	AA	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=200,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,2:1,4:4,0,6,0
chr4	170345644	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=228,141;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr4	170354836	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:2,1,0,4
chr4	170354873	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=179,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr4	170359222	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=164,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr4	170398717	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:6,5:1,3:0,7,0,8
chr4	170428843	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=212,147;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:6,1,4,3
chr4	170429359	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,2,1
chr4	170483153	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=170,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.822:9:0,6:1,2:1,0,3,5
chr4	170501954	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=200,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,8:3,3:6,2,5,6
chr4	170506629	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=190,151;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:10,0:10,8:9,11,0,8
chr4	170508586	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,2:5,3:8,0,5,0
chr4	170601449	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr4	170613564	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=214,174;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:0,6,0,4
chr4	170616918	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr4	170618697	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=186,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,2:4,0:4,10,2,0
chr4	170628474	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr4	170638891	.	ACT	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,214;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,1:5,2:10,2,2,1
chr4	170640993	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=132,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:4,1,6,1
chr4	170658731	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,1:3,4:3,0,5,0
chr4	170658944	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=58,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.440:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr4	170663321	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	170669824	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,5,0
chr4	170985855	.	A	ACCT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=152,135;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCT;STR;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:2,1:3,1,4,1
chr4	170985927	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=164,94;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,4:11,0:11,10,4,0
chr4	170989708	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=250,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:1,2:3,2:4,0,2,2
chr4	170994554	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr4	172735897	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr4	173232679	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.782:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr4	173232944	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,5,11
chr4	173269915	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr4	173803914	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=173,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:0,1,8,2
chr4	173852247	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=155,57;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:4,0:5,2:9,1,2,0
chr4	173873170	.	TG	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,17,4
chr4	173930479	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,3:0,6:0,0,4,6
chr4	174242817	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=156,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,0:9,3:3,13,1,2
chr4	174253938	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=168,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.348:29:10,6:9,3:10,9,5,5
chr4	174294990	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr4	174449862	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=227,247;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:2,1,2,0
chr4	174537063	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,113;MMQ=60,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,4:0,0,2,2
chr4	174537471	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=138,164;MMQ=60,51;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,3:5,2:2,7,4,1
chr4	175237536	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=220,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:1,2:4,1:2,3,1,3
chr4	175414246	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr4	175414278	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=163,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr4	175429808	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=167,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr4	175580119	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=155,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:7,0,4,0
chr4	175649861	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.933:13:0,4:0,4:0|1:175649861_T_G:175649861:0,0,3,10
chr4	175649873	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=19,18;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.558:7:0,0:1,1:0|1:175649861_T_G:175649861:0,3,0,4
chr4	177049880	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=131,57;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:17,1:10,2:14,13,1,2
chr4	177083166	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=167,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr4	177093505	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=213,218;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.543:11:3,4:1,2:2,3,4,2
chr4	177095908	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,20;MFRL=0,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,3,5
chr4	177113764	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,8,1
chr4	177113779	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,1:2,3:5,0,2,2
chr4	177116463	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr4	177116779	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=281,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,6:2,4:0,2,1,9
chr4	177142776	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr4	177143664	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr4	177248446	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:6,7,1,1
chr4	177605081	.	CTCA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCA;STR;TLOD=26.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr4	177608775	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr4	177608875	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr4	177650614	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=307,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,6,0
chr4	178256759	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=188,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.448:7:1,2:2,1:3,1,3,0
chr4	178257516	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr4	178272748	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:1,0,3,3
chr4	178353046	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr4	178355668	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr4	178361414	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=174,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:9,3:3,6:6,6,5,4
chr4	178361491	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.251:29:14,0:7,6:11,11,0,7
chr4	178361621	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=161,188;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,4:5,0:1,6,1,3
chr4	178363378	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:6,5:4,8:9,1,11,2
chr4	178882120	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,0,10
chr4	178897192	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	183063751	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=201,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,3:6,2:8,9,0,5
chr4	183267728	.	TAA	T,TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26,25;MFRL=161,172,218;MMQ=60,60,60;MPOS=10,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.69,12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.294,0.553:10:1,2,3:0,1,3:1,0,9,0
chr4	183268148	.	C	CG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=G;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr4	183268174	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr4	183522021	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=341,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=AT;STR;TLOD=12.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.630:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr4	183522409	.	TTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=401,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TTG;STR;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr4	183550030	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=141,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:15,0:16,4:15,17,0,4
chr4	183600752	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=158,139;MMQ=57,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:6,1:4,2:10,0,3,0
chr4	183601666	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,272;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:7,1:7,3:7,7,2,2
chr4	183601847	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=121,196;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:4,2:14,3:0|1:183601847_T_C:183601847:7,11,3,2
chr4	183601849	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=141,63;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,2:0.123:22:7,0:13,2:1|0:183601847_T_C:183601847:9,11,1,1
chr4	183601857	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.120:23:7,0:9,2:1|0:183601847_T_C:183601847:7,14,1,1
chr4	183601858	.	A	ATTCTGTCCTATTTTTC	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:21,2:0.120:23:8,0:9,2:1|0:183601847_T_C:183601847:7,14,1,1
chr4	183673226	.	T	TA,TAA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,29,25;MFRL=175,173,138;MMQ=60,60,60;MPOS=22,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,16,17;RU=A;STR;TLOD=9.81,4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,6,4:0.382,0.257:17:3,0,1:3,5,2:1,6,1,9
chr4	183673247	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=64.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,5:0,12:0,0,1,16
chr4	183674577	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=43.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,10,2
chr4	183814169	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=188,62;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,0:1,2:4,2,0,2
chr4	183814198	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=165,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,1:6,1:6,8,0,2
chr4	184170025	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,4,11
chr4	184171187	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=64.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.905:19:1,12:0,6:0,1,4,14
chr4	184180920	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=194,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:3,2:4,3:3,4,1,4
chr4	184182001	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,13,5
chr4	184190355	.	A	AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:3,1,2,5
chr4	184190535	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=120,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:7,3:3,5:7,3,3,5
chr4	184192183	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=224,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:0,2:1,2:1,0,3,1
chr4	184201909	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=165,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:6,3,3,0
chr4	184202148	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	184207232	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=225,74;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:2,8,2,0
chr4	184236951	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=115,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:1,4,1,3
chr4	184366629	.	T	TGCACA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCACA;STR;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,2:2,5:2,0,7,1
chr4	184367558	.	TCTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=202,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=79.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,20:0.841:23:1,8:2,11:2,1,12,8
chr4	184426526	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=91.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.966:26:0,16:0,10:0,0,11,15
chr4	184427580	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=253,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,6:0,5:0,2,0,12
chr4	184431719	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=139,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.087:32:16,1:13,1:13,17,2,0
chr4	184567431	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:4,1:1,2:4,1,3,0
chr4	184567663	.	C	CCCGCCAAAAAAA	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=114,148;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,4:0.127:37:13,0:19,4:19,14,0,4
chr4	184570723	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.632:14:4,3:1,6:1,4,1,8
chr4	184572341	.	GA	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=134,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:9,1:14,3:17,8,4,0
chr4	184577177	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=227,169;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.833:16:0,5:2,9:0,2,4,10
chr4	184588121	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:1,1:6,1:7,0,2,0
chr4	184588305	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:4,1:7,2:4,7,0,3
chr4	184596309	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=171,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=34.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.543:24:5,6:6,7:6,5,2,11
chr4	184596446	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:0,2:5,2:1,4,1,3
chr4	184600601	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,6:4,2:4,5,1,7
chr4	184605467	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:9,2:5,0:7,7,2,0
chr4	184922669	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,2:6,1:1,6,0,3
chr4	184932332	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=136,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:6,3:14,3:10,10,3,3
chr4	184932609	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,7:0,5:0,0,1,11
chr4	185012398	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=146,162;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.469:15:5,4:3,3:5,3,5,2
chr4	185074686	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=212,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,5:5,1:2,5,3,3
chr4	185312027	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=214,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,3:0,3,0,7
chr4	185320095	.	TGCA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=158,86;MMQ=60,55;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:7,2:16,0:14,9,2,0
chr4	185329227	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=182,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:6,0,5,1
chr4	185339641	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=175,250;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:5,3:2,0:7,0,3,0
chr4	185350307	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=253,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr4	185552135	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,212;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:6,2:4,4:10,0,6,0
chr4	185552345	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=200,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr4	185553098	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=63.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,19:0.909:20:1,9:0,10:0,1,8,11
chr4	185553353	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr4	185559487	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=178,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.812:14:2,7:0,5:2,0,8,4
chr4	185578485	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:8,1:2,2:3,7,0,3
chr4	185580420	.	ACATT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:3,0,0,1
chr4	185583092	.	C	CTATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr4	185593699	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,125;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,3:2,8:0,4,0,11
chr4	185612627	.	CT	C,CTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=15,31,19;MFRL=204,162,53;MMQ=60,60,60;MPOS=5,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=14.36,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,8,2:0.605,0.240:11:0,5,0:0,2,0:0,1,5,5
chr4	185612953	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=221,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	185615764	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=125,135;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.518:25:7,8:5,4:0|1:185615764_C_A:185615764:5,7,4,9
chr4	185615768	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=125,144;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,12:0.500:24:7,8:5,4:0|1:185615764_C_A:185615764:5,7,4,8
chr4	185623312	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=149,214;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:10,3:7,3:7,10,1,5
chr4	185631338	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=174,89940230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:0,4,1,1
chr4	185634144	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=182,107;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.329:16:5,0:6,5:3,8,2,3
chr4	185634171	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=214,110;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.377:13:3,1:2,4:0,8,1,4
chr4	185634218	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=188,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:1,2:2,1:0,3,1,2
chr4	185638231	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=225,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,2:2,4:3,0,6,0
chr4	185646047	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=185,79;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr4	185650276	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=184,180;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,1,3
chr4	185652201	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=189,249;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,1:2,3:1,2,1,4
chr4	185652213	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr4	185681475	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=34.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr4	185681753	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	185684247	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=161,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:6,0,4,0
chr4	185686948	.	AAC	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=220,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:3,3:3,0:7,1,3,0
chr4	185694697	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=148,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:5,0,3,0
chr4	185694776	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=152,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.313:30:11,4:9,5:16,5,6,3
chr4	185694877	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=151,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:8,2:7,1:4,12,0,3
chr4	185701620	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr4	185709891	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=193,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:9,5:7,5:6,10,7,3
chr4	185724457	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,2:11,1:16,5,2,1
chr4	185940461	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=226,300;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr4	185940952	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:13,0:4,3:9,9,2,1
chr4	185941089	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr4	186065844	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=293,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,2:3,3:6,0,5,0
chr4	186097045	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=115,221;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:6,3:1,6:2,5,4,5
chr4	186097219	.	C	CA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=130,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr4	186097284	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=147,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:1,0,0,1
chr4	186168387	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr4	186185551	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=250,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:1,5:1,0,6,1
chr4	186188348	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=170,144;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr4	186188373	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.832:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	186272540	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=230,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr4	186320666	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr4	186321067	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,8,1
chr4	186321447	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=369,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:1,0,6,0
chr4	186324841	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr4	186336465	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.321:23:10,5:5,2:7,9,4,3
chr4	186336583	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr4	186347055	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=202,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,31:0.914:33:1,17:1,11:0,2,11,20
chr4	186347073	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=79.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,15:0,12:0,0,4,23
chr4	186347092	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=66.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,11:0,10:0,0,0,21
chr4	186361876	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=33.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,3:0,6:0,0,1,8
chr4	186361924	.	G	GGCCGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGTAA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=24.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr4	186366181	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=129,260;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:5,3:6,0:4,8,2,1
chr4	186366315	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	186366382	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr4	186370727	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=97,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,2:6,2:9,7,0,4
chr4	186380515	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,217;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:1,2,2,3
chr4	186423677	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=223,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,8:0,3:0,1,1,10
chr4	186423734	.	TCA	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=239,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr4	186427841	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=258,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:0,2:2,1:0,3,0,3
chr4	186427871	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=235,258;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr4	186429645	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:10,2:8,5,0,2
chr4	186444698	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=516,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.750:6:0,3:1,1:0|1:186444698_A_C:186444698:0,1,0,5
chr4	186444704	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=516,260;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:0|1:186444698_A_C:186444698:0,1,0,4
chr4	186456617	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,2,2
chr4	186508723	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=152,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:9,4:2,4:9,2,8,0
chr4	186541367	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:1,7,0,3
chr4	186545448	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=173,70;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:11,0:8,3:9,10,2,1
chr4	186551624	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr4	186567901	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=110,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:11,2:13,7,0,2
chr4	186567943	.	A	AACACGCTTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=137,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,0,2
chr4	186570521	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=222,255;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:10,0,2,0
chr4	186570855	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=210,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:3,0:7,3:2,8,0,3
chr4	186578529	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=199,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:8,1,2,0
chr4	186583185	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr4	186599992	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=205,181;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.696:17:3,8:1,4:2,3,6,6
chr4	186611576	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,37;MFRL=202,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr4	186997806	.	G	GTAGAGATA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=56,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,0:2,2:2,8,1,1
chr4	187000256	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,238;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:0,6,0,4
chr4	187004294	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=115,335;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:5,7,2,0
chr4	187005376	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.784:12:1,5:1,4:0,2,1,9
chr4	187005379	.	C	CT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,21;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=44.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,4:0,0,1,11
chr4	187073030	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr4	187077393	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr4	187078785	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=64.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,8:0,11:0,0,10,9
chr4	187078922	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=149,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:0,2,3,5
chr4	187078938	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,0:1,2:1,4,0,2
chr4	187093018	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.413:17:6,4:4,2:7,3,5,2
chr4	187115632	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=185,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,6:3,3:7,0,7,2
chr4	187115841	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=155,271;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr4	187118040	.	TTC	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,28;MFRL=151,188;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.640:9:1,4:1,2:3,0,6,0
chr4	187118358	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=165,326;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr4	187118662	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:6,3:5,5:8,3,5,3
chr4	187122304	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=134,166;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.268:24:10,2:8,4:10,8,1,5
chr4	187122319	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=134,190;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,4:8,2:9,9,2,4
chr4	187129995	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=151,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:11,1:8,2:11,10,1,2
chr4	187130198	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=163,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.449:16:2,2:6,5:4,5,2,5
chr4	187171355	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr4	187172280	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=220,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr4	187172353	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.432:7:3,1:1,2:2,2,2,1
chr4	187178300	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr4	187178599	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,0,7
chr4	187178613	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:1,2:1,1:0,3,0,3
chr4	187179210	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.961:23:0,11:0,12:0,0,11,12
chr4	187197328	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=204,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0|1:187197328_G_A:187197328:2,0,2,0
chr4	187197337	.	CTG	AGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=188,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,1:3,0:0|1:187197328_G_A:187197328:4,0,1,0
chr4	187209559	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=215,211;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:5,3,2,0
chr4	187209702	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:6,1:3,2:4,5,0,3
chr4	187454961	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=162,195;MMQ=60,23;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:8,5:6,0:6,8,0,5
chr4	187518980	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,121;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,4:1,6:0,1,4,6
chr4	187530313	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=42.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr4	187531191	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=201,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:2,5,0,3
chr4	187532981	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=215,160;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.557:5:0,0:1,2:0,2,0,3
chr4	187534542	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=249,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,2:4,2:0,6,0,4
chr4	187535552	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=184,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:0,1:4,0:0,4,0,1
chr4	187535588	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=264,165;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr4	187538133	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=137,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,3:0,6:1,1,8,1
chr4	187584502	.	TTTGTACATGAGC	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=172,115;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:5,2:5,0:10,4,1,1
chr4	187584771	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.831:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr4	187627659	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,23;MFRL=465,461;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.711:5:0,0:1,4:1,0,4,0
chr4	187628312	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=130,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,1:9,1:13,9,0,2
chr4	187630989	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=233,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr4	188924050	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:3,9:12,1:5,10,4,6
chr4	188925176	.	T	TGAC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:9,7:0,4:3,6,7,4
chr4	188925388	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=27,34;MFRL=209,190;MMQ=52,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:188925388_T_G:188925388:0,2,0,1
chr4	188925392	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=238,190;MMQ=43,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:188925388_T_G:188925388:0,1,0,1
chr4	188925395	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=238,190;MMQ=43,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:188925388_T_G:188925388:0,1,0,1
chr4	188925399	.	G	GATTGAAGC	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=238,190;MMQ=43,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:188925388_T_G:188925388:0,1,0,1
chr4	188925422	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=22,31;MFRL=423,238;MMQ=60,43;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188925422_T_G:188925422:1,0,0,1
chr4	188925425	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=25,25;MFRL=423,238;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:188925422_T_G:188925422:1,0,0,1
chr4	189025972	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=126,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.430:19:5,4:6,4:5,6,6,2
chr4	189061675	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=148,229;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:7,1:1,2:6,2,3,0
chr4	189063361	.	CGTGTGTGTGT	C,CGTGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32,31;MFRL=0,82,133;MMQ=30,60,60;MPOS=9,5;POPAF=7.30,7.30;RPA=18,13,15;RU=GT;STR;TLOD=14.54,10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,3:0.476,0.375:8:1,2,1:0,2,2:1,0,7,0
chr4	189064873	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=219,151;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,2,1
chr4	189065055	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr4	189065104	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr4	190862083	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=175,148;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:3,1,4,1
chr4	190862155	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:6,8:2,8:3,5,9,7
chr4	190862182	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,20:0.657:30:6,9:4,11:3,7,12,8
chr4	190862239	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=15;MBQ=34,32;MFRL=188,150;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,15:0.444:34:12,6:7,9:0|1:190862239_G_C:190862239:9,10,13,2
chr4	190862242	.	TG	CC	.	.	DP=34;ECNT=15;MBQ=28,32;MFRL=188,150;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,15:0.444:34:12,6:6,9:0|1:190862239_G_C:190862239:9,10,13,2
chr4	190862259	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=28,30;MFRL=188,143;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=42.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.467:28:10,6:5,6:0|1:190862239_G_C:190862239:5,10,7,6
chr4	190862285	.	CG	C	.	.	DP=31;ECNT=15;MBQ=27,34;MFRL=169,143;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.451:29:11,5:4,5:0|1:190862285_CG_C:190862285:2,14,0,13
chr4	190862287	.	C	T,CTCG	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=29,28,35;MFRL=165,167,143;MMQ=50,60,52;MPOS=14,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=25.46,49.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,9,13:0.331,0.438:28:4,7,5:2,2,5:0,6,1,21
chr4	190862288	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=26,31;MFRL=154,152;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,4:0.156:30:13,3:13,0:0|1:190862288_A_G:190862288:2,24,0,4
chr4	190862289	.	AC	A	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=25,25;MFRL=170,143;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=48.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,13:0.437:30:10,5:5,7:0|1:190862285_CG_C:190862285:2,15,0,13
chr4	190862290	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=33,24;MFRL=176,152;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.204:22:7,3:5,1:0|1:190862288_A_G:190862288:2,16,0,4
chr4	190862302	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=34,29;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:11,3:17,1:0|1:190862288_A_G:190862288:1,29,0,5
chr4	190862307	.	G	C	.	.	DP=35;ECNT=15;MBQ=34,31;MFRL=157,151;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,5:0.162:35:12,4:17,1:0|1:190862288_A_G:190862288:1,29,0,5
chr4	190862318	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=15;MBQ=29,30;MFRL=173,152;MMQ=60,41;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.159:42:13,5:22,1:0|1:190862288_A_G:190862288:1,35,0,6
chr4	190862319	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=164,93;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,6:0.159:42:16,2:18,4:0|1:190862319_G_A:190862319:1,35,0,6
chr4	190862330	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=15;MBQ=35,25;MFRL=181,177;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.143:40:12,4:22,1:0|1:190862288_A_G:190862288:1,34,0,5
chr4	190862341	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=185,190;MMQ=60,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=51.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,18:0.487:37:8,7:11,11:1,18,0,18
chr4	190862342	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=15;MBQ=33,28;MFRL=189,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,6:0.179:37:12,2:18,4:0|1:190862319_G_A:190862319:1,30,0,6
chr4	190873254	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=138,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.529:11:5,4:0,2:3,2,4,2
chr4	190873436	.	AAAG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=151,186;MMQ=50,23;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,1:7,1:4,11,2,0
chr4	190873543	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=201,165;MMQ=40,23;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:6,2:3,2:2,8,1,3
chr4	190874167	.	G	A	.	.	DP=63;ECNT=10;MBQ=32,25;MFRL=141,133;MMQ=48,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=85.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,29:0.493:59:16,15:13,13:20,10,11,18
chr4	190874175	.	A	G	.	.	DP=79;ECNT=10;MBQ=27,32;MFRL=151,126;MMQ=48,48;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:68,4:0.067:72:38,1:26,3:35,33,4,0
chr4	190874183	.	C	A	.	.	DP=88;ECNT=10;MBQ=33,24;MFRL=148,134;MMQ=47,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,17:0.200:86:32,9:34,7:39,30,6,11
chr4	190874199	.	T	A	.	.	DP=101;ECNT=10;MBQ=28,28;MFRL=146,137;MMQ=48,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:87,13:0.137:100:40,7:44,6:0|1:190874199_T_A:190874199:40,47,10,3
chr4	190874206	.	T	A	.	.	DP=105;ECNT=10;MBQ=28,30;MFRL=141,137;MMQ=48,43;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:90,13:0.133:103:42,7:44,6:0|1:190874199_T_A:190874199:38,52,10,3
chr4	190874234	.	C	T	.	.	DP=103;ECNT=10;MBQ=32,28;MFRL=136,131;MMQ=48,43;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:80,16:0.173:96:38,8:42,8:32,48,10,6
chr4	190874255	.	A	T	.	.	DP=98;ECNT=10;MBQ=25,25;MFRL=122,110;MMQ=49,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:71,20:0.224:91:31,15:39,5:31,40,10,10
chr4	190874290	.	T	A	.	.	DP=67;ECNT=10;MBQ=28,26;MFRL=133,134;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,13:0.211:65:25,10:24,3:19,33,1,12
chr4	190874315	.	TA	GA,GT	.	.	DP=48;ECNT=10;MBQ=27,32,34;MFRL=149,134,144;MMQ=40,40,32;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=28.74,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:34,9,2:0.203,0.062:45:21,7,1:13,2,1:8,26,0,11
chr4	190874352	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=32,31;MFRL=151,157;MMQ=40,35;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,2:6,0:5,15,0,2
chr4	190876134	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=189,184;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:7,11:7,0:13,1,11,0
chr4	190876195	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=20;MBQ=29,25;MFRL=116,126;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,13:0.500:26:8,6:5,7:9,4,9,4
chr4	190876242	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=156,110;MMQ=60,37;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=124.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,47:0.623:75:12,23:16,24:13,15,36,11
chr4	190876247	.	G	C	.	.	DP=85;ECNT=20;MBQ=32,28;MFRL=122,112;MMQ=46,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,2:0.034:85:40,1:42,1:0|1:190876247_G_C:190876247:52,31,1,1
chr4	190876250	.	G	A	.	.	DP=95;ECNT=20;MBQ=32,25;MFRL=115,112;MMQ=47,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:92,2:0.031:94:42,1:45,1:0|1:190876247_G_C:190876247:54,38,1,1
chr4	190876256	.	C	T	.	.	DP=98;ECNT=20;MBQ=27,25;MFRL=115,141;MMQ=46,31;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:91,6:0.070:97:43,2:46,4:0|1:190876256_C_T:190876256:52,39,3,3
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chr4	190876269	.	T	C	.	.	DP=93;ECNT=20;MBQ=25,20;MFRL=126,103;MMQ=42,37;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:83,6:0.075:89:36,4:47,2:43,40,3,3
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chr4	190876278	.	G	A	.	.	DP=81;ECNT=20;MBQ=31,27;MFRL=106,156;MMQ=41,20;MPOS=33;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:76,5:0.072:81:32,2:40,3:0|1:190876256_C_T:190876256:34,42,2,3
chr4	190876287	.	G	A	.	.	DP=77;ECNT=20;MBQ=31,28;MFRL=115,113;MMQ=40,37;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:71,6:0.089:77:27,2:40,3:0|1:190876268_A_G:190876268:28,43,2,4
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chr4	190876301	.	C	A	.	.	DP=67;ECNT=20;MBQ=32,24;MFRL=114,126;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:59,5:0.087:64:26,2:30,3:0|1:190876301_C_A:190876301:15,44,2,3
chr4	190876305	.	A	T	.	.	DP=61;ECNT=20;MBQ=25,30;MFRL=114,156;MMQ=40,37;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:56,4:0.081:60:25,2:24,2:0|1:190876301_C_A:190876301:14,42,1,3
chr4	190876307	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=20;MBQ=32,23;MFRL=125,113;MMQ=40,25;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:51,4:0.087:55:26,1:21,3:0|1:190876268_A_G:190876268:9,42,1,3
chr4	190876319	.	A	T	.	.	DP=43;ECNT=20;MBQ=25,30;MFRL=169,106;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=38.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.403:40:12,9:11,7:3,21,1,15
chr4	190876335	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=20;MBQ=29,34;MFRL=148,167;MMQ=40,25;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:17,1:14,1:0|1:190876335_T_C:190876335:1,30,0,2
chr4	190876343	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=20;MBQ=32,27;MFRL=166,167;MMQ=40,25;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:17,1:12,1:0|1:190876335_T_C:190876335:1,30,0,2
chr4	190876349	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=175,156;MMQ=58,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.272:31:12,7:11,1:1,22,0,8
chr4	190876351	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=20;MBQ=32,32;MFRL=170,139;MMQ=40,32;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:17,2:13,0:1,29,0,2
chr4	190876359	.	GT	G	.	.	DP=28;ECNT=20;MBQ=32,32;MFRL=182,164;MMQ=60,23;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:8,7:7,2:1,17,0,9
chr4	190878452	.	TG	CA	.	.	DP=71;ECNT=18;MBQ=27,33;MFRL=194,237;MMQ=48,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,5:0.083:70:35,3:28,2:46,19,5,0
chr4	190878463	.	T	G	.	.	DP=76;ECNT=18;MBQ=27,33;MFRL=195,205;MMQ=51,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=62.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:52,22:0.303:74:31,11:18,11:36,16,16,6
chr4	190878485	.	G	A	.	.	DP=62;ECNT=18;MBQ=33,29;MFRL=182,213;MMQ=51,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=57.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,18:0.311:59:24,9:17,8:25,16,10,8
chr4	190878504	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=18;MBQ=34,28;MFRL=182,169;MMQ=42,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,9:0.270:35:16,5:8,4:0|1:190878504_C_T:190878504:16,10,5,4
chr4	190878506	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=18;MBQ=35,28;MFRL=176,181;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=70.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,21:0.628:33:8,13:4,8:8,4,13,8
chr4	190878512	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=18;MBQ=30,34;MFRL=182,157;MMQ=41,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,8:0.273:31:15,4:8,3:0|1:190878504_C_T:190878504:14,9,4,4
chr4	190878538	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=27,28;MFRL=196,197;MMQ=54,40;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.483:16:6,4:1,4:3,5,5,3
chr4	190878563	.	C	A	.	.	DP=55;ECNT=18;MBQ=33,28;MFRL=171,191;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:46,6:0.129:52:30,6:14,0:29,17,3,3
chr4	190878567	.	G	C	.	.	DP=63;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=171,141;MMQ=40,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:58,5:0.092:63:34,5:18,0:0|1:190878567_G_C:190878567:35,23,3,2
chr4	190878569	.	T	C	.	.	DP=68;ECNT=18;MBQ=28,31;MFRL=172,141;MMQ=40,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:63,5:0.086:68:37,5:21,0:0|1:190878567_G_C:190878567:37,26,3,2
chr4	190878580	.	A	G	.	.	DP=85;ECNT=18;MBQ=29,33;MFRL=173,169;MMQ=40,40;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,19:0.238:82:42,13:20,6:40,23,11,8
chr4	190878583	.	T	C	.	.	DP=89;ECNT=18;MBQ=29,32;MFRL=170,122;MMQ=40,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:83,6:0.077:89:54,5:26,1:0|1:190878567_G_C:190878567:53,30,4,2
chr4	190878597	.	C	T	.	.	DP=99;ECNT=18;MBQ=33,28;MFRL=170,170;MMQ=40,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:63,36:0.366:99:46,21:16,15:40,23,23,13
chr4	190878599	.	A	G	.	.	DP=103;ECNT=18;MBQ=30,33;MFRL=170,141;MMQ=40,40;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:96,7:0.076:103:60,6:29,1:0|1:190878567_G_C:190878567:61,35,4,3
chr4	190878600	.	TGAAGCAGGGGACATAGAA	T	.	.	DP=140;ECNT=18;MBQ=28,28;MFRL=168,141;MMQ=40,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:129,7:0.058:136:61,6:31,1:0|1:190878567_G_C:190878567:81,48,4,3
chr4	190878654	.	C	G	.	.	DP=142;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=139,163;MMQ=40,40;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:117,22:0.163:139:72,15:42,7:43,74,12,10
chr4	190878661	.	A	T	.	.	DP=142;ECNT=18;MBQ=25,29;MFRL=143,151;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=103.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:96,45:0.321:141:58,32:38,13:38,58,14,31
chr4	190878662	.	T	C	.	.	DP=144;ECNT=18;MBQ=29,27;MFRL=151,123;MMQ=40,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:123,19:0.138:142:81,9:39,10:45,78,7,12
chr4	190878700	.	G	A	.	.	DP=82;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=147,146;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:65,11:0.145:76:40,5:24,6:14,51,1,10
chr4	190878703	.	G	A	.	.	DP=74;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=148,144;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:64,9:0.123:73:37,4:24,4:13,51,0,9
chr4	190878728	.	AATG	A	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=180,144;MMQ=60,37;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.155:24:6,2:11,1:3,18,1,2
chr4	190878742	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=180,207;MMQ=48,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,3:6,6:1,14,2,8
chr4	190878750	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=179,205;MMQ=52,45;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:11,4:13,1:4,20,0,5
chr4	190881826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,329;MMQ=30,21;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,3:5,2:4,4,3,2
chr4	190881895	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=30,24;MFRL=180,311;MMQ=27,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:11,0:6,3:10,7,3,0
chr4	190881933	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=26,34;MFRL=222,139;MMQ=40,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,2:4,1:5,4,3,0
chr4	190881969	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=171,120;MMQ=40,31;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.331:34:13,4:10,7:13,10,5,6
chr4	190881992	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=28,27;MFRL=170,139;MMQ=41,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,19:0.426:45:14,9:12,10:0|1:190881992_T_C:190881992:14,12,6,13
chr4	190881997	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=167,139;MMQ=41,31;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=71.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,19:0.426:45:13,9:11,10:0|1:190881992_T_C:190881992:13,13,6,13
chr4	190882098	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,0;MFRL=166,290;MMQ=60,34;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,0:0,6,0,2
chr4	190882909	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=20;MBQ=26,35;MFRL=176,167;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.122:47:17,2:24,3:34,8,4,1
chr4	190882911	.	A	T	.	.	DP=49;ECNT=20;MBQ=30,25;MFRL=168,185;MMQ=40,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:44,5:0.118:49:17,3:25,2:0|1:190882911_A_T:190882911:35,9,5,0
chr4	190882917	.	A	G	.	.	DP=50;ECNT=20;MBQ=30,35;MFRL=168,185;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:45,5:0.115:50:16,3:28,2:0|1:190882911_A_T:190882911:35,10,5,0
chr4	190882928	.	G	A	.	.	DP=50;ECNT=20;MBQ=33,30;MFRL=168,180;MMQ=37,34;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,4:0.099:48:16,2:28,2:32,12,3,1
chr4	190882949	.	T	C	.	.	DP=58;ECNT=20;MBQ=28,32;MFRL=171,164;MMQ=37,29;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:48,8:0.155:56:17,2:31,6:28,20,7,1
chr4	190882973	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=20;MBQ=28,35;MFRL=167,207;MMQ=52,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,0:14,4:9,16,0,4
chr4	190882998	.	A	G	.	.	DP=58;ECNT=20;MBQ=29,34;MFRL=168,198;MMQ=52,26;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:23,0:24,4:18,31,2,2
chr4	190883001	.	C	G	.	.	DP=62;ECNT=20;MBQ=32,35;MFRL=175,165;MMQ=52,31;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,9:0.164:59:23,4:26,5:21,29,2,7
chr4	190883007	.	A	G	.	.	DP=65;ECNT=20;MBQ=28,35;MFRL=172,168;MMQ=49,39;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:28,2:31,1:24,37,1,2
chr4	190883026	.	G	T	.	.	DP=64;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=169,147;MMQ=45,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:59,5:0.090:64:32,2:26,3:23,36,1,4
chr4	190883030	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=20;MBQ=32,30;MFRL=168,187;MMQ=40,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:61,3:0.060:64:32,2:27,1:24,37,0,3
chr4	190883046	.	G	A	.	.	DP=59;ECNT=20;MBQ=32,23;MFRL=169,145;MMQ=48,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:54,4:0.074:58:28,4:23,0:23,31,2,2
chr4	190883051	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=20;MBQ=30,27;MFRL=171,179;MMQ=60,27;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,17:0.383:45:15,9:13,8:15,13,2,15
chr4	190883075	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=20;MBQ=30,28;MFRL=165,179;MMQ=50,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:13,2:16,1:13,18,1,2
chr4	190883080	.	CT	AG	.	.	DP=35;ECNT=20;MBQ=35,24;MFRL=169,185;MMQ=40,34;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.081:35:13,1:17,1:13,20,0,2
chr4	190883092	.	CTATT	C	.	.	DP=33;ECNT=20;MBQ=35,36;MFRL=168,205;MMQ=50,25;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TATT;STR;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:11,1:13,3:11,15,0,4
chr4	190883100	.	T	G	.	.	DP=31;ECNT=20;MBQ=30,32;MFRL=177,160;MMQ=52,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.186:30:11,1:14,4:9,16,3,2
chr4	190883110	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=20;MBQ=33,32;MFRL=169,230;MMQ=52,25;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.222:34:13,2:14,5:10,17,0,7
chr4	190883115	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=20;MBQ=27,33;MFRL=180,201;MMQ=52,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:12,1:17,1:10,24,0,2
chr4	190883117	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=20;MBQ=30,35;MFRL=180,230;MMQ=52,25;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:12,1:17,2:9,20,0,3
chr4	190883174	.	GT	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=184,201;MMQ=60,31;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:5,3:5,1:2,8,0,4
chr4	190884168	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=164,156;MMQ=52,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:7,1:6,2:8,5,0,3
chr4	190884225	.	T	TTTC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=123,168;MMQ=60,53;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,6:3,6:2,3,8,4
chr4	190904644	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=211,121;MMQ=40,23;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr4	190904717	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=135,191;MMQ=25,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:1,3,3,0
chr4	190905595	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=228,221;MMQ=51,25;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr4	190905897	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=182,220;MMQ=40,24;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:3,0:0,1:0|1:190905897_C_T:190905897:3,0,1,0
chr4	190905904	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=182,181;MMQ=40,23;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:0|1:190905897_C_T:190905897:3,0,2,0
chr4	190906025	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=142,106;MMQ=54,50;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,7:4,3:4,5,4,6
chr4	190906057	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=133,131;MMQ=52,35;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:0|1:190906057_G_A:190906057:2,5,0,5
chr4	190906060	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=133,131;MMQ=52,35;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:0|1:190906057_G_A:190906057:2,5,0,5
chr4	190906080	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=26,33;MFRL=144,132;MMQ=52,32;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr4	190906142	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,51;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	156218	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=154,156;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:5,4,1,1
chr5	169763	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=233,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:0,3,0,2
chr5	172971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:3,1,3,1
chr5	182077	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=201,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:2,2,3,0
chr5	192152	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	192437	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=166,70;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.270:23:8,0:9,5:10,7,5,1
chr5	194857	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=138,97;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.159:29:11,0:14,4:12,13,0,4
chr5	195507	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	224633	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=144,178;MMQ=49,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.193:24:7,1:12,3:9,11,1,3
chr5	224692	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=169,188;MMQ=51,50;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,2:5,2:4,10,0,4
chr5	225768	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=234,339;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,3:1,1:1,2,0,4
chr5	225941	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=231,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,2,0
chr5	226222	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=189,185;MMQ=56,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:0,6,0,4
chr5	228278	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=194,189;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr5	230980	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=145,138;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:3,7:5,9:5,3,11,5
chr5	231111	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=119,181;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.600:23:8,6:1,8:3,6,3,11
chr5	231143	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=141,161;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:1,9,1,1
chr5	233517	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=324,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	233572	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=128,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,2,2
chr5	235249	.	G	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=114,126;MMQ=58,22;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,15:0.390:39:12,0:12,15:14,10,0,15
chr5	235548	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=204,227;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,1:6,2:0,10,0,3
chr5	236753	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=167,165;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:236753_C_T:236753:1,3,0,3
chr5	236760	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=167,165;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:2,1:0|1:236753_C_T:236753:1,3,0,3
chr5	240663	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=179,155;MMQ=57,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:2,6,0,2
chr5	254442	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,27;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
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chr5	254711	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=194,140;MMQ=57,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:3,0:3,2:0|1:254706_G_A:254706:2,6,2,0
chr5	304220	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,299;MMQ=27,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:9,3,2,0
chr5	311478	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=181,175;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.238:22:8,4:9,0:6,11,1,4
chr5	354051	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=125,175;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:4,0:2,2:3,3,0,2
chr5	413428	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.862:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	413594	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,7:1,1:1,2,1,7
chr5	413621	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr5	422752	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=191,204;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr5	423906	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=136,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr5	428166	.	GC	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=192,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=30.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,6:2,6:0,4,1,11
chr5	432905	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.338:24:8,3:8,4:10,6,2,6
chr5	433952	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=203,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,1:8,4:8,6,3,2
chr5	434981	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.853:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	434998	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=189,221;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0,3,0,3
chr5	442571	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	453498	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:18,4:9,0:13,14,3,1
chr5	456915	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr5	457955	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=192,121;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr5	458161	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=114,78;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:5,8,2,0
chr5	459415	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,1:4,3:6,0,4,0
chr5	462465	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=171,145;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:3,12,1,2
chr5	464339	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	466811	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,9,2
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chr5	475585	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,16;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:475585_T_G:475585:4,0,1,0
chr5	475589	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,12;MFRL=209,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:475585_T_G:475585:4,0,1,0
chr5	475591	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=25,29;MFRL=208,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:475585_T_G:475585:3,0,1,0
chr5	475621	.	T	TG	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=26,28;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=33.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,6:2,2:0|1:475621_T_TG:475621:2,0,8,0
chr5	475626	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.771:11:0,6:2,3:0|1:475621_T_TG:475621:2,0,9,0
chr5	476530	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,3,9
chr5	477634	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	479879	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,105;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	479905	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	481610	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,10,1
chr5	482653	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=38.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,9:0,2:1,0,7,4
chr5	491944	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,1:1,1:4,5,2,0
chr5	612414	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	619333	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	647896	.	CT	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=148,243;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:16,3:5,0:19,3,3,0
chr5	653204	.	T	TGGGCCACC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,315;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0,3,0,1
chr5	666323	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	801362	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,45;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,0:0,3:0,0,0,4
chr5	878461	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,229;MMQ=60,30;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:5,3,2,0
chr5	879989	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,210;MMQ=27,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:5,0,2,0
chr5	884104	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,1:8,1:10,6,2,0
chr5	904444	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=183,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	1034784	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=183,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	1034952	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=137,224;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:3,2:6,0:6,3,1,1
chr5	1035399	.	T	TAATG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AATG;STR;TLOD=32.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr5	1035482	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=37.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,8:0,2:0,0,6,4
chr5	1036521	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=220,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	1053396	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=208,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,2:1,5:2,0,7,0
chr5	1053697	.	GAA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=223,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr5	1060366	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	1060400	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr5	1065383	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,193;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:4,2:8,0:6,6,2,0
chr5	1065683	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=177,241;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:1065683_A_C:1065683:0,2,0,2
chr5	1065689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0|1:1065683_A_C:1065683:0,0,0,4
chr5	1073689	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr5	1078898	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,5,4
chr5	1079506	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,52657;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:6,4,1,1
chr5	1081668	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=208,120;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=37.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:3,9:1,4:3,1,11,2
chr5	1081702	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=207,120;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.834:22:3,12:0,7:2,1,10,9
chr5	1085322	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=165,230;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.321:7:1,1:2,0:3,2,2,0
chr5	1085604	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=120,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr5	1093609	.	G	GGGGCGGGGACT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGCGGGGACT;STR;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	1094389	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=214,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,4:0,1,2,3
chr5	1212357	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,87;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	1212503	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,0:3,6:5,4,0,6
chr5	1214005	.	CCCT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=213,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	1214264	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr5	1218928	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,267;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	1221199	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	1225564	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	1225626	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,7:0,0,8,7
chr5	1225653	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=186,149;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:7,2:9,0:6,12,1,1
chr5	1225676	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=182,184;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:10,2:6,1:3,13,2,1
chr5	1225687	.	CT	TC	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr5	1225801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=189,249;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:1,4,0,3
chr5	1232274	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0,0,2,0
chr5	1232276	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:1232276_G_C:1232276:0,0,2,0
chr5	1232279	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,0:0|1:1232276_G_C:1232276:0,0,2,0
chr5	1232491	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,3,4
chr5	1232775	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=199,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr5	1240848	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	1243009	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:1,5,1,5
chr5	1253744	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	1258718	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=178,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:5,5,1,1
chr5	1266616	.	CCA	GAG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=158,50;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0|1:1266616_CCA_GAG:1266616:3,6,1,1
chr5	1266620	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=158,50;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,2:3,0:0|1:1266616_CCA_GAG:1266616:3,6,1,1
chr5	1320722	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:2,1:5,5:5,2,5,1
chr5	1325767	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=152,239;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr5	1325803	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.297:15:6,3:4,1:7,4,2,2
chr5	1334507	.	GA	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=121,210;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.459:22:6,8:6,2:4,8,4,6
chr5	1335385	.	CTG	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=176,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TG;STR;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr5	1338078	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=157,83;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:6,3:8,2:7,8,2,3
chr5	1338940	.	TC	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,0:9,2:8,6,2,0
chr5	1344458	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:8,6:6,7:7,7,8,5
chr5	1394815	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,135;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,3:4,1:4,4,1,3
chr5	1409127	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr5	1409985	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.541:20:7,8:2,2:1,8,5,6
chr5	1411412	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.508:12:2,3:2,3:3,3,4,2
chr5	1414823	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=151,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,2,0
chr5	1442974	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=276,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.657:7:1,1:1,2:2,0,4,1
chr5	1442979	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=175,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,1,1
chr5	1442987	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,24;MFRL=238,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.429:7:1,1:3,1:2,2,3,0
chr5	1464028	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=136,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr5	1466813	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,33;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,1:1,1:1,1,2,0
chr5	1470900	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=139,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.522:17:4,3:4,5:5,3,8,1
chr5	1471109	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	1473977	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	1474752	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,62;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:2,1:10,1:8,4,2,0
chr5	1479678	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr5	1481148	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=159,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr5	1501542	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.298:15:5,1:6,3:9,2,4,0
chr5	1801689	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,0,4
chr5	1814369	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:3,1,2,0
chr5	1814395	.	TTGTA	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGTA;STR;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,6,1
chr5	1878496	.	TGGC	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,18;MFRL=238,80;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GGC;STR;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,0:0,1:0,1,1,1
chr5	1881916	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,219;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:9,1:3,3:8,4,0,4
chr5	5140958	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:5140958_T_A:5140958:0,0,0,2
chr5	5140970	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=225,251;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:5140958_T_A:5140958:0,1,0,1
chr5	5146200	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=227,214;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:0,3:7,1:7,0,4,0
chr5	5146223	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,11,2
chr5	5187776	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=232,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:1,1,6,2
chr5	5190162	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,140;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:12,2:4,0:7,9,2,0
chr5	5200220	.	A	ATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=190,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TC;STR;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.716:5:1,3:0,1:1,0,3,1
chr5	5223073	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=150,134;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:1,2,0,3
chr5	5232398	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	5235028	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	5235096	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	5239783	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=172,104;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,5:5,0:8,4,5,0
chr5	5262766	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:6,1:7,3:8,5,3,1
chr5	5303349	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=257,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,5:2,2:3,2,5,2
chr5	5303614	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:1,2:7,0:5,3,0,2
chr5	5441371	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=163,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.409:27:3,0:13,10:3,13,0,11
chr5	5460569	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:1,11:1,5:1,1,10,6
chr5	5465088	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=185,15791956;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:11,0:12,2:9,14,2,0
chr5	5465158	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=151,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:9,0:11,2:9,11,0,2
chr5	5476250	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,18;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,1:0,0,0,5
chr5	6372585	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,3:6,5:8,8,6,2
chr5	6378614	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=26.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,5,7
chr5	6491497	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.264:17:3,1:9,3:4,9,1,3
chr5	6491532	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=189,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.273:12:4,1:5,2:0,9,0,3
chr5	6602668	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:0,1,2,6
chr5	6605532	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,4:0,0,3,7
chr5	6605540	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=237,736;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:4,2:3,6,0,2
chr5	6607125	.	GAAC	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr5	6611238	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=162,121;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:14,0:9,4:2,21,0,4
chr5	6611757	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr5	6611983	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr5	6617011	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	6618186	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	6620459	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr5	6623405	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=198,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:2,0:1,2:1,5,0,2
chr5	6623432	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,0:0,0,0,3
chr5	6632067	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=154,70;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:12,1:9,2:8,13,1,2
chr5	6632143	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=166,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr5	6632875	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=34,24;MFRL=231,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.783:21:2,4:2,13:2,2,8,9
chr5	6632909	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=319,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.751:14:2,4:1,7:0,3,2,9
chr5	6632942	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=227,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:2,2:1,6:0,3,0,8
chr5	6633042	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=265,281;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr5	6737571	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=252,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr5	6748518	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=221,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:1,5:1,5:2,0,6,4
chr5	6754762	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,4:0,0:1,0,4,0
chr5	7690707	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr5	7690754	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=161,206;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,3:7,0:8,4,3,0
chr5	7695845	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=208,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:2,4:1,4:1,2,6,2
chr5	7696028	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=212,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:1,3,0,2
chr5	7743787	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,156;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,3:8,3:7,3,3,3
chr5	7757705	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,6:0,5:0,0,4,7
chr5	7757715	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,189;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.936:12:0,7:0,4:0,0,5,7
chr5	7782231	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr5	7835616	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=155,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=28.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:3,5:0,3:1,2,4,7
chr5	7835685	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	7859523	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,99;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:7,5:8,2:11,4,6,1
chr5	7861470	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=223,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:2,8,0,2
chr5	7861638	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=237,166;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:2,1,7,1
chr5	7862926	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:7,2,2,1
chr5	7863141	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=236,196;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7863141_G_A:7863141:0,1,0,1
chr5	7863144	.	A	AATTCTAATGCCTGATTTGTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=236,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:7863141_G_A:7863141:0,1,0,1
chr5	7866135	.	TTGAGG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=146,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:2,2:0,6,0,4
chr5	7875307	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=176,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,2:2,1:7,1,3,0
chr5	7883188	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr5	7885782	.	AT	A,ATT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30,30;MFRL=169,191,147;MMQ=60,60,60;MPOS=22,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.43,10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.211,0.431:11:3,1,3:1,1,2:4,0,7,0
chr5	7886026	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=152,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,2:0,0:1,2,1,1
chr5	7891610	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=177,163;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr5	7893080	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,34;MFRL=145,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr5	7893106	.	A	ACCTTACACC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7893106_A_ACCTTACACC:7893106:0,4,0,1
chr5	7893109	.	T	TCTC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=185,112;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:7893106_A_ACCTTACACC:7893106:0,4,0,1
chr5	7893121	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=172,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr5	7896957	.	CT	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=80,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:11,3:5,0:15,4,2,1
chr5	9043142	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,3:0,2:0,1,1,4
chr5	9050410	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=246,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	9066464	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,310;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:6,1,2,0
chr5	9108333	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.278:23:8,2:9,4:9,8,4,2
chr5	9108427	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=202,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:10,1:4,2:2,12,0,3
chr5	9122926	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=251,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:5,5:11,3:7,9,3,5
chr5	10227548	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.530:7:0,3:3,1:3,0,2,2
chr5	10227823	.	C	CCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,0,5
chr5	10235220	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=203,58;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr5	10250047	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=0,143;MMQ=49,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,18:0.913:19:0,8:1,8:0,1,0,18
chr5	10250430	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=266,169;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=115.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,40:0.837:47:4,20:3,20:3,4,24,16
chr5	10250443	.	T	C	.	.	DP=49;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=266,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=136.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,40:0.837:47:4,21:3,19:3,4,24,16
chr5	10255021	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=195,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.726:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr5	10256161	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=212,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.680:26:2,11:5,7:4,4,11,7
chr5	10256365	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=237,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.691:7:0,4:1,1:0,2,0,5
chr5	10258125	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=215,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,3:1,6:1,1,8,1
chr5	10262740	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=204,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,8:1,1:0,1,1,8
chr5	10263453	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=182,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,1,0,7
chr5	10263457	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=182,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:1,2:0,4:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,1,0,8
chr5	10263461	.	GGGA	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:1,2:0,4:0|1:10263453_GA_G:10263453:0,1,0,7
chr5	10264962	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	10282479	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	10394911	.	ATTT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=121,174;MMQ=60,53;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:2,1:6,5,0,2
chr5	10397473	.	CT	C,CTT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,34,32;MFRL=166,108,103;MMQ=60,60,60;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=8.32,4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,6,3:0.305,0.204:17:0,4,0:7,2,3:0,8,3,6
chr5	10411441	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=146,45;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:9,7,1,1
chr5	10417589	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	10442496	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	10748231	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,14,0
chr5	10748338	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:16,2:15,11,0,2
chr5	10748462	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	10761009	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,9,0
chr5	11023076	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:12,1:8,2:12,8,3,0
chr5	11082762	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=183,89;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:6,0,4,0
chr5	11159657	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=24.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.563:16:5,7:1,2:2,5,5,4
chr5	11412302	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	13701327	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	13701351	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=167,158;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr5	13714740	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,188;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,3:4,0:4,6,0,3
chr5	13721378	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=163,218;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:1,1,0,4
chr5	13729714	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,3:2,3:2,1,0,6
chr5	13735147	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,295;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	13735892	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:2,6:6,2:5,3,7,1
chr5	13737700	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=219,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	13759172	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=226,263;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,0,2
chr5	13769257	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=108,72;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,1:5,3:2,6,2,2
chr5	13770757	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=260,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=10.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr5	13770989	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:8,0:11,3:9,10,0,3
chr5	13789035	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=152,154;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:1,6,0,3
chr5	13792356	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,1,0
chr5	13793985	.	CT	AC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:13793985_CT_AC:13793985:2,0,1,0
chr5	13793990	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:13793985_CT_AC:13793985:3,0,1,0
chr5	13807886	.	G	GAATCGGATGGAATGGAATTGAATGTATTGGAGTCGAGTAGAACA	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=176,123;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.298:7:3,1:0,0:0,6,0,1
chr5	13807894	.	T	TCAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:13807894_T_TCAG:13807894:0,3,0,1
chr5	13807898	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=178,150;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:2,1:1,0:0|1:13807894_T_TCAG:13807894:0,3,0,1
chr5	13810149	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.369:11:4,3:3,0:5,2,2,2
chr5	13810441	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=187,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:7,3:2,1:0,9,0,4
chr5	13810451	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr5	13830866	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=181,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.319:20:9,0:4,6:3,11,0,6
chr5	13842045	.	A	AAG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr5	13845107	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=199,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:4,10,0,2
chr5	13850739	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=146,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:6,1:2,3:4,4,1,3
chr5	13850750	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=150,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0,3,3,5
chr5	13851016	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	13859743	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=185,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:2,5,0,3
chr5	13859807	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=222,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,4:2,0:0,2,0,4
chr5	13862600	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=187,167;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,2,0
chr5	13864728	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,152;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:10,4:8,2:13,5,5,1
chr5	13865717	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:2,4,2,1
chr5	13866450	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:0,5,1,2
chr5	13868103	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=177,126;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:5,2:1,1:2,6,2,1
chr5	13882958	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=171,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:6,4:7,1:5,8,0,5
chr5	13885023	.	GCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:1,1:2,2:5,1,1,2
chr5	13914120	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=180,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr5	13914556	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	13914775	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,30;MFRL=209,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,3:5,3:1,4,1,5
chr5	13914796	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=243,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr5	13914819	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=35,26;MFRL=243,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr5	14290805	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=260,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr5	14366904	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=195,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:9,4:2,1:10,1,5,0
chr5	14374487	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,139;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:1,5,0,2
chr5	14378068	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr5	14381174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=223,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:4,1,2,0
chr5	14387489	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:5,1,5,1
chr5	14394283	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,5:2,3:0,6,1,7
chr5	14398902	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=159,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr5	14405895	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=237,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,2:2,0,6,0
chr5	14462816	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=144,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.791:17:2,4:1,10:3,0,9,5
chr5	14471666	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=250,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	14472626	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,5:0,3:0,0,9,0
chr5	14479938	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	14481270	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,24;MFRL=117,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.754:5:0,0:1,4:0,1,4,0
chr5	14481771	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=34,33;MFRL=125,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,10,0,2
chr5	14481774	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=125,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,10,0,2
chr5	14481779	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:5,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,10,0,2
chr5	14481784	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=36,34;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,8,0,2
chr5	14481787	.	GGATT	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=146,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:0|1:14481771_C_T:14481771:1,8,0,2
chr5	14481795	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=219,185;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:14481771_C_T:14481771:0,6,0,2
chr5	14487763	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:1,2:1,0:0,2,1,1
chr5	14492938	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,235;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:3,11,0,2
chr5	14610184	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.857:4:0,4:0,0:0,0,3,1
chr5	14673696	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=210,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,7:3,2:5,1,7,2
chr5	14678762	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=146,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:4,3:9,2:10,4,5,0
chr5	14742066	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=274,203;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:3,2,0,2
chr5	14769075	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.407:32:10,2:9,10:12,7,8,5
chr5	14871620	.	AGGGGCGAC	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGGGCGAC;STR;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.836:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	15927907	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=35,15;MFRL=227,141;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:15927907_G_A:15927907:2,0,1,0
chr5	15927912	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,15;MFRL=227,141;MMQ=50,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0|1:15927907_G_A:15927907:2,0,1,0
chr5	15927917	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=194,141;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,0:0|1:15927907_G_A:15927907:3,0,1,0
chr5	15927921	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,15;MFRL=180,141;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.284:5:4,0:0,0:0|1:15927907_G_A:15927907:4,0,1,0
chr5	16091242	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=247,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.776:7:1,0:0,3:0,1,0,6
chr5	16177807	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:0,7:3,2:2,1,4,5
chr5	16177909	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,76;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,0:9,6:9,9,1,5
chr5	16477751	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=175,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:5,9:0,0:4,1,7,2
chr5	16478120	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=187,267;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:5,2:7,1:8,4,1,2
chr5	16479151	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=118,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr5	16481062	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,3:2,1:5,3,1,3
chr5	16667003	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	16668370	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=178,240;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:6,2:12,2:8,10,2,2
chr5	16670618	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=112,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:5,8:4,4:6,3,6,6
chr5	16679966	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:3,2:1,0:3,1,2,0
chr5	16681966	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=186,212;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,2:6,3:8,3,2,3
chr5	16684109	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=143,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,5:4,2:0,8,0,7
chr5	16684143	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0,12,1,1
chr5	16699512	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:6,3,2,0
chr5	16704688	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:8,2,2,0
chr5	16711365	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=36.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,7:0,0,8,9
chr5	16711451	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	16762646	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,7,4
chr5	16762789	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=201,113;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr5	16763725	.	TA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=144,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.321:13:4,1:3,3:5,4,0,4
chr5	16763908	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.373:9:1,1:3,2:2,4,2,1
chr5	16764334	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=114,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:5,5:6,3:5,6,2,6
chr5	16766093	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr5	16783437	.	T	TAAAC	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=136,229;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.334:16:1,0:10,4:7,4,4,1
chr5	16794916	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,23;MFRL=150,163;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,1:8,3:16,5,2,2
chr5	16794924	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=177,103;MMQ=60,48;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.286:26:8,7:11,0:12,7,7,0
chr5	16795012	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=101,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:0,2,0,6
chr5	16818363	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=235,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr5	16877640	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr5	16877671	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:16877671_AC_A:16877671:6,2,3,0
chr5	16877673	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=209,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,1:4,2:0|1:16877671_AC_A:16877671:6,2,3,0
chr5	17276053	.	CCTCT	C,CCT,CCTCTCT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,34,35,20;MFRL=135,240,191,67;MMQ=60,60,60,60;MPOS=28,13,28;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,12,14;RU=CT;STR;TLOD=4.13,25.94,4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:3,2,9,3:0.140,0.485,0.184:17:1,0,4,2:1,2,5,1:1,2,5,9
chr5	17276742	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,22;MFRL=223,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=A;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.720:5:1,2:0,0:1,0,1,3
chr5	17276848	.	C	CA,CAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,32,31;MFRL=122,136,185;MMQ=60,60,60;MPOS=21,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=8.71,8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,7,4:0.570,0.317:12:1,2,1:0,3,3:1,0,8,3
chr5	17276986	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr5	17277018	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,208;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:0,6,0,4
chr5	19520932	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=148,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:3,3:1,3:0,4,0,6
chr5	21755735	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=184,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,2:6,0:12,4,0,2
chr5	21854985	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:0,7,0,2
chr5	23510203	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,41;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	23510224	.	CAT	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,26;MFRL=170,149;MMQ=47,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:23510224_CAT_C:23510224:0,3,0,1
chr5	23510227	.	G	GCT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=170,149;MMQ=47,41;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:23510224_CAT_C:23510224:0,3,0,1
chr5	23510232	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=217,155;MMQ=54,41;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr5	23510235	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=189,160;MMQ=44,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0,4,0,1
chr5	23518072	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,262;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr5	23523348	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr5	23527919	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=58.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,7:0,0,0,17
chr5	24509947	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=162,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr5	24511368	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=153,242;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr5	24511654	.	CAGAGAGAGAG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=242,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=23,18;RU=AG;STR;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.729:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr5	24537481	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=157,105;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.322:16:6,2:5,2:8,3,3,2
chr5	24593325	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=202,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,3:4,0:6,1,3,0
chr5	26886200	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.290:15:5,3:6,1:1,10,1,3
chr5	26890441	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=201,227;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr5	31322851	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.920:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr5	31405874	.	CTTTTTTTTTT	C,CTTTT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=19,19,19;MFRL=143,148,189;MMQ=60,60,60;MPOS=25,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=24,14,18;RU=T;STR;TLOD=3.05,9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,3:0.220,0.449:6:0,0,0:0,0,0:0,2,0,4
chr5	31407139	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,114;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0,6,0,3
chr5	31409115	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=287,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.768:11:0,5:2,4:2,0,9,0
chr5	31421407	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:15,4:8,0:11,12,4,0
chr5	31435975	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=174,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:2,2:1,1:0,5,0,3
chr5	31472087	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:4,2:7,2:11,0,3,1
chr5	31472117	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=144,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,3:11,2:12,5,4,1
chr5	31483596	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:6,2:14,4:14,6,3,3
chr5	31483753	.	GAA	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.650:9:0,1:0,1:0,3,2,4
chr5	31484992	.	A	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:10,13:12,0:8,14,13,0
chr5	31485152	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0,2,0,9
chr5	31486578	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=219,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,0:1,2:5,0,3,0
chr5	31504840	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=207,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr5	31508933	.	G	GT,GTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,34,32;MFRL=0,200,317;MMQ=60,60,49;MPOS=29,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,14;RU=T;STR;TLOD=4.90,3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.513,0.332:3:0,1,1:0,1,0:0,0,0,3
chr5	31508945	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=200,317;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr5	31511106	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=145,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:7,3,2,2
chr5	31515373	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=212,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,2:1,5:3,1,2,5
chr5	31526850	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,38;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.100:28:15,2:11,0:17,9,1,1
chr5	31529299	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,6
chr5	31529306	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0|1:31529299_A_G:31529299:0,0,0,4
chr5	31532429	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,11:0,0,15,5
chr5	31532685	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=254,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr5	31799658	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,7:2,2:4,2,4,5
chr5	31995769	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=192,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:7,6,0,2
chr5	32054014	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:2,3,0,2
chr5	32057651	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr5	32059318	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=170,114;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:12,0,2,0
chr5	32069863	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr5	32071404	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=215,82;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr5	32072213	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=278,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:3,3:0,2:3,0,5,0
chr5	32087228	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=159,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,1:9,3:8,8,3,1
chr5	32087253	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=183,181;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,1:9,2:6,9,1,2
chr5	32087802	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=177,126;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:2,5:3,0:2,3,1,4
chr5	32101168	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=125,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,1:3,8:4,2,9,0
chr5	32135599	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=207,256;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	32242062	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=301,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	32242341	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=215,289;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	32379210	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,13:0,0,12,8
chr5	32387654	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,110;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:8,0:16,4:15,9,0,4
chr5	32395502	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	32404171	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,27;MFRL=123,113;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.228:11:4,2:5,0:0|1:32404171_T_TA:32404171:4,5,0,2
chr5	32404173	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,2:5,0:0|1:32404171_T_TA:32404171:5,6,0,2
chr5	32404175	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=147,113;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:0|1:32404171_T_TA:32404171:5,6,0,2
chr5	32415360	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr5	32417694	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	32419849	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	32444286	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=156,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr5	32601005	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=146,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:0,1:7,2:7,0,3,0
chr5	32710896	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=156,140;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:8,5:8,3:11,5,5,3
chr5	32710965	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=165,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.368:9:3,1:1,0:0,6,0,3
chr5	32775047	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	32790616	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:3,2,4,4
chr5	33453416	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=127,92;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:11,1:8,1:4,15,1,1
chr5	33457535	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=206,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr5	33458636	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=169,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:2,0,7,0
chr5	33458833	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=219,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr5	33467745	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=155,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:3,8,1,5
chr5	33546113	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=275,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr5	33588684	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:5,4:12,4:12,5,5,3
chr5	33595996	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=214,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:3,2,4,0
chr5	33596193	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:2,1,1,4
chr5	33596224	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=236,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	33614255	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=196,174;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:2,7:2,0:6,0,7,0
chr5	33615904	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,224;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:3,1,4,1
chr5	33624496	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0,9,3,0
chr5	33630839	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:6,3,3,0
chr5	33637596	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=186,196;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr5	33637891	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:0,2:2,2:0|1:33637891_C_A:33637891:1,1,0,4
chr5	33637899	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=19,26;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,2:0,2:0|1:33637891_C_A:33637891:1,1,0,4
chr5	33643395	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=255,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:5,0,4,0
chr5	33643617	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=195,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:0,7,0,6
chr5	33648906	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=163,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:2,2,4,3
chr5	33649598	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=213,124;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:9,1,2,0
chr5	33649637	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,1:5,1,4,2
chr5	33649797	.	CC	TT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=160,77;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:8,0:9,1:0|1:33649797_CC_TT:33649797:6,11,1,1
chr5	33649807	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=145,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,10:0.524:19:4,3:5,7:0|1:33649797_CC_TT:33649797:3,6,4,6
chr5	33751454	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,5,2
chr5	33938009	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=177,73;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,0:1,2:1,5,1,1
chr5	33938018	.	CG	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=191,73;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:1,3,0,1
chr5	33938338	.	TG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=169,118;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.568:12:1,4:2,1:3,2,3,4
chr5	33951826	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=154,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr5	33963731	.	AAAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAC;STR;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	33964049	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:11,0:7,3:15,4,3,0
chr5	33964210	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=183,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	34020768	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:18,0:18,3:18,18,2,1
chr5	34687794	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,99;MMQ=60,59;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.298:20:11,4:3,0:7,7,6,0
chr5	34688210	.	CGACAAA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=118,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,0:5,3:8,1,1,2
chr5	34757505	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=282,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr5	34803848	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=119,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.145:32:13,4:15,0:16,12,0,4
chr5	34811794	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=225,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	34818976	.	G	GT,GTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,34,35;MFRL=190,98,148;MMQ=60,60,60;MPOS=30,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.62,5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,4:0.193,0.306:13:5,0,2:2,2,1:4,3,3,3
chr5	34818988	.	C	CAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:5,1:3,2:0|1:34818988_C_CAA:34818988:7,4,0,3
chr5	34818989	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=140,190;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.247:14:7,1:3,2:0|1:34818988_C_CAA:34818988:7,4,0,3
chr5	34821825	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=173,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,5:6,1:6,6,3,3
chr5	34824371	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=155,76;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,1:6,1:5,8,2,0
chr5	34863220	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,5:2,2:0,2,0,7
chr5	34915068	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=181,64;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,3:2,1:0,7,0,4
chr5	34923288	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=161,83;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.111:42:20,4:18,0:22,16,3,1
chr5	34925423	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=167,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,10:0.237:43:24,9:9,0:13,20,0,10
chr5	34945797	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=179,267;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.327:13:3,2:5,1:0|1:34945797_CT_C:34945797:3,6,3,1
chr5	34945812	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=69.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0|1:34945797_CT_C:34945797:0,0,10,9
chr5	34954588	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr5	34954668	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=126,89;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,10:0.293:34:17,8:7,0:14,10,10,0
chr5	34954778	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=144,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:16,0:6,2:9,13,2,0
chr5	35026683	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,21;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.876:6:0,1:0,2:0,0,0,6
chr5	35032769	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=281,171;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,2:4,1:6,0,3,0
chr5	35033526	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=192,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,6:0,3:1,0,7,2
chr5	35033706	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=228,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:3,4,0,3
chr5	35037006	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=18,31;MFRL=158,257;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.593:5:0,0:1,3:0,2,3,0
chr5	35084480	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=205,152;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:0,6:4,0:4,0,6,0
chr5	35628715	.	ACAAGGTCTTGT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=324,121;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.506:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr5	35659130	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=135,188;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:12,2:5,1:6,11,2,1
chr5	35692775	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=193,164;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:5,4:4,4:5,4,4,4
chr5	35695844	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=124,254;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:10,2:3,2:4,9,2,2
chr5	35697963	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,310;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr5	35700940	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=198,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr5	35704584	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr5	35713007	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=327,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.774:11:1,3:1,6:1,1,0,9
chr5	35739960	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	35740343	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=153,173;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=25.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:4,0:3,8:0,7,0,9
chr5	35753715	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=214,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=45.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,3:1,10:0,1,6,7
chr5	35753924	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=207,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr5	35763818	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,2:8,1:2,9,0,3
chr5	35763877	.	AG	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=285,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	35763895	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,257;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	35771917	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,1:10,1:4,13,0,2
chr5	35792356	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	35799987	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=137,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr5	35799994	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr5	35807132	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:3,2:9,2:5,7,0,4
chr5	35857177	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=228,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,5:1,6:0,3,1,10
chr5	35857235	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=267,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,3:1,5:0,1,0,8
chr5	35857262	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	35861152	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:3,0:3,7:0|1:35861152_C_G:35861152:2,4,2,5
chr5	35861159	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,36;MFRL=173,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.231:11:2,1:7,1:1|0:35861152_C_G:35861152:2,7,1,1
chr5	35875593	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:1,2:7,3:6,2,4,1
chr5	35910419	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=126,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,3:3,0:4,2,3,0
chr5	35921069	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=148,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:3,0,4,2
chr5	35921266	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,1:2,2:0,2,1,3
chr5	35954588	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:10,2:6,4:5,11,2,4
chr5	35957202	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:1,3:2,0,3,0
chr5	35968122	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,2:2,0:6,3,2,0
chr5	36111167	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:2,4:0,3:2,0,7,0
chr5	36122537	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=153,81;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,2:9,1:7,14,1,2
chr5	36123065	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=15,17;MFRL=164,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.327:14:3,1:0,0:2,7,1,4
chr5	36136349	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=231,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=54.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.850:18:0,7:2,9:2,0,11,5
chr5	36136675	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=199,93;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	36137620	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	36141386	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,5:0,2:0,2,0,7
chr5	36142589	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=235,177;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:4,0,4,1
chr5	36143392	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=209,148;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.808:24:2,9:2,11:3,1,10,10
chr5	36143414	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=149,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,0:10,3:16,5,0,4
chr5	36166827	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=350,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=T;STR;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.818:6:0,0:1,3:0,1,0,5
chr5	36168582	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr5	36195448	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=169,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:1,0:5,5:0,6,0,5
chr5	36201336	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,1,5
chr5	36207424	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	36217764	.	G	GTTAATCA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,6:0,0:0,0,7,0
chr5	36217997	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,26;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.603:13:1,7:4,1:3,2,4,4
chr5	36241922	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	36253839	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,167;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:16,0:9,3:14,11,0,3
chr5	36253937	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,10:0,1:0,0,1,10
chr5	36260976	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,4,11
chr5	36268218	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	36271491	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr5	36301362	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.724:9:1,1:1,4:0|1:36301362_T_A:36301362:1,1,6,1
chr5	36301369	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=183,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.747:10:1,3:1,4:0|1:36301362_T_A:36301362:1,1,7,1
chr5	36301420	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,6:2,1:5,5,5,2
chr5	36608727	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=156,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.374:6:0,0:4,1:0,4,0,2
chr5	36629529	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr5	36674256	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr5	36683888	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,2:6,1:0|1:36683888_G_A:36683888:6,3,3,0
chr5	36683903	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=220,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=41.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,15:0.800:18:2,4:1,11:1|0:36683888_G_A:36683888:3,0,10,5
chr5	36986369	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=253,152;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0,3,2,0
chr5	37003501	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:5,1:7,3:1,11,0,4
chr5	37027576	.	GTT	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=133,221;MMQ=54,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:2,1:5,1:1,9,0,2
chr5	37036449	.	GTATATA	G,GTA,GTATA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,33,31,34;MFRL=144,175,180,173;MMQ=60,60,60,60;MPOS=8,10,29;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=10,7,8,9;RU=TA;STR;TLOD=4.95,14.67,8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,5,4:0.119,0.265,0.235:18:3,1,2,3:2,1,3,1:4,3,8,3
chr5	37036558	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=129,111;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:14,3:8,0:9,13,0,3
chr5	37049225	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=177,88;MMQ=60,29;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=28.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.402:30:9,0:9,11:7,11,1,11
chr5	37063924	.	TGAA	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=176,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GAA;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:5,2:6,0:0|1:37063924_TGAA_T:37063924:8,7,1,1
chr5	37063936	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=172,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:0|1:37063924_TGAA_T:37063924:11,7,1,1
chr5	37108441	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:10,2:18,0:6,22,2,0
chr5	37115240	.	TGA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	37180351	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=218,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:2,2:0,5,0,3
chr5	37196094	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=128,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:5,1:6,5,1,1
chr5	37206229	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=173,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr5	37213658	.	TACCTG	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.140:27:10,0:13,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:11,13,2,1
chr5	37213666	.	TTAATATGAA	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=28,25;MFRL=138,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:10,0:11,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:11,14,2,1
chr5	37213679	.	GGGGAAGAACATT	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,0:10,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:9,11,2,1
chr5	37213694	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,30;MFRL=134,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,0:8,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:9,11,2,1
chr5	37213696	.	TGA	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:10,0:10,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:11,14,2,1
chr5	37213700	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=31,25;MFRL=124,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:11,0:11,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:11,12,2,1
chr5	37213702	.	GGGGGCAA	G	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=31,31;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:11,0:12,3:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:12,12,2,1
chr5	37213712	.	TGC	T	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=127,150;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:8,0:12,1:0|1:37213658_TACCTG_T:37213658:9,11,2,1
chr5	37244686	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=119,117;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,0:11,4:5,10,0,4
chr5	37244787	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=239,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:37244787_T_A:37244787:0,2,1,0
chr5	37244804	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=239,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:37244787_T_A:37244787:0,2,1,0
chr5	37244808	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=27,15;MFRL=239,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:37244787_T_A:37244787:0,2,1,0
chr5	37247700	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,11,5
chr5	37303424	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=211,167;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,1:3,1:6,3,1,1
chr5	37303548	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37303548_T_A:37303548:0,3,0,1
chr5	37303550	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=169,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:37303548_T_A:37303548:0,3,0,1
chr5	37307315	.	ACAT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=231,158;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:2,1:4,1:0|1:37307315_ACAT_A:37307315:6,1,2,0
chr5	37307323	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=14,31;MFRL=228,158;MMQ=60,40;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.249:10:1,1:2,1:0|1:37307315_ACAT_A:37307315:7,1,2,0
chr5	37326073	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=201,77;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	37333604	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=132,161;MMQ=60,22;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:11,5:4,0:5,10,5,0
chr5	37350390	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=139,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,0:6,2:1,11,0,2
chr5	37364443	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr5	37605122	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=119,260;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.633:6:1,2:0,1:2,0,2,2
chr5	37724990	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,4,1
chr5	37752497	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	37752709	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=163,115;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:10,0:5,2:5,10,0,2
chr5	38407273	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=145,218;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,1:7,2:2,10,0,3
chr5	38407888	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:10,5,0,3
chr5	38438617	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr5	38490251	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=113,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,3:5,0:8,4,0,3
chr5	38504303	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=180,167;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr5	38512154	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:0,4,0,3
chr5	38527228	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:4,1,6,2
chr5	38528969	.	CACACACACACAG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=137,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.681:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr5	38876573	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	38881877	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=133,105;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,0:8,3:5,8,0,3
chr5	38885353	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=206,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	38885647	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=208,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:0,4,0,3
chr5	38886040	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	38886250	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=183,61;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,0:9,2:9,3,0,2
chr5	38904082	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:7,4:6,5:7,6,4,5
chr5	38904363	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,4,1
chr5	38917574	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr5	38923171	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr5	38931919	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=140,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,2:0,6:3,0,8,0
chr5	38932466	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=129,215;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	38942554	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.764:6:0,0:1,4:0,1,0,5
chr5	38945919	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=197,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:1,3,0,2
chr5	38953665	.	G	GA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=112,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,18:0.886:20:2,5:0,11:0,2,9,9
chr5	38954994	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,8:0,7:0,0,0,15
chr5	38958524	.	GAAAATTTACTT	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=177,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:14,0:9,2:11,14,1,1
chr5	38958774	.	C	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,250;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.323:32:11,10:11,0:16,6,10,0
chr5	38958968	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=207,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.923:11:1,6:0,4:0,1,0,10
chr5	38959794	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	38962543	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,5,8
chr5	39074296	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:4,7:1,9:3,2,6,10
chr5	39119222	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	39119561	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	39119723	.	C	A	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=163,144;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.568:35:10,12:5,8:6,9,6,14
chr5	39124508	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	39127960	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=153,62;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr5	39134295	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=159,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:7,3:4,2:10,1,3,2
chr5	39139268	.	TG	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=154,175;MMQ=60,54;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:12,6,2,0
chr5	39153605	.	G	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=94,91;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:60,5:0.088:65:22,5:36,0:25,35,5,0
chr5	39341667	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=179,87;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,6:7,4:8,7,4,6
chr5	39342308	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:4,8,0,2
chr5	39375082	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=155,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.724:16:4,5:0,7:2,2,8,4
chr5	39377418	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=68,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,5:0,5:0,1,2,8
chr5	39390061	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr5	40681254	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,6:0.183:36:13,2:17,4:16,14,3,3
chr5	40716153	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	40728383	.	C	CAAAAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,241;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,30;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:40728383_C_CAAAAAAAAAAAAAAAA:40728383:0,0,1,0
chr5	40728398	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=36,15;MFRL=151,241;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:40728383_C_CAAAAAAAAAAAAAAAA:40728383:1,0,1,0
chr5	40728400	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=151,241;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:40728383_C_CAAAAAAAAAAAAAAAA:40728383:1,0,1,0
chr5	40746885	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:9,1:1,3:8,2,2,2
chr5	40747164	.	CTTT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,34;MFRL=150,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:1,1:0,3,0,2
chr5	40763014	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,123;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.171:33:12,5:16,0:17,11,5,0
chr5	40767498	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=132,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	40777531	.	T	TTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=266,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:4,0,3,3
chr5	40841739	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=123,52;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:19,2:17,0:0|1:40841739_G_T:40841739:18,18,1,1
chr5	40841749	.	A	AACAGCTGTCC	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=129,52;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:19,2:16,0:0|1:40841739_G_T:40841739:16,22,1,1
chr5	40843493	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=173,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:10,6:7,3:8,9,6,3
chr5	40928574	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=212,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	40934393	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=190,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:10,2:4,2:13,1,4,0
chr5	40945526	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	40949997	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,5,2
chr5	40950187	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=186,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr5	40964816	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=143,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:6,3:2,4:5,3,5,2
chr5	40964852	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=159,130;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:7,4:4,1:7,4,3,2
chr5	40972769	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=201,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr5	40979790	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,244;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:3,3,2,2
chr5	40980086	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=218,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	40981689	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=205,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:3,3,0,6
chr5	40981768	.	CCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=319,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr5	40998196	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=203,233;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,2,2
chr5	40998851	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,1:0,1,2,2
chr5	40999900	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=179,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,3:1,1:2,4,1,3
chr5	41000243	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=159,289;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr5	41001023	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,249;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	41004807	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:2,1:3,3:5,0,4,1
chr5	41008650	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=274,253;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.637:14:2,4:2,5:5,0,7,2
chr5	41012615	.	AA	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	41032998	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=173,290;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,0:1,3:1,3,1,2
chr5	41033309	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=241,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:41033309_A_G:41033309:0,3,0,1
chr5	41033311	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=241,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:41033309_A_G:41033309:0,3,0,1
chr5	41038850	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=140,123;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:3,2:3,4,0,2
chr5	41039000	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=137,208;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:0,3,1,3
chr5	41039451	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=29.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:3,13:4,0:6,1,13,0
chr5	41042284	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=105,76;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:3,5,2,4
chr5	41042300	.	CAA	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,20;MFRL=113,38;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:0|1:41042300_CAA_C:41042300:3,6,1,1
chr5	41042305	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=113,38;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.230:11:4,0:4,2:0|1:41042300_CAA_C:41042300:3,6,1,1
chr5	41042321	.	AAAGAT	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=57,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	41045768	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=265,315;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr5	41045835	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=151,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,3:6,4:5,2,6,1
chr5	41050999	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=203,240;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr5	41051041	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:2,0:0|1:41051041_A_G:41051041:4,1,2,0
chr5	41051043	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=148,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:41051041_A_G:41051041:4,1,2,0
chr5	41057562	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=139,207;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	41061871	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,31;MFRL=139,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.483:11:1,2:2,3:1,5,2,3
chr5	41149284	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=221,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,0:7,2:9,1,2,0
chr5	41154150	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,5:1,1:1,2,3,3
chr5	41159341	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=185,58;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:0|1:41159341_G_A:41159341:12,3,1,1
chr5	41159345	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=188,58;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:0|1:41159341_G_A:41159341:13,5,1,1
chr5	41159351	.	T	TTGGCCAACA	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=190,58;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:41159341_G_A:41159341:13,6,1,1
chr5	41159354	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=30,36;MFRL=190,58;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,1:0|1:41159341_G_A:41159341:13,6,1,1
chr5	41203344	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=207,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr5	41381901	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr5	41475766	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=113,153;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,7:4,3:5,5,3,7
chr5	41805575	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,3:4,0:7,0,3,0
chr5	41842746	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=186,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:4,1:6,4:5,5,3,2
chr5	41909830	.	CTTT	C,CTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,31,29;MFRL=114,138,134;MMQ=60,60,60;MPOS=31,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,12,14;RU=T;STR;TLOD=7.20,6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,3,4:0.187,0.295:16:2,1,3:1,2,0:7,2,6,1
chr5	41917196	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=127,140;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:6,0:12,5:10,8,0,5
chr5	41927423	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=198,139;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,0:5,3:1,6,0,3
chr5	41929926	.	GG	AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=161,142;MMQ=60,50;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,8:0.346:24:6,0:10,8:0|1:41929926_GG_AT:41929926:10,6,0,8
chr5	41929930	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=160,142;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,8:0.360:23:4,0:9,8:0|1:41929926_GG_AT:41929926:10,5,0,8
chr5	42718335	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=315,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,1,3
chr5	42719239	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=155,228;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.131:21:7,0:12,2:7,12,0,2
chr5	42769632	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=202,265;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr5	42769647	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=151,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:5,0,2,1
chr5	42769844	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=121,222;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	42779686	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.611:11:3,3:1,3:0,4,2,5
chr5	42783581	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:8,3:3,1:7,4,3,1
chr5	42799719	.	T	TTTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTA;STR;TLOD=46.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,6:0,4:1,0,8,3
chr5	42800808	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,228;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:7,1,2,1
chr5	42804758	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=147,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.161:23:8,0:10,3:0|1:42804758_C_T:42804758:11,9,2,1
chr5	42804762	.	AG	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=147,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:11,2:0|1:42804758_C_T:42804758:13,9,1,1
chr5	42804765	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=149,47;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:42804758_C_T:42804758:13,9,1,1
chr5	42804768	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=149,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:42804758_C_T:42804758:13,9,1,1
chr5	42810707	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=247,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	43122348	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=23,22;RU=T;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.788:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	43122371	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.810:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	43161337	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:1,3,3,0
chr5	43173567	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=95,134;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,5:2,1:1,1,2,5
chr5	43175103	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.592:25:3,8:7,7:8,2,7,8
chr5	43245922	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,174;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:8,6:7,4:6,9,5,5
chr5	43291181	.	A	AC	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=20,27;MFRL=96,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,1,0
chr5	43291187	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=139,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,1,0
chr5	43291193	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,15;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:1,3,1,0
chr5	43291198	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,0:1,1:1,3,1,0
chr5	43292483	.	C	CTTACTATGAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=203,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	43292908	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=255,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:1,7:1,2:2,0,7,3
chr5	43297032	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr5	43297144	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,8:0,12:0,0,9,11
chr5	43298093	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=205,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:6,3:5,0:9,2,2,1
chr5	43298544	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=229,285;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0|1:43298544_A_G:43298544:4,1,3,0
chr5	43298557	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0|1:43298544_A_G:43298544:0,0,6,0
chr5	43492265	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,6:0,8:0,0,13,1
chr5	43493592	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	43509462	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.873:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	43527398	.	G	GAC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,256;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AC;STR;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr5	43527673	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	43530035	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=186,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,4:2,1:0,4,0,5
chr5	43533992	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	43535754	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:0,5,2,6
chr5	43536855	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	43609272	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=147,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,4:8,3:6,6,5,2
chr5	43612984	.	T	TA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:1,11:1,6:1,1,15,2
chr5	43613181	.	T	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.106:35:18,3:13,0:10,22,0,3
chr5	44305309	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=119,110;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,4:4,1:3,2,2,3
chr5	44310492	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=161,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:4,4:8,4:7,5,5,3
chr5	44388714	.	AAGC	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=153,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGC;STR;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:7,1:12,2:14,10,1,2
chr5	45303999	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=204,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr5	45353422	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=33.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:2,0:4,12:0,7,0,12
chr5	49698986	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=203,161;MMQ=60,58;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.248:13:4,2:6,0:9,1,3,0
chr5	49701519	.	CTGT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=122,91;MMQ=60,57;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TGT;STR;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:7,6:6,4:6,7,7,3
chr5	49701755	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,36;MFRL=162,135;MMQ=57,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr5	50046139	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	50055456	.	CT	C,CTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=20,32,35;MFRL=163,120,196;MMQ=60,60,60;MPOS=23,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=10.66,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,7,4:0.467,0.293:14:2,1,3:0,5,0:1,2,9,2
chr5	50084508	.	C	CCTT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=222,148;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr5	50122645	.	GTT	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.278:12:6,3:2,0:5,4,1,2
chr5	50683541	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=191,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:3,1:8,4:2,9,2,3
chr5	50683655	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=170,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr5	52084365	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	52097183	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr5	52161500	.	G	GC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,1:1,3:1,1,2,2
chr5	52183805	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=229,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:0|1:52183805_T_A:52183805:0,5,1,1
chr5	52183806	.	G	GAGCCAAGGGACTCT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=229,61;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:52183805_T_A:52183805:0,5,1,1
chr5	52193414	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=32.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr5	52201508	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=3668,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	52204848	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=188,94;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.297:18:7,2:6,3:2,11,2,3
chr5	52204943	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr5	52211375	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,131;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:13,0:17,3:16,14,0,3
chr5	52223350	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr5	52223516	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=194,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:2,2,0,6
chr5	52235582	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=221,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:2,2,2,0
chr5	52235802	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,55;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr5	52243361	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=243,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:1,5:2,5:0,3,0,10
chr5	52322721	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:5,4:4,6:1,8,2,8
chr5	52337908	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=131,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,2:8,2:14,8,4,0
chr5	52338083	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=192,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.419:17:4,5:6,2:2,8,3,4
chr5	52344610	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=185,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:0,4:2,3:0,2,0,7
chr5	52351413	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:7,3:4,4:7,4,6,1
chr5	52351532	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=150,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:4,0:7,2:0,11,0,2
chr5	52351746	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,189;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.683:20:4,8:2,6:5,1,11,3
chr5	52355854	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=123,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:3,4,3,5
chr5	52358761	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=105,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.264:16:5,1:6,3:0,12,0,4
chr5	52366138	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=167,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.637:20:5,7:2,6:1,6,1,12
chr5	52366162	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=167,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:8,2:3,2:1,10,0,4
chr5	52367666	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	52367706	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=124,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:2,0,6,0
chr5	52368366	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.329:10:1,0:6,2:6,1,2,1
chr5	52368546	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=133,154;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:6,1:13,4:5,14,2,3
chr5	52368922	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=69,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,5:3,2:4,2,4,3
chr5	52370174	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,4:2,6:6,1,8,2
chr5	52382748	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=151,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr5	52385993	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=226,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	52404312	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=200,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:6,8:6,3:10,2,10,1
chr5	52781597	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=128,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.463:15:5,3:3,4:1,7,2,5
chr5	52781902	.	CAAAAA	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=233,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=21,16;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.344:13:2,1:3,3:0|1:52781902_CAAAAA_C:52781902:6,2,1,4
chr5	52781924	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=191,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,5:0.346:16:4,1:3,3:1|0:52781902_CAAAAA_C:52781902:1,10,5,0
chr5	52781930	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=187,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,5:0.374:14:3,0:4,3:1|0:52781902_CAAAAA_C:52781902:1,8,5,0
chr5	52954514	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=127,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	53450542	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=229,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,2:1,5:0,2,0,7
chr5	53814052	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,3,4
chr5	53815413	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,7:0.194:39:12,3:20,4:13,19,3,4
chr5	54275119	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,0:8,2:11,3,2,0
chr5	54277925	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:14,0:8,4:13,9,0,4
chr5	54320700	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=229,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,2:2,6:0,3,1,7
chr5	54403957	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr5	54404015	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=76.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,14:0,10:0,0,13,11
chr5	54423075	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=206,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:2,4,2,1
chr5	54439513	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=183,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,0:6,4:2,10,0,4
chr5	54466544	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=174,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,2:9,2:6,8,1,3
chr5	54468921	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=299,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	54528393	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,4:5,2:4,4,1,5
chr5	54557146	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=203,114;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.353:12:4,0:4,4:6,2,3,1
chr5	54569062	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=187,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,1:5,3:8,2,4,0
chr5	54593016	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=280,222;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	54603822	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=172,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:5,3:5,8:9,1,10,1
chr5	54603936	.	G	T	.	.	DP=65;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=135,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,12:0.198:62:22,0:27,11:29,21,0,12
chr5	54639292	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:18,0:13,6:10,21,0,6
chr5	54640496	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=152,388;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:1,7,1,1
chr5	54642783	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=157,138;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.444:25:7,11:7,0:12,2,11,0
chr5	54648918	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=205,341;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:7,0,2,0
chr5	54683977	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:1,8,1,1
chr5	54693374	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,4:1,6:1,2,1,9
chr5	54693402	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=131,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:1,0,0,4
chr5	54706325	.	T	TTTTAAA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=293,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.879:14:0,3:1,6:0,1,7,6
chr5	54709943	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,7:0,3:0,0,7,3
chr5	54710072	.	GT	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=102,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=T;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.478:9:1,4:3,0:1,4,1,3
chr5	54718618	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=256,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:3,7:1,3:4,0,10,0
chr5	54721619	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=213,224;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.609:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr5	54721642	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=340,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.747:10:0,4:2,2:2,0,8,0
chr5	54737791	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=379,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:0,2,0,4
chr5	54830295	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	54941810	.	TG	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=278,242;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr5	54944976	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=151,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:3,1,2,0
chr5	54952688	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,1:0,2:0,0,0,4
chr5	54964974	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,37;MFRL=184,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:2,0,1,0
chr5	54965513	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,4:6,2:2,8,1,5
chr5	54993829	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=167,132;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:2,2,3,2
chr5	55112262	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=134,125;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.321:10:5,1:1,2:6,1,3,0
chr5	55168328	.	C	CCTT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,1,2
chr5	55178976	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=144,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,4:3,2:4,4,2,4
chr5	55179052	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,2,7
chr5	55204530	.	CG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=257,261;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55204530_CG_C:55204530:0,1,0,1
chr5	55204534	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=257,261;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55204530_CG_C:55204530:0,1,0,1
chr5	55204538	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=257,261;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:55204530_CG_C:55204530:0,1,0,1
chr5	55206444	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.349:29:12,5:7,4:4,15,6,4
chr5	55212379	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	55213023	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,1,5
chr5	55237066	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=158,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:6,0:10,2:0|1:55237066_C_T:55237066:7,9,0,2
chr5	55237069	.	T	TTTAGGGAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:55237066_C_T:55237066:7,6,0,2
chr5	55237072	.	C	CTATG	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=156,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:55237066_C_T:55237066:7,6,0,2
chr5	55251931	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=166,118;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:5,8:1,7:4,2,7,8
chr5	55252984	.	C	CA	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.416:15:6,3:2,1:8,1,5,1
chr5	55398217	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=89,289;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr5	55398269	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=41.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,8:0,0,11,2
chr5	55412347	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=132,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,5:4,3:6,0,8,0
chr5	55422681	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,236;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,2:7,1:10,0,3,0
chr5	55830865	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,2768313;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.774:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr5	55851872	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:9,4:9,6:14,4,6,4
chr5	56152387	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=167,190;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,7:4,0:7,1,7,0
chr5	56152416	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=190,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.479:23:8,6:3,4:12,0,8,3
chr5	56177148	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=220,152;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,3:2,0:0,7,0,3
chr5	56177848	.	TCAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=269,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=CAA;STR;TLOD=33.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.755:10:1,4:1,4:1,1,3,5
chr5	56179341	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=185,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,2:3,1:5,1,1,2
chr5	56180480	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=200,152;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,2:4,1:5,3,2,1
chr5	56205643	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:0|1:56205643_A_G:56205643:0,9,1,3
chr5	56205662	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,1:4,2:0|1:56205643_A_G:56205643:0,7,1,3
chr5	56206073	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=189,209;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:5,0,5,0
chr5	56209043	.	CTTTA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=191,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTA;STR;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:1,8,0,3
chr5	56212595	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,5:0,0,4,4
chr5	56224714	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr5	56224782	.	ACTCT	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=203,231;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,5;RU=CT;STR;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	56226410	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,0:2,3:4,0,3,0
chr5	56226605	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,2:5,3:0,6,1,4
chr5	56229288	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr5	56231388	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=215,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,0:4,7:1,8,0,7
chr5	56233541	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=156,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:1,2:13,0:5,9,1,1
chr5	56233551	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:1,2:9,0:4,6,0,2
chr5	56246500	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=133,106;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:9,0:5,6:2,12,0,6
chr5	56246610	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=171,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,1,1
chr5	56255277	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=157,186;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,0:10,2:6,8,0,2
chr5	56517174	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=147,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,0:7,3:7,7,2,1
chr5	56526783	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=154,149;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:4,2,4,1
chr5	56526819	.	GT	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.354:9:3,3:3,0:2,4,2,1
chr5	56527224	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	56527247	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=184,170;MMQ=60,55;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr5	56547059	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=157,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,0,4
chr5	56778235	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=164,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:8,4:9,2:9,8,0,6
chr5	57750350	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=127,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,2:6,0:7,4,2,0
chr5	57753456	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=184,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:6,3:0,6:0,6,0,9
chr5	57754132	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,3,2
chr5	57754808	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.473:28:7,7:6,6:7,8,8,5
chr5	57790337	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=179,157;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:5,3:7,4:8,4,5,2
chr5	57790924	.	T	TAAGTGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=261,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57790924_T_TAAGTGGG:57790924:0,4,0,1
chr5	57790927	.	TC	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=261,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:57790924_T_TAAGTGGG:57790924:0,4,0,1
chr5	57792506	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=175,339;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:14,0:9,4:12,11,4,0
chr5	58021809	.	A	AT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=200,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,0:8,1:9,3,1,2
chr5	58270412	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=182,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:4,1:1,1:6,0,2,0
chr5	58271713	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,4:0,3:0,0,1,7
chr5	58284283	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,10,2
chr5	58285813	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=206,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.699:8:1,3:1,3:0,2,0,6
chr5	58286625	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,10,4
chr5	58286737	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,17;MFRL=230,247;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.336:7:1,0:0,0:1,4,0,2
chr5	58289334	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr5	58289364	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=193,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr5	58334645	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=198,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=92.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,29:0.938:30:0,20:1,9:0,1,22,7
chr5	58489218	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	58882102	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,4:2,0:5,2,4,0
chr5	59899413	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,2:0,3:0,2,0,5
chr5	59934483	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=180,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:4,0,4,0
chr5	59940502	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=176,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:4,1,4,1
chr5	59940765	.	G	GTTATCCTCTCCACTGTTCTGA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=175,199;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr5	60050391	.	T	TGCATAGGTAAGTGACA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=156,186;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,1:6,0:9,0,4,0
chr5	60063576	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=203,112;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,1:3,2:10,0,2,1
chr5	60083166	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:5,3:8,4:7,6,4,3
chr5	60083275	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=165,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:0,5,1,3
chr5	60170512	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=162,165;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:1,0:2,2,0,2
chr5	60170605	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=228,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,0,4
chr5	60186618	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=162,190;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	60186975	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=149,237;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	60186982	.	G	GAAAA	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=32,34;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,7;RU=A;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,3,0,1
chr5	60186986	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,3,0,1
chr5	60186988	.	C	CTT	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=34,34;MFRL=237,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,3,0,1
chr5	60186991	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=26,25;MFRL=282,147;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,2,0,1
chr5	60186995	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=282,147;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:60186982_G_GAAAA:60186982:0,2,0,1
chr5	60199363	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=156,273;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr5	60199402	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=178,222;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,3:4,0:5,1,3,0
chr5	60240986	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=197,281;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:2,3:2,5:2,2,4,4
chr5	60241268	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,238;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr5	60369083	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=133,141;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.782:21:2,7:2,9:1,3,5,12
chr5	60628181	.	A	AGCG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCG;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.698:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	60628591	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,329;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	60768742	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=164,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:3,2:17,0:0|1:60768742_G_A:60768742:11,9,1,1
chr5	60768744	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=164,88;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:3,2:17,0:0|1:60768742_G_A:60768742:11,9,1,1
chr5	60817142	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,112;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:5,0:14,2:12,7,0,2
chr5	60840167	.	G	GAGTGGGATTCA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=179,98;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,0,1
chr5	61602215	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,12;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:61602215_T_C:61602215:0,1,1,0
chr5	61602219	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=23,32;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:61602215_T_C:61602215:0,1,1,0
chr5	61602221	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=125,153;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:61602215_T_C:61602215:0,1,1,0
chr5	61642873	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=154,82;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr5	61643816	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,5,2
chr5	61648323	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,3,1
chr5	61648394	.	A	AT	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=190,185;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:8,0:16,1,3,0
chr5	61657228	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:1,3,2,3
chr5	61657377	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=106,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:1,4:1,1:1,1,2,3
chr5	61659094	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=152,69;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:10,1:7,1:9,8,0,2
chr5	61659110	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=144,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:9,3:11,0:8,13,0,3
chr5	61662223	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=193,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.354:9:3,1:3,2:4,2,2,1
chr5	61669490	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:6,1:6,3:12,0,3,1
chr5	61669503	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=186,83;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:5,0:6,5:11,0,2,3
chr5	61673670	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr5	61676902	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=170,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:0|1:61676902_G_T:61676902:6,0,1,1
chr5	61676911	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=167,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.330:7:1,2:4,0:0|1:61676902_G_T:61676902:5,0,1,1
chr5	61686647	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,201;MMQ=52,29;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:2,1:9,4:9,2,5,0
chr5	61688892	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr5	61690443	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=140,108;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:61690443_A_G:61690443:7,9,0,3
chr5	61690447	.	C	CT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=132,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,3:0.211:17:5,0:9,3:0|1:61690443_A_G:61690443:6,8,0,3
chr5	61699231	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.702:18:2,6:3,7:0,5,1,12
chr5	61699451	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=179,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,1,1
chr5	61715040	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,2,2
chr5	61745737	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=172,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.490:22:3,4:8,7:8,3,10,1
chr5	61747500	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=181,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:2,1:4,1:7,0,2,0
chr5	61762880	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=192,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	61781127	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr5	61785027	.	TAATTG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=238,243;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AATTG;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	61785936	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=202,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:3,2:7,2:7,3,2,2
chr5	61826663	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,2,6
chr5	61846210	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=139,74;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,1:7,1:6,7,0,2
chr5	61923204	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=113,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,2:5,1:0,7,0,3
chr5	62073118	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,1,13
chr5	63513099	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=135,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr5	63802632	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:8,0:5,2:0|1:63802632_G_T:63802632:8,6,1,1
chr5	63802639	.	TT	CA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=97,60;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,0:3,2:0|1:63802632_G_T:63802632:7,5,1,1
chr5	63802649	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=102,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:5,0:3,1:0|1:63802632_G_T:63802632:5,4,1,1
chr5	63803688	.	TTGGCTG	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:0|1:63803688_TTGGCTG_T:63803688:3,15,0,2
chr5	63803695	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,2:9,0:0|1:63803688_TTGGCTG_T:63803688:3,15,0,2
chr5	63905068	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,3:0,12:0,0,5,10
chr5	63905082	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=141,10534574;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:2,1:9,1:2,9,2,0
chr5	64023924	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=145,175;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.369:28:5,4:12,6:11,7,7,3
chr5	64023981	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=241,163;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,18:0.792:22:2,10:2,8:3,1,6,12
chr5	64096046	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:11,1:3,2:10,4,2,1
chr5	64447777	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=181,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:1,3,2,2
chr5	64483759	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=229,283;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr5	64629853	.	ACC	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,15;MFRL=136,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.105:26:3,0:18,0:15,9,1,1
chr5	64747918	.	T	TG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=150,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:10,0,1,1
chr5	64838584	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=200,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:4,2:6,2,5,0
chr5	64838758	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=240,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,4:2,3:0,5,0,7
chr5	64847543	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=124,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:0,3:3,3:0,3,0,6
chr5	64863484	.	TA	T,TAA	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30,28;MFRL=147,125,131;MMQ=60,60,60;MPOS=26,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.41,4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.363,0.351:8:1,1,1:1,2,2:0,2,1,5
chr5	64865405	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=189,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:3,5:2,5:4,1,9,1
chr5	64878858	.	CCTT	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=193,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:3,8:5,2:8,1,8,2
chr5	64886193	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,146;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:6,2:2,0:0,8,0,2
chr5	64890479	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=156,154;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:3,2:5,4:3,5,0,7
chr5	64906617	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=146,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:7,0,3,0
chr5	64919991	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=210,167;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.586:27:7,8:4,8:7,4,7,9
chr5	64920803	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:6,0,6,0
chr5	64933457	.	CAA	C,AAA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34,22;MFRL=117,162,129;MMQ=56,60,60;MPOS=14,0;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.12,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.318,0.285:9:1,3,1:1,0,1:2,1,3,3
chr5	64933638	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,22;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,0:4,1:0|1:64933638_T_A:64933638:2,7,0,2
chr5	64933641	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=149,125;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,1:4,1:0|1:64933638_T_A:64933638:2,7,0,2
chr5	64933643	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:64933638_T_A:64933638:2,6,0,2
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chr5	64933652	.	G	GTT	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=153,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:0|1:64933638_T_A:64933638:2,6,0,2
chr5	64942799	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
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chr5	64954159	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=225,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr5	64957779	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=211,119;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr5	64960311	.	A	ATCTC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=204,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,9;RU=TC;STR;TLOD=53.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.605:23:4,5:5,7:4,5,11,3
chr5	64968170	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=116,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.564:5:1,2:1,1:1,1,2,1
chr5	65073224	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,9,1
chr5	65105622	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,301;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr5	65308055	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=241,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,2:3,3:0,4,1,5
chr5	65310477	.	AT	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.229:18:10,3:2,1:12,2,2,2
chr5	65310507	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.179:26:16,0:6,4:13,9,0,4
chr5	65338809	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=258,241;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:65338809_G_A:65338809:2,0,1,0
chr5	65338814	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=258,241;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:65338809_G_A:65338809:2,0,1,0
chr5	65346680	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=149,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:12,7:14,0:13,13,7,0
chr5	65372793	.	CT	C,CTT	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,35,36;MFRL=119,99,196;MMQ=60,60,60;MPOS=14,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.05,7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.175,0.350:12:3,1,0:3,1,3:2,4,0,6
chr5	65455250	.	ATCT	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=22,25;MFRL=207,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCT;STR;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:0,2:2,1:0,4,0,3
chr5	65455258	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=183,239;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,0:1,1:0,5,0,2
chr5	65466659	.	A	G	.	.	DP=67;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=129,176;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=35.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:50,13:0.215:63:20,13:30,0:24,26,13,0
chr5	65892712	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	65892803	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	66195681	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=156,94;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,2,1
chr5	66195701	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=126,150;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,2:2,6:3,1,7,1
chr5	66226652	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=204,111;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.382:6:0,2:3,0:1,3,0,2
chr5	66300721	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=205,221;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:2,4:4,2:7,0,6,0
chr5	66391516	.	CTT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,36;MFRL=190,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:1,0:4,3:2,7,0,3
chr5	66429329	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=45.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,8,7
chr5	66448494	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,84;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:11,0:12,2:9,14,1,1
chr5	67569391	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=208,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr5	67569746	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.615:24:7,6:2,9:8,1,8,7
chr5	67575344	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.382:11:5,2:1,1:7,0,3,1
chr5	67575642	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=225,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:1,2:7,0:0,8,0,2
chr5	67584512	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=197,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,2:2,1:8,1,3,0
chr5	67587994	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:9,0,3,0
chr5	67591046	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=147,107;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.088:43:19,3:20,0:18,22,3,0
chr5	68396580	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,2:4,3:4,3,4,1
chr5	68399969	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=196,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,0,2
chr5	68400583	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:1,3:3,2:3,2,2,3
chr5	68400594	.	ATAT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=207,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAT;STR;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.559:7:1,3:1,1:0,3,0,4
chr5	68409094	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=42.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,3:0,0,4,10
chr5	68410962	.	GAAAAAAAAAAAAAAAA	G,GAAAAAAAAAAAAA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,32,32;MFRL=166,187,149;MMQ=44,55,60;MPOS=27,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=30,14,27;RU=A;STR;TLOD=11.20,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,1:0.405,0.237:6:0,1,0:0,2,1:2,0,4,0
chr5	68411010	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=156,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,2:2,5:0,2,6,1
chr5	68412048	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=250,143;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,3:0,7:1,0,6,4
chr5	68413042	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.905:8:0,6:0,2:0,0,5,3
chr5	68414334	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:2,5,4,3
chr5	68417755	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=119,124;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:2,4:0,5:1,1,2,7
chr5	68463014	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=108,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:5,8,2,1
chr5	68464234	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=168,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:68464234_A_G:68464234:0,2,0,2
chr5	68464243	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,1:0|1:68464234_A_G:68464234:0,3,0,2
chr5	68487709	.	G	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=102,139;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,10:0.257:41:18,0:12,10:19,12,0,10
chr5	68491714	.	T	TAGTCAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=141,257;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGTCAAG;STR;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:3,0:0,3:2,1,0,3
chr5	68513572	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=167,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr5	68513599	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.823:15:0,7:2,5:2,0,12,1
chr5	68524006	.	CT	C,CTT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,34,29;MFRL=139,183,160;MMQ=60,60,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=5.93,5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.308,0.306:10:2,2,1:2,1,1:4,0,5,1
chr5	68531253	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=136,210;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.267:24:12,4:6,2:9,9,4,2
chr5	68548389	.	T	TGC	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=161,218;MMQ=35,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:14,2:3,0:0|1:68548389_T_TGC:68548389:0,19,0,2
chr5	68548390	.	A	AGTGG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,24;MFRL=161,218;MMQ=35,51;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:13,1:5,0:0|1:68548389_T_TGC:68548389:0,19,0,2
chr5	68550348	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,15;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=18,19;RU=A;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.867:4:0,0:0,0:0,0,0,4
chr5	68564985	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=120,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.330:11:4,0:3,2:6,2,1,2
chr5	68602746	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=177,156;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:4,5:5,0:3,6,2,3
chr5	68667263	.	TCCC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=C;STR;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,0:0,0,0,3
chr5	68680543	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=TG;STR;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr5	68680706	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=116,55;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:13,2:10,0:16,7,0,2
chr5	68692375	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=209,185;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.447:5:2,1:0,1:0,3,0,2
chr5	68695940	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=139,155;MMQ=60,56;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:5,2,1,3
chr5	68696035	.	G	GTTTATTTA	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=153,146;MMQ=40,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,7;RU=TTTA;STR;TLOD=17.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.791:7:0,3:1,2:0,1,2,4
chr5	68696093	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:68696093_G_A:68696093:1,2,0,1
chr5	68696096	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:68696093_G_A:68696093:1,2,0,1
chr5	68706252	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,9,1
chr5	68706438	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	68728544	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=129,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:2,2,0,5
chr5	68862365	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=149,176;MMQ=43,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.445:10:4,3:2,1:6,0,1,3
chr5	68863565	.	CTTTGTAGAG	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=113,82;MMQ=25,25;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68863565_CTTTGTAGAG_C:68863565:0,1,0,1
chr5	68863578	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=113,82;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:68863565_CTTTGTAGAG_C:68863565:0,1,0,1
chr5	68863581	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,22;MFRL=149,82;MMQ=25,25;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:68863565_CTTTGTAGAG_C:68863565:0,2,0,1
chr5	70265904	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=331,307;MMQ=25,25;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70265904_T_C:70265904:0,1,0,1
chr5	70265906	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=331,307;MMQ=25,25;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:70265904_T_C:70265904:0,1,0,1
chr5	70757811	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=176,182;MMQ=60,40;MPOS=-1073741817;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr5	70760056	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:70760056_T_C:70760056:1,9,0,2
chr5	70760061	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=177,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:7,0:3,2:0|1:70760056_T_C:70760056:1,9,0,2
chr5	70763088	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=212,302;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,0:1,3:2,0,3,0
chr5	70766415	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=146,249;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr5	70779611	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,0:7,3:13,3,3,0
chr5	70785407	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=133,174;MMQ=60,59;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:6,3:9,0:0|1:70785407_A_T:70785407:9,8,3,0
chr5	70785413	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=137,174;MMQ=60,59;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:6,3:10,0:0|1:70785407_A_T:70785407:10,8,3,0
chr5	70797500	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,11;MFRL=374,190;MMQ=60,50;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=A;STR;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.629:3:0,0:1,0:0,1,0,2
chr5	70800473	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=169,79;MMQ=60,55;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.211:25:10,0:10,4:13,7,1,4
chr5	70800475	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=30,25;MFRL=124,148;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.361:23:5,4:9,4:7,8,6,2
chr5	70800503	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=191,79;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:10,0:7,4:0|1:70800503_T_A:70800503:11,7,1,4
chr5	70800505	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=28,26;MFRL=191,79;MMQ=60,55;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,5:0.239:23:11,0:7,4:0|1:70800503_T_A:70800503:11,7,1,4
chr5	70800538	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=142,190;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:7,6:8,4:7,8,7,3
chr5	70805272	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=181,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.479:16:3,7:2,1:7,1,7,1
chr5	70805277	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=118,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.440:16:8,3:1,4:8,1,6,1
chr5	70806649	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=167,187;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:3,3:0,6,3,3
chr5	70807016	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.456:9:3,3:2,1:0,5,0,4
chr5	70807991	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,5:3,1:7,0,6,0
chr5	70808069	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=154,102;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:4,4:11,0:6,9,4,0
chr5	70809065	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=152,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,12:0.317:39:11,12:16,0:15,12,12,0
chr5	70809269	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=222,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=T;STR;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:0,1,0,5
chr5	70811821	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=236,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,4:3,0:6,0,4,0
chr5	70818329	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,33,19;MFRL=137,167,190;MMQ=60,60,60;MPOS=17,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,18;RU=A;STR;TLOD=10.48,3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,3:0.409,0.235:16:3,4,0:2,3,1:0,6,0,10
chr5	70818877	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=194,241;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr5	70834833	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=143,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,4:6,4:5,7,3,5
chr5	70837295	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:1,7:0,5:0,1,4,8
chr5	70852611	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=201,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:3,0,3,0
chr5	70852686	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=125,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.179:21:12,2:6,1:12,6,2,1
chr5	70858268	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=142,104;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,2:2,0:5,8,2,0
chr5	70860493	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=134,197;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,6:0,1:1,0,7,0
chr5	70888665	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=101,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.428:7:2,2:0,1:2,2,3,0
chr5	70888918	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr5	70892027	.	GATTAAGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=69,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,3:1,1:2,0,4,0
chr5	70922616	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,4:0,8:0,0,1,11
chr5	70927856	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=221,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,4:0,4:1,0,6,2
chr5	70928083	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=164,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr5	70930966	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,8:6,5:5,3,8,5
chr5	70948654	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr5	70952506	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,6,1
chr5	71016481	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:7,1:1,1:0,8,0,2
chr5	71403306	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,807;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	71411718	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,4:4,0:0,8,0,4
chr5	71490916	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=175,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:16,0:10,3:13,13,1,2
chr5	71491233	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=134,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:17,2:19,0:23,15,1,1
chr5	71493539	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=183,253;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,2:5,0:6,8,0,2
chr5	71494173	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=151,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:13,1:3,1:7,9,1,1
chr5	71494702	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:6,5:21,0:15,12,5,0
chr5	71494906	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,3:7,1:3,6,2,2
chr5	71522125	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,2:0,7:0,0,0,10
chr5	71609906	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:13,3:11,0:11,13,3,0
chr5	71739546	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,6:1,2:1,0,8,0
chr5	71743024	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	71743322	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=214,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=18.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,0,6
chr5	72112421	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:72112421_T_C:72112421:0,0,7,0
chr5	72112430	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0|1:72112421_T_C:72112421:0,0,7,0
chr5	72144209	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=165,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:6,3:12,3:10,8,3,3
chr5	72182857	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=171,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,2:3,4:1,2,4,2
chr5	72182909	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=172,65;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:9,0:12,2:0|1:72182909_C_T:72182909:13,8,1,1
chr5	72182926	.	C	CTCCATCTCTATAGTT	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=139,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,0:12,2:0|1:72182909_C_T:72182909:12,8,1,1
chr5	72185591	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:1,1:4,3:5,3,4,0
chr5	72201058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.908:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr5	72252034	.	G	GGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=219,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=18.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:0,4,0,5
chr5	72349971	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=145,91;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,7:0.170:45:23,7:15,0:0|1:72349971_T_C:72349971:20,18,7,0
chr5	72349977	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=124,91;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,7:0.163:47:21,7:16,0:0|1:72349971_T_C:72349971:20,20,7,0
chr5	72350290	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=220,91;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,0:4,4:4,2,3,1
chr5	72364673	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=185,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,2:0,7:0,1,0,9
chr5	72370745	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,0:1,5:0,3,0,5
chr5	72378703	.	ATT	A,AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=16,19,17;MFRL=214,109,152;MMQ=60,60,60;MPOS=20,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.05,9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,5:0.210,0.434:11:0,0,2:1,1,0:0,4,0,7
chr5	72427353	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=232,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:4,1:0|1:72427353_C_T:72427353:5,1,2,0
chr5	72427363	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0|1:72427353_C_T:72427353:6,1,2,0
chr5	72798502	.	GTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	72798724	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=352,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,1:0,3:0,1,4,0
chr5	72800125	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=97,113;MMQ=60,58;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.172:29:9,0:8,0:10,14,5,0
chr5	72800129	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=104,105;MMQ=60,53;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.121:32:11,0:10,0:13,15,4,0
chr5	72850282	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=196,224;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:2,5:0,4:1,1,1,8
chr5	72858532	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=173,103;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:6,0:9,3:6,10,2,1
chr5	72872766	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:2,7:2,2:3,1,2,7
chr5	72873925	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=205,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr5	72874801	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=183,202;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,3,1
chr5	72875635	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=210,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	73072504	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=140,262;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:7,2:8,1:6,9,0,3
chr5	73076474	.	GT	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=144,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.338:13:5,2:4,2:8,1,2,2
chr5	73076511	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.422:17:6,3:4,4:5,5,4,3
chr5	73090165	.	A	AGTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,259;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=GTT;STR;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,1:8,3:8,2,3,1
chr5	73091126	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=166,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:5,3:8,1:12,1,3,1
chr5	73091149	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=149,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,2:11,1:17,3,2,1
chr5	73136409	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,0:3,3:9,7,0,3
chr5	73142380	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=165,207;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:0,4:7,0:0,7,0,4
chr5	73153389	.	TACAC	T,TAC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,24,25;MFRL=159,196,177;MMQ=60,60,60;MPOS=14,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=AC;STR;TLOD=5.38,4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.249,0.279:8:2,1,2:1,1,0:4,0,4,0
chr5	73160730	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=167,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:2,2,0,4
chr5	73163861	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,5,6
chr5	73189145	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=199,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:3,1:6,3:0,9,1,3
chr5	73190119	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,287;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.839:4:0,1:0,2:0,0,4,0
chr5	73190264	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,153;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:10,0:10,5,3,0
chr5	73197200	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr5	73205463	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:4,1:1,7,0,3
chr5	73205697	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	73205717	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	73930442	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,226;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,5:0,3:1,0,8,0
chr5	73931246	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=220,249;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,7:1,3:0,3,2,8
chr5	73992609	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=292,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.859:12:1,7:0,4:0,1,4,7
chr5	74001095	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=155,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:13,7:6,0:6,13,7,0
chr5	74011541	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,10;MFRL=136,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.668:4:1,1:0,0:0,1,0,3
chr5	74012386	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=154,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:1,2:5,0:6,0,0,2
chr5	74017664	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:7,0:2,9:0,9,0,10
chr5	74021485	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:16,4:3,0:0|1:74021485_C_G:74021485:6,14,4,0
chr5	74021492	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=23,29;MFRL=95,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:15,4:3,0:0|1:74021485_C_G:74021485:6,13,4,0
chr5	74028752	.	GACACACACAC	G,GACACACAC	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35,31;MFRL=0,150,212;MMQ=60,54,40;MPOS=13,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=26,21,25;RU=AC;STR;TLOD=7.59,3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.438,0.392:3:0,2,0:0,0,1:0,0,3,0
chr5	74028812	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,15;MFRL=119,150;MMQ=60,54;MPOS=-8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:2,0:0|1:74028812_G_T:74028812:9,3,2,0
chr5	74028814	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,19;MFRL=119,150;MMQ=60,54;MPOS=-9;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:9,0:2,0:0|1:74028812_G_T:74028812:9,3,2,0
chr5	74069863	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=127,195;MMQ=60,56;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.337:13:5,2:3,2:2,7,1,3
chr5	74072339	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=162,254;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	74091944	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,1:12,1:12,5,2,0
chr5	74096792	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:9,7,0,3
chr5	74324437	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=178,297;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	74326530	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,27;MFRL=112,171;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:2,1:11,3:6,7,1,3
chr5	74639638	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=38.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:4,12:4,0:7,1,12,0
chr5	74651084	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=161,266;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:7,3:3,1:3,7,2,2
chr5	74655870	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,18;MFRL=191,38;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,1:8,11,1,1
chr5	74655880	.	G	GGGGTTAATGTGTAGTTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=200,38;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,0:9,2:8,10,1,1
chr5	74685520	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=160,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:8,1:2,1:3,7,1,1
chr5	74712651	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr5	74715068	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,82;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr5	74879042	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=162,154;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.350:18:6,6:6,0:0|1:74879042_T_G:74879042:12,0,6,0
chr5	74879045	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=143,154;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:6,6:5,0:0|1:74879042_T_G:74879042:11,0,6,0
chr5	74880496	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=191,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.372:9:0,3:6,0:6,0,3,0
chr5	74889660	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,113;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	74892002	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=129,240;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:8,1:1,1:6,3,1,1
chr5	74981173	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,0:11,3:7,10,1,2
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chr5	75927595	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,35;MFRL=179,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr5	75927606	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=195,179;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr5	75927635	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:2,3,3,1
chr5	75927938	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=177,225;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:0,1,0,6
chr5	75933097	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	75936944	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=168,133;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.593:8:0,4:3,0:0,3,1,4
chr5	75948474	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	75948650	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=89,133;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.737:13:1,5:2,5:2,1,4,6
chr5	75948685	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=248,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,3:0,5:0,1,1,7
chr5	75950193	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	75950707	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=17,27;MFRL=321,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=23.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.863:9:0,5:0,3:0,1,7,1
chr5	75954521	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.709:22:6,0:0,16:3,3,0,16
chr5	75954537	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=125,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.739:5:1,3:0,1:0,1,1,3
chr5	75954577	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,35;MFRL=195,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0,4,0,2
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chr5	75970219	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr5	75996837	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,151;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:8,0,4,0
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chr5	76259350	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.628:11:1,5:2,2:0,4,0,7
chr5	76332606	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr5	76607841	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=129,89;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.443:23:9,6:3,4:6,7,7,3
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chr5	76640845	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:1,3,0,2
chr5	76703374	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr5	76704849	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,7:0,0,5,8
chr5	76722443	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=162,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:0,2:6,4:0,6,0,6
chr5	76729193	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	76747087	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=208,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,2:0,6:2,0,5,3
chr5	76760495	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=164,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,2:5,5:9,2,6,1
chr5	76760657	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=132,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:1,2:5,3:2,4,2,4
chr5	76785405	.	T	TG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.364:16:1,3:9,3:1,9,3,3
chr5	76787957	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=176,214;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:10,2:14,3,2,0
chr5	76926194	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=281,137;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:1,0,0,1
chr5	76926197	.	C	CAGGAGAATCGCTT	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=281,137;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:1,0,0,1
chr5	76926202	.	C	CCG	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=281,137;MMQ=60,50;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:1,0,0,1
chr5	76926206	.	GAC	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,35;MFRL=219,137;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:2,0,0,1
chr5	76926211	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=219,137;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:76926194_G_A:76926194:2,0,0,1
chr5	77003971	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=216,222;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=58.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,18:0.686:26:1,18:6,0:4,4,0,18
chr5	77004117	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=141,61;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:12,0:8,2:0|1:77004117_T_G:77004117:11,10,0,2
chr5	77004122	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=155,61;MMQ=60,22;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:10,0:10,2:0|1:77004117_T_G:77004117:12,8,0,2
chr5	77412045	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:3,4,1,1
chr5	77425028	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,6,7
chr5	77512158	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=232,292;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr5	77524068	.	TA	T,TAA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28,29;MFRL=163,141,151;MMQ=60,60,60;MPOS=16,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,8,10;RU=A;STR;TLOD=4.35,4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.297:7:1,2,1:2,0,1:0,3,0,4
chr5	77524091	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=164,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	77536713	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:10,0:25,2:0|1:77536713_C_T:77536713:16,19,1,1
chr5	77536715	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,20;MFRL=121,47;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:9,0:25,2:0|1:77536713_C_T:77536713:16,19,1,1
chr5	77563263	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=178,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,3:3,7:5,0,9,1
chr5	77745740	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,3:4,0:5,2,3,0
chr5	77745853	.	C	CA	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=94.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.969:28:0,11:0,17:0,0,11,17
chr5	77755035	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,9,9
chr5	78076160	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,295;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:4,3:9,0:13,0,3,0
chr5	78135276	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:10,3:6,0:4,12,0,3
chr5	78251347	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=130,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,6:3,1:0,6,1,6
chr5	78265092	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=161,243;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:78265092_C_T:78265092:0,1,0,4
chr5	78265096	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=161,243;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0|1:78265092_C_T:78265092:0,1,0,4
chr5	78301309	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=230,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.290:5:2,0:2,1:0|1:78301309_G_C:78301309:0,4,0,1
chr5	78301313	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=230,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:78301309_G_C:78301309:0,4,0,1
chr5	78320085	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:13,5:10,3:11,12,3,5
chr5	78324470	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=150,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,0:6,2:8,6,1,1
chr5	78324482	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=164,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:9,0:5,3:9,5,1,2
chr5	78340062	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr5	78340411	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0,4,0,4
chr5	78351581	.	CAT	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=239,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:1,3:1,1:2,0,3,1
chr5	78351607	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:2,6:3,1:3,2,3,4
chr5	78351636	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=147,149;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.501:14:5,4:2,3:3,4,3,4
chr5	78373251	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=226,284;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.327:10:3,3:2,0:6,1,3,0
chr5	78384220	.	TGG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,16;MFRL=187,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.305:8:3,0:3,0:6,0,2,0
chr5	78411822	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr5	78416416	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,240;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,1:4,2:0,12,0,3
chr5	78421780	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr5	78426729	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:6,2:5,0:10,1,2,0
chr5	78533584	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=292,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr5	78586914	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr5	78587135	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=192,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:1,7,1,2
chr5	78608354	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=21,28;MFRL=98,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.594:10:1,1:2,5:0,4,0,6
chr5	78608368	.	TT	GA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=173,91;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.204:12:2,1:8,1:0,10,0,2
chr5	78610448	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=186,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.232:15:9,0:3,1:0|1:78610448_A_C:78610448:0,12,3,0
chr5	78610451	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=186,235;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.232:15:8,1:3,0:0|1:78610448_A_C:78610448:0,12,3,0
chr5	78671747	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=17,15;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:78671747_G_T:78671747:1,0,1,0
chr5	78671750	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=12,16;MFRL=236,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:78671747_G_T:78671747:1,0,1,0
chr5	78671754	.	C	A,G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,10,17;MFRL=246,236,175;MMQ=60,60,60;MPOS=23,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.286,0.356:3:1,0,0:0,0,0:1,0,2,0
chr5	78671757	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,15;MFRL=187,236;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,0:1,0:1|0:78671747_G_T:78671747:4,0,1,0
chr5	78742980	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=159,241;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr5	78752857	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:1,0:7,4:2,6,0,5
chr5	78944371	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,0:1,2:6,1,2,0
chr5	78944784	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=274,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr5	79024734	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.338:10:2,1:4,2:5,2,3,0
chr5	79025737	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=181,276;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:3,9,1,1
chr5	79027853	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=167,152;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:6,12,0,2
chr5	79028917	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,81;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:6,0:3,2:5,4,1,1
chr5	79029495	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=180,230;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,0:6,5:8,5,0,5
chr5	79030292	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,71;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.240:27:10,6:11,0:6,15,5,1
chr5	79031798	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=135,135;MMQ=60,57;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,0:5,2:4,8,0,2
chr5	79041057	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=144,159;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:4,5,2,2
chr5	79058817	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=187,214;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:0,1:6,1:5,1,2,0
chr5	79086903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=173,59;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:3,3,0,2
chr5	79089528	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr5	79095119	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=158,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr5	79351544	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,4,1
chr5	79351852	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,5:0,6:0|1:79351852_A_T:79351852:0,0,8,4
chr5	79351859	.	GG	AA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,5:0|1:79351852_A_T:79351852:0,0,8,4
chr5	79354147	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=42.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr5	79354184	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=208,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr5	79354647	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,1,4
chr5	79354702	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=146,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	79355192	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,3,4
chr5	79355471	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,3:1,2:3,1,4,1
chr5	79361402	.	CATAAT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=228,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	79363754	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:6,1,2,0
chr5	79363959	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:5,2:8,0:0|1:79363959_T_TC:79363959:3,11,0,2
chr5	79363960	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:0|1:79363959_T_TC:79363959:3,11,0,2
chr5	79366080	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=122,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.503:10:3,2:2,3:3,2,5,0
chr5	79366249	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=15,32;MFRL=158,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.644:11:1,6:0,1:0,4,1,6
chr5	79368016	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	79369223	.	T	TGAGA	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:0,6,0,2
chr5	79369258	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=31,25;MFRL=200,184;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79369258_G_A:79369258:0,1,0,1
chr5	79369260	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=22,32;MFRL=200,184;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79369258_G_A:79369258:0,1,0,1
chr5	79369265	.	GG	TA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=28,27;MFRL=200,184;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:79369258_G_A:79369258:0,1,0,1
chr5	79369273	.	C	CATAGT	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:79369258_G_A:79369258:0,0,0,1
chr5	79373803	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=205,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:6,0:1,2:7,0,2,0
chr5	79375724	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=144,128;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,3:8,1:5,5,2,2
chr5	79378447	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=186,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.369:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr5	79378783	.	TGCGGGGCGTCCTGG	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=180,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:3,2:7,1:11,0,3,0
chr5	79443169	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,1,3
chr5	79473059	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,7,1
chr5	79498623	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.253:10:6,1:1,1:8,0,2,0
chr5	79551867	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	79616854	.	T	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=188,188;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,9:0.197:47:11,8:27,0:28,10,9,0
chr5	79617357	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=21,31;MFRL=125,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:4,2:8,2:6,6,2,2
chr5	79734170	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:8,5,1,1
chr5	79734297	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,8,8
chr5	79734797	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:2,11,0,2
chr5	79735858	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,2,7
chr5	79741018	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	79743821	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr5	79747291	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,9,3
chr5	79773028	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	79809658	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=347,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.611:6:2,0:0,2:0,2,0,4
chr5	79817983	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=155,124;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:7,0:5,4:0|1:79817983_A_G:79817983:3,10,1,3
chr5	79817988	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=164,124;MMQ=60,25;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,0:5,3:0|1:79817983_A_G:79817983:0,9,1,3
chr5	79855372	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.916:10:0,6:0,3:0,0,6,4
chr5	79855876	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:0,1,5,6
chr5	79950163	.	C	CTGGCGCGTCCCGCCCAGGT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=66.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,5:2,9:4,1,16,0
chr5	79950497	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=266,379;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,2:0,0:0|1:79950497_C_T:79950497:0,1,2,0
chr5	79950512	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=266,349;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:79950497_C_T:79950497:0,1,1,0
chr5	79950781	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:7,5:8,2:2,13,1,8
chr5	79960955	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,133;MMQ=60,30;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:14,0:10,8:17,7,8,0
chr5	79968258	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=198,192;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	79968271	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,192;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:0,5,0,2
chr5	79974646	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=40.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,11,0
chr5	80021193	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:3,0,3,0
chr5	80021445	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=154,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:0,4,1,4
chr5	80088461	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=25.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr5	80149981	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=301,156;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,6:1,6:1,1,6,6
chr5	80160596	.	AAATG	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=295,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=72.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,7:0,10:1,0,12,5
chr5	80256909	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=230,329;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	80388823	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=190,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:0,6,1,2
chr5	80390225	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,0,2
chr5	80390290	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=193,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0,3,0,3
chr5	80404715	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=178,202;MMQ=60,52;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr5	80408702	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=237,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:1,5,0,2
chr5	80508355	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=179,250;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:8,4,1,1
chr5	80521485	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=123,102;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,1:8,2:10,5,2,1
chr5	80562176	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:1,2:5,0:0,6,0,2
chr5	80600859	.	G	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=146,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:10,11:16,0:13,13,11,0
chr5	80600877	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=122,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.325:38:7,12:19,0:14,12,11,1
chr5	80604733	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=111,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:3,6:6,1:4,5,6,1
chr5	80631511	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,2:4,3:7,0,4,1
chr5	80641789	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=127,226;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:3,1:12,2:8,7,2,1
chr5	80667715	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80667715_T_A:80667715:0,1,0,1
chr5	80667717	.	A	AAATACTCTACTTGTTTAGACTG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=156,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:80667715_T_A:80667715:0,1,0,1
chr5	80756855	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=155,159;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:1,4,3,1
chr5	80785011	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=190,211;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:3,6:2,3:4,1,5,4
chr5	81474225	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,106;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,1,2
chr5	81474400	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=105,159;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:15,1:6,1:16,5,2,0
chr5	81549216	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=173,156;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:5,6:1,3:3,3,4,5
chr5	81571846	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=235,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.804:13:1,4:1,7:2,0,9,2
chr5	81571896	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,35;MFRL=120,220;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:11,2:17,0:14,14,1,1
chr5	81572184	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=257,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,8:2,1:2,1,8,1
chr5	81573992	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=357,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr5	81601142	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=173,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:4,1:2,1:6,0,2,0
chr5	82353083	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0|1:82353083_C_T:82353083:0,2,0,4
chr5	82353087	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:1,0:1,3:0|1:82353083_C_T:82353083:0,2,0,5
chr5	82360783	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=168,108;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,15:0.533:28:1,6:12,9:12,1,8,7
chr5	82499307	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	82834956	.	TG	CT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,1274;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:9,0:15,2:11,13,2,0
chr5	82835126	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=179,196;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:6,2:1,0:4,3,2,0
chr5	82835272	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=137,267;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,5:0.150:38:15,0:18,5:14,19,0,5
chr5	82843711	.	T	TATC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=268,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ATC;STR;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr5	82849120	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	82875800	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,10,9
chr5	82940273	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=195,184;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:1,0,9,5
chr5	82940510	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,3:1,2:0,3,0,5
chr5	82940548	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=139,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:0,1,0,6
chr5	82948458	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=141,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,4:6,0:6,8,4,0
chr5	83259225	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=192,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr5	83476194	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=146,101;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:3,2,3,2
chr5	83525735	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=182,98;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.142:23:4,0:15,2:6,14,0,3
chr5	83550057	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,2:6,0:3,16,0,2
chr5	83550060	.	AT	A,ATT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=25,28,25;MFRL=124,196,275;MMQ=60,60,60;MPOS=12,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=T;STR;TLOD=5.36,5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.233,0.231:14:5,1,3:3,2,0:1,7,0,6
chr5	86564564	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=187,255;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:4,5,3,1
chr5	86637164	.	G	GA	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=143,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.211:22:8,1:10,3:5,13,1,3
chr5	86644978	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=168,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:9,7:4,0:13,0,7,0
chr5	86667856	.	G	GA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=241,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,3:1,3:1,0,6,0
chr5	86670546	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=244,167;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr5	86679676	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=155,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.396:8:1,1:2,2:0,5,0,3
chr5	86704044	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86704044_G_A:86704044:1,0,0,1
chr5	86704046	.	G	GAA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:86704044_G_A:86704044:1,0,0,1
chr5	86705005	.	TTCTC	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=335,183;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=TC;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	87494728	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:4,2:1,3:5,1,5,0
chr5	87501822	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:1,6,0,2
chr5	87502324	.	GG	TA	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,11;MFRL=164,102;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.238:21:3,1:9,0:6,10,1,4
chr5	87502325	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=18,26;MFRL=162,157;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.743:18:1,5:0,9:0,4,6,8
chr5	87502338	.	A	AAAAGGCT	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=25,20;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.139:24:10,2:8,1:5,16,1,2
chr5	87503087	.	GACT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,34;MFRL=98,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,0,3
chr5	88018388	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:3,0:4,1,2,0
chr5	89701608	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=175,72;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,2:10,0:2,13,0,2
chr5	89705390	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=28.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,14:0.589:23:3,3:6,7:8,1,11,3
chr5	89757280	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=179,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:12,5,2,0
chr5	89769647	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.410:22:6,5:7,1:8,5,6,3
chr5	89781594	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0,3,0,3
chr5	89793406	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=209,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	89918582	.	C	CAG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=201,122;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:89918582_C_CAG:89918582:0,4,0,1
chr5	89918588	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=201,122;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:89918582_C_CAG:89918582:0,4,0,1
chr5	89918592	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=227,122;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:89918582_C_CAG:89918582:0,3,0,1
chr5	89923659	.	G	GGTACAGGTA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=183,96;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:89923659_G_GGTACAGGTA:89923659:0,4,0,1
chr5	89923665	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=183,96;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:89923659_G_GGTACAGGTA:89923659:0,4,0,1
chr5	89923667	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=165,132;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr5	89924976	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	89931159	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=156,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:1,4,0,3
chr5	89938587	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,7,4
chr5	89943655	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	89954184	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=287,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr5	89968626	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,1:0,8:0,0,0,9
chr5	89971358	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=220,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr5	89975432	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=126,74;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,2:0.096:29:9,0:18,2:7,20,0,2
chr5	89979589	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,7,8
chr5	89988412	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=227,106;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,6:3,2:2,3,6,2
chr5	89990545	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=206,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr5	90000210	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,184;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:7,2,0,2
chr5	90001988	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=108,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr5	90002220	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=242,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.644:8:1,3:2,1:0,3,1,4
chr5	90006981	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=144,146;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:13,0:8,5:13,8,0,5
chr5	90007196	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,3,8
chr5	90012614	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	90015792	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,6,1
chr5	90016129	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	90016871	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,166;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:6,3,1,2
chr5	90020868	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr5	90021499	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=203,117;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.661:7:2,5:0,0:1,1,1,4
chr5	90041161	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,8493;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	90041510	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:10,4:2,3:6,6,1,6
chr5	90052263	.	T	TC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=203,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr5	90052289	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=203,103;MMQ=60,60;MPOS=30;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:5,4,1,2
chr5	90053056	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=185,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,2:0,3:0,1,0,5
chr5	90059347	.	C	CATTCATA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:90059347_C_CATTCATA:90059347:0,3,0,2
chr5	90059350	.	T	TGAATCGATTCTCTCTCTC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:90059347_C_CATTCATA:90059347:0,3,0,2
chr5	90074646	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=212,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:4,5,2,0
chr5	90074705	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=170,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,1:4,1:3,5,2,0
chr5	90151589	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,108;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,3:2,7:2,0,6,4
chr5	90159580	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=144,110;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:6,2:12,3,0,3
chr5	90445829	.	T	TTC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=132,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.438:12:5,2:2,3:5,2,5,0
chr5	90445954	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.097:39:13,0:22,3:20,16,3,0
chr5	90446080	.	GTC	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=139,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.181:14:8,0:4,2:1,11,0,2
chr5	90449031	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,3:3,2:2,1,3,2
chr5	90669400	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=29.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	92956623	.	T	TCGA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=224,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CGA;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr5	93788638	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:2,7:3,5:3,2,6,6
chr5	93905185	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=151,80;MMQ=60,39;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,7:0.153:49:16,2:24,4:18,24,4,3
chr5	93905189	.	C	G	.	.	DP=52;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=111,151;MMQ=60,29;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,12:0.245:51:15,5:23,7:15,24,7,5
chr5	93905243	.	T	C	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=152,71;MMQ=60,28;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.263:43:15,6:12,4:15,17,3,8
chr5	93905255	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=152,95;MMQ=60,21;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.101:37:20,2:12,1:16,18,1,2
chr5	94006668	.	G	GTTTATAAGTTGATTTTGCCTGTCCTCAGAAATTTAACATATA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=157,52;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.156:25:13,1:8,2:9,13,2,1
chr5	94043353	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=151,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:0,7,0,5
chr5	94050447	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:2,2,4,0
chr5	94050487	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=227,181;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,7:3,1:4,2,6,2
chr5	94206957	.	CT	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.360:11:6,3:1,1:7,0,3,1
chr5	94208748	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	94245149	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=204,92;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr5	94259621	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=177,98;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.316:20:6,4:8,2:7,7,4,2
chr5	94259682	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=161,140;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:4,4:7,6:7,4,3,7
chr5	94728631	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	94749903	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=145,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=40.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.772:20:2,8:2,8:0,4,3,13
chr5	94749969	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=276,222;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr5	94805685	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33,22;MFRL=187,211,274;MMQ=60,60,60;MPOS=26,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=T;STR;TLOD=3.68,7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,3:0.281,0.391:8:2,1,0:0,2,3:0,2,0,6
chr5	94852180	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=157,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:12,3:5,1:7,10,1,3
chr5	94878911	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:14,2:9,0:12,11,2,0
chr5	94879053	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=214,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,2:0,0:2,3,0,2
chr5	94903527	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=159,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr5	94903575	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,2:3,1:6,2,3,0
chr5	94922530	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=158,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr5	94927426	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr5	94957175	.	C	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=171,89;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,0:3,3:3,6,0,3
chr5	94988734	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,2:3,1:8,0,3,0
chr5	94990174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=210,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr5	94992039	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,208;MMQ=60,56;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr5	95116141	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=167,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.273:31:15,4:7,4:8,15,4,4
chr5	95224700	.	GAAAA	G,GA,GAAA,GAAAAAA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,32,28,25,36;MFRL=118,168,227,245,128;MMQ=60,60,60,60,60;MPOS=25,17,11,24;POPAF=7.30,7.30,7.30,7.30;RPA=18,14,15,17,20;RU=A;STR;TLOD=7.52,5.33,3.08,4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3/4:1,4,3,2,3:0.210,0.202,0.150,0.295:13:1,3,2,0,2:0,0,0,1,1:1,0,9,3
chr5	95224804	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=122,144;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:19,4:7,0:8,19,0,4
chr5	95414786	.	T	TTAAAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,7,3
chr5	95732986	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=209,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:2,3,2,2
chr5	95747963	.	TCTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=179,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,4:4,2:6,3,6,0
chr5	95761448	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,16;MFRL=92,134;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:95761448_T_A:95761448:4,0,1,0
chr5	95761456	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,17;MFRL=116,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:95761448_T_A:95761448:4,0,1,0
chr5	95761469	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=54,67;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.275:8:5,0:1,1:6,0,1,1
chr5	95768847	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=184,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,3:0,0:0,2,0,3
chr5	96062617	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=153,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:3,2:6,0:3,6,0,2
chr5	96064961	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=110,88;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:7,2:2,0:1,8,0,2
chr5	96066576	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=156,267;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:6,11,1,1
chr5	96078295	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=186,106;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:12,4:8,0:20,0,4,0
chr5	96078309	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=154,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,5:8,2:16,1,7,0
chr5	96078337	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:7,3:10,2:11,6,2,3
chr5	96086334	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=164,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,3:5,1:8,6,2,2
chr5	96093386	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.329:16:2,1:5,2:4,7,0,5
chr5	96093389	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=197,0;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.280:15:1,2:9,1:2,9,2,2
chr5	96093391	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.333:15:2,0:5,4:4,6,0,5
chr5	96101031	.	TAA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,18;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=26,24;RU=A;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.626:3:1,1:0,0:0|1:96101031_TAA_T:96101031:1,0,0,2
chr5	96101066	.	T	TA	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=213,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:2,3:0,3:0|1:96101031_TAA_T:96101031:0,2,0,6
chr5	96103110	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=198,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:5,2,3,2
chr5	96112005	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=110,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr5	96112083	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=156,139;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,4:8,0:9,5,3,1
chr5	96112295	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=198,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr5	96116112	.	ATT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=186,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:6,1,3,0
chr5	96116286	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=197,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,0:4,3:0,6,0,3
chr5	96116940	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=176,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,3:3,2:0,10,1,4
chr5	96117300	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=249,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr5	96117579	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=156,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr5	96119579	.	A	ACT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=121,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:4,1:2,4:5,2,4,2
chr5	96230858	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=24,26;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,3:3,3:4,0,6,0
chr5	96230883	.	A	ATT	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=170,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=T;STR;TLOD=38.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,7:3,4:4,0,11,0
chr5	96232142	.	T	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=118,154;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.433:37:14,8:7,7:9,12,5,11
chr5	96232222	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=185,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,10:2,2:1,3,3,9
chr5	96232250	.	G	GAAA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=180,208;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:2,7:2,2:2,2,3,7
chr5	96232286	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=182,249;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:1,2,4,2
chr5	96232345	.	CAT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=183,291;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,2:5,1:7,2,2,1
chr5	96232402	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=183,198;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=31.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:0,6:7,5:7,0,10,1
chr5	96237114	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=57,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:2,1,2,0
chr5	96237413	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr5	96239294	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=152,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,2:0,8:2,4,2,8
chr5	96244585	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=98803,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,4:1,3:1,1,6,1
chr5	96244638	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=97,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,5:3,4:4,2,8,1
chr5	96245518	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=143,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,2:2,1:1,4,0,3
chr5	96253104	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=195,185;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:6,1,2,0
chr5	96332085	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=27.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.505:22:7,9:4,2:7,4,7,4
chr5	96339102	.	ACT	A,AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25,31;MFRL=0,194,153;MMQ=60,60,60;MPOS=30,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.18,7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.375,0.500:5:0,1,2:0,0,1:0,0,5,0
chr5	96339273	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=150,189;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,2,2
chr5	96341750	.	T	TTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=153,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=TA;STR;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.379:9:3,1:2,2:6,0,2,1
chr5	96342077	.	TAA	T,TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=23,28,27;MFRL=110,174,134;MMQ=60,60,60;MPOS=11,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=6.81,13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,7:0.228,0.393:19:3,3,4:3,1,3:6,2,7,4
chr5	96363407	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.780:10:0,2:1,6:2,0,6,2
chr5	96363459	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=112,208;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,5:4,9:3,5,4,10
chr5	96364063	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	96514717	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.351:12:2,1:6,3:6,2,4,0
chr5	96514982	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	96518792	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.288:18:9,3:4,1:9,4,2,3
chr5	96518927	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,6:5,6:4,6,5,7
chr5	98106245	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=202,229;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,2:5,2:13,0,2,2
chr5	98106505	.	GA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=292,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:0,1:3,1:0,3,0,2
chr5	98109838	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	98128914	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,7:0.249:29:11,0:11,6:12,10,0,7
chr5	98129109	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:4,9,0,2
chr5	98199048	.	CAA	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=169,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr5	98199077	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	98210690	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=169,125;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,3:5,6:3,4,8,1
chr5	98216982	.	CCT	GGG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,16;MFRL=138,190;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:6,0:5,6,2,0
chr5	98218734	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,138;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.623:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr5	98230221	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:8,2,2,0
chr5	98236689	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,126;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=32.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.316:36:15,0:10,11:13,12,0,11
chr5	98236831	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=135,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:5,6,3,2
chr5	98237139	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=189,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	99871228	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:10,4:13,0:13,11,4,0
chr5	99871696	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=148,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,3:3,0:1,5,1,2
chr5	101592809	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=169,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,1:3,8:3,1,6,3
chr5	101595831	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=183,188;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	101595885	.	T	TGA	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=130,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GA;STR;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,3:0,0:3,0,7,0
chr5	101596032	.	AAAAT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,24;MFRL=206,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:0,1:0,3,1,4
chr5	101606518	.	G	GA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=159,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:2,4:4,5:1,5,3,6
chr5	101627411	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=194,260;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr5	101631592	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,2:4,0,5,0
chr5	101724307	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:2,0,2,2
chr5	101726648	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=214,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:1,0,4,3
chr5	101726770	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=194,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:1,2:2,4:0,3,1,5
chr5	101726851	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=156,269;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr5	101755430	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr5	101795490	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=240,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=44.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,4:1,9:0,1,4,10
chr5	101811346	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr5	101816104	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=154,116;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:3,2,0,4
chr5	101816228	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=263,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	102202043	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,49;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:0,13,0,2
chr5	102249546	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=156,168;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr5	102282472	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	102295504	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=236,214;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,4,1
chr5	102295723	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=120,144;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,4:13,0:9,17,2,2
chr5	102296846	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:12,0:10,2:15,7,1,1
chr5	102310166	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr5	102325878	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=248,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr5	102340782	.	GATTA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=146,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATTA;STR;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,2:1,4:2,2,5,1
chr5	102363858	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=171,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:3,3,5,1
chr5	102364542	.	A	AAT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=178,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:4,2:5,3:5,4,2,3
chr5	102423576	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:102423576_A_G:102423576:0,0,4,0
chr5	102423579	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:102423576_A_G:102423576:0,0,4,0
chr5	102489511	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=95,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:4,6:2,5:4,2,8,3
chr5	102494751	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=209,214;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,4:1,3:2,0,7,0
chr5	102518877	.	CTTTTTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=37,30;RU=T;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.733:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	102518978	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=104,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.121:39:12,4:22,0:8,27,0,4
chr5	102537193	.	GT	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.214:19:7,2:7,1:13,2,4,0
chr5	102537200	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=131,115;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.547:20:6,6:3,5:8,1,10,1
chr5	102537231	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=5;MBQ=33,28;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,5:13,0:13,13,5,0
chr5	102537298	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=5;MBQ=29,29;MFRL=138,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=58.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,21:0.524:40:8,12:11,9:6,13,6,15
chr5	102537379	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,6:2,3:1,3,4,5
chr5	102614324	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=175,105;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,14:0.517:27:6,9:7,5:0|1:102614324_G_A:102614324:7,6,6,8
chr5	102614327	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,5:0.221:25:12,2:8,3:1|0:102614324_G_A:102614324:9,11,2,3
chr5	102886512	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=221,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:2,5:3,1:4,1,6,0
chr5	102890560	.	G	GA,GAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=37,26,26;MFRL=195,124,161;MMQ=60,60,60;MPOS=13,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=3.72,3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,2:0.380,0.377:5:1,0,0:0,1,1:1,0,0,4
chr5	102895209	.	AG	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=165,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr5	102895241	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=187,234;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr5	102895752	.	A	AC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=137,197;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:9,9:7,0:9,7,9,0
chr5	106722858	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=185,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:7,3:9,0:13,3,3,0
chr5	106723107	.	C	CT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=256,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.498:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	107700460	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:10,2:5,0:0|1:107700460_G_T:107700460:8,8,1,1
chr5	107700468	.	C	CCCTCCTCTTTCT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=134,72;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.140:19:9,1:6,0:0|1:107700460_G_T:107700460:9,8,1,1
chr5	107703446	.	CAAG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=39.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	108168451	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=140,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,2:0,1:2,0,3,1
chr5	108168470	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=130,120;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:2,0:3,0:3,4,2,0
chr5	108203451	.	GTT	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=141,101;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:1,1:4,1,2,0
chr5	108219238	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=157,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr5	108436008	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=230,106;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:108436008_C_G:108436008:3,0,1,0
chr5	108436014	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=230,106;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:108436008_C_G:108436008:3,0,1,0
chr5	108516629	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=46.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,10:0,4:0,0,5,9
chr5	108521893	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:6,7:1,4:6,1,6,5
chr5	108523293	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=226,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:4,5:5,3:5,4,1,7
chr5	108679822	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,16;MFRL=278,164;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:108679822_G_A:108679822:2,0,1,0
chr5	108679824	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,16;MFRL=278,164;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:108679822_G_A:108679822:2,0,1,0
chr5	108679826	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=31,16;MFRL=278,164;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:108679822_G_A:108679822:2,0,1,0
chr5	108679870	.	T	TTTAA	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTAA;STR;TLOD=83.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,9:0,8:0,0,13,6
chr5	108691738	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr5	108717157	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=170,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:3,4:0,3:3,0,7,0
chr5	109049486	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=159,243;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.122:27:10,0:9,2:9,15,0,3
chr5	109049507	.	CTT	C,GTT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,28,32;MFRL=163,89,247;MMQ=60,60,60;MPOS=15,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.41,8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,2,3:0.162,0.166:16:4,1,1:6,1,2:2,9,1,4
chr5	109051820	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:15,1:6,1:17,4,2,0
chr5	109125264	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,49;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:14,0:15,3:12,17,0,3
chr5	109183341	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=122,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:9,6,1,1
chr5	109190935	.	TCTC	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=160,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:13,9,1,1
chr5	110082153	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=192,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	110408705	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=144,234;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:2,8,0,2
chr5	110430488	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=22.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,3:2,4:7,0,7,0
chr5	110436450	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:3,7:5,5:2,6,4,8
chr5	110443228	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=142,228;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,0,3
chr5	110446455	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=162,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.349:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr5	110446741	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=224,247;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:0,2,3,1
chr5	110448751	.	ATT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=157,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.882:8:0,3:0,2:2,0,5,1
chr5	110448810	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=163,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:10,3:10,0:13,8,3,0
chr5	110454681	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=130,223;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr5	110459629	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=199,3001;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.325:22:8,6:7,0:5,10,0,7
chr5	110560140	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=183,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr5	110560413	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=177,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr5	110679657	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,6:0,1:0,0,7,0
chr5	110679873	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,0,2
chr5	110710699	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,0,10
chr5	110712491	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	110730557	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,3,6
chr5	111500738	.	TGTG	T	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=116,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.079:36:15,1:18,1:19,15,1,1
chr5	111500816	.	C	CTAAAA	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAAA;STR;TLOD=24.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:4,5:1,3:1,4,3,6
chr5	111500822	.	T	TAAA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=A;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:9,1:3,1:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:3,9,1,1
chr5	111500824	.	T	TAC	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,25;MFRL=134,138;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:0|1:111500822_T_TAAA:111500822:3,9,1,1
chr5	111595633	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,91;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:3,2:8,0:2,9,2,0
chr5	111595745	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr5	111611160	.	TATA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=181,416;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATA;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:9,2:1,0:0,10,0,2
chr5	112116632	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=170,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,1:3,1:2,7,0,2
chr5	112175617	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=140,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:10,3:5,4:7,8,3,4
chr5	112175832	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=142,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.123:22:11,1:9,1:9,11,1,1
chr5	112196949	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=247,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=41.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,6:3,7:6,0,12,1
chr5	112196983	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=169,250;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:11,2:12,2:21,3,4,0
chr5	112197132	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=181,245;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.107:35:14,3:16,0:0|1:112197132_G_A:112197132:9,23,1,2
chr5	112197140	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=180,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:16,2:16,0:0|1:112197132_G_A:112197132:9,24,1,1
chr5	112200098	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,8,3
chr5	112200457	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=136,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,0:11,2:0|1:112200457_G_A:112200457:6,16,1,1
chr5	112200463	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:9,0:12,2:0|1:112200457_G_A:112200457:5,17,1,1
chr5	112200465	.	AT	CA	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=25,20;MFRL=140,57;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:12,2:0|1:112200457_G_A:112200457:5,17,1,1
chr5	112200473	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=137,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:10,0:11,2:0|1:112200473_C_T:112200473:4,17,1,1
chr5	112200477	.	T	TATC	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=140,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:10,1:0|1:112200473_C_T:112200473:3,17,1,1
chr5	112203162	.	A	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=142,199;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,9:0.210:44:21,0:14,8:13,22,0,9
chr5	112238300	.	GA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,241;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	112257908	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:8,2:8,1:5,13,0,3
chr5	112312528	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=185,222;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:3,2:8,0:10,1,2,0
chr5	112312736	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:12,0:13,2:8,18,1,1
chr5	112328481	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=182,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,0:6,8:5,8,0,8
chr5	112343544	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	112346416	.	ATG	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=170,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr5	112346431	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr5	112349070	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=74,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.872:21:2,9:0,9:1,1,9,10
chr5	112385004	.	CA	GC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=238,175;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=62.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.843:17:1,5:1,10:0,2,2,13
chr5	112385035	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=238,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.767:11:1,5:1,3:0,2,0,9
chr5	112389747	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=223,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr5	112399934	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=173,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	112406718	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr5	112437714	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=153,225;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr5	112440132	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=261,181;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr5	112440142	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=181,261;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr5	112487137	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=71.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,23:0.962:23:0,9:0,14:0,0,5,18
chr5	112676191	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=232,145;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:2,0,9,0
chr5	112720648	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.671:16:3,1:2,10:4,1,10,1
chr5	112824039	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=152,223;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr5	112824048	.	T	TGCC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=201,229;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=GCC;STR;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,1:4,1:1,4,0,2
chr5	112824166	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,302;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	112849801	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=24,36;MFRL=199,223;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:7,0:1,2:0,8,0,2
chr5	112849823	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=178,243;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,1:1,3:0,7,0,4
chr5	112851088	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=293,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,3:0,8:1,1,1,10
chr5	112851121	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=27.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr5	112860910	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=173,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:9,0:4,3:1,12,0,3
chr5	112868693	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,210;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.263:36:13,5:14,4:14,13,5,4
chr5	112876584	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=194,165;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	112876889	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,303;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr5	112884197	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,8,1
chr5	112884594	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,274;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:7,1:5,2:10,2,2,1
chr5	112888854	.	CTTTTT	C	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,34;MFRL=196,151;MMQ=40,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,15;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.502:2:0,1:1,0:0|1:112888854_CTTTTT_C:112888854:1,0,1,0
chr5	112888871	.	T	TAA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=27,25;MFRL=151,196;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:1,1:0.499:2:1,0:0,1:1|0:112888854_CTTTTT_C:112888854:1,0,1,0
chr5	112888872	.	TTTCAG	T	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=28,16;MFRL=188,196;MMQ=60,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:112888854_CTTTTT_C:112888854:2,0,1,0
chr5	112888875	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,10;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,0:0,0:0|1:112888854_CTTTTT_C:112888854:0,0,1,0
chr5	112888880	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=23,16;MFRL=188,196;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:1,0:0,0:1|0:112888854_CTTTTT_C:112888854:2,0,1,0
chr5	112888883	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=21,15;MFRL=156,196;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.333:4:1,0:0,0:1|0:112888854_CTTTTT_C:112888854:3,0,1,0
chr5	112888900	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=7;MBQ=32,17;MFRL=133,174;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,0:6,0:0|1:112888854_CTTTTT_C:112888854:5,5,2,0
chr5	112889566	.	ATCT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=184,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,1:4,1:6,8,2,0
chr5	112889821	.	CCTCTA	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,0,1
chr5	112898969	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=231,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr5	112901494	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0|1:112901494_G_C:112901494:0,0,5,0
chr5	112901496	.	CG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=214,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:112901494_G_C:112901494:4,0,1,0
chr5	112926755	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.359:17:8,1:3,4:7,4,3,3
chr5	112926982	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr5	112927686	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:7,2,3,3
chr5	112927888	.	AT	A,ATTT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28,22;MFRL=166,207,153;MMQ=60,60,60;MPOS=23,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,13;RU=T;STR;TLOD=3.89,13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.242,0.430:10:1,0,0:2,2,2:1,2,1,6
chr5	112927900	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=180,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.426:12:2,2:5,3:1,6,1,4
chr5	113699791	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=201,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,0:4,3:0,8,0,3
chr5	114462589	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,3,7
chr5	114462630	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=159,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,2:1,2:0,7,0,4
chr5	114611356	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	114860363	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=176,87;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,2:8,2:7,11,2,2
chr5	114860951	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,138;MMQ=60,47;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,3:6,0:12,5,3,0
chr5	115167564	.	CA	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=123,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.439:18:5,5:5,3:2,8,2,6
chr5	115167595	.	CT	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=120,126;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,1:8,2:0,16,0,3
chr5	115168259	.	AATTT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=226,146;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.342:10:5,1:2,2:7,0,3,0
chr5	115177668	.	G	GAGATTACGAGGC	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=218,0;MMQ=60,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.408:15:5,5:4,1:7,2,6,0
chr5	115177721	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=173,149;MMQ=52,56;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,3:7,1:9,8,3,1
chr5	115249078	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=162,158;MMQ=60,27;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:9,2:10,4:5,14,6,0
chr5	115249271	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,207;MMQ=27,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:1,2:2,5:1,2,1,7
chr5	115323691	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=152,161;MMQ=23,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:0,6:8,4:0,8,1,9
chr5	115338704	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=170,105;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:2,6:4,1:0,6,0,7
chr5	115339086	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=126,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:3,2,1,2
chr5	115341638	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=121,193;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:6,6:5,2:5,6,3,5
chr5	115341657	.	T	TTTGCCTTC	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=165,47;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:115341657_T_TTTGCCTTC:115341657:4,11,1,1
chr5	115341660	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=157,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,2:6,0:0|1:115341657_T_TTTGCCTTC:115341657:3,11,1,1
chr5	115351150	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,352;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	115351224	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=222,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,3,0
chr5	115351498	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr5	115358151	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=152,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.088:32:14,2:16,0:16,14,2,0
chr5	115426746	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=126,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=38.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.424:31:11,5:7,8:12,6,11,2
chr5	115426932	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=199,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:9,1:7,3:0,17,0,4
chr5	115428439	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr5	115469773	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,5,0
chr5	115628120	.	CTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,0;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,1:0,2:2,1,3,0
chr5	115811321	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:2,4,1,2
chr5	115822384	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=188,159;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:115822384_C_A:115822384:3,2,2,0
chr5	115822392	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=130,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.211:12:4,2:6,0:0|1:115822384_C_A:115822384:8,2,1,1
chr5	115827356	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=278,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:6,0,8,0
chr5	115827407	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=252,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=37.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.818:14:1,3:1,9:2,0,8,4
chr5	115831092	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=240,199;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,4:2,1:6,1,3,2
chr5	115831305	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	115832056	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,192;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:6,3:8,2:2,12,1,4
chr5	115838117	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:0,3,0,5
chr5	115840528	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,237;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,4:9,1:12,3,3,2
chr5	118176842	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=188,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,3:3,0:0,3,0,3
chr5	118280395	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr5	118437730	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=126,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:2,7,0,2
chr5	118445891	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=125,127;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.205:37:20,7:10,0:16,14,7,0
chr5	118465215	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	118468730	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=212,386;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr5	118484467	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=130,75;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:11,7:4,0:6,9,5,2
chr5	118500981	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=110,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=A;STR;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:2,2:2,2,0,3
chr5	118513246	.	C	CTG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=185,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:0,9,0,3
chr5	118513876	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=125,301;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,2:13,1:11,10,1,2
chr5	118529605	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=165,64;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:12,2:10,0:10,12,2,0
chr5	118532034	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,3:2,5:2,2,7,1
chr5	118532247	.	A	ACACTCTCTTTGAGACTTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=189,222;MMQ=60,33;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:118532247_A_ACACTCTCTTTGAGACTTCT:118532247:0,4,0,1
chr5	118532249	.	A	AATTAAAGTCAAGTCT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=189,222;MMQ=60,33;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:4,1:0,0:0|1:118532247_A_ACACTCTCTTTGAGACTTCT:118532247:0,4,0,1
chr5	118556350	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	118691693	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:6,7:3,3:10,0,10,0
chr5	118691737	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=149,114;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:7,4:7,3:10,4,5,3
chr5	118691888	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=160,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.379:16:7,4:3,1:3,7,2,4
chr5	118691929	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,10:0,2:0,0,1,11
chr5	118728953	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:11,1:7,8:4,14,0,9
chr5	118788196	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,2:4,2:8,2,3,1
chr5	118809533	.	CCA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=CA;STR;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.547:9:0,4:4,1:4,0,5,0
chr5	118811313	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=166,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:8,0,6,0
chr5	118813240	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=156,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.404:23:9,3:4,6:7,7,1,8
chr5	118832433	.	TC	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr5	118837658	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=146,207;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,4:3,1:6,0,2,3
chr5	118837833	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=139,162;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,1,4
chr5	118862971	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,3:9,5:3,14,1,7
chr5	118867173	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=176,333;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:1,5,0,3
chr5	118872085	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=130,213;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:9,2:16,0:18,7,2,0
chr5	118877558	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.156:24:6,0:9,3:0|1:118877558_C_T:118877558:13,8,3,0
chr5	118877575	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=51,153;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:19,3:0.166:22:6,0:11,3:1|0:118877558_C_T:118877558:9,10,2,1
chr5	120021819	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,8:0,15:0,0,14,10
chr5	120022398	.	CGT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=297,340;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GT;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.327:4:3,1:0,0:0,3,0,1
chr5	121330223	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,14,3
chr5	121362852	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=147,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:2,0:5,3:1,7,0,3
chr5	121413090	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=174,89;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,2:9,0:7,8,1,1
chr5	121488487	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:6,0:12,2:9,9,1,1
chr5	121488635	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=242,133;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:2,4,0,2
chr5	121726714	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=227,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,0:2,3:3,0,3,0
chr5	121761021	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:12,0:1,2:8,5,1,1
chr5	121767643	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,3:7,1:10,5,2,2
chr5	122111005	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:0,11,0,4
chr5	122135323	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=155,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:5,0:3,2:8,0,2,0
chr5	122137708	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=197,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,3:5,5:5,5,3,5
chr5	122163401	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=234,185;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:1,2,2,1
chr5	122272489	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=175,28;MMQ=60,57;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:9,2:8,0:11,6,1,1
chr5	122281709	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=135,124;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.422:14:4,3:4,2:7,1,6,0
chr5	122343354	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=20,19;MFRL=174,95;MMQ=60,59;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:3,1:1,0:8,0,2,0
chr5	122359502	.	AAC	A,AACACACACACACACAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29,30;MFRL=0,174,151;MMQ=60,60,60;MPOS=6,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,22;RU=AC;STR;TLOD=5.53,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.375,0.517:6:0,0,0:0,2,2:0,0,6,0
chr5	122372402	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=227,174;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:0,5,0,3
chr5	122682154	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,4,1
chr5	122685801	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,3,5
chr5	122713989	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,120;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr5	122714134	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=192,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.366:6:2,1:0,1:1,3,0,2
chr5	122720923	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=180,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr5	122726783	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:10,2:5,1:12,3,2,1
chr5	122728913	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=252,75;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr5	122754309	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:122754309_G_A:122754309:0,3,0,2
chr5	122754310	.	AGATGGAGTC	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,23;MFRL=175,177;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:122754309_G_A:122754309:0,3,0,2
chr5	122888781	.	AT	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:18,2:9,1:13,14,2,1
chr5	122940383	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=152,227;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr5	122940544	.	GTT	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=164,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=T;STR;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:6,12,1,1
chr5	123973701	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=182,219;MMQ=60,51;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,0,4
chr5	123983915	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,203;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,4:6,7:6,5,6,5
chr5	123985306	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:19,5:13,0:24,8,5,0
chr5	123985320	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=180,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:9,7:10,3:15,4,6,4
chr5	123985443	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=186,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.406:25:9,3:6,7:2,13,2,8
chr5	123985464	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,34;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:4,4:0,10,1,4
chr5	123985484	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,1,9
chr5	125759418	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=195,53;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:9,0:12,2:0|1:125759418_G_A:125759418:5,16,1,1
chr5	125759423	.	A	ATCACTT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=195,53;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:12,2:0|1:125759418_G_A:125759418:5,15,1,1
chr5	125759425	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=197,53;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:6,0:11,2:0|1:125759418_G_A:125759418:4,14,1,1
chr5	125759427	.	C	CCCACG	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=199,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:4,0:11,2:0|1:125759418_G_A:125759418:4,13,1,1
chr5	125802027	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=137,176;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:4,7:1,6:3,2,8,5
chr5	125809145	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=167,246;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:0,1,0,6
chr5	125887685	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:2,4:2,2:2,2,6,0
chr5	125929067	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=89,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,0:12,3:6,17,1,2
chr5	125939522	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=147,106;MMQ=60,40;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:13,3:5,0:0|1:125939522_T_G:125939522:14,6,3,0
chr5	125939526	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=147,106;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:14,3:6,0:0|1:125939522_T_G:125939522:14,6,3,0
chr5	125944219	.	G	GTGTTTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TGTTTT;STR;TLOD=39.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.916:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	125952994	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=112,143;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:5,7:6,2:5,6,5,4
chr5	126145771	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	126156531	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=154,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr5	126168319	.	AG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr5	126206303	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:7,5:9,5:11,5,5,5
chr5	126250723	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=205,85;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:6,3:14,0:9,11,1,2
chr5	126869270	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:6,4:1,1:6,1,5,1
chr5	126994381	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	127420135	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=183,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:7,0,5,0
chr5	127485599	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,4:0,3:0,0,8,0
chr5	127613791	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,263;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	127622983	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=223,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.870:13:0,6:1,6:0,1,9,3
chr5	127624312	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=240,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:127624312_A_T:127624312:0,1,0,1
chr5	127624315	.	A	AGGCTGCCATACCTCCATAGCT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=240,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:127624312_A_T:127624312:0,1,0,1
chr5	127624819	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:9,6,2,0
chr5	127626456	.	TC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=177,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:3,0:8,2:7,6,2,0
chr5	127640783	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,11:0,0,7,11
chr5	127640861	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	127670603	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=139,249;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:2,3:4,0:0,6,1,2
chr5	127671657	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=193,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:6,1,2,0
chr5	127680042	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:6,0:1,5:4,3,1,4
chr5	127685624	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,2:5,3:11,0,3,2
chr5	127729053	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:5,1:6,1:2,9,1,1
chr5	128301736	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=33,35;MFRL=216,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr5	128301742	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=153,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:2,0,7,0
chr5	128301824	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=133,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,3:1,4:1,2,2,5
chr5	128301957	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=122,307;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,1:7,3:7,8,1,3
chr5	128301971	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=130,144;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,7:6,6:3,5,6,7
chr5	128321068	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=110,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:2,5,0,3
chr5	128326090	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=165,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,1:9,3:9,6,0,4
chr5	128326177	.	G	GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:6,1:5,1:2,9,2,0
chr5	128351492	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr5	128359247	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	128359297	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=175,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr5	128362830	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:3,1:10,1:9,5,0,2
chr5	128365489	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=97,209;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr5	128440571	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=206,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	128440864	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=209,169;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:7,4:8,0:10,5,4,0
chr5	128797410	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=178,209;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	128863471	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=101.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,14:0,14:0,0,15,13
chr5	129015452	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=256,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:4,5,4,2
chr5	129015668	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr5	129040056	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=165,135;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:4,1:10,3:4,10,4,0
chr5	129072943	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=48.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,3:0,11:0,0,3,11
chr5	129240972	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,306;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.695:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	129244065	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=31,23;MFRL=134,149;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:9,0:12,9:8,13,0,9
chr5	129244122	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=189,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:1,9,0,3
chr5	129244133	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,31;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,8:0,4:0,0,1,11
chr5	129519874	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	130522697	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=134,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,2:5,1:9,4,2,1
chr5	130535204	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:3,1:7,2:9,1,3,0
chr5	130766613	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,148;MMQ=60,49;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:7,2:15,3,0,2
chr5	130769379	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=36,30;MFRL=189,133;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,2:3,0:0|1:130769379_C_T:130769379:0,3,0,2
chr5	130769381	.	A	AGGTGG	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=203,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:0,2:3,0:0|1:130769379_C_T:130769379:0,4,0,2
chr5	130769385	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=27,27;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:0|1:130769379_C_T:130769379:0,5,0,2
chr5	130769387	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=204,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0|1:130769379_C_T:130769379:0,5,0,2
chr5	130769424	.	GA	G,GAA	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,26,18;MFRL=266,225,217;MMQ=60,60,60;MPOS=27,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=9.95,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.555,0.222:6:1,1,0:0,2,0:0,1,0,5
chr5	130808198	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,289;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	130831365	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=92.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,10:0,15:0,0,11,14
chr5	130843872	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=149,54;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,5:0.141:40:13,5:22,0:13,22,3,2
chr5	130857217	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.224:16:9,2:4,1:4,9,0,3
chr5	130982768	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=47.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,4:0,9:0,0,8,5
chr5	131006082	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,4:0,7:1,0,11,0
chr5	131006356	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=87.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,11:0,17:0,0,7,21
chr5	131006381	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=199,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.449:7:2,1:2,1:0,4,0,3
chr5	131039995	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:12,2:8,1:0,20,0,3
chr5	131066577	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=278,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,9:0,5:1,0,10,4
chr5	131290007	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=210,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:7,6,2,0
chr5	131309048	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,0:7,4:6,11,0,4
chr5	131312238	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=184,212;MMQ=60,43;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.716:22:3,1:2,12:5,1,16,0
chr5	131322666	.	CCACACACTCACA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=206,215;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.432:5:1,1:1,1:0,3,0,2
chr5	131323807	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=170,75;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,0:5,2:4,8,0,2
chr5	131324250	.	C	CTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TG;STR;TLOD=54.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,8:0,0,6,8
chr5	131325888	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr5	131326522	.	AC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=15,25;MFRL=234,62;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:0,2:0,2:1,0,0,5
chr5	131347520	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=169,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,5,0
chr5	131409903	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=187,61617081;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr5	131534499	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=227,130;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:3,1,4,0
chr5	131544830	.	C	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=125,125;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.267:28:5,7:15,0:16,5,7,0
chr5	131546280	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=138,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0,3,0,8
chr5	131553428	.	T	TA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=64,146;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,5:1,4:1,3,8,1
chr5	131602166	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=107,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:1,7:7,4:4,4,4,7
chr5	131607402	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=163,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.447:14:1,5:5,1:6,2,4,2
chr5	131630852	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=191,216;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=34.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:4,3:4,8:6,2,5,6
chr5	131657903	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:7,3:13,0:13,7,2,1
chr5	131658085	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,2,9
chr5	131660119	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=209,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,4:2,0:4,0,4,0
chr5	131670624	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,17041470;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,2:2,0:2,6,0,2
chr5	131671460	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,251;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:7,0,3,0
chr5	131671769	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.663:4:1,0:0,2:0,1,1,2
chr5	131719999	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=88.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,17:0,8:0,0,5,20
chr5	131720070	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=180,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	131721174	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.364:20:8,3:5,4:1,12,4,3
chr5	131721204	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:0,6,0,5
chr5	131730052	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,1:0,8:0,0,0,9
chr5	131755477	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	131792639	.	A	AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=196,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.696:11:2,7:1,1:3,0,8,0
chr5	131796163	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=242,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.569:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	131796573	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.900:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr5	131796609	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	131819970	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=195,254;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:3,0:12,2:0|1:131819970_T_C:131819970:15,0,0,2
chr5	131819977	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=178,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:0|1:131819970_T_C:131819970:9,0,1,2
chr5	131820275	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=152,294;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,2:3,0:1,5,0,2
chr5	131822055	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=182,180;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,0:3,2:1,6,0,2
chr5	131822072	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,0:4,2:2,7,1,1
chr5	131822133	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=187,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.403:10:2,0:4,3:3,3,2,2
chr5	131822224	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=141,250;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:2,4:8,0:7,3,3,1
chr5	131822575	.	T	TG	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=172,226;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:10,0:13,3:10,13,0,3
chr5	131823519	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=208,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	131878882	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=141,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,2:9,2:3,13,1,3
chr5	131892979	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,11,9
chr5	131915213	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=175,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:3,4,0,3
chr5	131923557	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=163,211;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:4,1,1,1
chr5	131931451	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=145,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.206:13:8,1:1,1:0,11,0,2
chr5	131972781	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=130,101;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=29.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.378:35:9,13:13,0:14,8,13,0
chr5	131995843	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,220;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:4,0,3,0
chr5	132009710	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:8,3,2,0
chr5	132036252	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=135,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:5,6:0,2:3,2,5,3
chr5	132036489	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=22,27;MFRL=152,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr5	132038199	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:5,0,4,1
chr5	132039132	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=178,182;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:0,3:1,5:1,0,7,1
chr5	132046789	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=128,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:0,2,0,8
chr5	132070242	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	132149322	.	G	GGCCGCC,GGCCGCCGCC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33,33;MFRL=0,374,244;MMQ=60,60,60;MPOS=16,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,7,8;RU=GCC;STR;TLOD=3.78,3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.422,0.417:2:0,0,0:0,1,1:0,0,2,0
chr5	132149684	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr5	132150019	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,11;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:132150019_G_T:132150019:0,0,0,1
chr5	132150024	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:132150019_G_T:132150019:0,0,0,1
chr5	132159520	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=194,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,2:4,1:3,3,3,0
chr5	132198287	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr5	132219135	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.314:20:10,3:4,3:5,9,3,3
chr5	132219304	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	132232793	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:11,6:11,0:0|1:132232793_C_T:132232793:11,12,6,0
chr5	132232803	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:11,6:12,0:0|1:132232793_C_T:132232793:11,12,6,0
chr5	132234152	.	C	CG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=20.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,2:0,0,2,5
chr5	132234182	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,33;MFRL=108,242;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.439:5:2,2:1,0:1,2,0,2
chr5	132234702	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=135,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:0,6:1,8:1,0,13,1
chr5	132239939	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=14,31;MFRL=321,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.635:8:1,3:0,1:3,0,5,0
chr5	132240151	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.927:9:0,3:0,5:0,0,0,9
chr5	132267850	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=240,106;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,14:0.714:19:2,5:3,7:0|1:132267850_A_AT:132267850:3,2,8,6
chr5	132267859	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=240,106;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,16:0.737:21:2,8:3,8:0|1:132267850_A_AT:132267850:3,2,9,7
chr5	132334252	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=279,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr5	132334474	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=114,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,1:7,4:4,6,3,2
chr5	132387979	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:6,2,3,1
chr5	132388068	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=178,99;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.554:16:2,4:5,5:2,5,5,4
chr5	132403341	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr5	132408905	.	CT	C,CTTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32,32;MFRL=189,224,213;MMQ=60,60,60;MPOS=21,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,14;RU=T;STR;TLOD=4.40,3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,2:0.325,0.283:8:1,1,0:2,2,1:3,0,5,0
chr5	132409650	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,206;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,4:3,1:6,0,5,0
chr5	132409867	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=184,258;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,1,1
chr5	132422448	.	TTTTTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=197,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TTTTG;STR;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:6,0,4,0
chr5	132425415	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,10;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.727:10:1,0:1,0:2,0,0,8
chr5	132428499	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=101,123;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.410:18:5,2:2,4:9,2,7,0
chr5	132433049	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,0:3,4:0,5,1,3
chr5	132437603	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=139,217;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.305:24:7,2:5,0:6,11,0,7
chr5	132437608	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=31,15;MFRL=148,209;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.236:23:5,0:4,0:6,12,0,5
chr5	132439510	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=214,214;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.211:31:11,6:14,0:23,2,6,0
chr5	132546059	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=287,236;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr5	132556523	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=175,257;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:6,3:13,1:11,8,1,3
chr5	132559950	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=200,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.678:16:2,7:2,4:1,4,4,7
chr5	132561277	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,1:4,2:7,1,3,0
chr5	132569032	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=178,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:0,3:6,0:6,0,3,0
chr5	132763335	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=171,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:6,5:8,1:8,7,0,6
chr5	133316325	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=210,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=A;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr5	133316568	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=129,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,4:0.142:33:15,0:14,4:17,12,4,0
chr5	133316707	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,21;MFRL=264,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:2,2:1,0:1,5,0,3
chr5	133327915	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,147;MMQ=60,48;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:6,1:1,2:7,0,3,0
chr5	133328570	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=182,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,1:7,3:14,4,4,0
chr5	133451557	.	GC	TT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,0:4,2:8,2,2,0
chr5	133509736	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=128,262;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,1:7,1:0|1:133509736_A_G:133509736:0,8,0,2
chr5	133509752	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=144,262;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:0|1:133509736_A_G:133509736:0,6,0,2
chr5	133537438	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,31;MFRL=258,208;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr5	133537479	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=223,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,5:2,1:2,0,6,0
chr5	133541548	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=277,172;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr5	133561589	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:1,4:2,3:1,2,0,7
chr5	133655067	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,159;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,2:3,3:5,1,4,1
chr5	133657610	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=15.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:1,4:6,3:2,5,1,6
chr5	133701964	.	C	CAT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=169,338;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:4,0,1,0
chr5	133738717	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=370,274;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	133880124	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=151,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,0:2,6:4,2,4,2
chr5	133897829	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	133900111	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,11:0,2:0,0,10,3
chr5	133909475	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,11:0,5:0,0,7,9
chr5	133914448	.	AACC	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,17;MFRL=160,273;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=ACC;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.173:15:6,0:7,0:8,5,2,0
chr5	133944043	.	ATT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=218,130;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.379:11:4,2:2,1:7,0,3,1
chr5	133945288	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:7,5:6,5:5,8,5,5
chr5	134010211	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	134015276	.	GT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=142,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,0:3,2:6,0,1,1
chr5	134033777	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr5	134074545	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=158,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,0:9,2:0,17,0,2
chr5	134079558	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=181,132;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134079558_A_AT:134079558:1,0,1,0
chr5	134079561	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=181,132;MMQ=60,40;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134079558_A_AT:134079558:1,0,1,0
chr5	134079564	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=181,132;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:134079558_A_AT:134079558:1,0,1,0
chr5	134099865	.	C	CTAGAATGTTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.679:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	134102723	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=104,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:0|1:134102723_G_T:134102723:5,10,0,2
chr5	134102727	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=145,111;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:134102723_G_T:134102723:5,10,0,2
chr5	134106506	.	C	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=213,171;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=A;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.519:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	134106761	.	CTCTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,30;MFRL=169,92;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=TCTT;STR;TLOD=6.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,1,1
chr5	134190510	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=210,176;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr5	134190898	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:11,0:4,2:5,10,1,1
chr5	134192330	.	CAAAT	C,CAAATAAAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32,33;MFRL=0,154,229;MMQ=60,47,47;MPOS=27,4;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=AAAT;STR;TLOD=11.16,7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,2:0.575,0.330:6:0,2,1:0,2,1:0,0,6,0
chr5	134331921	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=156,159;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:3,0:4,0,1,1
chr5	134344497	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,8,2
chr5	134365070	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr5	134365091	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,3:2,2:0,4,0,5
chr5	134366873	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=246,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr5	134688832	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=170,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,0:2,7:0,4,0,7
chr5	134724622	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=198,145;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:11,4:14,0:13,12,4,0
chr5	134782414	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=207,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.408:20:4,5:8,3:7,5,7,1
chr5	134782450	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=169,170;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:2,5:5,7:2,5,7,5
chr5	135170658	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=139,304;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:6,1:5,1:4,7,0,2
chr5	135178220	.	G	GC	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=162,218;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=29.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,0:2,9:0,4,0,9
chr5	135178231	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=175,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.686:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr5	135188214	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=23.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.524:17:2,4:6,5:4,4,6,3
chr5	135276201	.	AGTT	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:6,5:1,7:5,3,6,6
chr5	135276384	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr5	135276701	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=64.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,8,11
chr5	135277394	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=198,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	135283222	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=220,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,4:3,6:0,3,0,10
chr5	135283270	.	T	TA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=244,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.721:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr5	135391326	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:4,0,2,1
chr5	135392507	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,5:10,0:6,8,2,3
chr5	135396452	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=240,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.707:15:3,5:1,6:0|1:135396452_A_G:135396452:3,1,8,3
chr5	135396468	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=250,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=47.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,13:0.738:17:1,4:3,9:0|1:135396452_A_G:135396452:3,1,7,6
chr5	135396669	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=190,94;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:1,9:0,4:0,1,7,6
chr5	135398279	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,2:9,1:18,4,2,1
chr5	135496820	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.271:16:4,2:7,2:1,11,1,3
chr5	135498944	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=121,110;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.409:8:3,2:1,1:4,1,3,0
chr5	135508381	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=182,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,4:3,2:3,4,3,3
chr5	135510033	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=156,136;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:5,8:9,1:11,3,8,1
chr5	135513085	.	T	TC	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=70.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,8:0,10:0,0,11,7
chr5	135561133	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=218,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0,2,0,5
chr5	135692608	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=204,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:10,2:4,1:4,10,0,3
chr5	136315200	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=222,189;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr5	136328367	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=270,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,3:2,6:0,3,0,9
chr5	136476303	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=155,218;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:11,1:15,2:13,13,1,2
chr5	136969637	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,268;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:2,2:4,3:7,0,5,0
chr5	136975686	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=227,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:3,3:5,3:0|1:136975686_C_T:136975686:1,8,1,5
chr5	136975687	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=197,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:11,4:0.293:15:3,3:7,1:1|0:136975686_C_T:136975686:2,9,0,4
chr5	136993767	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:5,2:5,4,2,0
chr5	136997803	.	A	AAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,267;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=AG;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	137027953	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,10:0,8:0,0,12,6
chr5	137033906	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=188,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:6,0,3,0
chr5	137219163	.	A	C	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=209,284;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,16:0.315:52:12,16:22,0:22,14,16,0
chr5	137257288	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,1:0,4:0,0,6,0
chr5	137259251	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr5	137282031	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=22,32;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.261:14:4,0:4,2:1,10,0,3
chr5	137282045	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,23;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,3:5,0:0,8,1,3
chr5	137289941	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,0:7,3:7,9,0,3
chr5	137292133	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=163,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=18.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:0,5:2,2:2,0,6,1
chr5	137295823	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,18:0.633:28:4,6:6,12:3,7,10,8
chr5	137323117	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=185,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.670:10:0,3:3,4:3,0,6,1
chr5	137346646	.	TAA	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,0;MMQ=60,23;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.685:1:0,1:0,0:0|1:137346646_TAA_T:137346646:0,0,1,0
chr5	137346669	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,15;MFRL=125,0;MMQ=60,23;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:137346646_TAA_T:137346646:0,1,1,0
chr5	137347403	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,155;MMQ=60,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.618:6:1,1:1,2:2,0,4,0
chr5	137354851	.	CA	C,CAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27,24;MFRL=122,143,120;MMQ=60,60,60;MPOS=12,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.82,4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.335,0.445:6:0,0,1:1,1,2:0,1,0,5
chr5	137419725	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=207,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:4,3:3,3:0|1:137419725_A_G:137419725:8,0,5,1
chr5	137419728	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=157,210;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,6:0.437:14:5,2:1,4:1|0:137419725_A_G:137419725:7,1,6,0
chr5	137420376	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	137423652	.	A	AT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=22,23;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137423652_A_AT:137423652:0,1,0,1
chr5	137423654	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=13,28;MFRL=148,101;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:137423652_A_AT:137423652:0,1,0,1
chr5	137426447	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=193,209;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:6,3:6,4:5,7,4,3
chr5	137476416	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=84.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,12:0,13:0,0,11,14
chr5	137481546	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=153,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,0:7,2:9,3,0,2
chr5	137481558	.	T	TCTC	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,20;MFRL=165,36;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,0:8,2:0|1:137481558_T_TCTC:137481558:8,4,1,1
chr5	137481560	.	GA	CC	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=165,36;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:0|1:137481558_T_TCTC:137481558:8,4,1,1
chr5	137485292	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,3:0,0,12,2
chr5	137486651	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=223,139;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,0:4,4:4,4,0,4
chr5	137486684	.	A	AAAAATTTCATGACCTAAGTGGAGTAGGAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=142,139;MMQ=60,48;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.446:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	137498740	.	A	AGGAAGAAAGAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=29.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.898:7:0,1:0,4:0,0,7,0
chr5	137499926	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:8,0:3,6:7,4,0,6
chr5	137499976	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=106,104;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,4:8,0:5,10,4,0
chr5	137501415	.	CA	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=115,170;MMQ=40,40;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=18,17;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137501415_CA_C:137501415:1,0,1,0
chr5	137501433	.	AGC	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=15,30;MFRL=46590292,115;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.396:3:0,0:0,1:1|0:137501415_CA_C:137501415:1,1,1,0
chr5	137501436	.	AG	CC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=26,12;MFRL=46590265,170;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:137501415_CA_C:137501415:1,1,1,0
chr5	137501437	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=23,19;MFRL=46590292,115;MMQ=50,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.460:3:0,0:1,0:1|0:137501415_CA_C:137501415:1,1,1,0
chr5	137504227	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=135,66;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,5:7,0:7,11,4,1
chr5	137504839	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=164,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	137507104	.	TAAA	T,TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,28,26;MFRL=375,156,197;MMQ=60,60,60;MPOS=32,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.57,3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.300,0.352:6:0,1,1:1,1,1:0,2,1,3
chr5	137513369	.	G	GAA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,14;RU=A;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:0,1:0,1,2,1
chr5	137515331	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,5:5,0:10,2,5,0
chr5	137520901	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=252,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:0,10,0,4
chr5	137527917	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=228,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,4,1
chr5	137548809	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.322:17:3,3:6,2:6,6,4,1
chr5	137622388	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	137661434	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	137661764	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=85,0;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:10,0:0|1:137661764_C_A:137661764:6,13,1,1
chr5	137661767	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=85,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,2:9,0:0|1:137661764_C_A:137661764:6,13,1,1
chr5	137677579	.	TAC	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=108,61;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:15,0:8,4:8,17,2,2
chr5	137677592	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:0|1:137677592_C_A:137677592:4,12,0,2
chr5	137677594	.	A	ATGTGT	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,24;MFRL=136,61;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:7,0:6,2:0|1:137677592_C_A:137677592:4,12,0,2
chr5	137682312	.	C	CA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,188;MMQ=60,46;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:3,0:9,3:11,1,3,0
chr5	137715332	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=112,87;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.212:17:6,0:6,3:8,6,3,0
chr5	137728774	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=172,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr5	137735754	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,195;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:0,4,0,7
chr5	137760036	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=143,256;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:8,0:8,2:6,10,0,2
chr5	137762570	.	GAAAAAA	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,19;MFRL=0,301;MMQ=60,40;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=8,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:137762570_GAAAAAA_G:137762570:0,0,1,0
chr5	137762580	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,12;MFRL=0,301;MMQ=60,40;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:137762570_GAAAAAA_G:137762570:0,0,1,0
chr5	137763615	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,2:3,1:6,2,3,0
chr5	137765537	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=133,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,2:3,1:5,4,3,0
chr5	137780368	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:2,1,0,3
chr5	137801683	.	ACAG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=193,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=CAG;STR;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:4,1:6,1:5,5,0,2
chr5	137802404	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.636:20:2,7:5,6:5,2,10,3
chr5	137844274	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=185,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr5	137846155	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,4,0
chr5	137847078	.	TACACACACAC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=183,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,1;RU=AC;STR;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:0,2:1,0,6,0
chr5	137849422	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=199,108;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:0,15,0,2
chr5	137897174	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.288:12:6,2:2,1:8,1,3,0
chr5	137902297	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=143,58;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:7,2:5,0:8,4,2,0
chr5	137902868	.	GA	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=173,245;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.327:7:1,1:2,1:1,4,0,2
chr5	137903084	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=151,259;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:7,2,2,0
chr5	137909358	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=35,15;MFRL=232,141;MMQ=60,47;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:137909358_G_A:137909358:1,0,1,0
chr5	137909360	.	GC	CA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=232,141;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:137909358_G_A:137909358:1,0,1,0
chr5	137909365	.	TC	AA	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,30;MFRL=232,141;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:137909358_G_A:137909358:1,0,1,0
chr5	137909368	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=35,15;MFRL=88,141;MMQ=60,47;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:0,0:0|1:137909358_G_A:137909358:3,0,1,0
chr5	137909372	.	CTC	AAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,10;MFRL=88,141;MMQ=60,47;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,0:0|1:137909358_G_A:137909358:3,0,1,0
chr5	137909674	.	GAGA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=152,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGA;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,1:8,3:13,4,1,3
chr5	138160489	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:6,0:12,2:6,13,1,1
chr5	138208848	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,41989677;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:10,0:7,2:9,13,0,2
chr5	138264958	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=185,192;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,0:4,3:3,4,0,3
chr5	138463538	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=177,110;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,11:0.363:31:10,2:10,9:10,10,3,8
chr5	138643062	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=188,182;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,14:0.748:19:2,5:3,9:5,0,14,0
chr5	138714474	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	138715628	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=203,116;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:6,0:9,2:8,7,0,2
chr5	138718825	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=245,216;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.482:4:2,0:0,1:2,0,2,0
chr5	138718878	.	C	CA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	138724126	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=15.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	138727778	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=171,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,1:7,1:8,5,1,1
chr5	138728672	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=157,27767998;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:7,6,1,1
chr5	138739582	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=23,12;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.207:18:4,0:6,1:6,8,4,0
chr5	138739611	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=154,79;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.243:37:12,7:15,0:16,12,9,0
chr5	138749834	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=150,111;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,1:8,2:12,7,3,0
chr5	138775173	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,15:0.842:17:2,10:0,5:0,2,1,14
chr5	138857919	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=193,171;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.506:14:1,5:5,2:2,5,5,2
chr5	139189473	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	139193023	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,158;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.347:27:8,9:9,0:13,5,9,0
chr5	139202400	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=148,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:3,0:5,3:2,7,0,3
chr5	139213452	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr5	139215386	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=203,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:5,1:10,2:8,7,2,1
chr5	139216901	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr5	139217332	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,133;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:7,3:7,0:8,6,3,0
chr5	139227951	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	139239515	.	C	CG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=115,138;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.553:18:3,8:5,2:7,1,6,4
chr5	139245086	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=175,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:6,3:3,6:2,7,3,7
chr5	139251469	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=161,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,3:3,1:2,8,2,2
chr5	139260428	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=156,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.279:15:5,2:6,1:7,4,2,2
chr5	139422232	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=197,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:4,5,0,2
chr5	139494787	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=175,253;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.308:37:10,11:15,0:11,15,11,0
chr5	139494846	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=55;ECNT=2;MBQ=24,27,27,26;MFRL=110,108,82,153;MMQ=60,60,60,60;MPOS=22,19,10;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=A;STR;TLOD=12.04,13.01,5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:20,7,10,8:0.151,0.209,0.188:45:10,5,6,6:9,2,4,1:10,10,15,10
chr5	139494950	.	C	T	.	.	DP=66;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=124,128;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:57,4:0.079:61:29,0:28,4:15,42,0,4
chr5	139497988	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=144,245;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:15,5:24,0:18,21,5,0
chr5	139503941	.	TG	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=172,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,1:11,1:16,9,0,3
chr5	139508062	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:5,2:11,0:9,7,2,0
chr5	139574050	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=112,216;MMQ=60,60;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,1:9,2:7,10,2,1
chr5	139680085	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:12,0:7,2:10,9,1,1
chr5	139742130	.	GGT	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=115,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=GT;STR;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.466:28:5,7:9,6:7,8,7,6
chr5	139744067	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=189,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:10,0:16,2:9,17,0,2
chr5	139817996	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=114,266;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:7,1,2,0
chr5	139893108	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,13;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.691:4:0,0:0,1:0,1,0,3
chr5	139907552	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=151,209;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.194:34:10,6:17,0:14,14,6,0
chr5	139907750	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.498:6:2,1:0,1:3,0,2,1
chr5	139936980	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=210,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.785:15:0,6:2,6:2,1,7,5
chr5	139940036	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,4:0.119:40:19,0:17,4:17,19,0,4
chr5	139940887	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:2,1:5,1:5,2,2,0
chr5	139941318	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=73.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,23:0.632:36:7,12:6,11:3,10,10,13
chr5	140021858	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=154,167;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.676:19:3,9:2,4:4,2,8,5
chr5	140022436	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:4,2:2,4:4,2,5,2
chr5	140023238	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=98,125;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.691:27:3,10:5,9:4,4,6,13
chr5	140024491	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=174,261;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,5:4,0,4,2
chr5	140027216	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=184,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,3:2,8:0,3,2,9
chr5	140027629	.	GTA	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,35;MFRL=82,160;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.522:4:1,0:1,2:0|1:140027629_GTA_G:140027629:1,1,0,2
chr5	140027637	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=164,136;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:140027629_GTA_G:140027629:0,1,0,1
chr5	140027641	.	GT	AC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=274,136;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:140027629_GTA_G:140027629:0,2,0,1
chr5	140027648	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=274,136;MMQ=60,40;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:140027629_GTA_G:140027629:0,2,0,1
chr5	140037272	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.663:13:3,4:1,4:2,2,1,8
chr5	140038484	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,172;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:9,0:12,4:10,11,0,4
chr5	140039315	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=131,120;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,11:0.307:37:7,11:19,0:18,8,11,0
chr5	140039864	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=265,180;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,0:5,3:0,9,0,5
chr5	140039877	.	CTTTTTTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=292,265;MMQ=40,40;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=22,14;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.334:4:0,0:2,0:0,3,0,1
chr5	140050940	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=140,150;MMQ=50,25;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:13,2:12,5:14,11,7,0
chr5	140051983	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:4,3:8,1,4,1
chr5	140052271	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=212,224;MMQ=60,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr5	140054257	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=145,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=45.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.643:26:4,7:5,10:7,2,8,9
chr5	140054485	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=156,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,4:2,4:3,4,4,4
chr5	140073870	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.408:32:9,0:10,12:9,10,0,13
chr5	140075011	.	C	CAGTTGATAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	140077699	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,122;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,3,13
chr5	140081791	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=184,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,2:0,5:0,2,1,6
chr5	140180737	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,25;MFRL=141,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,0:3,3:3,1,3,0
chr5	140181306	.	CTGAA	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,4:4,1:5,2,2,3
chr5	140201264	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=213,254;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:9,0,3,0
chr5	140207710	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=169,30944;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,4:0.192:24:11,0:8,4:0|1:140207710_C_T:140207710:10,10,4,0
chr5	140207723	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=165,30944;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:11,0:6,4:0|1:140207710_C_T:140207710:9,10,4,0
chr5	140208161	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=188,110;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.131:28:9,0:16,3:12,13,0,3
chr5	140221046	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=183,177;MMQ=40,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:11,0:5,2:7,9,0,2
chr5	140228410	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=174,185;MMQ=50,35;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:8,3:1,2:0|1:140228410_A_G:140228410:4,5,0,6
chr5	140228413	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=174,185;MMQ=50,35;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:8,3:1,2:0|1:140228410_A_G:140228410:4,5,0,6
chr5	140229086	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=125,197;MMQ=52,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.827:15:0,7:2,6:1,1,9,4
chr5	140230370	.	AA	CC	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=159,154;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=123.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,28:0.936:29:1,14:0,14:1,0,14,14
chr5	140232218	.	T	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=189,191;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:11,0:14,4:16,9,0,4
chr5	140232558	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=196,177;MMQ=52,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:140232558_T_G:140232558:0,4,0,1
chr5	140232562	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=181,177;MMQ=44,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140232558_T_G:140232558:0,3,0,1
chr5	140232564	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=181,177;MMQ=44,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140232558_T_G:140232558:0,3,0,1
chr5	140232567	.	CA	GG	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=181,177;MMQ=44,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:140232558_T_G:140232558:0,3,0,1
chr5	140232692	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=233,172;MMQ=51,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr5	140237158	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=156,201;MMQ=48,49;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,2:11,2:5,12,0,4
chr5	140307518	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=205,125;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:6,0:10,5:6,10,0,5
chr5	140516042	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=192,122;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:6,5,1,1
chr5	140531097	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=159,112;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,2:12,0:10,9,1,1
chr5	140532284	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.219:30:11,0:12,6:12,12,0,6
chr5	140532409	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=258,145;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,6:2,4:3,4,4,6
chr5	140554713	.	A	G	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=167,1160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,8:0.158:55:16,8:31,0:24,23,0,8
chr5	140557658	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=174,186;MMQ=39,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:7,2:5,0:0,12,0,2
chr5	140559914	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=144,190;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,2:4,5:4,4,2,5
chr5	140564982	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,36;MFRL=242,0;MMQ=60,42;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=13,10;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.404:3:0,0:1,1:0,2,0,1
chr5	140565046	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=181,256;MMQ=57,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr5	140565083	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,262;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	140568034	.	C	CA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=65.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,11:0,7:0,0,9,9
chr5	140573844	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=227,209;MMQ=28,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,4:5,3:1,7,0,7
chr5	140573922	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,30;MFRL=273,240;MMQ=20,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,0,3
chr5	140574209	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=212,307;MMQ=40,46;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:3,2,1,1
chr5	140580660	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=142,70;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:11,0:6,2:10,8,1,1
chr5	140581090	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=220,252;MMQ=24,40;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:140581090_G_C:140581090:0,4,0,1
chr5	140581094	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=235,252;MMQ=23,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:140581090_G_C:140581090:0,2,0,1
chr5	140581102	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=239,252;MMQ=25,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:140581090_G_C:140581090:0,2,0,1
chr5	140591702	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=218,137;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:4,6:2,4:3,3,2,8
chr5	140598554	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=217,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,2:5,2:3,4,3,1
chr5	140627276	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=209,195;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:7,1,3,0
chr5	140683619	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=317,252;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140683619_GC_G:140683619:0,1,0,1
chr5	140683622	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=317,252;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:140683619_GC_G:140683619:0,1,0,1
chr5	140699840	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=227,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:5,4:7,5:6,6,5,4
chr5	140712299	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=185,177;MMQ=40,24;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.218:21:8,2:7,2:6,11,1,3
chr5	140732313	.	TAACCAGGC	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,108;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:2,0:0,8,0,2
chr5	140740558	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=176,271;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:11,1:2,1:3,10,1,1
chr5	140744566	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=178,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,1:8,1:10,1,2,0
chr5	140755537	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=188,168;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:8,8,1,1
chr5	140767491	.	CTGCCAG	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=37,34;MFRL=147,153;MMQ=27,34;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	140783087	.	A	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=184,190;MMQ=52,24;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,8:0.289:29:9,0:12,8:13,8,0,8
chr5	140785038	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=19,35;MFRL=198,186;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:140785038_A_G:140785038:0,2,0,1
chr5	140785049	.	TG	CA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=198,186;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:140785038_A_G:140785038:0,1,0,1
chr5	140785062	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:140785038_A_G:140785038:0,0,0,1
chr5	140794792	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=205,131;MMQ=52,51;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.412:20:3,3:8,5:4,8,4,4
chr5	140803325	.	G	GCCAAAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:140803325_G_GCCAAAAT:140803325:1,0,0,1
chr5	140803326	.	G	GACCGA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=121,95;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:140803325_G_GCCAAAAT:140803325:1,0,0,1
chr5	140812775	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.275:9:1,1:3,1:2,5,0,2
chr5	140866847	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=153,185;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:7,0:9,3:0|1:140866847_G_C:140866847:6,10,0,3
chr5	140866853	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=153,185;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:7,0:8,3:0|1:140866847_G_C:140866847:6,10,0,3
chr5	140870949	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=202,206;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,1:3,5:2,3,3,3
chr5	140870968	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=202,83;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:4,2:4,5,1,1
chr5	140898522	.	TCTC	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=149,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTC;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,1:15,1:17,21,2,0
chr5	140907266	.	TAAAAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=15,10;MFRL=151,190;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=23,18;RU=A;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.352:6:0,0:0,0:0,4,0,2
chr5	140955777	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.480:29:6,7:9,6:11,4,10,4
chr5	141016276	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=82.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,22:0.959:22:0,9:0,12:0|1:141016276_T_C:141016276:0,0,12,10
chr5	141016288	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:5,2:9,5:0|1:141016276_T_C:141016276:5,9,5,2
chr5	141023723	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=204,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:2,1:0|1:141023723_T_C:141023723:7,1,2,0
chr5	141023733	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=198,104;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.283:12:7,2:2,1:0|1:141023723_T_C:141023723:7,2,2,1
chr5	141023997	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=185,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,2:5,1:2,9,1,2
chr5	141024136	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.597:15:3,6:2,3:3,3,6,3
chr5	141025581	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=234,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.336:13:2,2:6,2:8,1,4,0
chr5	141026094	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=214,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:3,0,4,1
chr5	141026884	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=241,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:5,4:7,1:6,6,3,2
chr5	141027462	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=206,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,1:5,1:7,0,2,0
chr5	141035374	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:7,1:4,3:5,6,3,1
chr5	141035746	.	G	GGATTCTA	.	.	DP=46;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=136,47;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.066:43:21,2:18,0:0|1:141035746_G_GGATTCTA:141035746:19,22,1,1
chr5	141035750	.	A	ATGTATGCTTTTG	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=137,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:22,2:19,0:0|1:141035746_G_GGATTCTA:141035746:21,22,1,1
chr5	141041435	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=280,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,4:1,5:0,3,2,7
chr5	141044472	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=89,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.330:28:7,3:10,5:7,12,2,7
chr5	141049407	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=200,123;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,8:2,6:1,5,7,7
chr5	141052426	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=104,427;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.394:3:1,1:1,0:0|1:141052426_G_T:141052426:2,0,1,0
chr5	141052428	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=104,427;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.404:3:1,1:0,0:0|1:141052426_G_T:141052426:2,0,1,0
chr5	141052430	.	G	GACCTGGAACTTGTTGTCCTT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=34,36;MFRL=95,427;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:141052426_G_T:141052426:1,0,1,0
chr5	141052870	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr5	141053166	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,12;MFRL=189,258;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:0,0:6,0:0|1:141053166_A_C:141053166:4,4,2,0
chr5	141053170	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,22;MFRL=189,258;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.245:10:2,0:4,1:0|1:141053166_A_C:141053166:4,4,2,0
chr5	141234058	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:141234058_G_T:141234058:0,0,0,1
chr5	141234062	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,15;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:141234058_G_T:141234058:0,0,0,1
chr5	141234070	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,17;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:141234058_G_T:141234058:0,0,0,1
chr5	141234077	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,19;MFRL=0,129;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:141234058_G_T:141234058:0,0,0,1
chr5	141303633	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=199,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,4:0,0:0,2,0,4
chr5	141304318	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=169,204;MMQ=60,40;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:141304318_T_TA:141304318:0,4,0,1
chr5	141304329	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=169,204;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:4,1:0|1:141304318_T_TA:141304318:0,4,0,1
chr5	141316946	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=190,160;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,0:5,2:0,7,0,2
chr5	141334921	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,268;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,1:7,1:4,10,0,2
chr5	141335241	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.738:17:2,8:2,5:1,3,6,7
chr5	141353069	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=163,247;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:10,1,2,0
chr5	141364511	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=164,128;MMQ=39,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.333:34:5,2:18,9:2,21,5,6
chr5	141364532	.	C	CT	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=35,34;MFRL=168,164;MMQ=60,39;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:5,0:10,14:3,12,0,14
chr5	141367202	.	GA	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=42.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr5	141382584	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:2,0,6,0
chr5	141387336	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:6,1:7,5:10,3,3,3
chr5	141511525	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=133,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.291:18:6,3:6,2:2,11,0,5
chr5	141975067	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=236,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:1,3:3,7:2,2,3,7
chr5	141993487	.	C	CA	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=186,140;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:11,0:14,5,3,0
chr5	141993498	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=209,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=31.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:3,6:4,6:4,3,10,3
chr5	142258993	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=155,164;MMQ=60,59;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:9,0:12,4:10,11,0,4
chr5	142259083	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:0,9,0,2
chr5	142288318	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=169,156;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,3:6,0:6,2,3,0
chr5	142288527	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=172,119;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.270:20:10,4:5,1:0,15,1,4
chr5	142393562	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=140,204;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.521:17:5,5:3,3:7,1,6,3
chr5	142416741	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=67.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,12:0,7:0,0,13,6
chr5	142421296	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=194,149;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,3:5,0:7,4,3,0
chr5	142421317	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,17;MFRL=172,310;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.186:19:9,1:6,0:9,7,3,0
chr5	142513686	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=275,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,7:1,3:0,1,4,7
chr5	142545657	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=202,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:7,2:5,7,0,2
chr5	142601978	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=167,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:17,0:11,2:13,15,0,2
chr5	142689824	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=241,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,0,5
chr5	142779552	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=138,315;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.334:43:13,1:16,13:13,16,0,14
chr5	143543648	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=186,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:7,2:9,5:8,8,7,0
chr5	145144419	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=167,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:4,1,3,0
chr5	145197411	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=183,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:1,0,6,0
chr5	145199430	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,7,3
chr5	145199680	.	TTTTTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=213,194;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	145199681	.	TTTTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.832:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	145252574	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=28.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:3,7:0,2:0,3,2,7
chr5	145393518	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=141,108;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:12,0:5,3:8,9,1,2
chr5	145427527	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	145483679	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:2,0,5,0
chr5	145483713	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=190,212;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:1,1:2,2:1,2,4,0
chr5	145500055	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,92;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:3,8,0,2
chr5	145508174	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:5,12:4,0:7,2,12,0
chr5	145508457	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=220,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,2:4,2:0|1:145508457_T_C:145508457:3,2,4,0
chr5	145508471	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=220,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,2:4,1:0|1:145508457_T_C:145508457:3,2,4,0
chr5	145508688	.	AAAAAAG	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=208,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:1,2:1,4,0,2
chr5	145509573	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:5,5:7,3:6,7,4,4
chr5	145512390	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=269,0;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:3,1:8,0,2,0
chr5	145515346	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=157,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:1,1,0,3
chr5	145522674	.	T	TTATATA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,10;RU=TA;STR;TLOD=15.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.496:8:3,3:1,0:0,4,0,4
chr5	145522912	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	145531486	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:6,0:11,3:10,7,0,3
chr5	145532859	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,3:1,0:0|1:145532859_T_C:145532859:0,2,0,4
chr5	145532876	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=200,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:0|1:145532859_T_C:145532859:0,2,0,3
chr5	145533418	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=113,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:2,5,6,3
chr5	145538924	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,6:5,2:5,3,7,1
chr5	145539123	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=203,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr5	145547893	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=175,113;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr5	145562143	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:0,7,1,6
chr5	145640215	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=147,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr5	145640338	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=146,58;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:4,0:8,3:7,5,0,3
chr5	145643048	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=185,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,1:1,3:3,3,2,2
chr5	145647151	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:4,0:3,2:5,2,2,0
chr5	145647187	.	CTT	C,CT	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,34,33;MFRL=146,163,149;MMQ=60,60,60;MPOS=22,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.20,9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,6:0.143,0.327:18:5,0,4:3,2,2:6,4,7,1
chr5	145650963	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=127,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.431:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr5	145827085	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=158,198;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0,11,0,2
chr5	145834529	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=187,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:5,1,3,0
chr5	145838440	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=211,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:1,9:1,8:1,1,10,7
chr5	145850328	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=171,234;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:4,6,0,2
chr5	145851163	.	ATT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=107,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.243:14:7,2:4,1:3,8,0,3
chr5	145859763	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=166,226;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:0,7,0,3
chr5	145872381	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=197,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:8,0,2,0
chr5	145878290	.	G	GTATA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=155,235;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:6,0:0|1:145878290_G_GTATA:145878290:3,12,0,2
chr5	145878294	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=155,235;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:9,2:6,0:0|1:145878290_G_GTATA:145878290:3,12,0,2
chr5	145878296	.	G	GTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=155,235;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:8,2:5,0:0|1:145878290_G_GTATA:145878290:3,12,0,2
chr5	146030055	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,9,1
chr5	146657584	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=202,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,3:2,1:4,0,4,0
chr5	146657838	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=205,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,2:5,2:0,7,0,4
chr5	146722479	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,115;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,0:4,3:7,2,3,0
chr5	146728149	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=197,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,4,2
chr5	146773737	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,17;MFRL=202,225;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.320:7:2,0:1,0:1,4,0,2
chr5	147258535	.	A	T,ATT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32,16;MFRL=187,196,196;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.37,3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,1:0.286,0.357:3:1,0,0:0,1,0:0,1,0,2
chr5	147276579	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=133,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:11,1:5,1:7,9,0,2
chr5	147281308	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=96,230;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,4:0.113:42:14,4:23,0:13,25,2,2
chr5	147281313	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=30,24;MFRL=154,96;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=25.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,13:0.341:39:16,0:9,13:14,12,0,13
chr5	147285899	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=149,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,5:1,1:5,0,5,1
chr5	147444785	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,3,0
chr5	147444989	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:5,2:0,2:2,3,1,3
chr5	147449855	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=115,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.313:30:11,4:10,5:9,12,6,3
chr5	147450085	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=184,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr5	147468234	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=161,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:3,5:5,9:0,8,3,11
chr5	147468971	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr5	147475488	.	A	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=82,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:9,9:9,9:12,6,9,9
chr5	147475513	.	G	GT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=158,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.580:22:5,4:4,9:3,6,3,10
chr5	147477351	.	T	TTTTAA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=170,179;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:0,2:3,6:3,0,10,0
chr5	147478785	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=120,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,22:0.767:28:1,8:5,14:2,4,13,9
chr5	147478981	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=86,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,2:1,4:0,2,0,6
chr5	147479991	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=129,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:5,2:2,7:4,3,8,1
chr5	147480007	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=150,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=39.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.620:19:6,4:1,8:4,3,10,2
chr5	147480027	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:6,4:3,7:6,3,7,4
chr5	147480868	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=133,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:4,1,5,1
chr5	147480955	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=143,156;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:3,2:3,7:4,2,8,1
chr5	147481018	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=110,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.572:26:5,5:6,10:6,5,4,11
chr5	147484465	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=109,182;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,4:1,11:1,0,13,2
chr5	147486774	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,0,5
chr5	147486818	.	CGT	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr5	147491532	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=216,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:147491532_T_C:147491532:0,3,0,3
chr5	147491543	.	C	CTAGTGTTTAG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,34;MFRL=229,128;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:0,0:4,1:1|0:147491532_T_C:147491532:0,4,0,1
chr5	147493831	.	C	CT,CTT	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,31,35;MFRL=0,209,191;MMQ=60,60,40;MPOS=11,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=1,2,3;RU=T;STR;TLOD=3.79,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.400,0.400:2:0,0,1:0,1,0:0,0,2,0
chr5	147493833	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:147493833_C_T:147493833:0,0,2,0
chr5	147493846	.	C	A,T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=0,17,15;MFRL=0,157,191;MMQ=60,60,40;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.29,3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.500,0.333:3:0,0,0:0,0,0:0,0,3,0
chr5	147493848	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=26,15;MFRL=157,191;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:147493833_C_T:147493833:2,0,1,0
chr5	147493856	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=29,15;MFRL=142,191;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:147493833_C_T:147493833:3,0,1,0
chr5	147493863	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=8;MBQ=32,13;MFRL=142,191;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:147493833_C_T:147493833:3,0,1,0
chr5	147493865	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=28,12;MFRL=142,191;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,0:2,0:0|1:147493833_C_T:147493833:3,0,1,0
chr5	147493871	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=142,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,2:1,1:0|1:147493833_C_T:147493833:1,0,4,0
chr5	147497932	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=143,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr5	147498496	.	ATCCAGGGTCAATATTTGTTAACAAGATGAATATTCACTTTTTTCTCC	A	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=140,132;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:3,0:4,2:13,4,1,1
chr5	147498523	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=25,30;MFRL=130,213;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:4,1,2,2
chr5	147498652	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=87,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:6,2:5,5:3,9,2,5
chr5	147498669	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0|1:147498669_G_A:147498669:2,3,0,2
chr5	147498672	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=22,27;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,1:3,1:0|1:147498669_G_A:147498669:2,3,0,2
chr5	147499874	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=141,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.309:11:5,2:3,1:7,1,3,0
chr5	147504305	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=17.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,0:0|1:147504305_C_CT:147504305:5,0,5,0
chr5	147504315	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=133,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0|1:147504305_C_CT:147504305:5,0,5,0
chr5	147505227	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=170,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.694:21:3,8:3,6:5,1,8,7
chr5	147510776	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=165,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:5,1:0,6:4,1,6,1
chr5	147510866	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:4,2:1,7:2,3,3,6
chr5	147549416	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=151,143;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:8,0:4,8:2,10,0,9
chr5	147554997	.	TTTTTTCC	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,6:0,8:0,0,6,8
chr5	147555029	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr5	147693826	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=143,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:1,1:6,5:2,5,1,5
chr5	147695283	.	C	CTCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=237,218;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=TCA;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.495:6:2,1:1,2:1,2,0,3
chr5	147781732	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,212;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:6,3:7,5:1,12,4,5
chr5	147788798	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=162,113;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:9,4:7,6:8,8,3,7
chr5	147795677	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,10;MFRL=195,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.170:16:2,0:7,0:2,12,0,2
chr5	147803557	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=96,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr5	147812901	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=161,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr5	147819366	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,0:8,3:6,8,0,3
chr5	147821469	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=203,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	147856232	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=85,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,4:3,3:2,2,7,0
chr5	147856257	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=141,54;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.408:12:4,3:3,1:4,3,4,1
chr5	147856392	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=163,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:3,1:9,4:2,10,0,5
chr5	148206348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	148206375	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,10,0
chr5	148207447	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:8,8:2,7:4,6,8,7
chr5	148207633	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=140,168;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:6,3:3,11:3,7,6,8
chr5	148207667	.	C	CCG	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=120,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.643:20:5,6:2,6:0,7,0,13
chr5	148389763	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=164,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:3,2:10,2:13,0,4,0
chr5	148406386	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=215,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:2,4,2,3
chr5	148408055	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=163,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,5:8,4:8,8,2,7
chr5	148521799	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,6:0,0,0,10
chr5	148562981	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,112;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:10,5:8,5:15,3,7,3
chr5	148580025	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=146,174;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=30.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.856:12:0,6:1,4:0,1,2,9
chr5	148590423	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=183,135;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,4:2,2:2,4,1,5
chr5	148596693	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=172,91;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.393:8:3,0:2,3:0,5,1,2
chr5	148618708	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=173,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:2,2:4,2:5,1,4,0
chr5	148618749	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:8,4:13,3:0|1:148618749_C_T:148618749:14,8,6,1
chr5	148618752	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=155,192;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,7:0.258:29:8,4:14,3:0|1:148618749_C_T:148618749:14,8,6,1
chr5	148618964	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=210,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,4:1,1:0,5,0,5
chr5	148620224	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=173,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.394:21:4,2:8,6:10,3,6,2
chr5	148625972	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,0:2,4:3,1,3,1
chr5	148627252	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=218,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr5	148627503	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=308,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.632:9:3,2:0,3:1,2,2,4
chr5	148678994	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=205,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:6,0,3,0
chr5	148679301	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr5	148682188	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=330,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,1:1,5:0,1,0,6
chr5	148689735	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=199,167;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,0:6,4:1,7,0,4
chr5	148729348	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=166,101;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,0:8,2:5,7,1,1
chr5	148737811	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	148758642	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=195,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=26.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:4,12:3,0:7,0,12,0
chr5	148758695	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=160,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:9,1:13,1:16,6,1,1
chr5	148977613	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,4:3,3:0,7,0,7
chr5	148989312	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=24,31;MFRL=236,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:0|1:148989312_A_G:148989312:0,1,0,5
chr5	148989320	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=236,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:1,2:0,1:0|1:148989312_A_G:148989312:0,1,0,4
chr5	148997686	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=74.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,9:0,15:0,0,14,10
chr5	148999881	.	G	GC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=224,165;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=26.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:1,3:2,5:3,0,6,2
chr5	149000039	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=232,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,9:1,7:1,3,7,9
chr5	149001283	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=152,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:1,3:8,7:3,6,8,2
chr5	149006837	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=188,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,7:1,6:0,3,1,12
chr5	149006879	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr5	149112300	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=181,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:8,4:3,4:7,4,5,3
chr5	149214167	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=197,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr5	149214377	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=233,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.627:14:4,8:1,1:1,4,0,9
chr5	149221788	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=139,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr5	149221885	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=149,73;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,0:13,3:11,13,1,2
chr5	149221992	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=200,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,2:2,1:1,6,0,3
chr5	149240571	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.410:15:3,5:6,1:2,7,0,6
chr5	149247828	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=184,127;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr5	149294643	.	G	GACGGTCTCAATCTCTTGAC	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=272,102;MMQ=60,51;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149294643_G_GACGGTCTCAATCTCTTGAC:149294643:0,2,0,1
chr5	149294646	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=272,102;MMQ=60,51;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:149294643_G_GACGGTCTCAATCTCTTGAC:149294643:0,2,0,1
chr5	149294668	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=360,183;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149294668_G_A:149294668:0,1,0,1
chr5	149294669	.	C	CTTTATT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=360,183;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:149294668_G_A:149294668:0,1,0,1
chr5	149361257	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,259;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:7,4,2,0
chr5	149374879	.	CT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=36.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.464:26:8,4:6,8:10,4,3,9
chr5	149424966	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr5	149427387	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	149431223	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr5	149431259	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=230,296;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr5	149435608	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,93;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:7,1:5,5:2,10,2,4
chr5	149437190	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=189,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,4:2,4:0,2,1,7
chr5	149441000	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.854:5:0,1:0,2:0,0,5,0
chr5	149441005	.	CAG	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,22;MFRL=320,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:2,0:0,1:3,0,2,0
chr5	149441008	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=320,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.448:5:1,0:0,2:3,0,2,0
chr5	149441011	.	CTA	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=0,10;MFRL=128,171;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,0:0,0:1,0,2,0
chr5	149441041	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=23,16;MFRL=81,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.277:8:1,0:5,0:2,4,2,0
chr5	149449790	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=153,189;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,6:5,0:5,6,6,0
chr5	149449815	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.341:18:5,5:7,0:5,7,6,0
chr5	149452793	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=255,224;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr5	149456771	.	CT	AA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=174,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	149456811	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=118,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:5,2:4,4:5,4,3,3
chr5	149497177	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=195,73;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:5,1:5,9:4,6,5,5
chr5	149503932	.	AATGGGGGCCCCAGGCCAGGCCCAGTCATGGAGGCTCC	A	.	.	DP=36;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=147,51;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:13,2:13,0:0|1:149503932_AATGGGGGCCCCAGGCCAGGCCCAGTCATGGAGGCTCC_A:149503932:11,21,1,1
chr5	149503937	.	GGGCCCCAGGCCAGGCCCAGTCATGGAGGCTCCATGGA	G	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:28,2:0.097:30:11,0:11,2:1|0:149503932_AATGGGGGCCCCAGGCCAGGCCCAGTCATGGAGGCTCC_A:149503932:7,21,1,1
chr5	149509270	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	149511636	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,154;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:8,7:8,3:10,6,3,7
chr5	149513626	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=277,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,2:4,0:0,5,0,2
chr5	149515074	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	149516480	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr5	149546426	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=192,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.522:8:1,4:1,0:4,0,1,3
chr5	149576233	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=325,206;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,4,1
chr5	149576273	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=250,229;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,2,5
chr5	149578999	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr5	149580819	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=304,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:1,5:0,4:0,1,4,5
chr5	149582103	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=257,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,5:0,9:0,1,7,7
chr5	149582132	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=181,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,0:8,2:9,8,1,1
chr5	149583300	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,104;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,7:0,21:0|1:149583300_T_C:149583300:0,0,18,11
chr5	149583336	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,107;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=117.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,29:0.968:29:0,5:0,23:0|1:149583300_T_C:149583300:0,0,12,17
chr5	149584197	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=158,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:7,2:6,2:4,9,2,2
chr5	149584341	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,7,2
chr5	149584969	.	A	AG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=18.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr5	149584981	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=262,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:1,1,3,1
chr5	149602363	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=224,275;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:1,4,2,0
chr5	149602824	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=255,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:0,1:0,3,1,2
chr5	149624901	.	GCCT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=207,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=CCT;STR;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0,4,0,2
chr5	149627423	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,35;MFRL=114,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:1,2,4,0
chr5	149629683	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=227,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr5	149631413	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=158,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=59.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:4,12:1,6:3,3,9,9
chr5	149632955	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=154,134;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:3,1:7,2:7,3,3,0
chr5	149636073	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,36;MFRL=240,255;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,2:4,1:6,0,2,1
chr5	149636109	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=277,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,4,2
chr5	149737221	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,9,0
chr5	149755462	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=178,366;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:11,0:9,4:6,14,4,0
chr5	149755937	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=158,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:14,2,1,1
chr5	149775921	.	C	CATTATCACAACGAAGAAACTTTTTTTTTTT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=148,268;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:10,0:10,0:9,11,0,2
chr5	149784616	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=172,87;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.237:23:12,5:5,0:10,8,4,1
chr5	149784745	.	T	TGGAGCAGGTGCATC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=151,1509;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:5,0:8,2:0|1:149784745_T_TGGAGCAGGTGCATC:149784745:3,11,2,0
chr5	149784749	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=152,1509;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:4,0:9,2:0|1:149784745_T_TGGAGCAGGTGCATC:149784745:3,10,2,0
chr5	149823785	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr5	149827098	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:8,2:13,1:11,10,3,0
chr5	149901373	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=14,34;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.637:3:0,1:0,1:0,1,0,2
chr5	149914401	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.573:7:0,3:2,1:1,2,2,2
chr5	149921251	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=141,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.698:18:2,6:3,6:1,4,5,8
chr5	149931222	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=155,256;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr5	150029415	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:3,5,1,1
chr5	150049990	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=182,163;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr5	150051078	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.180:21:7,2:10,1:13,5,3,0
chr5	150051958	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,14:0,8:0,0,14,8
chr5	150056219	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=208,153;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:9,0,0,2
chr5	150072693	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=172,172;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:3,3:0,3:3,1,5,1
chr5	150076546	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=245,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	150111501	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.251:10:0,0:7,2:3,5,1,1
chr5	150113130	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=214,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,2:4,0:0,4,0,2
chr5	150135900	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=202,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,0:6,2:10,0,2,0
chr5	150138634	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=174,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:3,4:0,9,0,6
chr5	150174892	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=161,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,1,1
chr5	150227615	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=172,186;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:5,2:3,0:9,0,2,0
chr5	150407456	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=125,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:3,4:9,3:4,8,5,2
chr5	150407705	.	CAT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,130;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:1,12,0,2
chr5	150413406	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,33;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:4,2:2,4:1,5,1,5
chr5	150415338	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,210;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr5	150422003	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	150439895	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=176,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:11,5,0,2
chr5	150441822	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=168,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,1:5,1:1,13,0,2
chr5	150483147	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=150,167;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,3:11,0:14,10,3,0
chr5	150484787	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=112,230;MMQ=60,60;MPOS=28;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:13,1:11,2:13,11,2,1
chr5	150484889	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=175,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,2:11,2:7,14,2,2
chr5	150506086	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=155,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,1:5,3:3,5,2,3
chr5	150506104	.	AACACACACAC	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=149,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=14,9;RU=AC;STR;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.388:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr5	150515892	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=174,117;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,1:9,1:8,12,2,0
chr5	150516702	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,1:2,0,2,0
chr5	150518358	.	AG	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=45,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,2:4,7:3,3,6,3
chr5	150518435	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=204,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:0,7,0,5
chr5	150518892	.	GC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=15.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:5,2:5,4:8,3,4,2
chr5	150564973	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:4,2:13,1:8,9,0,3
chr5	150564975	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=207,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=50.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:2,4:3,11:1,4,7,8
chr5	150565008	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=300,149;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:1,4:1,10:0,2,9,5
chr5	150565724	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=165,202;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,4:0,8:1,2,2,10
chr5	150565770	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.825:9:0,5:1,3:0,1,0,8
chr5	150567049	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=38.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr5	150567074	.	T	TG	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=233,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr5	150632676	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=209,192;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:6,2:7,1:14,0,3,0
chr5	150639224	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,1:0,0,3,0
chr5	150646888	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,337;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:12,3:9,0:9,12,2,1
chr5	150660769	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=217,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0|1:150660769_A_G:150660769:3,2,1,4
chr5	150660794	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,22;MFRL=174,135;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:2,3:3,1:0|1:150660769_A_G:150660769:2,3,1,3
chr5	150663565	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:4,2,2,0
chr5	150682975	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=152,129;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr5	150683005	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=152,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,2:0,5,0,2
chr5	150696301	.	C	CAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=208,175;MMQ=40,50;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=23,25;RU=A;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.603:3:1,2:0,0:0|1:150696301_C_CAA:150696301:1,0,2,0
chr5	150696325	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=22,21;MFRL=192,149;MMQ=50,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,1:1,0:0|1:150696301_C_CAA:150696301:2,0,1,0
chr5	150696333	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=20,15;MFRL=179,149;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:150696333_T_A:150696333:4,0,1,0
chr5	150696344	.	GTC	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,16;MFRL=182,149;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.257:6:0,0:3,0:0|1:150696333_T_A:150696333:5,0,1,0
chr5	150712821	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.213:20:11,0:5,3:8,8,4,0
chr5	150726870	.	GTCT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=189,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCT;STR;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,3:5,2:4,3,2,3
chr5	150838284	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=230,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:2,5:1,3:0|1:150838284_C_G:150838284:3,0,8,0
chr5	150838293	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:150838284_C_G:150838284:0,0,11,0
chr5	150843996	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr5	150846663	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=169,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:9,1,2,0
chr5	150846706	.	AGCATT	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=130,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GCATT;STR;TLOD=36.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:10,3:4,7:14,2,8,2
chr5	150846865	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,18;MFRL=142,126;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.444:9:1,0:3,2:2,3,0,4
chr5	150846882	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=0,168;MMQ=58,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr5	150846935	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=168,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,2:0,1:0,3,0,3
chr5	150847505	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.501:18:2,3:7,6:0|1:150847505_T_C:150847505:3,6,2,7
chr5	150847509	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,34;MFRL=125,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.501:18:2,3:6,6:0|1:150847505_T_C:150847505:3,6,2,7
chr5	150847554	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=156,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:0,4,0,4
chr5	150847581	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,21;MFRL=0,294;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,0,2
chr5	150853193	.	CTTTTGCTTTG	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=177,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTGCTTTG;STR;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.706:8:1,4:0,2:0,2,4,2
chr5	150853412	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=186,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr5	150856107	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=135,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=44.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.578:24:4,8:6,6:7,3,8,6
chr5	150859151	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=147,285;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0,5,0,3
chr5	150885489	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.298:24:7,6:10,0:9,8,6,1
chr5	150886616	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=339,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr5	150886882	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:8,8:5,6:7,6,9,5
chr5	150889805	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=165,191;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr5	150891663	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=198,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,3:1,9:3,0,9,3
chr5	150901613	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=296,170;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:0,4:3,7:2,1,8,3
chr5	150905485	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=6;MBQ=34,28;MFRL=195,155;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,15:0.432:35:10,6:10,9:0|1:150905485_C_T:150905485:9,11,6,9
chr5	150905509	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=157,61;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:12,2:0|1:150905485_C_T:150905485:12,14,1,1
chr5	150905515	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=34,20;MFRL=155,61;MMQ=60,55;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:13,0:14,2:0|1:150905485_C_T:150905485:14,15,1,1
chr5	150905517	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=155,61;MMQ=60,55;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:14,0:14,2:0|1:150905485_C_T:150905485:14,15,1,1
chr5	150905519	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=153,61;MMQ=60,55;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:14,0:11,2:0|1:150905485_C_T:150905485:15,15,1,1
chr5	150905521	.	G	GACGGAAATCTGTGATGTCGTT	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=32,20;MFRL=156,61;MMQ=60,55;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:15,0:12,2:0|1:150905485_C_T:150905485:15,13,1,1
chr5	150906721	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=209,63;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:9,0,2,0
chr5	150908812	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=143,296;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:7,1:9,3:8,8,3,1
chr5	150917545	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr5	150921805	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=190,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:6,0,5,0
chr5	150923528	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=203,204;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,2:4,1:11,5,2,1
chr5	150924410	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=157,143;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,0:10,4:8,13,0,4
chr5	150925144	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=0,20;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.958:21:0,10:0,11:0,0,14,7
chr5	150925155	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=112,47;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:8,8,1,1
chr5	150925170	.	C	CAATTTATTTGGCTGCTATTTTTCTT	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=114,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:9,9,1,1
chr5	150943085	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=195,135;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.589:25:4,7:6,7:6,4,6,9
chr5	150946436	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,5:3,2:2,1,2,5
chr5	150948537	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr5	151043573	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=162,233;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:9,0,1,1
chr5	151049404	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=199,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:1,3,0,5
chr5	151052659	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=196,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.550:18:5,4:3,6:4,4,4,6
chr5	151170713	.	T	TATAAATTTATTA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=190,155;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:8,2:3,1:0,11,0,3
chr5	151180469	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=213,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,1:6,5:1,7,0,6
chr5	151202160	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,112;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.266:17:5,4:6,0:11,2,4,0
chr5	151236039	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=194,267;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:0,9,0,4
chr5	151239470	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=124,82;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:11,1:13,2:14,10,1,2
chr5	151239509	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=137,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:6,2:6,9,1,1
chr5	151239518	.	C	CCCCAGTCTCATTCCAGACACCAGACCAA	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=123,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,0:7,2:6,7,1,1
chr5	151771937	.	GGTC	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=183,183;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,2:0.073:39:20,2:15,0:20,17,0,2
chr5	152873649	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=166,207;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:2,5,0,2
chr5	153026570	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=161,147;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,4:6,0:10,8,4,0
chr5	153065746	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=173,90;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.331:16:5,2:6,3:7,4,4,1
chr5	153085668	.	T	TTTTGTTTG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,8;RU=TTTG;STR;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.548:7:2,1:1,2:0,3,0,4
chr5	153144216	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=131,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:2,5:0,7:0,2,0,12
chr5	153149742	.	TG	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,1:11,1:0|1:153149742_TG_T:153149742:12,8,1,1
chr5	153149744	.	TGTTTGA	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,28;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:8,1:12,1:0|1:153149742_TG_T:153149742:12,8,1,1
chr5	153149756	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,32;MFRL=154,89;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:6,1:9,1:0|1:153149742_TG_T:153149742:8,8,1,2
chr5	153149758	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=153,77;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.141:19:8,0:7,2:0|1:153149742_TG_T:153149742:10,7,0,2
chr5	153174310	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=239,150;MMQ=33,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.219:16:1,0:9,2:0,13,1,2
chr5	153372525	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,4:6,3:8,5,4,3
chr5	153414545	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:3,1:6,3:0,9,0,4
chr5	153429187	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=309,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,3:2,0:2,0,3,0
chr5	153433296	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:10,0:11,7,2,0
chr5	153570349	.	C	CCGGGCGGA	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=177,334;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGGGCGGA;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr5	153674536	.	TTGTGTG	T,TTG	.	.	DP=42;ECNT=3;MBQ=23,16,29;MFRL=202,153,200;MMQ=60,60,53;MPOS=28,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,13,14;RU=TG;STR;TLOD=12.77,5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,6,2:0.424,0.254:11:0,1,1:1,1,1:0,3,0,8
chr5	153674562	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:5,0:10,2:0|1:153674562_G_A:153674562:0,17,0,2
chr5	153674564	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=34,27;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,0:9,1:0|1:153674562_G_A:153674562:0,15,0,2
chr5	153760260	.	AG	TT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=315,301;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr5	153760270	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=264,70819355;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr5	153783587	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=131,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.334:25:9,3:7,5:9,8,4,4
chr5	153795274	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr5	153832966	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=165,57;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:153832966_A_C:153832966:7,4,1,1
chr5	153832970	.	G	GTTATCCATGGTTCTTTTGTATATTT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=165,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:4,0:6,2:0|1:153832966_A_C:153832966:7,4,1,1
chr5	153856974	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=137,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:4,0,4,0
chr5	153857653	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	154174839	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=158,91;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,0:11,3:10,9,3,0
chr5	154183957	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=216,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:154183957_GA_G:154183957:0,2,0,2
chr5	154183961	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=216,246;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0|1:154183957_GA_G:154183957:0,2,0,2
chr5	154191192	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=196,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=45.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,15:0.517:29:8,5:6,10:7,7,0,15
chr5	154193735	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	154245034	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=216,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:1,1,0,3
chr5	154271391	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	154275962	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=210,245;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr5	154278888	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=52.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,3,13
chr5	154287115	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr5	154291219	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	154291496	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=48.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,4:0,11:0,0,4,11
chr5	154296795	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=150,273;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	154308282	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	154308307	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr5	154311235	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr5	154311576	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr5	154315354	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,1:7,3:15,0,3,1
chr5	154395433	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=161,168;MMQ=60,24;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,9:0.262:36:16,0:11,9:11,16,0,9
chr5	155771421	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=181,108;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,1:2,0:4,2,1,1
chr5	155771773	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=193,170;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,3:0,2:0,1,0,5
chr5	156074654	.	TAAATTGA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.870:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr5	156353313	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=130,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:10,0:22,3:13,19,0,3
chr5	156375372	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=183,206;MMQ=60,53;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,4:2,0:4,0,3,1
chr5	156376703	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=108.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,29:0.969:29:0,10:0,18:0,0,7,22
chr5	156381370	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	156390297	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=161,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:1,4:1,5:0,2,0,9
chr5	156464212	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	156464242	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr5	156479323	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=176,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:2,1,4,0
chr5	156479509	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=115,128;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,19:0.690:27:5,9:3,10:3,5,7,12
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=139,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.505:14:3,3:3,4:3,4,3,4
chr5	156479568	.	C	CGTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=139,142;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.464:10:2,3:2,2:2,3,2,3
chr5	156482640	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156482640_A_G:156482640:0,1,0,1
chr5	156482642	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,27;MFRL=204,184;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:156482640_A_G:156482640:0,1,0,1
chr5	156531736	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=112,86;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.451:20:2,5:9,4:3,8,4,5
chr5	156644775	.	T	TC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=23.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr5	156659391	.	TTCTTTTGGACACAGTAAGTCTCCTTAACCTG	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=123,59;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.129:22:12,0:5,2:8,12,1,1
chr5	156670646	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=156,119;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:0,0:14,3:9,5,2,1
chr5	156670896	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:1,6,0,4
chr5	156679576	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=148,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:4,5:5,7:8,1,12,0
chr5	156721863	.	T	TC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=67.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,13:0,11:0,0,7,17
chr5	156738830	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:3,6:5,7:1,7,3,10
chr5	156742186	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=177,244;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.304:11:3,0:5,3:0,8,0,3
chr5	156747614	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,28;MFRL=267,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,3:3,1:6,2,3,1
chr5	156747632	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=270,150;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,4:5,1:7,3,4,1
chr5	156747669	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=180,132;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.314:26:7,5:11,2:12,6,5,3
chr5	156766037	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:4,4:7,2:9,2,5,1
chr5	156766273	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=128,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,2,3
chr5	156887133	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=193,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.283:12:5,2:4,1:6,3,2,1
chr5	156894173	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=98,235;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:1,3,0,1
chr5	156894181	.	T	TCTGCATCTCCATGAGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,19;MFRL=182,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.489:4:1,1:1,0:0,2,1,1
chr5	156898899	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,0,11
chr5	156899869	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,7:0,5:0,0,2,10
chr5	156916017	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=131,303;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:156916017_G_A:156916017:3,0,1,0
chr5	156916021	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,35;MFRL=160,303;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:156916017_G_A:156916017:4,0,1,0
chr5	156916037	.	C	CAAAAAGAA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=194,126;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAAAGAA;STR;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,1:4,1,3,1
chr5	156929931	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=150,56;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:13,0:12,5:5,21,0,5
chr5	156929982	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=134,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:12,2:9,0:7,14,2,0
chr5	156936549	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=159,253;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr5	156957741	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:4,1,4,0
chr5	157002552	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	157075719	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=133,151;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:6,1:2,0:6,2,2,0
chr5	157075943	.	TAC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:1,1:0,5,0,2
chr5	157102063	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=156,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.404:10:3,1:3,2:4,2,2,2
chr5	157106785	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,7,2
chr5	157158372	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=170,227;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,2:3,2:7,0,4,0
chr5	157158414	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=174,241;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,3:9,1:15,4,2,2
chr5	157158439	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,27;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:14,3:7,1:16,5,1,3
chr5	157164889	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=197,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,0:3,4:5,1,2,2
chr5	157170986	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=154,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr5	157178592	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,100;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=20.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,7:0,1:0,0,3,5
chr5	157180930	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=264,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.598:8:1,3:1,2:3,0,5,0
chr5	157180959	.	AAAT	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=194,131;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AAT;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:8,2:2,1:9,1,2,1
chr5	157241367	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr5	158140222	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=222,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr5	158511794	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=205,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,2:2,0:3,6,0,2
chr5	158522577	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:1,5:0,10:0,1,7,8
chr5	158526270	.	AGCTGCC	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GCTGCC;STR;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,3:0,0,4,0
chr5	158526534	.	TAA	T,TA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,30,24;MFRL=58,219,79;MMQ=60,60,60;MPOS=16,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.77,28.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,15:0.167,0.706:20:1,0,6:1,2,4:1,1,4,14
chr5	158588633	.	GAAAAA	G,GAAA	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33,26;MFRL=191,218,177;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,10,13;RU=A;STR;TLOD=47.73,5.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,12,2:0.655,0.173:16:0,5,0:1,6,1:0,2,2,12
chr5	158589898	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=39.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:3,7:4,5:6,1,11,1
chr5	158603571	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=175,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:5,7:5,5:8,2,10,2
chr5	158608880	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,2:6,0:16,0,2,0
chr5	158697468	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=191,6395402;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:3,8,2,0
chr5	158697481	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=191,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:4,1:1,6:2,3,3,4
chr5	158697716	.	GT	G,GTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,32,34;MFRL=180,225,261;MMQ=60,60,60;MPOS=19,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.44,3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,2:0.386,0.228:10:1,3,1:1,1,1:0,4,0,6
chr5	158710419	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=163,230;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=15.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr5	158750013	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:1,2:3,5:4,0,6,1
chr5	159463687	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:7,3,2,1
chr5	159478089	.	GTT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=13,35;MFRL=120,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.617:3:0,2:0,0:0,1,2,0
chr5	159640652	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=83,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,6:1,4:2,0,10,0
chr5	159661723	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=173,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,2:4,3:5,0,5,0
chr5	159665523	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=33.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.752:10:1,5:1,3:0|1:159665523_C_T:159665523:2,0,7,1
chr5	159665527	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=162,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:1,5:1,3:0|1:159665523_C_T:159665523:2,0,7,1
chr5	159665534	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,35;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,9:0.769:11:1,5:1,4:0|1:159665523_C_T:159665523:2,0,8,1
chr5	159665726	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=123,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,9:0.588:15:6,4:0,4:0|1:159665726_C_T:159665726:1,5,2,7
chr5	159665733	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=123,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:6,2:0,5:0|1:159665726_C_T:159665726:1,5,1,6
chr5	159831664	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=228,252;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,0:3,6:2,3,1,5
chr5	159835173	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=229,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,0:4,2:2,9,1,1
chr5	159839530	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=207,147;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.423:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr5	159839545	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=1894,131;MMQ=33,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:11,0:6,4:13,4,0,4
chr5	159840688	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=200,220;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,1,2
chr5	159840700	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=236,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr5	159849778	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=141,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,5:0.121:47:20,0:22,5:23,19,0,5
chr5	159851211	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr5	159855760	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=209,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,3:1,3:0,6,0,6
chr5	159992751	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:9,2:10,3:9,10,4,1
chr5	160026025	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:0,1,1,2
chr5	160029516	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=110,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:8,2,2,0
chr5	160043071	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=220,181;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr5	160044855	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,10,2
chr5	160047265	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	160049355	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr5	160097429	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr5	160097453	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,3:0,6:0,0,7,2
chr5	160114730	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,203;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:5,1,2,0
chr5	160763616	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=124,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:3,2:5,5:8,0,2,5
chr5	160763792	.	TAC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,17;MFRL=138,0;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:2,1:3,4,1,1
chr5	161119218	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=188,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,0:7,2:7,7,1,1
chr5	161281245	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=146,202;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.240:19:8,2:6,2:7,8,2,2
chr5	161292685	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=153,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:6,1:8,2:11,3,1,2
chr5	161302728	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=165,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:1,3:5,2:0,6,0,5
chr5	161318132	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.607:3:1,2:0,0:0|1:161318132_A_G:161318132:0,1,0,2
chr5	161318142	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161318132_A_G:161318132:0,3,0,1
chr5	161318144	.	AA	GG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:161318132_A_G:161318132:0,3,0,1
chr5	161322889	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.585:10:3,4:1,2:0,4,0,6
chr5	161569089	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr5	162868910	.	T	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=139,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:13,1:15,2:15,13,3,0
chr5	162884142	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,18;MFRL=232,257;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:1,1:4,0:1,6,0,2
chr5	162884145	.	GT	G,GTT	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=15,13,29;MFRL=261,257,163;MMQ=60,60,60;MPOS=27,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.35,6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.271,0.490:6:0,0,1:0,0,1:0,1,1,4
chr5	162887650	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=127,184;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,5:0.172:33:13,1:13,4:15,13,3,2
chr5	162891894	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=246,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr5	162910199	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,1:9,1:6,11,1,1
chr5	162910280	.	T	TG	.	.	DP=44;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=120,132;MMQ=60,57;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=60.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,20:0.468:43:10,20:13,0:16,7,20,0
chr5	162910310	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=166,132;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=61.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.480:42:6,20:15,0:11,11,20,0
chr5	162910435	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=113,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:7,2:3,2:2,8,0,4
chr5	162932822	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.403:18:4,2:5,5:0,11,0,7
chr5	162938940	.	GT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=115,228;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.705:8:2,4:0,2:2,0,5,1
chr5	162940739	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,8,5
chr5	162940774	.	GA	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=173,185;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=19.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.410:20:7,8:5,0:11,1,8,0
chr5	162944709	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,4:1,2:0,4,1,5
chr5	162945387	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=75,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr5	167303239	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=260,289;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr5	167379580	.	CT	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=155,78;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.146:23:8,0:11,2:16,4,1,2
chr5	167489049	.	C	CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=209,134;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.515:10:2,3:3,2:4,1,5,0
chr5	167517785	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=132,115;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr5	167589628	.	A	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=139,59;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:11,3:14,0:15,11,3,0
chr5	167622107	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=183,272;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:3,0,5,0
chr5	167626890	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:167626890_C_T:167626890:2,1,1,0
chr5	167626894	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=172,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:167626890_C_T:167626890:2,1,1,0
chr5	167627140	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=156,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,0:9,4:8,9,0,4
chr5	167653364	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=247,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	167689728	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=165,22;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,3:11,1:12,5,3,1
chr5	167798585	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=226,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=33.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.802:13:0,4:2,7:0,2,1,10
chr5	167868809	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=224,134;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=33.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:11,8:2,5:5,8,5,9
chr5	167868838	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:12,1:2,1:7,8,1,1
chr5	167868930	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,24;MFRL=208,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.648:6:1,4:0,0:0,2,0,4
chr5	167891668	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=239,205;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,2:1,4:3,0,5,1
chr5	167913459	.	C	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=163,298;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:12,1:10,2:10,12,2,1
chr5	167913661	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=255,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,0,6
chr5	167919623	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=198,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr5	167921047	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=181,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr5	167927541	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=214,202;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr5	167933673	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=171,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.390:9:2,1:4,2:6,0,2,1
chr5	167946076	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=120,235;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,1:10,1:19,6,2,0
chr5	167988073	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0,10,0,2
chr5	168100155	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=188,110;MMQ=60,22;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,3:6,0:9,1,3,0
chr5	168137879	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=168,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.167:21:11,0:6,1:0|1:168137879_T_G:168137879:16,2,0,3
chr5	168137885	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=162,207;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:20,5:0.221:25:11,3:9,2:1|0:168137879_T_G:168137879:15,5,3,2
chr5	168176541	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=190,61;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:8,1:2,1:7,3,0,2
chr5	168187760	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=203,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,0:6,2:6,0,1,1
chr5	168189501	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=177,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:8,5:6,1:10,4,5,1
chr5	168213007	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:4,4:2,8,1,4
chr5	168233413	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=198,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,3:4,8:6,1,8,3
chr5	168244256	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,1,3
chr5	168244506	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=170,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:0,4,0,5
chr5	168244543	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr5	168250429	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,0,4
chr5	168620435	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=154,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,1:5,2:8,5,1,2
chr5	169018234	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:7,3:11,0:5,14,0,3
chr5	169020337	.	CTT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.239:11:5,2:3,0:9,0,2,0
chr5	169020421	.	G	GACTGCACTTCCCCCTTTATATGTAATGT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=117,85;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:13,2:8,0:13,8,0,2
chr5	169025558	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=121,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:14,0:6,2:10,10,0,2
chr5	169025605	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=155,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:0|1:169025605_T_A:169025605:5,9,0,2
chr5	169025611	.	GATGAA	G	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,0:6,2:0|1:169025605_T_A:169025605:6,11,0,2
chr5	169025619	.	TGTCAC	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:8,0:5,2:0|1:169025605_T_A:169025605:5,9,0,2
chr5	169031218	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=267,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,1:0,5:0,1,1,5
chr5	169081315	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=211,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr5	169096207	.	T	TAAAAC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=48,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=AAAAC;STR;TLOD=15.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,1:2,2:2,0,1,3
chr5	169097474	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=225,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr5	169097505	.	T	TTTTTA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=207,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TTTTA;STR;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr5	169098176	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=152,0;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,2:11,0:10,11,0,2
chr5	169126326	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=197,109;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,3:6,0:6,2,2,1
chr5	169138879	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:3,2:0,0:3,1,3,0
chr5	169138909	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=89,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:11,4:0,1:7,4,4,1
chr5	169188457	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=174,209;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,1,0
chr5	169291267	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=133,239;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:9,3:4,1:6,7,2,2
chr5	169454831	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,4:2,3:0|1:169454831_G_A:169454831:6,3,5,2
chr5	169454833	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=215,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:6,4:3,3:0|1:169454831_G_A:169454831:6,3,5,2
chr5	169461399	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=180,93;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,2:4,0:9,3,2,0
chr5	169468243	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr5	169472765	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=241,96;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr5	169494611	.	T	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=155,209;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,7:0.265:28:13,0:8,7:11,10,0,7
chr5	169496051	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=188,262;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,4:3,0:4,0,4,0
chr5	169503118	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,22;MFRL=165,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.244:14:4,0:3,2:0|1:169503118_T_G:169503118:3,8,0,3
chr5	169503124	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.291:15:4,0:3,0:0|1:169503118_T_G:169503118:3,8,0,4
chr5	169503126	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=28,12;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.331:13:3,0:2,0:0|1:169503118_T_G:169503118:1,8,0,4
chr5	169503129	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,8;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.355:12:3,0:2,0:0|1:169503118_T_G:169503118:1,7,0,4
chr5	169503133	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,19;MFRL=165,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.452:9:3,1:0,1:0|1:169503118_T_G:169503118:1,4,0,4
chr5	169675693	.	AT	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=158,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.697:21:4,5:2,10:1,5,5,10
chr5	169679354	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,276;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:1,3:2,2:3,0,5,0
chr5	169680139	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=145,224;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.114:33:14,3:15,0:17,13,3,0
chr5	169686007	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=193,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr5	169689604	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=224,207;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=44.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:2,8:2,5:3,1,12,1
chr5	169689659	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:18,6:14,0:21,11,6,0
chr5	169695446	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=173,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr5	169697707	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=178,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,7:2,5:2,1,9,3
chr5	169720293	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.158:36:20,5:11,0:15,16,5,0
chr5	169806001	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=176,97;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:2,2:4,4:0,6,2,4
chr5	170139756	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:3,1:4,1:7,1,2,0
chr5	170145749	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=215,76;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,1:5,1:7,5,2,0
chr5	170149674	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=142,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,4:3,2:7,2,5,1
chr5	170159997	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=154,282;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr5	170160749	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,257;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr5	170162666	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=199,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr5	170221185	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=146,288;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,0:5,3:9,2,2,1
chr5	170235729	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,0:6,3:7,5,2,1
chr5	170341326	.	TTA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TA;STR;TLOD=28.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	170345932	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=213,167;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170345932_G_A:170345932:0,2,0,1
chr5	170345942	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=213,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:170345932_G_A:170345932:0,2,0,1
chr5	170380523	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr5	170610273	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=104,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=67.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,21:0.917:22:0,9:1,12:0,1,11,10
chr5	170640800	.	AG	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,24;MFRL=259,105;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:170640800_AG_A:170640800:0,4,0,1
chr5	170640803	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=259,105;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:170640800_AG_A:170640800:0,4,0,1
chr5	170640827	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr5	170669692	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=166,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:1,3:3,1:2,2,1,3
chr5	170737299	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=134,60;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.178:20:12,2:5,1:11,6,1,2
chr5	170815125	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,1:4,7:1,5,0,8
chr5	170818897	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=147,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:1,6:2,2:0|1:170818897_A_G:170818897:0,3,1,7
chr5	170818906	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=147,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0|1:170818897_A_G:170818897:0,3,1,7
chr5	170819887	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=164,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.551:27:6,11:6,4:5,7,5,10
chr5	170820024	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:1,7,3,4
chr5	170827115	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0|1:170827115_C_A:170827115:1,0,6,1
chr5	170827118	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=0,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=27.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0|1:170827115_C_A:170827115:1,0,6,1
chr5	170827311	.	T	TGGGAGATCATCTCATACTGA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,334;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GGGAGATCATCTCATACTGA;STR;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.650:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	170832243	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=84,133;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,2:1,4:1,0,6,0
chr5	170847555	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr5	171480055	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=120,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:5,0:10,4:1,14,1,3
chr5	171484497	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=187,150;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.442:16:7,4:2,3:4,5,2,5
chr5	171488293	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=220,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:3,3:2,5:0,5,0,8
chr5	171491650	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=172,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,2:4,0:7,0,2,0
chr5	171491682	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=190,118;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.344:12:4,1:4,1:0|1:171491682_C_T:171491682:6,2,3,1
chr5	171491697	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=172,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.310:16:7,0:3,3:0|1:171491682_C_T:171491682:6,5,3,2
chr5	171533581	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=185,70;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:8,0:0,2:8,0,2,0
chr5	171533734	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=142,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,3:10,0:9,12,2,1
chr5	171533782	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=186,139;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.392:26:9,4:7,6:8,8,4,6
chr5	171534682	.	T	TGCCCACAGGCTGACCGGGC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:4,1:2,3:6,0,3,1
chr5	171554396	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=175,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,1:8,1:6,6,0,2
chr5	171554473	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:1,4,1,3
chr5	171583610	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=165,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:5,2:3,0:7,1,2,0
chr5	171774363	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=168,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,1:1,3:1,4,1,3
chr5	171785892	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=160,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,2:3,7:4,1,1,8
chr5	171800765	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,157;MMQ=60,35;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,11:0.429:26:4,11:11,0:4,11,11,0
chr5	171809224	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=185,138;MMQ=60,53;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,1:4,1:0,12,0,2
chr5	172114021	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=185,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr5	172261462	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=106,200;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,1,3
chr5	172261489	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=106,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,0:1,3:0,2,0,3
chr5	172315872	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=203,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:0,8,0,4
chr5	172324128	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,3:2,0:2,4,0,3
chr5	172324978	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,0,7
chr5	172336616	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=195,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,2:0,6:1,0,4,4
chr5	172336688	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=148,111;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.260:13:4,3:6,0:5,5,2,1
chr5	172342009	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=145,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.265:13:5,3:5,0:0|1:172342009_G_A:172342009:2,8,1,2
chr5	172342029	.	G	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=145,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:6,4:0.416:10:5,1:1,3:1|0:172342009_G_A:172342009:0,6,0,4
chr5	172347440	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.766:18:0,6:2,8:3,1,6,8
chr5	172351160	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=189,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:2,6,0,2
chr5	172395408	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=252,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:0,8:1,2:0,1,7,3
chr5	172395581	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,141;MMQ=56,52;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.757:19:2,6:2,6:1,3,4,11
chr5	172395664	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=184,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,2:0,5:0,2,0,7
chr5	172396394	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=71.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,12:0,12:0,0,15,9
chr5	172421760	.	AT	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=134,97;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.493:6:2,2:1,1:2,1,1,2
chr5	172535553	.	AGG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=150,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=4,2;RU=G;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:3,0,2,0
chr5	172539241	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,4:3,2:4,0,5,1
chr5	172560793	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=130,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:4,3:2,4:2,4,0,7
chr5	172573767	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=235,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:1,3:0,8:1,0,11,1
chr5	172585770	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=159,66;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.331:13:4,4:5,0:5,4,4,0
chr5	172585927	.	TC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr5	172659511	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,429;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	172745269	.	AAGAGAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=152,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=AG;STR;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.502:6:1,0:0,2:0,3,0,3
chr5	173036315	.	T	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=117,175;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.233:31:11,0:13,6:13,11,0,7
chr5	173316729	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=106.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,34:0.973:34:0,16:0,18:0,0,16,18
chr5	174152100	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr5	174868700	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=290,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,2:1,1:2,0,3,0
chr5	174870150	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=265,163;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.700:18:2,8:3,5:1,4,7,6
chr5	174943551	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.179:15:5,1:7,1:8,5,1,1
chr5	175512075	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=130,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,2,2
chr5	175520358	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=179,236;MMQ=40,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:3,2:1,8,0,2
chr5	175530166	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,162;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,3:5,1:6,6,4,0
chr5	175717106	.	GAGC	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=132,124;MMQ=60,38;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AGC;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.154:17:7,2:7,0:10,5,0,2
chr5	175721962	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=169,151;MMQ=40,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:4,0,1,0
chr5	175723302	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=35,32;MFRL=207,156;MMQ=40,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0|1:175723302_C_G:175723302:4,5,0,2
chr5	175723304	.	C	CTGGTCGT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=207,156;MMQ=40,27;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0|1:175723302_C_G:175723302:4,5,0,2
chr5	175723308	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=203,156;MMQ=40,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:3,2:7,0:0|1:175723302_C_G:175723302:5,5,0,2
chr5	175749408	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=115,109;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.093:30:12,1:15,1:13,15,2,0
chr5	175774865	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=160,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:8,3:8,4:8,8,4,3
chr5	175782709	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,0:5,2:7,7,1,1
chr5	175786437	.	CATT	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=147,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:9,4:9,2:7,11,3,3
chr5	175792605	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr5	175798945	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=181,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.670:13:3,2:1,7:0,4,0,9
chr5	175815220	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=184,87;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:10,3:9,0:12,7,3,0
chr5	175815247	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,87;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.164:28:13,4:11,0:11,13,3,1
chr5	175815782	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=203,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:10,5:5,1:0|1:175815782_G_C:175815782:12,5,4,3
chr5	175815787	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=197,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:11,6:5,1:0|1:175815782_G_C:175815782:11,5,4,3
chr5	175815874	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=189,167;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:9,4:6,4:7,8,5,3
chr5	175819951	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=234,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.499:18:4,5:5,4:2,7,3,6
chr5	175843461	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0,0,0,9
chr5	175913485	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=174,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:3,5,1,1
chr5	175913587	.	T	TCACA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175913587_T_TCACA:175913587:0,1,0,1
chr5	175913588	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175913587_T_TCACA:175913587:0,1,0,1
chr5	175913591	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:175913587_T_TCACA:175913587:0,1,0,1
chr5	175919324	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=163,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:8,1:1,2:4,5,1,2
chr5	175921150	.	AGTT	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=153,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:10,0:11,4:10,13,2,2
chr5	175923431	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=244,172;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:3,4:3,5:6,0,8,1
chr5	175956177	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,254;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.442:14:4,2:3,4:1,7,2,4
chr5	175956271	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=277,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:1,8:2,4:3,0,10,2
chr5	175956500	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,13;MFRL=153,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.269:14:3,0:6,1:9,1,0,4
chr5	175956516	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=262,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:0,6:4,7:1,3,9,4
chr5	175959241	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,209;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:0,1:7,1:2,5,1,1
chr5	175992258	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr5	175992519	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=225,249;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:3,2,1,2
chr5	176002144	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=74.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:1,6:0,17:0,1,14,9
chr5	176002873	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=134,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.777:10:1,3:0,5:0,2,3,5
chr5	176002926	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=223,187;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.835:16:0,9:2,5:0,2,4,10
chr5	176004312	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr5	176004846	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=123,211;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.713:5:0,2:1,1:0,1,2,2
chr5	176004866	.	A	AGT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=123,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=GT;STR;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.753:6:0,1:1,4:0,1,3,2
chr5	176005084	.	T	TCTGTGGGCATGCTGG	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:3,2:10,0:0|1:176005084_T_TCTGTGGGCATGCTGG:176005084:3,10,1,1
chr5	176005088	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=185,39;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:3,2:10,0:0|1:176005084_T_TCTGTGGGCATGCTGG:176005084:3,10,1,1
chr5	176005175	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,3
chr5	176005184	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0|1:176005175_A_C:176005175:0,0,0,2
chr5	176017549	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,130;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=50.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.859:19:0,13:2,4:2,0,8,9
chr5	176018545	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,9:0,3:0,0,1,11
chr5	176026121	.	TCAAAGACCCAGGA	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=148,246;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:5,2:5,2:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:7,6,0,4
chr5	176026135	.	TCCTCCTTCCTC	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=148,246;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,2:5,2:0|1:176026121_TCAAAGACCCAGGA_T:176026121:9,6,0,4
chr5	176026491	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:2,6:8,1:7,3,2,5
chr5	176053336	.	GGT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=143,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=GT;STR;TLOD=9.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.826:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr5	176053645	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=236,246;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,2:1,0:1,1,2,1
chr5	176056529	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=74.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,12:0,0,11,11
chr5	176069831	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=0,20;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.922:11:0,3:0,6:0,0,4,7
chr5	176069862	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=229,112;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.425:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr5	176069863	.	C	CT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,33;MFRL=120,243;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	176069866	.	C	CGCCCG,CCGCCCG	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=0,28,32;MFRL=0,112,229;MMQ=60,60,60;MPOS=11,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.39,4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.388,0.500:5:0,1,2:0,1,1:0,0,0,5
chr5	176070756	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=136,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.151:18:10,0:6,2:5,11,0,2
chr5	176081856	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:1,1:4,1:5,0,1,1
chr5	176083175	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,120;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,4,5
chr5	176083997	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr5	176305466	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,4:1,2:1,4,4,2
chr5	176305678	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=165,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:1,5,0,2
chr5	176306676	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=205,144;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:2,1,5,0
chr5	176308870	.	C	CAG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=152,233;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,3:5,1:3,4,1,3
chr5	176314434	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=263,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,2,1
chr5	176314459	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=109,189;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.763:5:0,1:0,3:0,1,1,3
chr5	176315299	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=200,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.508:10:2,0:2,5:4,1,4,1
chr5	176316455	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=138,109;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:7,6:10,2:11,6,4,4
chr5	176318322	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=193,190;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:2,3,1,1
chr5	176333133	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr5	176338288	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:5,3:1,2:4,2,5,0
chr5	176378433	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=120,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:2,2:5,2:6,2,1,3
chr5	176471591	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=164,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr5	176477781	.	C	CTTGTGTCATTTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=180,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,2:5,0:4,4,1,1
chr5	176517326	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,260;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	176519287	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=251,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,2:1,5:3,1,5,2
chr5	176522728	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=177,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:2,4:0,5:2,1,4,5
chr5	176523562	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=220,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.638:9:2,1:1,5:2,1,3,3
chr5	176523597	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=220,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.717:12:2,3:1,6:1,2,7,2
chr5	176636550	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,17;MFRL=205,218;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.371:9:2,0:1,1:6,0,3,0
chr5	176637240	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=140,167;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:7,3:12,3:14,5,4,2
chr5	176637408	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=175,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:3,2:9,1:9,3,1,2
chr5	176637570	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=137,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:4,2:6,1:5,5,0,3
chr5	176694559	.	AC	CA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=175,192;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:11,0:11,2:12,11,0,2
chr5	176700885	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,282;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	176720766	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=215,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:8,0,2,0
chr5	176728878	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=204,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.372:25:7,6:8,3:7,9,1,8
chr5	176729736	.	ACC	A,AC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27,26;MFRL=228,150,178;MMQ=60,60,60;MPOS=27,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=C;STR;TLOD=3.21,12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,6:0.199,0.525:11:0,1,1:3,1,4:0,3,0,8
chr5	176730139	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,31;MFRL=186,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,3:0.250:14:5,1:5,2:0|1:176730139_G_C:176730139:3,8,3,0
chr5	176730142	.	CACCGTG	C	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=34,33;MFRL=166,151;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.178:15:5,1:6,1:0|1:176730139_G_C:176730139:4,9,2,0
chr5	176730154	.	CCCCTCCGGATGCACTCACGTTCTGATA	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=35,22;MFRL=164,168;MMQ=60,60;MPOS=-1073741821;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:5,0:7,1:0|1:176730139_G_C:176730139:6,15,2,0
chr5	176733024	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,67;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:14,0:10,2:9,15,0,2
chr5	176733616	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=212,180;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,6:0,3:0,1,0,9
chr5	176765395	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=212,177;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:2,2:4,0:6,0,3,0
chr5	176798040	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,26;MFRL=235,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:1,0:0,1:1,0,1,1
chr5	176798070	.	CGGGCCGGGGCCGGGGCCGGGGCCG	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=198,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,5;RU=GGGCCG;STR;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:0,1:2,0,2,0
chr5	176798306	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=158,120;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:8,5:5,4:5,8,5,4
chr5	176813404	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:9,3:5,1:8,6,2,2
chr5	176814901	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=270,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr5	176815004	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,7:5,1:7,3,7,1
chr5	176824137	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=202,202;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:2,1:0,5,0,2
chr5	176830627	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,2:2,0:1,2,0,2
chr5	176831119	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=227,226;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,3:1,3:3,0,6,0
chr5	176831177	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=146,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=C;STR;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.568:7:2,1:1,3:2,1,2,2
chr5	176831980	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.911:9:0,6:0,2:0,0,5,4
chr5	176857769	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=53.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,17,0
chr5	176858049	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:2,0:2,2:0,4,0,3
chr5	176859414	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=210,128;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,0:10,2:1,14,0,2
chr5	176859848	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=131,142;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.633:17:3,6:3,5:2,4,4,7
chr5	176860965	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=169,52;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:12,0:9,2:0|1:176860965_G_T:176860965:14,8,1,1
chr5	176860982	.	G	GCTTTCCTTTATGGCTCAGGATGTGCT	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=164,52;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.119:23:14,0:7,2:0|1:176860965_G_T:176860965:11,10,1,1
chr5	176868780	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=27,19;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.488:8:1,2:3,0:0|1:176868780_A_C:176868780:1,3,4,0
chr5	176868784	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=133,191;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.441:9:2,1:3,0:0|1:176868780_A_C:176868780:1,4,4,0
chr5	176885425	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=148,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:13,5,2,0
chr5	176886539	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=169,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,0:5,2:8,0,2,0
chr5	176887737	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176887737_T_A:176887737:0,1,1,0
chr5	176887746	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=36,25;MFRL=228,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:176887737_T_A:176887737:0,1,1,0
chr5	176895817	.	GC	AA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=61.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,5:0,0,10,4
chr5	176917764	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,2:1,0:3,0,2,0
chr5	176919656	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,234;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:3,1:4,2:2,5,0,3
chr5	176929974	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=185,141;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,6:2,2:6,0,7,1
chr5	176930135	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,12:0,6:0,0,10,8
chr5	176930171	.	AGAG	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GAG;STR;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:1,7:7,3:5,3,6,4
chr5	176931706	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=190,149;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:3,1,1,4
chr5	176935215	.	GC	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr5	176939051	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=161,203;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.883:15:1,9:0,5:0,1,8,6
chr5	176939688	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,8,5
chr5	176939735	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,10,2
chr5	176940274	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=174,188;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr5	176940871	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=64.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,19:0.953:19:0,11:0,8:0|1:176940871_G_C:176940871:0,0,8,11
chr5	176940873	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=121,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:9,2:8,0:0|1:176940871_G_C:176940871:7,10,1,1
chr5	176941793	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=177,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,0:4,2:6,5,0,2
chr5	176950879	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	176963349	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=46.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,6:0,8:0,0,13,3
chr5	176965887	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,210;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:13,3:8,0:15,7,3,0
chr5	177019688	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,7:0,12:0,0,5,15
chr5	177020602	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=123,306;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:6,1:12,2,2,0
chr5	177031602	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr5	177035488	.	GC	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=196,172;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=C;STR;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,2:0,2:2,2,1,3
chr5	177036043	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,6:0,4:0,1,1,9
chr5	177151456	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,210;MMQ=27,26;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,2,2
chr5	177166053	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=138,122;MMQ=40,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:5,0:0,3:4,1,2,1
chr5	177166109	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=147,115;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,0:4,2:9,8,1,1
chr5	177422823	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,2:2,5:4,0,6,1
chr5	177466530	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,182;MMQ=24,23;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr5	177546564	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,0:9,2:13,6,0,2
chr5	177547336	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:5,1,2,2
chr5	177570759	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=37.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,9:0,2:0,0,4,7
chr5	177574901	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=197,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.557:23:6,7:4,5:6,4,7,6
chr5	177578009	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=206,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,2:6,2:3,7,3,2
chr5	177633852	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=159,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,14:0.416:34:6,8:14,6:12,8,7,7
chr5	177634029	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=177,133;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,5:6,0:9,2,5,0
chr5	177637447	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=200,204;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:0,3:2,5:2,0,5,3
chr5	177639069	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=205,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr5	177642177	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=137,232;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr5	177658883	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,8:0,6:0,0,0,14
chr5	177658896	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=179,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,3:3,4:0,6,0,7
chr5	177673401	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=186,103;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.499:20:4,6:6,4:3,7,6,4
chr5	177675217	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=164,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.779:16:1,5:2,8:1,2,3,10
chr5	177679447	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=146,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,4,1
chr5	177679654	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=123,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,2:1,0:2,3,0,2
chr5	177679680	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:0,3,1,3
chr5	177684682	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=206,197;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:0,4,0,2
chr5	177686616	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686621	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,22;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686622	.	T	TG	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,20;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686627	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,16;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686632	.	AT	CC	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686639	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,15;MFRL=0,305;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,0:0|1:177686616_A_C:177686616:0,0,1,0
chr5	177686815	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=131,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,2:3,0:2,7,1,1
chr5	177695865	.	G	GGA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=244,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:177695865_G_GGA:177695865:0,2,0,1
chr5	177695869	.	G	GGAAGCTATTATTCTA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=244,134;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.403:3:1,1:0,0:0|1:177695865_G_GGA:177695865:0,2,0,1
chr5	177695874	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,22;MFRL=161,134;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:177695865_G_GGA:177695865:0,1,0,1
chr5	177715291	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=144,145;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.739:21:3,10:2,6:4,1,5,11
chr5	177715302	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=20,33;MFRL=100,140;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=38.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.827:18:2,9:1,6:1,2,5,10
chr5	177715452	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=172,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:12,2:5,4:11,6,3,3
chr5	177715465	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=157,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:10,2:6,3:11,7,3,2
chr5	177715477	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.801:23:2,12:2,7:2,2,12,7
chr5	177717287	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:5,0:6,4:9,2,3,1
chr5	177987740	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=163,103;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.332:33:12,5:9,4:7,15,6,5
chr5	177987780	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,5:4,1:2,8,2,5
chr5	178030941	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=10,18;MFRL=210,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.507:6:0,0:0,1:0,3,1,2
chr5	178039525	.	T	TCA	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=167,45;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CA;STR;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.193:13:6,0:5,2:0|1:178039525_T_TCA:178039525:8,3,1,1
chr5	178039530	.	G	GGATCCCCTAGATT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=173,45;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:178039525_T_TCA:178039525:8,4,1,1
chr5	178039532	.	G	GT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=173,45;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:178039525_T_TCA:178039525:8,4,1,1
chr5	178039533	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=173,45;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:6,0:6,2:0|1:178039525_T_TCA:178039525:8,4,1,1
chr5	178040394	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,213;MMQ=60,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	178040919	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=209,234;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr5	178140637	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=210,178;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,0:0,4:0,3,0,4
chr5	178140643	.	A	ACCC	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,25;MFRL=272,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.303:4:3,1:0,0:0|1:178140643_A_ACCC:178140643:0,3,0,1
chr5	178140645	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=24,33;MFRL=272,178;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.303:4:3,1:0,0:0|1:178140643_A_ACCC:178140643:0,3,0,1
chr5	178140646	.	A	AGTTTTTTTGTTTGT	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,26;MFRL=272,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:3,1:0,0:0|1:178140643_A_ACCC:178140643:0,3,0,1
chr5	178140647	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,28;MFRL=272,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:178140643_A_ACCC:178140643:0,3,0,1
chr5	178288214	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=180,174;MMQ=27,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,2:2,0:1,6,1,1
chr5	178358220	.	ATT	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr5	178359697	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=142,465;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,0:10,2:9,6,1,1
chr5	178369673	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=177,282;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,2:1,0:3,0,2,0
chr5	178454997	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=181,73;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:2,1:8,1:9,1,0,2
chr5	178455198	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,5:0,5:0,0,0,10
chr5	178541152	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=133,216;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:12,3:6,4:8,10,2,5
chr5	178549791	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=154,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:1,5:2,5:0,3,1,9
chr5	178555097	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=170,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:3,9,3,2
chr5	178557142	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=185,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:0,1,2,3
chr5	178564704	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178564704_C_T:178564704:0,0,1,0
chr5	178564706	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:178564704_C_T:178564704:0,0,1,0
chr5	178567054	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=22,30;MFRL=357,181;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	178581259	.	C	CTCTTTCTTCT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=256,117;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.495:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr5	178581797	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=167,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,7:1,3:0,1,8,2
chr5	178634683	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr5	178986978	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,2,1
chr5	178989473	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=145,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.384:8:2,2:3,0:5,0,2,1
chr5	178994473	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=124,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:5,1:6,1:4,7,1,1
chr5	178996435	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=172,217;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:7,1:2,5:2,7,2,4
chr5	179028818	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=124,104;MMQ=56,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.514:9:0,1:4,3:4,0,0,5
chr5	179028850	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=126,44;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:5,0:12,2:3,14,0,2
chr5	179036433	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=136,102;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:6,2:9,2:5,10,0,4
chr5	179041785	.	GAAAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=22,18;RU=A;STR;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,1:0,1:0,1,2,1
chr5	179043075	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,11:0,10:0,0,15,7
chr5	179045210	.	T	C	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=145,186;MMQ=60,38;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,5:0.125:46:15,0:23,5:0|1:179045210_T_C:179045210:20,21,0,5
chr5	179045213	.	A	AC	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=145,186;MMQ=60,38;MPOS=33;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=14.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,5:0.125:46:17,0:24,5:0|1:179045210_T_C:179045210:20,21,0,5
chr5	179048205	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=182,112;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.608:18:2,6:4,5:4,3,7,4
chr5	179048449	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=193,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:0,10,0,3
chr5	179069309	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr5	179069551	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,210;MMQ=60,51;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr5	179070556	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=159,164;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:4,3:0,0:0,4,0,3
chr5	179070578	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=26,23;MFRL=159,164;MMQ=60,36;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.289:5:4,1:0,0:0,4,0,1
chr5	179136138	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0,0,1,7
chr5	179147641	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=233,153;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:0,2,0,7
chr5	179149866	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=148,81;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,3:7,0:9,9,3,0
chr5	179150788	.	G	GT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=142,215;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:10,0:4,3:2,15,2,2
chr5	179153577	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr5	179227471	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=132,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:9,1:10,1:7,13,1,2
chr5	179260494	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr5	179260528	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=191,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr5	179267783	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:0,1:6,1:6,0,2,0
chr5	179271060	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=139,143;MMQ=60,27;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,3:3,0:3,0,3,0
chr5	179271310	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr5	179294748	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=200,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:11,5,3,0
chr5	179299856	.	AG	CA,CC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=16,35,27;MFRL=226,146,197;MMQ=60,60,60;MPOS=14,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.33,7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,1,2:0.312,0.375:4:0,1,0:0,0,2:1,0,3,0
chr5	179299861	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=18,28;MFRL=186,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:0,2:4,0,2,0
chr5	179299867	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=22,21;MFRL=113,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,2:2,0,3,1
chr5	179334857	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr5	179405144	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:2,0:3,3,1,1
chr5	179407229	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=178,207;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,5:1,5:1,2,3,7
chr5	179439991	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr5	179498595	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=149,102;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.642:12:4,3:0,5:3,1,3,5
chr5	179528558	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=150,70;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:1,2,1,1
chr5	179545562	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=201,221;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr5	179555407	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=177,135;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:5,4:2,3:5,2,7,0
chr5	179563532	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=160,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:1,2,1,1
chr5	179565071	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,2,9
chr5	179565136	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	179663614	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=296,240;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	179667986	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=175,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr5	179728707	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=148,214;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr5	179729625	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=151,160;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:0,9,0,2
chr5	179731695	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,1:3,4:5,0,5,1
chr5	179734139	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=177,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr5	179734145	.	GTGGGGGTGGGGGC	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGGGGTGGGGGC;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:4,1:6,0,2,0
chr5	179734312	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=137,204;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,1:5,1:2,5,0,2
chr5	179744062	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=239,135;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:4,1:8,2:8,4,1,2
chr5	179746036	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:5,2:2,0:0,7,0,2
chr5	179751111	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=229,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:4,0,5,0
chr5	179751355	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=202,169;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:1,12,0,2
chr5	179763018	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=168,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:1,2:0,3,0,2
chr5	179763398	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr5	179765413	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,1:0,0,5,0
chr5	179780292	.	CCTCCGTGGG	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CTCCGTGGG;STR;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,0:0,1,0,3
chr5	179780328	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=193,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.659:4:1,2:0,0:0|1:179780328_G_A:179780328:0,1,0,3
chr5	179780340	.	GT	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr5	179780357	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=-5;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0|1:179780328_G_A:179780328:0,0,0,2
chr5	179980527	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=126,230;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,2:2,2:0,3,0,4
chr5	179991806	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=228,68;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr5	179991841	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=215,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr5	179998454	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=202,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:2,13,2,0
chr5	180041001	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,4,0
chr5	180041008	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:180041001_G_C:180041001:0,0,4,0
chr5	180041208	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.899:8:0,1:0,6:0,0,4,4
chr5	180045703	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,25;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:180045703_G_T:180045703:1,0,2,0
chr5	180045704	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=21,25;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:180045703_G_T:180045703:1,0,2,0
chr5	180045705	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=148,236;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0|1:180045703_G_T:180045703:1,0,2,0
chr5	180046426	.	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	180047863	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=52.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,10:0,5:0,0,9,7
chr5	180048986	.	G	GCCTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=241,237;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CCTC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr5	180049927	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=273,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr5	180053307	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr5	180055862	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,4,0
chr5	180055864	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.841:4:0,1:0,1:0|1:180055862_T_G:180055862:0,0,4,0
chr5	180056192	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=288,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr5	180056620	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr5	180057057	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=186,77;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:3,0:11,2:5,9,0,2
chr5	180219304	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=166,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:6,1:8,1:8,6,1,1
chr5	180277646	.	GCATTCATAGGGCTTCTCCCCCGTGTGGATCCTTTTGTGGACTCTGAGCCCAGAGCTGTTCCTGAAGGCCTTCCCACACTCACCA	G	.	.	DP=85;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=142,80;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:67,4:0.071:71:9,0:19,4:30,37,2,2
chr5	180277739	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=144,93;MMQ=60,44;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,2:0.083:34:7,0:23,2:0|1:180277739_G_A:180277739:8,24,1,1
chr5	180277742	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=146,93;MMQ=60,44;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,2:0.081:35:8,0:23,2:0|1:180277739_G_A:180277739:8,25,1,1
chr5	180277748	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=146,93;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.086:33:9,0:21,1:0|1:180277739_G_A:180277739:7,24,1,1
chr5	180329458	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=175,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:1,3,2,3
chr5	180329532	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr5	180329536	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=176,192;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr5	180338300	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=161,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,3:5,7:4,5,9,1
chr5	180338440	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=185,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:7,2:3,3:4,6,3,2
chr5	180374484	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=121,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:3,6:1,6:3,1,6,6
chr5	180374575	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=206,185;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:5,4,1,1
chr5	180376363	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:180376363_G_C:180376363:0,0,0,1
chr5	180376368	.	C	CCCTGACCAGT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,115;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.678:1:0,0:0,1:0|1:180376363_G_C:180376363:0,0,0,1
chr5	180430797	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=92,186;MMQ=40,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=36.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.566:21:8,5:1,7:4,5,7,5
chr5	180431005	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=149,258;MMQ=55,54;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.391:3:0,1:2,0:0|1:180431005_G_T:180431005:0,2,0,1
chr5	180431006	.	C	CCCCCAGGTCTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=36,31;MFRL=149,258;MMQ=55,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:180431005_G_T:180431005:0,2,0,1
chr5	180477449	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=187,215;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr5	180481104	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=160,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.195:27:8,0:14,4:22,0,5,0
chr5	180481216	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=T;STR;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:0,0:1,0:1,2,0,2
chr5	180482899	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=119,256;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr5	180486224	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr5	180582980	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr5	180625672	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=118,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:9,1:6,4:8,7,4,1
chr5	180626036	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=138,261;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,2:6,0:6,4,1,1
chr5	180627224	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,283;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr5	180650951	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,0:0,1:0|1:180650951_G_C:180650951:0,0,4,0
chr5	180650956	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.831:4:0,0:0,1:0|1:180650951_G_C:180650951:0,0,4,0
chr5	180650958	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,1:0|1:180650951_G_C:180650951:0,0,3,0
chr5	180650966	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,23;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,2:0|1:180650951_G_C:180650951:0,0,3,0
chr5	180650969	.	GAA	CCC	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.674:4:0,0:0,2:0|1:180650951_G_C:180650951:1,0,3,0
chr5	180663941	.	GT	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,0:10,3:20,5,3,0
chr5	180669136	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,201;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,2:4,1,3,0
chr5	180669370	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=185,113;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,1:6,1:2,13,1,1
chr5	180686958	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=174,253;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:2,0:11,2:12,1,1,1
chr6	292447	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,12;MFRL=256,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.598:3:0,0:1,0:0|1:292447_T_A:292447:1,0,2,0
chr6	292452	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=238,174;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.498:4:1,1:1,0:0|1:292447_T_A:292447:2,0,2,0
chr6	292694	.	GC	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=203,221;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,0:5,3:0,8,0,3
chr6	311797	.	G	GT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=169,133;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:6,1:1,1:7,0,3,0
chr6	312023	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.181:31:11,3:15,2:0|1:312023_C_T:312023:5,21,1,4
chr6	312029	.	TAATG	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=44.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:18,12:0.407:30:10,5:8,7:1|0:312023_C_T:312023:4,14,0,12
chr6	335251	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:5,2:4,2:0|1:335251_T_C:335251:0,10,0,4
chr6	335253	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=177,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.313:14:5,2:4,2:0|1:335251_T_C:335251:0,10,0,4
chr6	335268	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:6,4:5,3:0,11,0,7
chr6	348051	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=188,213;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,5:4,3:6,2,8,0
chr6	348080	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=285,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=71.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,23:0.924:24:0,15:1,8:0,1,18,5
chr6	349016	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=192,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.520:19:1,5:8,4:2,7,3,7
chr6	350940	.	T	TA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=179,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=15.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.351:18:8,4:4,2:1,11,0,6
chr6	397261	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=208,127;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:0|1:397261_G_A:397261:3,6,0,3
chr6	397269	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=208,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:3,3:5,0:0|1:397261_G_A:397261:2,7,0,3
chr6	398775	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=154,118;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:0|1:398775_G_A:398775:9,1,3,0
chr6	398783	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.353:15:5,2:4,3:0|1:398775_G_A:398775:9,1,4,1
chr6	407583	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=158,117;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,0:15,3:14,15,3,0
chr6	407656	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=29,29;MFRL=69,145;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	407662	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=69,158;MMQ=60,24;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:407662_G_A:407662:0,4,0,1
chr6	407667	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,33;MFRL=69,158;MMQ=60,24;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:407662_G_A:407662:0,4,0,1
chr6	407669	.	TG	CA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,36;MFRL=69,158;MMQ=60,24;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:407662_G_A:407662:0,4,0,1
chr6	407673	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=69,158;MMQ=60,24;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:407662_G_A:407662:0,4,0,1
chr6	486768	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,21;MFRL=177,367;MMQ=60,25;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.304:13:5,0:4,2:0,9,0,4
chr6	497520	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=128,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:6,5:3,5:4,6,0,10
chr6	564515	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=247,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:5,1,11,0
chr6	572480	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:1,4:3,6:1,3,7,3
chr6	572714	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=252,174;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr6	599042	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=236,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=41.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,6:1,7:1,2,9,4
chr6	656810	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.254:22:8,2:6,3:12,5,5,0
chr6	1313117	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1313117_A_C:1313117:0,0,0,1
chr6	1313121	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:1313117_A_C:1313117:0,0,0,1
chr6	1315019	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:1315019_T_TG:1315019:0,2,2,2
chr6	1315021	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=166,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:0,3:2,1:0|1:1315019_T_TG:1315019:0,2,2,2
chr6	1395043	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=209,111;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:3,9:1,7:3,1,8,8
chr6	1612419	.	TA	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=165,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:4,2:8,1:3,12,1,3
chr6	1613415	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=147,105;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:12,1:12,2:11,13,0,3
chr6	1624512	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:1,1:6,1:5,2,0,2
chr6	1624821	.	T	TGGGGGGGGGGGGG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=133,112;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=5,18;RU=G;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.313:15:6,1:4,0:10,0,0,5
chr6	1726623	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=157,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:6,1:6,1:10,2,2,0
chr6	1742908	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	2624262	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=147,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.192:19:8,2:7,1:7,9,2,1
chr6	2624374	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=185,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,1:2,6:0,4,1,6
chr6	2683439	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	2685518	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=143,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:5,6,0,2
chr6	2685677	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=38.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,9,2
chr6	2685904	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=180,249;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	2689217	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,33;MFRL=142,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,2:3,1:3,6,0,3
chr6	2766465	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr6	2766727	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=196,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:0,6,0,6
chr6	2766779	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	2769205	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,2:0,7:0,0,0,9
chr6	2779680	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:9,2:7,0:7,10,1,1
chr6	2785563	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=141,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	2834265	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=362,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,2:0,4:0,1,0,8
chr6	2836266	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=191,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=27.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:2,9:3,1:1,4,3,7
chr6	2838046	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=247,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,6:2,3:1,1,9,0
chr6	2838102	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=170,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.613:24:2,9:7,5:6,3,10,5
chr6	2838248	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=179,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,6:1,4:0,1,4,6
chr6	2900762	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=157,67;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,6:0.204:32:10,0:16,6:9,17,2,4
chr6	2948614	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=157,126;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.486:29:6,7:8,7:7,8,7,7
chr6	2948965	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr6	2953252	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=203,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=45.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,16:0.710:22:4,12:2,4:3,3,11,5
chr6	2953445	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=175,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=38.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,9:1,3:0,1,4,8
chr6	2953496	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,1:2,1:0,9,0,2
chr6	2959420	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,0:5,7:6,3,4,3
chr6	3006821	.	CT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=158,104;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:13,2:6,1:7,14,1,2
chr6	3010459	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=254,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:1,2:2,5:0,3,1,6
chr6	3012725	.	TG	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=193,132;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.807:8:1,5:0,2:1,0,5,2
chr6	3019654	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=364,123;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	3078266	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	3081134	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=218,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:1,1,2,0
chr6	3085690	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=145,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	3118947	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=342,160;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,3:0,2:1,0,5,0
chr6	3156285	.	CTCA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,145;MMQ=40,27;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:2,6,0,2
chr6	3157579	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=208,322;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:3157579_G_C:3157579:2,0,1,0
chr6	3157584	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,12;MFRL=208,322;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:3157579_G_C:3157579:2,0,1,0
chr6	3157798	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	3157809	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=195,322;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0,2,0,1
chr6	3255416	.	CTGGTGGAAGTAGGATGTT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=168,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,2:0.089:32:11,2:12,0:18,12,1,1
chr6	3263830	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	3264101	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,3,6
chr6	3264502	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,11:0,15:0,0,11,15
chr6	3264526	.	CT	TC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=85.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,7,13
chr6	3264582	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	3284265	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=208,0;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr6	3285375	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=191,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:2,10,2,0
chr6	3723764	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=186,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,3:0,7:1,0,10,0
chr6	3739193	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=206,74;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr6	3983633	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=155,37;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:6,0:8,2:0|1:3983633_A_T:3983633:5,9,1,1
chr6	3983636	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=155,37;MMQ=60,57;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,0:7,2:0|1:3983633_A_T:3983633:5,9,1,1
chr6	4021554	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=37.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,5:0,0,12,0
chr6	4033065	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,264;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	4037582	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:3,0,4,1
chr6	4040924	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=231,194;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:5,0,5,0
chr6	4044297	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=124,221;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.695:11:3,6:0,2:1,2,1,7
chr6	4044344	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=199,198;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=39.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:1,7:1,4:0,2,0,11
chr6	4049422	.	TG	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr6	4052167	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=178,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.626:6:2,2:0,2:0|1:4052167_C_A:4052167:1,1,3,1
chr6	4052171	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=141,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,2:0.331:7:2,2:3,0:1|0:4052167_C_A:4052167:3,2,1,1
chr6	4052383	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=97,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:1,4:3,5:1,3,2,7
chr6	4057200	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=151,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:1,2,5,2
chr6	4057233	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,224;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,2:4,4:3,5,4,2
chr6	4057429	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=194,231;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,6:2,1:0,3,3,4
chr6	4070133	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=123,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:7,0:5,3:7,5,2,1
chr6	4074612	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=249,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,5,2
chr6	4119516	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=144,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,2:8,1:10,6,1,2
chr6	4119553	.	ATT	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=15,22;MFRL=181,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,0:2,1:1,5,0,2
chr6	4122249	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=161,99;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.479:27:7,6:7,7:6,8,8,5
chr6	4936074	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,1:0,5:0,0,0,7
chr6	4937728	.	C	CA,CAA	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=35,32,31;MFRL=190,192,185;MMQ=60,60,60;MPOS=14,27;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.05,6.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,3:0.332,0.332:9:2,1,1:0,2,2:3,0,5,1
chr6	4937742	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,19;MFRL=265,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=41.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:1,2:3,3:0|1:4937742_C_CT:4937742:4,0,8,3
chr6	4937747	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=265,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,11:0.706:15:1,4:3,6:0|1:4937742_C_CT:4937742:4,0,8,3
chr6	4952413	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	5000027	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.262:21:7,2:8,3:11,5,4,1
chr6	5000779	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=118,84;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.202:21:8,1:8,2:9,8,2,2
chr6	5086070	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	5260816	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	5431883	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=125,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.225:29:14,1:9,5:13,10,2,4
chr6	5431960	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=245,133;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:1,3:1,9:2,0,3,9
chr6	5545654	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	5831924	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=43.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.687:17:1,4:3,8:4,1,10,2
chr6	5832125	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,4:0,6:0,1,1,9
chr6	6152137	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=33,32;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:6,3:8,3:0|1:6152137_C_G:6152137:6,8,3,3
chr6	6152140	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=189,155;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.317:20:6,3:8,3:0|1:6152137_C_G:6152137:6,8,3,3
chr6	6152211	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:2,1:9,2:4,7,0,3
chr6	6167621	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,3:0,0,6,1
chr6	6174786	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,4:0,0,7,5
chr6	6196141	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,154;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.305:21:6,4:8,2:5,10,1,5
chr6	6588881	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=214,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr6	7229470	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=250,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:6,4,1,1
chr6	7232186	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	7240577	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=177,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,2,0
chr6	7240876	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,276;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:15,3:7,0:5,17,0,3
chr6	7295605	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,3:3,1:5,2,3,1
chr6	7295755	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=241,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:0,6,0,3
chr6	7298287	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,1:2,3:0,2,1,3
chr6	7301834	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=270,271;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	7303735	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=142,214;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:1,3:9,2:8,2,5,0
chr6	7313406	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:0,7,0,2
chr6	7330194	.	T	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	7368917	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=263,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,4:1,1:0,2,3,2
chr6	7373249	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,1:0,3:0,0,5,0
chr6	7373537	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=230,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,1:6,3:4,4,1,3
chr6	7374207	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=136,134;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,2:9,0:7,7,1,1
chr6	7378899	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=171,30;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,2:6,0:10,4,1,1
chr6	7379346	.	A	ATCCCCAGTACCTGGAATAGT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=193,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	7387433	.	T	TA	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=201,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.723:9:1,6:1,1:0,2,3,4
chr6	7387462	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=241,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,8:1,0:0,3,0,8
chr6	7390369	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=274,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=71.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.844:30:2,14:2,11:1,3,6,20
chr6	7396836	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,4:3,2:4,0,6,0
chr6	7396887	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=171,293;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,3:5,2:9,3,3,2
chr6	7401382	.	AAAAC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	7402835	.	GG	AA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=181,39;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:7,2:6,0:11,2,0,2
chr6	7404756	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=197,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.246:18:2,2:12,2:6,8,1,3
chr6	7410735	.	GTT	G,GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,23,34;MFRL=146,152,84;MMQ=60,60,31;MPOS=23,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.68,5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,3:0.185,0.248:13:6,1,0:2,0,2:2,6,0,5
chr6	7411750	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=161,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	7413094	.	AT	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=143,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.210:22:9,4:6,0:14,4,4,0
chr6	7414657	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=165,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,5:2,4:1,2,0,9
chr6	7564139	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=254,169;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,2:0,3:0,3,0,5
chr6	7567970	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=192,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:1,4:0,5:0,1,8,1
chr6	7571874	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=299,198;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:0,5:1,1:0,1,0,6
chr6	7574805	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=176,247;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	7574852	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=154,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:9,2,2,0
chr6	7578189	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr6	7578819	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=52.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0|1:7578819_T_G:7578819:0,0,2,10
chr6	7578823	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,13:0.935:13:0,3:0,9:0|1:7578819_T_G:7578819:0,0,2,11
chr6	7579412	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	7585670	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=166,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,14:0.405:35:9,7:12,7:8,13,8,6
chr6	7590484	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=183,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.318:13:4,1:5,2:8,1,4,0
chr6	7590624	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,261;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:10,2:3,1:5,8,0,3
chr6	7590653	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=163,244;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:9,3:3,2:3,9,0,5
chr6	7595241	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=62,120;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.250:17:8,1:5,3:10,3,4,0
chr6	7606384	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.124:38:21,4:12,0:17,17,4,0
chr6	7879407	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:2,7:8,1:4,6,3,5
chr6	8016089	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=202,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,3:3,2:0,4,0,5
chr6	8016157	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=228,173;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	8026577	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=226,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:1,1:3,4:2,2,5,1
chr6	8428071	.	CAT	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.464:13:2,3:5,1:7,0,6,0
chr6	8428137	.	A	AAGT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:5,0:6,3:8,3,2,2
chr6	8430396	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=148,125;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:10,2:6,4:4,12,3,3
chr6	9900599	.	T	TGAG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=140,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=54.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:1,7:5,7:5,1,9,5
chr6	10402438	.	C	CAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=185,266;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr6	10411775	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=118,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:14,0:6,3:16,4,3,0
chr6	10529087	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	10587038	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,7:0,11:0,0,8,10
chr6	10634216	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,123;MMQ=60,48;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,0:5,5:4,8,0,5
chr6	10634953	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,22;MFRL=230,235;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:2,0:0|1:10634953_T_C:10634953:0,3,0,1
chr6	10634956	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,22;MFRL=248,235;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0|1:10634953_T_C:10634953:0,2,0,1
chr6	10634960	.	AT	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,248;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	10687746	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=162,63;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,3:4,1:8,3,3,1
chr6	10695136	.	GTT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,240;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	10724943	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=112,206;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=38.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.861:12:1,7:0,4:0,1,1,10
chr6	10729020	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,51;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	10756854	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=195,142;MMQ=55,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:2,1:4,1:0|1:10756854_C_T:10756854:0,6,0,3
chr6	10756875	.	GAC	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=202,142;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:0|1:10756854_C_T:10756854:0,4,0,3
chr6	10764727	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=241,154;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:1,6:5,2:3,3,3,5
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chr6	10802101	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=219,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.789:12:1,1:1,9:1,1,6,4
chr6	10875238	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	10876036	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:3,0,3,0
chr6	10887253	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:2,2:2,0,4,1
chr6	10887276	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=186,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,4:2,1:2,0,3,2
chr6	10891651	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=30,30,32,27;MFRL=173,213,216,169;MMQ=60,60,60,60;MPOS=20,5,5;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=20,17,18,19;RU=T;STR;TLOD=12.76,8.40,3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,10,5,3:0.388,0.251,0.160:22:4,6,4,3:0,4,1,0:4,0,18,0
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chr6	10891677	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=17,15;MFRL=201,214;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.281:25:2,0:3,0:0|1:10891677_G_T:10891677:18,0,7,0
chr6	10891687	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=14,15;MFRL=176,192;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.272:23:2,1:1,1:0|1:10891677_G_T:10891677:16,1,6,0
chr6	10891781	.	C	T	.	.	DP=57;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=171.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,55:0.983:55:0,26:0,29:0,0,36,19
chr6	10894255	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=20,26;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:8,5:6,4:8,6,3,6
chr6	10894268	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=157,162;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.372:17:4,4:6,2:5,6,1,5
chr6	10894381	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=204,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,1:7,1:6,5,0,2
chr6	10898944	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=155,125;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:1,0:4,2:4,1,2,0
chr6	10906154	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=152,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:2,0,4,0
chr6	10927692	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,57;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	10931587	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	10942994	.	CTTT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=231,106;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.575:5:1,1:1,1:1,1,1,2
chr6	10961649	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=133,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:8,1,0,3
chr6	10989873	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=178,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.385:13:3,4:5,1:4,4,5,0
chr6	10990493	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=235,262;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,1:3,1:2,1,2,0
chr6	11005842	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=197,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:1,1:6,2:0,7,0,3
chr6	11094681	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,17;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:1,0:1,1:0,2,0,3
chr6	11185967	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=182,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.558:7:1,0:2,4:0,3,0,4
chr6	11191325	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,6:5,0:0|1:11191325_C_A:11191325:3,5,6,0
chr6	11191328	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:3,6:5,0:0|1:11191325_C_A:11191325:3,5,6,0
chr6	11192575	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=103,113;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,13:0.483:27:3,6:11,7:4,10,3,10
chr6	11306153	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=144,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:4,4:10,3:13,1,6,1
chr6	11538534	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=194,263;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,2,1
chr6	11714806	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=163,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:3,5:3,5:1,5,2,8
chr6	11723538	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.654:9:2,4:0,2:3,0,5,1
chr6	11779088	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.816:9:1,6:0,1:0,1,0,8
chr6	12016009	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,7:0,0,1,9
chr6	12120090	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=178,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:3,5:1,5:4,0,5,5
chr6	12122854	.	A	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=191,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.422:24:8,10:6,0:10,4,10,0
chr6	12123232	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:9,1:6,1:10,5,0,2
chr6	12124870	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=167,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.334:19:8,4:5,2:7,6,4,2
chr6	12290892	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=177,36;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:4,2:10,0:9,5,1,1
chr6	12294137	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=157,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:4,6,3,1
chr6	13182685	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,0:1,3:5,0,3,0
chr6	13182995	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=190,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr6	13228008	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,71;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,0:2,2:6,2,1,1
chr6	13278648	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,10:0,4:0,0,1,13
chr6	13287388	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,0:7,5:0,10,0,5
chr6	13307824	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=158,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:7,1:10,3:7,10,3,1
chr6	13316780	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.404:8:1,1:4,2:3,2,3,0
chr6	13321097	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=207,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,4:7,2:8,1,6,0
chr6	13365913	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	13470113	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.945:15:0,8:0,7:0,0,12,3
chr6	13470428	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:10,0:13,2:15,8,0,2
chr6	13592135	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,91;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:11,2:6,3:8,9,2,3
chr6	13612061	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:12,0:12,2:0|1:13612061_A_T:13612061:9,15,1,1
chr6	13612068	.	GC	CG	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=133,61;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:13612061_A_T:13612061:8,14,1,1
chr6	13612071	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=135,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:9,0:11,2:0|1:13612061_A_T:13612061:8,15,1,1
chr6	13612075	.	A	ATTTTTCAGAATCAGGTTT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=25,20;MFRL=130,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:0|1:13612061_A_T:13612061:6,14,1,1
chr6	13616712	.	A	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=149,213;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:6,0:12,2:10,9,1,1
chr6	13620877	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=260,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:2,1,2,0
chr6	13622567	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=187,199;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:10,2,3,0
chr6	13800626	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,7;RU=A;STR;TLOD=47.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.935:12:0,10:0,2:0,0,4,8
chr6	13977698	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=200,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,2:8,2:6,9,3,1
chr6	13978802	.	TCTC	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=147,108;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=5.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.217:17:7,2:7,1:7,7,1,2
chr6	13978837	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=147,164;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:5,1:6,6,1,1
chr6	14118138	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,174;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:2,3,1,2
chr6	14133863	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=190,79;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:4,2:9,0:9,4,2,0
chr6	14134083	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,218;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	15246896	.	CT	AG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=167,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:4,4:2,4:1,5,1,7
chr6	15246915	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=182,218;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,2:1,4:0,5,0,6
chr6	15374508	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=50.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,7:0,7:0,0,4,11
chr6	15374544	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=169,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr6	15410647	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=177,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:2,2:8,4:0,10,0,6
chr6	15468722	.	AGGGTGAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=161,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.447:7:0,2:3,1:4,0,3,0
chr6	15497422	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=156,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.464:15:1,4:7,2:3,5,4,3
chr6	15501726	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=113,357;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr6	15507560	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=160,309;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:9,3:9,2:9,9,1,4
chr6	15511429	.	C	CCCAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=237,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:2,0,7,0
chr6	15513399	.	CGT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GT;STR;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.679:4:1,1:0,2:0,1,1,2
chr6	15523388	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=188,105;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:7,1:11,8:7,11,5,4
chr6	15593240	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=272,133;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=86.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,26:0.902:28:1,14:1,12:2,0,19,7
chr6	15638067	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	15638085	.	A	AGG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=196,173;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.395:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	15651642	.	GAA	G,GAAA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=11,26,26;MFRL=154,176,187;MMQ=60,60,60;MPOS=32,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=A;STR;TLOD=4.06,5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.221,0.192:9:0,0,0:0,1,1:0,5,1,3
chr6	15651657	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=159,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.185:14:5,0:5,0:1,11,1,1
chr6	15652452	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=195,218;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:0,4,0,3
chr6	16145325	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=248,82;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:4,4:7,6:7,4,4,6
chr6	16274791	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=239,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:0,3,0,3
chr6	16279189	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=212,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:0,5,2,2
chr6	16290862	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.301:15:6,4:2,0:3,8,2,2
chr6	16290889	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=182,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:7,2:1,0:1,7,0,2
chr6	16306579	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=205,61;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:3,0,2,0
chr6	16306977	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=229,217;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,2:3,1:3,4,1,2
chr6	16328240	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:11,7,2,0
chr6	17541460	.	A	ATGC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=122,173;MMQ=60,49;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:17541460_A_ATGC:17541460:0,4,0,1
chr6	17541461	.	A	AAGAG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=149,173;MMQ=60,49;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17541460_A_ATGC:17541460:0,3,0,1
chr6	17541464	.	A	AATAGCCAATCAGAAGCC	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=149,173;MMQ=60,49;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:17541460_A_ATGC:17541460:0,3,0,1
chr6	17543036	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=145,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:2,1,2,0
chr6	17600619	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr6	17602797	.	CT	C,CTT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32,31;MFRL=166,120,120;MMQ=60,60,60;MPOS=6,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=T;STR;TLOD=4.84,4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,3,3:0.250,0.241:13:4,2,0:3,1,2:7,0,5,1
chr6	17605106	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=120,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:2,3,1,2
chr6	17616256	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=213,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr6	17616493	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	17633061	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,3,4
chr6	17675386	.	GAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.307:14:2,2:3,1:6,4,3,1
chr6	17764731	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=167,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,4:7,2:9,6,2,4
chr6	17777614	.	CT	C,CTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=21,32,32;MFRL=116,234,156;MMQ=60,60,58;MPOS=7,29;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,16;RU=T;STR;TLOD=4.50,4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,4,2:0.342,0.210:11:0,2,0:3,2,1:1,4,0,6
chr6	17779731	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=167,167;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:2,3:5,2:7,0,5,0
chr6	17785948	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr6	17790191	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,0:6,3:0,11,1,2
chr6	17799766	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	17800131	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=158,244;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:6,1,3,0
chr6	17804730	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=137,108;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:2,2:6,2:1,7,4,0
chr6	17809168	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=145,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,3:4,0:2,4,0,3
chr6	17809199	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	17817235	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,4:0,0,8,3
chr6	17817472	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=125,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.146:25:10,3:12,0:8,14,0,3
chr6	17817506	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=113,149;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,5:4,0:0,8,2,3
chr6	17834316	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=141,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr6	17834328	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=141,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,1,1
chr6	17834346	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=71,269;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr6	17837242	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,141;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:13,2:9,0:11,11,2,0
chr6	17852169	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=158,115;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.382:13:2,2:6,3:2,6,4,1
chr6	17855864	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr6	17856364	.	AG	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=27,26;MFRL=164,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.177:15:4,1:8,1:0|1:17856364_AG_A:17856364:4,9,0,2
chr6	17856371	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=163,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:4,1:6,1:0|1:17856364_AG_A:17856364:4,8,0,2
chr6	17856373	.	TT	AA	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=169,164;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:4,1:6,1:0|1:17856364_AG_A:17856364:3,7,0,2
chr6	17898423	.	G	GA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=138,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.189:20:6,1:11,2:6,11,1,2
chr6	18122506	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=205,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr6	18134021	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=127,145;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.441:14:2,2:5,4:4,4,4,2
chr6	18139214	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=136,118;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.369:25:6,4:10,5:9,7,6,3
chr6	18139802	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=235,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,5:4,2:6,1,7,0
chr6	18139964	.	GA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=167,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.302:18:6,2:5,3:4,9,1,4
chr6	18143769	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=161,236;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,1,1
chr6	18148019	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,140;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,2:5,6:10,2,7,1
chr6	18148155	.	GAA	G,GA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=138,210,152;MMQ=60,60,60;MPOS=14,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.26,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:13,2,4:0.128,0.227:19:5,1,1:5,1,2:2,11,1,5
chr6	18148247	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=246,167;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr6	18161706	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=123,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.382:8:3,0:2,2:0,5,0,3
chr6	18171684	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:5,3:6,0:4,7,2,1
chr6	18197475	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=139,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	18208319	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=198,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=25.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,6:1,2:1,1,7,1
chr6	18212794	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=131,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:8,0:6,2:3,11,1,1
chr6	18213988	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=145,209;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:10,1:5,4:7,8,1,4
chr6	18218068	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=113,151;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:9,9,1,1
chr6	18222102	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=119,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=T;STR;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:0,0:5,2:3,2,2,0
chr6	18226340	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=173,173;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:2,4:3,4:5,0,7,1
chr6	18256625	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=152,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:9,1:12,2:10,11,3,0
chr6	18258516	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:9,4:4,7:8,5,9,2
chr6	18399750	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,7:0,0,7,3
chr6	18399809	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=189,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,2:6,3:3,5,3,2
chr6	18427753	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=164,156;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr6	18439876	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=158,133;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.193:22:9,3:8,0:13,5,4,0
chr6	18459736	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=215,182;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,3:3,2:4,0,5,0
chr6	18463633	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,3:3,1:1,4,0,4
chr6	19837966	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19837966_T_C:19837966:0,0,1,0
chr6	19837969	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:19837966_T_C:19837966:0,0,1,0
chr6	20110043	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=198,125;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0,6,1,3
chr6	20118580	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=191,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:5,0,2,0
chr6	20124860	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=176,299;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:1,1,1,1
chr6	20128852	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,71;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,1,1
chr6	20131499	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=166,193;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:8,2:2,0:1,10,0,2
chr6	20144637	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,1,4
chr6	20212410	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=193,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:8,4:8,5:6,10,2,7
chr6	20212493	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=179,286;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,1:3,2:4,3,0,3
chr6	20481614	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=129,114;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,0:8,2:9,6,0,2
chr6	20483165	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=181,188;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,2:7,1:5,8,3,0
chr6	20490390	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=114,130;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.660:7:1,1:1,3:2,0,3,2
chr6	20546826	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=149,196;MMQ=40,54;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr6	20548781	.	CTC	AAA	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=13,15;MFRL=172,219;MMQ=60,46;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:0,0:1,0:0|1:20548781_CTC_AAA:20548781:4,1,2,0
chr6	20548791	.	C	T,A	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=24,20,23;MFRL=158,174,219;MMQ=60,50,46;MPOS=23,14;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.65,6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,2:0.250,0.250:9:0,0,0:2,1,1:4,1,4,0
chr6	20548793	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=23,10;MFRL=174,219;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,0:3,0:0|1:20548781_CTC_AAA:20548781:5,1,2,0
chr6	20548795	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,21;MFRL=172,219;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:0,0:3,1:0|1:20548781_CTC_AAA:20548781:4,1,2,0
chr6	20649552	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=167,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,1:4,8:3,3,4,5
chr6	20739694	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,22;MFRL=166,173;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,3:0,0:4,1,3,0
chr6	20758704	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=331,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,4:1,3:1,0,7,0
chr6	20758760	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=146,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.369:17:8,2:3,4:10,1,5,1
chr6	20758943	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=37.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	21108529	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr6	21231034	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=193,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,2:2,0:2,1,2,0
chr6	21595266	.	G	GGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=215,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=GGC;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	21595776	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=233,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:1,0,2,0
chr6	21596349	.	ATC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=221,92;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:5,1:13,1:9,9,2,0
chr6	21596500	.	CA	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=200,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.484:10:2,3:2,2:3,2,5,0
chr6	21597192	.	GAA	G,GA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,34,25;MFRL=109,169,138;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=A;STR;TLOD=3.75,5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:26,3,4:0.102,0.142:33:10,1,2:8,2,0:12,14,2,5
chr6	21597753	.	CT	C	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=19,20;MFRL=219,229;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.505:21:5,2:0,5:6,4,0,11
chr6	21597776	.	AG	TT	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=27,15;MFRL=99,181;MMQ=60,42;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,2:0.075:38:13,0:19,0:0|1:21597776_AG_TT:21597776:4,32,2,0
chr6	21597780	.	G	T	.	.	DP=39;ECNT=6;MBQ=32,21;MFRL=79,181;MMQ=60,42;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,2:0.073:39:14,1:21,0:0|1:21597776_AG_TT:21597776:4,33,2,0
chr6	21597783	.	G	T	.	.	DP=43;ECNT=6;MBQ=33,22;MFRL=79,181;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:41,2:0.067:43:13,1:22,0:0|1:21597776_AG_TT:21597776:5,36,2,0
chr6	21597790	.	A	C	.	.	DP=49;ECNT=6;MBQ=26,14;MFRL=88,181;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:19,0:26,0:0|1:21597790_A_C:21597790:6,41,2,0
chr6	21597792	.	G	C	.	.	DP=50;ECNT=6;MBQ=32,12;MFRL=88,181;MMQ=60,42;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,2:0.059:49:20,0:27,0:0|1:21597790_A_C:21597790:6,41,2,0
chr6	21597906	.	G	GTTTTCAATAAAATT	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.148:31:17,0:9,4:0|1:21597906_G_GTTTTCAATAAAATT:21597906:11,16,0,4
chr6	21597910	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=157,155;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.149:31:18,0:9,4:0|1:21597906_G_GTTTTCAATAAAATT:21597906:11,16,0,4
chr6	22571825	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=135,70;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,1:6,1:8,8,1,1
chr6	24174928	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=122,108;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,3:8,0:7,9,2,1
chr6	24174955	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=131,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:7,3:3,7:5,5,4,6
chr6	24205292	.	T	TTCTGTTATG	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=157,53;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,2:9,0:0|1:24205292_T_TTCTGTTATG:24205292:10,8,1,1
chr6	24205295	.	C	CTTTGTCCTGGG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=154,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,2:10,0:0|1:24205292_T_TTCTGTTATG:24205292:11,8,1,1
chr6	24205296	.	A	AACCT	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,23;MFRL=154,53;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.126:21:8,1:11,0:0|1:24205292_T_TTCTGTTATG:24205292:11,8,1,1
chr6	24205476	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,13;MFRL=224,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.350:12:3,0:3,1:2,6,4,0
chr6	24278200	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=37,32;MFRL=195,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	24302087	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=63.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,10:0,10:0,0,8,12
chr6	24358356	.	GCA	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=CA;STR;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.276:16:4,2:8,2:7,5,1,3
chr6	24358483	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,13:0,7:0,0,5,15
chr6	24403549	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=268,272;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0|1:24403549_C_A:24403549:0,2,0,2
chr6	24403559	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=305,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:24403549_C_A:24403549:0,1,0,2
chr6	24405357	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=199,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,6:0,4:1,0,6,4
chr6	24412555	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:12,3:7,0:8,11,0,3
chr6	24415380	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,259;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:3,10,1,2
chr6	24416562	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=219,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.821:9:1,6:0,2:1,0,8,0
chr6	24416593	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=189,149;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=41.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.869:13:1,7:0,5:0,1,10,2
chr6	24418835	.	T	TG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=239,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=G;STR;TLOD=21.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.670:10:3,5:0,2:0|1:24418835_T_TG:24418835:0,3,2,5
chr6	24418854	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,23;MFRL=239,95;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:3,3:0,1:0|1:24418835_T_TG:24418835:0,3,1,4
chr6	24418878	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=210,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0|1:24418835_T_TG:24418835:0,1,0,3
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chr6	24437611	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,289;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0,4,0,2
chr6	24445718	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=43.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,8,6
chr6	24448061	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	24448459	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=140,192;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.237:15:7,2:4,1:7,5,0,3
chr6	24450168	.	G	GCCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=147,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CCT;STR;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.730:9:1,1:1,6:0,2,1,6
chr6	24456902	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=173,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr6	24460679	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr6	24460707	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	24463020	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=285,92;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:0,5:3,8:1,2,9,4
chr6	24463055	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=284,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.825:15:1,5:1,8:0,2,2,11
chr6	24463059	.	ACTT	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=281,144;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=30.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:3,4:3,4:2,4,0,8
chr6	24467060	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=161,255;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,1:8,2:8,5,3,0
chr6	24467366	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,2:8,1:9,3,2,1
chr6	24475278	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=229,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0|1:24475278_G_A:24475278:1,0,2,0
chr6	24475300	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=200,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0|1:24475278_G_A:24475278:3,2,2,0
chr6	24475517	.	TATTA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	24476553	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=141,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr6	24480025	.	CAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=182,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AT;STR;TLOD=6.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr6	24505030	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=87,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:4,1,5,0
chr6	24505196	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=148,96;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:8,1:4,1:3,9,0,2
chr6	24515330	.	CTT	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,32;MFRL=113,121;MMQ=56,48;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=19,17;RU=T;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:2,0:0,1:3,0,1,0
chr6	24515350	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,12;MFRL=163,126;MMQ=60,55;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.516:11:1,0:3,1:1,4,6,0
chr6	24515364	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=103,150;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.168:16:5,1:6,1:5,9,2,0
chr6	24515371	.	C	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=33,23;MFRL=95,150;MMQ=60,51;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:6,0:9,1:5,12,2,0
chr6	24547606	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=172,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr6	24547646	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24547646_G_A:24547646:0,4,0,1
chr6	24547650	.	T	C,TATTTCA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=31,27,29;MFRL=202,172,130;MMQ=60,60,60;MPOS=21,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.92,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.375,0.250:5:1,2,0:1,0,1:0,2,0,3
chr6	24547652	.	TGA	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=183,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:24547646_G_A:24547646:0,4,0,1
chr6	24551624	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:6,4,2,0
chr6	24554762	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,102;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,0:6,5:5,5,3,2
chr6	24578272	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=176,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,5:2,1:6,0,4,2
chr6	24580036	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=209,132;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,0:3,6:4,0,5,1
chr6	24580185	.	C	CA	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=145,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=9.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.360:15:3,3:7,2:4,6,0,5
chr6	24582419	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=156,92;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:8,2:9,0:16,1,2,0
chr6	24583804	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=181,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:3,1:5,2:7,1,2,1
chr6	24651320	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:3,1:3,4,0,3
chr6	24666739	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=218,187;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:2,2:7,5:3,6,6,1
chr6	24667404	.	GTCC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,37;MFRL=275,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCC;STR;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:2,3:0,0:2,0,3,0
chr6	24667662	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=200,199;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:0,11,0,2
chr6	24687765	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,251;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	24687933	.	A	ATTT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=93,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=23,26;RU=T;STR;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.611:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	24687999	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,36;MFRL=165,232;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:0,4,0,3
chr6	24698215	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=110,90;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:11,1:10,3:10,11,2,2
chr6	24714690	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:3,4:4,2:2,5,1,5
chr6	24784575	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=275,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:8,5,2,0
chr6	24806594	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=123,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.384:19:7,4:4,3:6,6,6,1
chr6	24806739	.	C	CTT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=34,36;MFRL=169,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,0:3,4:1,5,1,3
chr6	24806752	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=25,36;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:0,3,1,3
chr6	24806777	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=171,256;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr6	24809853	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	24809874	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=30,32;MFRL=259,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr6	24809881	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,3:0,0,6,0
chr6	24828318	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=32.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,10,2
chr6	24828560	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.534:13:3,4:3,3:1,5,0,7
chr6	24828566	.	CCATT	C,CCATTCATT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32,35;MFRL=0,192,276;MMQ=60,60,60;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=5,4,6;RU=CATT;STR;TLOD=29.33,9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,8,3:0.603,0.323:11:0,4,1:0,3,2:0,0,1,10
chr6	24830651	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=180,159;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	24836161	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:3,6:0,6:0,3,0,12
chr6	24843174	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=162,1210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:9,3:7,0:7,9,1,2
chr6	24843231	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=175,62;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.194:13:5,0:6,2:8,3,1,1
chr6	24843334	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,23;MFRL=188,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:7,2:3,3:6,4,2,3
chr6	24852962	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=143,126;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.753:9:0,4:1,2:0,2,0,7
chr6	24861285	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=159,163;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:14,0:8,2:10,12,2,0
chr6	24869300	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=226,172;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,20:0.779:25:2,6:3,14:4,1,10,10
chr6	24871021	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=214,203;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	24871032	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=183,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,1:4,1:4,1,1,1
chr6	24871197	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,24;MFRL=110,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.630:9:1,1:2,4:1,2,2,4
chr6	25084691	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:5,4,6,4
chr6	25084718	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=140,191;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,7:3,4:3,4,7,4
chr6	25086968	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=23,29;MFRL=127,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.819:9:0,3:1,5:1,0,6,2
chr6	25092031	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=131,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:3,0,5,0
chr6	25092335	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=211,262;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:0,3:3,2:0,3,0,5
chr6	25097450	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=138,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=23.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,4:4,3:2,3,0,7
chr6	25106745	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=146,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,7:0,2:0,1,3,6
chr6	25106783	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=232,176;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,5:1,4:0,1,1,8
chr6	25108885	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,35;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:12,0:18,2:17,14,1,1
chr6	25108989	.	AC	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=210,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:25108989_AC_A:25108989:0,2,0,4
chr6	25108991	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=210,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0|1:25108989_AC_A:25108989:0,2,0,4
chr6	25115176	.	CGTTTTT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=205,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTTTTT;STR;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:3,1:3,1:5,2,2,0
chr6	25115397	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0,5,0,3
chr6	25279896	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=187,220;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,3:2,0:8,1,3,0
chr6	25280119	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=124,225;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:9,7:3,4:2,10,3,8
chr6	25426640	.	ATTT	A,AT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32,29;MFRL=237,127,117;MMQ=60,60,60;MPOS=11,8;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.29,5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.303,0.476:6:1,2,2:0,0,1:1,0,5,0
chr6	25450026	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=280,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.805:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr6	25450595	.	T	TA	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=135,109;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,2:0.071:40:21,0:17,2:17,21,0,2
chr6	25450952	.	CTTCCTTCT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=190,235;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:2,2:3,1:0,5,1,2
chr6	25472600	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=159,148;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:6,0,2,0
chr6	25491979	.	C	T	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,19;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.076:37:23,0:11,1:0|1:25491979_C_T:25491979:18,17,1,1
chr6	25491984	.	C	CCTTCTATTCTATG	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=125,51;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,2:0.077:37:23,0:12,2:0|1:25491979_C_T:25491979:17,18,1,1
chr6	25492296	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,6:0,7:0,0,2,11
chr6	25492354	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=215,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:0,12,0,2
chr6	25492364	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=219,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,4:4,0:0,8,0,4
chr6	25510648	.	TA	CA,CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32,32;MFRL=0,155,222;MMQ=60,60,60;MPOS=24,11;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.88,4.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,6,2:0.644,0.273:8:0,1,0:0,5,2:0,0,8,0
chr6	25511008	.	C	CAT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=142,164;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:6,0:9,2:6,9,1,1
chr6	25516126	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=172,273;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:1,7,1,1
chr6	25516158	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr6	25554148	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=166,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr6	25554180	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	25557121	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,17;MFRL=164,184;MMQ=60,50;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.181:14:5,0:4,0:7,5,0,2
chr6	25557132	.	GT	G,TT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,14,16;MFRL=0,164,180;MMQ=60,60,60;MPOS=22,24;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.54,5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,4:0.478,0.370:6:0,0,1:0,0,0:0,0,0,6
chr6	25581060	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=149,261;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	25581453	.	T	G	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=180,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=61.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,18:0.543:33:10,18:5,0:10,5,18,0
chr6	25600763	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=172,63;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.126:29:10,0:16,3:16,10,1,2
chr6	25600931	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:11,0:13,2:18,6,2,0
chr6	25600968	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:1,1:8,2:4,5,2,1
chr6	25610203	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=184,88;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr6	25619581	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=187,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	25652568	.	AG	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=218,136;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=11.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:4,0,4,0
chr6	25661887	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,3:2,6:0,3,2,7
chr6	25669833	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=198,84;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:5,1:4,1:3,6,1,1
chr6	25670143	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=170,160;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,8:5,0:7,0,8,0
chr6	25670304	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,71;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:6,3:12,0:7,12,2,1
chr6	25727355	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=173,75;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,2:3,0:5,2,0,2
chr6	25770707	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,85;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:4,1:3,2:4,4,1,2
chr6	25778055	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=170,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:6,0,2,0
chr6	25798932	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=283,198;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:2,0,2,0
chr6	25801057	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	25801252	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=210,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr6	25812069	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=233,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr6	25849779	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,326;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr6	25861811	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,2:5,0:0|1:25861811_T_G:25861811:5,6,2,0
chr6	25861818	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,2:6,0:0|1:25861811_T_G:25861811:5,7,2,0
chr6	25916165	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=219,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	25916176	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=22,33;MFRL=219,172;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	25924160	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=199,278;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:25924160_G_C:25924160:0,3,0,1
chr6	25924161	.	T	TTCACA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=199,278;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:1,0:2,1:0|1:25924160_G_C:25924160:0,3,0,1
chr6	26017598	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:11,3:21,1:17,15,3,1
chr6	26021813	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=210,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:2,5:1,6:3,0,11,0
chr6	26027456	.	T	TA	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=157,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.111:43:27,2:10,2:17,22,1,3
chr6	26031811	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,33;MFRL=166,268;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:10,0,2,0
chr6	26031868	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=133,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=36.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.555:25:7,5:4,9:10,1,13,1
chr6	26031950	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=146,140;MMQ=60,49;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:47,5:0.110:52:27,0:20,5:25,22,0,5
chr6	26031962	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=151,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,16:0.424:38:13,9:9,7:11,11,9,7
chr6	26033354	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,212;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:7,0:9,2:14,2,2,0
chr6	26033809	.	T	TAAG	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=187,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,20:0.565:35:5,14:8,6:0|1:26033809_T_TAAG:26033809:5,10,6,14
chr6	26033810	.	A	AAGT	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=149,243;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,6:0.189:35:14,5:14,1:1|0:26033809_T_TAAG:26033809:8,21,3,3
chr6	26091336	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=120,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,4:1,0:2,1,1,3
chr6	26091627	.	GC	AA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=139,71;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,3:12,0:10,12,2,1
chr6	26094367	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=153,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:2,6:4,7:5,1,8,5
chr6	26104096	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=205,99;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:5,0,1,1
chr6	26108282	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,4:7,6:4,8,7,3
chr6	26124243	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=246,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:3,7,1,3
chr6	26124430	.	C	T	.	.	DP=55;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,124;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,21:0.406:52:16,17:15,4:23,8,12,9
chr6	26184018	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=184,116;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=27.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,12:0.361:34:11,12:11,0:16,6,12,0
chr6	26189312	.	CC	GG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=158,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr6	26199014	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=191,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:10,1:10,2:17,3,3,0
chr6	26199524	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0,0,8,17
chr6	26200050	.	C	G	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=157,190;MMQ=52,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:43,3:0.083:46:23,1:20,2:20,23,1,2
chr6	26200083	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,171;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,21:0.540:39:7,10:10,11:12,6,7,14
chr6	26200256	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=175,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:0,5,0,5
chr6	26217728	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=183,158;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,5:3,2:0,4,0,7
chr6	26235300	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,124;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr6	26240624	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=210,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:6,1,6,1
chr6	26240649	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=266,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:4,3:3,8:5,2,10,1
chr6	26252336	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=196,145;MMQ=52,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.460:26:7,0:7,11:0,14,0,12
chr6	26271713	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=309,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:1,1:1,7:0,2,0,8
chr6	26368890	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=174,37462;MMQ=34,24;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=54.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,24:0.543:44:11,23:9,0:6,14,24,0
chr6	26370707	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=161,123;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:5,11:5,4:7,3,6,9
chr6	26370920	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=213,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:1,1:0,4,0,2
chr6	26373465	.	C	CTT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=169,176;MMQ=46,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=25,27;RU=T;STR;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.682:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	26373507	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=152,122;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:3,6,1,1
chr6	26373740	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=194,243;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,1:4,2:0,8,0,3
chr6	26374658	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=127,279;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:2,3,0,3
chr6	26385170	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=201,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:4,0,3,0
chr6	26385615	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=164,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:3,3:0,5,0,4
chr6	26391153	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,2:3,1:0,6,1,2
chr6	26391190	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=167,219;MMQ=60,55;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr6	26392515	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:10,0,1,1
chr6	26406122	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=133,92;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:9,0:10,2:13,7,0,2
chr6	26408253	.	C	CATCT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=210,66;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,2:0,0:0,3,1,1
chr6	26409729	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:3,6:15,5:13,5,6,5
chr6	26422260	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=205,225;MMQ=40,39;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:1,5:4,2:4,1,7,0
chr6	26422387	.	CCCT	C	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=169,49;MMQ=54,33;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CCT;STR;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.144:25:10,3:12,0:6,16,1,2
chr6	26423560	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=244,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,5:2,0:0,3,1,4
chr6	26428842	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:2,0:0,5:1,1,4,1
chr6	26463574	.	GG	TT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=134,254;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:8,5,0,2
chr6	26466389	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=245,161;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=47.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,11:0.857:12:1,7:0,4:0|1:26466389_G_A:26466389:0,1,1,10
chr6	26466392	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=245,148;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=76.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,21:0.917:22:1,16:0,5:0|1:26466389_G_A:26466389:0,1,1,20
chr6	26468660	.	G	A	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=102,149;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,19:0.426:45:16,11:9,8:9,17,9,10
chr6	26501424	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=197,224;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr6	26501471	.	AG	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=195,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,2:3,4:9,2,4,2
chr6	26501598	.	GTC	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=156,232;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.208:12:5,1:5,1:1,9,2,0
chr6	26501777	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=272,202;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,2:1,3:2,0,3,2
chr6	26505135	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,8,2
chr6	26545468	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=128,65;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:15,2:16,0:0|1:26545468_G_A:26545468:15,16,0,2
chr6	26545488	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=120,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,2:0.085:33:15,2:15,0:0|1:26545468_G_A:26545468:12,19,0,2
chr6	26545632	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=149,136;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,14:0.577:24:5,7:5,7:6,4,11,3
chr6	27114360	.	C	T	.	.	DP=58;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=172,243;MMQ=57,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,3:0.068:56:22,2:31,1:27,26,2,1
chr6	27114883	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=151,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,5:5,5:7,7,9,1
chr6	27216848	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	27219491	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=245,264;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	27220519	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=200,276;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:0,2:3,0:3,0,2,0
chr6	27424960	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	27440004	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=53.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,8:0,0,13,3
chr6	27775674	.	A	G	.	.	DP=64;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=110,222;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:56,5:0.095:61:29,3:27,2:31,25,1,4
chr6	27775697	.	G	C	.	.	DP=60;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=106,222;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:53,5:0.100:58:30,3:23,2:25,28,4,1
chr6	27778971	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=184,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.186:46:20,0:18,8:20,18,0,8
chr6	27858255	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:12,10:13,0:13,12,10,0
chr6	27879950	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=177,224;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:8,2:7,0:5,10,0,2
chr6	27879982	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:8,1:4,2:5,7,1,2
chr6	27880144	.	A	AACT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=164,134;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	28094731	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=158,272;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:8,0:5,2:2,11,0,2
chr6	28117338	.	T	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=118,118;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:17,0:8,4:6,19,0,4
chr6	28117443	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=144,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,2,1
chr6	28214698	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=116,177;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,1:5,1:8,2,2,0
chr6	28219826	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,3:2,2:0,5,0,5
chr6	28239681	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=106,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=32.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,4:0,5:0,1,7,2
chr6	28239915	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=191,164;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:10,1:8,2:10,8,2,1
chr6	28239932	.	T	TG	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=76.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,8:0,0,12,10
chr6	28254988	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=128,269;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:5,2:9,2:4,10,2,2
chr6	28255040	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=182,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr6	28265640	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=112,142;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr6	28268400	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,14;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,0:0,0,3,0
chr6	28268404	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=17,27;MFRL=290,203;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:0,2:1,0,2,0
chr6	28268420	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=20,15;MFRL=290,203;MMQ=60,50;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.602:3:0,0:1,0:1,0,2,0
chr6	28268452	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=200,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:0,1:3,0,4,0
chr6	28268484	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=203,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.297:11:6,3:2,0:8,0,2,1
chr6	28269501	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=145,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:4,11,1,1
chr6	28269791	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=148,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:3,3:11,2:9,5,2,3
chr6	28270047	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=144,285;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:7,0:8,4:8,7,1,3
chr6	28270064	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=143,140;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,2:6,4:2,6,3,3
chr6	28329037	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:6,1:4,2:8,2,2,1
chr6	28331094	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,22;MFRL=173,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.465:13:3,3:4,3:5,2,1,5
chr6	28331127	.	AA	GC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,9:0,8:0,0,7,10
chr6	28331252	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=244,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	28334079	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	28358975	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=145,145;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:5,10,0,3
chr6	28359073	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=182,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.298:18:4,3:9,2:9,4,2,3
chr6	28359307	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=182,13178970;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:12,0:5,2:7,10,0,2
chr6	28360744	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=153,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.207:27:15,5:7,0:10,12,5,0
chr6	28366262	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=180,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,1:2,3:0,4,0,4
chr6	28403225	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=41.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr6	28403603	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=60.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,14,2
chr6	28403629	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=175,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:9,1:4,2:10,3,2,1
chr6	28472253	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:5,2:3,8,1,2
chr6	28483482	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=147,141;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:4,4:5,9:2,7,4,9
chr6	28554543	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,212;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.538:9:2,1:2,3:0,4,0,5
chr6	28872446	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,252;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	28876509	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=157,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,4:3,4:6,3,4,4
chr6	28887903	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,78;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.175:32:16,0:11,5:13,14,5,0
chr6	28891176	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=153,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.144:19:9,2:7,0:4,13,0,2
chr6	28891458	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,2:1,3:0,2,0,5
chr6	28911802	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=77.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,14:0,0,9,18
chr6	28912076	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=158,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:5,2:5,6:4,6,2,6
chr6	28963248	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=190,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,2:1,6:0,1,2,6
chr6	29011927	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr6	29054717	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=156,90;MMQ=60,39;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,3:4,0:3,6,3,0
chr6	29054909	.	T	TTGTCTA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=166,60;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:5,2:5,0:3,7,1,1
chr6	29068690	.	ATTCT	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=188,267;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCT;STR;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.268:9:4,2:2,0:4,3,1,1
chr6	29068759	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:5,6:7,4:7,6,7,3
chr6	29069016	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=94,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:5,1:10,1:5,10,1,1
chr6	29069264	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=174,228;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:6,2:8,1:8,6,0,3
chr6	29069299	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=153,181;MMQ=60,53;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:5,5,3,2
chr6	29069337	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=174,179;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=24.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,5:2,4:1,3,4,5
chr6	29080344	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=154,0;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,1:9,2:6,7,2,1
chr6	29080349	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=156,77;MMQ=60,47;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,1:9,3:4,8,4,0
chr6	29080450	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,4:2,2:1,2,3,3
chr6	29080566	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,2:1,0:0,3,1,1
chr6	29141743	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=139,182;MMQ=50,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.870:9:0,2:0,6:0,1,4,4
chr6	29141772	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=107,201;MMQ=60,51;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,1:3,4:4,2,2,3
chr6	29142020	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=161,138;MMQ=60,52;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,1:5,1:5,4,0,2
chr6	29230683	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=174,125;MMQ=60,50;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:5,1,2,0
chr6	29231831	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=173,128;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:9,5:8,0:10,7,3,2
chr6	29274950	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:4,1:10,1:7,7,0,2
chr6	29323259	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=147,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,3:2,8:1,2,5,6
chr6	29323905	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=138,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:7,6,1,1
chr6	29342775	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=159,230;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:3,7,3,0
chr6	29364539	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:3,6,1,1
chr6	29364615	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:5,4:8,3:8,5,5,2
chr6	29364643	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=183,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:6,1:5,3:8,3,3,1
chr6	29364787	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=111,100;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=54.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:2,8:5,13:0,7,10,11
chr6	29364815	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=168,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:8,0:9,3:9,8,0,3
chr6	29364835	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=179,148;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:8,0:9,3:9,8,0,3
chr6	29364951	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=179,132;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:12,4:7,2:8,11,2,4
chr6	29365241	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=129,130;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,1:5,5:2,5,4,2
chr6	29365340	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=211,82;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,0:12,2:4,16,1,1
chr6	29394427	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	29395180	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,2:4,2:5,6,1,3
chr6	29407975	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=184,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.217:16:7,1:6,1:7,6,0,3
chr6	29408057	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=155,147;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,3:9,1:11,7,1,3
chr6	29408270	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,21;MFRL=174,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,0:1,5,0,2
chr6	29408528	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:5,6:3,5:4,4,4,7
chr6	29408554	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,6:7,3,4,4
chr6	29429765	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=163,208;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,2:7,1:5,7,2,1
chr6	29429785	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=124,226;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:5,1:12,1:9,8,2,0
chr6	29430865	.	CCAT	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=165,134;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAT;STR;TLOD=23.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:3,4:1,4,4,2
chr6	29430891	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=190,88;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.486:14:4,3:3,2:3,4,4,3
chr6	29431698	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,1:3,5:2,3,2,4
chr6	29454489	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,3,2
chr6	29455098	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=193,114;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,1:2,1:5,2,2,0
chr6	29455357	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=191,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.334:13:4,3:5,1:6,3,3,1
chr6	29523676	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,7:0,2:0,0,4,5
chr6	29523957	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=151,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,1:8,1:9,8,0,2
chr6	29555681	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,11,2
chr6	29555809	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=135,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:5,2:2,4:3,4,4,2
chr6	29555864	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=200,147;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,4:7,2:9,6,3,3
chr6	29571537	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=227,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:0,0:3,0:0|1:29571537_G_T:29571537:2,2,0,2
chr6	29571545	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=227,156;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,2:3,1:0|1:29571537_G_T:29571537:2,2,0,3
chr6	29576393	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=204,145;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:4,3,1,6
chr6	29580436	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=239,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,2,4
chr6	29581011	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,35;MFRL=226,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:4,5:1,7:3,2,5,7
chr6	29581041	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=30,35;MFRL=220,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=53.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:6,6:5,10:5,6,10,6
chr6	29581110	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.616:24:4,9:5,6:0|1:29581110_A_G:29581110:6,3,8,7
chr6	29581113	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=209,141;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=59.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.615:24:4,9:5,6:0|1:29581110_A_G:29581110:6,3,8,7
chr6	29590000	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=180,151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,1:6,4:3,8,0,5
chr6	29591225	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=112,169;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:13,0:5,6:5,13,0,6
chr6	29591864	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=232,56;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:5,2:1,2:1,5,1,3
chr6	29596808	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=215,99;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.439:23:6,7:7,3:11,2,3,7
chr6	29600054	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=236,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=50.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:5,12:2,6:5,2,7,11
chr6	29600104	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=214,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:3,7:4,3:4,4,2,8
chr6	29625001	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=34.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,8:1,3:0,1,7,4
chr6	29627222	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=222,106;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:4,2:4,2:5,3,2,2
chr6	29634012	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=62.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,7:0,11:0,0,10,9
chr6	29638434	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=214,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:2,1,5,0
chr6	29643232	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=177,60;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:29643232_T_A:29643232:9,6,1,1
chr6	29643256	.	A	ATATCATTT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=177,60;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:29643232_T_A:29643232:5,10,1,1
chr6	29643257	.	G	GACCCAGCA	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=177,60;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:5,2:9,0:0|1:29643232_T_A:29643232:5,10,1,1
chr6	29643879	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=252,175;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=11,19;RU=TG;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.371:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	29644633	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:10,3:2,0:9,4,3,0
chr6	29691140	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=190,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:0,8:3,1:3,0,9,0
chr6	29691303	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=153,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=74.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,26:0.818:31:1,12:4,13:4,1,17,9
chr6	29691390	.	CT	GC	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=133.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,31:0.970:31:0,16:0,13:0,0,13,18
chr6	29691713	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=198,149;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,9:2,3:3,3,4,9
chr6	29691744	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:3,6:3,9:3,3,7,8
chr6	29691772	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=145,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.140:26:8,0:12,3:10,13,2,1
chr6	29691857	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=4;MBQ=32,30;MFRL=131,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:9,4:17,1:14,12,4,1
chr6	29692305	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,0,9
chr6	29692729	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.483:21:3,3:7,7:6,5,5,5
chr6	29693011	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=345,130;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=100.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,35:0.947:36:1,19:0,16:1,0,16,19
chr6	29693113	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=205,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:4,7:2,7:2,4,7,7
chr6	29693726	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=167,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:5,7,1,1
chr6	29694044	.	T	TG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=192,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=G;STR;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.531:11:2,4:3,2:3,2,5,1
chr6	29794860	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=36,30;MFRL=215,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:0,8:4,3:1,3,3,8
chr6	29794897	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	29794906	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=298,164;MMQ=60,56;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=22.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.755:9:0,4:1,3:0,2,0,7
chr6	29794933	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=298,177;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr6	29794956	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,28;MFRL=259,192;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0,2,0,3
chr6	29795636	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=226,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=49.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,7:1,5:1,0,2,11
chr6	29795657	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,25;MFRL=226,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,5:3,4:2,1,1,9
chr6	29795720	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,8,4
chr6	29795768	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=226,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,5:1,8:0,1,8,5
chr6	29795809	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=31,29;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=21.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:0,3:3,4:2,1,4,3
chr6	29795993	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=43.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,6,8
chr6	29796103	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=300,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=37.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:1,2:2,9:2,1,5,6
chr6	29796115	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=214,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,3:2,5:1,2,2,6
chr6	29796126	.	A	AC	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=30.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.848:11:1,4:0,5:0,1,2,8
chr6	29796152	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=241,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.769:11:2,3:0,6:1,1,1,8
chr6	29796234	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=207,235;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=13.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:1,1,2,2
chr6	29796257	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=188,235;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:1,0,3,1
chr6	29796306	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=282,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:0,3:4,3:4,1,4,2
chr6	29796327	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=259,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.429:14:2,3:5,2:5,3,4,2
chr6	29796640	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=200,144;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,1:0,4:1,2,1,4
chr6	29796685	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=298,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,4:1,2:1,0,0,6
chr6	29797173	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=233,141;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=45.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.653:21:3,7:4,7:4,3,7,7
chr6	29797553	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=272,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,3:2,4:1,1,5,2
chr6	29797639	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=162,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:7,2:1,4:5,3,5,1
chr6	29797696	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=179,127;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=39.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,8:2,4:1,2,5,7
chr6	29797782	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=229,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:4,1:3,3:1,6,1,3
chr6	29798039	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=196,156;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:0,2:3,6:2,1,6,2
chr6	29798083	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=156,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:10,6,2,0
chr6	29798140	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=157,154;MMQ=52,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=39.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,13:0.701:18:2,5:3,8:2,3,4,9
chr6	29910265	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=6;MBQ=27,27;MFRL=166,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.274:20:5,2:9,3:14,1,4,1
chr6	29910276	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=185,147;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.653:24:3,3:5,13:6,2,12,4
chr6	29910277	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=153,155;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:4,2:14,3:14,5,4,1
chr6	29910286	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=0,26;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=92.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.963:25:0,9:0,11:0,0,17,8
chr6	29910324	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=166,142;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,13:0.388:34:8,6:13,7:7,14,6,7
chr6	29910358	.	C	G	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=44.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,15:0.447:34:9,7:9,8:8,11,4,11
chr6	29910429	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=149,160;MMQ=60,55;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,11:0.522:21:4,5:5,5:0|1:29910429_C_G:29910429:2,8,4,7
chr6	29910437	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=28,27;MFRL=149,180;MMQ=60,55;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,11:0.571:19:3,5:5,4:0|1:29910429_C_G:29910429:2,6,4,7
chr6	29910450	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=187,218;MMQ=60,50;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,0:5,2:4,7,2,0
chr6	29910457	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=15;MBQ=28,29;MFRL=180,187;MMQ=60,43;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,4:2,5:1,3,5,4
chr6	29910460	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=26,30;MFRL=210,160;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=25.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,4:5,3:5,3,3,4
chr6	29910478	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=15;MBQ=28,30;MFRL=170,201;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=49.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,12:0.722:16:2,5:2,6:0|1:29910478_G_C:29910478:3,1,8,4
chr6	29910482	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=15;MBQ=32,28;MFRL=191,201;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=48.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,12:0.684:17:2,6:2,5:0|1:29910478_G_C:29910478:4,1,8,4
chr6	29910492	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=28,26;MFRL=208,205;MMQ=60,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.587:19:4,4:4,6:5,3,8,3
chr6	29910496	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=15;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=79.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,8:0,11:0,0,14,5
chr6	29910508	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=15;MBQ=26,27;MFRL=216,205;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.692:19:4,5:2,8:3,3,10,3
chr6	29910522	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=32,32;MFRL=191,204;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=50.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:4,6:3,9:3,4,12,3
chr6	29910527	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=15;MBQ=32,24;MFRL=194,204;MMQ=40,39;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:10,0:10,3:13,7,3,0
chr6	29910538	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=32,26;MFRL=185,185;MMQ=40,38;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:13,0:12,2:17,8,2,0
chr6	29910558	.	T	A,C	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=27,28,32;MFRL=220,168,136;MMQ=60,40,31;MPOS=19,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=88.58,7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,22,3:0.742,0.129:28:2,8,1:1,12,2:1,2,18,7
chr6	29910562	.	A	T,C	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=28,26,32;MFRL=185,176,156;MMQ=53,40,45;MPOS=17,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=42.05,16.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,15,6:0.552,0.241:26:2,7,1:3,8,5:3,2,15,6
chr6	29910717	.	A	G	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=62.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,17:0.450:38:10,6:10,11:0|1:29910717_A_G:29910717:12,9,5,12
chr6	29910719	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=6;MBQ=31,27;MFRL=139,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,17:0.429:40:9,4:12,11:0|1:29910717_A_G:29910717:13,10,5,12
chr6	29910721	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=6;MBQ=31,33;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,16:0.425:38:10,4:12,10:0|1:29910717_A_G:29910717:13,9,4,12
chr6	29910742	.	G	C	.	.	DP=34;ECNT=6;MBQ=32,32;MFRL=134,240;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:13,2:16,1:10,19,2,1
chr6	29910759	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=6;MBQ=29,33;MFRL=128,285;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:12,3:12,1:0|1:29910759_T_C:29910759:6,21,4,0
chr6	29910761	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=128,285;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,4:0.151:31:12,3:14,1:0|1:29910759_T_C:29910759:6,21,4,0
chr6	29910801	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,12:0.619:19:7,4:0,8:2,5,5,7
chr6	29910820	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=31,27;MFRL=149,182;MMQ=60,54;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=48.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:1,9:0,7:0,1,7,9
chr6	29910834	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,4,6
chr6	29910865	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=228,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:4,5:4,3,5,3
chr6	29910892	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=175,197;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:3,4:7,1:6,5,4,1
chr6	29911000	.	T	C,G	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=0,30,27;MFRL=0,174,190;MMQ=60,60,56;MPOS=11,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=45.69,21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,13,8:0.581,0.379:21:0,6,2:0,7,5:0,0,11,10
chr6	29911005	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=190,172;MMQ=56,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=33.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.499:20:3,6:6,4:0|1:29911005_G_A:29911005:5,5,5,5
chr6	29911011	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=29,26;MFRL=190,175;MMQ=51,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=34.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,10:0.478:21:3,4:6,3:0|1:29911005_G_A:29911005:5,6,4,6
chr6	29911019	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=27,30;MFRL=192,177;MMQ=60,49;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,3:3,5:4,8,4,4
chr6	29911029	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=11;MBQ=31,26;MFRL=166,178;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.345:27:8,3:7,5:7,11,5,4
chr6	29911037	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=162,176;MMQ=60,49;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.416:27:9,3:6,8:7,9,5,6
chr6	29911056	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=163,178;MMQ=60,49;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:14,0:17,3:0|1:29911056_A_G:29911056:13,19,2,1
chr6	29911063	.	TA	GG	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=28,33;MFRL=161,244;MMQ=60,53;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,4:0.128:37:13,0:18,4:0|1:29911056_A_G:29911056:13,20,2,2
chr6	29911064	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=11;MBQ=28,34;MFRL=159,174;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.364:35:10,5:12,8:8,14,6,7
chr6	29911077	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=30,33;MFRL=168,141;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:14,1:23,2:15,22,2,1
chr6	29911086	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=11;MBQ=25,32;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=60.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,21:0.579:36:5,6:5,15:8,7,8,13
chr6	29911154	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=15;MBQ=29,30;MFRL=157,162;MMQ=60,40;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:9,6:5,7:5,10,10,3
chr6	29911190	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=15;MBQ=30,29;MFRL=217,165;MMQ=45,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=106.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,27:0.967:28:1,11:0,14:0,1,15,12
chr6	29911198	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=170,164;MMQ=40,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=75.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,20:0.694:28:4,10:4,9:3,5,11,9
chr6	29911207	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=15;MBQ=31,28;MFRL=174,152;MMQ=40,44;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=70.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:4,10:3,7:3,4,10,8
chr6	29911228	.	A	T,C	.	.	DP=21;ECNT=15;MBQ=0,28,30;MFRL=0,139,190;MMQ=60,56,43;MPOS=19,29;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=40.96,7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,14,4:0.763,0.191:18:0,5,1:0,9,3:0,0,7,11
chr6	29911239	.	TT	CA	.	.	DP=22;ECNT=15;MBQ=27,32;MFRL=139,166;MMQ=56,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:4,2:9,3:5,9,3,2
chr6	29911240	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=15;MBQ=25,33;MFRL=242,129;MMQ=40,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.820:14:1,3:1,9:2,0,3,9
chr6	29911256	.	T	G	.	.	DP=28;ECNT=15;MBQ=0,34;MFRL=0,165;MMQ=60,45;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=116.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,12:0,0,14,13
chr6	29911260	.	AC	CG	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=28,29;MFRL=155,170;MMQ=40,45;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.259:25:8,5:10,1:9,10,3,3
chr6	29911319	.	G	T	.	.	DP=37;ECNT=15;MBQ=29,32;MFRL=169,9499;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.343:36:12,2:11,10:13,11,2,10
chr6	29911356	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=15;MBQ=35,25;MFRL=195,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.363:25:3,4:13,4:1,15,3,6
chr6	29911367	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=15;MBQ=34,27;MFRL=177,188;MMQ=60,59;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:5,2:13,2:2,18,0,4
chr6	29911388	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=34,25;MFRL=165,165;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:4,3:10,0:0,14,0,3
chr6	29911396	.	AT	GA	.	.	DP=18;ECNT=15;MBQ=25,31;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:4,2:9,2:0,13,0,5
chr6	29911419	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=15;MBQ=27,30;MFRL=163,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:5,1:0,9,0,2
chr6	29911892	.	CCG	C	.	.	DP=48;ECNT=4;MBQ=32,20;MFRL=158,59;MMQ=40,39;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,5:0.123:45:16,0:21,5:0|1:29911892_CCG_C:29911892:22,18,2,3
chr6	29911893	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=154,183;MMQ=40,39;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.084:40:17,1:20,2:21,16,2,1
chr6	29911897	.	AG	TT	.	.	DP=44;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=154,59;MMQ=40,39;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:39,5:0.127:44:18,0:21,4:0|1:29911892_CCG_C:29911892:22,17,2,3
chr6	29911899	.	A	AACCCC	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=154,59;MMQ=40,35;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:14,0:19,2:22,17,1,3
chr6	29912028	.	AG	A	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=30,25;MFRL=189,217;MMQ=27,39;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:5,4:7,3:0|1:29912028_AG_A:29912028:9,3,0,7
chr6	29912030	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=189,217;MMQ=27,39;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.380:19:5,4:7,3:0|1:29912028_AG_A:29912028:9,3,0,7
chr6	29912085	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=30,26;MFRL=266,157;MMQ=39,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,4:4,2:6,5,6,0
chr6	29912108	.	G	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=196,147;MMQ=39,30;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,6:8,4:6,8,6,4
chr6	29912147	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=196,148;MMQ=52,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.452:33:10,9:8,5:10,8,6,9
chr6	29912188	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=28,31;MFRL=205,135;MMQ=52,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=50.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,20:0.567:35:10,6:5,14:6,9,12,8
chr6	29912204	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=32,25;MFRL=185,147;MMQ=60,49;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=83.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.578:37:8,6:7,14:9,7,14,7
chr6	29912227	.	TGGA	T	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=28,29;MFRL=183,167;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=53.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,15:0.457:33:13,6:5,9:10,8,9,6
chr6	29912333	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=146,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,13:0.438:30:11,8:6,5:9,8,8,5
chr6	29912368	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=7;MBQ=27,30;MFRL=146,142;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:13,5:4,5:7,10,4,6
chr6	29912398	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=187,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:12,2:2,4:4,10,1,5
chr6	29912410	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=32,26;MFRL=212,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,7:4,2:2,6,3,6
chr6	29912413	.	TG	T	.	.	DP=17;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=181,186;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:8,1:2,3:4,8,1,4
chr6	29912493	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=0,30;MFRL=0,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0|1:29912493_G_T:29912493:0,0,0,4
chr6	29912510	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=0,31;MFRL=0,227;MMQ=60,51;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0|1:29912493_G_T:29912493:0,0,0,3
chr6	29912754	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=135,192;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:4,3:2,2:5,1,5,0
chr6	29912766	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=27,28;MFRL=130,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:4,1,3,1
chr6	29912796	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=32,28;MFRL=133,167;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:11,2:3,3:8,6,2,3
chr6	29912830	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=69.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.955:19:0,10:0,9:0,0,8,11
chr6	29912852	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=155,219;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:10,3:5,2:0|1:29912852_T_C:29912852:4,12,4,1
chr6	29912856	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=6;MBQ=26,26;MFRL=155,223;MMQ=60,39;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:11,2:5,2:0|1:29912852_T_C:29912852:4,12,4,0
chr6	29912925	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,31;MFRL=205,214;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:9,2:3,0:0|1:29912925_A_G:29912925:6,6,1,1
chr6	29912935	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=60.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,12:0,2:0|1:29912925_A_G:29912925:0,0,8,6
chr6	29912944	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,203;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=60.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,11:0,3:0|1:29912925_A_G:29912925:0,0,8,6
chr6	29913001	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=25,32;MFRL=176,219;MMQ=60,51;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:7,0:12,3:11,8,2,1
chr6	29913037	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=13;MBQ=32,28;MFRL=147,243;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.228:24:8,1:11,4:10,9,3,2
chr6	29913042	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,11:0,16:0,0,14,13
chr6	29913067	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=27,32;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.567:28:8,7:4,9:7,5,9,7
chr6	29913074	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=114.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,26:0.965:26:0,14:0,10:0|1:29913074_A_G:29913074:0,0,15,11
chr6	29913078	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.963:25:0,14:0,9:0|1:29913074_A_G:29913074:0,0,14,11
chr6	29913098	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=13;MBQ=30,27;MFRL=158,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:12,3:9,2:9,12,3,2
chr6	29913135	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=33,33;MFRL=166,139;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=21.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:7,1:6,7:7,6,2,6
chr6	29913144	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=32,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:5,2:14,0:0|1:29913144_G_C:29913144:8,12,1,1
chr6	29913145	.	T	TCCTTCCTGCAGACTAC	.	.	DP=23;ECNT=13;MBQ=28,20;MFRL=154,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:5,2:14,0:0|1:29913144_G_C:29913144:8,12,1,1
chr6	29913171	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=33,29;MFRL=137,182;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,2:6,5:5,8,3,4
chr6	29913191	.	TG	CA	.	.	DP=24;ECNT=13;MBQ=29,34;MFRL=176,157;MMQ=60,51;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:6,4:7,6:0|1:29913191_TG_CA:29913191:6,8,3,7
chr6	29913197	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=13;MBQ=27,30;MFRL=176,157;MMQ=60,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,10:0.423:24:6,4:8,5:0|1:29913191_TG_CA:29913191:6,8,3,7
chr6	29913266	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=197,209;MMQ=60,57;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,1:8,1:3,6,1,1
chr6	29913374	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=202,223;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	29942857	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=193,68;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr6	29942983	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=181,166;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.517:21:7,6:3,4:5,5,8,3
chr6	29943005	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=189,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:10,5:6,0:10,6,2,3
chr6	29943035	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=191,174;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:11,6:10,0:0|1:29943035_G_A:29943035:12,10,3,3
chr6	29943039	.	G	T	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.266:28:12,6:8,1:0|1:29943035_G_A:29943035:11,10,4,3
chr6	29943254	.	AGGGCT	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=174,80;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:11,1:7,3:0|1:29943254_AGGGCT_A:29943254:10,11,3,1
chr6	29943269	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=174,80;MMQ=60,57;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.199:23:12,1:7,3:0|1:29943254_AGGGCT_A:29943254:9,10,3,1
chr6	29943281	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=174,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:9,1:8,2:6,11,1,2
chr6	29943336	.	GGT	G	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=20.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.676:7:1,3:1,2:0|1:29943336_GGT_G:29943336:0,2,0,5
chr6	29943340	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=17,26;MFRL=179,147;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=20.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.671:7:0,3:1,2:0|1:29943336_GGT_G:29943336:0,2,0,5
chr6	30030114	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr6	30032495	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=151,137;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.150:31:13,3:14,1:10,17,2,2
chr6	30035089	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=231,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:6,3:8,3:12,2,6,0
chr6	30036333	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=231,111;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:6,2:7,5:11,2,7,0
chr6	30036471	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.103:27:15,1:10,1:8,17,1,1
chr6	30037018	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=169,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:9,0:10,0:0|1:30037018_A_C:30037018:1,20,7,0
chr6	30037024	.	A	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,7:0.267:28:11,5:9,0:0|1:30037018_A_C:30037018:1,20,7,0
chr6	30037027	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=25,33;MFRL=171,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,7:0.250:30:11,4:9,0:0|1:30037018_A_C:30037018:1,22,7,0
chr6	30037032	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=174,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:11,1:11,0:0|1:30037018_A_C:30037018:2,20,6,0
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chr6	30039349	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:0,6,0,2
chr6	30040909	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:4,5,4,0
chr6	30041292	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=163,112;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,3:13,0:8,18,0,3
chr6	30042955	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=192,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr6	30071279	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=187,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,1:3,3:4,0,4,0
chr6	30071330	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=191,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,1:3,4:4,1,4,1
chr6	30075843	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,132;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=56.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,6:0,8:0,0,6,9
chr6	30075864	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=244,117;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.527:13:2,1:4,5:3,3,1,6
chr6	30075903	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=196,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,4:3,4:3,3,3,5
chr6	30076016	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.880:6:0,3:0,2:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,2,4
chr6	30076018	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:30076016_C_T:30076016:0,0,2,4
chr6	30076755	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,2:2,2:3,0,4,0
chr6	30078275	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,6:4,2:4,4,3,5
chr6	30078330	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=20,28;MFRL=135,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.469:13:3,4:4,2:2,5,3,3
chr6	30078376	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=157,287;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:5,0:8,6:5,8,0,7
chr6	30080274	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:1,4:7,2:6,3,2,4
chr6	30080496	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=181,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:0,7:5,2:2,3,4,5
chr6	30104783	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=210,187;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:5,3:2,2:6,1,4,1
chr6	30105174	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=154,112;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:3,4:1,0:1,3,1,3
chr6	30113955	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=235,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.372:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	30114725	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=140,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.199:33:18,4:9,2:22,5,4,2
chr6	30114803	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=5;MBQ=31,26;MFRL=187,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.189:19:8,2:8,1:0|1:30114803_G_A:30114803:4,12,1,2
chr6	30114825	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=189,199;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:30114803_G_A:30114803:3,12,0,2
chr6	30114842	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=32,24;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:6,2:5,1:3,8,0,3
chr6	30114897	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=211,188;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:1,1:6,3:2,6,1,3
chr6	30115367	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.174:15:7,0:6,1:0|1:30115367_CA_C:30115367:8,5,0,2
chr6	30115374	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=33,32;MFRL=177,154;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,0:7,2:0|1:30115367_CA_C:30115367:10,5,0,2
chr6	30115408	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=170,68;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr6	30115484	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=29,36;MFRL=217,122;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,3:6,0:3,9,3,0
chr6	30121460	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.322:26:7,4:10,4:11,7,3,5
chr6	30121605	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=227,250;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:0,6,0,2
chr6	30122154	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=69.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,6:0,14:0,0,4,16
chr6	30124631	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=32,25;MFRL=195,195;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:1,0:3,4:0|1:30124631_C_T:30124631:5,1,4,0
chr6	30124637	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,0:4,4:0|1:30124631_C_T:30124631:4,1,4,0
chr6	30124667	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=197,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:1,1:6,4:5,2,4,1
chr6	30124697	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=189,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,2:8,3:10,4,4,1
chr6	30124879	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=198,97;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.499:10:1,3:4,2:1,4,1,4
chr6	30126177	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=195,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:10,3,2,1
chr6	30126225	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=30,32;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.270:13:1,3:7,0:10,0,1,2
chr6	30126285	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=35,29;MFRL=198,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,4:9,2:7,7,3,3
chr6	30126303	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=197,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.236:19:8,3:7,1:8,7,2,2
chr6	30126424	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=220,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:3,4,1,4
chr6	30131503	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.505:20:3,3:6,7:5,5,6,4
chr6	30131546	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=229,157;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,2:6,3:3,6,2,3
chr6	30131585	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=31,28;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,2:7,0:5,7,1,1
chr6	30136217	.	CA	AT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=185,89;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,0:7,2:12,6,1,1
chr6	30136302	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,36;MFRL=191,79;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:0,5,2,0
chr6	30136929	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=176,155;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:2,1:5,3:6,2,3,1
chr6	30137111	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=175,242;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:2,2,0,2
chr6	30138476	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	30138489	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	30138853	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=36,24;MFRL=145,128;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.355:20:8,1:5,5:2,11,4,3
chr6	30138865	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=164,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,1:8,3:5,6,0,4
chr6	30138895	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=204,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,1:6,1:1,6,0,2
chr6	30139699	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.291:22:5,3:11,3:10,6,2,4
chr6	30154199	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=151,202;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:6,3:3,3:2,7,4,2
chr6	30157654	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,185;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:2,0,5,0
chr6	30166266	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=165,210;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:1,3:8,3:6,3,3,3
chr6	30228230	.	AC	CC,CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,34,32;MFRL=185,130,3598;MMQ=60,60,52;MPOS=30,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=14.36,3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,5,2:0.303,0.149:17:5,4,0:4,1,2:5,5,6,1
chr6	30228379	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=171,157;MMQ=60,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=32.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.500:22:5,7:6,4:5,6,4,7
chr6	30228398	.	CG	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=150,159;MMQ=60,44;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.448:16:4,3:5,4:3,6,2,5
chr6	30228416	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=30,33;MFRL=199,157;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,3:3,4:2,5,1,6
chr6	30228879	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=33,29;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:2,2:7,3:0|1:30228879_C_T:30228879:6,5,3,2
chr6	30228881	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,35;MFRL=161,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:4,2:7,3:0|1:30228879_C_T:30228879:6,5,3,2
chr6	30228938	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=156,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:7,3:10,4:7,10,6,1
chr6	30229013	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=140,135;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:9,1:6,5:7,8,3,3
chr6	30229034	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=172,147;MMQ=60,51;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:8,1:4,4:5,7,3,2
chr6	30229267	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=136,222;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:5,2:8,1:6,7,2,1
chr6	30229280	.	CC	AT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=195,136;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:6,1:3,4:6,4,3,2
chr6	30229306	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=200,197;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=27.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,6:4,4:4,5,8,2
chr6	30229457	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=146,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,7:0.333:22:8,1:6,6:0|1:30229457_C_T:30229457:7,8,1,6
chr6	30229463	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=162,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:6,1:4,5:0|1:30229457_C_T:30229457:5,5,0,6
chr6	30229504	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=185,156;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:1,3,0,3
chr6	30229990	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=276,97;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr6	30230085	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=54,94;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,6:4,3:5,1,5,4
chr6	30230128	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=108,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,1,3
chr6	30231071	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=173,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,4:8,5:1,10,5,4
chr6	30231108	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=178,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,4:6,4:4,6,3,5
chr6	30231224	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr6	30297018	.	C	CA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=223,198;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.343:7:1,1:4,1:5,0,2,0
chr6	30297529	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.546:20:4,4:5,6:3,6,4,7
chr6	30309105	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=121,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:8,6:6,2:7,7,5,3
chr6	30309508	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=110,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.311:11:3,2:4,1:4,4,2,1
chr6	30313227	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=175,190;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,0:7,2:7,6,1,1
chr6	30313268	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=176,168;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:6,10:2,4:5,3,8,6
chr6	30313440	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=252,201;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	30314116	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=205,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,2:6,1:7,0,3,0
chr6	30314566	.	TC	GA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=145,140;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,8:0.310:27:5,0:13,8:8,11,3,5
chr6	30314607	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=167,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:8,0:6,4:3,11,0,4
chr6	30457732	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=82,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=102.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,29:0.900:32:2,17:0,12:2,1,13,16
chr6	30458064	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=233,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=73.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,23:0.857:26:1,8:2,15:1,2,13,10
chr6	30460232	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=121,120;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.311:23:9,2:7,4:10,6,5,2
chr6	30515043	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=169,269;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:7,2:8,0:5,10,2,0
chr6	30521137	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=172,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=55.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.731:28:3,7:4,12:3,4,10,11
chr6	30523241	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,36;MFRL=204,271;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	30529781	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.135:24:14,0:7,2:12,9,0,3
chr6	30539438	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,9:0,10:0,0,2,17
chr6	30546144	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,209;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:7,2:5,0:7,5,1,1
chr6	30548111	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=185,129;MMQ=40,36;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:30548111_G_A:30548111:3,0,1,0
chr6	30548116	.	TCC	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,26;MFRL=162,129;MMQ=40,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0|1:30548111_G_A:30548111:3,1,1,0
chr6	30548137	.	GAA	G,GA	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=19,19,30;MFRL=118,94,260;MMQ=60,60,57;MPOS=12,6;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.40,9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,2,4:0.222,0.292:12:0,1,0:3,0,3:2,4,5,1
chr6	30548157	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,10;MFRL=88,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.351:14:3,0:5,0:3,6,5,0
chr6	30551286	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	30552937	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	30553342	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=149,88;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:8,0:5,5:8,6,5,0
chr6	30553871	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=29.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:0,6:1,4:1,0,7,3
chr6	30557539	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,4:11,0:12,10,0,4
chr6	30558477	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=45.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,5,9
chr6	30570241	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=183,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:9,0:3,2:2,10,0,2
chr6	30571471	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:4,5:1,4,1,8
chr6	30573842	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=229,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:8,2:2,5:6,4,4,3
chr6	30574455	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=202,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.287:22:10,1:6,5:7,9,3,3
chr6	30575603	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=116,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=71.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:11,12:1,11:6,6,17,6
chr6	30575760	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=20,22;MFRL=166,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.388:8:3,2:0,1:1,4,0,3
chr6	30576781	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=162,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=50.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.726:20:3,9:2,5:4,1,11,4
chr6	30593193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr6	30608048	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30608048_C_T:30608048:1,0,1,0
chr6	30608052	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:30608048_C_T:30608048:1,0,1,0
chr6	30611350	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=123,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:10,3:14,1:11,13,1,3
chr6	30613782	.	C	T	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=156,87;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.209:41:16,0:17,8:16,17,0,8
chr6	30617377	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=136,39487211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:7,0:11,2:0|1:30617377_C_T:30617377:5,13,1,1
chr6	30617388	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=131,70;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:23,3:0.142:26:6,0:14,3:1|0:30617377_C_T:30617377:7,16,1,2
chr6	30618688	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=154,173;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	30618906	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=153,303;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.251:18:5,3:8,1:3,11,4,0
chr6	30619285	.	CTTT	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=301,255;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=T;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr6	30622613	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=179,241;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:4,4,1,2
chr6	30627216	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=189,105;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,0:0,3:2,0,2,1
chr6	30628082	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	30645123	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.388:8:3,0:2,1:0|1:30645123_A_C:30645123:0,5,3,0
chr6	30645127	.	TTC	AGG	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=29,12;MFRL=186,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.389:8:3,0:2,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,5,3,0
chr6	30645136	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,29;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,2,0
chr6	30645138	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=25,12;MFRL=215,232;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,0:1,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,2,0
chr6	30645144	.	T	TTTAGG	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=31,25;MFRL=215,270;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:30645123_A_C:30645123:0,3,1,0
chr6	30645145	.	GAA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,32;MFRL=167,270;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:30645123_A_C:30645123:0,2,1,0
chr6	30645150	.	GCA	G	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=33,16;MFRL=167,270;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,0:0|1:30645123_A_C:30645123:0,2,1,0
chr6	30652673	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=111,110;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.132:36:22,0:8,4:15,17,0,4
chr6	30652781	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.193:29:15,3:9,2:14,10,1,4
chr6	30657015	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chr6	30668337	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=162,77;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:10,0:11,2:10,11,2,0
chr6	30668488	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=155,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:0,7,0,4
chr6	30670696	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=251,115;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.274:9:2,0:4,2:2,5,0,2
chr6	30671256	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0|1:30671256_T_C:30671256:3,8,0,2
chr6	30671259	.	GGCT	G	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=103,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:6,0:5,2:0|1:30671256_T_C:30671256:3,8,0,2
chr6	30671276	.	G	GACCACAGCGT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=167,160;MMQ=60,60;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,0,2
chr6	30671650	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,169;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:3,4:7,8:6,4,6,6
chr6	30672342	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=148,181;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.193:29:16,2:6,1:10,13,3,3
chr6	30675830	.	T	A	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=146,278;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:17,2:9,1:10,17,1,2
chr6	30676109	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=139,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr6	30679628	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=65.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,8:0,13:0,0,13,8
chr6	30680298	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=182,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:10,5:5,1:6,9,3,3
chr6	30680916	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=114,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=49.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,21:0.491:43:11,10:10,11:12,10,8,13
chr6	30688427	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=169,206;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:7,4:9,1:2,14,1,4
chr6	30698541	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=205,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:1,1:5,1:2,4,1,1
chr6	30698914	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:0,2:1,0:0,1,1,1
chr6	30708009	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=151,74;MMQ=60,28;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,4:0.138:34:15,4:13,0:11,19,1,3
chr6	30708143	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=171,328;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,1:3,2:2,6,1,2
chr6	30709357	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=151,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:7,3,2,0
chr6	30711805	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=91.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.965:27:0,17:0,10:0,0,18,9
chr6	30856863	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=192,261;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,1:7,1:4,8,2,0
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chr6	30882856	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=219,193;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.732:12:1,1:1,7:3,0,5,4
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chr6	30883920	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=241,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,24:0.806:29:2,13:3,11:2,3,15,9
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chr6	30885639	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=159,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,3:3,5:0,3,0,8
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chr6	30887988	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=237,108;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:2,5:2,3:2,2,3,5
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chr6	30889120	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=234,181;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:4,4:3,7:1,6,2,9
chr6	30890055	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=213,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=26.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,2:3,6:2,4,3,5
chr6	30890206	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=202,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.535:13:3,4:2,2:3,3,2,5
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chr6	30890569	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,3:0,4:1,0,0,7
chr6	30890871	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=201,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:3,2,1,4
chr6	30892054	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=112,164;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=36.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:3,4:0,8:1,2,9,3
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chr6	30892377	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=328,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr6	30893004	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=171,171;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:10,3:5,0:15,0,3,0
chr6	30893127	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=168,193;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:10,0:7,3:8,9,2,1
chr6	30893226	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=273,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:2,3:1,1:2,1,0,5
chr6	30893251	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=298,185;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=11.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,3:1,1:2,2,2,3
chr6	30893428	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=227,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.494:16:2,3:6,3:5,3,4,4
chr6	30893728	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=212,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=34.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:0,8:3,4:2,1,8,4
chr6	30893831	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=196,122;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.571:19:3,4:5,7:4,4,6,5
chr6	30893941	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,1,1
chr6	30899163	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr6	30899195	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=174,199;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:7,0,4,1
chr6	30899377	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=309,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,6:1,3:2,0,4,5
chr6	30899524	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=125,219;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:8,8,1,3
chr6	30899650	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=209,332;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,1:4,1:4,3,0,2
chr6	30916645	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=140,182;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:7,3:22,0:20,9,1,2
chr6	30917212	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,123;MMQ=60,39;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,4,6
chr6	30918400	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=241,109;MMQ=32,45;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.436:14:2,5:5,1:5,3,4,2
chr6	30919391	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,235;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:16,1:7,5:13,12,2,4
chr6	30919701	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=197,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=94.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,28:0.853:32:1,10:3,18:1,3,13,15
chr6	30954245	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=77.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,10:0,12:0,0,11,11
chr6	30955681	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr6	31079074	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=260,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0|1:31079074_C_T:31079074:3,0,7,0
chr6	31079076	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,28;MFRL=260,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,3:1,3:0|1:31079074_C_T:31079074:3,0,7,0
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chr6	31079889	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=151,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=43.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,15:0.372:41:4,7:22,8:21,5,8,7
chr6	31083729	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr6	31083797	.	ACTT	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=29,28;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=39.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,10:0.612:16:2,4:4,6:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:5,1,4,6
chr6	31083813	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=24,30;MFRL=166,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=31.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:0|1:31083797_ACTT_A:31083797:5,1,3,5
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chr6	31084163	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=153,211;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:0,3,1,4
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chr6	31084684	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=182,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:2,8:4,2:5,1,8,2
chr6	31084787	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=161,96;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.434:21:7,4:5,5:0|1:31084787_A_G:31084787:3,9,4,5
chr6	31084792	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=158,122;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,15:0.696:21:4,6:2,9:0|1:31084787_A_G:31084787:2,4,5,10
chr6	31084964	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:5,5:1,7:5,1,9,3
chr6	31085200	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,33;MFRL=128,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=42.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:2,5:6,8:6,2,9,4
chr6	31085269	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=130,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:4,5:5,5:4,5,4,6
chr6	31088037	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,7:2,2:3,0,8,1
chr6	31088202	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=150,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.407:8:3,3:1,0:1,4,0,3
chr6	31088232	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:0|1:31088232_A_G:31088232:0,1,0,6
chr6	31088241	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=151,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.702:8:1,5:0,1:0|1:31088232_A_G:31088232:0,2,0,6
chr6	31097301	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=193,143;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr6	31097453	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:3,6:6,7:5,4,4,9
chr6	31105633	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=20.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	31105891	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=65.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,6,13
chr6	31106133	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:3,3:3,3:0|1:31106133_CAG_C:31106133:2,6,7,0
chr6	31106140	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,23;MFRL=192,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:2,1:4,3:0|1:31106133_CAG_C:31106133:2,7,7,0
chr6	31106143	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=188,175;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,7:0.471:15:4,3:4,3:0|1:31106133_CAG_C:31106133:2,6,7,0
chr6	31106149	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=184,167;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:4,3:5,1:0|1:31106133_CAG_C:31106133:3,6,6,0
chr6	31106177	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:7,1:6,1:6,7,0,2
chr6	31106268	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=158,199;MMQ=60,54;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.801:13:1,4:1,7:0|1:31106268_A_G:31106268:0,2,2,9
chr6	31106282	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=204,199;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,6:0.500:12:4,0:2,6:0|1:31106268_A_G:31106268:0,6,0,6
chr6	31106409	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=149,282;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,1:5,1:8,2,1,1
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chr6	31106500	.	TC	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,24;MFRL=121,172;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=16.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,5:0.260:21:7,3:8,1:0|1:31106499_G_A:31106499:9,7,3,2
chr6	31106522	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,20;MFRL=167,77;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,2:9,0:9,9,1,1
chr6	31106643	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=192,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:1,1,6,4
chr6	31106875	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=188,239;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,2:6,1:2,8,0,3
chr6	31106893	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=185,206;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,1:7,2:1,12,0,3
chr6	31107338	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=210,270;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr6	31111180	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:6,2:2,1:1,8,2,1
chr6	31112602	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=127,222;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:10,1:3,1:8,5,2,0
chr6	31112737	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=185,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr6	31112899	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=185,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:3,0,3,0
chr6	31112925	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=181,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:2,1:5,0,3,0
chr6	31113030	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=96,178;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.739:13:0,5:3,5:1,2,3,7
chr6	31113052	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=26,25;MFRL=155,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.481:19:3,6:6,3:5,5,3,6
chr6	31113106	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=213,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:4,2:4,3:6,2,3,2
chr6	31113149	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=180,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:3,1,4,0
chr6	31113275	.	AG	GA	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=113,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=63.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:6,7:2,9:4,4,11,6
chr6	31113326	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=167,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:6,4,0,2
chr6	31116178	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,20;MFRL=89,61;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.260:11:6,2:2,0:2,6,2,1
chr6	31116189	.	CAGCATTGACCACAAGCCTCAGCT	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=119,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:7,2:3,0:6,9,1,1
chr6	31116526	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=145,230;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr6	31117756	.	CAAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=232,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr6	31118565	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,218;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.309:24:8,3:8,4:7,10,4,3
chr6	31122330	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=126,254;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:14,2:12,3:13,13,3,2
chr6	31124849	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=177,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.399:23:7,4:7,5:9,5,3,6
chr6	31125067	.	C	CAACT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=125,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AACT;STR;TLOD=37.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.839:10:1,4:0,4:1,0,8,1
chr6	31125158	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,17:0.668:25:4,5:4,12:3,5,11,6
chr6	31127562	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=182,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,2:2,3:0,6,0,5
chr6	31129616	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=176,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=71.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,22:0.825:26:1,10:3,12:3,1,8,14
chr6	31129642	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=121,165;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:2,8:5,7:5,2,6,9
chr6	31130502	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=377,125;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,5:1,1,2,6
chr6	31132414	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=209,219;MMQ=40,26;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,1,1
chr6	31132649	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=140,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.601:18:2,5:5,6:4,3,2,9
chr6	31133509	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=208,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.688:14:0,4:3,6:1,3,4,6
chr6	31133577	.	A	AAAGCCC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=199,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.802:8:1,5:0,1:1,0,2,5
chr6	31133620	.	T	TAG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=199,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AG;STR;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,1,3
chr6	31133943	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,22;MFRL=184,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,5:0,3:0,3,3,5
chr6	31138107	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=163,176;MMQ=50,49;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:4,5:2,3:3,3,5,4
chr6	31138377	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=221,193;MMQ=55,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:2,4,5,1
chr6	31236853	.	GT	AC,AT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,28,29;MFRL=88,220,153;MMQ=52,56,54;MPOS=17,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.89,22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,9:0.125,0.417:21:2,0,2:8,2,7:8,2,7,4
chr6	31236998	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=173,166;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,15:0.616:24:3,3:6,12:4,5,6,9
chr6	31237014	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=32,29;MFRL=143,173;MMQ=60,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=50.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,13:0.519:25:2,4:10,8:0|1:31237014_G_A:31237014:5,7,6,7
chr6	31237017	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=6;MBQ=35,28;MFRL=139,173;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=49.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,13:0.483:27:2,5:11,8:0|1:31237014_G_A:31237014:6,8,6,7
chr6	31237027	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=143,188;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,13:0.452:29:4,4:12,8:0|1:31237014_G_A:31237014:8,8,6,7
chr6	31237048	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=143,214;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=39.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,13:0.425:31:5,6:13,7:8,10,9,4
chr6	31237061	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=151,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=38.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,14:0.536:26:3,6:9,8:6,6,9,5
chr6	31237124	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,12:0.468:26:5,5:8,7:9,5,8,4
chr6	31237162	.	C	G	.	.	DP=38;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=173,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=44.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,15:0.421:36:9,7:12,8:9,12,6,9
chr6	31237230	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=149,152;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=66.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,18:0.528:34:6,8:10,10:0|1:31237230_A_G:31237230:13,3,11,7
chr6	31237233	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=149,151;MMQ=60,52;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=63.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.514:33:5,6:10,10:0|1:31237230_A_G:31237230:13,3,11,6
chr6	31237255	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=5;MBQ=27,28;MFRL=142,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=48.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,21:0.558:37:7,9:9,9:11,5,12,9
chr6	31237323	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=153,215;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.378:22:6,4:7,4:0|1:31237323_A_G:31237323:3,11,0,8
chr6	31237333	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=30,28;MFRL=150,206;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:5,3:4,4:0|1:31237323_A_G:31237323:3,7,0,7
chr6	31237353	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=146,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.643:12:3,4:1,3:0,4,0,8
chr6	31237405	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=220,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,4:3,1:1,4,1,4
chr6	31237437	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=220,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,4:2,0:1,2,1,3
chr6	31237660	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=128,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:1,1:5,2:0|1:31237660_A_G:31237660:6,0,4,0
chr6	31237664	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=124,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:0|1:31237660_A_G:31237660:4,0,4,0
chr6	31237703	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=32,29;MFRL=137,173;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:2,3:6,2:5,3,4,1
chr6	31237723	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=27,28;MFRL=131,179;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:1,4:8,3:0|1:31237723_G_A:31237723:5,4,5,3
chr6	31237727	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=26,33;MFRL=131,179;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:1,5:8,3:0|1:31237723_G_A:31237723:5,4,5,3
chr6	31237767	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=14;MBQ=25,35;MFRL=137,139;MMQ=60,52;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,8:0.450:18:3,2:7,5:0|1:31237767_T_C:31237767:7,3,2,6
chr6	31237769	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=14;MBQ=34,28;MFRL=140,139;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:2,2:6,6:0|1:31237767_T_C:31237767:7,4,4,8
chr6	31237771	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=30,28;MFRL=133,139;MMQ=60,59;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:2,3:6,9:0|1:31237767_T_C:31237767:6,3,4,8
chr6	31237773	.	TG	CC	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=27,34;MFRL=133,139;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,12:0.565:21:2,3:5,9:0|1:31237767_T_C:31237767:6,3,4,8
chr6	31237779	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=14;MBQ=32,31;MFRL=133,129;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,13:0.538:24:4,4:7,8:0|1:31237767_T_C:31237767:7,4,4,9
chr6	31237786	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=14;MBQ=29,29;MFRL=140,148;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=66.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,17:0.600:28:4,4:6,10:0|1:31237786_A_T:31237786:7,4,8,9
chr6	31237802	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=30,34;MFRL=148,126;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=80.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,22:0.677:32:5,10:5,12:0|1:31237786_A_T:31237786:5,5,12,10
chr6	31237833	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=14;MBQ=28,24;MFRL=113,113;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=68.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,22:0.589:37:6,11:6,10:0|1:31237833_T_C:31237833:7,8,12,10
chr6	31237858	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=14;MBQ=27,28;MFRL=113,113;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.456:33:9,7:8,6:0|1:31237833_T_C:31237833:8,10,9,6
chr6	31237876	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=29,32;MFRL=113,113;MMQ=60,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,8:0.409:20:6,4:5,4:0|1:31237876_A_G:31237876:7,5,4,4
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chr6	31238992	.	G	C	.	.	DP=37;ECNT=8;MBQ=30,30;MFRL=161,141;MMQ=52,40;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,11:0.315:36:11,3:14,8:12,13,4,7
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chr6	31239010	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=33,25;MFRL=140,161;MMQ=48,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,11:0.279:40:11,6:18,3:12,17,7,4
chr6	31239050	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=12;MBQ=32,20;MFRL=143,111;MMQ=60,43;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,15:0.348:44:19,8:10,5:0|1:31239050_G_A:31239050:11,18,8,7
chr6	31239057	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=12;MBQ=33,20;MFRL=148,106;MMQ=60,44;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=58.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,16:0.347:47:18,9:11,7:0|1:31239050_G_A:31239050:11,20,8,8
chr6	31239060	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=12;MBQ=24,32;MFRL=136,131;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,13:0.286:47:18,10:14,3:15,19,5,8
chr6	31239082	.	G	C	.	.	DP=42;ECNT=12;MBQ=32,29;MFRL=148,135;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=54.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,15:0.364:42:15,6:9,7:0|1:31239050_G_A:31239050:9,18,7,8
chr6	31239101	.	G	A,T	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=29,28,27;MFRL=65,160,142;MMQ=60,60,60;MPOS=22,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=32.77,33.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,9,11:0.345,0.438:25:5,4,6:0,5,4:2,3,6,14
chr6	31239114	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=152,145;MMQ=60,44;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:4,3:0|1:31239114_G_T:31239114:4,11,1,3
chr6	31239116	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=12;MBQ=32,24;MFRL=159,145;MMQ=56,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,4:0.227:20:9,1:4,3:0|1:31239114_G_T:31239114:4,12,1,3
chr6	31239141	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=28,30;MFRL=216,164;MMQ=54,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.415:10:4,3:2,1:0|1:31239141_C_T:31239141:1,5,1,3
chr6	31239151	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=26,31;MFRL=253,162;MMQ=52,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,2:2,1:0|1:31239141_C_T:31239141:0,5,2,3
chr6	31239170	.	C	CA	.	.	DP=14;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=216,164;MMQ=54,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.435:14:6,3:2,2:0|1:31239141_C_T:31239141:2,6,2,4
chr6	31239172	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=12;MBQ=34,29;MFRL=216,164;MMQ=54,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.435:14:5,3:2,2:0|1:31239141_C_T:31239141:2,6,2,4
chr6	31239205	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=12;MBQ=30,23;MFRL=198,189;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=20.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,3:4,3:5,7,5,2
chr6	31239279	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=175,227;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=34.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:4,5:4,4:7,2,7,2
chr6	31239306	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=161,199;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=25.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:5,7:3,6:7,1,10,3
chr6	31239407	.	G	T	.	.	DP=45;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=101.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,27:0.609:44:9,11:8,14:0|1:31239407_G_T:31239407:8,9,9,18
chr6	31239417	.	C	T	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=99.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,27:0.583:46:11,11:8,15:0|1:31239407_G_T:31239407:8,11,8,19
chr6	31239449	.	C	G	.	.	DP=46;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=157,248;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,8:0.187:46:21,4:17,4:13,25,3,5
chr6	31239501	.	G	T	.	.	DP=35;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=186,129;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,15:0.457:33:7,8:11,6:0|1:31239501_G_T:31239501:7,11,8,7
chr6	31239518	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=5;MBQ=30,27;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,17:0.515:33:5,8:11,7:0|1:31239501_G_T:31239501:8,8,9,8
chr6	31239652	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=155,191;MMQ=60,36;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.166:16:6,1:8,1:0|1:31239652_G_A:31239652:1,13,0,2
chr6	31239660	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=166,196;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:6,2:6,1:0|1:31239652_G_A:31239652:0,13,0,3
chr6	31239681	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=166,187;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,5:3,3:0|1:31239652_G_A:31239652:0,5,1,7
chr6	31239722	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=9;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,2,6
chr6	31239742	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=30,28;MFRL=184,164;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:0,4:4,1:0|1:31239742_G_C:31239742:2,2,4,1
chr6	31239752	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=9;MBQ=32,24;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:0,3:5,1:0|1:31239742_G_C:31239742:4,1,4,1
chr6	31239776	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=9;MBQ=29,31;MFRL=131,167;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=30.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.597:18:1,5:6,5:5,2,9,2
chr6	31239802	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=133,172;MMQ=60,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.542:22:1,5:9,7:5,5,10,2
chr6	31239821	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=33,25;MFRL=133,171;MMQ=60,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,14:0.500:28:7,5:6,9:0|1:31239821_G_T:31239821:7,7,11,3
chr6	31239827	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=9;MBQ=33,25;MFRL=133,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=53.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,16:0.494:32:7,4:9,9:0|1:31239821_G_T:31239821:8,8,11,5
chr6	31239855	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=9;MBQ=35,30;MFRL=134,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=32.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:6,5:7,7:7,6,6,6
chr6	31239868	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=35,33;MFRL=142,166;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=36.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.525:23:4,6:6,6:6,5,5,7
chr6	31322133	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=6;MBQ=27,35;MFRL=217,189;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:6,1:7,3:0|1:31322133_A_G:31322133:3,12,0,4
chr6	31322144	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=34,35;MFRL=225,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:5,2:5,3:0|1:31322133_A_G:31322133:3,7,1,4
chr6	31322175	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=6;MBQ=34,29;MFRL=152,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,5:2,0:0,3,3,2
chr6	31322220	.	CGCCA	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,35;MFRL=158,103;MMQ=60,50;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.306:8:1,0:5,1:0|1:31322220_CGCCA_C:31322220:0,6,0,2
chr6	31322229	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=28,34;MFRL=152,103;MMQ=60,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.332:7:0,1:5,1:0|1:31322220_CGCCA_C:31322220:0,5,0,2
chr6	31322303	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=6;MBQ=31,31;MFRL=125,109;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=52.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,20:0.470:42:13,4:9,13:11,11,16,4
chr6	31322395	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=27,30;MFRL=134,138;MMQ=60,55;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:3,1:9,1:4,10,1,1
chr6	31322402	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=5;MBQ=33,24;MFRL=115,150;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:2,1:10,1:2,10,2,1
chr6	31322459	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,31;MFRL=116,186;MMQ=60,42;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,5:5,0:4,4,0,5
chr6	31322470	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=146,161;MMQ=60,54;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.733:13:2,7:1,3:2,1,2,8
chr6	31322513	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:3,4:0,2:1,2,1,5
chr6	31322782	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=84,269;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:3,1,9,0
chr6	31322790	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=173,246;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,1:6,3:9,1,4,0
chr6	31322888	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=134,169;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.479:21:3,3:8,7:8,3,7,3
chr6	31322911	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.290:22:8,1:8,5:11,5,5,1
chr6	31322980	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,28;MFRL=156,180;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:6,2:14,4:0|1:31322980_C_T:31322980:8,14,1,5
chr6	31322996	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,27;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,7:0.243:31:8,2:13,5:0|1:31322980_C_T:31322980:7,17,3,4
chr6	31323012	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=164,257;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:3,3:16,1:7,13,1,3
chr6	31323020	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=5;MBQ=29,30;MFRL=160,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.312:27:7,1:11,7:0|1:31322980_C_T:31322980:5,14,2,6
chr6	31323039	.	T	TGAAGGGCTCCA	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=30,30;MFRL=155,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.371:22:5,1:9,6:6,8,4,4
chr6	31323233	.	A	G	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=133,137;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,8:0.217:38:11,4:19,3:13,17,3,5
chr6	31323296	.	A	G	.	.	DP=35;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=152,197;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=59.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:7,10:5,8:7,5,10,8
chr6	31323321	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=169,203;MMQ=48,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:13,2:12,1:13,12,2,1
chr6	31323337	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=26,27;MFRL=144,152;MMQ=60,40;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.349:30:8,7:9,3:9,11,4,6
chr6	31323409	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=7;MBQ=30,32;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,12:0.341:36:18,7:6,5:7,17,6,6
chr6	31323468	.	G	T	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=184,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,11:0.374:30:12,7:7,4:12,7,7,4
chr6	31323500	.	CCT	C	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=31,35;MFRL=144,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:17,3:8,0:0|1:31323500_CCT_C:31323500:16,14,3,0
chr6	31323506	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=139,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,3:0.117:32:21,3:7,0:0|1:31323500_CCT_C:31323500:15,14,3,0
chr6	31323945	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=31,32;MFRL=250,225;MMQ=60,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.490:8:3,1:1,2:3,1,3,1
chr6	31323953	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=35,34;MFRL=229,225;MMQ=60,44;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:4,3,2,0
chr6	31324003	.	TC	GT,AG	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=26,29,29;MFRL=149,118,162;MMQ=60,40,31;MPOS=9,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=23.35,5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,7,2:0.333,0.125:21:3,2,0:9,5,2:9,3,3,6
chr6	31324022	.	TCC	T	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=26,33;MFRL=115,213;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:3,1:20,2:0|1:31324022_TCC_T:31324022:14,10,0,3
chr6	31324024	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=31,29;MFRL=112,139;MMQ=60,40;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:3,0:16,3:12,7,1,2
chr6	31324025	.	G	GTC	.	.	DP=27;ECNT=7;MBQ=27,35;MFRL=115,213;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:4,1:19,2:0|1:31324022_TCC_T:31324022:14,10,0,3
chr6	31324036	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=23,27;MFRL=115,204;MMQ=60,40;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:3,1:18,3:12,10,0,4
chr6	31324077	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=11;MBQ=30,31;MFRL=133,239;MMQ=60,34;MPOS=29;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:6,0:16,4:0|1:31324077_C_G:31324077:10,13,2,2
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chr6	31324100	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=30,26;MFRL=132,239;MMQ=52,34;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:6,0:12,4:0|1:31324077_C_G:31324077:7,11,2,2
chr6	31324104	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=162,111;MMQ=52,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:6,0:11,5:7,10,2,3
chr6	31324144	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=27,26;MFRL=154,156;MMQ=60,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,1:5,2:4,10,0,3
chr6	31324151	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=168,136;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.387:16:7,1:3,5:2,8,1,5
chr6	31324154	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=145,168;MMQ=60,40;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,3:5,1:3,8,0,5
chr6	31324200	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=34,32;MFRL=221,230;MMQ=60,41;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:4,2,2,2
chr6	31324208	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=33,29;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0|1:31324208_G_T:31324208:4,1,1,2
chr6	31324210	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=11;MBQ=32,29;MFRL=223,233;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,1:4,2:0|1:31324208_G_T:31324208:4,1,1,2
chr6	31324245	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=11;MBQ=30,30;MFRL=219,233;MMQ=60,28;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,0:1,5:2,1,2,3
chr6	31324368	.	CA	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=225,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:4,0:7,3:0|1:31324368_CA_C:31324368:6,6,2,1
chr6	31324372	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=225,233;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:0|1:31324368_CA_C:31324368:6,6,2,1
chr6	31324524	.	GCC	G	.	.	DP=17;ECNT=17;MBQ=28,35;MFRL=65,183;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=26.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,7:0.444:16:5,4:4,2:0|1:31324524_GCC_G:31324524:5,4,3,4
chr6	31324528	.	G	GTT	.	.	DP=22;ECNT=17;MBQ=32,34;MFRL=65,173;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,13:0.583:22:5,4:4,3:0|1:31324524_GCC_G:31324524:5,4,4,9
chr6	31324531	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=17;MBQ=31,28;MFRL=65,183;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=56.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,15:0.615:24:5,8:4,4:0|1:31324524_GCC_G:31324524:5,4,5,10
chr6	31324536	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=17;MBQ=24,27;MFRL=65,183;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=57.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,15:0.640:23:5,9:3,6:0|1:31324524_GCC_G:31324524:4,4,5,10
chr6	31324586	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=28,27;MFRL=153,137;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=94.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,24:0.610:39:7,14:8,9:9,6,11,13
chr6	31324595	.	C	G	.	.	DP=43;ECNT=17;MBQ=30,31;MFRL=154,125;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=85.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,22:0.511:43:7,14:13,8:0|1:31324595_C_G:31324595:12,9,11,11
chr6	31324601	.	C	CG	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=31,27;MFRL=154,125;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=68.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,18:0.463:39:8,9:12,8:0|1:31324595_C_G:31324595:12,9,10,8
chr6	31324603	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=31,32;MFRL=153,114;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=64.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,17:0.474:36:8,9:10,8:0|1:31324595_C_G:31324595:12,7,10,7
chr6	31324615	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=17;MBQ=30,33;MFRL=135,243;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,2:0.080:35:17,0:16,2:20,13,0,2
chr6	31324641	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=17;MBQ=28,31;MFRL=135,259;MMQ=60,40;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:13,1:11,1:0|1:31324641_T_A:31324641:14,11,1,1
chr6	31324643	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=17;MBQ=32,30;MFRL=129,229;MMQ=60,40;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.143:26:11,2:11,1:14,9,1,2
chr6	31324664	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=17;MBQ=28,31;MFRL=135,229;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.111:34:15,1:15,2:0|1:31324641_T_A:31324641:12,19,2,1
chr6	31324666	.	A	T,C	.	.	DP=35;ECNT=17;MBQ=28,26,30;MFRL=159,229,120;MMQ=60,40,50;MPOS=16,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=8.44,39.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:14,3,15:0.108,0.460:32:7,1,8:7,2,7:5,9,9,9
chr6	31324702	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=17;MBQ=29,30;MFRL=135,136;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=59.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,17:0.450:38:10,9:11,6:0|1:31324702_C_T:31324702:10,11,5,12
chr6	31324705	.	A	C	.	.	DP=40;ECNT=17;MBQ=28,27;MFRL=144,136;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=59.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,17:0.439:39:10,9:12,6:0|1:31324702_C_T:31324702:11,11,5,12
chr6	31324706	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=17;MBQ=31,25;MFRL=151,101;MMQ=55,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,4:0.120:39:17,3:16,1:14,21,3,1
chr6	31324742	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=17;MBQ=25,29;MFRL=150,151;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.642:17:3,8:2,3:3,3,3,8
chr6	31324788	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=12;MBQ=29,32;MFRL=194,201;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.291:22:7,3:9,3:0|1:31324788_T_C:31324788:8,8,3,3
chr6	31324790	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=194,201;MMQ=60,56;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:6,3:9,3:0|1:31324788_T_C:31324788:8,8,3,3
chr6	31324820	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=12;MBQ=27,29;MFRL=181,208;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:9,1:13,2:15,8,1,2
chr6	31324829	.	GG	CA	.	.	DP=25;ECNT=12;MBQ=30,32;MFRL=189,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.518:25:5,5:6,6:5,7,10,3
chr6	31324851	.	A	AC	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=28,28;MFRL=173,175;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=C;STR;TLOD=37.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:2,3:8,6:6,6,12,0
chr6	31324887	.	GG	CT	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=33,34;MFRL=164,179;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,11:0.364:31:8,5:12,5:0|1:31324887_GG_CT:31324887:13,7,7,4
chr6	31324892	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=173,175;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,12:0.382:32:7,5:11,5:0|1:31324887_GG_CT:31324887:12,8,7,5
chr6	31324895	.	G	C	.	.	DP=31;ECNT=12;MBQ=27,33;MFRL=166,175;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,12:0.394:31:7,5:12,6:0|1:31324887_GG_CT:31324887:12,7,7,5
chr6	31324911	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=12;MBQ=30,35;MFRL=162,196;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.116:32:13,1:16,2:16,13,1,2
chr6	31324925	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=28,31;MFRL=162,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=58.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,16:0.415:39:10,9:13,6:0|1:31324925_A_G:31324925:13,10,7,9
chr6	31324931	.	A	C	.	.	DP=38;ECNT=12;MBQ=28,30;MFRL=156,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,18:0.475:38:9,8:11,8:0|1:31324925_A_G:31324925:10,10,8,10
chr6	31324953	.	C	T	.	.	DP=41;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=154,190;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=79.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,23:0.571:40:7,6:9,14:0|1:31324925_A_G:31324925:7,10,10,13
chr6	31324996	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=27,32;MFRL=132,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,16:0.587:27:3,6:8,10:4,7,3,13
chr6	31325004	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,25;MFRL=152,187;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.434:23:5,3:8,5:3,10,3,7
chr6	31325028	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=24,32;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,7:0.421:17:2,5:8,1:0|1:31325028_A_G:31325028:2,8,1,6
chr6	31325030	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=27,33;MFRL=142,180;MMQ=60,57;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:2,5:7,1:0|1:31325028_A_G:31325028:2,8,1,5
chr6	31325049	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=35,24;MFRL=152,162;MMQ=60,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,4:5,0:0|1:31325028_A_G:31325028:0,7,1,3
chr6	31371430	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=20,31;MFRL=111,248;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.377:19:7,2:4,4:6,6,4,3
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chr6	31378387	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=153,185;MMQ=60,48;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:4,3:6,2:4,6,3,2
chr6	31378768	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=321,237;MMQ=60,57;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,3,1
chr6	31378956	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=143,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:12,2:3,1:8,8,2,1
chr6	31378977	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,23;MFRL=147,98;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:7,4:5,1:6,6,3,2
chr6	31379109	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=122,126;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,2:6,1:0,7,0,4
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chr6	31379794	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=31,28;MFRL=161,181;MMQ=59,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,7:0.381:19:7,3:4,3:0|1:31379773_C_T:31379773:8,4,3,4
chr6	31379807	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=32,30;MFRL=156,181;MMQ=59,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,5:0.286:19:8,2:4,3:0|1:31379773_C_T:31379773:10,4,1,4
chr6	31379817	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,35;MFRL=160,185;MMQ=58,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,4:0.263:17:9,2:3,2:0|1:31379773_C_T:31379773:9,4,0,4
chr6	31379823	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=156,185;MMQ=59,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,4:0.277:16:8,2:3,2:0|1:31379773_C_T:31379773:8,4,0,4
chr6	31379931	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=142,188;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:9,4:2,2:3,8,5,1
chr6	31380091	.	C	CT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=195,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,3:5,0:8,3,2,1
chr6	31380161	.	G	GCTGCTGCTGCT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=191,96;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:0,3:3,6:2,1,4,6
chr6	31380194	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=198,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,7:0.348:21:3,2:10,4:0|1:31380194_T_C:31380194:8,6,4,3
chr6	31380198	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=31,26;MFRL=198,105;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,6:0.318:20:3,1:10,4:0|1:31380194_T_C:31380194:8,6,4,2
chr6	31382770	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=154,123;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:0,1:8,3:6,2,3,1
chr6	31382882	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=156,134;MMQ=54,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:14,1:3,3:3,14,2,2
chr6	31431082	.	A	G	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=157,178;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=82.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,29:0.611:47:7,18:11,10:7,11,13,16
chr6	31431723	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=163,266;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:4,8,1,1
chr6	31431813	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:10,2:7,2:0|1:31431813_A_G:31431813:9,8,3,1
chr6	31431820	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=178,135;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:13,8:0.390:21:7,3:6,5:1|0:31431813_A_G:31431813:7,6,5,3
chr6	31465915	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=154,148;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,2:2,4:4,1,4,2
chr6	31473546	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=115,176;MMQ=60,57;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.592:20:4,4:4,8:3,5,8,4
chr6	31473844	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=203,156;MMQ=55,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=37.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:0,4:2,7:2,0,9,2
chr6	31473957	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=156,176;MMQ=40,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,2:7,3:9,9,3,2
chr6	31474000	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:6,2:11,3:10,7,4,1
chr6	31475127	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=143,162;MMQ=60,52;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:6,5:1,2:3,4,5,3
chr6	31477461	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=164,251;MMQ=45,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:0,5:2,2:2,0,7,0
chr6	31477531	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,31;MFRL=189,174;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:6,4,2,1
chr6	31477681	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=171,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.828:15:1,7:1,6:0,2,2,11
chr6	31477767	.	CAG	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=128,259;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr6	31496776	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=207,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,5:3,3:4,2,5,3
chr6	31496925	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=169,79;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.392:18:2,4:9,2:7,4,6,1
chr6	31497457	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=142,155;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,1:1,3:1,0,4,0
chr6	31497478	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=142,144;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	31497622	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=151,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:2,2:9,1:8,3,2,1
chr6	31497706	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=135,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.519:25:6,9:6,4:9,3,7,6
chr6	31497744	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=107,202;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:4,3:3,4,3,3
chr6	31498244	.	G	GC	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=132,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.244:26:13,0:7,6:14,6,3,3
chr6	31498497	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=204,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr6	31506527	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=159,155;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,2:9,0:14,2,2,0
chr6	31506624	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=24,30;MFRL=128,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,9:0.345:27:10,4:8,5:0|1:31506624_T_C:31506624:11,7,5,4
chr6	31506648	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=139,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=42.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,13:0.400:33:11,5:7,8:0|1:31506624_T_C:31506624:10,10,6,7
chr6	31506691	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=133,144;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:9,2:4,8:7,7,5,5
chr6	31506744	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=148,121;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.477:21:6,3:5,7:4,7,4,6
chr6	31506854	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=184,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,7:2,4:2,2,8,3
chr6	31509355	.	G	A	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=145,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=88.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,26:0.458:57:11,11:10,13:0|1:31509355_G_A:31509355:24,7,18,8
chr6	31509372	.	G	A	.	.	DP=56;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=161,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=84.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,24:0.446:54:8,12:18,12:0|1:31509355_G_A:31509355:22,8,15,9
chr6	31509432	.	G	A	.	.	DP=49;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=159,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=62.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,25:0.542:46:12,14:9,11:9,12,6,19
chr6	31513864	.	A	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=123,166;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,12:0.400:31:8,9:8,3:11,8,9,3
chr6	31514153	.	GCTGT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=217,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTGT;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.504:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	31514426	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=195,82;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:31514426_G_C:31514426:0,3,0,1
chr6	31514433	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=195,82;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:31514426_G_C:31514426:0,3,0,1
chr6	31514437	.	C	CAGTACTGCTCTCATGCCTAGCATTTTACTAAGAGCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=217,195;MMQ=60,54;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.319:5:1,1:2,0:0,4,0,1
chr6	31525319	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,194;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	31525912	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,7:0,0,12,6
chr6	31540784	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=111,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,7:7,1:6,6,3,5
chr6	31555130	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,163;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:5,5:7,5:8,4,2,8
chr6	31555392	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:5,3:4,1:6,4,4,0
chr6	31583312	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=138,116;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:7,3:2,1:4,6,2,2
chr6	31584469	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=176,86;MMQ=60,33;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:9,0:8,4:3,14,0,4
chr6	31591557	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,2:0.099:28:11,1:15,1:11,15,1,1
chr6	31594628	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=166,200;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.569:16:2,3:2,6:3,4,6,3
chr6	31595882	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=140,107;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:0,3:7,1:4,3,2,2
chr6	31597100	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=153,108;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.136:27:6,0:18,3:14,10,1,2
chr6	31598293	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	31600304	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,210;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:6,1:1,2:2,5,2,1
chr6	31600326	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=206,102;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:5,5,0,2
chr6	31600467	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:5,1:9,1:0|1:31600467_G_A:31600467:9,6,0,2
chr6	31600469	.	C	CCTGATGAGGGGATCG	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=198,114;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.152:17:4,1:10,1:0|1:31600467_G_A:31600467:9,6,0,2
chr6	31600820	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=145,237;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	31600851	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,19;MFRL=145,266;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.586:3:1,1:0,0:0,1,0,2
chr6	31601344	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:0,5:2,5:2,0,5,5
chr6	31601513	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:1,5,1,5
chr6	31601843	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=189,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:8,5:2,1:3,7,0,6
chr6	31602967	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=157,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=57.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,21:0.611:34:10,12:3,9:0|1:31602967_G_A:31602967:6,7,12,9
chr6	31602972	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=171,119;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:29,4:0.142:33:17,4:11,0:1|0:31602967_G_A:31602967:13,16,4,0
chr6	31603770	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=109,241;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,1:8,1:9,10,1,1
chr6	31604044	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=44.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,4,8
chr6	31605167	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=172,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:4,1:5,7:5,4,5,3
chr6	31606901	.	C	CAAAG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=134,152;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAAG;STR;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,4:2,1:3,4,4,1
chr6	31607050	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=290,311;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,1,2
chr6	31607096	.	T	TC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=226,311;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:2,3,1,2
chr6	31609272	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=173,210;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,3:6,0:7,4,0,3
chr6	31610123	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=100,0;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:4,0,1,0
chr6	31611777	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=162,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:8,1:5,1:7,7,2,0
chr6	31613165	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=196,381;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr6	31614102	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=252,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr6	31616366	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=196,224;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr6	31619555	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:5,2,2,0
chr6	31623873	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=160,125;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.373:27:9,3:8,6:8,9,3,7
chr6	31624922	.	C	CA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=184,90;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr6	31625507	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=195,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.360:23:7,5:8,3:8,7,4,4
chr6	31625541	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=202,88;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:8,0:2,12,2,0
chr6	31627523	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=205,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=39.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:4,7:4,8:3,5,9,6
chr6	31628113	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:4,2:4,1:2,6,0,3
chr6	31629953	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=214,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	31630241	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=177,172;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=21.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.433:21:5,7:7,2:4,8,4,5
chr6	31632134	.	C	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.196:37:13,3:17,3:20,10,4,3
chr6	31634758	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,7:0,8:0,0,0,15
chr6	31634776	.	C	CACCAAGTGAAACAATGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=191,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0,4,0,1
chr6	31637807	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	31639757	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=138,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:5,2:8,1:5,8,3,0
chr6	31648174	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=204,75;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:6,2:3,9,1,1
chr6	31657413	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=148,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,6:4,5:1,5,7,4
chr6	31657754	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,3,0
chr6	31657924	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=181,58;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,2:6,2:2,9,4,0
chr6	31659731	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:4,3:5,4:0,9,2,5
chr6	31669149	.	TAC	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=152,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.605:18:5,4:2,7:2,5,4,7
chr6	31675297	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=181,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,3:6,1:4,6,0,4
chr6	31675501	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:8,9,1,1
chr6	31678028	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=223,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:2,2,2,0
chr6	31681493	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,12;MFRL=0,368;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,0:1,0:0,2,1,0
chr6	31685654	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	31687008	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=171,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:3,5:6,3:2,7,3,5
chr6	31691657	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.462:22:6,5:5,5:7,5,5,5
chr6	31691850	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=162,284;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:7,1:0,1:1,6,1,1
chr6	31701654	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=134,192;MMQ=60,24;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:13,4:12,0:11,14,4,0
chr6	31708147	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=129,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,1:4,3:8,0,4,0
chr6	31708463	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=215,291;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	31709004	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:10,0:6,3:10,7,3,0
chr6	31710968	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=102,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.308:24:10,5:6,2:6,11,1,6
chr6	31712196	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=133,268;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,0:4,2:5,1,2,0
chr6	31726031	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=160,69;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,0:15,3:10,16,1,2
chr6	31726253	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=193,271;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:8,0:4,2:10,2,1,1
chr6	31727857	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=143,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,2:0.094:30:14,0:13,2:13,15,0,2
chr6	31727897	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=136,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,4:0.152:31:16,3:10,1:9,18,1,3
chr6	31729359	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.850:11:1,7:0,3:1,0,5,5
chr6	31731014	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=247,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,2,2
chr6	31733650	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.542:13:3,1:2,6:3,3,5,2
chr6	31733950	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=186,285;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:4,0:1,2:6,0,2,0
chr6	31734345	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=210,224;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:6,1:5,2:10,2,1,2
chr6	31734890	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=115,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.703:5:1,2:0,0:1,0,1,3
chr6	31740861	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=160,132;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.418:12:3,4:4,0:3,4,5,0
chr6	31743838	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:9,1:3,3:7,5,1,3
chr6	31745284	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=150,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.546:7:3,2:0,1:3,0,4,0
chr6	31745347	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=146,252;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,3:5,0:0|1:31745347_T_G:31745347:12,9,3,0
chr6	31745354	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=136,252;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.154:24:13,3:5,0:0|1:31745347_T_G:31745347:11,10,3,0
chr6	31745518	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=105,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,1:3,3,0,3
chr6	31746962	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=190,120;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:1,1,1,1
chr6	31748689	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=169,159;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:5,6:1,0:2,4,5,1
chr6	31749348	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=186,56;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:0|1:31749348_C_T:31749348:10,6,1,1
chr6	31749350	.	G	GATCCACGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=186,56;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:8,0:7,2:0|1:31749348_C_T:31749348:10,6,1,1
chr6	31751056	.	CA	TG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	31752072	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,33;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:5,0:9,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:8,7,0,2
chr6	31752074	.	C	CTCT	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,36;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.153:17:6,0:9,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:8,7,0,2
chr6	31752078	.	G	GCTCTCTCACTCTCTC	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=28,34;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:9,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:8,6,0,2
chr6	31752081	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=28,30;MFRL=176,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:6,0:8,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:8,7,0,2
chr6	31752084	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=25,35;MFRL=151,157;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.165:16:6,0:8,2:0|1:31752072_C_CT:31752072:7,7,0,2
chr6	31765861	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,25;MFRL=152,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.414:8:3,3:2,0:2,3,0,3
chr6	31766186	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=118,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.417:22:4,9:9,0:9,4,9,0
chr6	31766294	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:3,6,0,2
chr6	31778272	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=188,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=59.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,23:0.649:35:6,13:6,10:4,8,9,14
chr6	31783507	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=116,198;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=40.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.590:22:4,7:4,6:7,2,12,1
chr6	31783755	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,333;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	31785228	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=129,141;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.702:25:4,4:3,13:2,5,7,11
chr6	31797587	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=162,182;MMQ=52,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,4:6,3:5,4,6,1
chr6	31797769	.	A	AAAGTT	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAGTT;STR;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.514:31:9,11:5,3:10,5,8,8
chr6	31797923	.	GTTTTTTTT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,14;MFRL=150,220;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=24,16;RU=T;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.391:3:1,0:0,0:1,1,0,1
chr6	31830468	.	C	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,7:0.199:38:18,0:13,7:13,18,0,7
chr6	31832356	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=151,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.328:10:6,1:1,2:7,0,3,0
chr6	31837488	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=180,167;MMQ=53,42;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31837488_C_T:31837488:0,4,0,1
chr6	31837490	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=180,167;MMQ=53,42;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:31837488_C_T:31837488:0,4,0,1
chr6	31837501	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=192,167;MMQ=46,42;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:31837488_C_T:31837488:0,4,0,1
chr6	31838490	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=150,152;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:8,7:3,1:4,7,5,3
chr6	31838545	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=212,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,7:2,1:3,6,3,5
chr6	31838713	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=152,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:3,1,1,2
chr6	31839309	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=162,164;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.388:16:5,1:5,4:0|1:31839309_C_T:31839309:4,6,2,4
chr6	31839331	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=162,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.384:11:5,2:2,1:0|1:31839309_C_T:31839309:3,4,1,3
chr6	31842652	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=181,244;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.252:10:2,0:5,2:2,6,1,1
chr6	31848492	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,201;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:10,0:6,2:7,9,2,0
chr6	31851234	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=167,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:6,5:10,2:8,8,4,3
chr6	31855914	.	CG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=159,54373331;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:4,1:2,6,0,2
chr6	31856070	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=165,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=15.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:4,3:1,3:3,2,3,3
chr6	31860337	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=158,189;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:3,0:4,2:2,5,0,2
chr6	31864304	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=33.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,3:1,8:1,2,7,4
chr6	31864547	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=191,161;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:10,2:11,1:7,14,1,2
chr6	31865056	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31907168	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=152,180;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	31910929	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,25;MFRL=175,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,3:5,0:0|1:31910929_G_A:31910929:8,2,1,2
chr6	31910938	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=175,208;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,3:5,1:0|1:31910929_G_A:31910929:9,1,2,2
chr6	31911665	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=178,144;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,3:6,0:10,3,3,0
chr6	31914935	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:2,4:3,5:2,3,5,4
chr6	31919578	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=205,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:5,1,2,0
chr6	31922254	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=165,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=15.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:1,2,3,2
chr6	31928306	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=192,204;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:6,3:11,1:9,8,2,2
chr6	31928799	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=128,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,6:1,2:3,2,7,1
chr6	31929014	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=129,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,16:0.531:30:8,7:6,9:9,5,7,9
chr6	31930441	.	G	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=45.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.729:24:1,7:5,9:4,2,11,7
chr6	31930462	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=146,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:4,2:11,3:9,6,1,4
chr6	31932177	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=202,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	31933529	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=217,208;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:5,1,5,0
chr6	31933867	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=215,227;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:1,3,0,2
chr6	31935901	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:5,2:1,1:0,6,0,3
chr6	31935928	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=238,196;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,3:1,0:0,6,0,3
chr6	31936668	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=152,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,3:2,5:5,1,5,3
chr6	31936679	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,4:4,4:7,4,6,2
chr6	31946837	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,130;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	31948421	.	TCTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=181,170;MMQ=52,49;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,2:5,6:5,2,6,2
chr6	31963624	.	G	GTAAGTGTAAACAGCCTTCTGAGCATGCTCTTCCA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=156,92;MMQ=27,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.321:5:2,1:2,0:0|1:31963624_G_GTAAGTGTAAACAGCCTTCTGAGCATGCTCTTCCA:31963624:1,3,0,1
chr6	31963626	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=156,92;MMQ=27,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.321:5:1,1:2,0:0|1:31963624_G_GTAAGTGTAAACAGCCTTCTGAGCATGCTCTTCCA:31963624:1,3,0,1
chr6	31965493	.	C	CTATATACCTAATG	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,140;MMQ=60,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.677:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	31994742	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=23,26;MFRL=256,219;MMQ=27,27;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.414:3:0,0:1,1:0|1:31994742_A_G:31994742:2,0,1,0
chr6	31994750	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=233,219;MMQ=27,27;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:31994742_A_G:31994742:2,0,1,0
chr6	32006597	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=158,218;MMQ=53,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,5:3,1:3,2,2,4
chr6	32006858	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=235,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.566:12:3,4:2,2:2,3,5,2
chr6	32007063	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=270,198;MMQ=31,34;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,1,1
chr6	32007258	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=170,177;MMQ=40,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.519:4:0,0:1,0:0|1:32007258_A_C:32007258:1,1,2,0
chr6	32007264	.	AG	CC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=23,21;MFRL=191,177;MMQ=60,34;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.381:6:1,1:2,0:0|1:32007258_A_C:32007258:1,3,2,0
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chr6	32026107	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,22;MFRL=240,65;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.756:6:0,5:1,0:0,1,2,3
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chr6	32029183	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=221,153;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:4,0,2,1
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chr6	32050067	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=303,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.636:14:3,3:1,6:2,3,2,7
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chr6	32065013	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=178,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:6,2:3,0:3,6,0,2
chr6	32065023	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=182,146;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,3:3,0:3,5,0,3
chr6	32089142	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=202,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:2,2:3,6:3,2,2,6
chr6	32095392	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=117,209;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:18,2:10,1:23,7,3,0
chr6	32119898	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=106,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.803:13:1,3:1,8:1,1,3,8
chr6	32122386	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=141,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,3:6,5:2,6,4,4
chr6	32122472	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=185,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:7,4:10,2:10,7,3,3
chr6	32123361	.	C	CTG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=173,265;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,18;RU=TG;STR;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr6	32123702	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,0;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.137:27:10,1:14,2:13,11,0,3
chr6	32125438	.	TCAATGCCAGCAGCTTCCTGGCCCTGATCAATGGGGAAAGAGACCATCC	T	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=143,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,2:0.065:44:7,0:12,2:17,25,1,1
chr6	32130428	.	TA	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=154,161;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.263:17:4,0:9,4:6,7,0,4
chr6	32134510	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=184,262;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,2:3,1:4,4,1,2
chr6	32134656	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=176,148;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:11,0:6,3:9,8,1,2
chr6	32147291	.	CTT	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=128,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=T;STR;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.292:18:8,0:4,5:10,3,2,3
chr6	32147478	.	G	T	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=168,144;MMQ=46,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=37.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,16:0.404:40:16,9:8,7:13,11,7,9
chr6	32147761	.	T	C	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=117,179;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=75.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,26:0.645:40:7,10:7,16:5,9,12,14
chr6	32149260	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=131,163;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.198:23:5,3:14,1:11,8,1,3
chr6	32150272	.	G	GT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=11.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:3,3:2,1:5,0,4,0
chr6	32150434	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=143,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:12,0:8,9:11,9,0,9
chr6	32150498	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=171,222;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,3:8,1:3,12,4,0
chr6	32151934	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=140,179;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:15,0:8,4:15,8,3,1
chr6	32151994	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=140,180;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,14:0.556:25:9,8:2,6:5,6,2,12
chr6	32154285	.	A	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=188,176;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=55.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,18:0.576:31:9,10:4,8:9,4,12,6
chr6	32154998	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=133,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.162:29:11,0:13,4:18,7,3,1
chr6	32155249	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=198,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr6	32155581	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=160,261;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:5,2:5,1:6,4,1,2
chr6	32156482	.	CG	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,126;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=G;STR;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.135:28:11,1:13,2:9,16,3,0
chr6	32159956	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=89,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,15:0.503:30:8,5:6,10:6,9,8,7
chr6	32165444	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=188,312;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,2:3,0:0,4,0,2
chr6	32166160	.	CTT	C,CTTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35,35;MFRL=143,196,179;MMQ=60,60,60;MPOS=24,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,14;RU=T;STR;TLOD=5.72,4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,3:0.240,0.308:10:1,3,3:3,0,0:4,0,5,1
chr6	32167009	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=213,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:0,5,1,4
chr6	32168771	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=124,299;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.201:13:5,2:5,0:3,8,1,1
chr6	32171683	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=74,205;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:3,4:0,3:2,1,3,4
chr6	32172065	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=49.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:4,8:3,8:4,3,9,7
chr6	32178773	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=4550441,227;MMQ=47,50;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:1,1,0,2
chr6	32183175	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=145,288;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:5,3:4,0:3,6,1,2
chr6	32184705	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=175,121;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.524:15:0,5:7,2:7,0,3,5
chr6	32184790	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=171,87;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:8,0:10,3:9,9,1,2
chr6	32185922	.	CAG	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:0,4:3,8:0,3,2,10
chr6	32187605	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=183,126;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.581:12:3,3:1,4:2,3,3,4
chr6	32187836	.	G	GCC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=102,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=3,5;RU=C;STR;TLOD=19.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,4:3,2:5,1,4,2
chr6	32188099	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=140,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,1:9,2:7,9,1,2
chr6	32188383	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=155,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=34.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.748:14:2,7:1,3:0,3,6,5
chr6	32188996	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=147,268;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:4,9,2,0
chr6	32189032	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=159,158;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.589:15:4,5:2,4:1,5,5,4
chr6	32190217	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=222,236;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:1,3:1,3:2,0,6,0
chr6	32190620	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,217;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr6	32191581	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=169,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.534:11:2,1:2,3:5,0,5,1
chr6	32191658	.	T	TAGCAGC	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=169,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=AGC;STR;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.479:5:1,0:2,2:1,2,0,2
chr6	32191730	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=165,237;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=22.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.753:10:2,4:0,4:0,2,0,8
chr6	32268501	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=161,51;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,4:6,1:5,7,3,2
chr6	32270283	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=107,147;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:9,1,2,0
chr6	32270363	.	A	T	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=101,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.121:31:15,2:13,1:8,20,1,2
chr6	32290208	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=135,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:7,3,2,0
chr6	32290851	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:12,2:4,0:6,10,2,0
chr6	32290927	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=171,151;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,3:6,0:5,4,1,2
chr6	32290954	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,31;MFRL=154,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:5,4,0,2
chr6	32291327	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=86,110;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=47.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:7,15:3,0:4,6,15,0
chr6	32291359	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=110,166;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,5:0.154:37:22,3:8,2:21,11,3,2
chr6	32292392	.	C	CAACT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=184,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:3,1,3,1
chr6	32292560	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=13.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.726:5:0,1:1,3:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,1,0,4
chr6	32292571	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=179,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.438:5:0,1:2,1:0|1:32292560_AT_A:32292560:0,3,0,2
chr6	32298372	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=62,95;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:11,0:7,3:12,6,2,1
chr6	32298438	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0|1:32298438_C_G:32298438:0,4,0,2
chr6	32298440	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=36,33;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:32298440_C_G:32298440:0,3,0,3
chr6	32298444	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,29;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.373:6:0,0:4,2:0|1:32298438_C_G:32298438:0,4,0,2
chr6	32298446	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=35,35;MFRL=159,197;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:0|1:32298440_C_G:32298440:0,3,0,3
chr6	32303236	.	TA	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=140,95;MMQ=60,43;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=14.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.365:23:10,2:5,6:5,10,0,8
chr6	32307446	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=148,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,2:5,0:2,6,1,1
chr6	32311152	.	G	GCACTCGCGTTTATTCCAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=287,142;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0,2,0,1
chr6	32317467	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=204,382;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:6,1,1,1
chr6	32323529	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	32333936	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=185,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:12,3:6,2:9,9,3,2
chr6	32335777	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=163,221;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:3,2:8,0:1,10,1,1
chr6	32336495	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=131,181;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.231:24:12,2:7,3:15,4,5,0
chr6	32336586	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=142,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,0:11,5:9,13,4,1
chr6	32337630	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=222,153;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,3:9,0:15,4,2,1
chr6	32337686	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:5,3:6,0:7,5,3,0
chr6	32339348	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,105;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr6	32339541	.	G	GTTTAGAAATTTTCTCAGGCATGTGCTTTT	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=197,209;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1,3,0,1
chr6	32339548	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,1,3
chr6	32361821	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=150,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:7,0:10,5:7,10,1,4
chr6	32362416	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=23,35;MFRL=183,212;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	32363816	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=180,238;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,0:3,3:6,1,3,0
chr6	32363844	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=176,212;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,2:8,3:11,3,4,1
chr6	32363955	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=169,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:10,2:8,3:9,9,2,3
chr6	32364034	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=135,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.147:18:5,2:11,0:8,8,1,1
chr6	32364190	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=264,257;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	32370616	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=233,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr6	32370684	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=164,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,1:8,4:12,3,3,2
chr6	32370835	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=174,183;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:10,2:10,2:14,6,3,1
chr6	32370890	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=162,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:7,0:10,2:8,9,0,2
chr6	32407709	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=161,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,1:8,1:13,5,2,0
chr6	32410137	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=0,33;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	32410159	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=162,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,2:5,1:7,0,3,0
chr6	32410210	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=27,33;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.142:26:7,1:13,2:0|1:32410210_T_C:32410210:15,8,1,2
chr6	32410215	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=26,30;MFRL=175,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,3:0.125:30:10,1:16,2:0|1:32410210_T_C:32410210:17,10,1,2
chr6	32410941	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=147,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:7,4:8,4,4,3
chr6	32410987	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:2,4:5,4:3,4,5,3
chr6	32411035	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=160,139;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.271:20:8,2:7,3:8,7,4,1
chr6	32411307	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=236,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,1:2,3:0,5,2,2
chr6	32411523	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=104,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:8,3:15,4:9,14,6,1
chr6	32411726	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=161,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,3:1,4:1,4,0,7
chr6	32485397	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=156,243;MMQ=60,33;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,2,0
chr6	32485410	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=148,191;MMQ=60,39;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.282:5:0,1:4,0:0|1:32485410_G_T:32485410:3,1,1,0
chr6	32485421	.	TC	GT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,36;MFRL=161,191;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:32485410_G_T:32485410:2,1,1,0
chr6	32485912	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=36,20;MFRL=96,47;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,5,1,1
chr6	32485917	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=31,20;MFRL=144,47;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,0:1,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,7,1,1
chr6	32485922	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=29,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:2,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,6,1,1
chr6	32485929	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:3,0:3,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,6,1,1
chr6	32485931	.	CA	AG	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=34,20;MFRL=159,47;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,6,1,1
chr6	32485934	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=25,33;MFRL=163,47;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,1:0|1:32485912_CAA_C:32485912:0,5,1,1
chr6	32485952	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=176,257;MMQ=60,50;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:3,1:2,2:0|1:32485952_C_G:32485952:0,5,0,3
chr6	32485972	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=183,257;MMQ=60,50;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,1:2,2:0|1:32485952_C_G:32485952:0,6,0,3
chr6	32487062	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=33,35;MFRL=212,309;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32487062_G_C:32487062:1,0,1,0
chr6	32487068	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=25,36;MFRL=212,309;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:32487062_G_C:32487062:1,0,1,0
chr6	32487091	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,36;MFRL=158,309;MMQ=60,48;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32487062_G_C:32487062:2,0,1,0
chr6	32487094	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=24,34;MFRL=158,309;MMQ=60,48;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32487062_G_C:32487062:2,0,1,0
chr6	32487096	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=158,309;MMQ=60,48;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:32487062_G_C:32487062:2,0,1,0
chr6	32487144	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=26,26;MFRL=108,169;MMQ=51,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:3,1,2,0
chr6	32487170	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=109,169;MMQ=33,38;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:5,2,2,0
chr6	32487175	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=29,27;MFRL=106,169;MMQ=30,38;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr6	32487268	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=6;MBQ=28,31;MFRL=165,180;MMQ=60,34;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:2,2,0,2
chr6	32487277	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=30,27;MFRL=197,180;MMQ=60,34;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:3,3,0,2
chr6	32487294	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=31,29;MFRL=172,273;MMQ=60,50;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:4,5,0,2
chr6	32487309	.	TG	CA	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=28,32;MFRL=157,261;MMQ=60,50;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.449:11:3,3:3,1:4,2,2,3
chr6	32487314	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=6;MBQ=29,27;MFRL=221,274;MMQ=50,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:4,1:5,6,2,0
chr6	32487353	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=28,35;MFRL=157,271;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,4:3,0:3,4,4,0
chr6	32489925	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,27;MFRL=152,240;MMQ=60,41;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:0|1:32489925_C_T:32489925:5,6,2,0
chr6	32489933	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=22,34;MFRL=140,240;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:4,1:5,1:0|1:32489925_C_T:32489925:5,5,2,0
chr6	32489939	.	TG	CA	.	.	DP=12;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=140,240;MMQ=60,41;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,1:3,1:0|1:32489925_C_T:32489925:4,6,2,0
chr6	32489943	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=141,240;MMQ=60,41;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:0|1:32489925_C_T:32489925:3,5,2,0
chr6	32489967	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,26;MFRL=154,206;MMQ=60,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	32497847	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=13;MBQ=28,33;MFRL=123,166;MMQ=51,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:5,4:8,1:12,4,4,2
chr6	32497857	.	T	TA	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=24,27;MFRL=131,147;MMQ=51,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:6,4:17,0:0|1:32497857_T_TA:32497857:19,6,3,1
chr6	32497860	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=13;MBQ=24,32;MFRL=131,147;MMQ=51,34;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,4:0.161:29:6,3:19,0:0|1:32497857_T_TA:32497857:19,6,3,1
chr6	32497863	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=13;MBQ=31,30;MFRL=122,220;MMQ=51,57;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.091:31:9,1:19,1:22,7,1,1
chr6	32497868	.	C	G	.	.	DP=39;ECNT=13;MBQ=32,26;MFRL=153,107;MMQ=52,49;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,11:0.331:34:11,1:12,10:16,7,7,4
chr6	32497887	.	A	T	.	.	DP=53;ECNT=13;MBQ=25,29;MFRL=132,175;MMQ=51,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:47,6:0.127:53:14,5:33,1:0|1:32497887_A_T:32497887:29,18,5,1
chr6	32497896	.	A	G,T	.	.	DP=52;ECNT=13;MBQ=29,20,29;MFRL=133,79,175;MMQ=52,27,40;MPOS=19,17;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.78,18.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:41,3,6:0.076,0.127:50:7,3,5:32,0,1:25,16,7,2
chr6	32497901	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=30,20;MFRL=134,79;MMQ=51,27;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:51,3:0.071:54:13,3:38,0:34,17,2,1
chr6	32497904	.	C	T	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=30,25;MFRL=131,236;MMQ=51,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.090:53:15,1:34,3:32,17,3,1
chr6	32497905	.	G	T	.	.	DP=54;ECNT=13;MBQ=27,25;MFRL=171,115;MMQ=52,47;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,22:0.417:53:12,3:18,19:21,10,14,8
chr6	32497918	.	C	G	.	.	DP=45;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=133,180;MMQ=55,44;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:43,2:0.064:45:12,1:29,1:0|1:32497887_A_T:32497887:25,18,2,0
chr6	32497928	.	G	C	.	.	DP=40;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=134,180;MMQ=58,44;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:12,1:24,1:0|1:32497887_A_T:32497887:20,18,2,0
chr6	32497961	.	TT	GC	.	.	DP=16;ECNT=13;MBQ=30,31;MFRL=123,178;MMQ=60,45;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:3,1:9,1:6,7,2,0
chr6	32498011	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=153,180;MMQ=51,45;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:7,6,0,2
chr6	32498033	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=34,25;MFRL=193,121;MMQ=52,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,1:8,3:3,12,2,2
chr6	32498041	.	CA	TG	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=180,212;MMQ=54,52;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:5,13,0,2
chr6	32498067	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=5;MBQ=29,34;MFRL=181,211;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.527:17:5,4:3,5:1,7,2,7
chr6	32498094	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=210,214;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.336:10:4,2:2,1:0,7,1,2
chr6	32546743	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=11;MBQ=33,23;MFRL=214,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,2:1,2:3,0,3,1
chr6	32546795	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=26,30;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:32546795_T_A:32546795:3,0,1,0
chr6	32546800	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=30,33;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:32546795_T_A:32546795:3,0,1,0
chr6	32546803	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=11;MBQ=30,27;MFRL=181,190;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:32546795_T_A:32546795:2,0,1,0
chr6	32546866	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=160,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,1:3,1:7,3,0,2
chr6	32546918	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=34,24;MFRL=188,115;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,7:0.362:20:9,4:4,3:0|1:32546918_G_A:32546918:6,7,1,6
chr6	32546928	.	CA	C	.	.	DP=20;ECNT=11;MBQ=35,30;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.239:19:7,3:6,1:0|1:32546928_CA_C:32546928:4,11,1,3
chr6	32546938	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=28,27;MFRL=147,225;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:7,3:5,1:0|1:32546928_CA_C:32546928:4,10,1,3
chr6	32546941	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=156,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.412:15:6,3:3,3:0|1:32546918_G_A:32546918:4,5,1,5
chr6	32546950	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=11;MBQ=23,33;MFRL=160,133;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:7,2:2,2:0|1:32546918_G_A:32546918:4,5,0,4
chr6	32546953	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=33,26;MFRL=157,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:0|1:32546918_G_A:32546918:3,5,0,4
chr6	32547903	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=8;MBQ=0,26;MFRL=0,186;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	32547947	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=8;MBQ=34,30;MFRL=144,150;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:6,1:6,2:5,7,2,1
chr6	32547982	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=144,91;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,5:0.146:39:14,1:18,4:0|1:32547982_G_A:32547982:15,19,4,1
chr6	32547988	.	T	C	.	.	DP=42;ECNT=8;MBQ=26,30;MFRL=130,215;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,9:0.232:41:11,5:20,3:0|1:32547988_T_C:32547988:15,17,4,5
chr6	32547990	.	TG	AA	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=152,114;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.178:43:17,1:18,5:0|1:32547982_G_A:32547982:15,21,5,2
chr6	32547991	.	G	A	.	.	DP=43;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=137,173;MMQ=60,46;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,11:0.301:37:11,6:15,5:0|1:32547988_T_C:32547988:11,15,5,6
chr6	32547997	.	T	G	.	.	DP=44;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=152,114;MMQ=60,40;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:36,7:0.178:43:15,1:19,5:0|1:32547982_G_A:32547982:16,20,5,2
chr6	32548026	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=135,194;MMQ=54,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,8:0.264:32:11,5:13,3:8,16,4,4
chr6	32548082	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=10;MBQ=29,28;MFRL=152,139;MMQ=60,48;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,13:0.467:28:10,4:5,9:5,10,10,3
chr6	32548113	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=10;MBQ=32,20;MFRL=175,109;MMQ=60,49;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,10:0.439:23:7,3:6,7:0|1:32548113_G_A:32548113:4,9,7,3
chr6	32548120	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=10;MBQ=34,25;MFRL=176,109;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=28.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:4,2:6,5:0|1:32548113_G_A:32548113:4,7,5,4
chr6	32548136	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=10;MBQ=33,32;MFRL=176,158;MMQ=55,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,8:0.562:14:1,4:4,4:0|1:32548136_T_G:32548136:1,5,1,7
chr6	32548141	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=10;MBQ=30,32;MFRL=176,142;MMQ=55,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:2,4:2,3:0|1:32548136_T_G:32548136:1,5,0,7
chr6	32548148	.	AA	GT	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=142,215;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:4,2:3,1:0|1:32548148_AA_GT:32548148:1,6,0,3
chr6	32548153	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=33,28;MFRL=141,215;MMQ=46,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:0|1:32548148_AA_GT:32548148:0,6,0,3
chr6	32548155	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=10;MBQ=33,26;MFRL=185,124;MMQ=46,34;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0,6,0,2
chr6	32548167	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=10;MBQ=25,31;MFRL=128,228;MMQ=46,33;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,4:1,0:0,4,0,4
chr6	32548178	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=10;MBQ=25,32;MFRL=152,203;MMQ=52,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.786:7:1,4:0,2:0,1,0,6
chr6	32548430	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=176,225;MMQ=60,49;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:3,1:5,1:7,1,1,1
chr6	32548435	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=34,24;MFRL=170,176;MMQ=58,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr6	32548466	.	CA	TA,TC	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=33,27,31;MFRL=174,106,225;MMQ=60,60,49;MPOS=16,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.30,5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:19,3,2:0.148,0.103:24:9,2,1:10,1,1:18,1,4,1
chr6	32548470	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=16;MBQ=35,25;MFRL=165,140;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:11,2:10,3:21,1,4,1
chr6	32548489	.	C	G	.	.	DP=35;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,6:0.189:35:13,3:16,3:24,5,6,0
chr6	32548492	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=16;MBQ=25,32;MFRL=149,106;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,5:0.157:36:13,3:18,2:27,4,4,1
chr6	32548497	.	AGAGC	A	.	.	DP=39;ECNT=16;MBQ=29,32;MFRL=149,112;MMQ=60,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,6:0.179:37:11,4:17,2:28,3,5,1
chr6	32548505	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=144,138;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:14,2:20,1:29,5,3,0
chr6	32548507	.	C	A	.	.	DP=40;ECNT=16;MBQ=35,28;MFRL=148,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=82.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,25:0.650:38:8,8:5,16:11,2,22,3
chr6	32548513	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=33,33;MFRL=155,112;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:11,4:21,2:28,4,5,1
chr6	32548514	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=148,104;MMQ=60,58;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,8:0.209:41:14,2:18,5:0|1:32548514_G_A:32548514:29,4,7,1
chr6	32548520	.	C	T	.	.	DP=42;ECNT=16;MBQ=32,25;MFRL=139,104;MMQ=60,58;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,8:0.214:40:15,3:17,4:0|1:32548514_G_A:32548514:28,4,7,1
chr6	32548550	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=16;MBQ=33,25;MFRL=111,136;MMQ=52,54;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,8:0.168:49:22,3:18,4:27,14,2,6
chr6	32548569	.	C	T	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=32,20;MFRL=150,84;MMQ=52,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:49,2:0.057:51:26,0:20,2:0|1:32548569_C_T:32548569:25,24,1,1
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chr6	32548581	.	A	G	.	.	DP=51;ECNT=16;MBQ=27,32;MFRL=148,178;MMQ=52,45;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,3:0.079:48:22,2:23,1:23,22,1,2
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chr6	32548660	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=30,31;MFRL=160,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.275:27:8,2:12,5:5,15,3,4
chr6	32548681	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=30,34;MFRL=156,168;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.546:9:3,1:1,4:0|1:32548681_T_C:32548681:1,3,1,4
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chr6	32548722	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=173,247;MMQ=60,46;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,2:1,3:0|1:32548722_C_A:32548722:0,5,0,5
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chr6	32548732	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,29;MFRL=211,247;MMQ=60,43;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:5,0:3,3:0,8,0,3
chr6	32548734	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=29,35;MFRL=211,247;MMQ=60,46;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,5:0.468:11:3,2:2,3:0|1:32548722_C_A:32548722:0,6,0,5
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chr6	32549246	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=25,32;MFRL=183,208;MMQ=40,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,0:5,2:6,0,2,0
chr6	32549249	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=33,32;MFRL=214,175;MMQ=47,31;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,0:4,3:5,0,3,0
chr6	32549259	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=28,29;MFRL=169,185;MMQ=60,32;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,1:2,5:2,0,6,0
chr6	32549278	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=25,33;MFRL=197,173;MMQ=47,32;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:4,2:6,0,2,0
chr6	32549284	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=18;MBQ=27,30;MFRL=169,195;MMQ=60,37;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,2:2,4:2,0,6,0
chr6	32549296	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=18;MBQ=27,33;MFRL=154,236;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,1:2,2:5,1,3,0
chr6	32549331	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=18;MBQ=34,30;MFRL=172,252;MMQ=52,42;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.150:18:7,1:7,1:0|1:32549331_C_A:32549331:10,6,2,0
chr6	32549340	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=18;MBQ=34,32;MFRL=172,252;MMQ=52,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,1:12,1:0|1:32549331_C_A:32549331:14,9,2,0
chr6	32549359	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=18;MBQ=35,20;MFRL=189,88;MMQ=52,48;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.159:23:9,0:11,3:0|1:32549359_C_T:32549359:13,7,1,2
chr6	32549383	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=33,20;MFRL=174,88;MMQ=47,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,3:0.160:23:10,0:10,3:0|1:32549359_C_T:32549359:10,10,1,2
chr6	32549401	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=18;MBQ=28,31;MFRL=170,164;MMQ=52,33;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.548:20:4,6:5,5:5,4,6,5
chr6	32549416	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=18;MBQ=33,27;MFRL=161,190;MMQ=52,50;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,5:0.170:29:12,2:11,3:12,12,4,1
chr6	32549452	.	C	G	.	.	DP=42;ECNT=18;MBQ=32,20;MFRL=189,86;MMQ=51,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:38,3:0.093:41:20,0:18,3:24,14,1,2
chr6	32549475	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=18;MBQ=27,34;MFRL=142,217;MMQ=60,40;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.539:29:8,10:5,5:8,5,10,6
chr6	32549481	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=18;MBQ=32,29;MFRL=197,144;MMQ=54,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.209:30:16,2:8,3:17,7,2,4
chr6	32549497	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=18;MBQ=30,32;MFRL=164,183;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=31.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.399:27:8,8:8,2:9,7,9,2
chr6	32549501	.	A	C,T	.	.	DP=26;ECNT=18;MBQ=28,31,28;MFRL=148,151,226;MMQ=60,40,44;MPOS=14,17;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=29.56,3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,10,2:0.398,0.107:24:6,8,1:6,2,1:7,5,9,3
chr6	32549548	.	G	A	.	.	DP=41;ECNT=20;MBQ=33,28;MFRL=164,181;MMQ=55,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.435:37:9,12:11,4:10,11,8,8
chr6	32549563	.	G	A	.	.	DP=46;ECNT=20;MBQ=32,29;MFRL=163,269;MMQ=55,55;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,4:0.110:43:20,2:17,2:20,19,2,2
chr6	32549579	.	TG	T	.	.	DP=43;ECNT=20;MBQ=29,29;MFRL=170,191;MMQ=60,35;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=G;STR;TLOD=13.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:35,5:0.142:40:15,3:20,2:0|1:32549579_TG_T:32549579:13,22,5,0
chr6	32549584	.	C	CT	.	.	DP=42;ECNT=20;MBQ=32,35;MFRL=177,191;MMQ=60,35;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:37,5:0.136:42:15,3:20,2:0|1:32549579_TG_T:32549579:14,23,5,0
chr6	32549589	.	A	C	.	.	DP=41;ECNT=20;MBQ=28,30;MFRL=183,125;MMQ=60,39;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,5:0.145:39:15,4:19,1:18,16,1,4
chr6	32549596	.	T	C	.	.	DP=38;ECNT=20;MBQ=26,33;MFRL=122,202;MMQ=60,52;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=130.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,32:0.870:36:1,17:3,14:2,2,14,18
chr6	32549611	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=20;MBQ=27,28;MFRL=210,129;MMQ=60,27;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,5:0.200:28:11,2:10,3:9,14,3,2
chr6	32549625	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=25,31;MFRL=209,238;MMQ=56,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,4:0.200:23:10,3:8,1:0|1:32549625_A_G:32549625:4,15,0,4
chr6	32549626	.	AAC	A	.	.	DP=24;ECNT=20;MBQ=25,23;MFRL=217,135;MMQ=60,40;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,2:8,0:4,17,0,2
chr6	32549628	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=33,26;MFRL=190,215;MMQ=60,52;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=33.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.542:21:6,7:3,5:1,8,2,10
chr6	32549630	.	AC	A	.	.	DP=22;ECNT=20;MBQ=26,26;MFRL=207,238;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:10,3:7,1:0|1:32549625_A_G:32549625:3,15,0,4
chr6	32549631	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=20;MBQ=27,31;MFRL=176,215;MMQ=60,52;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=47.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.687:17:3,7:2,5:1,4,2,10
chr6	32549636	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=20;MBQ=26,31;MFRL=212,226;MMQ=60,42;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,2:6,2:2,14,1,3
chr6	32549654	.	AC	A	.	.	DP=16;ECNT=20;MBQ=25,25;MFRL=209,208;MMQ=60,52;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:5,5:4,1:1,8,0,6
chr6	32549663	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=20;MBQ=32,31;MFRL=191,253;MMQ=59,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.317:14:7,1:2,3:0|1:32549663_G_T:32549663:0,10,1,3
chr6	32549667	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=20;MBQ=32,34;MFRL=191,253;MMQ=59,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.317:14:6,1:2,2:0|1:32549663_G_T:32549663:0,10,1,3
chr6	32549669	.	TG	AT	.	.	DP=12;ECNT=20;MBQ=31,25;MFRL=212,209;MMQ=60,44;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,4:5,0:0|1:32549669_TG_AT:32549669:1,7,0,4
chr6	32549675	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=20;MBQ=33,30;MFRL=212,209;MMQ=60,44;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,4:4,0:0|1:32549669_TG_AT:32549669:1,7,0,4
chr6	32549681	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=20;MBQ=32,30;MFRL=151,216;MMQ=60,52;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:1,5:1,5:0,2,1,9
chr6	32549711	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=20;MBQ=30,28;MFRL=187,191;MMQ=37,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.825:6:2,1:0,3:0,2,0,4
chr6	32551794	.	TCACACACACACACACACACACACACACA	T,TCACACACACACACACACACACACA	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,29,29;MFRL=139,168,196;MMQ=60,60,40;MPOS=29,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=20,6,18;RU=CA;STR;TLOD=3.37,3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,1,1:0.286,0.296:4:0,1,1:0,0,0:2,0,2,0
chr6	32551841	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,19;MFRL=164,196;MMQ=60,40;MPOS=-2;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.291:5:1,0:2,0:4,0,1,0
chr6	32552059	.	GA	AA,TT	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=32,28,28;MFRL=140,185,164;MMQ=60,45,59;MPOS=20,19;PON;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.55,49.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:11,5,14:0.184,0.445:30:5,2,6:6,3,7:3,8,6,13
chr6	32552075	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=13;MBQ=27,32;MFRL=145,170;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,17:0.622:27:4,7:6,10:4,6,6,11
chr6	32552085	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=33,34;MFRL=133,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:9,1:9,7,0,2
chr6	32552092	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=13;MBQ=24,30;MFRL=140,135;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,1:10,1:8,11,1,1
chr6	32552130	.	CCT	AGA	.	.	DP=13;ECNT=13;MBQ=33,20;MFRL=146,66;MMQ=60,55;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.533:13:2,2:3,5:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:4,2,3,4
chr6	32552134	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=30,32;MFRL=146,66;MMQ=60,41;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,1,1,4
chr6	32552137	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=36,32;MFRL=146,66;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,1,1,4
chr6	32552138	.	G	GTA	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=35,32;MFRL=168,66;MMQ=60,41;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:2,3:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,2,1,4
chr6	32552140	.	TG	T	.	.	DP=10;ECNT=13;MBQ=29,31;MFRL=168,66;MMQ=60,41;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:2,2:3,2:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,2,1,4
chr6	32552144	.	AC	A	.	.	DP=9;ECNT=13;MBQ=28,26;MFRL=168,83;MMQ=60,41;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,2:3,2:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,2,0,4
chr6	32552146	.	AG	A	.	.	DP=11;ECNT=13;MBQ=29,27;MFRL=170,83;MMQ=60,41;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,2:3,2:0|1:32552130_CCT_AGA:32552130:3,4,0,4
chr6	32552183	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=29,24;MFRL=170,269;MMQ=60,59;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.606:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr6	32552206	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=13;MBQ=32,29;MFRL=170,269;MMQ=60,59;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:0,3,0,2
chr6	32557319	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=19;MBQ=30,26;MFRL=166,211;MMQ=60,58;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=40.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,10:0.647:15:1,5:4,5:0|1:32557319_A_T:32557319:5,0,9,1
chr6	32557339	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=31,26;MFRL=174,211;MMQ=49,58;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=38.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,10:0.510:20:2,5:8,5:0|1:32557319_A_T:32557319:9,1,9,1
chr6	32557365	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=28,32;MFRL=161,265;MMQ=52,41;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,0:8,2:0|1:32557365_A_C:32557365:13,6,2,0
chr6	32557375	.	T	TA	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=25,25;MFRL=157,265;MMQ=52,41;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:32557365_A_C:32557365:11,7,2,0
chr6	32557378	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=25,32;MFRL=153,265;MMQ=52,41;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:10,2:0|1:32557365_A_C:32557365:11,7,2,0
chr6	32557386	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=32,31;MFRL=153,165;MMQ=52,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.135:20:5,1:12,1:0|1:32557386_C_G:32557386:10,8,2,0
chr6	32557405	.	G	T,A	.	.	DP=22;ECNT=19;MBQ=27,28,31;MFRL=150,156,167;MMQ=52,40,27;MPOS=10,18;POPAF=7.30,7.30;TLOD=9.29,7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:15,3,3:0.167,0.160:21:6,2,2:9,1,1:8,7,5,1
chr6	32557414	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=28,28;MFRL=165,156;MMQ=52,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,2:8,1:0|1:32557414_A_T:32557414:11,7,2,1
chr6	32557423	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=19;MBQ=28,26;MFRL=153,167;MMQ=52,27;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.174:21:9,2:8,1:0|1:32557386_C_G:32557386:9,9,3,0
chr6	32557435	.	AC	CG	.	.	DP=20;ECNT=19;MBQ=28,32;MFRL=150,140;MMQ=60,34;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:5,3:7,1:0|1:32557414_A_T:32557414:8,7,2,2
chr6	32557446	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=19;MBQ=33,30;MFRL=150,156;MMQ=58,39;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.271:20:9,3:6,2:0|1:32557414_A_T:32557414:7,8,2,3
chr6	32557477	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=34,25;MFRL=165,123;MMQ=59,43;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,8:0.250:34:12,4:14,4:0|1:32557477_G_A:32557477:9,17,3,5
chr6	32557478	.	CG	AA	.	.	DP=34;ECNT=19;MBQ=29,28;MFRL=132,199;MMQ=51,58;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=31.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,9:0.278:34:11,5:14,4:9,16,3,6
chr6	32557483	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=19;MBQ=30,32;MFRL=145,167;MMQ=60,49;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=92.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,23:0.706:32:3,11:6,12:1,8,9,14
chr6	32557486	.	T	A	.	.	DP=37;ECNT=19;MBQ=30,26;MFRL=150,123;MMQ=59,43;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.231:37:12,4:15,4:0|1:32557477_G_A:32557477:11,18,3,5
chr6	32557489	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=19;MBQ=29,29;MFRL=150,123;MMQ=59,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,8:0.231:37:14,4:15,4:0|1:32557477_G_A:32557477:11,18,3,5
chr6	32557506	.	T	C	.	.	DP=37;ECNT=19;MBQ=25,32;MFRL=127,143;MMQ=51,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=65.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,18:0.500:36:8,9:10,8:5,13,8,10
chr6	32557529	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=19;MBQ=32,33;MFRL=122,177;MMQ=55,33;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:9,3:8,4:10,7,3,4
chr6	32557552	.	A	C,G	.	.	DP=22;ECNT=19;MBQ=20,32,32;MFRL=85,122,157;MMQ=52,60,30;MPOS=10,25;POPAF=7.30,7.30;TLOD=43.78,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,15,2:0.641,0.120:22:3,8,1:2,7,1:2,3,7,10
chr6	32557606	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=327,220;MMQ=50,58;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:12,2:5,2:1,17,1,3
chr6	32557617	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=220,186;MMQ=58,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,3:1,3,1,4
chr6	32605164	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=12;MBQ=25,32;MFRL=124,249;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:8,0:2,2:0|1:32605164_T_G:32605164:7,3,2,0
chr6	32605173	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=12;MBQ=25,32;MFRL=127,249;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:9,0:2,2:0|1:32605164_T_G:32605164:8,3,2,0
chr6	32605189	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=27,33;MFRL=127,204;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:9,1:2,3:7,4,4,0
chr6	32605197	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=160,204;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:7,1:6,2:12,6,3,1
chr6	32605207	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=12;MBQ=32,34;MFRL=160,234;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.292:22:9,3:7,3:11,5,4,2
chr6	32605216	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=33,28;MFRL=165,197;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:10,1:8,2:12,7,2,1
chr6	32605234	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=163,335;MMQ=60,37;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:11,2:11,2:15,7,3,1
chr6	32605257	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=12;MBQ=33,29;MFRL=142,209;MMQ=60,49;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.242:31:13,3:11,4:17,7,4,3
chr6	32605271	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=31,30;MFRL=134,303;MMQ=60,57;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:19,2:14,1:23,11,0,4
chr6	32605274	.	T	C	.	.	DP=40;ECNT=12;MBQ=28,33;MFRL=128,252;MMQ=60,52;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,10:0.289:36:16,4:10,6:17,9,4,6
chr6	32605295	.	C	T	.	.	DP=44;ECNT=12;MBQ=32,29;MFRL=129,180;MMQ=60,39;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,4:0.116:41:18,2:18,2:20,17,3,1
chr6	32605325	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=12;MBQ=32,30;MFRL=127,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,3:0.102:37:18,1:16,2:16,18,0,3
chr6	32605380	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=130,271;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:11,2:5,1:0,16,0,3
chr6	32605400	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=139,296;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:7,2:3,0:0,10,0,2
chr6	32609009	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=171,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,4:4,1:6,0,4,1
chr6	32609047	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=32,30;MFRL=139,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:3,2:8,0:8,3,2,0
chr6	32609097	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=30,24;MFRL=144,178;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:7,2:15,0:7,15,0,2
chr6	32609105	.	GT	AT,AC	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=34,22,28;MFRL=144,178,169;MMQ=60,60,60;MPOS=13,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.38,8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:20,2,3:0.107,0.143:25:7,2,0:13,0,2:6,14,2,3
chr6	32609126	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:2,1:11,2:5,10,2,2
chr6	32609147	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=27,25;MFRL=155,179;MMQ=60,47;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:7,0:10,3:0|1:32609147_A_T:32609147:7,10,3,0
chr6	32609169	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=28,32;MFRL=148,218;MMQ=60,44;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:5,0:8,2:0|1:32609147_A_T:32609147:6,7,2,0
chr6	32609173	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=134,186;MMQ=60,54;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,0:6,4:6,5,3,1
chr6	32609256	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=148,90;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:13,5:4,0:7,10,5,0
chr6	32609371	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,33;MFRL=106,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr6	32609425	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=212,337;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	32609647	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609647_T_G:32609647:2,0,1,0
chr6	32609652	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609647_T_G:32609647:2,0,1,0
chr6	32609654	.	GT	AG	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609647_T_G:32609647:2,0,1,0
chr6	32609671	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609671_G_A:32609671:2,0,1,0
chr6	32609673	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=152,207;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:32609671_G_A:32609671:2,0,1,0
chr6	32609855	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=106,280;MMQ=60,36;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:7,2:8,8,2,1
chr6	32609873	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=108,280;MMQ=45,36;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:11,3:4,2:8,7,4,1
chr6	32610047	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=155,211;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,6:0.269:24:7,4:10,2:0|1:32610047_T_C:32610047:6,12,4,2
chr6	32610059	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=28,31;MFRL=155,213;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.273:20:8,3:7,2:0|1:32610047_T_C:32610047:6,9,3,2
chr6	32610109	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=131,216;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr6	32610286	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=157,273;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:3,3:6,2:9,0,5,0
chr6	32610314	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=150,200;MMQ=60,58;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,4:4,4:7,1,8,0
chr6	32610330	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.316:14:4,2:4,2:9,1,4,0
chr6	32610403	.	C	A	.	.	DP=36;ECNT=8;MBQ=33,28;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:13,2:15,2:12,16,2,2
chr6	32610436	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=8;MBQ=27,27;MFRL=156,207;MMQ=60,40;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,5:0.214:26:12,4:8,1:0|1:32610436_T_C:32610436:13,8,2,3
chr6	32610445	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=32,24;MFRL=152,207;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,5:0.182:31:12,3:12,1:0|1:32610436_T_C:32610436:15,11,2,3
chr6	32610461	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=8;MBQ=26,31;MFRL=135,183;MMQ=40,50;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.270:23:9,3:8,3:7,10,3,3
chr6	32610478	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=143,218;MMQ=40,47;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,4:0.208:22:10,3:7,1:0|1:32610478_C_G:32610478:8,10,3,1
chr6	32610481	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=29,33;MFRL=145,218;MMQ=40,47;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,4:0.185:25:10,3:9,1:0|1:32610478_C_G:32610478:9,12,3,1
chr6	32610487	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=140,218;MMQ=45,47;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.179:26:9,3:10,1:0|1:32610478_C_G:32610478:10,12,3,1
chr6	32610535	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=120,273;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.135:23:8,3:12,0:9,11,1,2
chr6	32627956	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,35;MFRL=130,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.229:11:4,2:5,0:0|1:32627956_C_G:32627956:6,3,2,0
chr6	32627958	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=26,33;MFRL=130,140;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,2:3,2:4,3,4,0
chr6	32627967	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=130,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:4,2:5,0:0|1:32627956_C_G:32627956:6,3,2,0
chr6	32627969	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,25;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:5,0:0|1:32627956_C_G:32627956:6,4,2,0
chr6	32627976	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=32,33;MFRL=124,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:32627956_C_G:32627956:6,4,2,0
chr6	32627992	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=6;MBQ=25,35;MFRL=69,238;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.292:22:5,5:10,1:0|1:32627956_C_G:32627956:10,6,4,2
chr6	32628022	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=9;MBQ=28,32;MFRL=107,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.276:27:9,5:11,2:12,8,4,3
chr6	32628030	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=31,29;MFRL=107,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,7:0.278:27:9,5:11,2:12,8,4,3
chr6	32628045	.	CAT	GGA	.	.	DP=28;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=134,229;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,10:0.393:26:7,7:8,3:11,5,6,4
chr6	32628064	.	TC	CG	.	.	DP=20;ECNT=9;MBQ=28,35;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:7,4:8,1:9,6,4,1
chr6	32628093	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=143,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:4,3:6,0:0|1:32628093_T_C:32628093:4,6,2,1
chr6	32628098	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=9;MBQ=32,27;MFRL=155,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:5,2:2,3:6,3,0,5
chr6	32628103	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,28;MFRL=143,174;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:5,4:3,0:0|1:32628093_T_C:32628093:4,6,2,2
chr6	32628122	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=9;MBQ=32,33;MFRL=161,168;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:0|1:32628122_G_C:32628122:2,10,0,2
chr6	32628127	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:5,2:3,0:0|1:32628122_G_C:32628122:1,9,0,2
chr6	32628538	.	GG	TA	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=192,249;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=13.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,4:0.312:14:4,2:5,2:0|1:32628538_GG_TA:32628538:10,0,4,0
chr6	32628549	.	TG	GA	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=26,36;MFRL=198,274;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,4:0.294:15:3,2:5,1:0|1:32628538_GG_TA:32628538:9,2,4,0
chr6	32628556	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=32,25;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,1:9,1:11,2,2,0
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chr6	32628571	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=33,27;MFRL=199,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,2:0.149:18:6,1:10,1:0|1:32628568_A_G:32628568:11,5,2,0
chr6	32628595	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:5,2:7,6:5,8,7,1
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chr6	32628606	.	C	A	.	.	DP=23;ECNT=11;MBQ=33,28;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:6,1:12,3:7,11,3,1
chr6	32628617	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=11;MBQ=28,20;MFRL=183,119;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:7,0:15,2:10,12,1,1
chr6	32628621	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=29,31;MFRL=176,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:4,3:12,4:6,10,4,3
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chr6	32628736	.	CA	TG	.	.	DP=19;ECNT=8;MBQ=33,32;MFRL=150,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,6:0.349:18:7,2:4,4:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,11,1,5
chr6	32628741	.	C	CTTAA	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=33,33;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.386:18:7,2:4,5:1,10,1,6
chr6	32628751	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=33,31;MFRL=142,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,1:4,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,10,0,5
chr6	32628764	.	CC	TT	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=32,32;MFRL=150,249;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.267:13:6,1:3,2:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,9,0,3
chr6	32628776	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=8;MBQ=33,25;MFRL=183,249;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,2:3,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,10,0,5
chr6	32628779	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=8;MBQ=32,31;MFRL=183,249;MMQ=60,40;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:3,3:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,8,0,5
chr6	32628784	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=33,26;MFRL=180,261;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:5,2:2,2:0|1:32628736_CA_TG:32628736:1,7,0,4
chr6	32629064	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=155,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:3,2:0,1:4,0,3,0
chr6	32629091	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=146,245;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:7,2:5,2:9,3,4,0
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chr6	32629141	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=14;MBQ=29,28;MFRL=159,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,5:0.207:27:9,3:12,1:0|1:32629137_T_G:32629137:12,10,5,0
chr6	32629161	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=26,31;MFRL=142,199;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.114:24:10,2:12,0:13,9,1,1
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chr6	32629227	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=14;MBQ=31,29;MFRL=132,186;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,8:0.300:28:7,6:12,2:0|1:32629227_C_T:32629227:10,10,5,3
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chr6	32629238	.	A	AGC	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=27,32;MFRL=133,169;MMQ=60,40;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,7:0.286:26:7,4:12,2:0|1:32629227_C_T:32629227:9,10,4,3
chr6	32629243	.	CAGAA	C	.	.	DP=26;ECNT=14;MBQ=32,35;MFRL=132,195;MMQ=60,40;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:7,4:13,2:0|1:32629227_C_T:32629227:8,12,4,2
chr6	32629257	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=14;MBQ=30,30;MFRL=142,260;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:4,3:11,1:0|1:32629227_C_T:32629227:6,11,2,2
chr6	32629281	.	CA	TT	.	.	DP=20;ECNT=14;MBQ=33,33;MFRL=137,268;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:8,0:8,3:0|1:32629281_CA_TT:32629281:2,15,0,3
chr6	32629289	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=33,28;MFRL=142,268;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.200:18:8,0:7,3:0|1:32629281_CA_TT:32629281:1,14,0,3
chr6	32629297	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=30,36;MFRL=163,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,4:0.250:18:7,1:6,3:0|1:32629281_CA_TT:32629281:0,14,0,4
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chr6	32629320	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=14;MBQ=25,32;MFRL=170,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,6:0.411:15:5,3:4,3:0|1:32629314_G_A:32629314:0,9,0,6
chr6	32629650	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=25,34;MFRL=220,182;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,3:4,0:5,0,3,0
chr6	32629680	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=5;MBQ=24,34;MFRL=136,252;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,3:2,0:0|1:32629680_A_G:32629680:1,1,3,0
chr6	32629697	.	T	TCTGTC	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=24,29;MFRL=138,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=18.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:1,4:7,0:0|1:32629680_A_G:32629680:6,2,4,1
chr6	32629708	.	T	TG	.	.	DP=16;ECNT=5;MBQ=25,27;MFRL=100,191;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=G;STR;TLOD=21.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,6:0.389:16:3,3:7,3:0|1:32629680_A_G:32629680:6,4,4,2
chr6	32629716	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=116,203;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,7:0.399:18:3,4:7,2:0|1:32629680_A_G:32629680:7,4,5,2
chr6	32629802	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=158,220;MMQ=60,50;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.215:21:4,3:13,1:6,11,1,3
chr6	32629889	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=151,213;MMQ=60,53;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:14,4:6,0:12,8,2,2
chr6	32629920	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=152,125;MMQ=56,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,13:0.560:23:8,5:2,8:3,7,9,4
chr6	32629935	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=149,165;MMQ=52,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,3:10,0:10,11,0,3
chr6	32630028	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,162;MMQ=40,49;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:12,1:7,1:5,14,2,0
chr6	32632523	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=28,36;MFRL=157,174;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.513:6:2,2:0,1:3,0,3,0
chr6	32632534	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=179,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr6	32632547	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	32632587	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=31,35;MFRL=158,154;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:2,1:0|1:32632587_A_G:32632587:4,1,0,2
chr6	32632598	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=8;MBQ=29,29;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0|1:32632587_A_G:32632587:4,1,0,2
chr6	32632601	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=8;MBQ=28,34;MFRL=184,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.328:7:3,1:2,1:0|1:32632587_A_G:32632587:4,1,0,2
chr6	32632650	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=152,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=31.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,12:0.547:22:4,9:5,3:6,4,10,2
chr6	32632688	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=27,29;MFRL=153,169;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,6:6,3:9,3,6,4
chr6	32632714	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=8;MBQ=31,32;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.436:17:5,4:5,3:7,3,2,5
chr6	32632770	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=8;MBQ=27,20;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,13:0.466:28:9,6:6,6:0|1:32632770_A_G:32632770:7,8,7,6
chr6	32632777	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=8;MBQ=33,20;MFRL=154,113;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,13:0.500:26:9,6:4,6:0|1:32632770_A_G:32632770:6,7,7,6
chr6	32632832	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=25,29;MFRL=133,156;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,5:4,5:4,5,1,9
chr6	32632903	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=33,27;MFRL=163,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	32632917	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	32632931	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,27;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	32632944	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=29,25;MFRL=168,250;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr6	32634184	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=16;MBQ=29,27;MFRL=163,260;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0|1:32634184_A_G:32634184:5,0,2,0
chr6	32634189	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=16;MBQ=32,24;MFRL=144,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,0:3,2:5,1,2,0
chr6	32634192	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=16;MBQ=28,32;MFRL=178,260;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:4,0:3,2:0|1:32634184_A_G:32634184:7,1,2,0
chr6	32634203	.	TC	T	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=25,25;MFRL=168,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.343:12:5,1:3,2:0|1:32634203_TC_T:32634203:7,1,3,1
chr6	32634209	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=16;MBQ=29,26;MFRL=163,224;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.320:13:5,1:4,2:0|1:32634203_TC_T:32634203:7,2,3,1
chr6	32634243	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=16;MBQ=33,26;MFRL=156,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:10,1:13,2:17,6,2,1
chr6	32634300	.	G	C	.	.	DP=33;ECNT=16;MBQ=31,35;MFRL=130,150;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:10,3:15,2:0|1:32634300_G_C:32634300:11,17,3,2
chr6	32634302	.	A	G	.	.	DP=33;ECNT=16;MBQ=26,35;MFRL=130,150;MMQ=60,40;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,5:0.171:33:10,3:15,2:0|1:32634300_G_C:32634300:11,17,3,2
chr6	32634306	.	A	T	.	.	DP=33;ECNT=16;MBQ=26,30;MFRL=126,153;MMQ=60,42;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,6:0.200:33:12,3:15,3:11,16,3,3
chr6	32634318	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=16;MBQ=32,28;MFRL=131,155;MMQ=60,44;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,7:0.244:31:10,3:12,4:9,15,3,4
chr6	32634331	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=16;MBQ=33,32;MFRL=125,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,5:0.193:29:10,1:13,4:0|1:32634331_G_C:32634331:8,16,2,3
chr6	32634341	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=16;MBQ=27,33;MFRL=126,196;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,7:0.222:34:13,3:13,4:0|1:32634331_G_C:32634331:8,19,3,4
chr6	32634350	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=16;MBQ=29,32;MFRL=131,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.228:33:13,2:13,4:7,19,3,4
chr6	32634373	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=16;MBQ=32,29;MFRL=132,251;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,4:9,2:9,10,2,5
chr6	32634387	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=16;MBQ=33,30;MFRL=144,251;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.250:22:9,4:8,1:6,11,2,3
chr6	32634402	.	AAGC	A	.	.	DP=19;ECNT=16;MBQ=23,25;MFRL=136,237;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:7,4:5,1:5,9,1,4
chr6	32709179	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=165,171;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:3,5,2,2
chr6	32709204	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=173,307;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:6,1:4,1:4,6,1,1
chr6	32709309	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,33;MFRL=126,160;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:2,2:3,5:2,3,2,5
chr6	32709363	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=134,185;MMQ=60,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:0|1:32709363_G_A:32709363:2,5,0,2
chr6	32709370	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=146,214;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:32709363_G_A:32709363:1,5,0,3
chr6	32713018	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=85,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:8,6:5,5:8,5,5,7
chr6	32713030	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=24,28;MFRL=74,164;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,10:0.423:24:6,7:8,3:10,4,4,6
chr6	32713188	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,4:2,5:0,4,3,6
chr6	32713487	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=205,83;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:5,0:0,2:5,0,1,1
chr6	32713771	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=27,35;MFRL=157,236;MMQ=40,34;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:9,0:7,2:12,4,0,2
chr6	32713854	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,29;MFRL=173,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,7:0.204:37:15,3:15,4:13,17,2,5
chr6	32713867	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:14,3:12,2:11,15,3,2
chr6	32713888	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=25,32;MFRL=164,191;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,2:7,1:8,8,0,3
chr6	32714031	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=7;MBQ=33,31;MFRL=169,199;MMQ=60,34;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:12,1:8,1:0|1:32714031_G_A:32714031:11,11,2,0
chr6	32714033	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=7;MBQ=32,32;MFRL=169,199;MMQ=60,34;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.114:24:11,1:10,1:0|1:32714031_G_A:32714031:11,11,2,0
chr6	32714083	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=7;MBQ=29,29;MFRL=169,166;MMQ=57,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,6:0.212:31:19,1:6,5:11,14,4,2
chr6	32714164	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=7;MBQ=29,34;MFRL=150,199;MMQ=60,36;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,2:0.090:31:10,1:19,1:11,18,0,2
chr6	32714168	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=27,35;MFRL=101,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=31.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.367:28:7,3:11,7:6,12,2,8
chr6	32714175	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=7;MBQ=33,28;MFRL=178,62;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.232:28:7,4:15,2:5,17,2,4
chr6	32714182	.	GA	G	.	.	DP=28;ECNT=7;MBQ=34,32;MFRL=169,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.242:26:6,4:14,2:2,18,2,4
chr6	32724143	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=32,27;MFRL=110,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,2,2
chr6	32724189	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=7;MBQ=32,28;MFRL=103,243;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:9,1:7,3:12,4,2,2
chr6	32724258	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=7;MBQ=31,28;MFRL=180,135;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:2,4:6,2:3,5,3,3
chr6	32724267	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=162,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,1:5,1:4,8,1,1
chr6	32724305	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=29,33;MFRL=176,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.333:10:3,1:4,1:0|1:32724305_T_C:32724305:0,7,1,2
chr6	32724317	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=32,30;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:3,1:4,1:0|1:32724305_T_C:32724305:0,9,0,2
chr6	32724324	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=30,34;MFRL=176,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,1:3,1:0|1:32724305_T_C:32724305:0,7,0,2
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chr6	32725193	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=236,221;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	32725456	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=245,210;MMQ=60,45;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:5,0,5,0
chr6	32725517	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=154,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:5,0:3,6:8,0,4,2
chr6	32725523	.	T	TC	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=26,25;MFRL=154,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=C;STR;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.472:15:5,1:3,6:7,1,4,3
chr6	32725619	.	TG	CA	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=30,34;MFRL=216,146;MMQ=55,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,8:0.474:17:6,4:3,4:0|1:32725619_TG_CA:32725619:2,7,2,6
chr6	32725625	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=29,32;MFRL=216,143;MMQ=55,40;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,9:0.500:18:6,5:3,4:0|1:32725619_TG_CA:32725619:2,7,4,5
chr6	32725653	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=11;MBQ=33,33;MFRL=143,249;MMQ=58,48;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.217:21:11,1:6,3:0|1:32725653_C_T:32725653:7,10,0,4
chr6	32725663	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=25,33;MFRL=139,249;MMQ=60,48;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:9,1:5,3:0|1:32725653_C_T:32725653:6,9,0,4
chr6	32725666	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=11;MBQ=32,27;MFRL=139,249;MMQ=60,48;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,4:0.238:19:8,1:5,3:0|1:32725653_C_T:32725653:5,10,0,4
chr6	32725672	.	A	AG	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=25,27;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:5,4:1,6:0|1:32725672_A_AG:32725672:1,5,2,9
chr6	32725673	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=11;MBQ=25,31;MFRL=172,139;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=43.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:5,5:1,6:0|1:32725672_A_AG:32725672:1,5,2,9
chr6	32725682	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=11;MBQ=32,36;MFRL=144,188;MMQ=60,33;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:8,0:4,2:3,9,0,2
chr6	32726577	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=197,239;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,4:3,2:6,0,6,0
chr6	32726769	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=27,26;MFRL=179,181;MMQ=60,47;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:10,0:10,3:0|1:32726769_A_G:32726769:6,16,3,0
chr6	32726772	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=5;MBQ=32,29;MFRL=179,181;MMQ=60,47;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,3:0.148:25:11,0:11,3:0|1:32726769_A_G:32726769:6,16,3,0
chr6	32726788	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=184,182;MMQ=60,49;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:11,1:12,3:7,16,4,0
chr6	32726803	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=29,31;MFRL=182,221;MMQ=60,57;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:11,2:9,6:9,11,4,4
chr6	32726838	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=140,246;MMQ=51,51;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.525:19:5,4:4,6:7,2,4,6
chr6	32726966	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=165,154;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,2:2,2:0,6,0,4
chr6	32727002	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=198,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:0,7,0,2
chr6	32727004	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=237,168;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.728:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr6	32729335	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,279;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	32729459	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,156;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:7,2:2,3:7,2,4,1
chr6	32729642	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=35.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,12:0.433:28:9,7:7,5:5,11,5,7
chr6	32729734	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=149,184;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:7,4:2,4:3,6,1,7
chr6	32731170	.	A	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=166,115;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:6,0:8,7:11,3,0,7
chr6	32731313	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=163,298;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:5,1:1,8,0,3
chr6	32782976	.	T	A	.	.	DP=53;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=144,222;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,8:0.176:47:26,7:13,0:20,19,8,0
chr6	32783086	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=155,180;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.192:24:8,3:12,1:8,12,3,1
chr6	32790099	.	G	GA,GAA	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,17,35;MFRL=150,156,116;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,11,12;RU=A;STR;TLOD=4.99,4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,2:0.252,0.183:13:3,0,1:3,1,1:2,6,2,3
chr6	32796653	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,28;MFRL=199,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,2:2,2:5,1,1,3
chr6	32796685	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,34;MFRL=190,161;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:4,2,3,3
chr6	32796751	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=25,34;MFRL=154,111;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.162:23:12,2:5,1:10,10,2,1
chr6	32796857	.	ACAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=262,208;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAC;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:1,3,0,1
chr6	32797109	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=195,217;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.375:14:5,2:4,3:0|1:32797109_G_A:32797109:8,1,5,0
chr6	32797115	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=201,217;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,5:0.374:14:4,2:4,3:0|1:32797109_G_A:32797109:7,2,5,0
chr6	32797168	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=194,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=26.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.518:21:5,6:5,4:4,6,8,3
chr6	32797297	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=197,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=32.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.648:15:4,5:1,5:0,5,0,10
chr6	32797620	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=177,187;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:5,1:4,4:10,0,5,0
chr6	32797684	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=145,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=30.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.523:21:6,7:4,4:4,6,6,5
chr6	32797876	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.707:15:3,6:1,5:1,3,3,8
chr6	32805307	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,12:0.419:29:6,7:11,5:10,7,5,7
chr6	32805470	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=112,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=52.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.741:25:2,11:4,7:3,3,16,3
chr6	32809223	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=180,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:4,0,4,0
chr6	32810443	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=118,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.586:22:2,8:6,4:6,3,10,3
chr6	32815480	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=26,33;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:3,3:0|1:32815480_A_G:32815480:2,7,0,3
chr6	32815483	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:4,3:0|1:32815480_A_G:32815480:2,7,0,3
chr6	32815491	.	CA	AT	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=171,320;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:5,0:4,1:0|1:32815480_A_G:32815480:2,7,0,3
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chr6	32844970	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=197,168;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,3:2,2:0,3,1,4
chr6	32847309	.	GC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=39.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,8:0,3:0,0,6,5
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chr6	32904981	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=49.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:0,8:2,8:2,0,9,7
chr6	32916540	.	A	ACTT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=37.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,5:0,0,8,1
chr6	32916555	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=166,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:4,1:7,1:8,4,1,1
chr6	32916699	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=214,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:2,2:7,4:2,7,1,5
chr6	32917042	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=178,131;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:2,2:14,3:13,5,2,3
chr6	32917544	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=162,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:3,5:8,0:6,5,4,1
chr6	32918628	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=233,117;MMQ=60,57;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:0,4,0,2
chr6	32918644	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=249,117;MMQ=60,57;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	32942302	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=188,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,14:0.517:27:6,3:7,11:5,8,6,8
chr6	32943086	.	T	TGA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=285,161;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=GA;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,0:1,0,3,1
chr6	32943151	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=178,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:6,7:7,4:9,4,6,5
chr6	32943345	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=193,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,3:4,6:1,5,2,7
chr6	32943357	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=150,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:4,1:5,3:0,9,1,3
chr6	32943979	.	C	CT	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,170;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=28.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,13:0.396:32:9,5:10,8:9,10,4,9
chr6	32944094	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=143,202;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,1:8,1:8,11,2,0
chr6	32944746	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:8,3:4,2:4,8,1,4
chr6	32945466	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.263:13:5,0:5,3:5,5,2,1
chr6	32945530	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=82.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.963:24:0,8:0,16:0,0,14,10
chr6	32946133	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=147,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:13,6:6,4:9,10,2,8
chr6	32974792	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=201,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:8,2:8,1:8,8,3,0
chr6	32974797	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=182,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=15.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:7,3:5,4:9,3,1,6
chr6	32974934	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:3,6:4,4:4,3,3,7
chr6	32975014	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=199,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,16:0.680:23:2,6:5,10:4,3,7,9
chr6	32975257	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.432:19:4,3:6,5:5,6,5,3
chr6	32975381	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=204,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,2,5
chr6	32975869	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=175,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,6:4,1:3,6,1,6
chr6	32977420	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=206,151;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	33036388	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=162,222;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,6:0.250:26:8,2:12,4:0|1:33036388_C_T:33036388:13,7,4,2
chr6	33036394	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=5;MBQ=32,28;MFRL=162,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:8,1:12,4:0|1:33036388_C_T:33036388:14,8,4,2
chr6	33036399	.	C	CT	.	.	DP=29;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=157,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.226:29:9,2:14,4:0|1:33036388_C_T:33036388:14,9,4,2
chr6	33036401	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=157,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,6:0.225:29:9,1:14,3:0|1:33036388_C_T:33036388:14,9,4,2
chr6	33036435	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=5;MBQ=26,32;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,6:0.236:28:8,2:11,4:11,11,5,1
chr6	33036617	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=174,273;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,9:0.304:31:10,5:11,4:5,17,4,5
chr6	33036630	.	GA	TC	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=166,284;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,10:0.379:27:7,6:10,4:4,13,5,5
chr6	33036708	.	CA	TG	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=194,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,3:5,0:0|1:33036708_CA_TG:33036708:2,6,2,2
chr6	33036717	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=195,250;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:4,4:5,0:0|1:33036708_CA_TG:33036708:3,6,3,1
chr6	33036950	.	CA	TG	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=31,28;MFRL=171,275;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,5:0.187:30:9,2:16,3:15,10,2,3
chr6	33036951	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=29,32;MFRL=160,279;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.348:28:7,4:11,6:12,6,3,7
chr6	33036959	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=9;MBQ=29,27;MFRL=151,275;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=38.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,11:0.387:29:7,5:11,6:11,7,5,6
chr6	33036971	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=30,27;MFRL=148,282;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:7,6:10,5:9,8,4,7
chr6	33036999	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=29,33;MFRL=166,241;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:8,4:9,3:9,8,2,5
chr6	33037080	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=170,248;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.377:22:7,3:7,5:0|1:33037080_G_A:33037080:5,9,3,5
chr6	33037082	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=9;MBQ=28,35;MFRL=170,248;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,8:0.377:22:7,3:7,5:0|1:33037080_G_A:33037080:5,9,3,5
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chr6	33037560	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=34,28;MFRL=193,227;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,5:0.300:18:5,2:7,3:0|1:33037557_C_T:33037557:4,9,3,2
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chr6	33037690	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=193,212;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,0:7,2:2,9,0,2
chr6	33041176	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=153,221;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.332:10:3,1:4,2:0|1:33041176_C_T:33041176:7,0,3,0
chr6	33041186	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=157,194;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:3,0:5,3:0|1:33041176_C_T:33041176:8,0,3,0
chr6	33041226	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=156,141;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:2,3:8,3:9,1,4,2
chr6	33043930	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=154,246;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.252:18:6,2:7,2:3,11,0,4
chr6	33048348	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=158,257;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:8,1:6,1:0|1:33048348_G_A:33048348:5,10,0,2
chr6	33048354	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=28,28;MFRL=158,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,3:0.199:18:8,2:6,1:0|1:33048348_G_A:33048348:5,10,1,2
chr6	33048380	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=34,28;MFRL=167,166;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.336:16:6,2:5,3:2,9,2,3
chr6	33048457	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=33,26;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=27.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.572:12:2,4:3,2:0|1:33048457_C_G:33048457:2,3,5,2
chr6	33048459	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=30,33;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,4:3,3:0|1:33048457_C_G:33048457:2,3,5,2
chr6	33048461	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=217,128;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=27.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,7:0.571:12:2,3:3,2:0|1:33048457_C_G:33048457:2,3,5,2
chr6	33048466	.	GG	TT	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=217,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=31.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,4:3,4:0|1:33048457_C_G:33048457:2,3,6,2
chr6	33048542	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=12;MBQ=28,26;MFRL=199,147;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=56.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.876:22:1,10:1,9:1,1,13,7
chr6	33048599	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=0,27;MFRL=0,156;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=61.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.940:14:0,5:0,9:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,6,8
chr6	33048602	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=66.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,15:0.941:15:0,5:0,10:0|1:33048599_C_A:33048599:0,0,7,8
chr6	33048606	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=12;MBQ=34,32;MFRL=142,167;MMQ=51,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=20.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,3:6,4:3,5,2,5
chr6	33048628	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=12;MBQ=29,33;MFRL=142,176;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:3,4:7,3:5,5,1,7
chr6	33048640	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=12;MBQ=27,32;MFRL=192,134;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:5,1:5,5:2,8,4,2
chr6	33048661	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=25,32;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:3,5:2,6:0|1:33048661_A_G:33048661:2,4,2,9
chr6	33048663	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=12;MBQ=31,26;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=44.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,11:0.632:17:4,5:2,6:0|1:33048661_A_G:33048661:2,4,2,9
chr6	33048686	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=32,24;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,3:0|1:33048686_G_A:33048686:1,4,1,5
chr6	33048689	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=12;MBQ=32,25;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,6:0.538:11:3,2:2,3:0|1:33048686_G_A:33048686:1,4,1,5
chr6	33048691	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=12;MBQ=32,33;MFRL=164,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:3,1:2,3:0|1:33048686_G_A:33048686:1,4,0,5
chr6	33048694	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=12;MBQ=25,35;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,2:0|1:33048686_G_A:33048686:1,4,0,4
chr6	33052950	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=173,224;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,8:0.429:19:5,3:6,5:0|1:33052950_T_C:33052950:5,6,4,4
chr6	33052958	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=32,29;MFRL=173,203;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=33.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,9:0.454:20:4,3:6,6:0|1:33052950_T_C:33052950:5,6,4,5
chr6	33052986	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=26,33;MFRL=166,198;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,2:6,6:5,7,3,5
chr6	33053026	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=181,246;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:2,0:4,2:1,5,0,2
chr6	33053455	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=196,227;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,0:2,4:2,0,4,0
chr6	33053468	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=31,25;MFRL=196,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,0:2,5:0|1:33053468_G_T:33053468:2,0,5,0
chr6	33053477	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=176,191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,1:2,4:0|1:33053468_G_T:33053468:2,0,5,0
chr6	33053577	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,1:11,3:11,8,2,2
chr6	33053682	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=8;MBQ=32,26;MFRL=165,147;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=43.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.630:25:6,11:3,5:1,8,2,14
chr6	33053723	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=30,32;MFRL=183,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,3:2,4:0|1:33053723_T_C:33053723:1,4,3,5
chr6	33053728	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=8;MBQ=27,28;MFRL=183,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:3,2:1,5:0|1:33053723_T_C:33053723:1,4,2,6
chr6	33053736	.	GGT	G	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=32,35;MFRL=204,303;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:2,0:7,2:3,6,0,2
chr6	33053737	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=34,33;MFRL=174,281;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.576:11:1,0:2,7:0,4,3,4
chr6	33053740	.	T	TCA,A	.	.	DP=11;ECNT=8;MBQ=30,31,28;MFRL=183,303,281;MMQ=60,60,60;MPOS=-2147483648,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.05,13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,5:0.230,0.463:10:1,0,0:2,2,5:0,3,3,4
chr6	33053772	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=8;MBQ=33,29;MFRL=237,298;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,0:3,4:0|1:33053772_G_A:33053772:2,2,2,2
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chr6	33053902	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=11;MBQ=31,35;MFRL=189,186;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,4:0.625:6:1,2:1,1:0|1:33053902_A_G:33053902:2,0,4,0
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chr6	33053971	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=11;MBQ=27,34;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=67.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,17:0.693:24:3,10:4,6:0|1:33053968_T_A:33053968:3,4,11,6
chr6	33053982	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=28,34;MFRL=172,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=54.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,16:0.608:26:4,10:6,6:3,7,9,7
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chr6	33054071	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=32,33;MFRL=140,145;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=62.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:4,12:1,4:3,2,6,10
chr6	33054074	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=10;MBQ=32,29;MFRL=158,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.458:22:8,8:4,2:4,8,5,5
chr6	33054091	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=10;MBQ=29,27;MFRL=140,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:4,4:1,3:2,3,1,6
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chr6	33054268	.	C	A	.	.	DP=32;ECNT=8;MBQ=32,28;MFRL=140,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=67.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,22:0.719:30:5,8:3,14:5,3,10,12
chr6	33054280	.	TG	CA	.	.	DP=34;ECNT=8;MBQ=26,33;MFRL=136,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=90.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,23:0.667:34:7,9:3,13:5,6,10,13
chr6	33054302	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=14;MBQ=28,32;MFRL=120,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,16:0.568:28:7,8:5,8:5,7,8,8
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chr6	33054353	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=14;MBQ=31,29;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.437:14:2,3:6,3:0|1:33054353_G_A:33054353:3,5,3,3
chr6	33054355	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=14;MBQ=27,35;MFRL=128,176;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,6:0.438:14:2,3:6,3:0|1:33054353_G_A:33054353:3,5,3,3
chr6	33054373	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=14;MBQ=28,30;MFRL=141,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,7:0.534:13:1,4:4,3:0|1:33054373_C_T:33054373:1,5,2,5
chr6	33054381	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=32,33;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:1,5:5,7:0|1:33054373_C_T:33054373:1,5,2,10
chr6	33054386	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=14;MBQ=36,31;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,12:0.650:18:1,4:4,7:0|1:33054373_C_T:33054373:1,5,2,10
chr6	33054400	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=14;MBQ=33,36;MFRL=155,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,9:0.667:13:0,4:4,5:0|1:33054400_T_C:33054400:0,4,0,9
chr6	33054404	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=14;MBQ=28,35;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:0,4:3,5:0|1:33054400_T_C:33054400:0,3,0,9
chr6	33054410	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=14;MBQ=28,35;MFRL=166,194;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=37.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:0,4:3,5:0|1:33054400_T_C:33054400:0,3,0,9
chr6	33054413	.	TT	GA	.	.	DP=14;ECNT=14;MBQ=33,32;MFRL=166,202;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=45.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,11:0.750:14:0,6:3,5:0|1:33054400_T_C:33054400:0,3,0,11
chr6	33054457	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=14;MBQ=29,32;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,0,4
chr6	33134102	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,1,3
chr6	33134392	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=222,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.817:20:3,7:0,9:1,2,5,12
chr6	33135391	.	CA	TG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,16;MFRL=173,213;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.738:6:1,1:0,1:0,1,3,2
chr6	33136575	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=6;MBQ=33,29;MFRL=203,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=30.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:2,4:2,7:1,3,6,5
chr6	33136626	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=33,27;MFRL=193,123;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:0,0:2,1:0|1:33136626_T_TA:33136626:0,2,0,1
chr6	33136627	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=35,22;MFRL=193,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.396:3:0,0:2,1:0|1:33136626_T_TA:33136626:0,2,0,1
chr6	33136638	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=0,29;MFRL=0,12820963;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	33136675	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=24,25;MFRL=0,88;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr6	33136692	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=6;MBQ=32,31;MFRL=55,179;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,0:2,3:0,8,0,3
chr6	33137727	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=238,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=56.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,19:0.869:21:1,8:1,10:0,2,12,7
chr6	33138498	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,8:0,5:0,0,6,7
chr6	33138677	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=207,66;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,1,3
chr6	33138746	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=251,328;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:1,0,2,2
chr6	33138839	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=299,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:2,4,4,0
chr6	33138955	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,4:0,0,7,5
chr6	33139047	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=149,186;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:5,0:11,5:11,5,0,5
chr6	33139328	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=52.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,7:0,10:0,0,11,7
chr6	33139475	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.937:13:0,7:0,6:0,0,1,12
chr6	33139547	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=189,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,1:6,1:2,12,0,2
chr6	33139662	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,4,3
chr6	33140009	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=31.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,9,0
chr6	33140983	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,1,1
chr6	33141161	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=293,198;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,1:0,7:1,0,6,2
chr6	33141253	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=15,32;MFRL=199,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=25.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.865:9:0,4:0,4:0,1,4,4
chr6	33141280	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:2,1,0,4
chr6	33141389	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=19,26;MFRL=293,244;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:0,1:0,1,2,0
chr6	33141475	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr6	33141920	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=26.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,1,6
chr6	33142012	.	AG	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=77,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=G;STR;TLOD=13.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.313:24:8,3:8,4:9,8,3,4
chr6	33142253	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,6:0,6:0,0,8,4
chr6	33143756	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=183,132;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:7,2:2,0:3,6,0,2
chr6	33143948	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=211,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,1:0,2:3,1,2,1
chr6	33144243	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=214,159;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=22.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:3,6:9,3:5,7,4,5
chr6	33144373	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=58.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,11,6
chr6	33144466	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:6,2:10,0:4,12,1,1
chr6	33145369	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=151,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.516:12:1,3:3,3:2,4,3,3
chr6	33146053	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.456:15:5,3:3,2:0,8,4,3
chr6	33146440	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=144,112;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,3:3,0:8,1,3,0
chr6	33147589	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	33148878	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.359:23:4,3:10,5:8,7,4,4
chr6	33152835	.	A	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=135,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=29.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:5,8:0,3:5,1,7,4
chr6	33153528	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=185,0;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:13,3:1,2:5,9,4,1
chr6	33153632	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=197,247;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	33154656	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=253,217;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr6	33162540	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=170,184;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,2:9,0:5,8,2,0
chr6	33162650	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=181,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:8,1,0,2
chr6	33162682	.	ACCCCCAAGGGAGCCTCAGTGCCCCCCAG	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=24,20;MFRL=163,131;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.108:26:4,1:3,0:12,12,1,1
chr6	33163451	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,7:0,6:0,0,5,8
chr6	33164432	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=227,111;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:6,3:1,12,3,0
chr6	33166034	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=20.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:5,3:7,4:12,0,4,3
chr6	33166967	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=127,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:8,0:5,3:7,6,0,3
chr6	33172905	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=37.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,6,4
chr6	33172932	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=46.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,6:0,9:0,0,9,6
chr6	33173748	.	CAGAG	C,CAGAGAGAG,CAGAGAGAGAG	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=32,34,34,33;MFRL=249,188,207,299;MMQ=60,60,60,50;MPOS=21,27,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=13,11,15,16;RU=AG;STR;TLOD=24.01,22.33,4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,8,8,2:0.277,0.341,0.102:25:3,5,5,1:3,3,3,1:6,1,7,11
chr6	33173842	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=207,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=16.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.347:21:5,4:9,3:10,4,2,5
chr6	33175575	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,1:2,4:6,0,4,1
chr6	33179689	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=142,117;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:1,1:3,3,3,0
chr6	33231285	.	C	CTCT	.	.	DP=37;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=144,91;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:31,3:0.110:34:19,2:12,1:0|1:33231285_C_CTCT:33231285:7,24,0,3
chr6	33231287	.	G	GCTTGTAACT	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=141,91;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:18,2:12,1:0|1:33231285_C_CTCT:33231285:8,24,0,3
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chr6	33235755	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=135,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:6,4:3,4:3,6,5,3
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chr6	33239905	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=171,174;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,4:0.125:38:15,2:18,2:15,19,2,2
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chr6	33255103	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=149,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,10:0.440:23:8,4:5,6:6,7,5,5
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chr6	33258443	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=148,136;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=54.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,20:0.636:31:5,13:6,7:8,3,17,3
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chr6	33262762	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=157,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,1:6,1:5,16,1,1
chr6	33269394	.	GAA	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=19,32;MFRL=284,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=A;STR;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:0,1:4,1,2,0
chr6	33269675	.	CT	TC	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,126;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr6	33272855	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=180,184;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.734:12:1,5:1,4:1,2,7,2
chr6	33281842	.	GA	TT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.389:16:6,4:4,2:2,8,3,3
chr6	33283766	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=112,158;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=31.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.451:25:7,4:5,7:9,5,5,6
chr6	33287119	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,141;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:5,4:9,0:10,4,4,0
chr6	33288075	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=197,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:8,3:5,1:7,6,4,0
chr6	33288271	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=25.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.477:19:6,3:4,6:3,7,5,4
chr6	33288373	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:8,0:8,9,1,1
chr6	33289154	.	A	G	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,141;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:44,3:0.081:47:18,3:26,0:25,19,3,0
chr6	33289454	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,84;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,0:5,2:3,6,2,0
chr6	33290547	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=197,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:2,5:6,1:8,0,6,0
chr6	33359716	.	G	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=190,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=46.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,17:0.529:32:7,9:8,8:7,8,12,5
chr6	33359820	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=31.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,1,9
chr6	33366251	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=161,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:3,2:2,1:0,5,0,3
chr6	33379941	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=235,182;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=10.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.531:13:3,1:3,6:6,0,7,0
chr6	33381165	.	C	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=190,189;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,9:0.202:46:15,8:22,0:23,14,9,0
chr6	33381868	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,3:0.095:40:15,1:22,2:20,17,0,3
chr6	33382416	.	CTG	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=143,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,6:4,4:7,3,4,6
chr6	33382457	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=164,143;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,10:0.343:30:7,4:13,6:10,10,4,6
chr6	33382943	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,9:0,6:0,0,10,5
chr6	33382955	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=167,208;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.232:15:5,2:7,1:8,4,1,2
chr6	33383837	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=216,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.298:14:4,0:6,3:0,10,0,4
chr6	33385526	.	AC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=186,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=C;STR;TLOD=11.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:1,2:3,1:1,6,1,3
chr6	33400433	.	AA	CC	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=117,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,1:3,1:0|1:33400433_AA_CC:33400433:0,4,3,0
chr6	33400438	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=27,12;MFRL=117,158;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:1,0:3,0:0|1:33400433_AA_CC:33400433:0,4,2,0
chr6	33402876	.	AGG	A	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=30,30;MFRL=241,203;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:3,1,1,0
chr6	33402879	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,12;MFRL=227,231;MMQ=60,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:3,1,1,0
chr6	33402881	.	G	T,A	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=35,15,15;MFRL=223,231,203;MMQ=60,40,40;MPOS=11,9;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.26,3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,1,1:0.222,0.222:6:2,0,0:1,0,0:3,1,2,0
chr6	33402883	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=29,19;MFRL=231,203;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:1,0:4,1,1,0
chr6	33402884	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=6;MBQ=24,16;MFRL=223,231;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.282:5:3,0:0,0:3,1,1,0
chr6	33402956	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.185:23:4,0:15,3:10,9,0,4
chr6	33403422	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=180,225;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	33406727	.	A	AAGGCTGGC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=232,107;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:33406727_A_AAGGCTGGC:33406727:1,3,0,1
chr6	33406730	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=232,107;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:33406727_A_AAGGCTGGC:33406727:1,3,0,1
chr6	33408465	.	TTC	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=27,23;MFRL=200,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TC;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.245:10:2,1:6,0:5,3,0,2
chr6	33408542	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=30,30;MFRL=176,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,0:10,3:8,7,2,1
chr6	33408680	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=182,141;MMQ=60,60;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.183:14:5,2:6,0:5,7,1,1
chr6	33408890	.	ATG	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=284,231;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=TG;STR;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	33410139	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=221,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:4,4:0,1:3,1,5,0
chr6	33414626	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,4:0,1:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,6
chr6	33414637	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,2:0|1:33414626_T_C:33414626:0,0,0,6
chr6	33414645	.	C	CTGAGCT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=197,110;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0,4,0,1
chr6	33422976	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=63.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,9:0,11:0,0,16,4
chr6	33541507	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=219,118;MMQ=60,27;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:0,5:3,0:3,0,4,1
chr6	33541719	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=95,224;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:13,3:10,1:12,11,2,2
chr6	33555348	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=178,124;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:3,7:1,4:3,1,5,6
chr6	33555690	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=238,314;MMQ=60,36;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33555690_G_C:33555690:0,1,0,1
chr6	33555694	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=238,314;MMQ=60,36;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33555690_G_C:33555690:0,1,0,1
chr6	33555697	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,25;MFRL=238,314;MMQ=60,36;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:33555690_G_C:33555690:0,1,0,1
chr6	33555713	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,30;MFRL=0,314;MMQ=60,36;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:33555690_G_C:33555690:0,0,0,1
chr6	33608379	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=55.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,8:0,0,2,14
chr6	33623509	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=128,270;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:4,5,0,2
chr6	33630624	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=260,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,1:3,2:3,1,2,1
chr6	33630816	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=171,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,0:2,6:0,2,1,5
chr6	33630846	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	33631155	.	TGGGAGG	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,25;MFRL=230,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,8:0.692:11:0,3:3,5:0|1:33631155_TGGGAGG_T:33631155:3,0,8,0
chr6	33631163	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=270,188;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=32.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,8:0.750:10:0,3:1,5:0|1:33631155_TGGGAGG_T:33631155:2,0,8,0
chr6	33635808	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=231,151;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:33635808_T_A:33635808:0,4,0,1
chr6	33635812	.	GG	AT	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,22;MFRL=237,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33635808_T_A:33635808:0,3,0,1
chr6	33635815	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,28;MFRL=237,151;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:33635808_T_A:33635808:0,3,0,1
chr6	33636232	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,9,0
chr6	33640048	.	G	GTTGGAAACTC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=93,109;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:2,1,0,1
chr6	33641897	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=180,89;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:4,2,2,0
chr6	33641956	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:5,1:10,2:9,6,1,2
chr6	33644768	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,7:0,7:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,8,6
chr6	33644773	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=61.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0|1:33644768_T_C:33644768:0,0,9,5
chr6	33646316	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=152,42;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,0:5,2:4,6,2,0
chr6	33646328	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=110,102;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.310:11:1,3:6,0:4,4,1,2
chr6	33646655	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=116,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.325:10:2,1:3,1:5,2,0,3
chr6	33647936	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=193,238;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.219:15:4,1:7,1:2,10,1,2
chr6	33650430	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=256,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=33.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.787:12:0,6:2,4:0,2,3,7
chr6	33650941	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=203,94;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:3,0:0,2:0,3,1,1
chr6	33651975	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=246,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.746:6:0,2:1,2:0,1,2,3
chr6	33652542	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=136,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.175:21:5,1:12,2:11,7,2,1
chr6	33653111	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=48.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr6	33653638	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=131,285;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,0,2
chr6	33654378	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,0,11
chr6	33654897	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr6	33655173	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,0:0,3:0,5,0,3
chr6	33655942	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=198,129;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:3,5,0,2
chr6	33656416	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=217,142;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,5:2,2:2,2,5,2
chr6	33657246	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr6	33659481	.	C	T	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=163,98;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,3:0.107:35:14,0:18,3:20,12,2,1
chr6	33660411	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	33696131	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=229,73;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr6	33740382	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=60.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.953:19:0,13:0,6:0,0,13,6
chr6	33740592	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	33744711	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=175,260;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,2:2,0:10,0,1,1
chr6	33748831	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=192,137;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=46.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.764:19:2,8:2,7:4,0,11,4
chr6	33754396	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=220,185;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr6	33754592	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=145,247;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:8,3:10,1:8,11,1,3
chr6	33768726	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=213,136;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,6,1
chr6	33768810	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=31,22;MFRL=139,211;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.299:28:9,8:11,0:8,12,8,0
chr6	34026938	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.873:6:0,0:0,4:0,0,1,5
chr6	34211341	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:6,2:3,3:3,6,2,3
chr6	34212734	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=26,18;MFRL=175,142;MMQ=48,56;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.412:10:2,1:4,1:0|1:34212734_A_C:34212734:0,6,4,0
chr6	34212737	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=175,142;MMQ=48,56;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.412:10:2,2:4,1:0|1:34212734_A_C:34212734:0,6,4,0
chr6	34212743	.	A	C,G	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=0,34,34;MFRL=0,142,181;MMQ=60,56,47;MPOS=12,5;POPAF=7.30,7.30;TLOD=11.48,17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,5:0.352,0.563:9:0,2,2:0,1,3:0,0,4,5
chr6	34212748	.	TT	CC	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=29,32;MFRL=175,142;MMQ=49,56;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=11.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.412:10:3,2:2,1:0|1:34212734_A_C:34212734:0,6,4,0
chr6	34212753	.	CAGG	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=189,152;MMQ=52,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.394:8:2,1:2,2:0|1:34212734_A_C:34212734:0,5,3,0
chr6	34214994	.	G	GTC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=TC;STR;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.876:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	34215221	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=154,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:2,1:5,3:0|1:34215221_G_A:34215221:6,1,3,1
chr6	34215228	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=170,158;MMQ=60,60;MPOS=26;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:9,2:0.231:11:2,1:7,1:1|0:34215221_G_A:34215221:7,2,2,0
chr6	34497330	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=113,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:34,2:0.078:36:17,0:17,2:19,15,0,2
chr6	34498328	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=200,120;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:5,1:7,4:7,5,2,3
chr6	34614443	.	G	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=137,117;MMQ=60,35;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,0:14,2:15,10,0,3
chr6	34622416	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,2:4,0:4,7,2,0
chr6	34664207	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,4,2
chr6	34735652	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=77,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=T;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,0:1,1:1,1,1,0
chr6	34790986	.	G	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=106,225;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.428:19:7,8:4,0:8,3,8,0
chr6	34838577	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=215,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:3,0,3,0
chr6	34847935	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,164;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,2:3,0:4,1,2,0
chr6	34949451	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:5,0,3,1
chr6	34951138	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=25,28;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.269:9:3,2:4,0:0|1:34951138_TA_T:34951138:1,6,2,0
chr6	34951150	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:4,0:3,0:0|1:34951138_TA_T:34951138:1,10,2,0
chr6	34951159	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=25,12;MFRL=106,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.196:13:4,0:6,0:0|1:34951138_TA_T:34951138:1,10,2,0
chr6	34962060	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=141,276;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:7,1:4,3:7,4,3,1
chr6	35047579	.	G	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=178,253;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,3:14,0:16,9,1,2
chr6	35047732	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:8,1:10,1:2,17,1,1
chr6	35051946	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=130,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:9,2:8,0:10,8,2,0
chr6	35053695	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=139,124;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.430:7:0,1:4,1:0,4,1,2
chr6	35056443	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=233,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=52.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.890:16:0,9:1,6:0,1,4,11
chr6	35056489	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=174,192;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=39.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,0:2,14:0,7,0,14
chr6	35107682	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=199,230;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr6	35205881	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=277,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,2:0,4:0,1,0,6
chr6	35211990	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=291,223;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	35213723	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=186,100;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:14,3:10,0:0|1:35213723_T_G:35213723:13,11,3,0
chr6	35213725	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,31;MFRL=186,100;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,3:0.138:27:13,2:9,0:0|1:35213723_T_G:35213723:13,11,3,0
chr6	35213758	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=166,100;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,3:13,0:15,11,2,1
chr6	35216296	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=174,168;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:3,1,6,1
chr6	35255441	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,162;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:9,5:10,0:9,10,5,0
chr6	35258539	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,169;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,3:2,5:1,1,2,6
chr6	35259261	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=186,187;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,2:6,5:9,1,4,3
chr6	35260615	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=163,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:7,2:2,2:7,2,3,1
chr6	35260858	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=202,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:1,1,0,2
chr6	35278370	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=170,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.142:30:13,0:13,3:12,14,0,4
chr6	35280216	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=184,204;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:6,0:10,4:10,6,3,1
chr6	35280489	.	G	GGGCTC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=171,47;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:7,0:13,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:7,13,1,1
chr6	35280491	.	G	GCGTC	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=170,47;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:7,0:12,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:7,14,1,1
chr6	35280493	.	GAA	G	.	.	DP=23;ECNT=5;MBQ=33,20;MFRL=167,47;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:8,0:12,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:6,15,1,1
chr6	35280496	.	G	GC	.	.	DP=24;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=161,47;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:8,0:13,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:7,15,1,1
chr6	35280500	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=5;MBQ=32,20;MFRL=167,47;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:8,0:10,2:0|1:35280489_G_GGGCTC:35280489:4,15,1,1
chr6	35280616	.	A	AGCGTATCTAGAAGCTGGAAAAGGC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=17,26;MFRL=256,105;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.477:2:0,1:0,0:0,1,0,1
chr6	35287203	.	A	AAC	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=15,15;MFRL=211,138;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:1,0,1,0
chr6	35378778	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=243,155;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,3,1
chr6	35391787	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=43.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,9:1,6:1,0,7,8
chr6	35423489	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,3,1
chr6	35424188	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=155,189;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:0,9,0,2
chr6	35425263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=256,151;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.391:6:2,0:0,2:2,2,1,1
chr6	35426175	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=181,195;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:5,0:3,3:4,4,1,2
chr6	35427556	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,0:5,5:5,5,3,2
chr6	35430686	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=182,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,5:6,1:6,4,3,3
chr6	35436571	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=181,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,3:6,2:11,2,3,2
chr6	35442997	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=214,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:4,4,1,1
chr6	35443573	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=208,217;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,0:2,3:1,3,0,3
chr6	35445265	.	G	GTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,35;MFRL=309,184;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35445265_G_GTC:35445265:0,1,0,1
chr6	35445267	.	A	ACAAATATTTTGTCTCCTGTAC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=309,184;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:35445265_G_GTC:35445265:0,1,0,1
chr6	35448189	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,11:0.706:15:1,5:3,6:3,1,4,7
chr6	35471246	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=184,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	35477025	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=250,124;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=66.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,19:0.836:22:2,11:1,8:2,1,11,8
chr6	35477152	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=141,198;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,0,5
chr6	35478612	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=272,88;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.617:6:1,3:1,0:2,0,1,3
chr6	35543541	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=160,143;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:5,8:7,0:12,0,8,0
chr6	35610681	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=240,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:0,3,0,5
chr6	35704831	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=208,207;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:11,0,1,1
chr6	35705142	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=174,230;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:11,0:9,3:5,15,0,3
chr6	35706063	.	T	G,TG	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=28,33,24;MFRL=235,177,257;MMQ=60,60,60;MPOS=18,32;POPAF=7.30,7.30;TLOD=6.43,3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.378,0.252:5:2,1,0:0,1,1:2,0,3,0
chr6	35706074	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,23;MFRL=169,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.417:5:2,0:0,1:3,0,2,0
chr6	35706078	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,16;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:35706078_C_G:35706078:4,0,2,0
chr6	35706081	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=7;MBQ=31,16;MFRL=168,204;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:1,0:0|1:35706078_C_G:35706078:4,0,2,0
chr6	35706086	.	TC	GA	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=24,19;MFRL=163,257;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:4,0,1,0
chr6	35706087	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=167,151;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,0:1,0:0|1:35706087_C_A:35706087:3,0,1,0
chr6	35706089	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=7;MBQ=26,17;MFRL=212,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:35706087_C_A:35706087:4,0,1,0
chr6	35715303	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=236,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,3:0,2:2,1,4,1
chr6	35747107	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=166,106;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,1:5,3:6,2,3,1
chr6	35747188	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=164,72;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,0:7,3:4,7,1,2
chr6	35765068	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=148,263;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.318:14:3,2:5,2:6,4,2,2
chr6	35765151	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=183,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.406:8:2,0:2,2:0,5,0,3
chr6	35773490	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=218,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:9,3:1,2:6,4,2,3
chr6	35787117	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:5,0,1,1
chr6	35836947	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=252,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:35836947_T_G:35836947:1,3,0,1
chr6	35836951	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=25,32;MFRL=252,204;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:0,0:0|1:35836947_T_G:35836947:1,3,0,1
chr6	35836954	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=32,23;MFRL=228,240;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,0:0,3,1,1
chr6	35840562	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=33,15;MFRL=211,162;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.397:3:0,0:2,0:0|1:35840562_G_T:35840562:1,1,0,1
chr6	35840568	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,10;MFRL=182,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:2,0:0|1:35840562_G_T:35840562:1,3,0,1
chr6	35840579	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=25,11;MFRL=190,162;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.334:4:1,0:0,0:0|1:35840562_G_T:35840562:0,3,0,1
chr6	35840584	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=21,30;MFRL=176,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,2:0.500:4:0,1:1,1:1|0:35840562_G_T:35840562:0,2,0,2
chr6	35965685	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=190,80;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:6,0:4,4:4,6,0,4
chr6	35987222	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,36;MFRL=159,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,5:2,2:4,0,7,0
chr6	36026959	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=176,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr6	36040642	.	AT	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=84,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=43.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,16:0.633:25:3,10:6,6:2,7,7,9
chr6	36041707	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=168,342;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr6	36063821	.	TG	T	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,66;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,2:0.067:42:21,0:17,1:17,23,2,0
chr6	36098333	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=32.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,6:0,3:0,0,6,3
chr6	36098951	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=207,257;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:4,0,1,0
chr6	36098953	.	T	G,A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,30,27;MFRL=217,204,257;MMQ=60,60,60;MPOS=14,10;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.58,3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.376,0.248:5:0,2,0:2,0,1:2,0,3,0
chr6	36099206	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,1:1,2:1,1,0,3
chr6	36100427	.	A	ATCT	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,0:12,2:12,12,1,1
chr6	36103921	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=154,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:0,1,0,3
chr6	36104803	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=140,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr6	36107014	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=151,38;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:8,2:4,0:8,6,1,1
chr6	36107172	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=230,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:2,3:2,6:1,3,2,7
chr6	36177908	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=204,84;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:2,3:4,0:6,0,3,0
chr6	36177934	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=162,84;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.292:15:3,4:8,0:7,4,3,1
chr6	36178319	.	ATGGG	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=247,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGG;STR;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0,2,0,1
chr6	36179173	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=159,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:6,0:8,2:7,8,1,1
chr6	36181947	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:4,3:8,0:9,3,0,3
chr6	36189887	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,7,1
chr6	36261885	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=403,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.838:10:0,5:1,4:1,0,6,3
chr6	36269603	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=212,220;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,4:4,0:3,2,3,1
chr6	36274148	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=125,191;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.181:20:10,1:7,1:0|1:36274148_T_A:36274148:6,11,1,2
chr6	36274153	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=123,191;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,3:0.166:22:10,1:8,2:0|1:36274148_T_A:36274148:6,13,1,2
chr6	36288879	.	G	GGTCTCAGCT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=180,261;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,1:4,3,3,0
chr6	36290030	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=168,216;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:9,4:2,0:9,2,3,1
chr6	36291080	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=146,323;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:2,2:7,0:6,3,0,2
chr6	36291985	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=173,270;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.177:15:4,0:8,2:6,7,0,2
chr6	36292007	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=201,270;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:0,0:8,2:3,5,0,2
chr6	36293230	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=194,161;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.499:22:5,6:6,5:3,8,0,11
chr6	36294627	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=215,253;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:2,2:2,2,0,2
chr6	36296514	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=121,128;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,1:7,3:1,11,1,3
chr6	36298328	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=122,192;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,0:3,5:1,4,0,5
chr6	36355372	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=139,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.387:19:4,6:6,1:6,6,2,5
chr6	36359695	.	TTTA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=110,153;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.772:7:1,4:0,1:0,1,1,5
chr6	36368169	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=206,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,2:1,4:1,0,5,1
chr6	36447287	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	36452603	.	TAAA	T,TAA,TAAAA	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=28,28,28,28;MFRL=143,133,123,96;MMQ=60,60,60,60;MPOS=23,30,19;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=16,13,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.89,6.33,5.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,3,3,6:0.134,0.203,0.286:19:3,2,1,3:3,1,2,3:1,6,4,8
chr6	36452653	.	C	CAGAACCCATCAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=36,17;MFRL=93,86;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:0,0:2,0:0|1:36452653_C_CAGAACCCATCAA:36452653:0,2,0,1
chr6	36452658	.	T	TCACTGTGTCTG	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=93,86;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:36452653_C_CAGAACCCATCAA:36452653:0,2,0,1
chr6	36465715	.	CTTTTT	C,CTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,23,19;MFRL=202,197,206;MMQ=51,42,60;MPOS=21,26;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,14,17;RU=T;STR;TLOD=4.18,3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.356,0.367:7:0,1,0:1,1,0:0,2,0,5
chr6	36466165	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=150,257;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,4:0.134:35:21,0:10,4:19,12,4,0
chr6	36467791	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=105,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,3:2,1:1,4,2,2
chr6	36475200	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=157,316;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,2:2,3:3,1,5,0
chr6	36493265	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=161,253;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,2:1,1:1,0,4,0
chr6	36493330	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=147,86;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:2,2:2,2:3,1,2,2
chr6	36508036	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=230,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=18.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr6	36566575	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=64,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,3:1,2:2,0,5,0
chr6	36569717	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=153,120;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;RPA=19,20;RU=T;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.650:10:2,5:1,1:3,0,3,4
chr6	36652339	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,6:4,1:2,2,1,6
chr6	36695519	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=167,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,1,4
chr6	36710269	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=180,146;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:4,2:4,3:0,8,1,4
chr6	36712962	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr6	36730797	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=190,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:1,3,2,0
chr6	36746581	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,3:3,3:5,3,5,1
chr6	36759741	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	36759768	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,2:1,3:3,1,5,0
chr6	36767920	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	36789940	.	C	CG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=119,240;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=G;STR;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.209:12:3,1:6,1:4,6,2,0
chr6	36823502	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=343,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=25.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,5:1,3:3,0,8,0
chr6	36842427	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=391,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:1,11:0,4:1,0,12,3
chr6	36853786	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0,0,3,2
chr6	36853857	.	T	TCGC	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CGC;STR;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.896:7:0,1:0,5:0,0,3,4
chr6	36884407	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=217,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:0,9,0,2
chr6	36887308	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,100;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,4:6,3:7,3,6,1
chr6	36936771	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=229,161;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:10,3:4,0:5,10,0,3
chr6	36940343	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,1:2,2:8,0,3,0
chr6	36943436	.	G	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=200,127;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:12,0:13,4:11,14,0,4
chr6	36943605	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=197,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr6	36945062	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:4,0:7,3:2,9,0,3
chr6	36945945	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=164,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:1,3,0,5
chr6	36949527	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=202,246;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	36989391	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,9:0,5:0,0,4,10
chr6	37139322	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=179,190;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:9,1:0,2:0,9,0,3
chr6	37140670	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,32,32,30;MFRL=177,190,185,196;MMQ=60,60,60,60;MPOS=3,8,6;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,11,12,13;RU=T;STR;TLOD=5.93,4.53,9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:10,3,3,6:0.153,0.153,0.269:22:4,3,3,4:5,0,0,2:10,0,12,0
chr6	37141962	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=189,172;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:0,5,0,4
chr6	37186693	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=149,185;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:12,2:7,2:8,11,4,0
chr6	37237544	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=170,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,0:2,5:0,3,0,5
chr6	37280844	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=187,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.788:12:0,6:2,4:0,2,0,10
chr6	37426517	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=166,102;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:13,0:13,3:10,16,0,3
chr6	37447075	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=195,137;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,3:3,3:0,5,2,4
chr6	37447994	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=184,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	37452897	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,181;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:9,2:4,0:11,2,2,0
chr6	37605972	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=123,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.301:18:6,1:6,4:4,9,0,5
chr6	37606305	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=191,73;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:9,1:4,1:6,7,2,1
chr6	37611796	.	GG	AA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=180,243;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.430:3:0,1:2,0:1,1,0,1
chr6	37614918	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=36,33;MFRL=274,197;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=C;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:1,0:1,2:1,1,2,0
chr6	37614924	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=274,197;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,0:1,0:1,1,2,0
chr6	37615159	.	A	AATAT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:37615159_A_AATAT:37615159:0,5,0,1
chr6	37615161	.	G	GAAGT	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:3,1:2,0:0|1:37615159_A_AATAT:37615159:0,5,0,1
chr6	37615164	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=32,22;MFRL=194,156;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:2,1:2,0:0|1:37615159_A_AATAT:37615159:0,5,0,1
chr6	37615177	.	A	AGAAAAAAG	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=25,27;MFRL=247,150;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0,2,0,1
chr6	37618202	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=241,269;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr6	37620129	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=34,26;MFRL=242,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=29.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.687:14:0,2:4,8:0,4,2,8
chr6	37620142	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=224,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:37620142_T_A:37620142:0,8,1,1
chr6	37620143	.	A	ATGGAATGGAATGGAATGGAAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=28,20;MFRL=224,55;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:2,0:5,2:0|1:37620142_T_A:37620142:0,8,1,1
chr6	37622628	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=177,0;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.179:20:6,2:11,1:6,11,0,3
chr6	38084569	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=175,210;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=28.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:3,6:3,5:0,6,1,10
chr6	38119942	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=187,231;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:10,1:3,1:12,1,2,0
chr6	38691328	.	GCAA	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=158,238;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CAA;STR;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	38697788	.	C	CAGAAAAAGTGCAAGGAGGCCCTGGGTCT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=157,129;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,1:0.245:7:4,0:2,1:2,4,0,1
chr6	38702468	.	CT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=214,198;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=T;STR;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:0,2:0,2,0,4
chr6	38746090	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=168,149;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0|1:38746090_A_G:38746090:4,1,3,0
chr6	38746098	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=171,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0|1:38746090_A_G:38746090:4,0,3,0
chr6	38750705	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=210,186;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr6	38771096	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,3:5,2:6,8,1,4
chr6	38773172	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=187,116;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:2,1:5,2:7,0,3,0
chr6	38781931	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=135,149;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.339:15:5,2:5,2:4,6,2,3
chr6	38791555	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=244,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr6	38794183	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,23;MFRL=139,93;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.598:13:3,5:2,3:2,3,3,5
chr6	38805902	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=236,268;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	38820451	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=174,166;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:10,1:1,1:5,7,2,0
chr6	38828424	.	G	GT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:10,1:1,2:2,9,0,3
chr6	38828453	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=25,31;MFRL=179,265;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:0,11,0,2
chr6	38840601	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,151;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:2,7,1,3
chr6	38843279	.	CC	TT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=234,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:38843279_CC_TT:38843279:4,0,2,0
chr6	38843283	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=225,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0|1:38843279_CC_TT:38843279:5,0,2,0
chr6	38851305	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=175,264;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:0|1:38851305_C_T:38851305:0,4,0,3
chr6	38851308	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=251,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,3:0.444:7:4,0:0,3:1|0:38851305_C_T:38851305:0,4,0,3
chr6	38851585	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=184,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	38877605	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=182,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,2:3,0:0,3,0,2
chr6	38882937	.	AG	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=171,142;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:6,3:1,1:6,1,3,1
chr6	38883082	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=92,43;MMQ=60,41;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:5,2:4,0:3,6,1,1
chr6	38885010	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=159,245;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:2,2,3,1
chr6	38899485	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=175,219;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,1:2,3:2,0,4,0
chr6	38905667	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=212,160;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.380:6:2,0:2,2:4,0,2,0
chr6	38906072	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=249,251;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:0,2:2,2:0,2,0,4
chr6	38913177	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=159,213;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:4,2:7,5:10,1,7,0
chr6	38950126	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=160,222;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:8,4,0,2
chr6	38957771	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=163,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.666:10:1,5:2,2:1,2,6,1
chr6	38979946	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	38980260	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=135,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:7,2:7,0:9,5,1,1
chr6	39033420	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0|1:39033420_A_G:39033420:0,0,5,0
chr6	39033427	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0|1:39033420_A_G:39033420:0,0,6,0
chr6	39033898	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	39046713	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,76;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,2:5,0:4,5,0,2
chr6	39073479	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=148,77;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,1:7,1:7,6,2,0
chr6	39162206	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=25.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	39313618	.	G	GA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=151,72;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr6	39325078	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=224,159;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=51.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:1,9:4,7:1,4,7,9
chr6	39325224	.	CTT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=189,204;MMQ=43,40;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.502:2:0,0:0,0:0,1,0,1
chr6	39328257	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=194,74;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:5,3:10,0:7,8,2,1
chr6	39330135	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=133,125;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,3:2,3:5,1,5,1
chr6	39330180	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=135,103;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.412:17:4,2:6,4:4,6,4,3
chr6	39682367	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=27.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr6	39828862	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=270,157;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:0,2,0,2
chr6	39832111	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=178,211;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:0,5:1,3:1,0,8,0
chr6	39832363	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=216,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.692:11:3,5:0,3:0,3,0,8
chr6	39839164	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=134,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,2:0,3:1,0,5,0
chr6	39846137	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=244,176;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=35.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,5:2,6:3,0,5,6
chr6	39846997	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=176,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:39846997_C_T:39846997:2,0,1,0
chr6	39847003	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=30,15;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39846997_C_T:39846997:1,0,1,0
chr6	39847006	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=30,10;MFRL=157,177;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:39846997_C_T:39846997:1,0,1,0
chr6	39851679	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:4,1,4,1
chr6	39855427	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,291;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	39866805	.	A	AACAATGGGC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=194,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.392:8:4,1:1,2:0,5,0,3
chr6	39867937	.	TT	AG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=190,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:11,0:3,2:5,9,1,1
chr6	39869066	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:2,2:1,5:2,2,5,2
chr6	39869259	.	G	GGCAA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.673:1:0,0:0,1:0|1:39869259_G_GGCAA:39869259:0,0,0,1
chr6	39869264	.	A	AAGACTTGCAGTGCCC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39869259_G_GGCAA:39869259:0,0,0,1
chr6	39869266	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,79;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:39869259_G_GGCAA:39869259:0,0,0,1
chr6	39873309	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=168,200;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:6,0:1,4:7,0,2,2
chr6	39873682	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=359,184;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	40998324	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=175,235;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:6,3,2,0
chr6	40998344	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=211,175;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.571:12:3,3:2,4:2,3,4,3
chr6	41011266	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=35,26;MFRL=176,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:5,1:7,4,4,2
chr6	41011304	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=151,8691;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,4:5,0:12,4,0,4
chr6	41029109	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=183,146;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.250:18:9,3:5,1:10,4,1,3
chr6	41036770	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=216,168;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:2,1:4,2:0,6,0,3
chr6	41037778	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=127,123;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,11:0.342:33:11,6:11,5:13,9,5,6
chr6	41038845	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,13:0.375:35:8,7:13,5:14,8,8,5
chr6	41046802	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=185,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:5,2:4,5:7,2,3,4
chr6	41052002	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	41160101	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=197,206;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:5,1:2,1:6,1,2,0
chr6	41165819	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=178,208;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,3:5,0:0|1:41165819_C_T:41165819:7,2,2,1
chr6	41165840	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=159,243;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:6,2:2,0:0|1:41165819_C_T:41165819:5,3,1,1
chr6	41169021	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=182,181;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,2:1,3:0,1,0,5
chr6	41196095	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=51.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,8,4
chr6	41196104	.	C	CCTT	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0|1:41196095_C_T:41196095:0,0,7,5
chr6	41197434	.	TG	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr6	41204329	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=184,161;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:2,3:3,2:3,3,4,1
chr6	41243991	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=137,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:6,2:1,4:1,6,2,4
chr6	41303784	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=188,251;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,4:0.333:13:2,2:6,2:0|1:41303784_G_A:41303784:4,5,2,2
chr6	41303805	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=198,228;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.357:12:3,1:5,2:0|1:41303784_G_A:41303784:5,3,2,2
chr6	41304241	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=197,245;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr6	41309698	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=47.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,5,9
chr6	41486990	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=228,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.616:8:2,3:0,2:3,0,5,0
chr6	41552429	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=266,155;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=16.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr6	41554993	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=214,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	41562514	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	41562530	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	41617308	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=259,251;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,1,2
chr6	41617626	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=169,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,0,4
chr6	41617658	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=208,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr6	41620975	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	41621168	.	TCTG	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,200;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTG;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,1:1,0:0,2,0,1
chr6	41652604	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=16,28;MFRL=184,153;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.514:14:1,5:2,2:1,6,4,3
chr6	41655814	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=146,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.541:13:1,3:4,4:0,6,1,6
chr6	41708152	.	CTG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,215;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TG;STR;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.505:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	41710176	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=166,148;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.248:18:8,4:6,0:8,6,1,3
chr6	41721682	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=163,46;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=32.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:2,6:4,4:2,4,8,2
chr6	41740483	.	CGTGTGTGTGTGT	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,114;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=17,11;RU=GT;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.687:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	41748263	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=174,269;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,1:5,3:0,9,0,4
chr6	41748279	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,0,11
chr6	41754573	.	C	CCTT	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=184,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,8:0.256:33:11,7:14,1:0|1:41754573_C_CCTT:41754573:15,10,6,2
chr6	41754576	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=181,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:27,6:0.199:33:14,4:13,2:1|0:41754573_C_CCTT:41754573:18,9,3,3
chr6	41755410	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,1:12,1:16,5,2,0
chr6	41876911	.	CA	C,CAAA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24,34;MFRL=0,154,161;MMQ=60,58,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,15;RU=A;STR;TLOD=4.67,3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,1:0.508,0.332:3:0,0,1:0,1,0:0,0,2,1
chr6	41888827	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.583:22:3,7:6,6:3,6,6,7
chr6	41898096	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=215,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,3:2,3:0,3,0,6
chr6	41898564	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=238,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,1:1,4:0,3,1,4
chr6	41903576	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=180,202;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	41904345	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=165,206;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,8:0.281:30:13,2:9,6:10,12,3,5
chr6	41905174	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=206,132;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:0,3,0,7
chr6	42018212	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=198,201;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,0:0|1:42018212_G_C:42018212:1,0,1,0
chr6	42018217	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=24,12;MFRL=198,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:42018212_G_C:42018212:1,0,1,0
chr6	42018222	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,12;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:42018212_G_C:42018212:2,0,1,0
chr6	42018227	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=26,26;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:42018212_G_C:42018212:2,0,1,0
chr6	42018229	.	GA	CC	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=18,12;MFRL=196,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:42018212_G_C:42018212:2,0,1,0
chr6	42025058	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=357,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,4:0,2:1,0,3,3
chr6	42036395	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=234,160;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,3:4,0:0,5,0,3
chr6	42044945	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=161,179;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:3,4:3,9:4,2,4,9
chr6	42054564	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=78,242;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:0,9,2,0
chr6	42075377	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=143,212;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr6	42110263	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=49.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr6	42152645	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=204,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,0:4,2:9,1,0,2
chr6	42153609	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	42162575	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	42175927	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,165;MMQ=60,51;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	42176120	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr6	42176743	.	TG	T	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.601:8:1,2:2,3:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,3,1,4
chr6	42176749	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,5:0.600:8:1,1:2,3:0|1:42176743_TG_T:42176743:0,3,1,4
chr6	42176776	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,27;MFRL=156,214;MMQ=60,24;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.330:4:1,1:2,0:0|1:42176776_T_C:42176776:0,3,0,1
chr6	42176780	.	TGG	CAC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,32;MFRL=195,214;MMQ=60,24;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:42176776_T_C:42176776:0,4,0,1
chr6	42181773	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=219,164;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=32.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,7:1,4:1,0,10,1
chr6	42181960	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=285,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=36.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.813:14:0,10:2,2:0,2,5,7
chr6	42182088	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,21;MFRL=248,157;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,1:0,3,0,3
chr6	42182183	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,5:0,0:0,0,0,5
chr6	42214379	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=225,272;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,0:2,2:0,6,0,2
chr6	42231086	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=157,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:9,0:6,2:10,5,2,0
chr6	42559866	.	AT	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=181,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.298:11:4,0:4,3:8,0,1,2
chr6	42607841	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=209,244;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:2,0,2,0
chr6	42608123	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=214,149;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.440:5:1,1:1,1:1,2,0,2
chr6	42611872	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=250,234;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr6	42612312	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,0,5
chr6	42613379	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=165,295;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.313:14:4,1:6,3:0,10,0,4
chr6	42617961	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=137,123;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:5,1,5,0
chr6	42626341	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=119,229;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:6,4,2,1
chr6	42626564	.	TAAA	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=99,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=20,17;RU=A;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.355:9:2,1:2,1:3,3,0,3
chr6	42638354	.	TACATA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=179,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACATA;STR;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,2:1,1:5,0,2,1
chr6	42638564	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,1:3,2:0,5,0,4
chr6	42641704	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:4,3:3,2:1,6,1,4
chr6	42650766	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=110,165;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=27.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.631:20:3,9:4,3:5,2,8,5
chr6	42652667	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=17,32;MFRL=127,202;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:0,2:0,1,3,2
chr6	42658752	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=117,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:6,1:11,3:11,8,3,1
chr6	42666020	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=170,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.304:8:2,2:3,0:4,2,2,0
chr6	42672407	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0|1:42672407_T_C:42672407:0,1,2,2
chr6	42672416	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=194,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0|1:42672407_T_C:42672407:0,1,1,2
chr6	42796138	.	CAAA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=290,207;MMQ=59,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,13;RU=A;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:4,0,1,0
chr6	42828194	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	42847725	.	T	C	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=126,70;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,4:0.091:53:25,0:19,4:24,25,1,3
chr6	42851258	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=183,205;MMQ=40,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:6,7,1,1
chr6	42853842	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,2,4
chr6	42883911	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=140,242;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,0:4,2:4,4,1,1
chr6	42893372	.	A	AT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=202,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,0:7,2:2,8,1,1
chr6	42928461	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=84,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:1,0,3,0
chr6	42928758	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	42931224	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=170,174;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=31.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.752:14:1,6:2,5:2,1,9,2
chr6	42931261	.	C	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=126,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:3,8:7,7:6,4,9,6
chr6	42932715	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=7.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,0:3,3:2,2,1,2
chr6	42934500	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,3:5,3:5,4,3,3
chr6	42934620	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=179,120;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr6	42935998	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=129,161;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.546:18:4,6:4,3:3,5,8,2
chr6	42937721	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=141,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:9,0:10,3:8,11,0,3
chr6	42942779	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=133,203;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:3,2:0,2:0,3,1,3
chr6	42974268	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=161,161;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:13,2:10,0:14,9,2,0
chr6	42985758	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=192,167;MMQ=60,54;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,5:6,0:5,8,5,0
chr6	42985770	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=190,167;MMQ=60,54;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,5:7,0:7,9,5,0
chr6	42993969	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43006739	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=190,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr6	43017256	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=167,230;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,0:10,3:8,10,0,3
chr6	43021910	.	C	CA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=34,33;MFRL=138,51863014;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	43021943	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,15;MFRL=182,244;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.548:5:1,0:1,1:2,0,3,0
chr6	43021980	.	G	GGA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=225,180;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:3,0,0,1
chr6	43021990	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,19;MFRL=179,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,1:1,0:0|1:43021990_A_T:43021990:0,2,2,0
chr6	43021995	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,19;MFRL=179,232;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.496:4:1,0:1,1:0|1:43021990_A_T:43021990:0,2,2,0
chr6	43023371	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=140,120;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:5,4:7,2:3,9,3,3
chr6	43034228	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=154,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,2:9,0:7,9,0,2
chr6	43038063	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	43038938	.	TA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=205,170;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.397:3:1,0:1,1:2,0,1,0
chr6	43041126	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=204,165;MMQ=40,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43041126_C_T:43041126:0,2,0,1
chr6	43041136	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=204,165;MMQ=40,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:43041126_C_T:43041126:0,2,0,1
chr6	43041790	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=212,0;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:3,2:4,0:0,7,0,2
chr6	43100066	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=232,175;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,4:4,0:4,2,4,0
chr6	43111445	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	43112382	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,31;MFRL=195,204;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,1:4,3:0,7,0,4
chr6	43127577	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=184,147;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:6,4:9,1:5,10,2,3
chr6	43128607	.	C	CGGGATTATAGACAG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=175,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:3,5,1,1
chr6	43146272	.	TAC	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=209,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=AC;STR;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr6	43146299	.	A	AGG	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=197,237;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.328:10:3,3:4,0:0|1:43146299_A_AGG:43146299:0,7,0,3
chr6	43146302	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,31;MFRL=197,237;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.329:10:3,2:4,0:0|1:43146299_A_AGG:43146299:0,7,0,3
chr6	43146303	.	A	ACC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=26,23;MFRL=197,237;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:3,2:4,0:0|1:43146299_A_AGG:43146299:0,7,0,3
chr6	43153409	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=273,165;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.453:7:3,2:0,1:2,2,0,3
chr6	43155458	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=26.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.408:25:9,5:6,5:5,10,6,4
chr6	43166677	.	C	CT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,19;MFRL=288,196;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.389:6:1,0:3,0:1,3,0,2
chr6	43172430	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=116,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:4,2,4,0
chr6	43173672	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=199,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	43173907	.	CC	AG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=144,140;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:8,3:3,2:3,9,3,2
chr6	43188716	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=141,200;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.628:6:0,3:2,1:0,2,0,4
chr6	43189375	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,155;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:3,1:6,1:6,3,1,1
chr6	43190923	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=201,141;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	43193499	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=154,58;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,1:8,1:12,4,2,0
chr6	43214319	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,2:3,2:5,0,4,0
chr6	43221264	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=220,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:4,1,2,2
chr6	43221291	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=225,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,0:1,0:0|1:43221291_T_A:43221291:1,1,2,0
chr6	43221300	.	AT	CA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=174,193;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,0:1,0:0|1:43221291_T_A:43221291:2,1,2,0
chr6	43221310	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,12;MFRL=235,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,0:0|1:43221291_T_A:43221291:2,2,1,0
chr6	43221313	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,13;MFRL=235,198;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:43221291_T_A:43221291:2,2,1,0
chr6	43225547	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=157,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.246:13:5,0:5,2:4,6,1,2
chr6	43225766	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=267,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:2,0:0|1:43225766_G_A:43225766:0,4,0,1
chr6	43225791	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=164,233;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0|1:43225766_G_A:43225766:0,2,0,2
chr6	43230548	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=175,104;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,0:2,2:3,0,1,1
chr6	43230940	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=176,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:2,0:5,4:4,3,2,2
chr6	43230970	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=128,193;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.501:12:3,3:3,3:4,2,4,2
chr6	43231163	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=213,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:0,1,0,3
chr6	43237501	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=155,40;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:43237501_G_T:43237501:1,3,1,1
chr6	43237503	.	C	CGCTGAATGA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=155,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0|1:43237501_G_T:43237501:1,3,1,1
chr6	43250387	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr6	43250725	.	GGAA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=228,191;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAA;STR;TLOD=32.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,2:1,0,6,2
chr6	43251118	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=220,199;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:1,3,1,4
chr6	43251298	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=171,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.399:18:4,4:7,3:6,5,2,5
chr6	43251880	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,247;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43269029	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=229,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,1,3
chr6	43270326	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0|1:43270326_A_G:43270326:0,0,3,0
chr6	43270329	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=293,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43270326_A_G:43270326:3,0,1,0
chr6	43270337	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=293,146;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:43270326_A_G:43270326:3,0,1,0
chr6	43273604	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=163,192;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:0,5:5,1:2,3,3,3
chr6	43274017	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.184:14:2,2:10,0:3,9,2,0
chr6	43276388	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=181,248;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:0|1:43276388_G_C:43276388:3,0,2,1
chr6	43276390	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=248,181;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,3:0.500:6:2,3:1,0:1|0:43276388_G_C:43276388:2,1,3,0
chr6	43399837	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=72.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,10:0,0,10,11
chr6	43401105	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:4,5,0,4
chr6	43412736	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=198,102;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,2:7,0:12,6,2,0
chr6	43413652	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=135,266;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:7,2:4,0:5,7,2,0
chr6	43414203	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=35,15;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,0:0|1:43414203_C_T:43414203:0,3,1,0
chr6	43414205	.	CCC	AAA	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=32,15;MFRL=100,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,0:0|1:43414203_C_T:43414203:0,3,1,0
chr6	43414216	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	43414234	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,33;MFRL=186,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.659:4:0,0:1,2:0,1,0,3
chr6	43415769	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	43416991	.	G	GTT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,32;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:3,1,0,1
chr6	43416993	.	C	CTA	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,33;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:3,1,0,1
chr6	43416994	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=35,30;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:3,1,0,1
chr6	43416995	.	G	GAA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=143,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:0,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:2,1,0,1
chr6	43416997	.	G	GAATACTTGA	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=35,31;MFRL=118,127;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0|1:43416991_G_GTT:43416991:2,0,0,1
chr6	43422196	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=202,46;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.500:24:6,3:6,9:8,4,1,11
chr6	43469445	.	GACAC	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=0,17;MFRL=0,201;MMQ=60,40;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=26,24;RU=AC;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.775:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	43469505	.	GTC	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=161,209;MMQ=60,59;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=TC;STR;TLOD=5.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	43494319	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	43496662	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=249,165;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:4,2:2,5:1,5,2,6
chr6	43501580	.	C	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,3:0,3:0,0,5,2
chr6	43514527	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,30;MFRL=188,205;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.550:7:0,1:0,2:0,3,0,4
chr6	43517744	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=129,72;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.328:7:3,2:2,0:2,3,1,1
chr6	43519229	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.332:16:7,0:4,5:0|1:43519229_T_C:43519229:2,9,0,5
chr6	43519233	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=157,165;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:6,0:4,5:0|1:43519229_T_C:43519229:2,9,0,5
chr6	43521263	.	TAC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=279,281;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=AC;STR;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.625:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	43550264	.	TGTG	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=206,176;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GTG;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,2:2,0:1,3,0,2
chr6	43596648	.	G	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=195,175;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,5:0.176:32:10,0:16,5:10,17,0,5
chr6	43646287	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=142,154;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.109:25:11,0:12,2:12,11,1,1
chr6	43655533	.	T	TCGTAATTTTTTCTCAATATCCTTATTTTAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=171,112;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=17.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:5,3:8,2:2,11,1,4
chr6	43745107	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=146,281;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr6	43746169	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=139,263;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:8,1:16,3:14,10,2,2
chr6	43746612	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=169,93;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:9,4:9,0:14,4,4,0
chr6	43748643	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	43968671	.	TC	AT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=21,15;MFRL=294,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,0:0|1:43968671_TC_AT:43968671:3,0,1,0
chr6	43968680	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,15;MFRL=274,181;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:3,0:0|1:43968671_TC_AT:43968671:4,0,1,0
chr6	44081510	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=195,246;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	44081934	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=159,188;MMQ=60,25;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:5,0:6,2:0,11,0,3
chr6	44081987	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,36;MFRL=150,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.514:6:1,1:1,2:0,3,0,3
chr6	44084354	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=192,80;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:7,2:3,9,1,1
chr6	44102572	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=203,309;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.603:3:1,0:0,2:0,1,1,1
chr6	44103019	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,2:3,0:9,2,1,1
chr6	44104279	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=209,168;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	44107200	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=219,79;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=15.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,6:3,1:6,2,2,5
chr6	44107365	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=202,127;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:2,2:8,2:2,8,3,1
chr6	44107612	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=228,184;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,1:1,3:0,1,0,4
chr6	44108150	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=163,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:7,3:0,0:0,7,0,3
chr6	44117727	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=223,234;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:5,4:1,0:3,3,2,2
chr6	44120435	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,198;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:6,0:8,2:4,11,1,1
chr6	44122416	.	TCTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=181,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,5,2
chr6	44134581	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,2,5
chr6	44134610	.	TTCC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=17,34;MFRL=112,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TCC;STR;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:0,2:0,2,0,2
chr6	44136955	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=198,177;MMQ=60,50;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:2,0:6,0,2,0
chr6	44140818	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=197,166;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:5,3:7,3:4,8,1,5
chr6	44144557	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=21,22;MFRL=200,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,0:0,1:2,4,2,0
chr6	44144798	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=271,297;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:1,2,2,0
chr6	44147250	.	AAC	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=86,142;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.201:18:9,2:4,1:12,3,2,1
chr6	44148247	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=154,103;MMQ=60,35;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:9,9,0,2
chr6	44148655	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=168,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:2,2:9,0:4,7,2,0
chr6	44151560	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=168,223;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.372:6:2,1:2,0:0|1:44151560_A_C:44151560:0,4,2,0
chr6	44151566	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=201,223;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:44151560_A_C:44151560:1,5,2,0
chr6	44151765	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=214,212;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr6	44151804	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=225,211;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:0,4,0,2
chr6	44216544	.	GTT	G,GT	.	.	DP=41;ECNT=1;MBQ=32,32,33;MFRL=149,146,197;MMQ=60,60,60;MPOS=17,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=6.44,27.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,4,14:0.151,0.520:27:7,1,9:2,3,5:2,7,7,11
chr6	44217374	.	T	G	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=143,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,16:0.512:31:7,12:8,3:10,5,9,7
chr6	44217910	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:10,1:12,2:6,16,1,2
chr6	44220076	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	44228162	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:6,3:8,2:11,3,4,1
chr6	44247951	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=81.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,7:0,14:0,0,12,10
chr6	44253617	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	44268806	.	T	TTGTC	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=40.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,4:0,5:0,0,9,1
chr6	44269023	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,1,16
chr6	44269193	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=157,216;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.498:8:2,1:1,3:3,1,3,1
chr6	44270768	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:0,2,2,1
chr6	44270936	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=137,227;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.277:16:5,2:7,2:5,7,1,3
chr6	44270986	.	GC	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=195,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:8,1:4,1:5,8,1,1
chr6	44272599	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.124:22:9,0:9,2:0|1:44272599_G_A:44272599:8,12,0,2
chr6	44272600	.	A	AAATAT	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,23;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:11,0:9,2:0|1:44272599_G_A:44272599:8,12,0,2
chr6	44273546	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=70,226;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.398:21:4,6:7,2:4,9,2,6
chr6	44273982	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.159:17:6,0:8,2:7,8,2,0
chr6	44274797	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr6	44279111	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,124;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=17.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:5,1:3,5:5,3,4,2
chr6	44279302	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:1,1:0,2:0|1:44279302_G_GA:44279302:1,1,1,2
chr6	44279309	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=22,29;MFRL=167,219;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.573:5:1,1:0,2:0|1:44279302_G_GA:44279302:1,1,1,2
chr6	44280812	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=149,177;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:3,3:4,2:6,1,5,0
chr6	44320650	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=199,55;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:44320650_GA_G:44320650:2,5,1,1
chr6	44320654	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=199,55;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:44320650_GA_G:44320650:2,5,1,1
chr6	44320655	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=199,55;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,2:0.273:9:3,2:4,0:0|1:44320650_GA_G:44320650:2,5,1,1
chr6	44355682	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,6:4,3:0,10,1,8
chr6	44355699	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=198,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:5,7:4,2:0,9,0,10
chr6	44364261	.	GT	G,GTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34,24;MFRL=161,173,107;MMQ=33,56,60;MPOS=19,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.85,4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.334,0.333:6:0,1,0:1,1,1:0,2,0,4
chr6	44371690	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=183,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:4,4,2,2
chr6	44374056	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=179,173;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:9,3:2,0:3,8,2,1
chr6	44922313	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=168,168;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:3,11,1,1
chr6	45296618	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=164,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	45333093	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=188,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.385:8:5,2:0,1:0,5,0,3
chr6	45390274	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=87,117;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:5,2:8,0:4,11,2,0
chr6	45480190	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=235,180;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:0,8,0,2
chr6	45514961	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=242,10811480;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:1,1:6,1:2,5,2,0
chr6	45870999	.	CAG	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=131,225;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:5,1:3,5,1,1
chr6	45922849	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=43.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,8:0,6:0,0,10,4
chr6	46048000	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=156,107;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:4,7:3,2:2,5,2,7
chr6	46107312	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=211,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:8,1:1,4:7,3,4,1
chr6	46190930	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,138;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.128:21:16,2:3,0:9,10,2,0
chr6	46521602	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:2,5,2,5
chr6	46554912	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=129,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.159:23:13,3:7,0:10,10,0,3
chr6	46604062	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=154,101;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,4:4,0:4,0,4,0
chr6	46630068	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=255,123;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:2,0,4,0
chr6	46636520	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=114,102;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:9,2:13,0:20,4,1,1
chr6	46649231	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,0:1,4:4,2,3,1
chr6	46655901	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=143,106;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.599:3:1,0:0,2:1,0,1,1
chr6	46658905	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=198,154;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:0|1:46658905_C_G:46658905:2,4,2,0
chr6	46658915	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=131,204;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,4:0.627:6:1,3:1,1:1|0:46658905_C_G:46658905:2,0,2,2
chr6	46661974	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=36,23;MFRL=244,200;MMQ=50,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	46672381	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=118,157;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:8,2:4,1:6,6,2,1
chr6	46684222	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=136,121;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:3,3:9,3:3,9,2,4
chr6	46717652	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=218,126;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:12,2:3,4:6,9,2,4
chr6	46719576	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=469,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	46726441	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=167,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:1,4:4,2:5,0,5,1
chr6	46726680	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=123,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:6,1:4,1:4,6,0,2
chr6	46761495	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,22;MFRL=202,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.648:18:3,8:3,4:4,2,3,9
chr6	46793175	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=236,146;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.565:21:6,9:3,3:4,5,5,7
chr6	46794048	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=257,166;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,7:0.533:13:3,4:3,3:5,1,5,2
chr6	46797329	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=161,113;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.662:10:2,5:1,1:1,2,2,5
chr6	46800768	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=127,174;MMQ=60,25;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.333:31:7,0:14,10:9,12,10,0
chr6	46803018	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,23;MFRL=166,138;MMQ=40,40;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,5:0.428:12:6,2:1,3:0|1:46803018_A_T:46803018:7,0,3,2
chr6	46803022	.	AA	CT	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=173,56;MMQ=40,44;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,0:3,2:0|1:46803018_A_T:46803018:10,2,1,1
chr6	46803029	.	A	ATTGCTACACATCCTT	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,20;MFRL=179,56;MMQ=40,44;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:7,0:6,2:0|1:46803018_A_T:46803018:12,2,1,1
chr6	46803345	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=267,128;MMQ=60,48;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:2,3:5,6:1,6,3,6
chr6	46806939	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=218,176;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr6	46806948	.	G	GTTTGGGGCAGCT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=206,178;MMQ=60,39;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:1,1:3,4:0,4,0,5
chr6	46823695	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,135;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=114.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,39:0.976:39:0,16:0,23:0,0,15,24
chr6	46823805	.	A	AG	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,192;MMQ=60,47;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=45.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,9:0,4:0,0,4,9
chr6	46826715	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,43;MPOS=8;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,8:0,8:0,0,8,8
chr6	46826768	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=22,32;MFRL=121,156;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,2:9,0:6,8,2,0
chr6	46828670	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	46832741	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=36.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,4,7
chr6	46832813	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=65,140;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.936:14:1,5:0,8:1,0,5,8
chr6	46832968	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=137,161;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr6	46834906	.	TG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	46856263	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=181,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,2:2,3,0,3
chr6	46867717	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=154,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,14:0.834:16:2,7:0,7:2,0,12,2
chr6	46867898	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=200,118;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:2,1:6,2:0,8,0,3
chr6	46976924	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=146,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,6:0.241:27:11,5:10,1:7,14,1,5
chr6	46977783	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,228;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:3,3,1,1
chr6	46991831	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=147,80;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.295:15:5,4:5,0:6,5,3,1
chr6	46995508	.	G	GA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=108,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:4,0:4,2:0,8,0,2
chr6	47202666	.	A	AT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=164,228;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=7.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:8,0:3,3:1,11,0,3
chr6	47202669	.	G	GA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=183,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.197:13:7,1:4,1:1,10,0,2
chr6	47253631	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=242,203;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:4,0,3,0
chr6	47277329	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	47445927	.	T	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=52.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,5:0,11:0,0,10,6
chr6	47547070	.	T	TA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=21,28;MFRL=210,86;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,2:0,0:2,0,2,0
chr6	47626685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=155,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,4:1,1:2,1,4,1
chr6	47641307	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=205,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:0,5,0,3
chr6	47646842	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=101,199;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:5,3:4,4:4,5,3,4
chr6	47649265	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=164,138;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:6,4:4,3:7,3,2,5
chr6	47653536	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,237;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:4,0:0,3:4,0,3,0
chr6	47653812	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=182,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=8.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	47654662	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=138,147;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.522:21:7,7:3,4:7,3,9,2
chr6	47661387	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=179,74;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,1:3,4:9,2,3,2
chr6	47678455	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=211,160;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=20.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.644:12:1,5:3,3:4,0,7,1
chr6	47678678	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=31.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,1,8
chr6	47678718	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=181,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr6	47681494	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=42.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,9,3
chr6	47682212	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=179,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=25.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:2,1:7,9:3,6,6,4
chr6	47684591	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=115,203;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:3,3,1,3
chr6	47686101	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=96.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.968:28:0,16:0,12:0,0,18,10
chr6	47686235	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=173,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,3:1,1:2,3,1,3
chr6	47749728	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=216,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=26.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,4:1,4:2,0,8,0
chr6	47759446	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=186,259;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:7,2:3,1:10,0,3,0
chr6	47762938	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=269,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	47847637	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=22,27;MFRL=125,79;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:14,1:4,1:8,10,2,0
chr6	47847683	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=208,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:1,5:1,2:0,2,1,6
chr6	49415351	.	TA	T,TAA	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=23,24,25;MFRL=169,195,147;MMQ=60,60,60;MPOS=15,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=A;STR;TLOD=4.80,4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,2:0.307,0.254:9:1,1,0:3,1,2:3,1,4,1
chr6	49415383	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,15;MFRL=152,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:4,0:4,0:8,5,4,0
chr6	49415386	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,10;MFRL=153,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.198:17:4,0:6,0:9,5,3,0
chr6	49424047	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=201,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	49437853	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:6,0,3,1
chr6	49437959	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=145,151;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=40.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,11:0.414:27:9,0:6,11:0|1:49437959_G_A:49437959:8,8,0,11
chr6	49437964	.	T	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,26;MFRL=144,151;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=40.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,11:0.400:28:10,0:6,11:0|1:49437959_G_A:49437959:9,8,0,11
chr6	49440599	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=166,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,4:7,1:7,8,3,2
chr6	49459978	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=27,31;MFRL=136,160;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:8,3:5,0:6,7,0,3
chr6	49460026	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,24;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49460026_A_T:49460026:0,3,1,0
chr6	49460030	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=148,0;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:49460026_A_T:49460026:0,3,1,0
chr6	49479694	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=151,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.289:11:5,0:3,2:3,5,1,2
chr6	49518808	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=166,197;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.287:26:12,4:6,3:8,11,4,3
chr6	49519124	.	TG	T	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=175,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,2:0.103:27:10,2:12,0:0|1:49519124_TG_T:49519124:10,15,1,1
chr6	49519134	.	C	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=174,93;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:12,0:14,0:0|1:49519124_TG_T:49519124:11,15,1,1
chr6	49574994	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=186,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr6	49660418	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=169,166;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:5,0,2,1
chr6	49663465	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=204,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,4:3,0:5,0,4,0
chr6	49755030	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=149,387;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:9,1:2,2:3,8,2,1
chr6	49815873	.	ATT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=170,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	49937257	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=207,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,5:5,1:3,6,5,1
chr6	50681785	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=173,86;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,2:0.085:33:16,1:15,1:20,11,2,0
chr6	50681817	.	C	CT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=122,180;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=20,21;RU=T;STR;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.726:8:1,3:0,0:1,1,3,3
chr6	50789932	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,2:0.094:30:20,2:6,0:0|1:50789932_G_A:50789932:9,19,0,2
chr6	50789944	.	CTGTG	C,CTG	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,33,33;MFRL=175,142,227;MMQ=60,60,60;MPOS=13,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,5,6;RU=TG;STR;TLOD=4.81,4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,2:0.184,0.181:13:7,0,2:2,2,0:0,9,0,4
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chr6	52051274	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=181,176;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:6,4,1,3
chr6	52101873	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=176,150;MMQ=60,54;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:10,4:11,0:10,11,4,0
chr6	52129667	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=254,242;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,1:3,3:0,6,0,4
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chr6	52130117	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:52130104_CT_AC:52130104:0,2,0,1
chr6	52130245	.	C	CAA	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,37;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=A;STR;TLOD=3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
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chr6	52137313	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=101,144;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:2,2,0,5
chr6	52142092	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=233,172;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,4:0,0:0,1,0,4
chr6	52142582	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	52144081	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=208,283;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr6	52147363	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=184,198;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:0,5:4,2:4,0,6,1
chr6	52147692	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=178,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:2,3:6,2:0,8,0,5
chr6	52267907	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,356;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	52267967	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=356,214;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,4:1,1:3,0,5,0
chr6	52269685	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=247,197;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:1,6:1,6:1,1,7,5
chr6	52270504	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,11:0.545:20:3,5:6,6:5,4,6,5
chr6	52270544	.	TTTG	T	.	.	DP=31;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=160,195;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,2:13,1:16,9,3,0
chr6	52271194	.	AAG	A	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=217,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=59.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,17:0.600:28:5,8:6,9:0|1:52271194_AAG_A:52271194:7,4,5,12
chr6	52271204	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=163,228;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,3:0.128:29:12,1:14,2:1|0:52271194_AAG_A:52271194:12,14,1,2
chr6	52271400	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=219,141;MMQ=60,50;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr6	52303399	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=164,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:4,6,0,2
chr6	52317597	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,289;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,2:6,2:7,9,1,3
chr6	52355206	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=423,208;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,3:1,8:0,1,1,10
chr6	52368034	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=143,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,5:0.161:35:13,2:17,3:13,17,2,3
chr6	52370939	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=124,163;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.611:13:3,3:1,5:2,3,3,5
chr6	52441754	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=186,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,2:4,5:0,7,0,7
chr6	52541811	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=246,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.858:12:0,5:1,6:1,0,11,0
chr6	52615564	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=189,57;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:1,7,1,1
chr6	52617731	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=146,194;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:2,5:9,2:4,7,5,2
chr6	52622814	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=146,252;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,0:4,4:1,6,0,4
chr6	52662263	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	52697601	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,6,2
chr6	52697825	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,1,6
chr6	52697834	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,242;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=35.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.909:9:0,1:0,8:0|1:52697825_A_C:52697825:0,0,1,8
chr6	52702324	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=53.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.942:15:0,7:0,8:0,0,8,7
chr6	52702529	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=30.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr6	52767271	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=148,74;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.234:15:7,0:5,3:5,7,1,2
chr6	52843477	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=208,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	52847273	.	T	TAC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=AC;STR;TLOD=10.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	52847551	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=231,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,3:1,3:0,1,0,6
chr6	52849481	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,19;MFRL=290,176;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.610:3:0,0:0,0:0,1,0,2
chr6	52850155	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=179,245;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	52858859	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=176,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr6	52895851	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=139,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:13,1:8,1:12,9,1,1
chr6	52938468	.	AT	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	52962715	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	52996708	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,162;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr6	52998788	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=31,30;MFRL=188,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,1:0,2:1,1,3,0
chr6	52998834	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=208,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:1,2:0,5:0,1,7,0
chr6	52998856	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,27;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,10:0.786:12:2,4:0,6:1,1,7,3
chr6	53134104	.	C	CACAG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=175,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACAG;STR;TLOD=10.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,2:2,1:0,7,0,3
chr6	53138203	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.851:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	53140928	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,3,4
chr6	53160383	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=153,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:6,3:4,4:8,2,5,2
chr6	53365019	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=93.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,15:0,11:0,0,17,9
chr6	53370107	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=24,32;MFRL=242,163;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=29.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.626:14:1,4:4,5:5,0,9,0
chr6	53370147	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,31;MFRL=167,163;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,0:4,3:10,0,1,2
chr6	53370395	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=243,253;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:2,2,1,1
chr6	53379405	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=210,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,4:1,1:0,2,0,5
chr6	53519857	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=26,30;MFRL=152,181;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=48.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.775:20:3,9:1,7:1,3,10,6
chr6	53519880	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=194,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:8,1:8,2:8,8,3,0
chr6	53520088	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	53520124	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	53707098	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=145,206;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:2,7:1,2:0,3,0,9
chr6	53764673	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=133,182;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:6,1:3,2:3,6,2,1
chr6	53767569	.	CAT	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=179,228;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0,13,1,1
chr6	53778865	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr6	53784235	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=36,25;MFRL=141,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr6	53784275	.	T	TTA	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=138,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.361:9:3,1:2,2:3,3,3,0
chr6	53784315	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,15;MFRL=146,94;MMQ=60,44;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:8,0:5,0:8,7,2,0
chr6	53785401	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=159,176;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,2:5,1:8,5,1,2
chr6	53785487	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=127,299;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:11,3:7,0:11,7,2,1
chr6	53989526	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=185,163;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.221:19:6,1:9,2:5,10,3,1
chr6	54013765	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=259,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr6	54025155	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=152,208;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:9,0:8,2:10,7,1,1
chr6	54067088	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=31.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr6	54095423	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	54186024	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=395,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,2,0
chr6	54792236	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=193,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.390:11:2,2:4,2:7,0,3,1
chr6	54805254	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=212,82;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:6,3:6,0:6,6,2,1
chr6	55113347	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:55113347_T_C:55113347:5,0,4,0
chr6	55113350	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=36,28;MFRL=189,195;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0|1:55113347_T_C:55113347:5,0,4,0
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chr6	55924136	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr6	55966418	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=160,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr6	56047438	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=131,179;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=23.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.376:22:5,2:9,6:6,8,2,6
chr6	56327849	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=136,116;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.825:21:2,9:1,8:2,1,10,8
chr6	56333747	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=129,118;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:3,4:7,1:8,2,5,0
chr6	56334594	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=107,156;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,0:1,5:2,1,4,1
chr6	56350339	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=218,156;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:0,3:2,2:0,2,0,5
chr6	56357668	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=270,251;MMQ=60,50;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=16,14;RU=A;STR;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0|1:56357668_CAA_C:56357668:5,0,2,0
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chr6	56359031	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.684:1:0,1:0,0:0|1:56359031_G_A:56359031:0,0,0,1
chr6	56359034	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:56359031_G_A:56359031:0,0,0,1
chr6	56374754	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=162,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:0,1:3,3:0,3,0,4
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chr6	56425088	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=178,133;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.366:28:7,10:11,0:10,8,10,0
chr6	56425284	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=256,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
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chr6	56437465	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=211,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:6,0,5,0
chr6	56437902	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=218,168;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,1:2,5:1,8,2,4
chr6	56438597	.	A	C	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=149,110;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.125:30:10,0:17,3:11,16,0,3
chr6	56462840	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=117,132;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=34.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:3,7:0,6:1,2,2,11
chr6	56467586	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=234,208;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:2,0,4,0
chr6	56468238	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=203,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:3,3:0,1:2,1,1,3
chr6	56468537	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=222,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=46.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.752:18:2,5:2,9:2,2,5,9
chr6	56470047	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=205,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.361:12:4,2:3,2:6,2,3,1
chr6	56471103	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=171,114;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.609:21:6,7:2,6:5,3,7,6
chr6	56473005	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=181,94;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:8,3:8,0:6,10,2,1
chr6	56476262	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=133,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:4,0,6,0
chr6	56476334	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,91;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.193:22:10,3:8,0:7,11,3,1
chr6	56479203	.	G	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=145,124;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.177:26:10,4:12,0:10,12,4,0
chr6	56482704	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=250,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.548:11:1,3:3,3:4,1,5,1
chr6	56482801	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=312,161;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=49.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.728:20:3,6:2,9:2,3,6,9
chr6	56483638	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=171,163;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:5,8,2,0
chr6	56494078	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=106,49;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:9,0:7,2:9,7,2,0
chr6	56506806	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=165,168;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.147:32:9,0:19,4:15,13,0,4
chr6	56507135	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:1,0,7,0
chr6	56818706	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	57244672	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=176,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:6,4:5,2:9,2,6,0
chr6	57244830	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=227,270;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,3:4,2:0,5,0,5
chr6	57246773	.	T	TAGG	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=193,130;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AGG;STR;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:10,3:3,4:12,1,7,0
chr6	57246785	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=31,33;MFRL=199,145;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.309:23:11,4:5,3:13,3,6,1
chr6	57246815	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:14,4:5,3:13,6,3,4
chr6	57246969	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,10:0.453:22:6,6:6,3:2,10,1,9
chr6	57246982	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,29;MFRL=149,129;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:5,5:5,3:2,8,2,6
chr6	57247022	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=35,29;MFRL=153,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.337:10:1,2:5,1:0,7,1,2
chr6	57372199	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=196,184;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,4:3,1:7,0,5,0
chr6	57372361	.	C	A	.	.	DP=43;ECNT=4;MBQ=35,25;MFRL=155,157;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=78.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,25:0.591:42:6,15:11,10:5,12,7,18
chr6	57372365	.	A	G	.	.	DP=46;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=155,173;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,11:0.266:43:15,5:15,6:8,24,4,7
chr6	57372374	.	CT	C	.	.	DP=45;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=155,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=16.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,8:0.227:37:11,5:18,3:6,23,1,7
chr6	57372436	.	GC	CC,CT	.	.	DP=21;ECNT=4;MBQ=33,31,32;MFRL=195,157,128;MMQ=60,60,60;MPOS=15,6;POPAF=7.30,7.30;TLOD=18.19,9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,7,4:0.400,0.250:17:3,2,3:3,5,1:0,6,1,10
chr6	57393029	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=25,30;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:2,1:0|1:57393029_T_A:57393029:6,0,3,0
chr6	57393034	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=33,25;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:57393029_T_A:57393029:6,0,3,0
chr6	57393040	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=8;MBQ=29,24;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:0|1:57393029_T_A:57393029:6,0,3,0
chr6	57393054	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=8;MBQ=28,30;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:3,2:9,0,3,0
chr6	57393074	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=164,197;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:7,0:9,2:0|1:57393074_A_G:57393074:17,1,2,0
chr6	57393092	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=8;MBQ=25,27;MFRL=160,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,4:0.216:21:7,1:9,3:0|1:57393074_A_G:57393074:16,1,3,1
chr6	57393112	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=8;MBQ=25,34;MFRL=158,151;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:10,3:13,1:18,7,3,1
chr6	57393125	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=8;MBQ=28,33;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,17:0.562:30:5,9:8,7:12,1,10,7
chr6	57393199	.	C	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=26.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:12,8:6,4:4,14,3,9
chr6	57393216	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=31,29;MFRL=146,114;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=31.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,11:0.521:21:6,7:4,4:0,10,2,9
chr6	57393222	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=24,34;MFRL=144,164;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,3:0.190:19:10,1:5,2:0|1:57393222_A_G:57393222:1,15,0,3
chr6	57393228	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=30,27;MFRL=146,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,3:0.222:16:9,1:3,2:0|1:57393222_A_G:57393222:1,12,0,3
chr6	57398047	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=30,35;MFRL=212,241;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:3,1:8,0,3,0
chr6	57398058	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=11;MBQ=34,33;MFRL=199,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:7,0,4,0
chr6	57398081	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=41.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.767:15:3,6:0,5:3,0,10,2
chr6	57398117	.	T	TA	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=28,26;MFRL=172,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:8,2:9,5:0|1:57398117_T_TA:57398117:11,6,6,1
chr6	57398118	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=11;MBQ=34,24;MFRL=172,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,7:0.307:24:8,1:9,4:0|1:57398117_T_TA:57398117:11,6,6,1
chr6	57398154	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=11;MBQ=28,32;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=73.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,19:0.606:31:4,7:7,11:0|1:57398154_T_C:57398154:6,6,12,7
chr6	57398157	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=11;MBQ=27,32;MFRL=154,168;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,17:0.581:29:4,7:8,10:0|1:57398154_T_C:57398154:6,6,10,7
chr6	57398163	.	A	G	.	.	DP=34;ECNT=11;MBQ=27,30;MFRL=141,148;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=65.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,18:0.543:33:4,8:11,9:0|1:57398154_T_C:57398154:8,7,9,9
chr6	57398186	.	G	GA	.	.	DP=40;ECNT=11;MBQ=32,32;MFRL=141,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=24.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,11:0.301:38:11,5:15,5:13,14,7,4
chr6	57398201	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=26,30;MFRL=134,148;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=94.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,26:0.614:42:6,11:10,14:7,9,13,13
chr6	57398226	.	T	A,G	.	.	DP=43;ECNT=11;MBQ=25,28,33;MFRL=127,165,161;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;TLOD=41.26,23.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:16,17,9:0.404,0.226:42:4,3,4:11,13,5:7,9,12,14
chr6	57398335	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=4;MBQ=25,28;MFRL=212,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.683:17:3,4:2,7:0,5,0,12
chr6	57398385	.	A	AT	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.499:6:0,1:3,2:0|1:57398385_A_AT:57398385:0,3,0,3
chr6	57398395	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=26,27;MFRL=196,134;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,3:0.500:6:0,1:3,2:0|1:57398385_A_AT:57398385:0,3,0,3
chr6	57398412	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	57466987	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=120,156;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:5,2,7,1
chr6	57467279	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=204,150;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.467:13:2,0:4,6:0|1:57467279_T_C:57467279:0,7,1,5
chr6	57467282	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=204,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=24.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:3,0:3,7:0|1:57467279_T_C:57467279:0,7,1,6
chr6	57467303	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=26,34;MFRL=201,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.640:12:3,0:1,7:1,3,0,8
chr6	57472255	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=171,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=41.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:2,9:4,6:5,1,15,0
chr6	57472299	.	A	G	.	.	DP=39;ECNT=4;MBQ=28,33;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=43.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,16:0.414:39:12,11:11,5:18,5,13,3
chr6	57472315	.	AG	GA,GG	.	.	DP=53;ECNT=4;MBQ=29,32,32;MFRL=115,171,168;MMQ=60,60,60;MPOS=9,22;POPAF=7.30,7.30;TLOD=62.25,14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:17,23,7:0.473,0.159:47:9,14,4:8,9,3:12,5,19,11
chr6	57472344	.	A	AT	.	.	DP=67;ECNT=4;MBQ=25,29;MFRL=135,206;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=22.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,13:0.215:62:31,8:17,5:21,28,10,3
chr6	57472476	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=30,26;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=19.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:9,7:8,2:2,15,1,8
chr6	57472488	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=33,28;MFRL=213,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,4:6,1:1,15,0,5
chr6	57472495	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=171,213;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=27.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.476:19:6,4:3,5:1,9,0,9
chr6	57472533	.	TT	CC,CT	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=36,32,33;MFRL=141,210,198;MMQ=60,60,60;MPOS=14,12;POPAF=7.30,7.30;TLOD=17.11,6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,6,3:0.386,0.225:15:5,4,2:1,2,1:0,6,0,9
chr6	57498894	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=177,186;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,5:1,8:3,0,13,0
chr6	57498944	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=136,192;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=63.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,19:0.742:25:5,8:1,11:5,1,17,2
chr6	57499042	.	A	AT	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=167,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=T;STR;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,10:0.318:32:15,3:7,7:9,13,4,6
chr6	57512439	.	T	C	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=134,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=24.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.323:29:13,3:7,6:19,1,7,2
chr6	57512476	.	G	A	.	.	DP=47;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=90.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,32:0.688:46:9,13:5,19:8,6,21,11
chr6	57512678	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=9;MBQ=34,29;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,20:0.751:26:3,12:3,8:2,4,11,9
chr6	57512711	.	G	A,C	.	.	DP=24;ECNT=9;MBQ=34,23,33;MFRL=186,158,139;MMQ=60,60,60;MPOS=4,19;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.62,51.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:6,4,14:0.185,0.555:24:1,2,8:5,2,5:3,3,3,15
chr6	57512718	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=9;MBQ=30,25;MFRL=172,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=45.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.520:23:4,7:6,4:3,8,2,10
chr6	57512775	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=9;MBQ=32,32;MFRL=160,157;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=34.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,9:0.714:12:1,6:2,3:0|1:57512775_T_G:57512775:0,3,0,9
chr6	57512779	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=33,29;MFRL=160,161;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=39.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,10:0.733:13:1,5:1,3:0|1:57512775_T_G:57512775:0,3,0,10
chr6	57512787	.	T	TCACCAAGGC	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=32,29;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,5:1,3:0|1:57512775_T_G:57512775:0,2,0,11
chr6	57512788	.	T	TTA	.	.	DP=13;ECNT=9;MBQ=32,30;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=46.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.800:13:1,5:1,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,2,0,11
chr6	57512792	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=30,33;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,2,0,7
chr6	57512793	.	AATT	A	.	.	DP=9;ECNT=9;MBQ=27,26;MFRL=150,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=28.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:0|1:57512775_T_G:57512775:0,2,0,7
chr6	62407067	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,1:4,3:2,3,3,1
chr6	62611356	.	ACAAAACG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,103;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	62757808	.	T	TGTGCCTCTGCTATCCACACGGCTTGCTCCC	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=151,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:2,2:4,0:2,4,1,1
chr6	62887031	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,272;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	63921360	.	CA	AG	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=309,201;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=25.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:2,0,8,0
chr6	63921361	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.913:10:0,6:0,4:0,0,10,0
chr6	63922376	.	T	TGGG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,15;MFRL=167,195;MMQ=60,53;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,0:4,0:0,5,2,0
chr6	63922500	.	ATTTTTT	A,ATT,ATTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,27,16,16;MFRL=0,212,277,282;MMQ=32,55,60,60;MPOS=15,19,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=19,13,15,16;RU=T;STR;TLOD=26.29,3.16,4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:1,10,2,3:0.573,0.159,0.195:16:0,5,0,0:1,4,0,1:1,0,6,9
chr6	63922916	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=242,155;MMQ=60,48;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,4:2,5:1,1,3,6
chr6	63922929	.	A	AAAAT	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=20,27;MFRL=83,155;MMQ=60,47;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=AAAT;STR;TLOD=11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,1:0,1:0,1,0,3
chr6	63923011	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=245,189;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr6	63991209	.	A	AATATATAT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,208;MMQ=60,47;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=13,17;RU=AT;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.684:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	64289938	.	AT	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=20,30;MFRL=128,140;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:1,1:2,1:3,2,2,0
chr6	64395876	.	GA	TT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=221,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64395876_GA_TT:64395876:0,2,0,1
chr6	64395883	.	G	GCTCAAAAAATTTAAGAAATAC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=221,139;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:64395876_GA_TT:64395876:0,2,0,1
chr6	64416061	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=165,177;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:12,5:14,0:12,14,5,0
chr6	64431002	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=128,114;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=15.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.270:24:6,5:11,0:15,3,6,0
chr6	64516020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:6,1,3,0
chr6	65016977	.	TGA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=224,191;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=GA;STR;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.465:7:1,1:3,2:1,3,1,2
chr6	65098768	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=174,185;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,7:3,2:0,5,1,8
chr6	65300264	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=174,285;MMQ=60,54;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=19.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:6,0:14,6:0|1:65300264_C_T:65300264:13,9,0,6
chr6	65300273	.	T	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=26,22;MFRL=172,285;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=19.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,6:0.233:28:5,0:16,6:0|1:65300264_C_T:65300264:13,9,0,6
chr6	65301679	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=150,110;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,3:4,0:5,6,1,2
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chr6	65302915	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	65302987	.	ATATCT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=172,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,2:7,1:6,2,3,0
chr6	65335915	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	65596759	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.909:8:0,8:0,0:0,0,3,5
chr6	65611952	.	T	TATTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=21.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	65655883	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.727:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr6	66005740	.	G	GA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=176,165;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,2:1,1:3,1,1,2
chr6	66044767	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	66045077	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	66045118	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	66053835	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr6	66063513	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=107,262;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:15,4:8,0:7,17,1,3
chr6	66115281	.	G	GAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=135,166;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=A;STR;TLOD=9.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.516:11:2,1:2,4:1,4,1,5
chr6	69666520	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=162,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:7,5:2,2:8,1,4,3
chr6	69666747	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,155;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.721:8:1,3:1,2:1,1,0,6
chr6	69724069	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=172,152;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:3,0:1,6:0,4,1,5
chr6	69759148	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr6	69772809	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=188,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=25.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,8:0.600:13:2,3:1,5:0|1:69772809_T_C:69772809:4,1,8,0
chr6	69772817	.	C	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=172,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:10,5:0.352:15:4,3:5,2:1|0:69772809_T_C:69772809:9,1,4,1
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chr6	70459209	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=139,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.350:9:3,1:3,2:5,1,3,0
chr6	70490511	.	A	C,G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,24,32;MFRL=165,195,191;MMQ=60,60,60;MPOS=34,7;POPAF=7.30,7.30;TLOD=5.69,11.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.307,0.385:10:0,0,3:3,3,1:0,3,0,7
chr6	70490528	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr6	70500120	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=202,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:3,0,3,0
chr6	70637941	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=180,100;MMQ=60,27;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:2,5,0,5
chr6	70744264	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=183,177;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr6	70778378	.	GC	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=110,228;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:3,2,1,2
chr6	70840124	.	AT	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=86,137;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,6:0.189:30:14,2:9,4:13,11,1,5
chr6	70852607	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=6.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.561:7:0,1:3,3:3,0,4,0
chr6	70854183	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=181,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.739:17:1,5:3,8:2,2,7,6
chr6	70854208	.	CAG	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=37.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:0,3:2,6:1,1,3,6
chr6	70859478	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,24;MFRL=250,246;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:70859478_C_T:70859478:4,0,1,0
chr6	70859487	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=250,246;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:3,0:1,3:0|1:70859478_C_T:70859478:3,1,2,1
chr6	70873331	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=172,130;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:7,2:5,0:6,6,2,0
chr6	70875976	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=261,192;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	70878156	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=184,165;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,4:4,3:2,5,2,5
chr6	70894894	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,265;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	70897967	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=136,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.364:25:8,4:8,4:4,12,2,7
chr6	70909252	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=217,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.443:9:2,3:3,1:4,1,3,1
chr6	70916998	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=232,86;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,2:3,2:1,5,0,4
chr6	70944123	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=195,205;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	70944465	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=185,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:7,0,4,2
chr6	70950281	.	AAT	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=214,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AT;STR;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	70951186	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=177,93;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:0|1:70951186_C_T:70951186:5,5,1,1
chr6	70951195	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=178,93;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:6,0:3,2:0|1:70951186_C_T:70951186:4,5,1,1
chr6	70962044	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=230,191;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	70963232	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr6	70964745	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=136,137;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:3,1:10,2:3,11,2,1
chr6	70965125	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=207,135;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:0,6,0,6
chr6	70970299	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=144,143;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,3:3,5:1,3,3,5
chr6	70976538	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=139,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.358:12:3,1:5,3:3,5,0,4
chr6	70979437	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.498:10:1,1:4,4:1,4,1,4
chr6	70981793	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=29,26;MFRL=196,508;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=A;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:7,0:10,2:4,13,2,0
chr6	70981794	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=193,327;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.186:20:6,1:11,2:7,10,0,3
chr6	70983644	.	TAATA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=181,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AATA;STR;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	70983888	.	GT	G,GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33,36;MFRL=177,168,156;MMQ=60,60,60;MPOS=22,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.48,3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.272,0.271:8:2,1,0:2,1,2:0,4,0,4
chr6	70984562	.	TG	CA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,204;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	70991003	.	GAA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=A;STR;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.360:9:2,3:3,0:6,0,3,0
chr6	71011596	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	71011831	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=133,89;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,2,2
chr6	71137992	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=167,276;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,2,1
chr6	71190577	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=217,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,2:4,2:5,0,4,0
chr6	71195952	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=185,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:6,0:13,3:7,12,1,2
chr6	71233621	.	TGG	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=146,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=G;STR;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,0:3,3:5,0,2,1
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chr6	72945492	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=149,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,5:2,3:0,3,0,8
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chr6	72968609	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=233,286;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.401:8:1,1:3,2:5,0,3,0
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chr6	73108872	.	AAG	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,24;MFRL=189,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=14.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr6	73331983	.	AGCG	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,342;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCG;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.685:1:0,0:0,0:0,0,1,0
chr6	73713679	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=174,82;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.190:24:7,2:13,2:6,14,2,2
chr6	73752822	.	T	TCA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=198,73;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:7,0:1,2:7,1,1,1
chr6	73787255	.	TTTG	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=214,62;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:0,0:1,4,1,1
chr6	73814907	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=202,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	73821169	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=173,170;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,3:2,1:0|1:73821169_T_C:73821169:0,6,0,4
chr6	73821193	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=189,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:0|1:73821169_T_C:73821169:0,5,0,3
chr6	73904104	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=242,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	73933501	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=170,164;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:1,1:7,3:3,5,3,1
chr6	73935135	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.917:9:0,8:0,1:0,0,3,6
chr6	73951987	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=6;MBQ=30,32;MFRL=179,196;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=59.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:1,12:0,5:0,1,5,12
chr6	73952058	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=6;MBQ=33,31;MFRL=175,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:2,6:1,2:2,1,7,1
chr6	73952103	.	A	C	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=148,157;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,6:0.290:22:9,5:7,1:0|1:73952103_A_C:73952103:11,5,4,2
chr6	73952109	.	C	A	.	.	DP=24;ECNT=6;MBQ=32,26;MFRL=154,157;MMQ=60,59;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,6:0.280:23:8,3:8,1:0|1:73952103_A_C:73952103:11,6,3,3
chr6	73952112	.	GG	TA	.	.	DP=26;ECNT=6;MBQ=33,28;MFRL=148,142;MMQ=60,58;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,5:0.222:25:10,3:8,1:0|1:73952103_A_C:73952103:11,9,1,4
chr6	73952118	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=6;MBQ=29,32;MFRL=142,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,7:0.285:26:10,4:9,3:11,8,2,5
chr6	74063070	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,1:6,3:5,4,2,2
chr6	74063589	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=174,229;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:7,3,0,2
chr6	74079464	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=167,199;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:3,7,2,2
chr6	74107501	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr6	74114365	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=217,231;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:1,3,2,0
chr6	74115383	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=156,353;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,0:4,2:10,0,2,0
chr6	74119084	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,4:0,0,4,5
chr6	74123363	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=155,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:1,1:5,1:5,2,2,0
chr6	74138503	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=134,219;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:5,7,1,1
chr6	74155346	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.914:9:0,2:0,6:0,0,5,4
chr6	74155491	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr6	74189574	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=38.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,4:0,9:0,0,7,6
chr6	74192422	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=181,205;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	74192431	.	CT	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=191,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0,4,0,1
chr6	74228006	.	A	G	.	.	DP=43;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=179,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=96.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,31:0.801:38:2,19:5,12:4,3,15,16
chr6	74228049	.	A	G	.	.	DP=41;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=177,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=78.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,25:0.685:36:5,14:6,11:6,5,12,13
chr6	74228062	.	A	C	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=166,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,10:0.282:37:16,5:11,5:13,14,5,5
chr6	74320306	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr6	74325164	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=143,142;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.235:32:11,0:13,7:8,17,0,7
chr6	74325257	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=22,26;MFRL=224,201;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.594:5:1,2:0,1:0,2,0,3
chr6	74345288	.	A	AGAACG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=260,182;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0,4,0,1
chr6	74348328	.	C	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	74354402	.	TT	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:74354402_TT_CC:74354402:0,2,0,1
chr6	74354414	.	TG	CC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=144,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,1:0|1:74354402_TT_CC:74354402:0,2,0,1
chr6	74432923	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=128,117;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.523:19:3,9:6,1:3,6,6,4
chr6	74472123	.	C	CTCAGAAGCTAGAGCAGCCTA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=112,52;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:4,2:11,0:10,5,1,1
chr6	74490863	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,258;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	74491138	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	74493615	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=225,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:1,1:2,2:0,3,0,3
chr6	74495257	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=210,91;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	74498432	.	TAAG	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAG;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	74518044	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=31,31;MFRL=80,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.390:3:1,0:1,1:0|1:74518044_C_T:74518044:0,2,0,1
chr6	74518050	.	T	TGGAA	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=29,33;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:0,1:0|1:74518044_C_T:74518044:0,3,0,1
chr6	74518054	.	A	AAAAAGTATGTTT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=24,27;MFRL=96,205;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:74518044_C_T:74518044:0,2,0,1
chr6	74519713	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=140,36;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:6,2:10,0:10,6,1,1
chr6	74528293	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=23,34;MFRL=172,105;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,0:0,3:0,2,0,3
chr6	75795122	.	G	GCACA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=CA;STR;TLOD=13.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.497:8:1,2:3,1:0,4,0,4
chr6	75796364	.	GTATA	G,GTA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=17,23,13;MFRL=141,191,121;MMQ=60,60,60;MPOS=31,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=TA;STR;TLOD=5.58,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.337,0.330:6:1,1,0:0,0,0:0,2,0,4
chr6	75811880	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=167,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:3,1:2,6:0,5,0,7
chr6	75827354	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	75830974	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=108,93;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,4:1,3:3,0,6,1
chr6	75833876	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=180,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:1,7:4,3:1,4,6,4
chr6	75843812	.	A	ATTCCTTTTCCTCCACACCCTT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75843812_A_ATTCCTTTTCCTCCACACCCTT:75843812:0,1,0,1
chr6	75843813	.	G	GCCA	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=164,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:75843812_A_ATTCCTTTTCCTCCACACCCTT:75843812:0,1,0,1
chr6	75848376	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=207,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,2,1
chr6	75860778	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,132;MMQ=60,54;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:75860778_T_G:75860778:0,0,1,0
chr6	75860784	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=35,17;MFRL=280,132;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,0:0|1:75860778_T_G:75860778:1,0,1,0
chr6	75890933	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=225,212;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.683:11:2,3:1,4:0,3,2,6
chr6	75893457	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=33.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,8,4
chr6	75904455	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	75947715	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=129,78;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.451:9:3,0:2,4:1,4,1,3
chr6	75968720	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,2,4
chr6	76018526	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=187,139;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:8,2:12,0:12,8,2,0
chr6	76063262	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=178,88;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,0:8,3:12,5,2,1
chr6	76063412	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=177,137;MMQ=60,50;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.286:12:4,1:5,2:0|1:76063412_G_T:76063412:2,7,0,3
chr6	76063419	.	C	CTGTGACTTGCCTTACTACAAAAAAAAAAAAAAAGCCT	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=189,137;MMQ=60,50;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,3:0.266:13:5,1:5,2:0|1:76063412_G_T:76063412:2,8,0,3
chr6	76357426	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=180,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:6,3:0,1:4,2,3,1
chr6	76373274	.	C	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	76385511	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=196,158;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=27.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,1:2,7:3,0,8,1
chr6	76386712	.	GT	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=159,196;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	76405700	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=156,206;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:6,1:0,9,0,2
chr6	76425230	.	AG	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=181,35871956;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:12,2:5,0:7,10,0,2
chr6	76538403	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=202,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:0,4,0,3
chr6	76550237	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=159,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:1,1:4,4:5,0,5,0
chr6	76554593	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,3,5
chr6	76595634	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=186,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	76596728	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=150,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,2:1,0:1,4,0,2
chr6	76600885	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=20,25;MFRL=125,158;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.253:14:7,1:2,2:8,3,2,1
chr6	76607983	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=200,132;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:3,0,4,0
chr6	76618182	.	AT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=129,193;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.509:8:3,1:1,3:4,0,2,2
chr6	76656978	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=37.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,10,1
chr6	76715138	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=167,73;MMQ=60,48;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:9,4:4,0:5,8,3,1
chr6	76720990	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=187,171;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,3:1,2:3,2,1,4
chr6	76728583	.	TA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=143,190;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.648:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	76735065	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,6:0,0:0,0,0,6
chr6	76743998	.	GCA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=168,94;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=CA;STR;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,0:8,2:8,2,1,1
chr6	76744298	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,1:1,3:3,0,4,0
chr6	76782049	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	78171941	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,6,2
chr6	78172992	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=166,172;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,9:0.400:23:6,4:8,5:9,5,3,6
chr6	79577412	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=173,199;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.385:24:10,4:5,5:9,6,4,5
chr6	79577644	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=231,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=45.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,15:0.696:21:4,8:2,7:2,4,2,13
chr6	79595167	.	A	ACTTAT	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=194,155;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=95.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,23:0.828:27:1,12:3,9:1,3,9,14
chr6	79657391	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=129,155;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:2,4:4,7:4,2,7,4
chr6	79664748	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=271,224;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=12.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:0,3,1,3
chr6	79668306	.	G	C	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,129;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,9:0.256:37:18,0:10,9:10,18,0,9
chr6	79672788	.	C	CT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=140,60;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.167:22:9,2:10,0:11,8,3,0
chr6	79695003	.	T	TA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=164,188;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.389:11:3,2:3,1:7,0,4,0
chr6	79695029	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=234,137;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.355:18:4,4:5,2:12,0,5,1
chr6	79713483	.	T	A	.	.	DP=56;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=116,127;MMQ=60,39;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:49,3:0.073:52:13,3:35,0:25,24,3,0
chr6	79752792	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=132,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=19.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:1,2:3,4:0,4,0,6
chr6	79787655	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=162,257;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.346:23:4,4:11,2:9,6,6,2
chr6	79911290	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=171,64;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	79911459	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=148,85;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:1,5,0,2
chr6	79913379	.	GAA	G,GA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,19,27;MFRL=0,158,153;MMQ=60,60,60;MPOS=20,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=3.37,14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,3,8:0.275,0.656:11:0,0,3:0,1,3:0,0,4,7
chr6	79944355	.	T	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=146,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.685:17:3,7:2,5:2,3,1,11
chr6	80198800	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=198,171;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:10,0:10,3:11,10,1,2
chr6	80228535	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=128,134;MMQ=60,60;MPOS=2;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:9,1:9,1:0|1:80228535_T_G:80228535:9,10,1,1
chr6	80228541	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=20,35;MFRL=125,145;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=45.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,14:0.558:25:6,6:5,8:0|1:80228535_T_G:80228535:5,6,6,8
chr6	80228662	.	AGAGGAGACTATGAC	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=250,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:1,0:0,2,0,1
chr6	80341320	.	CG	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=230,232;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.618:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	80631539	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,4:0,5:0,0,1,8
chr6	80724156	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=147,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,1:7,1:12,5,1,1
chr6	80724312	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=143,211;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.224:11:9,1:0,1:4,5,0,2
chr6	80732138	.	A	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=142,125;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,6:0.281:22:12,5:4,1:7,9,1,5
chr6	80744626	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=177,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,0:3,3:5,1,0,3
chr6	80747582	.	TATAATA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=118,177;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=ATA;STR;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:4,0,2,0
chr6	80749841	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=206,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,1:2,1:8,0,2,0
chr6	80750093	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=235,233;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,1:2,1:1,9,0,2
chr6	80837242	.	A	ATT	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=148,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=10,12;RU=T;STR;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.211:14:5,1:6,1:8,3,3,0
chr6	80912746	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=156,238;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,2:2,1:6,0,3,0
chr6	82883238	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=246,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	82910474	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=150,149;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82910474_T_G:82910474:0,1,0,1
chr6	82910480	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:82910474_T_G:82910474:0,0,0,1
chr6	82910486	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:82910474_T_G:82910474:0,1,0,1
chr6	82910492	.	T	G	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,30;MFRL=165,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:82910474_T_G:82910474:0,1,0,1
chr6	82912153	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=189,213;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr6	82921339	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=258,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=30.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,11:0.600:18:3,4:4,7:4,3,6,5
chr6	82922388	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=251,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=25.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:1,4:2,5:2,1,8,1
chr6	82924645	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	82930437	.	G	GA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,18;MFRL=181,167;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.491:10:1,1:3,0:1,4,1,4
chr6	82941656	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	83075316	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=228,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:4,2:7,0:8,3,1,1
chr6	83077073	.	TATAAAG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=154,262;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ATAAAG;STR;TLOD=7.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:15,0:3,3:5,13,3,0
chr6	83080337	.	TTTTATTGTTGTTGC	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=139,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.135:20:8,2:9,0:6,12,0,2
chr6	83080386	.	C	CTTTG	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.916:8:0,5:0,3:0,0,2,6
chr6	83080639	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	83666936	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0|1:83666936_T_C:83666936:0,0,5,1
chr6	83666943	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.857:5:0,2:0,2:0|1:83666936_T_C:83666936:0,0,3,2
chr6	83733785	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=167,124;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:0,5:3,4:1,2,4,5
chr6	83754094	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,297;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	83822985	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=186,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=25.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:2,4:0,4:2,0,6,2
chr6	83828724	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=152,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,8:2,4:2,1,3,9
chr6	83831730	.	C	T	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=155,114;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=29.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,12:0.406:30:8,5:10,7:10,8,7,5
chr6	83831733	.	A	C	.	.	DP=32;ECNT=3;MBQ=27,20;MFRL=148,34;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,2:0.088:32:13,0:15,2:0|1:83831733_A_C:83831733:17,13,1,1
chr6	83831738	.	C	CTGCACTCCAG	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=32,20;MFRL=143,34;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:12,0:15,2:0|1:83831733_A_C:83831733:17,12,1,1
chr6	83834957	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=201,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:13,2:3,0:6,10,0,2
chr6	83842101	.	CA	GT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.294:8:1,2:3,0:0|1:83842101_CA_GT:83842101:0,6,0,2
chr6	83842104	.	A	AAGG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=27,23;MFRL=156,104;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.298:8:2,2:4,0:0|1:83842101_CA_GT:83842101:0,6,0,2
chr6	83856897	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=155,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:7,1:2,1:8,1,1,1
chr6	83861930	.	TACAC	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=242,209;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=AC;STR;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,0:2,2:3,4,1,1
chr6	83872513	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=141,104;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:8,3:9,0:10,8,2,1
chr6	83878974	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=123,73;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.166:22:8,3:10,0:12,7,2,1
chr6	83898300	.	GT	G,GTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33,32;MFRL=211,240,180;MMQ=60,60,60;MPOS=20,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=T;STR;TLOD=3.50,4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,3:0.231,0.300:10:2,2,1:3,0,2:5,0,5,0
chr6	83933732	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83933732_AC_A:83933732:0,1,0,1
chr6	83933734	.	AG	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=29,26;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83933732_AC_A:83933732:0,1,0,1
chr6	83933742	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=187,109;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:83933732_AC_A:83933732:0,1,0,1
chr6	83938539	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=170,91;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=8.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:7,4:8,0:6,9,3,1
chr6	84061888	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,15;MFRL=186,170;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:4,0:1,7,2,0
chr6	84108065	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=220,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,2:1,1:3,1,2,1
chr6	84117639	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=33,27;MFRL=169,83;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,0:7,3:3,9,0,3
chr6	84117676	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,18;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,0:0|1:84117676_A_C:84117676:0,4,0,1
chr6	84117678	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,32;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:84117676_A_C:84117676:0,4,0,1
chr6	84117680	.	G	GACCATGTTAGGCACTGGGGCCC	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,32;MFRL=204,175;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:84117676_A_C:84117676:0,4,0,1
chr6	84233831	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,21:0.847:24:1,11:2,10:0,3,7,14
chr6	84266038	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=160,128;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:84266038_G_T:84266038:0,2,0,1
chr6	84266044	.	G	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:84266038_G_T:84266038:0,0,0,1
chr6	84284664	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,1:0,0,4,1
chr6	84284880	.	T	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=129,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.518:4:0,2:1,0:1,1,0,2
chr6	84290106	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=164,148;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:5,2:2,0:7,0,2,0
chr6	84290137	.	TAAAGA	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=148,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.453:11:4,5:2,0:6,0,3,2
chr6	84290235	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=141,147;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.120:31:18,3:9,0:0|1:84290235_G_A:84290235:13,15,0,3
chr6	84290259	.	G	A	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=150,147;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:28,3:0.121:31:20,3:6,0:0|1:84290235_G_A:84290235:12,16,0,3
chr6	84292139	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=132,208;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,2:0,3:1,0,0,5
chr6	84317533	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=175,156;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=45.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,16:0.740:21:3,8:2,8:1,4,12,4
chr6	84320455	.	TATATATATATAA	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=30,28;MFRL=191,0;MMQ=40,47;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,2:5,1:0,9,0,3
chr6	84320465	.	TAA	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=28,29;MFRL=187,174;MMQ=43,38;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr6	84320466	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=192,184;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.669:9:1,4:2,2:0|1:84320466_A_AT:84320466:0,3,0,6
chr6	84320467	.	A	AT	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=25,25;MFRL=192,184;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.669:9:1,4:2,2:0|1:84320466_A_AT:84320466:0,3,0,6
chr6	84366385	.	C	CAAG	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAG;STR;TLOD=25.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,5:0,1:1,0,6,0
chr6	84375377	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	84649734	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=128,131;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.322:10:4,2:2,1:4,3,3,0
chr6	84650214	.	GT	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=161,118;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.268:13:5,2:5,1:7,3,3,0
chr6	84764982	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=213,185;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,3:0,2:4,0,5,0
chr6	84799300	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=184,227;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr6	84872881	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=139,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.208:27:9,5:12,0:12,10,5,0
chr6	84872993	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=136,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.282:12:4,3:5,0:2,7,1,2
chr6	84894942	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=173,95;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:9,1:4,5:9,4,4,2
chr6	84896363	.	AG	CT	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84896363_AG_CT:84896363:0,0,0,1
chr6	84896368	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0|1:84896363_AG_CT:84896363:0,0,0,1
chr6	86180926	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	86199329	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=167,170;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,13:0.737:17:1,9:3,4:1,3,1,12
chr6	86201861	.	G	GTCTGA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=142,64;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:7,2:3,0:2,8,1,1
chr6	86224053	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=272,184;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=19.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:1,1,2,5
chr6	86246709	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=217,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	86246716	.	T	TA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=209,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	86248460	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,2:1,5:3,0,5,2
chr6	86277323	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=197,123;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,4:5,2:1,8,2,4
chr6	86303434	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,172;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:7,0:11,7:5,13,0,7
chr6	86324565	.	G	A	.	.	DP=40;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=159,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:38,2:0.071:40:23,2:14,0:0|1:86324565_G_A:86324565:22,16,1,1
chr6	86324569	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=151,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:40,2:0.068:42:23,2:15,0:0|1:86324565_G_A:86324565:23,17,1,1
chr6	86324839	.	C	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=208,94;MMQ=60,43;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.171:21:12,1:6,1:4,14,3,0
chr6	86346716	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,93;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,12:0.321:38:13,11:12,0:10,16,12,0
chr6	86346959	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=172,323;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=38.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,14:0.469:30:8,0:8,14:11,5,0,14
chr6	87726196	.	T	A	.	.	DP=46;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=130,155;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,5:0.137:42:21,5:12,0:20,17,5,0
chr6	87726330	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=192,78;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:2,1:5,1:0,7,0,2
chr6	87726448	.	GTT	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,284;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=3.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	87796161	.	G	GA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,35;MFRL=226,98;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.354:12:5,0:3,4:4,4,1,3
chr6	87796233	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr6	87797953	.	AAAC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=151,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr6	87928229	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=215,220;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr6	87967304	.	T	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=181,192;MMQ=60,59;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,0:10,4:11,7,4,0
chr6	87967636	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=174,65;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.197:18:4,0:11,3:6,9,2,1
chr6	88046800	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=134,182;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:9,3:10,2:10,10,3,2
chr6	88049879	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=207,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:7,0:7,2:10,4,0,2
chr6	88075122	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,112;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,1:3,5:0,7,2,4
chr6	88108048	.	AGAT	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=93,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=40.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,12:0.498:24:6,6:6,5:8,4,9,3
chr6	88108050	.	ATG	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:88108050_ATG_A:88108050:8,5,1,1
chr6	88108053	.	AG	A	.	.	DP=25;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=140,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,2:0.111:25:11,2:11,0:0|1:88108050_ATG_A:88108050:16,7,1,1
chr6	88108060	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=138,65;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:11,2:11,0:0|1:88108050_ATG_A:88108050:15,7,1,1
chr6	88108183	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=134,129;MMQ=60,47;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:0,5,0,2
chr6	88109233	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=207,171;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:3,3,2,0
chr6	88119528	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=149,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.411:17:2,2:8,5:10,0,5,2
chr6	88119693	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=153,104;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,1:3,3:1,9,1,3
chr6	88125542	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=191,40;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:4,2:7,2:5,6,0,4
chr6	88126423	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=190,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:6,2:5,2:8,3,2,2
chr6	88140811	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=106,151;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.294:15:5,3:6,1:6,5,2,2
chr6	88170710	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=147,151;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,1:3,1:4,3,1,1
chr6	88210467	.	AT	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=237,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.437:5:2,1:1,0:0,3,0,2
chr6	88224163	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=133,165;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:13,3:12,0:14,11,0,3
chr6	88226641	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=144,220;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:2,2,0,4
chr6	88226648	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=28,35;MFRL=148,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:88226648_T_C:88226648:0,4,0,1
chr6	88226652	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=25,33;MFRL=136,161;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:88226648_T_C:88226648:0,3,0,1
chr6	88231226	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=136,104;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.287:19:8,2:5,3:7,7,2,3
chr6	88231285	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=153,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:1,7,1,3
chr6	88255274	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:4,1,2,0
chr6	88255438	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=153,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:2,3,2,2
chr6	88273971	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=155,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:1,4,0,2
chr6	88299885	.	C	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=200,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,12:0.382:32:10,6:10,6:9,11,3,9
chr6	88300013	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=178,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:1,4,0,6
chr6	88303967	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=168,243;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr6	88311404	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=173,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.415:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr6	88311457	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,31;MFRL=146,242;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:7,2:1,2:4,4,2,2
chr6	88317292	.	CA	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=5.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.775:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	88317628	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=174,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:6,1:1,1:0,7,0,2
chr6	88331299	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=209,178;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,2:0,3,0,4
chr6	88346207	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=168,36;MMQ=60,45;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,2:7,0:3,14,1,1
chr6	88366602	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=172,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:11,3:3,2:8,6,3,2
chr6	88366771	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=249,209;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr6	88376676	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=262,133;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.455:9:1,1:3,1:0|1:88376676_AT_A:88376676:3,2,2,2
chr6	88376682	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=253,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.416:10:3,3:2,1:0|1:88376676_AT_A:88376676:4,2,2,2
chr6	88385266	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=169,120;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,4:10,0:13,5,4,0
chr6	88411244	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=170,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:5,1,3,1
chr6	88773961	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=254,165;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,3:3,1:2,4,1,3
chr6	89323961	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=124,84;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.339:7:2,0:2,2:4,1,2,0
chr6	89511228	.	TAC	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=151,175;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=8.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:5,0,3,0
chr6	89511254	.	AAC	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=136,140;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AC;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:6,1:4,1:7,7,3,0
chr6	89563434	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=166,8300;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:11,0:14,3:12,13,3,0
chr6	89601638	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=186,127;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.434:9:2,1:3,3:0,5,1,3
chr6	89614670	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=165,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.208:17:4,3:10,0:2,12,1,2
chr6	89638988	.	TA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=10,25;MFRL=123,181;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.568:9:0,1:1,3:1,3,2,3
chr6	89790559	.	CTTCA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTCA;STR;TLOD=46.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,8:0,3:0,0,11,0
chr6	89814766	.	CC	TT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=35,25;MFRL=175,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:3,0:0,1:3,0,1,0
chr6	89814772	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,4:0,0:0,0,4,0
chr6	89814830	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=132,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=56.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,17:0.900:18:0,11:1,5:1,0,10,7
chr6	89827716	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=233,269;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	89862725	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=163,153;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:2,0:5,3:4,3,3,0
chr6	89864679	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:3,1:0,3,0,3
chr6	89871759	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=245,191;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,0:3,5:4,3,4,1
chr6	89888443	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=166,328;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr6	89891582	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=118,24821191;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,2:3,0:4,2,2,0
chr6	89894968	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=156,294;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr6	89895202	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=146,238;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:2,2:2,1:0|1:89895202_G_A:89895202:0,5,1,3
chr6	89895207	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=146,238;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.454:9:1,3:3,1:0|1:89895202_G_A:89895202:0,5,1,3
chr6	89913108	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=244,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=46.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,11:0.801:13:0,6:2,5:0|1:89913108_C_G:89913108:0,2,9,2
chr6	89913112	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=36,29;MFRL=244,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,12:0.812:14:0,6:2,6:0|1:89913108_C_G:89913108:0,2,9,3
chr6	89913286	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=219,160;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.724:5:0,3:1,1:0,1,0,4
chr6	89967498	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=162,208;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:10,2:8,3:7,11,0,5
chr6	89974063	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=58.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,6:0,9:0,0,13,2
chr6	89974066	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,25;MFRL=173,152;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,2:7,3:8,2,5,0
chr6	89974115	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=156,132;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:3,5:10,3:5,8,3,5
chr6	89977322	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr6	89977906	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,91;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	90009581	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,69;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:3,12,0,2
chr6	90090068	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=143,85;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.200:23:12,4:7,0:12,7,3,1
chr6	90321955	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=190,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:3,1:8,8:6,5,8,1
chr6	90326360	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=190,173;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:4,3:8,2:4,8,3,2
chr6	90326471	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=320,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	90361811	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.855:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr6	90365504	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=174,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,3:0.142:26:8,2:15,1:11,12,3,0
chr6	90366329	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=158,199;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=7.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.493:10:3,2:2,3:5,0,5,0
chr6	90371202	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=41.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,7:0,7:0,0,7,7
chr6	90371704	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.908:8:0,5:0,2:0,0,7,1
chr6	90371986	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=39.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr6	90381849	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	90385754	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	90387233	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	90398197	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr6	90398315	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=173,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,1:8,1:12,4,1,1
chr6	90400292	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,5,1
chr6	90405306	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,8:0,3:0,0,10,2
chr6	90405993	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr6	90411867	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=244,181;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:90411867_A_C:90411867:0,2,0,1
chr6	90411875	.	CT	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=262,181;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:90411867_A_C:90411867:0,3,0,1
chr6	90415764	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=52.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,4:0,0,9,6
chr6	90418262	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.958:22:0,9:0,12:0,0,8,14
chr6	90426270	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	90428968	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=33.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,2,9
chr6	90432584	.	A	T,AAT	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=19,23,33;MFRL=201,188,194;MMQ=41,60,60;MPOS=6,26;POPAF=7.30,7.30;TLOD=4.05,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,1:0.336,0.260:5:1,0,1:0,2,0:2,0,3,0
chr6	90432589	.	C	G,A	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=31,16,17;MFRL=154,208,180;MMQ=60,51,40;MPOS=24,28;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.14,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,1:0.333,0.222:6:1,0,0:2,0,0:3,0,3,0
chr6	90432598	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=28,15;MFRL=167,208;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:2,0:4,0,2,0
chr6	90432645	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=5;MBQ=32,32;MFRL=155,217;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=51.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,17:0.546:31:7,17:7,0:8,6,17,0
chr6	90432662	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=55.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,8:0,9:0,0,7,10
chr6	90433206	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=168,169;MMQ=60,59;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:9,1,2,0
chr6	90437699	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,1,10
chr6	90437718	.	A	AGTAGTTTTTTCC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=243,99;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.326:4:1,1:2,0:0,3,0,1
chr6	90438631	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:2,1:4,1:3,3,2,0
chr6	90438933	.	T	TCGTAAAGAAAACATATTAG	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	90450135	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=7.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	90453248	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,9,4
chr6	90453492	.	AC	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	90455429	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr6	90463149	.	GA	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.807:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr6	90467905	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=245,185;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:7,1,2,0
chr6	90468465	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=26.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,8,0
chr6	90468775	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	90503766	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=178,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=8.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.561:12:1,3:2,2:2,3,5,2
chr6	90504016	.	A	AAGTAAAAGGAAAAAGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.671:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	90556397	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=114,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.288:11:4,1:2,2:3,5,0,3
chr6	90605836	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=23.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,0,8
chr6	91254396	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=187,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:0,4,2,3
chr6	91266350	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.490:14:2,3:5,4:1,6,2,5
chr6	91296420	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,162;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=35.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.800:13:2,5:0,5:2,0,10,1
chr6	93956676	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=146,104;MMQ=60,59;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:7,2:9,1:10,6,3,0
chr6	93956769	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=161,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,3:0,4:0,1,0,7
chr6	93964319	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=141,199;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.670:7:2,1:0,4:2,0,4,1
chr6	93969126	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=30,32;MFRL=127,79;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:8,0:1,2:0|1:93969126_A_T:93969126:6,3,0,2
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chr6	93969141	.	T	TGCGAGACTAATGC	.	.	DP=11;ECNT=5;MBQ=28,32;MFRL=149,79;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.231:11:7,0:2,2:0|1:93969126_A_T:93969126:5,4,0,2
chr6	93973658	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,227;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:4,2:4,1:1,7,0,3
chr6	94120192	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=202,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,4,0
chr6	94120219	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=155,148;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:5,3:2,0:5,2,3,0
chr6	94120639	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=192,55;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.202:16:7,0:6,2:7,6,2,1
chr6	94124530	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=184,178;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.722:5:1,3:0,1:0,1,2,2
chr6	96655096	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=221,207;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.580:17:2,5:5,5:7,0,6,4
chr6	96655105	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,27;MFRL=256,209;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=50.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.892:16:1,7:0,8:1,0,14,1
chr6	96655106	.	TAC	T	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=221,186;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=AC;STR;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.275:15:6,1:5,3:11,0,4,0
chr6	96656088	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=21.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,3,4
chr6	96656129	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,160;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,8,3
chr6	96656148	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,30;MFRL=160,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=29.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.872:13:1,5:0,7:0,1,11,1
chr6	96656767	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=71.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,11:0,6:0,0,13,8
chr6	96656775	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=30,29;MFRL=179,199;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=41.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,17:0.858:19:1,9:1,8:2,0,10,7
chr6	96656811	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=163,231;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:10,0:3,4:7,6,2,2
chr6	96658152	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=75.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,16,4
chr6	96658260	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.962:20:0,12:0,8:0|1:96658260_C_G:96658260:0,0,6,14
chr6	96658262	.	C	A	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=0,28;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=87.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,20:0.955:20:0,11:0,8:0|1:96658260_C_G:96658260:0,0,6,14
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chr6	96969840	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:9,7:8,2:7,10,4,5
chr6	96971185	.	G	GTT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,36;MFRL=164,3362468;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,13;RU=T;STR;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.162:16:7,1:5,1:6,8,1,1
chr6	96986741	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=180,322;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:6,2:4,0:1,9,0,2
chr6	96996228	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=184,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0|1:96996228_A_T:96996228:0,2,0,2
chr6	96996244	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=23,33;MFRL=205,234;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0|1:96996228_A_T:96996228:0,3,0,2
chr6	96999220	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=175,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,2:3,0:8,0,2,0
chr6	97000341	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=194,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:0,2:3,0:4,0,2,0
chr6	97338913	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=190,226;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr6	97339275	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,21;MFRL=215,190;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.551:7:0,1:3,1:0,3,2,2
chr6	97575196	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=118,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:3,0,3,0
chr6	97575295	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=170,159;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:6,0:8,5:9,5,1,4
chr6	97575423	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=179,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr6	97578888	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=165,204;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:0,1:4,1:0,4,0,2
chr6	97679540	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	97694582	.	A	ATAG	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAG;STR;TLOD=69.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,9:0,7:0,0,4,12
chr6	97711369	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=252,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:97711369_A_G:97711369:0,2,0,1
chr6	97711379	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=33,21;MFRL=252,127;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:97711369_A_G:97711369:0,2,0,1
chr6	98472564	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=167,234;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr6	99283376	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=22,35;MFRL=225,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.601:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr6	99284219	.	AC	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=196,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,2:6,2:11,4,1,3
chr6	99284446	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=181,93;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=A;STR;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:3,1:2,1:4,1,2,1
chr6	99284712	.	G	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=219,191;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,4:0.146:32:8,0:20,4:21,7,0,4
chr6	99285558	.	GA	G,GAA	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,33,33;MFRL=165,150,194;MMQ=60,60,60;MPOS=17,20;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,10,12;RU=A;STR;TLOD=7.98,4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,8,3:0.324,0.181:20:3,2,0:6,5,3:1,8,4,7
chr6	99322354	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=192,155;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:0,5,0,3
chr6	99323424	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=212,167;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=24.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:7,5:0,4:3,4,1,8
chr6	99347251	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=152,273;MMQ=60,59;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:8,4:6,0:5,9,4,0
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chr6	99825227	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=301,173;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=32.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.841:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr6	99831542	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=187,251;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:7,1,2,0
chr6	99849180	.	GAGA	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=160,239;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AGA;STR;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:6,2:14,3:8,13,2,3
chr6	99853849	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.842:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	99853866	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=22.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,3:0,4:0,0,5,2
chr6	99891616	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=196,260;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,2:1,1:1,4,0,3
chr6	99894360	.	CAAAGA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=152,272;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAAGA;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr6	99935975	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,4,0
chr6	99951679	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=148,229;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:4,0:8,2:5,7,1,1
chr6	99951750	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	99955243	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=204,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,4:2,2:2,1,7,0
chr6	99991578	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=288,172;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:0,4:3,0:0,3,0,4
chr6	99993188	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=235,245;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	99999019	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=258,186;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:0,4,0,6
chr6	100006244	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=22.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	100009630	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,226;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,2:7,0:2,10,1,1
chr6	100016240	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=44.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr6	100016340	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=179,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=39.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,14:0.484:29:7,6:8,8:6,9,9,5
chr6	100368759	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	100895344	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,7:0,1:0,0,0,8
chr6	100896567	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=31,11;MFRL=216,96;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,0:0,0:0,2,0,1
chr6	100896574	.	A	AGGGTTGCGGGGCTTTTAGC	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,26;MFRL=216,96;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr6	100911072	.	ATATGT	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=325,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,4:1,2:2,0,5,1
chr6	100988266	.	GA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=17,18;MFRL=213,138;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.307:8:2,0:0,0:1,5,0,2
chr6	101037718	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,269;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:7,1:2,1:7,2,1,1
chr6	101054999	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=194,197;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:6,7:4,1:2,8,0,8
chr6	101100783	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=222,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0|1:101100783_T_C:101100783:3,3,0,2
chr6	101100784	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=212,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:5,3:0.400:8:4,2:1,1:1|0:101100783_T_C:101100783:2,3,1,2
chr6	101110329	.	GTCCTGCCGAAGCAT	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=181,90;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.107:26:7,2:12,0:11,13,1,1
chr6	101163433	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=123,138;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.420:17:4,5:6,2:5,5,1,6
chr6	101214942	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=29,36;MFRL=119,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:101214942_A_G:101214942:1,0,1,0
chr6	101214952	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,22;MFRL=126,136;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:101214942_A_G:101214942:2,0,1,0
chr6	101215223	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=21.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,4:0,4:0,0,1,7
chr6	101215244	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=162,142;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr6	101248474	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,36;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0|1:101248474_T_C:101248474:0,0,0,2
chr6	101248480	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0|1:101248474_T_C:101248474:0,0,0,2
chr6	101253788	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=184,254;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=7.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr6	101312097	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr6	102124470	.	CT	C,CTT	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,32,35;MFRL=104,133,174;MMQ=60,60,60;MPOS=17,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=8.13,6.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,5,4:0.286,0.238:18:3,3,2:4,2,1:5,4,7,2
chr6	102247565	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.182:31:14,5:12,0:19,7,5,0
chr6	102307069	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=283,174;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,1:2,2:1,1,3,0
chr6	102337505	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,17;MFRL=182,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.374:6:3,0:1,0:0|1:102337505_C_G:102337505:3,1,2,0
chr6	102337509	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=173,202;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,0:1,0:0|1:102337505_C_G:102337505:4,1,2,0
chr6	102376517	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=198,169;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:2,4,0,2
chr6	102503317	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=170,254;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:5,1:7,1:7,5,0,2
chr6	102513865	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=216,192;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	102516276	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=234,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:4,4,2,0
chr6	105233244	.	T	TA	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=138,217;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,1:0,1,0,2
chr6	105300074	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0|1:105300074_C_G:105300074:0,0,3,0
chr6	105300105	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,26;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=28.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,6:0|1:105300074_C_G:105300074:0,0,5,3
chr6	105300262	.	C	CAG	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=36,30;MFRL=207,104;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=42.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.875:14:0,0:1,13:0,1,6,7
chr6	105405211	.	C	CT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=35,33;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:105405211_C_CT:105405211:0,4,0,1
chr6	105405214	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,30;MFRL=182,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:105405211_C_CT:105405211:0,4,0,1
chr6	105405220	.	T	TC	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=C;STR;TLOD=8.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.818:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	105577172	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=48.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,13,0
chr6	105577224	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=50.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.944:15:0,8:0,7:0,0,9,6
chr6	105577401	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=45.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,7:0,7:0,0,2,12
chr6	105595261	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,3:0,9:0,0,4,8
chr6	105609771	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=137,125;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:5,0:2,3:3,4,0,3
chr6	105729844	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,176;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,1:1,1:1,3,0,2
chr6	105845901	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=206,107;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:105845901_A_C:105845901:0,3,0,1
chr6	105845904	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=206,107;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:105845901_A_C:105845901:0,3,0,1
chr6	105845906	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=34,25;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr6	106534484	.	AT	A,ATT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=25,25,25;MFRL=171,175,167;MMQ=60,60,60;MPOS=21,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=T;STR;TLOD=3.29,5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:23,3,5:0.110,0.175:31:13,3,3:10,0,2:5,18,0,8
chr6	106553225	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=184,163;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.283:17:7,0:2,2:4,8,5,0
chr6	106554281	.	C	T	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=141,268;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:39,5:0.130:44:22,0:16,5:16,23,0,5
chr6	106975415	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=179,171;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.224:19:7,2:8,1:2,13,1,3
chr6	106989212	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,204;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,3:1,3:0,1,3,3
chr6	106992592	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=59.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.950:18:0,6:0,12:0,0,6,12
chr6	106992844	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=26.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	106999658	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	107001456	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,5,8
chr6	107003810	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=56.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.949:17:0,4:0,13:0,0,1,16
chr6	107006347	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=37.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,9:0,2:0,0,8,3
chr6	107009119	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,6,0
chr6	107050867	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr6	107067163	.	AG	CA	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=136,66;MMQ=60,54;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:14,0:11,2:12,13,0,2
chr6	107069232	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr6	107069273	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=145,207;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:4,2:9,0:11,2,2,0
chr6	107077474	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,10:0.365:28:8,10:10,0:13,5,10,0
chr6	107096853	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,240;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,1:2,3:7,0,3,1
chr6	107100107	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,120;MMQ=60,31;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,7:0.307:24:6,6:11,0:12,5,7,0
chr6	107113618	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=150,242;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:7,1:2,2:8,1,3,0
chr6	107351195	.	G	GT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=167,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.452:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr6	107351457	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	107361476	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,6:0,0,1,10
chr6	107365376	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,5,0
chr6	107365411	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr6	107372242	.	GTTTTC	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=52.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,5:0,0,7,5
chr6	107595430	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=113,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:8,2:9,0:8,9,2,0
chr6	107956095	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	107956569	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=167,139;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.125:22:11,2:8,0:9,11,2,0
chr6	108026317	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr6	108041801	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=247,370;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	108042213	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=51.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,8:0,5:0,0,3,10
chr6	108042216	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=35,27;MFRL=276,142;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,5:1,4:1,3,2,7
chr6	108042282	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=216,275;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108042282_C_T:108042282:0,1,0,1
chr6	108042297	.	C	CCATCAATTCT	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=216,275;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:108042282_C_T:108042282:0,1,0,1
chr6	108066144	.	A	G	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=169,217;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.124:30:6,0:21,3:15,12,3,0
chr6	108076672	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=224,279;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,3,0
chr6	108076870	.	T	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=10,10;MFRL=99,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.321:8:1,0:0,0:1,5,0,2
chr6	108093328	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=57.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,14,3
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chr6	108840870	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=179,194;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:6,1:5,4:10,1,4,1
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chr6	108985581	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=157,200;MMQ=27,27;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:6,1:6,1:0|1:108985576_G_A:108985576:6,6,1,1
chr6	109175372	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	109190267	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	109233816	.	AA	TC	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=179,147;MMQ=60,48;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:7,0:1,5:0,9,0,5
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chr6	109319967	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=153,149;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.362:14:4,5:5,0:1,8,0,5
chr6	109466396	.	C	CTATAT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=163,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAT;STR;TLOD=19.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,2:3,3:3,1,2,3
chr6	109480681	.	CT	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=142,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.395:13:1,1:7,3:3,5,0,5
chr6	109673933	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=170,289;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:5,1:7,1:9,3,1,1
chr6	109689431	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=201,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=25.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:3,3:3,5:5,1,5,3
chr6	109703391	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,146;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:0,3:2,1:2,0,4,0
chr6	109721228	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=176,190;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=23.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:2,2:1,5:2,1,5,2
chr6	109752563	.	G	GAA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=20,18;MFRL=223,320;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.293:8:1,0:2,0:1,5,0,2
chr6	109752565	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=227,228;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.647:6:1,1:0,2:1,1,0,4
chr6	109763947	.	TC	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=148,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=C;STR;TLOD=8.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,1:6,3:8,5,4,0
chr6	109764535	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=148,186;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,3:4,2:1,5,2,3
chr6	109765160	.	C	CTCCTGGTAACTCTGTGG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=184,248;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.492:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	109766701	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=152,269;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:8,3:10,1:9,9,1,3
chr6	109767631	.	T	TGTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.920:10:0,5:0,4:0,0,1,9
chr6	109768713	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=232,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.421:10:4,2:1,2:3,3,0,4
chr6	109769216	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,36;MFRL=176,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	109769336	.	TCACACACA	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,167;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=13,9;RU=CA;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	109770808	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,2,1
chr6	109775436	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,206;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:1,2,0,4
chr6	109786980	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=189,224;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,1:3,0,4,0
chr6	109797304	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	109814558	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=150,179;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.353:18:6,3:5,3:5,7,5,1
chr6	109830298	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	109835646	.	AC	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,22;MFRL=160,130;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.260:17:10,3:3,1:3,10,1,3
chr6	109837859	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=212,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=9.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:5,1:0,2:1,4,1,2
chr6	109837879	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,3:0,2:0,0,1,4
chr6	109850199	.	AAC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=196,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:1,3:0,3:1,0,1,5
chr6	109863238	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=156,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.653:9:0,1:2,5:3,0,4,2
chr6	109867161	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=171,225;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:11,0:10,3:7,14,0,3
chr6	109906329	.	GCTT	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=36,35;MFRL=125,188;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=CTT;STR;TLOD=6.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:7,1:0,1:7,0,1,1
chr6	109906347	.	T	A	.	.	DP=63;ECNT=2;MBQ=23,25;MFRL=215,215;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=44.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,21:0.349:61:12,21:28,0:35,5,21,0
chr6	109906506	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr6	109954252	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=175,135;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=31.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,11:0.801:13:2,7:0,4:0,2,4,7
chr6	109954585	.	C	CTATATGGTCCTTG	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.493:2:0,1:1,0:0,1,0,1
chr6	109962904	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0|1:109962904_A_C:109962904:0,0,1,3
chr6	109962915	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,123;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,0:0,1:0|1:109962904_A_C:109962904:0,0,1,1
chr6	110048489	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=232,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=T;STR;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.489:10:3,1:2,3:1,4,2,3
chr6	110053721	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr6	110053824	.	G	GT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=168,89;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=T;STR;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,2:1,1:2,1,3,1
chr6	110059510	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=132,238;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:6,1:3,2:3,6,3,0
chr6	110062551	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=204,221;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,3,0
chr6	110110943	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=153,250;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr6	110113889	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=147,131;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:0,3:6,2:2,4,2,3
chr6	110113923	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=160,131;MMQ=60,49;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:2,0:6,2:2,6,0,2
chr6	110301945	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=5;MBQ=30,33;MFRL=202,149;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,3:1,1:1,1,3,1
chr6	110302005	.	TTTC	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,29;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110302005_TTTC_T:110302005:0,4,0,1
chr6	110302010	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=31,24;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110302005_TTTC_T:110302005:0,4,0,1
chr6	110302012	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=33,31;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:110302005_TTTC_T:110302005:0,4,0,1
chr6	110302016	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=30,22;MFRL=188,127;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0|1:110302005_TTTC_T:110302005:0,4,0,1
chr6	110514293	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=175,303;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr6	110549980	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=176,250;MMQ=60,32;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,3:3,0:6,0,3,0
chr6	110567200	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=163,76;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:4,2:3,0:6,1,1,1
chr6	110643956	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,6,3
chr6	110644112	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,97;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	110714040	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=191,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.422:19:4,2:7,5:6,5,6,2
chr6	110729542	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=156,86;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:7,3:8,0:9,6,3,0
chr6	110752337	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=163,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr6	110797605	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:110797605_G_A:110797605:0,0,2,0
chr6	110797612	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:110797605_G_A:110797605:0,0,2,0
chr6	110797703	.	CCGCGGG	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,3:0.800:3:0,1:0,1:0|1:110797703_CCGCGGG_C:110797703:0,0,2,1
chr6	110797713	.	C	CCACCCCT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=13,32;MFRL=180,194;MMQ=60,60;MPOS=-1073741823;POPAF=7.30;TLOD=6.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.671:4:0,1:0,1:0|1:110797703_CCGCGGG_C:110797703:1,0,1,2
chr6	110797821	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=17.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,1,4
chr6	110942653	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,0,4
chr6	110948099	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=182,259;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,2:4,0:2,6,1,1
chr6	110988795	.	AC	TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=154,197;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:0,5,0,5
chr6	110991707	.	A	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=142,160;MMQ=60,49;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:0|1:110991707_A_C:110991707:11,10,0,3
chr6	110991710	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=142,160;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,3:0.153:24:12,0:9,3:0|1:110991707_A_C:110991707:11,10,0,3
chr6	111213927	.	T	TC	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=152,96;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=C;STR;TLOD=16.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.488:20:3,3:7,7:7,3,4,6
chr6	111280332	.	G	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.214:26:16,3:5,2:14,7,3,2
chr6	111281802	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=137,121;MMQ=60,35;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=15.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:4,0:9,5:5,8,0,6
chr6	111281880	.	A	ATAAATAT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=241,167;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAATAT;STR;TLOD=10.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,0:3,3:1,4,0,3
chr6	111283592	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=111,99;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:8,5:7,2:8,7,6,1
chr6	111283718	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=174,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:3,1:7,1:6,4,0,2
chr6	111321037	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=218,177;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	111329221	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=115,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=T;STR;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.822:7:0,1:1,5:1,0,5,1
chr6	111345420	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:7,1:10,2:8,10,3,0
chr6	111527696	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=188,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	111527988	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=147,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.666:13:3,5:1,4:0,4,1,8
chr6	111587055	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=228,185;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=21.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:4,5:1,3:5,0,7,1
chr6	111695887	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=207,166;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:5,3:3,7:5,4,4,6
chr6	111695899	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=185,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:9,0:6,3:8,7,1,2
chr6	111711232	.	C	CG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=221,172;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:1,0:3,5:4,0,5,0
chr6	111726611	.	A	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.266:13:6,2:4,1:9,1,3,0
chr6	111896790	.	CAAAA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,191;MMQ=60,40;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=21,17;RU=A;STR;TLOD=12.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,2:0,3:0,1,6,1
chr6	111995666	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=189,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:2,5:6,3:8,0,3,5
chr6	112025405	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=28,24;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.328:4:0,1:3,0:0|1:112025405_A_AC:112025405:0,3,0,1
chr6	112025406	.	T	TG	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=192,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:112025405_A_AC:112025405:0,3,0,1
chr6	112041170	.	G	A	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=167,0;MMQ=60,48;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,3:0.099:38:16,1:19,2:14,21,0,3
chr6	112375644	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=140,285;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:1,1:6,2:1,6,1,2
chr6	112389558	.	G	C	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=148,135;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.133:28:10,0:15,3:8,17,0,3
chr6	112389563	.	A	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,27;MFRL=163,148;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,7:0.250:30:11,0:12,7:10,13,0,7
chr6	112389637	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=24,33;MFRL=138,131;MMQ=60,54;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.264:21:10,0:4,5:0,16,0,5
chr6	112390565	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=164,91;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.202:13:6,2:4,0:5,6,2,0
chr6	112397445	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=132,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:2,2:3,1,2,0
chr6	112420685	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=166,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:2,2:4,3:0,6,0,5
chr6	112420703	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=175,235;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:3,2:4,2:0,7,0,4
chr6	112430886	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=219,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	112435264	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,36;MFRL=164,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:3,3:1,1:0|1:112435264_T_G:112435264:1,3,5,0
chr6	112435273	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=117,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,5:0.500:10:4,3:1,1:0|1:112435264_T_G:112435264:2,3,5,0
chr6	112435444	.	G	GAAT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=180,253;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=AAT;STR;TLOD=11.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,3:1,0:0,4,0,3
chr6	112435796	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=168,260;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr6	112435807	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=162,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.538:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr6	112443134	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=127,176;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:3,2:0,3:2,1,4,1
chr6	112455586	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=226,324;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:4,0,2,0
chr6	112457471	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=149,220;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=24.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.771:11:0,3:2,6:1,1,0,9
chr6	112471621	.	GACAA	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=118,193;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACAA;STR;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,0:1,3:1,0,3,0
chr6	112471688	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=149,188;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,2:4,4:4,1,5,1
chr6	112476182	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,22;MFRL=155,220;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:112476182_G_A:112476182:0,4,0,1
chr6	112476192	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=30,25;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:2,0:0|1:112476182_G_A:112476182:0,3,0,1
chr6	112476210	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=220,170;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	112486397	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=162,129;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.188:19:9,0:7,3:6,10,1,2
chr6	112506375	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=12.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.871:6:0,0:0,3:0,0,6,0
chr6	112506583	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,117;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=46.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,5:0,8:0,0,0,13
chr6	112528186	.	G	A	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=110,92;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:13,3:14,0:21,6,2,1
chr6	112535131	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,29;MFRL=165,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.528:15:1,1:6,7:4,3,7,1
chr6	112537497	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=52.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,10:0,4:1,0,14,0
chr6	112575200	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=170,145;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:7,3:5,3:5,7,2,4
chr6	112672432	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=98,124;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:5,2:4,5,2,0
chr6	114178831	.	C	CGCT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=GCT;STR;TLOD=51.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,8:0,4:0,0,11,1
chr6	114181623	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=201,152;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,0:5,2:2,6,1,1
chr6	114270221	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=153,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.248:22:7,5:10,0:6,11,5,0
chr6	114281112	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=141,64;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:10,0:11,2:0|1:114281112_G_A:114281112:9,13,1,1
chr6	114281117	.	GGGTCATGC	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=149,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:11,0:12,2:0|1:114281112_G_A:114281112:12,12,1,1
chr6	116264354	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=175,170;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.414:13:2,2:3,3:2,6,4,1
chr6	116288912	.	TA	T,TAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,27,28;MFRL=197,169,183;MMQ=60,60,60;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,11,13;RU=A;STR;TLOD=3.71,12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,6:0.261,0.579:10:0,2,3:1,1,2:0,1,2,7
chr6	116381395	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.368:22:11,7:3,0:8,6,8,0
chr6	116427506	.	CTT	C,CT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=19,22,27;MFRL=75,0,103;MMQ=60,60,60;MPOS=30,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,17,18;RU=T;STR;TLOD=5.41,5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,3,4:0.310,0.396:10:0,1,2:1,2,0:2,1,4,3
chr6	116427511	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=0,75;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.171:15:6,0:7,2:9,4,1,1
chr6	116429623	.	T	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=156,160;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,10:0.786:12:1,4:1,6:0|1:116429623_T_A:116429623:0,2,4,6
chr6	116429631	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=155,167;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,3:0.331:10:4,1:3,2:0|1:116429623_T_A:116429623:2,5,1,2
chr6	116441229	.	T	TGGG	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,22;MFRL=123,118;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=1,4;RU=G;STR;TLOD=21.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:1,1:3,4:3,1,4,2
chr6	116575344	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=236,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:0,2,0,6
chr6	116599665	.	T	C	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=142,207;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:11,3:14,1:14,11,2,2
chr6	116600465	.	T	TCAC	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,24;MFRL=213,169;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=CAC;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.351:15:8,1:1,4:5,5,3,2
chr6	116720534	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=192,165;MMQ=60,34;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:11,2:4,1:7,8,0,3
chr6	116752290	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=121,91;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,1:5,1:7,6,2,0
chr6	116782488	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=53.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,10:0,6:0,0,12,4
chr6	116783390	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,299;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	116836720	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.423:10:2,3:3,1:5,1,3,1
chr6	116864570	.	A	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=176,172;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=22.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,8:0.321:26:13,3:5,5:3,15,4,4
chr6	116878947	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=150,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=23.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.586:17:2,6:4,4:6,1,6,4
chr6	116901640	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=194,236;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,2:2,3:0,3,0,5
chr6	116912033	.	CTT	C,CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30,32;MFRL=173,196,157;MMQ=60,60,50;MPOS=5,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=T;STR;TLOD=4.66,4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,2:0.254,0.190:14:4,2,1:2,2,1:5,3,6,0
chr6	116914112	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=143,177;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.549:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr6	116943973	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=141,165;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.288:25:12,6:6,0:7,11,7,0
chr6	116968546	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=141,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=5.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	116979930	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=167,110;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,1:1,1:6,0,2,0
chr6	117019846	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=165,189;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,1:4,1:6,3,0,2
chr6	117026217	.	AT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,1:1,2:4,2,3,0
chr6	117053285	.	ACT	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=197,161;MMQ=60,40;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:1,3:0,0:0|1:117053285_ACT_A:117053285:4,1,3,0
chr6	117053288	.	T	TATA	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=24,28;MFRL=197,161;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.399:8:2,3:3,0:0|1:117053285_ACT_A:117053285:4,1,3,0
chr6	117053290	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=197,161;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=8.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,3:0.397:8:2,2:3,0:0|1:117053285_ACT_A:117053285:4,1,3,0
chr6	117073874	.	AATAT	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,253;MMQ=60,50;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=AT;STR;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.784:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr6	117073905	.	GTA	G,GTATA	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,32,35;MFRL=0,272,207;MMQ=60,60,40;MPOS=16,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,7,9;RU=TA;STR;TLOD=3.38,3.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.405,0.403:2:0,1,0:0,0,1:0,0,0,2
chr6	117086265	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=151,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:2,0,6,0
chr6	117113653	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=181,177;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:2,2,2,5
chr6	117114025	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=168,241;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:6,5:6,3:8,4,6,2
chr6	117114050	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=204,154;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,0:6,2:12,5,1,1
chr6	117128286	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=146,143;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,0:4,3:7,4,0,3
chr6	117150063	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,113;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.250:14:4,0:7,3:5,6,0,3
chr6	117198347	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr6	117198724	.	CAAT	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=225,370;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=AAT;STR;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.246:10:3,1:5,1:1,7,0,2
chr6	117215114	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=150,123;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:8,0:6,6:7,7,3,3
chr6	117239141	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=188,147;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:6,1:3,1:7,2,0,2
chr6	117240283	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=194,92;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:5,0,2,0
chr6	117243181	.	CT	C,CTTTTTT	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=32,29,34;MFRL=183,139,146;MMQ=60,60,40;MPOS=34,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,19;RU=T;STR;TLOD=3.20,3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.256,0.251:5:0,0,1:3,1,0:3,0,2,0
chr6	117243196	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=17,10;MFRL=165,139;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.294:5:0,0:1,0:4,0,1,0
chr6	117243203	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,15;MFRL=141,146;MMQ=60,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:0,0:2,0:0|1:117243203_A_T:117243203:4,0,1,0
chr6	117243211	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=30,17;MFRL=139,146;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,1:0.250:6:1,0:3,0:0|1:117243203_A_T:117243203:5,0,1,0
chr6	117246576	.	G	GA	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=204,149;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=A;STR;TLOD=7.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:2,1,2,1
chr6	117249847	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	117250182	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=246,119;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,1:0,2:1,0,0,3
chr6	117587096	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,29;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:117587096_C_T:117587096:0,4,0,1
chr6	117587098	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,31;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:117587096_C_T:117587096:0,4,0,1
chr6	117587100	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,28;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0|1:117587096_C_T:117587096:0,4,0,1
chr6	117587102	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=18,29;MFRL=231,143;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:0,0:0|1:117587096_C_T:117587096:0,4,0,1
chr6	117591619	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=165,197;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr6	117622150	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=30,36;MFRL=186,167;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:6,2,1,1
chr6	117622184	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:2,1:6,1:0|1:117622184_G_C:117622184:5,3,1,2
chr6	117622188	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=158,234;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.307:11:2,2:5,1:0|1:117622184_G_C:117622184:5,3,1,2
chr6	117631463	.	T	TTAA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=204,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=TAA;STR;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.497:6:2,2:1,0:1,2,0,3
chr6	117639301	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=207,221;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:5,2:5,1,3,1
chr6	117641158	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=157,86;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,1:5,1:3,10,2,0
chr6	117658281	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=136,126;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=17.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:2,5:7,0:0|1:117658281_A_T:117658281:6,5,5,0
chr6	117658286	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=144,126;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=17.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,5:0.315:17:5,5:7,0:0|1:117658281_A_T:117658281:7,5,5,0
chr6	117674087	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=200,161;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	117678083	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=174,149;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:1,1:4,3:2,3,1,3
chr6	117686943	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=167,108;MMQ=60,59;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,5:3,0:0,5,0,5
chr6	117706760	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=249,229;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.343:9:2,2:4,0:6,0,3,0
chr6	117708932	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=180,59;MMQ=60,57;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.156:17:8,0:5,2:0|1:117708932_C_T:117708932:9,6,1,1
chr6	117708939	.	T	TTGAA	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=26,20;MFRL=184,59;MMQ=60,57;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:7,0:6,2:0|1:117708932_C_T:117708932:7,6,1,1
chr6	117710661	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=187,219;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:5,0:6,5:4,7,3,2
chr6	117714346	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,158;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:0,0:3,2:3,0,2,0
chr6	117724462	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=187,268;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:3,3,0,2
chr6	117724499	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=207,217;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:1,2,1,2
chr6	117725383	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=152,169;MMQ=57,50;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,1,1
chr6	117737390	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=104,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,3:2,3:0,2,5,1
chr6	117804083	.	C	CATTCTGATTTTGAAAATCAGAGAAACCAT	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr6	117842759	.	CTG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=137,155;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TG;STR;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,2:0,5:2,2,3,4
chr6	117860058	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=231,110;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,2:4,4:0,7,1,5
chr6	117862048	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=196,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=24.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:3,5:6,3:4,5,7,1
chr6	117996818	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,113;MMQ=60,27;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr6	118475798	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=161,181;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,1:1,3:1,2,0,4
chr6	118556628	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=183,147;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:3,1,2,0
chr6	118635122	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=126,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,5:1,2:1,0,7,0
chr6	118786486	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=177,184;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:2,0:1,2:3,0,2,0
chr6	118803195	.	TAAA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,11;MFRL=0,286;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=18,15;RU=A;STR;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.700:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr6	118845168	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=172,237;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	118881770	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=179,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,8:0.375:22:5,6:9,2:6,8,0,8
chr6	118886615	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=194,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,2:1,3:3,0,4,1
chr6	118973998	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=127,220;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:3,9,0,2
chr6	118974042	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,30;MFRL=288,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,3:1,2:0,2,0,5
chr6	119148023	.	A	AGATACAGGGCTGCACACTG	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=131,137;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.161:16:6,2:8,0:4,10,0,2
chr6	119149149	.	C	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.895:17:0,7:1,9:0,1,6,10
chr6	119296378	.	TAA	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=112,236;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,9;RU=A;STR;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.501:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	119300477	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=165,273;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:3,1:1,2:4,0,3,0
chr6	119346010	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=244,169;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:0,2,0,3
chr6	119501160	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=166,212;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:6,1:3,3:1,9,1,3
chr6	119501601	.	T	TAA	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,28;MFRL=188,140;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=A;STR;TLOD=17.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,5:0.352:15:9,2:1,2:0|1:119501601_T_TAA:119501601:2,8,1,4
chr6	119501618	.	A	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=203,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,6:0.333:19:9,3:4,2:0|1:119501601_T_TAA:119501601:1,12,1,5
chr6	119509785	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=10.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	119510739	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,24;MFRL=428,192;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:1,0,3,0
chr6	119510777	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,35;MFRL=428,191;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.608:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	119511120	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=177,237;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:2,2:6,2:0,9,0,4
chr6	119522353	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=183,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:3,0,2,0
chr6	119522553	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=201,123;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:2,2:6,1:1,7,0,3
chr6	119611989	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=253,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:0,5,0,6
chr6	119623079	.	AT	GC	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=232,188;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.655:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	119623358	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=196,181;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,3:2,2:0,4,1,4
chr6	119627976	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=275,133;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:2,5:1,2:3,0,7,0
chr6	119628029	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=166,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,6:1,5:1,2,8,4
chr6	119628198	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=276,171;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,4:1,1:0,2,1,5
chr6	121412191	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=175,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.426:5:2,1:1,1:0,3,0,2
chr6	121427283	.	T	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=125,168;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:31,3:0.111:34:15,1:14,2:10,21,2,1
chr6	121436422	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr6	121452695	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,158;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	121482295	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr6	121491472	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.796:3:0,0:0,2:0,0,3,0
chr6	121560155	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,211;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,4:0,7:0,0,11,0
chr6	121624876	.	A	AAAGCTTTTT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=189,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,0:3,2:2,6,1,1
chr6	121626079	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,225;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=40.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,1,10
chr6	121768269	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=200,54;MMQ=57,25;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:5,0:7,2:0|1:121768269_C_A:121768269:6,8,0,2
chr6	121768274	.	C	CACAAAATTGAG	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=31,36;MFRL=165,54;MMQ=57,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:7,0:8,2:0|1:121768269_C_A:121768269:7,10,0,2
chr6	121768276	.	C	CTTTAAAAA	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=165,54;MMQ=57,25;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:8,2:0|1:121768269_C_A:121768269:7,10,0,2
chr6	121769905	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=159,170;MMQ=60,54;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=8.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.299:18:7,0:6,4:8,5,5,0
chr6	122720806	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=169,219;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:4,4:2,1:6,0,5,0
chr6	122720813	.	T	TGCCGTAGCTGCC	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,27;MFRL=219,130;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GCCGTAGCTGCC;STR;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.457:9:3,2:1,1:4,1,4,0
chr6	122740474	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=198,148;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.278:16:3,2:9,2:0,12,0,4
chr6	122743502	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	122744761	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=166,156;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:11,4:12,0:18,5,4,0
chr6	122749156	.	G	GTC	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=152,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TC;STR;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.450:9:2,2:3,2:1,4,1,3
chr6	122752471	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=203,203;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	122752550	.	T	TTA	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=26,28;MFRL=211,173;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TA;STR;TLOD=12.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,3:1,0:3,0,4,0
chr6	122768231	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=187,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.381:19:4,5:8,2:5,7,5,2
chr6	122772921	.	A	AATAT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=184,101;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=9,11;RU=AT;STR;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.605:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	122773119	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=153,248;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:9,2:5,0:8,6,1,1
chr6	122774955	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=164,85;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.211:17:3,0:11,3:6,8,0,3
chr6	122775192	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=218,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:122775192_CA_C:122775192:3,0,1,1
chr6	122775194	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=218,86;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:122775192_CA_C:122775192:3,0,1,1
chr6	122792765	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=195,132;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,9:0.435:21:7,7:5,2:0|1:122792765_G_C:122792765:9,3,8,1
chr6	122792768	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=195,125;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=35.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,10:0.458:22:7,8:5,2:0|1:122792765_G_C:122792765:9,3,8,2
chr6	123022496	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=203,236;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:4,0,4,0
chr6	123038887	.	CT	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	123039123	.	C	CT	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=32,34;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,0:1,6:0,3,0,6
chr6	123039132	.	A	ACAGCTAGAGGTATGG	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=27,25;MFRL=238,135;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.369:3:1,1:1,0:0|1:123039132_A_ACAGCTAGAGGTATGG:123039132:0,2,0,1
chr6	123039135	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=27,31;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,1:1,0:0|1:123039132_A_ACAGCTAGAGGTATGG:123039132:0,3,0,1
chr6	123039137	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=33,22;MFRL=188,135;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:123039132_A_ACAGCTAGAGGTATGG:123039132:0,3,0,1
chr6	123039201	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=5;MBQ=0,29;MFRL=0,278;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	123046260	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.269:9:3,1:4,1:5,2,2,0
chr6	123101348	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=29.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,6:0,2:0,0,8,0
chr6	123101373	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:7,2:1,1:8,0,3,0
chr6	123101647	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=128,177;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr6	123127597	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=253,42373544;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr6	123318301	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=141,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,3:0,3:1,0,6,0
chr6	123319382	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,0:0,3:0,0,0,3
chr6	123369910	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=26.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,1,6
chr6	123539684	.	CT	TC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr6	123539784	.	G	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=154,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:10,0:7,2:10,7,0,2
chr6	123539904	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=138,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,7:1,5:1,0,7,5
chr6	123580660	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	123581789	.	G	GA	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=19,25;MFRL=184,125;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;RPA=15,16;RU=A;STR;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.586:8:1,3:0,1:1,2,2,3
chr6	123586488	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=246,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:2,1:6,1:3,5,2,0
chr6	123592184	.	C	CTGTGTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=0,0;MMQ=54,22;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,15;RU=TG;STR;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.509:2:1,0:0,1:1,0,1,0
chr6	123600100	.	CA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=21.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr6	123658680	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=248,136;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	123687432	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,4:0,2:0,0,0,7
chr6	123703168	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=150,219;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.458:13:6,4:1,1:5,2,6,0
chr6	123714656	.	GC	TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=217,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:4,3:2,0:6,0,3,0
chr6	123714891	.	CAG	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=186,268;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:0,10,0,2
chr6	123819847	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,236;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	123833457	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,142;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,7:0,10:0,0,12,5
chr6	123851538	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=24.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,7,0
chr6	123851590	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,30;MFRL=278,195;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=39.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,10:0.846:11:0,6:1,3:0|1:123851590_G_A:123851590:0,1,8,2
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chr6	123869769	.	TAA	T	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=28,30;MFRL=142,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=19.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.716:12:1,3:1,6:0,3,0,9
chr6	123869784	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=27,25;MFRL=158,143;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:4,2:8,0:0|1:123869784_A_C:123869784:0,12,0,2
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chr6	123892044	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=145,268;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr6	123892337	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=134,209;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:0,3,0,2
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chr6	124604111	.	T	TATC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,20;MFRL=191,48;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.214:12:4,2:6,0:0|1:124604109_T_TCATAAATAATAG:124604109:10,0,1,1
chr6	124979689	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=40.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr6	125139473	.	TG	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=141,213;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,3:0,0:1,1,3,1
chr6	125366289	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=197,180;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=12.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:1,4:0,1:1,0,5,0
chr6	125402711	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=162,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.732:13:2,3:1,6:0,3,3,7
chr6	125541258	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=148,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.317:20:7,4:7,2:5,9,3,3
chr6	125569405	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=181,241;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:7,2,1,1
chr6	125597247	.	GA	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=167,195;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=14.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:6,2:2,4:8,1,5,1
chr6	125597301	.	T	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,23;MFRL=146,128;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.174:21:9,0:7,3:12,6,0,3
chr6	125597433	.	AAG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=178,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=AG;STR;TLOD=35.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.668:13:2,1:2,8:0,4,0,9
chr6	125598199	.	TG	CA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=171,175;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=36.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,9:0.667:13:1,7:3,2:4,0,8,1
chr6	125614100	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:5,1:4,2:4,5,0,3
chr6	125614121	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,163;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,1:1,2:0,5,0,3
chr6	125621618	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=126,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.558:14:2,4:4,3:4,2,6,2
chr6	125621645	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=128,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,10:0.647:15:2,7:3,3:4,1,6,4
chr6	125623185	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=186,261;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:1,3:0,0:0,1,0,4
chr6	126075709	.	ATTT	A,AT,ATT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27,25,25;MFRL=122,76,115,214;MMQ=60,60,60,60;MPOS=16,17,25;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,12,13,14;RU=T;STR;TLOD=3.47,6.76,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:7,2,4,3:0.149,0.250,0.209:16:3,1,2,1:2,1,2,1:2,5,0,9
chr6	126080623	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:7,1:3,1:6,4,1,1
chr6	126196142	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=183,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:8,3:5,3:4,9,4,2
chr6	126221008	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=134,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:3,1,3,0
chr6	126242004	.	CG	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=30.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr6	126249755	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=155,242;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=T;STR;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.374:8:3,2:2,0:3,2,2,1
chr6	126288023	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=48.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,11,3
chr6	126319881	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,138;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=15.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr6	126320761	.	T	C	.	.	DP=63;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=156,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:37,24:0.399:61:24,0:11,24:8,29,0,24
chr6	126334041	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=44.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,6:0,8:0,0,10,4
chr6	126669517	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=154,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:9,2,2,0
chr6	127471791	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=147,199;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,0,2
chr6	127476516	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,12:0.448:27:9,5:6,7:9,6,6,6
chr6	127476586	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=211,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:7,0:3,5:3,7,0,5
chr6	127608822	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=157,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.148:25:11,0:11,3:8,14,3,0
chr6	127608864	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,25;MFRL=171,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.165:22:9,0:10,3:8,11,3,0
chr6	127608940	.	G	T	.	.	DP=57;ECNT=3;MBQ=32,18;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:45,10:0.191:55:24,0:19,4:15,30,0,10
chr6	127768748	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=163,84;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.228:11:4,0:5,2:3,6,1,1
chr6	127768762	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=147,339;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:1,1:4,1:2,4,1,1
chr6	127768950	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=90,163;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,5:1,0:0,1,0,5
chr6	127768971	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=193,90;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:4,0:0,1:0,4,0,1
chr6	127770923	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=86,181;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:0,3:2,3:1,1,4,2
chr6	128176383	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr6	128297950	.	GA	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=18,32;MFRL=159,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.352:9:1,0:1,2:0,6,0,3
chr6	128297986	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=202,212;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:0,3,1,3
chr6	128307118	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=180,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:9,2:5,1:0,14,0,3
chr6	128316412	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=161,112;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:9,0:12,2:14,7,0,2
chr6	128324241	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=27.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	128330249	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=42.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.936:13:0,9:0,4:0,0,9,4
chr6	128383562	.	G	GA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=120,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=A;STR;TLOD=51.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,18:0.829:21:2,13:1,5:3,0,10,8
chr6	128385998	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=195,227;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr6	128388990	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,179;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	128403745	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=72.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,8:0,12:0,0,8,12
chr6	128562312	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=202,84;MMQ=60,33;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:9,4:6,0:8,7,4,0
chr6	129204292	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=15,29;MFRL=233,208;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.758:5:0,4:0,0:1,0,4,0
chr6	129370975	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=150,153;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:8,2:1,2:9,0,4,0
chr6	129571330	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=120,149;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,3:4,3:2,4,0,6
chr6	129622055	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,2:4,0:1,9,1,1
chr6	129670548	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=122,157;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:2,6,1,1
chr6	129674593	.	CTTT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=204,191;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=T;STR;TLOD=9.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,3:3,1:1,5,0,4
chr6	129724894	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=254,196;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr6	129775215	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=179,183;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:3,1:5,2:6,2,3,0
chr6	129777382	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,7,0
chr6	129785391	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=38.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,9,2
chr6	129796620	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=283,185;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:1,0,0,3
chr6	129833696	.	T	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,23;MFRL=220,99;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	129835814	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,199;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=30.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,0,10
chr6	129899842	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=155,182;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:0,2,0,4
chr6	129955117	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=225,152;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,5,0
chr6	129955151	.	G	GA	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=193,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,14;RU=A;STR;TLOD=8.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.558:9:1,1:3,1:4,0,1,4
chr6	129955327	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=221,144;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:1,3:3,1:0,4,0,4
chr6	130154686	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=56.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.943:15:0,9:0,6:0,0,6,9
chr6	130164764	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=49.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,6:0,10:0,0,3,14
chr6	130164856	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,0,5
chr6	130370404	.	C	CCT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=202,151;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CT;STR;TLOD=34.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,3:1,6:1,0,6,3
chr6	130371055	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=165,203;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:0,1,0,3
chr6	130387431	.	G	GTATATATATATA,GTATATATATATATATA	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,34,33;MFRL=0,185,154;MMQ=60,41,40;MPOS=19,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,14,16;RU=TA;STR;TLOD=7.15,9.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,2,3:0.376,0.518:5:0,1,0:0,1,3:0,0,4,1
chr6	130387459	.	A	AAGT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=119,82;MMQ=60,40;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.324:4:2,0:0,1:3,0,0,1
chr6	130399854	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,23;MFRL=115,39436464;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,2:1,0:2,1,0,2
chr6	130425540	.	CT	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=174,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=9.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.378:14:7,3:2,2:9,0,5,0
chr6	130454535	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=186,192;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:6,0,4,0
chr6	130454616	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=179,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.239:23:11,3:7,2:9,9,4,1
chr6	130466413	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,180;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,2:0,4:0,0,4,3
chr6	130475945	.	GTA	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=183,197;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=TA;STR;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.297:8:3,0:3,2:6,0,2,0
chr6	130496883	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=225,173;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:3,0,2,0
chr6	130505374	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=148,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.764:15:1,5:2,7:1,2,2,10
chr6	130530815	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=131,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,3:0,0:0,3,1,2
chr6	130535420	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,346;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:7,1:6,2:11,2,3,0
chr6	130536494	.	AT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=236,211;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,3:2,0:0,3,0,3
chr6	130762153	.	C	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=171,21277314;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,2:0.102:27:9,2:16,0:14,11,0,2
chr6	131179302	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=121,142;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:5,2:6,0:6,5,0,2
chr6	131186578	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=176,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,1:2,1:7,0,2,0
chr6	131190838	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,181;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:9,1:7,4:10,6,2,3
chr6	131197990	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	131211476	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=162,171;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.152:28:15,0:9,3:14,10,4,0
chr6	131211616	.	GAA	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=19,18;MFRL=247,264;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.494:9:0,1:0,0:0,5,0,4
chr6	131220709	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=175,174;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.315:17:7,3:5,2:5,7,2,3
chr6	131276466	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=165,233;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.244:6:1,1:4,0:0,5,0,1
chr6	131481130	.	G	GT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=144,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=9.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.343:16:7,3:3,2:8,3,5,0
chr6	131481394	.	CA	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=21.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr6	131490229	.	GA	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=130,220;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=13.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:3,3:0,2:2,1,5,0
chr6	131490472	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=174,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,2:2,0:0,6,0,2
chr6	131520507	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=227,191;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:4,2:1,0:5,0,2,0
chr6	131540726	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=159,225;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:2,2:1,3:1,2,5,0
chr6	131894358	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=148,222;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr6	131900144	.	GC	AT	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=180,266;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,0:3,2:4,0,2,0
chr6	131904704	.	G	GA	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,212;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr6	131911634	.	TG	AA	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.329:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr6	131911655	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	131912746	.	CT	C	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=31,34;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131912746_CT_C:131912746:0,1,0,1
chr6	131912751	.	TC	CT	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=24,35;MFRL=197,227;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:131912746_CT_C:131912746:0,1,0,1
chr6	131912759	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,22;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:131912746_CT_C:131912746:0,0,0,1
chr6	131948469	.	GAA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=181,169;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=A;STR;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.381:11:6,2:1,2:7,0,4,0
chr6	131948640	.	T	TGTATCTTATAAGATTTTACAAGTTGC	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=174,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:36,3:0.095:39:21,1:14,2:9,27,0,3
chr6	131948816	.	TAA	T,TA,TAAA	.	.	DP=51;ECNT=1;MBQ=28,29,31,28;MFRL=115,75,136,122;MMQ=60,60,60,60;MPOS=14,17,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=14,12,13,15;RU=A;STR;TLOD=8.42,13.78,4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:18,6,9,5:0.148,0.234,0.137:38:7,3,2,2:7,3,7,3:1,17,2,18
chr6	131949136	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=134,121;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.197:23:7,1:11,2:11,8,3,1
chr6	131958485	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,35;MFRL=164,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,4:2,1:2,1,4,1
chr6	131997798	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=194,238;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr6	131999016	.	T	TTAAAGCAAAA	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=28,20;MFRL=197,46;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:0|1:131999016_T_TTAAAGCAAAA:131999016:8,3,1,1
chr6	131999019	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=193,46;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:8,2:3,0:0|1:131999016_T_TTAAAGCAAAA:131999016:8,4,1,1
chr6	131999021	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=30,20;MFRL=193,46;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.188:14:9,2:3,0:0|1:131999016_T_TTAAAGCAAAA:131999016:8,4,1,1
chr6	131999145	.	C	CCT	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=34,31;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:131999145_C_CCT:131999145:0,4,0,1
chr6	131999146	.	A	AAAGG	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,24;MFRL=193,204;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:131999145_C_CCT:131999145:0,4,0,1
chr6	132006987	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=162,88;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:7,0:10,5:0|1:132006987_G_A:132006987:7,10,0,5
chr6	132006990	.	A	AT	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,27;MFRL=162,88;MMQ=60,54;MPOS=32;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=T;STR;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,5:0.250:22:6,0:10,5:0|1:132006987_G_A:132006987:7,10,0,5
chr6	132043349	.	A	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=123,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=28.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,5:2,6:4,1,7,4
chr6	132061605	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,1:2,2:0,2,0,3
chr6	132169052	.	T	TG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=219,160;MMQ=60,56;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:132169052_T_TG:132169052:0,2,0,1
chr6	132169053	.	A	AGGAGG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=219,160;MMQ=60,56;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0|1:132169052_T_TG:132169052:0,2,0,1
chr6	132172294	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=185,184;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:3,6:6,1:8,1,5,2
chr6	132189178	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=142,127;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:8,5:9,0:7,10,5,0
chr6	132201081	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=112,244;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:1,0:4,2:2,3,2,0
chr6	132207964	.	C	CTCT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=205,200;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=6.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr6	132270728	.	GA	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=18,26;MFRL=169,233;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=7.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.414:10:2,1:0,1:2,4,2,2
chr6	132641675	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=231,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,2:0,2:1,0,4,0
chr6	132641888	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=223,229;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:6,1:2,2:1,7,0,3
chr6	132644035	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=179,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=17.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:3,4:7,3:2,8,2,5
chr6	132645195	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=158,146;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:9,2:10,2:9,10,1,3
chr6	132696016	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=148,289;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr6	132785074	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=74,70;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.172:21:8,3:10,0:10,8,2,1
chr6	132874693	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=179,66;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:6,0:4,2:0|1:132874693_C_T:132874693:6,5,1,1
chr6	132874702	.	A	ATCCACC	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.172:15:7,0:6,2:0|1:132874693_C_T:132874693:9,4,1,1
chr6	132910612	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=169,151;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,11:0.572:19:5,4:3,7:3,5,3,8
chr6	132910622	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=194,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:7,0:8,2:5,10,0,2
chr6	132910877	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=24,16;MFRL=192,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.396:3:1,0:1,0:0,2,0,1
chr6	132910891	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=24,28;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:132910891_A_T:132910891:0,4,0,1
chr6	132910896	.	A	G,C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,31,35;MFRL=204,180,203;MMQ=60,60,60;MPOS=7,2;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.21,3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,1,1:0.250,0.250:5:1,1,0:2,0,1:0,3,0,2
chr6	132910897	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=26,35;MFRL=194,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:132910891_A_T:132910891:0,4,0,1
chr6	132910900	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=5;MBQ=27,29;MFRL=204,180;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:1,0:0,4,0,1
chr6	132966043	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=144,183;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr6	133048213	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=155,203;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr6	133055610	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=169,182;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,4:0.356:12:3,1:5,3:0|1:133055610_G_T:133055610:4,4,2,2
chr6	133055612	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=174,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,0:6,2:0|1:133055610_G_T:133055610:5,6,1,1
chr6	133073668	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=156,202;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,1:8,1:9,4,0,2
chr6	133076919	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=163,61;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,2:2,0:5,0,1,1
chr6	133092046	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,138;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:7,7,0,2
chr6	133108763	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=21,35;MFRL=174,254;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.411:8:0,1:4,2:0,5,0,3
chr6	133135807	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,239;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,2:6,6:10,0,8,0
chr6	133136029	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=186,259;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.240:23:6,1:12,4:11,7,2,3
chr6	133136041	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=173,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:5,1:12,3:11,6,4,0
chr6	133138067	.	ATT	A,AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,30,29;MFRL=163,66,221;MMQ=60,60,60;MPOS=17,12;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=3.47,5.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,3:0.249,0.333:9:2,1,1:1,1,2:3,1,5,0
chr6	133138749	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=20,29;MFRL=71,223;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:1,1:2,3:1,2,1,3
chr6	133827148	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=169,230;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,3:2,0:5,0,3,0
chr6	133827354	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=160,192;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=12.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,3:2,1:1,3,0,4
chr6	133849789	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,226;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,3:5,3:3,4,6,0
chr6	133849966	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=131,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.331:19:7,1:6,5:5,8,2,4
chr6	134493397	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,145;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,6:0.174:38:19,3:13,3:17,15,3,3
chr6	134493877	.	C	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,22;MFRL=152,150;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=10.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,7:0.227:33:14,0:12,7:10,16,0,7
chr6	134493947	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=158,153;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,1:3,4:2,2,1,4
chr6	134494548	.	C	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=85.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.967:27:0,11:0,16:0,0,11,16
chr6	134495291	.	T	TC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=173,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=22.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:0,0:3,6:0,3,1,6
chr6	135263632	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=150,132;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,5:9,0:10,7,6,0
chr6	135263664	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=147,132;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=14.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,6:0.269:24:7,6:11,0:5,13,6,0
chr6	135286438	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=163,177;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=10.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.552:9:3,3:0,2:0,4,0,5
chr6	135286505	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=219,202;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr6	135290355	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=160,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=29.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:7,6:14,5:21,0,7,4
chr6	135299959	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=216,146;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:2,2:2,2:0,4,2,3
chr6	135300362	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,95;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:8,9,2,1
chr6	135318854	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=255,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	135324051	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=33,33;MFRL=242,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:135324051_T_C:135324051:0,1,0,3
chr6	135324052	.	TTTAAA	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=242,181;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=11.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0|1:135324051_T_C:135324051:0,1,0,3
chr6	135511108	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=297,175;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=14.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,1:2,4:2,2,1,4
chr6	135522939	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=185,220;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=22.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:3,4:0,4:0,3,1,7
chr6	135621517	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,10;MFRL=247,311;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,0:0|1:135621517_C_A:135621517:4,0,1,0
chr6	135621520	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=247,311;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:1,1:0|1:135621517_C_A:135621517:4,0,1,0
chr6	135639644	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=199,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:3,2:6,0:7,3,2,0
chr6	135749682	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=167,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:1,2:4,1:5,0,3,0
chr6	135754471	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=366,195;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=13.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,1:1,4:0,1,0,5
chr6	135763866	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=187,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=40.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,15:0.667:22:3,8:4,7:3,4,3,12
chr6	135763899	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=177,160;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:6,2:3,0:0,9,0,2
chr6	135777115	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=123,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,1:4,2:1,4,1,2
chr6	135813251	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,5,1
chr6	136172996	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=290,201;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=7.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:4,1:1,2:5,0,3,0
chr6	136430001	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=203,111;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.267:9:0,1:4,1:0,7,0,2
chr6	136472439	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,1,5
chr6	136472496	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,32;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,4:1,1:0,1,0,5
chr6	136582113	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=202,176;MMQ=52,51;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:9,3:5,2:13,1,4,1
chr6	136582194	.	T	TAAA	.	.	DP=46;ECNT=3;MBQ=25,25;MFRL=117,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=8,11;RU=A;STR;TLOD=7.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,8:0.193:41:13,2:16,6:16,17,5,3
chr6	136582203	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=119,166;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,8:0.200:43:17,2:18,6:18,17,5,3
chr6	136582417	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=140,297;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:15,1:10,3:12,13,2,2
chr6	136589205	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=193,99;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,0:0,2:4,0,2,0
chr6	136589234	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=188,99;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:5,0:2,2:7,0,2,0
chr6	136597004	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=216,121;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:8,2:3,1:8,3,3,0
chr6	136599822	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=180,199;MMQ=60,42;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.233:11:3,1:4,1:3,6,1,1
chr6	136699001	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=195,136;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:7,0:8,2:5,10,0,2
chr6	136710543	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=141,154;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,3:0.132:28:6,0:19,3:10,15,3,0
chr6	136710669	.	TAA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=160,14918976;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=15,13;RU=A;STR;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr6	136888889	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,20;MFRL=150,61;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.164:22:8,2:11,1:9,10,1,2
chr6	136913664	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=136,150;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.281:23:8,2:8,4:8,9,3,3
chr6	136932603	.	TA	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=168,155;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,0:1,2:0,4,0,2
chr6	137113248	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=226,136;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:2,1:3,3:3,2,4,0
chr6	137166682	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=39.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,3:0,9:0,0,11,1
chr6	137166831	.	G	T	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=130,96;MMQ=60,39;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:10,4:15,0:10,15,0,4
chr6	137193436	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=158,134;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=10.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.315:14:4,2:5,2:4,6,0,4
chr6	137193496	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=210,178;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	137295016	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=26,34;MFRL=146,211;MMQ=40,40;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.530:2:0,1:1,0:0|1:137295016_T_C:137295016:1,0,1,0
chr6	137295024	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=146,211;MMQ=40,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:137295016_T_C:137295016:1,0,1,0
chr6	137295046	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,35;MFRL=209,211;MMQ=60,40;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:0,1:3,0:0|1:137295046_T_C:137295046:3,0,1,0
chr6	137295051	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=28,37;MFRL=209,211;MMQ=60,40;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:137295046_T_C:137295046:3,0,1,0
chr6	137329934	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=152,114;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,0:5,2:1,10,1,1
chr6	137338276	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,128;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr6	137477823	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=202,215;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.434:12:4,4:2,1:5,2,4,1
chr6	137482982	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=188,192;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=10.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:0,8,1,3
chr6	137524870	.	GAA	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,30;MFRL=160,180;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.397:8:0,1:1,1:0,5,0,3
chr6	137540370	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=29.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,9:0.490:19:2,4:5,5:8,2,9,0
chr6	137540520	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=153,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=47.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,15:0.552:27:6,10:6,5:4,8,2,13
chr6	137814666	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=194,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:0,1:3,1:1,2,0,2
chr6	137815375	.	T	TA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=214,236;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=A;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.424:5:1,2:1,0:1,2,1,1
chr6	138195961	.	TCTC	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=137,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTC;STR;TLOD=35.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.551:18:1,2:6,8:7,1,8,2
chr6	138196066	.	T	G	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=172,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=44.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,16:0.436:37:10,8:11,8:9,12,6,10
chr6	138197331	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=172,168;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=33.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,3:2,7:1,6,2,8
chr6	138417415	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=153,283;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:6,0,2,0
chr6	138531190	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:6,2:7,0:3,10,1,1
chr6	138613200	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=163,280;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:1,0,0,2
chr6	138617853	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,37;MFRL=226,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:1,0,1,0
chr6	138751629	.	G	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=184,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:8,3:6,2:7,7,1,4
chr6	138753659	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=147,110;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.157:17:4,0:11,2:0|1:138753659_C_T:138753659:9,6,1,1
chr6	138753669	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=158,110;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.142:19:5,0:11,1:0|1:138753659_C_T:138753659:10,7,1,1
chr6	138763221	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=142,295;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:10,6:7,0:8,9,0,6
chr6	138794628	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=268,156;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr6	138820271	.	G	GAC,GACAC	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=32,34,31;MFRL=119,66,170;MMQ=60,53,60;MPOS=18,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,13,14;RU=AC;STR;TLOD=4.33,8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:5,2,4:0.238,0.399:11:2,2,1:3,0,1:4,1,6,0
chr6	138820315	.	C	T	.	.	DP=79;ECNT=2;MBQ=34,22;MFRL=100,83;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:69,5:0.077:74:30,5:37,0:27,42,5,0
chr6	138892814	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=169,179;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,2:7,1:7,1,3,0
chr6	139097174	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=208,166;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:2,3:5,5:7,0,7,1
chr6	139097321	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=134,196;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.181:20:12,3:5,0:6,11,0,3
chr6	139113869	.	T	TTAAC	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=135,273;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TAAC;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,1:6,1,1,1
chr6	139186074	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=187,203;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,3:1,0,5,0
chr6	139202014	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=170,265;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,1:0,3:1,0,4,0
chr6	139207910	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=244,199;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:1,0,4,0
chr6	139208118	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=118,244;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.371:6:1,2:3,0:1,3,0,2
chr6	139229743	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,9,1
chr6	139234163	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=188,324;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr6	139355580	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=159,205;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:2,2:3,3:1,4,3,2
chr6	139355740	.	TC	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=229,120;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.332:7:3,0:2,2:1,4,0,2
chr6	139363988	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=145,129;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.303:21:10,0:5,6:3,12,0,6
chr6	139487394	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=141,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:4,2:6,6:9,1,5,3
chr6	139487836	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=149,144;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=69.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,21:0.734:28:4,7:3,14:3,4,8,13
chr6	139581356	.	CAAAT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=167,335;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=AAAT;STR;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:4,0,1,0
chr6	139583914	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=138,110;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:6,2:8,2:4,10,1,3
chr6	139583990	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=24,29;MFRL=180,173;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,1:2,1:0,4,0,2
chr6	142397170	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=132,129;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:8,6,2,0
chr6	142487469	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=133,160;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.588:10:4,2:0,4:2,2,1,5
chr6	142491463	.	C	CG	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=27.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,8,0
chr6	142491552	.	TGATGAAGTGAG	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=141,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:2,2:7,0:5,8,1,1
chr6	142491584	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=189,137;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:5,1:3,3:2,6,1,3
chr6	142510676	.	GTATT	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,35;MFRL=203,177;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=TATT;STR;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,1:3,3:4,2,0,4
chr6	142715195	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=167,261;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=16.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:1,4:0,1:0,1,0,5
chr6	142718801	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=82.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,27:0.966:27:0,12:0,15:0,0,12,15
chr6	142724918	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=176,223;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.818:9:1,4:0,4:0,1,5,3
chr6	142738314	.	CTTCTT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=171,190;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.572:12:1,3:3,4:5,0,7,0
chr6	143074558	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,23;MFRL=177,108;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.160:29:11,4:14,0:15,10,0,4
chr6	143081847	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=176,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.557:7:2,4:1,0:0,3,0,4
chr6	143090633	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=177,211;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.300:18:7,2:6,3:11,2,4,1
chr6	143381712	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=163,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,9:0.384:24:10,8:5,1:11,4,6,3
chr6	143382254	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=34,31,26;MFRL=185,162,173;MMQ=60,60,60;MPOS=20,24;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=GT;STR;TLOD=10.12,9.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,4,4:0.296,0.355:12:3,0,1:0,3,2:3,1,4,4
chr6	143654625	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=125,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,3:1,1:0,2,1,3
chr6	143759753	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:11,1:6,1:8,9,2,0
chr6	143759840	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=178,110;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.296:25:11,0:7,7:4,14,0,7
chr6	143784031	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=172,180;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=T;STR;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:3,3:3,1:4,2,3,1
chr6	143789181	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=223,209;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr6	144086394	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=210,207;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.669:10:2,1:1,6:2,1,6,1
chr6	144104469	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=188,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:4,0:3,3:1,6,1,2
chr6	144128095	.	TAA	T,TA	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,25,25;MFRL=144,149,159;MMQ=60,60,60;MPOS=16,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=5.38,7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,3,4:0.266,0.367:11:1,1,2:0,2,2:4,0,7,0
chr6	144144678	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=212,185;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=15.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:1,2:3,3:4,0,4,1
chr6	144144815	.	CA	C	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,20;MFRL=173,64;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:10,2:8,0:0|1:144144815_CA_C:144144815:8,11,1,1
chr6	144144817	.	TCGTCCATAACGAAGAGTGAGACTATTTGGAA	T	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=29,20;MFRL=173,64;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:29,2:0.091:31:10,2:8,0:0|1:144144815_CA_C:144144815:14,15,1,1
chr6	144144875	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=185,200;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:11,2:7,2:6,12,2,2
chr6	144165809	.	CT	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=19,22;MFRL=85,213;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=9.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,3:0,0:0,2,0,5
chr6	144171401	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=142,172;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:4,1:3,2:0,7,0,3
chr6	144178419	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=141,131;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.715:12:1,4:2,4:3,0,6,3
chr6	144269123	.	TC	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=30,23;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:144269123_TC_T:144269123:6,6,2,0
chr6	144269125	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=194,116;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:3,0:9,2:0|1:144269123_TC_T:144269123:6,6,2,0
chr6	144509845	.	T	TA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=144,169;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=A;STR;TLOD=13.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:2,2:5,3:6,1,2,3
chr6	144511720	.	C	CT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=228,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.342:7:2,2:3,0:2,3,2,0
chr6	144512235	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=218,234;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr6	144512671	.	T	TA	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=11,12;RU=A;STR;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.922:10:0,5:0,5:0,0,3,7
chr6	144757090	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:11,4:8,0:10,9,4,0
chr6	144761429	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=191,185;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:2,2:3,1:5,0,2,1
chr6	144795922	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=145,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:7,0:7,2:4,10,0,2
chr6	144803541	.	ATTG	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=147,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=3.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.232:13:7,1:3,2:3,7,2,1
chr6	144809978	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=196,76;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:3,3:7,0:1,10,1,2
chr6	144835040	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=159,144;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:4,0:5,3:7,2,1,2
chr6	144843091	.	AT	A,TT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,28,28;MFRL=197,215,0;MMQ=60,60,60;MPOS=14,4;POPAF=7.30,7.30;TLOD=7.06,6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,3:0.446,0.336:7:0,1,1:1,2,2:1,0,4,2
chr6	144844188	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=151,107;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:4,2:15,0:14,5,2,0
chr6	144860586	.	G	GGCTGTTGTGAATCTTTTTTT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=160,123;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.182:20:7,3:10,0:12,5,0,3
chr6	144872272	.	G	GAC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=197,241;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=AC;STR;TLOD=6.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,1:1,1:0,2,0,3
chr6	145095557	.	TCCAA	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=151,98;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,2:0.375:6:2,0:2,2:0|1:145095557_TCCAA_T:145095557:1,3,0,2
chr6	145095564	.	G	GAT	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,35;MFRL=149,98;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:1,0:2,2:0|1:145095557_TCCAA_T:145095557:0,3,0,2
chr6	145114935	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=142,189;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=15.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:1,3:6,2:6,1,5,0
chr6	145118941	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=209,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr6	145120682	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=131,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:13,1:3,1:3,14,0,2
chr6	145124151	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=194,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:3,3,3,1
chr6	145124295	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=163,86;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=24.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.563:21:3,10:6,2:3,6,6,6
chr6	145148690	.	A	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=187,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=9.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.580:5:0,2:2,1:1,1,3,0
chr6	145157706	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,2:3,2:1,9,0,4
chr6	145162001	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=231,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.438:14:3,4:5,2:2,6,1,5
chr6	145167978	.	C	G	.	.	DP=44;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=162,120;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=32.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,14:0.332:43:17,7:12,7:13,16,10,4
chr6	145168013	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=211,115;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:9,2:4,7:2,11,3,6
chr6	146007166	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=219,199;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=28.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,4:1,5:1,0,9,0
chr6	146126419	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=188,94;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,5:1,1:4,2,4,2
chr6	146126950	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=162,71;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.150:24:14,0:7,3:6,15,1,2
chr6	146207465	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=29,27;MFRL=92,139;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,6:2,2:4,3,6,2
chr6	146207502	.	G	GT	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=223,137;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=T;STR;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.584:15:5,5:0,4:1,5,4,5
chr6	146207657	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=226,211;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:1,2,0,2
chr6	146216184	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,3:3,3:0,3,0,6
chr6	146239245	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=199,111;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,15:0.762:19:2,4:2,11:2,2,9,6
chr6	146243581	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=215,247;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.370:6:2,2:2,0:0,4,1,1
chr6	146244012	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=252,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:2,4:1,2:0,3,3,3
chr6	146244743	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=161,244;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,3:3,2:6,0,5,0
chr6	146247504	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=209,162;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr6	146262697	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.937:14:0,5:0,9:0,0,14,0
chr6	146264677	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,245;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=15.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:6,6:11,0:8,9,6,0
chr6	146268623	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,22;MFRL=125,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.358:17:8,4:3,1:7,4,4,2
chr6	146275979	.	T	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=184,151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.157:17:9,0:6,2:7,8,1,1
chr6	146480740	.	TTCTCTCTCTC	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=211,132;MMQ=55,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=19,14;RU=TC;STR;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.574:5:1,0:1,2:0,2,0,3
chr6	146708057	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=143,62;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,3:0.123:30:15,3:12,0:16,11,2,1
chr6	146720871	.	TC	GT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=241,183;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:146720871_TC_GT:146720871:0,3,0,1
chr6	146720875	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=241,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0|1:146720871_TC_GT:146720871:0,3,0,1
chr6	146755324	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=201,223;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=25.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.601:13:3,7:2,1:2,3,5,3
chr6	146870692	.	G	GA	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=132,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=5.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:10,0:8,2:0|1:146870692_G_GA:146870692:6,12,0,2
chr6	146870700	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=162,125;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.122:22:10,0:9,2:0|1:146870692_G_GA:146870692:8,12,0,2
chr6	146966010	.	G	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=139,160;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:7,4:6,2:6,7,2,4
chr6	146975204	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=187,270;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,2:1,0:2,0,2,0
chr6	146975384	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=185,76;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:7,0:4,3:3,10,1,2
chr6	146975456	.	TTA	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,246;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TA;STR;TLOD=10.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.819:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr6	146987930	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=235,85;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:3,2:6,0:6,4,1,1
chr6	147012191	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=177,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,0:3,3:5,0,3,0
chr6	147012362	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=118,94;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,2:0.115:24:7,0:15,2:0|1:147012362_T_G:147012362:6,16,0,2
chr6	147012367	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,33;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:7,0:13,2:0|1:147012362_T_G:147012362:6,14,0,2
chr6	147012372	.	C	CT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:147012362_T_G:147012362:6,14,0,2
chr6	147012373	.	C	CTCTCTCTCTCT	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=20,35;MFRL=113,94;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:20,2:0.125:22:6,0:13,2:0|1:147012362_T_G:147012362:6,14,0,2
chr6	147073639	.	TATA	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=152,157;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=6.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.243:10:6,2:2,0:6,2,2,0
chr6	147091741	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,198;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:9,5,2,0
chr6	147103358	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,149;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,4:0,6:0,0,2,8
chr6	147103416	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	147631201	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,36;MFRL=162,156;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:5,2:6,1:7,4,3,0
chr6	147635318	.	T	TAC	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=201,174;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=AC;STR;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:2,1:2,2:3,1,3,0
chr6	147635547	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=258,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.689:11:0,3:3,4:0,3,2,6
chr6	147680176	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=147,201;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:3,0:6,0,2,0
chr6	148761456	.	G	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=195,191;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=17.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,5:7,1:6,7,3,3
chr6	148761603	.	C	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=188,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,4:2,0:1,5,1,3
chr6	148792522	.	CTTT	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,87;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=27,24;RU=T;STR;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.484:4:0,0:1,2:1,1,2,0
chr6	148835436	.	CT	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=178,128;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=T;STR;TLOD=19.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,4:2,4:4,2,6,2
chr6	148835684	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr6	148840795	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=170,252;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.128:29:16,0:10,3:11,15,0,3
chr6	148853867	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,5,1
chr6	148854870	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=186,205;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:6,0,1,1
chr6	148861716	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=273,248;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,0:1,4:1,2,0,4
chr6	148865121	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=199,107;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:2,0:8,2:5,5,0,2
chr6	148867217	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=213,155;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,10:0.327:31:4,5:17,4:11,10,6,4
chr6	149274918	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=181,0;MMQ=60,35;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=7.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.372:11:4,2:3,1:6,1,0,4
chr6	149274938	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,21;MFRL=0,198;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:4,0:5,1:4,9,2,0
chr6	149275118	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=146,130;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=12.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:3,0:6,6:1,8,0,6
chr6	149285719	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=165,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,4:4,2:1,4,3,3
chr6	149285768	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=29,35;MFRL=157,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=28.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:0,4:2,4:0,2,0,8
chr6	149340390	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,1,5
chr6	149700577	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=169,121;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:7,0:9,2:9,7,1,1
chr6	149718650	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=142,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,4:0,3:1,0,7,0
chr6	149722333	.	TA	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=26,27;MFRL=154,136;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,3:0.120:31:9,3:16,0:16,12,2,1
chr6	149780695	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=175,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=16.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.532:11:1,2:4,3:2,3,4,2
chr6	149780737	.	G	GACTA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=189,127;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=ACTA;STR;TLOD=41.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:3,3:2,7:0,5,6,5
chr6	149795342	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=230,152;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=18.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:5,7:4,1:7,2,4,4
chr6	149795692	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=121,176;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.247:14:8,2:3,1:4,7,0,3
chr6	149826691	.	T	A	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=162,201;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,5:0.166:34:16,0:13,5:18,11,0,5
chr6	149842148	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=169,268;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=15,14;RU=A;STR;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:2,1:2,1:3,1,2,0
chr6	149855742	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=133,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,1:2,1:5,1,2,0
chr6	149862453	.	G	GTAAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=250,147;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=TAAA;STR;TLOD=10.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.626:6:1,1:1,0:2,0,3,1
chr6	149922782	.	G	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=134,92;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.186:14:3,1:9,1:7,5,2,0
chr6	149922909	.	T	TAGCTGGTAGTAC	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,22;MFRL=145,92;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.244:10:3,1:5,0:1,7,0,2
chr6	149953835	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=173,153;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=5.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:3,0,2,0
chr6	149997657	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=201,162;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:0|1:149997657_T_C:149997657:4,2,2,0
chr6	149997663	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=184,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:7,2:0.273:9:3,2:4,0:1|0:149997657_T_C:149997657:5,2,2,0
chr6	150004779	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=129,216;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.222:25:16,2:4,3:8,12,2,3
chr6	150063480	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=158,163;MMQ=60,45;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr6	150063495	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=173,142;MMQ=60,45;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:2,2:7,0:8,1,2,0
chr6	150064707	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=214,177;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=4.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:5,0,2,0
chr6	150123316	.	CTT	C,CT	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,35,34;MFRL=147,276,90;MMQ=60,60,60;MPOS=16,16;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=4.06,3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.272,0.272:8:1,2,0:3,0,2:4,0,3,1
chr6	150123401	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=139,0;MMQ=60,59;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:9,8,0,2
chr6	150210994	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=115,256;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,3:0.182:20:5,2:12,0:0|1:150210994_T_C:150210994:10,7,2,1
chr6	150210999	.	G	C	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,34;MFRL=115,256;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,3:0.173:21:5,3:13,0:0|1:150210994_T_C:150210994:10,8,2,1
chr6	150263186	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=43.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,11,1
chr6	150289707	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=121,244;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,3,0
chr6	150341990	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=129,186;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,7:0.500:14:2,3:5,3:0|1:150341990_A_G:150341990:6,1,6,1
chr6	150341993	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=129,166;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,6:0.466:13:2,2:5,3:0|1:150341990_A_G:150341990:6,1,5,1
chr6	150385730	.	T	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=180,118;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.454:20:6,5:5,4:9,2,4,5
chr6	150385886	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=113,221;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,2:9,2:4,13,2,2
chr6	150387302	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=162,150;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=23.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:0,5:1,1:1,0,0,6
chr6	150387312	.	A	G,C	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=29,32,29;MFRL=162,176,125;MMQ=60,60,60;MPOS=15,1;POPAF=7.30,7.30;TLOD=16.02,3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,4,1:0.556,0.222:6:0,3,1:1,1,0:1,0,0,5
chr6	150464356	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,405;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr6	150464625	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,20;MFRL=176,74;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,0:5,2:8,5,1,1
chr6	151116867	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,142;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:1,0,2,0
chr6	151121760	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=214,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=9.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.709:5:0,1:1,2:0,1,4,0
chr6	151125724	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=23,27;MFRL=277,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.840:14:0,6:1,5:2,0,9,3
chr6	151125896	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=202,183;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,7:1,5:1,0,5,7
chr6	151125975	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=181,290;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:2,0:1,2:0,3,0,2
chr6	151130691	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=182,241;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:2,1:2,3:3,2,1,3
chr6	151130958	.	T	TTG	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151130958_T_TTG:151130958:0,1,0,1
chr6	151130961	.	CAT	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=32,31;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151130958_T_TTG:151130958:0,1,0,1
chr6	151130966	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151130958_T_TTG:151130958:0,1,0,1
chr6	151130969	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=169,103;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0|1:151130958_T_TTG:151130958:0,1,0,1
chr6	151152499	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=122,79;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:11,2:5,0:14,2,2,0
chr6	151197152	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=320,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,4,3
chr6	151199071	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=216,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,0:1,4:0,1,0,4
chr6	151247439	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=28.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr6	151259770	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:6,2,2,0
chr6	151266504	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,86;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=11.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	151266564	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=125,129;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.273:20:9,4:6,1:9,6,4,1
chr6	151266717	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=20,27;MFRL=81,161;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:5,2:2,2:2,5,1,3
chr6	151270369	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=245,216;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr6	151281567	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,6:0,10:0,0,6,10
chr6	151286224	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=270,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=33.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,4:1,6:0,1,3,7
chr6	151336631	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=171,134;MMQ=60,59;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=24.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:7,7:8,0:0|1:151336631_C_T:151336631:12,4,7,0
chr6	151336633	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=171,134;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=24.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:16,7:0.320:23:8,7:8,0:0|1:151336631_C_T:151336631:12,4,7,0
chr6	151336739	.	C	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=117,257;MMQ=60,60;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,4:0.178:26:13,2:9,2:11,11,3,1
chr6	151358011	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=159,202;MMQ=49,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:3,2:4,1:6,1,2,1
chr6	151358072	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=169,111;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:8,3:9,6:11,6,5,4
chr6	151358075	.	AAC	A	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=28,29;MFRL=140,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=8.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.129:29:11,1:13,2:15,11,3,0
chr6	151358299	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=120,140;MMQ=60,51;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:1,5:0,4:0,1,1,8
chr6	151358325	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,200;MMQ=60,47;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,4:0,3:0,0,1,6
chr6	151362895	.	CTTG	C	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=35,33;MFRL=264,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTG;STR;TLOD=105.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,26:0.846:30:2,12:2,14:3,1,11,15
chr6	151362942	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=79.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.959:21:0,10:0,11:0,0,8,13
chr6	151670284	.	CT	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,20;MFRL=225,96;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.213:12:7,0:3,2:0|1:151670284_CT_C:151670284:7,3,1,1
chr6	151670286	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=225,96;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:0|1:151670284_CT_C:151670284:7,3,1,1
chr6	151672499	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=182,40;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:9,3:6,0:7,8,2,1
chr6	151672516	.	A	AGTTCAGTTGTAATAGCTTGCG	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=185,40;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,2:6,0:8,8,1,1
chr6	151674116	.	T	TGAG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=97,206;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAG;STR;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,2:2,1:0,2,2,1
chr6	151674326	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=139,196;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=36.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.670:16:2,6:3,5:3,2,2,9
chr6	151674566	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=28,19;MFRL=184,65;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:8,0:8,1:0|1:151674566_T_C:151674566:8,9,1,1
chr6	151674573	.	T	TATAC	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=182,65;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,2:0.136:20:9,0:9,2:0|1:151674566_T_C:151674566:9,9,1,1
chr6	151726300	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=125,123;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.387:11:1,1:6,3:5,2,3,1
chr6	151726829	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=207,149;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:2,2,5,0
chr6	151742541	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	151743629	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=134,160;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.530:15:3,3:4,5:4,3,6,2
chr6	151754273	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=25,20;MFRL=166,88;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:3,2:8,3:6,6,2,3
chr6	151857370	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,2,0
chr6	151857594	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,134;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=41.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,4:0,9:0,0,9,4
chr6	151859146	.	GT	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=171,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:4,0,2,0
chr6	151869725	.	A	AT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=10.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr6	151894278	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=24.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,4:0,4:0,0,5,3
chr6	151894625	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=160,77;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:4,1:11,2:7,8,1,2
chr6	152129399	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=179,162;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:1,3,1,1
chr6	152163882	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=174,0;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:6,1:5,1:4,7,2,0
chr6	152202007	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,250;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	152265282	.	A	AT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=332,195;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=T;STR;TLOD=29.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.891:16:0,6:1,8:1,0,15,0
chr6	152265728	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=262,183;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0,1,0,1
chr6	152446316	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:4,0:1,4:0|1:152446316_C_T:152446316:6,0,2,2
chr6	152446320	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=167,175;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,4:0.417:10:3,0:2,4:0|1:152446316_C_T:152446316:6,0,2,2
chr6	152461061	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,20;MFRL=171,105;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.196:13:4,0:6,2:7,4,1,1
chr6	152464839	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,170;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,8:0.391:21:6,4:7,4:4,9,5,3
chr6	152476952	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=119,174;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:2,4:1,2:3,0,5,1
chr6	152523143	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,201;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,3:0,4:0,2,0,7
chr6	152534946	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,2,5
chr6	152534978	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,192;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	152539326	.	CA	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=285,368;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.377:6:0,1:4,1:4,0,2,0
chr6	152539572	.	TA	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=127,295;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.592:8:1,2:2,2:0,3,1,4
chr6	152542548	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=140,256;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=9.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.161:29:12,3:13,1:12,13,1,3
chr6	152560916	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=212,326;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:0,2,0,4
chr6	152565792	.	CT	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=33,33;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,2:3,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,9,0,2
chr6	152565796	.	GT	TG	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=31,30;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:2,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,10,0,2
chr6	152565801	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=181,131;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.187:14:8,2:3,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,10,0,2
chr6	152565803	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=32,31;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:3,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,9,0,2
chr6	152565805	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=5;MBQ=25,32;MFRL=156,131;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:8,2:2,0:0|1:152565792_CT_C:152565792:2,9,0,2
chr6	152570415	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=123,197;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=23.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.752:10:2,4:0,4:2,0,3,5
chr6	152615042	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=157,248;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.209:17:7,1:7,2:7,7,2,1
chr6	152629586	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=212,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=45.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.877:14:0,9:1,4:1,0,11,2
chr6	152629617	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,12:0.682:17:3,6:2,5:3,2,7,5
chr6	152631833	.	T	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,27;MFRL=169,145;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=13.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.320:25:7,6:9,0:14,3,8,0
chr6	152638209	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,0,5
chr6	152658191	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=101,184;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr6	152660310	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=146,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:8,1,4,0
chr6	152671475	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=174,169;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=40.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.867:13:0,6:1,6:1,0,1,11
chr6	152671553	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=15,29;MFRL=174,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.636:3:0,1:0,1:0,1,1,1
chr6	152671919	.	G	GA	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=74,172;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=A;STR;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:0,4:2,11:2,0,2,14
chr6	152671975	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,148;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,0,7
chr6	152673519	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=20.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	152688567	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,217;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	152690559	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,1:0,3:0,0,3,1
chr6	152694424	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=32,35;MFRL=205,145;MMQ=60,28;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	152694437	.	TG	CA	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=29,36;MFRL=217,184;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.326:4:2,0:1,1:0|1:152694437_TG_CA:152694437:0,3,0,1
chr6	152694453	.	CA	TG	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,27;MFRL=217,184;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:152694437_TG_CA:152694437:0,3,0,1
chr6	152697706	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=333,223;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,0:1,2:2,2,0,2
chr6	152711395	.	T	A	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,27;MFRL=170,182;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:6,1:6,1:7,5,1,1
chr6	152711455	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=32,33;MFRL=167,147;MMQ=60,46;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.172:27:12,0:11,4:15,8,0,4
chr6	152711470	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=167,147;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.167:28:10,0:14,4:16,8,0,4
chr6	152711487	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=28,26;MFRL=170,147;MMQ=60,46;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,4:0.191:24:9,0:11,4:10,10,0,4
chr6	152720692	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=148,100;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=10.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,5:8,0:15,0,5,0
chr6	152722228	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=160,221;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:2,2:7,3:6,3,4,1
chr6	152725255	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,279;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:3,1:0|1:152725255_C_T:152725255:3,0,1,0
chr6	152725257	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=199,279;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:2,1:0|1:152725255_C_T:152725255:3,0,1,0
chr6	152740681	.	TA	T,TAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,26,25;MFRL=164,242,135;MMQ=60,60,60;MPOS=21,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,12,14;RU=A;STR;TLOD=4.66,5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,3,3:0.222,0.238:14:2,2,1:6,1,2:5,3,6,0
chr6	152751218	.	ATAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=150,203;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TAG;STR;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:2,0:5,2:4,3,2,0
chr6	152751398	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=160,137;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.286:16:3,3:8,1:0,12,0,4
chr6	152751558	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=220,250;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:4,1,1,1
chr6	152755149	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:152755149_A_G:152755149:0,2,0,1
chr6	152755156	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=186,209;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:152755149_A_G:152755149:0,2,0,1
chr6	152768796	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=151,264;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.293:15:3,2:8,2:2,9,2,2
chr6	152772264	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=121,209;MMQ=60,60;MPOS=21;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:4,1:6,1:7,3,1,1
chr6	152784054	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=221,202;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:3,3:5,1:4,4,0,4
chr6	152784075	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=212,200;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,3:3,0:1,3,0,3
chr6	152793375	.	TA	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=148,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=A;STR;TLOD=16.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.368:20:5,2:7,5:10,3,5,2
chr6	152793412	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=156,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=32.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,12:0.481:25:7,3:6,9:3,10,8,4
chr6	152809527	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=173,243;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,1:6,1:8,2,1,1
chr6	152823722	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=193,96;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr6	152826627	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=215,194;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	152847335	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=147,247;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:4,3:9,0:4,9,1,2
chr6	153332785	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=180,116;MMQ=60,48;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,3:0.173:21:9,3:9,0:10,8,3,0
chr6	153332926	.	AATAAT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=146,223;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:1,6,0,2
chr6	153345309	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,304;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	154412004	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,4,0
chr6	154414375	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=59.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,15,1
chr6	154414446	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,131;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=35.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,4,8
chr6	154429085	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=T;STR;TLOD=54.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,10:0,10:0,0,15,5
chr6	154431393	.	C	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=44.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,11,1
chr6	154535444	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=173,176;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=8.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:2,1:4,2:2,4,0,3
chr6	154567666	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=168,175;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=22.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:3,4:1,3:4,0,7,0
chr6	154727825	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=23,30;MFRL=134,70;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.645:12:1,5:3,3:1,3,5,3
chr6	154727852	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=152,140;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:154727852_T_C:154727852:0,3,0,1
chr6	154727854	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=27,26;MFRL=152,140;MMQ=60,40;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:154727852_T_C:154727852:0,3,0,1
chr6	154727868	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=156,140;MMQ=60,40;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:154727852_T_C:154727852:0,3,0,1
chr6	154735973	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=150,186;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr6	154749225	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=191,139;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,2:0,5:1,0,6,1
chr6	154762376	.	CAA	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=23,21;RU=A;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.673:4:0,0:1,1:0|1:154762376_CAA_C:154762376:1,0,1,2
chr6	154762394	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=184,124;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.666:4:0,1:1,1:0|1:154762376_CAA_C:154762376:1,0,1,2
chr6	155109168	.	GT	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=140,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.315:11:3,2:4,1:1,7,0,3
chr6	155114060	.	T	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=157,85;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.154:24:11,0:9,3:12,9,0,3
chr6	155116285	.	TTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=171,263;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,0:6,4:0,10,1,3
chr6	155124583	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=403,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr6	155126695	.	CTT	C,CT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=21,36,28;MFRL=180,204,219;MMQ=60,60,60;MPOS=22,19;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=T;STR;TLOD=4.10,3.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.272,0.275:8:0,0,0:2,2,1:0,4,0,4
chr6	155129784	.	CCTTT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=198,122;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:0,3:3,2:3,1,3,2
chr6	155131089	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=180,188;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=11.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:4,2:2,2:5,1,4,0
chr6	155131163	.	G	A	.	.	DP=42;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=142,124;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=48.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,17:0.410:42:15,9:10,8:16,9,17,0
chr6	155152311	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=168,231;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr6	155485535	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,27;MFRL=182,164;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:6,2,5,1
chr6	155485554	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=18.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,7:0.421:17:4,1:6,6:8,2,5,2
chr6	155504366	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=150,62;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.216:21:10,4:7,0:10,7,4,0
chr6	155561760	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,112;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=40.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0|1:155561760_T_C:155561760:0,0,4,8
chr6	155561770	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=108,114;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:4,1:9,1:0|1:155561760_T_C:155561760:5,8,0,2
chr6	155569378	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=186,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=21.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,3:1,4:0,2,0,7
chr6	155571113	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=36.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr6	155572986	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,232;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=19.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	155574198	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=20,28;MFRL=124,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,4:0.555:7:2,3:1,1:0|1:155574198_C_T:155574198:1,2,0,4
chr6	155574207	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=124,201;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.428:5:2,1:1,0:0|1:155574198_C_T:155574198:1,2,0,2
chr6	155575546	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=184,210;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:13,2:6,2:6,13,3,1
chr6	155579246	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=211,174;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:2,9:0,3:1,1,1,11
chr6	155581619	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=234,209;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:4,2:1,2:0,5,0,4
chr6	155597686	.	C	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=230,258;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr6	155635585	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=28,32;MFRL=148,167;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=34.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,12:0.591:20:2,5:6,7:4,4,6,6
chr6	155635624	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=28,33;MFRL=162,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=28.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:2,4:5,5:1,6,0,9
chr6	155635637	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=29,30;MFRL=162,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.612:16:1,4:5,6:0,6,0,10
chr6	155728311	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=216,153;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:6,3:11,3,0,3
chr6	155750219	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,156;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,3:0,1:0,2,1,3
chr6	155774613	.	CT	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,89;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,0:10,2:11,7,0,2
chr6	157405761	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=153,192;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.629:11:0,4:3,3:4,0,7,0
chr6	157431610	.	T	G	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=178,224;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=28.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,11:0.353:32:11,11:10,0:12,9,11,0
chr6	157495951	.	AT	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=153,185;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=10.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.309:29:8,0:9,9:16,4,8,1
chr6	157496158	.	T	TG	.	.	DP=59;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=102,137;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=37.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:42,13:0.248:55:19,0:23,13:10,32,0,13
chr6	157507456	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr6	157507504	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=151,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,1:7,2:13,3,1,2
chr6	157507698	.	G	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=123,214;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.153:24:13,2:8,1:9,12,2,1
chr6	157522360	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=202,191;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:7,3:8,2:8,7,4,1
chr6	157528106	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=195,141;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.134:20:9,0:9,2:6,12,2,0
chr6	158013897	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=205,295;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:6,3:4,2:4,6,1,4
chr6	158014255	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=180,280;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=15.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
chr6	158068481	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=196,194;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:2,1:3,2:0,5,0,3
chr6	158074504	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=16.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	158093660	.	CA	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,4:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,0,8,0
chr6	158093664	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=5;MBQ=0,26;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=35.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,8:0.900:8:0,2:0,3:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,0,8,0
chr6	158093669	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=0,12;MFRL=102,170;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=34.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,8:0.818:9:0,0:0,2:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,1,8,0
chr6	158093673	.	CGTG	C	.	.	DP=10;ECNT=5;MBQ=24,31;MFRL=102,162;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=28.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:1,0:0,5:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,3,7,0
chr6	158093679	.	CTGT	C	.	.	DP=9;ECNT=5;MBQ=33,32;MFRL=102,160;MMQ=60,60;MPOS=-4;POPAF=7.30;TLOD=24.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:2,1:1,4:0|1:158093660_CA_C:158093660:0,3,6,0
chr6	158294104	.	CT	C,CTT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,21,26;MFRL=178,159,99;MMQ=60,60,54;MPOS=8,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=16,15,17;RU=T;STR;TLOD=3.23,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:3,2,2:0.299,0.299:7:2,0,1:1,1,0:3,0,1,3
chr6	158322886	.	CT	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=164,278;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=3.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.361:11:2,1:2,2:7,0,3,1
chr6	158361899	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=209,127;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.778:16:2,7:1,6:1,2,9,4
chr6	158438933	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,2:0,2:0,3,0,4
chr6	158450118	.	T	TG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=16,31;MFRL=168,167;MMQ=60,50;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:0,1:1,1:0|1:158450118_T_TG:158450118:0,3,0,2
chr6	158450121	.	T	TCTCCTGCAGAGGG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=168,167;MMQ=60,50;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.429:5:2,1:1,1:0|1:158450118_T_TG:158450118:0,3,0,2
chr6	158486110	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=0,23;MFRL=0,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=4.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0|1:158486110_C_T:158486110:0,0,0,2
chr6	158486113	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:158486110_C_T:158486110:0,1,0,1
chr6	158486116	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,24;MFRL=192,196;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:158486110_C_T:158486110:0,1,0,1
chr6	158487406	.	A	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr6	158492839	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=191,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:5,0:8,2:2,11,0,2
chr6	158499097	.	G	GT	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=162,219;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=6.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr6	158502137	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=67,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:6,1:1,3:5,3,4,0
chr6	158502590	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=22.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,3:0,4:0,0,4,3
chr6	158504981	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=161,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,3:2,2:2,0,3,2
chr6	158514214	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=29,35;MFRL=226,134;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:0,1:0|1:158514214_T_C:158514214:0,4,0,1
chr6	158514222	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=226,134;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:158514214_T_C:158514214:0,4,0,1
chr6	158514226	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=226,134;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,1:0|1:158514214_T_C:158514214:0,4,0,1
chr6	158535688	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=123,70;MMQ=60,59;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:2,3:8,0:6,4,2,1
chr6	158535720	.	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=33,28;MFRL=179,137;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA;STR;TLOD=56.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,14:0.743:18:1,3:3,5:1,3,5,9
chr6	158549039	.	T	TAAA	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=0,26;MFRL=0,209;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=27,30;RU=A;STR;TLOD=6.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:0,0,2,0
chr6	158549067	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,15;MFRL=99,209;MMQ=60,40;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.600:3:0,0:1,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:1,0,2,0
chr6	158549074	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=32,10;MFRL=99,246;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:1,0,1,0
chr6	158549077	.	C	A	.	.	DP=2;ECNT=7;MBQ=31,15;MFRL=99,246;MMQ=60,40;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:1,0,1,0
chr6	158549079	.	T	A	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=24,15;MFRL=159,246;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:1,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:2,0,1,0
chr6	158549081	.	TC	AA	.	.	DP=3;ECNT=7;MBQ=25,15;MFRL=159,246;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:0,0:2,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:2,0,1,0
chr6	158549086	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=7;MBQ=28,16;MFRL=159,246;MMQ=60,40;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.395:3:0,0:2,0:0|1:158549039_T_TAAA:158549039:2,0,1,0
chr6	158569886	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=148,159;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:1,5:4,1:4,1,4,2
chr6	158571641	.	A	AACAG	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=207,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:158571641_A_AACAG:158571641:0,8,1,1
chr6	158571642	.	T	TCACTATTTCCATC	.	.	DP=10;ECNT=4;MBQ=33,20;MFRL=207,63;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.250:10:1,0:6,2:0|1:158571641_A_AACAG:158571641:0,8,1,1
chr6	158571643	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=207,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.247:10:2,0:6,1:0|1:158571641_A_AACAG:158571641:0,8,1,1
chr6	158571655	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=35,35;MFRL=205,205;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:0,1:4,2:0,4,0,3
chr6	158579237	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=189,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	158873376	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=169,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=14.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,4:4,1:0,7,0,5
chr6	158882836	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=142,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:4,3:3,1:0,7,0,4
chr6	158910543	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=136,231;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,2:2,1:4,0,2,1
chr6	158994577	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,118;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=60.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,18:0.951:18:0,10:0,8:0,0,6,12
chr6	159002119	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=169,73;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:5,2:1,0:0,6,0,2
chr6	159026194	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=20.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,6,0
chr6	159028203	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=141,141;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=22.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.803:8:0,3:1,4:1,0,7,0
chr6	159046076	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=179,170;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=24.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:1,1:0,8:1,0,7,2
chr6	159050943	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=223,187;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,2:3,0:0,8,0,2
chr6	159058589	.	ACCT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=187,145;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCT;STR;TLOD=35.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.557:16:1,5:6,4:3,4,7,2
chr6	159146622	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=140,80;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,2:0.106:26:12,0:11,2:17,7,1,1
chr6	159146690	.	CTTTTTTTG	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=169,157;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TTTTTTTG;STR;TLOD=14.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:7,2:5,3:3,9,1,4
chr6	159184462	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=110,182;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.501:16:3,4:5,4:3,5,4,4
chr6	159187877	.	GAC	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=192,209;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=16.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,3:1,2:8,0,5,0
chr6	159188128	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=186,125;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,13:0.584:22:6,9:3,4:3,6,6,7
chr6	159188282	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=166,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,2:5,2:4,6,2,2
chr6	159191788	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=133,172;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.319:23:8,5:8,2:7,9,4,3
chr6	159192214	.	T	TGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=152,204;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=G;STR;TLOD=19.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,4:2,1:3,0,4,1
chr6	159197371	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=159,184;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:7,0,2,0
chr6	159204786	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=238,251;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,4:1,1:0,4,0,5
chr6	159205632	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=198,142;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.473:17:6,2:3,6:8,1,5,3
chr6	159205668	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=168,107;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,15:0.470:32:9,7:8,8:12,5,8,7
chr6	159206251	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=194,220;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:4,3:0,1:4,0,4,0
chr6	159316430	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=201,166;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,0:1,2:0,5,0,2
chr6	159402038	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,23;MFRL=171,184;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:1,0:0,5,0,2
chr6	159646853	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=206,205;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,0:3,2:0,6,0,2
chr6	159647449	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=125,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.235:15:5,3:7,0:11,1,3,0
chr6	159653330	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=254,0;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=5.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:5,1:6,2:3,8,2,1
chr6	159657195	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr6	159659523	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,3:0,0:0,0,3,0
chr6	159660779	.	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,158;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCACCACCCGCCGCACGA;STR;TLOD=30.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.917:7:0,3:0,4:0,0,2,5
chr6	159660879	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=9;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.893:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr6	159670276	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,32;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=25.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr6	159670303	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr6	159670309	.	GCATT	G	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,31;MFRL=237,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:159670309_GCATT_G:159670309:0,4,0,1
chr6	159670315	.	T	TAA	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=32,26;MFRL=237,172;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:2,0:0|1:159670309_GCATT_G:159670309:0,4,0,1
chr6	159677498	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=176,178;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:6,4:2,5:5,3,6,3
chr6	159682198	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=129,189;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,2:0.604:3:1,0:0,2:0|1:159682198_A_G:159682198:0,1,2,0
chr6	159682206	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=21.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0|1:159682198_A_G:159682198:0,0,4,2
chr6	159689004	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=158,203;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0,6,1,3
chr6	159689049	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=35,30;MFRL=164,208;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,2:2,0:1,3,0,2
chr6	159692321	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=109,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=22.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,3:4,5:4,2,7,1
chr6	160106088	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,27;MFRL=281,150;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.668:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr6	160106125	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=26,35;MFRL=277,255;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:0,2,0,2
chr6	160114311	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=175,123;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:4,3:1,0:0,5,0,3
chr6	160174456	.	T	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=186,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=79.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,22:0.886:24:0,14:2,8:2,0,16,6
chr6	160188125	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=114,131;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.185:25:13,4:8,0:8,13,4,0
chr6	160199687	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=149,195;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=49.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,15:0.889:16:0,9:1,6:0,1,11,4
chr6	160201677	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,5:0,1:0,0,0,6
chr6	160202167	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=33.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,7:0,4:0,0,1,10
chr6	160207049	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=249,146;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.770:11:1,7:1,2:0,2,3,6
chr6	160208918	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=162,0;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,3:0.180:20:9,3:8,0:7,10,0,3
chr6	160211554	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=70.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.960:22:0,11:0,11:0,0,16,6
chr6	160211636	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=3;MBQ=0,29;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=91.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,13,15
chr6	160211645	.	GGTT	G	.	.	DP=29;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTT;STR;TLOD=118.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,17:0,11:0,0,15,13
chr6	160211728	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=57.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.946:16:0,7:0,9:0,0,1,15
chr6	160218605	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,256;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,3:0,0:0,0,0,3
chr6	160221475	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,133;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr6	160221488	.	G	GTGATTGCATATCAATGTGAAT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=146,119;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr6	160221690	.	GCTT	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=206,206;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CTT;STR;TLOD=35.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,3:1,6:1,0,8,1
chr6	160224346	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=29.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,7:0,2:0,0,3,6
chr6	160225559	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=58.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,11,5
chr6	160229889	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=185,205;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=56.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.813:19:1,10:2,6:3,0,9,7
chr6	160232921	.	GTTTTGT	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,202;MMQ=60,53;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr6	160234796	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=200,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=12.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr6	160236976	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=157,175;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:2,1,4,0
chr6	160237489	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,261;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.825:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	160237662	.	CTT	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=32,24;MFRL=0,119;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,15;RU=T;STR;TLOD=4.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.733:5:0,0:1,2:1,0,0,4
chr6	160237741	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=29,26;MFRL=171,191;MMQ=60,46;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,1:1,0:0|1:160237741_T_A:160237741:0,4,0,1
chr6	160237745	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=31,25;MFRL=177,191;MMQ=60,46;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0|1:160237741_T_A:160237741:0,3,0,1
chr6	160237751	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=4;MBQ=27,31;MFRL=197,191;MMQ=60,46;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:160237741_T_A:160237741:0,2,0,1
chr6	160239712	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=171,203;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,10:0.557:18:3,5:4,5:4,4,3,7
chr6	160328247	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=121,63;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.186:14:5,0:7,2:0|1:160328247_T_A:160328247:8,4,1,1
chr6	160328254	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:7,0:3,2:0|1:160328247_T_A:160328247:7,4,1,1
chr6	160328255	.	GAC	G	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=132,63;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.199:13:7,0:3,2:0|1:160328247_T_A:160328247:7,4,1,1
chr6	160328258	.	T	TTG	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=149,63;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:10,2:0.212:12:7,0:3,2:0|1:160328247_T_A:160328247:6,4,1,1
chr6	160453561	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=180,154;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=39.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:2,5:1,7:2,1,8,4
chr6	160464289	.	G	A	.	.	DP=45;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=215,145;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=111.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,38:0.867:43:4,23:1,15:2,3,25,13
chr6	160465486	.	TTGTC	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=219,158;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:6,1:4,2:9,2,3,0
chr6	160465753	.	T	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=300,184;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=24.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,5:1,2:0,1,0,7
chr6	160468383	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=213,170;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:1,2,1,2
chr6	160479051	.	G	A	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=105,231;MMQ=60,59;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,9:0.270:35:11,9:15,0:14,12,9,0
chr6	160479882	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=36,26;MFRL=269,209;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:5,0,2,0
chr6	160481537	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=167,168;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=14.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:3,2:5,3:5,3,3,2
chr6	160483635	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=107,170;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=14.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,8:0.265:31:14,0:9,7:8,15,0,8
chr6	160489215	.	CAG	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=246,117;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=46.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.863:12:0,5:1,6:1,0,7,4
chr6	160492930	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=132,132;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.207:22:11,3:7,1:11,7,3,1
chr6	160499277	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=146,158;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,3:11,0:13,7,2,1
chr6	160524671	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=208,233;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr6	160524946	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=215,153;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=21.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,8:0.429:19:8,0:3,8:0,11,0,8
chr6	160553230	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=31,25;MFRL=129,113;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,0:5,2:6,3,2,0
chr6	160553238	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=108,121;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,2:5,4:4,5,5,1
chr6	160557569	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=234,177;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:3,1:5,2:4,4,3,0
chr6	160560742	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=155,84;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.110:25:12,2:10,0:8,15,1,1
chr6	160560845	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=28,31;MFRL=191,178;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=39.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.766:15:1,4:2,8:1,2,5,7
chr6	160560880	.	CATG	C	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=33,33;MFRL=180,259;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=14.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:5,1:3,2:1,7,2,2
chr6	160560897	.	CTGGTAAGT	C	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=183,217;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGTAAGT;STR;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,4:0,6:0,4,1,9
chr6	160560933	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=282,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:3,2:5,2:1,7,1,3
chr6	160564476	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=187,232;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr6	160575985	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=200,144;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,0:1,5:0,2,0,5
chr6	160576953	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=206,143;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.333:22:6,7:9,0:13,2,7,0
chr6	160579527	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=118,151;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=17.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:4,3:0,4:3,1,6,1
chr6	160645750	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=140,126;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:9,1:10,1:13,6,1,1
chr6	160663230	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=233,155;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:6,0,2,0
chr6	160666660	.	A	AC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=202,211;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=8.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:0,2,0,3
chr6	160668186	.	CCT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=219,227;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,2:4,2:2,2,1,3
chr6	160668389	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=208,62;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,0:3,2:0,5,0,2
chr6	160670178	.	TAAGG	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=180,228;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAGG;STR;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr6	160670378	.	C	T	.	.	DP=38;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=163,121;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:30,3:0.113:33:18,0:12,3:14,16,0,3
chr6	160670494	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=172,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:3,1:0,7,0,3
chr6	160671500	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=195,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=16.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,3:3,2:5,0,4,1
chr6	160831939	.	T	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=191,240;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:0,2,0,2
chr6	160857762	.	G	GT	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=160,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=6.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.666:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr6	160868701	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=273,183;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:0,3:2,3:2,0,4,2
chr6	160962135	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=164,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.353:15:5,4:5,1:6,4,3,2
chr6	160966409	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=208,170;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=13.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.533:11:2,5:3,1:5,0,5,1
chr6	160966603	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=142,40777;MMQ=60,35;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,2:5,0:1,7,0,2
chr6	160968929	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=179,196;MMQ=51,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:3,1:3,1:2,4,0,2
chr6	160969738	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=36,32;MFRL=200,79;MMQ=60,42;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:3,3:7,1:2,8,0,4
chr6	160978442	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=210,196;MMQ=52,56;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,1:4,1:5,4,1,1
chr6	161007538	.	G	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=120,221;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:5,1:9,1:9,5,1,1
chr6	161010554	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,193;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,3:4,0:3,6,2,1
chr6	161010766	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=125,157;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:5,2:1,1:3,3,0,3
chr6	161012101	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=178,114;MMQ=60,55;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.249:26:13,0:7,6:9,11,0,6
chr6	161071303	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,169;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:8,1,2,0
chr6	161071623	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,24;MFRL=224,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,2:5,0:0,7,0,2
chr6	161128922	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=127,117;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.468:11:3,2:2,3:0,6,1,4
chr6	161137663	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=186,116;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=11.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:4,2:6,2:7,3,3,1
chr6	161143376	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=185,132;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:3,0:2,3:4,1,3,0
chr6	161143608	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=117,92;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=14.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.362:20:5,2:8,5:3,10,3,4
chr6	161143634	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:1,3:4,1:1,4,1,3
chr6	161152294	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=245,121;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,0:3,3:2,1,0,3
chr6	161154932	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=34,10;MFRL=260,184;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:3,0:1,0:5,0,1,0
chr6	161154955	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=121,277;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,3:1,1:4,0,4,0
chr6	161160083	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=153,174;MMQ=60,51;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=32.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:1,7:0,4:0,1,7,4
chr6	161502094	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=165,175;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,9:0.625:14:2,5:3,4:2,3,4,5
chr6	161509003	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=32.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr6	161514114	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=147,215;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=8.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.364:14:6,0:3,4:1,8,0,5
chr6	161514173	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=32,24;MFRL=221,231;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr6	161519350	.	CCTG	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=CTG;STR;TLOD=35.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.931:9:0,5:0,4:0,0,6,3
chr6	161527831	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=155,133;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=8.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr6	161531006	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=54.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,0,17
chr6	161532855	.	CT	C	.	.	DP=39;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=257,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=T;STR;TLOD=103.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,34:0.947:35:1,14:0,20:0,1,19,15
chr6	161557703	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=14.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,1,3
chr6	161565305	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,66;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.434:14:8,1:0,5:1,7,3,3
chr6	161574367	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=196,221;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.265:13:6,0:4,3:8,2,0,3
chr6	161586840	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=242,216;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:0,1,0,2
chr6	161771219	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=161,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,4:0.184:25:13,2:8,2:11,10,2,2
chr6	161990483	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=166,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.562:14:3,2:3,6:0,6,2,6
chr6	161990516	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=33,36;MFRL=189,184;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,1:2,5:0,4,0,6
chr6	162622304	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=142,227;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,2:4,0:1,5,1,1
chr6	162864317	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=217,121;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.544:9:3,4:1,1:3,1,4,1
chr6	163235158	.	AT	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=183,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.347:9:1,2:4,1:6,0,3,0
chr6	163836376	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=184,166;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:1,9,0,2
chr6	163899794	.	CT	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=207,250;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.343:12:4,1:4,3:6,2,4,0
chr6	165693624	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=225,179;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:0,3,2,3
chr6	165695049	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=106,182;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:4,1:5,1:6,3,0,2
chr6	165806114	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=144,130;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.311:14:4,0:6,4:5,5,2,2
chr6	165809963	.	CA	C,CAA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,34,35;MFRL=103,72,163;MMQ=60,60,60;MPOS=29,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,9,11;RU=A;STR;TLOD=3.24,3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,2,2:0.206,0.206:12:2,1,0:6,1,2:3,5,0,4
chr6	165827194	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=167,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.704:8:1,3:1,3:1,1,1,5
chr6	165863695	.	C	CA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=30.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,5:0,3:0,0,6,3
chr6	165989776	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=7.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr6	166075362	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,181;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr6	166075428	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=89,177;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=18.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,8:0.250:34:1,0:25,8:21,5,0,8
chr6	166572005	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=204,136;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=23.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,8:0.646:12:1,3:2,5:1,3,5,3
chr6	166574246	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=347,194;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=17.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,1:1,5:2,0,6,0
chr6	166721424	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=170,243;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:1,0,1,1
chr6	166736235	.	CA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=179,165;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=A;STR;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,3:1,0:2,0,2,1
chr6	166736362	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=147,137;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.304:21:8,4:7,2:8,7,2,4
chr6	166737980	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=188,137;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=39.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,15:0.593:25:4,6:6,9:7,3,10,5
chr6	166741921	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=180,224;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:2,1:1,3:0,3,0,4
chr6	166743760	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=148,200;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,3:2,3:1,3,1,5
chr6	166796433	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=141,156;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr6	166831694	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=83,158;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:7,5:2,1:5,4,2,4
chr6	166844057	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=151,80;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:7,1:4,1:5,6,1,1
chr6	166862136	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.891:7:0,2:0,3:0,0,7,0
chr6	166862308	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=216,76;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:8,0:7,3:10,5,2,1
chr6	166862431	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=211,237;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:8,1:4,1:0,12,0,2
chr6	166889160	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=189,390;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,1:0,1:3,0,2,0
chr6	166889331	.	CAG	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=141,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AG;STR;TLOD=12.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.229:24:13,0:4,5:7,12,3,2
chr6	166922813	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,166;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:8,3,2,0
chr6	167352104	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=218,158;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,2:0,1:3,0,3,0
chr6	167352564	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=258,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:2,0:0,1:0|1:167352564_G_A:167352564:0,2,0,1
chr6	167352573	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=25,29;MFRL=258,172;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:0,1:0|1:167352564_G_A:167352564:0,2,0,1
chr6	167360104	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=138,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:1,2:3,1:4,0,2,1
chr6	167365862	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=190,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=14.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:2,4:2,1:4,0,5,0
chr6	167369748	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.683:1:0,0:0,1:0|1:167369748_C_T:167369748:0,0,0,1
chr6	167369751	.	G	GA	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:167369748_C_T:167369748:0,0,0,1
chr6	167427114	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=171,77;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.427:12:6,3:1,2:2,5,3,2
chr6	167447489	.	CT	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=20,33;MFRL=85,240;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.449:5:1,1:2,1:1,2,1,1
chr6	167453519	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,25;MFRL=187,206;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=12,13;RU=T;STR;TLOD=5.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,2:2,1:1,3,0,3
chr6	167453529	.	T	TCTC	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,29;MFRL=230,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:6,1:4,1:1,9,0,2
chr6	167549477	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=213,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr6	167590454	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=151,110;MMQ=39,21;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:1,0:3,3:2,3,3,0
chr6	167592464	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,220;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=22.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,2:0,4:0,0,6,0
chr6	167592656	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.906:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr6	167595183	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,216;MMQ=60,27;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,2,0
chr6	167595326	.	C	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=160,191332;MMQ=27,25;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:8,5:3,0:6,5,5,0
chr6	167595418	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=182,126;MMQ=27,27;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:3,1:1,2:1,3,0,3
chr6	167704944	.	T	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=61,161;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.815:14:1,7:1,5:2,0,8,4
chr6	167709501	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=166,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=34.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:3,5:4,7:5,2,9,4
chr6	167711418	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=149,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.332:16:4,1:7,4:9,2,4,1
chr6	167728640	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=177,136;MMQ=27,27;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.330:10:3,1:4,2:7,0,2,1
chr6	167728900	.	TC	CG	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=179,143;MMQ=60,33;MPOS=3;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:8,1:10,1:6,12,2,0
chr6	167752312	.	GTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=35,20;MFRL=148,53;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=10,4;RU=TTCC;STR;TLOD=6.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.373:7:2,0:3,2:0|1:167752312_GTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC_G:167752312:1,4,1,1
chr6	167752345	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=20,35;MFRL=53,167;MMQ=60,58;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:3,1:0.328:4:0,0:3,1:1|0:167752312_GTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC_G:167752312:1,2,0,1
chr6	167752359	.	C	CTCT	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=20,30;MFRL=53,167;MMQ=60,58;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.400:3:0,0:2,1:1|0:167752312_GTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC_G:167752312:1,1,0,1
chr6	167754439	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=156,133;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,2:0.111:25:8,0:15,2:4,19,0,2
chr6	167754764	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=174,133;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:8,2:5,0:8,5,1,1
chr6	167786643	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=171,166;MMQ=27,39;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.141:19:6,0:10,2:12,5,2,0
chr6	167789615	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=160,238;MMQ=52,57;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:4,3,1,3
chr6	167791406	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=159,144;MMQ=34,27;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=6.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.305:11:5,1:3,2:6,2,3,0
chr6	167791536	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=92,93;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,8:0.600:13:1,7:4,1:2,3,3,5
chr6	167796415	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,167;MMQ=60,46;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.897:7:0,1:0,6:0,0,3,4
chr6	168298875	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=61.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.955:20:0,11:0,9:0,0,13,7
chr6	168316118	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=141,192;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=40.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:0,4:4,8:2,2,6,6
chr6	168319356	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=117,193;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=5.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:3,0,2,0
chr6	168348504	.	CT	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=138,173;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.515:6:1,3:1,0:3,0,2,1
chr6	168349011	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=96,267;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,5:0.249:22:4,3:13,2:9,8,2,3
chr6	168377695	.	G	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=199,136;MMQ=60,53;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:2,1:1,0:0,3,0,1
chr6	168440639	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=168,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr6	168440829	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=190,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:5,2:1,0:1,5,2,0
chr6	168458074	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=174,255;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.696:8:1,3:1,2:0,2,1,5
chr6	168466504	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,1,2
chr6	168468098	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=176,95;MMQ=60,59;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,9:0.322:29:9,0:11,9:11,9,9,0
chr6	168468186	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=155,164;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.618:11:1,2:3,5:2,2,1,6
chr6	168475822	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=122,215;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=10.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr6	168479790	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.750:10:1,3:1,3:1,1,1,7
chr6	168708027	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=223,158;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:168708027_G_T:168708027:2,0,1,0
chr6	168708045	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=24,35;MFRL=174,158;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:1,1:2,0:0|1:168708027_G_T:168708027:3,0,1,0
chr6	168927213	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=204,270;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:1,6,0,3
chr6	168928225	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=176,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.664:10:1,4:2,2:3,0,7,0
chr6	168928251	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=200,256;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:3,3:8,0:9,2,3,0
chr6	168947956	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=235,257;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:5,1:1,1:0,6,0,2
chr6	169008822	.	TC	T	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=165,100;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=C;STR;TLOD=30.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,16:0.555:29:11,6:1,8:2,11,10,6
chr6	169008945	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,272;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=8.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:9,1:9,3:5,13,1,3
chr6	169064735	.	C	CT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=127,211;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,1:6,1:4,5,2,0
chr6	169067074	.	G	A	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=128,174;MMQ=60,54;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:33,9:0.227:42:19,9:14,0:13,20,9,0
chr6	169617934	.	GA	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=262,140;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=A;STR;TLOD=42.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.855:18:1,5:1,11:1,1,9,7
chr6	169620247	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr6	169622263	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=195,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,2:0,0:4,0,2,0
chr6	169626218	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=24,12;MFRL=137,195;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.394:8:0,0:3,1:4,1,3,0
chr6	169628169	.	CAA	C,CA	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=17,34,33;MFRL=75,67,225;MMQ=60,60,60;MPOS=16,15;POPAF=7.30,7.30;RPA=15,13,14;RU=A;STR;TLOD=3.59,3.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,2,2:0.299,0.351:6:0,2,2:0,0,0:0,2,4,0
chr6	169628245	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=3;MBQ=29,25;MFRL=120,128;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,4:0.131:36:20,3:12,1:18,14,1,3
chr6	169628284	.	G	A	.	.	DP=31;ECNT=3;MBQ=31,24;MFRL=121,126;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,3:0.127:29:17,3:9,0:12,14,0,3
chr6	169629783	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=222,140;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.519:19:6,4:3,4:1,8,5,5
chr6	169634809	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=153,235;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.143:19:8,2:9,0:9,8,2,0
chr6	169635010	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=166,238;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:4,3:4,1:2,6,1,3
chr6	169635020	.	CA	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=173,253;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,2:3,1:2,7,1,2
chr6	169637763	.	G	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=198,182;MMQ=60,60;MPOS=27;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.334:10:4,2:2,1:1,6,1,2
chr6	169640529	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=169,178;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.272:20:8,3:7,2:8,7,2,3
chr6	169646202	.	GCACACACATACACA	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=152,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.359:12:2,3:2,1:8,0,4,0
chr6	169982927	.	T	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=223,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.223:25:11,3:8,2:16,4,5,0
chr6	170038674	.	T	C	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,9:0.312:30:8,4:13,5:10,11,4,5
chr6	170049421	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,20;MFRL=137,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.395:8:4,3:1,0:1,4,2,1
chr6	170059145	.	AAC	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=175,195;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=AC;STR;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.236:15:6,1:6,2:9,3,2,1
chr6	170059234	.	C	G	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=34,31;MFRL=205,118;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.261:21:9,3:7,2:10,6,2,3
chr6	170068025	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=180,205;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:4,2:1,0:5,1,2,0
chr6	170068058	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=167,205;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:5,2:4,0:5,4,2,0
chr6	170103140	.	CCA	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=135,158;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=26.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.346:24:10,3:6,5:9,7,6,2
chr6	170103636	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=180,143;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=10.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.249:18:7,2:7,2:6,8,1,3
chr6	170103943	.	T	TA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=205,160;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=24.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:7,4:5,4:6,6,2,6
chr6	170106419	.	CTT	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=122,243;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=3,1;RU=T;STR;TLOD=16.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.284:19:5,3:9,2:6,8,2,3
chr6	170115779	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=149,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.314:17:6,3:6,2:9,3,2,3
chr6	170118085	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,4:0,1:0,0,0,5
chr6	170155331	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=160,148;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.434:21:6,4:6,5:11,1,6,3
chr6	170159023	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=225,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=41.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,13:0.824:15:1,8:1,5:2,0,12,1
chr6	170160870	.	G	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=137,247;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:9,10,0,2
chr6	170162515	.	A	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=167,106;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,4:0.263:16:7,1:5,2:8,4,2,2
chr6	170169819	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=209,186;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:1,9,0,2
chr6	170176407	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=104,162;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:0,4:2,1:2,0,6,0
chr6	170176787	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,27;MFRL=151,184;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=15.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:4,4:1,2:1,4,1,5
chr6	170176847	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=151,218;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr6	170181708	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,244;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr6	170594819	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,222;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,5,6
chr6	170595430	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,8:0,1:0,0,1,8
chr6	170627651	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=154,164;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,14:0.783:17:3,5:0,3:1,2,8,6
chr6	170632383	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=196,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:12,2:4,0:2,14,1,1
chr6	170844377	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,151;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:7,0:12,2:9,10,1,1
chr6	170858045	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=149,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=13.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:2,4:4,2:4,2,5,1
chr6	170871013	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=233,199;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.347:22:7,4:8,3:9,6,5,2
chr6	170871046	.	ACAG	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,237;MMQ=60,40;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=CAG;STR;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.878:3:0,0:0,2:0,0,1,2
chr6	170876017	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=146,117;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:7,2,2,0
chr6	170888012	.	T	TCTTTGG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,20;MFRL=160,65;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:8,2:3,0:0|1:170888012_T_TCTTTGG:170888012:4,7,1,1
chr6	170888014	.	A	ATTCAGTTGAG	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=25,25;MFRL=160,65;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.198:13:8,1:3,0:0|1:170888012_T_TCTTTGG:170888012:4,7,1,1
chr6	170892100	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=147,146;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=55.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,16:0.896:17:0,8:1,8:0,1,10,6
chr6	170892848	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=146,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.429:12:3,1:4,4:0,7,0,5
chr6	170892919	.	T	TACTC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=258,248;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,1:0,3:0,1,0,4
chr7	197316	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=228,138;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.230:14:7,1:4,1:6,5,0,3
chr7	197535	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,2,6
chr7	538191	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=4;MBQ=30,30;MFRL=144,207;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:6,2:11,0:10,7,0,2
chr7	538277	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=4;MBQ=34,26;MFRL=156,0;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=10.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,3:0.308:11:4,2:3,0:0|1:538277_G_C:538277:2,6,1,2
chr7	538284	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=4;MBQ=30,34;MFRL=166,99;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.385:11:3,2:3,2:0|1:538277_G_C:538277:1,6,1,3
chr7	538348	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=27,30;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr7	551946	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr7	591125	.	C	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=166,195;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:12,0:6,2:6,12,0,2
chr7	618855	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=169,158;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=15.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.507:12:3,2:2,4:3,3,4,2
chr7	618869	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=169,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=19.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:4,4,5,3
chr7	646958	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=185,150;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.213:17:4,1:9,2:10,4,3,0
chr7	751220	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	780980	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=48.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.939:14:0,11:0,3:0,0,9,5
chr7	794471	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=0,34;MFRL=0,209;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=35.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.915:9:0,2:0,7:0,0,2,7
chr7	794549	.	TA	T	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=26,27;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:794549_TA_T:794549:0,1,0,1
chr7	794551	.	GC	G	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=35,35;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:794549_TA_T:794549:0,1,0,1
chr7	796692	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=0,383;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:796692_C_T:796692:0,1,0,1
chr7	796700	.	A	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=26,21;MFRL=0,383;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:796692_C_T:796692:0,2,0,1
chr7	803342	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	808749	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=216,206;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=17.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:5,6:3,1:7,1,6,1
chr7	813618	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=38.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.927:11:0,5:0,6:0,0,11,0
chr7	813650	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=52.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.945:16:0,9:0,6:0,0,12,4
chr7	813867	.	C	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,255;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.888:7:0,5:0,1:0,0,0,7
chr7	814612	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=75.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,25:0.964:25:0,7:0,18:0,0,17,8
chr7	825114	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=49.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,9,4
chr7	881858	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=18.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,1,5
chr7	882601	.	T	A	.	.	DP=47;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,190;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,4:0.108:44:24,4:16,0:17,23,4,0
chr7	882829	.	GT	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=205,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.321:16:4,2:6,3:8,3,3,2
chr7	890978	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=252,166;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=39.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.816:14:1,6:1,6:0,2,11,1
chr7	891184	.	C	CGAT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=191,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GAT;STR;TLOD=24.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:0,3,0,6
chr7	899710	.	A	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,210;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=22.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.888:6:0,4:0,2:0,0,6,0
chr7	905786	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=263,172;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,1:0,4:0,1,0,5
chr7	912755	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=209,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,8:0.751:10:2,4:0,4:2,0,8,0
chr7	926962	.	G	A	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=171,138;MMQ=60,59;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:27,6:0.190:33:16,0:11,5:0|1:926962_G_A:926962:18,9,6,0
chr7	926970	.	C	G	.	.	DP=33;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=140,193;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:26,6:0.205:32:14,2:12,4:1|0:926962_G_A:926962:19,7,5,1
chr7	939896	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=35,22;MFRL=257,214;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:939896_C_T:939896:0,4,0,1
chr7	939903	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,35;MFRL=257,214;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:939896_C_T:939896:0,4,0,1
chr7	939909	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=33,34;MFRL=257,214;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:939896_C_T:939896:0,4,0,1
chr7	939915	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,30;MFRL=257,214;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0|1:939896_C_T:939896:0,4,0,1
chr7	940258	.	G	GGGCAAAGGCA	.	.	DP=24;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=176,145;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=67.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,16:0.810:19:1,9:2,6:1,2,8,8
chr7	940267	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=29,31;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=71.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,17:0.820:20:1,11:2,6:1,2,9,8
chr7	940296	.	AGCGCTGGGGTCCCCACAGAG	A	.	.	DP=17;ECNT=4;MBQ=29,27;MFRL=229,146;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=18.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.473:11:1,3:2,2:1,5,1,4
chr7	940298	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=24,33;MFRL=370,157;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.842:10:1,5:0,4:0,1,3,6
chr7	940501	.	AGAAGGGCC	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=390,207;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=GAAGGGCC;STR;TLOD=29.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:1,1:0,4:1,0,7,0
chr7	940724	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=223,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=23.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,8:0.826:9:1,3:0,5:0,1,2,6
chr7	943998	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=200,195;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:1,2:1,1:1,1,0,3
chr7	944683	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,22;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,4,2
chr7	974905	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=4;MBQ=29,32;MFRL=210,199;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:3,3:2,3:4,1,3,3
chr7	974960	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=4;MBQ=33,35;MFRL=279,155;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:2,3:0,3:1,1,4,2
chr7	974987	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=4;MBQ=31,17;MFRL=170,155;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=7.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.442:9:1,0:2,0:0|1:974987_C_G:974987:0,5,4,0
chr7	974998	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=4;MBQ=30,12;MFRL=170,167;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:1,0:3,0:0|1:974987_C_G:974987:0,5,2,0
chr7	1012822	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=176,134;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,3:7,0:10,3,3,0
chr7	1131356	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=24,30;MFRL=124,230;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.366:20:6,4:6,3:9,4,3,4
chr7	1132394	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=161,106;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.120:23:9,2:12,0:14,7,2,0
chr7	1195089	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=139,109;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:10,0:4,2:10,4,0,2
chr7	1481919	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=30.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,9:0.915:9:0,5:0,4:0|1:1481919_C_A:1481919:0,0,4,5
chr7	1481936	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=186,186;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.200:13:5,1:6,1:0|1:1481919_C_A:1481919:4,7,2,0
chr7	1482101	.	C	G	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=137,224;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:8,0:11,4:4,15,2,2
chr7	1482134	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=197,137;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=7.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.249:14:2,2:9,1:2,9,0,3
chr7	1511319	.	G	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=125,269;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:1,2:7,1:2,6,1,2
chr7	1511964	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.178:15:7,0:5,2:5,8,1,1
chr7	1517194	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=176,143;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:6,1,1,1
chr7	1518336	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=239,274;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:3,0,4,0
chr7	1519011	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=20,32;MFRL=98,141;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.488:6:0,2:3,0:2,1,3,0
chr7	1519892	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=229,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,2:4,1:7,0,2,1
chr7	1519946	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=251,218;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.461:11:3,5:3,0:5,1,4,1
chr7	1520902	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=225,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:1,2:4,0:4,1,2,0
chr7	1522157	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=181,152;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0|1:1522157_T_C:1522157:4,1,2,0
chr7	1522175	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=39.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0|1:1522157_T_C:1522157:0,0,9,2
chr7	1523559	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=254,232;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:2,0,1,2
chr7	1526903	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=170,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=7.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,3:2,0:3,1,3,0
chr7	1527687	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=258,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,0,4
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=133,157;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=57.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,15:0.887:20:5,1:0,1:5,0,9,6
chr7	1529201	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=166,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,4:0.217:21:8,3:9,1:14,3,2,2
chr7	1532631	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=152,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:3,1:1,4:4,0,4,1
chr7	1533556	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=20,27;MFRL=176,246;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.287:12:2,3:3,0:2,7,0,3
chr7	1533566	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=23,32;MFRL=112,197;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.540:11:4,5:1,1:2,3,0,6
chr7	1534425	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,0:0,6:0,0,4,2
chr7	1534593	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=169,203;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr7	1535051	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=120,148;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:4,0,2,0
chr7	1538499	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=33,33;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:3,2:10,1:2,11,2,1
chr7	1538539	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=27,34;MFRL=175,236;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:0,0:4,4:1,3,2,2
chr7	1538614	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=189,175;MMQ=60,60;MPOS=13;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:2,1,2,0
chr7	1540049	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,3:0,2:0,0,0,5
chr7	1579908	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=26,29;MFRL=136,245;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:10,6,0,2
chr7	1579998	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=163,59;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.166:16:6,2:6,0:11,3,2,0
chr7	1586662	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=143,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,2:3,0:6,1,2,0
chr7	1588391	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=202,213;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr7	1589083	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=9.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	1590368	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,34;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	1590443	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=29,25;MFRL=223,146;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:4,1:2,3:6,0,2,2
chr7	1786938	.	C	CCA	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=197,253;MMQ=56,50;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=CA;STR;TLOD=5.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.527:4:1,1:1,1:1,1,1,1
chr7	1787003	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=179,50;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.379:6:2,2:1,0:3,1,2,0
chr7	1787519	.	TA	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=26,24;MFRL=180,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=7.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.416:13:3,2:3,1:4,4,3,2
chr7	1787675	.	G	GTGCACCCATCACCCGAGCAGTGTA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=238,152;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr7	1886805	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=98,203;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=10.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.675:4:1,1:0,2:1,0,3,0
chr7	1887442	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=36,34;MFRL=184,156;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:1,1:3,1:0,4,0,2
chr7	1938031	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,26;MFRL=216,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,3:4,0:5,3,1,2
chr7	1976556	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=206,164;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.444:16:6,2:3,5:1,8,0,7
chr7	2054314	.	CG	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,10;MFRL=153,207;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=G;STR;TLOD=7.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:5,1:0,0:2,3,0,3
chr7	2119447	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=181,138;MMQ=60,54;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:7,0:9,4:4,12,0,4
chr7	2252817	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=206,111;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,7:0.363:20:7,6:6,1:7,6,5,2
chr7	2257732	.	A	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=219,147;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=18.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:2,0:6,7:2,6,0,7
chr7	2258899	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=14.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	2260482	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=25,32;MFRL=159,193;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.188:14:6,1:5,1:9,3,2,0
chr7	2260499	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,26;MFRL=159,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.588:15:2,5:4,4:4,2,7,2
chr7	2260715	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=221,220;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,2:0,0:0,1,0,2
chr7	2269552	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=264,185;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=21.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:1,4:2,4:3,0,8,0
chr7	2289586	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=204,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=12.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.399:13:6,2:2,3:3,5,2,3
chr7	2289710	.	G	C	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,35;MFRL=159,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	2290372	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=184,289;MMQ=50,55;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.571:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr7	2290433	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=133,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,5:4,1:7,4,5,1
chr7	2290685	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=160,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:3,0:2,2:0,5,0,2
chr7	2296493	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=43.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,9:0,4:0,0,8,5
chr7	2297212	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=232,210;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:3,0:0,2:2,1,1,1
chr7	2304191	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,249;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	2314652	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=283,193;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,0:1,2:2,0,2,0
chr7	2317934	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=163,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.333:10:3,1:4,2:2,5,0,3
chr7	2349366	.	CA	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=170,139;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.255:13:2,2:6,1:6,4,2,1
chr7	2349608	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:1,3:3,4:0,4,0,7
chr7	2406737	.	CAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=18,35;MFRL=199,133;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=17,14;RU=A;STR;TLOD=3.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.351:4:0,0:1,1:1,2,0,1
chr7	2409035	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=22.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,2:0,6:0,0,8,0
chr7	2412493	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	2414142	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=71.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,12:0,10:0,0,16,6
chr7	2418715	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=246,84;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=6.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,3:5,0:7,2,2,1
chr7	2473747	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=141,189;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.355:12:5,3:2,1:0,8,0,4
chr7	2552881	.	AGATG	A	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=182,179;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=GATG;STR;TLOD=6.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.207:12:5,2:2,0:5,5,1,1
chr7	2552986	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=25,34;MFRL=220,129;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,10:0.579:17:5,5:2,5:3,4,4,6
chr7	2565268	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=59.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,17:0.947:17:0,11:0,6:0|1:2565268_C_A:2565268:0,0,11,6
chr7	2565283	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=10.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,5:0.272:20:12,2:3,3:0|1:2565268_C_A:2565268:12,3,3,2
chr7	2587122	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=199,260;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:3,1:4,1:2,5,0,2
chr7	2618070	.	C	CA	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=104,193;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.564:14:4,1:2,7:3,3,3,5
chr7	2621567	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=242,260;MMQ=56,40;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,2:1,2:2,0,4,0
chr7	2623801	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=157,115;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.683:10:0,2:2,5:2,1,5,2
chr7	2626038	.	CCAGGGAATGG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CAGGGAATGG;STR;TLOD=18.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.759:6:0,2:1,2:0,1,0,5
chr7	2627578	.	CAG	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=166,136;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:4,3:1,0:1,4,2,1
chr7	2632724	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=140,98;MMQ=60,48;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=11.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.193:34:10,0:18,6:12,16,6,0
chr7	2634449	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=28,12;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:2634449_A_C:2634449:0,1,1,0
chr7	2634453	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,15;MFRL=0,144;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:2634449_A_C:2634449:0,1,1,0
chr7	2638278	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=27,32;MFRL=173,216;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:7,1:6,1:2,11,1,1
chr7	2638347	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,34;MFRL=243,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:4,1:2,3:0,6,0,4
chr7	2640985	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=20,25;MFRL=124,111;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.463:9:0,3:4,1:4,1,2,2
chr7	2641059	.	CT	C	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=177,183;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=7.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.390:13:3,0:3,5:5,3,5,0
chr7	2646723	.	A	G	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=147,187;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=32.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,10:0.524:19:6,4:3,6:5,4,7,3
chr7	2647048	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=240,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:3,1:0,5,0,3
chr7	2647058	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=226,249;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.299:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr7	2649673	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=26,31;MFRL=143,159;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.136:20:10,2:8,0:10,8,1,1
chr7	2649704	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=160,159;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=8.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:7,4:12,0:10,9,3,1
chr7	2686737	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=191,134;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,2:3,1:4,0,3,0
chr7	2686761	.	G	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=168,134;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,7:0.570:12:3,3:2,4:5,0,4,3
chr7	2687160	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=227,107;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:2,0,1,1
chr7	2689472	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=169,210;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.700:8:1,3:1,3:2,0,5,1
chr7	2691736	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=168,185;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.499:8:0,2:4,2:3,1,3,1
chr7	2696067	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=144,122;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:10,0:6,2:10,6,0,2
chr7	2696189	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=187,180;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.271:9:4,1:3,1:2,5,0,2
chr7	2699687	.	C	CG	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=58.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.954:19:0,10:0,9:0,0,6,13
chr7	2773035	.	C	CAT	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=172,138;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=60.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,17:0.692:24:5,7:2,8:5,2,12,5
chr7	2834869	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=238,218;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:3,1:2,1:0,5,0,2
chr7	2853995	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=187,111;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.357:26:8,5:9,4:7,10,5,4
chr7	2854010	.	G	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=184,105;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,11:0.413:27:6,7:10,4:7,9,4,7
chr7	2946552	.	C	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:1,2:0,2:0,1,0,4
chr7	2954801	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=32.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,2:0,7:0,0,9,0
chr7	2955097	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=240,186;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,2:1,2:0,2,0,4
chr7	2958298	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=306,173;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	2958986	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=182,177;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=3.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.118:23:16,2:5,0:15,6,1,1
chr7	2962241	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,32;MFRL=166,233;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=22.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:1,1,6,1
chr7	2985361	.	GACAC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=13,11;RU=AC;STR;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.686:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	3179968	.	T	G	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,0,6
chr7	3179973	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=21.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,5:0.864:5:0,0:0,5:0|1:3179968_T_G:3179968:0,0,0,5
chr7	3179991	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=22.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	3180550	.	C	CT	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,26;MFRL=334,261;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=16,17;RU=T;STR;TLOD=4.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.609:3:0,1:0,0:1,0,2,0
chr7	3180657	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,171;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,9:0,8:0,0,10,7
chr7	3188513	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=3;MBQ=0,35;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=11.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	3188549	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,233;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=14.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	3188576	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,33;MFRL=0,215;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=29.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	3188712	.	A	C	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,146;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=93.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,13:0,13:0,0,10,16
chr7	3188738	.	G	C	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=54.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.950:17:0,9:0,8:0,0,5,12
chr7	3991646	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=266,183;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.316:17:6,2:6,3:0,12,0,5
chr7	4002204	.	G	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,35;MFRL=212,190;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,2:1,0:4,0,2,0
chr7	4002375	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=204,125;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,9:0.332:28:11,5:8,4:9,10,4,5
chr7	4119285	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=156,209;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=12.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:3,2:3,2:0,6,1,3
chr7	4152863	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=210,151;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:5,0:5,4:8,2,4,0
chr7	4153647	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=156,113;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:7,0:4,2:8,3,1,1
chr7	4166959	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=264,169;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,4,0
chr7	4185313	.	T	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=162,151;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=28.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.480:23:5,10:6,0:10,2,0,11
chr7	4185592	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=27,24;MFRL=218,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,3:5,3:2,6,2,4
chr7	4189020	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,0:6,2:5,4,1,1
chr7	4214046	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=247,178;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,1:2,2:0,3,2,1
chr7	4259708	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=204,168;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.449:18:8,4:2,4:10,0,6,2
chr7	4259953	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,29;MFRL=243,200;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr7	4259989	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,33;MFRL=224,240;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=9.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:4,2:0,1:0,4,0,3
chr7	4272845	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=221,180;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:4,1:0,1:3,1,1,1
chr7	4277443	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=190,128;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.216:12:6,2:3,0:3,7,0,2
chr7	4795076	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=216,183;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:0,9,0,2
chr7	4827497	.	C	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4827497_C_A:4827497:0,0,0,1
chr7	4827498	.	CG	C	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=G;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4827497_C_A:4827497:0,0,0,1
chr7	4827500	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,27;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4827497_C_A:4827497:0,0,0,1
chr7	4827508	.	C	G	.	.	DP=1;ECNT=4;MBQ=0,35;MFRL=0,213;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:4827497_C_A:4827497:0,0,0,1
chr7	4830103	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=110,82;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.158:17:10,0:5,2:7,8,1,1
chr7	4831061	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=162,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,2:0.124:22:11,1:9,1:5,15,1,1
chr7	4839163	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=164,155;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:3,1:4,1:5,3,0,2
chr7	4839993	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=247,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,1:1,1:0,4,0,2
chr7	4841470	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=6;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,0:0,4:0,0,3,1
chr7	4843244	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=145,136;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:2,2:5,0:4,3,1,1
chr7	4871879	.	C	CAT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=187,201;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=14.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:3,3:4,1:3,4,1,3
chr7	4946973	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=3;MBQ=0,27;MFRL=0,220;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,3:0,8:0,0,8,3
chr7	4946983	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=33,34;MFRL=247,189;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:2,2:7,2:6,3,3,1
chr7	4947013	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=237,135;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.380:19:4,4:8,3:8,4,5,2
chr7	5026170	.	TA	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,217;MMQ=60,39;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=17.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.864:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	5104833	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=215,177;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.233:15:8,2:4,1:8,4,3,0
chr7	5112108	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=168,232;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=3.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:5,2:5,0:3,7,0,2
chr7	5232881	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,203;MMQ=60,43;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=36.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,1,11
chr7	5239319	.	TA	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=226,143;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=A;STR;TLOD=3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.497:4:1,2:1,0:0,2,0,2
chr7	5257490	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=58.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.947:17:0,10:0,7:0,0,15,2
chr7	5262385	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=158,182;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:4,4:5,2:1,8,0,6
chr7	5267911	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=200,262;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=6.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:3,2:1,0:0,4,0,2
chr7	5269424	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=225,187;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:1,3:0,3,0,7
chr7	5327680	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=47.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.941:14:0,7:0,6:0,0,2,12
chr7	5331307	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,246;MMQ=60,28;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=12.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	5334378	.	T	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,1,0
chr7	5334469	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=34,25;MFRL=118,198;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=24.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.406:20:7,3:5,5:9,3,7,1
chr7	5334472	.	CCT	C,CCTCT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,34,34;MFRL=100,132,227;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=7,6,8;RU=CT;STR;TLOD=4.87,24.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:9,2,7:0.146,0.364:18:5,1,3:4,1,4:6,3,8,1
chr7	5334636	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=128,237;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:4,1:1,1:0,5,0,2
chr7	5336855	.	TCCCTTCTCTGTC	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=244,207;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CCCTTCTCTGTC;STR;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.407:3:1,1:1,0:0|1:5336855_TCCCTTCTCTGTC_T:5336855:0,2,0,1
chr7	5336885	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=25,30;MFRL=226,233;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=13.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:0|1:5336855_TCCCTTCTCTGTC_T:5336855:0,1,0,4
chr7	5338770	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=231,253;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:1,3,1,2
chr7	5340002	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,4,0
chr7	5342413	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=158,184;MMQ=60,45;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.130:21:10,1:9,1:4,15,2,0
chr7	5348468	.	T	TGC	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=27,15;MFRL=157,281;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=5.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.442:7:1,1:3,0:0|1:5348468_T_TGC:5348468:1,3,3,0
chr7	5348472	.	CAA	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,31;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.453:9:1,1:3,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:1,4,4,0
chr7	5348478	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=7;MBQ=34,22;MFRL=164,200;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,4:0.453:9:2,0:2,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:1,4,4,0
chr7	5348482	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=7;MBQ=27,29;MFRL=165,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=12.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.499:8:2,1:2,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:0,4,4,0
chr7	5348485	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,31;MFRL=156,200;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=11.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,4:0.383:11:2,1:2,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:3,4,4,0
chr7	5348488	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=7;MBQ=28,32;MFRL=155,220;MMQ=55,49;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.253:10:3,0:4,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:3,5,2,0
chr7	5348491	.	A	C	.	.	DP=11;ECNT=7;MBQ=27,28;MFRL=156,220;MMQ=50,49;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,2:0.233:11:3,0:4,2:0|1:5348468_T_TGC:5348468:4,5,2,0
chr7	5369489	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=150,124;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=15.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:3,0,5,1
chr7	5369522	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=35,32;MFRL=255,134;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=42.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,13:0.876:14:0,7:1,6:0,1,8,5
chr7	5391424	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,20;MFRL=164,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.318:23:9,6:7,1:11,5,3,4
chr7	5396459	.	GGC	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,36;MFRL=325,293;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0,1,1,0
chr7	5396955	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=231,171;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,1:0,1:0,2,0,2
chr7	5401688	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:0|1:5401688_G_A:5401688:0,1,0,1
chr7	5401691	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=137,0;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,1:0,0:0|1:5401688_G_A:5401688:0,1,0,1
chr7	5410425	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=291,154;MMQ=60,60;MPOS=4;PON;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.702:8:1,4:1,2:1,1,4,2
chr7	5416947	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=31,12;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5416953	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,1:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5416957	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=25,22;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5416960	.	C	CCCCA	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=32,35;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,3:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5416962	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=5;MBQ=29,12;MFRL=149,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,3:0.667:4:1,0:0,0:0|1:5416947_G_C:5416947:0,1,3,0
chr7	5430283	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=181,150;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=26.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:1,4:2,6:1,2,1,9
chr7	5487458	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=54.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.944:16:0,7:0,9:0,0,9,7
chr7	5529758	.	G	A	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=174,154;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=28.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,13:0.515:25:5,5:7,7:1,11,3,10
chr7	5529922	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,36;MFRL=268,209;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,0:2,2:0,3,0,2
chr7	5530782	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=180,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr7	5530827	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=174,92;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.356:12:0,1:8,3:4,4,3,1
chr7	5540769	.	A	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=60.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,19:0.952:19:0,11:0,8:0,0,14,5
chr7	5567596	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=189,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,8:0.257:33:15,3:10,5:12,13,3,5
chr7	5568366	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,26;MFRL=156,152;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.249:25:9,3:10,2:5,14,1,5
chr7	5569327	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=168,181;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.374:14:6,2:3,3:4,5,4,1
chr7	5642987	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=144,235;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.332:13:6,3:3,1:6,3,2,2
chr7	5662647	.	C	T	.	.	DP=34;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=152,106;MMQ=60,55;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:30,3:0.114:33:12,0:17,3:0|1:5662647_C_T:5662647:22,8,0,3
chr7	5662653	.	C	T	.	.	DP=35;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=151,106;MMQ=60,55;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:32,3:0.108:35:13,0:19,3:0|1:5662647_C_T:5662647:22,10,0,3
chr7	5662658	.	C	G	.	.	DP=36;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=150,106;MMQ=60,55;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:33,3:0.105:36:12,0:18,3:0|1:5662647_C_T:5662647:23,10,0,3
chr7	5752513	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=190,117;MMQ=60,54;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.280:23:9,0:7,6:3,14,0,6
chr7	5760860	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=220,189;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	5780537	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=258,133;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:4,1:0,0:5,1,2,0
chr7	5800769	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,159;MMQ=60,39;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	5920406	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,46;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=26.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr7	5923682	.	G	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=122,209;MMQ=27,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.330:7:2,2:3,0:2,3,0,2
chr7	5941209	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=172,147;MMQ=47,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:3,3:5,2:6,2,2,3
chr7	5941354	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=158,111;MMQ=30,39;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=16.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,8:0.409:20:8,6:4,2:5,7,4,4
chr7	5941411	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=177,112;MMQ=49,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=11.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,2,3
chr7	5944687	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=199,186;MMQ=45,43;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=13.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.466:13:4,3:3,3:4,3,1,5
chr7	5944913	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=301,247;MMQ=34,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,2:2,0:2,0,0,2
chr7	5958650	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=156,132;MMQ=27,27;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr7	5959661	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=146,137;MMQ=27,27;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:6,1:2,1:0,8,0,2
chr7	5965214	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=178,170;MMQ=27,26;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=6.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,2:9,2:11,8,4,0
chr7	5965229	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=178,218;MMQ=27,27;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.220:16:6,2:7,1:6,7,2,1
chr7	5965381	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=35,20;MFRL=188,86;MMQ=27,21;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:2,0:2,3:3,1,1,2
chr7	5965398	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=30,20;MFRL=158,86;MMQ=27,21;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:2,1:1,2:3,0,2,1
chr7	5967980	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=156,158;MMQ=27,27;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,5:0.221:25:13,4:7,1:12,8,0,5
chr7	5968053	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=149,151;MMQ=27,30;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=6.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.494:8:2,3:2,1:0,4,2,2
chr7	5983195	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,147;MMQ=60,36;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,1:0,3:0,0,0,4
chr7	6037057	.	GAAAA	G,GA,GAA	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=10,36,16,19;MFRL=103,138,184,146;MMQ=60,60,60,60;MPOS=27,18,20;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=17,13,14,15;RU=A;STR;TLOD=3.62,3.20,4.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:4,2,4,5:0.125,0.225,0.386:15:0,2,1,0:1,0,1,2:1,3,3,8
chr7	6038722	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,34;MFRL=152,167;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=24.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:0,2:4,5:1,3,2,5
chr7	6038998	.	AC	CA	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=157,153;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,1:0.333:4:1,0:2,1:0,3,0,1
chr7	6055081	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=164,135;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:2,1:3,1:0,5,1,1
chr7	6062926	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,15;MFRL=268,207;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.499:6:0,0:1,0:3,0,3,0
chr7	6062931	.	C	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=18,17;MFRL=302,201;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:0,0:0,0:2,0,3,0
chr7	6064470	.	CT	C,CTT	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=23,20,17;MFRL=239,161,215;MMQ=60,60,50;MPOS=21,22;POPAF=7.30,7.30;RPA=17,16,18;RU=T;STR;TLOD=3.09,3.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,3,2:0.443,0.333:6:1,1,0:0,1,0:0,1,0,5
chr7	6066057	.	G	GC	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=161,120;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=40.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,13:0.538:24:5,6:6,6:5,6,6,7
chr7	6071277	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=22,34;MFRL=122,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=32.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.834:10:1,3:0,6:0,1,0,9
chr7	6076963	.	C	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=172,126;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:2,3:7,0:9,0,3,0
chr7	6078376	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=153,198;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=14.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.719:5:1,3:0,1:0,1,0,4
chr7	6084310	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=231,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=28.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.714:12:2,6:1,3:0,3,0,9
chr7	6088339	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=23,35;MFRL=187,182;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=27.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,7:0.727:9:0,3:2,3:0|1:6088339_T_C:6088339:2,0,5,2
chr7	6088349	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=162,177;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=23.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,6:0.636:9:0,4:3,2:0|1:6088339_T_C:6088339:3,0,4,2
chr7	6088533	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,0:5,4:0,5,0,4
chr7	6156411	.	T	C	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=172,85;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,4:0.171:27:16,3:7,0:9,14,4,0
chr7	6175633	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=192,219;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=19,18;RU=T;STR;TLOD=3.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.615:3:0,0:0,1:0,1,0,2
chr7	6185194	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=176,198;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.156:17:5,0:10,2:8,7,2,0
chr7	6185680	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,127;MMQ=60,50;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6185680_G_T:6185680:0,0,1,0
chr7	6185683	.	A	ACC	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,18;MFRL=0,127;MMQ=60,50;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=1,3;RU=C;STR;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:6185680_G_T:6185680:0,0,1,0
chr7	6185686	.	CCA	C	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,127;MMQ=60,50;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:6185680_G_T:6185680:0,0,1,0
chr7	6185968	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=267,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.607:3:0,1:1,1:0,1,2,0
chr7	6189717	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=28,25;MFRL=146,213;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=18.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,8:0.362:23:4,7:10,1:8,7,3,5
chr7	6189750	.	C	T	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=194,210;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:4,7:4,2:4,4,3,6
chr7	6189780	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=27,32;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=31;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.223:16:7,1:5,2:5,8,2,1
chr7	6193464	.	T	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=151,147;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:3,0:4,2:0,7,0,2
chr7	6193521	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=207,243;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=11.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:2,2:1,2:3,0,1,3
chr7	6194429	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=157,208;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.227:11:4,1:5,1:0,9,0,2
chr7	6204498	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=188,153;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:4,1:2,1:5,1,1,1
chr7	6210444	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=202,245;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,0:5,2:6,3,0,2
chr7	6213396	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=143,180;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=9.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:2,3:4,1:1,5,2,2
chr7	6230059	.	GTT	G	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=33,35;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=18,16;RU=T;STR;TLOD=3.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,1:0.250:6:2,1:1,0:4,1,1,0
chr7	6230097	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=32,15;MFRL=95,183;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:8,0:2,0:2,8,2,0
chr7	6230210	.	A	ATGAATTC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=194,171;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:1,1:0,0:0,1,0,1
chr7	6230269	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,35;MFRL=0,357;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	6442142	.	AC	CA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,25;MFRL=172,109;MMQ=39,43;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.420:5:1,1:2,0:0,3,0,2
chr7	6470296	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:5,1:0|1:6470296_A_T:6470296:1,4,0,2
chr7	6470299	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=24,31;MFRL=111,180;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:5,2:0.333:7:0,1:4,1:0|1:6470296_A_T:6470296:1,4,0,2
chr7	6470331	.	A	T	.	.	DP=1;ECNT=3;MBQ=0,32;MFRL=0,111;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	6474362	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=182,156;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=23.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,9:0.370:25:9,9:7,0:12,4,9,0
chr7	6476180	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=154,158;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:6,2:7,0:3,10,2,0
chr7	6485740	.	CA	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=146,165;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=A;STR;TLOD=5.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.331:10:0,0:6,2:0,7,1,2
chr7	6487293	.	G	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=47.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr7	6513779	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=174,180;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=11.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:4,1:4,3:7,1,4,0
chr7	6522129	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=227,180;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=20.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.495:18:6,3:3,5:6,3,4,5
chr7	6537566	.	CA	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=227,166;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:1,2:4,2:4,2,3,1
chr7	6537913	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=193,135;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:5,0:2,2:0,7,0,2
chr7	6541347	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,220;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:2,3:1,2:3,0,5,0
chr7	6542532	.	T	G	.	.	DP=42;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,142;MMQ=60,22;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=30.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,16:0.394:41:10,0:15,16:10,15,0,16
chr7	6545619	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=261,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,0:1,3:0,3,0,3
chr7	6550479	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=34,26;MFRL=155,185;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.214:12:4,0:6,2:7,3,2,0
chr7	6550494	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,147;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=39.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,5:0,8:0,0,9,4
chr7	6566442	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,0,2
chr7	6628242	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=173,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,8:0.300:28:8,5:12,3:13,7,5,3
chr7	6639687	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,25;MFRL=144,80;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:7,3:9,0:11,5,3,0
chr7	6639953	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=175,175;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=15.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:4,2:2,4:1,5,0,6
chr7	6641635	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=184,226;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.272:9:4,1:3,1:6,1,2,0
chr7	6661256	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.206:22:10,4:8,0:9,9,2,2
chr7	6661480	.	ACAG	A	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=152,210;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAG;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.150:18:8,0:8,2:9,7,1,1
chr7	6732315	.	A	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=183,108;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=18.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,7:0.348:21:5,3:9,4:5,9,1,6
chr7	6744690	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=221,53;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:5,0:3,2:6,2,2,0
chr7	6798742	.	G	GACTGATT	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=227,201;MMQ=33,33;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	6806605	.	G	A	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=204,244;MMQ=45,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	6845516	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=149,201;MMQ=27,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=46.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,17:0.784:21:2,8:2,9:4,0,13,4
chr7	6845594	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=3;MBQ=32,30;MFRL=142,172;MMQ=27,24;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.454:9:0,1:5,3:3,2,1,3
chr7	6845671	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=35,27;MFRL=193,205;MMQ=27,27;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=6.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,2:0,4,0,3
chr7	6852522	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=195,181;MMQ=27,33;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:2,0,2,0
chr7	6854512	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,216;MMQ=60,52;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,1,1
chr7	6861880	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=167,206;MMQ=60,27;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,4:1,0:1,0,2,2
chr7	7277807	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=213,214;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,9:0.772:11:1,4:1,5:2,0,8,1
chr7	7398457	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=233,142;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=49.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,16:0.773:20:2,7:2,9:1,3,4,12
chr7	7400239	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=216,237;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=6.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,2:1,0:0,1,0,2
chr7	7421310	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=199,143;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=36.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.847:11:1,6:0,4:0,1,1,9
chr7	7459602	.	AT	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:8,2:13,0:0|1:7459602_AT_A:7459602:5,21,1,1
chr7	7459606	.	C	G	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=174,66;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,2:0.100:28:11,2:15,0:0|1:7459602_AT_A:7459602:5,21,1,1
chr7	7472438	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=177,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,1:2,1:0,2,0,2
chr7	7480376	.	C	CA	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=207,128;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=A;STR;TLOD=34.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,13:0.611:21:6,4:2,7:7,1,9,4
chr7	7483350	.	C	CAGGCAGTAAGTGTGGAGAGG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,20;MFRL=160,57;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.200:13:9,2:2,0:2,9,1,1
chr7	7491873	.	AG	CT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=56.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.933:13:0,6:0,7:0,0,13,0
chr7	7493244	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=276,197;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:3,1:0,1:0,3,0,2
chr7	7528951	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,155;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=30.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,8:0,2:0,0,8,2
chr7	7545571	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=159,229;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,1:3,1:7,0,2,0
chr7	7557297	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=36.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,4:0,6:0,0,10,0
chr7	7571094	.	G	C	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=10;PON;POPAF=7.30;TLOD=86.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,24:0.962:24:0,11:0,13:0,0,10,14
chr7	7622696	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=44.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,14,1
chr7	7628275	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,206;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=38.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,7:0,5:0,0,0,12
chr7	7645535	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,9,3
chr7	7677569	.	A	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=29,35;MFRL=143,214;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=7.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.198:18:6,0:9,3:8,7,0,3
chr7	7916817	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=21.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,6:0.700:8:0,2:2,3:0|1:7916817_A_G:7916817:1,1,5,1
chr7	7916824	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,26;MFRL=151,190;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=18.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,5:0.667:7:0,2:2,3:0|1:7916817_A_G:7916817:1,1,4,1
chr7	8043504	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=175,274;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,2:6,2:7,2,4,0
chr7	8110475	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=188,186;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.556:16:3,5:4,4:7,0,8,1
chr7	8110773	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=198,211;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:1,10,0,7
chr7	8125964	.	C	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,29;MFRL=120,292;MMQ=60,60;MPOS=5;PON;POPAF=7.30;TLOD=27.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,11:0.462:24:7,6:6,5:5,8,6,5
chr7	8126040	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=33,27;MFRL=208,108;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=9.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,5:0.230:24:7,0:12,5:9,10,0,5
chr7	8126096	.	CCAG	C	.	.	DP=20;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=222,163;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=4,3;RU=CAG;STR;TLOD=5.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:5,1:8,1:7,7,2,0
chr7	8126194	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=193,252;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=20.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,4:6,3:1,10,1,6
chr7	8181286	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=201,318;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,0:6,2:8,1,2,0
chr7	8181555	.	C	CCA	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=221,180;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=CA;STR;TLOD=23.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.920:10:1,4:0,4:0,1,0,9
chr7	8196529	.	A	T	.	.	DP=22;ECNT=4;MBQ=27,27;MFRL=199,178;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,20:0.875:22:1,6:1,14:1,1,13,7
chr7	8196559	.	TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	T	.	.	DP=36;ECNT=4;MBQ=25,26;MFRL=207,189;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=25,6;RU=A;STR;TLOD=6.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:29,3:0.117:32:9,2:12,1:19,10,2,1
chr7	8196566	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=29,29;MFRL=194,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.274:23:7,4:9,3:10,6,5,2
chr7	8196567	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	.	.	DP=32;ECNT=4;MBQ=0,29;MFRL=0,196;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=28.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.962:20:0,9:0,11:0,0,13,7
chr7	8261042	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=161,359;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:6,1:8,1:6,8,0,2
chr7	8268155	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=169,181;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=10.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.389:13:4,2:4,2:8,0,2,3
chr7	8790549	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=135,184;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:3,1:3,2:6,0,3,0
chr7	10973362	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=215,144;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=19.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.615:11:3,4:1,3:0,4,1,6
chr7	11021935	.	TTG	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=141,149;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TG;STR;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.302:10:3,0:3,3:7,0,3,0
chr7	11022230	.	A	G	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=173,211;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=59.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,18:0.732:24:2,10:4,8:2,4,14,4
chr7	11030274	.	G	GT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,36;MFRL=184,171;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.301:8:2,1:4,0:6,0,2,0
chr7	11053282	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=157,264;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,2:3,0,3,0
chr7	11076514	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=183,251;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=3.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:6,0:2,2:8,0,2,0
chr7	11078283	.	CA	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=193,247;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.399:8:4,1:0,2:5,0,3,0
chr7	11091425	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=141,181;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=9.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.347:15:7,2:3,3:1,9,1,4
chr7	11101394	.	GTT	G,GT	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=33,33,33;MFRL=142,117,161;MMQ=60,60,60;MPOS=16,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=11,9,10;RU=T;STR;TLOD=3.11,6.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:12,2,4:0.118,0.245:18:3,1,2:6,1,2:9,3,4,2
chr7	11208989	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=132,210;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.167:16:8,0:6,2:11,3,1,1
chr7	11416378	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,32;MFRL=213,191;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=16.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.601:8:1,3:2,2:0,3,0,5
chr7	11418931	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=221,154;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=19.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,7:0.320:23:5,2:11,5:9,7,3,4
chr7	11419378	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=191,239;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=43.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,12:0.868:13:0,9:1,3:0,1,0,12
chr7	11422310	.	G	GTATT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=143,311;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TATT;STR;TLOD=9.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.443:7:1,1:3,1:0,4,0,3
chr7	11446769	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=225,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,1:3,2:0,10,1,2
chr7	11446902	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=162,258;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,1:5,2:8,2,3,0
chr7	11485591	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=235,290;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=11.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:5,0,4,0
chr7	11487100	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,20;MFRL=180,84;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.362:9:4,0:2,3:0,6,1,2
chr7	11509438	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=95,169;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=12.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,5:0.333:16:9,4:1,1:0|1:11509438_A_G:11509438:7,4,4,1
chr7	11509439	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=151,74;MMQ=60,24;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:14,3:0.209:17:11,3:3,0:1|0:11509438_A_G:11509438:9,5,2,1
chr7	11521542	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=27,29;MFRL=186,120;MMQ=60,60;MPOS=11;PON;POPAF=7.30;TLOD=13.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:8,4:9,2:11,6,3,3
chr7	11521609	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=3;MBQ=32,32;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=6.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,3:0.152:24:11,0:9,3:9,12,0,3
chr7	11521631	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=25,29;MFRL=173,149;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,3:0.149:22:11,0:8,2:3,16,0,3
chr7	11581003	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=151,267;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=12.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.286:19:8,4:6,1:10,4,4,1
chr7	11630298	.	C	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=272,104;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.624:22:5,11:3,3:3,5,2,12
chr7	11633193	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,167;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:3,1:5,5:0,8,0,6
chr7	12263799	.	TG	CA	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=169,183;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,0:5,4:9,0,3,1
chr7	12269260	.	A	ATGTT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=104,161;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=43.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:4,4:2,7:4,2,9,2
chr7	12270565	.	A	AT	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=180,266;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=17.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:3,2:0,4:3,0,6,0
chr7	12270625	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=31,30;MFRL=169,155;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,3:0.332:10:6,1:1,2:5,2,3,0
chr7	12270770	.	T	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=157,218;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=21.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:2,4:10,5:5,7,3,6
chr7	12271452	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,24;MFRL=118,138;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,8:0.345:24:5,3:11,5:9,7,3,5
chr7	12370908	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=194,146;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:5,0:0,2:0,5,0,2
chr7	12372999	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=26,34;MFRL=203,217;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.363:9:3,2:3,1:6,0,3,0
chr7	12373082	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=177,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.238:19:8,3:7,1:7,8,4,0
chr7	12375667	.	G	GT	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=165,151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=4.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:0,0:2,2:2,0,2,0
chr7	12383892	.	T	C	.	.	DP=45;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=178,113;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=28.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:32,12:0.283:44:17,0:14,12:13,19,0,12
chr7	12383967	.	T	A	.	.	DP=35;ECNT=2;MBQ=25,27;MFRL=136,139;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=19.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,9:0.294:32:8,4:15,5:10,13,4,5
chr7	12395813	.	T	C	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=113,180;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=100.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,31:0.865:35:2,10:2,20:3,1,23,8
chr7	12400799	.	A	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=28,23;MFRL=182,170;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=11.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:27,7:0.221:34:16,7:11,0:13,14,7,0
chr7	12414620	.	G	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=156,153;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:5,1:4,2:7,2,2,1
chr7	12419039	.	TCA	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=26.12	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.885:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	12420092	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=160,153;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=48.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.884:15:1,9:0,5:0,1,10,4
chr7	12420447	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=218,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=31.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,5:1,4:0,1,0,9
chr7	12617854	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=159,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=19.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.499:16:4,4:4,4:3,5,3,5
chr7	12644334	.	G	T	.	.	DP=9;ECNT=3;MBQ=0,30;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=25.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,5:0,3:0,0,1,7
chr7	12644348	.	G	GGT	.	.	DP=6;ECNT=3;MBQ=31,32;MFRL=240,255;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=GT;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.674:4:0,3:1,0:0,1,0,3
chr7	12644370	.	A	AGAGGTT	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,25;MFRL=264,194;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,1:1,0:0,4,0,1
chr7	12666360	.	TAC	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,242;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AC;STR;TLOD=19.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,6:0.226:29:10,2:11,4:17,6,1,5
chr7	12684340	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=0,31;MFRL=0,185;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=49.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.940:14:0,6:0,8:0,0,0,14
chr7	12684406	.	C	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=28,30;MFRL=171,214;MMQ=52,24;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:12684406_C_T:12684406:0,4,0,1
chr7	12684415	.	CA	AG	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=34,25;MFRL=184,214;MMQ=60,24;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0|1:12684406_C_T:12684406:0,4,0,1
chr7	12684423	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=4;MBQ=36,28;MFRL=181,214;MMQ=60,24;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,1:3,0:0|1:12684406_C_T:12684406:0,3,0,1
chr7	12727826	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=217,166;MMQ=60,54;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.650:18:1,8:5,4:5,1,11,1
chr7	12728770	.	C	T	.	.	DP=48;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=164,205;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:41,3:0.086:44:24,2:17,1:19,22,0,3
chr7	12729925	.	GTT	G,GT	.	.	DP=40;ECNT=1;MBQ=33,28,33;MFRL=186,142,160;MMQ=60,60,60;MPOS=25,16;PON;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=T;STR;TLOD=4.37,27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,4,15:0.140,0.511:29:3,2,6:6,1,7:7,3,7,12
chr7	12730250	.	G	GT,GTT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,28,34;MFRL=251,145,180;MMQ=60,60,60;MPOS=20,17;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,14,15;RU=T;STR;TLOD=3.42,3.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:2,3,2:0.401,0.305:7:2,1,0:0,1,2:0,2,1,4
chr7	12730362	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=241,153;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,15:0.801:18:1,7:2,8:3,0,10,5
chr7	13950838	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=30,30;MFRL=132,217;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,6:0.250:26:11,3:9,3:10,10,2,4
chr7	13978645	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=32,26;MFRL=151,182;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=13.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,4:0.500:8:1,2:3,2:0|1:13978645_C_T:13978645:4,0,4,0
chr7	13978648	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=25,28;MFRL=151,168;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=16.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,5:0.545:9:1,1:3,3:0|1:13978645_C_T:13978645:4,0,5,0
chr7	13978809	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=150,159;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,8:0.529:15:5,5:2,3:4,3,3,5
chr7	14026357	.	A	G	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=160,191;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=64.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,20:0.810:24:4,7:0,13:0,4,9,11
chr7	14028220	.	GAA	G,GA	.	.	DP=30;ECNT=2;MBQ=28,35,28;MFRL=142,131,160;MMQ=60,60,60;MPOS=26,30;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,12,13;RU=A;STR;TLOD=7.43,12.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,9:0.205,0.443:21:5,3,5:0,1,0:7,1,13,0
chr7	14028245	.	G	GA	.	.	DP=61;ECNT=2;MBQ=34,32;MFRL=134,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=A;STR;TLOD=75.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,42:0.869:48:4,16:2,12:4,2,31,11
chr7	14188806	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=208,112;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=23.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.406:25:5,6:10,4:7,8,6,4
chr7	14653054	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=26,36;MFRL=138,244;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:12,0:12,3:13,11,1,2
chr7	14737622	.	AAAAG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=221,199;MMQ=60,50;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=AAAG;STR;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.674:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr7	14775821	.	TG	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=29,29;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=G;STR;TLOD=61.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.852:18:1,11:0,5:0|1:14775821_TG_T:14775821:1,1,5,11
chr7	14775824	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=133,145;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=61.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,16:0.851:18:2,11:0,5:0|1:14775821_TG_T:14775821:1,1,5,11
chr7	15346196	.	TAA	T,TAAA	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30,28;MFRL=163,179,159;MMQ=60,60,60;MPOS=26,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,13;RU=A;STR;TLOD=4.15,6.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,5:0.177,0.327:14:5,1,2:2,1,1:0,7,1,6
chr7	15405301	.	CAT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=36,27;MFRL=194,158;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:1,3:4,1:0,5,0,4
chr7	15426956	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=132,285;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:4,0,4,0
chr7	15430259	.	A	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.474:17:2,5:7,3:7,2,5,3
chr7	15430413	.	TGTAAA	T	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=138,215;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GTAAA;STR;TLOD=10.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,4:0.155:30:13,2:11,2:9,17,4,0
chr7	15430599	.	GT	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,34;MFRL=222,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=6,5;RU=T;STR;TLOD=4.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	15458186	.	T	C	.	.	DP=43;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=133,113;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=27.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,12:0.309:40:13,3:15,9:17,11,6,6
chr7	15458294	.	A	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=25,24;MFRL=146,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.413:10:3,3:2,1:1,5,1,3
chr7	15458330	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=204,159;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:0,5,0,2
chr7	15725797	.	ATGG	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=196,233;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TGG;STR;TLOD=14.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.412:11:1,3:4,1:7,0,3,1
chr7	15726066	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=31,23;MFRL=186,236;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=24.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,12:0.558:21:4,7:5,3:3,6,0,12
chr7	15726117	.	A	AT	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=27,25;MFRL=219,196;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=15.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.398:13:4,3:4,2:0,8,0,5
chr7	16131260	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=17.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.884:6:0,2:0,4:0,0,5,1
chr7	16255602	.	A	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,253;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,3:0,4:0,0,6,1
chr7	16317762	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=158,160;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:6,0:7,3:5,8,3,0
chr7	16317859	.	TA	T	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=161,187;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.501:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr7	16317896	.	A	ATCTTG	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=197,111;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:2,1:0,0:0,2,0,1
chr7	16341163	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.175:15:5,2:7,0:0|1:16341163_C_T:16341163:0,13,1,1
chr7	16341165	.	A	AGCCT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=26,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:16341163_C_T:16341163:0,13,1,1
chr7	16341168	.	A	AGTTT	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=28,20;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,2:7,0:0|1:16341163_C_T:16341163:0,13,1,1
chr7	16341169	.	A	AATATAG	.	.	DP=15;ECNT=4;MBQ=27,25;MFRL=195,56;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.176:15:6,1:7,0:0|1:16341163_C_T:16341163:0,13,1,1
chr7	16348059	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=181,168;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	16445673	.	A	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=100,161;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.260:21:8,3:8,2:7,9,2,3
chr7	16460893	.	T	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=198,190;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.462:9:2,4:2,0:0,5,0,4
chr7	16503932	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,33;MFRL=186,133;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=42.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.632:22:3,6:4,8:6,2,8,6
chr7	16505054	.	GA	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=161,165;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=A;STR;TLOD=10.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:2,1:1,4:3,0,5,0
chr7	16505341	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=29.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	16572051	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=285,178;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=15.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:3,0,6,0
chr7	16572376	.	TA	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=80,203;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=7.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.577:5:1,3:1,0:0,2,0,3
chr7	16577376	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=121,129;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.729:9:1,4:1,3:0,2,3,4
chr7	16597114	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=222,164;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=14.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:3,2:1,6,1,4
chr7	16597174	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=205,172;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=8.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:3,1:6,2:1,8,0,3
chr7	16598655	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=242,194;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=27.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,7:1,3:1,2,2,8
chr7	16605861	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=31,30;MFRL=190,205;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=6,7;RU=T;STR;TLOD=3.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr7	16607177	.	TA	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=171,178;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=17,16;RU=A;STR;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.467:14:3,3:3,2:2,6,0,6
chr7	16619686	.	A	AT	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=23,28;MFRL=114,227;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=3.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.260:10:0,0:8,2:6,2,2,0
chr7	16620928	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=209,0;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:5,2:5,1:7,3,1,2
chr7	16621052	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=145,157;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,2:4,0:2,7,0,2
chr7	16640300	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,33;MFRL=219,237;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,1:1,3:4,0,4,0
chr7	16640358	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=131,238;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=20.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.701:8:0,3:2,3:2,0,5,1
chr7	16650427	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=175,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.460:11:3,4:3,1:0,6,1,4
chr7	16676080	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,16;MFRL=170,172;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.148:18:7,0:5,0:9,7,0,2
chr7	16676082	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=16,28;MFRL=135,183;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.306:14:4,2:1,2:5,5,2,2
chr7	16684247	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=247,173;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.174:15:5,2:8,0:13,0,2,0
chr7	16705132	.	TTG	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=27,29;MFRL=177,125;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=TG;STR;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.243:14:5,3:3,0:5,6,0,3
chr7	16725501	.	CTTT	C,CTTTT	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,33,26;MFRL=199,183,265;MMQ=60,60,59;MPOS=12,21;POPAF=7.30,7.30;RPA=19,16,20;RU=T;STR;TLOD=4.37,4.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:4,2,2:0.248,0.278:8:1,1,1:1,1,0:1,3,4,0
chr7	16736478	.	GC	AG	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=204,201;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=4.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,2:0.300:8:1,1:5,1:0|1:16736478_GC_AG:16736478:6,0,2,0
chr7	16736479	.	C	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=18.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:0,8:0.897:8:0,2:0,6:1|0:16736478_GC_AG:16736478:0,0,8,0
chr7	16745589	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,219;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,4,2
chr7	16793504	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,223;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=38.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,7:0,5:0,0,12,0
chr7	16793677	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=199,251;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=11.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,5:0.285:19:4,2:10,3:5,9,3,2
chr7	16815786	.	C	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=237,172;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=42.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,14:0.652:21:5,6:2,8:6,1,12,2
chr7	16816000	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=237,180;MMQ=60,60;MPOS=20;PON;POPAF=7.30;TLOD=88.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,27:0.824:32:3,11:2,16:1,4,10,17
chr7	16818799	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=202,193;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=36.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,11:0.750:14:2,8:1,3:0,3,0,11
chr7	16823021	.	AT	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=173,179;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=14.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,7:0.383:19:6,4:6,3:12,0,5,2
chr7	16823095	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=162,128;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=55.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,18:0.761:23:0,11:5,7:2,3,11,7
chr7	16823117	.	T	G	.	.	DP=22;ECNT=3;MBQ=30,26;MFRL=150,176;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=11.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,6:0.294:21:9,1:6,4:5,10,1,5
chr7	16823169	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=28,34;MFRL=171,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=19.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,3:3,3:2,4,1,5
chr7	16834393	.	A	AAG	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=30,31;MFRL=248,139;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=AG;STR;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.298:8:3,1:2,1:6,0,2,0
chr7	16834444	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=132,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:5,4:3,4:7,1,8,0
chr7	16839501	.	A	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=190,139;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,3:4,1:0,6,1,3
chr7	16901185	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,231;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=9.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,1:0,2:0,0,0,3
chr7	16913520	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,4:0,3:0,0,0,7
chr7	16913557	.	A	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	16921639	.	GAC	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=152,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=AC;STR;TLOD=4.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,2:0.155:17:11,1:4,1:4,11,1,1
chr7	17362188	.	T	TA	.	.	DP=44;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=158,99;MMQ=60,54;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=6.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:40,3:0.089:43:23,0:17,3:18,22,0,3
chr7	17379926	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=24,34;MFRL=326,195;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.629:6:2,0:0,4:0,2,0,4
chr7	17854484	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=197,120;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,0:7,3:6,7,0,3
chr7	17854532	.	G	T	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,26;MFRL=152,147;MMQ=60,60;MPOS=25;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:5,4:3,5:5,3,8,1
chr7	17854575	.	GAA	G	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=17,20;MFRL=144,197;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=14,12;RU=A;STR;TLOD=5.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.476:6:0,1:0,1:0,3,0,3
chr7	17861093	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=135,168;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=21.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,7:0.400:18:5,3:6,4:6,5,4,3
chr7	17869766	.	CAAGATATAACA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=224,109;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,1:3,0:0,4,0,1
chr7	17874300	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=151,216;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=15.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.667:7:1,1:1,4:2,0,5,0
chr7	17890413	.	CA	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=217,195;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=A;STR;TLOD=36.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,13:0.780:16:0,6:3,7:3,0,12,1
chr7	17908130	.	T	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=131,140;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.723:16:4,4:0,8:0,4,3,9
chr7	17913083	.	A	AC	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,201;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=34.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,3:0,5:0,0,10,0
chr7	17932932	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=172,121;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=23.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.354:29:9,0:10,10:13,6,6,4
chr7	17979793	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=236,171;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=25.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.607:16:3,2:3,7:5,1,9,1
chr7	18067479	.	ACT	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=157,191;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CT;STR;TLOD=72.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,18:0.704:25:2,9:5,9:3,4,3,15
chr7	18630208	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,34;MFRL=209,188;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,2:2,2:0,4,0,4
chr7	18631098	.	ATG	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=TG;STR;TLOD=9.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.879:5:0,2:0,2:0,0,5,0
chr7	18668945	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=28,25;MFRL=162,143;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=T;STR;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:4,0:3,2:8,2,2,1
chr7	18674435	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=200,211;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:6,1:7,2:1,12,0,3
chr7	18788576	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=199,200;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.270:9:2,0:5,2:6,1,2,0
chr7	18914251	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=197,150;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=20.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:7,7:1,0:2,6,0,7
chr7	18975650	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=12.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,2:2,2:0,5,0,4
chr7	19015481	.	G	A	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,23;MFRL=186,162;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,7:0.234:32:11,0:14,7:15,10,0,7
chr7	19184746	.	C	CTCT	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=204,228;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TCT;STR;TLOD=38.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,10:0.689:14:3,5:1,3:2,2,5,5
chr7	19738359	.	TA	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=154,128;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.191:19:5,1:10,2:4,12,0,3
chr7	19763866	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=169,148;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,4:0.199:23:10,2:9,2:15,4,1,3
chr7	20180477	.	G	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=21,21;MFRL=198,226;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.389:8:1,0:1,1:5,0,3,0
chr7	20180507	.	G	GAC	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=96,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=9,10;RU=AC;STR;TLOD=8.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.576:5:0,0:2,2:1,1,2,1
chr7	20371395	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,186;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=74.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,15:0,6:0,0,17,4
chr7	20403353	.	AT	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=20,28;MFRL=79,212;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=16.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.732:11:2,3:1,5:1,2,1,7
chr7	20406542	.	A	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=186,185;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,2:3,0:6,0,2,0
chr7	20418926	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=201,142;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,6:0.258:25:11,5:8,1:13,6,3,3
chr7	20430960	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=24.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,1:0,6:0,0,7,0
chr7	20444532	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,197;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,0,9
chr7	20663070	.	A	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=215,196;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:0,3,0,3
chr7	20668259	.	G	A	.	.	DP=38;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=132,193;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=5.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:34,3:0.102:37:17,3:16,0:0|1:20668259_G_A:20668259:29,5,3,0
chr7	20668277	.	C	A	.	.	DP=37;ECNT=2;MBQ=33,29;MFRL=191,132;MMQ=60,59;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=56.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:12,20:0.616:32:7,9:4,10:1|0:20668259_G_A:20668259:10,2,15,5
chr7	20685508	.	T	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=181,171;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=26.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,9:0.435:21:6,5:6,3:6,6,7,2
chr7	20685786	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,24;MFRL=216,166;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=9.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.555:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr7	20687181	.	C	T	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=128,148;MMQ=60,60;MPOS=22;PON;POPAF=7.30;TLOD=19.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,9:0.344:27:8,6:10,3:13,5,4,5
chr7	20687332	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=243,166;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=19.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:2,3:5,4:1,6,0,7
chr7	20690984	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,34;MFRL=201,181;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:3,1:5,1:8,0,2,0
chr7	20698077	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=170,169;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=8.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.319:13:4,1:5,2:8,1,0,4
chr7	20698270	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=143,171;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=11.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:5,2:1,2:1,5,1,3
chr7	20698804	.	C	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=183,94;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr7	20739632	.	A	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=183,176;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=21.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:6,2:2,5:6,2,5,2
chr7	20739774	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=177,159;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=10,9;RU=T;STR;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.442:9:1,2:4,2:3,2,1,3
chr7	20762543	.	T	A	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=26,30;MFRL=173,159;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=19.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.616:11:2,4:2,3:4,0,7,0
chr7	20762609	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=153,127;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:4,2:3,4:4,3,4,2
chr7	20762646	.	G	T	.	.	DP=24;ECNT=3;MBQ=34,20;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=22.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,11:0.478:23:5,4:7,7:3,9,6,5
chr7	20778773	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=36,32;MFRL=151,195;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=19.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:0,4:3,2:0,3,0,6
chr7	20778844	.	A	AG	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=241,356;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=4,5;RU=G;STR;TLOD=8.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.671:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	20782474	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=121,185;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=19.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:1,3:2,3:2,1,4,2
chr7	20824940	.	AGCC	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=29,29;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=5,4;RU=GCC;STR;TLOD=19.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.605:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr7	20825145	.	GGCAGCCGCGGCTGCTGCCGCGGCCGCC	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=73,254;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:0,2:0,1:2,1,3,0
chr7	20826270	.	GA	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=127,128;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=13,12;RU=A;STR;TLOD=10.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.403:13:6,2:2,3:8,0,5,0
chr7	21468579	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=166,214;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=23.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:2,4:6,5:0,8,0,9
chr7	21468869	.	TCC	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,24;MFRL=205,180;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=10,8;RU=C;STR;TLOD=18.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.754:6:0,1:1,3:0,1,5,0
chr7	21469728	.	A	G	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=198,93;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.262:17:6,3:7,1:8,5,1,3
chr7	21470513	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=31,36;MFRL=234,231;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.604:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	21470536	.	A	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=27,31;MFRL=234,291;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=6.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,0:1,2:0,1,0,2
chr7	21582963	.	GA	TT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=148,292;MMQ=60,60;MPOS=24;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:4,2:1,2:5,0,3,1
chr7	21584820	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=148,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:2,1:7,2:1,8,0,3
chr7	21600674	.	T	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=129,157;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,5:0.241:23:8,5:9,0:11,7,5,0
chr7	21603750	.	GA	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=180,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=A;STR;TLOD=4.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.289:12:5,0:1,2:8,1,2,1
chr7	21609623	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=133,194;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=17.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.500:12:3,2:3,4:6,0,6,0
chr7	21639818	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=33,29;MFRL=229,181;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,1:1,2:0,1,0,3
chr7	21640618	.	C	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,32;MFRL=145,280;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,2:0.187:14:9,1:3,1:10,2,0,2
chr7	21654970	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=164,334;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,2:3,0:0,5,0,2
chr7	21657185	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=162,298;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.511:8:1,2:2,2:4,0,4,0
chr7	21658855	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=139,192;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=11.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:6,2:2,2:3,5,1,3
chr7	21695416	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=161,162;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:8,0:2,2:9,1,2,0
chr7	21695649	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=247,282;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.427:5:1,1:2,1:0,3,1,1
chr7	21721130	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=154,150;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,2:3,1:4,1,0,3
chr7	21744039	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=192,216;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:7,0:3,4:5,5,3,1
chr7	21744318	.	TA	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=184,226;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=10.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:4,3:5,1:0,9,1,3
chr7	21745061	.	A	G	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=148,245;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:8,1:8,3:11,5,3,1
chr7	21757636	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,274;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=18.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,1:0,5:0,0,0,6
chr7	21765636	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	21775210	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=17.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,3:0,3:0,0,6,0
chr7	21775443	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=10.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,2:0,2:0,0,1,3
chr7	21784193	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=150,65;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,2:0.149:18:8,1:7,1:6,10,0,2
chr7	21789442	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,178;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,14:0.682:20:3,7:3,7:1,5,1,13
chr7	21813318	.	A	AT	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=8,9;RU=T;STR;TLOD=21.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.915:8:0,3:0,4:0,0,7,1
chr7	21818486	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,254;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=17.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.869:5:0,4:0,1:0,0,5,0
chr7	21826199	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=194,164;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=21.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,7:0.445:16:6,4:3,3:4,5,6,1
chr7	21847457	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=240,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.583:10:4,4:0,2:4,0,5,1
chr7	21856390	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=172,147;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=21.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,8:0.693:11:0,7:3,1:0,3,0,8
chr7	21858043	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=119,190;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=18.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,6:0.703:8:2,4:0,2:1,1,0,6
chr7	21901540	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=29,32;MFRL=186,153;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=20.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:3,3:4,4:5,2,3,4
chr7	21901566	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,188;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=34.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.921:10:0,5:0,5:0,0,5,5
chr7	21907452	.	G	GT	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,33;MFRL=90,239;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=41.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:7,11:0.600:18:2,4:4,6:0|1:21907452_G_GT:21907452:5,2,7,4
chr7	21907458	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=25,33;MFRL=134,235;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=43.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,12:0.520:23:5,5:6,7:0|1:21907452_G_GT:21907452:8,3,7,5
chr7	21907696	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,35;MFRL=0,218;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=35.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.735:13:2,3:1,7:0,3,0,10
chr7	21907722	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=19,23;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=16,15;RU=T;STR;TLOD=5.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.683:4:0,0:0,2:0,1,0,3
chr7	21920556	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=199,151;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=29.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,11:0.632:17:1,2:5,9:1,5,1,10
chr7	21934317	.	C	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=165,166;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,5:0.213:26:9,0:12,5:9,12,0,5
chr7	21940557	.	AACTT	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=ACTT;STR;TLOD=70.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,16:0.947:16:0,7:0,9:0,0,16,0
chr7	21941861	.	ATCTT	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TCTT;STR;TLOD=51.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.932:12:0,6:0,6:0,0,9,3
chr7	21943722	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=178,263;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=7.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:8,2:7,1:7,8,3,0
chr7	21943842	.	G	A	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=174,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=23.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,10:0.407:25:9,3:6,7:8,7,4,6
chr7	21945086	.	C	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=231,189;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=21.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:1,5:1,2:2,0,7,0
chr7	21945840	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=35,27;MFRL=178,210;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=41.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,14:0.882:15:1,7:0,7:1,0,12,2
chr7	21947736	.	G	GGGTTGGGTTCATACGCCGCGTGATC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,20;MFRL=202,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.368:6:1,0:3,2:4,0,1,1
chr7	21985338	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=194,101;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=17.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,8:0.309:27:9,5:10,3:0|1:21985338_G_A:21985338:10,9,5,3
chr7	21985347	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=91.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,25:0.965:25:0,12:0,13:0|1:21985338_G_A:21985338:0,0,14,11
chr7	21985484	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=187,102;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=12.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,6:0.279:23:9,3:8,3:8,9,2,4
chr7	22190135	.	A	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,13;MFRL=125,223;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.278:9:3,0:3,0:2,5,0,2
chr7	22206854	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=236,177;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=9.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:0,3,0,3
chr7	22259670	.	C	A	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=158,131;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=35.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,15:0.576:26:5,4:5,11:5,6,7,8
chr7	22330700	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=156,183;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=4.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:4,1:5,1:9,0,2,0
chr7	22347861	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=33,32;MFRL=215,205;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr7	22347888	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=205,263;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=6.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:4,3:4,0:8,0,3,0
chr7	22349769	.	C	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,174;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=6.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:3,0:2,3:0,5,0,3
chr7	22355166	.	CTATATA	C,CTATA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,35,33;MFRL=0,244,233;MMQ=60,60,60;MPOS=31,13;POPAF=7.30,7.30;RPA=10,7,9;RU=TA;STR;TLOD=3.32,3.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,1,1:0.285,0.508:2:0,0,1:0,1,0:0,0,0,2
chr7	22357716	.	T	G	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=152,192;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=37.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.721:16:3,5:1,6:0,4,0,12
chr7	22459324	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,29;MFRL=185,137;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,0:3,2:8,1,1,1
chr7	22459509	.	AT	TA	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=165,167;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=9.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.190:19:9,3:7,0:5,11,1,2
chr7	22771156	.	C	T	.	.	DP=37;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=142,119;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,10:0.297:35:14,5:11,5:12,13,4,6
chr7	22852643	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=238,178;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.400:13:5,2:3,3:5,3,5,0
chr7	22852776	.	A	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=147,252;MMQ=60,24;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=4.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,3:0.189:19:11,0:5,3:4,12,0,3
chr7	22857589	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=164,107;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=29.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,12:0.519:23:7,8:4,4:5,6,9,3
chr7	22862467	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=168,167;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,2:6,4:0,10,0,6
chr7	22985868	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,275;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,0,1
chr7	23000783	.	G	GCTCT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,192;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=2,4;RU=CT;STR;TLOD=52.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,6:0,0,12,0
chr7	23191636	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=30,28;MFRL=167,119;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.165:16:9,1:5,1:12,2,2,0
chr7	23191664	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=161,119;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:10,1:6,3:11,5,3,1
chr7	23195555	.	CTTTAT	C	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=85.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.957:20:0,11:0,8:0,0,7,13
chr7	23221870	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=23,32;MFRL=237,185;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.394:11:0,3:4,1:0,7,2,2
chr7	23227632	.	AT	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=139,145;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.261:18:5,3:5,1:8,6,4,0
chr7	23293098	.	C	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=190,137;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.219:14:3,0:8,3:4,7,1,2
chr7	23296616	.	A	T	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=157,137;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,3:0.147:25:11,3:11,0:12,10,3,0
chr7	23300049	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=216,139;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:4,0,3,0
chr7	23306020	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=147,127;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.247:10:4,1:4,1:8,0,2,0
chr7	23307634	.	ATGGG	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=246,133;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=TGGG;STR;TLOD=23.37	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.587:10:1,1:3,5:1,3,1,5
chr7	23352512	.	C	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=173,169;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,12:0.722:16:2,3:2,9:3,1,1,11
chr7	23545047	.	T	C	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=24,34;MFRL=183,0;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.200:18:6,3:9,0:15,0,3,0
chr7	23545119	.	TA	T	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=24,25;MFRL=125,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=11.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.513:15:2,5:4,1:6,2,5,2
chr7	23571558	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=215,189;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=11.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,2:0,2:0,2,2,2
chr7	23682603	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=138,45;MMQ=60,54;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:11,2:6,0:11,6,2,0
chr7	23719766	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=30,32;MFRL=126,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=24.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:4,5:2,3:6,0,8,0
chr7	23719779	.	G	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=125,169;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=36.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,13:0.634:20:4,7:3,5:7,0,12,1
chr7	23737795	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,20;MFRL=164,69;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.158:23:11,0:9,3:11,9,2,1
chr7	23766954	.	GT	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=203,129;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.284:12:4,2:4,1:1,8,0,3
chr7	23794139	.	TA	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,153;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=A;STR;TLOD=35.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,4,6
chr7	23794183	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,32;MFRL=168,161;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=12.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.416:10:3,3:3,1:0,6,0,4
chr7	23802463	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=153,136;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=21.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,9:0.416:22:9,5:4,4:5,8,4,5
chr7	23802579	.	G	C	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,33;MFRL=166,158;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:0,9:1,1:0,1,1,9
chr7	23810605	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=33.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr7	23823355	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,204;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.892:7:0,5:0,2:0,0,0,7
chr7	23826066	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,205;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=37.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.917:10:0,7:0,3:0,0,10,0
chr7	23854717	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,200;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=53.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,17:0.948:17:0,10:0,7:0,0,12,5
chr7	23854838	.	G	GA	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,154;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=A;STR;TLOD=83.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.964:26:0,9:0,17:0,0,10,16
chr7	23872024	.	C	CTTTG	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,141;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=TTTG;STR;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.841:4:0,2:0,2:0,0,0,4
chr7	24324759	.	T	G	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=214,173;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.445:7:1,3:3,0:4,0,3,0
chr7	24324808	.	C	G	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=20,32;MFRL=111,205;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.501:10:5,3:0,2:3,2,5,0
chr7	24325009	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=192,140;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=23.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,9:0.526:17:7,8:1,1:6,2,6,3
chr7	24329133	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=221,163;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.563:14:2,4:4,4:6,0,4,4
chr7	24329235	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=221,0;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=4.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:4,2:5,0:3,6,0,2
chr7	24718710	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=108,187;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=19.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:4,3:0,3:4,0,4,2
chr7	24746022	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=28,34;MFRL=174,215;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=22.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,8:0.290:29:6,1:15,7:0|1:24746022_A_G:24746022:4,17,2,6
chr7	24746026	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,28;MFRL=194,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:25,3:0.133:28:5,2:18,1:1|0:24746022_A_G:24746022:6,19,0,3
chr7	24747910	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,28;MFRL=157,186;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.636:9:0,1:3,5:0,3,1,5
chr7	24756810	.	A	AGTCCCTCTGCTGAGGGATCCTCTGCTGGGG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=194,269;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=GTCCCTCTGCTGAGGGATCCTCTGCTGGGG;STR;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.481:6:2,1:1,1:3,0,3,0
chr7	24758565	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=27,33;MFRL=216,199;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=13.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.715:5:0,3:1,1:1,0,4,0
chr7	24758645	.	G	T	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,27;MFRL=120,142;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,5:4,1:10,1,5,1
chr7	24784403	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=179,138;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=18.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.596:10:1,3:2,3:2,2,0,6
chr7	24789082	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,25;MFRL=228,179;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:2,1:0,3:2,0,4,0
chr7	24839712	.	T	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=193,157;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=5.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:5,2:4,0:9,0,2,0
chr7	24888620	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=51.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,6:0,8:0,0,14,1
chr7	24902762	.	C	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=191,150;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=28.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,12:0.647:18:3,3:3,8:6,0,10,2
chr7	24903107	.	C	G	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=31,27;MFRL=254,165;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=55.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,19:0.800:23:2,5:2,13:1,3,11,8
chr7	24903139	.	C	T	.	.	DP=39;ECNT=2;MBQ=31,28;MFRL=187,161;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=62.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,23:0.585:39:9,6:7,16:9,7,10,13
chr7	24903227	.	G	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=180,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=27.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,10:0.500:20:6,5:4,5:1,9,1,9
chr7	24904868	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=28,30;MFRL=149,178;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=11.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:3,1:0,3:3,0,4,0
chr7	24904889	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,33;MFRL=205,206;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=15.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:4,1:1,4:5,0,3,2
chr7	24911526	.	G	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=219,134;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=35.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,14:0.625:22:4,3:4,11:5,3,4,10
chr7	24911760	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=167,130;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=11.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,6:0.499:12:5,0:1,6:1,5,6,0
chr7	25182001	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=222,312;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:0,1,0,2
chr7	25182172	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,32;MFRL=209,216;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=7.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:3,1:0,1:2,1,3,0
chr7	25194618	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=158,188;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=18.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,8:0.478:17:3,3:5,5:7,2,5,3
chr7	25194857	.	A	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=186,122;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=24.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,9:0.455:20:6,2:5,7:0,11,0,9
chr7	25198268	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=35,35;MFRL=174,137;MMQ=60,40;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:0,4,0,1
chr7	25207849	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=35,31;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.308:11:6,3:2,0:8,0,3,0
chr7	25264847	.	T	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=260,195;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=15.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,6:0.637:9:1,2:2,4:0,3,0,6
chr7	25989520	.	T	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,33;MFRL=176,223;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=16.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.333:19:3,1:10,5:9,4,3,3
chr7	26225249	.	A	C	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=178,7703;MMQ=60,25;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=12.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,7:0.216:35:14,0:14,7:16,12,7,0
chr7	26247984	.	CTT	C,CT	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,32,32;MFRL=236,133,165;MMQ=60,60,60;MPOS=15,18;POPAF=7.30,7.30;RPA=12,10,11;RU=T;STR;TLOD=3.02,12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:7,2,6:0.148,0.405:15:2,0,2:4,2,4:6,1,8,0
chr7	26251843	.	C	T	.	.	DP=33;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=159,259;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:26,5:0.181:31:12,1:13,4:8,18,5,0
chr7	26386122	.	T	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=213,168;MMQ=60,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=14.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.349:18:6,2:6,4:3,9,4,2
chr7	26386154	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,30;MFRL=165,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.398:8:2,1:3,2:0,5,1,2
chr7	26404071	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,28;MFRL=280,236;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=20.74	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.731:9:2,2:0,5:2,0,7,0
chr7	26411423	.	C	CT	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=193,187;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=10,11;RU=T;STR;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.264:13:3,1:6,2:10,0,3,0
chr7	26576535	.	T	C	.	.	DP=32;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=224,150;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=67.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,21:0.710:29:4,7:4,14:5,3,11,10
chr7	26724279	.	T	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=26,29;MFRL=159,156;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,7:0.617:11:1,5:3,2:4,0,7,0
chr7	26883761	.	TA	T,TAA	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,31,31;MFRL=191,160,187;MMQ=60,60,60;MPOS=27,23;POPAF=7.30,7.30;RPA=14,13,15;RU=A;STR;TLOD=5.34,6.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,4,5:0.243,0.295:17:3,1,2:5,2,3:1,7,1,8
chr7	27135313	.	GCGA	G	.	.	DP=31;ECNT=4;MBQ=32,34;MFRL=177,310;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=7.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:22,4:0.177:26:9,3:12,1:0|1:27135313_GCGA_G:27135313:17,5,2,2
chr7	27135314	.	C	T	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=31,28;MFRL=174,218;MMQ=60,60;MPOS=23;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,10:0.358:29:11,2:8,8:14,5,6,4
chr7	27135316	.	ATGG	A	.	.	DP=30;ECNT=4;MBQ=29,28;MFRL=177,286;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=TGG;STR;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.274:25:5,5:12,2:13,5,4,3
chr7	27135319	.	G	A	.	.	DP=29;ECNT=4;MBQ=32,28;MFRL=177,286;MMQ=60,60;MPOS=-2147483648;POPAF=7.30;TLOD=10.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:18,7:0.267:25:6,4:11,2:0|1:27135313_GCGA_G:27135313:14,4,4,3
chr7	27147451	.	TA	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=204,153;MMQ=60,40;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=20,19;RU=A;STR;TLOD=3.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.434:3:2,0:0,1:2,0,1,0
chr7	27147732	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=184,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,2:9,0:0|1:27147732_G_A:27147732:9,12,1,1
chr7	27147735	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=2;MBQ=32,18;MFRL=184,95;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.120:23:11,1:10,0:0|1:27147732_G_A:27147732:9,12,1,1
chr7	27169934	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,312;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	27170145	.	T	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,298;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	27203139	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=169,213;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.577:10:2,2:2,3:4,0,6,0
chr7	27213481	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=33,26;MFRL=141,74;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:7,2:8,0:0|1:27213481_G_A:27213481:6,9,0,2
chr7	27213499	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=33,24;MFRL=137,74;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,2:0.202:13:4,2:5,0:0|1:27213481_G_A:27213481:1,10,0,2
chr7	27222409	.	G	A	.	.	DP=35;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=184,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=20.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:23,10:0.313:33:11,6:12,4:10,13,6,4
chr7	27224666	.	A	G	.	.	DP=36;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=135,239;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=14.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:28,6:0.196:34:17,6:11,0:10,18,6,0
chr7	27238691	.	C	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,239;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=11.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	27282889	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,26;MFRL=197,196;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=15.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:2,2:5,4:5,2,6,0
chr7	27566053	.	G	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,36;MFRL=168,263;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.444:7:2,1:2,2:0,4,0,3
chr7	27582783	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=161,202;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=19.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,7:0.800:8:0,3:1,4:0,1,0,7
chr7	27671899	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,34;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=25.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,5:0,2:0,0,7,0
chr7	27788354	.	C	A	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=33,24;MFRL=191,171;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.258:13:6,2:4,1:0,10,0,3
chr7	27842733	.	A	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,34;MFRL=133,215;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=10.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,4:0.208:22:8,0:10,4:11,7,1,3
chr7	27868472	.	T	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,15;MFRL=161,265;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,3:0.444:7:0,0:2,0:0|1:27868472_T_A:27868472:1,3,0,3
chr7	27868479	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=21,16;MFRL=186,265;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=7.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,3:0.571:5:0,0:1,0:0|1:27868472_T_A:27868472:0,2,0,3
chr7	27886011	.	C	CATATACGTATACGTGTAT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=171,199;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=15.40	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.497:10:4,2:1,1:5,0,5,0
chr7	28031704	.	T	C	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=138,194;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=9.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.227:20:10,1:6,3:11,5,2,2
chr7	28534501	.	C	CT,CTT	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=33,32,24;MFRL=154,137,175;MMQ=60,60,60;MPOS=26,11;POPAF=7.30,7.30;RPA=9,10,11;RU=T;STR;TLOD=30.79,5.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:8,15,3:0.586,0.140:26:2,8,1:5,6,1:4,4,9,9
chr7	28857606	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=191,186;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.836:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr7	28997497	.	GC	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=C;STR;TLOD=43.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.930:12:0,5:0,7:0,0,3,9
chr7	28997596	.	G	GC	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,193;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=17.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.868:5:0,2:0,3:0,0,2,3
chr7	28997765	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=34,34;MFRL=176,197;MMQ=60,60;MPOS=12;PON;POPAF=7.30;TLOD=4.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.169:16:7,0:5,2:8,6,1,1
chr7	28997776	.	C	G	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=30,34;MFRL=166,297;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.286:12:4,2:4,1:5,4,2,1
chr7	29103582	.	TAAA	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=28,28;MFRL=155,214;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,11;RU=A;STR;TLOD=4.01	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.465:4:1,2:1,0:1,1,2,0
chr7	29103867	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,29;MFRL=0,203;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,1,4
chr7	29103944	.	A	AT	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=T;STR;TLOD=21.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,0,6
chr7	29105769	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=32,26;MFRL=178,157;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=A;STR;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:12,2:0.185:14:7,1:3,1:0|1:29105769_GA_G:29105769:1,11,1,1
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chr7	29105776	.	A	G	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=25,31;MFRL=178,179;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:8,6:0.419:14:6,4:2,2:1|0:29105769_GA_G:29105769:0,8,1,5
chr7	29111525	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=3;MBQ=33,30;MFRL=112,174;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=20.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:11,6:0.368:17:5,2:6,4:0|1:29111525_G_A:29111525:5,6,3,3
chr7	29111541	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=33,28;MFRL=116,154;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=17.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.400:13:3,1:5,4:0|1:29111525_G_A:29111525:4,4,2,3
chr7	29111620	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=3;MBQ=0,36;MFRL=0,214;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=28.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.889:7:0,2:0,5:0,0,1,6
chr7	29126185	.	G	A	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=176,87;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,5:0.206:27:9,5:13,0:10,12,0,5
chr7	29132212	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,33;MFRL=163,209;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=13.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:2,0:0,4:2,0,4,0
chr7	29152416	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=140,140;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=26.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,10:0.478:21:5,4:6,6:3,8,4,6
chr7	29152448	.	GA	G	.	.	DP=17;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=163,85;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=8,7;RU=A;STR;TLOD=13.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.411:15:4,2:5,4:2,7,1,5
chr7	29160604	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=210,183;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,5:0.333:16:4,0:7,5:5,6,1,4
chr7	29394220	.	CTT	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=31,35;MFRL=147,0;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=12,10;RU=T;STR;TLOD=17.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,2:1,2:1,0,4,1
chr7	29407518	.	TTC	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=143,141;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=TC;STR;TLOD=8.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:7,2:5,1:11,1,3,0
chr7	29520042	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=24,28;MFRL=0,235;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=14.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.751:6:1,0:0,5:0,1,1,4
chr7	29544468	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=205,149;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:3,2:2,3:0,5,1,4
chr7	29605935	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=36,30;MFRL=240,148;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=6.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.560:5:2,1:0,1:2,0,3,0
chr7	29606597	.	AT	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,150;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=9,8;RU=T;STR;TLOD=34.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,6,6
chr7	29606976	.	G	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,259;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=6.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,1:0,1:0,0,0,2
chr7	29874358	.	A	C	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=25,12;MFRL=152,191;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,4:0.244:17:8,1:5,0:1,12,4,0
chr7	29944062	.	A	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=148,213;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=9.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:1,0:0,3:0,1,0,3
chr7	29954015	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=144,115;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=12.17	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.594:8:3,0:0,4:3,0,5,0
chr7	29976182	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=32,27;MFRL=177,134;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:7,4,1,1
chr7	29976260	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=160,71;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,3:0.210:17:8,0:5,3:6,8,2,1
chr7	30029714	.	T	C	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,32;MFRL=148,171;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=20.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.471:15:4,4:4,3:8,0,7,0
chr7	30062202	.	A	G	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=248,146;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:1,2:2,1:3,0,3,0
chr7	30085766	.	T	G	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=23,31;MFRL=138,163;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=22.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,8:0.565:14:3,6:3,2:5,1,6,2
chr7	30087381	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=167,216;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=18.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:7,1:1,6:6,2,5,2
chr7	30092256	.	CAAAA	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,34;MFRL=132,154;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;RPA=20,16;RU=A;STR;TLOD=11.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.676:4:1,2:0,1:1,0,3,0
chr7	30101683	.	C	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,32;MFRL=148,223;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=11.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,3:4,1:3,6,0,4
chr7	30113617	.	A	AG	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=191,160;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=10.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,5:0.388:13:4,5:4,0:6,2,3,2
chr7	30174773	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=31,27;MFRL=199,160;MMQ=60,60;MPOS=17;PON;POPAF=7.30;TLOD=38.75	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.638:23:3,7:5,7:5,3,10,5
chr7	30468913	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=196,130;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:3,2:6,0:9,0,2,0
chr7	30477204	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=185,98;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=8.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,5:0.260:20:8,4:7,0:6,9,0,5
chr7	30491215	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=167,333;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,3:0.238:15:5,1:5,2:7,5,2,1
chr7	30491780	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=175,189;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,2:0.164:16:7,0:7,2:4,10,1,1
chr7	30496309	.	G	GC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,162;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=17.62	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.874:6:0,4:0,2:0,0,5,1
chr7	30536611	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=25,32;MFRL=184,186;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=13.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.725:5:0,2:1,2:1,0,4,0
chr7	30536874	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=182,133;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=16.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,6:0.584:10:2,2:2,4:2,2,2,4
chr7	30544360	.	G	A	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=32,22;MFRL=162,148;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:4,5:7,1:1,10,1,5
chr7	30634630	.	G	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,152;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,2:0,0:0,0,1,1
chr7	30643069	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,28;MFRL=118,175;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.385:11:1,1:6,3:3,4,4,0
chr7	30655489	.	A	T	.	.	DP=28;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=164,129;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=27.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,11:0.400:28:11,6:6,5:11,6,6,5
chr7	30656650	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=222,303;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	30662079	.	G	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=156,151;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.176:15:8,2:5,0:3,10,2,0
chr7	30668273	.	TG	AA	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,1:12,1:0|1:30668273_TG_AA:30668273:6,13,0,2
chr7	30668277	.	C	A	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=33,26;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:6,1:12,1:0|1:30668273_TG_AA:30668273:6,13,0,2
chr7	30668280	.	A	AAAGAAAAAGAAAG	.	.	DP=21;ECNT=3;MBQ=28,26;MFRL=160,116;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:7,1:12,1:0|1:30668273_TG_AA:30668273:6,13,0,2
chr7	30673345	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=158,343;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=4.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:3,1,2,0
chr7	30673512	.	TAAA	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=12,31;MFRL=159,89;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=15,12;RU=A;STR;TLOD=6.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.334:7:2,0:0,2:0,5,0,2
chr7	30693081	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=181,217;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.222:16:5,2:8,1:9,4,2,1
chr7	30694808	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,16;MFRL=0,319;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0,0,0,1
chr7	30695641	.	C	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,12;MFRL=117,103;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=7.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,5:0.285:18:4,0:7,0:8,5,0,5
chr7	30701914	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=34,27;MFRL=183,123;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:5,2:2,2:2,5,1,3
chr7	30705105	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=182,296;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.198:13:6,1:5,1:8,3,0,2
chr7	30728908	.	A	T	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=149,175;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=20.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,8:0.450:18:4,2:6,5:3,7,1,7
chr7	30739674	.	A	AATGTTGTGGCTAGTTTGATCTT	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,25;MFRL=217,136;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=6.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,2:3,0:0,7,0,2
chr7	30795547	.	A	G	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,293;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=3.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0,0,0,1
chr7	30805849	.	A	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,30;MFRL=287,217;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=13.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.752:6:1,2:0,2:1,0,5,0
chr7	30805913	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=114,120;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,5:0.352:15:3,4:7,1:4,6,1,4
chr7	30817998	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=165,104;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.230:11:5,0:4,2:9,0,2,0
chr7	30876432	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=188,100;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=27.35	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,9:0.590:15:3,6:3,3:3,3,6,3
chr7	30891927	.	T	TA	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=29,16;MFRL=124,66;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=7.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,3:0.138:27:11,0:13,1:7,17,1,2
chr7	30892972	.	G	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=183,171;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=14.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,5:5,0:5,4,3,2
chr7	30921989	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=26,26;MFRL=202,173;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=7,6;RU=C;STR;TLOD=4.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.295:8:3,1:3,1:0,6,0,2
chr7	31003819	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=254,222;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.97	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,0:0,2:0,1,0,2
chr7	31011485	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=235,174;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=19.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,6:0.539:11:2,4:3,2:5,0,6,0
chr7	31015622	.	GGC	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=32,33;MFRL=141,267;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=6.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.249:10:4,1:4,1:0,8,0,2
chr7	31016018	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=155,141;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=3.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.229:11:1,0:8,2:7,2,1,1
chr7	31121490	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=146,167;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,1:1,2:0,3,0,3
chr7	31125082	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=28.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,2,8
chr7	31125133	.	AT	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=26,24;MFRL=200,298;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=T;STR;TLOD=4.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.248:10:3,1:5,1:0,8,0,2
chr7	31127158	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=190,216;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,2:0.231:11:3,1:5,1:7,2,2,0
chr7	31127398	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=237,262;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.276:9:0,2:6,0:0,7,0,2
chr7	31135471	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=266,209;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=19.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,7:0.727:9:2,6:0,1:0,2,0,7
chr7	31594166	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,157;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=63.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,20:0.956:20:0,13:0,7:0,0,6,14
chr7	31594258	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=227,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=18.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.781:7:1,4:0,2:1,0,3,3
chr7	31614057	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=196,161;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=3.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,1:1,0:1,0,1,0
chr7	31681765	.	C	T	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=31,25;MFRL=112,199;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=26.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,11:0.501:22:6,4:5,7:5,6,7,4
chr7	31681939	.	G	A	.	.	DP=52;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=211,211;MMQ=60,59;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=27.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:35,15:0.307:50:29,0:5,15:1,34,0,15
chr7	31682601	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=156,194;MMQ=60,60;MPOS=7;PON;POPAF=7.30;TLOD=7.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,4:0.247:18:8,1:6,2:7,7,1,3
chr7	31691697	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=134,174;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=42.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,12:0.765:15:2,4:1,8:0,3,2,10
chr7	31735263	.	G	C	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=32858197,144;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=31.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.667:16:4,5:1,6:0,5,4,7
chr7	31876766	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,208;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=44.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,6:0,6:0,0,11,1
chr7	31918879	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=193,346;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,0,2
chr7	32209376	.	T	C	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=147,138;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=23.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.667:10:1,3:2,4:2,1,6,1
chr7	32209459	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,163;MMQ=60,60;MPOS=18;PON;POPAF=7.30;TLOD=68.50	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,22:0.959:22:0,10:0,12:0,0,10,12
chr7	32248984	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=160,175;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=5.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	32249216	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,30;MFRL=157,204;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=5.18	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,2:2,0:0,3,0,2
chr7	32527009	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,25;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=32.25	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,6:0,5:0,0,0,11
chr7	32528796	.	T	G	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=190,180;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=34.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,11:0.445:25:3,6:11,5:10,4,8,3
chr7	32530511	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=202,200;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=8.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:0,5,0,3
chr7	32535437	.	C	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=31,26;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=8.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.384:11:4,2:3,2:2,5,0,4
chr7	32593234	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=31,34;MFRL=173,178;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=14,13;RU=T;STR;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.585:5:0,2:2,1:2,0,3,0
chr7	32593271	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=44.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,14:0.944:14:0,4:0,10:0,0,10,4
chr7	32594158	.	TTC	T	.	.	DP=30;ECNT=3;MBQ=29,29;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=8.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:25,3:0.133:28:18,1:6,2:0|1:32594158_TTC_T:32594158:11,14,0,3
chr7	32594165	.	T	TC	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=29,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:17,1:6,2:0|1:32594158_TTC_T:32594158:11,12,0,3
chr7	32594166	.	G	T	.	.	DP=26;ECNT=3;MBQ=34,32;MFRL=161,144;MMQ=60,60;MPOS=-1;POPAF=7.30;TLOD=8.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,3:0.143:26:17,1:6,2:0|1:32594158_TTC_T:32594158:11,12,0,3
chr7	32594278	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=27,31;MFRL=178,160;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,11:0.857:12:0,9:1,2:0,1,4,7
chr7	32598087	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,30;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=9.99	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,1:0,2:0,0,3,0
chr7	32598138	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=0,161;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=30.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,6:0,4:0,0,5,5
chr7	32598442	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=27,34;MFRL=189,150;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=5.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,2:2,0:5,0,2,0
chr7	32598524	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=0,27;MFRL=0,113;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=35.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,12:0.929:12:0,4:0,8:0,0,7,5
chr7	32609565	.	A	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=29,27;MFRL=184,191;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.784:7:0,4:1,2:1,0,6,0
chr7	32613119	.	TAC	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=163,196;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:3,1:1,3,0,1
chr7	32615553	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=36,25;MFRL=273,137;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=25.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.835:10:0,4:1,5:0,1,6,3
chr7	32620325	.	T	TTG	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,156;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=TG;STR;TLOD=25.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.916:7:0,3:0,4:0,0,7,0
chr7	33014404	.	G	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=191,182;MMQ=53,33;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.84	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:2,0:0,2:0,2,0,2
chr7	33016120	.	G	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,200;MMQ=60,40;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=23.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,3:0,5:0,0,5,3
chr7	33059289	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,31;MFRL=134,103;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.296:8:0,2:6,0:3,3,2,0
chr7	33059407	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,35;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=7.39	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.764:2:0,0:0,2:0,0,0,2
chr7	33060946	.	A	G	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=94,165;MMQ=58,60;MPOS=14;PON;POPAF=7.30;TLOD=53.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,18:0.594:30:8,8:4,10:5,7,9,9
chr7	33102462	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=35,30;MFRL=210,231;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=12.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.718:5:0,2:1,2:0,1,0,4
chr7	33136983	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,139;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=25.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,1:0,7:0,0,2,6
chr7	33138875	.	A	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=150,173;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=18.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,7:0.500:14:4,5:3,2:6,1,5,2
chr7	33139147	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=192,211;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,3:1,0:0,3,0,3
chr7	33140340	.	T	A	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=29,20;MFRL=187,57;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.130:21:11,0:8,2:0|1:33140340_T_A:33140340:6,13,1,1
chr7	33140344	.	C	CCAGCTCTCTA	.	.	DP=22;ECNT=2;MBQ=32,20;MFRL=187,57;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=5.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:19,2:0.129:21:11,0:8,2:0|1:33140340_T_A:33140340:6,13,1,1
chr7	33195355	.	T	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=91,210;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,1:1,0:0|1:33195355_T_C:33195355:0,2,0,1
chr7	33195359	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,28;MFRL=91,210;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.393:3:1,1:1,0:0|1:33195355_T_C:33195355:0,2,0,1
chr7	33217071	.	CT	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=142,150;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.303:8:4,2:1,0:5,1,2,0
chr7	33297108	.	TCA	T	.	.	DP=6;ECNT=4;MBQ=29,30;MFRL=213,226;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=CA;STR;TLOD=7.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,2:0.427:5:2,1:1,1:0|1:33297108_TCA_T:33297108:0,3,0,2
chr7	33297110	.	AC	A	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=26,24;MFRL=257,134;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,1:0.393:3:1,1:1,0:1|0:33297108_TCA_T:33297108:0,2,0,1
chr7	33297114	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=25,21;MFRL=235,134;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:33297108_TCA_T:33297108:0,4,0,1
chr7	33297117	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=4;MBQ=24,29;MFRL=235,134;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:4,1:0.286:5:2,1:2,0:1|0:33297108_TCA_T:33297108:0,4,0,1
chr7	33376047	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=185,187;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=7.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:4,2:6,1:9,1,2,1
chr7	33380598	.	G	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=150,254;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,2:0.250:10:5,1:3,1:3,5,0,2
chr7	33380673	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=29,34;MFRL=182,231;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=6.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	33388618	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,24;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.863:5:0,2:0,3:0,0,4,1
chr7	33388829	.	T	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=30,25;MFRL=149,233;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=9.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,3:2,1:0,3,0,4
chr7	33392380	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=29,34;MFRL=143,0;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:6,2:4,0:9,1,1,1
chr7	33644941	.	T	C	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=28,35;MFRL=198,196;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,7:0.616:11:3,3:1,3:0|1:33644941_T_C:33644941:0,4,1,6
chr7	33644948	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=32,31;MFRL=182,196;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=27.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,7:0.667:10:2,3:1,4:0|1:33644941_T_C:33644941:0,3,1,6
chr7	33945183	.	C	A	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=144,175;MMQ=60,25;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=24.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,10:0.611:16:6,10:0,0:6,0,10,0
chr7	33979555	.	G	A	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=121,122;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:20,3:0.160:23:9,0:11,3:6,14,3,0
chr7	34125622	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=30,32;MFRL=186,232;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:22,2:0.115:24:11,1:11,1:11,11,0,2
chr7	34697982	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=187,179;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=27.45	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,9:0.833:10:0,6:1,3:1,0,9,0
chr7	34698210	.	A	G	.	.	DP=15;ECNT=3;MBQ=24,32;MFRL=109,163;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=14.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,2:6,4:4,5,2,4
chr7	34698234	.	A	C	.	.	DP=14;ECNT=3;MBQ=26,29;MFRL=109,167;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=7.95	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.329:13:3,2:5,2:3,6,0,4
chr7	34698251	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=3;MBQ=34,34;MFRL=220,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=16.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,5:0.500:10:2,2:3,3:0,5,0,5
chr7	34888010	.	T	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=26,31;MFRL=171,148;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.487:6:1,1:2,1:3,0,3,0
chr7	34917664	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=182,173;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=4.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:4,2:1,0:4,1,2,0
chr7	34977685	.	C	CTCTACCAT	.	.	DP=16;ECNT=2;MBQ=27,20;MFRL=207,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.173:15:6,2:7,0:0|1:34977685_C_CTCTACCAT:34977685:5,8,1,1
chr7	34977686	.	G	GCCAGC	.	.	DP=18;ECNT=2;MBQ=31,31;MFRL=207,67;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:13,2:0.170:15:5,1:7,0:0|1:34977685_C_CTCTACCAT:34977685:5,8,1,1
chr7	34979748	.	C	CT	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=66,194;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=T;STR;TLOD=3.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.516:4:1,1:1,1:2,0,2,0
chr7	34989364	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,212;MMQ=52,50;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:3,1:3,1:4,2,2,0
chr7	35009183	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=187,185;MMQ=33,27;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,5:0.375:14:3,1:6,4:3,6,1,4
chr7	35050217	.	A	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=25,35;MFRL=134,152;MMQ=48,39;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=7.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.251:14:8,0:3,3:6,5,0,3
chr7	35050886	.	G	C	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=33,34;MFRL=144,247;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.213:12:5,2:5,0:8,2,2,0
chr7	35241962	.	A	AGGGGGG	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,15;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=0;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35241962_A_AGGGGGG:35241962:0,0,1,0
chr7	35241963	.	T	C	.	.	DP=1;ECNT=2;MBQ=0,0;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=50;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:35241962_A_AGGGGGG:35241962:0,0,1,0
chr7	35271254	.	T	C	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=30,33;MFRL=161,119;MMQ=60,59;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:2,1:2,1:1,3,0,2
chr7	35280404	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=194,180;MMQ=52,56;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=4.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.381:6:1,1:2,1:4,0,2,0
chr7	35280693	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,30;MFRL=144,279;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=19.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,7:0.470:15:3,3:5,4:1,7,1,6
chr7	35288213	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=25,35;MFRL=147,207;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=17.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.757:6:0,3:1,2:1,0,5,0
chr7	35288276	.	T	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=29,30;MFRL=161,194;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=9.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:5,1:4,3:6,3,2,2
chr7	35288458	.	CAGAG	C,CAG	.	.	DP=18;ECNT=1;MBQ=35,35,36;MFRL=194,129,172;MMQ=60,60,60;MPOS=26,14;POPAF=7.30,7.30;RPA=8,6,7;RU=AG;STR;TLOD=5.48,4.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:10,2,2:0.165,0.176:14:6,1,0:4,1,2:4,6,0,4
chr7	35289536	.	A	C	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=21,12;MFRL=167,81;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=4.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:6,3:0.343:9:1,0:2,1:0|1:35289536_A_C:35289536:3,3,3,0
chr7	35289543	.	A	C	.	.	DP=12;ECNT=2;MBQ=28,13;MFRL=177,81;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=4.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:9,3:0.265:12:3,0:4,0:0|1:35289536_A_C:35289536:6,3,3,0
chr7	35289889	.	C	CA	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,184;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;RPA=3,4;RU=A;STR;TLOD=25.27	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,0,8
chr7	35673870	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,26;MFRL=167,0;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,4:0.296:15:6,2:4,2:8,3,4,0
chr7	35840898	.	G	GC	.	.	DP=30;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=95.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,28:0.967:28:0,15:0,13:0,0,11,17
chr7	35930260	.	G	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,25;MFRL=229,183;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.76	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.627:6:1,1:1,3:2,0,4,0
chr7	35930437	.	A	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=25,36;MFRL=144,274;MMQ=60,54;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:2,1:0,2:0,2,0,3
chr7	36278660	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=175,132;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:8,0:3,2:6,5,0,2
chr7	36324436	.	G	A	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=195,156;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=45.83	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.852:18:2,8:0,8:0,2,2,14
chr7	36338564	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=2;MBQ=30,30;MFRL=212,136;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=19.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,6:0.775:7:1,2:0,3:0|1:36338564_G_A:36338564:1,0,6,0
chr7	36338589	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=31,29;MFRL=218,121;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=12.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,5:0.399:13:2,3:6,1:0|1:36338564_G_A:36338564:5,3,3,2
chr7	36338841	.	T	C	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=30,27;MFRL=149,196;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=13.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,6:0.437:14:4,3:4,3:3,5,0,6
chr7	36366569	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=177,150;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=10.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:3,2:1,2:0,4,0,4
chr7	36370499	.	C	G	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,32;MFRL=0,159;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,0:0,3:0,0,3,0
chr7	36370555	.	G	T	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=27.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.923:10:0,3:0,6:0,0,9,1
chr7	36406513	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=152,63;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.499:4:0,0:2,2:0,2,1,1
chr7	36438805	.	C	G	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=32,32;MFRL=165,108;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:21,2:0.119:23:11,1:10,1:12,9,0,2
chr7	36445856	.	G	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=294,143;MMQ=60,60;MPOS=19;PON;POPAF=7.30;TLOD=44.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,16:0.855:18:0,2:2,14:1,1,7,9
chr7	36446218	.	T	A	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=26,28;MFRL=184,19151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,1,1,0
chr7	36446220	.	G	T	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=29,26;MFRL=184,19151;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,1,1,0
chr7	36446223	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=5;MBQ=0,32;MFRL=184,19151;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,1,1,0
chr7	36446227	.	G	GACATAA	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,33;MFRL=0,19151;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,0,1,0
chr7	36446230	.	G	T	.	.	DP=1;ECNT=5;MBQ=0,22;MFRL=0,19151;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,1:0|1:36446218_T_A:36446218:0,0,1,0
chr7	36447287	.	A	G	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=28,33;MFRL=195,226;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=18.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,6:0.467:13:3,3:4,3:7,0,4,2
chr7	36447349	.	A	ACTT	.	.	DP=21;ECNT=2;MBQ=27,29;MFRL=157,159;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=CTT;STR;TLOD=21.24	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,6:0.332:19:6,3:7,2:8,5,6,0
chr7	36447600	.	T	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=30,36;MFRL=220,161;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.455:9:3,1:2,3:0,5,0,4
chr7	36456613	.	AC	A	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=24,29;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=10.67	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.846:11:1,2:0,7:0,1,10,0
chr7	36462205	.	G	A	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=175,143;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=6.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,3:0.199:18:8,1:7,2:11,4,3,0
chr7	36465570	.	T	C	.	.	DP=34;ECNT=2;MBQ=28,32;MFRL=148,123;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=40.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,17:0.492:34:10,7:7,7:12,5,11,6
chr7	36465606	.	CTT	C,CT,CTTT	.	.	DP=32;ECNT=2;MBQ=33,27,32,33;MFRL=175,130,110,227;MMQ=60,60,60,60;MPOS=18,18,18;POPAF=7.30,7.30,7.30;RPA=15,13,14,16;RU=T;STR;TLOD=3.93,5.34,6.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2/3:5,6,5,5:0.252,0.231,0.249:21:3,5,1,3:2,1,4,2:3,2,6,10
chr7	36466571	.	C	T	.	.	DP=26;ECNT=2;MBQ=29,28;MFRL=149,151;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=17.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.332:25:4,4:13,4:3,14,4,4
chr7	36466589	.	C	T	.	.	DP=25;ECNT=2;MBQ=32,28;MFRL=162,149;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=18.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,8:0.333:25:8,0:9,8:8,9,0,8
chr7	36552790	.	G	GT	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,190;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=29.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.912:9:0,4:0,4:0,0,8,1
chr7	36588405	.	A	AC	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=27,25;MFRL=118,185;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=9.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.572:5:1,2:1,1:0,2,0,3
chr7	36588955	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=259,124;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=9.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,4:0.500:8:2,3:2,1:3,1,2,2
chr7	36656035	.	G	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,31;MFRL=140,141;MMQ=60,60;MPOS=15;PON;POPAF=7.30;TLOD=21.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,9:0.500:18:7,4:2,5:4,5,3,6
chr7	36656147	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=14.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,4:0,0:0,0,0,5
chr7	36661423	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=47.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.941:15:0,10:0,5:0,0,2,13
chr7	36698684	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,24;MFRL=302,222;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=9.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,4:0.625:6:1,0:1,4:2,0,4,0
chr7	36726476	.	CGTGT	C,CGT	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=0,27,25;MFRL=0,208,200;MMQ=60,60,60;MPOS=25,25;POPAF=7.30,7.30;RPA=13,11,12;RU=GT;STR;TLOD=10.28,7.87	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:0,4,3:0.512,0.402:7:0,3,1:0,1,1:0,0,0,7
chr7	36763560	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=188,202;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=3.88	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.329:7:3,1:2,1:5,0,2,0
chr7	36927078	.	G	T	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=150,185;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=4.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.428:5:1,1:2,1:3,0,2,0
chr7	36934448	.	A	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,176;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=94.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,26:0.965:26:0,11:0,15:0,0,17,9
chr7	37053134	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=198,301;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:3,0:1,2:0,4,0,2
chr7	37272769	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=193,197;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=10.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,4:0.357:12:2,3:6,1:6,2,1,3
chr7	37299056	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=176,280;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=4.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,2:0.300:8:2,1:4,1:0,6,0,2
chr7	37355590	.	C	CT	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,191;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=T;STR;TLOD=51.41	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,15:0.946:15:0,6:0,9:0,0,3,12
chr7	37780765	.	C	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=35,26;MFRL=172,253;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=3.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.212:12:3,1:7,0:4,6,2,0
chr7	37889786	.	A	G	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,183;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;TLOD=10.49	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.811:3:0,2:0,1:0,0,3,0
chr7	37901581	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,143;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=40.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.935:13:0,7:0,6:0,0,7,6
chr7	37903853	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=0,24;MFRL=0,187;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=13.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,1:0,4:0,0,5,0
chr7	37903904	.	C	T	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=33,25;MFRL=224,122;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=31.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,12:0.814:14:2,6:0,6:2,0,9,3
chr7	37904065	.	TAAC	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,28;MFRL=224,164;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AAC;STR;TLOD=17.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.545:9:4,1:0,4:0,4,1,4
chr7	37904099	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=32,25;MFRL=223,176;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=12.65	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:1,1:0,4:0,1,1,4
chr7	37905236	.	G	A	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=163,109;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,3:0.285:12:3,1:6,2:1,8,0,3
chr7	37916427	.	T	G	.	.	DP=27;ECNT=1;MBQ=24,31;MFRL=141,188;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=51.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,17:0.644:26:5,17:4,0:8,1,17,0
chr7	37923849	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=34,28;MFRL=192,160;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:1,1:1,4:2,0,4,1
chr7	37924737	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,182;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=37.77	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.925:11:0,7:0,4:0,0,6,5
chr7	37924879	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=264,150;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=16.64	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,5:0.669:7:0,2:2,3:1,1,0,5
chr7	37927779	.	T	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=24,35;MFRL=215,209;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=10.30	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.672:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	37933983	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,170;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=18.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr7	37934234	.	G	A	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,168;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=38.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,13:0.938:13:0,5:0,8:0,0,1,12
chr7	37936384	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,207;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=16.81	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,0:0,5:0,0,5,0
chr7	37953720	.	C	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=35,33;MFRL=210,138;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,2,1
chr7	37960262	.	AAGGCAGTGGCAGC	A	.	.	DP=25;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=154,175;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=AGGCAGTGGCAGC;STR;TLOD=41.70	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,11:0.679:16:0,5:4,6:2,3,5,6
chr7	37989775	.	T	C	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=25,31;MFRL=142,177;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=14.55	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.367:17:5,3:6,3:9,2,4,2
chr7	38253923	.	C	A	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=31,31;MFRL=133,162;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=9.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,4:0.312:14:2,3:8,1:9,1,3,1
chr7	38301741	.	T	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=25,30;MFRL=183,154;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,4:0.383:11:2,1:5,3:5,2,2,2
chr7	38304926	.	C	T	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=135,113;MMQ=55,38;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=8.29	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.415:10:2,2:4,2:4,2,4,0
chr7	38305043	.	T	C	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=25,34;MFRL=123,193;MMQ=52,34;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.26	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,2:0.137:20:9,1:9,1:7,11,0,2
chr7	38424539	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=33,26;MFRL=122,225;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=9.04	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,4:0.417:10:1,2:5,2:2,4,2,2
chr7	38429370	.	C	T	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=154,142;MMQ=60,60;MPOS=2;POPAF=7.30;TLOD=5.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.306:11:4,2:4,1:6,2,3,0
chr7	38431644	.	G	GC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=0,31;MFRL=0,226;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=10.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,3:0.800:3:0,2:0,1:0,0,0,3
chr7	38500782	.	G	A	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=219,197;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,3:0.667:4:0,2:1,1:1,0,3,0
chr7	38505014	.	A	C	.	.	DP=13;ECNT=2;MBQ=32,32;MFRL=166,126;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.43	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,3:0.267:13:7,2:3,1:8,2,3,0
chr7	38505025	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=2;MBQ=35,29;MFRL=122,150;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=28.09	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,10:0.734:13:2,8:1,2:2,1,7,3
chr7	38505712	.	T	G	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=203,131;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.90	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,2:0.199:13:7,2:4,0:9,2,2,0
chr7	38514868	.	G	A	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=33,31;MFRL=193,144;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=7.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,3:0.364:9:4,2:2,1:3,3,3,0
chr7	38530568	.	G	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,28;MFRL=172,213;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=14.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,5:0.750:6:0,4:1,1:1,0,4,1
chr7	38530807	.	T	TA	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,28;MFRL=0,230;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;RPA=7,8;RU=A;STR;TLOD=11.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,2:0,1:0,0,0,4
chr7	38543371	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,30;MFRL=0,175;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=13.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	38781018	.	T	C	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=30,23;MFRL=146,116;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=9.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:5,5:2,0:1,6,1,4
chr7	38781822	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,274;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=8.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:2,2:0,1:0,2,0,3
chr7	38782905	.	C	T	.	.	DP=8;ECNT=3;MBQ=0,25;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=31.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,4:0,4:0,0,8,0
chr7	38782944	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=3;MBQ=30,27;MFRL=164,149;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=13.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,6:0.388:16:4,3:5,3:9,1,5,1
chr7	38782951	.	G	A	.	.	DP=17;ECNT=3;MBQ=31,29;MFRL=155,163;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=24.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,9:0.555:16:3,4:4,5:6,1,8,1
chr7	38785062	.	G	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=190,157;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=8.46	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,3:0.500:6:2,2:1,1:3,0,3,0
chr7	38810880	.	T	TA	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=29,28;MFRL=166,265;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;RPA=14,15;RU=A;STR;TLOD=4.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,3:0.441:7:1,2:2,1:0,4,0,3
chr7	38813711	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,189;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=30.19	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,4:0,5:0,0,5,4
chr7	38816441	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=26,35;MFRL=221,193;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=12.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr7	38857364	.	G	A	.	.	DP=10;ECNT=2;MBQ=33,30;MFRL=231,136;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=14.73	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.602:8:2,2:1,3:3,0,5,0
chr7	38857378	.	T	A	.	.	DP=15;ECNT=2;MBQ=28,29;MFRL=136,136;MMQ=60,60;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=5.28	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,3:0.248:14:7,2:4,0:9,2,3,0
chr7	38860933	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=26,33;MFRL=222,136;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=15.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,5:0.600:8:1,1:2,4:0,3,0,5
chr7	38908876	.	T	C	.	.	DP=15;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=142,157;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=15.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,6:0.412:15:3,2:6,4:2,7,3,3
chr7	39125413	.	T	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=24,33;MFRL=186,178;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=35.86	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,10:0.849:11:1,3:0,7:1,0,10,0
chr7	39243750	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=33,30;MFRL=175,182;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=18.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,6:0.778:7:1,4:0,2:1,0,6,0
chr7	39243963	.	T	A	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,169;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=26.98	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,9:0.909:9:0,6:0,3:0,0,1,8
chr7	39243978	.	A	G	.	.	DP=8;ECNT=2;MBQ=0,31;MFRL=0,178;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=28.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.900:8:0,5:0,3:0,0,0,8
chr7	39379698	.	CCA	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=32,31;MFRL=289,181;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;RPA=3,2;RU=CA;STR;TLOD=7.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.501:4:2,2:0,0:0,2,0,2
chr7	39472669	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,29;MFRL=165,220;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=4.71	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.373:6:1,0:3,2:4,0,1,1
chr7	39500352	.	C	G	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,173;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=28.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,8:0.903:8:0,6:0,2:0,0,1,7
chr7	39504345	.	C	T	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,33;MFRL=301,188;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39504345_C_T:39504345:0,2,0,1
chr7	39504353	.	CAACA	C	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=34,35;MFRL=301,188;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:2,1:0.400:3:1,0:1,1:0|1:39504345_C_T:39504345:0,2,0,1
chr7	39745676	.	T	A	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,26;MFRL=162,163;MMQ=60,49;MPOS=31;POPAF=7.30;TLOD=40.85	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,16:0.654:24:6,15:2,0:8,0,16,0
chr7	40037161	.	C	T	.	.	DP=29;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=130,62;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=6.94	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:26,3:0.129:29:19,2:7,1:0|1:40037161_C_T:40037161:11,15,2,1
chr7	40037179	.	C	CACCCCGCAACTCAGCCTCA	.	.	DP=19;ECNT=2;MBQ=33,20;MFRL=119,62;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:17,2:0.143:19:14,2:2,0:0|1:40037161_C_T:40037161:7,10,1,1
chr7	40087320	.	GT	G	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,34;MFRL=234,201;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;RPA=12,11;RU=T;STR;TLOD=3.32	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:5,0,2,0
chr7	40127710	.	CT	C	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=210,152;MMQ=60,60;MPOS=31;POPAF=7.30;RPA=11,10;RU=T;STR;TLOD=6.92	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,4:0.453:9:4,3:1,1:4,1,2,2
chr7	40228033	.	C	CAA,CCAA	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=31,31,32;MFRL=271,107,128;MMQ=40,50,60;MPOS=12,16;POPAF=7.30,7.30;TLOD=3.72,3.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1/2:1,2,3:0.340,0.463:6:0,1,0:1,1,3:1,0,3,2
chr7	40229012	.	AC	TT	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=30,25;MFRL=307,246;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:40229012_AC_TT:40229012:1,0,1,0
chr7	40229019	.	A	AAT	.	.	DP=3;ECNT=2;MBQ=0,28;MFRL=307,246;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=3.66	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.498:2:0,0:0,1:0|1:40229012_AC_TT:40229012:1,0,1,0
chr7	40356305	.	G	A	.	.	DP=11;ECNT=2;MBQ=34,29;MFRL=175,201;MMQ=60,60;MPOS=9;POPAF=7.30;TLOD=3.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:8,2:0.248:10:4,1:4,1:0|1:40356305_G_A:40356305:7,1,2,0
chr7	40356315	.	A	T	.	.	DP=9;ECNT=2;MBQ=28,27;MFRL=192,170;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	1|0:2,7:0.727:9:2,3:0,4:1|0:40356305_G_A:40356305:1,1,6,1
chr7	40356525	.	AT	TC	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=89,126;MMQ=60,32;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,1:0.400:3:0,1:2,0:0,2,0,1
chr7	40900175	.	A	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=27,35;MFRL=212,184;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=15.44	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,5:0.462:11:3,2:3,3:0,6,0,5
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chr7	41730235	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,28;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41730232_T_A:41730232:0,1,0,1
chr7	41730239	.	C	CCAAGTATATGCTAATA	.	.	DP=2;ECNT=3;MBQ=32,34;MFRL=190,176;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=3.72	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:1,0:0,1:0|1:41730232_T_A:41730232:0,1,0,1
chr7	42004666	.	C	T	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=31,29;MFRL=200,162;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.96	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,5:0.317:17:9,3:2,2:6,6,4,1
chr7	42005329	.	G	A	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=176,146;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.211:12:1,0:9,2:5,5,1,1
chr7	42064852	.	C	G	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,172;MMQ=60,60;MPOS=28;POPAF=7.30;TLOD=38.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,10:0.919:10:0,9:0,1:0,0,9,1
chr7	42116475	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=35,20;MFRL=190,89;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=7.15	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,5:0.259:21:4,0:12,5:3,13,3,2
chr7	42951515	.	G	A	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=0,23;MFRL=0,227;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=4.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.744:2:0,1:0,0:0,0,2,0
chr7	42957465	.	ATT	A	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,177;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=26.14	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,3:0,3:0,0,2,4
chr7	42974827	.	A	C	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,36;MFRL=0,174;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=23.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,2:0,4:0,0,0,6
chr7	42977195	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=2;MBQ=0,25;MFRL=0,164;MMQ=60,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=17.51	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.875:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	42977243	.	T	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,218;MMQ=60,50;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=11.80	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,3:0,1:0,0,0,4
chr7	43351273	.	C	T	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=34,25;MFRL=234,165;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=7.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,3:0.573:5:1,1:1,2:2,0,3,0
chr7	43447365	.	A	AG	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,27;MFRL=168,184;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=5.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:1,0:6,2:0,7,0,2
chr7	43484310	.	T	C	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=28,33;MFRL=192,154;MMQ=60,60;MPOS=16;PON;POPAF=7.30;TLOD=46.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,15:0.640:23:3,8:5,7:5,3,8,7
chr7	43485248	.	A	G	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,224;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=23.34	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,6:0.880:6:0,4:0,2:0,0,0,6
chr7	43490509	.	C	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=26,28;MFRL=72,191;MMQ=60,60;MPOS=19;POPAF=7.30;TLOD=3.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,2:0.175:15:11,1:2,1:5,8,1,1
chr7	43495878	.	C	CT	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=33,33;MFRL=198,159;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=5,6;RU=T;STR;TLOD=34.11	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:6,13:0.667:19:4,6:2,7:0,6,5,8
chr7	43540264	.	A	G	.	.	DP=19;ECNT=1;MBQ=30,26;MFRL=188,162;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=13.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:12,6:0.350:18:4,1:8,5:9,3,6,0
chr7	43540803	.	C	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=34,10;MFRL=179,248;MMQ=60,40;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:3,0:0,0:4,0,1,0
chr7	43548516	.	C	T	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=34,26;MFRL=174,150;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=13.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,5:0.546:9:3,2:1,3:3,1,5,0
chr7	43591955	.	A	G	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=74.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,21:0.957:21:0,10:0,10:0,0,7,14
chr7	43594471	.	C	T	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=34,32;MFRL=169,88;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=5.78	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:2,2:0.500:4:1,1:1,1:0,2,0,2
chr7	43622806	.	T	C	.	.	DP=26;ECNT=1;MBQ=22,20;MFRL=122,84;MMQ=60,60;MPOS=22;POPAF=7.30;TLOD=14.08	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:18,7:0.297:25:8,3:9,4:12,6,4,3
chr7	43635511	.	C	T	.	.	DP=28;ECNT=2;MBQ=35,24;MFRL=157,118;MMQ=60,49;MPOS=32;POPAF=7.30;TLOD=12.23	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,4:0.167:28:11,4:13,0:0|1:43635511_C_T:43635511:12,12,4,0
chr7	43635517	.	T	A	.	.	DP=27;ECNT=2;MBQ=28,31;MFRL=156,118;MMQ=60,49;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=12.31	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:23,4:0.172:27:11,4:11,0:0|1:43635511_C_T:43635511:11,12,4,0
chr7	43659182	.	G	A	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=179,134;MMQ=60,60;MPOS=25;POPAF=7.30;TLOD=14.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,7:0.332:22:7,4:8,3:7,8,5,2
chr7	43687074	.	TGGA	T	.	.	DP=24;ECNT=1;MBQ=25,28;MFRL=161,245;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;RPA=2,1;RU=GGA;STR;TLOD=4.10	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:19,2:0.129:21:10,2:9,0:18,1,2,0
chr7	43810695	.	A	G	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=184,196;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=22.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,8:0.500:16:4,3:4,5:3,5,5,3
chr7	43810820	.	C	T	.	.	DP=21;ECNT=1;MBQ=32,30;MFRL=144,194;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=8.60	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:8,3:7,1:9,6,1,3
chr7	43827414	.	G	A	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=29,31;MFRL=216,140;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=5.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,2:0.375:6:2,2:2,0:4,0,2,0
chr7	43846644	.	A	T	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=26,30;MFRL=153,153;MMQ=60,60;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=8.13	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:24,4:0.166:28:14,0:10,4:11,13,0,4
chr7	43921483	.	T	C	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=25,29;MFRL=126,109;MMQ=60,60;MPOS=33;POPAF=7.30;TLOD=5.38	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:25,4:0.150:29:7,3:15,0:16,9,4,0
chr7	43927512	.	C	T	.	.	DP=9;ECNT=1;MBQ=27,33;MFRL=175,159;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=5.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,2:0.273:9:4,0:3,2:0,7,0,2
chr7	43978186	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=27,35;MFRL=207,132;MMQ=50,40;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:4,1:0.286:5:1,0:2,1:0,4,0,1
chr7	43978193	.	G	C	.	.	DP=4;ECNT=3;MBQ=32,29;MFRL=248,132;MMQ=40,40;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:2,0:1,1:0|1:43978193_G_C:43978193:0,3,0,1
chr7	43978197	.	A	T	.	.	DP=5;ECNT=3;MBQ=26,32;MFRL=204,132;MMQ=50,40;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=3.02	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:2,0:2,1:0|1:43978193_G_C:43978193:0,4,0,1
chr7	43988188	.	C	T	.	.	DP=17;ECNT=1;MBQ=32,28;MFRL=186,171;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=13.91	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:11,6:0.368:17:7,5:4,1:9,2,6,0
chr7	44044907	.	A	G	.	.	DP=2;ECNT=1;MBQ=28,35;MFRL=219,190;MMQ=40,40;MPOS=27;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0,1,0,1
chr7	44089904	.	A	G	.	.	DP=29;ECNT=1;MBQ=28,27;MFRL=185,129;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.89	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,9:0.356:26:5,4:12,5:5,12,5,4
chr7	44091343	.	A	G	.	.	DP=12;ECNT=1;MBQ=32,35;MFRL=196,139;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=8.42	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:8,3:0.307:11:7,2:1,1:8,0,3,0
chr7	44097330	.	G	T	.	.	DP=16;ECNT=1;MBQ=34,23;MFRL=188,104;MMQ=60,60;MPOS=34;POPAF=7.30;TLOD=4.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:13,3:0.221:16:4,3:9,0:9,4,3,0
chr7	44097696	.	T	C	.	.	DP=22;ECNT=1;MBQ=28,32;MFRL=164,115;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=17.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:14,6:0.318:20:5,2:9,4:5,9,4,2
chr7	44098142	.	C	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=28,30;MFRL=168,154;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=10.00	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:9,4:0.333:13:3,3:6,1:4,5,0,4
chr7	44100393	.	T	TC	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=28,29;MFRL=141,200;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=C;STR;TLOD=3.59	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:17,2:0.142:19:13,2:4,0:13,4,2,0
chr7	44112873	.	G	T	.	.	DP=14;ECNT=1;MBQ=35,29;MFRL=206,112;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=12.54	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:7,5:0.428:12:4,3:2,2:5,2,2,3
chr7	44113656	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=233,185;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=8.33	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,2:4,1:2,3,1,2
chr7	44116010	.	C	T	.	.	DP=7;ECNT=1;MBQ=32,25;MFRL=191,272;MMQ=60,60;MPOS=26;POPAF=7.30;TLOD=3.63	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.333:7:3,0:2,2:5,0,2,0
chr7	44144201	.	C	G	.	.	DP=5;ECNT=2;MBQ=34,36;MFRL=238,279;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.16	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.329:4:2,1:1,0:0|1:44144201_C_G:44144201:3,0,1,0
chr7	44144222	.	A	C	.	.	DP=4;ECNT=2;MBQ=17,13;MFRL=238,279;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=3.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:0,0:1,0:0|1:44144201_C_G:44144201:3,0,1,0
chr7	44147567	.	C	CG	.	.	DP=6;ECNT=1;MBQ=0,27;MFRL=0,165;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.07	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.848:4:0,3:0,0:0,0,1,3
chr7	44148690	.	A	G	.	.	DP=23;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=160,61;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=5.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:21,2:0.121:23:6,0:13,2:0|1:44148690_A_G:44148690:7,14,1,1
chr7	44148695	.	GC	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=34,20;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:15,2:0|1:44148690_A_G:44148690:7,17,1,1
chr7	44148697	.	A	G	.	.	DP=26;ECNT=4;MBQ=27,20;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=5;POPAF=7.30;TLOD=5.06	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:8,0:12,2:0|1:44148690_A_G:44148690:7,17,1,1
chr7	44148701	.	T	C	.	.	DP=27;ECNT=4;MBQ=29,20;MFRL=165,61;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.05	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:24,2:0.107:26:7,0:15,2:0|1:44148690_A_G:44148690:8,16,1,1
chr7	44150358	.	A	T	.	.	DP=20;ECNT=1;MBQ=29,23;MFRL=154,149;MMQ=60,59;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=6.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:15,4:0.237:19:11,4:4,0:10,5,4,0
chr7	44151009	.	C	T	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=30,28;MFRL=218,252;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;TLOD=19.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,7:0.668:10:1,4:2,3:1,2,6,1
chr7	44152119	.	A	AG	.	.	DP=10;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,195;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=25.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,7:0.899:7:0,1:0,6:0,0,6,1
chr7	44152549	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=27,28;MFRL=153,184;MMQ=60,60;MPOS=11;POPAF=7.30;TLOD=4.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,2:0.331:7:2,1:3,1:4,1,1,1
chr7	44154865	.	A	AG	.	.	DP=11;ECNT=1;MBQ=0,29;MFRL=0,166;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=G;STR;TLOD=35.93	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,11:0.923:11:0,5:0,5:0,0,5,6
chr7	44156146	.	G	A	.	.	DP=8;ECNT=1;MBQ=32,27;MFRL=173,157;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=10.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,4:0.556:7:1,1:2,3:0,3,0,4
chr7	44157117	.	A	C	.	.	DP=1;ECNT=6;MBQ=0,12;MFRL=0,221;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=4.20	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:0,1:0.667:1:0,0:0,0:0|1:44157117_A_C:44157117:0,0,1,0
chr7	44157125	.	A	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=27,31;MFRL=235,221;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,1:0|1:44157117_A_C:44157117:1,0,1,0
chr7	44157127	.	T	C	.	.	DP=2;ECNT=6;MBQ=24,12;MFRL=235,221;MMQ=60,60;MPOS=14;POPAF=7.30;TLOD=3.79	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:1,1:0.500:2:0,0:1,0:0|1:44157117_A_C:44157117:1,0,1,0
chr7	44157133	.	C	CCCG	.	.	DP=4;ECNT=6;MBQ=33,32;MFRL=169,221;MMQ=60,60;MPOS=8;POPAF=7.30;TLOD=3.36	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:3,1:0.333:4:1,0:1,1:0|1:44157117_A_C:44157117:3,0,1,0
chr7	44157134	.	A	G	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=31,16;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=7;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:1,0:1,0:0|1:44157117_A_C:44157117:4,0,1,0
chr7	44157138	.	T	C	.	.	DP=5;ECNT=6;MBQ=27,12;MFRL=167,221;MMQ=60,60;MPOS=3;POPAF=7.30;TLOD=3.21	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:4,1:0.286:5:3,0:1,0:0|1:44157117_A_C:44157117:4,0,1,0
chr7	44180079	.	A	AG	.	.	DP=4;ECNT=1;MBQ=0,26;MFRL=0,273;MMQ=60,60;MPOS=17;POPAF=7.30;RPA=2,3;RU=G;STR;TLOD=13.56	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,4:0.833:4:0,4:0,0:0,0,1,3
chr7	44180226	.	A	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=29,33;MFRL=284,232;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=6.47	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:0,1:1,1:1,0,2,0
chr7	44185088	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=28,31;MFRL=178,212;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;TLOD=4.22	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:10,2:0.215:12:5,1:4,1:8,2,1,1
chr7	44189274	.	T	C	.	.	DP=8;ECNT=6;MBQ=25,32;MFRL=188,245;MMQ=60,60;MPOS=21;POPAF=7.30;TLOD=8.53	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.400:8:1,1:4,2:4,1,3,0
chr7	44189321	.	A	G	.	.	DP=10;ECNT=6;MBQ=29,30;MFRL=165,158;MMQ=60,60;MPOS=24;POPAF=7.30;TLOD=7.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:5,3:0.405:8:3,1:1,2:5,0,2,1
chr7	44189365	.	T	C	.	.	DP=17;ECNT=6;MBQ=28,20;MFRL=168,49;MMQ=60,60;MPOS=13;POPAF=7.30;TLOD=5.61	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:15,2:0.158:17:4,0:11,2:0|1:44189365_T_C:44189365:9,6,1,1
chr7	44189372	.	G	C	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=29,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=6;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0|1:44189365_T_C:44189365:8,6,1,1
chr7	44189374	.	C	G	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=33,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=4;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0|1:44189365_T_C:44189365:8,6,1,1
chr7	44189377	.	C	CATCTTA	.	.	DP=16;ECNT=6;MBQ=31,20;MFRL=166,49;MMQ=60,60;MPOS=1;POPAF=7.30;TLOD=5.69	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:PGT:PID:PS:SB	0|1:14,2:0.167:16:3,0:11,2:0|1:44189365_T_C:44189365:8,6,1,1
chr7	44190468	.	T	G	.	.	DP=3;ECNT=1;MBQ=27,34;MFRL=186,198;MMQ=60,60;MPOS=12;POPAF=7.30;TLOD=6.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,2:0.600:3:1,1:0,1:1,0,2,0
chr7	44228636	.	G	C	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=31,32;MFRL=294,152;MMQ=60,60;MPOS=16;POPAF=7.30;TLOD=5.57	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,2:0.429:5:1,1:2,1:0,3,0,2
chr7	44259561	.	G	GC	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,33;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=23;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=8.52	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	44259574	.	C	T	.	.	DP=2;ECNT=2;MBQ=0,26;MFRL=0,164;MMQ=60,60;MPOS=29;POPAF=7.30;TLOD=5.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,2:0.750:2:0,0:0,2:0,0,2,0
chr7	44266077	.	G	A	.	.	DP=13;ECNT=1;MBQ=30,29;MFRL=149,147;MMQ=60,60;MPOS=15;POPAF=7.30;TLOD=22.82	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:3,9:0.713:12:2,2:1,7:2,1,5,4
chr7	44266184	.	C	T	.	.	DP=23;ECNT=1;MBQ=29,30;MFRL=144,265;MMQ=60,60;MPOS=18;POPAF=7.30;TLOD=8.58	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:16,4:0.226:20:9,1:7,3:10,6,2,2
chr7	44272314	.	G	GC	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=0,32;MFRL=0,202;MMQ=60,60;MPOS=30;POPAF=7.30;RPA=1,2;RU=C;STR;TLOD=18.68	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,5:0.857:5:0,2:0,3:0,0,5,0
chr7	44279075	.	G	A	.	.	DP=1;ECNT=1;MBQ=0,33;MFRL=0,229;MMQ=60,60;MPOS=10;POPAF=7.30;TLOD=3.48	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:0,1:0.667:1:0,1:0,0:0,0,1,0
chr7	44281475	.	T	A	.	.	DP=5;ECNT=1;MBQ=33,27;MFRL=192,195;MMQ=60,60;MPOS=20;POPAF=7.30;TLOD=11.03	GT:AD:AF:DP:F1R2:F2R1:SB	0/1:1,4:0.714:5:0,2:1,2:0,1,0,